View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12599_low_17 (Length: 450)

Name: NF12599_low_17
Description: NF12599
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12599_low_17
NF12599_low_17
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (21-450)||(15100527-15100955)
chr7 (21-450)||(14262169-14262596)
chr7 (21-450)||(13675349-13675777)
chr7 (21-449)||(16070222-16070647)
chr7 (21-450)||(20748507-20748933)
chr7 (21-450)||(19149108-19149534)
chr7 (21-450)||(12204724-12205152)
chr7 (21-450)||(16948396-16948824)
chr7 (22-448)||(13023255-13023680)
chr7 (21-448)||(19614572-19614998)
chr7 (34-450)||(14139589-14140004)
chr7 (24-450)||(15342331-15342756)
chr7 (21-450)||(12458537-12458965)
chr7 (34-448)||(18051879-18052292)
chr7 (23-394)||(14284356-14284726)
chr7 (21-448)||(23503796-23504222)
chr7 (21-396)||(11301191-11301565)
chr7 (23-450)||(11386353-11386779)
chr7 (21-394)||(13966648-13967020)
chr7 (21-394)||(26092778-26093150)
chr7 (21-450)||(49154198-49154626)
chr7 (23-450)||(48813198-48813623)
chr7 (21-391)||(26116573-26116942)
chr7 (21-450)||(11235159-11235587)
chr7 (21-450)||(11551048-11551476)
chr7 (21-450)||(14334292-14334720)
chr7 (21-450)||(15159003-15159431)
chr7 (21-450)||(8709501-8709929)
chr7 (21-450)||(14956450-14956878)
chr7 (23-450)||(12689400-12689826)
chr7 (23-450)||(15146830-15147257)
chr7 (22-450)||(15296-15723)
chr7 (24-450)||(15626424-15626849)
chr7 (105-450)||(13688021-13688365)
chr7 (21-450)||(10872586-10873014)
chr7 (71-450)||(44789297-44789675)
chr7 (222-450)||(18179841-18180069)
chr7 (131-450)||(18588117-18588435)
chr7 (21-446)||(14041591-14042015)
chr7 (21-446)||(14351621-14352045)
chr7 (237-450)||(9590479-9590692)
chr7 (21-153)||(11770483-11770615)
chr7 (355-450)||(7826129-7826224)
chr7 (355-450)||(27105720-27105815)
chr7 (355-450)||(27172510-27172605)
chr7 (367-450)||(11770348-11770431)
chr7 (21-129)||(14213570-14213678)
chr7 (224-399)||(39143-39318)
chr7 (355-450)||(4442157-4442252)
chr7 (71-159)||(7825846-7825934)
chr7 (71-159)||(27106010-27106098)
chr7 (71-159)||(27172227-27172315)
chr7 (357-448)||(13379114-13379205)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (21-450)||(49042-49470)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (21-450)||(2654-3082)
scaffold0079 (71-450)||(35484-35862)
scaffold0079 (222-388)||(28237-28403)
scaffold0079 (413-450)||(28405-28442)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (21-450)||(150507-150935)
scaffold0011 (21-450)||(24473-24901)
scaffold0011 (21-146)||(193947-194072)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (21-450)||(4687-5115)
scaffold0035 (237-450)||(42047-42260)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (21-450)||(109568-109996)
scaffold0031 (24-448)||(54933-55356)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (24-450)||(28563-28988)
scaffold0067 (21-450)||(59154-59582)
scaffold0067 (21-450)||(50120-50548)
scaffold0067 (21-450)||(65542-65970)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (21-450)||(9998-10425)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (21-450)||(21455-21883)
scaffold0261 (21-450)||(13276-13704)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (21-450)||(15001302-15001729)
chr4 (21-450)||(15357057-15357485)
chr4 (21-450)||(16149618-16150046)
chr4 (21-450)||(16153764-16154192)
chr4 (21-448)||(15072266-15072692)
chr4 (99-450)||(15257913-15258262)
chr4 (23-448)||(27902295-27902719)
chr4 (21-450)||(8707818-8708242)
chr4 (23-450)||(1647214-1647640)
chr4 (34-448)||(51604731-51605144)
chr4 (21-394)||(3262787-3263159)
chr4 (21-391)||(29451533-29451902)
chr4 (21-394)||(11205225-11205596)
chr4 (21-283)||(15323124-15323385)
chr4 (21-391)||(44659862-44660231)
chr4 (21-450)||(8051300-8051728)
chr4 (21-450)||(14301656-14302084)
chr4 (21-449)||(14696020-14696447)
chr4 (21-450)||(14161377-14161805)
chr4 (21-450)||(14682474-14682902)
chr4 (21-450)||(23957654-23958082)
chr4 (23-450)||(40474949-40475375)
chr4 (21-450)||(12478507-12478935)
chr4 (21-450)||(19776470-19776898)
chr4 (21-450)||(27713243-27713671)
chr4 (21-450)||(18225123-18225551)
chr4 (222-450)||(16218337-16218565)
chr4 (222-450)||(16221657-16221885)
chr4 (21-448)||(14849045-14849471)
chr4 (39-450)||(8388337-8388747)
chr4 (107-450)||(16234669-16235011)
chr4 (23-421)||(15145591-15145988)
chr4 (113-450)||(17092826-17093162)
chr4 (246-449)||(23443237-23443439)
chr4 (24-388)||(16353246-16353610)
chr4 (319-450)||(22631908-22632039)
chr4 (355-450)||(15291095-15291190)
chr4 (21-208)||(18613743-18613929)
chr4 (21-102)||(15247831-15247910)
chr4 (375-450)||(16251527-16251602)
chr4 (39-156)||(12341095-12341212)
chr4 (21-145)||(1640321-1640445)
chr4 (71-159)||(15291385-15291473)
chr4 (413-450)||(16353207-16353244)
chr4 (378-450)||(12340802-12340874)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (21-450)||(453153-453581)
scaffold0001 (21-450)||(515293-515721)
scaffold0001 (23-450)||(494957-495384)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (21-450)||(21743561-21743989)
chr1 (21-450)||(19661145-19661573)
chr1 (21-450)||(19856227-19856655)
chr1 (21-450)||(20938072-20938500)
chr1 (21-450)||(24097612-24098040)
chr1 (21-448)||(20833911-20834337)
chr1 (21-450)||(20296334-20296762)
chr1 (34-448)||(20854771-20855184)
chr1 (21-394)||(21952831-21953203)
chr1 (21-394)||(48424826-48425198)
chr1 (21-394)||(52987694-52988066)
chr1 (21-396)||(31538060-31538434)
chr1 (21-391)||(38910894-38911263)
chr1 (21-396)||(37679002-37679376)
chr1 (222-450)||(41310679-41310907)
chr1 (21-450)||(24792625-24793053)
chr1 (21-450)||(21838872-21839300)
chr1 (21-450)||(17043024-17043452)
chr1 (21-450)||(50618407-50618835)
chr1 (23-450)||(19108292-19108718)
chr1 (39-450)||(33389038-33389448)
chr1 (24-198)||(41308598-41308771)
chr1 (21-450)||(21233740-21234168)
chr1 (21-450)||(21832224-21832652)
chr1 (21-450)||(51331502-51331930)
chr1 (177-450)||(16378172-16378445)
chr1 (24-450)||(22503298-22503723)
chr1 (71-450)||(16348604-16348983)
chr1 (39-421)||(41351700-41352081)
chr1 (21-450)||(20140005-20140433)
chr1 (21-450)||(21750862-21751290)
chr1 (24-450)||(21862382-21862807)
chr1 (21-163)||(23196544-23196686)
chr1 (21-450)||(430125-430553)
chr1 (21-448)||(22360255-22360681)
chr1 (355-450)||(20829401-20829496)
chr1 (346-450)||(35930834-35930938)
chr1 (222-311)||(20944152-20944241)
chr1 (71-159)||(20829691-20829779)
chr1 (24-168)||(21026098-21026242)
chr1 (346-450)||(41215865-41215969)
chr1 (346-450)||(20527299-20527403)
chr1 (21-60)||(22116835-22116874)
chr1 (355-448)||(20927309-20927402)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (23-450)||(33274-33700)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (21-450)||(11731-12160)
scaffold0309 (21-450)||(16579-17007)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (21-450)||(1425-1853)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (21-450)||(5291-5718)
scaffold0149 (21-450)||(9722-10149)
scaffold0149 (258-450)||(1-193)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (23-440)||(19454797-19455213)
chr6 (21-450)||(25769615-25770043)
chr6 (21-450)||(14377998-14378426)
chr6 (21-450)||(14379548-14379976)
chr6 (21-450)||(19436773-19437201)
chr6 (21-450)||(18796461-18796889)
chr6 (21-449)||(21473372-21473798)
chr6 (21-448)||(19881069-19881495)
chr6 (21-450)||(10466931-10467359)
chr6 (21-448)||(34643670-34644096)
chr6 (24-394)||(21568129-21568498)
chr6 (34-448)||(28280897-28281310)
chr6 (26-448)||(15461112-15461533)
chr6 (21-391)||(24366183-24366552)
chr6 (39-450)||(2872885-2873295)
chr6 (24-450)||(22828437-22828862)
chr6 (24-325)||(19487489-19487779)
chr6 (39-450)||(24293864-24294274)
chr6 (21-450)||(5837301-5837729)
chr6 (39-450)||(27189225-27189635)
chr6 (39-450)||(27259605-27260015)
chr6 (267-450)||(24516490-24516673)
chr6 (122-442)||(23085861-23086180)
chr6 (21-438)||(16925732-16926148)
chr6 (21-450)||(25607943-25608371)
chr6 (21-450)||(27563915-27564343)
chr6 (34-450)||(19866471-19866886)
chr6 (39-450)||(25114341-25114751)
chr6 (71-450)||(28261279-28261657)
chr6 (71-450)||(28284259-28284637)
chr6 (71-450)||(28340028-28340406)
chr6 (24-450)||(16961564-16961989)
chr6 (237-450)||(18183449-18183662)
chr6 (21-450)||(22760537-22760965)
chr6 (237-450)||(18963170-18963383)
chr6 (240-450)||(16573879-16574089)
chr6 (240-450)||(16621291-16621501)
chr6 (21-450)||(25763310-25763738)
chr6 (21-450)||(18406026-18406454)
chr6 (21-450)||(20634022-20634450)
chr6 (23-450)||(22435642-22436068)
chr6 (21-163)||(5295574-5295716)
chr6 (319-450)||(30679089-30679220)
chr6 (21-340)||(23080240-23080558)
chr6 (345-449)||(8761835-8761939)
chr6 (228-450)||(18450480-18450702)
chr6 (324-450)||(21755006-21755132)
chr6 (355-450)||(16380455-16380550)
chr6 (355-450)||(16648051-16648146)
chr6 (25-163)||(18965663-18965801)
chr6 (23-388)||(22444040-22444404)
chr6 (355-450)||(23998352-23998447)
chr6 (346-450)||(1646896-1647000)
chr6 (346-450)||(16100110-16100214)
chr6 (346-450)||(14130564-14130668)
chr6 (71-159)||(16380745-16380833)
chr6 (346-450)||(23025828-23025932)
chr6 (384-444)||(23080556-23080616)
chr6 (71-174)||(1647171-1647274)
chr6 (23-162)||(18196102-18196241)
chr6 (71-159)||(16648341-16648429)
chr6 (71-159)||(23998069-23998157)
chr6 (23-111)||(18450276-18450364)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (21-450)||(4114-4545)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (21-450)||(22234039-22234467)
chr5 (34-448)||(17267455-17267868)
chr5 (21-391)||(22504500-22504869)
chr5 (21-342)||(21679005-21679325)
chr5 (34-448)||(22463785-22464198)
chr5 (21-448)||(25849896-25850322)
chr5 (33-448)||(20823286-20823700)
chr5 (26-448)||(28893063-28893484)
chr5 (26-448)||(28921889-28922310)
chr5 (21-394)||(20344103-20344475)
chr5 (21-391)||(14885169-14885538)
chr5 (26-450)||(20777739-20778162)
chr5 (92-450)||(21562144-21562500)
chr5 (21-391)||(24796575-24796944)
chr5 (21-394)||(37541556-37541928)
chr5 (23-449)||(20466219-20466644)
chr5 (21-449)||(26736847-26737274)
chr5 (21-450)||(37289615-37290043)
chr5 (21-450)||(14997858-14998286)
chr5 (21-450)||(22331006-22331434)
chr5 (21-450)||(22136507-22136935)
chr5 (23-450)||(22349760-22350186)
chr5 (26-340)||(28914642-28914955)
chr5 (26-340)||(28929910-28930223)
chr5 (21-450)||(29474192-29474620)
chr5 (21-450)||(23473066-23473494)
chr5 (21-450)||(18780953-18781381)
chr5 (21-450)||(19771799-19772227)
chr5 (41-450)||(27683519-27683927)
chr5 (21-450)||(41772681-41773109)
chr5 (21-450)||(27520245-27520673)
chr5 (21-450)||(27612193-27612621)
chr5 (27-450)||(21337413-21337835)
chr5 (39-450)||(27666609-27667019)
chr5 (21-450)||(16358341-16358769)
chr5 (21-450)||(34568333-34568761)
chr5 (71-450)||(40710669-40711047)
chr5 (24-450)||(20801239-20801664)
chr5 (21-450)||(25428272-25428700)
chr5 (21-164)||(24618699-24618842)
chr5 (21-164)||(24714930-24715073)
chr5 (21-164)||(24747958-24748101)
chr5 (237-448)||(21409188-21409399)
chr5 (355-450)||(21935307-21935402)
chr5 (355-450)||(23507838-23507933)
chr5 (355-450)||(24583364-24583459)
chr5 (71-159)||(21935597-21935685)
chr5 (339-448)||(21676955-21677064)
chr5 (24-111)||(21408979-21409066)
chr5 (71-174)||(24583081-24583184)
chr5 (71-159)||(23507555-23507643)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (21-450)||(1807-2235)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (21-450)||(16050-16478)
scaffold0266 (355-448)||(7803-7896)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (21-450)||(2893-3321)
scaffold0034 (23-448)||(69310-69734)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (21-450)||(50748-51176)
scaffold0026 (21-413)||(30883-31274)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (21-450)||(11950073-11950501)
chr3 (25-450)||(12358692-12359116)
chr3 (21-450)||(31940439-31940867)
chr3 (21-450)||(12179874-12180308)
chr3 (21-450)||(31693350-31693778)
chr3 (21-450)||(17187910-17188338)
chr3 (21-450)||(15229139-15229567)
chr3 (21-450)||(15235007-15235435)
chr3 (21-450)||(18132511-18132939)
chr3 (21-448)||(14088209-14088635)
chr3 (21-448)||(13970287-13970713)
chr3 (34-447)||(16379096-16379508)
chr3 (21-391)||(16834734-16835103)
chr3 (23-450)||(11959334-11959760)
chr3 (136-450)||(16826446-16826754)
chr3 (21-448)||(13318669-13319095)
chr3 (34-448)||(41179071-41179484)
chr3 (34-448)||(44778796-44779209)
chr3 (33-448)||(10418212-10418626)
chr3 (34-448)||(13943573-13943986)
chr3 (21-394)||(28755854-28756226)
chr3 (21-450)||(16327825-16328253)
chr3 (150-405)||(12269875-12270129)
chr3 (21-394)||(47125480-47125852)
chr3 (23-450)||(15400693-15401119)
chr3 (255-450)||(24189073-24189268)
chr3 (21-449)||(14874676-14875103)
chr3 (39-450)||(5108787-5109197)
chr3 (21-448)||(15261156-15261582)
chr3 (252-450)||(14291697-14291895)
chr3 (21-450)||(20060230-20060658)
chr3 (39-450)||(5423106-5423516)
chr3 (39-450)||(15346421-15346831)
chr3 (39-450)||(53383194-53383604)
chr3 (21-450)||(48426973-48427401)
chr3 (175-450)||(12510648-12510923)
chr3 (107-450)||(16754877-16755219)
chr3 (21-450)||(15587568-15587996)
chr3 (279-450)||(11888530-11888701)
chr3 (39-450)||(16805123-16805533)
chr3 (21-450)||(10007126-10007554)
chr3 (21-450)||(13254216-13254644)
chr3 (21-450)||(10907736-10908164)
chr3 (21-450)||(16637299-16637727)
chr3 (39-450)||(6602280-6602690)
chr3 (39-450)||(12888253-12888663)
chr3 (227-448)||(8745557-8745776)
chr3 (21-449)||(16693690-16694117)
chr3 (107-450)||(3687555-3687897)
chr3 (21-388)||(15723172-15723538)
chr3 (24-450)||(15013932-15014357)
chr3 (238-391)||(10407720-10407873)
chr3 (21-450)||(17491376-17491804)
chr3 (258-450)||(14579584-14579776)
chr3 (303-450)||(15357890-15358037)
chr3 (21-198)||(10385207-10385383)
chr3 (25-298)||(15340799-15341071)
chr3 (23-340)||(12499776-12500092)
chr3 (354-450)||(24185048-24185144)
chr3 (355-450)||(8272575-8272670)
chr3 (355-450)||(30139675-30139770)
chr3 (355-450)||(30149226-30149321)
chr3 (390-450)||(15714232-15714292)
chr3 (94-283)||(11889623-11889811)
chr3 (402-450)||(12272254-12272302)
chr3 (346-450)||(15611963-15612067)
chr3 (355-450)||(13965528-13965623)
chr3 (346-448)||(6151031-6151133)
chr3 (375-450)||(15948646-15948721)
chr3 (378-449)||(18437022-18437093)
chr3 (399-450)||(43164578-43164629)
chr3 (346-450)||(17200494-17200598)
chr3 (71-159)||(30139392-30139480)
chr3 (71-159)||(30148943-30149031)
chr3 (71-159)||(8272865-8272953)
chr3 (21-67)||(16826750-16826796)
chr3 (355-436)||(25768187-25768268)
chr3 (71-159)||(15611689-15611777)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (21-450)||(21927400-21927829)
chr8 (21-450)||(23656900-23657328)
chr8 (24-448)||(20008303-20008726)
chr8 (21-450)||(21323659-21324086)
chr8 (21-450)||(31414849-31415279)
chr8 (21-448)||(19861408-19861834)
chr8 (24-450)||(22052839-22053264)
chr8 (21-450)||(20390072-20390487)
chr8 (21-394)||(27356509-27356881)
chr8 (34-448)||(31569225-31569637)
chr8 (21-450)||(16269604-16270032)
chr8 (21-450)||(29301806-29302234)
chr8 (21-391)||(6605631-6606000)
chr8 (255-450)||(19984386-19984581)
chr8 (23-391)||(28988104-28988472)
chr8 (21-394)||(4984015-4984387)
chr8 (21-293)||(22372904-22373175)
chr8 (23-450)||(18858552-18858978)
chr8 (23-391)||(28982884-28983253)
chr8 (21-450)||(20016643-20017071)
chr8 (24-450)||(23887000-23887429)
chr8 (21-353)||(14567115-14567446)
chr8 (21-448)||(22375835-22376261)
chr8 (21-450)||(22118555-22118983)
chr8 (21-450)||(22127339-22127767)
chr8 (21-450)||(22422272-22422700)
chr8 (21-450)||(32602117-32602546)
chr8 (21-450)||(30311524-30311952)
chr8 (23-450)||(21164918-21165344)
chr8 (21-450)||(22131421-22131849)
chr8 (262-450)||(22061059-22061247)
chr8 (39-450)||(17672403-17672813)
chr8 (23-450)||(22246813-22247239)
chr8 (21-450)||(15535356-15535784)
chr8 (23-450)||(19979942-19980368)
chr8 (24-447)||(20394516-20394938)
chr8 (39-421)||(19482473-19482854)
chr8 (21-450)||(22041800-22042228)
chr8 (25-450)||(23652018-23652442)
chr8 (222-450)||(22522719-22522947)
chr8 (21-450)||(21252917-21253345)
chr8 (21-388)||(21920190-21920556)
chr8 (32-450)||(21392241-21392658)
chr8 (32-450)||(21782800-21783217)
chr8 (32-450)||(21786735-21787152)
chr8 (278-450)||(22989274-22989446)
chr8 (349-448)||(22373168-22373267)
chr8 (21-450)||(19864473-19864902)
chr8 (326-450)||(21781567-21781691)
chr8 (21-208)||(22988703-22988889)
chr8 (355-450)||(16875475-16875570)
chr8 (21-162)||(19114663-19114804)
chr8 (375-450)||(20650735-20650810)
chr8 (355-450)||(21848717-21848812)
chr8 (346-450)||(23155422-23155526)
chr8 (375-450)||(16414417-16414492)
chr8 (71-159)||(16875765-16875853)
chr8 (378-450)||(21194920-21194992)
chr8 (375-450)||(24932204-24932279)
chr8 (50-159)||(21849007-21849116)
chr8 (369-449)||(23902484-23902564)
chr8 (224-399)||(19869868-19870043)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (21-450)||(19290-19718)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (21-450)||(795-1222)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (21-450)||(44357-44785)
scaffold0104 (21-450)||(24152-24580)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (21-450)||(49815-50243)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (21-450)||(37586-38014)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (24-450)||(14141-14572)
scaffold0124 (355-450)||(5746-5841)
scaffold0124 (71-159)||(6038-6126)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (21-450)||(19574-19997)
scaffold0077 (71-159)||(26496-26584)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (21-450)||(23278314-23278742)
chr2 (21-450)||(19650527-19650955)
chr2 (21-448)||(19717496-19717922)
chr2 (21-450)||(23112274-23112705)
chr2 (24-394)||(24950131-24950500)
chr2 (21-394)||(31832196-31832568)
chr2 (194-450)||(25255629-25255885)
chr2 (34-448)||(27789291-27789704)
chr2 (23-450)||(23098495-23098921)
chr2 (34-448)||(12575904-12576317)
chr2 (21-391)||(1065289-1065658)
chr2 (26-450)||(24818707-24819130)
chr2 (21-450)||(24711572-24712000)
chr2 (21-450)||(24875227-24875655)
chr2 (21-198)||(25264592-25264768)
chr2 (21-450)||(41606862-41607290)
chr2 (24-450)||(21143518-21143943)
chr2 (21-254)||(23295473-23295705)
chr2 (21-450)||(27372807-27373235)
chr2 (21-450)||(24263908-24264336)
chr2 (26-307)||(27208791-27209072)
chr2 (39-450)||(27219572-27219982)
chr2 (21-450)||(9485754-9486182)
chr2 (71-450)||(16926948-16927326)
chr2 (71-450)||(17000588-17000966)
chr2 (39-450)||(10870406-10870816)
chr2 (46-448)||(21323745-21324146)
chr2 (21-450)||(23106205-23106633)
chr2 (39-450)||(44384047-44384457)
chr2 (23-450)||(24677029-24677455)
chr2 (21-450)||(23073401-23073829)
chr2 (106-450)||(9337205-9337548)
chr2 (21-445)||(23189457-23189879)
chr2 (23-450)||(24705959-24706385)
chr2 (237-449)||(30209395-30209607)
chr2 (25-450)||(22734251-22734675)
chr2 (228-449)||(30010662-30010883)
chr2 (357-450)||(22279978-22280071)
chr2 (379-450)||(24829665-24829736)
chr2 (24-135)||(45534481-45534592)
chr2 (346-450)||(25130471-25130575)
chr2 (401-445)||(23611090-23611134)
chr2 (346-442)||(24568153-24568249)
chr2 (71-159)||(24829955-24830043)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (25-421)||(6692-7087)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (25-450)||(169-592)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (24-450)||(41638-42062)
scaffold0102 (107-450)||(51285-51627)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (21-450)||(2212-2640)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (21-450)||(29225-29653)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (24-448)||(28466-28889)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (21-449)||(324642-325069)
scaffold0004 (21-450)||(201408-201836)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (21-450)||(99502-99930)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (23-450)||(9001-9427)
scaffold0222 (186-448)||(1431-1693)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (23-450)||(46974-47400)
scaffold0053 (24-448)||(55789-56212)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (21-450)||(250558-250986)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (21-439)||(1496-1913)
scaffold0476 (237-432)||(10319-10514)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (25-448)||(5031-5453)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (21-450)||(64459-64876)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (21-450)||(42855-43282)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (25-450)||(10770-11194)
[»] scaffold0076 (5 HSPs)
scaffold0076 (21-448)||(31619-32045)
scaffold0076 (21-271)||(55019-55268)
scaffold0076 (266-448)||(54353-54535)
scaffold0076 (355-450)||(42529-42624)
scaffold0076 (71-159)||(42246-42334)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (21-448)||(52983-53409)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (21-450)||(584-1009)
scaffold0420 (279-450)||(7809-7978)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (21-448)||(48456-48882)
scaffold0028 (39-450)||(45107-45517)
scaffold0028 (39-450)||(16892-17302)
scaffold0028 (39-450)||(10430-10840)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (21-448)||(20787-21213)
scaffold0090 (21-281)||(24949-25208)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (21-434)||(10742-11154)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (21-450)||(31259-31687)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (21-450)||(9401-9825)
scaffold0235 (21-450)||(19615-20039)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (21-450)||(176284-176712)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (24-450)||(262165-262590)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (142-450)||(559-866)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (24-448)||(114500-114923)
scaffold0029 (239-448)||(94836-95045)
scaffold0029 (39-450)||(107751-108161)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (21-450)||(21058-21486)
scaffold0058 (24-450)||(27188-27612)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (21-450)||(79771-80199)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (21-442)||(782-1202)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (21-390)||(1-369)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (21-325)||(16214-16517)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (21-450)||(6085-6513)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (26-448)||(25056-25477)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (21-437)||(9827-10257)
scaffold0348 (251-450)||(18423-18622)
scaffold0348 (401-450)||(5789-5838)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (26-450)||(268551-268974)
scaffold0007 (24-450)||(84460-84884)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (53-448)||(922-1316)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (134-449)||(11172-11486)
scaffold0074 (21-450)||(5050-5477)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (21-450)||(40273-40701)
scaffold0010 (189-448)||(45369-45628)
scaffold0010 (21-450)||(3852-4280)
scaffold0010 (21-165)||(45624-45767)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (33-448)||(21836-22238)
scaffold0114 (21-450)||(18281-18709)
scaffold0114 (335-450)||(39307-39422)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (22-450)||(28872-29298)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (21-421)||(556-955)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (22-269)||(933-1179)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (21-328)||(8870-9176)
scaffold0130 (320-448)||(4831-4959)
scaffold0130 (34-168)||(44864-44998)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (24-340)||(12349-12664)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (23-450)||(22645-23071)
scaffold0042 (23-450)||(37760-38186)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (26-450)||(10681-11104)
scaffold0018 (24-450)||(24238-24663)
scaffold0018 (26-361)||(16962-17296)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (21-448)||(14421-14847)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (23-450)||(8974-9400)
scaffold0083 (376-450)||(1324-1398)
scaffold0083 (376-450)||(6628-6702)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (21-290)||(44721-44989)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-450)||(217360-217788)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (22-450)||(7-434)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (21-450)||(8876-9304)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (23-450)||(5829-6255)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (25-450)||(2841-3265)
scaffold0647 (24-450)||(7599-8024)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (21-450)||(40091-40519)
scaffold0109 (24-450)||(14064-14490)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (21-450)||(11179-11607)
scaffold0080 (71-450)||(36336-36714)
scaffold0080 (24-450)||(30823-31248)
scaffold0080 (237-450)||(53788-54001)
scaffold0080 (401-450)||(13834-13883)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (21-450)||(16815-17242)
scaffold0040 (21-60)||(111817-111856)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (26-281)||(1267-1521)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (23-450)||(57955-58381)
scaffold0017 (46-433)||(195444-195830)
scaffold0017 (237-450)||(18006-18219)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (21-450)||(55693-56121)
scaffold0022 (24-450)||(40573-40998)
scaffold0022 (24-450)||(74293-74718)
scaffold0022 (357-450)||(8766-8859)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (39-450)||(9322-9732)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (21-450)||(7027-7455)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (21-450)||(16096-16524)
scaffold0044 (21-450)||(2358-2788)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (21-252)||(378-608)
scaffold0180 (21-252)||(4698-4928)
scaffold0180 (24-233)||(33910-34118)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (21-252)||(414-644)
scaffold0089 (21-317)||(14786-15081)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (24-450)||(938-1363)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (21-450)||(3519-3947)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (21-450)||(24885-25313)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (23-448)||(22128-22551)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (24-450)||(15918-16342)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (21-450)||(14406-14834)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (21-138)||(36051-36168)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (249-450)||(114978-115179)
scaffold0037 (23-163)||(115207-115347)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (25-450)||(719-1140)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (24-450)||(20179-20604)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (21-450)||(2445-2873)
scaffold0023 (24-407)||(86710-87091)
scaffold0023 (21-450)||(151048-151476)
[»] scaffold0008 (5 HSPs)
scaffold0008 (41-450)||(85736-86144)
scaffold0008 (21-450)||(85170-85598)
scaffold0008 (355-450)||(132429-132524)
scaffold0008 (346-450)||(26029-26133)
scaffold0008 (71-174)||(132704-132807)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (24-450)||(7961-8386)
scaffold0120 (346-450)||(24438-24542)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (25-450)||(15161-15585)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (21-450)||(7159-7587)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (23-339)||(1900-2215)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (314-450)||(11188-11324)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (222-450)||(21383-21611)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (21-450)||(704-1130)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (25-450)||(3374-3798)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (21-450)||(17592-18014)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (21-450)||(5809-6237)
scaffold0270 (21-450)||(12939-13367)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (22-450)||(390-816)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (21-421)||(103171-103570)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (23-450)||(35966-36392)
scaffold0081 (23-450)||(20542-20968)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (258-450)||(15934-16127)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (25-450)||(1-425)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (24-161)||(195181-195318)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (21-129)||(23339-23447)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (222-450)||(29855-30083)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (71-450)||(753-1127)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (24-450)||(1322-1747)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (23-361)||(4134-4471)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (326-447)||(8685-8806)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (21-121)||(241-341)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (24-450)||(7990-8415)
scaffold0358 (237-450)||(17398-17611)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (53-250)||(8923-9119)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (21-449)||(13152-13579)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (175-450)||(2690-2965)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (26-136)||(4589-4699)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (237-450)||(33-246)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (23-388)||(7954-8318)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (21-361)||(23103-23442)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (21-108)||(5974-6061)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (372-450)||(9894-9972)
scaffold0146 (372-450)||(17561-17639)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (23-140)||(1823-1940)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (21-450)||(8310-8737)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (294-426)||(28446-28578)
scaffold0215 (107-262)||(28591-28745)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (186-331)||(1748-1893)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (355-450)||(25665-25760)
scaffold0225 (71-159)||(25382-25470)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (355-450)||(15179-15274)
scaffold0162 (71-159)||(14896-14984)
scaffold0162 (346-450)||(11114-11218)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (346-450)||(886-990)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (366-450)||(11099-11183)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (21-131)||(35688-35798)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (23-168)||(992-1137)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (346-450)||(1561-1665)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (346-450)||(1892-1996)
scaffold0218 (408-450)||(26651-26693)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (355-450)||(1824-1919)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (346-449)||(13566-13669)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (355-450)||(7015-7110)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (355-450)||(34356-34451)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (21-163)||(38174-38316)
scaffold0122 (413-450)||(41445-41482)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (21-370)||(6351-6699)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (24-316)||(414-705)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (21-129)||(3864-3972)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (24-168)||(3574-3718)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (346-450)||(89762-89866)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (375-450)||(16349-16424)
[»] scaffold0302 (3 HSPs)
scaffold0302 (355-450)||(7424-7519)
scaffold0302 (375-450)||(502-577)
scaffold0302 (71-159)||(7141-7229)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (346-450)||(743-847)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (25-168)||(7914-8057)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (355-450)||(7180-7275)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (411-450)||(12296-12335)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (346-450)||(6945-7049)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (375-447)||(383-455)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15100955 - 15100527
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15100955 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 15100856  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15100855 cacttgcaagacgatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggta 15100757  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15100756 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtccta 15100657  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15100656 aaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatcca 15100557  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15100556 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 15100527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14262596 - 14262169
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14262596 ctgcaataccactactagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 14262497  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  14262496 cacttgcaacataatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtct-agaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 14262399  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14262398 agcatggaaaattctattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatattgtgtccta 14262299  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  14262298 aaggccatcttctgcatatcctcatccttcaccttaatatgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaactgatcca 14262199  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14262198 ttaaatcatcaaacctcggaagtggatacc 14262169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 13675349 - 13675777
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  13675349 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagataactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctcattcaa 13675448  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  13675449 tacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaataaa-tcagaatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccaggta 13675547  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13675548 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtccta 13675647  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||   ||||||||||||||||||||    
T  13675648 aaggccgtcttctccatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttgaaaacctttgcacccactaactgatcca 13675747  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13675748 ttatgtcatcaatcctcggaagtggatacc 13675777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16070647 - 16070222
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16070647 ctgcaataccactaccagaaataatatgacccagaaaacttacttcacttaaccagaactcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 16070548  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  16070547 cacttgcaatacaatcttcagatactctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tgagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 16070449  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16070448 gacatggaaaattctgttcatatactccataaacact--aggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtccta 16070351  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16070350 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaagcacacgagcacccactaactggtcca 16070251  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||    
T  16070250 tcaagtcatcaattctcggaagtggatac 16070222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 20748507 - 20748933
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20748507 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacacacaacttcttttctttcaa 20748606  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  20748607 cacttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcatcagtcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 20748705  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  20748706 agcatggaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtccta 20748805  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  20748806 aaggccgtcttctgca-atcctcatccttcaccttaatctta-ggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatcca 20748903  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  20748904 ttaaatcgtcaattcttggaagtggatacc 20748933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 19149108 - 19149534
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19149108 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacacacaacttcttttctttcaa 19149207  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  19149208 cacttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcatcagtcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 19149306  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  19149307 agcatggaaaattcaattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtccta 19149406  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  19149407 aaggccgtcttctgca-atcctcatccttcaccttaatctta-ggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatcca 19149504  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19149505 ttaaatcgtcaattcttggaagtggatacc 19149534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12205152 - 12204724
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12205152 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 12205053  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||| ||    
T  12205052 cacttgcaacacaattttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttaaaataaatt-aagatatcatcaataaacacgaccacagatttatccagata 12204954  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  12204953 agcatggaaaattctattcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtatccta 12204854  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || | ||||||||||||||||||||    
T  12204853 aaggccgttttctgcatatcttcatacttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcatgcacccactaactgatcca 12204754  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12204753 ttaaatcatcaattctcggaagtggatacc 12204724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16948824 - 16948396
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16948824 ctgcaataccactaccagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccaaaactcacactttgacagcttagcatacaacttcttttctttcaa 16948725  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |    
T  16948724 gacttgcaacacaatcttcagatgctctgcgtgctcctcttcgattttagaataaa-tcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaa 16948626  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16948625 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttttattcgtaatgtccatatcgtgtccta 16948526  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  16948525 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatcca 16948426  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16948425 ttaagtcatcaattctcgggagtggatacc 16948396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 448
Target Start/End: Original strand, 13023255 - 13023680
Alignment:
Q  22 tgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaat 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13023255 tgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccacaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaaa 13023354  T
Q  122 acttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag 221  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||  ||||| |||||||||||  |     
T  13023355 acttgcaatacaattctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcaaattatcatcaataaacaccaccacaaatttatccagaaaa 13023453  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13023454 gcatggaaaattcggttcatataatacataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 13023553  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    |||||||| || ||||||||    
T  13023554 aggccgtcttctgcatatcctcatcattcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttgctaaacaccttcgcacccaccaattgatccat 13023653  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13023654 caaatcatcaattctcggaagtggata 13023680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Original strand, 19614572 - 19614998
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19614572 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 19614671  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| | |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  19614672 tacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaataga-tcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggta 19614770  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19614771 agcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 19614870  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||    
T  19614871 aaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatcca 19614970  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | |  || ||||| |||||||| |||||    
T  19614971 tcaggtcgtcaattctcggaagcggata 19614998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 34 - 450
Target Start/End: Original strand, 14139589 - 14140004
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14139589 accagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaacaca 14139688  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  14139689 attctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaaaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaatt 14139787  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14139788 cgattcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 14139887  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||| | ||| ||||| || ||||||||    
T  14139888 gcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatattactaaaaacctttgcacccaccagctggtccatcaagtcatcaat 14139987  T
Q  434 cctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||    
T  14139988 cctcggaagtggatacc 14140004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 15342331 - 15342756
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||    
T  15342331 caataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtac 15342430  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | | ||| || ||||| || | |||||| || ||||||||  || |    
T  15342431 ttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctctttagtcttagaataaatt-aggatatcgtcaatgaatacaaccacaaacttatccagaaagac 15342529  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15342530 atggaaaattcagttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaag 15342629  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |    |||||| || ||||||||||| |    
T  15342630 gccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatca 15342729  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||| |||||||| ||| |||||||    
T  15342730 agtcataaatcctcgaaagcggatacc 15342756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 12458537 - 12458965
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12458537 ctgcaataccactaccagaaataatgtgtcccagaaatctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacttcttttctttcaa 12458636  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| | | || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  |    
T  12458637 aacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacacaacaacgaaattatccagaaa 12458735  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12458736 agcatggaagattatgttcaaatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttcta 12458835  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||||||||    
T  12458836 aaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatggtaaccagacctcaaatcgatcttactgaacactttcgcacctactaactgatcca 12458935  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  12458936 ttaggtcatcaatcctcggaagcggatacc 12458965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18052292 - 18051879
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  18052292 accagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaacaca 18052193  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  18052192 attctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaatt 18052094  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18052093 cgattcatatactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 18051994  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  18051993 gcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaat 18051894  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| |||||    
T  18051893 cctcggaagcggata 18051879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14284726 - 14284356
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  14284726 gcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaactagaactcacatttcgacaacttagcatacagcttcttctctttcaata 14284627  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || | |||||| || ||||||||| | |    
T  14284626 cttgcaatataatcctcagatgttctgtatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaacttatccaggaaag 14284528  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14284527 catgaaaaatcctgtttatatactccatgaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgacaataacgtgtcctaaa 14284428  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||    
T  14284427 ggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaaccatacctcaagtcgatattactaaa 14284356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23504222 - 23503796
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23504222 ctgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaa 23504123  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||  |    
T  23504122 aacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaa 23504024  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23504023 agcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtccta 23503924  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||    
T  23503923 aaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtcca 23503824  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||    
T  23503823 tcaagtcatcaatcctcggaagcggata 23503796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11301565 - 11301191
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  11301565 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagatctcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaa 11301466  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  11301465 cacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 11301367  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  11301366 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 11301267  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaata 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11301266 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactaaata 11301191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11386779 - 11386353
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||  |    
T  11386779 gcaataccactaccagaaataatgtggccgagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagaa 11386680  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    | || ||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||  ||||||||| |||||||  | |    
T  11386679 cctgtaatacaatcctcagatgctcggcatgctcttcttcagtcttagaataaattaaa-atatcatcaataaacaccaccacgaatctatccagaaaag 11386581  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11386580 catgaaaaattctgttcttatactccataaatacacctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccacaacgtgtcctaaa 11386481  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    | | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    |||||| || |||||||||||     
T  11386480 gtccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatc 11386381  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || || |||||||||||||| |||||||    
T  11386380 aagtcgtcaatcctcggaagcggatacc 11386353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13967020 - 13966648
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  13967020 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttctctttcaa 13966921  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  13966920 aacttgcaagacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 13966822  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  13966821 agcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 13966722  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13966721 aaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagatctcaaatcaatcttactaaa 13966648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26093150 - 26092778
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  26093150 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 26093051  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  26093050 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 26092952  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  26092951 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 26092852  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26092851 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaa 26092778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 49154198 - 49154626
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  49154198 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 49154297  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  49154298 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 49154396  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  49154397 agcatggaaaattcggttcatgtaccccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 49154496  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||| || ||||||||||    
T  49154497 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatcca 49154596  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || ||||| || ||||| |||||||    
T  49154597 tcaagtcgtcaattctaggaagcggatacc 49154626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 48813623 - 48813198
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||  |    
T  48813623 gcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaa-ttggcatataacttcttctccttcagca 48813525  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||  |||||| || | |||| || |||||||| |||| |||||||||   ||| |  || |    
T  48813524 cttgcaacacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttagagtata-tcaaaatatcatcaatgaacacaaccacgaagcgatctaaataag 48813426  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48813425 catgaaaaatacaattcatgtactccataaacacacttggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaa 48813326  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  48813325 ggttgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatttggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcgcccactaactgatccatc 48813226  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  48813225 aaatcatcaattcttggaagtggatacc 48813198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26116942 - 26116573
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  26116942 ctgcaatatcactaccaaaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaa 26116843  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || || ||||||||||  || |  || ||||||||  |    
T  26116842 cacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcgtcaataaacaccacaagaaacttatccagaaa 26116744  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||    
T  26116743 agcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataatgtgtccta 26116644  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26116643 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact 26116573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11235587 - 11235159
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  11235587 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 11235488  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  11235487 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 11235389  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||     
T  11235388 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctg 11235289  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11235288 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 11235189  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11235188 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 11235159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11551476 - 11551048
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  11551476 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 11551377  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| || |||| ||| |||||   |||||   |    
T  11551376 cacttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggaataaa-tcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaa 11551278  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || |||    
T  11551277 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttcta 11551178  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11551177 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 11551078  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  11551077 tcaaatcatcaattcttggaagtggatacc 11551048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 14334292 - 14334720
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  14334292 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 14334391  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  14334392 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 14334490  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||  |     
T  14334491 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttg 14334590  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  14334591 aaagctgtcttctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 14334690  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14334691 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 14334720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15159431 - 15159003
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  15159431 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 15159332  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||| ||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  15159331 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 15159233  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  15159232 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 15159133  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15159132 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatcca 15159033  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15159032 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 15159003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 8709501 - 8709929
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  8709501 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 8709600  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||  ||   |||||   |    
T  8709601 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccataaaccgatccaaaaa 8709699  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  8709700 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 8709799  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8709800 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttaccttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatcca 8709899  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8709900 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 8709929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 14956450 - 14956878
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  14956450 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 14956549  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||  ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || |||| ||| ||||||  |||||   |    
T  14956550 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatcttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaa 14956648  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  14956649 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 14956748  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||  || || || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14956749 aaagctgtcttctgcatattttcatcttttactttaatttggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 14956848  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14956849 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 14956878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 12689400 - 12689826
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  12689400 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaaca 12689499  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || || | ||| |||||   |||||   | |    
T  12689500 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatg 12689598  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || |     
T  12689599 catggaagatgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctcag 12689698  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  12689699 agctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatc 12689798  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12689799 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 12689826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15147257 - 15146830
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  15147257 gcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaaca 15147158  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag- 221  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | | || || |||||||| || | |||||||||   |||||   |      
T  15147157 cttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-taaaaatatcatcaatgaaaaaaaccacgaaccgatccaaaaaat 15147059  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||    
T  15147058 gcatggaaaatgcgattcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccaaaaggcataactttatactcgtaatgtccatatcgcgttttaa 15146959  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15146958 aagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccat 15146859  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || |||||||| || |||||||||||||    
T  15146858 caagtcatcaattcttggaagtggatacc 15146830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15723 - 15296
Alignment:
Q  22 tgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaat 121  Q
    ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||     
T  15723 tgcaataccatcaccaaaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaac 15624  T
Q  122 acttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag 221  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||  ||| |||||   |||||   ||    
T  15623 acttgcaagacaatcatcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacgcaactacgaaccgatccaaaaag 15525  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || |    
T  15524 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactctaggcgcattgtttacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctga 15425  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||   |||||||||||||||||||||    
T  15424 aagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccat 15325  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15324 caaatcctcaattctcggaagtggatacc 15296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 15626424 - 15626849
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||    
T  15626424 caataccgttaccagaaataatatggccaaggaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcac 15626523  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||  ||  |||| |||||||||  |||| | || | | || || ||||| || |||  |||||||||   ||| |  || ||    
T  15626524 ttgcaaaacaatcttcaaatactcgacatgttcttcttcagacttatagtatattaaa-atatcatcgatgaacgcaaccacgaagcgatctaaataagc 15626622  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| |  || |||||||||||     
T  15626623 atgaaaaatacggttcatgtactccataaatacacctggtgcattagtaacactgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaa 15626722  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || ||||||| | |||| || || ||||  |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15626723 gccgtcttcttcgtatcttcatctttcagtttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatca 15626822  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    
T  15626823 aatcatcaattcttggaagtggatacc 15626849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 450
Target Start/End: Original strand, 13688021 - 13688365
Alignment:
Q  105 acttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataacca 204  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||| ||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||    
T  13688021 acttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaacca 13688119  T
Q  205 cgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatg 304  Q
    | ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||  |    
T  13688120 caaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcataggg 13688219  T
Q  305 accatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgca 404  Q
    |||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13688220 accataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctagtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgca 13688319  T
Q  405 cccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13688320 cccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 13688365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 10872586 - 10873014
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || | ||| |  ||||| ||||||||    
T  10872586 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttaggataaagtttcttctctttcaa 10872685  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || |||||||  ||||| ||   ||||||  |    
T  10872686 cacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacgaccacaaaccgatccagaaa 10872784  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  10872785 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 10872884  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  10872885 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 10872984  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10872985 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 10873014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 44789675 - 44789297
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |    
T  44789675 aaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 44789576  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | || | |||| || || || |||||||||||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  44789575 agtaga-tcaaaatatcgtcgataaacataaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 44789477  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||    
T  44789476 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgacaacc 44789377  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44789376 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 44789297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 222 - 450
Target Start/End: Original strand, 18179841 - 18180069
Alignment:
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || |    
T  18179841 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcgtagtggccataacgcgttctga 18179940  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  18179941 aagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccat 18180040  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18180041 caaatcatcaattctctgaagtggatacc 18180069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 131 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18588435 - 18588117
Alignment:
Q  131 acaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaa 230  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   | ||||||||     
T  18588435 acaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 18588337  T
Q  231 attcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtct 330  Q
    || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||| ||| || |||||||| || || || || | |||||    
T  18588336 atgcaattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttattttcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 18588237  T
Q  331 tctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatc 430  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18588236 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 18588137  T
Q  431 aatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  18588136 aattctcggaagtggatacc 18588117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 446
Target Start/End: Original strand, 14041591 - 14042015
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||| |  ||  | ||| |||| ||||| ||||| || || ||||| |  || || ||||||||    
T  14041591 ctgcaataccactaccagtagtaacatgtccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgataatttagcataaagtttattctctttcaa 14041690  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||| ||| |||| || |||| |||| || |||||||| || ||||| |||||   |||||   |    
T  14041691 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcatcatgttcttcctcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaataactacgaaacgatccaaaaa 14041789  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || || |||    
T  14041790 tgcatgaaaaatgtgattcatgtactccataaacacatcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttcta 14041889  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14041890 aaagctgtcttctccatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 14041989  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtgga 446  Q
    | || |  ||||| || |||||||||    
T  14041990 tcaagttctcaattcttggaagtgga 14042015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 446
Target Start/End: Original strand, 14351621 - 14352045
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||| |  ||  | ||| |||| ||||| ||||| || || ||||| |  || || ||||||||    
T  14351621 ctgcaataccactaccagtagtaacatgtccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgataatttagcataaagtttattctctttcaa 14351720  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||| ||| |||| || |||| |||| || |||||||| || ||||| |||||   |||||   |    
T  14351721 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcatcatgttcttcctcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaataactacgaaacgatccaaaaa 14351819  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || || |||    
T  14351820 tgcatgaaaaatgtgattcatgtactccataaacacatcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttcta 14351919  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14351920 aaagctgtcttctccatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 14352019  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtgga 446  Q
    | || |  ||||| || |||||||||    
T  14352020 tcaagttctcaattcttggaagtgga 14352045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Original strand, 9590479 - 9590692
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || || || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||    
T  9590479 ttcatatactccataaacactccaagtgcattggtcacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 9590578  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9590579 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaaattttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 9590678  T
Q  437 cggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||||    
T  9590679 cagaagtggatacc 9590692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11770615 - 11770483
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| |||||||| ||||||||    
T  11770615 ctgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttaacatataacttcttctctttcaa 11770516  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatg 153  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  11770515 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatg 11770483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 7826129 - 7826224
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7826129 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 7826224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27105815 - 27105720
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27105815 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 27105720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 27172510 - 27172605
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27172510 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 27172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11770431 - 11770348
Alignment:
Q  367 aacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  11770431 aacccgatctcaaattaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacc 11770348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 14213570 - 14213678
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  14213570 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 14213669  T
Q  121 tacttgcaa 129  Q
     ||||||||    
T  14213670 cacttgcaa 14213678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 39318 - 39143
Alignment:
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| || |  || || ||||||||||||  ||| || ||||||||||| || || || |||    
T  39318 atggaaaattctgttcatatactccataaaaactcctggcgcgttggacactccaaaaggcatcaccgaatactcataatgaccataacgggttctgaag 39219  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacac 399  Q
    || ||||||   ||||| ||   ||||||    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39218 gcagtcttcaatatatcttccgacttcactcgtatctgatggtaccctgacctcaaatcaattttactaaatacac 39143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 4442157 - 4442252
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4442157 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggatacc 4442252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 7825846 - 7825934
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  7825846 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 7825934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27106098 - 27106010
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  27106098 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 27106010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 27172227 - 27172315
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  27172227 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 27172315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 448
Target Start/End: Original strand, 13379114 - 13379205
Alignment:
Q  357 atctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  13379114 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagaggata 13379205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 49042 - 49470
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49042 ctgcaataccactaccataaatgatatggccaagaaaacttacttgacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 49141  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  49142 cacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 49240  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  49241 agcatggaaaattttgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtccta 49340  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  49341 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatcca 49440  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  49441 ttaaaccatcgatcctcagaagtggatacc 49470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 2654 - 3082
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2654 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacatttagacaacttggcatacaacttcttctctttcaa 2753  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2754 cacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggta 2852  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2853 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcgtaatgtccatatcatgtccta 2952  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2953 aaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcgacttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatcca 3052  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3053 ttaagtcatcaatcgtcggaagtggatacc 3082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Original strand, 35484 - 35862
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||| |    
T  35484 aaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttgg 35583  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | |||| | || || ||||| || |  | |||||||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  35584 agtaaattaaa-atatcatcgatgagaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 35682  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    |||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||    
T  35683 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacc 35782  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35783 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 35862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 388
Target Start/End: Original strand, 28237 - 28403
Alignment:
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || |    
T  28237 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctga 28336  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatctt 388  Q
    | ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  28337 aagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatctt 28403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 450
Target Start/End: Original strand, 28405 - 28442
Alignment:
Q  413 ctgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28405 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 28442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 150507 - 150935
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150507 ctgcaataccacttccagaaataatgtggccaagaaaacttacctcacttaaccagaattcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 150606  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  150607 tacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaaaatgtcatcaataaattcaaccatgaatttatccaggta 150705  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||    
T  150706 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtccatatcatgtccta 150805  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150806 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 150905  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  150906 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 150935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24901 - 24473
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  24901 ctgcaataccactactagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcatataacttcttctctttcaa 24802  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || ||||| || |||| |||||||||    ||||   |    
T  24801 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttcgagtata-tcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgttccaaaaa 24703  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  24702 tgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttcta 24603  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24602 aaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatcca 24503  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  24502 ttaagtcgtcaattcttggaagtggatacc 24473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 194072 - 193947
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  194072 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacgacttcttttctttcaa 193973  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgtt 146  Q
     ||||| || |||||| ||| |||||    
T  193972 aacttgtaacacaatcctcagatgtt 193947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 4687 - 5115
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4687 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactgacttcacttaaccagaactcacaattcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaa 4786  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4787 tacttgtaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcagaatgtcatcaataaacacaactacgaatttatccaggta 4885  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||    
T  4886 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgaccta 4985  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4986 aaggccgtcttcggcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatcca 5085  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5086 ttaaatcgtcaattctcggaagtggatacc 5115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 42260 - 42047
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  | ||  ||||||||||||| |||||||| |    
T  42260 ttcatatattccataaacactccttgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgttcgtaatgtgtcctaaaggccgtcttctgaa 42161  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    ||||| | || ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||   || |||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  42160 tatccccatctttcactttgatctggtgatagcctgatcttaagtcaatcttaaagaacacaaatgcacccactaactgatccatcaaatcgtcgatcct 42061  T
Q  437 cggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||||    
T  42060 cagaagtggatacc 42047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 109568 - 109996
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  109568 ctgcaataccactacaagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcattttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 109667  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||    
T  109668 tacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcacgatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatctagata 109766  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109767 ggcatggaaaattcggttcatagactccataaacacactaggcacattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtccta 109866  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  109867 aaagccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatcca 109966  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  109967 ttaaatcgtcaattctcggaagcggatacc 109996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 55356 - 54933
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  |   | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| ||||| || ||    
T  55356 caataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctttttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttaaacac 55257  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| | || || |||| | || || ||||| | ||| | |||||| ||   |||||   | ||    
T  55256 ttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtattggagtaaa-taaaaatatcatccagaaaaacaaccacaaagggatccaaaaatgc 55158  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||| || || ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||     
T  55157 atggaagatgcgattcaattactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgtgttctgaaa 55058  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  55057 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggttataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 54958  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  54957 aatcatcaattcttggaagtggata 54933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 28563 - 28988
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  28563 caataccactaccataaataatgtggccaacaaaacttacttcatctaaccagaactcacattttgacaacttcgcagacaacttcttttctttcaacac 28662  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  28663 tttcaagacgatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagc 28761  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28762 atggaaaattcggttcatatactccataagcacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 28861  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28862 gccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaatacacgagcacccactaactgatccatta 28961  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  28962 agtcatcaatcctcggaagtggatacc 28988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 59582 - 59154
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  59582 ctgctataccattaccaaaaataatatggccaagaaagctaacttcacttaactagaactcgcacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 59483  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||| || | |||||||||||||||||   |    
T  59482 cacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaa-atatcatcaatgaatacaaccacgaatttatccaaaaa 59384  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  59383 agcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgtccta 59284  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||   ||||| ||| ||||| ||||    
T  59283 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtcca 59184  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  59183 tcaagtcatcaatcctcggtagtggatacc 59154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 50548 - 50120
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  50548 ctgctataccattaccaaaaataatatggccaagaaagctaacttcacttaactagaactcgcacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 50449  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||| || | |||||||||||||||||   |    
T  50448 cacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaa-atatcatcaatgaatacaaccacgaatttatccaaaaa 50350  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  50349 agcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgtccta 50250  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||   ||||| ||| ||||| ||||    
T  50249 aatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtcca 50150  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  50149 tcaagtcatcaatcctcggtagtggatacc 50120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 65970 - 65542
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  65970 ctgctataccattaccaaaaataatatggccaagaaagctaacttcacttaactagaactcgcacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 65871  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||| || | |||||||||||||||||   |    
T  65870 cacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaa-atatcatcaatgaatacaaccacgaatttatccaaaaa 65772  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  65771 agcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgtccta 65672  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||   ||||| ||| ||||| ||||    
T  65671 aatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtcca 65572  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  65571 tcaagtcatcaatcctcggtagtggatacc 65542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 10425 - 9998
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10425 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttgacatacaacttcttttctttcaa 10326  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10325 tacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatctaggta 10227  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10226 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccca 10127  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  10126 aaggccgtcttctgcatatcctcatctttcaccttaatctgatggt-acctgaccttaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatcca 10028  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10027 ttaagtcgtcaatcctcggaagtggatacc 9998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21883 - 21455
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21883 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacttcttctctttcaa 21784  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  21783 tacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttctgtcttcgaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 21685  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21684 ggcgtggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaagaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtccta 21585  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21584 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatcca 21485  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||    
T  21484 tgaagttatcaatcctcggaagtggatacc 21455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13276
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  13704 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaattttgcatacaacttcttctctttcaa 13605  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  13604 tacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttctgtcttcgaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 13506  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13505 ggcgtggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaagaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtccta 13406  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  13405 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatcca 13306  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||    
T  13305 tgaagttatcaatcctcggaagtggatacc 13276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15001729 - 15001302
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001729 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga-ctcacatttaaacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 15001631  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  15001630 cacttgcaacacaatcctcagatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 15001532  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  15001531 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaacaggcgcattagtatcaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtccta 15001432  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15001431 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatcca 15001332  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15001331 ttaaatcgtcaatcctcggaagtggatacc 15001302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15357485 - 15357057
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357485 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacatttcgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 15357386  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  15357385 tacttgtaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcagaatgtcatcaataaatacaaccgcgaacttatccaggta 15357287  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  15357286 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcatagtgaccataacgtgtccta 15357187  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  15357186 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatcca 15357087  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357086 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 15357057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 16149618 - 16150046
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16149618 ctgcaataccactaccagaaataatgtggcaaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgataacttagcatacaacttcttttctttcaa 16149717  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||  || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16149718 tatttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcattgaataaa-tcagaatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggta 16149816  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16149817 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 16149916  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  16149917 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatcca 16150016  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16150017 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 16150046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 16153764 - 16154192
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16153764 ctgcaataccactaccagaaataatgtggctaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgataacttagcatacaacttcttttctttcaa 16153863  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||  || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16153864 tatttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcattgaataaa-tcagaatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggta 16153962  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16153963 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 16154062  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  16154063 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatcca 16154162  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16154163 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 16154192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Original strand, 15072266 - 15072692
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15072266 ctgcaataccactacaagaaataatgtgaccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaa 15072365  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  15072366 cacttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttattcattcttagaataaatt-aggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 15072464  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15072465 agcatggaaaactctattcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtccta 15072564  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| || || ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  15072565 aaggccgttttttgcgtatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatcca 15072664  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  15072665 ttaaatcatcaattatcggaagtggata 15072692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 99 - 450
Target Start/End: Original strand, 15257913 - 15258262
Alignment:
Q  99 catacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15257913 catacaacttcttttctttcgatacttgcaatacaatctttagatgctctgcatgctcttcttcggtccttgaataaa-tcaagatatcatcaataaaca 15258011  T
Q  199 taaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattc 298  Q
     |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15258012 caaccacaaatttattcagataggcatggaaaattcggttcatatattccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattc 15258111  T
Q  299 gtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaataca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  15258112 gtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatattctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctaaacaca 15258211  T
Q  399 cgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15258212 cgagcacccactaactgatcgatt-aatcatcaatcctcgaaagtggatacc 15258262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 448
Target Start/End: Original strand, 27902295 - 27902719
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  27902295 gcaataccactaccagaaataatgtggcctagaaaactcacttcatttaactagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaa 27902394  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
      ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||| |  |||||||||||||||||| | |    
T  27902395 tctgcaacacaatcttcatgtgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcaaaatatgatcaataaataccaccacgaatttatccaggaaag 27902493  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27902494 catggaaaattcggttcatatactccatgaacactccaggcgctttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 27902593  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||   |||||| || |  || |||||     
T  27902594 ggccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccatttggtccatc 27902693  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  27902694 aagtcatcaatcctcggaagtggata 27902719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 8707818 - 8708242
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8707818 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaataaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacatcttcttttccttcaa 8707917  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||  ||    
T  8707918 cacttgcaacacaactttctaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaat-aaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaaata 8708016  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8708017 agcatggaaaattctattcatgtactccataaacacaccccgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtgcta 8708116  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| || |||| |||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8708117 aaggccgttttctacatatcttcatcttttactttaatatgatggtaacccgacctca----aatcttactaaacacgcgtgcacccactaactgatcca 8708212  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8708213 ttaaatcatcaattctcggaagtggatacc 8708242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1647640 - 1647214
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||||||||  |    
T  1647640 gcaataccactaccagaaatcacgtggccaacaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttagcatacaactttctttctttcagaa 1647541  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
       |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || |||||||| || |  |||||||||||||||||  | |    
T  1647540 tccgcaacacaatcttcaggtgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcaaaatatcatcaatgaataccaccacgaatttatccagaaaag 1647442  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1647441 catggaaaatcctattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgagtcctaaa 1647342  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||   |||||| || ||||| |||||     
T  1647341 ggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaactggtccatc 1647242  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  1647241 aagtcatcaatcctcggaagtggatacc 1647214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 51605144 - 51604731
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  51605144 accagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcagcaca 51605045  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  51605044 attctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaatt 51604946  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  51604945 cgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaagccgtcttct 51604846  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  51604845 gcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaat 51604746  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| |||||    
T  51604745 cctcggaagcggata 51604731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3263159 - 3262787
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  3263159 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 3263060  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  3263059 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 3262961  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  3262960 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 3262861  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3262860 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaa 3262787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29451902 - 29451533
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  29451902 ctgcaataccactaccagaaataatatgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaatctcttttccttcaa 29451803  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || ||||||||||| |  || || || ||||||||  |    
T  29451802 cacttgcaatacaattctcagatgatctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaa 29451704  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  29451703 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 29451604  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29451603 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact 29451533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11205596 - 11205225
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  11205596 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagcttacttcacttaaccagaactcacattttaaaaccttgt-atacaacctcttttccttcaa 11205498  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  11205497 cacttgcaatacaattctcaggtgttctgcatgctcctcttcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 11205399  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  11205398 agcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 11205299  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  11205298 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaagtcaatcttgctaaa 11205225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 15323124 - 15323385
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15323124 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 15323223  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  15323224 cacttgcaacacaattttcagatgctctgcatgctcttcttcactcttagaat-aaattacaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 15323322  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaagg 283  Q
     |||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15323323 agcatggaaaattctattcatgtattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagg 15323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44660231 - 44659862
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| || | |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  44660231 ctgcaataccactaccagaaataatgtgatccagaaagctcacttcacttagccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaa 44660132  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || || ||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  44660131 cacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcgtcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 44660033  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  44660032 agcatggaagattcgattcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 44659933  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44659932 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataacctgacctcaaatcaatcttact 44659862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8051728 - 8051300
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  8051728 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 8051629  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  8051628 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 8051530  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  8051529 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 8051430  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  8051429 aaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 8051330  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8051329 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 8051300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14302084 - 14301656
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  14302084 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 14301985  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  14301984 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 14301886  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  14301885 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 14301786  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14301785 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 14301686  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14301685 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 14301656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 14696020 - 14696447
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||     
T  14696020 ctgcaataccactactagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttagcatataaattcttctctttcag 14696119  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||   ||| || || | |||| || |||||||| |||| |||||||||   |||||  ||    
T  14696120 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtata-tcaaaatatcatcaatgaacacaaccacgaagcaatccaaata 14696218  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||   |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||   |||||  ||||| ||||| || || |||    
T  14696219 cgcatgaaaaatagagttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccaaaaggcatcactgaatattaataatgtccataacgcgttcta 14696318  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14696319 aaggccgtcttctgcatatccttatctttcactttaatttggtgttaacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtacacccactaactgatcca 14696418  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    | ||||||||||| || |||||| |||||    
T  14696419 taaaatcatcaattcttggaagtagatac 14696447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 14161377 - 14161805
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |  ||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  14161377 ctgcaataccactaccagagataatgtggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacatttcgacaacttggcatacaacttactttccttcaa 14161476  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     || || |  |||||||||| ||| || ||||| ||||||||  ||| |||||||| | | ||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||    
T  14161477 cacctgtagaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttctgtctcagaataaatt-aggatatcatcaataaatacaactacgaacttatccagata 14161575  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||   | |||| ||||| |  || |||||||||    
T  14161576 agcatgaaaaattctgttcatatactccataaatactccaggtgcattagaaacaccgaaaggcatcactgaaaattcataatgtctgtaacgtgtccta 14161675  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||| ||||| || | ||| ||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||    
T  14161676 aaagccgtcttctgtatatcttcattctttactctaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatcca 14161775  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  14161776 tcaaatcatcaattcttggaagtggatacc 14161805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 14682474 - 14682902
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  14682474 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 14682573  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||| |||| |||| || |||| |||| || ||||| || |||| ||| |||||   |||||   |    
T  14682574 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaa 14682672  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||     
T  14682673 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaactctccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataaccttatattcatagtgaccataacgcgttctg 14682772  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14682773 aaagctgtcttctgcatatcgtcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcagatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 14682872  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14682873 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 14682902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 23957654 - 23958082
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  23957654 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 23957753  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  23957754 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 23957852  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  23957853 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 23957952  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23957953 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatcca 23958052  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23958053 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 23958082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 40474949 - 40475375
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  40474949 gcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttcgacaatttagcataaagtttcttctctttcaaca 40475048  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || |||| |||||| ||   |||||   | |    
T  40475049 cttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacacaaccacaaaccgatccaaaaatg 40475147  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||    
T  40475148 catgaaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgggttctgaa 40475247  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  40475248 agctgtcttatgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatc 40475347  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40475348 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 40475375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 12478507 - 12478935
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  12478507 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 12478606  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||| || |||| |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   |    
T  12478607 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcggtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaa 12478705  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  12478706 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 12478805  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  12478806 aaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 12478905  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12478906 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 12478935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19776898 - 19776470
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  19776898 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 19776799  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||| || |||| |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   |    
T  19776798 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcggtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaa 19776700  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  19776699 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 19776600  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  19776599 aaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 19776500  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19776499 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 19776470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 27713243 - 27713671
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  27713243 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 27713342  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  27713343 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 27713441  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  27713442 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 27713541  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||| |||    
T  27713542 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgaccca 27713641  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27713642 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 27713671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18225551 - 18225123
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||  || |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  18225551 ctgcaatatcatcaccagaaataacatggccaagaaaaggtacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 18225452  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  18225451 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcgtcaataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 18225353  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  18225352 ggcatggaagatgcgattcatatactccataaacagtccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 18225253  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  18225252 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 18225153  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18225152 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 18225123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 222 - 450
Target Start/End: Original strand, 16218337 - 16218565
Alignment:
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | | |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  16218337 gcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctgacacatttgtaacaccgaagggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaa 16218436  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16218437 aagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccat 16218536  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16218537 taagtcatcaattctcggaagtggatacc 16218565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 222 - 450
Target Start/End: Original strand, 16221657 - 16221885
Alignment:
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | | |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  16221657 gcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctgacacatttgtaacaccgaagggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaa 16221756  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16221757 aagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccat 16221856  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16221857 taagtcatcaattctcggaagtggatacc 16221885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14849471 - 14849045
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||     
T  14849471 ctgcaataccactaccagaaataacttggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcatataacttcttctccttcag 14849372  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||   ||| || || | |||| || || || || |||| |||||||||   |||||   |    
T  14849371 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttcggacttggagtata-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaagcgatccaaaaa 14849273  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  14849272 tgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatctctttatattcataatgtccataacgcgttcta 14849173  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || ||  |||| ||||| || || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14849172 aaagccgtcttctgcatatcttcatctctcactttaatttggtgataacccgatctcaaatcaaccttgctaaatacacgcgcacccactaactgatcca 14849073  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || ||||||||  | |||||||||||    
T  14849072 tcaagtcatcaatttttggaagtggata 14849045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 8388337 - 8388747
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  8388337 aaataacatggccaaggaaactcacctcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 8388436  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | || || || || ||||||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  8388437 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaa-atatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 8388535  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||    
T  8388536 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 8388635  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8388636 tcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 8388735  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  8388736 gaagtggatacc 8388747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16235011 - 16234669
Alignment:
Q  107 ttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacg 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || || |||| ||| |||    
T  16235011 ttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacg 16234913  T
Q  207 aatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgac 306  Q
    ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || |||||||| || ||||    
T  16234912 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgtattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgac 16234813  T
Q  307 catatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacc 406  Q
    |||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  16234812 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacc 16234713  T
Q  407 cactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16234712 cactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 16234669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15145988 - 15145591
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||| | |||||||| |    
T  15145988 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcctctctttcaaca 15145889  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||| | ||||||||||  |||||   | |    
T  15145888 cttgcaagacaatgttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaagacaaccacgaatcgatccaaaaatg 15145790  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||    
T  15145789 catgaaagatacgattcatgtactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaa 15145690  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
     ||||||||||||||||| || || || || |||||||  || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15145689 agctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacccgatctcaaatcaatgttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccat 15145591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 113 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17093162 - 17092826
Alignment:
Q  113 tctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaattta 212  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| |||||| ||   |    
T  17093162 tctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccga 17093064  T
Q  213 tccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatc 312  Q
    ||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  17093063 tccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataac 17092964  T
Q  313 gtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaa 412  Q
    | || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||     
T  17092963 gcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactag 17092864  T
Q  413 ctgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17092863 ttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 17092826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 246 - 449
Target Start/End: Original strand, 23443237 - 23443439
Alignment:
Q  246 tccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgt 345  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| || |    
T  23443237 tccataaacacacctggcgcattcgtaaa-ccgaaaggcatcactttatactcataatgtccataacgtgttctaaaagttgtcttatgcatatcttcat 23443335  T
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    | ||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23443336 ctttcactttaatctggtgataacccaatctcaaatcaatcttggtaaacacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtgg 23443435  T
Q  446 atac 449  Q
    ||||    
T  23443436 atac 23443439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16353610 - 16353246
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggcca-agaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  16353610 caataccatcaccagaaataacatggccanagaaaacttacctcttttaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaaca 16353511  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||| || |||| | || || ||||| || |  | |||||||||   |||||   | |    
T  16353510 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaattaaa-atatcatcgatgagaacaaccacgaaccgatccaaaaatg 16353412  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || ||    
T  16353411 catggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaa 16353312  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatctt 388  Q
     ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  16353311 agctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatctt 16353246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 319 - 450
Target Start/End: Original strand, 22631908 - 22632039
Alignment:
Q  319 taaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatc 418  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  22631908 taaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatc 22632007  T
Q  419 cattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22632008 catcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 22632039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15291190 - 15291095
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15291190 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 15291095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18613929 - 18613743
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||| |||||||||| ||   | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  18613929 ctgcaataccatcaccagatataacatggcctagaaaacttacttttttcaaccagaattcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaa 18613830  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaa 208  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || | ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  18613829 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagt-aaatcaaaatgtcgtcaataaacacaactacgaa 18613743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 15247831 - 15247910
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcata 102  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  15247831 ctgcaacaccactaccagaaataatgtggccaaggaaacttacttctcttaaccagaactcac--tttgacaacctggcata 15247910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16251602 - 16251527
Alignment:
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16251602 ctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatacatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 16251527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12341212 - 12341095
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |    
T  12341212 aaatcatatgaccaaggaaacttacttcccgtaaccaaaactcacaatttgaaagcttagaaaacaacttcttttccttcaagacacgcaacacaatcct 12341113  T
Q  139 catatgttctgcatgctc 156  Q
    || ||| || ||||||||    
T  12341112 cagatgctcagcatgctc 12341095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1640445 - 1640321
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||| ||  |||| |||||| ||||| |||||||||||  ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  1640445 ctgcaatatcatcaccagaaataacatggctaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgaaaatttagcataaagtttcttctctttcaa 1640346  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgt 145  Q
     |||||||| |||||||||| ||||    
T  1640345 cacttgcaaaacaatcttcaaatgt 1640321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15291473 - 15291385
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  15291473 aaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 15291385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16353244 - 16353207
Alignment:
Q  413 ctgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16353244 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 16353207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12340874 - 12340802
Alignment:
Q  378 aaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  12340874 aaatcaatcttactgaacacttctgcaccaaccaattgatccatcaaatcatcaatcctcgggagcggatacc 12340802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 453581 - 453153
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  453581 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaatcttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttgacatacaacttcttctctttcaa 453482  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  453481 tacttgtaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcaaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 453383  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||    
T  453382 ggcatggaaaattcggttcatatattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtccatatcgtgtctta 453283  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  453282 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgctgaatacactagcacccactaactgatcca 453183  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  453182 ttaaatcatcgatcctcggaagtggatacc 453153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 515721 - 515293
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  515721 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaa 515622  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||  ||| ||| ||||| || || |||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||  |    
T  515621 cacttgcaagacaattctcagatgctctgcgtgttcctcttcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacacaacgacaaacttatccagaaa 515523  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  515522 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtaatcgtaatgaccatatcgtgtccta 515423  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |     ||||| || ||||||||||    
T  515422 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatcca 515323  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||    
T  515322 tcaagtcatcaattctaggaagcggatacc 515293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 494957 - 495384
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataat-atggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaat 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| | |||||| |||||||      
T  494957 gcaataccactaccagaaataaacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcagactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagc 495056  T
Q  122 acttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag 221  Q
    |||||||| |||||||||| ||  || ||||| |||||||||  ||| || || | |||| || || || || |||| |||||| ||   |||||   |     
T  495057 acttgcaaaacaatcttcaaatactcagcatgttcttcttcagacttcgagtata-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaac 495155  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  495156 gcatgaaaaatacgattcatgtactcaataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaa 495255  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | || |||||||||||||| || || ||||| |||||| | || ||||| || ||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  495256 aagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatcaggtgataaccagatctcaaataaatattgctaaacacacgtgaacccactaactgatccat 495355  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || |||||||| || |||||||||||||    
T  495356 caagtcatcaattcttggaagtggatacc 495384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21743989 - 21743561
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743989 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaagacttacttcacttaaccagaactcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 21743890  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  21743889 cacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatt-aagatgtgatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 21743791  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  21743790 agcatggaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtccta 21743691  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21743690 aaggccgtcttctgcatatcctcattcttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatcca 21743591  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21743590 tcaaatcgtcaattctcggaagtggatacc 21743561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19661573 - 19661145
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19661573 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaggaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttcttttaa 19661474  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19661473 cacttacaatacaatcttcagatgctatgcatgctcttcttcagtccttgaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatctaggta 19661375  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  19661374 ggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtccta 19661275  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  19661274 gaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacatttgcacccactaactgatcca 19661175  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19661174 ttaagtcgtcaattctcggaagtggatacc 19661145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 19856227 - 19856655
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19856227 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaaggaaactcacttcacttaactagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttcttttaa 19856326  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19856327 tatttgcaatactatcttcagatgttcttcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaaaatgtcaccaataaacacaaccacgaatttatccaggta 19856425  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  19856426 ggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcatgagtaacaacgaaaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgtccta 19856525  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||   |||||||||||| |||||||    
T  19856526 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatcca 19856625  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19856626 ttaagtcgtcaattctcggaagtggatacc 19856655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20938500 - 20938072
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20938500 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 20938401  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||| ||||| ||  ||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20938400 tacttgtaatactattctcagatgctctacatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagactgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaagta 20938302  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20938301 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 20938202  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  20938201 aaggccgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatcca 20938102  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || |||||||| |||||||||||||    
T  20938101 tcaagtcgtcaatcctaggaagtggatacc 20938072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24098040 - 24097612
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24098040 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaa 24097941  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| | |||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |    
T  24097940 gacttacaatacaatcttcagattttctgcatgctcctcttcagtcttagaataga-tcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaa 24097842  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  24097841 agcatggaaaatttggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgttcatatcgtgtccta 24097742  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  24097741 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcgatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatcca 24097642  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24097641 ttaagtcatcaattctcggaagtggatacc 24097612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20834337 - 20833911
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  20834337 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcgcttcacataaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaaccttttctctttcaa 20834238  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20834237 aatttgcaacacaatcttcaaatgttctgcatgttcttcttcagtctttgaataaa-tcagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggta 20834139  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20834138 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccacgcgcattagtaacacctaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 20834039  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||   ||||||||| ||||||||||    
T  20834038 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcatactgaaaacctttgcacccaccaactgatcca 20833939  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  20833938 tcaagtcatcaatcctcggaagtggata 20833911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 20296334 - 20296762
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  20296334 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaatctcttttccttcaa 20296433  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  | | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  20296434 cacttgcaatacaattcttagatgctctgcatgctcctcttcattcttagaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 20296532  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  20296533 agcatggaagattcggttcatgtactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 20296632  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     ||||| || ||||||||||    
T  20296633 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatcca 20296732  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20296733 tcaaatcctcaattctcggaagcggatacc 20296762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20855184 - 20854771
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | || ||||| |  ||||| |||    
T  20855184 accagaaataacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctccttcaaaatctgcaacaca 20855085  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| || ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  20855084 atcttcaagtgttctgcatgctcctcttcagttttagaataaa-tcaaaatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaatt 20854986  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20854985 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttct 20854886  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  20854885 gcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaat 20854786  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    || ||||||||||||    
T  20854785 ccgcggaagtggata 20854771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 21952831 - 21953203
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21952831 ctgcaaaaccaccaccataaataatgtgacccagaaagctcacttcgcttaaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacctcttttctttcaa 21952930  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  21952931 aacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcgttcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 21953029  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  21953030 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 21953129  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21953130 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaa 21953203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 48424826 - 48425198
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  48424826 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 48424925  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  48424926 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 48425024  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  48425025 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 48425124  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48425125 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaa 48425198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 52987694 - 52988066
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  52987694 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 52987793  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  52987794 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 52987892  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  52987893 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 52987992  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52987993 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaa 52988066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31538434 - 31538060
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  31538434 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 31538335  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  31538334 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 31538236  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  31538235 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 31538136  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaata 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31538135 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatctatcttactaaata 31538060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 38911263 - 38910894
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  38911263 ctgcaataccactaccagaaataatatgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacagcttagcatacaacctcttttccttcaa 38911164  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || ||||||||||| |  || || || ||||||||| |    
T  38911163 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaataccacaacaaacttatccaggaa 38911065  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  38911064 agcatggaaaatttggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccataacgtgtccta 38910965  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38910964 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact 38910894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 396
Target Start/End: Original strand, 37679002 - 37679376
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || | |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  37679002 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccaaaaaacttacttcacctaaccagaattcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 37679101  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||  || ||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  37679102 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgcttctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 37679200  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  37679201 agcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 37679300  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaata 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37679301 aaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaata 37679376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 222 - 450
Target Start/End: Original strand, 41310679 - 41310907
Alignment:
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  41310679 gcatggaaaattctgttcatatactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaagacatcacgttatattcatagtgaccataacgtgtcctaa 41310778  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41310779 aggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctcaaatcagttttacgaaacacacgtgcacccactaactgatccat 41310878  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41310879 taaatcgtcaattctcggaagtggatacc 41310907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24793053 - 24792625
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||||||||||||    
T  24793053 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttctttcaa 24792954  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||   |||||   |    
T  24792953 cacttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 24792855  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||| || || ||     
T  24792854 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccaaaaggcatacctttatattcatagtgaccataacgcgttctg 24792755  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  24792754 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 24792655  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24792654 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 24792625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 21838872 - 21839300
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  21838872 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 21838971  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  21838972 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 21839070  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  21839071 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 21839170  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  21839171 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 21839270  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21839271 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 21839300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17043452 - 17043024
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  17043452 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 17043353  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||| || | ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  17043352 tacttgcaagacaatcttcatatgctcagcatgttcttctttagtcttggagt-aaatcaaaatatcatcgataaacacaacaacgaaccgatccaaaaa 17043254  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  17043253 ggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 17043154  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  17043153 aaagatgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 17043054  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17043053 tcaaatcatcaattctcggtagtggatacc 17043024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 50618835 - 50618407
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  50618835 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaa 50618736  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||| ||||| ||| |||| || |||| |||| ||||||||||| || | |||||||||   ||| |   |    
T  50618735 cacttgcaaaacagtcttcaaatgctcaacatgttcttcctcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatcaaaaaa 50618637  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||    
T  50618636 tgcatgaaaaatgtgattcatgtactccataaacactccaggggcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttcta 50618537  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50618536 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatcca 50618437  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  50618436 tcaagtcatcaattctcggaagtggatacc 50618407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 19108292 - 19108718
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  19108292 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaaca 19108391  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    |||| || |||||||||| ||| || ||||| |||| |||| ||||||| |||| |||| || ||||| ||||||| ||| |||||   |||||   | |    
T  19108392 cttggaagacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttagagtaaa-tcaaaatatcatcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatg 19108490  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    | ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |  |||||||| || || || ||    
T  19108491 cgtggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatggtgaccataacgcgttctgaa 19108590  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     | ||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  19108591 agttgtcttctgcatatcttcatcttttacttttatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatc 19108690  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19108691 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 19108718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33389448 - 33389038
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  33389448 aaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatctt 33389349  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  33389348 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 33389250  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  33389249 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 33389150  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33389149 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 33389050  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  33389049 gaagtggatacc 33389038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 41308598 - 41308771
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41308598 caataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacac 41308697  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaaca 198  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41308698 ttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaat-aaattaagatgtcatcaataaaca 41308771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21234168 - 21233740
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  21234168 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 21234069  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  21234068 cacttgcaagacaatcttcagatgttcagcatgttcttcttcagtcttggagt-aaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 21233970  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  | || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  21233969 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcgaggtgcattgatcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 21233870  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  21233869 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 21233770  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21233769 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 21233740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 21832224 - 21832652
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  21832224 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 21832323  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  21832324 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 21832422  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||  |     
T  21832423 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccatgtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttg 21832522  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  21832523 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 21832622  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21832623 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 21832652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 51331930 - 51331502
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  || | |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  51331930 ctgcaataccatcactagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaaacttcttctctttcaa 51331831  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  51331830 cacttgcaaaacaatcttcagatgctccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 51331732  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  51331731 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 51331632  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  51331631 aaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 51331532  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51331531 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 51331502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 177 - 450
Target Start/End: Original strand, 16378172 - 16378445
Alignment:
Q  177 atcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgc 276  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||   |  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16378172 atcaaaatgtcatcaataaacacaaccacgaaacgatccaaaaacacatgaaaaattcgattcatgtactccatgaacacaccaggcgcatttgtaacac 16378271  T
Q  277 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacct 376  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||  || ||||| || ||    
T  16378272 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctagtgataacctgatct 16378371  T
Q  377 caaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  16378372 caaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacc 16378445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22503723 - 22503298
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || |  || ||||| |  ||||| ||||| || ||    
T  22503723 caataccatcaccataaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatattttagcataaagtttcttctcttttaacac 22503624  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || || | |||| ||||   |||||   | ||    
T  22503623 ttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaaaacaaccccgaaccgatccaaaaatgc 22503525  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || || || ||     
T  22503524 atggaagatgcgattcatttactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaagacataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaa 22503425  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22503424 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactatctgatccatca 22503325  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22503324 aatcatcaattctcggaagtggatacc 22503298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16348983 - 16348604
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  16348983 aaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttgg 16348884  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | |||| |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  16348883 agtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 16348785  T
Q  271 taacgccgaaa-ggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaac 369  Q
    |||| || ||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  16348784 taactcccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataac 16348685  T
Q  370 ccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16348684 ctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 16348604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 41352081 - 41351700
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  41352081 aaataacatgaccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 41351982  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || || |||| ||||||||| | |||||   | |||||||| || || ||    
T  41351981 cagatgttctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 41351883  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  41351882 catataccccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 41351783  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||    
T  41351782 tcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatccat 41351700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 20140005 - 20140433
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| || | ||   | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  20140005 ctgcaataccactacgagaaataacatggccaagaaagctcacttttttcaaccagaattcacacttagacaatttagcatagagcttcttttctttcaa 20140104  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||||||||||  || || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || |||||||| || | |||||  ||   |||||   |    
T  20140105 cacttgcaaaacaatcttcaagtgatcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccaaaaaacgatccaaaaa 20140203  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||     
T  20140204 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtgacaccgaacgacattaccttgtactcataatgtccataacgcgttctg 20140303  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  20140304 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgaactcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 20140403  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  20140404 tcaaatcatcgattctcggaagtggatacc 20140433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 21750862 - 21751290
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| | ||||||    
T  21750862 ctgcaataccattgccagaaataacatgtccaagaaaaattacttcttttaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctttttcaa 21750961  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| | || || |||||||| || | |||||||||   |||||   |    
T  21750962 cacttgcaaaaccaacttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaa-atatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaa 21751060  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  21751061 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaagagcattagtaacaccaaaaggcataactttatactcataatgtccataccgcgtccta 21751160  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | |||||||| |||||| || || ||||| |||||||| || | |||||| |||||||| |||||  | || |||| |||||| |||||||||||||    
T  21751161 aaagttgtcttctacatatcttcatctttcactttaatctggtgatgacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacacttgcacctactaactgatcca 21751260  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21751261 tcaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 21751290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21862807 - 21862382
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| | |||||| ||||| || ||    
T  21862807 caataccattgccataaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagcttcttctctttgaacac 21862708  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| || ||||||| ||| || ||||| ||||| ||| |||| || |||| | || |||||||||||||| | |||||||||    ||||   | ||    
T  21862707 ttgcaaaaccatcttcaaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaattaaa-atgtcatcaataaaaacaaccacgaaacggtccaaaaatgc 21862609  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| || ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  |||| || || |||||     
T  21862608 atgaaaaatgcgattcatgtgctccataaacacactaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtgcataccgcgttctaaaa 21862509  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||  ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21862508 gctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatgtatcttgctgaacacacgtgcacccaccaactgatccatca 21862409  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||| || || |||||||||||||    
T  21862408 agtcatctattcttggaagtggatacc 21862382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23196686 - 23196544
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23196686 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaa 23196587  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttca 163  Q
     |||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23196586 cacttgcaacacaattttcagatgctctacatgctcttcttca 23196544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 430553 - 430125
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  |||||||||| ||||| || || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  430553 ctgcaataccactaccagaaataacatgcccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcacacttagataatttcgcataaagcttcttctctttcaa 430454  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| |||| || |||||||| || | |||||||||   |||||   |    
T  430453 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 430355  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || ||  |||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| |||| || || ||     
T  430354 tgcatgaaagatgcgaatcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctg 430255  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  430254 aaggctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 430155  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  430154 tcaagtcatcaatccttggaagttgatacc 430125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22360681 - 22360255
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| | || | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | | |||| ||||||||    
T  22360681 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagatagctcacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaatcatcttctctttcaa 22360582  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     || ||||| || |  |||| ||| || ||| | |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||||||||| | ||| |||||   ||||    |    
T  22360581 cacctgcaaaaccagtttcaaatgctcagcaggttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaataaaaacaacgacgaaccgatcctaaaa 22360483  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||     
T  22360482 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactcaaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctg 22360383  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || ||   ||||||||||||||||||||    
T  22360382 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacttttgcacccactaactgatcca 22360283  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22360282 tcaaatcatcaatcctcggaagtggata 22360255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20829496 - 20829401
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20829496 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 20829401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 35930938 - 35930834
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35930938 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 35930839  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  35930838 atacc 35930834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 311
Target Start/End: Original strand, 20944152 - 20944241
Alignment:
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatat 311  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  20944152 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttttattcataatgaccatat 20944241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20829779 - 20829691
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  20829779 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 20829691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Original strand, 21026098 - 21026242
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||| | |||  | |||||||||||||| || || |  || ||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  21026098 caataccatcaccagaaataacatggccaaaaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagatattttagcataaagtttcttctctttcaacac 21026197  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatctt 168  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  21026198 ttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtctt 21026242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 41215969 - 41215865
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  41215969 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagcgg 41215870  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  41215869 atacc 41215865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Original strand, 20527299 - 20527403
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  ||||| |||| || || || |||||||||||||||||||| ||   || | |  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20527299 ccttcactctaatcagatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctttgtatcttctagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 20527398  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  20527399 atacc 20527403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Original strand, 22116835 - 22116874
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaact 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22116835 ctgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaact 22116874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 448
Target Start/End: Original strand, 20927309 - 20927402
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||| || || || |||| ||||||||| ||||| ||   |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20927309 taatctgatgatatcctgatctcatatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctttgaagtggata 20927402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 33274 - 33700
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  33274 gcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaactagaactcacattttaacaacttggcatacaacttcttctctttcaaca 33373  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    | || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||    
T  33374 cctgtaatacaatctttagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaagatgtcatcaatgaacacaaccacgaatttatccaaatagg 33472  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33473 catggaaaatttggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaa 33572  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33573 ggccgtcttctgcatatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaattgatccatt 33672  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  33673 aagtcatcaatcctcggaagtggatacc 33700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 11731 - 12160
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11731 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttaattcactcaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 11830  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  11831 cacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaatt-aggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 11929  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  11930 ggcatgaaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtccta 12029  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaa-tcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcc 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12030 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaattcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatcc 12129  T
Q  420 attaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12130 attaaatcgtcaattctcggaagtggatacc 12160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 16579 - 17007
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  16579 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcaattagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 16678  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||| ||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||| ||||| |  ||||||||   |||||        
T  16679 cacttacaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaaaaccaccacgaaccgatccaaaag 16777  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || ||     
T  16778 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactcctggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgaccataccgcgttctg 16877  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  16878 aaagctgtcttctgcatatcttcacctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 16977  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16978 tcaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 17007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1853 - 1425
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1853 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaactaacttcatttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaa 1754  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  1753 cacttgcaatacaatcttcagatcttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 1655  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  1654 ggcatggaaaattcggtttatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagatatcaccttatattcatagtgttcatatcgtgtccta 1555  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  1554 aagaccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactatacacacgagcacccactgactgatcca 1455  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1454 ttaaatcatcaatcctcggaaatggatacc 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5718 - 5291
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5718 ctgcaataccactaccagaactaatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaa 5619  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  5618 cacttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 5520  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5519 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgc-agtcgcattagtaacaccgaaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtccta 5421  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5420 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatcca 5321  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5320 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 5291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 10149 - 9722
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10149 ctgcaataccactaccagaactaatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaa 10050  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10049 cacttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 9951  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9950 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgc-agtcgcattagtaacaccgaaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtccta 9852  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9851 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatcca 9752  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9751 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 9722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 258 - 450
Target Start/End: Original strand, 1 - 193
Alignment:
Q  258 ccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaa 357  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||| | || |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| || || || || ||||    
T  1 ccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatatacatagtgaccataccgtgttctgaaatctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaa 100  T
Q  358 tctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  101 tctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacgcgtgcacccacaaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 440
Target Start/End: Original strand, 19454797 - 19455213
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19454797 gcaacaccactaccaaaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaa 19454896  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||    
T  19454897 cttgcaatactatcttcagatgctctgcatgctcttctttagtctttgaataaa-tcaagatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccaagtagg 19454995  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19454996 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 19455095  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455096 ggccgtcttctacatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtaaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 19455195  T
Q  423 aaatcatcaatcctcgga 440  Q
    || |||||||||||||||    
T  19455196 aagtcatcaatcctcgga 19455213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 25769615 - 25770043
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  25769615 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttagcatacaacttcatttatttcaa 25769714  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||    
T  25769715 cacttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcatacttagaataaatt-aggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccggata 25769813  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  25769814 agcatggaaaattcggttcatatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtccta 25769913  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    |||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25769914 aaggccattttctgcatatcctcatcattcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatcca 25770013  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25770014 ttaaatcatcaattctcggaagtggatacc 25770043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14378426 - 14377998
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14378426 ctgcaatacaactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcacatttcgacaacttggcatacaactttttctctttcaa 14378327  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   | ||||||||||| | |||||| |||||||||||  |    
T  14378326 gacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcagactatcatcaataaatacaaccacaaatttatccagaaa 14378228  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14378227 agcatgtaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 14378128  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  14378127 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatcca 14378028  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
      || |||| |||||| |||||||||||||    
T  14378027 acaagtcataaatcctaggaagtggatacc 14377998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14379976 - 14379548
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14379976 ctgcaatacaactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcacatttcgacaacttggcatacaactttttctctttcaa 14379877  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   | ||||||||||| | |||||| |||||||||||  |    
T  14379876 gacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcagactatcatcaataaatacaaccacaaatttatccagaaa 14379778  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14379777 agcatgtaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 14379678  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  14379677 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatcca 14379578  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
      || |||| |||||| |||||||||||||    
T  14379577 acaagtcataaatcctaggaagtggatacc 14379548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 19436773 - 19437201
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||  || ||||| |     
T  19436773 ctgcaataccactaccagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaagcagaactcacacttcgacaacttagcatacaactctttctcttttag 19436872  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  19436873 aatttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaataga-tcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 19436971  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19436972 ggcatggaaaatttggttcatatactccatgaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtccta 19437071  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||    
T  19437072 aaggctgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctctgcacccaccaactgatcca 19437171  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||    
T  19437172 tcaagtcataaatcctcggaagtggatacc 19437201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 18796461 - 18796889
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18796461 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccatgaaaactcacttcatttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 18796560  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||| |||| |||||| || | |||||| ||||||||||| ||    
T  18796561 tacttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaataga-tcaaaatgttatcaatgaatacaaccacaaatttatccagata 18796659  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796660 ggcatggaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcacattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 18796759  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||    
T  18796760 aaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtagcctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatcca 18796859  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||    
T  18796860 tcaagtcgtcaatcctcggaagcggatacc 18796889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 21473372 - 21473798
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21473372 ctgcaataccactaccaaaaatattgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacatacaacttcctttctttcaa 21473471  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  21473472 cacttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcattcttagaataaatt-aggatatcataaataaacacaaccacaaatttatccagata 21473570  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  21473571 agcatgaaaaattcggttcatatactccataaacacaccag-cgcattagtaacatcgaaagacatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtccta 21473669  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||||| ||    
T  21473670 aaggccgttttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaacacacgagcacccactaactgattca 21473769  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||    
T  21473770 ttaaatcatcaattctaggaagtcgatac 21473798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Original strand, 19881069 - 19881495
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  19881069 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcactttgacaatttggcatacagtttcttctctttcaa 19881168  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| | |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  19881169 tacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaataga-tcaaaatgtcatcaatgaacacaaccacaaatttatccaggta 19881267  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19881268 agcatgaaaaatcctattcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtccta 19881367  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||    
T  19881368 aaggcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatcca 19881467  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || || |||||||||||||| |||||    
T  19881468 tcaagtcgtcaatcctcggaagcggata 19881495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 10467359 - 10466931
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||| || ||||||| || || |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10467359 ctgcaataccactatcagaaataatgtgacccagaaaactcacttcgcttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaa 10467260  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| | |  | || |||||||||||||  || || || |||||||   |    
T  10467259 aacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagattaga-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccataaa 10467161  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  10467160 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgactttatcgtgtccta 10467061  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  10467060 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatcca 10466961  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  10466960 tcaagtcatcaattctcggaagtggatacc 10466931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34644096 - 34643670
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34644096 ctgcaataccacttccagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 34643997  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||| ||  |  | ||||| | |||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  34643996 tacttgcaacacaattcttagatgttctgcatgctcttcctccgttgtcgaataga-tcaaaatgtcatcaatgtacacaaccacaaatttatccagata 34643898  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34643897 agcatgaaaaattctattcatatactccatgaacaccccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 34643798  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |     ||||| || ||||||||||    
T  34643797 aaggcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatcttggcaccaaccaactgatcca 34643698  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || || ||||| |||||||| |||||    
T  34643697 tcaagtcgtcaattctcggaagaggata 34643670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21568498 - 21568129
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21568498 caataccactaccagaaataatgtggccgagaaaacttacttcaattagccagaattcacatttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaac 21568399  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
     |  ||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||  || ||||||||||| | |||||  |||||||||||  | ||    
T  21568398 ctataattcaatcctcagatgttctacatgctcctcttcggtcttagaataaa-tcagaatatcatcaataaatacaaccataaatttatccagaaaagc 21568300  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21568299 atgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaagacatcactttgtattcgtaatgaccataaagtgtcctaaag 21568200  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21568199 gccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaa 21568129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28281310 - 28280897
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  28281310 accagaaataatgtgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaattcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaacaca 28281211  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  28281210 attctcagatgttctgcatgctctccttcagtcttcgaataaa-tcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaatt 28281112  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28281111 cgattcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttct 28281012  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   |||||| || | ||| ||||| || ||||||||    
T  28281011 gcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacctaccagctggtccatcaagtcatcaat 28280912  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| |||||    
T  28280911 cctcggaagcggata 28280897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 448
Target Start/End: Original strand, 15461112 - 15461533
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |  |    
T  15461112 ataccattaccagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaaccagaaatcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaatct 15461211  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || || || |||||| | |||||||||| |||  || ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  15461212 gcaacacaatcttcaagtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataaa-tcagaatatcatctataaacaccaccacaaatttatctagaaaggcat 15461310  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15461311 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggc 15461410  T
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    ||||| || ||||| ||||| |||    
T  15461411 cgtcttttgcatatcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaa 15461510  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  15461511 tcatcaatccgcggaagtggata 15461533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Original strand, 24366183 - 24366552
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  24366183 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaa 24366282  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  |||  || ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  24366283 cacttgcaatacaattctcaggtgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 24366381  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  24366382 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaatacacctggcacattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 24366481  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24366482 aaggccgtcttttgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact 24366552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2873295 - 2872885
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||  | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| | |||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  2873295 aaataacatggccaaggaaactcacttctttcaaccaaaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctccttcaacacttgcaaaacaatctt 2873196  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || |||||||||||||| ||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  2873195 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacataaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 2873097  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  2873096 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 2872997  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2872996 tcttcatcctttactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 2872897  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  2872896 gaagtggatacc 2872885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22828862 - 22828437
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  22828862 caataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacac 22828763  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || |||  ||| |||||   |||||   | ||    
T  22828762 ttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacgcaactacgaaccgatccaaaaatgc 22828664  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||     
T  22828663 atggaagatacgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaa 22828564  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22828563 gctgtcttctgcatatctttatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 22828464  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22828463 aatcatcaattctcggaagtggatacc 22828437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19487779 - 19487489
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  19487779 caatactactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttctttaccttcaacac 19487680  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||   |||||  || ||    
T  19487679 ttgcaacacaatctttaaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaat-aaatcaagatgtcatcaataaaaacaaccacaaaccgatccaaataagc 19487581  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||           ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19487580 at----------attcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaag 19487491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24294274 - 24293864
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24294274 aaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatctt 24294175  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  24294174 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 24294076  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| |  || || || |||||||||||||||    
T  24294075 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctgaaagctgtcttctgcata 24293976  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24293975 tcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 24293876  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  24293875 gaagtggatacc 24293864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5837729 - 5837301
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5837729 ctgcaataccattaccagaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagacaacttggcataaagcttcttttctttcaa 5837630  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||| ||||| ||| |||| ||||||| |||  ||||| ||||| || | |||||| ||   |||||   |    
T  5837629 cacttgcaaaacagtcttcagatgctcaacatgttcttcctcagtcttggaataaa-tcagaatgtcgtcaatgaagacaaccacaaagcgatccaaaaa 5837531  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||| || || ||     
T  5837530 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctg 5837431  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||    
T  5837430 aaagcggtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacaaaagcacccactaactgatcca 5837331  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5837330 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 5837301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 27189225 - 27189635
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  27189225 aaataacatggccaaggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttggacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 27189324  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| || || || || | |||||||||   ||| |   | |||||||| || || ||    
T  27189325 cagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaagatatcgtcgatgaatacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaagatgcgatt 27189423  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  27189424 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 27189523  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27189524 tcctcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 27189623  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  27189624 gaagtggatacc 27189635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27260015 - 27259605
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  27260015 aaataacatggccaaggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttggacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 27259916  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| || || || || | |||||||||   ||| |   | |||||||| || || ||    
T  27259915 cagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaagatatcgtcgatgaatacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaagatgcgatt 27259817  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  27259816 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 27259717  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27259716 tcctcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 27259617  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  27259616 gaagtggatacc 27259605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 267 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24516673 - 24516490
Alignment:
Q  267 ttagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggt 366  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  24516673 ttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggt 24516574  T
Q  367 aacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24516573 aacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 24516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23086180 - 23085861
Alignment:
Q  122 acttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag 221  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||  |||||| || | |||| || ||||| || |||| |||||||||   |||||  ||     
T  23086180 acttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcatacttagagtata-tcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatccaaatac 23086082  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23086081 gcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacccggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcataatgtccataacgtgtcctaa 23085982  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    |||| |||||||  ||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23085981 aggccgtcttctagatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccat 23085882  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaag 442  Q
     || || ||||| || |||||    
T  23085881 caagtcgtcaattcttggaag 23085861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16926148 - 16925732
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  16926148 ctgcaataccattaccagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagataacttggcataaagtttcttctctttcaa 16926049  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || || | |||||||||   |||||   |    
T  16926048 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 16925950  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  16925949 tgcatggaagatgcgcttcatatactccaaaaacactccaggtgcattggtcacaccgaacggcataacattatattcatagtgaccataccgcgttctg 16925850  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  16925849 aaagctgtcttctacatatcttcatctttcactttaatctggtgataaccttacctcaaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaactgatcca 16925750  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcg 438  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  16925749 tcaaatcatcaattctcg 16925732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 25608371 - 25607943
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  25608371 ctgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 25608272  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||  |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||||||||| | ||| ||||||  |||||   |    
T  25608271 cacttgtaaaacaatcttcaaatgctcagcatcttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaataaaaacaactacgaatcgatccaaaaa 25608173  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || |  ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||     
T  25608172 tgcatgaaagatgcaattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacagcattaccttgtactcataatgtccataacgcgttctg 25608073  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  25608072 aaagctgtcttctgcatgtcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatcca 25607973  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  25607972 tcaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 25607943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27564343 - 27563915
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  27564343 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaa 27564244  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || |||| |||||||||   ||| |   |    
T  27564243 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatttcatcgatgaacacaaccacgaaccgatctaaaaa 27564145  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| |||||   ||| ||| | || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  27564144 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactttaggtgcaatggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 27564045  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||| |||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  27564044 aaagctgccttctgcatatcttcatcttttactttaatttggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 27563945  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27563944 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 27563915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 450
Target Start/End: Original strand, 19866471 - 19866886
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||  || || |  || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  19866471 accagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacgcttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagaca 19866570  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||| |||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||| | |||||| ||   |||||   | |||||||| ||     
T  19866571 atcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaaaacaaccacaaagcgatccaaaaatgcatggaagatg 19866669  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||    
T  19866670 cgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttct 19866769  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || || || || |||||||  || ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19866770 gcatatcttcatcttttactttaatctcgtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 19866869  T
Q  434 cctcggaagtggatacc 450  Q
     ||||||||||||||||    
T  19866870 tctcggaagtggatacc 19866886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 25114341 - 25114751
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  25114341 aaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttgacataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 25114440  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || ||||| || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  25114441 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcatcgatgaacaaaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 25114539  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || ||||||||  | |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  25114540 catatactccataaacactccaggtgtattggtaacaccaaaaggcataactttatattcacagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 25114639  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || ||  |||| || ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25114640 tcttcaacctttactttaatctgatgataacctggccccaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 25114739  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  25114740 gaagtggatacc 25114751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 28261657 - 28261279
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  28261657 aaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttgg 28261558  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | |||| |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  28261557 agtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 28261459  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    | ||  |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||    
T  28261458 tcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 28261359  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28261358 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 28261279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Original strand, 28284259 - 28284637
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  28284259 aaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttgg 28284358  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | |||| |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  28284359 agtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 28284457  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    | ||  |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||    
T  28284458 tcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 28284557  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28284558 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 28284637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 28340406 - 28340028
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  28340406 aaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttgg 28340307  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | |||| |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  28340306 agtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 28340208  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    | ||  |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||    
T  28340207 tcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 28340108  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28340107 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 28340028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16961989 - 16961564
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  16961989 caataccattaccagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagatgacttggcataaagtttcttctctttcaacac 16961890  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || ||||| || | |||||||||   |||||   | ||    
T  16961889 ttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgc 16961791  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||| || |||||||| || || || ||     
T  16961790 atggaagatgcgattcatatactccataaacacttcaggtgcattggtcacaccgaacgacataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaa 16961691  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    ||||| |||||||||||||| |    
T  16961690 gctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaactttcgcaccgactaactgatccatca 16961591  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    
T  16961590 aatcatcaattcttggaagtggatacc 16961564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18183662 - 18183449
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  ||||||||||    
T  18183662 ttcatgtacaccataaacacaccaggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgtgctaaaagacgtcttctgca 18183563  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||    
T  18183562 tatcttcatctttcactttaatctggtgataaccggacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatgcatcaagtcatcaattct 18183463  T
Q  437 cggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||    
T  18183462 cggaagtggatacc 18183449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22760965 - 22760537
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  22760965 ctgcaataccactaccacaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 22760866  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||| ||| || | ||||| ||| || |||||||||||||||  ||| || |||| |||| || |||| |||||| | |||||||||   |||||   |    
T  22760865 cacttacaaaaccagcttcaaatgctcagcatgctcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcattaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 22760767  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || ||     
T  22760766 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtccataacgcgttctg 22760667  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||| |||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  22760666 aaagctgtcttgtgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgacaacacgtgcacccactaactaatcca 22760567  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22760566 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 22760537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18963383 - 18963170
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  18963383 ttcatgtactccataaatacacctggtgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaagtcgtcttctgca 18963284  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    |||| || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  18963283 tatcgtcatctttcactttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatcatcaattct 18963184  T
Q  437 cggaagtggatacc 450  Q
     |||||||||||||    
T  18963183 tggaagtggatacc 18963170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 450
Target Start/End: Original strand, 16573879 - 16574089
Alignment:
Q  240 atatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatat 339  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  16573879 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 16573978  T
Q  340 cctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcgg 439  Q
    | || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16573979 cttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcgg 16574078  T
Q  440 aagtggatacc 450  Q
    |||||||||||    
T  16574079 aagtggatacc 16574089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16621501 - 16621291
Alignment:
Q  240 atatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatat 339  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  16621501 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 16621402  T
Q  340 cctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcgg 439  Q
    | || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16621401 cttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcgg 16621302  T
Q  440 aagtggatacc 450  Q
    |||||||||||    
T  16621301 aagtggatacc 16621291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 25763738 - 25763310
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||   |||| |||| | |||||||||||||||||  ||  | |||||||| |||||||| || || || |||||||  ||  | ||||||||    
T  25763738 ctgcaataccgtcaccagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacaattagataatttagcatacatttttatctctttcaa 25763639  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||| ||||| |||| || |||| | || |||||||||||||| | |||||  ||   |||||   |    
T  25763638 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttctccttcagtcttggagtaaattaaa-atgtcatcaataaagacaaccataaagcgatccaaaaa 25763540  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||| |||| || || |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| || || ||     
T  25763539 tgcaaggaagatgcgattcatatactccataaacagtccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcatagtggccataacgcgttctg 25763440  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || ||  |||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  25763439 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttacttttttctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 25763340  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25763339 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 25763310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18406454 - 18406026
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  18406454 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttaaacaatttagcatatagtttcttctctttcaa 18406355  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || |  |||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || |||||||| || | |||||| ||   |||||   |    
T  18406354 cacttgcaaaaccagtttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaa 18406256  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    || ||     
T  18406255 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatgtccataatacgttctg 18406156  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| || | |||||| |||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  18406155 aaggctgtcttctgcatatcttaatctttcactttaatctggtgatgacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatcca 18406056  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18406055 tcaaatcatcaattctcggaggtggatacc 18406026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20634450 - 20634022
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  20634450 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 20634351  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| ||||||| |  ||| || |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||   |||||   |    
T  20634350 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttctttagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 20634252  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||     
T  20634251 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctg 20634152  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || |  || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  20634151 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttctactttaatctggtgataaccagatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 20634052  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20634051 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 20634022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 22435642 - 22436068
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || | ||| |  ||||| |||||||| |    
T  22435642 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttaggataaagtttcttctctttcaaca 22435741  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||| | |||| || |||| | || || ||||| ||||| | |||||||||   |||||   | |    
T  22435742 cttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttctttagtcttggagtaaattaaa-atatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatg 22435840  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| || || || ||||| |||||||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||  | ||    
T  22435841 catgaaagatgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacacgttttgaa 22435940  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||     
T  22435941 agctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatc 22436040  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22436041 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 22436068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5295716 - 5295574
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5295716 ctgctataccattaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaacacgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaa 5295617  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttca 163  Q
     |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5295616 cacttgcaacacaattttcagatgctctgcatgctcttcttca 5295574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 319 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 30679220 - 30679089
Alignment:
Q  319 taaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30679220 taaaggctgtcttctgcatatcctcatccgtcactttaatctgatgatagcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgtacccactaactgatc 30679121  T
Q  419 cattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  30679120 catcaaatcatcaattcttggaagtagatacc 30679089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 340
Target Start/End: Original strand, 23080240 - 23080558
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |  ||  | |||||||| ||| | ||||| || || ||||| |  ||||| |||||||     
T  23080240 ctgcaataccactaccaaaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcaaactttgataatttagcataaagtttcttctctttcag 23080339  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||| |||  ||| || |||| |||| || ||||| || |||| |||||||||   ||| ||  |    
T  23080340 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcctcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatctagaaa 23080438  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  23080439 tgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcgttcta 23080538  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatc 340  Q
    ||  | ||||||||||||||    
T  23080539 aaatccgtcttctgcatatc 23080558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8761939 - 8761835
Alignment:
Q  345 tccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtg 444  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8761939 tccttcaacttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtg 8761840  T
Q  445 gatac 449  Q
    |||||    
T  8761839 gatac 8761835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 450
Target Start/End: Original strand, 18450480 - 18450702
Alignment:
Q  228 aaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctg 327  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||  |  || |||||||||||||  |    
T  18450480 aaaatacggttaatatattccataaatactcccagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatattcgtaatttctgtaacgtgtcctaaaggtcg 18450579  T
Q  328 tcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatc 427  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || ||||  || || ||||| || || ||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18450580 tcttctgaatatcctcttctttcactttgatctagtgatagcccgagcttaagtcaattttactgaacacaagcgcacccactaattgatccatcaaatc 18450679  T
Q  428 atcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     |  |||||||||||||||||||    
T  18450680 gttgatcctcggaagtggatacc 18450702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 324 - 450
Target Start/End: Original strand, 21755006 - 21755132
Alignment:
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || |||  ||||||||||||||||||||| |    
T  21755006 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacaaatgcacccactaactgatccatca 21755105  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  21755106 agtcatcaatcctcggaagtggatacc 21755132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16380550 - 16380455
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16380550 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 16380455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16648146 - 16648051
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16648146 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctttgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 16648051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18965801 - 18965663
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||    
T  18965801 aataccattaccagaaataatatggccaaggaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcatcact 18965702  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttca 163  Q
    || || |||||||||| ||| || | ||| |||||||||    
T  18965701 tgaaaaacaatcttcaaatgctcagaatgttcttcttca 18965663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 388
Target Start/End: Original strand, 22444040 - 22444404
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || | ||| |  ||||| |||||||| |    
T  22444040 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttaggataaagtttcttctctttcaaca 22444139  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||| | |||| || | |||| || || ||||| ||||| | |||||||||   |||||   | |    
T  22444140 cttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttctttagtcttggagt-aaattaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatg 22444238  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| || || || ||||| |||||||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||  | ||    
T  22444239 catgaaagatgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacacgttatgaa 22444338  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatctt 388  Q
     ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  22444339 agctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatctt 22444404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 23998352 - 23998447
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23998352 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 23998447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1647000 - 1646896
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1647000 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 1646901  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  1646900 atacc 1646896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Original strand, 16100110 - 16100214
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16100110 ccttcactataatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatccttggtagtgg 16100209  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  16100210 atacc 16100214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Original strand, 14130564 - 14130668
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||    ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14130564 ccttcactctaatctgatgatatcttgacctcaaatcaatcttgctaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 14130663  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  14130664 atacc 14130668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16380833 - 16380745
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  16380833 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 16380745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23025932 - 23025828
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||     |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23025932 ccttcactctaatctgatgatatcttgacctcaaatcaatcttactaaacacctccacaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcgg 23025833  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  23025832 atacc 23025828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 444
Target Start/End: Original strand, 23080556 - 23080616
Alignment:
Q  384 atcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtg 444  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||    
T  23080556 atcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtg 23080616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1647274 - 1647171
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||   || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||||| |||| ||| |    
T  1647274 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaaccggttatctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttcctcaaacttcg 1647175  T
Q  171 aata 174  Q
    ||||    
T  1647174 aata 1647171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18196241 - 18196102
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||  | ||||| || ||| | |||||||| || ||||| | |||||| |||||||  |    
T  18196241 gcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaattcacatctttcaaccaaaattcatactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagca 18196142  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttc 162  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  18196141 cttgcaaaacaatcttcaaatgcttagcatgctcttcttc 18196102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16648429 - 16648341
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  16648429 aaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 16648341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 23998069 - 23998157
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||  || |||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  23998069 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacataactggttctctttcaagacttacaacacaatcctcaaatgttcagcatgctcttc 23998157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Original strand, 18450276 - 18450364
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttctt 111  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||   |||  | |||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||    
T  18450276 gcaataccattaccagaaataatatgaccaagaaaactcccttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataacttctt 18450364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 4114 - 4545
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4114 ctgcaataccactaccataaatgatatggcccagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaa 4213  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  4214 cacttgcaatacaatcttcagatgttatgcatgctcttcttcagtcttataataaa-tcaagatgtgatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 4312  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttat---attcgtaatgaccatatcgtgtc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||    
T  4313 ggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttattatattcataatgaccataacgtgtc 4412  T
Q  318 ctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgat 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  4413 ctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatggtaaccggacctcaaatcaattttactaaacacaggtgcacccacaaactgat 4512  T
Q  418 ccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4513 ccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacc 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22234467 - 22234039
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22234467 ctgcaataccactactagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgataacttgacatacaacttcttttctttcaa 22234368  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22234367 cacttgcaatacaatcttcagatgatctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 22234269  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  22234268 agcatggaaaattttgttcatatactccacaaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtccta 22234169  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22234168 aaggccgtcttcggcatatcctcatccatcaccttaatctgatggtaacctaacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatcca 22234069  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234068 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 22234039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17267868 - 17267455
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  17267868 accagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaacttacatttcgacaatttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacaca 17267769  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  |||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17267768 attctcaggtgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaa-tcagaatatcatcaataaataccaccacaaatttatccagaaaggcatgaaaaatt 17267670  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17267669 cgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 17267570  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  17267569 gcatatcctcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaat 17267470  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| |||||    
T  17267469 cctcggaagcggata 17267455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Original strand, 22504500 - 22504869
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  22504500 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaa 22504599  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  22504600 aacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcgttcttagaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 22504698  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  22504699 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggctcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtccta 22504798  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22504799 aaggccatcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaagtcaatcttact 22504869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21679325 - 21679005
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21679325 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 21679226  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| | |||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||    
T  21679225 tacttgcaatacaatcctcggatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaataga-tcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatctaggta 21679127  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
      |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21679126 aacatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatccgtaatgaccatatcgtgtccta 21679027  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcct 342  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  21679026 aaggcagtcttctgcatgtcct 21679005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Original strand, 22463785 - 22464198
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||  | || ||||| |  ||||| |||    
T  22463785 accagaaataacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgtacttcgacaacttggcatacaactttctctccttcaaaatctgcaacaca 22463884  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| || ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  22463885 atcttcaagtgttctgcatgctcctcttcagttttagaataaa-tcaaaatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaatt 22463983  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22463984 cggttcatatactccatgaacataccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttct 22464083  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22464084 gcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaggtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaat 22464183  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    || ||||||||||||    
T  22464184 ccgcggaagtggata 22464198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Original strand, 25849896 - 25850322
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  25849896 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaa 25849995  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||  || || || ||||||||  |    
T  25849996 cacttgcaatactattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttcgaataaa-tcaagatatcatcaatgaacactacaacaaacttatccagaaa 25850094  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  25850095 agcatggaagatttggttcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 25850194  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |     ||||| || ||||||||||    
T  25850195 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatcca 25850294  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || || ||||| |||||||| |||||    
T  25850295 tcaagtcgtcaattctcggaagcggata 25850322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 33 - 448
Target Start/End: Original strand, 20823286 - 20823700
Alignment:
Q  33 taccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatac 132  Q
    ||||| ||||||  ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |  ||||| ||    
T  20823286 taccagaaataacgtggccgaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaatctgcaacac 20823385  T
Q  133 aatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaat 232  Q
    ||||||||  ||||| || || || |||||| | || ||||| | |||| || ||||| |||||||  ||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  20823386 aatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagtttttgaataga-tcaatatatcatctataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaat 20823484  T
Q  233 tcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20823485 tcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttc 20823584  T
Q  333 tgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaa 432  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  20823585 tgcatatcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaa 20823684  T
Q  433 tcctcggaagtggata 448  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20823685 tccgcggaagtggata 20823700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28893484 - 28893063
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |  |    
T  28893484 ataccattaccagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaatct 28893385  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || || || |||||| | |||||||| | |||| || ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||  | ||||    
T  28893384 gcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataga-tcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcat 28893286  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28893285 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagc 28893186  T
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
     |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    ||||| || ||||| ||||| ||     
T  28893185 cgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaag 28893086  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28893085 tcatcaatccgcggaagtggata 28893063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28922310 - 28921889
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |  |    
T  28922310 ataccattaccagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaatct 28922211  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || || || |||||| | |||||||| | |||| || ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||  | ||||    
T  28922210 gcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataga-tcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcat 28922112  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28922111 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagc 28922012  T
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
     |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    ||||| || ||||| ||||| ||     
T  28922011 cgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaag 28921912  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28921911 tcatcaatccgcggaagtggata 28921889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 20344103 - 20344475
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  20344103 ctgcaataccattaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttctctttcaa 20344202  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  20344203 aacttgcaagacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 20344301  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  20344302 agcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcacgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 20344401  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  20344402 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaagtcaatcttgctaaa 20344475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14885538 - 14885169
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  14885538 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccaggaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaa 14885439  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || ||  ||| ||| ||||| || || || ||| |||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||  |    
T  14885438 cacttgcaacactattctcagatgctctgcgtgttcctcctcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaa 14885340  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  14885339 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 14885240  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14885239 aaggccgtcttctgcatatcctcatcctttacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact 14885169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 450
Target Start/End: Original strand, 20777739 - 20778162
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||| ||||| || ||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |  |    
T  20777739 ataccattaccagaagtaacatggcctaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaatct 20777838  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| |||||||| |  ||||  || || || |||||||| |||||||| | |||| || ||||| |||||||  ||||| |||||||||||  | ||||    
T  20777839 gcaacacaatctttaggtgtttggcgtgttcctcttcaattttagaataga-tcaaaatatcatctataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcat 20777937  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20777938 ggaaaattcggttcatatactccatgaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgttctaaaggc 20778037  T
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||| || ||||| ||||| ||     
T  20778038 cgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaag 20778137  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||    
T  20778138 tcgtcaatccgcgggagtggatacc 20778162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 92 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21562500 - 21562144
Alignment:
Q  92 aacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatca 191  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||     
T  21562500 aacttggcatacagctttttttccttcaacacttgaaacacaatttttaaatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaggatgtcatct 21562402  T
Q  192 ataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcacct 291  Q
    ||||||| ||| || ||   ||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  21562401 ataaacacaactacaaaccaatctaaataggcatggaaaattctattcatgtactccataaacacaccagacgcattagtaacaccgaaagacatcactt 21562302  T
Q  292 tatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21562301 tatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtggtaacccgacctcaaatcaatcttgct 21562202  T
Q  392 aaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21562201 gaacacgcgtgca-ccactaactgatccattaaaccatcaattctcggaagtggatacc 21562144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24796944 - 24796575
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  24796944 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatgtaaccagaattcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 24796845  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||| |  | || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  24796844 cacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaattaga-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 24796746  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  24796745 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 24796646  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24796645 aaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact 24796575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37541928 - 37541556
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  37541928 ctgcaataccactaccataaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 37541829  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || ||  ||| ||| ||||| || || || ||| |||| ||||| | |  | || ||||||||||| |  || || || ||||||||  |    
T  37541828 cacttgcaacactattctcagatgctctgcgtgttcctcctcattcttggaatagattaga-atatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaa 37541730  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  37541729 ggcatggaaaattcgattcatgtattccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 37541630  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37541629 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaa 37541556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20466644 - 20466219
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |    
T  20466644 gcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttggcatataacttcttctccttcagca 20466545  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||  |||| |||||||||  |||||| || | |||| || ||||| || | || |||||||||   ||| |  || |    
T  20466544 cttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttagagtata-tcaaaatatcatcgatgatcacaaccacgaagcgatctaaatacg 20466446  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20466445 catgaaaaatacgattcatgtacttcataaacacacccggtgcattagtaacaccaaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaa 20466346  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  20466345 ggccgtcttttgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccagtaactgatccatc 20466246  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  20466245 aaatcatcaattcttggaagtggatac 20466219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26737274 - 26736847
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||     
T  26737274 ctgcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcatataacttcttatctttcag 26737175  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||   ||| || |||| |||| || ||||| || |||| |||||||||   ||| |   |    
T  26737174 cacttgcaaaataatcttcaaatgttcagcatgttcttcttcggacttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatctaaaaa 26737076  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||    
T  26737075 tgcatgaaaaatttgattcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgtgttcta 26736976  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26736975 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaatacatgtgcacccactaactgatcca 26736876  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26736875 tcaaatcatcaattctcggaagtggatac 26736847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 37290043 - 37289615
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  37290043 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 37289944  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  37289943 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 37289845  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||     
T  37289844 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcataatgaccataacgcgttctg 37289745  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37289744 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatcca 37289645  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37289644 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 37289615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14998286 - 14997858
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  14998286 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 14998187  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  14998186 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcctcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 14998088  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  14998087 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 14997988  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14997987 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatcca 14997888  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14997887 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 14997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22331434 - 22331006
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  22331434 ctgcaataccatcaccagaaataacatagcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 22331335  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  22331334 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 22331236  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  22331235 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 22331136  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22331135 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatcca 22331036  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22331035 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 22331006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 22136507 - 22136935
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  22136507 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcaaaaagtttcttctctttcaa 22136606  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| ||||| || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  22136607 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 22136705  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||     
T  22136706 tgcatggaagatgcgattcatataccccataaacactccaggtgcattagtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctg 22136805  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22136806 aaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatcca 22136905  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22136906 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 22136935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 22349760 - 22350186
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  22349760 gcaataccatcaccataaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaaca 22349859  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || || | ||| |||||   |||||   | |    
T  22349860 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatg 22349958  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||    
T  22349959 catggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaa 22350058  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     || ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  22350059 agccgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatc 22350158  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22350159 aaatcatcaattctcggaaatggatacc 22350186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28914955 - 28914642
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |  |    
T  28914955 ataccattaccagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaatct 28914856  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || || || |||||| | |||||||| | |||| || ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||  | ||||    
T  28914855 gcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataga-tcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcat 28914757  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28914756 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagc 28914657  T
Q  326 tgtcttctgcatatc 340  Q
     ||||||||||||||    
T  28914656 cgtcttctgcatatc 28914642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28930223 - 28929910
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |  |    
T  28930223 ataccattaccagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaatct 28930124  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || || || |||||| | |||||||| | |||| || ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||  | ||||    
T  28930123 gcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataga-tcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcat 28930025  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28930024 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagc 28929925  T
Q  326 tgtcttctgcatatc 340  Q
     ||||||||||||||    
T  28929924 cgtcttctgcatatc 28929910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 29474620 - 29474192
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || || || ||  |||| |  ||||| ||||||||    
T  29474620 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttcgataatttatcataaagtttcttctctttcaa 29474521  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||||| |||||| || | |||||   |    
T  29474520 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaactgatccaaaaa 29474422  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  29474421 tgcatgaaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 29474322  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29474321 aaagctgtcttctgcatatctccatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatcca 29474222  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29474221 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 29474192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 23473066 - 23473494
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |  ||| | ||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||     
T  23473066 ctgcaataccaccaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaactagaactcacactttgacaatttagcatataacttcttctctttcag 23473165  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||||  || | | | || ||||| |||||||||  ||| || || | |||| || || || || |||| |||||||||   |||||   |    
T  23473166 cacttgcaaaacaacttttaaacgctcagcatgttcttcttcagactttgagtaca-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaa 23473264  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  23473265 tgcatgaaaaatacgattcatgtactccatagacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttcta 23473364  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || ||||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23473365 aaagccgtcttctacatatcttcatctttcactttaatttgatgataaaccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatcca 23473464  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||    
T  23473465 tcaagtcatcaattcttggaagtggatacc 23473494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 18780953 - 18781381
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | || ||||| ||||| || ||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  18780953 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaatcagaattcacacttagacaatttcgcaaaaagtttcttctctttcaa 18781052  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| ||||| || ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  18781053 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 18781151  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  18781152 ggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcgttggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 18781251  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  18781252 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 18781351  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18781352 ttaaatcatcaattctcggaggtggatacc 18781381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 19771799 - 19772227
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  19771799 ctgcaattccatcaccaaaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 19771898  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| || || || |||| |||||| ||   |||||   |    
T  19771899 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaagatatcgtcgatgaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 19771997  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  19771998 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 19772097  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  19772098 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgatatcctcacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagttgatcca 19772197  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19772198 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 19772227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27683927 - 27683519
Alignment:
Q  41 ataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttca 140  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  27683927 ataacatggcctagaaaactcacttctttgaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctctcaacacttgcaaaacaatcttca 27683828  T
Q  141 tatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttca 240  Q
     ||| || ||||| ||||| ||| |||| || |||| |||| || |  || ||||||| |||||| ||   |||||   | |||||||| || || ||||    
T  27683827 gatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaa-tcaaaatattgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattca 27683729  T
Q  241 tatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatc 340  Q
    ||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  27683728 tatactccatagacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 27683629  T
Q  341 ctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcgga 440  Q
     || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27683628 ttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgga 27683529  T
Q  441 agtggatacc 450  Q
    ||||||||||    
T  27683528 agtggatacc 27683519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 41772681 - 41773109
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  41772681 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacatttagacaatttagcataaaaattcttctctttcaa 41772780  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  41772781 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaagatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 41772879  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  41772880 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 41772979  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  41772980 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 41773079  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41773080 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 41773109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 27520245 - 27520673
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  27520245 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 27520344  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | || || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  27520345 cacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaa-atatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 27520443  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  27520444 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 27520543  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  27520544 aaagccgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 27520643  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27520644 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 27520673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 27612193 - 27612621
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  27612193 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 27612292  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||||||   |||||   |    
T  27612293 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaa 27612391  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  27612392 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 27612491  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||||    
T  27612492 aaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctggtcca 27612591  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27612592 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 27612621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21337835 - 21337413
Alignment:
Q  27 taccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttg 126  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  ||||| |||||||  |||||    
T  21337835 taccactaccagaaataacgtggccgagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttg 21337736  T
Q  127 caatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatg 226  Q
    ||| ||||||||||  || || ||||| |||||||||| ||| || |||| |||| || || || || || | |||||| ||  ||||||   | |||||    
T  21337735 caaaacaatcttcaagtgctcagcatgttcttcttcaaacttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaatacaaccactaagctatccaaaaacgcatg 21337637  T
Q  227 gaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggct 326  Q
     ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||    
T  21337636 aaaaatacgattcatgtattccataaacacacctggcgcattcgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatatccataacgtgttctaaaagct 21337537  T
Q  327 gtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaat 426  Q
    || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  21337536 gtattctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaacacacatgcacccaataactgatccatcaagt 21337437  T
Q  427 catcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| || |||| ||||||||    
T  21337436 catcaattcttggaattggatacc 21337413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27667019 - 27666609
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  27667019 aaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 27666920  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| || || || |||| |||||||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  27666919 cagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaagatatcgtcgatgaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 27666821  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||  || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  27666820 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcaaaactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 27666721  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  27666720 tcctcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcg 27666621  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
     |||||||||||    
T  27666620 aaagtggatacc 27666609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 16358341 - 16358769
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  16358341 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 16358440  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  16358441 cacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 16358539  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  16358540 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 16358639  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  16358640 aaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 16358739  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16358740 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 16358769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 34568333 - 34568761
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  34568333 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 34568432  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  34568433 cacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 34568531  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  34568532 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 34568631  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  34568632 aaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 34568731  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34568732 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 34568761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Original strand, 40710669 - 40711047
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |    
T  40710669 aaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 40710768  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | || | |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  40710769 agtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 40710867  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||    
T  40710868 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcc 40710967  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40710968 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 40711047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 20801239 - 20801664
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  |||| |||| | ||||||||| |||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||  ||    
T  20801239 caataccatcaccagaaatgacatggccaaggaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcagcac 20801338  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | || || ||||| ||||| | ||| |||||   |||||   | ||    
T  20801339 ttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaa-atatcatcgataaagaaaactacgaaccgatccaaaaatgc 20801437  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || ||     
T  20801438 atggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaa 20801537  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20801538 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatga 20801637  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||    
T  20801638 aatcatcaattctcggaagaggatacc 20801664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 25428272 - 25428700
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  25428272 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaactagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 25428371  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || |  |||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||||||||| | ||||||||||   ||||   |    
T  25428372 cacttgcaaaaccagattcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaatcggtccaaaaa 25428470  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||| || || ||     
T  25428471 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatagtccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtattcatagtggccataccgcgttctg 25428570  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  25428571 aaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatcca 25428670  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25428671 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 25428700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24618842 - 24618699
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24618842 ctgcaataccactaccaggaataatatggcccagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaa 24618743  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaa 164  Q
     |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24618742 cacttgcaacacaattttcagatgctctgcatgctcttcttcaa 24618699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24715073 - 24714930
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24715073 ctgcaataccactaccaggaataatatggcccagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaa 24714974  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaa 164  Q
     |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24714973 cacttgcaacacaattttcagatgctctgcatgctcttcttcaa 24714930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24748101 - 24747958
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24748101 ctgcaataccactaccaggaataatatggcccagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaa 24748002  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaa 164  Q
     |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24748001 cacttgcaacacaattttcagatgctctgcatgctcttcttcaa 24747958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 448
Target Start/End: Original strand, 21409188 - 21409399
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||||||| |    
T  21409188 ttcatatattccataaatactcctggcgcattaataacaccgaaaggcatcacagaatattcgttatgtccgtaatgtgtcctaaaggccgtcttctgaa 21409287  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    ||||||| || ||||| || || || || || ||| | || || ||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  21409288 tatcctcatctttcactttgatatggtgatagccccatcttaagtcaattttactgaacacacgcgcacccatcaactgatccatcaaatcgtcgatcct 21409387  T
Q  437 cggaagtggata 448  Q
    |||| |||||||    
T  21409388 cggaggtggata 21409399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21935402 - 21935307
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21935402 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 21935307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 23507838 - 23507933
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23507838 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 23507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 24583364 - 24583459
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24583364 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 24583459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21935685 - 21935597
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  21935685 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 21935597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21677064 - 21676955
Alignment:
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||| |  || ||||| ||||    
T  21677064 tcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcg 21676965  T
Q  439 gaagtggata 448  Q
    |||| |||||    
T  21676964 gaagcggata 21676955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Original strand, 21408979 - 21409066
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttctt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||  | |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||    
T  21408979 caataccactaccagaaataatatgaccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataaattctt 21409066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 174
Target Start/End: Original strand, 24583081 - 24583184
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||  || |||||||| |||||||| |||||  ||| ||| || ||||||||||| |||| ||| |    
T  24583081 aaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaattctcaaatgctcagcatgctcttcctcaaactttg 24583180  T
Q  171 aata 174  Q
    ||||    
T  24583181 aata 24583184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 23507555 - 23507643
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| |  |||  || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  23507555 aaccaaaactcacacttagacaactttgcacatcactggttctctttcaatacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 23507643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 1807 - 2235
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1807 ctgcaataccactaccagaaataatatggtcaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttattttctttcaa 1906  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||    
T  1907 cacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaattttatccagata 2005  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2006 agcatggaaaattctgttcatatactccataaacacactaggcgcattagtagcaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtccta 2105  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2106 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatcca 2205  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2206 ttaaatcgtcaattctcggaagtggatacc 2235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 16050 - 16478
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16050 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacctcttttccttcaa 16149  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  16150 cacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcgtagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 16248  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16249 agcatggaaaattccgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtccta 16348  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16349 aaggccgtcttctgcaaatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaataaattttactaaacacacaagcacccactaactgatcca 16448  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16449 ttaaatcgtcaattctcggaactggatacc 16478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7896 - 7803
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||   |||||| || |  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  7896 taatctgatgatatcctgacctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccgtggaagtggata 7803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 3321 - 2893
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3321 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacaaacttcactaaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 3222  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  3221 tacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatt-aggatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccagata 3123  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3122 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtccta 3023  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  3022 aaagccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatcca 2923  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2922 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 2893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 448
Target Start/End: Original strand, 69310 - 69734
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  69310 gcaataccactaccagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaacaagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaa 69409  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
      ||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||  | |    
T  69410 tctgcaacacaatcttcaagcgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcaaaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaag 69508  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  69509 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 69608  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||   |||||| || || || |||||     
T  69609 agccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaattggtccatc 69708  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  69709 aagtcatcaatcctcggaagtggata 69734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 50748 - 51176
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50748 ctgcaatacctctaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaacaagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttatctttcaa 50847  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||    
T  50848 cacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcatagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccaaaaatttatccagata 50946  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50947 ggcatgaaaaattctattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtccta 51046  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  51047 aaggccgtcttcggcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaatacaagagcacccactaactgatcca 51146  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  51147 ttaaatcttcaattctcgaaagtggatacc 51176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 30883 - 31274
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| | |||||| ||||||||    
T  30883 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttaacataaagcttcttctctttcaa 30982  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||| || |  ||| || |||| |||| || ||||||||||| | ||||| |||   |||||   |    
T  30983 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttattaagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaataaaaacaaccatgaaccgatccaaaaa 31081  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || |||||  ||||||| || || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || || ||     
T  31082 tgcatgaaagatgcgattcatgcactccataaatactctaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtggccataccgcgttctg 31181  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaac 413  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||| ||| |||| ||| ||||| || || |||| |||||||||||||    
T  31182 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataactcgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaac 31274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11950501 - 11950073
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11950501 ctgcactaccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttctctttcaa 11950402  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11950401 tacttgcaacacaatcttcaaatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggta 11950303  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11950302 agcatggaaaattcggttcatctactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatccccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 11950203  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||    
T  11950202 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacccttgcacccaccaaatgatcca 11950103  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||    
T  11950102 tcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacc 11950073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12359116 - 12358692
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  12359116 aataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatact 12359017  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||    
T  12359016 tgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaa-tcagaatgtcatcaataaatacaaccactaatttatccaggtaagca 12358918  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12358917 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgctttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcttaaagg 12358818  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || ||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  12358817 ccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcattcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaa 12358718  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  12358717 gtcatcaatcctcggaagtggatacc 12358692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 31940439 - 31940867
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31940439 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaa 31940538  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  31940539 aacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctattcttcagtctttgaataaa-tcagtatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagata 31940637  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  31940638 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgtgcatatcgtgtccta 31940737  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||| ||||    
T  31940738 aaggctgtcttatgcatatcctcatccttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtcca 31940837  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||    
T  31940838 tcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacc 31940867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 12179874 - 12180308
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12179874 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaa 12179973  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  12179974 tatttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttataat-aaattagaatgtcatcaatagacacaaccacgaatttattcaggta 12180072  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattc------gtaatgaccatatcgt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||       || |||||||| |||    
T  12180073 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatattcatatatatagtgaccataacgt 12180172  T
Q  315 gtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaact 414  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12180173 gtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaact 12180272  T
Q  415 gatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12180273 gatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 12180308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31693778 - 31693350
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31693778 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaa 31693679  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  31693678 aacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttaaataaa-tcagtatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagata 31693580  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31693579 agcatggaaaattcagttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgtccatatcgtgtccta 31693480  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||| ||||    
T  31693479 aaagccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtcca 31693380  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || |||| |||||||||||||||||    
T  31693379 tcaagtcgtcaaccctcggaagtggatacc 31693350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 17187910 - 17188338
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  17187910 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaactttttctctttcaa 17188009  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||  ||    
T  17188010 tacttgcaatacaattttcagatgttctgcatgctcttcctcagtccttgaataaa-tcagaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaaata 17188108  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17188109 ggcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtccta 17188208  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||    
T  17188209 aaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatcca 17188308  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  17188309 tcaagtcatccatcctcggaagtggatacc 17188338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 15229139 - 15229567
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15229139 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaacccgaattcacatttggacaacatggcatacaacttcttttctttcaa 15229238  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||    
T  15229239 cacttgcaacataattttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatt-aagatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagata 15229337  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15229338 agcatggaaagttctattcatgtattccataaacacactaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtccta 15229437  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| || |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| |    
T  15229438 aaggccgttttctacatatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcga 15229537  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15229538 ttaaatcatcaattctcggaagtggatacc 15229567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 15235007 - 15235435
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15235007 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaacccgaattcacatttggacaacatggcatacaacttcttttctttcaa 15235106  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||    
T  15235107 cacttgcaacataattttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatt-aagatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagata 15235205  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15235206 agcatggaaagttctattcatgtattccataaacacactaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtccta 15235305  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| || |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| |    
T  15235306 aaggccgttttctacatatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcga 15235405  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15235406 ttaaatcatcaattctcggaagtggatacc 15235435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18132939 - 18132511
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18132939 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaagtcacttcacttaatcagaactcgcacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaa 18132840  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| | |||| ||| |||||| | | |||| |||||| |||| ||||||| | | ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18132839 cacttgcaacataatcctcagatgttccgtaagctcctcttcagtctttgaataaatt-aggatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggta 18132741  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18132740 agcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtccta 18132641  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  18132640 aaggccgtcttttgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatcca 18132541  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||    
T  18132540 tcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacc 18132511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Original strand, 14088209 - 14088635
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14088209 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 14088308  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| | |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  14088309 tacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaataga-tcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggta 14088407  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14088408 agcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 14088507  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||    
T  14088508 aaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatcca 14088607  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | |  || ||||| |||||||| |||||    
T  14088608 tcaggtcgtcaattctcggaagcggata 14088635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13970713 - 13970287
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13970713 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 13970614  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| | |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  13970613 tacttgcaatacaaccctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaataga-tcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggta 13970515  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970514 agcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 13970415  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |     ||||| || ||||||||||    
T  13970414 aaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgatctcaagtcaattttactaaaaatcttcgcaccaaccaactgatcca 13970315  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | |  || |||||||||||||| |||||    
T  13970314 tcaggtcgtcaatcctcggaagcggata 13970287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 34 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16379508 - 16379096
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16379508 accagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaacaca 16379409  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  || ||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  16379408 attctcagatgttctgcatgctcttcttaagtcttagaataaa-tcagaatatcatcaataaataccaccaggaatttatccagaaaggcatgaaaaatt 16379310  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16379309 cgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 16379210  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||  || ||||| || ||||||||    
T  16379209 gcatatcttcatcattcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaatcttactaaaaacctttgcacccactaggtggtccatcaagtcatcaat 16379110  T
Q  434 cctcggaagtggat 447  Q
    ||||||||||||||    
T  16379109 cctcggaagtggat 16379096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16835103 - 16834734
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16835103 ctgctataccatcaccagaaataatatggccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaa 16835004  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||  |    
T  16835003 tacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcgtcagtcttagaataaatt-aggatgtcatcaataaatacaaccacaaacttatccagaaa 16834905  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16834904 tgcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtatacgtaatgaccataacgtgtccta 16834805  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16834804 aaggccgtcttctgcatatctccatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttact 16834734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11959760 - 11959334
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  11959760 gcaataccactaccacaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaattcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaa 11959661  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| | | || || ||||||||||||| ||| |  |||||||||||  | |    
T  11959660 cttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacacaactagaaatttatccagaaaag 11959562  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11959561 catggaaaatcctattcatatattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 11959462  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||   ||||| |||||||||||||||     
T  11959461 agtcgtcttctgcatatcctcatccttgaccttcatctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactgaacacctttgcactcactaactgatccatc 11959362  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||    
T  11959361 aagtcatcaattctcggaagtggatacc 11959334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 136 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16826754 - 16826446
Alignment:
Q  136 cttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcg 235  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     |||||||||||||    
T  16826754 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctcagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccag-----catggaaaattcg 16826661  T
Q  236 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgc 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  16826660 gttcatatactccataaacacaccagacgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgc 16826561  T
Q  336 atatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcc 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16826560 atatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcc 16826461  T
Q  436 tcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||    
T  16826460 tcggaagtggatacc 16826446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13319095 - 13318669
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | ||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | ||||||||    
T  13319095 ctgcaataccactaccagaaataacgtagcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaatttagcatacaaatttctctctttcaa 13318996  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     | |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| | || || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||  |    
T  13318995 aatttgcaacataatcttcagatgttctgcatgctcctctttagtcttggaataaattaaa-atatcatcaataaataccaccacaaatttatccagaaa 13318897  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13318896 agcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaatggcatcaccttgtattcgtaatgaccatattgtgtccta 13318797  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||||||||||    
T  13318796 aaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactgatcca 13318697  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13318696 tcaaatcatcaatcctcgggagtggata 13318669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Original strand, 41179071 - 41179484
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  41179071 accagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcagcaca 41179170  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  41179171 attctcagatgttctgaatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaatt 41179269  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41179270 cgattcatatactccatgaacacaccgggtgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 41179369  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  41179370 gcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaat 41179469  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| |||||    
T  41179470 cctcggaagcggata 41179484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Original strand, 44778796 - 44779209
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||    
T  44778796 accagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaatttcctttctttcaaaacttgcaacaca 44778895  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  44778896 attctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaatt 44778994  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44778995 cgattcataaactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 44779094  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  44779095 gcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaat 44779194  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
     |||||||| |||||    
T  44779195 tctcggaagcggata 44779209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 33 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10418626 - 10418212
Alignment:
Q  33 taccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatac 132  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||    
T  10418626 taccagaaataacgtggcctagaaaactcacttcatttaaccagaactcgcacttcgacagcttggcatacaacttcctctctttcaatatttgcaacac 10418527  T
Q  133 aatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaat 232  Q
    ||||||||  ||||| || || || |||||| | || ||||| | ||||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  10418526 aatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagtttttgaataga-tcaagatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaat 10418428  T
Q  233 tcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10418427 tcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttc 10418328  T
Q  333 tgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaa 432  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  10418327 tgcatatcttcgtccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaa 10418228  T
Q  433 tcctcggaagtggata 448  Q
    ||| ||||||||||||    
T  10418227 tccgcggaagtggata 10418212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Original strand, 13943573 - 13943986
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | |    
T  13943573 accagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcagcata 13943672  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  13943673 attctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaatt 13943771  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13943772 cgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 13943871  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  13943872 gcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaat 13943971  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| |||||    
T  13943972 cctcggaagcggata 13943986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 28755854 - 28756226
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  28755854 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 28755953  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  28755954 cacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 28756052  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28756053 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacacccggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccataacgtgtccta 28756152  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28756153 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaa 28756226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16328253 - 16327825
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  16328253 ctgcgataccactaccagaaataatatgacccagaaaactcacttcacttaaccataactcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaa 16328154  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
      |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | | || || |||||||||||||  || || || |||||| |  |    
T  16328153 atcttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttagaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccggaaa 16328055  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16328054 ggcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccatatcgtgtccta 16327955  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |     ||||| || ||||||||||    
T  16327954 aaagtcgttttctgcatatcctcattcttcaccttaatctgatggtaaccagacatcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatcca 16327855  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || ||||| |||| |||||||||||    
T  16327854 tcaagtcgtcaattctcgaaagtggatacc 16327825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 405
Target Start/End: Original strand, 12269875 - 12270129
Alignment:
Q  150 catgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactcca 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12269875 catgctcttcttcaatctttgaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatcaagataagcatggaaaattcggttcatatactcca 12269973  T
Q  250 tgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtcctt 349  Q
    | |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12269974 taaacacatcaggaacattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcctt 12270073  T
Q  350 caccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcac 405  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  12270074 caccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcac 12270129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 47125480 - 47125852
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  47125480 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatgtaaccagaattcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 47125579  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | |  | || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  47125580 cacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaga-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 47125678  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  47125679 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 47125778  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47125779 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaa 47125852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15401119 - 15400693
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  15401119 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaaca 15401020  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    || |||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||   |||||   | |    
T  15401019 ctcgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatg 15400921  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||    
T  15400920 catggaagatgcgattcatatactccataaacactccaagtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaa 15400821  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  15400820 agctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatttggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatc 15400721  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15400720 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 15400693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 255 - 450
Target Start/End: Original strand, 24189073 - 24189268
Alignment:
Q  255 acaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcacct 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24189073 acaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatcctcatccttcacct 24189172  T
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24189173 tgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 24189268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14875103 - 14874676
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  14875103 ctgcaataccatcaccagaaataacaaggccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaa 14875004  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||| | ||||||||||  |||||   |    
T  14875003 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaatcgatccaaaaa 14874905  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || ||     
T  14874904 ggcatgaaagatgcgattcatgtactccatgaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataccgcgttctg 14874805  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||| ||| ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14874804 aaagatgtcttctgcaaatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 14874705  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14874704 tcaaatcatcaattctcggaagtggatac 14874676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5109197 - 5108787
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5109197 aaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttttctttcaacacttgcaaaacaatctt 5109098  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| || || || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  5109097 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaagatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 5108999  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  5108998 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 5108899  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5108898 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 5108799  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  5108798 gaagtggatacc 5108787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Original strand, 15261156 - 15261582
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| | |||||| || ||||     
T  15261156 ctgcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttttacaatttagcataaagcttcttctccttcag 15261255  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| | |||| || ||||| || || | |||||||||   |||||   |    
T  15261256 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggaatata-tcaaaatatcatcgatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaa 15261354  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  15261355 cgcatgaaagatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttctaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttcta 15261454  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||  ||||||||||||| || || ||||  |||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15261455 aaagccatcttctgcatatcttcatctttcagtttaatctagtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatcca 15261554  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||    
T  15261555 tcaattcatcaattctcggaagtggata 15261582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 252 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14291895 - 14291697
Alignment:
Q  252 aacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14291895 aacacaccaggcgcattagtaacaccgaaatgcatcatcttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttca 14291796  T
Q  352 ccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  14291795 ccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgctgaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcagaagtggatacc 14291697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20060658 - 20060230
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  20060658 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccaaaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 20060559  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   ||||||  |    
T  20060558 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccagaaa 20060460  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  20060459 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 20060360  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  20060359 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 20060260  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20060259 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 20060230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5423516 - 5423106
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5423516 aaataacatggccaaggaaactcacttcattcaacaagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 5423417  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| || || || |||||||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  5423416 cagatgctcggcatgttcttcttcagtcttagagtaaa-tcaagatatcgtcgatgaacataactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 5423318  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  5423317 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcata 5423218  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5423217 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 5423118  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  5423117 gaagtggatacc 5423106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15346831 - 15346421
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15346831 aaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatctt 15346732  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  15346731 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 15346633  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  15346632 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 15346533  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || ||||| || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15346532 tcttcatcctttactttaagctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 15346433  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  15346432 gaagtggatacc 15346421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 53383604 - 53383194
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  53383604 aaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacctgtaagacaatctt 53383505  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || || |||| |||||||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  53383504 cagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 53383406  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  53383405 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 53383306  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  53383305 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 53383206  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  53383205 gaagtggatacc 53383194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 48426973 - 48427401
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  48426973 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 48427072  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  48427073 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 48427171  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  48427172 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 48427271  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  48427272 aaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 48427371  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48427372 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 48427401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 175 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12510923 - 12510648
Alignment:
Q  175 aaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaac 274  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12510923 aaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatacttcataaacacaccaggcgcgttagtaac 12510824  T
Q  275 gccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgac 374  Q
     |||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  12510823 accgaaaggcatcattttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctaatggtaaccagac 12510724  T
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| ||||||||||| || |     ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12510723 ctcaagtcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacc 12510648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16755219 - 16754877
Alignment:
Q  107 ttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacg 206  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || |||||||||| ||||||     
T  16755219 ttcttctctttcaacacttgtaaaacaatcttcaaatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcaataaacacaaccaca 16755121  T
Q  207 aatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgac 306  Q
    ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  16755120 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgac 16755021  T
Q  307 catatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacc 406  Q
    |||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  16755020 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacc 16754921  T
Q  407 cactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16754920 cactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 16754877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15587996 - 15587568
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  15587996 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 15587897  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| |||||| ||   ||||||  |    
T  15587896 cacttgtaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccagaaa 15587798  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||     
T  15587797 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctg 15587698  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  15587697 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 15587598  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15587597 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 15587568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 279 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11888701 - 11888530
Alignment:
Q  279 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctca 378  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  11888701 aaaggcatcaccgaatattcataatgtccataacgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctca 11888602  T
Q  379 aatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11888601 aatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 11888530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16805533 - 16805123
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16805533 aaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 16805434  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||| ||||| |||| || |||| |||| ||||| || ||||||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  16805433 cagatgctcagcatgttctccttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 16805335  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  16805334 catgtactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtgctgaaagctgtcttctgcata 16805235  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16805234 tcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 16805135  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  16805134 gaagtggatacc 16805123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 10007126 - 10007554
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  10007126 ctgcaataccgtcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 10007225  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || | ||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   |    
T  10007226 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagaatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaa 10007324  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  10007325 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 10007424  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  10007425 aaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 10007524  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10007525 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 10007554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 13254216 - 13254644
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  13254216 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 13254315  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  13254316 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 13254414  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  13254415 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 13254514  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||  |||||||    
T  13254515 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagttgatcca 13254614  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13254615 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 13254644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 10907736 - 10908164
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  10907736 ctgcaataccgtcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 10907835  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||   ||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   |    
T  10907836 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcaaaatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaa 10907934  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  10907935 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 10908034  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  10908035 aaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 10908134  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10908135 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 10908164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 16637299 - 16637727
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  16637299 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 16637398  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  16637399 cacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 16637497  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  16637498 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 16637597  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  16637598 aaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 16637697  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16637698 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 16637727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 6602280 - 6602690
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||| |    
T  6602280 aaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcgt 6602379  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||  |||| || |||| |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  6602380 cagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 6602478  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || |||||||| ||||||    
T  6602479 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttttgcata 6602578  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6602579 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 6602678  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  6602679 gaagtggatacc 6602690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 12888253 - 12888663
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  12888253 aaataacatggccaagtaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 12888352  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    ||  || || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || ||||  || |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  12888353 caggtgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacactactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 12888451  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  12888452 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 12888551  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12888552 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 12888651  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  12888652 gaagtggatacc 12888663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 227 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8745776 - 8745557
Alignment:
Q  227 gaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggct 326  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  8745776 gaaaattcgattcatat-ctccatga-cacnacgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaagggc 8745679  T
Q  327 gtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaat 426  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || |    
T  8745678 gtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgtcctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagt 8745579  T
Q  427 catcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8745578 catcaatcctcggaagcggata 8745557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 16693690 - 16694117
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  16693690 ctgcaataccatcaccagaaataacatgaccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 16693789  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| ||| || ||   |||||   |    
T  16693790 cacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtata-tcaaaatttcgtctataaacacaactactaaccgatccaaaaa 16693888  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  16693889 tgcatggaagatgcgattcatttactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaatggcataactttatattcatagtgaccatagcgcgttctg 16693988  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||    |||||||||||||||||||    
T  16693989 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcacattaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaagactttcgcacccactaactgatcca 16694088  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||    
T  16694089 tcaagtcatcaattctcggaagtggatac 16694117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 450
Target Start/End: Original strand, 3687555 - 3687897
Alignment:
Q  107 ttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacg 206  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || || |||| ||| |||    
T  3687555 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacg 3687653  T
Q  207 aatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgac 306  Q
    ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || ||||    
T  3687654 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgac 3687753  T
Q  307 catatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacc 406  Q
    |||| || || || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  3687754 cataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcc 3687853  T
Q  407 cactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3687854 cactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 3687897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15723538 - 15723172
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  15723538 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttcgacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 15723439  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  15723438 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 15723340  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||     
T  15723339 tgcatgaaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctg 15723240  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatctt 388  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  15723239 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatctt 15723172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15014357 - 15013932
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | |||  | |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || ||||  ||    
T  15014357 caataccattacaagaaataatatggccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataacttcttctccttcagcac 15014258  T
Q  124 ttgcaatacaat-cttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    |||||| ||||| || || ||| || ||||| || || ||  ||||||| || | |  | || ||||| ||||||| ||| || |||  |||||  || |    
T  15014257 ttgcaaaacaattctaca-atgctcggcatgttcctcctcggtcttagagtatattaga-atatcatctataaacacaacaacaaatcgatccaaataag 15014160  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  15014159 catgaaaaatacgattcatatattccataaacactccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtccataacatgtcctaaa 15014060  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||  |||||||| |||||||| || |||||  | || || || || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||     
T  15014059 ggtcgtcttctgaatatcctcatctttcactctgatatggtgatagcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcatccactaactaatccatc 15013960  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  15013959 aaatcgtggatcctcggaagtggatacc 15013932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 238 - 391
Target Start/End: Original strand, 10407720 - 10407873
Alignment:
Q  238 tcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcat 337  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10407720 tcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacacagaaaggcattactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcat 10407819  T
Q  338 atcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10407820 atcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact 10407873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 17491376 - 17491804
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  17491376 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 17491475  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| | || || ||||||||||| | |||||||||   |||||   |    
T  17491476 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaa-atatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 17491574  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     | ||| || || || ||||| |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| | ||||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||     
T  17491575 tgaatgaaagatgcgattcatgtacttcataaatactccaggtgcatttgtaacactgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctg 17491674  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  17491675 aaagctgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatcca 17491774  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17491775 tcaaataatcaattctcggaagtggatacc 17491804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14579776 - 14579584
Alignment:
Q  258 ccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaa 357  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  14579776 ccaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataccgcattctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaa 14579677  T
Q  358 tctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  14579676 tctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacc 14579584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 303 - 450
Target Start/End: Original strand, 15357890 - 15358037
Alignment:
Q  303 tgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtg 402  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15357890 tgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcatcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtg 15357989  T
Q  403 cacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15357990 cacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 15358037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 10385207 - 10385383
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  10385207 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaa 10385306  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaaca 198  Q
     ||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10385307 cacttgcaatacaattctcagatgccctgcatgctcttcctcgttcttggaat-aaatcaagatatcatcaatgaaca 10385383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 15340799 - 15341071
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||    
T  15340799 aataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacact 15340898  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
     |||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || | ||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||   |||||   | |||    
T  15340899 cgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagt-aaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgca 15340997  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattc 298  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  15340998 tggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattc 15341071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 12499776 - 12500092
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| ||| |||| |    
T  12499776 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctatcaaca 12499875  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || | ||||||| || || || ||||| | |||||||||   |||||   | |    
T  12499876 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagt-aaatcaaaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatg 12499974  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||    
T  12499975 catggaagatgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaa 12500074  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatc 340  Q
     |||||||| ||||||||    
T  12500075 agctgtcttatgcatatc 12500092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Original strand, 24185048 - 24185144
Alignment:
Q  354 ttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24185048 ttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 24185144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8272670 - 8272575
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8272670 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 8272575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 30139675 - 30139770
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30139675 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 30139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 30149226 - 30149321
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30149226 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 30149321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 390 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15714292 - 15714232
Alignment:
Q  390 ctaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15714292 ctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 15714232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11889811 - 11889623
Alignment:
Q  94 cttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaat 193  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||| | || |||||| || | |||| || ||||||||    
T  11889811 cttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttccttaaacttagagtata-tcaaaatatcatcaat 11889713  T
Q  194 aaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaagg 283  Q
     |||| |||||||||   ||| |  || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11889712 gaacacaaccacgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtattccatgaacacacctggcgcattagtgacaccgaaagg 11889623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 450
Target Start/End: Original strand, 12272254 - 12272302
Alignment:
Q  402 gcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12272254 gcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 12272302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Original strand, 15611963 - 15612067
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15611963 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 15612062  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  15612063 atacc 15612067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13965623 - 13965528
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || ||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13965623 taatctgatgatatcctgatctcgaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 13965528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6151133 - 6151031
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6151133 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 6151034  T
Q  446 ata 448  Q
    |||    
T  6151033 ata 6151031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15948721 - 15948646
Alignment:
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15948721 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 15948646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 18437022 - 18437093
Alignment:
Q  378 aaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18437022 aaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgggagtggatac 18437093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 450
Target Start/End: Original strand, 43164578 - 43164629
Alignment:
Q  399 cgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43164578 cgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 43164629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Original strand, 17200494 - 17200598
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  17200494 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatcctcgggagcgg 17200593  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  17200594 atacc 17200598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 30139392 - 30139480
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  30139392 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 30139480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 30148943 - 30149031
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  30148943 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 30149031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8272953 - 8272865
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  8272953 aaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 8272865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16826796 - 16826750
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattca 67  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16826796 ctgcaataccactactagaaataatgtggccaagaaaacttacttca 16826750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 436
Target Start/End: Original strand, 25768187 - 25768268
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||   |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25768187 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatgttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcct 25768268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 15611689 - 15611777
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||| |||||   || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  15611689 aaccaaaactcacgcttagacaacttggcacacaaccggttatctttcaaaacttgcaagacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 15611777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 21927400 - 21927829
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21927400 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaatcttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 21927499  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgca-tgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggt 219  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  21927500 cacttgcaatacaatcttcagatgctctgcaatgctcttcttcagtcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagat 21927598  T
Q  220 aggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcct 319  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  21927599 aagcatggaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcct 21927698  T
Q  320 aaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcc 419  Q
    |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21927699 aaaggtcgtcttctgcatatgctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatcc 21927798  T
Q  420 attaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21927799 attaagtcgtcaattctcggaagtggatacc 21927829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 23656900 - 23657328
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23656900 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccataactcacactttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaa 23656999  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  | || ||||||||||| | |||||  |||||||||||  |    
T  23657000 tacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaatatattaga-atatcatcaataaatacaaccataaatttatccagaaa 23657098  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23657099 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 23657198  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||   |||||| || ||||||||||    
T  23657199 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacttttgcacctacgaactgatcca 23657298  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23657299 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 23657328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20008726 - 20008303
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20008726 caataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacag 20008627  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||    
T  20008626 ttgcaacacaatcttcatatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaatt-aggatatcatcactaaacacaaccacaaatttatccagataagc 20008528  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20008527 atggaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaag 20008428  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  20008427 gccgtcttctgcatatcctcatctttcaccttaatctgatggtaacctgagctcaaatcaatcttactgaacacgcgtgcacccactaattgatccatta 20008328  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  20008327 aatcatcaattctcggaagtggata 20008303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21324086 - 21323659
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21324086 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactt-ttctctttcaa 21323988  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21323987 aatttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataga-tcagaatgtcatcgataaacacaaccacgaatttatccaggta 21323889  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  21323888 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacattgtactcgtaatgtccatatcgtgtccta 21323789  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  21323788 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccactaactgatcca 21323689  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||    
T  21323688 tcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacc 21323659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31415279 - 31414849
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccat-aaataatatggcc-aagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttc 118  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  31415279 ctgcaataccactaccaagaaataatgtgacccaagaaaattcacttcacttaaccagaacttacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttt 31415180  T
Q  119 aatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccagg 218  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  31415179 aacacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcctcttcggtcttagaataaa-tcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaga 31415081  T
Q  219 taggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcc 318  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31415080 aaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacaccccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcc 31414981  T
Q  319 taaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatc 418  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||||||||||||||||||    
T  31414980 taaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatc 31414881  T
Q  419 cattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31414880 cattaagtcatcaattctcggaagtggatacc 31414849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Original strand, 19861408 - 19861834
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19861408 ctgcaataccaataccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttatttcaa 19861507  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  19861508 cacttgcaactcaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcattcttagaataaatt-aggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 19861606  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19861607 agcatggaaaattctgttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaagggcattaccttatactcataatgtccatatcgtgtccta 19861706  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttac-taaatacacgtgcacccactaactgatcc 419  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | || |||||  |||||||||||||||||    
T  19861707 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaattaat-ttacatgaacacacgaccacccactaactgatcc 19861805  T
Q  420 attaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19861806 attaaatcatcaattctcggaagtcgata 19861834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 22052839 - 22053264
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||    
T  22052839 caataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcaacaacttagcatacaactttttctctttcagtac 22052938  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||| |||||||| || | | |||| || ||||||||  ||||    
T  22052939 ttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatt-aggatatcatcaatgaatacacccacaaacttatccagaaaggc 22053037  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22053038 atgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacctggtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaag 22053137  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |    |||||| || | ||||||||| |    
T  22053138 gccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttattgaaaatctttgcaccaaccagctgatccatca 22053237  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||    
T  22053238 agtcatcaattctcggaagcggatacc 22053264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 20390072 - 20390487
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20390072 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttgcttcacttaactagaattcaaatttggacaacttggcatacaactttttttccttcaa 20390171  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||| | |    
T  20390172 cacttgcaacacaatctttaaatgctccgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaagaa 20390270  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||  |||||              |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20390271 agcatggaaaattctattcatg-------------caccaggcacattagtaacaccgaaagacatcactttatatttgtaatgtccatatcgtgtccta 20390357  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20390358 aaggccgttttctgcatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgaacccactaactgatcca 20390457  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20390458 taaaatcatcaattctcggaagtggatacc 20390487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 27356509 - 27356881
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  27356509 ctgcaataccactaccaaaaataatatgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaacttcgcatacaacctcttctcttttaa 27356608  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  27356609 aacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 27356707  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27356708 agcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 27356807  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27356808 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatagtaaccagatctcaagtcaatcttactaaa 27356881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31569637 - 31569225
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  31569637 accagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcagcaca 31569538  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  31569537 attctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaatt 31569439  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31569438 cgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 31569339  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  31569338 gcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaa-ctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaat 31569240  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| |||||    
T  31569239 cctcggaagcggata 31569225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16270032 - 16269604
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  16270032 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttccttcaa 16269933  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  |||  || ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||  || || || ||||||||  |    
T  16269932 cacttgcaatacaattctcaggtgctctgcatgctcctcttcattcttggaataaa-tcaagatatcatcaatgaacaccacaacaaacttatccagaaa 16269834  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  16269833 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggcccgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 16269734  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |     ||||| || ||||||||||    
T  16269733 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataactagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatcca 16269634  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16269633 tcaaatcgtcaattctcggaagcggatacc 16269604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 29302234 - 29301806
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29302234 ctgcaataccactaccagaaataacgtggccaagaaaacttacttcactcaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcctctctttcaa 29302135  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || ||||||||||  ||||||||||| | ||||||  ||||||| |||| |||  |||||||||||||| |  || || || | ||| | | |    
T  29302134 cacttgtaacacaatcttcaagtgttctgcatgttattcttcggtcttagagtaaa-tcagaatgtcatcaataaataccacaacaaactgatctaagaa 29302036  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||     
T  29302035 tgcatgaaaaattctgttcatgtactccataaataccccaggtgcatttgtaacaccaaaaggcatcaccttatactcataatgcccataacgtgttctg 29301936  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29301935 aatgccgtcttctgcatattctcatctttcaccttaatctagtgataacccgacctcaagtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatcca 29301836  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||    
T  29301835 tcagatcatcaatcctcggaagcggatacc 29301806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Original strand, 6605631 - 6606000
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  6605631 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 6605730  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     || |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || ||||||||||| |  || || || ||||||||  |    
T  6605731 cacctgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaa 6605829  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  6605830 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 6605929  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6605930 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact 6606000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 255 - 450
Target Start/End: Original strand, 19984386 - 19984581
Alignment:
Q  255 acaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcacct 354  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19984386 acaccaggcgaattagtaacaccgaaaggcatcaccttttattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacct 19984485  T
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19984486 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcagaagtggatacc 19984581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Original strand, 28988104 - 28988472
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggcc-aagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaat 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||     
T  28988104 gcaataccactaccagaaataatgtgacccaagaaaacttacttcacgtaaccagaattcacattgtgataacttagcatacaacctcttttccttcaac 28988203  T
Q  122 acttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag 221  Q
    |||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | |  | || ||||||||||| |  ||||| || ||||||||  |     
T  28988204 acttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaga-atatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaaa 28988302  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  28988303 gcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaa 28988402  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28988403 aggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagccctcaaatcaatcttact 28988472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 4984015 - 4984387
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||   ||| || || ||    
T  4984015 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttaacatacaatcgcttctcctttaa 4984114  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||| | |||| ||| ||||  || || || ||||| ||  |    
T  4984115 cacttgcaatactattctcagatgctctgcatgctcttcctcgttcttggaataaa-tcaaggtatcattaatgaacaccacaacaaacttatctagaaa 4984213  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  4984214 agcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgctttagttacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 4984313  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4984314 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaa 4984387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 22372904 - 22373175
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22372904 ctgcaataccactaccaaaaataatgtgaccaagaaaacttacttcacgtaaccataattcacatttggaccacttggcatacaacttcttttctttcaa 22373003  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22373004 cacttgcaacacaatcttaagatgctctgcatggtcttcttcattcttagaat-aaattaggatatcatcagtaaacacaaccacaaatttatccagata 22373102  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcacctta 293  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22373103 agcatggaaaattcaattcatgtactccatgaacacaccaggcgcattagtaacacccaaaggcatcacctta 22373175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 18858552 - 18858978
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  18858552 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaaca 18858651  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| ||||| || ||||||| |||||| ||   |||||   | |    
T  18858652 cttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatg 18858750  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| ||    
T  18858751 catggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctgaa 18858850  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18858851 agccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatc 18858950  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18858951 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 18858978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Original strand, 28982884 - 28983253
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccat-aaataatatggcc-aagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  28982884 gcaataccactaccaagaaataatgtgacccaagaaaacttacttcacgtaaccagaattcacattgtgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 28982983  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | |  | || ||||||||||| |  ||||| || ||||||||  |    
T  28982984 cacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaga-atatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaa 28983082  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  28983083 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 28983182  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28983183 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagccctcaaatcaatcttact 28983253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20017071 - 20016643
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  20017071 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 20016972  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  20016971 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 20016873  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  20016872 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 20016773  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  20016772 aaagctgtcttctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 20016673  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20016672 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 20016643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 23887000 - 23887429
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |  ||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||    
T  23887000 caataccactacgaaaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaactagaattcacactttgacaacttggcatataacttcttctccttcagcac 23887099  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttc----tgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggt 219  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||    | |||| ||||||| |  |||||| || | |||| || ||||| || |||| |||||||||   ||| |  |    
T  23887100 ttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatacatgttcttctttagacttagagtata-tcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatctaaat 23887198  T
Q  220 aggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcct 319  Q
    | ||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  23887199 aagcatgaaaaatatgattcatgtactccataaacacatctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatactcgtaatgtccataacgtgtcct 23887298  T
Q  320 aaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcc 419  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23887299 aaaggccgtcttatgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccaacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatcc 23887398  T
Q  420 attaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  23887399 atcaaatcatcaattcttcgaagtggatacc 23887429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 353
Target Start/End: Original strand, 14567115 - 14567446
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  14567115 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaatctcttttccttcaa 14567214  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || || || |  || | ||||||||| || ||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  14567215 cacttgcaacactatttttaggtgctttgcatgctcctcctcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 14567313  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  14567314 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgccttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 14567413  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcacc 353  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  14567414 aaggccgtcttttgcaaatcctcatccttcacc 14567446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22376261 - 22375835
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |   | |||||||| | | | |||||||| || ||||| |||||||| |||||||     
T  22376261 ctgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcatctatttcaaccagaatttatagtttgacaatttagcatataacttcttctctttcag 22376162  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | | || || || || || |||| |||||| ||   |||||   |    
T  22376161 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtata-taaaaatatcgtcgatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaa 22376063  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| || |||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||    
T  22376062 tgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggtgcatttgtaatgctgaaaggcatcactttatattaataatgtccataacgtgttcta 22375963  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22375962 aaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctgttgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatcca 22375863  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||    
T  22375862 tcaaatcatcaattcttggaagtggata 22375835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22118983 - 22118555
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| |  ||  |  ||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  22118983 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacctctttcgaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 22118884  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||| | ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  22118883 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcacgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 22118785  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  | |||||||| || || ||     
T  22118784 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctg 22118685  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22118684 aaagctgtcttctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatcca 22118585  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22118584 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 22118555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22127767 - 22127339
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| |  ||  |  ||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  22127767 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacctctttcgaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 22127668  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||| | ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  22127667 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcacgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 22127569  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  | |||||||| || || ||     
T  22127568 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctg 22127469  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22127468 aaagctgtcttctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatcca 22127369  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22127368 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 22127339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22422700 - 22422272
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||| ||||| |  ||  | ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  22422700 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccataattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaa 22422601  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||   ||| || |||| |||| || |||||||| || | |||||||||   |||||   |    
T  22422600 cacttgcaaaacaatcttcaaatgttcaacatgttcttcttcggacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaa 22422502  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||     
T  22422501 tgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctg 22422402  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22422401 aatgctatcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatcca 22422302  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22422301 tcaaatcatcaattctcggaagtgaatacc 22422272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 32602117 - 32602546
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaacca-gaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttca 119  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||  | ||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||    
T  32602117 ctgcaataccattaccagaaataacatggccaaaaaaacttacttctttcaaccaagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttca 32602216  T
Q  120 atacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggt 219  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||||| ||| |||||   |||||       
T  32602217 acacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaacacaacaacgaaccgatccaaaa 32602315  T
Q  220 aggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcct 319  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | ||    
T  32602316 aggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattct 32602415  T
Q  320 aaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcc 419  Q
     || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||   ||||||| |||||||||||    
T  32602416 gaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcaccctctaactgatcc 32602515  T
Q  420 attaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32602516 atcaaatcatcaattctcggtagtggatacc 32602546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 30311952 - 30311524
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  30311952 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 30311853  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | || || || |||||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  30311852 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaa-atatcgtcaataaacacaacaacgaaccgatccaaaaa 30311754  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  30311753 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 30311654  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  30311653 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 30311554  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  30311553 tcaaatcatcaattatcggaagtggatacc 30311524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21165344 - 21164918
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| ||||| || |    
T  21165344 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttggataatttagcataaagtttcttctcttttaaca 21165245  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | || || ||||  ||||| | ||||||||||  ||||| | | |    
T  21165244 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaa-atatcatagataaaaacaaccacgaatcgatccaagaatg 21165146  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||    
T  21165145 catgaaagatgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaa 21165046  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||     
T  21165045 agctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaatgcgtgcacccactaactgatccatc 21164946  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21164945 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 21164918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22131849 - 22131421
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  22131849 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 22131750  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || | | ||||| || ||||| ||||||| ||| | ||||  |||||   |    
T  22131749 cacttgcaagacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagt-agatcaaaatatcatcgataaacacaacaaagaatcgatccaaaaa 22131651  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||  | || ||     
T  22131650 ggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccgtaatgcgttctt 22131551  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || |  |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  22131550 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgttctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 22131451  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22131450 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 22131421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22061247 - 22061059
Alignment:
Q  262 gcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctg 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22061247 gcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccttcttctgcatttcctcatccttcaccttaatctg 22061148  T
Q  362 atggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22061147 atggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacttttgcacccaccaactgattcattaagtcatcaatcctgggaagtggatacc 22061059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17672813 - 17672403
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17672813 aaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatctt 17672714  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  17672713 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 17672615  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  17672614 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 17672515  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17672514 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 17672415  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  17672414 gaagtggatacc 17672403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22247239 - 22246813
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||  |    
T  22247239 gcaataccattaccagaaataacatggccatgaaaactcgcctctttcaaccagaattcacactttgaaaatttagcatataacttcttctctttcagca 22247140  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| ||||||| || ||| ||  |||| ||| |||||||||| || || | |||| || || || || |||| ||||| |||   |||||   | |    
T  22247139 cttgcaaaacaatctacaaatgctcaacatgttctccttcaatcttggagtata-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccatgaaacgatccaaaaacg 22247041  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    || | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||    
T  22247040 caggaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacttgttctaaa 22246941  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  22246940 agcggtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccatc 22246841  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||    
T  22246840 aaagcatcaattcttggaagtggatacc 22246813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 15535356 - 15535784
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  15535356 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 15535455  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| ||||| || ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  15535456 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 15535554  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  15535555 tgcatggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 15535654  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    |   |||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  15535655 ataactgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 15535754  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15535755 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 15535784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 19979942 - 19980368
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||| | || || || || ||||| || ||||| |||||||| |    
T  19979942 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaaatcatacttagataatttagcataaaatttcttctctttcaaca 19980041  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||  || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||| | |||||||||   |||||   | |    
T  19980042 cttgcaagacaatcttcagattctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatg 19980140  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||    
T  19980141 catgaaagatgcgattcatgtactccataaacactccaggcgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccatacagtgttctgaa 19980240  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     | |||||||| |||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  19980241 agttgtcttctacatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatc 19980340  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||    
T  19980341 aagtcatcaattctcggaagtggatacc 19980368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20394938 - 20394516
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  | | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||    
T  20394938 caataccattaccagaaataatatggccaagaaaactcaccttattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatataactttttctctttcagcac 20394839  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||  |||||| || | |||| || || ||||| |||| ||| || ||   ||| |  || ||    
T  20394838 ttgcaaaacaatcttcaaatgctcggcatgttcttcttcagacttagagtata-tcaaaatatcgtcaatgaacacaacaacaaagcgatctaaataagc 20394740  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||| | |  ||||||||||     ||||||||||| || || |||||||||||     
T  20394739 atgaaaaatacgattcatgtattccataaatacacccggtgcatttgtagcactaaaaggcatcattgattattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaa 20394640  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || ||||||| |||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20394639 gccgtcttctacatatcttcatccttcagtttaatctgatgatagcccgatctcaaatcaatcttaataaacacacgtgcacccactaactgatccatca 20394540  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggat 447  Q
    ||||||| || ||  |||||||||    
T  20394539 aatcatcgattcttagaagtggat 20394516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19482854 - 19482473
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  19482854 aaataacatgaccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 19482755  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || || |||| ||||||||| | |||||   | |||||||| || || ||    
T  19482754 cagatgttctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 19482656  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  19482655 catataccccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 19482556  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||    
T  19482555 tcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatccat 19482473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 22041800 - 22042228
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| || || || || || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  22041800 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttatttctttcaaccagaattctcacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaa 22041899  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
      ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| |||||||||   |||||   |    
T  22041900 cgcttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaca-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaa 22041998  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |  || ||     
T  22041999 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgaattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctg 22042098  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||    |||||||||||||||||||    
T  22042099 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatcca 22042198  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22042199 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 22042228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Original strand, 23652018 - 23652442
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||  ||  | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||    
T  23652018 aataccattaccagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccaaaattcacacttagacaatttagcatatagcttcttctctttcaacact 23652117  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    || || |||||||||| ||| || ||||| || |||||| |||| || |||| ||||  | |||||||| || | |||||||||   |||||   | |||    
T  23652118 tgtaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcctcttcagtcttggagtaaa-tcaaagtatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgca 23652216  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || ||||| ||||| || || || ||      
T  23652217 tgaaagatgcgattcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccaaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaac 23652316  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    |||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23652317 ctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaa 23652416  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  23652417 atcatcaattctcagaagtagatacc 23652442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 222 - 450
Target Start/End: Original strand, 22522719 - 22522947
Alignment:
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||||    
T  22522719 gcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacactcctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtcgataacgtgttctaa 22522818  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | || || ||||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22522819 aagccgttttctgcatatcttcatctttcactttattctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatccat 22522918  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || |||||||| || |||||||||||||    
T  22522919 caagtcatcaattcttggaagtggatacc 22522947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 21252917 - 21253345
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  21252917 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattctcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 21253016  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||  || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||| ||||| | |||| ||||   |||||   |    
T  21253017 tacttgcagaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaaaacaacctcgaaccgatccaaaaa 21253115  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || || ||     
T  21253116 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttctg 21253215  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  21253216 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 21253315  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  21253316 tcaaatcatcaattctcgaaagttgatacc 21253345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21920556 - 21920190
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  21920556 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaa 21920457  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||  ||||||||| |||| |||  ||||||| || ||||||||||| | |||||||||   |||||   |    
T  21920456 cacttgcaaaactaacttcaaatgctcagcatattcttcttcagtctt-gaagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 21920358  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     || || || || |  ||||| |||||||| || || ||| | ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| || || |||    
T  21920357 tgcttgaaagatacaattcatgtactccataaatactccatgtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataacgcgttcta 21920258  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatctt 388  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  21920257 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatctt 21920190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21392658 - 21392241
Alignment:
Q  32 ctaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaata 131  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |    
T  21392658 ctaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaattttgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaa 21392559  T
Q  132 caatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaa 231  Q
    | | ||||| ||| ||  |||| |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||| ||||| | |||||||||   |||||   | ||||| || |    
T  21392558 ccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaaga 21392460  T
Q  232 ttcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtctt 331  Q
    | || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |  || || | ||||||    
T  21392459 tgcgattcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtctt 21392360  T
Q  332 ctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatca 431  Q
    ||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21392359 ctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatca 21392260  T
Q  432 atcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21392259 atcctcggaagtggatacc 21392241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21783217 - 21782800
Alignment:
Q  32 ctaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaata 131  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |    
T  21783217 ctaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaa 21783118  T
Q  132 caatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaa 231  Q
    | | ||||| ||| ||  |||| |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||| ||||| | |||||||||   |||||   | ||||| || |    
T  21783117 ccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaaga 21783019  T
Q  232 ttcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtctt 331  Q
    | || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |  || || | ||||||    
T  21783018 tgcgattcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtctt 21782919  T
Q  332 ctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatca 431  Q
    ||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21782918 ctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatca 21782819  T
Q  432 atcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21782818 atcctcggaagtggatacc 21782800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21787152 - 21786735
Alignment:
Q  32 ctaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaata 131  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |    
T  21787152 ctaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaattttgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaa 21787053  T
Q  132 caatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaa 231  Q
    | | ||||| ||| ||  |||| |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||| ||||| | |||||||||   |||||   | ||||| || |    
T  21787052 ccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaaga 21786954  T
Q  232 ttcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtctt 331  Q
    | || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |  || || | ||||||    
T  21786953 tgcgattcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtctt 21786854  T
Q  332 ctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatca 431  Q
    ||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21786853 ctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatca 21786754  T
Q  432 atcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21786753 atcctcggaagtggatacc 21786735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 278 - 450
Target Start/End: Original strand, 22989274 - 22989446
Alignment:
Q  278 gaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctc 377  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||||| || || || || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  22989274 gaaaggcatcactttatattcataatacccataacgcgttctgaaagctgtattctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctc 22989373  T
Q  378 aaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||    
T  22989374 aaatcaatcttgctaaacacacttgcagccactaactgatccatcaagtcatcaattattggaagtggatacc 22989446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 349 - 448
Target Start/End: Original strand, 22373168 - 22373267
Alignment:
Q  349 tcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22373168 tcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattcttggaagtggata 22373267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19864902 - 19864473
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  19864902 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 19864803  T
Q  121 tacttgcaata-caatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggt 219  Q
     ||||| || | | |  |||| ||| ||   ||| |||||||||  |||||| |||| |||| || |||||||| || | ||||| |||   |||||       
T  19864802 cacttgtaaaaaccagtttcaaatgctcaatatgttcttcttcagacttagagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccatgaaccaatccaaaa 19864704  T
Q  220 aggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcct 319  Q
    | ||||| || ||  | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || || ||    
T  19864703 atgcatgaaagatgagattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttctactcatagtgaccataccgcgttct 19864604  T
Q  320 aaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcc 419  Q
     || ||||||||||||||||| || |  || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || |     ||||||||||||||||||    
T  19864603 gaaagctgtcttctgcatatcttcatattttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaaatttagcacccactaactgatcc 19864504  T
Q  420 attaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864503 atcaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 19864473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 326 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21781691 - 21781567
Alignment:
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
    ||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  21781691 tgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaa 21781592  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21781591 tcatcaatcctcggaagtggatacc 21781567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 22988703 - 22988889
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||| |||||||     
T  22988703 ctgcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcag 22988802  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaa 208  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| || ||||| || |||| |||||||||    
T  22988803 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggaat-atatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaa 22988889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16875570 - 16875475
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16875570 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 16875475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 19114663 - 19114804
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  19114663 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 19114762  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttc 162  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  19114763 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttc 19114804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20650810 - 20650735
Alignment:
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20650810 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 20650735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21848812 - 21848717
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21848812 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaaatggatacc 21848717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23155526 - 23155422
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  23155526 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcagaagcgg 23155427  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  23155426 atacc 23155422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 16414417 - 16414492
Alignment:
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16414417 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 16414492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16875853 - 16875765
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  16875853 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 16875765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21194992 - 21194920
Alignment:
Q  378 aaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21194992 aaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccattaaatcatcaatcctcagaagcggatacc 21194920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24932279 - 24932204
Alignment:
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  24932279 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcattggaagtggatacc 24932204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21849116 - 21849007
Alignment:
Q  50 ccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctg 149  Q
    ||||||||||| | |||  | ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |    
T  21849116 ccaagaaaactcacttccttcaaccaaaactcccacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcag 21849017  T
Q  150 catgctcttc 159  Q
    ||||||||||    
T  21849016 catgctcttc 21849007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 449
Target Start/End: Original strand, 23902484 - 23902564
Alignment:
Q  369 cccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||    ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23902484 cccgatctcaaatcaatcttactgaacacttccgcaccaaccagctgatccattaaatcatcaatcctcagaagcggatac 23902564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 399
Target Start/End: Original strand, 19869868 - 19870043
Alignment:
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || |  || || |||||||||||   ||| || ||||||||||| || || || |||    
T  19869868 atggaaaattctgttcatatactccataaacactcctggcgcgttggacactccaaaaggcatcactgaatactcataatgaccataacgggttctgaag 19869967  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacac 399  Q
    || ||||||   ||||| ||   |||| |    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19869968 gcagtcttcgatatatcttccgacttcgctcgtatctggtggtaccctgacctcaaatcaattttactaaatacac 19870043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 19290 - 19718
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19290 ctgcaataccaataccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttatctttcaa 19389  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  19390 cacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcctcttcggtcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacataaccacaaatttatctagata 19488  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  19489 agcatggaaaattttgtttatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtccta 19588  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19589 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaattgatcca 19688  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19689 ttagatcatcaatcctcggaagtggatacc 19718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 795
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  1222 ctgcattaccacttccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaattcacacttcgacaacttggcatacaacttcttctcctttaa 1123  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1122 tacttgcaatacaatcttcagatgttctgcattctcttcttcattcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaactcaaccacgaatttatccaggta 1024  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1023 ggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtccta 924  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  923 aaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaa-acctttgcacccactaactgatcca 825  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  824 ttaagtcgtcaatcctcggaagtggatacc 795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 44785 - 44357
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44785 ctgcaataccactaccagaaataatggggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacttattttctttcaa 44686  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  44685 tacttgcaatacaatcttcagatgttttgtatgctcttctttagtcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 44587  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  44586 tgcatggaaaatttttttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtccta 44487  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  44486 aaggccgtcttctccatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatcca 44387  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44386 tcaaatcgtcaattctcggaagtggatacc 44357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 24152 - 24580
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24152 ctgcaataccacaaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttcttttaa 24251  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |    
T  24252 tacttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaga 24350  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24351 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacaccccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtccta 24450  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  24451 aaggctgtcttctgcatatcgtcatccttcaccttaatctggtggtaacttgacctcaagtcaatcttactgaacacccttgcacccactaactgatcca 24550  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24551 ttaagtcatcaattctcggaagtggatacc 24580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 50243 - 49815
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50243 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaacaagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 50144  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  50143 cacttgaaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 50045  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50044 ggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacatcgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtccta 49945  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  49944 aagggcgtattctgcatatcctcatcattcaccttaatctaatggtaacctgacctcaaatcaatcttgcagaacacacgagcacccactaactgatcca 49845  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  49844 tgaaatcgtcaattctcgaaagtagatacc 49815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 37586 - 38014
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37586 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaactcactttacttaaccaaaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaa 37685  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  37686 tacttctaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaa-tcagaatgtcatcaataaattcaaccacaaatttatccaggta 37784  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37785 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgtaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgttcta 37884  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||| |||||||    
T  37885 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatcca 37984  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37985 ttaagtcatcaatcctcgaaagtggatacc 38014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 14141 - 14572
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14141 caataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatat 14240  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14241 ttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttataat-aaattagaatgtcatcaatagacacaaccacgaatttattcaggtaggc 14339  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattc------gtaatgaccatatcgtgtc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||       || |||||||| ||||||    
T  14340 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatattcatatatatagtgaccataacgtgtc 14439  T
Q  318 ctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgat 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14440 ctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaacacacgtgcacccactaactgat 14539  T
Q  418 ccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14540 ccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 14572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5841 - 5746
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5841 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6126 - 6038
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  6126 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 6038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19997 - 19574
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| || |     || |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  19997 ctgcaataccactaccagaaataatgtgatcaagaaaacttacttcacttaaccaaaaat-----ttagacaacttggcatacaacttattctctttgaa 19903  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19902 tacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcattcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaagta 19804  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19803 ggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgtcagacgcattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtccta 19704  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  19703 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 19604  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  19603 ttaagtcgtcaatcctcagaagtggatacc 19574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26584 - 26496
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  26584 aaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgttcagcatgctcttc 26496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 23278314 - 23278742
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23278314 ctgcaataccactaccaaaaataatgtggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 23278413  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  23278414 tatttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcagaatgtcatcaataaaaacaaccacgaaattatccagata 23278512  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23278513 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtccta 23278612  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  23278613 aaggtcgtcttctgcatatccttgtccttcaccttaatttgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatcca 23278712  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  23278713 tcaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 23278742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19650955 - 19650527
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19650955 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaactagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaa 19650856  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||   |    
T  19650855 aacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcctcttcggtcttagaataaattaga-atatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaaaa 19650757  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19650756 agcatggaaaatttggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtgacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccatatcgtgtccta 19650657  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  19650656 aaggtcgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatcca 19650557  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19650556 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 19650527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19717922 - 19717496
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19717922 ctgcaataccactaccagaaataatgtggcctagaaatcttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacagcttcttttctttcaa 19717823  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |  | || ||||||||||||| ||||   |||||||||||  |    
T  19717822 aacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctgatcttcagtcttagaataaattaga-atatcatcaataaacacaacccaaaatttatccagaaa 19717724  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19717723 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgctttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 19717624  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||   ||||||||| ||||||||||    
T  19717623 aaggccgtcttgtgcatatcctcatccttcaacttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttaaaaacctttgcacccaccaactgatcca 19717524  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||    
T  19717523 tcaagtcatcaatcctcagaagtggata 19717496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 23112274 - 23112705
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23112274 ctgcaataccactactagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttccttcaa 23112373  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || || | |||||| ||    
T  23112374 cacttgcaacacaatctttaaatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaagatatcatcaataaacacaactacaaactgatccagata 23112472  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23112473 agcatggaaaattctattcatgtactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccatatcgcgtccta 23112572  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaa---atcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgat 417  Q
    ||||| || |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  23112573 aaggccgttttctacatatcttcatctttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcatcaatcttgctgaatatgcgtgcacccactaactgat 23112672  T
Q  418 ccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23112673 ccattaaatcatcaattctcggaagtggatacc 23112705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 394
Target Start/End: Original strand, 24950131 - 24950500
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||| | || |||  |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||     
T  24950131 caataccactacgagaagtaaggtggccaagaagactcacttcacttaaccataactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatat 24950230  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| ||    
T  24950231 ttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaa-tcagaatatcatcaacaaatacaaccgcaaatttatccaggtaagc 24950329  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24950330 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 24950429  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24950430 gccgtcttctgcatatcttcatcctttaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaa 24950500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 31832196 - 31832568
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  31832196 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaa 31832295  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  31832296 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 31832394  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  31832395 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 31832494  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31832495 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaa 31832568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 194 - 450
Target Start/End: Original strand, 25255629 - 25255885
Alignment:
Q  194 aaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcacctta 293  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25255629 aaacacaaccatgaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacctta 25255728  T
Q  294 tattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaa 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  25255729 tattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctga 25255828  T
Q  394 atacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25255829 acacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 25255885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Original strand, 27789291 - 27789704
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  27789291 accagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcagcaca 27789390  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  27789391 attctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaatt 27789489  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27789490 cgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 27789589  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  27789590 gcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaat 27789689  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| |||||    
T  27789690 cctcggaagcggata 27789704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23098921 - 23098495
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||  |    
T  23098921 gcaataccactaccagaaataatgtggccgagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaacattttctctttcagaa 23098822  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    | || ||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||  ||||||||| |||||||  | |    
T  23098821 cctgtaatacaatcctcagatgctcggcatgctcttcttcagtcttagaataaattaaa-atatcatcaataaacaccaccacgaatctatccagaaaag 23098723  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23098722 catgaaaaatcctattcatatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttctattcgtaatgaccataacgtgtcctaaa 23098623  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |    |||||| || |||||||||||     
T  23098622 ggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtatcctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatc 23098523  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || || ||||||||| |||| |||||||    
T  23098522 aagtcgtcaatcctcagaagcggatacc 23098495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 34 - 448
Target Start/End: Original strand, 12575904 - 12576317
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  12575904 accagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaattcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaacaca 12576003  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||   | ||||| ||||||    
T  12576004 attctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaa-tcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccaaaaaagcatgaaaaatt 12576102  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12576103 cgattcatatactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttct 12576202  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    ||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  12576203 gcatatcttcatctttcaccttaatttggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaat 12576302  T
Q  434 cctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| |||||    
T  12576303 cctcggaagcggata 12576317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Original strand, 1065289 - 1065658
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  1065289 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaatcagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 1065388  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || ||||||||||| |  ||||| || ||||||||  |    
T  1065389 cacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaa 1065487  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  1065488 agcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 1065587  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttact 391  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1065588 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact 1065658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24819130 - 24818707
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||  ||||    
T  24819130 ataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaaccagagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcactt 24819031  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| |||||| ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||| || | |||| || |||||||| |||| ||||| |||   ||| |  || ||||    
T  24819030 gcaagacaatcctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtata-tcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcat 24818932  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    | ||||| || ||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24818931 gaaaaatacgattcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggc 24818832  T
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
     |||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24818831 cgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaa 24818732  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||| | || |||||||||||||    
T  24818731 tcatcagttcttggaagtggatacc 24818707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 24711572 - 24712000
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  24711572 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 24711671  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  24711672 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 24711770  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  24711771 tgcatggaaaatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 24711870  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  24711871 aaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatcca 24711970  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24711971 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 24712000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24875655 - 24875227
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  24875655 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 24875556  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || |||||||| || | ||| |||||   |||||   |    
T  24875555 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaatacaactacgaaccgatccaaaaa 24875457  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  24875456 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 24875357  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||    
T  24875356 aaagccgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctgatgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaatcgatcca 24875257  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24875256 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 24875227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 25264592 - 25264768
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25264592 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 25264691  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaaca 198  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25264692 cacttgcaagacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaat-aaatcaagatgtcatcaataaaca 25264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 41607290 - 41606862
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  || | |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  41607290 ctgcaataccatcactagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 41607191  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  41607190 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 41607092  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  41607091 tgcatggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 41606992  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41606991 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatcca 41606892  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41606891 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 41606862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21143943 - 21143518
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  21143943 caataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacac 21143844  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || |||| ||| |||||   |||||   | ||    
T  21143843 ttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgc 21143745  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||     
T  21143744 atggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaa 21143645  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21143644 gctgtcttctgtatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 21143545  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21143544 aatcatcaattctcggaagttgatacc 21143518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 23295473 - 23295705
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23295473 ctgcaataccactacccaaaataatgtggcccagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 23295572  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23295573 aacttgtaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaat-aaatcaggatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggta 23295671  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaac 254  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23295672 agcatggaaaattcggttcatatactccatnaac 23295705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 27372807 - 27373235
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  27372807 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 27372906  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  27372907 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 27373005  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  27373006 tgcatggaagatgcgattcatatattccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 27373105  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27373106 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatcca 27373205  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27373206 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 27373235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 24263908 - 24264336
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  24263908 ctgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 24264007  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||  |||| || |||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  24264008 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcaacatgttcctcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccaatccaaaaa 24264106  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  24264107 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 24264206  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  24264207 aaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 24264306  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24264307 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 24264336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27209072 - 27208791
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | |||||||| |  |    
T  27209072 ataccactaccagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaagttggcatacaactttctctctttcaaaatct 27208973  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||||| | |||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  27208972 gcaacacaatcttcaggtgctctgcatgcacctcttcagtcttagaataaa-tcaaaatatcatctataaacaccaccacgaatttatccagaaaagcat 27208874  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttata-ttcgtaatgacc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  27208873 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacactaggcgctttagtaacaccgaaagacatcactttgtatttcgtaatgacc 27208791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 27219572 - 27219982
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  27219572 aaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 27219671  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  27219672 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 27219770  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||||    
T  27219771 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctgaaagccgtcttctgcata 27219870  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27219871 tcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 27219970  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  27219971 gaagtggatacc 27219982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 9485754 - 9486182
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  9485754 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 9485853  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  9485854 cacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 9485952  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  9485953 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 9486052  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||    
T  9486053 aaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatcca 9486152  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9486153 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 9486182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Original strand, 16926948 - 16927326
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |    
T  16926948 aaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 16927047  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | || | |||| || || || ||||||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  16927048 agtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 16927146  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||    
T  16927147 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacc 16927246  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16927247 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 16927326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Original strand, 17000588 - 17000966
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |    
T  17000588 aaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 17000687  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | || | |||| || || || ||||||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  17000688 agtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 17000786  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||    
T  17000787 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacc 17000886  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17000887 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 17000966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 10870406 - 10870816
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  10870406 aaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 10870505  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| |||||| ||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  10870506 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 10870604  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||    
T  10870605 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 10870704  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10870705 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 10870804  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  10870805 gaagtggatacc 10870816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21324146 - 21323745
Alignment:
Q  46 atggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgt 145  Q
    |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || |  || ||||| |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||     
T  21324146 atggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctccttcaacacttgcaagacaatcttcagatgc 21324047  T
Q  146 tctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatac 245  Q
    || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || || || | ||| |||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||    
T  21324046 tcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgatgaaaacaactacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatac 21323948  T
Q  246 tccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgt 345  Q
    ||||| || || ||||| | ||| ||||| || |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || |    
T  21323947 tccataaatactccaggtgtattggtaacaccaaaaggcataactttatactcatagtggccataacgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcat 21323848  T
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21323847 cttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 21323748  T
Q  446 ata 448  Q
    |||    
T  21323747 ata 21323745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23106633 - 23106205
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  ||||||| || || || || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  23106633 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttcttttaaccataattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 23106534  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| |||| || |||||||| || | ||||||||| | |||||   |    
T  23106533 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaactgatccaaaaa 23106435  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || || |||    
T  23106434 tgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttcta 23106335  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||| ||||||||||    
T  23106334 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatcca 23106235  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  23106234 tcaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 23106205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 44384457 - 44384047
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  44384457 aaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 44384358  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  44384357 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 44384259  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  44384258 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 44384159  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || || || || |||||||| || |||||  | |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44384158 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctaatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 44384059  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  44384058 gaagtggatacc 44384047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 24677029 - 24677455
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| ||||| || |    
T  24677029 gcaataccatcaccagaaataacatggcccagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctcttttaaca 24677128  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | || || ||||| || || | |||||||||   |||||   | |    
T  24677129 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaa-atatcatcgatgaaaaaaaccacgaaccgatccaaaaatg 24677227  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || ||    
T  24677228 catggaagatgcgattcatatactccataaacactacaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaa 24677327  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||| ||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||  |   |||||||||||||||||||||     
T  24677328 agctatcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaatcttttgcacccactaactgatccatc 24677427  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24677428 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 24677455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 23073401 - 23073829
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  23073401 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 23073500  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || || | ||||| |||    | ||| |||||||||  ||| || |||| |||| || |||||||| || | |||||||||    ||||   |    
T  23073501 cacttggaaaaccaacttcaaatggctagtatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacattccaaaaa 23073599  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || ||     
T  23073600 tgcatgaaagatgcggttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtattcataatggccatatcgcgttctg 23073699  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||| || || | || ||||||||||||||||||||    
T  23073700 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaatacttgcacccactaactgatcca 23073799  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23073800 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 23073829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 450
Target Start/End: Original strand, 9337205 - 9337548
Alignment:
Q  106 cttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccac 205  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || ||||||| ||||||    
T  9337205 cttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaga-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 9337303  T
Q  206 gaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatga 305  Q
     ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||    
T  9337304 aaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtga 9337403  T
Q  306 ccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcac 405  Q
    ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| || || || |||||||    
T  9337404 ccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcac 9337503  T
Q  406 ccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9337504 ccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 9337548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 445
Target Start/End: Original strand, 23189457 - 23189879
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||| ||   | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  23189457 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcccagaaaacttactttcttcaaccagaa-tcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 23189555  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||| ||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  23189556 cacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtctataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 23189654  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  23189655 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 23189754  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||  || |||||  ||||||| |||||||| || || ||   ||||||||||||| ||||||    
T  23189755 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacctaacctcaagtcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatcca 23189854  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  23189855 tcaaatcatcaattctcggaagtgg 23189879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24706385 - 24705959
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  24706385 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacatttagataatttagcataaagtttcttctctttcaaca 24706286  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || |||||||| || | | |||||||   |||||   | |    
T  24706285 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacagccacgaaccgatccaaaaatg 24706187  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    | || || ||  | ||||| |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||    
T  24706186 cgtgaaagatatgattcatgtactccataaacactccaggtacattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaa 24706087  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||||||||||||||||| || |  || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||    ||||||||||||| ||||||     
T  24706086 agctgtcttctgcatatcttctttttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactaatccatc 24705987  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24705986 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 24705959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30209607 - 30209395
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||| |  || |||||||||||||| |||||||| |    
T  30209607 ttcatatattccataaacactcccagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatatttgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgaa 30209508  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  30209507 tatcctcatctttcactttgatctggtgatagcctgaccttaactcaattttactgaacacacgcgcacccactaactgatccatcaaatcttcgatcct 30209408  T
Q  437 cggaagtggatac 449  Q
    |||||||||||||    
T  30209407 cggaagtggatac 30209395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22734675 - 22734251
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||    
T  22734675 aataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaatttacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacact 22734576  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    ||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| | || || ||||||||||| | |||||||||   |||||   |  ||    
T  22734575 tgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaa-atatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaattca 22734477  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    || || || || ||||| |||| ||| || || ||||| |||||  |||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || || || || |    
T  22734476 tgaaagatgcgattcatgtactacataaatactccaggtgcatttataacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaag 22734377  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
     ||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||  | || |||| || |||||||||||||||||| ||    
T  22734376 ttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgttgaaaacacttgtacccactaactgatccatcaa 22734277  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22734276 atcatcaattctcggaagtggatacc 22734251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30010883 - 30010662
Alignment:
Q  228 aaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctg 327  Q
    ||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||| || || |||||||||||||  |    
T  30010883 aaaatacgattcatatatttcataaacactcctggcgcattagtaacactgaaaggcatcacagaatattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggtcg 30010784  T
Q  328 tcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatc 427  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||  | || || || || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  30010783 tcttctgaatatcctcatctttcactttaatctggtgatagcctaatcttaagtccattttactgaacacacgcgcacccactaacggatccatcaaatc 30010684  T
Q  428 atcaatcctcggaagtggatac 449  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  30010683 gtcgatcctcggaagtggatac 30010662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 357 - 450
Target Start/End: Original strand, 22279978 - 22280071
Alignment:
Q  357 atctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22279978 atctgatgatatccagatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 22280071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24829736 - 24829665
Alignment:
Q  379 aatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24829736 aatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 24829665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Original strand, 45534481 - 45534592
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||| | |||  | |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| |||||||  ||    
T  45534481 caataccactaccagaaataatatgaccgagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataacttcttctctttcagcac 45534580  T
Q  124 ttgcaatacaat 135  Q
    |||||| |||||    
T  45534581 ttgcaaaacaat 45534592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Original strand, 25130471 - 25130575
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    ||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25130471 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagttgatccataaaatcatcaatcctcggaagcgg 25130570  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  25130571 atacc 25130575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 445
Target Start/End: Original strand, 23611090 - 23611134
Alignment:
Q  401 tgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23611090 tgcacccactaaccgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 23611134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24568249 - 24568153
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaag 442  Q
    |||||||  |||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24568249 ccttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctaatccattaaatcatcaatccttggaag 24568153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24830043 - 24829955
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| | |||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  24830043 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagaattgcaacacaatcctcaaatgctccgcatgctcttc 24829955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 25 - 421
Target Start/End: Original strand, 6692 - 7087
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6692 aataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaatact 6791  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||  | |||    
T  6792 tgcaatacaatcttcagatgttctacatgctcttcctcagtcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttaatcagaaaagca 6890  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6891 tgaaaaattcggttcatatactctataaacacatcaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 6990  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6991 ccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttacggaatacacgagcacccactaaccgatccat 7087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Original strand, 169 - 592
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169 aataccactacaagaaataatgtggccaagaaaactaacatcacttaaccagaaatcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 268  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||  |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  269 tgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcctaaaataa--tcaaaatgtcatcaataaatacaaccatgaatttatccagataggca 366  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  367 tggaaaattcggttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcttaatgtccatatcgtgtcctaaagg 466  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  467 ccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaagctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaa 566  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || ||||||||||||||||||||||    
T  567 gtcgtcaatcctcggaagtggatacc 592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 41638 - 42062
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  41638 caataccactaccagatataatatggccaagaaaacttacttcgcgtaaccagaattcacacttggacagcttgtcatacaacttcttttctt-caacac 41736  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||    
T  41737 ttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccatataagc 41835  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  41836 atgcaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaactccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaag 41935  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41936 gccgtattctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgagcacccactaactgatccatta 42035  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42036 aatcatcaattctcggaagtggatacc 42062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 51627 - 51285
Alignment:
Q  107 ttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacg 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||  ||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| || || | ||||||     
T  51627 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatcttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcatcgatgaaaacaaccaca 51529  T
Q  207 aatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgac 306  Q
    || | |||||     ||||| || || || |||||||||||||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||    
T  51528 aagtgatccaaaagtgcatgaaagatgcgattcatatactccataaatactcgaggtgcattggtaacaccaaaaggcatgactttgtattcatagtgac 51429  T
Q  307 catatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacc 406  Q
    |||| || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  51428 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacc 51329  T
Q  407 cactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51328 cactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 51285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2640 - 2212
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2640 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttagacaacttggcatacaacttcctttctttaaa 2541  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||    
T  2540 cacttgcaacaaaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaga-atatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaata 2442  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2441 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtccta 2342  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2341 aaggtcgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatcca 2242  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2241 ttaaatcatcaattctcggaagtggatacc 2212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 29653 - 29225
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29653 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttagacaacttggcatacaacttcctttctttaaa 29554  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||    
T  29553 cacttgcaacaaaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaga-atatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaata 29455  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29454 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtccta 29355  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29354 aaggtcgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatcca 29255  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29254 ttaaatcatcaattctcggaagtggatacc 29225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 24 - 448
Target Start/End: Original strand, 28466 - 28889
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28466 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaatttcttttctttcaacac 28565  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  28566 ttgcaacacaatcatcagatgctctgcatgcttttcttcattcctagaataaatt-aggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggc 28664  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  28665 atggaaaattctgttcatatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaag 28764  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  28765 gtcgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactgaacacgcgtgcacccactaactgatctatta 28864  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  28865 aatcatcaattctcggaagtggata 28889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 324642 - 325069
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  324642 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacacttcgacgacttagcatacaactttttctctttcaa 324741  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||| | |||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  324742 aatttgcaatacaatcttcagatgttctacatgctcttcttcagtccttgaataga-tcagaatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagata 324840  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  324841 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 324940  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  324941 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttactaaaaaccttcgcacccactaactgatcca 325040  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    | || || |||||||||||||||||||||    
T  325041 tcaagtcgtcaatcctcggaagtggatac 325069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 201836 - 201408
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  201836 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaatttacttcacttaaccagaattcacatttggaccatttggcatacagcttcttttccttcaa 201737  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || | |||| || ||||||||||||| |||||| ||   |||||  ||    
T  201736 cacttgcaacacaaccttcaaatgttctgcatgttcttcttcagtcttagagtata-tcaaaatatcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaaata 201638  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  201637 agcatggaaaattctattcatgtactccataaacacacccggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtccta 201538  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  201537 aaggccgttttctgcatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctaaacactcgtgtacccactaactgatcca 201438  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  201437 ttaaatcatcaattctcggaagtggatacc 201408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 99930 - 99502
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |     
T  99930 ctgcaataccactaccagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatataactttttctcttttag 99831  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  99830 aatttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaataga-tcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 99732  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  99731 ggcatggaaaattcgattcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtccta 99632  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||    
T  99631 aaggctgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaattcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatcca 99532  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  99531 ttaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 99502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 9001 - 9427
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||| || |||||||| |    
T  9001 gcaataccactaccagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaactagaactcacacttcgacaacttagcacacaactttttctctttcaaaa 9100  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  9101 cttgtaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatt-aagatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccagatagg 9199  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9200 catggaaaatttggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 9299  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||     
T  9300 ggccgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcatccactaactgatccatc 9399  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  9400 aagtcatcaatcctcggaagtggatacc 9427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 186 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1693 - 1431
Alignment:
Q  186 tcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggca 285  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1693 tcatcaataaatacaaccacaaatttatcctgaaaagcatggaaaatttggttcatatcctccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggca 1594  T
Q  286 tcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaat 385  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1593 tcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttcttcatatcctcatcctttaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaat 1494  T
Q  386 cttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1493 cttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggata 1431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 47400 - 46974
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |    
T  47400 gcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacctacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacgtcgcatacaactttttttctttcaaca 47301  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||    
T  47300 cttgcaatacaatctgcagatgctctgcatgctcatcttcattcttaaaataaatt-aggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagatagg 47202  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47201 catggaaaatttggttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccataacgtgtcctaaa 47102  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47101 ggccatcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctccaatcaattttactaaacacacgtgcacccactagctgatccatt 47002  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  47001 aaatcgttaattctcggaagtggatacc 46974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 56212 - 55789
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||    
T  56212 caataccactaccagaaataatgtggctaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtac 56113  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||||||||| || | |||||  || ||||||||  | ||    
T  56112 ttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttggaataaatt-aggatgtcatcaatgaatacaaccataaacttatccagaaaagc 56014  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56013 atgaaaaatacggttcatatactccatgaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaatttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaag 55914  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    |  |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |    |||||| || ||||| ||||| |    
T  55913 gtcgtcttctgcatatcttcatccttcacctgaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttattgaaaatctttgcaccgaccaactggtccatca 55814  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || |||||||||||||| |||||    
T  55813 agtcgtcaatcctcggaagcggata 55789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 250558 - 250986
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  250558 ctgcaataccactgccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaacttagcatacaacctcttttccttcaa 250657  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |    
T  250658 cacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaacaacaaatttatccagaaa 250756  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  250757 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacactccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 250856  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||||||||| || |||||||    
T  250857 aaggccgtcttctgcatattctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccaccaattgatcca 250956  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  250957 ttaagtcatcaattctcggaagtggatacc 250986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1913 - 1496
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1913 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 1814  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || | |||| || |||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  1813 tacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttctgtccttgaattaa-tcagaatgtcatcaatgaatagaaccacaaatttatccaggta 1715  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1714 ggcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaacgaaagacatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 1615  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| ||||||||    
T  1614 aaggcagtcttctgcatatccttatccttcaccttgatctgatggtagcctgacctcaagtcaatcttactgaaaaccctcgcacccactagctgatcca 1515  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcgg 439  Q
    | || ||||||||||||||    
T  1514 tcaagtcatcaatcctcgg 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 237 - 432
Target Start/End: Original strand, 10319 - 10514
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  || || ||||| |||||||||||||    
T  10319 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcaccttatactcataatgaccatcccgcgttctaaaagctgtcttctgca 10418  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaa 432  Q
    |||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10419 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaa 10514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5453 - 5031
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5453 aatactactaccataaataatatggccaagaaaacttactccacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacact 5354  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||    
T  5353 tgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaatt-aggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagca 5255  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  5254 tggaaaattctattcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcatcttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaagg 5155  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5154 ccgttttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaatttgtctgaacacacgagcacccactaactgatccattaa 5055  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  5054 atcatcaattctcggaagtggata 5031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 64876 - 64459
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  64876 ctgcaataccactaatagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttctttttcaa 64777  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  64776 cacttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaat-aaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 64678  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64677 agcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccagg-----------cgccgaacggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 64589  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |    
T  64588 aaggacgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcatccactaactgatcaa 64489  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  64488 ttaaaccatcaatcctcgtaagtggatacc 64459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 42855 - 43282
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42855 ctgcaataccactaccagaaatgatgtggccaagaaagcttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttctctttcaa 42954  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    || |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  42955 tatttgcaacacaattttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataga-tcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggta 43053  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43054 agcatagaaa-ttcggttcatatactcgatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 43152  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  43153 aaggccctcttctgcataccctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatcca 43252  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || |||||||||| |||||||||||    
T  43253 tcaagtcgtcaatcctcgaaagtggatacc 43282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Original strand, 10770 - 11194
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10770 aataccactaccagaaatgatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacact 10869  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||  || |||    
T  10870 tgcaatacaatctttaaatgctctgtatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaactacaaattgatccaaataagca 10968  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  10969 tggaaaattctattcatgtactccataaacacaccaggcgcattggtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgcccgtatcgtgtcttaaagg 11068  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    | || ||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11069 ccgttttctgcatatctttttctttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccattaa 11168  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11169 atcatcaattctcggaagtggatacc 11194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 5)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32045 - 31619
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32045 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 31946  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| | |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  31945 tacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaataga-tcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggta 31847  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846 agcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 31747  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||    
T  31746 aaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatcca 31647  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | |  || ||||| ||||||||||||||    
T  31646 tcatgtcgtcaattctcggaagtggata 31619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 55268 - 55019
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55268 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcttatttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaa 55169  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |  || ||||||||||| |  |||||||||||| | ||  |    
T  55168 aacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaat-agattagaatatcatcaataaataccaccacgaatttaactagaaa 55070  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55069 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacacccggcgcattagt 55019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 266 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 54535 - 54353
Alignment:
Q  266 attagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatgg 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54535 attagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatgg 54436  T
Q  366 taacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  54435 taacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggata 54353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 42529 - 42624
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42529 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 42624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 42246 - 42334
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  42246 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 42334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Original strand, 52983 - 53409
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  52983 ctgcaataccactaccagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttaacatacaactttttctctttcaa 53082  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  53083 tatttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-tcagaatatcatcaataaatacaaccacaaatttatccaggta 53181  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  53182 agcatggaaaatccggttcatatactccatgaacaaaccaggcacattagtaacatcgaaaggtatcaccttgtactcgtaatgtccatatcgtgtccta 53281  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||    
T  53282 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaattgatcca 53381  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || ||||||||||| | |||||||||    
T  53382 tcaagtcatcaatcctagaaagtggata 53409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 584 - 1009
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  584 ctgcaataccactaccagaaataatgtggcccagaaaacttacttcactta-ccaaaactcacatttcgacaatttagcatacaacttcttttctttcaa 682  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |    
T  683 cacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaga-atgtcatcaataaacaccaccacaaatttatccagaaa 781  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  782 agcatggaaaattcggttcatatactacatgaacacacccggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 881  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    ||  | ||| ||||||||||    
T  882 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatattactaaaaaactttg--ctcaccaactgatcca 979  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  980 tcaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 1009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 279 - 450
Target Start/End: Original strand, 7809 - 7978
Alignment:
Q  279 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctca 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7809 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 7908  T
Q  379 aatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||| |||||||| |    ||  | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7909 agtcaatattactaaaaaactttg--ctcaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 7978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 48882 - 48456
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  48882 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 48783  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| | |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  48782 tacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaataga-tcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggta 48684  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48683 agcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtgcta 48584  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||    
T  48583 aaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatcca 48484  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | |  || ||||| |||||||| |||||    
T  48483 tcaggtcgtcaattctcggaagcggata 48456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 45107 - 45517
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45107 aaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagttttttctctttcaatacttgcaagacaatctt 45206  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  45207 cagatgatcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 45305  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  45306 catatactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 45405  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  45406 tcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattcttg 45505  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    |||| |||||||    
T  45506 gaagcggatacc 45517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 16892 - 17302
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16892 aaataacatggccaaggaaactcacttctctcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 16991  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| |||| |||| |||| || |||| |||| || ||||| || || | ||| |||||   |||||   | |||||||| ||  | ||    
T  16992 cagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgtgatt 17090  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||    
T  17091 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 17190  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  17191 tcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttg 17290  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||| ||||||    
T  17291 gaagtcgatacc 17302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 10430 - 10840
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  10430 aaataacatggccaaggaaactcacttctctcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 10529  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
     | ||| || ||||| |||| |||| |||| || |||| |||| || ||||| || || | ||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  10530 tagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 10628  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |  ||||||||||||    
T  10629 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagtcgtcttctgcata 10728  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  10729 tcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttg 10828  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||| ||||||    
T  10829 gaagtcgatacc 10840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Original strand, 20787 - 21213
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||    
T  20787 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctatgaa 20886  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||| |  ||||||| | |||| ||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  20887 tacttgcaatacagtcctcagatgttctgcatgctcttcctcatttctagaataga-tcaaaatgtcatcaatgaataccaccacaaatttatccaggta 20985  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20986 ggcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaagcatcaccttatattcgtagtgaccatatcgtgtccta 21085  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    |||||| || ||||| ||||    
T  21086 aaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttaatctaatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactggtcca 21185  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | || |||||||| |||||||| |||||    
T  21186 tcaagtcatcaattctcggaagcggata 21213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 281
Target Start/End: Original strand, 24949 - 25208
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||    
T  24949 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctatgaa 25048  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||| |  |||||| | ||||| ||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  25049 tacttgcaatacagtcctcagatgttctgcatgctcttcctcatttctagaat-agatcaaaatgtcatcaatgaataccaccacaaatttatccaggta 25147  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaa 281  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25148 ggcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaa 25208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11154 - 10742
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11154 ctgctataccattaccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttctctttaaa 11055  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | || || ||||||||||| |  || ||||||||||||||| |    
T  11054 tacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaaa-atatcatcaataaataccactacgaatttatccaggaa 10956  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10955 agcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 10856  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | |  |||||| || ||||||||||    
T  10855 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatatttgcaccaaccaactgatcca 10756  T
Q  421 ttaaatcatcaatc 434  Q
    | || |||||||||    
T  10755 tcaagtcatcaatc 10742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31687 - 31259
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31687 ctgcaataccaataccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacagctttgcatacaacttcttttctttcaa 31588  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||||  ||||| |||||| ||||  |    
T  31587 gacttgcaatataatcttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcagaatatcatcaataaacaccaccacaaatttaaccagaaa 31489  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31488 agcatggaaaattcggttcatatattccataaataccccaggcgcattagtaacactgaaaggcatcaacttgtattcgtaatgtccatatcgtctccta 31389  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  31388 aaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatcca 31289  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  31288 tcaagtcatcaattctcggaagtggatacc 31259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9825 - 9401
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9825 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaatcttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 9726  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     | |||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||  |||| |||  || ||||||||||||| |||||| ||||||    ||||    
T  9725 aatttgcaacacaatcttcaaatgttctgtatgctcctcttcagtcctagcttaaa-tcagaatatcatcaataaacacaaccacaaattta----ggta 9631  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9630 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 9531  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| ||   ||||||||||| |||||||     
T  9530 aaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccg 9431  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  9430 tcaagtcatcaatcctcagaagtggatacc 9401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20039 - 19615
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20039 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaagcttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 19940  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     | |||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||  |||| |||  || ||||||||||||| |||||| ||||||    ||||    
T  19939 aatttgcaacacaatcttcaaatgttctgtatgctcctcttcagtcctagcttaaa-tcagaatatcatcaataaacacaaccacaaattta----ggta 19845  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19844 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 19745  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| ||   ||||||||||| |||||||     
T  19744 aaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccg 19645  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  19644 tcaagtcatcaatcctcagaagtggatacc 19615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 176712 - 176284
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  176712 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaatttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttcattcaa 176613  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||   |||||  ||    
T  176612 cacttacaacacaatctttaaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaataaa-tcaagatgtcatcaataaatacaacaacaaaccgatccaaata 176514  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  176513 agcatggaaaattctattcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagatatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtccta 176414  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  || || |||||||| || || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  176413 aaggtcgttttatgcatatcttcatcttttactttaatctaatggtaacccgacctcaaatcaatcatgctaaacacgcgtgcacccactaactgatcca 176314  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  176313 ttaaatcatcaattcgcggaagtggatacc 176284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 262165 - 262590
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||    
T  262165 caataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtac 262264  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | | ||| || ||||| || | |||||| || ||||||||  || |    
T  262265 ttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctctttagtcttagaataaatt-aggatatcgtcaatgaatacaaccacaaacttatccagaaagac 262363  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  262364 atggaaaattcagttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaag 262463  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |    |||||| || ||||||||||| |    
T  262464 gccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatca 262563  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||| |||||||| ||| |||||||    
T  262564 agtcataaatcctcgaaagcggatacc 262590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 142 - 450
Target Start/End: Original strand, 559 - 866
Alignment:
Q  142 atgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcat 241  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  559 atgtcctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatt-aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaaattctgttcat 657  T
Q  242 atactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658 atactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaatggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcc 757  T
Q  342 tcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaa 441  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  758 tcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaaccaattttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaa 857  T
Q  442 gtggatacc 450  Q
    || ||||||    
T  858 gttgatacc 866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 448
Target Start/End: Original strand, 114500 - 114923
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  114500 caataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcatttaaccagaactcgcacttcgacaatttggcatacaatttcttctctttcaatac 114599  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| | |||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||    
T  114600 ttgcaatacaatcatcagatgttctgcatgctcttcctcagttcttgaataga-tcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagc 114698  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114699 atgaaaaattctattcatatattccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 114798  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||| |    
T  114799 gcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgaccacaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatca 114898  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
      || ||||| |||||||| |||||    
T  114899 ggtcgtcaattctcggaagaggata 114923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 239 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 95045 - 94836
Alignment:
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  95045 catatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtagtgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcata 94946  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    ||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  94945 tcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcg 94846  T
Q  439 gaagtggata 448  Q
    ||||||||||    
T  94845 gaagtggata 94836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 108161 - 107751
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  108161 aaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 108062  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| || ||||||||||| || |||| |||| || ||||| || |||| ||| |||||   |||||   | |||||||| || ||  |    
T  108061 cagatgctcagcatgttcctcttcaatcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaacgcatggaagatgcgact 107963  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || ||| |||||| ||||    
T  107962 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatcttctacata 107863  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  107862 tcctcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcttgcacccactaactgatccatcaaatcatccattctcg 107763  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  107762 gaagtggatacc 107751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 21058 - 21486
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| ||  |||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  21058 ctgcaataccactaccagaaataatgtgaccaagaaaacttactttacttaaccaaaactaacatttcaacaatttagcatacaacttattttctttcaa 21157  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  | || ||||||| ||| | ||| || |||||||||||  |    
T  21158 aacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaga-atatcatcaagaaatacaactacaaatttatccagaaa 21256  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  21257 agcatgaaaaattcggttcatatactccatgaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggtatcaccttctattcataatgaccgtgtcgtgtccta 21356  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| |  |||||||    
T  21357 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccacttgatcca 21456  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
      || || ||||||||||||||||||||||    
T  21457 ccaagtcgtcaatcctcggaagtggatacc 21486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27612 - 27188
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | | |  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||    
T  27612 caataccactaccagaaataatatgaccaagaaaactcact-cgttcaaccagaattctcactttgataacttggcatataacttcttctctttcagcac 27514  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||  ||| ||| || ||||| || || |||  |||||| || | ||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||   ||| || || |     
T  27513 ttgcaaaacaattctcaaatgctcggcatgttcctcctcagacttagagtata-tcaggatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagt 27415  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||  || || || |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||  || || ||| ||||||||    
T  27414 atgaaaaatacgattcatatattccacaaatactcccggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacagaatattcataatttccgtaacgtatcctaaag 27315  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
     |  ||||||| || ||||| || ||||  || ||| | || || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27314 tccatcttctgaatgtcctcatctttcagtttgatccggtgatagcccgatcttaagtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatacatca 27215  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  27214 aatcattgatcctcggaagtggatacc 27188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 80199 - 79771
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  80199 ctgctataccattaccaaaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcgcattttgacaatttagcatacaacttcttttctttcaa 80100  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     || || ||||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| | || || |||||||| || |  ||||| || ||||||||| |    
T  80099 aacctgtaatacaatcctcagatgctttgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaaa-atatcatcaatgaatactaccacaaacttatccaggaa 80001  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  80000 agcatgaaaaatcctgttcatatactccatgaacacaccaagcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 79901  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |    |||||| || ||||||||||    
T  79900 aaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatcca 79801  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  79800 tcaagtcatcaatcctcgaaagtggatacc 79771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1202 - 782
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1202 ctgcaataccactaccagaaataatatgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaa 1103  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| | | || || || ||||| || | ||| || |||||||||||  |    
T  1102 aacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagattaaa-atatcgtcaatgaatacaacaacaaatttatccagaaa 1004  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  1003 atcatggaaaatttggttcatatactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtccta 904  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |     ||||| || ||||||||||    
T  903 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatcca 804  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaag 442  Q
    | || || ||||||||||||||    
T  803 tcaagtcgtcaatcctcggaag 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 369 - 1
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  369 ctgcaataccacttccagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaa 270  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| ||  |  | ||||| | |||| |||||||||||  |||  ||||| ||||||||||| ||    
T  269 tacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctcttcctccgttgtcgaataga-tcaaaatgtcatcaatgtacactaccacaaatttatccagata 171  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  170 agcatgaaaaattctattcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 71  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttac 390  Q
    ||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  70 aaggcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16517 - 16214
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16517 ctgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttccttcaa 16418  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16417 tatttgcaatactatcttcagatgttctacatgcactttttcagtctttgaataaa-tcagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggta 16319  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16318 agcatggaaaattcggttcatatactctaggaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtccta 16219  T
Q  321 aaggc 325  Q
    |||||    
T  16218 aaggc 16214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6513 - 6085
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |  || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6513 ctgcaatacaactaccagaaataatgtaacccagaaaactcacttcacttaaccataactcacattttaacaactttgcatacaacttcttttctttcaa 6414  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     || |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | | || || ||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |    
T  6413 aacgtgcaatacaattctcagatgttctgcatgctcctcttcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaataccaccatgaatttatccaggaa 6315  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6314 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccatgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatttcgtgtccta 6215  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |    |||||| || ||||||||||    
T  6214 aaggccgtcttctgcatgtcttcatccttcccctttatctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatcca 6115  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || ||||||||| |||| |||||||    
T  6114 tcaagtcgtcaatcctcagaagcggatacc 6085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 448
Target Start/End: Original strand, 25056 - 25477
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |  |    
T  25056 ataccactaccagaaataacgtggcctagaaaactcacttcagttaaccagaactcccacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaatct 25155  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||    
T  25156 gcaacacaatcttcaagtgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa-tcaaaatatcatctataaataccaccacgaatttatccagaaaggcat 25254  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25255 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacgccaggcgcgttaataacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaaggc 25354  T
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
     |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||||| ||||| ||     
T  25355 cgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatcaag 25454  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  25455 tcatcaaatctcggaagtggata 25477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 10257 - 9827
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10257 ctgctataccattaccagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaa 10158  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaaca------------taacca---c 205  Q
     ||  | || |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | || || ||||||||||| |            ||||||   |    
T  10157 aacacgtaacacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatt-aacatatcatcaataaataccaccacgaatttaaccagaac 10059  T
Q  206 gaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatga 305  Q
    ||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10058 gaatttaaccagaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacacctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatga 9959  T
Q  306 ccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcac 405  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||   |||||    
T  9958 ccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcac 9859  T
Q  406 ccactaactgatccattaaatcatcaatcctc 437  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  9858 ccaccaactggtccatcaagtcatcaatcctc 9827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18622 - 18423
Alignment:
Q  251 gaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttc 350  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  18622 gaacacacctggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttc 18523  T
Q  351 accttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  18522 accttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaattggtccatcaagtcatcaatcctcggatgtggatacc 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 401 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5838 - 5789
Alignment:
Q  401 tgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5838 tgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 5789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 450
Target Start/End: Original strand, 268551 - 268974
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |  |    
T  268551 ataccattaccagaaataacatggcctaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaatct 268650  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || || || |||||| | |||||||||| |||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  268651 gcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataaa-tcaaaatatcatctataaacaccaccacgaatttatccagaaaagcat 268749  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  268750 ggaaaatctggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccacatcgtgtcctaaaggc 268849  T
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||| || ||||| ||||| ||     
T  268850 cgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaag 268949  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||    
T  268950 tcatcaatccgcgggagtggatacc 268974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 84884 - 84460
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| | ||   | |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||    
T  84884 caataccactaactgaaataatatgaccaaggaaactcactttgttcaaccagaattcgcactttgataacttggcatataacttcttctctttcagcac 84785  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||  ||| ||| || |||||||| || |   ||||||| || | |||  || ||||| ||||||| ||| || ||   ||| || || |     
T  84784 ttgcaaaacaattctcaaatgctcggcatgctcctccttggtcttagagtata-tcataatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagt 84686  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||| || || |   ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  84685 atgaaaaatacgattcatatattccataaatactctcagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaag 84586  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    |  |||||||| |||||||| || ||||| || ||| | || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  84585 gtcgtcttctgaatatcctcatctttcactttgatccggtgatagcccgatctcaagtcaattttattgaacacacgcgcacccactaact-atccatca 84487  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  84486 aatcgttaatcctcggaagtcgatacc 84460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 53 - 448
Target Start/End: Original strand, 922 - 1316
Alignment:
Q  53 agaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcat 152  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  922 agaaaactcacttcacttaactagaactcacattttgacagctttgcatacaatctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcat 1021  T
Q  153 gctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatga 252  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | || || ||||||||||| | ||| || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1022 gctcctcttcattcttagaataaattaaa-atatcatcaataaatacaacaacaaatttgtccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatga 1120  T
Q  253 acacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcac 352  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  1121 acacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcattactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatccttcac 1220  T
Q  353 cttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |     ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  1221 cttaatctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggata 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 134 - 449
Target Start/End: Original strand, 11172 - 11486
Alignment:
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaatt 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||   | ||||||||||||    
T  11172 atcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaga-atatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaagaagcatggaaaatt 11270  T
Q  234 cggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttct 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11271 cggttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttct 11370  T
Q  334 gcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11371 gcatatcctaatccttcaccttaatcagatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaat 11470  T
Q  434 cctcggaagtggatac 449  Q
    ||||||||||||||||    
T  11471 cctcggaagtggatac 11486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 5050 - 5477
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||     
T  5050 ctgcaataccactagcagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcacactttgacaactttgcatataacttcttctctttcag 5149  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || ||||| |||| |||||| ||   |||||  ||    
T  5150 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtata-tcaaaatatcgtcaatgaacacaaccacaaagcgatccaaata 5248  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||| ||| | ||||| ||||| |||    
T  5249 cgcatgaaaaatacgattcatgtactc-atgaacacacctggcgcattcgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcataaagcccataacgtgttcta 5347  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5348 aaggccgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccaatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatcca 5447  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
      |||||||||||  | |||||||||||||    
T  5448 acaaatcatcaattataggaagtggatacc 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40701 - 40273
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  40701 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaa 40602  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  40601 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaa-atatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 40503  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  40502 agcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtccta 40403  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||| || ||||||||||    
T  40402 aaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatcca 40303  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || || ||||| || ||||| |||||||    
T  40302 tcaagtcgtcaattctaggaagcggatacc 40273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 189 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 45628 - 45369
Alignment:
Q  189 tcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatca 288  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45628 tcaataaacacaaccacaaatttatccaagtaagcatggaaaatttggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatca 45529  T
Q  289 ccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatctt 388  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  45528 ccttttattcttaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatctt 45429  T
Q  389 actaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||| ||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  45428 actaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagcggata 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 3852 - 4280
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||| |||||||     
T  3852 ctgcaataccactaccagaaataacattgccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcag 3951  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || || |||| |||||||||   |||||   |    
T  3952 cacttgcaatacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtata-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaa 4050  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |||    
T  4051 tgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgtatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtctataacgtgttcta 4150  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  4151 aaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatcttaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccacaaaatgatcca 4250  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4251 tcaaatcatcaattcttggaagcggatacc 4280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45767 - 45624
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  45767 ctgcaataccacaaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaa-ttagcatacaacttcttctctttcaa 45669  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaat 165  Q
     ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45668 aacttgtaacacaatcttcagatgttttgcatgctcttcttcaat 45624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 33 - 448
Target Start/End: Original strand, 21836 - 22238
Alignment:
Q  33 taccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatac 132  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||    
T  21836 taccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttaactaaaactcacattttgacaatttggcttacaacttcttttctttcaaagcctgtaatac 21935  T
Q  133 aatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaat 232  Q
    | || ||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||             |||||| | |||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  21936 actcctcagatgttatgcatgctcctcttcggtcttagaataaaa-------------aataaatacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaat 22022  T
Q  233 tcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22023 tcggttcatatactccatgaacacaccaggtgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtactcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttc 22122  T
Q  333 tgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaa 432  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||   | ||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  22123 tgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaactttttcacccaccaactggtccatcaagtcatcaa 22222  T
Q  433 tcctcggaagtggata 448  Q
    ||||||||||||||||    
T  22223 tcctcggaagtggata 22238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18709 - 18281
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||| | ||||| ||    
T  18709 ctgcaataccactaccataaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcatctcttttaa 18610  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| ||  |||| |||||||||| ||| |  |||| |||| || ||||| ||||| | ||||||||| | |||||   |    
T  18609 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcatcatgttcttcttcaaacttggggtaaa-tcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaactgatccaaaaa 18511  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||| |||| || || ||     
T  18510 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgatcataccgcgttctg 18411  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || || ||  ||||||  || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||| ||||||||||||||    
T  18410 aaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactataatctagtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcactcactaactgatcca 18311  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18310 tcaaatcatcaatcctcagaagtggatacc 18281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 335 - 450
Target Start/End: Original strand, 39307 - 39422
Alignment:
Q  335 catatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatc 434  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  39307 catatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatgaagtcatcaatc 39406  T
Q  435 ctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||||    
T  39407 ctcggaagtggatacc 39422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 450
Target Start/End: Original strand, 28872 - 29298
Alignment:
Q  22 tgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaat 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  28872 tgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacctcttttctttcaaa 28971  T
Q  122 acttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag 221  Q
    |||||||| |||||  |||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||  |     
T  28972 acttgcaacacaattctcaggtgctctgcatgctct-cttcattcttagaatagatt-aagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaa 29069  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  29070 gcatggaaaattaggttcatatactacataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 29169  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |  |  ||||| || || ||||||||    
T  29170 aggccatcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatggtaaccaaacctcaagtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaattgatccat 29269  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  29270 caaatcgtcaattctcggaagcggatacc 29298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 955 - 556
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| | || || || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  955 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaattcacttcccttaaccagaacccgcacttcgaaaacttggcatacaactttttctctttcaa 856  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |  ||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||  |  | ||||| | | || ||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||    
T  855 aatctgcaacacaatcttctggtgttctgcgtgctcttcctcggttcttgaataga-taaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatctaggta 757  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  756 agcatgaaaaattctattcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 657  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| || ||||||||||    
T  656 aaggccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatttcatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcaccaaccaactgatcca 557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 933 - 1179
Alignment:
Q  22 tgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaat 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933 tgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcatttaactagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaat 1032  T
Q  122 acttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag 221  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  1033 acttgcaatacaatattcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaat-aaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataa 1131  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcatta 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1132 gcatggaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcacatta 1179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9176 - 8870
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176 ctgcaataccactaccagaaataatatggcgaagaaaacacacttcacataaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 9077  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  9076 cacttgcaacataattttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaa-taaagatatcatcaataaacacgaccacaaatttatccagata 8978  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8977 agcatggaaaattaagttcatgtacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtccta 8878  T
Q  321 aaggctgt 328  Q
    ||||||||    
T  8877 aaggctgt 8870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 320 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4959 - 4831
Alignment:
Q  320 aaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcc 419  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||||    
T  4959 aaaggctgttttctgcatatcttcatccttcaccttaatcagatggtaacctaacctcaaataaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcc 4860  T
Q  420 attaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4859 attaaatcatcaattctcagaagtggata 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44998 - 44864
Alignment:
Q  34 accataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaataca 133  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| | |||||| |||    
T  44998 accagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaagtcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacatttgcaagaca 44899  T
Q  134 atcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatctt 168  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  44898 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtctt 44864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12664 - 12349
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||     
T  12664 caataccagtaccaaaaatgatgtggcccagaaaactcacttcactttaccagaacttacactttgacaacttagcatacaactttttctctttcaataa 12565  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||  || | ||||||||| | |||||| ||||| |||| ||| ||    
T  12564 ttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataga-tcagaatattatcaataaatacaaccacaaatttttccaagtaagc 12466  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12465 atggaaaattcggttcgtatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaag 12366  T
Q  324 gctgtcttctgcatatc 340  Q
    || ||||||||||||||    
T  12365 gccgtcttctgcatatc 12349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 22645 - 23071
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |    
T  22645 gcaataccactaccaaaaataacatggccaagaaaacttacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttggcatataacttcttttccttcggca 22744  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || |  || |||||||||  |||||| || | |||| || ||||  || |||| ||||||||| | |||||  || |    
T  22745 cttgcaaaacaatcttcaaatgctcagtgtgttcttcttcagacttagagtata-tcaaaatatcattgatgaacacaaccacgaagtgatccaaatacg 22843  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22844 catgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcagttgtaacaacgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaa 22943  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | || | |||||||||||||||||||     
T  22944 ggccgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtggtagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacagacattcacccactaactgatccatc 23043  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| || || |||||||||||||    
T  23044 aaatcatctattcttggaagtggatacc 23071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 38186 - 37760
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  38186 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaaca 38087  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| || || | |||| ||||   |||||   | |    
T  38086 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaaaacaaccgcgaaccgatccaaaaatg 37988  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||    
T  37987 catggaagatgcgatttatatactccataaacactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaa 37888  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||||     
T  37887 agctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactaatccatc 37788  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37787 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 37760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11104 - 10681
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||  ||||    
T  11104 ataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaaccagagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcactt 11005  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| |||||| ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||| || | |||| || |||||||| |||| ||||| |||   ||| |  || ||||    
T  11004 gcaagacaatcctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtata-tcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcat 10906  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    | ||||| || ||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10905 gaaaaatacgattcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggc 10806  T
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
     |||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10805 cgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaa 10706  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||| | || |||||||||||||    
T  10705 tcatcagttcttggaagtggatacc 10681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24663 - 24238
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |  ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||    
T  24663 caataccattaccagaaataacatggcctagaaaactcacctcattcaaccagaattcacattttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcac 24564  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| |||  |  || | ||||||||| ||||||| || | |||| ||||| || || |||| |||||||||   ||| || || ||    
T  24563 ttgcaaaacaatcttcaaatgcgcaacaagttcttcttcagtcttagagtata-tcaaaatgtcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatctagatacgc 24465  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||   |||||  || || | ||| ||||| |||||     
T  24464 atgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacttggcgcgtttgtaacaccgaaaggcatcactgaatatttatagtgtcaataacgtgttctaaaa 24365  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    | ||||||||||||||||||||| || || |||||||  || |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24364 gttgtcttctgcatatcctcgtcttttactttaatctagtgataacccaatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatca 24265  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  24264 agtcatcaattctcggaagtggatacc 24238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17296 - 16962
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||  ||||    
T  17296 ataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaaccagagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcactt 17197  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    |||| |||||| ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||| || | |||| || |||||||| |||| ||||| |||   ||| |  || ||||    
T  17196 gcaagacaatcctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtata-tcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcat 17098  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggc 325  Q
    | ||||| || ||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17097 gaaaaatacgattcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggc 16998  T
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctg 361  Q
     |||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  16997 cgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctg 16962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14847 - 14421
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||  | ||| |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||     
T  14847 ctgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgacaatttagcatataacttcttctctttcag 14748  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||| || || | |||| || || || || |||| |||||||||  ||||||   |    
T  14747 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttcaatcttggagtata-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaactatccaaaaa 14649  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  14648 tgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttcta 14549  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14548 aaagcagtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatcca 14449  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    | ||||||| ||| || |||||||||||    
T  14448 taaaatcattaattcttggaagtggata 14421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9400 - 8974
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||   |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||  |    
T  9400 gcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcatccaaccagaattcacactttgacagcttggcatataacttcttctccttcagca 9301  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| ||  |||| |||||||||  |||||| || | |||| || ||||| || |||| |||||||||   ||| |  || |    
T  9300 cttgcaaaacaatcctcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttagagtata-tcaaaatatcatccatgaacacaaccacgaaacgatctaaatacg 9202  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  9201 catgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcataatgtccataacgtgtcctaaa 9102  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     || ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  9101 agccgtcttctccatatccccgtctttcaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatc 9002  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9001 aaatcatctatccttggaagtggatacc 8974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1398
Alignment:
Q  376 tcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1324 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacc 1398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Original strand, 6628 - 6702
Alignment:
Q  376 tcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6628 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacc 6702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 44721 - 44989
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  44721 ctgcaataccattaccagaaataatgtgacctagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacagcttagcatacaacctcttttccttcaa 44820  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |    
T  44821 cacttgcaatataattctcagatgttttgcatgctcctcttcattcttggaataaa-tcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaa 44919  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcacc 290  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44920 agcatggaaaattcggttcatatactccatgaacactccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacc 44989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 217788 - 217360
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |  ||| | ||| |||||||||| |||||||| ||  |||| | |||||| |||||||     
T  217788 ctgcaataccactaccagaaataacgtggccaagaaaactcacctcattcaactagaactcacactttgacaatttaacatatagcttcttctctttcag 217689  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||  |||| |||||||| | ||| || || | |||| || |||||||| | || |||||||||   ||| |   |    
T  217688 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttcgaacttcgagtata-tcaaaatatcatcaatgatcacaaccacgaaacgatcaaaaaa 217590  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  217589 cgcatgaaaaatatgattcatgtactccataaacacacctggggcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttcta 217490  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  217489 aaggacgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgcaaaacacacgtgcacccactaactgatcca 217390  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  217389 tcaaatcatcaattcttggaagtggatacc 217360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 434 - 7
Alignment:
Q  22 tgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaat 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||| ||||||||     
T  434 tgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcaac 335  T
Q  122 acttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag 221  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| || ||||| ||||| ||| |||| || |||| |||| ||||||||||| || | |||||||||   |||||   |     
T  334 acttgcaacacagtcttcaaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaat 236  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |  || ||||    
T  235 gcatgaaaaatgcgattcatgtactccatcaacacaccaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcacgttatactcataatgtccataacacgttctaa 136  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  135 aagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatccat 36  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || |||||||| || |||||||||||||    
T  35 caagtcatcaattcttggaagtggatacc 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 8876 - 9304
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  8876 ctgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 8975  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||   |||||   |    
T  8976 cacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaa 9074  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  9075 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 9174  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  9175 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 9274  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9275 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 9304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6255 - 5829
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| | |  ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |    
T  6255 gcaataccattaccagaaataacatgaccaagaaaaatgacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcagca 6156  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||||  |||||| || | |||| || || || || |||| |||||||||   ||| || || |    
T  6155 cttgcaaaacaatcttcaattgctcagcatgttcttcttcagccttagagtata-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatctagatatg 6057  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  6056 catggaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcgtttgtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcctaatgtccatgtcgtgttctaaa 5957  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  5956 agccgtcttttgcatattgtcgtccttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactggtccatc 5857  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    || || ||||| || |||||||||||||    
T  5856 aagtcgtcaattcttggaagtggatacc 5829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Original strand, 2841 - 3265
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |  ||| | |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||  |||    
T  2841 aataccattaccagaaataatatggccacggaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaattgagcatataacttcttctctttcagcact 2940  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    ||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||| || | |||| || ||||| || |||| |||||||||   |||||  || |||    
T  2941 tgcaaaataatcttcaaatgttcagcatgttcttcttcagacttagattata-tcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaataagca 3039  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  3040 tgaaaaatacgattcatgtattccataaatacacccggtgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaagg 3139  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    |  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3140 ccatcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaa 3239  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||    
T  3240 atcatcaattcttggaagtgggtacc 3265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8024 - 7599
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | | |  | |||||||| ||| | || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  8024 caataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcactcctttcaaccagaattcatacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacac 7925  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| || | ||||| ||| ||  |||| |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||||||||| | ||| | |||   |||||   | ||    
T  7924 ttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaataaaaacaactatgaaccgatccaaaaatgc 7826  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| |  || || ||     
T  7825 atgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacccgttctgaaa 7726  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||  ||||||||||||||||||||| |    
T  7725 gcagtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacatttgcacccactaactgatccatca 7626  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || | |||||||||||    
T  7625 aatcatcaattcttgaaagtggatacc 7599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 40091 - 40519
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  40091 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 40190  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  40191 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcatcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 40289  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||  |     
T  40290 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttg 40389  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||  || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  40390 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctagtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 40489  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40490 tcaaatcatcagttctcggaagtggatacc 40519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14490 - 14064
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | || ||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  14490 caataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaacagaattcacacttagaaaatttagcataaagtttcttctctttcaacac 14391  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||  ||||||||| || | || ||||   || || ||||| |||||||  ||||||||   |||||   ||||    
T  14390 ttgcaagacaatcttcagatgctcagcatattcttcttcagtcatggagtaaataaaaaatatcatcgataaacaccaccacgaaccgatccaaaaaggc 14291  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||     
T  14290 atggaagatgcgattcatatactccataaacattccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaa 14191  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||  || || ||||| |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| |    
T  14190 gctatcttctgcatatcatcatctttcactttaatctagtgataccccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatca 14091  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14090 aatcatcaattctcggaagtggatacc 14064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11607 - 11179
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  11607 ctgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaaatttcttctctttcaa 11508  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| |||||||  ||||||||   |||||   |    
T  11507 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaacaccaccacgaaccgatccaaaaa 11409  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||     
T  11408 ggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctg 11309  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  11308 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 11209  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11208 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 11179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Original strand, 36336 - 36714
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |    
T  36336 aaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttcttttaacacctgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 36435  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | |||| | || || ||||||||||| | |||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||      
T  36436 agtaaa-taaaaatatcatcaataaaaacaaccacaaaaagatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattca 36534  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    ||||  |||||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| || |||||    
T  36535 taacatcgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacc 36634  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
      | ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36635 taatctcaaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaaatctcggaagtggatacc 36714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 30823 - 31248
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||||||||| || ||    
T  30823 caataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactgacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttcttttaacac 30922  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
     ||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | || || || || || || | ||||||||| | |||||   | ||    
T  30923 ctgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaa-atatcttcgatgaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgc 31021  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  |||||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || ||     
T  31022 atggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattcataacatcgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaa 31121  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| || || || || || ||||| || |||||  | ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31122 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacctaatctcaaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 31221  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||    
T  31222 aatcatcatatctcggaagtggatacc 31248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Original strand, 53788 - 54001
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||  ||||||| ||||| |  || |||||||||||||    
T  53788 ttcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagggaccataccgtgttcagaaagctgtcttctgca 53887  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    |||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53888 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 53987  T
Q  437 cggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||    
T  53988 cggaagtggatacc 54001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13883 - 13834
Alignment:
Q  401 tgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13883 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 13834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 16815 - 17242
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || ||||| || ||| |  ||  | || ||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16815 ctgcaatatcactaccagaaataacattgccaaaaacactcacctctttcaatcagaattgacactttgacaatttggcatataacttcttctctttcaa 16914  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || || | |||| || || || || |||| |||||||||   ||| |  ||    
T  16915 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtata-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaagcgatctaaata 17013  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||   |||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  17014 cgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcattggtaacaccgaaagg-atcactgaatattcataatgtccataacgtgttcta 17112  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17113 aaagttgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaattaatcttactaaacacacgtgcacccactaattgatcca 17212  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  17213 tcaaatcatcaattcttggaagtggatacc 17242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 111856 - 111817
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaact 60  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  111856 ctgcaataccaccaccagaaataatatggccaagaaaact 111817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 281
Target Start/End: Original strand, 1267 - 1521
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  1267 ataccattaccagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcgcattttgacaatttagcatacaacttcttttctttcaaaacct 1366  T
Q  126 gcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcat 225  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || || |||||||| || |  |||||||||||||||||  | ||||    
T  1367 gtaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaat-aaattaaaatatcatcaatgaatactaccacgaatttatccagaaaagcat 1465  T
Q  226 ggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaa 281  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1466 gaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaa 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 57955 - 58381
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  57955 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaaca 58054  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    |||| || |||||||||| |||  | ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||   | |    
T  58055 cttggaagacaatcttcagatgcacagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcatcgataaacacaactacgaactgatccaaaaatg 58153  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||    
T  58154 catggaagatgcgattcatataatccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaa 58253  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| ||||||||     
T  58254 agctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaattgatccatc 58353  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  58354 aaatcatcaattctcggaagtggatacc 58381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 195830 - 195444
Alignment:
Q  46 atggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgt 145  Q
    |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || |  || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| |||     
T  195830 atggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaaccttcagatgc 195731  T
Q  146 tctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatac 245  Q
    || ||||| |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||| ||||| | |||||| ||   ||||||  | |||||||| || || |||||||||    
T  195730 tcagcatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaagacaaccacaaaacgatccagaaatgcatggaagatgcgattcatatac 195632  T
Q  246 tccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgt 345  Q
    ||||| || ||  | || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| || |    
T  195631 tccataaatacttctggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcat 195532  T
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaat 433  Q
    | || | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  195531 catttatcttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 195444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18219 - 18006
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || | | |||||||||    
T  18219 ttcatgtactacataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtactgaaagatatcttctgca 18120  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    |||| || || || || |||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18119 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacatgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 18020  T
Q  437 cggaagtggatacc 450  Q
    ||| ||||||||||    
T  18019 cggtagtggatacc 18006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 55693 - 56121
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  55693 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaa 55792  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||| ||||| ||| |||| || |||| |||| ||||||||||| || | |||||||||   ||| |   |    
T  55793 cacttgcaaaacagtcttcaaatgctcaacatgttcttcctcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatcaaaaaa 55891  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||    
T  55892 tgcatgaaaaatgtgattcatgtactccataaacactccaggggcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttcta 55991  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55992 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatcca 56091  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  56092 tcaagtcatcaattctcggaagtggatacc 56121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 40573 - 40998
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  40573 caataccactaccataaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacac 40672  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| ||| |||||| ||| || ||||| ||||| ||  |||| || |||| | || ||||||||||| || | |||||||||   |||||   | ||    
T  40673 ttgcaaaacagtcttcaaatgctcagcatgatcttcctcggtcttggagtaaattaaa-atgtcatcaatgaaaaaaaccacgaaacgatccaaaaatgc 40771  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||     
T  40772 atgaaaaatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaa 40871  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  40872 gctgtcttctgcatatctttatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 40971  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||| | || |||||||||||||    
T  40972 agtcatcagttcttggaagtggatacc 40998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 74293 - 74718
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  74293 caataccactaccataaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacac 74392  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| ||| |||||| ||| || ||||| ||||| ||  |||| || |||| | || ||||||||||| || | |||||||||   |||||   | ||    
T  74393 ttgcaaaacagtcttcaaatgctcagcatgatcttcctcggtcttggagtaaattaaa-atgtcatcaatgaaaaaaaccacgaaacgatccaaaaatgc 74491  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||     
T  74492 atgaaaaatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaa 74591  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  74592 gctgtcttctgcatatctttatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 74691  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||| | || |||||||||||||    
T  74692 agtcatcagttcttggaagtggatacc 74718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8859 - 8766
Alignment:
Q  357 atctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8859 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 8766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 9322 - 9732
Alignment:
Q  39 aaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 138  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  9322 aaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 9421  T
Q  139 catatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggtt 238  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | || || ||||| || || | ||| |||||   |||||   | |||||||| || || ||    
T  9422 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-taaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 9520  T
Q  239 catatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcata 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  9521 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 9620  T
Q  339 tcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcg 438  Q
    ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  9621 tcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgtacccactaactgatccatcagatcatcaattctcg 9720  T
Q  439 gaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||    
T  9721 gaagtggatacc 9732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7455 - 7027
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  7455 ctgcaattccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaa 7356  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||| |||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||  ||| |||||||| || || | ||||| |||   |||||   |    
T  7355 cacttgcaaaacagtcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaac-caaaatgtcatcgatgaatacaaccatgaaacgatccaaaaa 7257  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||    
T  7256 tgcatgaaagattcgattcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcactttatactcataatgtccataacgcgttcta 7157  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | |||||||||||||||  | || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7156 aaagttgtcttctgcatatctccatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatcca 7057  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  7056 tcaaatcgtcaattcttggaagtggatacc 7027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 16096 - 16524
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  16096 ctgcaataccatcaccggaaataacatggccaagaaaacttaattctttcaaccagaattcacacttagacaagttagcataaattttcttctctttcaa 16195  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || | ||||||| || || |||||||||| ||| |||||   |||||   |    
T  16196 cacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagt-aaatcaaaatatcgtcaataaacacaactacgaaccgatccaaaaa 16294  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || |||||||| || |||||| | || || ||     
T  16295 tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacggaaaggcataactttatattcatagtgaccacaacgcgttctg 16394  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||  |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  16395 aaaactgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 16494  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16495 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 16524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 2358 - 2788
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgac-aacttggcatacaacttcttttctttca 119  Q
    |||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| || ||| || || ||||| |  || || |||||||    
T  2358 ctgcaataccatcaccggaaataacatggccaagaaaacttaattctttcaaccagaattcacacttagaccaagttagcataaaggttattctctttca 2457  T
Q  120 atacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggt 219  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||||| |||||||||   |||||       
T  2458 acacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaa 2556  T
Q  220 aggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccg-aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcc 318  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||||||| || |||||||| || |||||||| || || |    
T  2557 atgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccggaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttc 2656  T
Q  319 taaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatc 418  Q
    | ||  |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  2657 tgaaaactgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgttcacccactaactaatc 2756  T
Q  419 cattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2757 catcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 2788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 608 - 378
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  608 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 509  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |  ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || | |||| | ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  508 aatctgcaacacaatcttcagatgttctgaatgctattcttcagtccttgaat-agatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 410  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatga 252  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  409 agcatggaaaattcggttcatatactccatga 378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4928 - 4698
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  4928 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 4829  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |  ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || | |||| | ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  4828 aatctgcaacacaatcttcagatgttctgaatgctattcttcagtccttgaat-agatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 4730  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatga 252  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4729 agcatggaaaattcggttcatatactccatga 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34118 - 33910
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  34118 caataccactatcagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacatcttcttttcctttaacac 34019  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||   |||||  || ||    
T  34018 ttgcaacataatctttaaatgctctgcatgctcttcttcagacctagaat-aaatcaaaatgtcatcaataaatacaaccacgaaccaatccaaataagc 33920  T
Q  224 atggaaaatt 233  Q
    ||||||||||    
T  33919 atggaaaatt 33910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 644 - 414
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  644 ctgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaa 545  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |  ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || | |||| | ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  544 aatctgcaacacaatcttcagatgttctgaatgctattcttcagtccttgaat-agatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagata 446  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatga 252  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  445 agcatggaaaattcggttcatatactccatga 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15081 - 14786
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  15081 ctgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaactagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaa 14982  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| |||| |||| | || || || |||||||||||||  || || || ||||||||  |    
T  14981 cacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaat-agattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaa 14883  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtc 317  Q
     |||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  14882 agcatggaagattagattcatgtactccataaaaacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtc 14786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 938 - 1363
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | |||  | |||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||| || |||| |||    
T  938 caataccactaccagaaatgatatggccaagaaaagtcacttcgttcaaccagaattcacacttcgataatttggcatataacttcttctccttcagtac 1037  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| |||||  ||| ||| || ||||| || |||||  ||||||| || | |||  || ||||| ||||||| ||| || || | |||||  || ||    
T  1038 ttgcaaaacaattctcaaatgctccgcatgttcctcttcggtcttagagtata-tcataatatcatctataaacacaacaacaaactgatccaaataagc 1136  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |  || ||||||||||||    
T  1137 atgaaaaatacgattcatatattccataaacactcccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatatttgtaatgtctgtaacgtgtcctaaag 1236  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1237 gctgtcttatgaatatcctcatctttcactttgatctggtgatggcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatca 1336  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||  || |||||||||||||||||||    
T  1337 aattgtcgatcctcggaagtggatacc 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 3519 - 3947
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||| | ||||||||| |  ||  | ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  3519 ctgcaataccattgccagaaataacatgtctaagaaaactcacctctttcaaccataattcacactttgacaatttagcataaaactttttctctttcaa 3618  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||| ||| ||| |||||| ||| || ||||| ||||| ||| |||| || |||| |||| ||||||||||| || | |||||||||   |||||   |    
T  3619 cacttccaaaacagtcttcaaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaa 3717  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||  |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || || |||    
T  3718 tgcatgaaaaatgcgattcacgtactccataaacacagcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtccataacgcgttcta 3817  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  3818 aaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatatggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 3917  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||    
T  3918 tcaagtcatcaattcttggaagtggatacc 3947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 25313 - 24885
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  25313 ctgcaataccactaacagaaataacatatccaagaaaactcaattctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttatctttcaa 25214  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| ||||| |||||||| || |||| |||| || || |||||||| | |||||||||   |||||   |    
T  25213 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcctcaatcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcaataaaaagaaccacgaaacgatccaaaaa 25115  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || || ||     
T  25114 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacacttcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgcgttctg 25015  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  25014 aaagctgtcttctgcatatcatcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatcca 24915  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  24914 tcaaatcatcaattatcggaagtggatacc 24885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22551 - 22128
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||| ||  |    
T  22551 gcaataccactaccagaaataatatggccaaaaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatataacgttttctcttgcagca 22452  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |  || || |||||||||  |||||| || | |||| || |||||||| |||| ||| || |    ||| |  || |    
T  22451 cttgcaaaacaatcttcaaatgcttggcgtgttcttcttcagacttagagtata-tcaaaatatcatcaatgaacacaacaacaatgcgatctaaataag 22353  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||  |||| |  ||||| || ||| | || ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||   ||||| |||||| || || |||||||||||    
T  22352 catgagaaatgcaattcatgtattccgtaaatacacccggtgcattagtaacac-gaaaggcatcactgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaa 22254  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22253 ggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatgatagctcgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatc 22154  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||||||| || || |||||||||||    
T  22153 aaatcatcgattcttggaagtggata 22128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16342 - 15918
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||  ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||    
T  16342 caataccattaccagaaataacacggtcaagaaaacttacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctccttgaacac 16243  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| | |||||||| ||| || ||||  || |||||| ||||||| || | |||| || ||||| || || |||||||||||   ||| || || ||    
T  16242 ttgcaaaa-aatcttcaaatgctcagcatattcctcttcagtcttagagtata-tcaaaatatcatcgatgaatataaccacgaaacgatctagatacgc 16145  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||   ||| || ||||| ||||| ||| | |||||     
T  16144 atgaaaaatgcgattcatgtactacataaacacacctggcgcgtttgtaacacccaaaggcatcactgaatactcataatgtccataacgttttctaaaa 16045  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||  ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  16044 gccatcttctgcatatcctcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaacacatgtgcacccactaactaatccatca 15945  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15944 aatcatcaattctcggaagtggatacc 15918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 14406 - 14834
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||| || | ||| | |||||| |||||||     
T  14406 ctgcaataccattacccgaaataacatggccaagaaaactaacctcattcaaccagaactcacactttgacaatttagaatatagcttcttctctttcag 14505  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||   ||| || || | |||| || || || || |||| |||||||||   |||||   |    
T  14506 cacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgctcttcttcggacttcgagtata-tcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaa 14604  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  14605 cgcatgaaaaattcgattcatgtattccataaacacaccaggtgcctttgtaacatcgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttcta 14704  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |  |||||||||||||| || || ||||| |||||| | || ||||| || |||||||  || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14705 aaagtcgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatcgggtgataacctgatctcaaattgatgttgctaaacacacgtgtacccactaactgatcca 14804  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||    
T  14805 tcaagtcatcaattcttggaagtggatacc 14834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 36051 - 36168
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 36150  T
Q  121 tacttgcaatacaatctt 138  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36151 tacttgcaatacaatctt 36168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 249 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 115179 - 114978
Alignment:
Q  249 atgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtcct 348  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |    
T  115179 atgaacacacctggcacatttgtaacaccgaaaggcatcactcaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccatcttctggatatcctcgtctt 115080  T
Q  349 tcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggata 448  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  115079 tcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggata 114980  T
Q  449 cc 450  Q
    ||    
T  114979 cc 114978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 115347 - 115207
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||  |    
T  115347 gcaatgccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccaaaattcacactttgacaacttggcatataactacttctccttcagca 115248  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttca 163  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  115247 cttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttca 115207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1140 - 719
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||    
T  1140 aataccactaccaaaaataacatgtccaagaaagctcacttctctcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacact 1041  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    ||||| || | ||||| ||| || |||||   |||||||  ||| || |||| |||| || |||||||| || | |||||||||   |||||   | |||    
T  1040 tgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatg---ttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgca 945  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    || || || || ||||| |||||||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || |    
T  944 tgaaagatgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatgtccataacgcgttctgaaag 845  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  844 ctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgttcacccactaactgatccatcaa 745  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  744 atcatcaattcttggaagtggatacc 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 20179 - 20604
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || |||||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  20179 caataccactaccagaaatagcatgtccaagaaagctcaattctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacac 20278  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| || | ||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||   |||||   | ||    
T  20279 ttgcaaaaccaacttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgc 20377  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| || ||  | ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||     
T  20378 atgaaagatatgattcatgtactccataaacactctaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttctgaaa 20477  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20478 gttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctgttgataacctgatctcaagtcaatcttgctgaaaacactagcacccactaactgatccatta 20577  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||| || |||||||||||||    
T  20578 agtcatcaattcttggaagtggatacc 20604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2873 - 2445
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  2873 ctgcaataccactactagaaataacatggccaagaaaactcatctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaa 2774  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||||||   | |||||| ||| || ||||| ||||| |||  ||| || |||| |||| || |||||||| || | |||||||||   |||||   |    
T  2773 cacttgcaaactagtcttcaaatgctcagcatgttcttcctcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaa 2675  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||    
T  2674 tgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacaccaagcgcgtttgtaacaccagaaggcatcactttatactcataatgtccataacgcgttcta 2575  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  2574 aaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatatggtgataaccggatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattcatcca 2475  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  2474 tcaagtcatcaattctcggaagtggatacc 2445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 407
Target Start/End: Original strand, 86710 - 87091
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| || || || || |||| |||||| ||||| || || ||||  ||    
T  86710 caataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataactaggcatataacttattctccttcagcac 86809  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| ||| |||| | ||| || ||||| || || ||  ||||||| || | |  | || ||||| ||||||||||| || |||  || ||  || ||    
T  86810 ttgcaaaacattcttaa-atgctcggcatgttcctcctcggtcttagagtatattaga-atctcatctataaacataacaacaaatcgattcaaataagc 86907  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| |||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  86908 atgaaaaatatgattcatatattccataaacactccaggggcgttagtaacaccgaaaggcatcatcgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaag 87007  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcaccc 407  Q
    || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  87008 gccgtcttctgaatatcctcatctttcactttgatctggtgatagcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcaccc 87091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 151048 - 151476
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| || | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | ||| || ||||||||    
T  151048 ctgcaataccactaccagaaattacatgtcctagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttattctctttcaa 151147  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| | || || | ||| ||||| | |||||||||   |||||   |    
T  151148 cacttgcaacaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaa-atattatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 151246  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||| | |||||  |||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || || ||     
T  151247 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaagtgcattcataacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctg 151346  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  151347 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataaccagatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatcca 151446  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  151447 tcaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 151476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 5)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 86144 - 85736
Alignment:
Q  41 ataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttca 140  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  86144 ataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctccttcaacacttgcaagacaatcttca 86045  T
Q  141 tatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttca 240  Q
     ||| ||   ||| ||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| || || | |||||| ||   |||||   | |||||||| || || ||||    
T  86044 gatgctcaatatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatgtcatcgatgaaaacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattca 85946  T
Q  241 tatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatc 340  Q
    | ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  85945 tttactctataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 85846  T
Q  341 ctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcgga 440  Q
     || || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  85845 ttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttactgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgta 85746  T
Q  441 agtggatacc 450  Q
    ||||||||||    
T  85745 agtggatacc 85736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 85598 - 85170
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  85598 ctgcaataccactacctgaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 85499  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| |||| ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| ||  ||| | || || ||||||||||| | |||||||||   ||| |   |    
T  85498 cacttgcaaaacaagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggaggaaattaaa-atatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatctaaaaa 85400  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| ||||| ||     
T  85399 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgtgttctg 85300  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||  | |||||||| ||||| || || ||   || |||||||||||||||||    
T  85299 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataaccttatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgtacccactaactgatcca 85200  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  85199 tcaaatcatcaatcctcgtaagtggatacc 85170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 132524 - 132429
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  132524 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 132429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Original strand, 26029 - 26133
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  ||||| |||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || |  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26029 ccttcactctaatcggatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaacaagatgatacatcaaatcatcaatccttggaagtgg 26128  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  26129 atacc 26133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 132807 - 132704
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||||| |||| ||| |    
T  132807 aaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaaaacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttcctcaaacttcg 132708  T
Q  171 aata 174  Q
    ||||    
T  132707 aata 132704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 7961 - 8386
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  7961 caataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacac 8060  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| || | ||||| ||| |  ||||| |||||||||  | | || |||| |||| || |||||||| || | |||||| ||   |||||   | ||    
T  8061 ttgcaaaactagcttcaaatgcttagcatgttcttcttcagacatggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgc 8159  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| || || || ||     
T  8160 atgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatctccataacgcgttctgaaa 8259  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
     |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8260 actgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatca 8359  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8360 aatcatcaattctcggaagtggatacc 8386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Original strand, 24438 - 24542
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||   |||||| || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  24438 ccttcactctaatctgatgatatcctgatcttaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccttggaagcgg 24537  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  24538 atacc 24542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15585 - 15161
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |  ||  | ||| |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |  |||    
T  15585 aataccactaccagaaattacatggccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgacaatttagcatataactttttctcttttagcact 15486  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    ||||| |||||||||| ||| || || || ||||||||| |||| || || | |||| || || || || |||| || ||||||   |||||   | |||    
T  15485 tgcaaaacaatcttcaaatgctcagcttgttcttcttcagtcttggagtata-tcaaaatatcgtcgatgaacacaatcacgaaacgatccaaaaatgca 15387  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| |  || ||||| |    
T  15386 tgaaaaatacgattcatgtactccataaagatacctggcgcatttgtaacaccgaaaggaatcactttatattcataatgtctataacaagttctaaaag 15287  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    | |||||||||||||| || || ||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15286 ccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatccgatgataacccgatctcaaagcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaa 15187  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     |||||||| || ||||||| |||||    
T  15186 gtcatcaattcttggaagtgtatacc 15161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 7159 - 7587
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||  |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  7159 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaaactcacttcttttaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaa 7258  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| ||  |||| ||||| ||  |||| || |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||   ||| |   |    
T  7259 cacttgcaaaaccaacttcaaatgctcaacatgttcttcctcggtcttggagtaaa-tcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatctaaaaa 7357  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |  || ||     
T  7358 tgcatgaaagatacgattcatgtactccataaacactctaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataccacgttctg 7457  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||   |||||||||||||||||||    
T  7458 aacgctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacattagcacccactaactgatcca 7557  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  7558 tcaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 7587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2215 - 1900
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||  |    
T  2215 gcaataccactaccagaaataacatgaccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatttaacttcttctccttcagca 2116  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||| |  |||||| || | |||| || |||||||| |||| ||||| |||   ||| |  || |    
T  2115 cttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttgagacttagagtata-tcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacg 2017  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2016 catgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacccggcgcattagtaacaccgaaagccatcactgcatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaa 1917  T
Q  323 ggctgtcttctgcatat 339  Q
    ||| |||||||||||||    
T  1916 ggccgtcttctgcatat 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 314 - 450
Target Start/End: Original strand, 11188 - 11324
Alignment:
Q  314 tgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaac 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  11188 tgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaac 11287  T
Q  414 tgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11288 tgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacc 11324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 222 - 450
Target Start/End: Original strand, 21383 - 21611
Alignment:
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || | |||||| || || || |    
T  21383 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtaaccataacgcgttctga 21482  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | |||||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21483 aagctgtcttctgcatctctccatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccat 21582  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21583 caaatcatcaattctcggaagtggatacc 21611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 704 - 1130
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| ||||  || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  704 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacccttagacaatttcgcataaaggttcttctctttcaa 803  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| |||  ||||||| || ||||| ||||| | |||||||||   |||||   |    
T  804 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagactt-gaagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 902  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||     
T  903 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggcgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatggccataccgcgttctg 1002  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| || || ||   ||||||||| ||||||||||    
T  1003 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataa--cgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatcca 1100  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1101 tcaaatcatcaatactcggaagtggatacc 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Original strand, 3374 - 3798
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| | |    
T  3374 aataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacaat 3473  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    ||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||   || || |||| |||| || |||||||| || | |||||| ||   |||||   | |||    
T  3474 tgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagagttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgca 3572  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    || || || || ||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||  | || || || |    
T  3573 tgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgaattagtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtccatactgcgttctgaaag 3672  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3673 ctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaa 3772  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    
T  3773 atcatcaattctcgaaagtggatacc 3798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 17592 - 18014
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  17592 ctgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagattcttctctttcaa 17691  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| ||||||||| | || |||  ||||||     |||||| | || | |||||||||   |||||   |    
T  17692 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtatt-gaagtaaatca-----tcatcattgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaa 17785  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||    
T  17786 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttcta 17885  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  17886 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgt-cacccaccaactgatcca 17984  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || ||||||||  | |||||||||||||    
T  17985 tcaagtcatcaattattggaagtggatacc 18014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 5809 - 6237
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||||| | ||| ||| |||  || ||||| | |||||| ||||||||    
T  5809 ctgcaataccaccactagaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaaccagaatttacactttaacagtttagcatatagcttcttctctttcaa 5908  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||   ||| || || | |||| || ||||| || |||| |||||||||   ||| |   |    
T  5909 cacttgtaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtata-tcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatcaaaaaa 6007  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     || || | ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | |||    
T  6008 tgcttgaataatacgattcatgtattccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattcta 6107  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6108 aaagtcgtcttctgcatatcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatcca 6207  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
      || |||||||| || |||||||||||||    
T  6208 acaagtcatcaattcttggaagtggatacc 6237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 12939 - 13367
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||||| | ||| ||| |||  || ||||| | |||||| ||||||||    
T  12939 ctgcaataccaccactagaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaaccagaatttacactttaacagtttagcatatagcttcttctctttcaa 13038  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||   ||| || || | |||| || ||||| || |||| |||||||||   ||| |   |    
T  13039 cacttgtaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtata-tcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatcaaaaaa 13137  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     || || | ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | |||    
T  13138 tgcttgaataatacgattcatgtattccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattcta 13237  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || |  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13238 aaagtcgtcttctgcatatcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatcca 13337  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
      || |||||||| || |||||||||||||    
T  13338 acaagtcatcaattcttggaagtggatacc 13367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 450
Target Start/End: Original strand, 390 - 816
Alignment:
Q  22 tgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaat 121  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||  | ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  ||||| ||||||||     
T  390 tgcaataccactacaagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccaaaattcacagttagataacttcgcataaagtttcttctctttcaac 489  T
Q  122 acttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtag 221  Q
    |||||||| || | ||||| ||| ||   ||| |||||||||  |||||| |||| |||| || |||| |||||| | ||| ||||| | |||||   |     
T  490 acttgcaaaaccagcttcaaatgctcat-atgttcttcttcagacttagagtaaa-tcaaaatatcataaataaaaacaactacgaactgatccaaaaat 587  T
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  |  | ||||    
T  588 gcatgaaagatgcgattcatatactccataaatactccaggtgcattagtaaaactgaaaggcattaccttatactcataatgtccatactgcattctaa 687  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | ||||||||||| | ||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||    
T  688 aagctgtcttctggacatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgcggaaaacacgtgcactcactaactgatccat 787  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     || | |||||| ||||||||||||||||    
T  788 caagttatcaattctcggaagtggatacc 816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 421
Target Start/End: Original strand, 103171 - 103570
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||  | || ||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||| |||||||     
T  103171 ctgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaatcagaattcacactttgataatttagcataaagcttcttctctttcag 103270  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||  ||| || |||| |||| || ||||| || || |  ||||||||   |||||   |    
T  103271 cacttgcaaaacagtcttcaaatgttcggcatgttcttcctcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcgatgaatactaccacgaaacgatccaaaaa 103369  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || |||    
T  103370 tgcatgaaaaatgcgattcatgcactccataaacacacctggcgcatttgcaacaccgaaaggcatcactttatactcatagtgtccataacgcgttcta 103469  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    ||  |  ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  103470 aaatccatcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatcca 103569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 35966 - 36392
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| ||| | || |    
T  35966 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcatccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctattaaca 36065  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | || || |||||||| || | |||||| |||  |||||   | |    
T  36066 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtaaattaaa-atatcatcaatgaaaacaaccacaaatcgatccaaaaatg 36164  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| || ||  | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||| || || || ||    
T  36165 catgaaagatgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatactcatagtgaccataccgcgttctgaa 36264  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   |  ||||||||||||||||||     
T  36265 agctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatc 36364  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36365 aaatcattaattctcggaagtggatacc 36392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Original strand, 20542 - 20968
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| ||| | || |    
T  20542 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcatccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctcttaaca 20641  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||| | |||| || || |||||||| || | |||||| |||  |||||   | |    
T  20642 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagt-aaattaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaatcgatccaaaaatg 20740  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    |||| || ||  | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||  | || || || || |||||||| || || || ||    
T  20741 catgaaagatgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcatatctttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaa 20840  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatt 422  Q
     ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   |  ||||||||||||||||||     
T  20841 agctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatc 20940  T
Q  423 aaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20941 aaatcattaattctcggaagtggatacc 20968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 258 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16127 - 15934
Alignment:
Q  258 ccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttc-acctta 356  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || ||  || |||    
T  16127 ccaggtgcattggtaacaccaaaacgcataaccttatattcataatgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttttacttta 16028  T
Q  357 atctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16027 atctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 15934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 450
Target Start/End: Original strand, 1 - 425
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  |||||||||| ||||| || || || || ||||| | |||||| |||||||| |||    
T  1 aataccactaccagaaataacatgcccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcacacttagataatttcgcataaagcttcttctctttcaacact 100  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggca 224  Q
    ||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| |||| || |||||||| || | |||||||||   |||||   | |||    
T  101 tgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgca 199  T
Q  225 tggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaagg 324  Q
    || || || ||  |||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| |||| || || || ||||    
T  200 tgaaagatgcgaatcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctgaagg 299  T
Q  325 ctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaa 424  Q
    |||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  300 ctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaa 399  T
Q  425 atcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||    
T  400 gtcatcaatccttggaagttgatacc 425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Original strand, 195181 - 195318
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||    
T  195181 caataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtac 195280  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttctt 161  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  195281 ttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctctt 195318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23447 - 23339
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23447 ctgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaccttcttttccttcaa 23348  T
Q  121 tacttgcaa 129  Q
     ||||||||    
T  23347 cacttgcaa 23339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 222 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 30083 - 29855
Alignment:
Q  222 gcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 321  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||  | |    
T  30083 gcatggaagatgcgattcatatactccataattactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgggttttga 29984  T
Q  322 aggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccat 421  Q
    | |||||||||| ||| || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| |||||||||    
T  29983 aagctgtcttctacatgtcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactatctgatccat 29884  T
Q  422 taaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29883 caaatcatcaattctcggaagtggatacc 29855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1127 - 753
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttag 170  Q
    |||||||| ||||| || || || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| |    
T  1127 aaccagaattcacacttagataatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgg 1028  T
Q  171 aataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattag 270  Q
    | |||| |||| ||  |||| || || | |||||| || | |||||   | ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  1027 agtaaa-tcaaaataccatctatgaaaacaaccacaaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcatttg 929  T
Q  271 taacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||    |     
T  928 taacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgaccataccgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatcttctg----ca 833  T
Q  371 cgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |   |||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  832 ctttctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1747 - 1322
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  ||||||| || | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  1747 caataccactaccagaaataacatgtacaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacac 1648  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| || | ||||| ||| ||  |||| |||||||||  ||| || |||| |||| || |||||||| || | ||||| |||   |||||   | ||    
T  1647 ttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaaccatgaaccaatccaaaaatgc 1549  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| || ||  | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||||  | || || ||     
T  1548 atgaaagatgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatggccatactgcgttctgaaa 1449  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || |||||||| |||||| | ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| |    
T  1448 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacccgatctcaaagctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccataa 1349  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1348 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 1322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Original strand, 4134 - 4471
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  4134 gcaataccatcaccaaaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaaca 4233  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |||  ||||||  || ||||||||||| | |||||| ||   |||||   | |    
T  4234 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcattctt-gaagtaaatcagaatatcatcaataaaaacaaccacaaagccatccaaaaatg 4332  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| || ||  | ||    
T  4333 catggaagatacgattcatatactccataaacactccaagtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaa 4432  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctg 361  Q
     ||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  4433 agctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctg 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 326 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 8806 - 8685
Alignment:
Q  326 tgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaa 425  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8806 tgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaa 8707  T
Q  426 tcatcaatcctcggaagtggat 447  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  8706 tcatcaattctcggaagtggat 8685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 341 - 241
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  341 ctgcaataccattaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 242  T
Q  121 t 121  Q
    |    
T  241 t 241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 7990 - 8415
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  |||||||| || | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  7990 caataccactaccagaaataacatatccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacac 8089  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||| || | ||||| ||| ||  |||  ||||| |||| ||| || |||| |||| || |||||||| || | || ||||||   |||||   | ||    
T  8090 ttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatattcttcctcaaacttggagtaaa-tcaaaatatcatcaatgaaaacaagcacgaaccgatccaaaaatgc 8188  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaag 323  Q
    ||| || ||  | |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||  | || || ||     
T  8189 atgaaagatgtgattcatatactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaa 8288  T
Q  324 gctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccatta 423  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   |||||||||||| |||||||| |    
T  8289 gctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatca 8388  T
Q  424 aatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8389 aatcatcaatcctcgaaagtggatacc 8415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Original strand, 17398 - 17611
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||  | || || || |||||||||||||    
T  17398 ttcatatactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaagctgtcttctgca 17497  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    |||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17498 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcct 17597  T
Q  437 cggaagtggatacc 450  Q
    || |||||||||||    
T  17598 cgaaagtggatacc 17611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9119 - 8923
Alignment:
Q  53 agaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcat 152  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  9119 agaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcat 9020  T
Q  153 gctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccat 250  Q
    |||| || ||| |||| |||| | || || || |||||||||||||  || || || ||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9019 gctcctcctcattcttggaat-atattaatatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaatttggttcatgtactccat 8923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13579 - 13152
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  |||||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  13579 ctgcaataccattaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 13480  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| ||  |||| |||||||||  ||| || |||| |||| || |||||  | ||   |||||||||   |||||   |    
T  13479 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcatcatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcttttaaatcaaccacgaaccgatccaaaaa 13381  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||| | ||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||| ||||| ||     
T  13380 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccacgtgcattcgtaacaccaaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgtgttctg 13281  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| ||  | || || |||||||||||||||||||||||||    
T  13280 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggagataacccgatctcaaatctattcttctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 13181  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatac 449  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||    
T  13180 tcaagtcatcaattcttggaagtggatac 13152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 450
Target Start/End: Original strand, 2690 - 2965
Alignment:
Q  175 aaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaac 274  Q
    ||||||| || ||||||||||| | ||||||||| | || ||   | ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  2690 aaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaatgattcaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacactcgaggtgcatttgtaac 2789  T
Q  275 gccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgac 374  Q
     | ||| |||||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  2790 actgaacggcatcactttttattcatagtgtccatatcgcgttctaaaaggtgtcttctggatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgat 2889  T
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| |||||  | || ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||    
T  2890 ctcaaatctatcttgatgaaaacacgtgcatccactaactgatccatcaagtcatcaattcatggaagtggatacc 2965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4699 - 4589
Alignment:
Q  26 ataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatactt 125  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4699 ataccattaccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaaaacct 4600  T
Q  126 gcaatacaatc 136  Q
    | |||||||||    
T  4599 gtaatacaatc 4589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Original strand, 33 - 246
Alignment:
Q  237 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 336  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | || |||||  || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||    
T  33 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacactgagaggcaaaactttatactcataatgtccataccgcgttctaaaagccgtcttctgca 132  T
Q  337 tatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcct 436  Q
    |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| |||||  | || ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||    
T  133 tatcttcatccttcactttaatctagtgataacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacacgcgcacccactaacggatccatcaagtcatcaattct 232  T
Q  437 cggaagtggatacc 450  Q
     |||||||||||||    
T  233 tggaagtggatacc 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 388
Target Start/End: Original strand, 7954 - 8318
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  7954 gcaataccatcaccagaaataacatggcccataaaacttacctctttcaaccagaactcacatttagataatttagcataaagtttcttctctttcaaca 8053  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtagg 222  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| || || ||| | || |||  ||||||| || || || ||||||| ||| | |||   |||||   |||    
T  8054 cttgcaagacaatcttcagatgttcagcatgttcctcctcagtttt-gaagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaacaatgaaccgatccaaaaagg 8152  T
Q  223 catggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaa 322  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||  |  | || ||    
T  8153 catggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataaagcattctgaa 8252  T
Q  323 ggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatctt 388  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||    
T  8253 agctgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatatggtgataccctgatctcaaatcaatctt 8318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23442 - 23103
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    |||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| || ||||  |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  23442 ctgcaataccatctccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacagtttggcataaagtttcttctctttcaa 23343  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| | || || |||| |||| ||||| || ||||||| ||| || ||   |||||   |    
T  23342 cacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagttttggagtaaa-tcaaaatgtcgtcgataaacacaactactaaccgatccaaaaa 23244  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || || ||     
T  23243 tgcatggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctg 23144  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctg 361  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  23143 aacgctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctg 23103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6061 - 5974
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaactt 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  6061 ctgctataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactt 5974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 372 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9972 - 9894
Alignment:
Q  372 gacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9972 gacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 9894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 372 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17639 - 17561
Alignment:
Q  372 gacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17639 gacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacc 17561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 1823 - 1940
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  1823 gcaataccactaccagaaataatgtggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttctctctttcaaaa 1922  T
Q  123 cttgcaatacaatcttca 140  Q
      ||||| ||||||||||    
T  1923 tctgcaacacaatcttca 1940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 8310 - 8737
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| || || || ||||| || |||||   |||||||||||||||    
T  8310 ctgcaataccactactagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataatgcttcttttctttcaa 8409  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || | ||| ||||| | |  ||| || |||| |||| || ||||| ||||| | |||||||||   |||||   |    
T  8410 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagaatgttcttccttagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaacgatccaaaaa 8508  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || ||  |     
T  8509 tgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactacaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttatg 8608  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatcca 420  Q
    || | ||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  8609 aaagatgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaa-acttttgcacccactaactgatcca 8707  T
Q  421 ttaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||    
T  8708 tcaagtcatcaatcctcggaagtgaatacc 8737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28578 - 28446
Alignment:
Q  294 tattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaa 393  Q
    ||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || |    
T  28578 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctga 28479  T
Q  394 atacacgtgcacccactaactgatccattaaat 426  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28478 aaacacgtgcacccactaactgatccattaaat 28446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28745 - 28591
Alignment:
Q  107 ttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacg 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| |||| || || || ||||| | |||||||    
T  28745 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaa-tcaaaatatcgtcgataaaaacaaccacg 28647  T
Q  207 aatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccagg 262  Q
    ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  28646 aaacgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccagg 28591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1893 - 1748
Alignment:
Q  186 tcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggca 285  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||| || || |||||||| || || |||||||    
T  1893 tcatctataaagacaaccacaaatttatctaggtagggatggaaaattctattcatgtgctccatgaacactcctggtgcattagtcaccccaaaaggca 1794  T
Q  286 tcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtctt 331  Q
    | |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  1793 taaccaaatattcgtagtgaccatatcgggtcctaaaagcagtctt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 25665 - 25760
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25665 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 25760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 25382 - 25470
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  25382 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 25470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 15179 - 15274
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15179 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 15274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 14896 - 14984
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  14896 aaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 14984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11218 - 11114
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||   || ||| || |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11218 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactgaacacctctgaaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 11119  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  11118 atacc 11114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 990 - 886
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  990 ccttcactctaatctgatgatatcccgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcgg 891  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  890 atacc 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 366 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11183 - 11099
Alignment:
Q  366 taacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11183 taacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 11099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Original strand, 35688 - 35798
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| || || ||||| || | ||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35688 ctgcactaccactaacagaaataatgtgacccagaaagctcacttcgcttaacgagaactcgcattttgacaacttcgcatacaacctcttttctttcaa 35787  T
Q  121 tacttgcaata 131  Q
     ||||||||||    
T  35788 aacttgcaata 35798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Original strand, 992 - 1137
Alignment:
Q  23 gcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaata 122  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || |  || ||||| |  |||||||||||||| |    
T  992 gcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttttctttcaaca 1091  T
Q  123 cttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatctt 168  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  1092 cttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtctt 1137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1665 - 1561
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1665 ccttcactctaatctgatgatatcctaacttcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 1566  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  1565 atacc 1561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1996 - 1892
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1996 ccttcactctaatttgatgatatcccgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 1897  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  1896 atacc 1892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 408 - 450
Target Start/End: Original strand, 26651 - 26693
Alignment:
Q  408 actaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26651 actaactgatccatcaaataatcaatcctcggaagcggatacc 26693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1919 - 1824
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1919 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 1824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13669 - 13566
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13669 ccttcactgtaatctgatgatatcctgatctcaattcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 13570  T
Q  446 atac 449  Q
    ||||    
T  13569 atac 13566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 7015 - 7110
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7015 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctctgaagtggatacc 7110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 34356 - 34451
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34356 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtgcatacc 34451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38316 - 38174
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | |||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  38316 ctgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 38217  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttca 163  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  38216 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttca 38174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 41482 - 41445
Alignment:
Q  413 ctgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41482 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 41445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6699 - 6351
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||| |  | |||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  6699 ctgcaataccactactagcaataacatgtccaagaaagcacacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaa 6600  T
Q  121 tacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggta 220  Q
     |||||||| || | ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||| |||| || ||||| ||||| | |||||||||   |||||   |    
T  6599 cacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaa-tcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaa 6501  T
Q  221 ggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtccta 320  Q
     ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||  || || || || || |||||||| || || ||     
T  6500 cgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcaaaactttgtactcatagtgaccataccgcgttctg 6401  T
Q  321 aaggctgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatctgatggtaacc 370  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||    
T  6400 aaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacc 6351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 414
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||    
T  705 caataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcagccagaactcacactttgataatttagcataaagtttcttctcttttaacac 606  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaaatcaagatgtcatcaataaacataaccacgaatttatccaggtaggc 223  Q
    |||||  |||||||||| ||| || ||||| ||||||| | |||| || |  ||||||  | ||||| || |||| ||| | |||   |||||   | ||    
T  605 ttgcaggacaatcttcaaatgctcagcatgttcttctttagtcttggagt-caatcaaattatcatcgatgaacacaactaagaaccgatccaaaaatgc 507  T
Q  224 atggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgt 316  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  506 atggaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatattaatagtgaccataccgtgt 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 3864 - 3972
Alignment:
Q  21 ctgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||  |||||||||| |||||  | ||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  3864 ctgcaataccactaccaaaaataacatgtctaagaaaacttacttcttttaaccagaattcacacatagacaatttagcataaagcttcttctctttcaa 3963  T
Q  121 tacttgcaa 129  Q
     ||||||||    
T  3964 cacttgcaa 3972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3718 - 3574
Alignment:
Q  24 caataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatac 123  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  3718 caataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacac 3619  T
Q  124 ttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatctt 168  Q
    |||||| | |||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  3618 ttgcaagataatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtctt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Original strand, 89762 - 89866
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  89762 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatgaaatcatcaatccttggaagtgg 89861  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  89862 atacc 89866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 16349 - 16424
Alignment:
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||    ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16349 ctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 16424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 7424 - 7519
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  7424 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaaccagctgatccatcatatcatcaatccttggaagtggatacc 7519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 502 - 577
Alignment:
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||| || | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  502 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagcagatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 7141 - 7229
Alignment:
Q  71 aaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttc 159  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  7141 aaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttc 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 847 - 743
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |     ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  847 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacatttccgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaatcgg 748  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  747 atacc 743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8057 - 7914
Alignment:
Q  25 aataccactaccataaataatatggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacaatttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatact 124  Q
    |||||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || |  || ||||| |  ||||| |||||||| |||    
T  8057 aataccatcaccagaaataacatgggcaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacact 7958  T
Q  125 tgcaatacaatcttcatatgttctgcatgctcttcttcaatctt 168  Q
    ||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  7957 tgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtctt 7914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7275 - 7180
Alignment:
Q  355 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  7275 taatctgatgatatcctgatcttaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcataaatccttggaagcggatacc 7180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12335 - 12296
Alignment:
Q  411 aactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacc 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12335 aactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 12296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7049 - 6945
Alignment:
Q  346 ccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtgg 445  Q
    |||||||  |||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    ||||| || | || |||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  7049 ccttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctaatccatcaaaccatcaatcctcggaagcgg 6950  T
Q  446 atacc 450  Q
    |||||    
T  6949 atacc 6945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 447
Target Start/End: Original strand, 383 - 455
Alignment:
Q  375 ctcaaatcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggat 447  Q
    |||||||| ||||||||||| ||   |||||| || |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  383 ctcaaatctatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatcttcggaagtggat 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University