View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12599_low_19 (Length: 435)

Name: NF12599_low_19
Description: NF12599
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12599_low_19
NF12599_low_19
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (1-419)||(3264650-3265068)
chr4 (1-419)||(11207087-11207505)
chr4 (1-419)||(29453393-29453811)
chr4 (2-419)||(44661723-44662140)
chr4 (177-420)||(15149778-15150021)
chr4 (4-419)||(15003223-15003638)
chr4 (31-419)||(12523674-12524062)
chr4 (4-419)||(20890981-20891395)
chr4 (42-419)||(16252082-16252459)
chr4 (4-419)||(16355044-16355459)
chr4 (4-414)||(23955750-23956160)
chr4 (4-413)||(18297209-18297618)
chr4 (31-419)||(18227072-18227460)
chr4 (4-419)||(1649136-1649551)
chr4 (177-419)||(7090431-7090672)
chr4 (31-413)||(14680571-14680953)
chr4 (4-413)||(12476604-12477013)
chr4 (40-413)||(14303613-14303985)
chr4 (4-413)||(27711340-27711749)
chr4 (37-419)||(16145910-16146292)
chr4 (4-413)||(8386416-8386825)
chr4 (68-413)||(14652312-14652657)
chr4 (4-413)||(29039003-29039412)
chr4 (28-413)||(14266522-14266907)
chr4 (4-413)||(19778392-19778801)
chr4 (31-419)||(14159490-14159878)
chr4 (4-366)||(15358949-15359311)
chr4 (22-344)||(27900459-27900781)
chr4 (4-413)||(8053222-8053631)
chr4 (31-419)||(14850992-14851380)
chr4 (4-419)||(15070411-15070826)
chr4 (4-419)||(15245922-15246337)
chr4 (40-413)||(40473044-40473417)
chr4 (4-419)||(51606040-51606455)
chr4 (4-317)||(15414885-15415198)
chr4 (39-419)||(33222916-33223296)
chr4 (220-413)||(15364390-15364583)
chr4 (4-227)||(15077825-15078048)
chr4 (4-326)||(14997407-14997729)
chr4 (4-326)||(9290926-9291248)
chr4 (149-282)||(16676447-16676580)
chr4 (297-419)||(14927151-14927273)
chr4 (4-257)||(8706078-8706331)
chr4 (4-324)||(55375217-55375537)
chr4 (4-326)||(15293016-15293338)
chr4 (4-326)||(13247736-13248058)
chr4 (136-345)||(16752665-16752874)
chr4 (31-273)||(1640051-1640293)
chr4 (178-326)||(16445245-16445393)
chr4 (288-419)||(18164332-18164463)
chr4 (238-419)||(42702901-42703082)
chr4 (148-310)||(12132412-12132574)
chr4 (4-310)||(16685361-16685666)
chr4 (178-348)||(9849511-9849681)
chr4 (4-86)||(12342722-12342804)
chr4 (263-317)||(18550180-18550234)
chr4 (4-74)||(18864761-18864831)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (1-419)||(25847987-25848405)
chr5 (1-419)||(14887029-14887447)
chr5 (1-419)||(20342194-20342612)
chr5 (1-419)||(37545534-37545953)
chr5 (1-419)||(24798435-24798853)
chr5 (4-419)||(22502591-22503006)
chr5 (4-419)||(23573672-23574087)
chr5 (22-416)||(28923827-28924221)
chr5 (181-420)||(23516470-23516709)
chr5 (22-416)||(28895001-28895395)
chr5 (4-419)||(22381111-22381526)
chr5 (31-413)||(22332955-22333337)
chr5 (4-416)||(22461867-22462279)
chr5 (4-419)||(20798690-20799105)
chr5 (40-419)||(21984382-21984761)
chr5 (177-413)||(23440161-23440397)
chr5 (4-413)||(40708716-40709125)
chr5 (31-419)||(18775707-18776095)
chr5 (31-419)||(25423119-25423507)
chr5 (4-419)||(23080130-23080545)
chr5 (31-413)||(14999807-15000189)
chr5 (22-416)||(20821368-20821762)
chr5 (4-413)||(16356438-16356847)
chr5 (4-413)||(19769896-19770305)
chr5 (4-417)||(21890800-21891213)
chr5 (22-419)||(22235979-22236376)
chr5 (4-413)||(27610290-27610699)
chr5 (4-413)||(34566430-34566839)
chr5 (22-416)||(20773675-20774069)
chr5 (31-413)||(27685468-27685850)
chr5 (31-413)||(37291564-37291946)
chr5 (4-413)||(27668531-27668940)
chr5 (4-413)||(27518343-27518752)
chr5 (31-413)||(22134604-22134986)
chr5 (151-419)||(26738893-26739161)
chr5 (31-413)||(29476141-29476523)
chr5 (16-413)||(41770778-41771175)
chr5 (85-419)||(23442415-23442749)
chr5 (4-416)||(24749595-24750007)
chr5 (4-419)||(17269374-17269789)
chr5 (4-419)||(20468137-20468552)
chr5 (31-406)||(21498104-21498479)
chr5 (31-413)||(22348361-22348741)
chr5 (25-419)||(23471159-23471553)
chr5 (22-416)||(24735670-24736064)
chr5 (4-419)||(21564014-21564422)
chr5 (271-419)||(21343666-21343814)
chr5 (4-326)||(11210735-11211057)
chr5 (244-419)||(20573451-20573626)
chr5 (25-273)||(21339348-21339596)
chr5 (189-416)||(24737011-24737238)
chr5 (4-326)||(21937229-21937551)
chr5 (4-326)||(24581216-24581538)
chr5 (4-310)||(23503464-23503770)
chr5 (4-326)||(27011089-27011411)
chr5 (223-419)||(21662300-21662495)
chr5 (223-419)||(21665761-21665956)
chr5 (40-218)||(21831820-21831998)
chr5 (4-419)||(21404766-21405167)
chr5 (4-83)||(1069-1148)
chr5 (22-95)||(21229232-21229305)
chr5 (209-306)||(25244598-25244695)
chr5 (209-306)||(25308750-25308847)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (1-419)||(6679175-6679593)
chr8 (1-419)||(803972-804390)
chr8 (1-413)||(14565212-14565624)
chr8 (1-419)||(6603722-6604140)
chr8 (177-420)||(21167012-21167255)
chr8 (31-419)||(19978031-19978419)
chr8 (4-419)||(29303728-29304143)
chr8 (31-419)||(15533444-15533832)
chr8 (4-419)||(12304822-12305237)
chr8 (31-419)||(30313473-30313861)
chr8 (182-419)||(21251006-21251243)
chr8 (4-419)||(16408347-16408762)
chr8 (4-419)||(22061735-22062150)
chr8 (31-419)||(23650105-23650493)
chr8 (4-419)||(23654991-23655406)
chr8 (177-419)||(21394340-21394582)
chr8 (177-419)||(21788833-21789075)
chr8 (31-413)||(32600214-32600596)
chr8 (4-413)||(17674325-17674734)
chr8 (4-413)||(19112760-19113169)
chr8 (181-413)||(21922214-21922446)
chr8 (31-419)||(22046437-22046825)
chr8 (31-419)||(22133370-22133758)
chr8 (4-413)||(20018052-20018461)
chr8 (151-419)||(22164640-22164908)
chr8 (4-419)||(1266303-1266717)
chr8 (4-419)||(20010202-20010617)
chr8 (31-418)||(20396454-20396841)
chr8 (4-413)||(19485172-19485581)
chr8 (172-419)||(22032096-22032343)
chr8 (4-419)||(19851475-19851890)
chr8 (4-419)||(19857511-19857926)
chr8 (88-419)||(21681856-21682187)
chr8 (4-419)||(31416776-31417191)
chr8 (31-411)||(22120503-22120883)
chr8 (1-215)||(16271523-16271737)
chr8 (22-419)||(21840481-21840878)
chr8 (4-419)||(31571144-31571559)
chr8 (22-419)||(20388163-20388560)
chr8 (177-413)||(22987271-22987507)
chr8 (22-328)||(22051018-22051324)
chr8 (70-419)||(20007914-20008263)
chr8 (96-419)||(21324803-21325127)
chr8 (22-338)||(22377774-22378089)
chr8 (22-338)||(22383949-22384264)
chr8 (210-419)||(23948953-23949162)
chr8 (244-419)||(15441245-15441420)
chr8 (1-326)||(20652632-20652957)
chr8 (4-326)||(21196804-21197126)
chr8 (4-245)||(23949158-23949398)
chr8 (4-326)||(16877397-16877719)
chr8 (4-132)||(20975953-20976081)
chr8 (4-326)||(22982593-22982913)
chr8 (4-326)||(21850639-21850961)
chr8 (211-419)||(16265127-16265335)
chr8 (208-413)||(28982427-28982632)
chr8 (208-413)||(28987647-28987852)
chr8 (4-310)||(22315364-22315670)
chr8 (7-317)||(19863223-19863533)
chr8 (7-317)||(19867860-19868170)
chr8 (273-419)||(27347290-27347436)
chr8 (4-134)||(23157313-23157443)
chr8 (4-82)||(25282531-25282609)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (1-419)||(8211971-8212389)
chr7 (1-419)||(11306106-11306524)
chr7 (1-419)||(49152289-49152707)
chr7 (1-365)||(26118448-26118812)
chr7 (4-419)||(19147199-19147614)
chr7 (31-419)||(17211-17599)
chr7 (4-419)||(20746598-20747013)
chr7 (4-419)||(14264090-14264505)
chr7 (31-419)||(15154552-15154935)
chr7 (4-419)||(15624539-15624954)
chr7 (4-413)||(8198621-8199030)
chr7 (4-413)||(8707598-8708007)
chr7 (4-413)||(10870988-10871397)
chr7 (4-413)||(23516637-23517046)
chr7 (4-419)||(15102449-15102862)
chr7 (31-413)||(15160952-15161334)
chr7 (40-413)||(11237117-11237490)
chr7 (4-413)||(14332390-14332799)
chr7 (4-413)||(18551626-18552035)
chr7 (4-419)||(12206646-12207061)
chr7 (4-419)||(16950317-16950732)
chr7 (4-413)||(44791219-44791628)
chr7 (31-413)||(11552997-11553379)
chr7 (4-419)||(15203866-15204281)
chr7 (31-413)||(12687494-12687876)
chr7 (28-413)||(18177735-18178120)
chr7 (31-413)||(13686057-13686439)
chr7 (67-413)||(14954613-14954959)
chr7 (4-417)||(16072140-16072553)
chr7 (4-419)||(13021345-13021760)
chr7 (4-419)||(14286222-14286637)
chr7 (4-246)||(12456940-12457182)
chr7 (181-419)||(14037794-14038032)
chr7 (181-419)||(14347824-14348062)
chr7 (4-419)||(1253-1668)
chr7 (4-419)||(6413499-6413914)
chr7 (4-419)||(14129861-14130276)
chr7 (4-419)||(14433679-14434094)
chr7 (37-419)||(12455690-12456072)
chr7 (1-191)||(13968511-13968701)
chr7 (4-419)||(18053799-18054214)
chr7 (4-419)||(23199589-23200004)
chr7 (4-419)||(23505716-23506131)
chr7 (4-419)||(13665541-13665940)
chr7 (4-416)||(11388274-11388685)
chr7 (4-302)||(35964718-35965016)
chr7 (4-248)||(15340590-15340834)
chr7 (43-419)||(21661951-21662324)
chr7 (4-326)||(7823980-7824302)
chr7 (4-326)||(27107642-27107964)
chr7 (4-310)||(14936443-14936749)
chr7 (4-326)||(21674401-21674723)
chr7 (2-326)||(12368442-12368766)
chr7 (4-308)||(12193654-12193958)
chr7 (168-419)||(26288047-26288297)
chr7 (4-310)||(45146652-45146957)
chr7 (103-257)||(11772208-11772362)
chr7 (42-227)||(9596236-9596421)
chr7 (4-310)||(15364036-15364342)
chr7 (4-326)||(4440008-4440330)
chr7 (7-317)||(41017-41327)
chr7 (6-310)||(13353247-13353551)
chr7 (148-308)||(13378796-13378956)
chr7 (358-416)||(15479338-15479396)
chr7 (334-419)||(15340484-15340569)
chr7 (178-311)||(20466877-20467010)
chr7 (4-84)||(17923985-17924065)
chr7 (178-250)||(5432638-5432710)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (4-419)||(10468853-10469268)
chr6 (1-419)||(24364274-24364692)
chr6 (25-416)||(15459201-15459592)
chr6 (4-419)||(21471463-21471878)
chr6 (177-420)||(19864548-19864791)
chr6 (21-419)||(16963388-16963786)
chr6 (31-419)||(12497888-12498276)
chr6 (31-419)||(12510625-12511013)
chr6 (31-419)||(25765321-25765708)
chr6 (10-409)||(16927650-16928049)
chr6 (4-413)||(16626721-16627130)
chr6 (31-412)||(25609892-25610273)
chr6 (4-413)||(29591924-29592333)
chr6 (70-419)||(12505217-12505566)
chr6 (4-413)||(24313172-24313581)
chr6 (4-413)||(27187304-27187713)
chr6 (4-413)||(27261527-27261936)
chr6 (31-419)||(27331464-27331852)
chr6 (31-419)||(27392204-27392592)
chr6 (4-419)||(25768053-25768468)
chr6 (31-413)||(2874834-2875216)
chr6 (181-419)||(22078869-22079107)
chr6 (4-413)||(1543088-1543497)
chr6 (4-413)||(28263201-28263610)
chr6 (4-413)||(28341950-28342359)
chr6 (22-402)||(17415365-17415745)
chr6 (177-413)||(18408120-18408356)
chr6 (191-419)||(21833172-21833400)
chr6 (4-413)||(28292376-28292785)
chr6 (25-413)||(23078337-23078725)
chr6 (4-419)||(5839223-5839638)
chr6 (4-419)||(8766152-8766567)
chr6 (22-365)||(18800858-18801201)
chr6 (4-419)||(22796636-22797051)
chr6 (4-366)||(14381471-14381833)
chr6 (31-413)||(25112420-25112802)
chr6 (4-419)||(27560621-27561036)
chr6 (177-413)||(22762632-22762868)
chr6 (4-416)||(34645590-34646002)
chr6 (4-419)||(28282817-28283232)
chr6 (4-338)||(1640715-1641049)
chr6 (190-417)||(25750673-25750900)
chr6 (4-416)||(19879163-19879575)
chr6 (37-416)||(21564169-21564548)
chr6 (37-190)||(19453511-19453664)
chr6 (4-416)||(18794555-18794967)
chr6 (261-419)||(17032424-17032582)
chr6 (181-419)||(18197728-18197966)
chr6 (182-419)||(14131361-14131598)
chr6 (13-416)||(11280518-11280921)
chr6 (4-326)||(16382377-16382699)
chr6 (4-326)||(16098005-16098327)
chr6 (4-326)||(15078368-15078690)
chr6 (4-326)||(23996203-23996525)
chr6 (7-326)||(25743095-25743413)
chr6 (177-275)||(11291818-11291916)
chr6 (4-326)||(18837912-18838234)
chr6 (184-416)||(11287782-11288014)
chr6 (4-310)||(1648788-1649094)
chr6 (203-327)||(25750900-25751024)
chr6 (12-323)||(16233167-16233478)
chr6 (4-223)||(22433927-22434146)
chr6 (4-310)||(21412942-21413248)
chr6 (22-103)||(5297227-5297308)
chr6 (350-419)||(22433859-22433928)
chr6 (7-310)||(18571622-18571925)
chr6 (177-308)||(25655456-25655587)
chr6 (4-88)||(1652266-1652350)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (1-419)||(37677092-37677511)
chr1 (4-419)||(20294425-20294840)
chr1 (25-419)||(31550133-31550527)
chr1 (25-417)||(19760818-19761210)
chr1 (31-413)||(17044973-17045355)
chr1 (4-419)||(20939994-20940409)
chr1 (4-419)||(20249863-20250278)
chr1 (9-419)||(19854327-19854737)
chr1 (4-413)||(33390960-33391369)
chr1 (31-413)||(19106386-19106768)
chr1 (4-413)||(16350530-16350939)
chr1 (10-413)||(21830322-21830725)
chr1 (4-413)||(51333424-51333833)
chr1 (4-416)||(20856692-20857104)
chr1 (177-419)||(20136791-20137033)
chr1 (31-419)||(50620202-50620590)
chr1 (4-419)||(20835819-20836237)
chr1 (4-413)||(21836969-21837378)
chr1 (4-413)||(41354400-41354809)
chr1 (92-419)||(19664895-19665222)
chr1 (181-419)||(21747548-21747785)
chr1 (5-419)||(22433048-22433462)
chr1 (31-419)||(16078610-16078979)
chr1 (181-419)||(16369310-16369548)
chr1 (4-366)||(41307891-41308253)
chr1 (259-419)||(50612602-50612762)
chr1 (123-348)||(11382678-11382903)
chr1 (142-419)||(20075128-20075405)
chr1 (4-326)||(20831323-20831645)
chr1 (4-326)||(20914316-20914638)
chr1 (331-413)||(21163299-21163381)
chr1 (195-419)||(20244213-20244437)
chr1 (4-271)||(22135489-22135756)
chr1 (274-419)||(20395194-20395339)
chr1 (178-326)||(46518827-46518975)
chr1 (4-98)||(19663067-19663161)
chr1 (4-250)||(20184364-20184610)
chr1 (264-326)||(22142232-22142294)
chr1 (177-310)||(21202391-21202524)
chr1 (1-29)||(31539925-31539953)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (1-419)||(47123571-47123989)
chr3 (31-419)||(12497865-12498253)
chr3 (4-419)||(14876597-14877012)
chr3 (1-419)||(10383596-10384014)
chr3 (31-419)||(17489467-17489855)
chr3 (4-419)||(16329746-16330161)
chr3 (4-415)||(16371034-16371445)
chr3 (31-419)||(9522336-9522724)
chr3 (4-419)||(16492279-16492694)
chr3 (22-416)||(10420150-10420544)
chr3 (4-413)||(10905833-10906242)
chr3 (4-419)||(18134433-18134848)
chr3 (4-413)||(10005223-10005632)
chr3 (4-413)||(15348343-15348752)
chr3 (4-419)||(15227276-15227691)
chr3 (4-419)||(15953055-15953470)
chr3 (1-415)||(13322736-13323150)
chr3 (40-413)||(13252313-13252686)
chr3 (4-413)||(15589490-15589899)
chr3 (4-413)||(16635396-16635805)
chr3 (4-413)||(43162720-43163129)
chr3 (4-413)||(53385116-53385525)
chr3 (31-413)||(15725059-15725440)
chr3 (4-413)||(20062152-20062561)
chr3 (4-413)||(48425070-48425479)
chr3 (31-419)||(16807051-16807439)
chr3 (4-419)||(16691777-16692192)
chr3 (31-413)||(26792524-26792906)
chr3 (4-413)||(6600370-6600779)
chr3 (4-413)||(16756683-16757092)
chr3 (4-416)||(13972207-13972619)
chr3 (4-419)||(8759169-8759584)
chr3 (4-419)||(11961121-11961536)
chr3 (10-413)||(15402614-15403017)
chr3 (25-419)||(15247764-15248158)
chr3 (4-419)||(15208508-15208923)
chr3 (10-413)||(15338892-15339295)
chr3 (37-419)||(11303893-11304275)
chr3 (4-413)||(5425028-5425436)
chr3 (31-411)||(16412407-16412787)
chr3 (4-419)||(41177149-41177564)
chr3 (4-419)||(12360629-12361044)
chr3 (4-419)||(13941651-13942066)
chr3 (22-348)||(16836615-16836941)
chr3 (85-419)||(14571475-14571809)
chr3 (1-187)||(28754177-28754363)
chr3 (4-419)||(16381015-16381429)
chr3 (40-419)||(12850402-12850781)
chr3 (4-419)||(44776874-44777289)
chr3 (4-416)||(14086303-14086715)
chr3 (43-346)||(15015881-15016184)
chr3 (4-326)||(8274497-8274819)
chr3 (4-326)||(16742801-16743123)
chr3 (4-187)||(17492489-17492672)
chr3 (4-326)||(15576470-15576792)
chr3 (4-310)||(18748401-18748707)
chr3 (4-179)||(4678305-4678480)
chr3 (22-185)||(13001770-13001933)
chr3 (14-248)||(17192892-17193126)
chr3 (4-326)||(13975144-13975465)
chr3 (10-110)||(26009086-26009186)
chr3 (4-88)||(14573887-14573971)
chr3 (4-137)||(14183010-14183143)
chr3 (4-225)||(6712507-6712728)
chr3 (4-110)||(267356-267462)
chr3 (4-310)||(6152949-6153243)
chr3 (208-326)||(6153141-6153259)
chr3 (208-310)||(21686681-21686783)
chr3 (341-419)||(31945099-31945177)
chr3 (343-419)||(31689049-31689125)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (1-419)||(11358270-11358688)
chr2 (1-419)||(31830287-31830705)
chr2 (4-420)||(24675117-24675533)
chr2 (1-419)||(20832614-20833032)
chr2 (177-420)||(22757035-22757278)
chr2 (1-419)||(1063380-1063798)
chr2 (4-416)||(24707881-24708293)
chr2 (40-419)||(21325701-21326080)
chr2 (4-419)||(23276405-23276820)
chr2 (31-419)||(23063706-23064094)
chr2 (4-413)||(16924895-16925304)
chr2 (4-413)||(16998635-16999044)
chr2 (4-413)||(16981787-16982196)
chr2 (4-413)||(17063352-17063761)
chr2 (177-419)||(23188637-23188879)
chr2 (4-413)||(9609771-9610180)
chr2 (4-419)||(23293587-23294002)
chr2 (4-413)||(44385968-44386377)
chr2 (181-420)||(23138665-23138904)
chr2 (181-420)||(23550455-23550694)
chr2 (4-411)||(24709670-24710077)
chr2 (31-413)||(24262005-24262387)
chr2 (4-409)||(17067014-17067419)
chr2 (40-413)||(24878430-24878803)
chr2 (10-413)||(27217651-27218054)
chr2 (4-413)||(10868485-10868894)
chr2 (4-419)||(23087079-23087494)
chr2 (4-413)||(22325255-22325664)
chr2 (4-413)||(27370904-27371313)
chr2 (40-383)||(24825717-24826060)
chr2 (4-413)||(21145429-21145838)
chr2 (4-416)||(27365478-27365890)
chr2 (4-419)||(27787370-27787785)
chr2 (235-419)||(27377101-27377285)
chr2 (4-419)||(12573982-12574397)
chr2 (43-403)||(45529162-45529516)
chr2 (149-419)||(30211461-30211731)
chr2 (4-308)||(25128387-25128691)
chr2 (4-326)||(22276001-22276323)
chr2 (4-326)||(12640318-12640640)
chr2 (23-134)||(19652467-19652578)
chr2 (4-248)||(23817452-23817696)
chr2 (4-310)||(22761968-22762274)
chr2 (4-326)||(24831586-24831908)
chr2 (1-81)||(20828226-20828306)
chr2 (4-310)||(24570067-24570373)
chr2 (208-419)||(24653974-24654185)
chr2 (308-413)||(41609047-41609152)
chr2 (277-418)||(24944997-24945138)
chr2 (177-225)||(27368404-27368452)
chr2 (4-73)||(24948564-24948633)
chr2 (4-74)||(18362700-18362770)
chr2 (31-116)||(41608811-41608896)
chr2 (179-227)||(14708908-14708956)
chr2 (262-310)||(23817750-23817798)
chr2 (262-310)||(28144701-28144749)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-419)||(16572-16990)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (31-419)||(65434-65822)
scaffold0042 (277-420)||(39924-40067)
scaffold0042 (177-229)||(39854-39906)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (31-419)||(705-1093)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (4-416)||(9945-10357)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (13-413)||(38758-39158)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (40-420)||(14388-14768)
scaffold0044 (40-413)||(655-1028)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (4-419)||(13763-14178)
scaffold0034 (4-413)||(4815-5224)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (31-413)||(4294-4676)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (31-413)||(8631-9013)
scaffold0109 (31-419)||(33462-33850)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (149-419)||(278837-279107)
scaffold0005 (68-413)||(164635-164980)
scaffold0005 (149-413)||(308694-308958)
scaffold0005 (5-419)||(260337-260751)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (4-416)||(130-542)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (4-419)||(47153-47568)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (40-420)||(63929-64309)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (4-419)||(26290-26705)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (4-419)||(49069-49484)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (4-420)||(6042-6458)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (4-419)||(2780-3195)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (4-419)||(322733-323148)
scaffold0004 (4-419)||(117597-118012)
scaffold0004 (25-419)||(112050-112444)
scaffold0004 (4-419)||(385848-386263)
scaffold0004 (40-419)||(203366-203745)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (22-416)||(95882-96276)
scaffold0029 (31-413)||(109700-110082)
scaffold0029 (4-416)||(112591-113003)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (25-419)||(127082-127476)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (22-419)||(27548-27945)
scaffold0139 (37-419)||(1044-1425)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (4-420)||(180245-180661)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (4-415)||(20016-20427)
scaffold0298 (37-419)||(13256-13638)
scaffold0298 (37-419)||(17026-17408)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (4-419)||(556-970)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (4-419)||(6052-6467)
scaffold0120 (4-419)||(1386-1801)
scaffold0120 (67-326)||(22816-23075)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (4-419)||(42195-42610)
scaffold0010 (4-419)||(47261-47676)
scaffold0010 (268-346)||(2252-2330)
scaffold0010 (388-419)||(2212-2243)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (40-416)||(6215-6592)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (4-416)||(26174-26586)
scaffold0192 (4-113)||(26859-26968)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (4-419)||(1168-1583)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (4-419)||(3904-4319)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (4-415)||(19153-19564)
scaffold0058 (181-404)||(58445-58668)
scaffold0058 (179-310)||(74038-74169)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (177-411)||(14076-14310)
scaffold0106 (4-419)||(31439-31854)
scaffold0106 (31-230)||(17660-17858)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (177-419)||(219452-219694)
scaffold0012 (67-413)||(229078-229424)
scaffold0012 (8-326)||(32863-33179)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (4-419)||(21533-21948)
scaffold0235 (4-250)||(26004-26250)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (4-419)||(27255-27669)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (4-419)||(51725-52140)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (4-419)||(195565-195979)
scaffold0011 (4-419)||(148599-149014)
scaffold0011 (181-419)||(26572-26810)
scaffold0011 (4-326)||(121812-122134)
scaffold0011 (277-419)||(68575-68717)
scaffold0011 (4-225)||(180147-180368)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (4-413)||(6407-6816)
scaffold0403 (4-88)||(3151-3235)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (177-413)||(9378-9614)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (31-419)||(14968-15356)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (4-419)||(9827-10237)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (4-419)||(14113-14528)
scaffold0203 (304-419)||(9039-9154)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (4-415)||(261-672)
scaffold0124 (37-419)||(10917-11299)
scaffold0124 (4-326)||(7672-7994)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (5-419)||(90795-91209)
scaffold0001 (185-419)||(162142-162376)
scaffold0001 (4-419)||(448088-448503)
scaffold0001 (179-326)||(78666-78813)
scaffold0001 (34-83)||(114545-114594)
scaffold0001 (284-359)||(175352-175427)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (4-419)||(4779-5194)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (4-419)||(12839-13254)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (4-383)||(21932-22311)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (4-419)||(32614-33029)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (12-419)||(10610-11016)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (4-419)||(25727-26142)
scaffold0113 (181-419)||(16705-16943)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (1-416)||(61072-61487)
scaffold0067 (1-416)||(67460-67875)
scaffold0067 (1-416)||(52038-52453)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (25-419)||(17016-17410)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (181-419)||(5250-5488)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (4-413)||(449-858)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (10-413)||(6972-7377)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (4-413)||(43189-43598)
scaffold0028 (31-413)||(8520-8902)
scaffold0028 (4-416)||(50376-50788)
scaffold0028 (177-282)||(13832-13937)
scaffold0028 (4-326)||(106435-106757)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (151-419)||(832-1099)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (184-420)||(27995-28231)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (4-419)||(18399-18814)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (4-419)||(57679-58093)
scaffold0053 (4-419)||(48895-49310)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (4-419)||(37231-37646)
scaffold0026 (76-366)||(38107-38398)
scaffold0026 (175-366)||(27370-27561)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (31-413)||(7412-7794)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (31-383)||(7855-8207)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (40-419)||(3169-3548)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (4-419)||(14906-15321)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (4-419)||(116767-117182)
scaffold0037 (4-326)||(98137-98459)
scaffold0037 (229-326)||(23553-23650)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (37-419)||(20151-20533)
scaffold0114 (37-419)||(43534-43916)
scaffold0114 (37-419)||(44546-44928)
scaffold0114 (284-419)||(36084-36219)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (186-419)||(26-259)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (151-419)||(49522-49790)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (177-420)||(30-273)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (185-420)||(1033-1268)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (4-419)||(24933-25348)
scaffold0234 (182-343)||(16211-16372)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (4-419)||(42812-43227)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (67-417)||(16390-16740)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (37-419)||(248642-249024)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (4-293)||(1096-1385)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (40-419)||(937-1316)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (4-419)||(5776-6191)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (4-419)||(12643-13058)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (4-419)||(25581-25996)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (77-419)||(195-537)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (151-417)||(4063-4329)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (181-419)||(15522-15759)
scaffold0333 (181-271)||(15832-15922)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (4-419)||(7100-7513)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (4-419)||(6898-7313)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (4-326)||(1916-2238)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (4-230)||(3217-3443)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-419)||(39768-40185)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (4-348)||(5313-5657)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (4-419)||(28630-29046)
scaffold0064 (4-419)||(40621-41037)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (37-348)||(10869-11180)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (4-371)||(9047-9414)
scaffold0507 (177-326)||(368-517)
scaffold0507 (4-137)||(216-349)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (52-419)||(4912-5279)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (77-419)||(1104-1446)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (58-419)||(3920-4281)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (5-317)||(1-312)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (4-419)||(557-972)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (5-233)||(5315-5543)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (126-419)||(14115-14407)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (40-347)||(678-985)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (4-230)||(107-333)
scaffold1710 (178-326)||(946-1094)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (4-416)||(33539-33951)
scaffold0076 (4-326)||(40380-40702)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (4-419)||(5453-5867)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (181-411)||(16455-16685)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (151-323)||(7522-7694)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (4-407)||(86366-86769)
scaffold0007 (4-116)||(46560-46672)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (10-416)||(18881-19287)
scaffold0090 (10-365)||(23094-23449)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (168-416)||(223-471)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (263-419)||(16986-17142)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (4-326)||(46276-46598)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (37-179)||(6232-6374)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (284-419)||(4567-4702)
scaffold0023 (25-248)||(4337-4560)
scaffold0023 (178-230)||(58972-59024)
scaffold0023 (370-420)||(36974-37024)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (4-324)||(23518-23838)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (4-310)||(916-1222)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (4-326)||(13030-13352)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (4-310)||(14661-14967)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (4-326)||(248-570)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (4-326)||(14779-15100)
scaffold0132 (4-249)||(43737-43982)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (1-326)||(3281-3606)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (4-225)||(71442-71663)
scaffold0021 (168-302)||(13397-13531)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (4-326)||(3737-4059)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (240-419)||(1206-1385)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (4-343)||(28128-28467)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (4-310)||(3806-4112)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (4-250)||(1286-1532)
scaffold0117 (264-326)||(10431-10493)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (5-326)||(14600-14921)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (178-310)||(10493-10625)
scaffold0447 (178-310)||(5879-6011)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-326)||(24002-24327)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (238-419)||(4235-4416)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (178-310)||(8488-8620)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (177-233)||(3754-3810)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (4-310)||(8753-9059)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (4-310)||(9125-9431)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (4-250)||(26019-26265)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (148-326)||(8217-8395)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (289-419)||(136148-136278)
scaffold0019 (4-89)||(136269-136354)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (4-89)||(8-93)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (269-419)||(13380-13530)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (299-419)||(2023-2143)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (4-190)||(7426-7612)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (4-215)||(14370-14581)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (4-89)||(18410-18495)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (4-197)||(12738-12931)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (4-71)||(5160-5227)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (177-323)||(10781-10927)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 3264650 - 3265068
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3264650 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 3264749  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264750 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 3264849  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3264850 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgt 3264949  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  3264950 gctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 3265049  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  3265050 tttcgaacttgcacgatgt 3265068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 11207087 - 11207505
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11207087 cctttggttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 11207186  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11207187 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 11207286  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11207287 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgt 11207386  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  11207387 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatc 11207486  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  11207487 tttcgaacttgcacgatgt 11207505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 29453393 - 29453811
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29453393 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 29453492  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29453493 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggacgggatttggttcatgagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 29453592  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||     
T  29453593 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgg 29453692  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  29453693 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 29453792  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  29453793 tttcgaacttgcacgatgt 29453811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 419
Target Start/End: Original strand, 44661723 - 44662140
Alignment:
Q  2 ctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44661723 ctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctg 44661822  T
Q  102 gtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44661823 gtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagt 44661922  T
Q  202 cgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtg 301  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| |||||||| ||||    
T  44661923 cgacagaagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtgttggtcgtg 44662022  T
Q  302 ctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatct 401  Q
    |  ||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||    
T  44662023 cgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatct 44662122  T
Q  402 ttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  44662123 ttcgaacttgcacgatgt 44662140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 177 - 420
Target Start/End: Original strand, 15149778 - 15150021
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15149778 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 15149877  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||    
T  15149878 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgacgt 15149977  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15149978 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 15150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 15003223 - 15003638
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  15003223 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaagtggaggactcctttatgttggt 15003322  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15003323 ttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 15003422  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  15003423 acaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgca 15003522  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  15003523 ttgaagtctaagaagttgactcctaagtttattgatccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatcttt 15003622  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  15003623 cgaatttgcatgatgt 15003638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12524062 - 12523674
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  12524062 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggttttag 12523963  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12523962 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtag 12523863  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  12523862 gaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaag 12523763  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12523762 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgt 12523674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20891395 - 20890981
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20891395 ttgattgagttcacatataacaatagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 20891296  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  20891295 ttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccgaatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcg 20891196  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  20891195 acagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgca 20891096  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  | | ||| || ||| | |||||||    
T  20891095 ttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggttcgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatag-gatgggtttccaacacatcttt 20890997  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  20890996 cgaacttgcatgatgt 20890981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 419
Target Start/End: Original strand, 16252082 - 16252459
Alignment:
Q  42 tattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttg 141  Q
    |||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  |     
T  16252082 tattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagatt 16252181  T
Q  142 gttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 241  Q
     ||||  ||||||| ||||| || | ||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  16252182 cttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaataaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttg 16252281  T
Q  242 agtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252282 agtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 16252381  T
Q  342 gtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16252382 gtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacatctttcgaatttgcacgatgt 16252459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 16355044 - 16355459
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||| || |||||| | |||||||| || || || || ||||| ||||| || || | ||| || || ||||    
T  16355044 ttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtatttgaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatggagaattccgttgtgttggt 16355143  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16355144 ttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 16355243  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355244 acaaaataattatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 16355343  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16355344 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagacttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttt 16355443  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  16355444 cgaatttgcatgatgt 16355459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23956160 - 23955750
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  23956160 ttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 23956061  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23956060 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 23955961  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23955960 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 23955861  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  23955860 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 23955761  T
Q  404 cgaatttgcat 414  Q
    |||||||||||    
T  23955760 cgaatttgcat 23955750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18297618 - 18297209
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  18297618 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 18297519  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18297518 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 18297419  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18297418 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 18297319  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18297318 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 18297219  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  18297218 cgaatttgca 18297209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 18227072 - 18227460
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||| |||| ||||| || || || || |    
T  18227072 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttttagtcaggtgaaagagtggtcttag 18227171  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  |||||||  ||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18227172 gacccgagattgttcagaagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag 18227271  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18227272 gaagaatcttgagtttcaggaaggagagcacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgaga 18227371  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18227372 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgtatctttcgaatttgcacgatgt 18227460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 1649136 - 1649551
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  1649136 ttgatagagttcacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatgtcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgctggt 1649235  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1649236 ttgagtcatgagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacgaagaaagtcaagataatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 1649335  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||| | ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||    
T  1649336 acataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgct 1649435  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  1649436 ttgaagtcgaagaagttgacttccaagttcattggtccgtatcagatatcagagaggattggaactgtggcatatagagttgggttgccacctcatcttt 1649535  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  1649536 cgaatttgcatgatgt 1649551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 177 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7090672 - 7090431
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7090672 agagaagatgaaagcgtcgaagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 7090573  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  7090572 actcctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgct-cgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 7090474  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7090473 accgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 7090431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14680953 - 14680571
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  14680953 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 14680854  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14680853 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag 14680754  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14680753 gaaggatcttgagtttcaggaacgagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaataagttgaccccgaga 14680654  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680653 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 14680571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12477013 - 12476604
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  12477013 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 12476914  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||| ||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12476913 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaggaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 12476814  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12476813 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 12476714  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  12476713 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttg 12476614  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  12476613 cgaatttgca 12476604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 40 - 413
Target Start/End: Original strand, 14303613 - 14303985
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||      
T  14303613 agtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagaga 14303712  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303713 ttgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 14303812  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  14303813 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac-ccgaagttcattggt 14303911  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14303912 ccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 14303985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27711749 - 27711340
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  27711749 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagactttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 27711650  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27711649 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 27711550  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27711549 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgct 27711450  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  27711449 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 27711350  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  27711349 cgaatttgca 27711340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16146292 - 16145910
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |    
T  16146292 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagatttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggacagagtgttgtgttgggaccag 16146193  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |     
T  16146192 atttggttcatcagactacggagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggc 16146093  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     ||||||||||| || |  || || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||    
T  16146092 ccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatt 16145993  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16145992 ggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 16145910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8386825 - 8386416
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  8386825 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcgccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 8386726  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8386725 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 8386626  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8386625 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 8386526  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8386525 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 8386426  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  8386425 cgaatttgca 8386416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 68 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14652657 - 14652312
Alignment:
Q  68 tgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcag 167  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || |     
T  14652657 tgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaa 14652558  T
Q  168 gatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttt 267  Q
    ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14652557 gatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtattt 14652458  T
Q  268 ttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggat 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  14652457 ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaa 14652358  T
Q  368 cggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  14652357 cggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgca 14652312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 29039003 - 29039412
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  29039003 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 29039102  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29039103 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 29039202  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  29039203 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgct 29039302  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  29039303 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatcttt 29039402  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  29039403 cgaatttgca 29039412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 413
Target Start/End: Original strand, 14266522 - 14266907
Alignment:
Q  28 agctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgt 127  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || |    
T  14266522 agctatcattccagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtct 14266621  T
Q  128 tgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 227  Q
    | ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| ||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266622 taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctgagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 14266721  T
Q  228 tagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccg 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14266722 tagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcacccctatgactggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccg 14266821  T
Q  328 agatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |  || |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14266822 aagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 14266907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 19778392 - 19778801
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  19778392 ttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 19778491  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || |  || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19778492 ttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 19778591  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19778592 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 19778691  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  19778692 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatcttt 19778791  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  19778792 cgaatttgca 19778801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14159878 - 14159490
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||||| ||| || ||||    
T  14159878 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagaatgtggttttgg 14159779  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||||||  | |||||  ||||||| || || || | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14159778 gaccggagattgttcaacagactactgaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgataagcgtag 14159679  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  14159678 aaaagatcttgaatttcaaggaggagatcatgtgttcctgagagttactcccatgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgagg 14159579  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159578 tttattggtccatatcagatatcagaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 14159490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 15358949 - 15359311
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15358949 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcatgtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 15359048  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15359049 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 15359148  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || || |||  |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  15359149 acagaagagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttccgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 15359248  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgga 366  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  15359249 ttgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatcagagagggttgga 15359311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27900781 - 27900459
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27900781 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtcgggagaaagtg 27900682  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  27900681 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagctatcatga 27900582  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| ||||  |||| | |||||| |||||||| |||||||||    
T  27900581 caagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttg 27900482  T
Q  322 actccgagatttattggtccgta 344  Q
    ||||| |  || |||||||||||    
T  27900481 actccaaagttcattggtccgta 27900459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 8053222 - 8053631
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||    
T  8053222 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggt 8053321  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8053322 ttgaatcaggagagagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 8053421  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8053422 acaaaagagttatcacgataagcgtagaagagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 8053521  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||   |||||||||||| || |||| ||||| || || ||||| |||||||||     
T  8053522 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacgatggcttaccgtgtgggtttaccgccgcatcttg 8053621  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  8053622 cgaatttgca 8053631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 14850992 - 14851380
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| || || ||| | ||||| ||||||||||| || || |    
T  14850992 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggaagaaggtgcagaactccgttgtgttggctcgagtcaggtgagagtgtggttttag 14851091  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||  ||||| || | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851092 gaccagaaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 14851191  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||| | |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  14851192 gaaaaaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgaccggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttaactccgagg 14851291  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851292 tttattggtccgtatcagatataggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 14851380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15070826 - 15070411
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||| || || ||||    
T  15070826 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcagaactccattgtgttggt 15070727  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15070726 ttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 15070627  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||      
T  15070626 acagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgtg 15070527  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||| || ||| |||  || ||||||||| | ||||| ||| | || || || ||||| |||||||    
T  15070526 ttgaagtttatgaagttgactacgaagtttattggtccataccagatatttgagagagttggaacagtggcatacagggtgggtttgccaccacatcttt 15070427  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  15070426 cgaatttgcatgatgt 15070411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15246337 - 15245922
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| || ||    
T  15246337 ttgatagagttgacgtacaacaacagtcaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttattctagt 15246238  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15246237 ttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacgaagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 15246138  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || |   |||||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||     
T  15246137 acaaaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttacccctatgacgggtgtaggacgtgca 15246038  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| || |||| || |||||| | ||||| ||| ||||  | || ||||| |||||||    
T  15246037 ttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagataacagagagggttggaacagtggcatacagagtgcgtttgccaccacatcttt 15245938  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15245937 cgaatttgcattatgt 15245922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40473417 - 40473044
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||      
T  40473417 agtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggaga 40473318  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  | ||||| ||||||||    |||||   |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40473317 ttgttcagcaaactactgagaaagttcaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatct 40473218  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  40473217 tgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggt 40473118  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    | ||||||| |||  |||||||||||| || |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40473117 ctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 40473044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 51606040 - 51606455
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  51606040 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 51606139  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51606140 ttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 51606239  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| || || ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  51606240 acagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 51606339  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  51606340 ttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 51606439  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  51606440 cgaacttgcatgatgt 51606455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 317
Target Start/End: Original strand, 15414885 - 15415198
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  15414885 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggt 15414984  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | |||||  |||||||||| || ||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15414985 ttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaacagactacggaaaaggtcaaattgataagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 15415084  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||     
T  15415085 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgataggtgttggtcgtgcc 15415184  T
Q  304 ttgaagtcaaagaa 317  Q
    ||||| || |||||    
T  15415185 ttgaaatcgaagaa 15415198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 33223296 - 33222916
Alignment:
Q  39 gagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggat 138  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||     
T  33223296 gagtattggtatgacaccattcaaagcattgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagac 33223197  T
Q  139 ttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 238  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  33223196 ttggttcatgaaactactgagaaagtcaagttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaac 33223097  T
Q  239 ttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 338  Q
    |||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |  || |||||    
T  33223096 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgacaccaaagttcattgg 33222997  T
Q  339 tccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  33222996 tccgtatcagatttcaaagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccccatctttcgaacatgcatgatgt 33222916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 220 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15364583 - 15364390
Alignment:
Q  220 gataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15364583 gataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 15364484  T
Q  320 tgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15364483 tgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 15364390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15078048 - 15077825
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||| || || ||||    
T  15078048 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcagaactccattgtgttggt 15077949  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15077948 ttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 15077849  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcg 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  15077848 acagaagagttaccatgacaagcg 15077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14997729 - 14997407
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  14997729 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 14997630  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||  | ||||||| | |||| |||||| |  | || || || |||||||| || || | ||||||   ||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  14997629 ttgagtccagagagagtgctttgttaggaccgaaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtag 14997530  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | || |||||| || ||||| ||||||    
T  14997529 acagaagagtcatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcttgtgaccggagttggtcgtgct 14997430  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  14997429 ttgaagtgtaggaagttgactcc 14997407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9291248 - 9290926
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  9291248 ttgattgagtttacttacaacagcagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccattgtgttggt 9291149  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  9291148 ttgagtccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 9291050  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || || |||||||| || | ||||||||| | |||||| | |||    
T  9291049 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcaggtatttttgagggtgaatcctgtgaccgatgttggtcatgc 9290950  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  9290949 tttgaagtgtaggaagttgactcc 9290926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 282
Target Start/End: Original strand, 16676447 - 16676580
Alignment:
Q  149 agactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 248  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16676447 agactactgagaaagttaagatgatttaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 16676546  T
Q  249 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcct 282  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676547 gcaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcct 16676580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 419
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927273
Alignment:
Q  297 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccg 396  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||    
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  397 catctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  14927251 catctttcgaatttgcacgatgt 14927273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8706331 - 8706078
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||  | ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||    
T  8706331 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtatatgaatgacaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaacttcgttatgttggt 8706232  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||  || ||||| | | | || ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8706231 ttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactatagaaaaagttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagaatcg 8706132  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggaga 257  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  8706131 acacaagagttatcacgacaagcgtaggaaagaccttgaatttaaggaaggaga 8706078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 324
Target Start/End: Original strand, 55375217 - 55375537
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||| |  || || ||||    
T  55375217 ttgattgagtttacttacaacaacagtttacattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacactgttgtgttggt 55375316  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || ||||| |||| | |||| ||||| ||  | || || || |||||||| || || | |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||     
T  55375317 ttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccagaagttgtacaagaaactacggaaaaggttaagatgattcagt-agaagatgaaagcgtctcagagta 55375415  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | |||||| ||||||||||| || ||    
T  55375416 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcgagc 55375515  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    ||||||||  | ||||||||||    
T  55375516 tttgaagtgtatgaagttgact 55375537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 15293016 - 15293338
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  15293016 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 15293115  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || || ||||| || || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  15293116 ttgagtccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacagaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 15293214  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||  | || || ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | |||||||| ||| || || |||||    
T  15293215 gacagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgtgc 15293314  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  15293315 tttgaagtgtaggaagttgactcc 15293338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13248058 - 13247736
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||| | ||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||| || || || || ||||    
T  13248058 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattaggatggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttggt 13247959  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || |||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | ||||||   |||||||||||| ||||| |||||| |    
T  13247958 ttgaatccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtag 13247859  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  || || || || |||||||| || | || |||||  |||||||| | ||||    
T  13247858 acagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgatcggtgttggtcttgct 13247759  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  13247758 ttgaagtgtaggaagttgactcc 13247736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16752874 - 16752665
Alignment:
Q  136 gatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 235  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  16752874 gatttggttcatcaaacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaagg 16752775  T
Q  236 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 335  Q
      ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||  || ||    
T  16752774 cccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcat 16752675  T
Q  336 tggtccgtat 345  Q
    ||||||||||    
T  16752674 tggtccgtat 16752665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Original strand, 1640051 - 1640293
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||| || || || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || || || |    
T  1640051 tatcattctagtattggaatgtcaccttttgaggctttgtatggtcgaagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagggtggttttag 1640150  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  1640151 gacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcatag 1640250  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgaga 273  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  1640251 gaaagaccttgagttccaagaaggagatcatgtatttttgaga 1640293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 326
Target Start/End: Original strand, 16445245 - 16445393
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 277  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |||||||| || || |    
T  16445245 gagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtga 16445344  T
Q  278 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
     |||||||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16445345 atcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16445393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 419
Target Start/End: Original strand, 18164332 - 18164463
Alignment:
Q  288 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttgga 387  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| ||| |||| ||     
T  18164332 tggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggt 18164431  T
Q  388 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18164432 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgt 18164463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 42703082 - 42702901
Alignment:
Q  238 cttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 337  Q
    |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||    
T  42703082 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 42702983  T
Q  338 gtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  42702982 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgt 42702901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Original strand, 12132412 - 12132574
Alignment:
Q  148 gagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 247  Q
    ||||||||||| || || | ||||||   |||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||| |||||||||| | || || ||  |||||||||    
T  12132412 gagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcaaagtaggcagaagagttgtcatgataagaggaggaaggacattgagtttc 12132511  T
Q  248 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 310  Q
    |||  || || || ||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132512 aagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 12132574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16685666 - 16685361
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | |||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| ||||    
T  16685666 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggaaggaggtgtagaacgtcgttatgttggt 16685567  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggattt-ggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagt 201  Q
     |||||| ||  |||||| | |||| |||||  ||||  || || ||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  16685566 atgagtcaggatagagtgctttgttaggacc--atttatgtgcaagagactacgaagaaagttaagatgattcag-gagaagatgagagcgtctcagagt 16685470  T
Q  202 cgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtg 301  Q
     | || || | ||||||||||||| | |  || ||| || | |||||||  || || || | |||||||||||| | || ||| || ||||||||  |||    
T  16685469 aggcagaaaatttatcatgataagaggatgaaggatatttaatttcaagttggtgatcatgggtttttgagagtgaatcatgtaaccggtgttgggtgtg 16685370  T
Q  302 ctttgaagt 310  Q
    |||||||||    
T  16685369 ctttgaagt 16685361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 348
Target Start/End: Original strand, 9849511 - 9849681
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 277  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |  | ||||||| ||||||||| |  || || ||| |||| |||||||  ||||| ||  |||||||||||||      
T  9849511 gagaagatgaaagcatcgtagagtaggtagaagagttgtcatgataaacagaggaaggatattgaatttcaagtcggagatcaaatgtttttgagagttg 9849610  T
Q  278 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 348  Q
      |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  9849611 acctagtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtccaagaagttgacaccgtgttttattggtccttatcag 9849681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Original strand, 12342722 - 12342804
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtag 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||    
T  12342722 ttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtattgggatggcaccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtag 12342804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 317
Target Start/End: Original strand, 18550180 - 18550234
Alignment:
Q  263 tgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 317  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18550180 tgtttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtctaagaa 18550234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18864831 - 18864761
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatgg 74  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  18864831 ttgattgaatttgcctataacaacagttatcactctagtataggcatggccccgtacgaagctttgtatgg 18864761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25848405 - 25847987
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25848405 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 25848306  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25848305 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 25848206  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25848205 tcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttttgagagtcactcctttgacgggtgttggacgt 25848106  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  25848105 gctttgaaatcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatacagagttggtttgccacctcatc 25848006  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  25848005 tttcgaacttgcacgatgt 25847987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 14887029 - 14887447
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887029 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 14887128  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14887129 ggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 14887228  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14887229 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgt 14887328  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  14887329 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 14887428  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  14887429 tttcgaacttgcacgatgt 14887447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20342612 - 20342194
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20342612 cctttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 20342513  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20342512 agtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 20342413  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  20342412 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagcgtgatcatgtttttctgagagtcacccctttgacaggtgttggacgt 20342313  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  20342312 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatc 20342213  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  20342212 tttcgaacttgcacgatgt 20342194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 37545534 - 37545953
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37545534 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcactgttcgaagccttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgct 37545633  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37545634 ggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 37545733  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttt-tgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 299  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  37545734 tcgacagaacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacg 37545833  T
Q  300 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcat 399  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||    
T  37545834 tgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttctgagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 37545933  T
Q  400 ctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  37545934 ctttcgaacttgcacgatgt 37545953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 24798435 - 24798853
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24798435 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 24798534  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| ||||||||    
T  24798535 ggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggactggatttggttcacgagactactgagaaagtcagaatgataagggaaaagatgagagcttcgcagag 24798634  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || || || || || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  24798635 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgg 24798734  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  24798735 gctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatc 24798834  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  24798835 tttcgaacttgcacgatgt 24798853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 22503006 - 22502591
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22503006 ttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggcatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgctggt 22502907  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||| |||||||    
T  22502906 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgtagagtcg 22502807  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22502806 acagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgct 22502707  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  22502706 ttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 22502607  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| ||||| |||||    
T  22502606 cgaacttgcacgatgt 22502591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23574087 - 23573672
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  23574087 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 23573988  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23573987 ttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 23573888  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573887 acaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 23573788  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23573787 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttt 23573688  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  23573687 cgaatttgcacgatgt 23573672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 416
Target Start/End: Original strand, 28923827 - 28924221
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||    
T  28923827 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtg 28923926  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28923927 ttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatga 28924026  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||    
T  28924027 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttg 28924126  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||| |  || || ||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28924127 actccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatga 28924221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 181 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23516709 - 23516470
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516709 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 23516610  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  23516609 atgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtattagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcg 23516510  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23516509 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagatgtc 23516470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 416
Target Start/End: Original strand, 28895001 - 28895395
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||    
T  28895001 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtg 28895100  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28895101 ttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatga 28895200  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||    
T  28895201 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttg 28895300  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||| |  || || ||||| |||||| | ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28895301 actccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactctggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatga 28895395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 22381526 - 22381111
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381526 ttgattgagttcacatataacaacagctatcactcgagtataggtatggcactattcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 22381427  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  22381426 ttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaggtcaaaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcg 22381327  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||     
T  22381326 acagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgatgacgggtgtaggacgtgca 22381227  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  22381226 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacggtggcttatagagttggtttgccaccacatcttt 22381127  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  22381126 cgaacttgcatgatgt 22381111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 22332955 - 22333337
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  22332955 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 22333054  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333055 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagtccggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 22333154  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  22333155 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 22333254  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22333255 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 22333337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22462279 - 22461867
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22462279 ttgatagaatttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 22462180  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22462179 tcgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggaattggttcatgaaactacagagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 22462080  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  22462079 acaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgca 22461980  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || ||| | ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  22461979 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatcttt 22461880  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  22461879 cgaatttgcatga 22461867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20799105 - 20798690
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  20799105 ttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 20799006  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || |  || || |||||  |  | |||||  ||||||| ||||| || | ||||||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  20799005 ttgagtcaggagaaagagaggtcttaggaccaaagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcg 20798906  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20798905 acaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgct 20798806  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  20798805 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcaaatatcagaaagagttggaccggtggcatatcgattgggattaccaccgcatcttt 20798706  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  20798705 cgaatttgcatgatgt 20798690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 40 - 419
Target Start/End: Original strand, 21984382 - 21984761
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||      
T  21984382 agtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagaga 21984481  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21984482 ttgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgtaggaaagatct 21984581  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984582 tgagtttcaagagggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 21984681  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21984682 ccgtatcagatatcggaaagagctggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaacttgcacgatgt 21984761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 177 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23440397 - 23440161
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440397 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 23440298  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  23440297 actcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaatgaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 23440198  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440197 atcgagagggattaccaccgcatctttcgaatttgca 23440161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40709125 - 40708716
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  40709125 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 40709026  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40709025 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 40708926  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40708925 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccgcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 40708826  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  40708825 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 40708726  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  40708725 cgaatttgca 40708716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18776095 - 18775707
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||| | |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  18776095 tatcattctagtattcgaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 18775996  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18775995 gacccgagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagagaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag 18775896  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18775895 gaaggatcttgagtttcaggagggagaccacgtctttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttgactccgaga 18775796  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18775795 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgatgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 18775707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25423507 - 25423119
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  25423507 tatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 25423408  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    ||||  |  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25423407 gaccaaagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtag 25423308  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25423307 gaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttgactccgaga 25423208  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25423207 tttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcaggtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 25423119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 23080130 - 23080545
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23080130 ttgatagagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggactcctctatgctggt 23080229  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| |||    
T  23080230 ttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggtgcatgagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagattcg 23080329  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||  ||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||  |||||||     
T  23080330 acagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaagacgtgca 23080429  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  23080430 ttgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttaccaccacatcttt 23080529  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  23080530 cgaacttgcatgatgt 23080545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 14999807 - 15000189
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  14999807 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgagactttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 14999906  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14999907 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtag 15000006  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  15000007 aaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 15000106  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15000107 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 15000189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20821762 - 20821368
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  20821762 aacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcggaagtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtg 20821663  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20821662 ttgtgttggggccggatttggttcatgagactacagagaaagttaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatga 20821563  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  20821562 caagcgtaagaaagaccttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 20821463  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||| |  || |||||||| |||||| | |||||||| |||||| | ||||||||  || |||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20821462 actccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagggttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatga 20821368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16356847 - 16356438
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16356847 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16356748  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16356747 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 16356648  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  16356647 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgct 16356548  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  16356547 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatcttt 16356448  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  16356447 cgaatttgca 16356438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19770305 - 19769896
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  19770305 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 19770206  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19770205 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 19770106  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19770105 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 19770006  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  19770005 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 19769906  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  19769905 cgaatttgca 19769896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 417
Target Start/End: Original strand, 21890800 - 21891213
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||| ||||| ||||    
T  21890800 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtacaagactccattatgttggt 21890899  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21890900 ttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaacagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 21890999  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    | | |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||| ||||     
T  21891000 atagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttacacctatgactggtgtaggatgtgcg 21891099  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  21891100 ttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 21891199  T
Q  404 cgaatttgcatgat 417  Q
    ||||||||||||||    
T  21891200 cgaatttgcatgat 21891213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Original strand, 22235979 - 22236376
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  22235979 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttattctggtttgagtcaggagagagtg 22236078  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22236079 ttgtgttgggaccggagttggttcatcagactacagagaaagtcaagatggtcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatga 22236178  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  22236179 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 22236278  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||| | ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22236279 actccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtgtcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 22236376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27610699 - 27610290
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  27610699 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 27610600  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27610599 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgccgcagagtcg 27610500  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27610499 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 27610400  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||     
T  27610399 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcaacttg 27610300  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  27610299 cgaatttgca 27610290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34566839 - 34566430
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  34566839 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 34566740  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34566739 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 34566640  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  34566639 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgct 34566540  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  34566539 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatcttt 34566440  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  34566439 cgaatttgca 34566430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20774069 - 20773675
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || | ||    
T  20774069 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaagactcctttatgttggttcgagtcgggagaaaatg 20773970  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20773969 ttgttttgggaccggaattggttcatgagactacagagaaagtcaagatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatga 20773870  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||| | ||||| ||| ||||||| ||||| | ||| || ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||    
T  20773869 caagcgtcggaaagagcttcagtttcaggaagggggccatgtttttctgagggttactcctatgacgggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttg 20773770  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||| |  || || ||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20773769 actccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatga 20773675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 27685468 - 27685850
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  27685468 tatcattcaagtattggaatgacacctttcgaggccttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 27685567  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685568 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 27685667  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  27685668 gaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 27685767  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27685768 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 27685850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 37291564 - 37291946
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  37291564 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 37291663  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| ||||||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37291664 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagtgtag 37291763  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||      
T  37291764 gaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccgaag 37291863  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37291864 tttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 37291946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 27668531 - 27668940
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  27668531 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 27668630  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27668631 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 27668730  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27668731 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 27668830  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27668831 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 27668930  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  27668931 cgaatttgca 27668940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27518752 - 27518343
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| || || ||||    
T  27518752 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggt 27518653  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27518652 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 27518553  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27518552 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 27518453  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  27518452 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 27518353  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  27518352 cgaatttgca 27518343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22134986 - 22134604
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || || || |    
T  22134986 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctagtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 22134887  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| ||||||||   ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22134886 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcag 22134787  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  22134786 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaag 22134687  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22134686 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22134604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 151 - 419
Target Start/End: Original strand, 26738893 - 26739161
Alignment:
Q  151 actacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    ||||| |||||||| | ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26738893 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaag 26738992  T
Q  251 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 350  Q
    || |||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26738993 aaagagatcatatatttttgagggtcactcctgtgactggtgttggatgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagat 26739092  T
Q  351 atcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26739093 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcaagatgt 26739161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 29476141 - 29476523
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  29476141 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 29476240  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| || |||||  ||||||||  |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476241 gaccagagattgttcaacagactactgaaaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 29476340  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||      
T  29476341 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacgaag 29476440  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29476441 ttcattggtccatatcaggtattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 29476523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41771175 - 41770778
Alignment:
Q  16 acttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtg 115  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || |||||||| || || |    
T  41771175 acttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggag 41771076  T
Q  116 agagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagtta 215  Q
    | || |  || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41771075 aaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagagtcgacaaaagagtta 41770976  T
Q  216 tcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41770975 tcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaag 41770876  T
Q  316 aagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41770875 aagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 41770778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 419
Target Start/End: Original strand, 23442415 - 23442749
Alignment:
Q  85 aggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaaga 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  23442415 aggactcctttatgttggtttgagacgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaaga 23442514  T
Q  185 tgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  23442515 tgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctat 23442614  T
Q  285 gactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagtt 384  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||| |||  |||     
T  23442615 gacgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttgactccaaagttcattggtccgtatcagttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtg 23442714  T
Q  385 ggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |  || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23442715 gttttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgt 23442749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 24749595 - 24750007
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24749595 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 24749694  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  ||||||| || || || | | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24749695 ttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcg 24749794  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  24749795 acagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgca 24749894  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  24749895 ttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatcttt 24749994  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  24749995 cgaatttgcatga 24750007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 17269374 - 17269789
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  17269374 ttgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 17269473  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17269474 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 17269573  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  17269574 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgct 17269673  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||  | ||  ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  17269674 ttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 17269773  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  17269774 cgaacttgcatgatgt 17269789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 20468137 - 20468552
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||  || |||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  20468137 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgcatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggt 20468236  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||||||  |  | |||||  | ||||| ||||| || | | |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20468237 tcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaatgttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttg 20468336  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20468337 actgaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgca 20468436  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| | | | | ||||||||  |||| || |||||||| |||||||    
T  20468437 ttgaagtcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtgtcagatattagaaagaatagaaacagtggcgtattgagtgggtttaccaccacatcttt 20468536  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  20468537 cgaatttgcatgatgt 20468552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 406
Target Start/End: Original strand, 21498104 - 21498479
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  21498104 tatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttag 21498203  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21498204 gacccgagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtag 21498303  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     | |||  | ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21498304 gatagacatcgagtttcaagagggagatcatgtagttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgaga 21498403  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcga 406  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21498404 tttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggtgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcga 21498479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22348741 - 22348361
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  22348741 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtagtcttag 22348642  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||   |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22348641 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcacgataagcgtag 22348542  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    ||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  22348541 aaaa--tcttgagtttcgggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaag 22348444  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22348443 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22348361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23471553 - 23471159
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  23471553 aacagctatcattctagtattggaatggcaccttttgatgctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtag 23471454  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    | ||||| ||  |  | |||||  | ||||  ||||| || | ||||||   | | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23471453 ttttggggccataaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaagcgtctcagagtcggcaaaagagtaatcatgataa 23471354  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23471353 gcgtaggcaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcaagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgact 23471254  T
Q  325 ccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23471253 tggaggtttattggtccgtatcaggtatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcacgatgt 23471159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 416
Target Start/End: Original strand, 24735670 - 24736064
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  24735670 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcggaagaaagtg 24735769  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |  |||||||||| ||  | |||||  ||||||| || || || | | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24735770 tgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatga 24735869  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||    
T  24735870 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 24735969  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24735970 actccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatga 24736064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 21564014 - 21564422
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  21564014 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggt 21564113  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||        ||||| ||||||||||  ||| | |||||| ||||||| || || ||||   |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  21564114 ttgagta-------agtgtagtgttgggactagatatagttcatcagactacagaaaaggtcaaattgataagagagaagacgaaagtgtcgcaaagtcg 21564206  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||    
T  21564207 gcagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactcatgtgacacgtgttagtcgtgct 21564306  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||| |||| || |||||| |  | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  21564307 ttgaagtctaagaatttgactccacggtttattggtccatatcagatatctgatagagtttggacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatcttt 21564406  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  21564407 cgaatttgcatgatgt 21564422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 271 - 419
Target Start/End: Original strand, 21343666 - 21343814
Alignment:
Q  271 agagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  21343666 agagtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacgg 21343765  T
Q  371 tggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21343766 tggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 21343814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 11210735 - 11211057
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | ||| || |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||  | || || ||||    
T  11210735 ttgattgagtttacttacaacaatagttttcattctagtattggaatgacaccgtttgaggccttgtatggtaggaggtgtaggacatcgttgtgttggt 11210834  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||  | || || ||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||     
T  11210835 ttgagtccggagagagtgttttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcag-gagaagatgaaagcatctcagagta 11210933  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  11210934 gacagaagagttatcatgataagaggaggaaagatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgc 11211033  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  11211034 tttgaagtgtaggaagttgactcc 11211057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20573626 - 20573451
Alignment:
Q  244 tttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 343  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  20573626 tttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgt 20573527  T
Q  344 atcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20573526 atcagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 20573451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Original strand, 21339348 - 21339596
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  21339348 aacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtgg 21339447  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    | || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339448 ttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 21339547  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgaga 273  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21339548 gcgtaggaaagaccttgagtttcaagaacgagaccaagtatttttgaga 21339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 416
Target Start/End: Original strand, 24737011 - 24737238
Alignment:
Q  189 agcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgact 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  24737011 agcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacg 24737110  T
Q  289 ggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggat 388  Q
    ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  |||| || |    
T  24737111 ggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtt 24737210  T
Q  389 taccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24737211 tgccacctcatctttcgaatttgcatga 24737238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 21937229 - 21937551
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  21937229 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 21937328  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || || || |||| | |||| || |||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  21937329 ttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 21937427  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  21937428 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 21937527  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  21937528 tttgaagtgtaggaagttgactcc 21937551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24581538 - 24581216
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  24581538 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 24581439  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || || || ||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  24581438 ttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaaccacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 24581340  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || ||||||||| | || || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  24581339 gacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttgtaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 24581240  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  24581239 tttgaagtgtaggaagttgactcc 24581216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23503770 - 23503464
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  | ||| || ||| | |||||||| |||||  | || |||||||| ||||||| |||||| || || || ||||    
T  23503770 ttgattgagtttactaacaacaacaattttcattctagtgtcggtatggctccgtttaaggctttgtatggtcggaggtctaggacaccgttgtgttggt 23503671  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||  |||| || ||||||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  23503670 ttgagtctggtgaaagtgctttgttaggaccggaagtggtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaagcgtctcagagta 23503572  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||   || || || |||||||| || || | || |||||| |||||||| ||| |    
T  23503571 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaaattggtgatcatgtgttttttagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtcc 23503472  T
Q  303 tttgaagt 310  Q
    ||||||||    
T  23503471 tttgaagt 23503464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27011411 - 27011089
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||| |||| || || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  27011411 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 27011312  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||  || ||||||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  27011311 ttgagttcggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 27011213  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||    
T  27011212 gacataagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgc 27011113  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  27011112 tttgaagtgtaggaagttgactcc 27011089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 419
Target Start/End: Original strand, 21662300 - 21662495
Alignment:
Q  223 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 322  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21662300 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21662399  T
Q  323 ctccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || |||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| |  || ||||  |||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21662400 cttcgaggtttattggt-tgtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgt 21662495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 419
Target Start/End: Original strand, 21665761 - 21665956
Alignment:
Q  223 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 322  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21665761 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21665860  T
Q  323 ctccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || |||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| |  || ||||  |||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21665861 cttcgaggtttattggt-tgtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgt 21665956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Original strand, 21831820 - 21831998
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    ||||| || ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  21831820 agtataggaatgacaccatttgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgagggtgtagtgttgggaccggata 21831919  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 218  Q
    | |||||  |||||||  | || || | | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21831920 ttgttcaccagactacataaaaggttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatca 21831998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21405167 - 21404766
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagcct--tgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctg 101  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||| | || || ||    
T  21405167 ttgatcgagttcacttataataacagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagcgtgttgtatggtcggagatgcagaacttcgttgtgttg 21405068  T
Q  102 gtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagt 201  Q
    || |||||| ||||||| |||  |  ||||||| ||  | |||||  ||||||| ||||| || | | |||| ||||| || ||||| | ||| ||||||    
T  21405067 gtatgagtccggtgagattgtgatactgggaccagacattgttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaatatgaaggtgtcacagagt 21404968  T
Q  202 cgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtg 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||                 ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21404967 agacaaaagagttatcatgataagcgtaggaac----------------aaggagatcatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtg 21404884  T
Q  302 ctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatct 401  Q
    |  | || ||||||||  |||||||| | ||||||||  |||||||| | || |||||||||||  | || |||||  |||| || |||||||| |||||    
T  21404883 cgctaaaatcaaagaaactgactccgtggtttattggctcgtatcagatttcggaaagagttgggacagttgcgtatagagtgggtttaccaccacatct 21404784  T
Q  402 ttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||| || ||||||||    
T  21404783 ttcgaacttacatgatgt 21404766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 1069 - 1148
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtg 83  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1069 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 95
Target Start/End: Original strand, 21229232 - 21229305
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactccttt 95  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  21229232 aacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattgtatggtcgcagatgcaggactccttt 21229305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Original strand, 25244598 - 25244695
Alignment:
Q  209 agagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttg 306  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | || |||    ||||||||||||||||||    
T  25244598 agagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggagatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25244695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Original strand, 25308750 - 25308847
Alignment:
Q  209 agagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttg 306  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | || |||    ||||||||||||||||||    
T  25308750 agagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggagatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25308847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 6679593 - 6679175
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6679593 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 6679494  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6679493 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 6679394  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||    
T  6679393 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgt 6679294  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  6679293 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 6679194  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  6679193 tttcgaacttgcacgatgt 6679175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 803972 - 804390
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  803972 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 804071  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  804072 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcacgagactactaagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagag 804171  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  804172 tcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgt 804271  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  804272 gctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 804371  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  804372 tttcgaacttgcacgatgt 804390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14565624 - 14565212
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14565624 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 14565525  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  14565524 ggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttggttcacgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagag 14565425  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14565424 tcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgt 14565325  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  14565324 gctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 14565225  T
Q  401 tttcgaatttgca 413  Q
    ||||||| |||||    
T  14565224 tttcgaacttgca 14565212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 6604140 - 6603722
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  6604140 cctttgattgagtttacgtataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttgtgtt 6604041  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6604040 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 6603941  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||     
T  6603940 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgg 6603841  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||  | ||||| ||| ||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  6603840 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcaaatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 6603741  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  6603740 tttcgaacttgcacgatgt 6603722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 177 - 420
Target Start/End: Original strand, 21167012 - 21167255
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167012 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 21167111  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||    
T  21167112 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgt 21167211  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167212 atcgagttgggttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 21167255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19978419 - 19978031
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| || || || || ||||| || || ||||||||||| || || || || || || |    
T  19978419 tatcattctagtattggaatggcacctttggaggctttatatggtcgaagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttag 19978320  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978319 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 19978220  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978219 aaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 19978120  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19978119 tttattggtccgtatcagatatcggaaatagttggaacggtggcgtaacgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgt 19978031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 29303728 - 29304143
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29303728 ttgatagagttcacttataacaacaactatcattcgagtataggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 29303827  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  29303828 ttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcagaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcg 29303927  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||     
T  29303928 acaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccaatgacgggtgtaggacgtgca 29304027  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||| |||||||||||| |   | || |||||||||||| | ||||| ||| ||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  29304028 ttgaagtcaaggaagttgactccaaagatcataggtccgtatcagatttcagagagaattggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatcttt 29304127  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  29304128 cgaacttgcatgatgt 29304143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15533832 - 15533444
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  15533832 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 15533733  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| |  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15533732 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtag 15533633  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15533632 gaaagatcttgagtttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgaga 15533533  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15533532 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 15533444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12305237 - 12304822
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12305237 ttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagcattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggacccctttatgctggt 12305138  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  12305137 ttgagtcgggtgagagtgctgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcg 12305038  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  12305037 acagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcc 12304938  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |  ||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| || |||| | | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  12304937 ttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttgaaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 12304838  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| ||||| |||||    
T  12304837 cgaacttgcacgatgt 12304822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 30313473 - 30313861
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| | |||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  30313473 tatcattctagtattggaacggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtggtggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 30313572  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    | |  ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30313573 ggctcgagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag 30313672  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313673 gaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 30313772  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30313773 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgt 30313861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 182 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21251243 - 21251006
Alignment:
Q  182 agatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcc 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251243 agatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcc 21251144  T
Q  282 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccga 381  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  21251143 tgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcga 21251044  T
Q  382 gttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21251043 gtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 21251006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 16408347 - 16408762
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| |  || ||||| || || ||||    
T  16408347 ttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatacagaactccgttgtgttggt 16408446  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || || || || ||||||||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16408447 ttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcg 16408546  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16408547 acaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagttccaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgct 16408646  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16408647 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttt 16408746  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  16408747 cgaatttgcacgatgt 16408762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 22061735 - 22062150
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22061735 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 22061834  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22061835 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagaaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 22061934  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || |||||| |||| || |||||| |||| ||||| |||| |||     
T  22061935 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgca 22062034  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  22062035 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaaatatcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 22062134  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  22062135 cgaacttgcatgatgt 22062150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23650493 - 23650105
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  23650493 tatcattctagtattggaatggcgccttatgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 23650394  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23650393 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagataaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtag 23650294  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23650293 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgaga 23650194  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23650193 tttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcttatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 23650105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23655406 - 23654991
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  23655406 ttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgctggt 23655307  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23655306 ttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 23655207  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    | | |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  23655206 atagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagacggagatcatttgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 23655107  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || ||| || | ||||  ||   | | || || ||||| |||||||    
T  23655106 ttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggtttgaacagtggtatatatattgggtttgccaccacatcttt 23655007  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  23655006 cgaatttgcatgatgt 23654991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 177 - 419
Target Start/End: Original strand, 21394340 - 21394582
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394340 agagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 21394439  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||    
T  21394440 actcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgt 21394539  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21394540 accgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgt 21394582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 177 - 419
Target Start/End: Original strand, 21788833 - 21789075
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788833 agagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 21788932  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||    
T  21788933 actcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgt 21789032  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21789033 accgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgt 21789075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32600596 - 32600214
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || || || |    
T  32600596 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttcggtcaggtgaaagagtggtcttag 32600497  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| ||||| || | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  32600496 gaccagagattgttcagtagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcag 32600397  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32600396 gaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaga 32600297  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32600296 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgca 32600214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 17674325 - 17674734
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  17674325 ttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 17674424  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || |  || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17674425 ttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 17674524  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17674525 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 17674624  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  17674625 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 17674724  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  17674725 cgaatttgca 17674734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19113169 - 19112760
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  19113169 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 19113070  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  |  ||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19113069 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattattcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 19112970  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19112969 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 19112870  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19112869 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 19112770  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  19112769 cgaatttgca 19112760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 181 - 413
Target Start/End: Original strand, 21922214 - 21922446
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21922214 aagatgaaagtgtcgcagagtccacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 21922313  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21922314 atgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccgagatatattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 21922413  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  21922414 agtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgca 21922446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 22046825 - 22046437
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| | ||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||  | |    
T  22046825 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgctggtttgaatcaggtgaaagagtggtcctag 22046726  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22046725 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgataaacgcag 22046626  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22046625 gaaggatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccagtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagg 22046526  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22046525 tttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 22046437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 22133370 - 22133758
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||| | || || ||||| || ||| ||||||||||  |||| || || || || |    
T  22133370 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggtgatgcagaactccgttgtgcgggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttag 22133469  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22133470 gacccgagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtag 22133569  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22133570 gaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgagagacactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgaga 22133669  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22133670 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtcggaataccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 22133758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 20018052 - 20018461
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  20018052 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 20018151  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20018152 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 20018251  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20018252 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgaatttgaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 20018351  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  20018352 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 20018451  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  20018452 cgaatttgca 20018461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 151 - 419
Target Start/End: Original strand, 22164640 - 22164908
Alignment:
Q  151 actacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    ||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22164640 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcagg 22164739  T
Q  251 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 350  Q
    ||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22164740 aaggagacattgtgtttttgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 22164839  T
Q  351 atcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22164840 atcggaaagagttggaacggtggcgcatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 22164908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1266717 - 1266303
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  1266717 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcaggactcctttgtgctagt 1266618  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  1266617 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtaag-atgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 1266519  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| ||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||     
T  1266518 acaaaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgca 1266419  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  1266418 ttgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 1266319  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  1266318 cgaatttgcatgatgt 1266303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 20010202 - 20010617
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  20010202 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaaactttgtatggtcggaggtgtaggactcctttgtgttggt 20010301  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20010302 ttgagtcgggagaaagtgtgttgttgggaccagatttagttcatcagactatagagaaggtccagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 20010401  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||  || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||  |||| ||||| || |||||     
T  20010402 acagaagagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgatgacgggtgtgggtcgtgcg 20010501  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| || || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  20010502 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 20010601  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  20010602 cgaatttgcatgatgt 20010617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 418
Target Start/End: Original strand, 20396454 - 20396841
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||    
T  20396454 tatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggcgagagtgtagttttgg 20396553  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||  ||| | |||||  | ||||| ||||| || | | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20396554 gactagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttgatgcgagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtag 20396653  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||  |||    
T  20396654 aaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgactctaaga 20396753  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatg 418  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |   |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20396754 tttattggtctgtatcagatatcagaaagaattgaaatagtggcgtatcgagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatg 20396841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 19485172 - 19485581
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  19485172 ttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 19485271  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | || || ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19485272 ttgaatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 19485371  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19485372 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 19485471  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||  |||  || |||||||| |||||| | |  |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19485472 ttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 19485571  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  19485572 cgaatttgca 19485581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 172 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 22032343 - 22032096
Alignment:
Q  172 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttga 271  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  22032343 atcaaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttga 22032244  T
Q  272 gagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| | || |    
T  22032243 gagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttgaaacgtt 22032144  T
Q  372 ggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22032143 ggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttacacgatgt 22032096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19851890 - 19851475
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  19851890 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattgtgttggt 19851791  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19851790 ttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcg 19851691  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||  |||| | ||| || |||||     
T  19851690 acagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacggttgtaggtcgtgcg 19851591  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| || || |||||| | ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||    
T  19851590 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatcttt 19851491  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  19851490 cgaatttgcatgatgt 19851475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19857926 - 19857511
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  19857926 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattgtgttggt 19857827  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19857826 ttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcg 19857727  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||  |||| | ||| || |||||     
T  19857726 acagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacggttgtaggtcgtgcg 19857627  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| || || |||||| | ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||    
T  19857626 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatcttt 19857527  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  19857526 cgaatttgcatgatgt 19857511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 419
Target Start/End: Original strand, 21681856 - 21682187
Alignment:
Q  88 actcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatga 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  21681856 actcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatga 21681955  T
Q  188 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgac 287  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  21681956 aagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgac 21682055  T
Q  288 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttgga 387  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  |||| ||     
T  21682056 gggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggt 21682155  T
Q  388 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21682156 ttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgt 21682187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 31416776 - 31417191
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  31416776 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcatgactcctttatgctggt 31416875  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  31416876 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttagtgcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaaggtgaaagcgtcgcagagtcg 31416975  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||||| || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||     
T  31416976 acagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcttatgacgggtgtaggacgtgca 31417075  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||| || | |||||||| |||||| | ||||| ||  ||||||  || ||||| |||||||    
T  31417076 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtattagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttgctttgccaccacatcttt 31417175  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  31417176 cgaacttgcatgatgt 31417191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 411
Target Start/End: Original strand, 22120503 - 22120883
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||  ||||| || || || || |    
T  22120503 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtgaggtgaaagagtggtcttag 22120602  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    || | ||  | |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120603 gatcagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 22120702  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||      
T  22120703 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcgaag 22120802  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttg 411  Q
    || |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  22120803 ttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttg 22120883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16271523 - 16271737
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16271523 cctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 16271622  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  16271623 ggtttgcgtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagag 16271722  T
Q  201 tcgacaaaagagtta 215  Q
    |||||| | ||||||    
T  16271723 tcgacagaggagtta 16271737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840481
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  21840878 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtg 21840779  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21840778 tggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatga 21840679  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||| | || ||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  21840678 caagcgaaggaaggcacttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctaagagttactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttg 21840579  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||| ||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21840578 actccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgt 21840481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 31571144 - 31571559
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  31571144 ttgatagagttcacctacaacaatagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 31571243  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31571244 tcgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 31571343  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| ||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  31571344 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 31571443  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  31571444 ttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattggcccgtatcagatttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 31571543  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  31571544 cgaacttgcatgatgt 31571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20388560 - 20388163
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| | | ||    
T  20388560 aacaacagttaccattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatggttggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcgggttaaaatg 20388461  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    | ||||||||||  ||| | |||||| |||||||  | || ||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20388460 tagtgttgggacgagatatagttcatcagactacaaaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttatcatga 20388361  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20388360 caagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactctagtgacaggtgttggtcgtgctttgaagtctaagaagttg 20388261  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || ||  | ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||  | ||| | ||  |||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20388260 accccacggtttattggtccatattagatatctgagagagttgggacagtgacatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatgtgcatgatgt 20388163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 177 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22987507 - 22987271
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  22987507 agagaagatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgattttcaagaaggagatcatgtattttttagagtc 22987408  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  22987407 actccagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttgactctgaagtttattggtccgtatcagatatcataaagaattggaacggtggcgt 22987308  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22987307 atcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22987271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22051324 - 22051018
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  22051324 aacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtg 22051225  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  22051224 ttgtgttgggaccagatttggttcaacagacgacagagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatga 22051125  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
    |||||| || || |  |||||||||||||| || || || || ||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  22051124 taagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttttgaaagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttg 22051025  T
Q  322 actccga 328  Q
    |||||||    
T  22051024 actccga 22051018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20008263 - 20007914
Alignment:
Q  70 tatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcagga 169  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | ||    
T  20008263 tatggtcggaggtgcatgactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtaaaga 20008164  T
Q  170 tgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 269  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||||| || |||||| |    
T  20008163 tgataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttccaagagggagatcatgtgtttct 20008064  T
Q  270 gagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcg 369  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| |  || |||||||| |||||| |||| || || |||||| |     
T  20008063 gagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtgactccaaagttcattggtccatatcagatatctgagagggttggaaca 20007964  T
Q  370 gtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||| ||  |||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20007963 gtggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgcatgatgt 20007914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 419
Target Start/End: Original strand, 21324803 - 21325127
Alignment:
Q  96 atgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcg 195  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  21324803 atgctggtttgagtcaggagatagtgtggtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcg 21324902  T
Q  196 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |    
T  21324903 cagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtag 21325002  T
Q  296 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccacc 395  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| | || |||||| | ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  21325003 gacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccacc 21325102  T
Q  396 gcatc-tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
     |||| ||||||| |||||||||||    
T  21325103 acatcatttcgaacttgcatgatgt 21325127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 22377774 - 22378089
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||||||  | ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  22377774 aacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggc-ttgtatggaagaaggtgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggtgagagtg 22377872  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    | || || ||||| ||  | ||| |  | ||||||||||| || | ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377873 tggttttaggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 22377972  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22377973 taagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttg 22378072  T
Q  322 actccgagatttattgg 338  Q
    |||||||||||||||||    
T  22378073 actccgagatttattgg 22378089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 22383949 - 22384264
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||||||  | ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  22383949 aacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggc-ttgtatggaagaaggtgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggtgagagtg 22384047  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    | || || ||||| ||  | ||| |  | ||||||||||| || | ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384048 tggttttaggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 22384147  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22384148 taagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttg 22384247  T
Q  322 actccgagatttattgg 338  Q
    |||||||||||||||||    
T  22384248 actccgagatttattgg 22384264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 210 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23949162 - 23948953
Alignment:
Q  210 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaag 309  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  23949162 gagttattatgataagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaa 23949063  T
Q  310 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatt 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23949062 tcaaagaagttgactccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatt 23948963  T
Q  410 tgcatgatgt 419  Q
    | || |||||    
T  23948962 ttcacgatgt 23948953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 244 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15441420 - 15441245
Alignment:
Q  244 tttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441420 tttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 15441321  T
Q  344 atcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15441320 atcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgcacgatgt 15441245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 20652632 - 20652957
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||| || || || |    
T  20652632 cctttgattgagtttacttacaacaatagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccgttgtgtt 20652731  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||| |||| || || ||||   |||| ||||||||  |||| || |||||||||||||| || | |||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  20652732 ggtttaagtccggagaaagtgccttgttaggaccggaggtggtgcaagagactacggagaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagag 20652831  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    | |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||||||||  || || || || ||||||||||| | || |||||| |||||||| |||    
T  20652832 tggacagaagagttatcattataagaggagaaaggatatagagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgt 20652931  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||    
T  20652932 gctttgaagtgtaggaagttgactcc 20652957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 21196804 - 21197126
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  21196804 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 21196903  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||| | | ||||| | ||||||   |||||| ||||||||||| |||||| |    
T  21196904 ttgaatccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactatgtaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagagttg 21197003  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
     || | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||| || || |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||| ||    
T  21197004 gcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggtaggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaactggagttggtcgtact 21197103  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  21197104 ttgaagtgtaggaagttgactcc 21197126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23949398 - 23949158
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  23949398 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaagctctatatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggt 23949299  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||  | ||| |  | ||||| |||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23949298 tcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaatcgtt-agcaaactactgagaaagttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 23949200  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23949199 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggaccttgagtt 23949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 16877397 - 16877719
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  16877397 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgcaggacaccgttatgttggt 16877496  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  16877497 ttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 16877595  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| || |||||    
T  16877596 gacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgc 16877695  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  16877696 tttgaagtgtaggaagttgactcc 16877719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 20975953 - 20976081
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20975953 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 20976052  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttggga 132  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20976053 ttgagtcaggagagagtgttgtgttggga 20976081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22982913 - 22982593
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | ||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  22982913 ttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtgtcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 22982814  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||  |||||  || | |||| | ||||||  | || || ||||||| ||| || || | |||||||  ||||||||||||||| || |||||| |    
T  22982813 ttgagtcaagtgag--tgctttgttagaaccggaagttgtgcaagagactatggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtag 22982716  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||| |  || || || | |||||| ||||| | || ||||| ||||||||| ||||||    
T  22982715 acagaagagttatcatgataaaaggtgaaaagatattgagtttcaggttggtgatcatgcgttttttagagtgaatcatgtgattggtgttggtcgtgct 22982616  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||   |||||||||||||    
T  22982615 ttgaagtgtcagaagttgactcc 22982593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 21850639 - 21850961
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || |||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  21850639 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggtaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 21850738  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| || |||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  21850739 ttgagtccggagagagtgctttgttagggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gaaaagatgaaggcgtctcagagta 21850837  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||     
T  21850838 gacagaagagctatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtga 21850937  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  21850938 tttgaagtgtaggaagttgactcc 21850961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 419
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265335
Alignment:
Q  211 agttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 310  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagt 16265226  T
Q  311 caaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaattt 410  Q
    | | |||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  16265227 cgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 16265326  T
Q  411 gcatgatgt 419  Q
    ||| |||||    
T  16265327 gcacgatgt 16265335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28982632 - 28982427
Alignment:
Q  208 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttga 307  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  28982632 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28982533  T
Q  308 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaa 407  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  28982532 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28982433  T
Q  408 tttgca 413  Q
     |||||    
T  28982432 cttgca 28982427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28987852 - 28987647
Alignment:
Q  208 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttga 307  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  28987852 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28987753  T
Q  308 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaa 407  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  28987752 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28987653  T
Q  408 tttgca 413  Q
     |||||    
T  28987652 cttgca 28987647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22315670 - 22315364
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||  | |||||||| || || || || ||||    
T  22315670 ttgattgagtttacttataacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtagaacgccattgtgttggt 22315571  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
     |||||| ||||| |||  |  | | ||||||||  | ||||| || ||||| || || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  22315570 atgagtcaggtgaaagttcttgggtaggaccggaagttgttcaagaaactacagaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 22315472  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||||||||| |  || || || |||||||||||||| | |||||| || ||||| || |||||    
T  22315471 gacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaaccggtgtaggtcgtgc 22315372  T
Q  303 tttgaagt 310  Q
    ||||||||    
T  22315371 tttgaagt 22315364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19863533 - 19863223
Alignment:
Q  7 attgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||| |||||||| || || || ||||||||  |||| ||| | || ||||| || ||||  |    
T  19863533 attgagtttacttataacaacagtttccattctagtattgggatggcaccatttgaggcgttgtatggtaggagatgtcgaacacctttgtgttggtacg 19863434  T
Q  107 agtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 206  Q
    |||| || |||| ||  ||||||||||||||  | |||||  |||| || || || ||||  |||||  ||||||  |||||||| || || ||| ||||    
T  19863433 agtctggcgagattgcagtgttgggaccggagattgttcagcagacgaccgaaaaggtcaaaatgattcgagagagaatgaaagcatcacaaagtagaca 19863334  T
Q  207 aaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttg 306  Q
     ||||| |||||||||||  | || |||    | |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  19863333 gaagagctatcatgataaaagaaggaaatcattggagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttg 19863234  T
Q  307 aagtcaaagaa 317  Q
    ||||| |||||    
T  19863233 aagtctaagaa 19863223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19868170 - 19867860
Alignment:
Q  7 attgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||| |||||||| || || || ||||||||  |||| ||| | || ||||| || ||||  |    
T  19868170 attgagtttacttataacaacagtttccattctagtattgggatggcaccatttgaggcgttgtatggtaggagatgtcgaacacctttgtgttggtacg 19868071  T
Q  107 agtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 206  Q
    |||| || |||| ||  ||||||||||||||  | |||||  |||| || || || ||||  |||||  ||||||  |||||||| || || ||| ||||    
T  19868070 agtctggcgagattgcagtgttgggaccggagattgttcagcagacgaccgaaaaggtcaaaatgattcgagagagaatgaaagcatcacaaagtagaca 19867971  T
Q  207 aaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttg 306  Q
     ||||| |||||||||||  | || |||    | |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  19867970 gaagagctatcatgataaaagaaggaaatcattggagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttg 19867871  T
Q  307 aagtcaaagaa 317  Q
    ||||| |||||    
T  19867870 aagtctaagaa 19867860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27347436 - 27347290
Alignment:
Q  273 agtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtg 372  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||  | |||    
T  27347436 agtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtg 27347337  T
Q  373 gcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || ||   |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  27347336 gcatataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcacgatgt 27347290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 23157313 - 23157443
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||| |||| || || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  23157313 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 23157412  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggacc 134  Q
    |||| || ||||| |||| | |||| |||||    
T  23157413 ttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggacc 23157443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25282609 - 25282531
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || || ||| ||||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  25282609 ttgattgagtttacttacaacaacagatttcattctagcattagtatggcgccgtttgaggctttgtatggacggaggt 25282531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 8211971 - 8212389
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8211971 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcgccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 8212070  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  8212071 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagag 8212170  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8212171 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgt 8212270  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  8212271 gctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatc 8212370  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  8212371 tttcgaacttgcacgatgt 8212389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 11306106 - 11306524
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11306106 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 11306205  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  11306206 ggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagag 11306305  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11306306 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgt 11306405  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  11306406 gctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 11306505  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  11306506 tttcgaacttgcacgatgt 11306524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 49152707 - 49152289
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49152707 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 49152608  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49152607 ggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 49152508  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||     
T  49152507 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgg 49152408  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  49152407 gctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 49152308  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  49152307 tttcgaacttgcacgatgt 49152289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 26118448 - 26118812
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26118448 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 26118547  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26118548 ggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaggatgaaagcttcgcagag 26118647  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||    
T  26118648 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgt 26118747  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgg 365  Q
    ||| ||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  26118748 gctctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagatagagttgg 26118812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19147614 - 19147199
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19147614 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggt 19147515  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19147514 ttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 19147415  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  19147414 acagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgca 19147315  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||| ||||  | || ||||| |||||||    
T  19147314 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatcttt 19147215  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||| ||||    
T  19147214 cgaatttgcataatgt 19147199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 17211 - 17599
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||| |||| ||||| || || || || |    
T  17211 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttcagtcaggtgaaagagtggtcttag 17310  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17311 gacccgaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgcag 17410  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17411 gaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgaga 17510  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17511 tttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 17599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20747013 - 20746598
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20747013 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggt 20746914  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20746913 ttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 20746814  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  20746813 acagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgca 20746714  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||| ||||  | || ||||| |||||||    
T  20746713 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatcttt 20746614  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||| ||||    
T  20746613 cgaatttgcataatgt 20746598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 14264090 - 14264505
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14264090 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggt 14264189  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  14264190 ttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccgtatttggttcatcagactacgaagaatgtcaagatgataagcgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 14264289  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  14264290 acagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgca 14264389  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  14264390 ttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatcttt 14264489  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||| ||||||    
T  14264490 cgaatttgcctgatgt 14264505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 15154552 - 15154935
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  15154552 tatcattctagtattgggatggcaccttatgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 15154651  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    ||   ||||  |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154652 ga---gatt--gttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcaccgagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 15154746  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154747 aaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 15154846  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15154847 tttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccactgcatctttcgaatttgcacgatgt 15154935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15624954 - 15624539
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||| | ||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  15624954 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattagaatgacaccattcgaagcactgtatggtcggaggtgtaggactccattgtgttggt 15624855  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||| ||  | |||||| | |||||  |||| || | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15624854 tcgagtcaggtgagagtgtaattttgggaccagaaatcgttcatcaaactacttagaaggttaagttgatccaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 15624755  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  15624754 atagaagagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgca 15624655  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15624654 ttgaagtcaaggaaattgactccgaggtttattggttcatatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatcttt 15624555  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  15624554 cgaatttgcatgatgt 15624539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8199030 - 8198621
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  8199030 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 8198931  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8198930 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 8198831  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8198830 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 8198731  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8198730 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 8198631  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  8198630 cgaatttgca 8198621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8708007 - 8707598
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  8708007 ttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 8707908  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8707907 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 8707808  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8707807 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 8707708  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8707707 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 8707608  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  8707607 cgaatttgca 8707598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10871397 - 10870988
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  10871397 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 10871298  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10871297 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 10871198  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10871197 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 10871098  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  10871097 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaggttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttg 10870998  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  10870997 cgaatttgca 10870988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 23516637 - 23517046
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |||    
T  23516637 ttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgccggt 23516736  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||  ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23516737 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacaagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcatcgcagagtcg 23516836  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23516837 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 23516936  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  23516937 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 23517036  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  23517037 cgaatttgca 23517046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 15102449 - 15102862
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  15102449 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggt 15102548  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  15102549 tcgagtcaggagagagtgttgt--tgggaccggatttgattcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcg 15102646  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  15102647 acaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 15102746  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  15102747 ttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatcttt 15102846  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  15102847 cgaatttgcatgatgt 15102862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 15160952 - 15161334
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  15160952 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 15161051  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161052 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 15161151  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  15161152 gaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 15161251  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15161252 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 15161334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 40 - 413
Target Start/End: Original strand, 11237117 - 11237490
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||      
T  11237117 agtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagaga 11237216  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||  |||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237217 ttgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagagaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 11237316  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  11237317 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggt 11237416  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11237417 ccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 11237490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14332799 - 14332390
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  14332799 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 14332700  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| |  || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14332699 ttgaataaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 14332600  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14332599 acaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 14332500  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  14332499 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttg 14332400  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  14332399 cgaatttgca 14332390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 18551626 - 18552035
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  18551626 ttgattgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 18551725  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18551726 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 18551825  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18551826 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 18551925  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  18551926 ttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 18552025  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  18552026 cgaatttgca 18552035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 12206646 - 12207061
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |  ||||| ||||| ||||    
T  12206646 ttgatagagttcacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgtatgatcggaggtgcaatactccgttatgttggt 12206745  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||| || || ||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12206746 ttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccggatatagttcagcagactacagaaaaggtcaaattgataaaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 12206845  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  12206846 acaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttaagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgcc 12206945  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| |||| || ||||||| | | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  12206946 ttgaaatcaaagaagttgacgccgaagtttattggttcgtaccagatatctgagagagttgcaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatcttt 12207045  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  12207046 cgaatttgcatgatgt 12207061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 16950317 - 16950732
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16950317 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 16950416  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||| ||||||||||||    
T  16950417 ttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggacaggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcg 16950516  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  | ||||||||| || || || || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  16950517 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 16950616  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||    
T  16950617 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttggcaccacatcttt 16950716  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  16950717 cgaacttgcatgatgt 16950732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 44791219 - 44791628
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  44791219 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 44791318  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44791319 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 44791418  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44791419 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 44791518  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  44791519 ttgaagtcaaagaaattgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 44791618  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  44791619 cgaatttgca 44791628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 11552997 - 11553379
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  11552997 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 11553096  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11553097 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgcag 11553196  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  11553197 aaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaag 11553296  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  11553297 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgca 11553379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15204281 - 15203866
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||| ||| || |||||  ||||||| | ||||||||||||||| || || ||||    
T  15204281 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggaaccatttgaagcgctgtatggtcagaggtgtaggactccgttgtgttggt 15204182  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| || | | |||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  15204181 tcgagtaaggtgatagtgtagttttgggaccagattttgttcagcaaactacagagaaggttaagttgatccatgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 15204082  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||     
T  15204081 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacttttgtgactggtgttggccgcgca 15203982  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||| |||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  15203981 ttgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtctgtatcagattacagaaagaattggaacggtagagtatcgagtgggtttaccaccgcatcttt 15203882  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  15203881 cgaatttgcatgatgt 15203866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12687876 - 12687494
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||  | || || |    
T  12687876 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttag 12687777  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | || ||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12687776 gaccagagattgtccaacagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag 12687677  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  12687676 gaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgcgagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaag 12687577  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12687576 tttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgca 12687494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18178120 - 18177735
Alignment:
Q  28 agctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgt 127  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || |    
T  18178120 agctatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtct 18178021  T
Q  128 tgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 227  Q
    | ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178020 taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtttagatgattcgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 18177921  T
Q  228 tagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccg 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18177920 tagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttcttgagagtcactcctataactggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccg 18177821  T
Q  328 agatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |  || |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18177820 aagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 18177735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13686439 - 13686057
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  13686439 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgatggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 13686340  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686339 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 13686240  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  13686239 gaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 13686140  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  13686139 ttcattggtccgtatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgtcgcatctttcgaatttgca 13686057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 67 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14954959 - 14954613
Alignment:
Q  67 ttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtca 166  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | || ||  ||||||| |||||||| |    
T  14954959 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtccagcagactactgagaaagtta 14954860  T
Q  167 ggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 266  Q
     ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14954859 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 14954760  T
Q  267 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgga 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14954759 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccaaagtttattggtccgtataagatatcagaaagagttgga 14954660  T
Q  367 tcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
     ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14954659 acggtggcttatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgca 14954613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 417
Target Start/End: Original strand, 16072140 - 16072553
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  16072140 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggcgcataactcctttatgttggt 16072239  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16072240 ttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcgtcagactatggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 16072339  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  16072340 acagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 16072439  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| | |  ||| || || ||||| |||||||    
T  16072440 ttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatgcaaagtgggtttgccaccacatcttt 16072539  T
Q  404 cgaatttgcatgat 417  Q
    ||||||||||||||    
T  16072540 cgaatttgcatgat 16072553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13021760 - 13021345
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  13021760 ttgatagagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggaggtgcaggactcctctatgttggt 13021661  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  13021660 ttgagtcaggaaagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcg 13021561  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  || ||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| || ||   ||||||     
T  13021560 acagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttcaagacggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggcgtaaaacgtgca 13021461  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  13021460 ttgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggttttccaccacatcttt 13021361  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  13021360 cgaacttgcatgatgt 13021345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 14286222 - 14286637
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14286222 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgctggt 14286321  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  14286322 ttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcg 14286421  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| ||||     
T  14286422 acagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacaggtgtaggatgtgca 14286521  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||| | ||| | ||  ||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  14286522 ttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttcatataggattggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 14286621  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  14286622 cgaacttgcatgatgt 14286637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12457182 - 12456940
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12457182 ttgattgagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtataggactcctttatgctagt 12457083  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12457082 ttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttcataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcg 12456983  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttt 246  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  12456982 acagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14038032 - 14037794
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14038032 aagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactc 14037933  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  14037932 ctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcg 14037833  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14037832 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 14037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14348062 - 14347824
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14348062 aagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactc 14347963  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  14347962 ctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcg 14347863  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14347862 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 14347824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 1253 - 1668
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  1253 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcagaggtgaaggactcctttatgctggt 1352  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||| |||    
T  1353 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagattcg 1452  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| ||| ||| ||| || |||| ||||| ||||||||     
T  1453 acagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttgtgaaagttacttctatgacgggtgtaggacgtgca 1552  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||| ||||||| | | |||||| |||||| |  |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  1553 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttaagaaagggttggaacactggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 1652  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  1653 cgaacttgcatgatgt 1668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 6413914 - 6413499
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6413914 ttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 6413815  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  6413814 ttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtctggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaacatgaaagcatcgcagagtcg 6413715  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   |||||||||| || || || || |||||| |||| || |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  6413714 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 6413615  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |  ||||||||||| |  || |||||| || ||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  6413614 ttgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattggttcgaatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 6413515  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  6413514 cgaacttgcatgatgt 6413499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14130276 - 14129861
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14130276 ttgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggt 14130177  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  14130176 ttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 14130077  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||| ||||| |||||  ||||  |||| |||||||||    
T  14130076 acagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccgatgacgagtgtaggacgtgct 14129977  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | | ||| ||  ||||| || |||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  14129976 ttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagttggcttgccaccacatctat 14129877  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  14129876 cgaacttgcatgatgt 14129861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14434094 - 14433679
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14434094 ttgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggt 14433995  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  14433994 ttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 14433895  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||| ||||| |||||  ||||  |||| |||||||||    
T  14433894 acagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccgatgacgagtgtaggacgtgct 14433795  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | | ||| ||  ||||| || |||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  14433794 ttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagttggcttgccaccacatctat 14433695  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  14433694 cgaacttgcatgatgt 14433679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12456072 - 12455690
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  12456072 tcgagtataggtatggtaccgttcgaagctttgtatggtaggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccgg 12455973  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |     
T  12455972 acttggtacatgagactactgagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggc 12455873  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     || |||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| |  || |||    
T  12455872 cctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcatt 12455773  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||| || | ||||| ||  || |||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  12455772 ggtcggtatcagatttcagagagagttagaacagtggcttatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgt 12455690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 13968511 - 13968701
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13968511 cctttgattgggttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtatgactcctttatgct 13968610  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  13968611 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcagattgataagggaaaagatgaaagc 13968701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 18053799 - 18054214
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || || ||||    
T  18053799 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgagggtgcaggactccgttgtgttggt 18053898  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18053899 tcgagtcaggagaaagagttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 18053998  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  18053999 acagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 18054098  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || |  |||||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  18054099 ttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcagatttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 18054198  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  18054199 cgaacttgcatgatgt 18054214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 23199589 - 23200004
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||    
T  23199589 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggt 23199688  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23199689 ttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagctgatcagggagaagatgaaagcgtcacagagtcg 23199788  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  23199789 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 23199888  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | ||| || || | ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  23199889 ttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccaccacatctat 23199988  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  23199989 cgaacttgcatgatgt 23200004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 23505716 - 23506131
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||    
T  23505716 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggt 23505815  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23505816 ttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagctgatcagggagaagatgaaagcgtcacagagtcg 23505915  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  23505916 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 23506015  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | ||| || || | ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  23506016 ttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccaccacatctat 23506115  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  23506116 cgaacttgcatgatgt 23506131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13665940 - 13665541
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||    
T  13665940 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggggcatgactcctttatgctggt 13665841  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||           ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13665840 ttgagtcaggagagagttttgtgttggg-----------ttcatcaaactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 13665752  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||| || |  |||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || ||     
T  13665751 acagaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggca 13665652  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || |     ||||||||| | |||||||| |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  13665651 ttgaagtcgaagaagttgactccaaagttca-----ccgtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 13665557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 11388274 - 11388685
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||| || |||||||| || ||||    
T  11388274 ttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatgttcgaaggtgcagaactcctttgtgttggt 11388373  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  ||||||| || || || | | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11388374 ttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcg 11388473  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  11388474 acagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatgagtttcaaga-ggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgca 11388572  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  11388573 ttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatcttt 11388672  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  11388673 cgaatttgcatga 11388685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 35964718 - 35965016
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  35964718 ttgatcgagttcacttataataacagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 35964817  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
     |||||| || || ||||| ||  ||||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | | |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  35964818 atgagtctggcgatagtgtagtactgggaccagacattgttcaacaaactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtag 35964917  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  35964918 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactagtgtatgacgtgc 35965016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15340834 - 15340590
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  15340834 ttgatagagttcacctacaacaacatttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagttttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctagt 15340735  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| | |||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  15340734 ttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagctgataagggaaaagatgaaagcgtcacagagtcg 15340635  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 248  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  15340634 acagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttca 15340590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21662324 - 21661951
Alignment:
Q  43 attggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttgg 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||   |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||  | |    
T  21662324 attggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttgtgatgagtccggtgagagtgtggtactgggaccagacattg 21662225  T
Q  143 ttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 242  Q
    ||||  ||||||  || || || | | |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21662224 ttcaacagactaatgaaaatgttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttga 21662125  T
Q  243 gtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 342  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||  | || ||||||||  | |||||||| |||||||| |||    
T  21662124 gtttc---aaggagaccatgtgtttttgagagtcacccctcttaccggtgttggacgggcactaaaatcaaagaaactaactccgaggtttattggcccg 21662028  T
Q  343 tatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||| | ||  ||||||||||  |||| |||||    || || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21662027 tatcagatttcgcaaagagttggggcggttgcgtataacgtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgt 21661951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7824302 - 7823980
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  7824302 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 7824203  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || || || |||| | |||| || |||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  7824202 ttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 7824104  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  7824103 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 7824004  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||    
T  7824003 tttaaagtgtaggaagttgactcc 7823980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 27107642 - 27107964
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  27107642 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 27107741  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || || || |||| | |||| || |||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  27107742 ttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 27107840  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  27107841 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 27107940  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||    
T  27107941 tttaaagtgtaggaagttgactcc 27107964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14936749 - 14936443
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  | || || ||||    
T  14936749 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgttggt 14936650  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || |||||  ||| | |||| ||||||||  | || ||  | |||| ||| || || | ||||||   |||||||||||||||||| |||||| |    
T  14936649 ttgaatcaggtgaaggtgctttgttaggaccggaagttgtgcaataaactaaggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 14936550  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| |  || || || |||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  14936549 acagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgactggtgttggtcgtgct 14936450  T
Q  304 ttgaagt 310  Q
    |||||||    
T  14936449 ttgaagt 14936443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 21674401 - 21674723
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||  | || || ||||    
T  21674401 ttgattgaatttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaagacaacgttgtgttggt 21674500  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||||| |||   | ||||||   |||||||||||||||||| || ||| |    
T  21674501 ttgagtcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaatataagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcaaagtag 21674600  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||| |||||||  || || || |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||    
T  21674601 acagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgaatttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccttgtgattggtattggacgtgct 21674700  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  ||||| ||||||||    
T  21674701 ttgaagtgtaagaaattgactcc 21674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 12368442 - 12368766
Alignment:
Q  2 ctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  12368442 ctttgattgagtttacttacaacaaaaaatttcattctagtattggtatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttg 12368541  T
Q  102 gtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagt 201  Q
    ||| || || || || |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||| | || || | |||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12368542 gttcgaatccggagaaagtgctttgtttggaccggaagttgtgcaagagactacgaaaaaggttaagatgatccaagagaaaatgaaggcgtctcagagt 12368641  T
Q  202 cgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtg 301  Q
     |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||||||||| | || ||||||  ||||||| | ||    
T  12368642 agacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgactttcaggttggtgatcacgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccagtgttggtcatg 12368741  T
Q  302 ctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||||  | ||||||||||||    
T  12368742 ctttgaagtgtaggaagttgactcc 12368766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12193958 - 12193654
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  12193958 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattaaagtatcagtatgacaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtagaactcctttgtgttggt 12193859  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
     |||||| ||||| | || | |||| |||||| |  | || || || ||||||||||| || | ||||||   ||||||||||| |||||| |||||| |    
T  12193858 atgagtcaggtgaaaatgctttgttaggaccgaaggttgtgcaagaaactacggagaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtag 12193759  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
     || ||||||||||||| |||| | || || ||  |||| ||||| |  || || || || |||||||| || | |||||| || |||||||||||||||    
T  12193758 gcagaagagttatcatgttaagaggaggaatgacattgattttcaggttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgct 12193659  T
Q  304 ttgaa 308  Q
    |||||    
T  12193658 ttgaa 12193654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 419
Target Start/End: Original strand, 26288047 - 26288297
Alignment:
Q  168 gatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttt 267  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || || ||||| || || || || || |||    
T  26288047 gatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcatgttttt 26288145  T
Q  268 ttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggat 367  Q
     |||| || |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||||| ||| ||     
T  26288146 ctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgtatcagatttcagaaagggtttgaa 26288245  T
Q  368 cggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  26288246 cagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgt 26288297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45146957 - 45146652
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  || || ||||| |||||| ||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  45146957 ttgattgagtttacttacaacaacagtttgcattctagtatcggtatgacaccgttggaggctctgtatggtcggaggtgtaggacgccattgtgttggt 45146858  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || ||||| |||| | |||| |||||| |  |  | || ||||||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  45146857 ttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccgaaggttatgcaagagactacggaaaatgttaagatgattcag-gagaagatgaaagcgtctcagagta 45146759  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
     | | |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||| ||||||||  || || || |||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||    
T  45146758 aatagaagagttatcattataagagtaggaaggacattgtgtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagaatgaatcatg-gactggtgttggacgtgc 45146660  T
Q  303 tttgaagt 310  Q
    ||||||||    
T  45146659 tttgaagt 45146652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 257
Target Start/End: Original strand, 11772208 - 11772362
Alignment:
Q  103 tttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  11772208 tttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccggaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaatgatgaaaacgtcgtagagtc 11772307  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggaga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11772308 gacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggaga 11772362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9596421 - 9596236
Alignment:
Q  42 tattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttg 141  Q
    |||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||| | || || ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  |     
T  9596421 tattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagatt 9596322  T
Q  142 gttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 227  Q
    |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596321 gttcagcagactacagagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15364342 - 15364036
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  | || || ||||    
T  15364342 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgacgttgtgttggt 15364243  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| |  || || |||| | ||||  |||||||  | || ||  | | || ||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  15364242 ttgaataaggagaaagtgatatgttaagaccggaagttgtgcaaaaaaataaggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 15364144  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| |  || || || |||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||    
T  15364143 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgc 15364044  T
Q  303 tttgaagt 310  Q
    ||||||||    
T  15364043 tttgaagt 15364036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4440330 - 4440008
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||  |||||||||| | | || || ||||||||  | |||||||| |   | || || ||||    
T  4440330 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtaccggtatggcactgcttgaggctttgtatggaagaaggtgtagaatgtcgttgtgttggt 4440231  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | || || ||||| |||| | |||| || |||||  | || || ||||||||||| || || | ||||||   |||||||||||| ||||| |||||| |    
T  4440230 tcgaatcaggtgaaagtgctttgttagggccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtag 4440131  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||||||||| |  || || || |||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||    
T  4440130 acagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccctatgactggtgtaggacgtgct 4440031  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  4440030 ttgaagtgtaggaagttgactcc 4440008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 317
Target Start/End: Original strand, 41017 - 41327
Alignment:
Q  7 attgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||| || || || ||||||||  |||| ||| | || ||||| || ||||  |    
T  41017 attgagtttacttataacaacagtttccattctagtactgggatggcaccatttgaggcgttgtatggtaggagatgtcgaacacctttgtgttggtacg 41116  T
Q  107 agtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 206  Q
    |||| || |||| ||  ||||||||||| ||  | |||||  |||| || ||||| ||||  | |||  | ||| | |||||||| || || | | ||||    
T  41117 agtctggcgagattgcagtgttgggaccagagattgttcagcagacgaccgagaaggtcaaaacgattcgggaggaaatgaaagcatcacaaattagaca 41216  T
Q  207 aaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttg 306  Q
     ||||| ||||||||||| || |||||| |  | |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  41217 gaagagctatcatgataaacgaagaaaataattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgctttg 41316  T
Q  307 aagtcaaagaa 317  Q
    ||||| |||||    
T  41317 aagtctaagaa 41327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13353551 - 13353247
Alignment:
Q  6 gattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggttt 105  Q
    |||||||||||||||||| || || | ||| || | ||  | |||||||||||| || || ||||||||  | |||||||||||  | || || |||| |    
T  13353551 gattgagtttacttataataagagttttcattctattaccgatatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtaggacgtcgttgtgttggtat 13353452  T
Q  106 gagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgac 205  Q
    ||||| ||||| |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||| | || || | ||||||   |||||||| || ||| || ||||||   |    
T  13353451 gagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagagactacgaaaaaggttaagatgatttaagagaagacgagagcatctcagagtacgc 13353352  T
Q  206 aaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcttt 305  Q
    | |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||| |||   || || |  |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  13353351 agaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagttccaaattggtgatcttgtgtttctgagagtgaatactgtgactggtgttggacgtgcttt 13353252  T
Q  306 gaagt 310  Q
    |||||    
T  13353251 gaagt 13353247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13378956 - 13378796
Alignment:
Q  148 gagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 247  Q
    ||||||||||| || || | |||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||| |||||||| | |||||  |  |||||||||    
T  13378956 gagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagcgttattatgataagaggagaaagaaaattgagtttc 13378857  T
Q  248 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaa 308  Q
    | |  || || || |||||||||||||| | |||| | ||| | ||||| |||||||||||    
T  13378856 aggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctataacttgagttggtcgtgctttgaa 13378796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 416
Target Start/End: Original strand, 15479338 - 15479396
Alignment:
Q  358 agagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15479338 agagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgcatga 15479396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15340569 - 15340484
Alignment:
Q  334 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15340569 attggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 15340484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20467010 - 20466877
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 277  Q
    |||||||||||||  || |||||| | || || ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||  | |||  | |||||||| ||||| |    
T  20467010 gagaagatgaaagaatctcagagtaggcagaatagttatcatgataagcggaggaaggatattgagtttctagttgaagataatgtgttttttagagtta 20466911  T
Q  278 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtc 311  Q
      || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20466910 accccgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtc 20466877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17924065 - 17923985
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgt 84  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  17924065 ttgattaagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctctgtatggtcggaggtgt 17923985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 250
Target Start/End: Original strand, 5432638 - 5432710
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    |||||||||| |||||| || ||| | || |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||    
T  5432638 gagaagatgagagcgtctcaaagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaag 5432710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 10468853 - 10469268
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10468853 ttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 10468952  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10468953 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcg 10469052  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  10469053 acagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgca 10469152  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  10469153 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 10469252  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||  ||||||||||    
T  10469253 cgaacctgcatgatgt 10469268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24364692 - 24364274
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24364692 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcatcgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 24364593  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24364592 ggtttgagtcgagtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 24364493  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||    
T  24364492 tcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgt 24364393  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||  ||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  24364392 gcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 24364293  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  24364292 tttcgaacttgcacgatgt 24364274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15459592 - 15459201
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||    
T  15459592 aacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttg 15459493  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  15459492 tgttgggaccggatttggttcacgagactacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaa 15459393  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  15459392 gcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgact 15459293  T
Q  325 ccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    || |  || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15459292 ccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagtgggattaccacctcatctttcgaatttgcatga 15459201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21471878 - 21471463
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21471878 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggacggaggtgcaggactcctttgtgttggt 21471779  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21471778 ttgagtcgggagaaagtgcagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagttaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 21471679  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||||     
T  21471678 acagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggggtaggacgtgcg 21471579  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  21471578 ttgaaatctaagaagttgactccgaagtttattgatccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 21471479  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  21471478 cgaatttgcatgatgt 21471463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 177 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 19864791 - 19864548
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19864791 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttagagtc 19864692  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  19864691 actcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagatttggaacggtggcgt 19864592  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19864591 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgtatgatgtc 19864548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 419
Target Start/End: Original strand, 16963388 - 16963786
Alignment:
Q  21 taacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagt 120  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || || ||     
T  16963388 taacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttgatttgagtcaggagaaaga 16963487  T
Q  121 gttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatg 220  Q
    || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963488 gtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatg 16963587  T
Q  221 ataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagtt 320  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16963588 ataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccaagtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagtt 16963687  T
Q  321 gactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16963688 gactccgagatttattggtccatatcagatatcggaaatagttggaacgatggcgtatcgtgttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 16963786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12498276 - 12497888
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||  | || || |    
T  12498276 tatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttag 12498177  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12498176 gacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag 12498077  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12498076 gaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgaga 12497977  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497976 tttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 12497888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 12510625 - 12511013
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||  | || || |    
T  12510625 tatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttag 12510724  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12510725 gacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag 12510824  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12510825 gaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgaga 12510924  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510925 tttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 12511013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 25765321 - 25765708
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |  || || || |    
T  25765321 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaaaagtggtcttag 25765420  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25765421 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtag 25765520  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765521 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgcttttgagagtcacgc-tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 25765619  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25765620 tttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgt 25765708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 409
Target Start/End: Original strand, 16927650 - 16928049
Alignment:
Q  10 gagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||    
T  16927650 gagttcacgtataacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagt 16927749  T
Q  110 cgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 209  Q
    | || || || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| | |||||| | ||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16927750 caggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagggaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgccgcagagtcgaaaaaa 16927849  T
Q  210 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaag 309  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16927850 gagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactagtgttggacgtgctttgaag 16927949  T
Q  310 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16927950 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgtcttggattaccaccgcatctttcgaatt 16928049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 16626721 - 16627130
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16626721 ttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16626820  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||  ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16626821 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactattgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 16626920  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16626921 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 16627020  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  16627021 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 16627120  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  16627121 cgaatttgca 16627130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 412
Target Start/End: Original strand, 25609892 - 25610273
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  25609892 tatcattctagtattggaatggcaccttatgatgctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 25609991  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25609992 gaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtag 25610091  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25610092 gaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcacacctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgattccgaga 25610191  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgc 412  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25610192 tttattggtccgtattagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgc 25610273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 29591924 - 29592333
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  29591924 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 29592023  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29592024 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 29592123  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29592124 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 29592223  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  29592224 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatcttt 29592323  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  29592324 cgaatttgca 29592333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 70 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12505566 - 12505217
Alignment:
Q  70 tatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcagga 169  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||  | || || ||||| ||  | |||||| | ||||| ||||| || | ||    
T  12505566 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagattggtcttaggacccgagattgttcatcatactactgagaatgttaaga 12505467  T
Q  170 tgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 269  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12505466 tgattcaagagaatatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 12505367  T
Q  270 gagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcg 369  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||    
T  12505366 gagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacg 12505267  T
Q  370 gtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12505266 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgatttttcatgatgt 12505217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 24313172 - 24313581
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  24313172 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 24313271  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24313272 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 24313371  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24313372 acaaaagagttatcatgataagcataggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 24313471  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  24313472 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 24313571  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  24313572 cgaatttgca 24313581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27187713 - 27187304
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||||||| || || ||||    
T  27187713 ttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggt 27187614  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27187613 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 27187514  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27187513 acaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 27187414  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||    
T  27187413 ttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatcttt 27187314  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  27187313 cgaatttgca 27187304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 27261527 - 27261936
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||||||| || || ||||    
T  27261527 ttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggt 27261626  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27261627 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 27261726  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27261727 acaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 27261826  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||    
T  27261827 ttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatcttt 27261926  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  27261927 cgaatttgca 27261936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 27331464 - 27331852
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  27331464 tatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagggtggttttag 27331563  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||    |||||  | ||||| |||||||| |  |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27331564 gacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtag 27331663  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  27331664 aaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgaga 27331763  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27331764 tttattggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 27331852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 27392204 - 27392592
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  27392204 tatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagggtggttttag 27392303  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||    |||||  | ||||| |||||||| |  |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27392304 gacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtag 27392403  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  27392404 aaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgaga 27392503  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27392504 tttattggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 27392592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25768468 - 25768053
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  25768468 ttgatagagttcacgtacaacaactgttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtggtcggaggtgcaggactccattgtgttggt 25768369  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25768368 ttgagtcgggagaaagtgtggtctttggaccggatttagttcatcaaactacggagaaggtcaagttgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 25768269  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||     
T  25768268 acagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttatgacgggtgtaggacgtgcg 25768169  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  25768168 ttgaagtctaagaaattgacttcaaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 25768069  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||||||||||||||    
T  25768068 ccaatttgcatgatgt 25768053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 2874834 - 2875216
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || || || |    
T  2874834 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtcgggtgaaagagtggtcttag 2874933  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874934 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 2875033  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||      
T  2875034 aaaagattttgagtttcaagaaggagaccacgagtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaataagttgaccccgaag 2875133  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2875134 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 2875216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Original strand, 22078869 - 22079107
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22078869 aagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcttaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 22078968  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  22078969 ctgtgattggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattcgtccgtatcagatatcggaaagagttggtacggtggcgtatcg 22079068  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22079069 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 22079107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 1543088 - 1543497
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |  ||||| || |||||||    
T  1543088 ttgatcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcataactccgttgtgctggt 1543187  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1543188 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcccagagtcg 1543287  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  1543288 acaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgct 1543387  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  1543388 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttt 1543487  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  1543488 cgaatttgca 1543497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 28263201 - 28263610
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||  || || ||||| || || ||||    
T  28263201 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggt 28263300  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28263301 ttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 28263400  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28263401 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 28263500  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28263501 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 28263600  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  28263601 cgaatttgca 28263610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 28341950 - 28342359
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||  || || ||||| || || ||||    
T  28341950 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggt 28342049  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28342050 ttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 28342149  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28342150 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 28342249  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28342250 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 28342349  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  28342350 cgaatttgca 28342359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 17415745 - 17415365
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||    
T  17415745 aacaacagttaccattcgagtattgatatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagaagaaagtg 17415646  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||     
T  17415645 ttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgg 17415546  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  17415545 caagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 17415446  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctt 402  Q
    ||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||||||||||    
T  17415445 actccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 177 - 413
Target Start/End: Original strand, 18408120 - 18408356
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  18408120 agagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaatagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtatttttgagagta 18408219  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  18408220 actcgtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 18408319  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    | || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18408320 atcgggtgggattaccaccgcacctttcgaatttgca 18408356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 191 - 419
Target Start/End: Original strand, 21833172 - 21833400
Alignment:
Q  191 cgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactgg 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833172 cgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactgg 21833271  T
Q  291 tgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggatta 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21833272 tgttggaggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggatta 21833371  T
Q  391 ccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833372 ccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 21833400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 28292376 - 28292785
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  28292376 ttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 28292475  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28292476 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 28292575  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28292576 acaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 28292675  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||| |||||| | |  |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28292676 ttgaagttaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 28292775  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  28292776 cgaatttgca 28292785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23078725 - 23078337
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  23078725 aacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcataactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtgg 23078626  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    | || ||||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23078625 ttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgcagactcgacaaaagagttatcatgataa 23078526  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  23078525 gcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttgggcgcgcattgaagtcaaagaagttgact 23078426  T
Q  325 ccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||  | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23078425 ccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagtttaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 23078337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 5839223 - 5839638
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  5839223 ttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggt 5839322  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| |||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5839323 ttgaatcaggagatagggtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtcaagatgatttaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 5839422  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  5839423 acagaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacacgtttttgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcg 5839522  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5839523 ttgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcatcttt 5839622  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5839623 cgaatttacatgatgt 5839638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 8766152 - 8766567
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8766152 ttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggttggaggtgcaggactcatttatgctggt 8766251  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  8766252 ttgagtcaggagagagtgtcgtgtggggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcg 8766351  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||| |||| || ||| || ||||  | || ||||||||     
T  8766352 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttacttctatgacaagggtaggacgtgca 8766451  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  8766452 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatcttt 8766551  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  8766552 cgaatttgcatgatgt 8766567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18801201 - 18800858
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || ||||    
T  18801201 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcctcgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagttaggagaaagtg 18801102  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18801101 ttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatga 18801002  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||  |||||||| ||| |||||    
T  18801001 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttg 18800902  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgg 365  Q
    ||| | |  || |||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  18800901 acttcaaagttcattggtccatatcagatatcagagagggttgg 18800858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 22796636 - 22797051
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |    
T  22796636 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtacggtcggaggtgcaggactcctttatgttgat 22796735  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||| || || ||||||||||||||||| ||||     
T  22796736 ttgagtcaggagagagtgtagtgttgcgaccggatttggttcatcagactacagagaaggttaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtct 22796835  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  22796836 acataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 22796935  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||| ||||||  |||| || || |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  22796936 ttgaagtctaggaagttgactcctaagtttattggtctgtatcatatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatcttt 22797035  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  22797036 cgaatttgcatgatgt 22797051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 14381471 - 14381833
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14381471 ttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 14381570  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  14381571 ttgagtcatgagagagtgtcgtgttgggatcggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtgg 14381670  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  14381671 acagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 14381770  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgga 366  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  14381771 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttgga 14381833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25112802 - 25112420
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || | ||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  25112802 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaattccgttatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 25112703  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| |   | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25112702 gaccagcgatcgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagagtcgacaaaagacttatcatgataagcgtag 25112603  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||      
T  25112602 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaag 25112503  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25112502 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 25112420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 27560621 - 27561036
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  27560621 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccattgtgttggt 27560720  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27560721 ttgaatcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 27560820  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  27560821 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgct 27560920  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  27560921 ttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 27561020  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  27561021 cgaacttgcatgatgt 27561036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 177 - 413
Target Start/End: Original strand, 22762632 - 22762868
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22762632 agagaagatgaaagtttcggagagtcgacaatagagttacaatgataagcgtaggacagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttgtgagagtc 22762731  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  22762732 actcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgaatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgt 22762831  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    | | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22762832 atcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22762868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 34645590 - 34646002
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| || ||||    
T  34645590 ttgatagaatttacttataacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgcagatgcaggactcctttgtgttggt 34645689  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  | ||||| || || || | | |||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  34645690 ttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttgataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcg 34645789  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  34645790 acagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggtgtgggtcgtgca 34645889  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||    
T  34645890 ttaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatcttt 34645989  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  34645990 cgaatttgcatga 34646002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 28282817 - 28283232
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  28282817 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 28282916  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28282917 ttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 28283016  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  28283017 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 28283116  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || |  |||||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||||| ||  | ||  ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  28283117 ttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcagatttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 28283216  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| ||||| |||||    
T  28283217 cgaacttgcacgatgt 28283232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1641049 - 1640715
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  1641049 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgcatggacggaggtgcagaactccgttatgttggt 1640950  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    || |||||||||| |||||  |||||||||| ||| | |||||| ||||||| || || ||||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1640949 ttaagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcatcagactacagaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 1640850  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  1640849 acagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgaattttaggaaggagatcatgtgtttctaagagtcacccctgtgacaggtgttggtcgtgcc 1640750  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 338  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1640749 ttgaaatcgaagaagttgaccccgaggtttattgg 1640715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25750900 - 25750673
Alignment:
Q  190 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactg 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  25750900 gcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgg 25750801  T
Q  290 gtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggatt 389  Q
    ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||    
T  25750800 gtgtaagacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggttt 25750701  T
Q  390 accaccgcatctttcgaatttgcatgat 417  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25750700 gccaccacatctttcgaatttgcatgat 25750673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19879575 - 19879163
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  19879575 ttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggacgaaggtgcagaactcctttgtgttggt 19879476  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| ||||| || |||||  ||||||| || ||  | |||||  | ||||| || || || | | | || |||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19879475 ttgaatcgggagaaagtgtgatgttggggccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataagagaacagatgaaagggtcgcagagtcg 19879376  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| || | ||||| || |||||     
T  19879375 acagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatggcaggtgtaggccgtgca 19879276  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||||| || |||||||    
T  19879275 ttgaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatcttt 19879176  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  19879175 cgaatttgcatga 19879163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 416
Target Start/End: Original strand, 21564169 - 21564548
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||  |||||||||| |    
T  21564169 tcgagtattggtatggttccgttcgaagctttgtacggtcggaggtgccggactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtgatgttgggaccag 21564268  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    |  | |||||  ||||||   | || || | | |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  21564269 acatagttcagcagactaaaaaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagctatcatgacaaacgtaggaagga 21564368  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||    
T  21564369 ccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctttgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttatt 21564468  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||||||  |||| || || || || ||||||| ||||||||||||    
T  21564469 ggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcgtatagagtgggtttgccgcctcatctttagaatttgcatga 21564548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19453664 - 19453511
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  19453664 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccag 19453565  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaag 190  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19453564 atttggttcatcagactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaag 19453511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18794967 - 18794555
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |  |||||||| || ||||    
T  18794967 ttgatagagtttacctacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccatttgaagccttgtacggtcgaaggtgcataactcctttgtgttggt 18794868  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||  || || |||||  ||||||| || ||  | || ||  ||||||| || || || | | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18794867 ttgagttaggagaaagtgtgatgttggggccagacatagtgcaacagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcg 18794768  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  18794767 acagaagagctatcatgacaatcgtaggaaagaccttcagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcc 18794668  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||  | || |||||| | ||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  18794667 ttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctaagagggttggaacagtggcatatcgagtgggtttgccacctcatcttt 18794568  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  18794567 cgaatttgcatga 18794555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 261 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17032582 - 17032424
Alignment:
Q  261 cgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaaga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17032582 cgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaaga 17032483  T
Q  361 gttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17032482 gttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 17032424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Original strand, 18197728 - 18197966
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||| | || || ||| ||| ||||||||    
T  18197728 aagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtcggaaagaccttaagtttcaagagggatatcatgtatttctgaaagtcactc 18197827  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
     ||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||| ||  | | |||||||| ||    
T  18197828 ttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtctgtataagatatcggaaagaatttaaacagtggcgtatcg 18197927  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18197928 agtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 18197966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 419
Target Start/End: Original strand, 14131361 - 14131598
Alignment:
Q  182 agatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  14131361 agatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactcc 14131460  T
Q  282 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccga 381  Q
    | |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| | ||||| ||  ||    
T  14131461 tatgacaggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatctgagagagttggaacagtggcatataga 14131560  T
Q  382 gttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || || || ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14131561 gtgggtttgccacaacatctttcgaatttgcatgatgt 14131598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 416
Target Start/End: Original strand, 11280518 - 11280921
Alignment:
Q  13 tttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgg 112  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || || || || |||||||| || |||||||||||||    
T  11280518 tttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatgatcgaagatgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgg 11280617  T
Q  113 gtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagag 212  Q
    | || |||||  |||||||||| ||  | |||||  | ||||| || || || | | | || |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11280618 gagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagag 11280717  T
Q  213 ttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtca 312  Q
     |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||| |||| ||||| |||| ||| || || ||     
T  11280718 ctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagaatcacacctatgacaggtgtaggacatgcattaaaatct 11280817  T
Q  313 aagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgc 412  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||||| || |||||||| |||||||    
T  11280818 aagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcaaatttgc 11280917  T
Q  413 atga 416  Q
    ||||    
T  11280918 atga 11280921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 16382377 - 16382699
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  16382377 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 16382476  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  16382477 ttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 16382575  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  16382576 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 16382675  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||    
T  16382676 tttaaagtgtaggaagttgactcc 16382699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16098327 - 16098005
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  16098327 ttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtatcggtatggctccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 16098228  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||   |||| ||||||||  | || || ||||||||  | || || | |||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |    
T  16098227 ttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtcttagagtag 16098128  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||    
T  16098127 acagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgct 16098028  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  16098027 ttgaagtgtaggaagttgactcc 16098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 15078368 - 15078690
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||||| ||| || || || ||||    
T  15078368 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatgatcggaggtgtaagacaccgttgtgttggt 15078467  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||   |||| ||||||||  | || || ||||||||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |    
T  15078468 ttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccgagaaaagatgaaagcgtctcagagtag 15078567  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||| ||| | |||||||| |  || || || || ||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  15078568 acataagagttatcatgataagaagagaaaggatatcgagtttcaggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgtgct 15078667  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  15078668 ttgaagtgtaggaagttgactcc 15078690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23996525 - 23996203
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  23996525 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcactgtttgaggccttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 23996426  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  23996425 ttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 23996327  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || ||||||||||| || || | |||| |||| || ||||| |||||    
T  23996326 gacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgc 23996227  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  23996226 tttgaagtgtaggaagttgactcc 23996203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 25743095 - 25743413
Alignment:
Q  7 attgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttg 106  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||    
T  25743095 attgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggagctgtaggacaccgttgtgttggtttg 25743194  T
Q  107 agtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 206  Q
    |||| ||||| |||| | ||| || ||||||  | || || ||||||||||| || || | ||||||   ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  25743195 agtcaggtgaaagtgctttgtagg-accggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtagaca 25743293  T
Q  207 aaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttg 306  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||    
T  25743294 gaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttg 25743393  T
Q  307 aagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||  | ||||||||||||    
T  25743394 aagtgtaggaagttgactcc 25743413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11291916 - 11291818
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagt 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11291916 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 11291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 18837912 - 18838234
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||  | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  18837912 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatccgaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 18838011  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| | ||||||  | || || ||||||||||| || || | ||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||      
T  18838012 ttgagtccggagagagtgctatgttagcaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtac 18838111  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    | | |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||| | || | ||||||||| |||||||| | ||||    
T  18838112 atagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgct 18838211  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  18838212 ttgaagtgtaggaagttgactcc 18838234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 416
Target Start/End: Original strand, 11287782 - 11288014
Alignment:
Q  184 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||     
T  11287782 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcaccccta 11287881  T
Q  284 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagt 383  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||| | ||||| ||  | ||    
T  11287882 tgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 11287981  T
Q  384 tggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
     || ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  11287982 gggtttaccccctcatctttcaaatttgcatga 11288014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 1648788 - 1649094
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  1648788 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 1648887  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || |||| || | | || ||||||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  1648888 ttgagtccggagagaatgctttattaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gaaaagatgaaggcgtctcagagta 1648986  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  1648987 gacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 1649086  T
Q  303 tttgaagt 310  Q
    ||||||||    
T  1649087 tttgaagt 1649094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25751024 - 25750900
Alignment:
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25751024 gacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgc 25750925  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactccg 327  Q
     ||||| || ||||||| |||||||    
T  25750924 gttgaaatctaagaagtggactccg 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16233478 - 16233167
Alignment:
Q  12 gtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcg 111  Q
    ||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || |||||||||||     
T  16233478 gtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtcc 16233379  T
Q  112 ggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaga 211  Q
    || ||||||| | |||| |||| |||  | || || ||||||||||| || || | ||| ||   ||| |||||||| ||||| || ||| |||| ||||    
T  16233378 ggagagagtgctttgttaggactggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagattattcaagaaaagatgaaggcgtctcaaagtagacagaaga 16233279  T
Q  212 gttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtc 311  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| |||||||     
T  16233278 gttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgcgttgaagtg 16233179  T
Q  312 aaagaagttgac 323  Q
     | |||||||||    
T  16233178 taggaagttgac 16233167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22434146 - 22433927
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  22434146 ttgatagagttcacttacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 22434047  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22434046 ttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 22433947  T
Q  204 acaaaagagttatcatgata 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22433946 acaaaagagttatcatgata 22433927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 21412942 - 21413248
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | ||| || | ||| |||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  21412942 ttgattgagtttacttacaataacagttttcattctaatatcggtatggcactgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 21413041  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || |   |||| |||||||   | || || || |||||||| || || | |||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |    
T  21413042 ttgaatccggagaaagcgcattgttaggaccgggagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtctcagagtag 21413141  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||  |||| ||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  21413142 accgaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatatgttcttgtgagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgct 21413241  T
Q  304 ttgaagt 310  Q
    |||||||    
T  21413242 ttgaagt 21413248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Original strand, 5297227 - 5297308
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5297227 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 5297308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 350 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 22433928 - 22433859
Alignment:
Q  350 tatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433928 tatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 22433859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18571925 - 18571622
Alignment:
Q  7 attgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttg 106  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || ||| | ||||| || || ||||||||  ||||||||||||| |  || || |||||||    
T  18571925 attgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatgactccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacactgttgtgttggtttg 18571826  T
Q  107 agtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgac 205  Q
    |||| ||||| |||| | | ||  |||| ||  |  | || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||| |||    
T  18571825 agtcaggtgaaagtgctttattaagaccagaagttatgcaagaaactacggaaaatgttaagatgattcag-gagaaaaggaaagcgtctcagagtagac 18571727  T
Q  206 aaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcttt 305  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || || |||||||| || | || |||||| | |||||| ||||||||    
T  18571726 agaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccgatgttggtcgtgcttt 18571627  T
Q  306 gaagt 310  Q
    |||||    
T  18571626 gaagt 18571622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25655587 - 25655456
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||| |  || || || ||||||||||||||     
T  25655587 agagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcataataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtg 25655488  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaa 308  Q
    | ||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  25655487 aatctgataactggtgttggtcgtgctttgaa 25655456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 1652350 - 1652266
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtagga 88  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  1652350 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagga 1652266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 37677511 - 37677092
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37677511 cctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 37677412  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  37677411 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagag 37677312  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttt-ttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 299  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  37677311 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttcttgagggtcactcctttgacgggtgttggacg 37677212  T
Q  300 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcat 399  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||| || ||||| |||    
T  37677211 tgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacat 37677112  T
Q  400 ctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  37677111 ctttcgaacttgcacgatgt 37677092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20294840 - 20294425
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20294840 ttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggttggaggtgtaggactcctttatgctggt 20294741  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  20294740 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcagaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcg 20294641  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20294640 acagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgct 20294541  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  20294540 ttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 20294441  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| ||||| |||||    
T  20294440 cgaacttgcacgatgt 20294425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 419
Target Start/End: Original strand, 31550133 - 31550527
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31550133 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttg 31550232  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31550233 tgttgggaccggatttagttcatgagactacggagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaa 31550332  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| |  |||||||||    
T  31550333 gcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgact 31550432  T
Q  325 ccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31550433 cctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgt 31550527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 417
Target Start/End: Original strand, 19760818 - 19761210
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  19760818 aacagttatcattctagtattggaatgacacctttcgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtag 19760917  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    | |||||||| ||| | |||||  | ||||| ||||| || | | |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19760918 ttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 19761017  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19761018 gcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgattggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgact 19761117  T
Q  325 ccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgat 417  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19761118 ccgagatttattggaccgtatcagatatccgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcatgat 19761210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 17044973 - 17045355
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  17044973 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 17045072  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17045073 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag 17045172  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17045173 gaaggatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaga 17045272  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045273 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 17045355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 20939994 - 20940409
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20939994 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgttatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtataggactcctttatgctagt 20940093  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20940094 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcaaactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcg 20940193  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  20940194 acagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 20940293  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  20940294 ttgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 20940393  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  20940394 cgaacttgcatgatgt 20940409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20250278 - 20249863
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  20250278 ttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 20250179  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||  | || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20250178 ttgagtcaagcgaaagagtggtcttaggaccagagatcgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 20250079  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20250078 acaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagcg 20249979  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20249978 ttgaagtcaaagaagttgactccgaaatttattgttccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcaccttt 20249879  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  20249878 cgaatttgcacgatgt 20249863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19854737 - 19854327
Alignment:
Q  9 tgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgag 108  Q
    |||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19854737 tgagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcacggttcgaagctttgtatagtcggaggtgcaggactcctttacgctggtttgag 19854638  T
Q  109 tcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaa 208  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19854637 tcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacaga 19854538  T
Q  209 agagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaa 308  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || |||||    
T  19854537 agagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaa 19854438  T
Q  309 gtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaat 408  Q
    ||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || |||||  |||||||||||    
T  19854437 gtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccaaatctttcgaat 19854338  T
Q  409 ttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||    
T  19854337 ttgcatgatgt 19854327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 33390960 - 33391369
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  33390960 ttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 33391059  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33391060 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 33391159  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33391160 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 33391259  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  33391260 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 33391359  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  33391360 cgaatttgca 33391369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19106768 - 19106386
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||  | |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  19106768 tatcattctagtattggaatggcaccttttgagtctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttag 19106669  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19106668 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcggag 19106569  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  19106568 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 19106469  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19106468 tttattggtccatatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattactaccgcatctttcgaatttgca 19106386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 16350530 - 16350939
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16350530 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16350629  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16350630 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 16350729  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16350730 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 16350829  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16350830 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 16350929  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  16350930 cgaatttgca 16350939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21830725 - 21830322
Alignment:
Q  10 gagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 109  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  21830725 gagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagt 21830626  T
Q  110 cgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| ||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21830625 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 21830526  T
Q  210 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaag 309  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21830525 gagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaag 21830426  T
Q  310 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatt 409  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21830425 tcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatt 21830326  T
Q  410 tgca 413  Q
    ||||    
T  21830325 tgca 21830322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 51333424 - 51333833
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  51333424 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 51333523  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51333524 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 51333623  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  51333624 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 51333723  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  51333724 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 51333823  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  51333824 cgaatttgca 51333833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 20856692 - 20857104
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20856692 ttgatagaatttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 20856791  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20856792 tcgagtcgggagaaagtgttgtgttggggctggaattggttcatgaaactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagtgtcgcagagtcg 20856891  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| |||||| ||||| ||||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  20856892 acaaaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgca 20856991  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || ||| | ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  20856992 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatcttt 20857091  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  20857092 cgaatttgcatga 20857104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 177 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20137033 - 20136791
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20137033 agagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagacctcgtgtttttgagagtc 20136934  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  | |||||||    
T  20136933 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttgggacagtggcgt 20136834  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20136833 atcgtgttggtttaccacggcatctttcgaatttgcacgatgt 20136791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 50620202 - 50620590
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  50620202 tatcattctagtattggaattgcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttag 50620301  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620302 gacctgagattgttcaataaactactgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 50620401  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  50620402 gaaagaccttgagtttcaagaggaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagg 50620501  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50620502 tttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgt 50620590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 20835819 - 20836237
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20835819 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggctccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtagaactcctttatgctggt 20835918  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20835919 ttgagtcaggagagagtgttgttttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 20836018  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| | || |  ||| ||||| | || || || || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |     
T  20836019 acataagagttatcatgacaagcgttggaaggcccttaagttttaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtaca 20836118  T
Q  304 ttgaagtc---aaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    || |||||    |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  20836119 tttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatc 20836218  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  20836219 tttcgaacttgcatgatgt 20836237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21837378 - 21836969
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||| || || ||||    
T  21837378 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgacgctttgtatggtcggagatgcacaactccgttgtgttggt 21837279  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| |||| |||   |||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21837278 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagacagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcatagtcg 21837179  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21837178 acaaaagagttatcatgatcagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 21837079  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  21837078 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 21836979  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  21836978 cgaatttgca 21836969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 41354400 - 41354809
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  41354400 ttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 41354499  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | || || ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41354500 ttgaatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 41354599  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41354600 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 41354699  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||  |||  || |||||||| |||||| | |  |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  41354700 ttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 41354799  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  41354800 cgaatttgca 41354809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 92 - 419
Target Start/End: Original strand, 19664895 - 19665222
Alignment:
Q  92 ctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagc 191  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19664895 ctttatgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggatcggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagc 19664994  T
Q  192 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggt 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||| |||| ||     
T  19664995 gtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggg 19665094  T
Q  292 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattac 391  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || |    
T  19665095 gtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgc 19665194  T
Q  392 caccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19665195 caccacatctttcgaatttgcatgatgt 19665222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21747785 - 21747548
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  21747785 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataataagcgtagaaa-gatcttgagtttctagaaggagaccacatatgtttgagagtcactc 21747687  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21747686 ctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaatccgagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 21747587  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21747586 agtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgt 21747548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 419
Target Start/End: Original strand, 22433048 - 22433462
Alignment:
Q  5 tgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtt 104  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433048 tgatagagttcacatataacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccattcgaagctttgtatggttggaggtgtaggactcctttatgctggtt 22433147  T
Q  105 tgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcga 204  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22433148 tgagtcaggagcgagtgtggtgttgggaccgaatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcga 22433247  T
Q  205 caaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctt 304  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||||||||| || || || || |||||  |||| || |||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  22433248 cagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttcaggagggtgatcatgtgttcctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcat 22433347  T
Q  305 tgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttc 404  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  || || ||| |||||||| | ||||| || |||| | | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||    
T  22433348 tgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggttcgtatcagatttcagagagggttgcaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttc 22433447  T
Q  405 gaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| ||||||||||    
T  22433448 gaatatgcatgatgt 22433462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 16078610 - 16078979
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  16078610 tatcattctagtattggaatggcaccttttaaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 16078709  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16078710 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag 16078809  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
                       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16078810 -------------------gaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgaga 16078890  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16078891 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 16078979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16369548 - 16369310
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  16369548 aagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagggttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactc 16369449  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16369448 ctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccg 16369349  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369348 tgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 16369310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41308253 - 41307891
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||    
T  41308253 ttgatagagttcacgtacaacaacaattagcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcatgactcctttatgttggt 41308154  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41308153 ttgagttgggagaaagtgtggtgttgggactggatttggttcatcagactacggagaaagtcaaaataataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 41308054  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||| |||| |||||  |||||||     
T  41308053 acagaagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttgagtttcaagagggagaccatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtatgacgtgca 41307954  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgga 366  Q
    |||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  41307953 ttgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttgga 41307891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 259 - 419
Target Start/End: Original strand, 50612602 - 50612762
Alignment:
Q  259 cacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaa 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50612602 cacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaa 50612701  T
Q  359 gagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||  |||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50612702 gagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgt 50612762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11382903 - 11382678
Alignment:
Q  123 tgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  11382903 tgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgac 11382804  T
Q  223 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 322  Q
    ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  11382803 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttga 11382704  T
Q  323 ctccgagatttattggtccgtatcag 348  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||    
T  11382703 ctcctaagtttattggtccgtatcag 11382678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 419
Target Start/End: Original strand, 20075128 - 20075405
Alignment:
Q  142 gttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||    
T  20075128 gttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttg 20075227  T
Q  242 agtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 341  Q
    ||||||| || || || || || ||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||    
T  20075228 agtttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtcc 20075327  T
Q  342 gtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||| | ||||| ||   |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20075328 gtatcagatttcagagagagtgggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 20075405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 20831323 - 20831645
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  20831323 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 20831422  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || || || |||| | |||| || |||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  20831423 ttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 20831521  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  20831522 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 20831621  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||    
T  20831622 tttaaagtgtaggaagttgactcc 20831645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20914638 - 20914316
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  20914638 ttgattgagtttacttacaaaaacaattttcatactagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 20914539  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || || |||| | |||| | ||||||  | || || ||||||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  20914538 ttgagtccggagaaagtgctatgttagaaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 20914440  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    || | |||||||||||| ||||  | ||||| ||| ||||||||||||  || || || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  20914439 gagagaagagttatcattataaatggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgc 20914340  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  20914339 tttgaagtgtaggaagttgactcc 20914316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21163381 - 21163299
Alignment:
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  21163381 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgca 21163299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20244437 - 20244213
Alignment:
Q  195 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtt 294  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| |||||     
T  20244437 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgtg 20244338  T
Q  295 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccac 394  Q
    |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||    
T  20244337 ggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttccac 20244238  T
Q  395 cgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  20244237 cacatctttcgaacttgcatgatgt 20244213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 271
Target Start/End: Original strand, 22135489 - 22135756
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| | | | || ||||| | |||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||    
T  22135489 ttgattgattttacttacaacaacagtttttattctagtatcgatatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacgccattgtgttggt 22135588  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||  | || || || |||||| | ||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||     
T  22135589 ttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactacgaaaaaagttaagatgattcag-gggaagatgaaagcgtctcagagta 22135687  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttga 271  Q
    | || |||||||||||||||||| | ||||| ||  || ||||||| |  || ||||| ||||||||||    
T  22135688 ggcagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattaagtttcaggttggtgaccatgtgtttttga 22135756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 419
Target Start/End: Original strand, 20395194 - 20395339
Alignment:
Q  274 gtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtgg 373  Q
    ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| |||||||||   ||||    
T  20395194 gtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtgg 20395293  T
Q  374 cgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20395294 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgt 20395339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 46518975 - 46518827
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 277  Q
    |||||||| ||  |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || |    
T  46518975 gagaagattaagacgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 46518876  T
Q  278 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  46518875 atcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 46518827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 19663067 - 19663161
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatg 98  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  19663067 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtccatgactcctttatg 19663161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20184610 - 20184364
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| | ||| || ||||| |||||| |||||||    |  |||||||| |||| ||||||||| || || || ||||    
T  20184610 ttgattgagtttactaacaacaacagttttcattctagtatcggtatgacaccgtttttggttttgtatggacggatgtgtaggacgccgttgtgttggt 20184511  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
     || ||  || || |||| | |||| |||||| |  |||| || ||||||| | ||||||| | |||||||  ||||||||||  || ||| |||||| |    
T  20184510 atgtgtaaggagaaagtgatttgttaggaccgaaagtggtacaagagactatgaagaaagtgaagatgatccaagagaagatgtgagtgtctcagagtag 20184411  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
     || ||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  20184410 gcagaagagttataatgataagaggaggaaagatattgagtttcaag 20184364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Original strand, 22142232 - 22142294
Alignment:
Q  264 gtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22142232 gtttttgagagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcc 22142294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 310
Target Start/End: Original strand, 21202391 - 21202524
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||| |  || || ||  |||||||||||||     
T  21202391 agagaagatgaaagcatctcagagaaggcagaagagttatcatgataagaggacaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatatgtttttgagagtg 21202490  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 310  Q
    | |||| | || |||||||||||| |||||||||    
T  21202491 aatcctataaccggtgttggacgtactttgaagt 21202524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 31539925 - 31539953
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacag 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31539925 cctttgattgagtttacttataacaacag 31539953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 47123989 - 47123571
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47123989 cctttgattgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 47123890  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47123889 ggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 47123790  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  47123789 tcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgg 47123690  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  47123689 gctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatc 47123590  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  47123589 tttcgaatttgcacgatgt 47123571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12498253 - 12497865
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  12498253 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 12498154  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498153 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 12498054  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498053 gaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 12497954  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497953 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 12497865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 14876597 - 14877012
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14876597 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 14876696  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || |  || || ||||| ||  | |||||  ||||||| ||||| || | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14876697 ttgagtcaggtgaaagagcggtcttaggacccgagattgttcagcagactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 14876796  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14876797 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgtgct 14876896  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14876897 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccactgcatcttt 14876996  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  14876997 cgaatttgcatgatgt 14877012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 10384014 - 10383596
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10384014 cctttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttgtgct 10383915  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10383914 ggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 10383815  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||    
T  10383814 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgt 10383715  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| || |    
T  10383714 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacacc 10383615  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  10383614 tttcgaacttgcacgatgt 10383596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17489855 - 17489467
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || || |||||||| || ||||| || || || || |    
T  17489855 tatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttag 17489756  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489755 gaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 17489656  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489655 gaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 17489556  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17489555 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgt 17489467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 16329746 - 16330161
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16329746 ttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctctatgttggt 16329845  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  16329846 ttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcacagagtcg 16329945  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  16329946 acataagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacaggtgttggacgtgca 16330045  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | | |||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  16330046 ttgaagtcgaggtagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 16330145  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  16330146 cgaacttgcatgatgt 16330161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16371445 - 16371034
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16371445 ttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16371346  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16371345 ttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 16371246  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16371245 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaagaagaagactacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgct 16371146  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  16371145 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgggacggtggcgtattgagtgggattaccaccgcatcttt 16371046  T
Q  404 cgaatttgcatg 415  Q
    ||||||||||||    
T  16371045 cgaatttgcatg 16371034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9522724 - 9522336
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || || |    
T  9522724 tatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtcttggtttgagtcaggtgagagagtggtcttag 9522625  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || |  |||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9522624 gaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtag 9522525  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522524 aaaagatcttgactttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 9522425  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9522424 tttattggtccgtatcagatatcaaaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgt 9522336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 16492279 - 16492694
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16492279 ttgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatgacaccttgtgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16492378  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||  || ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16492379 ttgtatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 16492478  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16492479 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagct 16492578  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16492579 ttaaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttt 16492678  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| || |||||    
T  16492679 cgaattttcacgatgt 16492694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 416
Target Start/End: Original strand, 10420150 - 10420544
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  10420150 aacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtg 10420249  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10420250 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagaccacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatga 10420349  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  10420350 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 10420449  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||| |  || |||||||| |||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||  || |||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10420450 actccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagtcggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatga 10420544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10906242 - 10905833
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| || || ||||    
T  10906242 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggt 10906143  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10906142 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 10906043  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10906042 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 10905943  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  10905942 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttt 10905843  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  10905842 cgaatttgca 10905833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 18134433 - 18134848
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18134433 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggt 18134532  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18134533 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagataaagtcaaaatgatcggagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 18134632  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || |  || ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||     
T  18134633 acagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcttgtatttctgagagttactcctatgactggtgtaggacgtgcc 18134732  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  18134733 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatcttt 18134832  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    | || |||||||||||    
T  18134833 caaacttgcatgatgt 18134848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10005632 - 10005223
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  10005632 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 10005533  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10005532 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 10005433  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10005432 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 10005333  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  10005332 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttg 10005233  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  10005232 cgaatttgca 10005223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 15348343 - 15348752
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  15348343 ttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 15348442  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || |||||  |  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15348443 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 15348542  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15348543 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 15348642  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  15348643 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 15348742  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  15348743 cgaatttgca 15348752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15227691 - 15227276
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  15227691 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagatttgtatggttggaggtgcagaactccgttatgttggt 15227592  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||| ||||  ||||  |||||||||| ||||| |||||  |||||||  | || ||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15227591 ttgagtcgagtgaaggtgtaatgttgggaccagatttagttcagcagactacaaaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagtgtcgcagagtcg 15227492  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  15227491 acagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgcc 15227392  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  15227391 ttgaaatcgaagaagttgacgccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatcttt 15227292  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  15227291 cgaatttgcatgatgt 15227276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 15953055 - 15953470
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||    
T  15953055 ttgatagagttcacgtacaacaacagttgccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgtttgt 15953154  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15953155 ttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 15953254  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||| | |||||| |||| |||||  |||||||     
T  15953255 acaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagatttactcctatgacgggtgtacgacgtgca 15953354  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||||||| |||| || || |||||| | ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||    
T  15953355 ttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggttcgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatcttt 15953454  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  15953455 cgaatttgcatgatgt 15953470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 415
Target Start/End: Original strand, 13322736 - 13323150
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  13322736 cctttgatagagtttacctacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtacggtcggaggtgcagaactcctttatgct 13322835  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  13322836 ggtttgagtcaggtcagagtgctgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagaaaggatgaaagcgtcgcagag 13322935  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||    
T  13322936 tcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttgggtttcaggagggagaccatgtgtttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgt 13323035  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||  || ||  ||||| | ||||| ||  |  |||| || ||||| ||||    
T  13323036 gcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatattggagaggattggaacagtggcatataggattggttttccaccacatc 13323135  T
Q  401 tttcgaatttgcatg 415  Q
    |||||||||||||||    
T  13323136 tttcgaatttgcatg 13323150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 40 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13252686 - 13252313
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| || || || || || || || ||||| ||      
T  13252686 agtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaga 13252587  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252586 ttgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 13252487  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  13252486 tgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggt 13252387  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13252386 ccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 13252313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 15589490 - 15589899
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  15589490 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 15589589  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15589590 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 15589689  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15589690 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 15589789  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  15589790 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 15589889  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  15589890 cgaatttgca 15589899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16635805 - 16635396
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16635805 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16635706  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16635705 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 16635606  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  16635605 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgct 16635506  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  16635505 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatcttt 16635406  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  16635405 cgaatttgca 16635396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 43163129 - 43162720
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  43163129 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 43163030  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43163029 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 43162930  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  43162929 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgct 43162830  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  43162829 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatcttt 43162730  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  43162729 cgaatttgca 43162720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 53385116 - 53385525
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  53385116 ttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 53385215  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53385216 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 53385315  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53385316 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgct 53385415  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| || |||||||| ||||  || |||||||| |||||| | |  |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  53385416 ttgaagtcgaaaaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 53385515  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  53385516 cgaatttgca 53385525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 15725059 - 15725440
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  15725059 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 15725158  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||| || ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725159 gaccagagattgttcagcagactactgagaaattc-ggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 15725257  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  15725258 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaag 15725357  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15725358 tttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 15725440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 20062152 - 20062561
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  20062152 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 20062251  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20062252 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 20062351  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  20062352 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgct 20062451  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  20062452 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 20062551  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  20062552 cgaatttgca 20062561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 48425479 - 48425070
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  48425479 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcaaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 48425380  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||  ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48425379 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggactagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 48425280  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48425279 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 48425180  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  48425179 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 48425080  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  48425079 cgaatttgca 48425070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 16807051 - 16807439
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  16807051 tatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 16807150  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| |  |||||   |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  16807151 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagaattatcatgataagcgcag 16807250  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16807251 aaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgaga 16807350  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| | |||||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16807351 tttttcggtccgtatcagatatcgaaaaaatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgt 16807439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16692192 - 16691777
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||  || || ||||| || || ||||    
T  16692192 ttgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggt 16692093  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| || ||||| | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16692092 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcagactactgaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 16691993  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16691992 acagaagagttatcatgataagcgcaagaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcc 16691893  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  16691892 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgggtcgtatcaaatatcggaaagggttggaacggtggcatatcgtgtgggattaccaccgcatcttt 16691793  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  16691792 cgaatttgcacgatgt 16691777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 26792524 - 26792906
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  26792524 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 26792623  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792624 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 26792723  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  26792724 gaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttaagagtcactcctatgactagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 26792823  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26792824 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtggatttaccgccgcatctttcgaatttgca 26792906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6600779 - 6600370
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||  || || ||||    
T  6600779 ttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggt 6600680  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6600679 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 6600580  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6600579 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 6600480  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||| | |  |||| ||||||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6600479 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 6600380  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  6600379 cgaatttgca 6600370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 16756683 - 16757092
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16756683 ttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcatcgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16756782  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| | ||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16756783 ttgagtcagatgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 16756882  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16756883 acagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 16756982  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |  |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16756983 ttgaagtcgaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcatattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 16757082  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  16757083 cgaatttgca 16757092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 13972207 - 13972619
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  13972207 ttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggt 13972306  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  | |||||||| || || | | | || |||||   |||||||||||||||||||||    
T  13972307 ttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcg 13972406  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  13972407 acagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgca 13972506  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  13972507 ttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatcttt 13972606  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  13972607 cgaatttgcatga 13972619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 8759169 - 8759584
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  8759169 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 8759268  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8759269 ttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 8759368  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  8759369 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 8759468  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  8759469 ttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 8759568  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  8759569 cgaacttgcatgatgt 8759584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 11961121 - 11961536
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11961121 ttgattgagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 11961220  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||||  ||||| || || |||||||| || | |||||||||    
T  11961221 ttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatgtggttcatgagacgactgaaaaggtcaaaatgataagggaaaagatgaaggctttgcagagtcg 11961320  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||     
T  11961321 acagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgagtgtacgacgtgca 11961420  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||   ||||| ||  ||||||  || || || |||||||    
T  11961421 ttgaagtcgaggaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtggcttatagagttgatttgcccccacatcttt 11961520  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  11961521 cgaacttgcatgatgt 11961536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 413
Target Start/End: Original strand, 15402614 - 15403017
Alignment:
Q  10 gagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 109  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  15402614 gagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttacatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 15402713  T
Q  110 cgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| ||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15402714 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 15402813  T
Q  210 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaag 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  15402814 gagttatcacgataagcgtagaaaagattttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaag 15402913  T
Q  310 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatt 409  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  15402914 tcaaagaagttgaccccgatgttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatt 15403013  T
Q  410 tgca 413  Q
    ||||    
T  15403014 tgca 15403017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15248158 - 15247764
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||| | ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  15248158 aacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatagtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtgg 15248059  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    | || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15248058 ttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgataa 15247959  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    |||||| ||| |   |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15247958 gcgtaggaaaaacaatgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgact 15247859  T
Q  325 ccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||| | ||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15247858 ccgaggtgtattggtccgtattagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 15247764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15208923 - 15208508
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  15208923 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggacggagatgcagaactccgttgtgttggt 15208824  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15208823 ttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcg 15208724  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  15208723 acagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacattgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgca 15208624  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  15208623 ttgaagtaaaagaagttgactccgaggtttattggtccgaatcagatatcagaaagaattggaacggtggagtatcgagtgggtttacaaccgcatcttt 15208524  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| || |||||    
T  15208523 cgaattttcacgatgt 15208508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15339295 - 15338892
Alignment:
Q  10 gagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 109  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |  || ||||| || |||||||||||||    
T  15339295 gagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatacagaactccgttgtgctggtttgagt 15339196  T
Q  110 cgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| ||||| ||   |||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15339195 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcatcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagcaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 15339096  T
Q  210 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  15339095 gagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaag 15338996  T
Q  310 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatt 409  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  15338995 tcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtagcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatt 15338896  T
Q  410 tgca 413  Q
    ||||    
T  15338895 tgca 15338892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Original strand, 11303893 - 11304275
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  11303893 tcgagtattggtaaggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccga 11303992  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |     
T  11303993 atttgattcatcaggctacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtatgaaggc 11304092  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
    ||||||||||||||| || || || || ||| |||||||    ||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||    
T  11304093 tcttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagttttccctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatt 11304192  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||   ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11304193 ggtccgtatcagatatcagagagggttggaatagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 11304275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 5425028 - 5425436
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| | ||| || || ||||| || || ||||    
T  5425028 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgttggt 5425127  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || |  || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5425128 ttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 5425227  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5425228 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgcttt-gagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 5425326  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5425327 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 5425426  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  5425427 cgaatttgca 5425436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 411
Target Start/End: Original strand, 16412407 - 16412787
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||  |||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  16412407 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggttggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 16412506  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | |||||  |||||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16412507 gaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttggcaaaagagttatcatgataagcgtag 16412606  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  16412607 gaatgaccttgagtttcatgaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 16412706  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttg 411  Q
    || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16412707 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttg 16412787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41177564 - 41177149
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  41177564 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 41177465  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41177464 ttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 41177365  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  41177364 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 41177265  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  41177264 ttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 41177165  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  41177164 cgaacttgcatgatgt 41177149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 12360629 - 12361044
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12360629 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattatgctggt 12360728  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||| ||| |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  12360729 ttgagtcaggagagagtgctgtattgggaccagacttggttcatcggactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcg 12360828  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| ||||||| ||| || ||||  |||| ||||||||     
T  12360829 acagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttacttctatgacatgtgtaggacgtgca 12360928  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  12360929 ttgaaatcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 12361028  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  12361029 cgaacttgcatgatgt 12361044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13942066 - 13941651
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  13942066 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 13941967  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13941966 ttgaataaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 13941867  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  13941866 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 13941767  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  13941766 ttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 13941667  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  13941666 cgaacttgcatgatgt 13941651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 16836615 - 16836941
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  16836615 aacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtg 16836714  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  16836715 ttgtgttgggaccagatttggttcatgagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatga 16836814  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
    |||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||    
T  16836815 taagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttg 16836914  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcag 348  Q
    |||||||  || |||||||||||||||    
T  16836915 actccgaagttcattggtccgtatcag 16836941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14571809 - 14571475
Alignment:
Q  85 aggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaaga 184  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  14571809 aggactcctttgtgttggtttgaatcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagaccacggagaaagtcaagatgataagagaaaaga 14571710  T
Q  185 tgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |    
T  14571709 tgaaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctat 14571610  T
Q  285 gactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagtt 384  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  ||||     
T  14571609 gacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttgactcctaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtg 14571510  T
Q  385 ggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14571509 ggcttgccaccatatctttcgaatttgcatgatgt 14571475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28754363 - 28754177
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28754363 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 28754264  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatga 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  28754263 ggtttgagtcgggtgaaagtgttgcgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatga 28754177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 16381015 - 16381429
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||    
T  16381015 ttgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatcgcaccgttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgctggt 16381114  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgtt--gggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagt 201  Q
    ||||||| || ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16381115 ttgagtccggagagagtgttatggttggggaccggatttggttcatgagactacagaaaaggtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagt 16381214  T
Q  202 cgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtg 301  Q
    ||||   ||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || || || ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||    
T  16381215 cgac---agagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgggatggtgatcatgtatttttaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtg 16381311  T
Q  302 ctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatct 401  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||  ||||  ||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||    
T  16381312 ctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatct 16381411  T
Q  402 ttcgaatttgcatgatgt 419  Q
     ||||| |||||||||||    
T  16381412 atcgaacttgcatgatgt 16381429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 419
Target Start/End: Original strand, 12850402 - 12850781
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12850402 agtattggtatggcaccgttcaaagatttgtatggtcggaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatt 12850501  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||| | |||||  | |||||||   |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  ||    
T  12850502 tagttcatcaaactacataaaaagtcaaattgataagagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaataaaggccct 12850601  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  12850602 tgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 12850701  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || || ||| |||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12850702 ccataccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttggaatttgcatgatgt 12850781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 44777289 - 44776874
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  44777289 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattatatggtcgaaggtgcaggactcctttgtgttggt 44777190  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44777189 tcgagacaggagaaagtgttgtgttgggaccagatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 44777090  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| | || || |  |||||||| ||||| || || || || ||| | |||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  44777089 acagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttgagttccaagagggtgatcatgtatttctaagagtcactccgatgacaggtgtaggacgtgct 44776990  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | |||||| |||||||  || ||||| ||||||||| | ||||| ||  | ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  44776989 ttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggcccgtatcagatttcagagaggatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 44776890  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  44776889 cgaacttgcatgatgt 44776874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14086715 - 14086303
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  14086715 ttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggt 14086616  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  | |||||||| || || | | | || |||||   |||||||||||||||||||||    
T  14086615 ttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcg 14086516  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  14086515 acagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgca 14086416  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||  | ||||| ||  | || || || || || |||||||    
T  14086415 ttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgccccctcatcttt 14086316  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  14086315 cgaatttgcatga 14086303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 346
Target Start/End: Original strand, 15015881 - 15016184
Alignment:
Q  43 attggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttgg 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || || |||| ||| || ||||||| ||| ||  | ||||| ||  | |    
T  15015881 attggaatggcaccgttcgaagcattgtatgatcggagatgcagaactccattgtgttggtatgaatccggtgagaatgtggtactaggaccagaaattg 15015980  T
Q  143 ttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 242  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | | |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15015981 ttcaacaaactacagagaaggttaagttgattagggagaagatgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttga 15016080  T
Q  243 gtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  | ||||| |||||  | |||||||| ||||||| ||||    
T  15016081 gtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggatgagcactaaagtcgaagaaactaactccgaggtttattgctccg 15016180  T
Q  343 tatc 346  Q
    ||||    
T  15016181 tatc 15016184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 8274497 - 8274819
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  8274497 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 8274596  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  8274597 ttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 8274695  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  8274696 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 8274795  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  8274796 tttgaagtgtaggaagttgactcc 8274819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 16742801 - 16743123
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  16742801 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttttgttggt 16742900  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  16742901 ttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 16742999  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  16743000 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtgtcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 16743099  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  16743100 tttgaagtgtaggaagttgactcc 16743123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17492672 - 17492489
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17492672 ttgatagagttcacatacaacaatagttatcattcgaatattggtatggcaccgatcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttaagctggt 17492573  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatga 187  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| || || |||||||    
T  17492572 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagggaaaagatga 17492489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15576792 - 15576470
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  15576792 ttgattgagtttacttacaacaacagtttgcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagaacaccgttatgttggt 15576693  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || |  ||||||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  15576692 ttgagtctggagagagtgctttgtttggaccggaagttgtgcgagagactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 15576594  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  15576593 gacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 15576494  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  15576493 tttgaagtgtaggaagttgactcc 15576470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18748707 - 18748401
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || ||||| |||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  | || || ||||    
T  18748707 ttgattgagtttagttacaacaacaattttcattctagtatcggtatggcaccgtttgagggtttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgttggt 18748608  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || ||||| |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||||| ||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||| |||||| |    
T  18748607 ttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagataagatgaaagtgtctcagagtag 18748508  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || ||  |  ||||||||||||  || || || |||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  18748507 acagaagagttatcatgataagaggaggaagaacattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttaagagtgaaccctgtaactggtgttggacgtgct 18748408  T
Q  304 ttgaagt 310  Q
    |||||||    
T  18748407 ttgaagt 18748401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4678480 - 4678305
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  4678480 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 4678381  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagaga 179  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  4678380 ttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacataaaaagtcaagatgatcagaga 4678305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13001933 - 13001770
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  13001933 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaaaactccattatgttggtttgagtcgggagaaagtg 13001834  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagat 185  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || |||| | |||| ||||| |||||    
T  13001833 tagtgttgggaccagatttagttcatcaaactacagaaaatgtcaagttgataagagaaaagat 13001770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17193126 - 17192892
Alignment:
Q  14 ttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcggg 113  Q
    ||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  ||    
T  17193126 ttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttgtgttggtttgaataagg 17193027  T
Q  114 tgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagt 213  Q
     || |||||||||||  |||||||  | || || |||| |||||| || || | ||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  17193026 agaaagtgttgtgttacgaccggaagttgtgcaagagagtacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagt 17192927  T
Q  214 tatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 248  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  17192926 tatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 17192892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 13975144 - 13975465
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  13975144 ttgattgagtt-acttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 13975242  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||  | |||| || |||||  | ||  | || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| || || ||||||     
T  13975243 ttgagtccggagagagtcctttgttagggccggaagttgtggaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcatctcagagta 13975341  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| ||||     
T  13975342 gacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgt 13975441  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  13975442 tttgaagtgtaggaagttgactcc 13975465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Original strand, 26009086 - 26009186
Alignment:
Q  10 gagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 109  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  26009086 gagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagt 26009185  T
Q  110 c 110  Q
    |    
T  26009186 c 26009186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14573971 - 14573887
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtagga 88  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14573971 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccaatcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 14573887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Original strand, 14183010 - 14183143
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | ||| |  |||||||||||||| || ||||| || |||||||   |||| ||||| || ||||| || ||||    
T  14183010 ttgattgagtttacttacaacaatagttttcatttaagtattggtatggctcctttcgatgctttgtatgagaggagatgtagaacacctttgtgttggt 14183109  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgga 137  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  14183110 atgagtcgagtgaaagtgttgtgttgggatcgga 14183143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 6712507 - 6712728
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | ||  || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||  | |||||||| || || || || ||||    
T  6712507 ttgattgagtttacttacaacaacaattttccttctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtagaacgccgttgtgttggt 6712606  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
     |||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||  | || || | ||||||   | |||||||||||||||| |||||| |    
T  6712607 atgagtcaggcgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtacaagagactacataaaaggttaagatgattcaaaagaagatgaaagcgtctcagagtag 6712706  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataag 225  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  6712707 gcagaagagttatcatgataag 6712728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Original strand, 267356 - 267462
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || ||||    
T  267356 ttgattgagtttacctacaacaacagttttcattcgagtattgggataacaccgtttgaagctttatatgggaggaggtgtaggaatccgttgtgttggt 267455  T
Q  104 ttgagtc 110  Q
     ||||||    
T  267456 atgagtc 267462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 6152949 - 6153243
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    |||||||||||||| || |||||||  | ||| || ||||| |  ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  6152949 ttgattgagtttacatacaacaacaattttcattctagtatcgagatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 6153048  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || || || ||||||||||| ||  ||||  | || || ||||||||||| || || | ||||| |||| |||||||||||||||||            
T  6153049 ttgaatccggagaaagtgttgtgttagggtcggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaagcgtc-------- 6153139  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
         |||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||  || || || |||||| ||||||| | || |||||| ||||| || |||||    
T  6153140 ----taagagttatcatgataagaggagaaaggatattaagtttcaagttggtgatcatgtgtttctgagagtgaatcatgtgaccggtgtcggtcgtgc 6153235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 326
Target Start/End: Original strand, 6153141 - 6153259
Alignment:
Q  208 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttga 307  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||  || || || |||||| ||||||| | || |||||| ||||| || ||||||||||    
T  6153141 aagagttatcatgataagaggagaaaggatattaagtttcaagttggtgatcatgtgtttctgagagtgaatcatgtgaccggtgtcggtcgtgctttga 6153240  T
Q  308 agtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||  |  |||||||||||    
T  6153241 agtgcagaaagttgactcc 6153259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21686783 - 21686681
Alignment:
Q  208 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttga 307  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||  || || || || ||||| ||||| | || ||| || | |||||||||||||||||    
T  21686783 aagagttatcattataagaggagaaaagatattcagtttcaagttggtgatcatgtattttttagagtgaatcatgtaaccgatgttggacgtgctttga 21686684  T
Q  308 agt 310  Q
    |||    
T  21686683 agt 21686681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31945177 - 31945099
Alignment:
Q  341 cgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||   |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31945177 cgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 31945099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 419
Target Start/End: Original strand, 31689049 - 31689125
Alignment:
Q  343 tatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31689049 tatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgcatgatgt 31689125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 11358270 - 11358688
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11358270 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 11358369  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11358370 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 11358469  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  11358470 tcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggtcgt 11358569  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  11358570 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 11358669  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  11358670 tttcgaacttgcacgatgt 11358688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31830705 - 31830287
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31830705 cctttgattgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 31830606  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31830605 ggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 31830506  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  31830505 tcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgg 31830406  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  31830405 gctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatc 31830306  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  31830305 tttcgaatttgcacgatgt 31830287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24675533 - 24675117
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  24675533 ttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattgtgttggt 24675434  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||| |||||||    
T  24675433 ttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcg 24675334  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24675333 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgct 24675234  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24675233 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatcttt 24675134  T
Q  404 cgaatttgcatgatgtc 420  Q
     ||||||||||||||||    
T  24675133 tgaatttgcatgatgtc 24675117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20833032 - 20832614
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20833032 cctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 20832933  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  20832932 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgtagag 20832833  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||     
T  20832832 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgg 20832733  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  20832732 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc 20832633  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  20832632 tttcgaacttgcacgatgt 20832614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 177 - 420
Target Start/End: Original strand, 22757035 - 22757278
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22757035 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaagagaccacgtgtttttgagagtc 22757134  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22757135 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 22757234  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757235 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 22757278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1063798 - 1063380
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1063798 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 1063699  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  1063698 ggtttgagtcgtgtgagagtgttgtgttgggaccagatttggtacatgagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgagagcttcgcagag 1063599  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||     
T  1063598 tcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgg 1063499  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||  | ||||| ||  ||||||  || ||||| ||||    
T  1063498 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaattggtactgtggcatatagagttgctttgccaccacatc 1063399  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  1063398 tttcgaacttgcacgatgt 1063380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 24707881 - 24708293
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  24707881 ttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 24707980  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24707981 ttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 24708080  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708081 acaaaagaaatatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 24708180  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24708181 ttgaagtcaaagaagttgactcctagattttttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttt 24708280  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  24708281 cgaatttgcatga 24708293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 40 - 419
Target Start/End: Original strand, 21325701 - 21326080
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| || || || || | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||      
T  21325701 agtattggaatggcaccttttgaggctttatctggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcgggtgaaagagtggtcttaggaccagaga 21325800  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  | || || |||||||| | ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21325801 ttgttcaacaaaccactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatct 21325900  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21325901 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagt 21326000  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326001 ccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 21326080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23276820 - 23276405
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23276820 ttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacttctttatgctggt 23276721  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23276720 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagtcatgatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 23276621  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| ||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||     
T  23276620 acataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagatttactcctatgatgggtgtgggacgtgca 23276521  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |  |||| |||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  23276520 ttgaagtcgagtaagtcgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 23276421  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  23276420 cgaacttgcatgatgt 23276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23064094 - 23063706
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  23064094 tatcattcaagtattggaatggcaccttatgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggtcttag 23063995  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | ||| |  | ||||| ||||| || | ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23063994 gaccagagattgttgaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccatgataagcgtag 23063895  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063894 gaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgttttttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 23063795  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23063794 tttattggtccgtttcagatatctgaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgt 23063706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16925304 - 16924895
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16925304 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16925205  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16925204 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 16925105  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16925104 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 16925005  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16925004 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 16924905  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  16924904 cgaatttgca 16924895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16999044 - 16998635
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16999044 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16998945  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16998944 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 16998845  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16998844 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 16998745  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16998744 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 16998645  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  16998644 cgaatttgca 16998635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16982196 - 16981787
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  16982196 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 16982097  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16982096 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 16981997  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16981996 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 16981897  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16981896 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 16981797  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  16981796 cgaatttgca 16981787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17063761 - 17063352
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  17063761 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 17063662  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17063661 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 17063562  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17063561 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 17063462  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  17063461 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 17063362  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  17063361 cgaatttgca 17063352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 177 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23188879 - 23188637
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23188879 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtgtcaggaaggagaccacatgtttttgagagtc 23188780  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  23188779 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgt 23188680  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23188679 atcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 23188637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9610180 - 9609771
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  9610180 ttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 9610081  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9610080 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 9609981  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  9609980 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgct 9609881  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  9609880 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatcttt 9609781  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  9609780 cgaatttgca 9609771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23294002 - 23293587
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||    
T  23294002 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggttgaggactcctttatgtcggt 23293903  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23293902 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 23293803  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  23293802 acggaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 23293703  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  23293702 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 23293603  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    | || |||||||||||    
T  23293602 ctaacttgcatgatgt 23293587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 44385968 - 44386377
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  44385968 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 44386067  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || |  || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44386068 ttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcg 44386167  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44386168 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 44386267  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  44386268 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttg 44386367  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  44386368 cgaatttgca 44386377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 181 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23138904 - 23138665
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23138904 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagagtcactc 23138805  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  23138804 ttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcg 23138705  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23138704 agtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtc 23138665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 181 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23550694 - 23550455
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23550694 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagagtcactc 23550595  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  23550594 ttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcg 23550495  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23550494 agtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtc 23550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24710077 - 24709670
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  24710077 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgtttgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 24709978  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || |  || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24709977 ttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 24709878  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24709877 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 24709778  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  24709777 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtattagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 24709678  T
Q  404 cgaatttg 411  Q
    ||||||||    
T  24709677 cgaatttg 24709670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24262387 - 24262005
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  24262387 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 24262288  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262287 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 24262188  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  24262187 gaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 24262088  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||| ||||||  |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  24262087 ttcattggtctgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 24262005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17067419 - 17067014
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  17067419 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 17067320  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17067319 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 17067220  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17067219 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 17067120  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  17067119 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctttacgagtgggtttaccgccgcatcttt 17067020  T
Q  404 cgaatt 409  Q
    ||||||    
T  17067019 cgaatt 17067014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 40 - 413
Target Start/End: Original strand, 24878430 - 24878803
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||      
T  24878430 agtattggaatgacacctttcgaggctttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagaga 24878529  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  | ||||| ||||||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878530 ttgttcagcaaactactgagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 24878629  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  24878630 tgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggt 24878729  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || |||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24878730 ccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 24878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27218054 - 27217651
Alignment:
Q  10 gagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 109  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |    
T  27218054 gagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaat 27217955  T
Q  110 cgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 209  Q
    | || || || || || || ||||| ||  |  ||||  | ||||| ||||||||   ||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27217954 caggagaaagagtggtcttaggaccagagatttttcagcaaactactgagaaagttcagatgatacaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaa 27217855  T
Q  210 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaag 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  27217854 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaag 27217755  T
Q  310 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatt 409  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  27217754 tcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatt 27217655  T
Q  410 tgca 413  Q
    ||||    
T  27217654 tgca 27217651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10868894 - 10868485
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| || || ||||    
T  10868894 ttgatcgagttcacttataacaatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 10868795  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  10868794 ttgaatcaggagaaagggtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcg 10868695  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10868694 acaaaagagctatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 10868595  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  10868594 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttt 10868495  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  10868494 cgaatttgca 10868485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23087494 - 23087079
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  23087494 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgactattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcggaactccgttatgttggt 23087395  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | |||| | ||||||  || || || |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23087394 ttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatattgttcgtcagactattgaaaaggttaaattgataagagagaagatgaaagcgtcgtagagtcg 23087295  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||     
T  23087294 acagaagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgacaggtgttggtcgtgcc 23087195  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| | ||||||||  ||||  | || ||||| |||||||    
T  23087194 ttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattggtccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcgtatagagtgtgtttgccaccacatcttt 23087095  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  23087094 cgaatttgcatgatgt 23087079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 22325255 - 22325664
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |  || ||||    
T  22325255 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgtggtgttggt 22325354  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || |  || || || || ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22325355 ttgaatcaggagaaagagcggtcttagggccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 22325454  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22325455 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 22325554  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  22325555 ttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttg 22325654  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  22325655 cgaatttgca 22325664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27371313 - 27370904
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||   || || ||||    
T  27371313 ttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgaagaactatgttgtgttggt 27371214  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27371213 ttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 27371114  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  27371113 acaaaagagctatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggatgtgct 27371014  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||     
T  27371013 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtggatttaccgccgcatcttg 27370914  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  27370913 cgaatttgca 27370904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 383
Target Start/End: Original strand, 24825717 - 24826060
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||      
T  24825717 agtattggtatggcaccttttgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttgggttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaa 24825816  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  | ||||| ||||| || | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24825817 ttgttcagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaggagttatcatgataagcgtaggaaagacct 24825916  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||||||| | ||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24825917 tgagttttaggaaggagataatgtatttttaagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggt 24826016  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagt 383  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  24826017 tcgtatcagatatcagaaagaattgggacggtggcgtatcgagt 24826060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 21145429 - 21145838
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |  ||||| || |||||||    
T  21145429 ttgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaaaactccgttgtgctggt 21145528  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||  ||||| || || || || |||||  |  | || ||  | ||||| ||||||||   ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21145529 ttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgtccagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcg 21145628  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  21145629 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgct 21145728  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||| |||  |||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  21145729 ttgaaatcaaagaagttgaccccgaagtttattgatctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttatcgagtgggtttaccaccgcatcttt 21145828  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  21145829 cgaatttgca 21145838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 27365478 - 27365890
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  27365478 ttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggacgaaggtgcagaactcctttgtgttggt 27365577  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  | |||||||| || || | | | || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27365578 ttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcg 27365677  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  27365678 acagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggtgtaggccgtgca 27365777  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || |||||||||||||| |  || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  27365778 ttaaaatctaagaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatcttt 27365877  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  27365878 cgaatttgcatga 27365890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27787785 - 27787370
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  27787785 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 27787686  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27787685 ttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaaggtgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 27787586  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  27787585 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgct 27787486  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  27787485 ttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 27787386  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  27787385 cgaacttgcatgatgt 27787370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 235 - 419
Target Start/End: Original strand, 27377101 - 27377285
Alignment:
Q  235 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377101 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 27377200  T
Q  335 ttggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27377201 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 27377285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12574397 - 12573982
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  12574397 ttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggt 12574298  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12574297 tcgagtcaagagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcg 12574198  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || ||| | || || || ||  |||| ||||| |||||||||    
T  12574197 acagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagggttaccccgatgacgggtgtaggacgtgct 12574098  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||  ||||  ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  12574097 ttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctat 12573998  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  12573997 cgaacttgcatgatgt 12573982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45529516 - 45529162
Alignment:
Q  43 attggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttgg 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |  ||||| || || |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |    
T  45529516 attggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcaaaactccattgtgttggtatgagtccggtgagagtgtggtattgggaccggacattg 45529417  T
Q  143 ttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 242  Q
    ||||  |||||||  |||| || | | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  45529416 ttcaacagactactaagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcatcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcctaggaaggatcttga 45529317  T
Q  243 gtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 342  Q
    ||||      | |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||| |||||||  ||     
T  45529316 gttt------gaagaccatgtgtttatgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattgaccca 45529223  T
Q  343 tatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||| | || |||||||||||  |||| |||||  |||| || ||||||| ||||||||    
T  45529222 tatcagatttcggaaagagttgggacggttgcgtatagagtgggtttaccactgcatcttt 45529162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 149 - 419
Target Start/End: Original strand, 30211461 - 30211731
Alignment:
Q  149 agactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 248  Q
    ||||||| ||||| || | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30211461 agactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 30211560  T
Q  249 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 348  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30211561 agaaggagaccatgtgttttttagagtcacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcag 30211660  T
Q  349 ttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
     | || |||| ||||||   ||| |||||   ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30211661 atttcggaaaaagttggggtggttgcgtataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgt 30211731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25128691 - 25128387
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  25128691 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattcaagtatcggtatgacaccgtttgatgctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttatgttggt 25128592  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||  | || || ||||||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||||||| || |||||| |    
T  25128591 ttgagtcgggtgaaagtgttttgttaggatcggaggttgtccaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtag 25128492  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||||||||||||| |  | || || ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||    
T  25128491 acagaagagttatcatgatgaaaggaggaaggacattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccatgtgactggtgttggacgcgct 25128392  T
Q  304 ttgaa 308  Q
    |||||    
T  25128391 ttgaa 25128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22276323 - 22276001
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  22276323 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 22276224  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || |||||||   |||| |||| |||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  22276223 ttgagtccggagagagtgccttgttaggactggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 22276125  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  22276124 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgc 22276025  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||   | ||||||||||||    
T  22276024 tttgaagggtaggaagttgactcc 22276001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 12640318 - 12640640
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12640318 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgttggt 12640417  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  12640418 ttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 12640516  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| || |||||    
T  12640517 gacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgc 12640616  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  12640617 tttgaagtgtaggaagttgactcc 12640640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Original strand, 19652467 - 19652578
Alignment:
Q  23 acaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgt 122  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19652467 acaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgt 19652566  T
Q  123 tgtgttgggacc 134  Q
    ||||||||||||    
T  19652567 tgtgttgggacc 19652578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Original strand, 23817452 - 23817696
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||    
T  23817452 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggagatgtaggacaccgttgtgttggt 23817551  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||  |  | |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||| |||||||| |||||| |    
T  23817552 ttgagtcaagataaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgatccaagagaagatcaaagcgtctcagagtag 23817651  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 248  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  23817652 acagaagagttatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttca 23817696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 22761968 - 22762274
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  | || || ||||    
T  22761968 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgttggt 22762067  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||  | || || | |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  22762068 ttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 22762167  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
      | |||||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||| |  || || || |||||||||||||| | || ||| ||||||||| | |||| |    
T  22762168 gaagaagagttatcatgacaagaggatgaaagatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtaactggtgttagtcgtggt 22762267  T
Q  304 ttgaagt 310  Q
    |||||||    
T  22762268 ttgaagt 22762274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 24831586 - 24831908
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||    ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  24831586 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgttagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 24831685  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || |||| || | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||     
T  24831686 ttgagtccggagagaatgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggtgtctcagagta 24831784  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | |||| ||||||| || || |||||    
T  24831785 gacagaagagttatcatgataagagaacgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgactggagtgggtcgtgc 24831884  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  24831885 tttgaagtgtaggaagttgactcc 24831908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20828306 - 20828226
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggagg 81  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20828306 cctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggagg 20828226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 24570067 - 24570373
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||| | | |||||||||||| || || || ||||    
T  24570067 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttatatcgtcagaggtgtaggacaccgttgtgttggt 24570166  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||  || || |||||| |||| ||||||||  | ||  | ||||||||||| || || | ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||     
T  24570167 ttgagttaggagaaagtgttttgttaggaccggaagttgtgaaagagactacggaaaaggttaagatgaatca-agagaagatgaaaacgtctcagagta 24570265  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    || | ||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || || || |||||||| | || ||| ||||||||||| |||||    
T  24570266 gatagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgc 24570365  T
Q  303 tttgaagt 310  Q
    ||||||||    
T  24570366 tttgaagt 24570373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24654185 - 24653974
Alignment:
Q  208 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||| ||| ||||    
T  24654185 aagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcattga 24654086  T
Q  308 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaa 407  Q
    |||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||  |  |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24654085 agtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 24653986  T
Q  408 tttgcatgatgt 419  Q
     |||||||||||    
T  24653985 cttgcatgatgt 24653974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 308 - 413
Target Start/End: Original strand, 41609047 - 41609152
Alignment:
Q  308 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaa 407  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  41609047 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacagccgcatctttcgaa 41609146  T
Q  408 tttgca 413  Q
    ||||||    
T  41609147 tttgca 41609152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24945138 - 24944997
Alignment:
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||| | || |||||| | ||||| |    
T  24945138 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagggttggaacagtggcat 24945039  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatg 418  Q
    |  ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  24945038 atagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatg 24944997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Original strand, 27368404 - 27368452
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368404 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 27368452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 24948633 - 24948564
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatg 73  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24948633 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatg 24948564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 18362700 - 18362770
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatgg 74  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  18362700 ttgattgaatttgcctataacaacagttatcactctagtataggcatggccccgtacgaagctttgtatgg 18362770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 116
Target Start/End: Original strand, 41608811 - 41608896
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtga 116  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  41608811 tatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 41608896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14708956 - 14708908
Alignment:
Q  179 agaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 227  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14708956 agaagatgaaagcatcgtggagtagacagaagagttatcatgataagcg 14708908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 310
Target Start/End: Original strand, 23817750 - 23817798
Alignment:
Q  262 gtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 310  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23817750 gtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 23817798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28144749 - 28144701
Alignment:
Q  262 gtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 310  Q
    |||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28144749 gtgtttttgagagtgaatcttgtaaccggtgttggacgtgctttgaagt 28144701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 16572 - 16990
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16572 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgct 16671  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16672 ggtttaagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagag 16771  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||    
T  16772 ccgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgt 16871  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||| || | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  16872 gctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtattagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatc 16971  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  16972 tttcgaacttgcacgatgt 16990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 65822 - 65434
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |    
T  65822 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 65723  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65722 gaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 65623  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65622 gaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggcgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgaga 65523  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  65522 tttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 65434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 277 - 420
Target Start/End: Original strand, 39924 - 40067
Alignment:
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||    
T  39924 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgt 40023  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40024 attgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtc 40067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 39854 - 39906
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgta 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39854 agagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgta 39906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 705
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||  ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  1093 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgttcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgatagtgtggttttag 994  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  993 gaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcatag 894  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  893 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 794  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  793 tttattggtccgtatcagatatcggaaagggttggaatggtggcgtatcgtgttggcttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 9945 - 10357
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9945 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 10044  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10045 ttgggtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgcagagtcg 10144  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  10145 acaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 10244  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||||||   ||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  10245 ttgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccatatcagagttcagaaagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacctcatcttt 10344  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  10345 cgaatttgcatga 10357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 413
Target Start/End: Original strand, 38758 - 39158
Alignment:
Q  13 tttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  38758 tttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcag 38857  T
Q  113 gtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagag 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  38858 gtgagagcgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataaggaaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagag 38957  T
Q  213 ttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtca 312  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||     
T  38958 ttatcatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgccttgaagtcg 39057  T
Q  313 aagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgc 412  Q
    | |||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||    
T  39058 aggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggagcagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgc 39157  T
Q  413 a 413  Q
    |    
T  39158 a 39158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 40 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14768 - 14388
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||  |||| || || || || ||||| ||      
T  14768 agtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagaga 14669  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  14668 ttgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatct 14569  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568 tgagtttcaggaaggataccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 14469  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14468 ccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtc 14388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 40 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1028 - 655
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||      
T  1028 agtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagaga 929  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  ||||||   |||||||   |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  928 ttgttcagcagactagtaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcaccataagcgtagaaaagatct 829  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  828 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggt 729  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || |||||  |||  |||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  728 ccatatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 13763 - 14178
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  13763 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggagatgcaggactcctttatgctggt 13862  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  13863 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 13962  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  13963 acaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 14062  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  14063 ttgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagaaaggattggaacagtggcatatagagttgggttgccaccacatcttt 14162  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  14163 cgaacttgcatgatgt 14178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 4815 - 5224
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4815 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaatctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 4914  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4915 ttgagtcaagagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcattagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 5014  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  || || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  5015 acagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 5114  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  5115 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 5214  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    |||| |||||    
T  5215 cgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 4294 - 4676
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  4294 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 4393  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4394 gaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 4493  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4494 gaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgaga 4593  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4594 tttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 4676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9013 - 8631
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  9013 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 8914  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8913 gaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 8814  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8813 gaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgaga 8714  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8713 tttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 33462 - 33850
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||  |||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  33462 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaagctttgtatggttggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 33561  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33562 gaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 33661  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33662 gaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgaga 33761  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33762 tttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattactaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 33850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 149 - 419
Target Start/End: Original strand, 278837 - 279107
Alignment:
Q  149 agactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 248  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278837 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 278936  T
Q  249 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  278937 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcag 279036  T
Q  349 ttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  279037 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 279107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 68 - 413
Target Start/End: Original strand, 164635 - 164980
Alignment:
Q  68 tgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcag 167  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || |     
T  164635 tgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaa 164734  T
Q  168 gatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttt 267  Q
    ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  164735 gatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtattt 164834  T
Q  268 ttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggat 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  164835 ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaa 164934  T
Q  368 cggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  164935 cggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgca 164980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 149 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 308958 - 308694
Alignment:
Q  149 agactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 248  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308958 agactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 308859  T
Q  249 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||    
T  308858 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccccaaagtttattggtccgtatcag 308759  T
Q  349 ttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  308758 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 308694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 260751 - 260337
Alignment:
Q  5 tgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtt 104  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  260751 tgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactctgttatgctggtt 260652  T
Q  105 tgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcga 204  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  260651 tgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcga 260552  T
Q  205 caaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctt 304  Q
    || || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  260551 cagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctt 260452  T
Q  305 tgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttc 404  Q
    | || || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||  || || ||||||| ||  ||||| | || |||||  |||||||    
T  260451 taaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattagaacggtggcatatagagtttgtttgccaccatatctttc 260352  T
Q  405 gaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| |||||||||||    
T  260351 gaacttgcatgatgt 260337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 542 - 130
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  542 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattcgtatggcaccgttcgaagctttgtacggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 443  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||| |||||||    
T  442 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcatcgtagagtcg 343  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||    
T  342 acagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtatgacgtgct 243  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||    
T  242 ttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttaccaccacatcttt 143  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  142 cgaatttgcatga 130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 47568 - 47153
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  47568 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggt 47469  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47468 ttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 47369  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||||| | || ||||| ||||||||     
T  47368 acagaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctataacgggtgtaggacgtgca 47269  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  47268 ttgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 47169  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  47168 cgaatttgcatgatgt 47153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 40 - 420
Target Start/End: Original strand, 63929 - 64309
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||  || || || || || || ||||| |||     
T  63929 agtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggagaaagagtggtcttaggaccagata 64028  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  ||||||| |||||| | | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  64029 ttgttcagcagactactgagaaaattaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagatct 64128  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  64129 tgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactgtgagattcattggt 64228  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  64229 ccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtc 64309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26705 - 26290
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26705 ttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattgggatggtaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgttggt 26606  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  26605 ttgagtcaggtgaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatgagactactgagaaagttaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcg 26506  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| | ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26505 acagaagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgct 26406  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| || || ||| | ||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||    
T  26405 ttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggtgggaacagtggcttatagagctggtttgccaccacatcttt 26306  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  26305 cgaacttgcatgatgt 26290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 49069 - 49484
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49069 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 49168  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49169 ttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcatgagactacagaaaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 49268  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| |||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||     
T  49269 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttctgagggtcattcctatgacgggtgtgggacgtgca 49368  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  49369 ttgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatcttt 49468  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  49469 cgaacttgcatgatgt 49484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 6458 - 6042
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||  || || ||||    
T  6458 ttgattgagttcacatacaataacatttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggt 6359  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || ||||| || || || || ||||| ||  | || ||  | ||||| |||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  6358 ttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtgcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 6259  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6258 acaaaagagttatcataataagcgcaggcaggatcttgagtttcaagagggagaccacgtgtttttaagagtcactcctgtgactggtgtttgacgtgct 6159  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6158 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattagaaagagttggaatggtggcgtatcgagttggattaccaccgcagcttt 6059  T
Q  404 cgaatttgcatgatgtc 420  Q
    |||||||||||||||||    
T  6058 cgaatttgcatgatgtc 6042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3195 - 2780
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3195 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 3096  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| || || |||||||||| ||||||||||||    
T  3095 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacaacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcg 2996  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  2995 acagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtatttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 2896  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  2895 ttgaagtctgagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 2796  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  2795 cgaatttgcatgatgt 2780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 323148 - 322733
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  323148 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattccagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgatcggaggtgcaggactcctttatgctggt 323049  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323048 ttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtccggatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 322949  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  322948 acagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 322849  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||| ||||||| || |||||| |  |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  322848 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccatatcagatatcagagagggttggaacaatggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 322749  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  322748 cgaacttgcatgatgt 322733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 118012 - 117597
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  118012 ttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgttggt 117913  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  117912 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcatactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacaaagtcg 117813  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| ||||  |||| ||||||||     
T  117812 acagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgagtgtgggacgtgca 117713  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  117712 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 117613  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  117612 cgaatttgcatgatgt 117597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 112444 - 112050
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||| ||||| || |||||||  ||| |||| || |||||  ||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  112444 aacagttatcattctagtattgaaatgacaccatttgaagctctgtatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggagagagtgtag 112345  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    | |||||||| ||| | |||||  | ||||  ||||| || | | |||||  ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  112344 ttttgggaccagatatcgttcaacaaactattgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgatagcatcacagagtcgacaaaagagatatcatgataa 112245  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    |||||  || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  112244 gcgtaagaaggaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgact 112145  T
Q  325 ccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112144 cccaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 112050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 386263 - 385848
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  386263 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcactgttctaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattgtgttggt 386164  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  386163 ttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcattagactacggagaaggttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcc 386064  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||||| ||||| ||  | ||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||  ||||     
T  386063 acagaagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttcaagagggagatcatctatttctgagagtcactcctacgacgggtgtaggttgtgcg 385964  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||| | || ||| |||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  385963 ttgaagtataagaagttgactccgaagtttataggttcataccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 385864  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  385863 cgaatttgcatgatgt 385848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 419
Target Start/End: Original strand, 203366 - 203745
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  203366 agtataggaatggcaccattcaaagctttgtatggtcggaggtgcagaactctgttatgttggtttgagtcgggtgagagtgtagtgttgggaccgaata 203465  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  |||||||  | || || | | | || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||| ||    
T  203466 ttgttcaccagactacataaaaggttaagctaataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagatttatcacgataagcgcaggaaagacct 203565  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  203566 tgaatttcaagaaggagaccatgtgtttctaagagtcactcttgtgacaggtgctggccgtgctttgaagccaaagaagttgacgccgaggtttattggt 203665  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  203666 ccgtatcagatatctaaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgt 203745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 416
Target Start/End: Original strand, 95882 - 96276
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  95882 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcggaggtgtagaactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtg 95981  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  95982 ttgtgttggggccggacttggttcatgagactacggagaaagttagggtgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatga 96081  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||    
T  96082 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttttgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttg 96181  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||| |  || || ||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  || |||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  96182 actccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatga 96276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Original strand, 109700 - 110082
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  109700 tatcattctagtattggaacggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 109799  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  109800 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtag 109899  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  109900 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 109999  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  110000 ttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 110082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 113003 - 112591
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  113003 ttgatagagtttacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggt 112904  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| ||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  | |||||  | || || |   |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  112903 ttgaatcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacataaaaggtaaacttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcg 112804  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  112803 acagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgca 112704  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||||| || |||||||    
T  112703 ttaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatcttt 112604  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  112603 cgaatttgcatga 112591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 419
Target Start/End: Original strand, 127082 - 127476
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |    
T  127082 aacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttaagtcaggtgagagtgtgg 127181  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    | || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  127182 ttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttccagagtcgacagaagagttatcatgataa 127281  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  127282 gcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgact 127381  T
Q  325 ccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  127382 ccgagatttattgatccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgt 127476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27945 - 27548
Alignment:
Q  22 aacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtg 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  27945 aacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagaaagtg 27846  T
Q  122 ttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 221  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27845 ttgtgttgggaccagattcggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatga 27746  T
Q  222 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 321  Q
     |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  27745 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatcgaagtcgaagaagttg 27646  T
Q  322 actccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||| |  || |||||||||||| || ||||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27645 actccaaagttcattggtccgtataagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgt 27548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Original strand, 1044 - 1425
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | || | ||| ||||||||||| |    
T  1044 tcgagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctctatgttggtttgagtcaagagaaaatgtggtgttgggaccag 1143  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |     
T  1144 atttagttcatcagactacgaagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgtaggaaggc 1243  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  1244 ccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcattcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccga-agttatt 1342  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||   ||| || ||   ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1343 ggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcataaaaagtaggtttgaaaccacatctttcgaatttgaatgatgt 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 180661 - 180245
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  180661 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattgtgttggt 180562  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || || || || || ||||| ||| | |||||  ||||||  |||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  180561 ttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 180462  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  180461 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccggtgactggtgttggacctgct 180362  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  180361 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatcagaaagagttagaacagtggcgtatcgagttggcttaccaccgcatcttt 180262  T
Q  404 cgaatttgcatgatgtc 420  Q
    ||||||| |||||||||    
T  180261 cgaattttcatgatgtc 180245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20427 - 20016
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20427 ttgatagagttcacatacaacaaaagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 20328  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  20327 ttgagtcaggagagagtgttgtcttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaactcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcccagagtcg 20228  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  20227 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcg 20128  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  20127 ttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 20028  T
Q  404 cgaatttgcatg 415  Q
    ||||||||||||    
T  20027 cgaatttgcatg 20016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Original strand, 13256 - 13638
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  13256 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgg 13355  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    | ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |     
T  13356 aattgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggc 13455  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     ||||||||||| || || || || || ||| | ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||    
T  13456 ccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcatt 13555  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  13556 ggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgt 13638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Original strand, 17026 - 17408
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  17026 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgg 17125  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    | ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |     
T  17126 aattgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggc 17225  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     ||||||||||| || || || || || ||| | || || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||    
T  17226 ccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcatt 17325  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  17326 ggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgt 17408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 556 - 970
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||| |||| |  || || |||||||| ||||| || |  ||||| || || ||||    
T  556 ttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcaaaactccgttgtgttggt 655  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  656 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcg 755  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  756 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttt-gagagtccctcgtgtgactggtgttggacgtgct 854  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  855 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtgggattaccaccgcatcttt 954  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  955 cgaatttgcaggatgt 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 6467 - 6052
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| | ||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  6467 ttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttacgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 6368  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || |||||  |  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6367 ttgagtctggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatcgcagagtcg 6268  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6267 acaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcacacctgtgactggtgttggacgagct 6168  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6167 ttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatcttt 6068  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  6067 cgaatttgcacgatgt 6052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 1386 - 1801
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  1386 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttatgctggt 1485  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  1486 ttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagactagagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 1585  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||| || |  ||||||||||| |  | ||| || || |||  |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  1586 acagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttgagtttcaggtggaagatcatgtatttcggagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 1685  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  1686 ttgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattagtccgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttcccaccacatcttt 1785  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  1786 cgaatttgcatgatgt 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23075 - 22816
Alignment:
Q  67 ttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtca 166  Q
    ||||||||  |||||||| |||| || || || ||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||||| || || |    
T  23075 ttgtatggtaggaggtgttggacaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggtta 22976  T
Q  167 ggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgt 265  Q
     |||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||    
T  22975 agatgattcag-gagaagatgaaggagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgt 22877  T
Q  266 ttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22876 ttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 22816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 42195 - 42610
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42195 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 42294  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42295 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcg 42394  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||| ||||     
T  42395 actgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaagtgca 42494  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  42495 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 42594  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||| ||||||    
T  42595 cgaacttgcttgatgt 42610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 47261 - 47676
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47261 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgaaggactcctttatgctggt 47360  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47361 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcg 47460  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||  |||     
T  47461 actgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaaatgca 47560  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  47561 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 47660  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||| ||||||    
T  47661 cgaacttgcttgatgt 47676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2252
Alignment:
Q  268 ttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatc 346  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2330 ttgagagtcactctagtgataggtgttggacgtgcattgaaatcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtatc 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 2243 - 2212
Alignment:
Q  388 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2243 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 2212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 40 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6592 - 6215
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6592 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgcttgtttgagttgggagaaagtgttgtgttgggaccggatt 6493  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  6492 tggttcatgagactactgagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagacct 6393  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgttt-ttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 338  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||  |||| || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||    
T  6392 tgagtttcaggaaggtgaccatgtttttcctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattgg 6293  T
Q  339 tccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    ||| |||||| | ||||||||| ||||| | ||||| ||  || |||| || ||| | | ||||||||||||||||||    
T  6292 tccttatcagatttcagaaagatttggaactgtggcatatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgcatga 6215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26586 - 26174
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||    
T  26586 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttgtgtcggt 26487  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26486 ttgagtcgggagaaaatgtagtgttgggagcggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcg 26387  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  26386 acagaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcg 26287  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  26286 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 26187  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
     ||||||||||||    
T  26186 tgaatttgcatga 26174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 26968 - 26859
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||    
T  26968 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttgtgtcggt 26869  T
Q  104 ttgagtcggg 113  Q
    ||||||||||    
T  26868 ttgagtcggg 26859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1583 - 1168
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||  |||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  1583 ttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattgaaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggt 1484  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| || || || || ||||  ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1483 ttgagtcgggtgaaagagtggtcttaggactagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagataagatgaaagcgtcgcagagtcg 1384  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1383 acaaaaaagttaccatgataagtgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttcgacgtgcc 1284  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1283 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgttccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtggatttaccaccgcatcttt 1184  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  1183 cgaatttgcacgatgt 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4319 - 3904
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  4319 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaagcttcgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggt 4220  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  4219 ttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcggagaatcg 4120  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  4119 acagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgatagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcg 4020  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  4019 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagtgttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatcttt 3920  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  3919 cgaatttgcatgatgt 3904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19564 - 19153
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19564 ttgatagagttcacatacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttattctggt 19465  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19464 ttgagtcaggatagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagggaaaagatgaaagcatcgcagagtcg 19365  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||| |||     
T  19364 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttcaggatggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgca 19265  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  19264 ttgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggttcgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 19165  T
Q  404 cgaatttgcatg 415  Q
    ||||||||||||    
T  19164 cgaatttgcatg 19153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 181 - 404
Target Start/End: Original strand, 58445 - 58668
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  58445 aagatgaaagcgtcgcatagtagacaaaagagttatcatgataagcataggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccactc 58544  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
     |||||| |||||||||| |||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  |||| |||||  |    
T  58545 atgtgaccggtgttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtatag 58644  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttc 404  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  58645 agtgggtttaccaccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 74169 - 74038
Alignment:
Q  179 agaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcac 278  Q
    |||||| || ||| || |||||| | || ||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||| |  |  || || |||||| ||||||| |     
T  74169 agaagacgagagcatctcagagtaggcataagagctatcatgataagagcaggaaagatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttctgagagtgaa 74070  T
Q  279 tcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 310  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  74069 tcctgtaaccggtgttggacgtgctttgaagt 74038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 177 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14310 - 14076
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14310 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggagagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgatagtc 14211  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||||    
T  14210 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttattggtctgtatgagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 14111  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttg 411  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14110 atcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttg 14076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31854 - 31439
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  31854 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgatatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcatgactcctttatgctggt 31755  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||  || || || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31754 ttgagttaggagaaagcgttgtgttgggatcggatttggttcatcaaactacatagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 31655  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| | || |||||| ||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||     
T  31654 acagaatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtgtttctgagagttacttctatgacgggtgtaggacgtgca 31555  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| || ||  ||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  31554 ttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgataggtttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 31455  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  31454 cgaatttgcatgatgt 31439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17858 - 17660
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| | ||| ||||| ||| | || || ||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  17858 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcagagatgtagaacttcgttgtgttggtt-gagtcaggtgaaagagtggtcttag 17760  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  |||||||  ||||||| | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17759 gaccagagattgttcagcagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttataatgataagcgtag 17660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 177 - 419
Target Start/End: Original strand, 219452 - 219694
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  219452 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagagtc 219551  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  219552 actcctgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgt 219651  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  219652 atcaagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 219694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 67 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 229424 - 229078
Alignment:
Q  67 ttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtca 166  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || |    
T  229424 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggtta 229325  T
Q  167 ggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 266  Q
     ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  229324 agatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagaccttgaatttcaagaaggagatcatgtatt 229225  T
Q  267 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgga 366  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  229224 tttgagagtcactcctattactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttgttggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 229125  T
Q  367 tcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
     |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  229124 acggtggcgtaccgaatagggttaccaccgcatctttcgaatatgca 229078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 326
Target Start/End: Original strand, 32863 - 33179
Alignment:
Q  8 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 107  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||  |||||||||| || || || || ||||||||    
T  32863 ttgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccatttaaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttggtttga 32962  T
Q  108 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 206  Q
    ||| ||  |||||| | |||| || || ||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| || |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  32963 gtccgg--agagtgctttgttaggcccagaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gaaaagatgaaggcgtctcagagtagaca 33059  T
Q  207 aaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttg 306  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||||||||    
T  33060 gaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttg 33159  T
Q  307 aagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  33160 aagtgtaagaagttgactcc 33179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 21533 - 21948
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21533 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 21632  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  21633 ttgagtcaggagtgggtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 21732  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||  |||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  21733 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtaaccatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 21832  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||| || |||| || || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  21833 ttgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattggtccgtataagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 21932  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  21933 cgaacttgcatgatgt 21948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26250 - 26004
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  26250 ttgatcgaatttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 26151  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || || || |||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | ||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||     
T  26150 ttgaatccggagaaagtgctttgtttggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcatagta 26052  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  26051 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaag 26004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27669 - 27255
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27669 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 27570  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| || || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  27569 tcgagtcaggagaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgccgtagagtcg 27470  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| |||||  |||||||  |||  ||||| |||||||| ||| | || || ||| ||||||| |||||| || | ||||| ||||||||     
T  27469 acagaagagttaccatgacgagcgtag-gaaggccttgaatttcaagagggatatcatgtatttctgagagttactcctatgtcgggtgtaggacgtgca 27371  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  27370 ttgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaaccgtggcatacagagtgggattgccaccacatcttt 27271  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  27270 cgaatttgcatgatgt 27255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 51725 - 52140
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||| || ||||    
T  51725 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatagtcggaggtgcatgactcctttgtgttggt 51824  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  51825 ttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcaaactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcg 51924  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||     
T  51925 acagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacatgca 52024  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  52025 ttgaagtctaagaagttgactccaaagtttagtggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 52124  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  52125 cgaatttgcatgatgt 52140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 195565 - 195979
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  195565 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccatccgagtattggtatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 195664  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  195665 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgtagagacg 195764  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  195765 acagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgt-tttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 195863  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  195864 ttgaagtctaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 195963  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  195964 cgaatttgcatgatgt 195979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 149014 - 148599
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  149014 ttgatagagttcacatacaacagcagttaccattcgagtattggtatggctccgttcgaacctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 148915  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  148914 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaagtcaggatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 148815  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||  |||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| || || || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  148814 acggaagagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttctaagagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 148715  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||| ||| || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  148714 ttgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatgagagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatcttt 148615  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  148614 cgaatttgcatgatgt 148599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Original strand, 26572 - 26810
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26572 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagagttactc 26671  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||| ||    
T  26672 ctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttgactccgaggtttattggcccgtatcagatatcagaaaggattgaaacggtggcgtatcg 26771  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26772 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttccatgatgt 26810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 121812 - 122134
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | ||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||  |||||||||| || || || || ||||    
T  121812 ttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtatcggattggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttggt 121911  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || || || |||||| |||| ||| ||||  | || || || | |||||| || || |  ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  121912 ttgaatccggggaaagtgttttgttaggaacggaagttgtgcaagaaattacggaaaaggttaacatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 122010  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  122011 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgc 122110  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  122111 tttgaagtgtaggaagttgactcc 122134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 419
Target Start/End: Original strand, 68575 - 68717
Alignment:
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| |    
T  68575 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcat 68674  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || |||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  68675 acagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgt 68717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 180368 - 180147
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||| || || || ||||    
T  180368 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccattgtgttggt 180269  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || || |||||| |||| |||||| |  | || || || |||||||| || || | ||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||     
T  180268 ttgagtccggagaaagtgttttgttaggaccgcaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaagtcgtctcagagta 180170  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataag 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  180169 gacagaagagttatcatgataag 180147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6816 - 6407
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| || || ||||  || || ||||    
T  6816 ttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggt 6717  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6716 ttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactacagagaaggttaagatgattcaagagtagatgaaagcgtcgcagagtcg 6617  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6616 acaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgct 6517  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||   |||||  || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  6516 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattggaaagagttgggatggtggtatatcgagtgggattaacaccgcatcttt 6417  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  6416 cgaatttgca 6407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 3235 - 3151
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtagga 88  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3235 ttgatagagttcacgtacaagaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 3151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 177 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9614 - 9378
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9614 agagaagatgaaggcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtattgttgagagtc 9515  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  9514 actcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtgactcctagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 9415  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9414 accgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 9378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 419
Target Start/End: Original strand, 14968 - 15356
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||  ||||||| |||||||| || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  14968 tatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgtatggtcggaggtgcagaacttcgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgg 15067  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||| | |||||  | ||||| ||||| || | | |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068 gaccagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 15167  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  15168 gaaagaccttgagtttcaggaaggagatcatgtatctttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctaagg 15267  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15268 ttaattggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 10237 - 9827
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10237 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgttggt 10138  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10137 ttgagacgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 10038  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| |     | |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||| || | ||||| ||||||||     
T  10037 acagaagagttaccatgacaagcgtagga-----cgtgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatggcgggtgtaggacgtgcg 9943  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  9942 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 9843  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
     |||||||||||||||    
T  9842 tgaatttgcatgatgt 9827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 14113 - 14528
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14113 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatcctggt 14212  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14213 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggtttatcagactatagagatagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 14312  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| | || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  14313 acagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagttttaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 14412  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||   |||||| || ||||| |||||||    
T  14413 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 14512  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  14513 cgaacttgcatgatgt 14528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 419
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9154
Alignment:
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||   |||||| || ||||| |||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  9139 cgaacttgcatgatgt 9154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 415
Target Start/End: Original strand, 261 - 672
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  261 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggt 360  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  361 ttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 460  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| | || || |||||| |||| ||||| ||||||||     
T  461 acagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgca 560  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  561 ttgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 660  T
Q  404 cgaatttgcatg 415  Q
    ||||||||||||    
T  661 cgaatttgcatg 672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 11299 - 10917
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  11299 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgg 11200  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    | ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |     
T  11199 aattgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggc 11100  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     ||||||||||| || || || || || ||| | || || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||    
T  11099 ccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcatt 11000  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10999 ggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgt 10917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 7672 - 7994
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  7672 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 7771  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || |||| || | |||| ||||| ||  | || || || ||| |||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  7772 ttgagtccggagagaatgctttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactgcggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 7870  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||    
T  7871 gacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 7970  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  7971 tttgaagtgtaggaagttgactcc 7994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 419
Target Start/End: Original strand, 90795 - 91209
Alignment:
Q  5 tgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtt 104  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  90795 tgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgttggtt 90894  T
Q  105 tgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcga 204  Q
    |||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  90895 tgagtcaggagaaagtgtagcgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcga 90994  T
Q  205 caaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctt 304  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |    
T  90995 cagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctacgacgggtgtaggacgtgcat 91094  T
Q  305 tgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttc 404  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||| ||| || |||| || || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||    
T  91095 tgaagtctaagaagttgacttcaaagtttattagtccatattagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttc 91194  T
Q  405 gaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||    
T  91195 gaatttgcatgatgt 91209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 185 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 162376 - 162142
Alignment:
Q  185 tgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgt 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  162376 tgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcgtaaaaaagatcttgtgtttcaagaagtagaccacgtatttttgagagtcactcctat 162277  T
Q  285 gactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagtt 384  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  162276 gactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtg 162177  T
Q  385 ggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  162176 ggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 162142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 448503 - 448088
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| || || ||||    
T  448503 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggaagaaggtgcagaactccgttgtgttggt 448404  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||  |||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  448403 tcgagtcaggtgagagtgtggttttttgaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcg 448304  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||     
T  448303 acagaagagctatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattttttagagtcactcctgtaactattgttggacgagca 448204  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||| | | ||| || ||||||||||||||||    
T  448203 ttgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcggaaagaattggaacggtggcgcatcaagtgggtttaccaccgcatcttt 448104  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  448103 cgaatttgcacgatgt 448088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 326
Target Start/End: Original strand, 78666 - 78813
Alignment:
Q  179 agaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcac 278  Q
    |||||||||| || || |||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||||||||| |     
T  78666 agaagatgaaggcatctcagattagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaa 78765  T
Q  279 tcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  78766 tcatgtgacaggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 78813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 114594 - 114545
Alignment:
Q  34 cactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtg 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  114594 cactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 114545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 175427 - 175352
Alignment:
Q  284 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaag 359  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  175427 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgatcccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaag 175352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5194 - 4779
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||  ||||    
T  5194 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcagaactcctttataatggt 5095  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5094 ttgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 4995  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||     
T  4994 acagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgca 4895  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||| || |||| || || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  4894 ttgaagtctaagaaattgactccaaagttcattggtccgtataagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 4795  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||||||||||||||    
T  4794 caaatttgcatgatgt 4779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 12839 - 13254
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  12839 ttgatagagttcacatataataacagttaccattctagtattggaatggcaccattcgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccattgtgttggt 12938  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| ||| ||||||  || |||||||| ||  |  ||||  | ||||| ||||||||   |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12939 tcgagtcaggttagagtgcagttttgggaccagaaattcttcagcaaactactgagaaagtttagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 13038  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13039 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaagaaggagaccatgtgttattgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgca 13138  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||  |||| || |||||||| || ||||    
T  13139 ttgaagtctaagaaattgacttcgagatttattagttcgtatcagatatcagaaagaatgggaatggtagcgtatggagtgggtttaccaccacaacttt 13238  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
     |||||| ||||||||    
T  13239 tgaatttacatgatgt 13254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22311 - 21932
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||| || ||  |||| || || ||||    
T  22311 ttgatcgagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagatctccgttgtgttggt 22212  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||  |||||||| |  |||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22211 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactattgagaaagttaaaatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcg 22112  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22111 acaaaagagttatcatgataagtgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgcgactggtgttggacgtgct 22012  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22011 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 32614 - 33029
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||| | || || || |||||||  ||||| || || ||||| || || ||||    
T  32614 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcatcttttgaggctttgtatgatcggagatgaagaactccgttgtgttggt 32713  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| |||| |||||| || || || || ||  | |||||  | |||||  |||| || | ||||||   ||| ||||||||||| ||| || ||||    
T  32714 ttgagtcaggtgggagtgtggttttagggccagaaattgttcaacaaactactaagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgtagggtcg 32813  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  32814 acaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttttaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacttgca 32913  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32914 ttgaagttaaagaagttgacttcgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatcttt 33013  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  33014 cgaatttgcatgatgt 33029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 419
Target Start/End: Original strand, 10610 - 11016
Alignment:
Q  12 gtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcg 111  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  10610 gtttacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtggtcggaggtgcagaactccgttacgttggtttgagtcg 10709  T
Q  112 ggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaga 211  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||| | |||||  ||||||| ||||| | ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10710 ggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaacagactacagagaaggccaat-tgataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaga 10808  T
Q  212 gttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtc 311  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||| ||    
T  10809 gttatcatgacaagtgtagaaaggatcttgagttacaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtataggtcgtgccttgaaatc 10908  T
Q  312 aaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttg 411  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| || | ||||||| | ||||| ||  |||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  10909 gaagaagttgacaccgaggtttattggtccatatcagatatctgagaaagttggaacagtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttg 11008  T
Q  412 catgatgt 419  Q
    ||| ||||    
T  11009 cataatgt 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 25727 - 26142
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||||||||    
T  25727 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagaatcctttatgctggt 25826  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  25827 ttgagttaggagagagtgttgtgctgggaccggatttggtccatcagactacggagaaggtaaagatgataagggaaaagatgaaagcgtctcagagtcg 25926  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||     
T  25927 acagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgca 26026  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  26027 ttgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaaaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttt 26126  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    | || |||||||||||    
T  26127 caaacttgcatgatgt 26142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16943 - 16705
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||    
T  16943 aagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 16844  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || ||||||   ||||| ||  |    
T  16843 ctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcatatag 16744  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16743 tgttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgt 16705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Original strand, 61072 - 61487
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  61072 cctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgct 61171  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  61172 ggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagag 61271  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||  ||||| ||||||    
T  61272 tcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgt 61371  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||| ||||  |||| |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| ||||    
T  61372 gcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatc 61471  T
Q  401 tttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||||||||||||||    
T  61472 tttcgaatttgcatga 61487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Original strand, 67460 - 67875
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  67460 cctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgct 67559  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  67560 ggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagag 67659  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||  ||||| ||||||    
T  67660 tcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgt 67759  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||| ||||  |||| |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| ||||    
T  67760 gcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatc 67859  T
Q  401 tttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||||||||||||||    
T  67860 tttcgaatttgcatga 67875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Original strand, 52038 - 52453
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  52038 cctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgct 52137  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52138 ggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagag 52237  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||  ||||| ||||||    
T  52238 tcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgt 52337  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||| ||||  |||| |||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| ||||    
T  52338 gcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatc 52437  T
Q  401 tttcgaatttgcatga 416  Q
    ||||||| ||||||||    
T  52438 tttcgaaattgcatga 52453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17410 - 17016
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || ||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  17410 aacagttatcattctagcattggaatggcaccttttgaggctctgtatggtcggaggtgtagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagattgtag 17311  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    | |||||||| ||  |  ||||  | ||||| | ||| || | ||||||   ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17310 ttttgggaccagaaatcattcaacaaactactgtgaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 17211  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17210 gcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgact 17111  T
Q  325 ccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17110 ccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 17016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5488 - 5250
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5488 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatggtaaacgcaggaaagatcttgagtttaaagaaggagaccacatatttttgagagtcactc 5389  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5388 ctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcg 5289  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5288 agtgggattaccactgcatctttcgaatttgcacgatgt 5250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 858 - 449
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  858 ttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 759  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || || |  || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   |||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||    
T  758 ttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcg 659  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  658 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgct 559  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  558 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttg 459  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  458 cgaatttgca 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7377 - 6972
Alignment:
Q  10 gagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 109  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  7377 gagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagt 7278  T
Q  110 cgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| ||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7277 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 7178  T
Q  210 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgt-ttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaa 308  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7177 gagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaa 7078  T
Q  309 gtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgca-tctttcgaa 407  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  7077 gtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcattctttcgaa 6978  T
Q  408 tttgca 413  Q
    ||||||    
T  6977 tttgca 6972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 43598 - 43189
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || || ||||| || |||||||    
T  43598 ttgatcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgttcggagatgcagaactccgttgtgctggt 43499  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  43498 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcg 43399  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  43398 acaaaagagttaccatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgct 43299  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  43298 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcatactgagtgggtttaccaccgcatcttt 43199  T
Q  404 cgaatttgca 413  Q
    ||||||||||    
T  43198 cgaatttgca 43189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8902 - 8520
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||  ||||| || || || || |    
T  8902 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagttaggtgaaagagtggtcttag 8803  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||||||  | |||||  ||||||| ||||||||   ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8802 gaccggagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtag 8703  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  8702 aaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 8603  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  8602 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaagggtggcttaccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgca 8520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 50376 - 50788
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  50376 ttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggt 50475  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  | |||||||| || || | | | || |||||   |||||||||||||||||||||    
T  50476 ttgagtcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcg 50575  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| | |||| | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  50576 acagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgca 50675  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||  | ||||| ||  | || || || || || |||||||    
T  50676 ttaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgccccctcatcttt 50775  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  50776 cgaatttgcatga 50788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13937 - 13832
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13937 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtatttttgagagtc 13838  T
Q  277 actcct 282  Q
    ||||||    
T  13837 actcct 13832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 106435 - 106757
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||| || || || ||||    
T  106435 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggctccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 106534  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| ||  | || |||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||     
T  106535 ttgaatccagagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaggatgattcag-gagaagatgaaagcatctcagagta 106633  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||    
T  106634 gacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcctgc 106733  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||    
T  106734 tttaaagtgtaggaagttgactcc 106757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 151 - 419
Target Start/End: Original strand, 832 - 1099
Alignment:
Q  151 actacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    ||||| |||||||| | ||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  832 actaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatggaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgaaaagcgtagaaaagatcttgagttccaag 931  T
Q  251 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  932 aaggagaccacgt-tttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 1030  T
Q  351 atcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || ||||| || ||||  |||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  1031 ataagaaaaagatggaaaggtggaatatcgagttggattaccacagcaactttcgaaattgcatgatgt 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 184 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28231 - 27995
Alignment:
Q  184 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |    
T  28231 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccgg 28132  T
Q  284 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagt 383  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  28131 tgactggtgttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttgaatcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagt 28032  T
Q  384 tggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28031 tggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 27995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 18399 - 18814
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| || |    
T  18399 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaaaactcctttatgttgat 18498  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18499 ttgagtcaggagaaagtgtagagttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcg 18598  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||     
T  18599 acagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgca 18698  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||  ||||||| ||||||| || ||| || | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  18699 ttgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtttgtatcagatatcagagagggttagaacagtggcatacagagtgggttttccaccacatcttt 18798  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
     |||||||||||||||    
T  18799 tgaatttgcatgatgt 18814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 57679 - 58093
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  57679 ttgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggt 57778  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||| |    
T  57779 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagagggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagttg 57878  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||  | || || || || ||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  57879 acaaaa-agttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgct 57977  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || | ||||||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||||| ||  ||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  57978 ttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtctgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 58077  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  58078 cgaacttgcatgatgt 58093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 48895 - 49310
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  48895 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtacgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgttggt 48994  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | |||||  |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  48995 tcgagtcacgtgaaagtgtggtattgggactggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcg 49094  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    | | |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| | || |||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||| ||||     
T  49095 atagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggaaatcatgtgtttctgagagtaacacctatgacaggtgtaggaagtgcg 49194  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| || || |||||| | | ||| |||  ||| || || ||||| |||||||    
T  49195 ttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagcggcatacaaagtgggtttgccaccacatcttt 49294  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  49295 cgaattttcataatgt 49310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 37646 - 37231
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  37646 ttgatggagttcacgtacaacaacaattaccattcgagtattggtatcgcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacccctttgtgttggt 37547  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37546 ttgagtcaggagaaactgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 37447  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| || |   ||||||||||||   |||| || |||||| | |||||||| ||| |||| ||||| || |||||     
T  37446 acagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggccattgagtttcaagggagagatcatgtgtttcttagagtcacccctatgacaggtgtaggtcgtgcg 37347  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  37346 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtctatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacctcatcttt 37247  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||||||||||||||    
T  37246 caaatttgcatgatgt 37231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 366
Target Start/End: Original strand, 38107 - 38398
Alignment:
Q  76 cggaggtgtaggactcctttatgctggttt-gagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatc 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  38107 cggaggtgcaggactcctttatgctggttttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttgaatcatcagactacggagaaagtcaagatgatt 38206  T
Q  175 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 274  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  38207 agagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagag 38306  T
Q  275 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgga 366  Q
    | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  38307 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttgga 38398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 366
Target Start/End: Original strand, 27370 - 27561
Alignment:
Q  175 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 274  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  27370 agagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagag 27469  T
Q  275 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgga 366  Q
    | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  27470 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttgga 27561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7794 - 7412
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  7794 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttag 7695  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||||||    |||||  ||||||| ||||||||   ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7694 gaccggagactgttcaacagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtag 7595  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  7594 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 7495  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  7494 ttcattggtccgtatcagatattggagagagttggaacggtggcttagcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgca 7412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 8207 - 7855
Alignment:
Q  31 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||| | || || ||||| || || |||||||||||  |||| || || || || |    
T  8207 tatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggtgatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttag 8108  T
Q  131 gaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||| ||||| || | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8107 gaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtag 8008  T
Q  231 aaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgaga 330  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8007 gaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcacttcggtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgaga 7908  T
Q  331 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagt 383  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7907 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 7855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3548 - 3169
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || | |||||||||  ||||||||||    ||||| || ||      
T  3548 agtattggaatggcaccattcgaggctttgtatggccggagatgcagaactccattgtgttagtttgagtcaagtgagagtgtaaatttggggccagaaa 3449  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | || ||  | ||||| ||||| || | |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3448 tcgtgcaacaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagacct 3349  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3348 taagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggt 3249  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
     |||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3248 tcgtatcagatatttgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgt 3169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15321 - 14906
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||||||  ||| ||| || ||||| || || ||||    
T  15321 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattccagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggtaggaagtgcagaactccattgtgttggt 15222  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| ||||||||||| || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | ||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15221 tcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtctcagagtcg 15122  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  15121 acatatgagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcatgaaggagatcatgtatttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgcgca 15022  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15021 ttgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggcttaccaccgcatcttt 14922  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  14921 cgaacttgcatgatgt 14906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 116767 - 117182
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| ||| |||| || ||||   ||||||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  116767 ttgatagagttgacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccatttgaagttctgtatggtcggaggtgtaggactctgttgtgttggt 116866  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||||||  |  | |||||  | ||||| ||||| || | | |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  116867 tcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcg 116966  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  116967 acaaaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgagtttcaagaaagagaacaagtatttttgagagtcactcatgtgaatagtgttggacgtgca 117066  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| || ||||||||| || |||    
T  117067 ttgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattgtaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgtatattt 117166  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  117167 cgaatttgcatgatgt 117182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 98459 - 98137
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | |||  | ||||| ||||||| |||||| || |  |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  98459 ttgattgagtttactttcaacaacagttttcatgctagtatcggtatggtaccgtttgaggttttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 98360  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  98359 ttgagtccggagagagtgttttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 98261  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || ||||||||||| || || | |||| |||| || ||||| |||||    
T  98260 gacagaagagttatcatgataagaggagtaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgc 98161  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  98160 tttgaagtgtaggaagttgactcc 98137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 326
Target Start/End: Original strand, 23553 - 23650
Alignment:
Q  229 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23553 agaaaggatattgagtttcatgttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 23650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20533 - 20151
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  20533 tcgagtataggtatgacattgttcgaagctttgtatagtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccgg 20434  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |     
T  20433 atttggttcatgagactacgaaaaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggc 20334  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     ||||||||||| || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||     
T  20333 ccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatc 20234  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| | ||||| || ||||||   ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20233 ggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 20151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 43916 - 43534
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  43916 tcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacgg 43817  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |     
T  43816 atttggttcatgagactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggc 43717  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     ||||||||||| || || || || |||||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || ||     
T  43716 ccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatc 43617  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43616 ggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 43534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 44928 - 44546
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  44928 tcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacgg 44829  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |     
T  44828 atttggttcatgagactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggc 44729  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     ||||||||||| || || || || |||||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || ||     
T  44728 ccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatc 44629  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44628 ggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 44546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 36219 - 36084
Alignment:
Q  284 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagt 383  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| || ||||||   ||||| ||  ||||    
T  36219 tgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagt 36120  T
Q  384 tggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  36119 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcaagatgt 36084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 186 - 419
Target Start/End: Original strand, 26 - 259
Alignment:
Q  186 gaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||    
T  26 gaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtg 125  T
Q  286 actggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttg 385  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||      
T  126 actggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtga 225  T
Q  386 gattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  226 gtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 151 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 49790 - 49522
Alignment:
Q  151 actacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    ||||| |||||||| | ||||||   ||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49790 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaagaggaaagcgtcgcagagttggcaaaagatttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 49691  T
Q  251 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 350  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  49690 aaggagaccacatattttttagagtcactcctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggcccgtatcagat 49591  T
Q  351 atcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49590 atcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgt 49522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 177 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 30
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  273 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatcttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgagagtc 174  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| |    
T  173 aatccggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatagtggcat 74  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  73 atcgagttggtttaccaccgcatctttcaaattttcatgatgtc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 185 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 1268 - 1033
Alignment:
Q  185 tgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgt 284  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  1268 tgaaatcgtcgcagagtcggcaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagttcaaagaaggagatcatgtattcttgagagtcacccctgt 1169  T
Q  285 gactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagtt 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| || |||||||||||||     
T  1168 gactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcggatatcggaaagagttggaacgttggcgtaccgagtg 1069  T
Q  385 ggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1068 ggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtc 1033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 24933 - 25348
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||| | ||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||    
T  24933 ttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattctagtatttggatgacaccattcgaagctttgcatggtcggaggtgcagaactccgttctgttggt 25032  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||| || || || | | | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25033 ttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactacagaaaaggttaagctaataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 25132  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||| |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25133 acagaagacttatcacgacaaacgtaggaaagatcttgaatttcaagcaggagaccatgtgtttctaagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgct 25232  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  25233 ttgaaatcgaagaagttgacgctgaggtttattggctcgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatcttt 25332  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  25333 cgaatttgcatgatgt 25348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 343
Target Start/End: Original strand, 16211 - 16372
Alignment:
Q  182 agatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcc 281  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| | || |||||||  || || || |||||||| || || | |||    
T  16211 agatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatatagactttcaagttggggatcatgtgtttttaagggtgaatcc 16310  T
Q  282 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 343  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  16311 tgtgaccggtgtttgtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttattggaccgt 16372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 43227 - 42812
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43227 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggaggtgtaggactcctctatgctggt 43128  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  43127 ttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 43028  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||    || |||||||| || || || || || ||| | || ||||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  43027 acagaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgca 42928  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  42927 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatcttt 42828  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
     ||| |||||||||||    
T  42827 tgaacttgcatgatgt 42812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 417
Target Start/End: Original strand, 16390 - 16740
Alignment:
Q  67 ttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtca 166  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || |||||  |  | |||||  | ||||| ||||| || |    
T  16390 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccaaaaattgttcaacaaactactgagaaggtta 16489  T
Q  167 ggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 266  Q
     ||||||   | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  16490 agatgattcaataaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatt 16589  T
Q  267 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16590 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcacattgaagtcaaagaagttgactcagaggtttactggtccgtatcagatatcgaaaagagttgga 16689  T
Q  367 tcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgat 417  Q
     |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16690 acggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgat 16740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 249024 - 248642
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  249024 tcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtaggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccga 248925  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||       
T  248924 acttggttcatgagactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtc 248825  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     || |||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||    
T  248824 cctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatt 248725  T
Q  337 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||   ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  248724 ggtccgtatcagatttcagagaaagttggaaaagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 248642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 1096 - 1385
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1096 ttgatagaatttacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 1195  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  1196 tcgagacgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagttg 1295  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgt 293  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| || |||||| |||| |||||    
T  1296 acaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgt 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1316 - 937
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| || ||||  || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||     
T  1316 agtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggttggaggtgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagata 1217  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  | ||||| |||||  | | |  ||||  ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1216 tcgttcagcaaactactgagaagattaagtggatccaagaaaagattaaagcgtcgcagatttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagacct 1117  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1116 tgagtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaaatgaaagaaattgaatccgaggtttattggt 1017  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1016 ccatatcagatatcagaaagaattggaacagtggcatatcgattgggtttaccaccgcatctttcgaatatgcatgatgt 937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 5776 - 6191
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||    
T  5776 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactccattgtgttggt 5875  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||| | | ||||| || || |||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5876 ttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcgtcaaactacagaaaaggtcaagttgataagagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcg 5975  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  || |||||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||||     
T  5976 acaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggtcgtgca 6075  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| || ||||||||| | ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||    
T  6076 ttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaactgtggcatatagagtgggtttgccaccacatcttt 6175  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||| ||||||    
T  6176 cgaatttgcttgatgt 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 12643 - 13058
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12643 ttgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcttttatgctggt 12742  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  12743 ttgagtcaggagagagtgttgtattaggaccagatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcg 12842  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    | | || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||  |||| ||||| | |||||||    
T  12843 atagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtagaacgtgct 12942  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||  || |||||||||||| || | ||||| ||  ||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  12943 ttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattggtccgtattagatttcagagaggattggaacggtggcatacagagttggcttgccaccacatcttt 13042  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  13043 cgaacttgcatgatgt 13058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 25581 - 25996
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | || |||||| ||||| || || ||||    
T  25581 ttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcagaagtgtagaactccgttgtgttggt 25680  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||  | ||||| ||||| || | | | |||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25681 tcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttaatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 25780  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  25781 acaaaagaattatcatgataagcgtaggaaggactttgagtttcaggaaggaaaccatgtattttttagagtcactcctatgactggggttggacgtgca 25880  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||||| |||  | |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  25881 ttgaagtcaaggaaactaactcggatgtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaaccgtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatcttt 25980  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  25981 cgaatttgcacgatgt 25996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 77 - 419
Target Start/End: Original strand, 195 - 537
Alignment:
Q  77 ggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcag 176  Q
    |||||||||||||||  || || ||||| || || ||||||||||  || |||||||| ||  | || ||  | ||||| ||||| || | |||||||      
T  195 ggaggtgtaggactctgttgtgttggttcgaatcaggtgagagtgcagttttgggaccagaaattgtacagcaaactactgagaaggttaagatgatcca 294  T
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  295 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaacaactaccatgataagcgtaggaaagacattgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtc 394  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    | |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||    
T  395 aatcctgtaaccggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaaggattggaatggtggcgt 494  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  495 atcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 151 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4329 - 4063
Alignment:
Q  151 actacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    ||||| ||||| || | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  4329 actactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttactatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaag 4230  T
Q  251 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 350  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  4229 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccatatcagat 4130  T
Q  351 atcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgat 417  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4129 atcagaaaggattggaacggtggcgtatcaagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgat 4063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 181 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15522
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  15759 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgacagtcattc 15660  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||    
T  15659 ttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcatatcg 15560  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  15559 agtaggtttaccaccacat-tttcgaatttgcacgatgt 15522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15922 - 15832
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttga 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15922 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttga 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 7100 - 7513
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7100 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcgccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 7199  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7200 ttgtgtcaggagagggtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagtctacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcg 7299  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||| ||||||| || || || || || ||| |||| || ||| || |||  ||||| ||||||||     
T  7300 acataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttaagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttacttctatgatgggtgtaggacgtgca 7399  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||||   |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||| |||    
T  7400 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaa--ggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatattt 7497  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||| |||||||||||    
T  7498 cgaacttgcatgatgt 7513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 6898 - 7313
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  || || ||||    
T  6898 ttgatagagttcacgtataacaacaattaccattcgagtattggtatgataccgttcgaagcattgtatggtcggaggtgcagaactcaattgtgttggt 6997  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || |||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6998 ttgagtcgacagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcaaactacagaaaaggtcaagttgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcg 7097  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| || |||||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||||     
T  7098 acagaagagttatcatgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctatgacaggtgtaggtcgtgcg 7197  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  7198 ttgaagtctaagaagttgactccgaagttcattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatcttt 7297  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  7298 cgaatttgcatgatgt 7313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2238 - 1916
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2238 ttgatagagttcacgtacaactacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggt 2139  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  2138 tcgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttgattcttcagactacggagagggtcaagatgataagagaaaaggtgaaagcgacgcagagtcg 2039  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  2038 acaaaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgca 1939  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  1938 ttgaagtctaagaagttgactcc 1916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 3217 - 3443
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3217 ttgatagagttcacatagaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 3316  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3317 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaacggatttggttcatcagactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 3416  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  3417 acagaagagttatcgtgataaacgtag 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 40185 - 39768
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  40185 cctttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaatgtttgaagctctgtatggtcggaggtgcag-actcctttatgtt 40087  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40086 ggtttgagtcgggagaaagtgtggtattgggaccggatttggttcatcagactaacgagaaagtcaagattataagagaaaagatgaaagcgtcgcagag 39987  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||     
T  39986 tcgacagaagagttactatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgc 39887  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatc 400  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||| | |||| || || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| ||||    
T  39886 gcactcaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatccgatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatc 39787  T
Q  401 tttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | |||||||||||||||||    
T  39786 tctcgaatttgcatgatgt 39768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5657 - 5313
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  5657 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtaatggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaagtgcaggactccgttatgctggt 5558  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5557 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataaggaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 5458  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||    
T  5457 acagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgct 5358  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 348  Q
    ||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5357 ttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 5313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 28630 - 29046
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  ||||  | ||    
T  28630 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactctgttatctttgt 28729  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcaga-gagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||||| |||||| ||||  |||||||||||  || | |||||| ||||||  || || ||||   |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28730 ttgagttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcatcagactatagaaaaggtcaaattgataagaggagaagatgaaagcatcgcaaagtc 28829  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  | |||||    
T  28830 gacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgc 28929  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| | || || ||||||||  | ||||| ||  |||| || |  ||| | |||||     
T  28930 tttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttacccatcacatctc 29029  T
Q  403 tcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||    
T  29030 tcgaatttgcatgatgt 29046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 40621 - 41037
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  ||||  | ||    
T  40621 ttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactctgttatctttgt 40720  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcaga-gagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||||| |||||| ||||  |||||||||||  || | |||||| ||||||  || || ||||   |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  40721 ttgagttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcatcagactatagaaaaggtcaaattgataagaggagaagatgaaagcatcgcaaagtc 40820  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  | |||||    
T  40821 gacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgc 40920  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| | || || ||||||||  | ||||| ||  |||| || |  ||| | |||||     
T  40921 tttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttacccatcacatctc 41020  T
Q  403 tcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||    
T  41021 tcgaatttgcatgatgt 41037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11180 - 10869
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  11180 tcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagttaggagagagtgtggtgttgggaccgg 11081  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |     
T  11080 atttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaatgcgtcttagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggc 10981  T
Q  237 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 336  Q
     ||||||||||| || || || || |||||| | || || ||| || ||||  |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||     
T  10980 ccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttcttagggttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatc 10881  T
Q  337 ggtccgtatcag 348  Q
    ||||||||||||    
T  10880 ggtccgtatcag 10869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9414 - 9047
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||    
T  9414 ttgatagagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtagaaggtgcaggactccgttgtgttggt 9315  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || ||||||||| | || || | ||| ||  | |||||  | ||| | ||||| || | ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9314 ttgattcaggtgagagtctggttttagcaccagaaattgttcaacaaactgctgagaaggttaagataatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 9215  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9214 acaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggggatcatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgcg 9115  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  9114 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggt 9047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 326
Target Start/End: Original strand, 368 - 517
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || || ||||| ||||||||     
T  368 agagaagatgaaagcatctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttcttgagagtg 467  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  468 aatcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Original strand, 216 - 349
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| || || || |||| ||| || ||||||||||| |  ||||| ||||    
T  216 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccatttgaggctttgtgtggtcgaaggtgtaggacgcggttatgttggt 315  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgga 137  Q
    |||| || ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  316 ttgattcaggtgaaagtgctttgttaggaccgga 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 419
Target Start/End: Original strand, 4912 - 5279
Alignment:
Q  52 gcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgaga 151  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||| |||  |||| |||||| |||    
T  4912 gcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtggggagaaagtgtggtgttggaaccatatttagttcatcaga 5011  T
Q  152 ctacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaaga 251  Q
    | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  5012 ccacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaaga 5111  T
Q  252 aggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtta 351  Q
     ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  5112 gggagatcatgtgtttctgagaatcactcctatgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggttcgtatcagata 5211  T
Q  352 tcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||  | || |||||| |  |||| |||  ||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5212 tctaagagggttggaacactggcatacatagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgt 5279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 419
Target Start/End: Original strand, 1104 - 1446
Alignment:
Q  77 ggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcag 176  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  1104 ggaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagtcaggagaaagtgttatgttgggaccggatttggttcattagactacggagaaggtcaagataataag 1203  T
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||     
T  1204 agaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtt 1303  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgt 376  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| |    
T  1304 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcat 1403  T
Q  377 accgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |   | | || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1404 aaaaaataggtttgccaccacatctttcgaaattgcatgatgt 1446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4281 - 3920
Alignment:
Q  58 ttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacgg 157  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||  |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  4281 ttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactcctatatattggtttgagtcaagagaaagtgtagtgttgggaccggatttagtttatcagactacgg 4182  T
Q  158 agaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggaga 257  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| |||||    
T  4181 agaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagatggaga 4082  T
Q  258 ccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaa 357  Q
     || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||| |||| ||     
T  4081 tcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtctgtatcagatatctgag 3982  T
Q  358 agagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    || |||||| | ||||| |||  |||||  || || || |||||||||||||||||| ||||    
T  3981 agggttggaacagtggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgcattatgt 3920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 1
Alignment:
Q  5 tgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtt 104  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  312 tgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgttatggaac-gttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattatgttggtt 214  T
Q  105 tgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcga 204  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  213 tgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcatagagtcgg 114  T
Q  205 caaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctt 304  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  113 cagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcat 14  T
Q  305 tgaagtcaaagaa 317  Q
    ||||||| |||||    
T  13 tgaagtctaagaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 972 - 557
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  972 ttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggctcctttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 873  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  ||||||| || || || | | |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  872 ttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagaaaacagatgaaagcgtcgcagagtcg 773  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||     
T  772 acataagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagttactcctatgacaggtgtaggcagtgca 673  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  | ||||| || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||    
T  672 ttaaaatctaagaagttgactccgaagtttatcggtccgtatcaaatttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatcttt 573  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  572 cgaatttgcatgatgt 557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 5315 - 5543
Alignment:
Q  5 tgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtt 104  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  5315 tgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttggatggtcggaggtgtaggactcctttctgatggtt 5414  T
Q  105 tgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcga 204  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5415 tgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcga 5514  T
Q  205 caaaagagttatcatgataagcgtagaaa 233  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5515 cagaagagttaccatgacaagcggagaaa 5543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 126 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14407 - 14115
Alignment:
Q  126 gttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  14407 gttgggaccggatttggttcatcagactacggagaatgtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaag 14308  T
Q  226 cgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactc 325  Q
    | |||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14307 catagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactc 14208  T
Q  326 cgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||  ||||| ||| ||||  || |||| ||||| |||||| | ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14207 cgaagtttatcggttcgtactagatatctgaaag-gttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgt 14115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 347
Target Start/End: Original strand, 678 - 985
Alignment:
Q  40 agtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatt 139  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||      
T  678 agtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagaga 777  T
Q  140 tggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 239  Q
    | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  778 ttgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 877  T
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  878 tgagtttaaggaaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggt 977  T
Q  340 ccgtatca 347  Q
    ||||||||    
T  978 ccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 333 - 107
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| || || |||||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  333 ttgatagagttcacatacaacaaccgttaccattcgagtatttgtatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggt 234  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  233 ttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgtagagtcg 134  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  133 acagaagagttaccatgacaagcgtag 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 326
Target Start/End: Original strand, 946 - 1094
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 277  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || |    
T  946 gagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 1045  T
Q  278 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1046 atcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 1094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Original strand, 33539 - 33951
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  33539 ttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggt 33638  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| ||  | |||||  | |||||||| || || | | | || |||||   |||||||||||||||||||||    
T  33639 ttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcg 33738  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  33739 acagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgca 33838  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
    || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||  | ||||| ||  | || || || || || |||||||    
T  33839 ttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgccccctcatcttt 33938  T
Q  404 cgaatttgcatga 416  Q
    |||||||||||||    
T  33939 cgaatttgcatga 33951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40702 - 40380
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  40702 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 40603  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || || || |||| | |||| || |||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  40602 ttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 40504  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  40503 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgc 40404  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||    
T  40403 tttaaagtgtaggaagttgactcc 40380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 5453 - 5867
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || || || || ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  5453 ttgattgagttcacgtataataacagttaccattctagcattggaatgacaccgttcgaagcgttgtttggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 5552  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
     |||||| ||||||| ||| ||  | ||||| ||  | |||||  | || || ||||| || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5553 atgagtccggtgagaatgtggtactaggacctgaaattgttcaacaaacaacagagaaggttaagttgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtag 5652  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  5653 acaaaagagttatcatgataagcgca-aaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgagca 5751  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
     | ||||| |||||  || ||||||| |||| |||| |||||||  | ||| ||||||||||  | || |||||  ||||  | |||||||| |||||||    
T  5752 ctaaagtcgaagaaactgtctccgaggtttaatggttcgtatcatatttcataaagagttgggacagttgcgtatagagtgagtttaccaccacatcttt 5851  T
Q  404 cgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  5852 cgaatttgcatgatgt 5867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 411
Target Start/End: Original strand, 16455 - 16685
Alignment:
Q  181 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||   |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  16455 aagatgaaagcgtcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtagggaggatcttatatttcaagaaggagatcatgtattttttagggtcactc 16554  T
Q  281 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccg 380  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||| |     
T  16555 cagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttgacaccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagaattggaatggtggcgtatca 16654  T
Q  381 agttggattaccaccgcatctttcgaatttg 411  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||    
T  16655 tgtaggtttaccaccgcatctttcgaatttg 16685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7694 - 7522
Alignment:
Q  151 actacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    ||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7694 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaatgagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 7595  T
Q  251 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 323  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 407
Target Start/End: Original strand, 86366 - 86769
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||  || || ||||    
T  86366 ttgatcgagttcacttataataacagttaccattctagcattgcaatggtaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggt 86465  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
     |||||| ||||||| ||| ||  ||||||| ||  |  ||||  ||||||| ||||| || | | |||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  86466 atgagtccggtgagactgtggtactgggaccagacatttttcaacagactactgagaaggttaagttgataagagaaaagatggaagcgtcacagagtag 86565  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  86566 acaaaagagttatcatgataatcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgca 86665  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatcttt 403  Q
     | || ||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||    
T  86666 ctaaaatcaaagaaactgacttcgaggtttattggcccgtatcaaatttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcaacttt 86765  T
Q  404 cgaa 407  Q
    ||||    
T  86766 cgaa 86769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 46672 - 46560
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||  |||| || || ||||| || |||||||    
T  46672 ttgatcgagttcacttacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtaggagatgcagaactccgttgtgctggt 46573  T
Q  104 ttgagtcgggtga 116  Q
    ||||||| |||||    
T  46572 ttgagtcaggtga 46560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19287 - 18881
Alignment:
Q  10 gagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 109  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||    
T  19287 gagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcagaactcctttgtgttggttcgagt 19188  T
Q  110 cgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 209  Q
    |||| || |||||  ||||||| ||  |  | |||||  ||||||| || ||  | | | |||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19187 cgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaacagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatgaaagcgtcgcagagtcaacagaa 19088  T
Q  210 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaag 309  Q
    ||| |||||||| |||||||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||     
T  19087 gagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaa 18988  T
Q  310 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatt 409  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||  | ||||||||  |||| || || ||||| |||||||||||||    
T  18987 tctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgggacagtggcgtatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatt 18888  T
Q  410 tgcatga 416  Q
    |||||||    
T  18887 tgcatga 18881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23449 - 23094
Alignment:
Q  10 gagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 109  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||    
T  23449 gagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcagaactcctttgtgttggttcgagt 23350  T
Q  110 cgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 209  Q
    |||| || |||||  ||||||| ||  |  | |||||  ||||||| || ||  | | | |||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  23349 cgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaacagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatgaaagcgtcgcagagtcaacagaa 23250  T
Q  210 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaag 309  Q
    ||| |||||||| |||||||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||     
T  23249 gagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaa 23150  T
Q  310 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgg 365  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||    
T  23149 tctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgg 23094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 168 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 223
Alignment:
Q  168 gatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||    
T  471 gatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgttttt 372  T
Q  268 ttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggat 367  Q
     |||| || |||||| |||| ||| | |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  371 ctgagggttactcctatgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttggaa 272  T
Q  368 cggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatga 416  Q
    | ||||| ||  ||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  271 ctgtggcatatagagttggtttgcctcctcatctttcgaatttgcatga 223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17142 - 16986
Alignment:
Q  263 tgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||    
T  17142 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagt 17043  T
Q  363 tggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |  | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042 tttaacggtggcgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 16986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 46598 - 46276
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  46598 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 46499  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  46498 ttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 46400  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  46399 gacaaaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgtgc 46300  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  46299 tttgaagtgtaggaagttgactcc 46276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Original strand, 6232 - 6374
Alignment:
Q  37 tcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccgg 136  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  6232 tcgagtataggtatggcatcgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcagaagagagtgtggtgttgggaccgg 6331  T
Q  137 atttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagaga 179  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  6332 atttggttcatgagactacagaaaaagtcaagatgatcagaga 6374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 284 - 419
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4702
Alignment:
Q  284 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagt 383  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  384 tggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgcatgatgt 4702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 4337 - 4560
Alignment:
Q  25 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttg 124  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||||||  |||  ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  4337 aacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggttggatttgtagaactcctttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtgg 4436  T
Q  125 tgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 224  Q
    | || ||||| ||  | |||||  | ||||| || ||  | | ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4437 ttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgacaagcttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataa 4536  T
Q  225 gcgtagaaaagatcttgagtttca 248  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    
T  4537 gcgtaggaaagatctcgagtttca 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 59024 - 58972
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  59024 gagaagatgaaagcgtcgtagagtagacaaaagcgttatcatgatcagcgtag 58972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 420
Target Start/End: Original strand, 36974 - 37024
Alignment:
Q  370 gtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtc 420  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36974 gtggcgtatctagttggattaccaccgcctcttacgaatttgcatgatgtc 37024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23838 - 23518
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | |||  | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  23838 ttgattgagtttacttacaacaacatttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgttggt 23739  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  23738 ttgagtctggagagagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaagcgtctcagagta 23640  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||   | || |||||||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||    
T  23639 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttagtgatcacgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgc 23540  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgact 324  Q
    ||||||||  | ||||||||||    
T  23539 tttgaagtgtaggaagttgact 23518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 916 - 1222
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | |||||  | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||  | || ||||    
T  916 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatacaagtatcagaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccaatgtgttggt 1015  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||||| || || | |||| ||  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  1016 ttgagttaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatggtccaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 1115  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |  || || || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  1116 acagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttctggttggcgatcatgtattttttagagtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgct 1215  T
Q  304 ttgaagt 310  Q
    |||||||    
T  1216 ttgaagt 1222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13352 - 13030
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||| || || || ||||    
T  13352 ttgattgagtttacctacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtaggacaccattgtgttggt 13253  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || ||||| |   |||| ||||||||  | || || ||||||||||| || || |  ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  13252 ttgaatccggagagagagccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaaaatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 13153  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||    
T  13152 acagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgaccggtgttggtcgtgct 13053  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  13052 ttgaagtgtaggaagttgactcc 13030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14967 - 14661
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||   | || || | ||    
T  14967 ttgattgagtttagttacaacaacagttttcattcttgtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggatgtcgttgtgtttgt 14868  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||  | || || ||||||||||| ||| | | ||||||   |||||||||||||| ||| |||||| |    
T  14867 ttgagtcaggtgaaagtgttttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaatttaagatgattgaagagaagatgaaagagtctcagagtag 14768  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||||||||| |  || || || |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  14767 acagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgct 14668  T
Q  304 ttgaagt 310  Q
    |||||||    
T  14667 ttgaagt 14661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 248 - 570
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||  |||| || |||||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  248 ttgattgagtttacttacaacaacaattttcattcttgtatcggaatggcaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 347  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||  | ||  | ||||||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  348 ttgagtccggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgaaagagactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcagagta 446  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || |  || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  447 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgc 546  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||| |||  | ||||||||||||    
T  547 tttggagtgtaggaagttgactcc 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15100 - 14779
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| | ||| |||||||| || |  ||||||||  ||||||||||||| || || || ||||    
T  15100 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcgatatagcaccgtttgaggttttgtatggtaggaggtgtaggacaccgttgtg-tggt 15002  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||||| || || | ||||||    ||||||||||| | ||| |||||| |    
T  15001 ttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatttaggagaagatgaaggtgtctcagagtag 14902  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  14901 acagaaaagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgct 14802  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  14801 ttgaagtgtaggaagttgactcc 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43982 - 43737
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||  ||||||||||||| || || ||||||||  ||||||||| ||| ||  | || ||||    
T  43982 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcagtatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtatgacaccgctgtgttggt 43883  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || || |||| | | || ||||||||  | || || ||||||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  43882 ttgagtccggagaaagtgctttattaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaagcgtctcagagta 43784  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaa 249  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  43783 gacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaa 43737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3606 - 3281
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || || |||| ||| || || || |    
T  3606 cctttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaagacaccgttgtgtt 3507  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagag 200  Q
     |||||| || || || |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||| ||| || || | ||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  3506 agtttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactatggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagag 3407  T
Q  201 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgt 300  Q
    | |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||||| |  || || || |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| |||    
T  3406 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtattggtcgt 3307  T
Q  301 gctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||    
T  3306 gctttgaagtgtaggaagttgactcc 3281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 71663 - 71442
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |  || || ||||    
T  71663 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacactgttgtgttggt 71564  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || || || ||||||||||| ||||||||  | || || ||||||||||| || || | |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  71563 ttgaatctggagaaagtgttgtgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 71464  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataag 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  71463 acagaagagttatcatgataag 71442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13531 - 13397
Alignment:
Q  168 gatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttt 267  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||  | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||| ||     
T  13531 gatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcacgtattc 13432  T
Q  268 ttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||    
T  13431 ttgagagttaatcctgtaactggtgttggtcgtgc 13397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Original strand, 3737 - 4059
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  3737 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccattgtgttggt 3836  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| ||  | ||||||| | |||| || | |||  | || || || |||||||| || || | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  3837 ttgaatccagagagagtgctttgttaggcctggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaagcgtctcagagta 3935  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  |  || || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  3936 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttttaagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgc 4035  T
Q  303 tttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||    
T  4036 tttaaagtgtaggaagttgactcc 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1206
Alignment:
Q  240 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 339  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  340 ccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||||||| ||||  | || |||||| | ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgt 1206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Original strand, 28128 - 28467
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | |||  | ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||  | ||||||||||| || || || ||||    
T  28128 ttgattgagtttacttacaacaacaattttcatgctagtatcggtatgacaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtaggacaccattgtgttggt 28227  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |  | || || || |||||||| || || | ||||||   |||||||||||| || || || ||| |    
T  28228 ttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccgaaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcatctcaaagtag 28327  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| ||| || || ||||||||||| || | || |||||| |||||||| ||||||    
T  28328 acagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagttacaagtaggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgct 28427  T
Q  304 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 343  Q
    |||||||  | ||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  28428 ttgaagtgtaggaagttgactcctcgatttgttggaccgt 28467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 3806 - 4112
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | | || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  3806 ttgattgagtttacttacaacaacagtttttattctagtatcggcatggctccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 3905  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    ||||||| || ||||||| | ||||  |||||||  | || || ||||||||| | || || | ||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||     
T  3906 ttgagtccggagagagtgctttgttaagaccggaagttgtgcaagagactacgaaaaaggttaagatgattcag-gagaagatgaaggcgtctcaaagta 4004  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||||||||| | |   ||||| |||||||| |||||    
T  4005 gacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatttggtgaccggtgttggtcgtgc 4104  T
Q  303 tttgaagt 310  Q
    ||||||||    
T  4105 tttgaagt 4112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 1286 - 1532
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| || ||| ||||||| || || |||||||| | |||||||||||| || || || | ||    
T  1286 ttgattaagttcacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatgacaccgtttgaggctttgtatggactgaggtgtaggacaccgttgtgttagt 1385  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||  | || || ||||||||||| || || | |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  1386 ttgagtcaggtgaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 1485  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    | | ||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||    
T  1486 atagaagagttatcatgataagaagagaaaggatattgagtttcaag 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Original strand, 10431 - 10493
Alignment:
Q  264 gtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  10431 gtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 326
Target Start/End: Original strand, 14600 - 14921
Alignment:
Q  5 tgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||| || | ||| || ||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||| || || || || |||||    
T  14600 tgattgagtttacttacaacaacagttttcattctactatcggaatggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttggtt 14699  T
Q  105 tgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcga 204  Q
    ||| || || || || | | |||| ||||||||  | || || || |||||||| || || | ||||||   |||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  14700 tgaatccggagaaagcgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtaga 14799  T
Q  205 caaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctt 304  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |  || || || ||||||||||| || | || ||||||  ||||||| |||||||    
T  14800 cagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgaatttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccagtgttggtcgtgctt 14899  T
Q  305 tgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    ||||||  | ||||||||||||    
T  14900 tgaagtgtaggaagttgactcc 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10625 - 10493
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || |    
T  10625 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 10526  T
Q  278 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 310  Q
     |||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  10525 atcctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6011 - 5879
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  || || || ||||||||||| || |    
T  6011 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 5912  T
Q  278 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 310  Q
     |||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  5911 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 5879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24327 - 24002
Alignment:
Q  1 cctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgct 100  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |  | ||| || ||||| || ||| ||||||| || || |||||||| | |||||||||||| || || || |    
T  24327 cctttggtagagtttacttacaacaataattttcattctagtatcggaatgacaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtaggacaccgttgtgtt 24228  T
Q  101 ggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgat-cagagagaagatgaaagcgtcgcaga 199  Q
     ||| |||||  ||||||||| | |||| ||||| ||  | || || ||||||| ||| || || | |||||| ||| |||||||| ||||| || || |    
T  24227 agttcgagtcaagtgagagtgctttgttaggaccagaagttgtccaagagactatggaaaaggttaagatgattcag-gagaagattaaagcatctcaaa 24129  T
Q  200 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 299  Q
    || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  24128 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttttttagagttaatccggtgactggtgttggtcg 24029  T
Q  300 tgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||    
T  24028 tgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 419
Target Start/End: Original strand, 4235 - 4416
Alignment:
Q  238 cttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 337  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || |    
T  4235 cttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcg 4334  T
Q  338 gtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    ||||||||||| | ||| | || |||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4335 gtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 4416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8488
Alignment:
Q  178 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  || || || ||||||||||| || |    
T  8620 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 8521  T
Q  278 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 310  Q
     |||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8520 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Original strand, 3754 - 3810
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3754 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 8753 - 9059
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | |||  | | ||| || ||| ||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  8753 ttgattgagtttacttacaaaaacagttttcatactaatatcggaatgacacagtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 8852  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    |||| || |  || |||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||||| || || | ||||||   |||||||||||||||||| |||||| |    
T  8853 ttgaatccgaagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 8952  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||||||||| |  || || ||  |||||||||| || | || ||| || |||||||| ||||||    
T  8953 acagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatctgtttttgagggtgaatcatgtcaccggtgttggtcgtgct 9052  T
Q  304 ttgaagt 310  Q
    |||||||    
T  9053 ttgaagt 9059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9431 - 9125
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |  ||| ||||||| || || |||||||| || || ||||||   || || || ||||    
T  9431 ttgatttagtttacttataacaacagttttcattctagtatcgcgatgacaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaggttaccgttgtgttggt 9332  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcg 203  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||| |||| |||  | || || |||||||| || || || | ||||||   |||||||||||||||||| |||||| |    
T  9331 ttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggacaggaagttgtgcaagagactacagaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 9232  T
Q  204 acaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgct 303  Q
    | | ||||| ||||||||||||   ||||| ||| |||||||||| |  || || || || || |||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||    
T  9231 atagaagagctatcatgataagatgagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgct 9132  T
Q  304 ttgaagt 310  Q
    |||||||    
T  9131 ttgaagt 9125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 26019 - 26265
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||| || || || ||||    
T  26019 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggacaccgttgtgttggt 26118  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatga-tcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    || | || ||||| |||  | |||| ||||  ||  | || || || |||||||| || || | ||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  26119 tttaatccggtgaaagttctttgttaggactagaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcag-gaaaagatgaaggcgtctcagagta 26217  T
Q  203 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 250  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  26218 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaag 26265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8395 - 8217
Alignment:
Q  148 gagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 247  Q
    ||||||||||| || || | ||||||   |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  8395 gagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaatatgaaagcgtctcagagtagacagaagacttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 8296  T
Q  248 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 326  Q
    |||  || || || || |||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  8295 aagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgatgtgtaggaagttgactcc 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136148
Alignment:
Q  289 ggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggat 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  389 taccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 136148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 136354 - 136269
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggac 89  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  136354 ttgatagagttcacatacaacaacagttacaattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggac 136269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 93 - 8
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggac 89  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  93 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggccttgtatggtcggaggtgtaggac 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Original strand, 13380 - 13530
Alignment:
Q  269 tgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatc 368  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||  ||||||| |||| || || |||||| |    
T  13380 tgagagttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttggaac 13479  T
Q  369 ggtggcgtaccgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
     ||| | ||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13480 agtgacatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgt 13530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 419
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2143
Alignment:
Q  299 gtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggatcggtggcgtaccgagttggattaccaccgca 398  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||||| ||| |||| || ||  |||| ||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  399 tctttcgaatttgcatgatgt 419  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2123 tctttcgaatttgcatgatgt 2143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7612 - 7426
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | ||| || |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  7612 ttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtattggaatggcaccgtttgagactttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 7513  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaag 190  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||  | || || || |||||||| ||||  | ||||||   ||||||||||||||    
T  7512 ttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaagagaagatgattcaagagaagatgaaag 7426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14581 - 14370
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  14581 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcgccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 14482  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatg-atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtc 202  Q
    |||| || || || |||  | |||| ||||||||  | || || || |||||| | ||||| | |||| |||| |||||| |||||||| || ||||||     
T  14481 ttgaatccggagaaagttctttgttaggaccggaagtcgtgcaagaaactacgaaaaaagttaagatgaatca-agagaaaatgaaagcatctcagagta 14383  T
Q  203 gacaaaagagtta 215  Q
    |||| ||||||||    
T  14382 gacagaagagtta 14370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18495 - 18410
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggac 89  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||  ||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||    
T  18495 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcagtatggcaccgtttgaggctttgtatggacagaggtgtaggac 18410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12738
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggt 103  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  12931 ttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 12832  T
Q  104 ttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgca 197  Q
    ||||||  ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  12831 ttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgca 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Original strand, 5160 - 5227
Alignment:
Q  4 ttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgta 71  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5160 ttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagctttgta 5227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10927 - 10781
Alignment:
Q  177 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 276  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| | || |||||||| ||||||||| | || || ||  |||||||||| |  || || || ||||||||||||||     
T  10927 agagaagatgagagcgtctcatagtaggcagaagagttaccatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtg 10828  T
Q  277 actcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 323  Q
    | |  ||| || ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  10827 aattttgtaaccggtgttggacgtgctttcaagtgttagaagttgac 10781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University