View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12598_low_61 (Length: 313)

Name: NF12598_low_61
Description: NF12598
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12598_low_61
NF12598_low_61
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (18-303)||(34490886-34491171)
chr3 (18-300)||(6095809-6096091)
chr3 (18-303)||(49199680-49199966)
chr3 (18-303)||(30235798-30236083)
chr3 (18-303)||(40913011-40913297)
chr3 (18-303)||(4569624-4569909)
chr3 (50-303)||(43402032-43402285)
chr3 (19-303)||(47303925-47304208)
chr3 (18-303)||(36018523-36018809)
chr3 (18-303)||(54593377-54593662)
chr3 (50-303)||(43403975-43404228)
chr3 (18-303)||(46860143-46860430)
chr3 (18-303)||(41819734-41820016)
chr3 (18-303)||(55302175-55302460)
chr3 (18-303)||(5434088-5434374)
chr3 (104-303)||(28074290-28074488)
chr3 (22-280)||(1683184-1683440)
chr3 (24-303)||(34795542-34795819)
chr3 (116-281)||(26323821-26323985)
chr3 (84-303)||(36796079-36796304)
chr3 (18-299)||(39127236-39127503)
chr3 (18-118)||(26323286-26323385)
chr3 (18-193)||(20937440-20937613)
chr3 (180-235)||(31340448-31340503)
chr3 (18-303)||(35138918-35139209)
chr3 (268-303)||(31340501-31340536)
chr3 (18-64)||(31340411-31340457)
chr3 (22-80)||(36796692-36796749)
chr3 (74-132)||(50432840-50432898)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (18-303)||(38746678-38746963)
chr5 (18-293)||(40146944-40147219)
chr5 (18-303)||(27015205-27015490)
chr5 (18-303)||(213141-213423)
chr5 (18-303)||(5057721-5058005)
chr5 (18-302)||(28277989-28278274)
chr5 (18-303)||(27637824-27638109)
chr5 (18-302)||(316439-316720)
chr5 (18-303)||(4160307-4160589)
chr5 (18-302)||(14689622-14689902)
chr5 (19-293)||(35615854-35616125)
chr5 (66-271)||(33906288-33906491)
chr5 (138-303)||(16642208-16642372)
chr5 (133-277)||(10055031-10055175)
chr5 (135-293)||(30792923-30793080)
chr5 (135-303)||(30802614-30802782)
chr5 (22-137)||(16641155-16641269)
chr5 (28-232)||(21205873-21206076)
chr5 (19-100)||(8019464-8019542)
chr5 (255-303)||(33906578-33906627)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (19-299)||(26363942-26364222)
chr4 (18-303)||(54882693-54882978)
chr4 (18-303)||(55085575-55085861)
chr4 (18-303)||(8665080-8665365)
chr4 (18-303)||(6655629-6655914)
chr4 (18-303)||(50674056-50674341)
chr4 (18-303)||(50262908-50263193)
chr4 (18-303)||(379051-379336)
chr4 (18-303)||(12073066-12073350)
chr4 (18-303)||(41964089-41964372)
chr4 (18-303)||(35662115-35662398)
chr4 (18-303)||(46703174-46703457)
chr4 (21-303)||(33989535-33989816)
chr4 (84-293)||(40630667-40630876)
chr4 (18-303)||(27417171-27417446)
chr4 (18-306)||(2209378-2209671)
chr4 (21-253)||(8647861-8648093)
chr4 (84-303)||(46569822-46570041)
chr4 (22-293)||(33089582-33089841)
chr4 (191-303)||(8653273-8653385)
chr4 (22-303)||(35370553-35370833)
chr4 (19-303)||(22882964-22883248)
chr4 (19-303)||(22934628-22934912)
chr4 (18-235)||(12119281-12119495)
chr4 (30-277)||(3785790-3786034)
chr4 (167-303)||(10071558-10071693)
chr4 (18-281)||(35369652-35369912)
chr4 (182-284)||(10071963-10072065)
chr4 (18-273)||(41961110-41961368)
chr4 (18-281)||(26699656-26699920)
chr4 (48-274)||(34112314-34112539)
chr4 (133-302)||(38811404-38811573)
chr4 (17-281)||(22629104-22629361)
chr4 (19-250)||(25723433-25723658)
chr4 (18-87)||(40632334-40632403)
chr4 (17-131)||(32091324-32091436)
chr4 (192-303)||(47514885-47514997)
chr4 (84-235)||(6200140-6200291)
chr4 (18-57)||(41639345-41639384)
chr4 (221-282)||(32091265-32091326)
chr4 (207-302)||(6719259-6719355)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (18-303)||(1631942-1632227)
chr2 (18-303)||(42288320-42288604)
chr2 (18-303)||(35447094-35447379)
chr2 (18-303)||(45726603-45726887)
chr2 (22-303)||(17450264-17450544)
chr2 (26-303)||(33647841-33648118)
chr2 (18-293)||(24397739-24398011)
chr2 (118-302)||(7450975-7451158)
chr2 (22-309)||(42261826-42262111)
chr2 (22-303)||(30218250-30218529)
chr2 (28-132)||(43730992-43731093)
chr2 (174-280)||(40935546-40935651)
chr2 (87-189)||(16676031-16676134)
chr2 (176-225)||(34811599-34811647)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (18-303)||(11348371-11348656)
chr1 (18-293)||(42298185-42298460)
chr1 (18-303)||(37167970-37168255)
chr1 (18-303)||(37879121-37879406)
chr1 (18-303)||(193285-193569)
chr1 (18-303)||(37033283-37033564)
chr1 (18-303)||(13547299-13547584)
chr1 (18-303)||(13549210-13549495)
chr1 (18-303)||(29135921-29136205)
chr1 (18-303)||(34603249-34603533)
chr1 (18-303)||(7482442-7482726)
chr1 (18-303)||(28242061-28242346)
chr1 (18-303)||(47114845-47115129)
chr1 (25-303)||(34602557-34602834)
chr1 (18-303)||(47255550-47255829)
chr1 (22-303)||(19754164-19754448)
chr1 (24-303)||(19752359-19752637)
chr1 (28-201)||(31925926-31926099)
chr1 (17-281)||(41135516-41135778)
chr1 (22-282)||(6808141-6808399)
chr1 (19-281)||(16216709-16216966)
chr1 (18-272)||(22079039-22079278)
chr1 (87-276)||(9109680-9109869)
chr1 (51-218)||(12318725-12318890)
chr1 (208-282)||(31928208-31928282)
chr1 (22-265)||(3331255-3331505)
chr1 (117-194)||(4535783-4535861)
chr1 (18-139)||(25651922-25652043)
chr1 (147-303)||(6068290-6068447)
chr1 (144-237)||(38747052-38747144)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (19-303)||(6360123-6360407)
chr7 (18-303)||(2389955-2390240)
chr7 (18-303)||(4512600-4512884)
chr7 (18-303)||(6431644-6431929)
chr7 (18-303)||(29608414-29608694)
chr7 (18-303)||(34310926-34311212)
chr7 (18-303)||(2361182-2361466)
chr7 (18-303)||(48599544-48599819)
chr7 (18-303)||(4508916-4509192)
chr7 (18-303)||(4510758-4511034)
chr7 (18-300)||(3258671-3258952)
chr7 (19-303)||(22269647-22269929)
chr7 (18-303)||(22328608-22328895)
chr7 (18-189)||(8359527-8359699)
chr7 (161-303)||(32358189-32358331)
chr7 (59-303)||(5116307-5116551)
chr7 (240-303)||(30814438-30814501)
chr7 (161-268)||(22552791-22552897)
chr7 (18-132)||(1360364-1360478)
chr7 (19-159)||(23794039-23794176)
chr7 (60-235)||(43363667-43363839)
chr7 (17-98)||(37545120-37545199)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (18-303)||(3808919-3809204)
chr6 (18-303)||(5043301-5043585)
chr6 (18-302)||(17762661-17762947)
chr6 (18-303)||(2973149-2973435)
chr6 (18-295)||(21593347-21593622)
chr6 (18-278)||(603290-603550)
chr6 (18-303)||(26830334-26830619)
chr6 (18-303)||(22425038-22425321)
chr6 (65-269)||(17757789-17757995)
chr6 (112-303)||(26800443-26800634)
chr6 (84-303)||(25072858-25073076)
chr6 (18-138)||(5741001-5741120)
chr6 (18-80)||(25073463-25073525)
chr6 (19-132)||(11660452-11660562)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (18-303)||(7001-7285)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (18-303)||(11383659-11383944)
chr8 (18-303)||(42435201-42435486)
chr8 (18-303)||(44353468-44353750)
chr8 (18-294)||(40221427-40221703)
chr8 (18-279)||(40328476-40328737)
chr8 (18-303)||(4283219-4283482)
chr8 (120-303)||(22976207-22976389)
chr8 (111-303)||(2999823-3000016)
chr8 (30-303)||(40585397-40585669)
chr8 (18-131)||(18655246-18655358)
chr8 (87-280)||(9633816-9634007)
chr8 (17-303)||(3846031-3846313)
chr8 (113-290)||(40535538-40535713)
chr8 (128-274)||(11136843-11136989)
chr8 (116-303)||(3817641-3817829)
chr8 (207-303)||(20686456-20686552)
chr8 (22-153)||(10020272-10020398)
chr8 (51-132)||(33655548-33655628)
chr8 (197-266)||(10020150-10020219)
chr8 (17-72)||(10240061-10240114)
chr8 (19-132)||(10101365-10101475)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (22-303)||(11231-11512)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (18-303)||(80493-80778)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (18-303)||(18213-18495)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (22-309)||(490661-490946)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (19-303)||(1609-1901)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34491171 - 34490886
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491171 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 34491072  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34491071 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatgaatcttctccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggtt 34490972  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34490971 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 34490886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 6095809 - 6096091
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095809 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 6095908  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6095909 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcaaaagagccccctcttttggtt 6096008  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcct 300  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6096009 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcct 6096091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 49199680 - 49199966
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactca-c 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49199680 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaac 49199779  T
Q  117 ccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  49199780 ccaagttgctcacaaaagactctccactcatatgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggt 49199879  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49199880 tctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 49199966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30236083 - 30235798
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30236083 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagccttcgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 30235984  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30235983 caacttgctcacaaatgactctccactcttgtgttttccaaccccatgaatattccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggtt 30235884  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30235883 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 30235798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40913297 - 40913011
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40913297 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttaacctttaatttcactaaggatcttctcttttgctttcacaagactcacc 40913198  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctcc-aaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40913197 caatttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggt 40913098  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40913097 tctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctaaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttg 40913011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4569909 - 4569624
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4569909 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaagatcatctcttttggtttcacaagactcacc 4569810  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  4569809 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaataggcacacccccttttcccaagagccccctcttttgatt 4569710  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4569709 ctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 4569624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 43402032 - 43402285
Alignment:
Q  50 aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgt 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43402032 aaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagacttacccaagttgttcacaaatgattctccactcatgt 43402131  T
Q  150 gtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacct 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  43402132 gtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacct 43402231  T
Q  250 cacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43402232 cacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 43402285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47304208 - 47303925
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  47304208 aattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtttttgatttcactaaggatattctcttttggttttacaagactcacct 47304109  T
Q  119 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttc 218  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47304108 aagttgctcacaaaa-actctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttc 47304010  T
Q  219 tccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47304009 tccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaacatttagtatctaaaaccataaaagttctctcctttg 47303925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36018809 - 36018523
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018809 caattgtttcccaactctagaatctaaaccccaaaagagaaccaatccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 36018710  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  36018709 caagttgctcacaaatgactctccattcatgtgtttcccatccccatggatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaaaagctccctcttttggtt 36018610  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  36018609 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctgaaagttctctcctttg 36018523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54593662 - 54593377
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  54593662 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaac-aacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcact 54593564  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  54593563 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatgaatcttccccaaaaggtaccaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 54593464  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  54593463 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcctttg 54593377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 43403975 - 43404228
Alignment:
Q  50 aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgt 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43403975 aaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcccaaatgactctccactcatgt 43404074  T
Q  150 gtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacct 249  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43404075 gttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacct 43404174  T
Q  250 cacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43404175 cacccaaagaccctcaacttttagtatctaaaaccctaaaagttccctcatttg 43404228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46860430 - 46860143
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccct--tagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactca 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46860430 caattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctcttagtctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactca 46860332  T
Q  116 cccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttgg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46860331 cccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccatccctatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttgg 46860232  T
Q  216 ttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  46860231 ttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttctctcatttg 46860143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 41819734 - 41820016
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  41819734 caattatttcccaactctagaatctaaccgctaaaagagaaccaacccttagc-tttgatttcataaag-atcttctcttttggtttcataagactcact 41819831  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41819832 caagttgctcacaaatgagtctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttc-ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 41819930  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41819931 ctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaacctaaaagttatctcctttg 41820016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 55302175 - 55302460
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55302175 caattgtttcccaactctataatctaacctacaaaagagaaccaacccctagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcact 55302274  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  55302275 caagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaacctcatgaatttttcccaaaaggcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggtt 55302374  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  55302375 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacttttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttg 55302460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 5434088 - 5434374
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5434088 caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaatcaatctttagtctttgattacat-aaggatcttctcttttggtttcccaagactcacc 5434186  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5434187 caacttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctctccctaaaaaacactaacccttttcccaagagccccctcttttggt 5434286  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||  |||| | |||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  5434287 tctataagatttacatcttgaagctttaaacctccctcaaagacccttaacttttggtatctaaatatcctaaaagttccctcctttg 5434374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28074488 - 28074290
Alignment:
Q  104 tcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagc 203  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| |||||||    
T  28074488 tcacaagactcacctaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccccatgaatcttccccaaaacgcaccaac-tatttcccaagagc 28074390  T
Q  204 cccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28074389 cccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttg 28074290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1683440 - 1683184
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1683440 tgtttcccaactctagattctaacc-ccaaaagataaccaacccttagcctttgatttt-ctaaggatcttctcttttggtctcacaagactcaccaaag 1683343  T
Q  122 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctc 220  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| |||||||||  ||||  || | ||  ||||||||||||||    
T  1683342 ttgctcataaatgattatccactcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcccaaaatgcaccaacc-ctttccgaaaaaccttctcttttggttctc 1683244  T
Q  221 caagactcacatcttgaaac-ttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 280  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1683243 caagattcacat-ttgaaacatttgaatctcacccaaagaccctcaacctttagtttctaa 1683184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34795819 - 34795542
Alignment:
Q  24 tttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagtt 123  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34795819 tttcccaactttagaatttaaccac-aaaagagaaccatcccttagcctttgatttt-ctaaggatcttctcttttggtctcccaagactcacccaagtt 34795722  T
Q  124 gctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctcca 222  Q
     || |||||  |||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||  || |  | || | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  34795721 tcttacaaa-aactctcctttgatgtgtatcccaaccccatgaatctctcctcaaaaggcatgaaac-ctctccctagaaccccctcttctggttctcca 34795624  T
Q  223 agactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34795623 agattcagatcttgaagctttgaacatcacccaacgaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaagatctctcctttg 34795542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 26323821 - 26323985
Alignment:
Q  116 cccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctcc--aaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctctttt 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| || |  |||| ||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||    
T  26323821 cccaagttgctcacaaa-gactctcctttgatgtgtttctcaaccccatgaatct-ctgctgaaaatgcaccaaccctttcc-caatagccctctctttt 26323917  T
Q  214 ggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 281  Q
    | |||| ||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26323918 gattcttcaagatttacatcttgaagctttgaacttcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa 26323985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36796304 - 36796079
Alignment:
Q  84 aaggatcttctcttttggtttcac-aagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaagg 181  Q
    |||||||| | |||||||||||   |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||      
T  36796304 aaggatctacacttttggtttccttaagattcacccaagttgctaaccaatgactctccactcttgtgtctcccgaccccgtgaatctctccccaaaatc 36796205  T
Q  182 caccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctcca----agactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 277  Q
     ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    ||  | |||||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| ||    
T  36796204 aaccgacctttttca-aagagtcccctcttttggttcttcaaaagaggtttacatcttgaagctttgaacctcatctaaagaccttcaacctttagtttc 36796106  T
Q  278 taa-aaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||   ||||||||||| |||||||||    
T  36796105 taagttccctaaaagttatctcctttg 36796079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39127503 - 39127236
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| || ||||           
T  39127503 caattgtttccaaactctagaatttaaccac-aaaagagaactaacccttagcctttgatttc-ctaagggtattctcttttggtctctcaag------- 39127413  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
        |||| |||||| |||||     | ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||  | ||| |||||| ||||| |||| ||    
T  39127412 ----ttgcccacaaa-gactcatatttgatgtgtttcccaacctcatgaatctctcccaaaaaggcaccaactctcttc-caagagtcccctattttagt 39127319  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcc 299  Q
    |||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39127318 tctctaagattcatatcttgaagctttgaacctca-ccaaaggccccaaacctttagtatgtaaataccctaaaagttctctcc 39127236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 26323286 - 26323385
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||| || |||||||||||    
T  26323286 caattgtttcccaactctaaaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttttgatttc-ctaaggatattcttttttggtctcccaagactcacc 26323384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20937613 - 20937440
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20937613 caattatttctcaactctagaatctactc-ccaaaagagaaccaacctttatcctttgatttc-ctaagaatcttctcttttggtctcccaagaatcacc 20937516  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttt 193  Q
    ||||||  ||||||| ||||| |   | ||||||||  ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  20937515 caagtttgtcacaaa-gactcccttttgatgtgtttttcaaccacatgaatctctcctcaaaaggcaccaacctttt 20937440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 235
Target Start/End: Original strand, 31340448 - 31340503
Alignment:
Q  180 ggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatctt 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31340448 ggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatctt 31340503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 35138918 - 35139209
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg-atttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcac 116  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||  ||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||     
T  35138918 caattgtttcc-aactttaaaatttaacc-ccaaaagagaattaacccttagcttttttatttc-ctaaggatcttctattttggtctcccaagactcat 35139014  T
Q  117 ccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccc-cctcttttg 214  Q
     ||||||||||| ||| |||||||   | || ||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||  ||||  |||| |||   |||||||    
T  35139015 tcaagttgctcataaa-gactctcatttgatttgttttccaacctcatgaatctctcctcaaaaggcatcaacc-ctttccgaagaacccatttcttttg 35139112  T
Q  215 gttctccaagactcacatct------tgaaactttt-aacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||||| ||||||||      | ||| |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  35139113 gttctccaagattcacatcttacatcttaaagttttgaacctcatctaaagaccctcaacgtttagtatctaaatacccaaaaagtaccctcctttg 35139209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 303
Target Start/End: Original strand, 31340501 - 31340536
Alignment:
Q  268 ctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340501 ctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 31340536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Original strand, 31340411 - 31340457
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacc 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||    
T  31340411 caattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagggcaccaacc 31340457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 36796749 - 36796692
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc 80  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  36796749 tgtttcccaactcttgaatctaaccctcaaaagt-aatcaacccttagcctttgatttc 36796692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 132
Target Start/End: Original strand, 50432840 - 50432898
Alignment:
Q  74 tgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaa 132  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  50432840 tgatttcactaaggatctccttttttggtctctcaagattcaaccaagttgctcacaaa 50432898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38746963 - 38746678
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746963 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcaataaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 38746864  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  38746863 caagttgctcgcaaatgactctccactcacgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcttaagagccccctcttttggtt 38746764  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746763 ctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 38746678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40147219 - 40146944
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147219 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 40147120  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40147119 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggtt 40147020  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtt 293  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147019 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtt 40146944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27015490 - 27015205
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27015490 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcacc 27015391  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27015390 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgattcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggtt 27015291  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    || ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27015290 cttcaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 27015205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 213423 - 213141
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213423 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaacc----cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 213328  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  213327 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 213228  T
Q  218 ct-ccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    || |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  213227 ctcccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 213141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5058005 - 5057721
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5058005 caattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgattttactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcc 5057906  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  5057905 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacctttttcccaaaag-cccctcttttggtt 5057807  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5057806 ctcaaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 5057721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28278274 - 28277989
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28278274 caattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagagagccaacccttagcatttgatttcactaacaatcttctcttttgatttcacaagactcacc 28278175  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagc-cccctcttttggt 216  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28278174 caagttgctcacaatagtctctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggt 28278075  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctccttt 302  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28278074 tctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctccttt 28277989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 27637824 - 27638109
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctc--ttttggtttcacaagactca 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27637824 caattgtttcccaactctagcatctaacccccaaaagagaacaaacttttagtctttgatttcactaaggatcttctctcttttggtttcacaagactca 27637923  T
Q  116 cccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttgg 215  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  27637924 cccaagttgctcataaaagactcttcactcatgtgtttcctaaccccatgaatcttc-ccaaaatgcaccaacccttttcccaagagctccctcttttgg 27638022  T
Q  216 ttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27638023 ttctccaagattcacatcttg-aactttgaacctcacccaaagattctcaacctttagtatctaaaaccttaaaagttccctcctttg 27638109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 316720 - 316439
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  316720 caattgttttccaactttaaaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcct--aggattttctcttttggtctcccaagattcacc 316623  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
     |||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||    
T  316622 -aagttgctcacaaa-gactctcttttgatgtgtttcccaaccttatgaatctctccccaaaaggcaccaaccctctcc-caagagcccccccttttggt 316526  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagttctctccttt 302  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  316525 tctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaagtacaataaaagttctctccttt 316439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4160589 - 4160307
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4160589 caattgtttctcaactct-gaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttaattac-ctaaggatcttctcttttggtttcccaagattcacc 4160492  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| || ||||||| |||  |||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  4160491 ctagttgctcacaaatgactctccacttacgtg-ttcccaaccctatgaatctctccccaaaagacacttacc-ctctcccaagagccccctcttttagt 4160394  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  4160393 tctccaggattcacttctttaaactttgaacatcacccaaa-accctcaaactttagtatctaaataccctaaatgttctctcatttg 4160307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Original strand, 14689622 - 14689902
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| || ||||||| | |    
T  14689622 caattgtttcacaactctagaatctatcc-ccaaaagagaaccaacccctagcctttgatttt-ctaaggatcttttcttttggtgtcccaagacttatc 14689719  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
     ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  14689720 taagttgctcacaaat-actctccttttatgtgtttcccattctcacgaatct-ctccaaaaggcaccaacccttt-cacaagaaccccttcttttggtt 14689816  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctccttt 302  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14689817 ctccaaaattcacatcttgaaactttgaacatcactcaaagacccttaaccttcactatctaaatgccctaaaagttttctccttt 14689902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35616125 - 35615854
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||  || | |||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  35616125 aattgtttccaaactctagaatctaaccac-aaaagagaatcaactct-agcctttgatttcttgatg-atcttcgcttttggtttcccaagactcacca 35616029  T
Q  119 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||| | ||||| |||||| |  | ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| || || ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  35616028 aagttgattacaaa-gactcttcttttatgtgtttctcaactccatgaatctctccccaaaaggcatcacccctttcc-caagagtcccctcttttggtt 35615931  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtt 293  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  35615930 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaatactctaaaagtt 35615854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 271
Target Start/End: Original strand, 33906288 - 33906491
Alignment:
Q  66 ttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatg 165  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  33906288 ttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcactaa-gtctctcctttgatgtgtttctcaaccccatg 33906385  T
Q  166 aatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctc 264  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  33906386 aatctctccccaaaaggcaccaacc-ctctcccaagagcccccttttttggttctacaagattcacattttgaggcttcgaacctcactcaaagaccctc 33906484  T
Q  265 aaccttt 271  Q
    |||||||    
T  33906485 aaccttt 33906491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 138 - 303
Target Start/End: Original strand, 16642208 - 16642372
Alignment:
Q  138 ctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttg 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  16642208 ctccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctgtccccaaaaggcaccaaccctttcc-caagagccc--tcttttggttcttcaagattcacttcttg 16642304  T
Q  237 aaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16642305 aagctttgaacctcacccaaagaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaagtgctctcctttg 16642372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 277
Target Start/End: Original strand, 10055031 - 10055175
Alignment:
Q  133 tgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcaca 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10055031 tgactctctactcatgtgtttcccaaccccgtgaatctctccccataaggcaccaaacctttcc-caagagccctctcttttggttctccaagattcaca 10055129  T
Q  232 tcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 277  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  10055130 tcttgaagctttgaatctcacccaaaaaccttcaatctttagtatc 10055175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30793080 - 30792923
Alignment:
Q  135 actctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatc 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||| |||| | | |||||||||||||||| | |||||    
T  30793080 actctctactcatgtgtttcccaaccccatgaatatctccccaaaaggcaccaaccttttcc-caa-agccacatattttggttctccaaga-taacatc 30792984  T
Q  234 ttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtt 293  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30792983 ttgaagctttgaacatcacctaaagaccctcaacctttagtatctaattaccctaaaagtt 30792923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30802782 - 30802614
Alignment:
Q  135 actctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatc 233  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||    
T  30802782 actctccactcatgtgttttctaaccccatgaatctctccccaaaaggcacaaacc-ctttcccaagagcctcctcttttggttctctaaga-taacatc 30802685  T
Q  234 ttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
     |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  30802684 atgaagctttgaacctcacctaaagaccctcaacctagaatatctaaataccctaaaagttccctcatttg 30802614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 137
Target Start/End: Original strand, 16641155 - 16641269
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16641155 tgttccccaactctagaatctaatccccaaaagagaaccaacctttagcctttgattt-tttaagtatcttctcttttggtttcacaagactcaccaaag 16641253  T
Q  122 ttgctcacaaatgact 137  Q
    ||| |||||| |||||    
T  16641254 ttgttcacaattgact 16641269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 21205873 - 21206076
Alignment:
Q  28 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctc 127  Q
    ||||||| | |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  || | |||||||| || ||     
T  21205873 ccaactccataatctaaccctcaaaagagaaccaatccttagtctttgatttcat-aaggttcttcacttttagtttcctaaaattcacccaaatttctg 21205971  T
Q  128 acaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctcc--aaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaaga 225  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||| |||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  21205972 acaaatgactcctcactcatgtgtttcccaaccctatgaa-cctctccgaaaaagacaccaaccctttcca-aagaaccccatcttttggttctctaaga 21206069  T
Q  226 ctcacat 232  Q
     ||||||    
T  21206070 ttcacat 21206076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8019542 - 8019464
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttg 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  8019542 aattatttcccaactatagaatctaacccccaaaa-ataaccaa-ccttagcctttgattt-tctaaggatcttcacttttg 8019464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 33906578 - 33906627
Alignment:
Q  255 aaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33906578 aaagaacctcaacctttaatatctaaataccctaaaagttctcttctttg 33906627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26364222 - 26363942
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364222 aattgtttcccaactctaaaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 26364123  T
Q  119 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364122 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggccccaacccttttcacaagagccccctcttttggttc 26364023  T
Q  219 tccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcc 299  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26364022 tccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaggccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcc 26363942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54882978 - 54882693
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54882978 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacgagactcacc 54882879  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54882878 caagtttctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggtt 54882779  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54882778 ctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 54882693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 55085575 - 55085861
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55085575 caattgtttccgaactctagaatctaacccccaaaggagaatcaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaca 55085674  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  55085675 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggtt 55085774  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaa-cttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55085775 ctccaagatttacatcttgaaagcttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 55085861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8665365 - 8665080
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665365 caattgtttcccaactccagaatctaacccccaaaagaaaaccaacacataacctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 8665266  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8665265 caagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 8665166  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665165 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 8665080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6655914 - 6655629
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6655914 caattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttgattttactaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacc 6655815  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  6655814 caagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggtt 6655715  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6655714 ctccaagattcacatcttaaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 6655629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 50674056 - 50674341
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50674056 caattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 50674155  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  50674156 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccataaggcaccaacccttttcattagagccccctcttttggtt 50674255  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50674256 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacccttaacatttagtatttaaaaccctaaaagttccctcctttg 50674341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 50262908 - 50263193
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50262908 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaagggtcttctcttttggtttcacaagagtcacc 50263007  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  50263008 gaggttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttttccaagagccccctcttttggtt 50263107  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50263108 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtgtctaaaaccctaaaagttccctcctttg 50263193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 379336 - 379051
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  379336 caattgtttcccaactctagaatctaacccacaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacc 379238  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  379237 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccattctcatgaatcttccccaaaaggcaccgacccttttcacaagagccccctcttttggtt 379138  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  379137 ctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagtccctcaacctttagtatctacaaatcctaaaagttctctcctttg 379051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12073350 - 12073066
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12073350 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacc 12073251  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaa-cctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12073250 caagttgctcacaaaagactcttcactcatgtgttttccaaccccatgaatcttc-ccaaaaggcaccaaccctttttcccaagag-cccctcttttggt 12073153  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12073152 tctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttg 12073066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41964372 - 41964089
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964372 caattgtttcccaactctagaatctaacc-ccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 41964274  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41964273 caagttgctcacaaaagactctctactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaag--actaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 41964176  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  41964175 ctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcctttg 41964089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35662398 - 35662115
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35662398 caattgtttcccaactctagaatctaacacccaaaagagaaccaacccttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 35662301  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  35662300 caagttgctcacaaagaactctccattcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggtt 35662201  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  35662200 ctccaagattcacatattgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtatctaaaatcctaaaagttctctcatttg 35662115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46703457 - 46703174
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46703457 caattgtttcccaacactataatctaacccccaaaagagaaccaacttttagcctttgatttc-ctaaggattttctcttttggtttcacaagactcacc 46703359  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  46703358 caagttgctgacaaaagactctccattcatgt-tttcccatccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttgatt 46703260  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46703259 ctcgaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 46703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33989816 - 33989535
Alignment:
Q  21 ttgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33989816 ttgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaacaaatccttagcctttgattac-ctaaggatcttctcttttggtttcaaaagactcacccaa 33989718  T
Q  121 gttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||     
T  33989717 gttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaatcccatgaatctctcccaaaaggcaccaacc-ttctcccaagagccccctattttggttctt 33989619  T
Q  221 caagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  33989618 caagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactttagtatctaaataccctaaaagttatctgctttg 33989535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 84 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40630876 - 40630667
Alignment:
Q  84 aaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggca 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40630876 aaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggca 40630777  T
Q  184 ccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaac 283  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40630776 ccaacccttttcacaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaac 40630677  T
Q  284 cctaaaagtt 293  Q
    ||||||||||    
T  40630676 cctaaaagtt 40630667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 27417171 - 27417446
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27417171 caattgtttcaaaactcaagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttcactaaggatcttcttttttggttttacaagactcacc 27417270  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||          || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27417271 caa----------aaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagacaccaacccctttcccaagagccccttcttttggtt 27417360  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27417361 ctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 27417446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2209671 - 2209378
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  2209671 caattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgct 2209572  T
Q  118 caagttgctcacaaa-----tgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttt 212  Q
     |       | || |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||    
T  2209571 gagaaccaacccatagcctttgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcgtt 2209472  T
Q  213 tggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttgctt 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2209471 tggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcatttgctt 2209378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8648093 - 8647861
Alignment:
Q  21 ttgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaa 120  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8648093 ttgtttcctaactccagaatctaacccccaaaagagaaccaacacataacatttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaa 8647994  T
Q  121 gttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctc 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8647993 gttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctc 8647894  T
Q  221 caagactcacatcttgaaacttttaacctcacc 253  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8647893 caagattcacatcttgaagctttgaacctcacc 8647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 84 - 303
Target Start/End: Original strand, 46569822 - 46570041
Alignment:
Q  84 aaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggca 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46569822 aaggaccttctcttttggtttcataagattcacctaagttgttcacaaaagactttccactcatttgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaaggca 46569921  T
Q  184 ccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaac 283  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46569922 ccaatccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacctaaagaccttcaacatttagtatctaaaac 46570021  T
Q  284 cctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  46570022 cctaaaatttccctcctttg 46570041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33089841 - 33089582
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||           |||||    
T  33089841 tgtttcccaactctataatctaacctccaaaagagaaccaacctttagcctttgatttt-ctaaggatcttctcttttggtctc-----------ccaag 33089754  T
Q  122 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||| |||||    
T  33089753 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcgaccccatgaatctctctccaaaagacaccaaccctctcc-caagagccccctcttttgattctc 33089655  T
Q  221 caagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtt 293  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  33089654 caagattcacatcttcaaactttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaatacctaaaagtt 33089582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8653385 - 8653273
Alignment:
Q  191 ttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653385 ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 8653286  T
Q  291 gttctctcctttg 303  Q
    |||||||||||||    
T  8653285 gttctctcctttg 8653273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Original strand, 35370553 - 35370833
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||||||    
T  35370553 tgtttcccaattctataatctaact-ccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcccaaag-atcttctattttggtatccatagactcacccaag 35370650  T
Q  122 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctctttt-ggttct 219  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||| |||  ||||| ||||||||| | || |||||| ||||||| | | | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  35370651 ttgcttacaaa-gactctcctttgatgtttttatcaacctcatgaatctctttcgaaaagggaccaaccctctcc-caagaaccccctcttttaggttct 35370748  T
Q  220 ccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  35370749 ccaagattcacatcttaaagctttgaacctctcccaaagaccctcaacctttagtatctaaataccttaaaagttccctcctttg 35370833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 22882964 - 22883248
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccacc-aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  22882964 aattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttgatttt-ctaaggatcttctcttttggtctcctaagactcgcc 22883062  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
    ||| ||||||||||| |||||||   | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | || ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  22883063 caaattgctcacaaa-gactctcatttgatgtgtttcctaaccctatgagtctctctccaaaaggtatcagcc-ctctcccaagagccccctctttttgt 22883160  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  22883161 tctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaataccctaaaatttccctcatttg 22883248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 22934628 - 22934912
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccacc-aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  22934628 aattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttgatttt-ctaaggatcttctcttttggtctcctaagactcgcc 22934726  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
    ||| ||||||||||| |||||||   | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | || ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  22934727 caaattgctcacaaa-gactctcatttgatgtgtttcctaaccctatgagtctctctccaaaaggtatcagcc-ctctcccaagagccccctctttttgt 22934824  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  22934825 tctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaataccctaaaatttccctcatttg 22934912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12119495 - 12119281
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12119495 caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttaac-ttcgatttctt-aaggatcttctcttttggtttcacaagacacacc 12119398  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||||  |||| ||||||  |||| ||||  ||    
T  12119397 caaattgctcacaaatgattcaccactaatgtgtttcgcaaccccatgaatcttcccaaaagggaaccaacc-ctttcccaagagttcccttttttaatt 12119299  T
Q  218 ctccaagactcacatctt 235  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  12119298 ctccaagattcatatctt 12119281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3786034 - 3785790
Alignment:
Q  30 aactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcac 129  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  3786034 aactctagaatctaccc-ccaaaagagaaccaactcttagcctttgatttc-ctaaggatattctcttttggtctcccaagactcgcacaatttgctcac 3785937  T
Q  130 aaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactc 228  Q
    ||| ||||||||  | | ||||| | | ||||||| | ||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3785936 aaa-gactctcctttgaagtgttcctcgaccccataattctctcctcaaaaggcaccaacccttttc-caagagccccctcttttggttcttcaagattc 3785839  T
Q  229 acatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 277  Q
    |||||||||| |||| || ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  3785838 acatcttgaagctttgaatctcgcctaaagactctcaacctttagtatc 3785790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10071693 - 10071558
Alignment:
Q  167 atcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaa 266  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10071693 atcttctccaaaaa-catcaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaa 10071595  T
Q  267 cctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10071594 cctttagtatctaaaaccttaaaagttccctcctttg 10071558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 281
Target Start/End: Original strand, 35369652 - 35369912
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||| ||||| | ||   |||||||||    
T  35369652 caattgtttcccaattctataatccaacc-ccaaaagagaaccaacccttagcctttgattccc--aaagatcttctattttgctatccatagactcacc 35369748  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctctttt-gg 215  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||   | |||||||||  |||| ||||||||| | || |||||| ||||||| | | | ||||| ||||||||||| ||    
T  35369749 caagttgcttacaaa-gactatcttttgatgtgtttctaaacctcatgaatctctttcgaaaagggaccaaccctctcc-caagaaccccctcttttagg 35369846  T
Q  216 ttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 281  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35369847 ttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 35369912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10072065 - 10071963
Alignment:
Q  182 caccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10072065 caccaacccttttcacaagagccccctcttttagttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 10071966  T
Q  282 acc 284  Q
    |||    
T  10071965 acc 10071963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41961368 - 41961110
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||| || |||||||||||    
T  41961368 caattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttttgatttc-ctaaggatattcttttttggtctcccaagactcacc 41961270  T
Q  118 caagtt-----gctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctctt 211  Q
    ||||||     ||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||| | | | |||||||||| ||    
T  41961269 caagttacgttgctcacata-gactctcctttaatgtgtttcccaaccc-atgaatctctccccaaaaagcaccgaccttctcc-ctagagccccctttt 41961173  T
Q  212 ttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcaccc-aaagaccctcaacctttag 273  Q
    | |||||| ||||| |||||| | || ||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41961172 tcggttctacaagattcacatttggacactttgaatctcaccccaaagaccctcaccctttag 41961110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 281
Target Start/End: Original strand, 26699656 - 26699920
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  || |||| |||||||| ||||   |||||||| |    
T  26699656 caattgtttcccaactttataatctaacccctaaaagagaaccaacctttaacctttgattaca-taaagatcatctcttttagttttctaagactcatc 26699754  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctc-caaaaggcaccaacctttttcacaagagccccc-tcttttgg 215  Q
      ||||| |||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || |||||    
T  26699755 tgagttgttcactaatgaatctccactcatgtatctcccgaccccatgaatctcttctgaaaaggcaccaaccctttttccaagatcccccttcatttgg 26699854  T
Q  216 ttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 281  Q
     |||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26699855 ctctctaagattcacatcttgaagttttgaacctcaaccaaagatcttcaacctttagtatctaaa 26699920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34112539 - 34112314
Alignment:
Q  48 ccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcat 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34112539 ccaaaagagaaccaaactttagcctttgatttc-ctaaggatcttcagttttgtttttccaagattcatccaagttgctcacagatgactctccactcat 34112441  T
Q  148 gtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaa 246  Q
    |||||| |||||||| |||| || || |||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||  | || | ||| ||    
T  34112440 gtgttttccaaccccgtgaacctctccccaaaaggcaccaacccttttc-taagagcctcgtctttaggttatccaagattcacaattggacattttgaa 34112342  T
Q  247 cctcacccaaagaccctcaacctttagt 274  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34112341 tctcacacaaagaccctcaatctttagt 34112314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 302
Target Start/End: Original strand, 38811404 - 38811573
Alignment:
Q  133 tgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcaca 231  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  38811404 tgactctccacttatgtgtttcctaacctcatgaatctctccgcaaaagacaccaaccctttcc-caagagcccc-tctttgggttctccaagattcaca 38811501  T
Q  232 tcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagttctctccttt 302  Q
    |||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  38811502 tcttaaagctttgaacctcacccaaataccctcaacctttagtatctaagtaccctaaaagttccctccttt 38811573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 22629104 - 22629361
Alignment:
Q  17 tcaattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | || |     ||||||||||||||  | ||||||||| | | ||||| || ||||| ||||    
T  22629104 tcaattgtttcccaactctagaatctaacaaaaaaaaaaaaaac-----ttagcctttgatttt-ctaaggatcttttatgttggtctcccaagattcac 22629197  T
Q  117 ccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaat--cttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttg 214  Q
     ||| ||||||| | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||| |||| ||||  ||| |  | ||| |||||    
T  22629198 tcaaattgctcagagat-actctcctctcatgtgtttctcaaccccataaatatcttc-ccaaaaggcactaaccattttt-caatattctcctattttg 22629294  T
Q  215 gttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||| |||| || |||||||||| ||||||    
T  22629295 gttctccaagattcacatcttgaacttttaaatctcacccagagacactgaacctttagtttctaaa 22629361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 25723433 - 25723658
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    || || |||||||| |   |||| |||||||||| ||| |  ||| ||||||      
T  25723433 aattgttttccatctctagaatctaacacccaaaagagaacc----ctcagtctttgattactt-aagggtcttctctttcggtctaccaaaactcactt 25723527  T
Q  119 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||   | |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  25723528 aagttgttcacaaa-gactctcttttgatgtgtttcccaaccccacgaagctctctccaaaaggcattaaccattatc-caagagctccctcttttggtt 25723625  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctc 250  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| ||||||    
T  25723626 ctccaagattcacattttgaagctttgaacctc 25723658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 40632403 - 40632334
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaagg 87  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  40632403 caattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttaacatttgatttcactaagg 40632334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32091436 - 32091324
Alignment:
Q  17 tcaattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcac 116  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||| | |||| || ||| ||| ||    
T  32091436 tcaattgtttccaaactttagaatcttacc-ccaaaaaagaaccaacactttgcctttgatttc-ctaaggatcttctcctctggtctcccaaaacttac 32091339  T
Q  117 ccaagttgctcacaa 131  Q
    |||||||| ||||||    
T  32091338 ccaagttgttcacaa 32091324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 303
Target Start/End: Original strand, 47514885 - 47514997
Alignment:
Q  192 tttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaa 290  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||    
T  47514885 tttcccaagagtccactcttttggttcaccaagattcatatcttgaagctttgaacttcacccgaagaccttcaacctttagtgtttaagtaccctaaaa 47514984  T
Q  291 gttctctcctttg 303  Q
    |||| ||| ||||    
T  47514985 gttcactcatttg 47514997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 235
Target Start/End: Original strand, 6200140 - 6200291
Alignment:
Q  84 aaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggc 182  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||  || |||||||  |||||||||||| ||||||||   |||| || ||||||||     
T  6200140 aaggatcttctcttttggtatctcaagattcatccaaattgctca-taaggactctcatctcatgtgtttctcaaccccacatatctctccccaaaagga 6200238  T
Q  183 accaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatctt 235  Q
    ||| | || | || ||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  6200239 acccaactctgtcccaagagctccatcttttagttctccaagatacacatctt 6200291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 41639384 - 41639345
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagaga 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41639384 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 41639345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32091326 - 32091265
Alignment:
Q  221 caagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaa 282  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32091326 caagattcacatcttgaagttttgaacctcactcaaagaccctcaacatttagtatccaaaa 32091265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6719355 - 6719259
Alignment:
Q  207 ctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagttctctccttt 302  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| |||||||||||  |||||    |||||||||||||||||||    
T  6719355 ctcttttagttttccaagattcacatcttgaacctttgaatctcaccctaaaaccttcaacctttagcctctaagttgcctaaaagttctctccttt 6719259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 1631942 - 1632227
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631942 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 1632041  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1632042 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagacaccaacccttttcacaagagccccctcttttggtt 1632141  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    | |||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1632142 ccccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 1632227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 42288320 - 42288604
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288320 caattgtttcccaactctagaatctaaacccgaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 42288419  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42288420 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttc-ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 42288518  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42288519 cttcaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcatttg 42288604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 35447094 - 35447379
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35447094 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggttttacaagactcacc 35447193  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35447194 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaaggcaccaacccttttcacaagag-cccctcttttggtt 35447292  T
Q  218 ctc-caagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35447293 ctctcaagactcacatcttgaagctttgaacctcacacaaatactctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 35447379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45726887 - 45726603
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45726887 caattgtttcctaaccctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacatgactcacc 45726788  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  45726787 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacc-ctttcccaagagctccctcttttggtt 45726689  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45726688 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcatttg 45726603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17450544 - 17450264
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17450544 tgtttgccaactctagaatccaacccccaatagagaatcaacccttagcctttgatttc-ctaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 17450446  T
Q  122 ttgctcacaaatgactc-tccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctc 220  Q
    || ||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17450445 tttctcacaattgactccttcgctcatgtgtttcccatccccatgaatctttcacaaagggcaccaaccctttcc-caagagccccctcttttggttctc 17450347  T
Q  221 caagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17450346 caagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 17450264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33648118 - 33647841
Alignment:
Q  26 tcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||    
T  33648118 tcccaactctagaatctaacccccaaaagataattaacccttg--ctttgatttccctaaggatcttctcttttggttttataagactcgcctaagtagc 33648021  T
Q  126 tcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaag 224  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33648020 taacaaatgactctctactcatatgttttccaacctcgtgaatctctcctcaaaaggcaccaacccttttcccaagagcctcctcttttgattctccaag 33647921  T
Q  225 actcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33647920 attcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaatactctaaaagttctctcctttg 33647841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24398011 - 24397739
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24398011 caattgtttcccaactctataatctaacccccaaa---gaaccaacccttagc-tttgacttt-ctaaggatattctcttttggtttcacaagactaacc 24397917  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24397916 caaattggtcacaaatgactctccactcatgtgtttaccagcccgatgagtctctccctaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggt 24397817  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtt 293  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24397816 tctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacacaaagaccgtcaacctttagtatctaaataccctaaaagtt 24397739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7451158 - 7450975
Alignment:
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  7451158 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccataaatcttctccaaaagtcatcaaccctttaccaaagagccccctcttttggtt 7451059  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctccttt 302  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7451058 ctccaagattcacatcctgaagctttgaacctcacccaaagacgc-caacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctccttt 7450975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 309
Target Start/End: Original strand, 42261826 - 42262111
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || |||| ||||||||| | || ||| | |||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  42261826 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttc-ctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaag 42261923  T
Q  122 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctc 220  Q
    ||||||| |||  |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||    
T  42261924 ttgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctcca-aagagcccccttttttggttctc 42262021  T
Q  221 caagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttgcttctc 309  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| |||||    
T  42262022 caagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctc 42262111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Original strand, 30218250 - 30218529
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||| | |||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30218250 tgtttcccaactctagagcctaacccccaaaagagaaccaatatttagcttttgatttc-ctaaggatc-ccccttttggtttcgcaagactcactcaag 30218347  T
Q  122 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctc 220  Q
    ||||||||||| || |||||  |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | || ||  ||||| |  |||||||| ||    
T  30218348 ttgctcacaaa-gattctcctttggtgtgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcactaa-ctctctcccataagccctcatttttggttgtc 30218445  T
Q  221 caagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||| |||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30218446 caagattcacattttgatgttttgaacctcacccaaagaccctcaacatatagtatctaaataccctaaaagttccctcctttg 30218529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 43731093 - 43730992
Alignment:
Q  28 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctc 127  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  43731093 ccaactctagaatttaacc-ccaaaaga-aaccaacctttagactttgatttc-ctacggatattctattttggtttcccaagattcacccaaattgctc 43730997  T
Q  128 acaaa 132  Q
    |||||    
T  43730996 acaaa 43730992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 280
Target Start/End: Original strand, 40935546 - 40935651
Alignment:
Q  174 ccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttag 273  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||| | || ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40935546 ccaataggcaccaaccctttcc-caagagcctcatcttttggttctcctagattcacatttggacactttgaatctctcccaaaggccctcaacctttag 40935644  T
Q  274 tatctaa 280  Q
    | |||||    
T  40935645 tttctaa 40935651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16676134 - 16676031
Alignment:
Q  87 gatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctcc--aaaaggcac 184  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||| | || ||||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||    
T  16676134 gatcttctcttttggtctcccaagtttcaactaacttgctcagaaataactcttctctcatatgtttcccaaccaaatgaat-ttctccttaaaaggcac 16676036  T
Q  185 caacc 189  Q
    |||||    
T  16676035 caacc 16676031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 34811599 - 34811647
Alignment:
Q  176 aaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaaga 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  34811599 aaaaggcaccaacctttttc-caaaaaccccctcttttggttctctaaga 34811647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11348656 - 11348371
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348656 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 11348557  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11348556 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccagaccttttcccaagagccccctcttttggtt 11348457  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11348456 ctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacccttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttg 11348371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Original strand, 42298185 - 42298460
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298185 caattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttgatttcacttaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 42298284  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42298285 caagttgctcgcaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggtt 42298384  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtt 293  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298385 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtt 42298460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37168255 - 37167970
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37168255 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaacctttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagactcacc 37168156  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37168155 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 37168056  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  37168055 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaaactgtaaaagttccctcctttg 37167970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 37879121 - 37879406
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37879121 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacc 37879220  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37879221 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaattttccccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctctttttgtt 37879320  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  37879321 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagatcctcaacatttagtatctaaaaccctaacagttccttcctttg 37879406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 193569 - 193285
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  193569 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatc 193470  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  193469 caagttgctcacaaaagactcttcacacatgtgtttcccaaccccatgaatcttc-ccaaaaggcaccaaccttttccccaagagccccctcttttggtt 193371  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  193370 ctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcaccgaaagaccctcaacctttaatatctaaaaccctaaaagttatctcctttg 193285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 37033283 - 37033564
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37033283 caattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 37033382  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37033383 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaacctcatgaatcttcctcaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 37033482  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37033483 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag----taaaaccctaaaagttccctcctttg 37033564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 13547299 - 13547584
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13547299 caattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacc 13547398  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13547399 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaattttcctcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggtt 13547498  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13547499 atccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactctaaaagttctctcctttg 13547584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 13549210 - 13549495
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13549210 caattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacc 13549309  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13549310 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaattttcctcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggtt 13549409  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13549410 atccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactctaaaagttctctcctttg 13549495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29136205 - 29135921
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29136205 caattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaactaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 29136106  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29136105 caagttgctcacaaaaaactctccactcatgtttttcc-aaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcttttggtt 29136007  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29136006 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 29135921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34603533 - 34603249
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603533 caattgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 34603435  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34603434 caagttgctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggtt 34603335  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34603334 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccttcaacctttaatatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 34603249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 7482442 - 7482726
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7482442 caattgcttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacc 7482539  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagag-ccccctcttttggt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7482540 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggt 7482639  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7482640 tctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccgttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttg 7482726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28242346 - 28242061
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28242346 caattgttttccaactctagaatctaacccctaaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatattctcttttggtttcacaagactcacc 28242247  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28242246 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccttatgaatcttc-ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 28242148  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  28242147 ctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcctttg 28242061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47115129 - 47114845
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115129 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcattaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 47115030  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  47115029 caagttgctcacaaaagactctccattcatgtgtttcccaaccccatgaatcttc-ccaaaaggtaccaaccctgttcccaagagccccctcttttggtt 47114931  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  47114930 ctccaagattcacagcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttaatatctaaagccttaaaagttccctcctttg 47114845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 34602557 - 34602834
Alignment:
Q  25 ttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttg 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34602557 ttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttg 34602655  T
Q  125 ctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaag 224  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34602656 ctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttaccaagagctccctcttttggttctccaag 34602755  T
Q  225 actcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34602756 attcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccttcaacctttaatatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 34602834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 47255550 - 47255829
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47255550 caattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcact 47255649  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47255650 -aagttgctcacaaaagactctccaatcatgtgtttcccaaccc-atgaatcttccccaaaaggcacca----ttttcccaagagccccatcttttggtt 47255743  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47255744 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 47255829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19754448 - 19754164
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacg---aaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754448 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattatcctttgatttcacttataaggattttctcttttggtttcacaagactcaccc 19754349  T
Q  119 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttc 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  19754348 aagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctctcttggttt 19754249  T
Q  219 tccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||| ||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19754248 tccaagattcaaatcatggtgctttgaacctcacccaaagacccttaacctttagtatctagaaccctaaaagttccctcctttg 19754164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19752637 - 19752359
Alignment:
Q  24 tttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagtt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  19752637 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatctaagtt 19752538  T
Q  124 gctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaa 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19752537 gctcacaaaatactctccactcatgtgtttcccaactcaatgaatcttccccaaaaggcaccaacc-ttttcataagagccccatcttttggttctccaa 19752439  T
Q  224 gactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    || ||||||  |||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  19752438 gattcacattatgacgcttagaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaaaccctaaaaattccctcatttg 19752359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 31925926 - 31926099
Alignment:
Q  28 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctc 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31925926 ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagtctcacccaagttgctc 31926025  T
Q  128 acaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaaga 201  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31926026 acaaaagattctccactcacgtgtttcccaaacccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaaga 31926099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41135778 - 41135516
Alignment:
Q  17 tcaattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcac 116  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41135778 tcaaatgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcctttaatttc-caaatgatcttctcttttggtttcctaagactcac 41135680  T
Q  117 ccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttgg 215  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  | || ||| | |  ||||||||||    
T  41135679 ccaagtttctcacaaa-gactctcctttgatgtgtttcccaaccccatgaatctctccctaaaaggcaccaacc-ctctcccaaaatcttcctcttttgg 41135582  T
Q  216 ttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 281  Q
    ||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41135581 ttctccaagatccacatcttgaaggtttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 41135516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6808399 - 6808141
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |  | |||||||| ||  || ||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||    
T  6808399 tgtttctcaactctagaatctaacctcgaaa-gagaaccaaccttccgtctttgattacat-aatgatcttctcttttggttttccattactcaccctag 6808302  T
Q  122 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctc 220  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| || |||  | | || |||||||||  |||||||||||||    
T  6808301 ttgctcacaaatgactcttcattcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcccaaaagaca-caaaatctctc-caagagcccaatcttttggttctc 6808204  T
Q  221 caagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaaga-ccctcaacctttagtatctaaaa 282  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6808203 caagattcacatcttgaagttttgaacctcacctaaagacccctcaacctttagtatctaaaa 6808141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 281
Target Start/End: Original strand, 16216709 - 16216966
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||   ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||  ||| | |||| |    
T  16216709 aattgtttctcaactctagaatctaacc--ctaaactaaaccaactcgtagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttaagttttcaaaattcactc 16216805  T
Q  119 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| | | ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16216806 aagttgctcacaa-tgactctcctctcatgtgtttgccaacac-atgaatttctatccaaaatgcaccaacccttttcg-aagagccccctcttttggtt 16216902  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 281  Q
    || |||||   |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16216903 cttcaagatatacatcttgaacctttgaatatcacccaaagacccttaacctttagtttctaaa 16216966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22079278 - 22079039
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  22079278 caattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaa-caatccttagcctttgatttca-taagcatcttatattttggtttgccaagactcacc 22079181  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
     |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||           || ||||| | ||||||||  |  | |||  ||||||||||||||||    
T  22079180 taagttgctcacaaa-gactctcccttgatgtgtttcccaac-----------tccccaaacgacaccaacc-ctcacccaattgccccctcttttggtt 22079094  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaaccttta 272  Q
    ||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22079093 ctttaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaacttta 22079039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 276
Target Start/End: Original strand, 9109680 - 9109869
Alignment:
Q  87 gatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||   | |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| || |    
T  9109680 gatcttctattttgatttcccaagactcatccaaattgctcacaaaagactctcatttgatgtgtctcccaacctcatgaatctctccccaaaagacatc 9109779  T
Q  186 aacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtat 276  Q
    |||| | | | || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9109780 aaccctctcc-catgagtccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaataccctcaacctttagtat 9109869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 12318725 - 12318890
Alignment:
Q  51 aaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||  | |||||    
T  12318725 aaagagaaccaacccttagcctttgatttc-caaaagattttctattttggtctcccaagactcacccaagttgctcataaa-aactctcctttgatgtg 12318822  T
Q  151 tttcccaaccccatgaatcttct--ccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttc 218  Q
    |||| ||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||  | || ||||||||| ||| ||||||||    
T  12318823 tttctcaatcctatgaa-cttctccccaaaaggcaccaacc-ctctcccaagagccctctcatttggttc 12318890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 282
Target Start/End: Original strand, 31928208 - 31928282
Alignment:
Q  208 tcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaa 282  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31928208 tcttttggttttctaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagactctcaacctttagtatctaaaa 31928282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3331505 - 3331255
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |  |||| ||||| |||    
T  3331505 tgtttcccaactctagaatccaacc-ccaaaaga-aacaaacccttagcctttgatttc-ctaaggatctcctcttttggtaccctaagattcacctaag 3331409  T
Q  122 ttgctcacaaatgact----ctccactcatgtgtttcccaac--------cccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccct 208  Q
    |||||| |||  ||||    |||| |||||||||||||||||         | |||||||| || | ||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  3331408 ttgctcgcaa--gactctacctcctctcatgtgtttcccaactttcctaagcaatgaatctctcccaaaacgacacgaacc-ctttcccaagagccccct 3331312  T
Q  209 cttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctca 265  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||   ||| || |||||| |||||||||||    
T  3331311 cttttggttctctaagattcacatcttgatcatttaaatctcacctaaagaccctca 3331255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Original strand, 4535783 - 4535861
Alignment:
Q  117 ccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaaccttttt 194  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||    
T  4535783 ccaagttgctcacaaacgactatccactcatgtgtttttcaaccccatgaatctattcccaaaagacaccaaccctttt 4535861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25652043 - 25651922
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccacc-aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||  ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  25652043 caattgtttcccaactctagaatctaccttcataaaagagaaccaattcttaatatttgatttt-ctaaggatcttcacttttgctttcccaagattcac 25651945  T
Q  117 ccaagttgctcacaaatgactct 139  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  25651944 ccaagttgctcacatataactct 25651922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6068447 - 6068290
Alignment:
Q  147 tgtgtttcccaaccccatgaatcttctcc-aaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaactttta 245  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |  ||| |||| |||| |   ||| |    
T  6068447 tgtgtttcccaaccttatgaatctcttcccaaaagacaccaaccttttcct-aagagccccctcttttggttcccttagattcacgtcttcatcatttga 6068349  T
Q  246 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||  | |||   |||||||||||||||||||||    
T  6068348 atctcatccaaagaccctcaacttttagcctttaagttccctaaaagttctctcctttg 6068290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 237
Target Start/End: Original strand, 38747052 - 38747144
Alignment:
Q  144 tcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttga 237  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| || |||| ||| |||||||    
T  38747052 tcatgtgttttccaaccctatgaacctctctccaaaaggcaccaaccctttt-tcaagagccccc-gttttggttgtctaagattcatatcttga 38747144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 6360123 - 6360407
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6360123 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcaccc 6360222  T
Q  119 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6360223 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatgaatcttcttcaaaaggcaccattccttttctcaagagccccctcttttggttc 6360322  T
Q  219 tccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360323 tccaagattcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttaatatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 6360407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2390240 - 2389955
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390240 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 2390141  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2390140 caagttgctcacaaaagactatccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagccaccaacccttttcgcaatagccccctcttttggtt 2390041  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2390040 ttccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttg 2389955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 4512600 - 4512884
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4512600 caattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaactaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 4512699  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  4512700 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacc-ctttcccaagagccccctcttttggtt 4512798  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4512799 ctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagaatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 4512884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6431929 - 6431644
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431929 caattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 6431830  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  6431829 caagttgctcacaaaagactctacactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggtt 6431730  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6431729 ctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 6431644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29608694 - 29608414
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29608694 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagaatcttctattttggtttcacaagactcacc 29608595  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29608594 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaa-----tccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggtt 29608500  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29608499 ctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 29608414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 34310926 - 34311212
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310926 caattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 34311025  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34311026 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatgaaccttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggtt 34311125  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||    
T  34311126 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccttcctttg 34311212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 2361182 - 2361466
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2361182 caattgtttcccaactctagaatctaacctc-aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacc 2361280  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2361281 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcatccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttgatt 2361380  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    || ||||| ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2361381 cttcaagattcacatcttgaaggattgaatctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaatcctaaaagttccctcctttg 2361466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 48599544 - 48599819
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599544 caattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 48599643  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  48599644 caagttgctcacaaaagactctctactcatgttttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggt- 48599742  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
             |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48599743 ---------tcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 48599819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 4508916 - 4509192
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4508916 caattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatccttagcctttgatttcactaaggatcttatcttttggtttcacaagactcacc 4509015  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  4509016 aaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacc-ctttcccaagagctccctcttttggtt 4509114  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
            ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4509115 --------ctcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttg 4509192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 4510758 - 4511034
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4510758 caattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatcgttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 4510857  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  4510858 aaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacc-ctttcccaagagctccctcttttggtt 4510956  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
            ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4510957 --------ctcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttg 4511034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3258952 - 3258671
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3258952 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaatgagaaccaacccttagg-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 3258855  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||    
T  3258854 caagttgctaataaaagactctccactcatatgtttcccatccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccatctttttgtt 3258755  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcct 300  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  3258754 ctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcct 3258671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22269929 - 22269647
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22269929 aattgtttcc-aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcctatgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcaccc 22269831  T
Q  119 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttc 218  Q
    ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22269830 aagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccctccccatgaatcttccccaaaaggcaccaa-ctctttcccaagag-cccctcttttggttc 22269733  T
Q  219 tccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  22269732 tccaagattcacatcttgtagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactttagtatctacataccctaaatgttccctcctttg 22269647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 22328608 - 22328895
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccacc-aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcac 116  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22328608 caattgtttcccaactttaggatctaaccccccaaaagagaaccaacccttagcttttgattacat-aaggatattctcttttagtttcccaagattcac 22328706  T
Q  117 ccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttgg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  22328707 ccaagttgctcacaaatgactctctactcatgtttttcccaaccctatgaatctctccccaaaaggcaccaactcttttcctaagagccccctcttttgg 22328806  T
Q  216 ttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22328807 ttctccaagatttacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacctttagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 22328895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 8359527 - 8359699
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaa-ccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcac 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  8359527 caattgttttccaactcaagaatctaaacccccaaaaaataaccaactcttagcctttgatttcactaaggattttctcttttggtttcacaagactcat 8359626  T
Q  117 ccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacc 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8359627 ccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacc 8359699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 32358189 - 32358331
Alignment:
Q  161 ccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagac 260  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32358189 ccatgaattttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 32358288  T
Q  261 cctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32358289 cctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 32358331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5116551 - 5116307
Alignment:
Q  59 ccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 158  Q
    ||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||   | | |||||| ||||    
T  5116551 ccaactcttaacctttgatttcctga-ggatcttctcttttggttacccaagactcacctaagtttatcacaaatgaccctcatttgaagtgtttaccaa 5116453  T
Q  159 ccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaa 257  Q
     || |||||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||| ||||| |||    
T  5116452 tccaatgaatctctctccaaaaggcaccgaccctctcc-caagagccccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagttttgaacatcacctaaa 5116354  T
Q  258 gaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  5116353 gaccctcaacctttagtatttaaataccctaaaagtcccctcctttg 5116307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30814501 - 30814438
Alignment:
Q  240 cttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30814501 ctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttaagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 30814438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 268
Target Start/End: Original strand, 22552791 - 22552897
Alignment:
Q  161 ccatgaatcttctcc-aaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaaga 259  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||| || ||||||||||||    
T  22552791 ccatgaatcttttcccaaaaggcaccaaccgtttcca--agagccccctcttttggttctctaagattcacattttgaccctttaaatctcacccaaaga 22552888  T
Q  260 ccctcaacc 268  Q
    |||||||||    
T  22552889 ccctcaacc 22552897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 132
Target Start/End: Original strand, 1360364 - 1360478
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccacc-aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcac 116  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1360364 caattgtttttcaactctagaatctaaccccccaaaagagaaccaatccatatcctttgatttcccaaaa-atattctcttttggttttccaagactcac 1360462  T
Q  117 ccaagttgctcacaaa 132  Q
     |||||||||| ||||    
T  1360463 tcaagttgctcgcaaa 1360478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 23794039 - 23794176
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||  | || ||||||    
T  23794039 aattgtttttcaactctagaatctaaccac--aaaatgaaccaaccattagcctttgattt-tctaaggatctcctcttttggtctcttacgattcaccc 23794135  T
Q  119 aagttgctcacaaatgactc-tccactcatgtgtttcccaac 159  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  23794136 aaattgctcacaaa-gactcatccgctcatgtgtttctcaac 23794176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Original strand, 43363667 - 43363839
Alignment:
Q  60 caacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaac 159  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||| |||     
T  43363667 caacccttagcatttaatttc-ctaaagatcttctcttttggtctctcaagattcacccaaattgctcac-aaggactctcatctcatgtgtttctcaa- 43363763  T
Q  160 cccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatctt 235  Q
    ||| ||||||| |  |||||||| ||||| |  | || ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  43363764 cccttgaatctcttcccaaaaggaaccaa-caatgtcccaagagctccctcttttagttctccaagatacacatctt 43363839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 37545120 - 37545199
Alignment:
Q  17 tcaattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttt 98  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  37545120 tcaattgtttcctaactctgtaatctaacct--aaaaaagaaccaactcttagcctttgatttttgtaaggatcttctcttt 37545199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 3808919 - 3809204
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3808919 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaa-agaaccaacccttagcctttgatttcactaaggattttctcttttggttttacaagactcacc 3809017  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagag-ccccctcttttggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3809018 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggaaccaacccttttcacaagagcccccctcttttggt 3809117  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3809118 tctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 3809204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5043585 - 5043301
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043585 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttgattccactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 5043486  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5043485 caaattgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttc-ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccctctcttttggtt 5043387  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5043386 ctccaagattctcatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 5043301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17762947 - 17762661
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17762947 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacc 17762848  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct--tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttgg 215  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17762847 caagttgctcccaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctaacccccaaaaggcaccaaaccttttcacaagagccccctcttttgg 17762748  T
Q  216 ttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctccttt 302  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17762747 ttctccaagattcacatcttgaagccttgaacttcacccaaagatcctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctccttt 17762661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 2973149 - 2973435
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973149 caattgtttcccaactctagaatctaatccctaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 2973248  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2973249 caagttgttcacaaatgactctgcattcatgtgtttcccaaccccatgaatcttcccaaaaaagcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggtt 2973348  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2973349 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctacaaaccctaaaagttccctcctttg 2973435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21593622 - 21593347
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593622 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 21593525  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  21593524 caagttgctcaaaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggtt 21593425  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttct 295  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21593424 ctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacatttagtatctaaaaccctaaaagttct 21593347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 278
Target Start/End: Original strand, 603290 - 603550
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603290 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 603389  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  603390 caagttgctcacaaaggacactccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctttcctcaagagccccctcttttggtt 603489  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatct 278  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  603490 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttactatct 603550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 26830334 - 26830619
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26830334 caattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagaatcttctcttttggtttcacaagactcgcc 26830433  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  26830434 caagttgctcacaaatgactctgcgctcatctgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcccaagagactcctcttttggtt 26830533  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26830534 ctccaagattcacatcttgaagttttaaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 26830619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 22425038 - 22425321
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22425038 caattgtttcccaactctataatctaacc-ccaaaagagaaccaacccttagc-tttgatttc-ctaaggatattctcttttggtttcacaagactaacc 22425134  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagag--ccccctcttttgg 215  Q
     |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || || ||||||  |||||||||||||    
T  22425135 gaagttgctcttaaatgactcttcacccatgtgtttcacaaccccatgaatcttccccaaaatgcaccaacccttatcccaagaggcccccctcttttgg 22425234  T
Q  216 ttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22425235 ttctccaagattcacatcttgaagctctgaaccacacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct-aaagttccctcctttg 22425321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17757995 - 17757789
Alignment:
Q  65 cttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccat 164  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17757995 cttagcctttgatttcactgatgatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccat 17757896  T
Q  165 gaatct--tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccc 262  Q
    ||||||   | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||| || ||||||||||||||     
T  17757895 gaatctaacccccaaaatgcaccaacccttttcacaagagccccctattttggttctccaacattcacatcttcaagctttgaatctcacccaaagacca 17757796  T
Q  263 tcaacct 269  Q
    |||||||    
T  17757795 tcaacct 17757789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 112 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26800634 - 26800443
Alignment:
Q  112 ctcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctctt 211  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26800634 ctcacccaagttgctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccc-atgaatcttccccaaaaggcaccaacctttttcccaagagccccctctt 26800536  T
Q  212 ttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||| |||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  26800535 ttggttatccatgatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttttctcctttg 26800443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25073076 - 25072858
Alignment:
Q  84 aaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaa-aggc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| | || ||| ||||||||  | |||||||||| ||||| ||||||||  ||| || ||||    
T  25073076 aaggatcttctcttttggtttcccaagacctatccaagtttcacataaa-gactctcctttgatgtgtttccaaaccctatgaatctcttcccaagaggc 25072978  T
Q  183 accaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa- 281  Q
    || | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25072977 acaatcccttttc-caagagccccc-ctttgggttctcaaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaat 25072880  T
Q  282 accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  25072879 accctaaaagttcacttctttg 25072858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 5741001 - 5741120
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  5741001 caattgttttccaactttagaatctaaccccccaaaagtaaccaacccttagcctttgattt-actaaggatcttcactttttgtttctcaagattcacc 5741099  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactc 138  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  5741100 caaattgctcacaaaagactc 5741120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25073525 - 25073463
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25073525 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaacccttagcctttaatttc 25073463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11660562 - 11660452
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | | || | | |||||||||| || ||||| ||| ||    
T  11660562 aattgtttccgaactctagaatctaacc-ccaaaa-tgaaccaacccttagcctttgaattc-ctatggttatcctcttttggtctcccaagattcatcc 11660466  T
Q  119 aagttgctcacaaa 132  Q
    || |||||||||||    
T  11660465 aaattgctcacaaa 11660452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7285 - 7001
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285 caattgtttcc-agctctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgattttactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 7187  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7186 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggtt 7087  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7086 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 7001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11383944 - 11383659
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383944 caattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 11383845  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11383844 caagttgctcacaaaagactttccacttatgtatttcccaaccccatgaatcttcctcaaaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggtt 11383745  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11383744 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 11383659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 42435201 - 42435486
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42435201 caattgtttaccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcact 42435300  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42435301 caagttgctcacaaaagactctccattcatatgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagtcaccaacctttttcccaagagccccctcttttggtt 42435400  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42435401 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttg 42435486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44353750 - 44353468
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44353750 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagaatcttttcttttggtttcacaagactcacc 44353651  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  44353650 caagttgctcaccgatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctcttcacaagagccccctcttttagtt 44353551  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||   |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44353550 ctccaagattc---tcttgaagttttaaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 44353468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40221703 - 40221427
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40221703 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcacc 40221604  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  40221603 taagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcactaacccctttcccaagagccccctattttggtt 40221504  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttc 294  Q
    ||| |||| ||||||||||||  | | ||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221503 ctcgaagattcacatcttgaagttctaaacctcatccaaagaccttccacctttagtatcaaaaaccctaaaagttc 40221427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40328737 - 40328476
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328737 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcatagcctttgatttcactaaagatcttctcttttggtttcacaagactcacc 40328638  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40328637 caagttgctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccatccccatgaatcttccctaaaaggcaccaacccttttcccaagaaccccctcttttggtt 40328538  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta 279  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40328537 ctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctaaatctttagtatcta 40328476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4283482 - 4283219
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4283482 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaac 4283383  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||                      ||||||||||||||||    
T  4283382 caagtttctcacaaaagactttccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaa----------------------gccccctcttttggtt 4283305  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283304 ctccaagatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 4283219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 120 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22976389 - 22976207
Alignment:
Q  120 agttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttct 219  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  22976389 agttgctcacaatagactcttcactcatgtgttttc-aaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttttccaagagcctcctcttttggttct 22976291  T
Q  220 ccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22976290 ccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactctaaaagttcactcctttg 22976207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 303
Target Start/End: Original strand, 2999823 - 3000016
Alignment:
Q  111 actcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctt-ctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctc 209  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||| |||||||| | | | ||||| |||||||    
T  2999823 actcgcccaagttgctcacaattgactctctactcatgtgtttctcatccccatgaatctttccccaaaagacaccaaccatatcc-caagaaccccctc 2999921  T
Q  210 ttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2999922 ttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaattccctaaaagttctctcctttg 3000016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40585669 - 40585397
Alignment:
Q  30 aactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcac 129  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  40585669 aactttagaatctaccc-ccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtctaccaatactcacccaaattgctcac 40585572  T
Q  130 aaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactc 228  Q
    ||| ||||||||  | |||||||| | |||||||||||||| || ||||||| || ||||| | | || |||||||| |||||||| ||||| || | ||    
T  40585571 aaa-gactctcctttgatgtgttttcaaaccccatgaatctctcaccaaaagacatcaaccctctccaaaagagcccactcttttgattctcaaatattc 40585473  T
Q  229 acatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  40585472 acatcttgaagctttgaacctcaaccaaagactcttaacctttagtatctaaatactctaaaagttatttcctttg 40585397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18655358 - 18655246
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18655358 caattgtttcctaagtctagaatctaacc-ccaaaagagtatcaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacc 18655260  T
Q  118 caagttgctcacaa 131  Q
     |||||||||||||    
T  18655259 gaagttgctcacaa 18655246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 280
Target Start/End: Original strand, 9633816 - 9634007
Alignment:
Q  87 gatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcacca 186  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||   |||||||| ||||    
T  9633816 gatcttctcgtttggtttcctaagattcacccaagttgctcacaaatgactctcatcttatgtgtttaccaaccccattaatctctcccaaaaggtacca 9633915  T
Q  187 acctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 280  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||| || | ||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  9633916 accttttt--caagagcgccatcttttgattattcaagattcacatttggacactttgaatctcacccaaagacgttcgacctttagtttctaa 9634007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 303
Target Start/End: Original strand, 3846031 - 3846313
Alignment:
Q  17 tcaattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcac 116  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||| | || |||| ||||||||||| ||  |||| | ||    
T  3846031 tcaattgttttctgactctagattctaacc-ccaaaat-gaaccaaccatttacctttgatttc-caaaagatcgtctcttttggtatccaaagatttac 3846127  T
Q  117 ccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttgg 215  Q
    |||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||| |||||| | | ||||||||    
T  3846128 ccaatttgctcacaaa-gaatcttctctcatgtgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaagacaccaactcttttc-caagag-ctcttcttttgg 3846224  T
Q  216 ttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||| ||||| ||||||  |||| |||| || ||||| |||  |||||||||||||||| || ||  ||||| |||||| |||||||||    
T  3846225 ttcttcaagattcacattatgaacctttgaatctcactcaagaaccctcaacctttagtttcaaagtaccctgaaagttttctcctttg 3846313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40535713 - 40535538
Alignment:
Q  113 tcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaa-tcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctctt 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| | || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  40535713 tcacctaagttgctcacaa-tgactcttctctcatgtgttttccaatcacatgaacttttatccaaaaggcatcaacccttt-ctcaagaaccccctctt 40535616  T
Q  212 ttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaa 290  Q
    ||||||||  ||||  |||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40535615 ttggttctaaaagatccacaacttgaaactttgaac--cacccaaagaccatcaatctttagtatctaaataccctaaaa 40535538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11136989 - 11136843
Alignment:
Q  128 acaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctccaagac 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || || |||||||||| | |||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |     
T  11136989 acaaatgactctccactcatgtgttttcctacccaatgaacctctccccaaaaggcatcgaccaatttc-caagagccctctcttttagttctccaaaat 11136891  T
Q  227 tcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagt 274  Q
    ||| || | || | ||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11136890 tcatatttggacaatttgaatctcacccaaagacccccaacctttagt 11136843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 303
Target Start/End: Original strand, 3817641 - 3817829
Alignment:
Q  116 cccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctt-ctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccc--cctcttt 212  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    |||||    
T  3817641 cccaatttgctcacaaa-gaatcttctcttatgtattttccaaccccatgaatctttctccaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctaattcttt 3817738  T
Q  213 tggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||| ||||| || |||||| || |||| ||  | || || | |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  3817739 tggttcttcaagaatcccatcttcaacctttgaa-tttactcagaaaccctcaacctttagtttctaagtaccctaaaagttttctcctttg 3817829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 303
Target Start/End: Original strand, 20686456 - 20686552
Alignment:
Q  207 ctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  20686456 ctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacttca-ccaaagatcctcaacatttagtatctaagtaccctgaaagttccctcctttg 20686552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10020398 - 10020272
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |  |||| ||||| |||    
T  10020398 tgtttcccaactctagaatccaacc-caaaaaga-aacaaacccttagcctttgatttc-ctaaggatctcctcttttggtaccctaagattcacctaag 10020302  T
Q  122 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgttt 153  Q
    ||| ||||||  |||||| | |||||||||||    
T  10020301 ttgttcacaa--gactcttctctcatgtgttt 10020272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 132
Target Start/End: Original strand, 33655548 - 33655628
Alignment:
Q  51 aaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaa 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  33655548 aaagagaaccaacccttaacctttgattt-tctaaggatcttctcttttgttctcctaagattcacccaaattgctcacaaa 33655628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10020219 - 10020150
Alignment:
Q  197 caagagccccctcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaa 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||   ||| || |||||| ||||||||||||    
T  10020219 caagagccccctcttttggttctctaagattcacatattgatcatttgaatctcacctaaagaccctcaa 10020150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10240114 - 10240061
Alignment:
Q  17 tcaattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcct 72  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  10240114 tcaattgtttcccaaatctagaatctaac--cccaaagagaaccaactcttagcct 10240061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 10101365 - 10101475
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 118  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| | ||  |||| ||| ||    
T  10101365 aattatttcctaacactagaatctaacc-ccaaaac-gtaccaacccttagactttgatttaat-aaggatctcctcttttgatctcctaagattcatcc 10101461  T
Q  119 aagttgctcacaaa 132  Q
    ||||||||||||||    
T  10101462 aagttgctcacaaa 10101475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11512 - 11231
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11512 tgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttgattttactaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 11413  T
Q  122 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctcc 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  11412 ttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccatcttttggttctcc 11313  T
Q  222 aagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11312 aagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 80493 - 80778
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  80493 caattgtttcctaactctagaatctaacccccaaaatagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatctactcttttagtttcccaagactcacc 80592  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggtt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  80593 caagttgctcacaaaagactctccgctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggtt 80692  T
Q  218 ctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  80693 ctccaagattcaaatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctctagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 80778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 18213 - 18495
Alignment:
Q  18 caattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacc 117  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18213 caattgtttcc-aactctataatctaacc-ccaaaagagaaccaactcttagtctttgatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcact 18310  T
Q  118 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctcc-aaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggt 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18311 caagttgctcacaaataactctccactcatgtgttttc-aacctcatgaatcttcccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctctttttgt 18409  T
Q  217 tctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttg 303  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  18410 tctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacccgcaacctttagtatctaaaa-cctataagttttctcctttg 18495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 309
Target Start/End: Original strand, 490661 - 490946
Alignment:
Q  22 tgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaag 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || |||| ||||||||| | || ||| | |||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  490661 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttc-ctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaag 490758  T
Q  122 ttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctcttttggttctc 220  Q
    ||||||| |||  |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||    
T  490759 ttgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctcca-aagagcccccttttttggttctc 490856  T
Q  221 caagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagttctctcctttgcttctc 309  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| |||||    
T  490857 caagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctc 490946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 1609 - 1901
Alignment:
Q  19 aattgtttcccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctta----------gcctttgatttcacgaaggatcttctcttttggtttcaca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||          || ||||||||| | ||||||||||||||||| | || ||    
T  1609 aattgtttcccaactctagaatctaacc-ccaaaagagaaccaacacttataagttataagcttttgatttc-ctaaggatcttctcttttgatctccca 1706  T
Q  109 agactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccc 207  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| ||||  ||||||||| ||  |||||| |||||| | |   | |||||| ||||    
T  1707 agactcgcccaagttgctcacaa-tgactctcatatgatgtgtttctcaactacatgaatctctccacaaaagacaccaagcctcgcc-caagagtcccc 1804  T
Q  208 tcttttggttctccaagactcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1805 tcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttggagctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaataccctaaaagttctctcatttg 1901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University