View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12598_low_70 (Length: 282)

Name: NF12598_low_70
Description: NF12598
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12598_low_70
NF12598_low_70
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (14-268)||(54685104-54685358)
chr3 (14-268)||(33342079-33342333)
chr3 (42-268)||(38168112-38168338)
chr3 (32-268)||(53771239-53771474)
chr3 (42-268)||(30153140-30153365)
chr3 (32-268)||(16261651-16261886)
chr3 (70-267)||(28558370-28558567)
chr3 (68-268)||(23492571-23492771)
chr3 (112-268)||(7854180-7854336)
chr3 (112-268)||(17955885-17956041)
chr3 (121-267)||(45581830-45581976)
chr3 (112-268)||(55513068-55513224)
chr3 (112-268)||(3992748-3992904)
chr3 (112-268)||(54038025-54038181)
chr3 (112-268)||(2844389-2844545)
chr3 (14-143)||(13839200-13839329)
chr3 (156-268)||(18970119-18970231)
chr3 (42-143)||(12030004-12030105)
chr3 (42-143)||(2050115-2050215)
chr3 (42-143)||(17912330-17912430)
chr3 (42-143)||(19260681-19260781)
chr3 (188-267)||(48421776-48421855)
chr3 (32-143)||(11986003-11986112)
chr3 (188-267)||(15550797-15550876)
chr3 (42-110)||(5240561-5240628)
chr3 (32-143)||(13954728-13954836)
chr3 (32-143)||(45861122-45861230)
chr3 (68-143)||(2449109-2449184)
chr3 (68-143)||(15615137-15615212)
chr3 (14-145)||(51960932-51961065)
chr3 (69-143)||(14285289-14285363)
chr3 (68-143)||(14842444-14842519)
chr3 (69-143)||(19947026-19947100)
chr3 (158-267)||(11402789-11402898)
chr3 (166-264)||(17393636-17393735)
chr3 (68-143)||(8268607-8268682)
chr3 (68-143)||(8275707-8275782)
chr3 (68-143)||(18896918-18896993)
chr3 (70-143)||(12264668-12264741)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (14-268)||(9785-10040)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (14-268)||(781-1035)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (14-268)||(9652699-9652953)
chr2 (32-268)||(21273872-21274106)
chr2 (112-268)||(22274920-22275076)
chr2 (112-268)||(22284153-22284309)
chr2 (112-262)||(25213252-25213403)
chr2 (112-262)||(15633418-15633568)
chr2 (38-143)||(22863235-22863340)
chr2 (38-143)||(36982291-36982396)
chr2 (44-143)||(8891549-8891648)
chr2 (68-143)||(463043-463118)
chr2 (112-267)||(7321716-7321871)
chr2 (40-143)||(24341238-24341341)
chr2 (68-143)||(14906311-14906386)
chr2 (68-143)||(23820388-23820463)
chr2 (66-143)||(20015328-20015405)
chr2 (33-143)||(17396492-17396599)
chr2 (68-143)||(19689272-19689347)
chr2 (38-142)||(32466177-32466279)
chr2 (33-143)||(25265227-25265335)
chr2 (69-143)||(33128372-33128446)
chr2 (32-143)||(12641483-12641591)
chr2 (189-267)||(20279610-20279688)
chr2 (32-143)||(12635709-12635817)
chr2 (32-143)||(12728699-12728807)
chr2 (32-143)||(34824782-34824890)
chr2 (68-143)||(8944153-8944228)
chr2 (32-142)||(23774444-23774551)
chr2 (27-92)||(27262176-27262244)
chr2 (69-143)||(28031092-28031166)
chr2 (69-142)||(21142203-21142276)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (14-266)||(17207-17459)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (14-268)||(21650893-21651147)
chr5 (42-268)||(21205124-21205348)
chr5 (33-268)||(2032008-2032243)
chr5 (70-268)||(11342883-11343081)
chr5 (70-262)||(16105847-16106040)
chr5 (40-263)||(25005019-25005240)
chr5 (38-143)||(27182398-27182503)
chr5 (14-131)||(23981307-23981425)
chr5 (189-267)||(22662653-22662731)
chr5 (40-141)||(18530917-18531018)
chr5 (63-143)||(108680-108760)
chr5 (68-143)||(20623286-20623361)
chr5 (68-143)||(21233399-21233474)
chr5 (40-143)||(22053682-22053785)
chr5 (68-143)||(37053061-37053136)
chr5 (68-143)||(16536514-16536589)
chr5 (68-143)||(23507270-23507345)
chr5 (68-143)||(25900277-25900352)
chr5 (32-131)||(32951024-32951121)
chr5 (72-131)||(7529240-7529299)
chr5 (32-143)||(1219361-1219469)
chr5 (32-142)||(23328865-23328972)
chr5 (32-142)||(24616469-24616576)
chr5 (32-142)||(24712845-24712952)
chr5 (32-142)||(24745863-24745970)
chr5 (67-143)||(7425631-7425707)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (14-268)||(2029119-2029373)
chr7 (42-268)||(3049780-3050006)
chr7 (63-268)||(42056140-42056346)
chr7 (32-268)||(2190008-2190243)
chr7 (112-268)||(126613-126769)
chr7 (112-268)||(1936918-1937074)
chr7 (112-268)||(32493947-32494103)
chr7 (112-268)||(111170-111326)
chr7 (70-250)||(15516720-15516901)
chr7 (38-143)||(11580588-11580693)
chr7 (43-143)||(16212071-16212170)
chr7 (38-131)||(13036865-13036958)
chr7 (42-143)||(36052971-36053071)
chr7 (159-267)||(13352151-13352259)
chr7 (159-267)||(39291457-39291565)
chr7 (40-143)||(15709469-15709572)
chr7 (42-145)||(25124448-25124550)
chr7 (32-143)||(7293333-7293441)
chr7 (42-110)||(17817292-17817359)
chr7 (42-110)||(19049642-19049709)
chr7 (68-143)||(11516544-11516619)
chr7 (68-143)||(15441435-15441510)
chr7 (68-143)||(30262000-30262075)
chr7 (32-143)||(13321334-13321443)
chr7 (40-143)||(36024452-36024556)
chr7 (68-143)||(14113860-14113935)
chr7 (68-142)||(25292209-25292283)
chr7 (69-143)||(47480902-47480976)
chr7 (68-131)||(14423511-14423574)
chr7 (190-264)||(15977820-15977894)
chr7 (69-142)||(10000245-10000318)
chr7 (32-143)||(13758677-13758785)
chr7 (166-264)||(18151259-18151357)
chr7 (69-142)||(48622541-48622614)
chr7 (27-92)||(3895395-3895462)
chr7 (67-143)||(15927875-15927951)
chr7 (67-143)||(18979894-18979970)
chr7 (27-92)||(39046437-39046504)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (40-268)||(55779-56007)
scaffold0032 (68-214)||(108032-108179)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (42-268)||(24385584-24385809)
chr8 (33-268)||(41506631-41506866)
chr8 (112-268)||(24716763-24716919)
chr8 (112-268)||(39115473-39115629)
chr8 (112-267)||(274642-274797)
chr8 (112-267)||(641052-641207)
chr8 (112-267)||(826858-827013)
chr8 (159-267)||(17502360-17502468)
chr8 (27-267)||(21259304-21259547)
chr8 (42-143)||(43373324-43373424)
chr8 (42-143)||(24928648-24928748)
chr8 (159-267)||(4234054-4234162)
chr8 (159-267)||(23218076-23218184)
chr8 (56-143)||(16193588-16193674)
chr8 (202-268)||(22321437-22321503)
chr8 (32-143)||(22907052-22907160)
chr8 (68-143)||(5238404-5238479)
chr8 (68-143)||(24661119-24661194)
chr8 (68-143)||(43685863-43685938)
chr8 (33-142)||(7000442-7000551)
chr8 (69-131)||(21494314-21494376)
chr8 (69-143)||(22886654-22886728)
chr8 (69-143)||(3431134-3431208)
chr8 (189-267)||(18118259-18118337)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (32-268)||(13208-13443)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (32-268)||(15272134-15272369)
chr4 (67-268)||(14951960-14952161)
chr4 (112-268)||(5682429-5682584)
chr4 (112-268)||(25119108-25119264)
chr4 (32-213)||(15135830-15136010)
chr4 (38-143)||(13246737-13246842)
chr4 (42-143)||(122194-122294)
chr4 (136-268)||(19559557-19559689)
chr4 (40-143)||(15674938-15675041)
chr4 (159-268)||(49071885-49071994)
chr4 (40-143)||(10104099-10104202)
chr4 (32-143)||(26680517-26680625)
chr4 (68-143)||(16608970-16609045)
chr4 (40-143)||(33241011-33241114)
chr4 (27-127)||(40885371-40885475)
chr4 (33-142)||(55376417-55376525)
chr4 (40-140)||(31132628-31132728)
chr4 (68-143)||(16327797-16327872)
chr4 (188-262)||(34177617-34177691)
chr4 (69-131)||(32460561-32460623)
chr4 (68-143)||(10488879-10488954)
chr4 (68-134)||(13048092-13048158)
chr4 (69-142)||(22738577-22738650)
chr4 (32-143)||(20001030-20001138)
chr4 (32-142)||(26339327-26339434)
chr4 (69-143)||(7131940-7132014)
chr4 (69-143)||(8045272-8045346)
chr4 (39-92)||(23269756-23269809)
chr4 (203-263)||(14500208-14500268)
chr4 (67-143)||(15287118-15287194)
chr4 (67-143)||(15294227-15294303)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (42-269)||(6375-6601)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (32-268)||(23995121-23995356)
chr6 (42-268)||(26089933-26090159)
chr6 (69-267)||(15742078-15742275)
chr6 (69-268)||(18002353-18002553)
chr6 (112-268)||(19983193-19983349)
chr6 (112-268)||(35015058-35015214)
chr6 (112-268)||(4991271-4991427)
chr6 (112-268)||(18583515-18583671)
chr6 (38-143)||(23148303-23148408)
chr6 (38-143)||(23153754-23153859)
chr6 (33-143)||(27751742-27751852)
chr6 (159-267)||(22585494-22585602)
chr6 (159-267)||(22590325-22590433)
chr6 (136-267)||(15889631-15889762)
chr6 (159-268)||(15004855-15004963)
chr6 (159-267)||(25640504-25640611)
chr6 (32-143)||(29666181-29666290)
chr6 (68-143)||(1649978-1650053)
chr6 (14-143)||(35009253-35009384)
chr6 (69-143)||(32276617-32276691)
chr6 (39-90)||(14128502-14128552)
chr6 (69-131)||(16299844-16299906)
chr6 (69-143)||(18823241-18823315)
chr6 (69-143)||(18839096-18839170)
chr6 (67-143)||(16232199-16232275)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (42-268)||(193329-193545)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (42-267)||(12350-12574)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (70-268)||(15861285-15861483)
chr1 (112-268)||(21860209-21860365)
chr1 (112-268)||(44034872-44035028)
chr1 (188-268)||(22367216-22367296)
chr1 (38-143)||(37844301-37844406)
chr1 (38-143)||(20445987-20446092)
chr1 (38-143)||(20893478-20893583)
chr1 (38-143)||(20531751-20531856)
chr1 (38-143)||(20913335-20913439)
chr1 (112-204)||(41218667-41218759)
chr1 (56-143)||(20931650-20931737)
chr1 (68-143)||(45051726-45051801)
chr1 (68-143)||(51452809-51452884)
chr1 (32-142)||(7640775-7640882)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (112-268)||(80062-80218)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (69-268)||(4304-4504)
scaffold0303 (188-268)||(5-85)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (112-268)||(5984-6140)
scaffold0686 (112-257)||(5778-5923)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (112-266)||(162079-162233)
scaffold0016 (112-266)||(166165-166319)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (112-268)||(31181-31337)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (112-268)||(41507-41663)
scaffold0078 (32-143)||(36904-37012)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (112-262)||(130760-130911)
scaffold0028 (38-131)||(89305-89398)
scaffold0028 (38-131)||(107635-107728)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (112-252)||(42568-42708)
scaffold0132 (40-143)||(13824-13927)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (112-268)||(30292-30448)
scaffold0116 (68-128)||(353-413)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (112-268)||(353-508)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (14-143)||(26243-26372)
scaffold0162 (40-143)||(8021-8125)
scaffold0162 (68-143)||(12063-12138)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (14-102)||(15238-15326)
scaffold0175 (179-268)||(15147-15236)
scaffold0175 (68-143)||(839-914)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (14-143)||(51008-51140)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (42-143)||(146906-147006)
scaffold0025 (40-143)||(9160-9263)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (35-131)||(123011-123107)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (136-267)||(44039-44170)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (14-143)||(42034-42166)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (42-143)||(9183-9283)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (42-143)||(172210-172310)
scaffold0001 (42-143)||(177913-178013)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (42-143)||(1430-1530)
scaffold0266 (42-143)||(3440-3540)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (38-143)||(247292-247398)
scaffold0012 (68-143)||(34032-34107)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (56-143)||(272330-272417)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (32-146)||(57315-57427)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (42-143)||(12418-12519)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (42-143)||(128027-128127)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (38-142)||(339-443)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (188-267)||(305-384)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (188-267)||(1478-1557)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (42-143)||(36766-36869)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (33-142)||(25532-25640)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (68-143)||(22857-22932)
scaffold0141 (68-143)||(27112-27187)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (68-143)||(1453-1528)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (32-143)||(55936-56045)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (68-143)||(5846-5921)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (159-267)||(3785-3897)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (69-143)||(34266-34340)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (68-143)||(45338-45413)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (69-143)||(18026-18100)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (69-143)||(41965-42039)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (68-145)||(5947-6024)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (43-143)||(48903-49002)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (68-131)||(10213-10276)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (69-143)||(5434-5508)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (69-143)||(5549-5623)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (69-131)||(49710-49772)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (27-92)||(2875-2942)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (69-128)||(9223-9282)
scaffold0215 (69-128)||(16121-16180)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (216-267)||(6082-6133)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (69-119)||(3528-3578)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (27-92)||(34034-34102)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (69-131)||(95310-95372)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (69-142)||(12002-12075)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (30-92)||(11465-11529)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 54685104 - 54685358
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54685104 agagaagaacaagggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaaattaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttcatccaa 54685203  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685204 ggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 54685303  T
Q  214 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685304 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 54685358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33342333 - 33342079
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33342333 agagaagaacaagggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaa 33342234  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33342233 ggtaagagggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaat 33342134  T
Q  214 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342133 ctttgaaattcgtgctaatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 33342079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38168338 - 38168112
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38168338 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 38168239  T
Q  142 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  38168238 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtacttatgttgtagaa 38168139  T
Q  242 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38168138 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 38168112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53771474 - 53771239
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  53771474 gagagaagagcttgaggaatcaag-attgg-gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 53771377  T
Q  132 tatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771376 tatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 53771277  T
Q  231 atgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53771276 atgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgt 53771239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30153365 - 30153140
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  30153365 cttgaagaatcaag-attggggtgagcttaggagctaaagagaagtctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtttttatcataatc 30153267  T
Q  142 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 241  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153266 atttaattaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 30153167  T
Q  242 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30153166 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 30153140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16261886 - 16261651
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  16261886 gagagaagagcttgaggaatcaag-attgg-gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttggaattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 16261789  T
Q  132 tatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261788 tatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcgtaattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 16261689  T
Q  231 atgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16261688 atgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgt 16261651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28558567 - 28558370
Alignment:
Q  70 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttct 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  28558567 taggagcaaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagagggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttcc 28558468  T
Q  170 atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558467 atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacctaatctttgaaattcgtgcttatgtgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 28558370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23492771 - 23492571
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgtt 167  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23492771 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgtt 23492672  T
Q  168 ctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23492671 ctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcttgcttatgttgtagagatatgtttgaatgtgttaatttgatg 23492572  T
Q  268 t 268  Q
    |    
T  23492571 t 23492571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7854336 - 7854180
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7854336 aaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 7854237  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854236 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 7854180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 17955885 - 17956041
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955885 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataatcgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 17955984  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17955985 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtctgaatatgttaatttgatgt 17956041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 45581976 - 45581830
Alignment:
Q  121 gggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaa 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581976 gggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaa 45581877  T
Q  221 attcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581876 attcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 45581830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 55513224 - 55513068
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  55513224 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatggaaataagtgattatcatgaaccca 55513125  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55513124 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaattcgatgt 55513068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3992904 - 3992748
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3992904 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtaattatcatgaactca 3992805  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992804 acctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 3992748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 54038025 - 54038181
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  54038025 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaactca 54038124  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54038125 atgtttgacattcgtgcttatattgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgt 54038181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2844545 - 2844389
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2844545 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttgattctttttctcttattctatgcataattgattatgggaataagcgattatcatgaaccca 2844446  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  2844445 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagatttttgttttaatatgttaatttgatgt 2844389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13839329 - 13839200
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  13839329 agagaagaaaaagggttagagagaagaacttgaagaattgaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtagggattactcttcatctaa 13839230  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  13839229 ggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13839200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18970231 - 18970119
Alignment:
Q  156 ttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||    
T  18970231 ttttctctttttctatgcataagtgattatttgaataagtgattattatgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttaagtat 18970132  T
Q  256 gttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||    
T  18970131 gttaatttgatgt 18970119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 12030004 - 12030105
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  12030004 cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttaatcattatcataatc 12030103  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  12030104 at 12030105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2050215 - 2050115
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2050215 cttgaagaatcaag-attggagtgagtttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 2050117  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  2050116 at 2050115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 17912330 - 17912430
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17912330 cttgaagaatcaagg-ttggagtgagcttaggagctaaattgaagcctgaggtgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 17912428  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  17912429 at 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 19260681 - 19260781
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19260681 cttgaagaatcaag-attggagtgagattaagagctaaattgaagtctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 19260779  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  19260780 at 19260781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 48421855 - 48421776
Alignment:
Q  188 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48421855 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcatgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatg 48421776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 11986003 - 11986112
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||||||||  ||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  11986003 gagagaagagtttgaagaatcaa--attggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtctt 11986100  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
     || ||||||||    
T  11986101 catcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15550876 - 15550797
Alignment:
Q  188 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15550876 gaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatg 15550797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Original strand, 5240561 - 5240628
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 110  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5240561 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 5240628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 13954728 - 13954836
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13954728 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 13954824  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||  ||||||||    
T  13954825 taccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45861230 - 45861122
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45861230 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 45861134  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||  ||||||||    
T  45861133 taccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 2449109 - 2449184
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2449109 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15615212 - 15615137
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15615212 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15615137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Original strand, 51960932 - 51961065
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagaga--gaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatcc 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||| ||| | |||||  |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||     
T  51960932 agagaggaacaagggttagagaaggagaaacttgaagaatcaagaattagggtgaatctaggaggtaaagtgaagtctaagtttggattaatcattatct 51961031  T
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcattt 145  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  51961032 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcattt 51961065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14285363 - 14285289
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14285363 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 14842444 - 14842519
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14842444 cttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14842519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19947100 - 19947026
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  19947100 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11402898 - 11402789
Alignment:
Q  158 ttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgt 257  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||  ||||||||||||||  |||||  |||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||| |    
T  11402898 ttctctagttctatgcacaagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctcatattatagtgatatgtttgagtatat 11402799  T
Q  258 taatttgatg 267  Q
     |||||||||    
T  11402798 gaatttgatg 11402789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17393735 - 17393636
Alignment:
Q  166 ttctatgcataattgatta--tgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaattt 263  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  17393735 ttctatgcataattgcttaattgaga-taagtgattattatgaacttaattgttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgggtatgttaattt 17393637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 8268607 - 8268682
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  8268607 cttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 8268682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 8275707 - 8275782
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  8275707 cttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 8275782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 18896918 - 18896993
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  18896918 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcat 18896993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 143
Target Start/End: Original strand, 12264668 - 12264741
Alignment:
Q  70 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  12264668 taggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 12264741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 9785 - 10040
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9785 agagaagaacaagggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaa 9884  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcat-aattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaa 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9885 ggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataaattgattatgaaaataagtgattatcatgaacccaa 9984  T
Q  213 tctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9985 tctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 781 - 1035
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  781 agagaagaacaagggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaa 880  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 213  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  881 ggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaat 980  T
Q  214 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  981 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagaggtttgttttaatatgttaatttgatgt 1035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 9652699 - 9652953
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  9652699 agagaagaataagggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaaacctaagttgggattaatcttcatctaa 9652798  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 213  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9652799 ggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttttcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaat 9652898  T
Q  214 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652899 ctttgaaattcgtggttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 9652953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 268
Target Start/End: Original strand, 21273872 - 21274106
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  21273872 gagagaagagcttgaggaatcaag-attgg-gtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaag-gggttagtctt 21273968  T
Q  132 tatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 230  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21273969 tatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 21274068  T
Q  231 atgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21274069 atgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgt 21274106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22275076 - 22274920
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275076 aaggtaagggggttagcctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 22274977  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274976 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 22274920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22284309 - 22284153
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22284309 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcatatttgattatgagaataagtgattatcatgaactca 22284210  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22284209 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttaatgt 22284153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213252
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 210  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 25213304  T
Q  211 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25213303 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatt 25213252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15633568 - 15633418
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15633568 aaggtaaggaggttagtctttatcataatcacttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattataatgaaccca 15633469  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 262  Q
    ||  ||||| ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||    
T  15633468 attcttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaatt 15633418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22863340 - 22863235
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  22863340 agaacttgaagaatcaaggattggggtgagcttaggagctaaattgcagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcat 22863241  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  22863240 aatcat 22863235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Original strand, 36982291 - 36982396
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  36982291 agaacttgaagaactaaggattggagtgagctgaggagctaaattgaagcctaagttggtattagtctttatctaaggtaagggggttagtctttatcat 36982390  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  36982391 aatcat 36982396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8891648 - 8891549
Alignment:
Q  44 tgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  8891648 tgaacaatcaaggattggagtgagcttaggaactaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaaggggttagtctttatcataatcat 8891549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 463118 - 463043
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  463118 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 463043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7321871 - 7321716
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||  || || ||||||| || |||||||  |  |||||| | |||||||||  || ||||  |||||||||| |||  ||||||||    
T  7321871 aaggtaagggggttagaattcattataatcacttagttaatttctactctcttttcctatgcatacgtgcttatttgaataagtgactattgtgaaccca 7321772  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7321771 acttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatg 7321716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 24341238 - 24341341
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  24341238 aacttgaagcatcaagaattggagtgagcttaggagctaaaatgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataa 24341337  T
Q  140 tcat 143  Q
    ||||    
T  24341338 tcat 24341341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 14906311 - 14906386
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14906311 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23820463 - 23820388
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23820463 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20015405 - 20015328
Alignment:
Q  66 aacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20015405 aacttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 143
Target Start/End: Original strand, 17396492 - 17396599
Alignment:
Q  33 agagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtcttt 132  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17396492 agagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtgagcttaggagctaaattaaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtcttt 17396588  T
Q  133 atgataatcat 143  Q
    |  ||||||||    
T  17396589 accataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 19689272 - 19689347
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19689272 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 32466279 - 32466177
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  32466279 agaacttgaagaaccaagaattgg-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttgatccttatctaaggtaag-gggttagtcttcatcat 32466182  T
Q  138 aatca 142  Q
    |||||    
T  32466181 aatca 32466177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 143
Target Start/End: Original strand, 25265227 - 25265335
Alignment:
Q  33 agagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtcttt 132  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||     
T  25265227 agagaagagcttgaagaatcaa--attggggtaagcttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaatgtaagggggttagtcttc 25265324  T
Q  133 atgataatcat 143  Q
    || ||||||||    
T  25265325 atcataatcat 25265335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33128446 - 33128372
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  33128446 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 12641483 - 12641591
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||  |    
T  12641483 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagttat 12641579  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  12641580 tatcataatcat 12641591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20279688 - 20279610
Alignment:
Q  189 aataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  20279688 aataagtgattatggtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcatgttatagagatatgtttgggtatatgaatttgatg 20279610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 12635709 - 12635817
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  12635709 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 12635805  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  12635806 tatcataatcat 12635817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12728807 - 12728699
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  12728807 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 12728711  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  12728710 tatcataatcat 12728699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34824890 - 34824782
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  34824890 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgat 34824794  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  34824793 tatcataatcat 34824782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8944228 - 8944153
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  8944228 cttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 8944153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23774551 - 23774444
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  23774551 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 23774455  T
Q  132 tatgataatca 142  Q
    ||| |||||||    
T  23774454 tatcataatca 23774444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27262244 - 27262176
Alignment:
Q  27 ggttagagagaaga---acttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaag 92  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  27262244 ggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggaaagctaggagctaaattgaagcctaag 27262176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 28031092 - 28031166
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28031092 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttgaattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21142276 - 21142203
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatca 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  21142276 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatca 21142203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 17207 - 17459
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17207 agagaagaacaagggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctccatctaa 17306  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 213  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17307 ggtaagcgggttagtctttatcataatcatttaggtaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataattgattatcatgaacccaat 17406  T
Q  214 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgat 266  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17407 ctttgaaattagtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgat 17459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21651147 - 21650893
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21651147 agagaagaacaagggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttcatctaa 21651048  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 213  Q
    |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21651047 ggtaagggggttaatatttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctgtgcatagttgattatgggaataagtgattatcatgaacccaat 21650948  T
Q  214 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650947 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 21650893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21205348 - 21205124
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  21205348 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttggaattaatcttcatctaagataag-ggattagtctttatcataatc 21205251  T
Q  142 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205250 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 21205151  T
Q  242 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21205150 atatgtttggatatgttaatttgatgt 21205124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2032243 - 2032008
Alignment:
Q  33 agagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtcttt 132  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||     
T  2032243 agaggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaggtaagggggttagttttc 2032144  T
Q  133 atgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttat 232  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2032143 atcataatcgtttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttat 2032044  T
Q  233 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2032043 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 2032008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11343081 - 11342883
Alignment:
Q  70 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttct 169  Q
    |||||||| |||||||||  | ||| || ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11343081 taggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttct 11342982  T
Q  170 atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342981 atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 11342883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16106040 - 16105847
Alignment:
Q  70 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttc 168  Q
    |||||||| |||||||||   ||||  | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  16106040 taggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattc 16105941  T
Q  169 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16105940 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatt 16105847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25005240 - 25005019
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  25005240 aacttgaagaatcaagaattggagtgaatctaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaagtaagggggttagtcttcatcataa 25005141  T
Q  140 tcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtag 239  Q
    |||||| |||  |  ||||||  ||||| |||| |||| || | |   ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25005140 tcatttagtt--tagtttttcaattgttgtatgaataagtgctcaattgaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgaag 25005043  T
Q  240 agatatgtttgaatatgttaattt 263  Q
     ||||||||||| | |||||||||    
T  25005042 tgatatgtttgagtgtgttaattt 25005019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Original strand, 27182398 - 27182503
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||    
T  27182398 agaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatcat 27182497  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  27182498 aatcat 27182503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 23981307 - 23981425
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttaga-gagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatcca 112  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  23981307 agagaagaacaagggttagaagaggagatcttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcttcatctt 23981406  T
Q  113 aggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23981407 aggtaagggggttagtctt 23981425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 22662653 - 22662731
Alignment:
Q  189 aataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22662653 aataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatttgaatatgttaatttgatg 22662731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 141
Target Start/End: Original strand, 18530917 - 18531018
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  18530917 aacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataa 18531016  T
Q  140 tc 141  Q
    ||    
T  18531017 tc 18531018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 143
Target Start/End: Original strand, 108680 - 108760
Alignment:
Q  63 gtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  108680 gtgagcttaggaggtaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20623361 - 20623286
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20623361 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 21233399 - 21233474
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21233399 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 22053682 - 22053785
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  22053682 aacttgaagaatcaagaattgaagtgagcttaggagctaaagtgaagtctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataa 22053781  T
Q  140 tcat 143  Q
    ||||    
T  22053782 tcat 22053785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37053136 - 37053061
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37053136 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16536589 - 16536514
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16536589 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23507345 - 23507270
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23507345 cttaggagttaaagtgaagcataagttggaattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23507270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 25900277 - 25900352
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25900277 cttaggagctaaattaaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32951121 - 32951024
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  32951121 gagagaagagcttgaagaatcaa--attggggtaagcttaggagctaaattgaagtctaagtttgaattaatcattatttaaggtaagggggttagtctt 32951024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7529299 - 7529240
Alignment:
Q  72 ggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  7529299 ggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtctt 7529240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 1219361 - 1219469
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  1219361 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgat 1219457  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  1219458 tatcataatcat 1219469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23328972 - 23328865
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  23328972 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 23328876  T
Q  132 tatgataatca 142  Q
    ||| |||||||    
T  23328875 tatcataatca 23328865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24616576 - 24616469
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  24616576 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 24616480  T
Q  132 tatgataatca 142  Q
    ||| |||||||    
T  24616479 tatcataatca 24616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24712952 - 24712845
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  24712952 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 24712856  T
Q  132 tatgataatca 142  Q
    ||| |||||||    
T  24712855 tatcataatca 24712845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24745970 - 24745863
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  24745970 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 24745874  T
Q  132 tatgataatca 142  Q
    ||| |||||||    
T  24745873 tatcataatca 24745863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7425707 - 7425631
Alignment:
Q  67 acttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  7425707 acttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 7425631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2029373 - 2029119
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  2029373 agagaagagcaagggttagagagaagaacttgaagaattaaaaattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttggaattaatctttatctaa 2029274  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 213  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029273 ggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattttttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 2029174  T
Q  214 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2029173 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgt 2029119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3050006 - 3049780
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  3050006 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaagagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtttttatcataatc 3049907  T
Q  142 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3049906 atttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgtttatattgtagag 3049807  T
Q  242 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3049806 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 3049780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Original strand, 42056140 - 42056346
Alignment:
Q  63 gtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctc 162  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42056140 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctc 42056239  T
Q  163 ttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaat 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42056240 ttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaat 42056339  T
Q  262 ttgatgt 268  Q
    |||||||    
T  42056340 ttgatgt 42056346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 268
Target Start/End: Original strand, 2190008 - 2190243
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||    
T  2190008 gagagaagagcttgaggaatcaag-attgg-gtgagcttaggagttaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggcggttagtttt 2190105  T
Q  132 tatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2190106 tatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgtacccaatctttgaaattcgtgctt 2190205  T
Q  231 atgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2190206 atgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgt 2190243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 126769 - 126613
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126769 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctattgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 126670  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126669 atctttgaaattcgtgcttatgttgcagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 126613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 1936918 - 1937074
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1936918 aaggtaaggaggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 1937017  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937018 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 1937074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 32493947 - 32494103
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32493947 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 32494046  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494047 atctttgaaattcgtgtttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 32494103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 111170 - 111326
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  111170 aaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgaaaataagtgattatcatgaaccca 111269  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111270 atatttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 111326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 250
Target Start/End: Original strand, 15516720 - 15516901
Alignment:
Q  70 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttc 168  Q
    |||||||| |||||||||   |||| || |||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15516720 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattc 15516819  T
Q  169 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516820 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttg 15516901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Original strand, 11580588 - 11580693
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  11580588 agaacttgaagaatcaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttaatctaaggtaaggggattagtctttatcat 11580687  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  11580688 aatcat 11580693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16212170 - 16212071
Alignment:
Q  43 ttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatca 142  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16212170 ttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 16212072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Original strand, 13036865 - 13036958
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  13036865 agaacttgaagaatcaaggattggagtaagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 13036958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36053071 - 36052971
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36053071 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 36052973  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  36052972 at 36052971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13352259 - 13352151
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  13352259 tctctttttctatgcataagtgtttatttgaataagtgattattgtgaacccaacccttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgtt 13352160  T
Q  259 aatttgatg 267  Q
    |||||||||    
T  13352159 aatttgatg 13352151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Original strand, 39291457 - 39291565
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39291457 tctctttttctatgcataagtacttatttgaataagtgattattgtgaacctaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgtt 39291556  T
Q  259 aatttgatg 267  Q
    |||||||||    
T  39291557 aatttgatg 39291565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15709572 - 15709469
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  15709572 aacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagaggattagtcttcatcataa 15709473  T
Q  140 tcat 143  Q
    ||||    
T  15709472 tcat 15709469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25124550 - 25124448
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  25124550 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatc 25124452  T
Q  142 attt 145  Q
    ||||    
T  25124451 attt 25124448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7293441 - 7293333
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7293441 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 7293345  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  7293344 tatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Original strand, 17817292 - 17817359
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 110  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17817292 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 17817359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 19049709 - 19049642
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 110  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19049709 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 19049642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11516619 - 11516544
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11516619 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 15441435 - 15441510
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15441435 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 30262000 - 30262075
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30262000 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13321443 - 13321334
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  13321443 gagagaagagcttgaagaatcaa--attggggtaagcttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtctt 13321346  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
     || ||||||||    
T  13321345 catcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36024556 - 36024452
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaa-gtgggttagtctttatgata 138  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||| | ||||||||||| || |||    
T  36024556 aacttgaagaatcaagaattggagtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaaggggggttagtcttcatcata 36024457  T
Q  139 atcat 143  Q
    |||||    
T  36024456 atcat 36024452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 14113860 - 14113935
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14113860 cttagaagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 142
Target Start/End: Original strand, 25292209 - 25292283
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatca 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  25292209 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagataagggggttagtctttatcataatca 25292283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 47480902 - 47480976
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  47480902 ttaggaggtaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 131
Target Start/End: Original strand, 14423511 - 14423574
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14423511 cttagaagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 14423574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 264
Target Start/End: Original strand, 15977820 - 15977894
Alignment:
Q  190 ataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttg 264  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15977820 ataagtgattattatgaactaaatgtttgaaattcatgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttg 15977894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Original strand, 10000245 - 10000318
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatca 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  10000245 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 10000318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13758785 - 13758677
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  13758785 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 13758689  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  13758688 tatcataatcat 13758677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Original strand, 18151259 - 18151357
Alignment:
Q  166 ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttg 264  Q
    |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||   ||||||||||||    
T  18151259 ttctatgcataaattcttatttgaataagtgattattgtgaacttaaccgttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgattaggtatgttaatttg 18151357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Original strand, 48622541 - 48622614
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatca 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  48622541 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatca 48622614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3895462 - 3895395
Alignment:
Q  27 ggttagagagaaga--acttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaag 92  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  3895462 ggttagagagaagaggacttgaagaatcaaggattggggttgagctaggagcaaaattgaagcctaag 3895395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15927951 - 15927875
Alignment:
Q  67 acttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  15927951 acttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 15927875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 18979894 - 18979970
Alignment:
Q  67 acttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  18979894 acttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 18979970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 39046437 - 39046504
Alignment:
Q  27 ggttagagagaaga--acttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaag 92  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  39046437 ggttagagagaagaggacttgaagaatcaaggattggggttaagctaggagcaaaattgaagcttaag 39046504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 56007 - 55779
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  56007 aacttgaagaatcaagaattggagagagcttaggagctaaattgaagcctaaattgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataa 55908  T
Q  140 tcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtag 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55907 tcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtag 55808  T
Q  240 agatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  55807 atatatgtttgaatatgttaatttgatgt 55779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Original strand, 108032 - 108179
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctctt-gt 166  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  108032 cttaggagctgaattgaagcctaagttggaattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttcat 108131  T
Q  167 tctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108132 tctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatc 108179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Original strand, 24385584 - 24385809
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24385584 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 24385682  T
Q  142 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 241  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385683 atttagttaattccttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattattatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 24385782  T
Q  242 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24385783 atatgtttgaatatgataatttgatgt 24385809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 268
Target Start/End: Original strand, 41506631 - 41506866
Alignment:
Q  33 agagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtcttt 132  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||     
T  41506631 agaggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaagagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaggtaagggggttagttttc 41506730  T
Q  133 atgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttat 232  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41506731 atcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatccgtgcttat 41506830  T
Q  233 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506831 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 41506866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 24716763 - 24716919
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24716763 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccg 24716862  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716863 atctttgaaattcgtggttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 24716919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39115629 - 39115473
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| | |||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39115629 aaggtaagggtgttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 39115530  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115529 atctttgacattcgtgcttatgttgtaaagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 39115473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 274797 - 274642
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  274797 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaaccca 274698  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274697 atctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 274642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 267
Target Start/End: Original strand, 641052 - 641207
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  641052 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaaccca 641151  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641152 atctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 641207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 267
Target Start/End: Original strand, 826858 - 827013
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  826858 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaaccca 826957  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826958 atctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 827013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17502468 - 17502360
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17502468 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgtt 17502369  T
Q  259 aatttgatg 267  Q
    |||||||||    
T  17502368 aatttgatg 17502360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 267
Target Start/End: Original strand, 21259304 - 21259547
Alignment:
Q  27 ggttagagagaaga---acttgaagaattaaggattgga-gtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttggg--attaatcttcatccaaggtaagt 120  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||  | | ||||||||     
T  21259304 ggttagagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagct-aggagctaaattgaagcttaagctagggaattaatct--aactaaggtaagg 21259400  T
Q  121 gggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaa 220  Q
    |||||||  || || ||||||| || |||||||  |  |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  21259401 gggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaa 21259500  T
Q  221 attcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21259501 attcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatg 21259547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 43373324 - 43373424
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43373324 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 43373422  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  43373423 at 43373424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 24928648 - 24928748
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  24928648 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatctttatctaaggtaatggggttagtctttatcataatc 24928746  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  24928747 at 24928748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4234162 - 4234054
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  4234162 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgcagtgatatgtttgagtatgtt 4234063  T
Q  259 aatttgatg 267  Q
    |||||||||    
T  4234062 aatttgatg 4234054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23218184 - 23218076
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  23218184 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgcttatgtggtagtgatatgtttgagtatgtt 23218085  T
Q  259 aatttgatg 267  Q
    |||||||||    
T  23218084 aatttgatg 23218076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 143
Target Start/End: Original strand, 16193588 - 16193674
Alignment:
Q  56 gattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16193588 gattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattcatctttatctaaggtaag-gggttagtctttatcataatcat 16193674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 268
Target Start/End: Original strand, 22321437 - 22321503
Alignment:
Q  202 catgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321437 catgaacccaatctttgaaattcgtgctcaggttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 22321503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 22907052 - 22907160
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22907052 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 22907148  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  22907149 tatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5238479 - 5238404
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5238479 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 24661119 - 24661194
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24661119 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43685938 - 43685863
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43685938 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 142
Target Start/End: Original strand, 7000442 - 7000551
Alignment:
Q  33 agagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtcttt 132  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||||||| ||     
T  7000442 agaggagaacttgtagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaagtaagggggttagttttc 7000541  T
Q  133 atgataatca 142  Q
    || |||||||    
T  7000542 atcataatca 7000551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 131
Target Start/End: Original strand, 21494314 - 21494376
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  21494314 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtctt 21494376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22886728 - 22886654
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22886728 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 3431134 - 3431208
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3431134 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttggattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 18118259 - 18118337
Alignment:
Q  189 aataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  18118259 aataagtgattattgtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcgtgttatagagatatgtttgcgtatataaatttgatg 18118337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 268
Target Start/End: Original strand, 13208 - 13443
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  13208 gagagaagagcttgaggaatcaag-attgg-gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 13305  T
Q  132 tatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13306 tatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 13405  T
Q  231 atgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13406 atgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgt 13443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 268
Target Start/End: Original strand, 15272134 - 15272369
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  15272134 gagagaagagcttgaggaatcaag-attgg-gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 15272231  T
Q  132 tatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272232 tatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 15272331  T
Q  231 atgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15272332 atgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgt 15272369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14952161 - 14951960
Alignment:
Q  67 acttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgt 166  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14952161 acttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgt 14952062  T
Q  167 tctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952061 tctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgat 14951962  T
Q  267 gt 268  Q
    ||    
T  14951961 gt 14951960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 5682429 - 5682584
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682429 aaggtaagtgggttagtttttatcataatcatttagttaatt-ttttcctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 5682527  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682528 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 5682584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 25119108 - 25119264
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25119108 aaggtaagggagttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 25119207  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119208 atcttgaaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 25119264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Original strand, 15135830 - 15136010
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  15135830 gagagaagagcttgaggaatcaag-attgg-gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 15135927  T
Q  132 tatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135928 tatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 15136010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13246842 - 13246737
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  13246842 agaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcat 13246743  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  13246742 aatcat 13246737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 122294 - 122194
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  122294 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaagagctaaattgaagtctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggggattagtctttatcataatc 122196  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  122195 at 122194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19559689 - 19559557
Alignment:
Q  136 ataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtt 235  Q
    ||||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||| |||||    
T  19559689 ataatcaattagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatgtacccaacttttgaaattcctgctcatgtt 19559590  T
Q  236 gtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  19559589 gtagtgatatgtttgagcatgttaatttgatgt 19559557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 15674938 - 15675041
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  15674938 aacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataa 15675037  T
Q  140 tcat 143  Q
    ||||    
T  15675038 tcat 15675041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 49071994 - 49071885
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  49071994 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgatcattgtgaacccaaccgttgaaattcgtgctcatattgtagtgatatgtttgagtatgtt 49071895  T
Q  259 aatttgatgt 268  Q
    ||||||||||    
T  49071894 aatttgatgt 49071885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 10104099 - 10104202
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  10104099 aacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtaaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataa 10104198  T
Q  140 tcat 143  Q
    ||||    
T  10104199 tcat 10104202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26680625 - 26680517
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26680625 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 26680529  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  26680528 tatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 16608970 - 16609045
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16608970 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33241114 - 33241011
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  33241114 aacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagttaaagcgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataa 33241015  T
Q  140 tcat 143  Q
    ||||    
T  33241014 tcat 33241011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 40885371 - 40885475
Alignment:
Q  27 ggttagagagaaga---acttgaagaattaaggatt-ggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgg 122  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  40885371 ggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggatttggagtgaatctaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggg 40885470  T
Q  123 gttag 127  Q
    |||||    
T  40885471 gttag 40885475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 142
Target Start/End: Original strand, 55376417 - 55376525
Alignment:
Q  33 agagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtcttt 132  Q
    |||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  55376417 agaggagaacttgaagaaccaagaattgg-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttgatccttatctaaggtaagggggttagtcttc 55376515  T
Q  133 atgataatca 142  Q
    || |||||||    
T  55376516 atcataatca 55376525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31132728 - 31132628
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  31132728 aacttgtagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtggagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataa 31132629  T
Q  140 t 140  Q
    |    
T  31132628 t 31132628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 16327797 - 16327872
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16327797 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggcctaatcttcatataaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 262
Target Start/End: Original strand, 34177617 - 34177691
Alignment:
Q  188 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 262  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34177617 gaataagtgattattgtgaatccaatcttgaaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatt 34177691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 131
Target Start/End: Original strand, 32460561 - 32460623
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  32460561 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtctt 32460623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10488954 - 10488879
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||  |||||||    
T  10488954 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaaggtggttggtctttatcttaatcat 10488879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 134
Target Start/End: Original strand, 13048092 - 13048158
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttat 134  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  13048092 cttaggagttaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagttaagggggttagtctttat 13048158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22738650 - 22738577
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatca 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  22738650 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 22738577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20001138 - 20001030
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  20001138 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 20001042  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  20001041 tatcataatcat 20001030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26339434 - 26339327
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  26339434 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 26339338  T
Q  132 tatgataatca 142  Q
    ||| |||||||    
T  26339337 tatcataatca 26339327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 7131940 - 7132014
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  7131940 ttaggagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 7132014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8045346 - 8045272
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8045346 ttaggagctaaagtgaagtctaagtttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 92
Target Start/End: Original strand, 23269756 - 23269809
Alignment:
Q  39 gaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaag 92  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  23269756 gaacttgaagaatcaaggattggagttgagctaggagcaaaattgaagcctaag 23269809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 263
Target Start/End: Original strand, 14500208 - 14500268
Alignment:
Q  203 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaattt 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| | | |||| |||||| |||||||||||    
T  14500208 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattt 14500268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 15287118 - 15287194
Alignment:
Q  67 acttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  15287118 acttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 15287194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 15294227 - 15294303
Alignment:
Q  67 acttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  15294227 acttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 15294303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Original strand, 6375 - 6601
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6375 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattattccttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 6473  T
Q  142 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6474 atttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgataataggtgcttatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 6573  T
Q  242 atatgtttgaatatgttaatttgatgtc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574 atatgtttgaatatgttaatttgatgtc 6601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23995356 - 23995121
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  23995356 gagagaagagcttgaggaatcaag-attgg-gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 23995259  T
Q  132 tatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgctt 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23995258 tatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatatttggaattcgtgctt 23995159  T
Q  231 atgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23995158 atgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgt 23995121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26090159 - 26089933
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||| | | | | | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26090159 cttgaagaatcaag-attggagtgaggttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattgagcattacctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 26090061  T
Q  142 atttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtaga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090060 atttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtaga 26089961  T
Q  241 gatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089960 gatatgtttgaatatgttaatttgatgt 26089933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 267
Target Start/End: Original strand, 15742078 - 15742275
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttc 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15742078 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcctttggttaattctttttctcttgttc 15742177  T
Q  169 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15742178 -atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgattatgttaatttgatg 15742275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Original strand, 18002353 - 18002553
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttg-tt 167  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18002353 ttaggagctaaagtgaaggctaagtttagattaatcataacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgatt 18002452  T
Q  168 ctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18002453 ctatgcataattgattatgggcataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttcatttgatg 18002552  T
Q  268 t 268  Q
    |    
T  18002553 t 18002553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 19983193 - 19983349
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19983193 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcca 19983292  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983293 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 19983349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 35015058 - 35015214
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35015058 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 35015157  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015158 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 35015214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991271
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 210  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgtttaattctttttctcttgattttatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 4991328  T
Q  211 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4991327 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgtt-atttgatgt 4991271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18583671 - 18583515
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18583671 aaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcctgttctatgcatcattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 18583572  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18583571 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgt 18583515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23148408 - 23148303
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||    
T  23148408 agaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatcat 23148309  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  23148308 aatcat 23148303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23153859 - 23153754
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||    
T  23153859 agaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatcat 23153760  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  23153759 aatcat 23153754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27751852 - 27751742
Alignment:
Q  33 agagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtcttt 132  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||     
T  27751852 agaggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttc 27751753  T
Q  133 atgataatcat 143  Q
    || ||||||||    
T  27751752 atcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Original strand, 22585494 - 22585602
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  22585494 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatttt 22585593  T
Q  259 aatttgatg 267  Q
    |||||||||    
T  22585594 aatttgatg 22585602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Original strand, 22590325 - 22590433
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  22590325 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatttt 22590424  T
Q  259 aatttgatg 267  Q
    |||||||||    
T  22590425 aatttgatg 22590433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 15889631 - 15889762
Alignment:
Q  136 ataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtt 235  Q
    ||||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15889631 ataatcacttagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaatacgtgattattgtgaacccaacctttgaaattcgtgctcatgtt 15889730  T
Q  236 gtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15889731 gtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatg 15889762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 268
Target Start/End: Original strand, 15004855 - 15004963
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  15004855 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagagattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatg-t 15004953  T
Q  259 aatttgatgt 268  Q
    ||||||||||    
T  15004954 aatttgatgt 15004963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Original strand, 25640504 - 25640611
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 258  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25640504 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtag-gatatgtttgagtatgtt 25640602  T
Q  259 aatttgatg 267  Q
    |||||||||    
T  25640603 aatttgatg 25640611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29666290 - 29666181
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  29666290 gagagaagagcttgaagaatcaa--attggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaacataagtgggttagtctt 29666193  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
     || ||||||||    
T  29666192 catcataatcat 29666181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 1649978 - 1650053
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1649978 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1650053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 35009253 - 35009384
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagaga--gaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatcc 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||| ||||| |||||  || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||     
T  35009253 agagaggaacaagggttagagaaggagaaacttgaagaatcaagaattggggtgaatctaagagctaaagtgaagccaaagtttggattaatcattatct 35009352  T
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  35009353 aaagtaagggggttagtcttcatcataatcat 35009384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 32276617 - 32276691
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  32276617 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 90
Target Start/End: Original strand, 14128502 - 14128552
Alignment:
Q  39 gaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagccta 90  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14128502 gaacttgaagaactaaggattgg-gtgagcttaggagctaaattgaagccta 14128552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 131
Target Start/End: Original strand, 16299844 - 16299906
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||| |||||||||||    
T  16299844 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtctt 16299906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 18823241 - 18823315
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18823241 ttaggagctaaagtgaagtttaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 18839096 - 18839170
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18839096 ttagaagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16232275 - 16232199
Alignment:
Q  67 acttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  16232275 acttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 16232199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Original strand, 193329 - 193545
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  193329 cttgaagaattaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 193427  T
Q  142 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||    
T  193428 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatcattgaaattcgtgc---------agag 193518  T
Q  242 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  193519 atatgtttgaatatgttaatttgatgt 193545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 267
Target Start/End: Original strand, 12350 - 12574
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  12350 cttgaagaatcaag-attggattgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggatgaatctttatctaaggtaagggggttagtttttatcataatc 12448  T
Q  142 atttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagag 241  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12449 atttagttaattctttttcttttgttctatgcataattgattatgggaataagttattatcatgaacccaatctttgaaatttgtgcttatgttgtagag 12548  T
Q  242 atatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12549 atatgtttgaatatgttaatttgatg 12574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Original strand, 15861285 - 15861483
Alignment:
Q  70 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttct 169  Q
    |||||||| |||||||||   |||| || |||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861285 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttct 15861384  T
Q  170 atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861385 atgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 15861483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21860365 - 21860209
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21860365 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 21860266  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860265 atctttgaaattcgtacttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 21860209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 44034872 - 44035028
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034872 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 44034971  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44034972 atctttgaaattcttgtttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgt 44035028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22367296 - 22367216
Alignment:
Q  188 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367296 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 22367216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Original strand, 37844301 - 37844406
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  37844301 agaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatttttatctaaggtaagggggttagtctttatcat 37844400  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  37844401 aatcat 37844406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20446092 - 20445987
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  20446092 agaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggagttagtctttatcat 20445993  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  20445992 aatcat 20445987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Original strand, 20893478 - 20893583
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||    
T  20893478 agaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatcat 20893577  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  20893578 aatcat 20893583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20531856 - 20531751
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    ||||||||||| ||    
T  20531856 agaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagataaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggaaattagtctttatcat 20531757  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  20531756 aatcat 20531751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20913439 - 20913335
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |    
T  20913439 agaaattgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcgt 20913341  T
Q  138 aatcat 143  Q
    ||||||    
T  20913340 aatcat 20913335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41218759 - 41218667
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 204  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41218759 aaggtaagggggttagttttcatcatgatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattctcat 41218667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20931737 - 20931650
Alignment:
Q  56 gattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  20931737 gattggagtgagcttagcagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 20931650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45051801 - 45051726
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45051801 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 45051726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 51452884 - 51452809
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  51452884 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 7640775 - 7640882
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||  |    
T  7640775 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttat 7640871  T
Q  132 tatgataatca 142  Q
    ||| |||||||    
T  7640872 tatcataatca 7640882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 80218 - 80062
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80218 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 80119  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80118 atctttgaaatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 80062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Original strand, 4304 - 4504
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttg-tt 167  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | | | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4304 ttaggagctaaagtgaagcaaaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagactttatcataatcatttggttaattctttttctcttcatt 4403  T
Q  168 ctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4404 ctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattagtgcttatgttgtagagatatgtttaaatatgttaatttgatg 4503  T
Q  268 t 268  Q
    |    
T  4504 t 4504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 268
Target Start/End: Original strand, 5 - 85
Alignment:
Q  188 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 85  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 5984 - 6140
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5984 aaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 6083  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6084 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgt 6140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 112 - 257
Target Start/End: Original strand, 5778 - 5923
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5778 aaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 5877  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5878 atctttgaaattcgtgcttctgttgtagagatgtgtttgaatatgt 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 112 - 266
Target Start/End: Original strand, 162079 - 162233
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162079 aaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 162178  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  162179 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgat 162233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 112 - 266
Target Start/End: Original strand, 166165 - 166319
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166165 aaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 166264  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  166265 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgat 166319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 31181 - 31337
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31181 aaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 31280  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  31281 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgt 31337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41663 - 41507
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41663 aaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 41564  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41563 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgt 41507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 36904 - 37012
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36904 gagagaagaacttgaagaatcca--attgg-gtaagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 37000  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
    ||| ||||||||    
T  37001 tatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 112 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130760
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 210  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 130812  T
Q  211 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  130811 aatctttgaaattcgtgctcatgttgtagagatatgtttggatacgttaatt 130760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Original strand, 89305 - 89398
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  89305 agaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 89398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Original strand, 107635 - 107728
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  107635 agaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 107728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42708 - 42568
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42708 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 42609  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42608 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatggttgaa 42568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13927 - 13824
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  13927 aacttgaagaattaagaattggggtgaatctagaagataaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataa 13828  T
Q  140 tcat 143  Q
    ||||    
T  13827 tcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30448 - 30292
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||| |||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  30448 aaggtaagggggttatttttcatcataatcatttagttaattatttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccct 30349  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30348 atctttgaaattcatgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 30292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 413 - 353
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagt 128  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  413 cttaggagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagt 353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 353 - 508
Alignment:
Q  112 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 211  Q
    |||||||  |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  353 aaggtaacggggttattctttatcataatcatctagttaattctttt-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 451  T
Q  212 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  452 atatttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatatttgaatatgttaatttgatgt 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26372
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaa 113  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26243 agagaagaaaaagggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagatgggattaatcttcatctaa 26342  T
Q  114 ggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26343 ggtaagggggttagtctttatcataatcat 26372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 8021 - 8125
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaa-gtgggttagtctttatgata 138  Q
    |||||||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||| || |||    
T  8021 aacttgaagaatcaagaattgaggtgaatctaggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggggttagtcttcatcata 8120  T
Q  139 atcat 143  Q
    |||||    
T  8121 atcat 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12138 - 12063
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12138 cttaggagctaaattgaagccaaagtttggattaatcattatctaagataagggggttagtcttcatcataatcat 12063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15326 - 15238
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaa 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326 agagaagaacaaaggttagagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaa 15238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15236 - 15147
Alignment:
Q  179 tgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236 tgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtcgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 15147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 839 - 914
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||| ||||||| |   ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  839 cttaggagctgaattgaatcaagagttggggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 51008 - 51140
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51008 agagaagaacaagggttagagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 51107  T
Q  111 caaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
      |||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  51108 ttaggtaaggagattagtctttatcataatcat 51140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 147006 - 146906
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  147006 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 146908  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  146907 at 146906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9263 - 9160
Alignment:
Q  40 aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataa 139  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||||| ||||||||| || ||||    
T  9263 aacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagtgtgttagtcttcatcataa 9164  T
Q  140 tcat 143  Q
    ||||    
T  9163 tcat 9160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Original strand, 123011 - 123107
Alignment:
Q  35 agaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  123011 agaagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtctt 123107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 44039 - 44170
Alignment:
Q  136 ataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtt 235  Q
    ||||||| || |||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44039 ataatcacttagttaatttcttctctcttttgctatgcataagtgattatttgaataagtgattattgtgaacctaatctttgaaattcgtgctcatgtt 44138  T
Q  236 gtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44139 gtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatg 44170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42166 - 42034
Alignment:
Q  14 agagatgaacaaaggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  42166 agagaagaacaagggttagagagaaggagaacttgaagaactaaggattggactgagcttaggaggtaaattgaagtctaagttgggattaatatttatc 42067  T
Q  111 caaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
     |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcat 42034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9283 - 9183
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9283 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 9185  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  9184 at 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 172310 - 172210
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  172310 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 172212  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  172211 at 172210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 178013 - 177913
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  178013 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 177915  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  177914 at 177913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1530 - 1430
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1530 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgtgattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 1432  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  1431 at 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 3440 - 3540
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  3440 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttgtcataatc 3538  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  3539 at 3540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Original strand, 247292 - 247398
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattg--gagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatg 135  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  247292 agaacttgaagaatcaagggttgaggag-gagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatc 247390  T
Q  136 ataatcat 143  Q
    ||||||||    
T  247391 ataatcat 247398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 34032 - 34107
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  34032 cttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 272417 - 272330
Alignment:
Q  56 gattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  272417 gattggagtgagctcaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 272330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 57315 - 57427
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  57315 gagagaagagcttgaggaatcaag-attgg-gtgagcttagtagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 57412  T
Q  132 tatgataatcatttg 146  Q
    ||| |||||||||||    
T  57413 tatcataatcatttg 57427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12519 - 12418
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12519 cttgaagaatcaaaaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttaggattaatctctatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 12420  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  12419 at 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 128027 - 128127
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatc 141  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  128027 cttgaagaatcaag-attggagtgagattaggagataaaatgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 128125  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  128126 at 128127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 443 - 339
Alignment:
Q  38 agaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgat 137  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  443 agaacttgaagaatcaagaattggggtggtcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatccttatctaaggtaagggggttagtcttcatcat 344  T
Q  138 aatca 142  Q
    |||||    
T  343 aatca 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 384 - 305
Alignment:
Q  188 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  384 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcttgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatg 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Original strand, 1478 - 1557
Alignment:
Q  188 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1478 gaataaatgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatg 1557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 36766 - 36869
Alignment:
Q  42 cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaat---tgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgata 138  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  36766 cttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagaagtgaagcctaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcata 36864  T
Q  139 atcat 143  Q
    |||||    
T  36865 atcat 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25532
Alignment:
Q  33 agagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtcttt 132  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  25640 agaggagaacttgaagaatcaagaattag-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaggtaagggggttagtcttc 25542  T
Q  133 atgataatca 142  Q
    || |||||||    
T  25541 atcataatca 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22932 - 22857
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22932 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27187 - 27112
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27187 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 1453 - 1528
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1453 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 55936 - 56045
Alignment:
Q  32 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| | ||| || |||||||||||    
T  55936 gagagaagagcttgaagaatcaa--attggggtgaacttaggagataaattaaagcctaagtttggattaatcattatctacggtcagggggttagtctt 56033  T
Q  132 tatgataatcat 143  Q
     || ||||||||    
T  56034 catcataatcat 56045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5921 - 5846
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  5921 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Original strand, 3785 - 3897
Alignment:
Q  159 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtag----agatatgtttgaata 254  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||    | |||||||||| ||    
T  3785 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaaccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatatgtttgagta 3884  T
Q  255 tgttaatttgatg 267  Q
    |||||||||||||    
T  3885 tgttaatttgatg 3897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 34266 - 34340
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  34266 ttaggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45413 - 45338
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  45413 cttaggagcttaattgaagcctaagtttggattaaccattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18100 - 18026
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18100 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42039 - 41965
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  42039 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 41965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 5947 - 6024
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcattt 145  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5947 cttaggagctgaattgaagcaagagttaggattaatctctatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 49002 - 48903
Alignment:
Q  43 ttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatca 142  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||| | | | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49002 ttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtaaagcctaagtttagattgagcattacctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 48904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 131
Target Start/End: Original strand, 10213 - 10276
Alignment:
Q  68 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  10213 cttatgagctaaagtgaagcctaagttggggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtctt 10276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 5434 - 5508
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  5434 ttaggagctaaagtgaagcctaagattggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5623 - 5549
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 143  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  5623 ttaggagctaaaatgaagcccaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 131
Target Start/End: Original strand, 49710 - 49772
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||| |||||||||||    
T  49710 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtctt 49772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 2875 - 2942
Alignment:
Q  27 ggttagagagaaga--acttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaag 92  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2875 ggttagagagaagatgacttgaagaatcaaggattggggttaagctaggagcaaaattgaagcctaag 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 128
Target Start/End: Original strand, 9223 - 9282
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  9223 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggttagt 9282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 128
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16180
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  16121 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggttagt 16180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6133 - 6082
Alignment:
Q  216 ttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg 267  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6133 ttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaaattgatg 6082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3578 - 3528
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaag 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  3578 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttgaattaatcatcatctaaggtaag 3528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 34102 - 34034
Alignment:
Q  27 ggttagagagaa---gaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaag 92  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  34102 ggttagagagaaaaggaacttgaagaatcaaggattgggggaaagctaggagctaaattgaagcctaag 34034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 95372 - 95310
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctt 131  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | | | |||||||| |||||||||||    
T  95372 ttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtctt 95310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Original strand, 12002 - 12075
Alignment:
Q  69 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatccaaggtaagtgggttagtctttatgataatca 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  12002 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaaaattaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatca 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 92
Target Start/End: Original strand, 11465 - 11529
Alignment:
Q  30 tagagagaaga--acttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaag 92  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  11465 tagagagaagaggacttgaagaatcaaggattggggttaagctaggagcaaaattgaagcctaag 11529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University