View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12600_low_22 (Length: 341)

Name: NF12600_low_22
Description: NF12600
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12600_low_22
NF12600_low_22
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-334)||(17268409-17268742)
chr8 (1-330)||(7757335-7757664)
chr8 (1-334)||(791304-791637)
chr8 (1-317)||(9325194-9325510)
chr8 (1-317)||(21202972-21203288)
chr8 (1-317)||(21213388-21213704)
chr8 (1-317)||(21333883-21334199)
chr8 (1-317)||(21997632-21997948)
chr8 (1-317)||(21988098-21988414)
chr8 (1-334)||(2690450-2690781)
chr8 (14-273)||(5867563-5867821)
chr8 (156-334)||(20098382-20098559)
chr8 (15-118)||(37295660-37295763)
chr8 (14-92)||(37816670-37816748)
chr8 (1-78)||(14437197-14437274)
chr8 (122-243)||(13673889-13674010)
chr8 (122-243)||(14881990-14882111)
chr8 (122-243)||(14894340-14894461)
chr8 (1-75)||(26362529-26362603)
chr8 (1-118)||(18536375-18536491)
chr8 (122-243)||(31999543-31999664)
chr8 (122-243)||(33774434-33774555)
chr8 (122-246)||(31991742-31991866)
chr8 (65-169)||(5759115-5759218)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (1-334)||(15668755-15669088)
chr4 (1-334)||(16252980-16253313)
chr4 (1-334)||(26330793-26331126)
chr4 (1-331)||(13403204-13403533)
chr4 (1-330)||(9836227-9836556)
chr4 (1-317)||(3487790-3488106)
chr4 (1-317)||(3497113-3497429)
chr4 (1-317)||(16249031-16249347)
chr4 (1-331)||(17160809-17161139)
chr4 (1-317)||(18105583-18105900)
chr4 (1-317)||(21845688-21846004)
chr4 (1-317)||(21855280-21855596)
chr4 (1-317)||(21901551-21901867)
chr4 (1-317)||(21911143-21911459)
chr4 (1-317)||(40921428-40921744)
chr4 (1-268)||(16241695-16241962)
chr4 (1-307)||(6691813-6692119)
chr4 (1-307)||(6702219-6702525)
chr4 (1-317)||(5293256-5293572)
chr4 (1-317)||(5302915-5303231)
chr4 (1-317)||(27680919-27681235)
chr4 (1-317)||(27690574-27690890)
chr4 (16-334)||(52498698-52499017)
chr4 (1-330)||(17985032-17985362)
chr4 (1-334)||(6405991-6406322)
chr4 (3-168)||(13793229-13793394)
chr4 (1-170)||(11476653-11476822)
chr4 (28-330)||(14600898-14601199)
chr4 (1-306)||(1292953-1293257)
chr4 (1-78)||(26458170-26458247)
chr4 (1-88)||(19917979-19918069)
chr4 (122-243)||(17838190-17838311)
chr4 (1-78)||(522387-522464)
chr4 (1-78)||(17421491-17421568)
chr4 (123-243)||(7847057-7847176)
chr4 (122-243)||(17828799-17828920)
chr4 (1-71)||(30651390-30651460)
chr4 (1-78)||(16058066-16058143)
chr4 (123-243)||(16629168-16629288)
chr4 (14-87)||(41525672-41525745)
chr4 (122-259)||(53946587-53946724)
chr4 (30-243)||(16211382-16211592)
chr4 (28-72)||(2829367-2829410)
chr4 (122-240)||(16472311-16472429)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (1-334)||(4378-4711)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (1-334)||(55478210-55478543)
chr3 (1-334)||(25432427-25432760)
chr3 (1-334)||(4024559-4024892)
chr3 (1-334)||(20491622-20491955)
chr3 (1-334)||(12154-12487)
chr3 (1-317)||(4370962-4371278)
chr3 (1-317)||(4380681-4380997)
chr3 (1-334)||(16335608-16335942)
chr3 (1-334)||(10012394-10012727)
chr3 (1-317)||(5655793-5656109)
chr3 (1-317)||(8972431-8972747)
chr3 (1-317)||(8982986-8983302)
chr3 (1-317)||(9536720-9537036)
chr3 (1-317)||(9547046-9547362)
chr3 (1-317)||(1685418-1685734)
chr3 (3-334)||(6432309-6432641)
chr3 (5-334)||(6421869-6422199)
chr3 (144-334)||(10508468-10508656)
chr3 (1-78)||(24793273-24793350)
chr3 (1-261)||(12376170-12376430)
chr3 (1-78)||(17733934-17734011)
chr3 (1-78)||(19035203-19035280)
chr3 (122-243)||(19828537-19828658)
chr3 (1-118)||(21542449-21542565)
chr3 (1-78)||(49387543-49387620)
chr3 (30-243)||(2489774-2489986)
chr3 (1-74)||(24873427-24873500)
chr3 (52-243)||(13120196-13120385)
chr3 (30-243)||(20745278-20745490)
chr3 (122-243)||(4783274-4783395)
chr3 (127-243)||(13113140-13113256)
chr3 (13-118)||(13431652-13431757)
chr3 (37-117)||(29709489-29709569)
chr3 (122-169)||(20292867-20292914)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (1-334)||(21885881-21886214)
chr1 (1-334)||(13964463-13964796)
chr1 (1-334)||(18382930-18383262)
chr1 (1-334)||(42033759-42034096)
chr1 (1-334)||(8539818-8540152)
chr1 (5-334)||(2370571-2370900)
chr1 (1-334)||(30549765-30550098)
chr1 (1-334)||(8605057-8605391)
chr1 (1-334)||(2115568-2115901)
chr1 (1-334)||(25019035-25019369)
chr1 (1-317)||(21458213-21458529)
chr1 (1-334)||(16154450-16154784)
chr1 (65-334)||(1968905-1969174)
chr1 (1-306)||(1186580-1186883)
chr1 (1-334)||(18062380-18062712)
chr1 (100-334)||(41544399-41544634)
chr1 (3-307)||(22956152-22956454)
chr1 (12-273)||(34822654-34822915)
chr1 (1-117)||(41544270-41544386)
chr1 (220-334)||(22406646-22406761)
chr1 (122-243)||(21782349-21782470)
chr1 (1-78)||(52955458-52955535)
chr1 (30-243)||(26193652-26193864)
chr1 (5-75)||(1989662-1989732)
chr1 (1-78)||(1974874-1974951)
chr1 (122-273)||(21821737-21821889)
chr1 (1-78)||(41208351-41208428)
chr1 (1-243)||(22960528-22960770)
chr1 (5-75)||(1982244-1982314)
chr1 (122-243)||(20308505-20308626)
chr1 (28-243)||(18097143-18097356)
chr1 (122-243)||(25867917-25868038)
chr1 (30-243)||(27065724-27065936)
chr1 (123-243)||(20328672-20328792)
chr1 (122-229)||(25823752-25823860)
chr1 (14-118)||(50940948-50941051)
chr1 (122-243)||(20314189-20314310)
chr1 (122-243)||(20318347-20318468)
chr1 (14-64)||(30210869-30210919)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (1-303)||(14943906-14944208)
chr7 (1-303)||(15371499-15371801)
chr7 (1-334)||(42620747-42621080)
chr7 (1-334)||(9535401-9535735)
chr7 (1-334)||(9545684-9546018)
chr7 (1-317)||(5381976-5382292)
chr7 (1-317)||(5391614-5391930)
chr7 (1-317)||(5926720-5927036)
chr7 (1-317)||(6544390-6544706)
chr7 (1-317)||(8500634-8500950)
chr7 (1-317)||(8511104-8511420)
chr7 (1-317)||(26348310-26348626)
chr7 (1-317)||(46496699-46497015)
chr7 (1-317)||(46507311-46507627)
chr7 (1-317)||(6534091-6534407)
chr7 (1-317)||(43983062-43983378)
chr7 (16-317)||(26363360-26363661)
chr7 (1-317)||(44896902-44897218)
chr7 (1-317)||(44907305-44907621)
chr7 (1-334)||(32097947-32098281)
chr7 (1-334)||(32108384-32108718)
chr7 (1-317)||(11626525-11626840)
chr7 (1-317)||(16132075-16132391)
chr7 (1-317)||(16142624-16142940)
chr7 (1-305)||(14248701-14249005)
chr7 (1-334)||(2992076-2992409)
chr7 (31-334)||(9006474-9006776)
chr7 (14-118)||(40701709-40701813)
chr7 (239-334)||(22964652-22964747)
chr7 (1-78)||(15988838-15988915)
chr7 (15-118)||(33090976-33091079)
chr7 (1-78)||(13285954-13286031)
chr7 (1-78)||(42595179-42595256)
chr7 (1-76)||(41027368-41027443)
chr7 (1-78)||(12827528-12827605)
chr7 (3-78)||(31824544-31824619)
chr7 (122-243)||(24541126-24541247)
chr7 (122-243)||(45552832-45552953)
chr7 (1-78)||(5615665-5615742)
chr7 (30-243)||(27988150-27988362)
chr7 (1-78)||(25441910-25441987)
chr7 (1-73)||(7034914-7034986)
chr7 (121-243)||(19585411-19585533)
chr7 (1-118)||(12491071-12491188)
chr7 (199-237)||(12769761-12769799)
chr7 (179-243)||(19799369-19799434)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (1-334)||(7938-8271)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-334)||(93020-93353)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (1-334)||(29540025-29540358)
chr6 (5-334)||(14791170-14791500)
chr6 (1-317)||(12454638-12454954)
chr6 (1-334)||(24922160-24922494)
chr6 (1-334)||(20911849-20912183)
chr6 (1-334)||(24931196-24931530)
chr6 (1-291)||(27787728-27788017)
chr6 (1-317)||(16897531-16897847)
chr6 (1-317)||(16908184-16908500)
chr6 (1-307)||(18159656-18159962)
chr6 (1-307)||(18169468-18169774)
chr6 (1-307)||(31357155-31357461)
chr6 (1-307)||(31366883-31367189)
chr6 (1-328)||(3285418-3285746)
chr6 (1-243)||(18200876-18201117)
chr6 (5-261)||(14044956-14045211)
chr6 (102-243)||(16320945-16321085)
chr6 (1-78)||(8563410-8563487)
chr6 (1-78)||(22223760-22223837)
chr6 (1-78)||(22249595-22249672)
chr6 (18-118)||(9761632-9761732)
chr6 (122-243)||(26021408-26021529)
chr6 (1-78)||(34765151-34765228)
chr6 (124-243)||(18712578-18712697)
chr6 (30-243)||(1596091-1596303)
chr6 (1-87)||(28092398-28092483)
chr6 (1-69)||(24361863-24361931)
chr6 (28-250)||(16923219-16923439)
chr6 (102-169)||(791505-791571)
chr6 (102-169)||(16333167-16333233)
chr6 (122-243)||(24505704-24505825)
chr6 (30-169)||(26161616-26161754)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (1-330)||(24696663-24696992)
chr2 (1-334)||(38957896-38958230)
chr2 (1-317)||(2998775-2999091)
chr2 (1-317)||(18650803-18651119)
chr2 (1-317)||(18662921-18663237)
chr2 (1-332)||(45014301-45014633)
chr2 (1-317)||(4457780-4458096)
chr2 (1-317)||(4467405-4467721)
chr2 (1-317)||(5337213-5337529)
chr2 (1-317)||(5347066-5347382)
chr2 (1-317)||(9502839-9503155)
chr2 (1-317)||(9514205-9514521)
chr2 (1-334)||(38930560-38930895)
chr2 (1-332)||(45024378-45024710)
chr2 (1-334)||(17488257-17488591)
chr2 (14-334)||(72307-72626)
chr2 (1-180)||(44639104-44639281)
chr2 (202-334)||(44639277-44639409)
chr2 (1-146)||(29423126-29423266)
chr2 (1-78)||(22901908-22901985)
chr2 (1-78)||(19342105-19342182)
chr2 (5-78)||(23721735-23721808)
chr2 (30-243)||(12570221-12570433)
chr2 (1-115)||(16327799-16327912)
chr2 (4-78)||(22908956-22909030)
chr2 (1-118)||(40409202-40409318)
chr2 (100-273)||(24239418-24239591)
chr2 (5-78)||(16135313-16135385)
chr2 (1-92)||(27160101-27160192)
chr2 (1-92)||(27170470-27170561)
chr2 (30-243)||(45190472-45190684)
chr2 (102-243)||(22687952-22688092)
chr2 (30-243)||(573895-574107)
chr2 (102-243)||(16934571-16934711)
chr2 (102-243)||(17005231-17005371)
chr2 (123-260)||(15940324-15940463)
chr2 (284-334)||(24239589-24239639)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (1-331)||(22244285-22244615)
chr5 (1-317)||(18360862-18361178)
chr5 (1-317)||(21753028-21753344)
chr5 (1-317)||(21762315-21762631)
chr5 (1-317)||(33938902-33939218)
chr5 (1-317)||(33949302-33949618)
chr5 (1-334)||(27411715-27412049)
chr5 (1-317)||(18389819-18390135)
chr5 (1-317)||(26192161-26192477)
chr5 (1-317)||(26202765-26203081)
chr5 (1-307)||(8765525-8765831)
chr5 (1-334)||(32070007-32070341)
chr5 (1-317)||(11411269-11411584)
chr5 (1-306)||(31105009-31105313)
chr5 (1-307)||(23378743-23379048)
chr5 (1-326)||(21484194-21484518)
chr5 (5-78)||(19548642-19548715)
chr5 (30-243)||(31916447-31916659)
chr5 (1-92)||(36316170-36316261)
chr5 (102-243)||(13572160-13572300)
chr5 (122-243)||(20896588-20896709)
chr5 (122-243)||(30944285-30944406)
chr5 (122-243)||(30953707-30953828)
chr5 (122-243)||(37299314-37299435)
chr5 (122-243)||(37549104-37549225)
chr5 (30-237)||(4038388-4038594)
chr5 (1-78)||(20947615-20947692)
chr5 (1-78)||(20958004-20958081)
chr5 (30-243)||(27274589-27274801)
chr5 (122-243)||(37651902-37652023)
chr5 (122-237)||(18210311-18210426)
chr5 (122-237)||(18219649-18219764)
chr5 (52-243)||(19888785-19888974)
chr5 (122-225)||(20905031-20905134)
chr5 (122-237)||(21681284-21681399)
chr5 (122-237)||(22173749-22173864)
chr5 (30-243)||(34130898-34131111)
chr5 (123-243)||(20763995-20764114)
chr5 (122-243)||(37817233-37817356)
chr5 (28-72)||(205883-205926)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-334)||(15416-15749)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (16-334)||(74900-75218)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-334)||(310186-310520)
scaffold0005 (28-330)||(216179-216480)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (1-290)||(21323-21612)
[»] scaffold0014 (4 HSPs)
scaffold0014 (1-317)||(234156-234472)
scaffold0014 (30-243)||(146328-146540)
scaffold0014 (32-243)||(153725-153934)
scaffold0014 (30-243)||(114721-114932)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-307)||(8010-8316)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (1-334)||(19543-19877)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (1-272)||(55987-56262)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-307)||(13417-13722)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-205)||(17454-17658)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (9-305)||(198868-199162)
[»] scaffold1705 (1 HSPs)
scaffold1705 (121-336)||(415-630)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (83-330)||(29010-29254)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (5-334)||(65255-65583)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (152-334)||(1146-1327)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (1-237)||(15046-15282)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (5-118)||(241857-241969)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (1-78)||(969-1046)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (1-78)||(5563-5640)
scaffold0313 (1-78)||(19720-19797)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (122-273)||(10920-11072)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (30-243)||(111989-112201)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (1-79)||(3700-3778)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (30-237)||(18402-18608)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (5-87)||(40765-40847)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (123-243)||(23010-23130)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (30-243)||(1064-1276)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (123-232)||(4429-4538)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (4-78)||(1092-1166)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (127-243)||(24108-24224)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (28-145)||(59766-59882)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (30-169)||(13648-13786)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17268742 - 17268409
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  17268742 tcagaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaataatgaaacaacaatgaagagcagtgacttca 17268643  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17268642 acatctaggatgatattcccttttggaatattcccagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatctttgtatat 17268543  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17268542 gcctttgttgcttgattgatccatgcaaatgtaccttcctggaaatttatccatatcacatgtgccttgcatgatcttgatcaatgttcttgagattctt 17268443  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    | ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  17268442 gacttgtataagaacaattttctgatctctgctt 17268409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7757664 - 7757335
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  7757664 tcagaatgttccatctgttttacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatactaatagtgaaacgacaatgaagagcaatgatatta 7757565  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7757564 atatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaaagttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataattcttgtatat 7757465  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757464 gtctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctagacatatatccatgtctcatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 7757365  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctct 330  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  7757364 ggcttgtataagaacaaccttctgatctct 7757335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 791637 - 791304
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  791637 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagagatttta 791538  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  791537 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 791438  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  791437 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccgtatcacatgtgccttgcatgattttgatcaaagttcttgagactctt 791338  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  791337 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 791304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 9325194 - 9325510
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  9325194 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 9325293  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9325294 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9325393  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9325394 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9325493  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  9325494 ggcttgtataagaacaa 9325510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 21202972 - 21203288
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21202972 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21203071  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21203072 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21203171  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21203172 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21203271  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21203272 ggcttgtataagaacaa 21203288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 21213388 - 21213704
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21213388 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21213487  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21213488 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21213587  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21213588 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21213687  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21213688 ggcttgtataagaacaa 21213704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21334199 - 21333883
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21334199 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21334100  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21334099 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21334000  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21333999 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21333900  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21333899 ggcttgtataagaacaa 21333883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 21997632 - 21997948
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  21997632 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacagtaatgaagagcagtgataata 21997731  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21997732 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21997831  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  21997832 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcacagttcttgagattctt 21997931  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21997932 ggcttgtataagaacaa 21997948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 21988098 - 21988414
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  21988098 tcagaatgttccatctgtttcacataggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacagtaatgaagagcagtgataata 21988197  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21988198 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21988297  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  21988298 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcacagttcttgagattctt 21988397  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21988398 ggcttgtataagaacaa 21988414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 2690450 - 2690781
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaa-tgaagagcagtgatttt 99  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||| |    
T  2690450 tcagaatgtttcatttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtatttggtgtaatcaa-tcctaatagtgaaaatataactgaagtgcagtgattgt 2690548  T
Q  100 aacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtata 199  Q
    || |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||| |    
T  2690549 aatatctaggatgatattctcatt-ggaatattcctagtacttcaatgttcatagtctaaaatgaacattgaatatcctctttgacattaactttgtaaa 2690647  T
Q  200 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||   || || |||||||||||| ||||    
T  2690648 tacctctattgcttgattgatccatgcaattgtacttttctggatacttattcatgtcacgtgtgacttgcatgttttttat-aatgttcttgagtttct 2690746  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| | |||  |||||| ||||||||    
T  2690747 tggcttgtataagaccaaccttctgaactctgctt 2690781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 5867563 - 5867821
Alignment:
Q  14 tttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatga 113  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  5867563 tttgtatcacttaggatgatttgtaagactctcatttaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatcgatgaagggcaatgtttgtaacgtctaggatga 5867662  T
Q  114 tattcccttttggaatattcatagtacttc-aatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgac-ataatccttgtatatgcctttattgc 211  Q
    |||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |  | ||||||||||| |    
T  5867663 tatt-cttattggaatattcctagtacttcaaatgttcatagtcttaaatgaacattgaagatcctttttgactttaatcc-taaaaatgcctttattcc 5867760  T
Q  212 ttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatg 273  Q
    ||||||||||| |   |||||||||| ||||  || ||| ||||| || |||||||||||||    
T  5867761 ttgattgatccttctcaatgtactttactgg-catttattcatgttacgtgtgccttgcatg 5867821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20098559 - 20098382
Alignment:
Q  156 cttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatg 255  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||    
T  20098559 cttaaatgaacattgaatatcttttttgacattaatcttgtaaatgcttttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatttattcatg 20098460  T
Q  256 tcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||  ||||||||||  || | ||||||| ||| |||||  |||| | ||||||||    
T  20098459 tcatgtgtgccttgcatgctcttgat-gatgttcttgattttatgggcttgtataagaacaaccttcttaactctgctt 20098382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 37295763 - 37295660
Alignment:
Q  15 ttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgat 114  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || ||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  37295763 ttgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatataatcaaatcctaatagtgaaacgttgataaagtgcggtgtatgtaacatctaggatgat 37295664  T
Q  115 attc 118  Q
    ||||    
T  37295663 attc 37295660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 37816748 - 37816670
Alignment:
Q  14 tttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcag 92  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37816748 tttgtttcacttaggatgatttgtaagactctcatttgatgtaatcaaattctaatagtgaaacatcaatgaagtgcag 37816670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14437274 - 14437197
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14437274 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 14437197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13674010 - 13673889
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  13674010 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 13673912  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  13673911 ccatgcagatgtacttttctgga 13673889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 14881990 - 14882111
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  14881990 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 14882088  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  14882089 ccatgcagatgtacttttctgga 14882111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 14894340 - 14894461
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  14894340 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 14894438  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  14894439 ccatgcagatgtacttttctgga 14894461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 26362529 - 26362603
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaa 75  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26362529 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaa 26362603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18536491 - 18536375
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |   | ||    
T  18536491 tcagaatgttccctta-tttcacttaggatgatttgtaaaactctcatttgatgtaatcaaattctaatagtgaaacatcaatgaagtgcactatgtata 18536393  T
Q  101 acatctaggatgatattc 118  Q
    | ||||||||||||||||    
T  18536392 agatctaggatgatattc 18536375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 31999543 - 31999664
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  31999543 tttggaatattcttagtactttaatgttcatagtcttgaatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagat 31999641  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||    
T  31999642 ccatgcagatgaacttttctgga 31999664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 33774434 - 33774555
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  ||||||||| |  ||||| |||    
T  33774434 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttacttgttgatagat 33774532  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  33774533 ccatgcagatgtacttttctgga 33774555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 246
Target Start/End: Original strand, 31991742 - 31991866
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||||| |||    
T  31991742 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttgaatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttttccatgcatttatttgttgatagat 31991840  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctggatat 246  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  31991841 ccatgcagatgaacttttctggatat 31991866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5759218 - 5759115
Alignment:
Q  65 ctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatga 164  Q
    |||||||| |||||  | ||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  5759218 ctaatagtaaaacacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggataatattctcatt-ggaatattcttagtactttaatgttcatagtcttgaatga 5759120  T
Q  165 acatt 169  Q
    |||||    
T  5759119 acatt 5759115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15669088 - 15668755
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15669088 tcagaatgttccatttgtttcactttggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 15668989  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15668988 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 15668889  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15668888 gcctttattacttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttacataaccttgatcaaagttcttgagattctt 15668789  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||    
T  15668788 ggcttgtataagaacaaccttctgatatctgctt 15668755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16253313 - 16252980
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16253313 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtaatttta 16253214  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  16253213 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatagcctctttgacataatccttgtatat 16253114  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16253113 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagactctt 16253014  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  16253013 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 16252980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26331126 - 26330793
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26331126 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatatta 26331027  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26331026 acatctaggatgatattcccttgtagaatattcctagtacatcaatgttcatggtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 26330927  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26330926 gtctttattgcttaattgatccatgcagatgtactttcctgtacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 26330827  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  26330826 ggcttgtataagaacatccttctgatctctgctt 26330793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 13403204 - 13403533
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13403204 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagaacagtgatttta 13403303  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13403304 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgccataatccttatatat 13403403  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403404 gtctttattgcttgattgatccatgc-aatgtactttccaggacatttaatcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 13403502  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctg 331  Q
    |||||||| || |||||  | ||||||||||    
T  13403503 ggcttgtgcaagaacaacctcctgatctctg 13403533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 9836227 - 9836556
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9836227 tcagaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatataatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattaaa 9836326  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9836327 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 9836426  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| |||| ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |     
T  9836427 gtctttattgcttgattgatccatgcaaatgtattttcctgaacatttattcatgacatgtgtgtcttgcatgactttgatcaatgttcttaagattatg 9836526  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctct 330  Q
     |||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  9836527 tgcttgtataagaacaaccttctgatctct 9836556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 3487790 - 3488106
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||    
T  3487790 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgctatta 3487889  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3487890 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 3487989  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3487990 gcctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 3488089  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  3488090 ggcttgtataagaacaa 3488106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 3497113 - 3497429
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||    
T  3497113 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgctatta 3497212  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497213 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 3497312  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3497313 gcctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 3497412  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  3497413 ggcttgtataagaacaa 3497429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16249347 - 16249031
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  16249347 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 16249248  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16249247 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 16249148  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16249147 gcctttattgcttaatttatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16249048  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  16249047 ggcttgtataagaacaa 16249031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17161139 - 17160809
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||    
T  17161139 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttataagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagaacaatgatatta 17161040  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17161039 acatctaagatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacatcgaatatcctttttgacataattattgtatat 17160940  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  17160939 gcctttattgattgattgatccatgcaaatgtactttcctagatatatatccgtgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttctttacattctt 17160840  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctg 331  Q
    | ||||| ||| |||||  |||| |||||||    
T  17160839 gacttgtataagaacaaccttctaatctctg 17160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 18105583 - 18105900
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  18105583 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 18105682  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataa-tccttgtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| || |||||||    
T  18105683 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactctttgtata 18105782  T
Q  200 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18105783 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattct 18105882  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaa 317  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  18105883 tggcttgtataagaacaa 18105900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21846004 - 21845688
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21846004 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21845905  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21845904 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21845805  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21845804 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21845705  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21845704 ggcttgtataagaacaa 21845688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21855596 - 21855280
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21855596 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21855497  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21855496 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21855397  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21855396 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21855297  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21855296 ggcttgtataagaacaa 21855280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21901867 - 21901551
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21901867 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21901768  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21901767 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21901668  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21901667 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21901568  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21901567 ggcttgtataagaacaa 21901551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21911459 - 21911143
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21911459 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21911360  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21911359 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21911260  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21911259 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21911160  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21911159 ggcttgtataagaacaa 21911143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40921744 - 40921428
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  40921744 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 40921645  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  40921644 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 40921545  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40921544 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 40921445  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  40921444 ggcttgtataagaacaa 40921428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16241962 - 16241695
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16241962 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 16241863  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  16241862 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtatatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacataatccttgtatat 16241763  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgcctt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16241762 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgcctt 16241695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6692119 - 6691813
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  6692119 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 6692020  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  6692019 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 6691920  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6691919 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 6691820  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  6691819 ggcttgt 6691813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6702525 - 6702219
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  6702525 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 6702426  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  6702425 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 6702326  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6702325 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 6702226  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  6702225 ggcttgt 6702219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 5293256 - 5293572
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5293256 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 5293355  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5293356 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5293455  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  5293456 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgaccacagttcttgagattctt 5293555  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  5293556 ggcttgtataagaacaa 5293572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 5302915 - 5303231
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5302915 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 5303014  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5303015 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5303114  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  5303115 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgaccacagttcttgagattctt 5303214  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  5303215 ggcttgtataagaacaa 5303231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 27680919 - 27681235
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  27680919 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 27681018  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  27681019 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 27681118  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27681119 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 27681218  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  27681219 ggcttgtataagaacaa 27681235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 27690574 - 27690890
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  27690574 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 27690673  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  27690674 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 27690773  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27690774 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 27690873  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  27690874 ggcttgtataagaacaa 27690890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 52499017 - 52498698
Alignment:
Q  16 tgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgata 115  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  52499017 tgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcaatgatattaatatttaggatgata 52498918  T
Q  116 ttcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttga 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52498917 ttcccttatggaatattcatagtacattaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatatgcctttattgcttga 52498818  T
Q  216 ttgatccatgcaaatgtacttt-cctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataa 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  52498817 ttgatccatgcaaatgtactttccctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacttcgaccaatgttcttgagattattggcttgcataagaa 52498718  T
Q  315 caagattctgatctctgctt 334  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  52498717 caaccttctgatctctgctt 52498698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 17985032 - 17985362
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  17985032 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 17985131  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||    
T  17985132 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgtttatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 17985231  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  17985232 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 17985331  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctct 330  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  17985332 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctct 17985362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 6405991 - 6406322
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  6405991 tcagaatgttccttttgtttcacttatgatgatttgtaagacttctatttgatgtaatcaaattctaatagtgaaacaacaatgaagatcaatgattgta 6406090  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  6406091 acatctaggaagatattctc-tttggaatattcctagtacttcaatgttcatagtctttaatgaacattgaatatcatttttgacattaaccttgtaaat 6406189  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||  |||||| | ||||||| || ||||     
T  6406190 gtcttaattgcttaattgatccatgaaaatgtattttcctggacatttattcatgtcaagtgtgccttgcatgttcttgat-attgttctttagtttctg 6406288  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||    
T  6406289 ggcttgtataagaacaaccttctgaactctgctt 6406322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Original strand, 13793229 - 13793394
Alignment:
Q  3 agaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaac 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13793229 agaatgttccttttgtttcatttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattgtaac 13793328  T
Q  103 atctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13793329 atctaggatgatattcccttttaaaataatcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacat 13793394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11476822 - 11476653
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  11476822 tcagaatgttccttttgtttcacttaggataatctgtaagaataccatttgatgtaataaaattctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattgaa 11476723  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattg 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  11476722 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagcacttcaatgttcgtagttataaatgaacattg 11476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 330
Target Start/End: Original strand, 14600898 - 14601199
Alignment:
Q  28 gatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaat-gaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttgg 126  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| | || ||    
T  14600898 gatgatttgtaagacttgtacttgatgtaatcaa-tcctaatagtgaaaacataattgaagtgcagtaattgcaacatctaggatgatattcacatt-gg 14600995  T
Q  127 aatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgctt-gattgatccat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | | || || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14600996 aatattcttagtacttcaatgtttatagtcttaa-tgaacattgaatatcctttttgacatttaactttataaatgtctttattgctttgattgatccat 14601094  T
Q  225 gcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctg 324  Q
    ||||| ||||||| ||||| || | | ||| |||||  || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||    
T  14601095 gcaaacgtacttttctggacatttgttcatatcacaaatgacttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattcttgacttgtataagaacaaccttctg 14601193  T
Q  325 atctct 330  Q
    | ||||    
T  14601194 acctct 14601199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1293257 - 1292953
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgttt-cagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaa-tgaagagcagtgattt 98  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||  || ||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| |||     
T  1293257 tcagaatgttccatttgttttcacttagtattatttgtaagacttgtacttgatgtaatcaa-tcctaatagtgaaaacataactgaagtgcagtaattg 1293159  T
Q  99 taacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgta 197  Q
     |||||||| ||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||| ||||| |||  | | |||||    
T  1293158 caacatctaagatgatattcaaatt-ggaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttga-tgatcattgaatatcccttttgtcatttaactttgta 1293061  T
Q  198 tatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagatt 297  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || | | ||||||| | ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1293060 aatgtctttattgtttgattgatccatgcaaatgtacttttatggacatttgttcatgtcataagtgacttgcatgttcttgat-aatgttcttgagatt 1292962  T
Q  298 cttggcttg 306  Q
     ||| ||||    
T  1292961 attgacttg 1292953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26458247 - 26458170
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26458247 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaactcctaatagtgaaaca 26458170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19918069 - 19917979
Alignment:
Q  1 tcagaatgttcct---tttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaaga 88  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19918069 tcagaatgttcctaattttgtttcacttaggatgatttgcaagacatccatttgatgtaatcaattcctaatagtgaaacaataatgaaga 19917979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 17838190 - 17838311
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  17838190 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 17838288  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  17838289 ccatgcagatgtacttttctgga 17838311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 522387 - 522464
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  522387 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 522464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 17421491 - 17421568
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17421491 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattgatgtaatcaattcctaatagtgaaaca 17421568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Original strand, 7847057 - 7847176
Alignment:
Q  123 ttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatc 221  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||  | |||| ||||||||  |||||||||||  ||||| ||||    
T  7847057 ttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatccttt--ggcatagatccttgttcatgcctttatttgttgatagatc 7847154  T
Q  222 catgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  7847155 catgcaaatgtacttttctgga 7847176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 17828799 - 17828920
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  17828799 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagccttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 17828897  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  17828898 ccatgcagatgtacttttctgga 17828920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 30651460 - 30651390
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatag 71  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  30651460 tcagaatgttctttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaattctaatag 30651390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16058143 - 16058066
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16058143 tcagaatgttctttttatttcaattaggatgatttgtaagattcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtggaaca 16058066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16629288 - 16629168
Alignment:
Q  123 ttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatc 221  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||    
T  16629288 ttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatc 16629190  T
Q  222 catgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  16629189 catgcagatgtacttttctgga 16629168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 41525745 - 41525672
Alignment:
Q  14 tttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaag 87  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  41525745 tttgttttacttaggatgatttgtaagacatccatttgatgtaattaaatcctaatagtaaaacataaatgaag 41525672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Original strand, 53946587 - 53946724
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgaca-taatccttgtatatgcctttattgcttgattga 219  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||| |  | |||||  | |||||||||||| |||  |    
T  53946587 tttggaatattcctagaacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaaca-cctttttgacacttttgcttgtccaagcctttattgct-gataca 53946684  T
Q  220 tccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcac 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  53946685 tccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcac 53946724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 16211382 - 16211592
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||| |||||  | ||||| ||||| |  | |||||||||||| |||||| | || ||||    
T  16211382 tgatttgtaagacttaacttttgatgtaatcaactc-taatagtaaaacacaactgaagtgcagtaaagt-aacatctaggataatattctcatt-ggaa 16211478  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaa 228  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |  |||| ||| |||||    |||||| ||||||| | |  |||||||||||| ||||    
T  16211479 tattcctagtactttaatgttcatagtcttaggtgaacattaaagatcc-tttagacatttctcttgtaaatgccttaagtttttgattgatccacgcaa 16211577  T
Q  229 atgtactttcctgga 243  Q
    | |||||||| ||||    
T  16211578 aggtactttcttgga 16211592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2829410 - 2829367
Alignment:
Q  28 gatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagt 72  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2829410 gatgatttgtaagactactttttgatgtaatc-aatcctaatagt 2829367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16472429 - 16472311
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgaca-taatccttgtatatgcctttattgcttgattga 219  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||| |  | ||||| || |||||||||||| |||  |    
T  16472429 tttggaatattcctagaacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaaga-cctttttgacacttttgcttgtctaagcctttattgct-gatcca 16472332  T
Q  220 tccatgcaaatgtactttcct 240  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  16472331 tccatgcaattgtactttcct 16472311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 4378 - 4711
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4378 tcagaatgttccatctatttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcttaatagtgaaactacaatgaagagcagtgatttta 4477  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4478 acatctaggatgatattcccttatggaatattcctagtacatcaatgttcatagtctcaaatgcacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 4577  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4578 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgtgattctt 4677  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  4678 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 4711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 55478210 - 55478543
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55478210 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatatta 55478309  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55478310 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtatatcaatattcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatctttgtatat 55478409  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55478410 gtctttattgcttgattgatccatgcaaaagtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 55478509  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  55478510 ggcttgtataagaacaaccttctgatctatgctt 55478543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25432760 - 25432427
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  25432760 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctattagtgaaacaataatgaagagcagtgatatta 25432661  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25432660 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcatttttgacataatccttgtatat 25432561  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25432560 gcctttattgcttgattaatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgcattgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 25432461  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  25432460 ggcttgtataagaacaaccttctgatctatgctt 25432427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 4024559 - 4024892
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4024559 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccattagatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagtagtgatatta 4024658  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4024659 acctctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgcatat 4024758  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4024759 gcctttattgcttgattgatccatgtaaatctactttcctgaacatatatcaatgtcacatgtgccttgcatgaacttgatcaatgttcttgagattctt 4024858  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |  |||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  4024859 gttttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 4024892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20491955 - 20491622
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| || |||    
T  20491955 tcagaatgttccatctgtttcacttagcatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatccaaatagtaaaacaacaatgaagagaagttatatta 20491856  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491855 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 20491756  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20491755 gcttttattgctagattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 20491656  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||| | ||| |||||  |||| |||| |||||    
T  20491655 ggcttatataagaacaaccttctaatctatgctt 20491622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 12154 - 12487
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12154 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcaatgatttta 12253  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  12254 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 12353  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||     
T  12354 gcttttatttgttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgtcttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctc 12453  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12454 ggcttgtataagaacaacattctgatctctgctt 12487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4371278 - 4370962
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||    
T  4371278 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgctatta 4371179  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4371178 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 4371079  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4371078 gcctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 4370979  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  4370978 ggcttgtataagaacaa 4370962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4380997 - 4380681
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||    
T  4380997 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgctatta 4380898  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4380897 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 4380798  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4380797 gcctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 4380698  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  4380697 ggcttgtataagaacaa 4380681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 16335608 - 16335942
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16335608 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 16335707  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  16335708 acacctaggatgatatccccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 16335807  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  16335808 gcctttattgcttgattgattcatgcaaatgtactttccaggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 16335907  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  16335908 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagctt 16335942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 10012394 - 10012727
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10012394 tcagaatgttccatctgtttcacttaggacgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatggtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 10012493  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||||||||||||||    
T  10012494 acatctaggatgatattctcttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgatataatccttgtatat 10012593  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10012594 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcacatgtcacatgtgtcgtgcatgaccttgatcaaagttcttgagactctt 10012693  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  10012694 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 10012727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 5655793 - 5656109
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5655793 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 5655892  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5655893 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5655992  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5655993 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5656092  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  5656093 ggcttgtataagaacaa 5656109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8972747 - 8972431
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8972747 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 8972648  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8972647 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8972548  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8972547 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8972448  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  8972447 ggcttgtataagaacaa 8972431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8983302 - 8982986
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8983302 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 8983203  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8983202 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8983103  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8983102 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8983003  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  8983002 ggcttgtataagaacaa 8982986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9537036 - 9536720
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  9537036 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 9536937  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9536936 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9536837  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9536836 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9536737  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  9536736 ggcttgtataagaacaa 9536720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9547362 - 9547046
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  9547362 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 9547263  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9547262 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9547163  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9547162 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9547063  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  9547062 ggcttgtataagaacaa 9547046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 1685418 - 1685734
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  1685418 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 1685517  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  1685518 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 1685617  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  1685618 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgcgattctt 1685717  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  1685718 ggcttgtataagaacaa 1685734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6432641 - 6432309
Alignment:
Q  3 agaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaac 102  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||    
T  6432641 agaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaaaagcagtaataataac 6432542  T
Q  103 atctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgc 202  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||    
T  6432541 atctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatatgc 6432442  T
Q  203 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattcttg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  6432441 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 6432342  T
Q  302 gcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  6432341 gcttgtttaagaacaaccttctgatctcagctt 6432309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6422199 - 6421869
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacat 104  Q
    |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||    
T  6422199 aatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaataataacat 6422100  T
Q  105 ctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcct 204  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  6422099 ctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatatgcct 6422000  T
Q  205 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattcttggc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  6421999 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgtcttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggc 6421900  T
Q  304 ttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  6421899 ttgtttaagaacaaccttctgatctcagctt 6421869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Original strand, 10508468 - 10508656
Alignment:
Q  144 aatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10508468 aatgttcatagtcttaa-tgaacattgaatatcctttttgacattaaccttgtaaatgtcttcattgcttgattgatccatgaaaatgtacttttctgga 10508566  T
Q  244 tatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
     || ||| |||||||| |||| |||| |||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||    
T  10508567 catttattcatgtcacgtgtgacttgaatgctcttgat-aatgttcttgaaactcttggcttgtgtaaagacaaccttctgaactctgctt 10508656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24793350 - 24793273
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24793350 tcagaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgcaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 24793273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12376430 - 12376170
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtt--tcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaa-tgaagagcagtgatt 97  Q
    |||||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||| ||||||| |    
T  12376430 tcagaatgttccttttgttcttactttaggatgatttgtaagacttacttttgatgtaatcaa-tcctaatagtaaagacacaactgaagtgcagtgaat 12376332  T
Q  98 ttaacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgta 197  Q
      |||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  || | ||| |||||    ||||||    
T  12376331 gcaacatctaggataatattctcatt-ggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagat-catttagacatttctcttgta 12376234  T
Q  198 tatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacat 261  Q
     ||||||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  12376233 aatgccttaacttcttgattgatccattcaaaggtgctttcctggacatacatttatgtcacat 12376170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17734011 - 17733934
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17734011 tcagaatgttccttttgtttcacttaggataatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcataatagtgaaaca 17733934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19035280 - 19035203
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19035280 tcagaatgttccttttgtttcacttaggataatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcataatagtgaaaca 19035203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 19828537 - 19828658
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  19828537 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 19828635  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  19828636 ccatgcagatgtacttttctgga 19828658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 21542449 - 21542565
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||  | |||   | ||    
T  21542449 tcagaatgttccttt-gtttcacttaggattatttgtaagactctcatttaatgtaatcaaatcctagtagtgtaacatcaatgaaatgtagtatgtgta 21542547  T
Q  101 acatctaggatgatattc 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21542548 acatctaggatgatattc 21542565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 49387543 - 49387620
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  49387543 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 49387620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 2489774 - 2489986
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | | |  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  2489774 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 2489871  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  2489872 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcatgcctttatttgttgatagatccatgca 2489970  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  2489971 gatgtacttttctgga 2489986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 24873427 - 24873500
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtga 74  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||    
T  24873427 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaatttatgtaatcaaatcctaatagtga 24873500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 13120196 - 13120385
Alignment:
Q  52 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcc 151  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||  | ||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||| | || | ||||||| |||||||| |||||||     
T  13120196 atgtaatcaaa-cctaatagtaagacacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggataatattctcatt-gaaatattcctagtactttaatgttca 13120293  T
Q  152 tagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  13120294 tagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgttcatgcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 13120385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 20745278 - 20745490
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | | |  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  20745278 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 20745375  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  20745376 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgca 20745474  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||| ||||| |||||    
T  20745475 gatgaacttttctgga 20745490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 4783274 - 4783395
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  4783274 tttggaatattcctagtactttaatgttcatcatcttggatgaacattaaagatccttttt-acatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 4783372  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  4783373 ccatgcagatgtacttttctgga 4783395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 243
Target Start/End: Original strand, 13113140 - 13113256
Alignment:
Q  127 aatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatg 225  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  13113140 aatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgttcatgcctttatttgttgatagatccatg 13113238  T
Q  226 caaatgtactttcctgga 243  Q
    || ||||||||| |||||    
T  13113239 cagatgtacttttctgga 13113256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 13431652 - 13431757
Alignment:
Q  13 ttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatg 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||    ||||||| ||||||| | |||||| ||||| | |||||||| |||||   | |||||| |||||||    
T  13431652 ttttgtttcacttaagatgatttgtaagacccttatttgatataatcaagttctaataatgaaatatcaatgaagtgcagtatgtgtaacatataggatg 13431751  T
Q  113 atattc 118  Q
    ||||||    
T  13431752 atattc 13431757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 117
Target Start/End: Original strand, 29709489 - 29709569
Alignment:
Q  37 taagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatatt 117  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||| ||| |   | |||||||||||||||||||    
T  29709489 taagacttccatttgatgtaattaaatcctaatagtaaaacgttaatgaagtgcaatatgtataacatctaggatgatatt 29709569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20292914 - 20292867
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacatt 169  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20292914 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttgaatgaacatt 20292867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21886214 - 21885881
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21886214 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 21886115  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  21886114 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 21886015  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  21886014 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 21885915  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21885914 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 21885881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13964796 - 13964463
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13964796 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccattagatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatatta 13964697  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13964696 acctctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgcatat 13964597  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964596 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatctactttcctaaacatatatcaatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 13964497  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |  |||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  13964496 gttttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 13964463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18383262 - 18382930
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18383262 tcagaacgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaattaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgaattta 18383163  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18383162 acatctaggatgatattcccttttggaatatttctagtacttcaatgttcattgtcttaaatgaacattgaatatcttttttgacataatccttgtatat 18383063  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383062 gccattattgcttgattgatctatgc-aatgtattttcctggacatttaaccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 18382964  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  18382963 ggcttgtgtaagaacaactttctgatctctgctt 18382930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42034096 - 42033759
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42034096 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatctgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatatta 42033997  T
Q  101 a----catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgt 196  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42033996 attaacatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgt 42033897  T
Q  197 atatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  42033896 atatgcctttattgcttgattgatctatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagat 42033797  T
Q  297 tcttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  42033796 tcttggcttgcataagaacaaccttctgatctctgctt 42033759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8540152 - 8539818
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8540152 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatatta 8540053  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcc-tttttgacataatccttgtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8540052 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatggtcttaaattaacattgaatatcctttttttacataatccttatata 8539953  T
Q  200 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8539952 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatatgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattat 8539853  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  8539852 tggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 8539818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 334
Target Start/End: Original strand, 2370571 - 2370900
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacat 104  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2370571 aatgttctttttgtttcacttatgatgatttataagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaaaacaatgaagagcaatgattttaacat 2370670  T
Q  105 ctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2370671 ctaggatgatattcccttttggaatatttctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcca 2370770  T
Q  205 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggct 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2370771 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttccttgacatttattcatgtcacatgtgcattccatgaccttgatcaatgttcttgagattttgggct 2370870  T
Q  305 tgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||| ||| |||||  || |||||| |||||    
T  2370871 tgtataagaacaaccttttgatctatgctt 2370900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 30549765 - 30550098
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30549765 tcagaatgttccatctgtttcacttaagatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 30549864  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  30549865 acatctagcatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 30549964  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  30549965 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacacatgtcacatgtgacttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 30550064  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30550065 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 30550098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8605391 - 8605057
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8605391 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatacttaaacaacaatgaagagcagtgatatta 8605292  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcc-tttttgacataatccttgtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8605291 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatggtcttaaattaacattgaatatcctttttttacataatccttatata 8605192  T
Q  200 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8605191 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatatgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattat 8605092  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  8605091 tggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 8605057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2115901 - 2115568
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2115901 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 2115802  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || | | ||| ||||||||||| |||||    
T  2115801 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttgatagtcttaaatgaacattgaataccttctttaacataatccttttatat 2115702  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  2115701 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 2115602  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  2115601 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 2115568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25019369 - 25019035
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||    
T  25019369 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgataata 25019270  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  25019269 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 25019170  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  25019169 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 25019070  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  25019069 tggcttgtttaagaacaaccttctaatctctgctt 25019035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21458529 - 21458213
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21458529 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21458430  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21458429 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21458330  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21458329 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21458230  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21458229 ggcttgtataagaacaa 21458213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16154784 - 16154450
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  16154784 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 16154685  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||    
T  16154684 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 16154585  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  16154584 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatatactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 16154485  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  16154484 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 16154450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 65 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1969174 - 1968905
Alignment:
Q  65 ctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  1969174 ctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatattaacatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgtccataatcttaaatga 1969075  T
Q  165 acattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtg 264  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  1969074 acattaagtatcttttttgacataatccttgtatattcctttattgcttgattgatccatgaatttgtactttcctagacatatatccatatcacatgtg 1968975  T
Q  265 ccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||    
T  1968974 ccttgcatgaccttaatcaatgttcttgagattcttggcttgtataagaataaccttctgatctctgctt 1968905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 1186580 - 1186883
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1186580 tcagaatgttccttttgtttcacttatgatgatttgtaagacttccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagagattgta 1186679  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  1186680 acatctaggatgatattctc-tttggaatatttctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacattattcttgtaaat 1186778  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||| | || ||| ||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||     
T  1186779 gtctttattgtttgattgatacatgataatgtactttactgaacatttattcatgttacatgtgccttgtatgttcttgat-aatgttcttgagtttctg 1186877  T
Q  301 ggcttg 306  Q
    ||||||    
T  1186878 ggcttg 1186883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 18062380 - 18062712
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18062380 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggattatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaattctaacagtggaacaacaatgaagagcagtgatttta 18062479  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||    
T  18062480 acatataagatgatattcccttttggaatatttatagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacattaaccttataaat 18062579  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || | | |||||||| | |  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||     
T  18062580 gtctttattgcttcattgatccatggagatgtactttcctggacatttgttcatgtcacgtatagcttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattcta 18062678  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  || ||| ||||||||    
T  18062679 ggcttgtataagaacaaccttttgaactctgctt 18062712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 100 - 334
Target Start/End: Original strand, 41544399 - 41544634
Alignment:
Q  100 aacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtata 199  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41544399 aacatctaggataatattcccttgtggaatattcctagtacatcaacgttcatagtcttaaatgaacattgagcatcctttttgacatagtccttgtata 41544498  T
Q  200 tgcctttattgctt-gattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattc 298  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41544499 tgcctttgttgctttgatagatccatgcaaatgtactttcgtggacatatatccatgtcacatgtgtcttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattc 41544598  T
Q  299 ttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||| |||||||| |||||  |||| |||| |||||    
T  41544599 ttggtttgtgtaagaacaaccttctaatctttgctt 41544634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22956454 - 22956152
Alignment:
Q  3 agaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaa-tgaagagcagtgattttaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||||  ||    
T  22956454 agaatgttccatttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtatttgatgtaaacaa-tcctaatagtgaaaacataactgaagtgcagtgattgcaa 22956356  T
Q  102 catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatg 201  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  22956355 catctaggatgatattct-tattggaatattcttagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaaccttaaatatcctttttgacattaaccttgtaaatg 22956257  T
Q  202 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttg 301  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22956256 cctctattgtttgattgattcatgaaaatgtactttcctagacatttattcatgtcacgtgtgacttgcatgatcttgat-aatgttcttgagattcttg 22956158  T
Q  302 gcttgt 307  Q
    ||||||    
T  22956157 gcttgt 22956152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34822915 - 34822654
Alignment:
Q  12 cttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggat 111  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||    
T  34822915 cttttgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagtgcagtgtttgtaacatctagtat 34822816  T
Q  112 gatattcccttttggaatattcatagtacttc-aatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattg 210  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |  |||||| || |||||||||    
T  34822815 gatattctc-tttagaatattcctagtacttcaaatgttcatagtcttaaatgaacaatgaagatcttttttgacattaatcttgtaaattcctttattg 34822717  T
Q  211 cttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatg 273  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34822716 cttgattgatccaagacaatgtactttactgaacctttattcatgtcacatgtgccttgcatg 34822654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 41544270 - 41544386
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41544270 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacactgaagagcagtgatatta 41544369  T
Q  101 acatctaggatgatatt 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  41544370 acatctaggatgatatt 41544386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 334
Target Start/End: Original strand, 22406646 - 22406761
Alignment:
Q  220 tccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaag 318  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||     
T  22406646 tccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttggtcaaagttcttgagactcttggcttgtttaagaacaac 22406745  T
Q  319 attctgatctctgctt 334  Q
     |||||||||||||||    
T  22406746 cttctgatctctgctt 22406761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21782470 - 21782349
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21782470 tttggaatattcctagtacttcaagtgtttatagtcttgaatgaaccttgaaga-cctttttgacattattcttgtaaatgcctttattgcttgattgat 21782372  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||| | ||||||||| |||||    
T  21782371 ccatgtagatgtactttactgga 21782349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 52955458 - 52955535
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52955458 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaattctaatagtgaaaca 52955535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 26193652 - 26193864
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | |||  | ||||| ||||||| |    |||||||||| |||||| | || ||||    
T  26193652 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagacataactgaagtgcagtgaatgcgtcatctaggataatattctcatt-ggaa 26193749  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  26193750 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgca 26193848  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||||| |||||    
T  26193849 aatgtactttactgga 26193864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Original strand, 1989662 - 1989732
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaa 75  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989662 aatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaa 1989732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 1974874 - 1974951
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1974874 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 1974951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 21821737 - 21821889
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21821737 tttggaatattcctagtacttcaagtcttcatagtcttgaatgaactttgaaga-cttttttgacattattcttgtaaatgcctttattgcttgattgat 21821835  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctggata-tatatccatgtcacatgtgccttgcatg 273  Q
     || | | ||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||| | |||||||    
T  21821836 tcaagtagatgtactttactggacattttattcatgtcacatgtacgttgcatg 21821889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 41208428 - 41208351
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41208428 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaatttatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 41208351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22960770 - 22960528
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtt--tcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaa-acaacaatgaagagcagtgatt 97  Q
    |||||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| ||||||| || |||| | ||||| | ||||| |    
T  22960770 tcagaatgttccttttgttcttactttaggatgatttgtaagacttacttttaatgtaatc-aatcttaatagtaaagacaaaactgaagtgtagtgaat 22960672  T
Q  98 ttaacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgt 196  Q
      |||||||||||| |||||  |  |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||  |||||||    
T  22960671 gcaacatctaggataatattttc-attggaataatcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaaga-cctttttgacatagttccttgt 22960574  T
Q  197 atatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
      |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||    
T  22960573 ccatgcctttattg-ttgatagatccatgcagatgtacctttctgga 22960528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Original strand, 1982244 - 1982314
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaa 75  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982244 aatgtttcttttgtttcacttagaatgatttgtaagacttgtatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaa 1982314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20308626 - 20308505
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  20308626 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagat 20308528  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  20308527 ccatgcagatgtacttttctgga 20308505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 243
Target Start/End: Original strand, 18097143 - 18097356
Alignment:
Q  28 gatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaa---acaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattccctttt 124  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| |  ||| ||||||| |  |||||||||||| |||||| | ||     
T  18097143 gatgatttgtaagacttacttttgatgtagtcaattc-taatagtgaagatacaacca--aagtgcagtgaatgcaacatctaggataatattctcatt- 18097238  T
Q  125 ggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgatccat 224  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  || | ||| |||||  | |||||  ||||||  | | ||||||||||||||    
T  18097239 ggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagat-catttagacattgttcttgtgaatgcctcaagttcttgattgatccat 18097337  T
Q  225 gcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18097338 gcaactgtactttcctgga 18097356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25868038 - 25867917
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  25868038 tttggaatattcctagtaccttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagat 25867940  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  25867939 ccatgcagatgtacttttctgga 25867917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27065936 - 27065724
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | | |  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  27065936 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 27065839  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  27065838 tattcttagtgctttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgta 27065740  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  27065739 gatgtacttttctgga 27065724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Original strand, 20328672 - 20328792
Alignment:
Q  123 ttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatc 221  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||| |  |||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||||  ||||| |||     
T  20328672 ttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagataaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttttccatgcctttatttgttgatagatt 20328770  T
Q  222 catgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  20328771 catgcatatgtacttttctgga 20328792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 25823752 - 25823860
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgaca-taatccttgtatatgcctttattgcttgattga 219  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||| |  | |||||  | |||||||||||||||||||    
T  25823752 tttggaatattcctagaacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaaga-cctttttgacacttttgcttgttcaagcctttattgcttgattga 25823850  T
Q  220 tccatgcaaa 229  Q
    ||||||||||    
T  25823851 tccatgcaaa 25823860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 50941051 - 50940948
Alignment:
Q  14 tttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatga 113  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||| |||| ||| |  |  |||||||||||||||    
T  50941051 tttgtttcacttaggataatttgtaagacttccatttgatgtaa-ccaattttaatagtaaaacatcaacgaagtgcaattttcataacatctaggatga 50940953  T
Q  114 tattc 118  Q
    |||||    
T  50940952 tattc 50940948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20314310 - 20314189
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  20314310 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggataaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagat 20314212  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||    
T  20314211 ccatgtatatgtaattttctgga 20314189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 20318347 - 20318468
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  || ||||||||||||  | |||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  20318347 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagat-ctttttgacatagtttcttgtccatgcctttatttgttgatagat 20318445  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
      ||||| ||||||||| |||||    
T  20318446 taatgcatatgtacttttctgga 20318468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 30210919 - 30210869
Alignment:
Q  14 tttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatc 64  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30210919 tttgtttctattaggatgatttgtaagactttcatttgatgtaatcaaatc 30210869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14944208 - 14943906
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14944208 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagttatatta 14944109  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14944108 acatataggatgatattcccttgtggaatgttcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 14944009  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14944008 gcctttattgcttaattgatccatgcaaatgtactttcctggacagatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 14943909  T
Q  301 ggc 303  Q
    |||    
T  14943908 ggc 14943906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15371801 - 15371499
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15371801 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagttatatta 15371702  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371701 acatataggatgatattcccttgtggaatgttcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 15371602  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371601 gcctttattgcttaattgatccatgcaaatgtactttcctggacaaatatacatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 15371502  T
Q  301 ggc 303  Q
    |||    
T  15371501 ggc 15371499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42621080 - 42620747
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42621080 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 42620981  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||  || ||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||    
T  42620980 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacattaatgtttatattcttatatgaacattgaatttctttttttacataatccttttatat 42620881  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  42620880 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattctcatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 42620781  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  42620780 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 42620747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 9535401 - 9535735
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||    
T  9535401 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgataata 9535500  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  9535501 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacaatgaatgccttctttgacataatccttgtatat 9535600  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  9535601 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactat 9535700  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  9535701 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 9535735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 9545684 - 9546018
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||    
T  9545684 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgataata 9545783  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  9545784 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacaatgaatgccttctttgacataatccttgtatat 9545883  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  9545884 gcctttatttcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 9545983  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  9545984 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 9546018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 5381976 - 5382292
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5381976 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 5382075  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5382076 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5382175  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5382176 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5382275  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  5382276 ggcttgtataagaacaa 5382292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 5391614 - 5391930
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5391614 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 5391713  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5391714 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5391813  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5391814 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5391913  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  5391914 ggcttgtataagaacaa 5391930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5927036 - 5926720
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5927036 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 5926937  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5926936 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5926837  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5926836 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5926737  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  5926736 ggcttgtataagaacaa 5926720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6544706 - 6544390
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  6544706 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 6544607  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  6544606 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 6544507  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6544506 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 6544407  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  6544406 ggcttgtataagaacaa 6544390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8500950 - 8500634
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8500950 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 8500851  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8500850 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8500751  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8500750 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8500651  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  8500650 ggcttgtataagaacaa 8500634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8511420 - 8511104
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8511420 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 8511321  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8511320 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8511221  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8511220 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8511121  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  8511120 ggcttgtataagaacaa 8511104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 26348310 - 26348626
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  26348310 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 26348409  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  26348410 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 26348509  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26348510 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 26348609  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  26348610 ggcttgtataagaacaa 26348626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46497015 - 46496699
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  46497015 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 46496916  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  46496915 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 46496816  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46496815 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 46496716  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  46496715 ggcttgtataagaacaa 46496699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46507627 - 46507311
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  46507627 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 46507528  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  46507527 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 46507428  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46507427 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 46507328  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  46507327 ggcttgtataagaacaa 46507311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6534407 - 6534091
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  6534407 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 6534308  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  6534307 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgtttatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 6534208  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6534207 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 6534108  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  6534107 ggcttgtataagaacaa 6534091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43983378 - 43983062
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  43983378 tcagaatgttccatctgtttcacttaggctgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 43983279  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  43983278 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 43983179  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43983178 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 43983079  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  43983078 ggcttgtataagaacaa 43983062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 317
Target Start/End: Original strand, 26363360 - 26363661
Alignment:
Q  16 tgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgata 115  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26363360 tgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgata 26363459  T
Q  116 ttcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttga 215  Q
    |||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26363460 ttcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatatgcctttattgcttga 26363559  T
Q  216 ttgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  26363560 ttgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattcttggcttgtataagaac 26363659  T
Q  316 aa 317  Q
    ||    
T  26363660 aa 26363661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44897218 - 44896902
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  44897218 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 44897119  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  44897118 acatctaggatgatattcctttgtgaagtattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 44897019  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  44897018 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgaccacagttcttgagattctt 44896919  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  44896918 ggcttgtataagaacaa 44896902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44907621 - 44907305
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  44907621 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 44907522  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  44907521 acatctaggatgatattcctttgtgaagtattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 44907422  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  44907421 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgaccacagttcttgagattctt 44907322  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  44907321 ggcttgtataagaacaa 44907305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32098281 - 32097947
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  32098281 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgcaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 32098182  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||    
T  32098181 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 32098082  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  32098081 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 32097982  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  32097981 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 32097947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32108718 - 32108384
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  32108718 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgcaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 32108619  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||    
T  32108618 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 32108519  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  32108518 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 32108419  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  32108418 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 32108384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 11626525 - 11626840
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  11626525 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgcaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 11626624  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  11626625 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 11626724  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11626725 gcctttattgcttgattgat-catgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 11626823  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  11626824 ggcttgtataagaacaa 11626840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 16132075 - 16132391
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  16132075 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 16132174  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  16132175 acatctaggatgatattcctttgaaaaatattcctagtacgtcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 16132274  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16132275 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16132374  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  16132375 ggcttgtataagaacaa 16132391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 16142624 - 16142940
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  16142624 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 16142723  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  16142724 acatctaggatgatattcctttgaaaaatattcctagtacgtcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 16142823  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16142824 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16142923  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  16142924 ggcttgtataagaacaa 16142940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 14248701 - 14249005
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgttt-cagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttt 99  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14248701 tcagaatgttccttttgttttcacttgggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcgaatccttatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattgt 14248800  T
Q  100 aacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtata 199  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  14248801 aacatctaggatgatattctcctt-ggaatatttatagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcatttttgacataaatcttgtata 14248899  T
Q  200 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14248900 tgcctttatttcttgattgatccatgcaaatgtactttcttggacatttattaatttcacgtgtgccttgcatgatcttgatcaatgttcttgagtttct 14248999  T
Q  300 tggctt 305  Q
     |||||    
T  14249000 gggctt 14249005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 2992076 - 2992409
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2992076 tcagaatgttccttttgtttcatttaggatgatttctaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagaagtgattgta 2992175  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttg--acataatccttgtat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||||     
T  2992176 acatctaggatgatattcccttttgaaatattcctagtacttcaatgtctatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgcaatttaat-cttgtaa 2992274  T
Q  199 atgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||| |||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||    
T  2992275 atgcctttattgcttgattgatccatgcaagtttactttcctgcgcatttattcatgtcacgtgtgccttgcatactcttgat-aatgttcttgagtttc 2992373  T
Q  299 ttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    | | ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2992374 tggacttgtataagaacaacattctgaactctgctt 2992409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9006776 - 9006474
Alignment:
Q  31 gatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaata 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9006776 gatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagaagtgattgcaacatctaggatgatattctc-tttggaata 9006678  T
Q  131 ttcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaa 229  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9006677 tttctagtatttcaagtgttcatagtcttgaatgaacattgaatatcctttttgacattaatcttgtaaatacctttattgcttgattgatccatgccaa 9006578  T
Q  230 tgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctgatctc 329  Q
    ||||||||  |||| || ||| |||||||  ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||||| |||    
T  9006577 tgtactttaatggacatttattcatgtcatgtgtaccttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattctgggcttttataagaacaatcttctgaactc 9006479  T
Q  330 tgctt 334  Q
    |||||    
T  9006478 tgctt 9006474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40701813 - 40701709
Alignment:
Q  14 tttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatga 113  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||    
T  40701813 tttgtttcacttaggataatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaataatgaaacatcattgaagtgcagtgtgtataacatctagaatga 40701714  T
Q  114 tattc 118  Q
    |||||    
T  40701713 tattc 40701709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 239 - 334
Target Start/End: Original strand, 22964652 - 22964747
Alignment:
Q  239 ctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22964652 ctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactcttggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 22964747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 15988838 - 15988915
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15988838 tcagaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactgttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 15988915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 33091079 - 33090976
Alignment:
Q  15 ttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgat 114  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||   | ||||||||||||||||    
T  33091079 ttgtttcacttaggatgatttgtaagactctcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacattgatgaagtgcagtatatgtaacatctaggatgat 33090980  T
Q  115 attc 118  Q
    ||||    
T  33090979 attc 33090976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 13285954 - 13286031
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285954 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 13286031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 42595256 - 42595179
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42595256 tcagaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 42595179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 41027443 - 41027368
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaa 76  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41027443 tcagaatgttccatttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaa 41027368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 12827528 - 12827605
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827528 tcagaatattcattttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 12827605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 31824619 - 31824544
Alignment:
Q  3 agaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824619 agaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 31824544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 24541126 - 24541247
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  24541126 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 24541224  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  24541225 ccatgcagatgtacttttctgga 24541247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45552953 - 45552832
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  45552953 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtctttgatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 45552855  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  45552854 ccatgcagatgtacttttctgga 45552832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 5615665 - 5615742
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5615665 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 5615742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27988362 - 27988150
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | |||  | ||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||| | || ||||    
T  27988362 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagacacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggataatattctcatt-ggaa 27988265  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | |||| |  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27988264 tattcctagtactttaatgttcataggcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttatccatgcctttatttgttgatagatccatgca 27988166  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     |||||||||||||||    
T  27988165 gatgtactttcctgga 27988150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 25441987 - 25441910
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||||||||||    
T  25441987 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatataatcaaatcctaatagtgaaaca 25441910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 7034914 - 7034986
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtg 73  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7034914 tcagaatgttccatctatttcacttaggataatttgttagactaccatttgatgtaatcaaatccttatagtg 7034986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19585533 - 19585411
Alignment:
Q  121 ttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattga 219  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| ||    
T  19585533 tttttgaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatc-tttttgacatagttccttgttcatgcctttatttgttgataga 19585435  T
Q  220 tccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  19585434 tccatgcagatgtacttttctgga 19585411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12491188 - 12491071
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaa-acaacaatgaagagcagtgatttt 99  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||   || || ||||||| |||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||||      
T  12491188 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtatctggtgtaatc-aatcctaatattgaagacaaaattgaagtgcagtgattgc 12491090  T
Q  100 aacatctaggatgatattc 118  Q
    || ||||||||||||||||    
T  12491089 aatatctaggatgatattc 12491071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12769799 - 12769761
Alignment:
Q  199 atgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtacttt 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12769799 atgcctttatttcttgattgatccatgcagatgtacttt 12769761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19799434 - 19799369
Alignment:
Q  179 ttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  19799434 ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 19799369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8271 - 7938
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8271 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaattatgaagagcagtgatttta 8172  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||    
T  8171 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacataatccttgtttat 8072  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8071 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgtcttgcatgaccttgatcaaagttcttgagactctt 7972  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  7971 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 7938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 93020 - 93353
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  93020 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactactatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 93119  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  93120 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacataatccctgtatat 93219  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  93220 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctagacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttctttagactctt 93319  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  93320 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 93353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29540358 - 29540025
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||    
T  29540358 tcagaatgttccatttgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaattctaatagtgaaacaagaatgaagagtaatgatgtta 29540259  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29540258 acatctaggatgatattcccttgtgggatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataattcttgtatat 29540159  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29540158 gtctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgctttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 29540059  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  29540058 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 29540025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14791500 - 14791170
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacat 104  Q
    |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14791500 aatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgattttaacat 14791401  T
Q  105 ctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcct 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  14791400 ctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatatgcct 14791301  T
Q  205 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattcttggc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  14791300 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggc 14791201  T
Q  304 ttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14791200 ttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 14791170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12454954 - 12454638
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  12454954 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 12454855  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  12454854 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 12454755  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12454754 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 12454655  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  12454654 ggcttgtataagaacaa 12454638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 24922160 - 24922494
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||    
T  24922160 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaataata 24922259  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  24922260 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 24922359  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  24922360 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatctatgtcacatgtgccttgcatgtcctttgatcaaagttcttgagactct 24922459  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  24922460 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagctt 24922494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20912183 - 20911849
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  20912183 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 20912084  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||    
T  20912083 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 20911984  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  20911983 gcctttattgcttgattgattcatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 20911884  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  20911883 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 20911849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 24931196 - 24931530
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||    
T  24931196 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaataata 24931295  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  24931296 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 24931395  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | |    
T  24931396 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatctatgtcacatgtgccttgcatgtcctttgatcaaagttcttgagactat 24931495  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  24931496 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagctt 24931530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 27787728 - 27788017
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27787728 tcagaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcatatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattgta 27787827  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  27787828 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacattaaccttgtaaat 27787927  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttctt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||| |||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  27787928 gcctttattgcttgattgatccatacaagtgtactttcctgaacatttattcatgtcatgtgtgccttgcatgctcttgat-aatgttctt 27788017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16897847 - 16897531
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||    
T  16897847 tcagaatgttccatctgtttcacttagaatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagaacagtgataata 16897748  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  16897747 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 16897648  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16897647 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16897548  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  16897547 ggcttgtataagaacaa 16897531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16908500 - 16908184
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||    
T  16908500 tcagaatgttccatctgtttcacttagaatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagaacagtgataata 16908401  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  16908400 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 16908301  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16908300 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16908201  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  16908200 ggcttgtataagaacaa 16908184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18159962 - 18159656
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  18159962 tcagaatgttccatctgtttcacttaggctgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 18159863  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18159862 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtattaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18159763  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18159762 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18159663  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  18159662 ggcttgt 18159656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18169774 - 18169468
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  18169774 tcagaatgttccatctgtttcacttaggctgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 18169675  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18169674 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtattaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18169575  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18169574 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18169475  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  18169474 ggcttgt 18169468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31357461 - 31357155
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  31357461 tcagaatgttccatctgtttcacttaggctgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 31357362  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  31357361 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 31357262  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31357261 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 31357162  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  31357161 ggcttgt 31357155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31367189 - 31366883
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  31367189 tcagaatgttccatctgtttcacttaggctgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 31367090  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  31367089 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 31366990  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31366989 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 31366890  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  31366889 ggcttgt 31366883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3285746 - 3285418
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |   ||    
T  3285746 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaaaacta 3285647  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctt-tttgacataatccttgtata 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3285646 acatctaggatgatatttccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaat-tccttctttgacataatccttgtata 3285548  T
Q  200 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgac-cttgatcaatgttcttgagattc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  3285547 tgcctttatttcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacttttgatcaaagttcttgagactc 3285448  T
Q  299 ttggcttgtgtaataacaagattctgatct 328  Q
    ||||||| | ||| |||||  |||||||||    
T  3285447 ttggcttttttaagaacaaccttctgatct 3285418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18201117 - 18200876
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18201117 tcagaatgttccatctgtatcacttaggatgatttgtaagactacc-tttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatatta 18201019  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201018 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatcttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 18200919  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18200918 gcctttattgctttattgatccatgcaaatgtactttcctgga 18200876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14045211 - 14044956
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacat 104  Q
    |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  14045211 aatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtgagactatcttttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaaaaacagtgatattaacat 14045112  T
Q  105 ctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcct 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  14045111 ctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataattcttatatatgtct 14045012  T
Q  205 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacat 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||||    
T  14045011 ttattgcttgattgatcgatgcaaatat-ctttcctagacaagtatccatgtcacat 14044956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16321085 - 16320945
Alignment:
Q  102 catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  16321085 catctaggatgatattctcatt-ggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcat 16320988  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  16320987 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 16320945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 8563410 - 8563487
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8563410 tcagaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttaattgatgtaatcaaatcctaatattgaaaca 8563487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 22223760 - 22223837
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22223760 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttttaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 22223837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 22249595 - 22249672
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22249595 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttttaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 22249672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 9761632 - 9761732
Alignment:
Q  18 tttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatatt 117  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  9761632 tttcacttaggatgatttgtaagatttctatttgatgtaatcaaatcttaacagtaaaacatcaatgaagtgcagtgtgtataacatctaggatgatatt 9761731  T
Q  118 c 118  Q
    |    
T  9761732 c 9761732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 26021408 - 26021529
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  26021408 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 26021506  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  26021507 ccatgcagatgtacttttctgga 26021529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 34765228 - 34765151
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  34765228 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 34765151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 243
Target Start/End: Original strand, 18712578 - 18712697
Alignment:
Q  124 tggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatcc 222  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||||    
T  18712578 tggaatattcatagtagtttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 18712676  T
Q  223 atgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  18712677 atgcagatgtacttttctgga 18712697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1596303 - 1596091
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | |||  | ||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||| | || | ||    
T  1596303 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagacacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggataatattctcatt-gaaa 1596206  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  1596205 tattcctagtactttaatgttcatagtcttgtatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgttcatgcctttatttgttgatagatccatgca 1596107  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  1596106 gatgtacttttctgga 1596091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28092483 - 28092398
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaag 87  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28092483 tcagaaagttccttta-tttcacttaggattatgtgtaagactctcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatcaatgaag 28092398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 24361863 - 24361931
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaat 69  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  24361863 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttttaattgatgtaatcaaatcctaat 24361931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16923439 - 16923219
Alignment:
Q  28 gatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagt-gaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || |||  | ||||| ||||| |   |||| |||||||| ||| |||  |||||    
T  16923439 gatgatttgtaagactactttttgatgtaatc-aatcctaatagtagagacataactgaagtgcagt-aaagtaacctctaggataata-tcctctttgg 16923343  T
Q  127 aatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgaca-taatccttgtatatgcctttattgcttgattgatccat 224  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||| |  | |||||  | ||||||||||| ||||  ||||||    
T  16923342 aatattcctagaacttcaagtgttcatagtcttgaattaaccttgaggat-ctttttgacacttttgcttgtccaagcctttattgc-tgatacatccat 16923245  T
Q  225 gcaaatgtactttcctggatatatat 250  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16923244 gcaattgtactttcctggacatatat 16923219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 169
Target Start/End: Original strand, 791505 - 791571
Alignment:
Q  102 catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacatt 169  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  791505 catctaggatgatattctcatt-ggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttgaatgaacatt 791571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16333233 - 16333167
Alignment:
Q  102 catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacatt 169  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  16333233 catctaggatgatattctcatt-ggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacatt 16333167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 24505704 - 24505825
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  ||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||  ||||| |||    
T  24505704 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatccttttt-acatagttccttgtccatgcttttatttgttgatagat 24505802  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    | ||||| ||||||||| |||||    
T  24505803 ctatgcagatgtacttttctgga 24505825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26161754 - 26161616
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| |||||||||| || ||||||| |||||  | ||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||| | || ||||    
T  26161754 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactc-taatagtaaaacacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggattatattctcatt-ggaa 26161657  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacatt 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  26161656 tattcctagtactttaatgttcatagtcttgattgaacatt 26161616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 24696663 - 24696992
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24696663 tcagaatgttccttctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 24696762  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  24696763 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 24696862  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  24696863 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 24696962  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctct 330  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  24696963 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctct 24696992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 38957896 - 38958230
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38957896 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatataatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcggtgatttta 38957995  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||| ||    
T  38957996 acatctagaatgatattcccttgtggaatatttctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgtcttctttgacataatcctcgtacat 38958095  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  38958096 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttacatgacctttgatcaaagttcttgagactct 38958195  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  38958196 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagctt 38958230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 2998775 - 2999091
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  2998775 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 2998874  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  2998875 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 2998974  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2998975 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 2999074  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  2999075 ggcttgtataagaacaa 2999091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18651119 - 18650803
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  18651119 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 18651020  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18651019 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18650920  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18650919 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18650820  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  18650819 ggcttgtataagaacaa 18650803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18663237 - 18662921
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  18663237 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 18663138  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18663137 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18663038  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18663037 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18662938  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  18662937 ggcttgtataagaacaa 18662921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45014633 - 45014301
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  45014633 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 45014534  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  45014533 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 45014434  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  45014433 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactctactggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 45014334  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgc 332  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  45014333 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgc 45014301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4458096 - 4457780
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  4458096 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 4457997  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  4457996 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 4457897  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4457896 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 4457797  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  4457796 ggcttgtataagaacaa 4457780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4467721 - 4467405
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  4467721 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 4467622  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  4467621 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 4467522  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4467521 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 4467422  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  4467421 ggcttgtataagaacaa 4467405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 5337213 - 5337529
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5337213 tcagaatgttccatctgtttcacttaggctgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 5337312  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5337313 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5337412  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5337413 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5337512  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  5337513 ggcttgtataagaacaa 5337529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 5347066 - 5347382
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5347066 tcagaatgttccatctgtttcacttaggctgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 5347165  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5347166 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5347265  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5347266 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5347365  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  5347366 ggcttgtataagaacaa 5347382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 9502839 - 9503155
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  9502839 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 9502938  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9502939 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaatattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9503038  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9503039 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9503138  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  9503139 ggcttgtataagaacaa 9503155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 9514205 - 9514521
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  9514205 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 9514304  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9514305 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaatattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9514404  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9514405 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9514504  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  9514505 ggcttgtataagaacaa 9514521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 38930560 - 38930895
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  38930560 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaagcaataatgaagagcaatgatttta 38930659  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||| |||||||||| ||    
T  38930660 acatctaggatgatattctcttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacaaaatccttgtacat 38930759  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattc- 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||     
T  38930760 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 38930859  T
Q  299 ttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  38930860 ttggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagctt 38930895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45024710 - 45024378
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  45024710 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 45024611  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  45024610 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 45024511  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  45024510 gtctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactctactggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaatttcttgagactct 45024411  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgc 332  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  45024410 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgc 45024378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17488591 - 17488257
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  17488591 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 17488492  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||    
T  17488491 acatctaggatgatatttctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 17488392  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  17488391 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaaattcttgagactct 17488292  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  17488291 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 17488257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 72307 - 72626
Alignment:
Q  14 tttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatga 113  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  72307 tttgtttcacttagaatgatttgtaagactaccatttgatgtaattaaatcctaatagtgaaacagcaacgaagagcagtgattgcaacatctaagatga 72406  T
Q  114 tattcccttttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgaca-taatccttgtatatgcctttattgc 211  Q
    ||||| | |||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  72407 tattctc-tttgaaatatccctagtacttcaagtgttcataatcttaaatgaacattgaatattttctttgacattaatcc-tgtaaatgtctttattgc 72504  T
Q  212 ttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||  ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  72505 ttgattgatccatgccaatgtactttactggacatttattcatgtcatgtgtaccttgcatgttcttgat-attgttcttgagattctgggcttgtataa 72603  T
Q  312 taacaagattctgatctctgctt 334  Q
     |||||  || ||| ||||||||    
T  72604 gaacaaccttttgaactctgctt 72626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 44639104 - 44639281
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||    
T  44639104 tcagaatgttccttt-gtttcacttaagatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctagtagttaaacaacaatatagagcagtgatatta 44639202  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatccttt 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44639203 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctattaaatcaatgttcatagtcttaaatgaaca-tgagtatccttt 44639281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 202 - 334
Target Start/End: Original strand, 44639277 - 44639409
Alignment:
Q  202 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44639277 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatatcacatgtgccttggatgaccttgatcaatgttcttgagaatcttg 44639376  T
Q  302 gcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  44639377 gcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 44639409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29423266 - 29423126
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||    
T  29423266 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataataaagaagagtgatatta 29423167  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaat 146  Q
    ||||     |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  29423166 acat-----atgatatttccttgtggaatattcctagtacatcaat 29423126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22901985 - 22901908
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22901985 tcagaatgttccttttgtttcagttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 22901908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19342182 - 19342105
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19342182 tcagaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 19342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23721808 - 23721735
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23721808 aatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 23721735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12570433 - 12570221
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| |||||||||| || ||||||| |||||  | ||||| ||||||| |  |||||||||||| |||||| | || ||||    
T  12570433 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactc-taatagtaaaacacaactgaagtgcagtgaatgcaacatctaggataatattctcatt-ggaa 12570336  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  12570335 tattcctagtactttaatgttcatagtcttatatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgtctttatttgttgatagatccatgca 12570237  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  12570236 gatgtacttttctgga 12570221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16327912 - 16327799
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||||   | |     
T  16327912 tcagaatgttccttt-gtttcagtttagatgatttgtaagactaccatttgatgcaatcgaatcccaacagtgaaacatcgatgaagtgcagtatgtatt 16327814  T
Q  101 acatctaggatgata 115  Q
    |||||||||||||||    
T  16327813 acatctaggatgata 16327799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 22908956 - 22909030
Alignment:
Q  4 gaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22908956 gaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaataatgaaaca 22909030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 40409202 - 40409318
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||   | ||    
T  40409202 tcagaatattccttt-gtttcacttaggaagatttgtaagactctcatttgatgtaatcaaactctaatagtgaaacatcaatgaagtgtagtatgtgta 40409300  T
Q  101 acatctaggatgatattc 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40409301 acatctaggatgatattc 40409318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 273
Target Start/End: Original strand, 24239418 - 24239591
Alignment:
Q  100 aacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtat 198  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||  || |||||||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||  | | || ||     
T  24239418 aacatctaggatgatattctcatt-ggaatattcccagcacttcaattttcatagtcttga-tgaacattgaatatccttttttacatttaactttataa 24239515  T
Q  199 atgcctttattgctt-gattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatg 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || | | |||||||||  || ||||||||    
T  24239516 atgcctttattgctttgattgatccatgcaaatgttcttttctggacattttttcatgtcacaaatgacttgcatg 24239591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 78
Target Start/End: Original strand, 16135313 - 16135385
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16135313 aatgttccttt-gtttcagtttagatgatttgtaagactaccatttgatgcaatcgaatcctaacagtgaaaca 16135385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 27160101 - 27160192
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcag 92  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  27160101 tcagaatgtttcttttgttttacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatctatgaagtgcag 27160192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 27170470 - 27170561
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcag 92  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  27170470 tcagaatgtttcttttgttttacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatctatgaagtgcag 27170561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45190684 - 45190472
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | | |  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  45190684 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 45190587  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  45190586 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgca 45190488  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  45190487 gatgtacttttctgga 45190472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Original strand, 22687952 - 22688092
Alignment:
Q  102 catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatat 200  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  22687952 catctaggataatattctcatt-ggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttttatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 22688049  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  22688050 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 22688092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 574107 - 573895
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | | |  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  574107 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 574010  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  574009 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcttttatttgttgatagatccatgca 573911  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  573910 gatgtacttttctgga 573895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Original strand, 16934571 - 16934711
Alignment:
Q  102 catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatat 200  Q
    |||||||||| |||||| | || | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  ||    
T  16934571 catctaggataatattctcatt-gaaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgttcat 16934668  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  16934669 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 16934711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Original strand, 17005231 - 17005371
Alignment:
Q  102 catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatat 200  Q
    |||||||||| |||||| | || | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  ||    
T  17005231 catctaggataatattctcatt-gaaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgttcat 17005328  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  17005329 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 17005371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15940463 - 15940324
Alignment:
Q  123 ttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtat-cctttttgaca-taatccttgtatatgcctttattgc-ttgattga 219  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| | | | || || |||  |||||||| ||||||||    
T  15940463 ttggaatattcctagcacttcaatgttcatagtctt-gatgaacattgaatatccctttttgacatttaactttataaatgaatttattgctttgattga 15940365  T
Q  220 tccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcaca 260  Q
    || |||||||| |||||| ||||| || | | |||||||||    
T  15940364 tcgatgcaaatatacttttctggacatttgttcatgtcaca 15940324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 334
Target Start/End: Original strand, 24239589 - 24239639
Alignment:
Q  284 atgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||    
T  24239589 atgttcttgagattcttggcttgtataagaacaaccttctgacctctgctt 24239639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22244615 - 22244285
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  22244615 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaaaaacgaagagcagtgatatta 22244516  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22244515 acatttaggatgatatttccttgtggaatattcctagtacatcaatgtccatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 22244416  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22244415 gcctttattgattgattgatccatgcaaatgtaatttcctggacatatattcatatcacatgtgccttgcatgaccttgatcagtgttcttgagattctt 22244316  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctg 331  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  22244315 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctg 22244285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18361178 - 18360862
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  18361178 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 18361079  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18361078 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18360979  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18360978 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18360879  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  18360878 ggcttgtataagaacaa 18360862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21753344 - 21753028
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21753344 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21753245  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21753244 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21753145  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21753144 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21753045  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21753044 ggcttgtataagaacaa 21753028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21762631 - 21762315
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  21762631 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 21762532  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21762531 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21762432  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21762431 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21762332  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21762331 ggcttgtataagaacaa 21762315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33939218 - 33938902
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  33939218 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 33939119  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  33939118 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 33939019  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33939018 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 33938919  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  33938918 ggcttgtataagaacaa 33938902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33949618 - 33949302
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  33949618 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 33949519  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  33949518 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 33949419  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33949418 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 33949319  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  33949318 ggcttgtataagaacaa 33949302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27412049 - 27411715
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  27412049 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 27411950  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||    
T  27411949 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 27411850  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  27411849 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 27411750  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  27411749 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 27411715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18390135 - 18389819
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  18390135 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttctaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 18390036  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18390035 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18389936  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18389935 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18389836  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  18389835 ggcttgtataagaacaa 18389819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 26192161 - 26192477
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  26192161 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 26192260  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  26192261 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 26192360  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||    
T  26192361 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatggccttgatcacagttcttgagtttctt 26192460  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  26192461 ggcttgtataagaacaa 26192477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 26202765 - 26203081
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  26202765 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 26202864  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  26202865 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 26202964  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||    
T  26202965 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatggccttgatcacagttcttgagtttctt 26203064  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  26203065 ggcttgtataagaacaa 26203081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 8765525 - 8765831
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8765525 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 8765624  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8765625 acatctaggatgatattcctttgtgaaatgttcctagtacatcaatgttcatagtctgaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8765724  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8765725 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8765824  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  8765825 ggcttgt 8765831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32070341 - 32070007
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  32070341 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataata 32070242  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||    
T  32070241 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 32070142  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  32070141 gcctttattgtttgattgttccatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 32070042  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  32070041 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgctt 32070007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 11411269 - 11411584
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  11411269 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 11411368  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  11411369 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattactag-acatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 11411467  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11411468 gcctttattgcttgattgatccatgtaaatgtacttttctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 11411567  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  11411568 ggcttgtataagaacaa 11411584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31105313 - 31105009
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  31105313 tcagaatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagtagtgatttat 31105214  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||| ||    
T  31105213 acatctaggatgatattcctttttggaataatcctagcacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttggcattaatcttgtaaat 31105114  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||  ||| || ||||||||| |||||||     
T  31105113 gactttattgcttgattgatccataccaatgtactttactggacatttattcatgtcacgtgtaccttgcatgttctttat-aatgttcttcagattcta 31105015  T
Q  301 ggcttg 306  Q
    ||||||    
T  31105014 ggcttg 31105009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 23378743 - 23379048
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23378743 tcagaatggtccttttgtttctcttaggatgatttgtaagacttccatttgatgtaatcaaatcgtaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgaatgta 23378842  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||  |    
T  23378843 acatctaggatgatattccctttttgaatattcctagtactttaatgttcatagtcttaaatgaacatcgaatatcctttttgacattaaccttgtaatt 23378942  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || || ||| || ||||  |||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||     
T  23378943 gtctttattgcttgattgatcgatgcaaatgtactttacctgaaatttattcaagtcatgtgtgtcttgcatgttcttgat-aatgttcttgagtttcta 23379041  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  23379042 ggcttgt 23379048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 21484194 - 21484518
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgttt-cagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaa-tgaagagcagtgattt 98  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||| | |||||||     
T  21484194 tcagaatgttccatttgttttcacctaggatgatttgtaagacttgtatttgatgtaatcaa-tcctaatagtgaaaacataactgaagtggagtgattg 21484292  T
Q  99 taacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtat 198  Q
     |||||||| |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||     
T  21484293 caacatctaagatgatattctcatt-ggaatattcccagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgcatatccttttttacattaaccttgtaa 21484391  T
Q  199 atgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || ||| ||||||||| |||  ||| |||  ||| || ||||||||||||||||    
T  21484392 atgcctttattgcttgattgatccatgcaaacgtacttttctagacatttattcatgtcacaagtgagttgtatgttctttat-aatgttcttgagattc 21484490  T
Q  299 ttggcttgtgtaataacaagattctgat 326  Q
    ||||||| | ||| |||||  |||||||    
T  21484491 ttggcttatttaagaacaaccttctgat 21484518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 78
Target Start/End: Original strand, 19548642 - 19548715
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19548642 aatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 19548715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31916659 - 31916447
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | |||  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  31916659 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagacacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 31916562  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  31916561 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgca 31916463  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  31916462 gatgtacttttctgga 31916447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 36316261 - 36316170
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcag 92  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  36316261 tcagaatgttgtttttgtttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtggaacatcgatgaagtgcag 36316170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Original strand, 13572160 - 13572300
Alignment:
Q  102 catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatat 200  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||  ||    
T  13572160 catctaggacaatattctcttttg-aatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagatccttgtccat 13572257  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  13572258 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 13572300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20896709 - 20896588
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20896709 tttggaattttcctagtacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaaga-cttttttgacattattcttgtaaatgtctttattgcttgattgat 20896611  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||| | ||||||||| |||||    
T  20896610 ccatgtagatgtactttactgga 20896588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 30944285 - 30944406
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  30944285 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 30944383  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  30944384 ccatgcagatgtacttttctgga 30944406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 30953707 - 30953828
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  30953707 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 30953805  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  30953806 ccatgcagatgtacttttctgga 30953828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 37299314 - 37299435
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  37299314 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 37299412  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  37299413 ccatgcagatgtacttttctgga 37299435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 37549104 - 37549225
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  37549104 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagat 37549202  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  37549203 ccatgcagatgtacttttctgga 37549225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Original strand, 4038388 - 4038594
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||| | |  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  4038388 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtgagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 4038485  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  4038486 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgca 4038584  T
Q  228 aatgtacttt 237  Q
     |||||||||    
T  4038585 gatgtacttt 4038594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20947692 - 20947615
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20947692 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 20947615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20958081 - 20958004
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20958081 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 20958004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 27274589 - 27274801
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | | |  | ||||| ||||||| |  | ||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  27274589 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggatagtattctcttt-ggaa 27274686  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27274687 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgca 27274785  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  27274786 gatgtacttttctgga 27274801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 37651902 - 37652023
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||  ||||| |||    
T  37651902 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcatttatttgttgatagat 37652000  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  37652001 ccatgcagatgtacttttctgga 37652023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Original strand, 18210311 - 18210426
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  18210311 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagat 18210409  T
Q  221 ccatgcaaatgtacttt 237  Q
    ||||||| |||||||||    
T  18210410 ccatgcagatgtacttt 18210426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Original strand, 18219649 - 18219764
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  18219649 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagat 18219747  T
Q  221 ccatgcaaatgtacttt 237  Q
    ||||||| |||||||||    
T  18219748 ccatgcagatgtacttt 18219764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 19888785 - 19888974
Alignment:
Q  52 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcc 151  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||  | ||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||| | || | ||||||| |||||||| |||||||     
T  19888785 atgtaatcaaa-cctaatagtaagacacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggataatattctcatt-gaaatattcctagtactttaatgttca 19888882  T
Q  152 tagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  19888883 tagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgttcatgcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 19888974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 20905031 - 20905134
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20905031 tttggaatattcttagtacttcaagttttcatagtcttgaatgaaccttgaaga-cttttttgacattattcttgtaaatgcctttattgctttattgat 20905129  T
Q  221 ccatg 225  Q
    |||||    
T  20905130 ccatg 20905134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21681399 - 21681284
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  21681399 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagat 21681301  T
Q  221 ccatgcaaatgtacttt 237  Q
    ||||||| |||||||||    
T  21681300 ccatgcagatgtacttt 21681284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Original strand, 22173749 - 22173864
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||    
T  22173749 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagat 22173847  T
Q  221 ccatgcaaatgtacttt 237  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22173848 ccatgcagatgtacttt 22173864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 34130898 - 34131111
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||| ||| ||||||||| | | |  | ||||||||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  34130898 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaataaaaacctaatagtaagatacaactgaagagcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 34130996  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| ||  ||||| ||| |  |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  34130997 tattcctagtactttaatgttcatagttttggatgaatattaaagatcctttt-gacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgca 34131095  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  34131096 gatgtacttttctgga 34131111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20764114 - 20763995
Alignment:
Q  123 ttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgatc 221  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| ||||    
T  20764114 ttggaatattcctagtactttaatgttcat-gtcttagatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatc 20764017  T
Q  222 catgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  20764016 catgcatatgtacttttctgga 20763995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37817356 - 37817233
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatg-aacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcc-tttattgcttgattg 218  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||| |  |||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||  ||||| |    
T  37817356 tttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgccttttatttgttgatag 37817258  T
Q  219 atccatgcaaatgtactttcctgga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||    
T  37817257 atccatgcagatgtacttttctgga 37817233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 205883 - 205926
Alignment:
Q  28 gatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagt 72  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  205883 gatgatttgtaagactactttttgatgtaatc-aatcctaatagt 205926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15749 - 15416
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15749 tcagaatgttccatttgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 15650  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||    
T  15649 acatctaggatgatgttcccttgtggaatattcctagttcatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacatattccttgtatat 15550  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15549 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatatgccgtgcatgaccttgatcaaagttcttgagactctt 15450  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  15449 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgctt 15416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 334
Target Start/End: Original strand, 74900 - 75218
Alignment:
Q  16 tgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgata 115  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  74900 tgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagatcagtgattttaacatctaggatgata 74999  T
Q  116 ttcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttga 215  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75000 ttcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatatgcctttattgcttga 75099  T
Q  216 ttgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  75100 ttgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactcttggcttgtataagaac 75199  T
Q  316 aagattctgatctctgctt 334  Q
    ||| || |||||| |||||    
T  75200 aagcttatgatctgtgctt 75218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 310186 - 310520
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  310186 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 310285  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  310286 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgctcatagtcttacatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 310385  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  310386 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 310485  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  310486 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagctt 310520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 216480 - 216179
Alignment:
Q  28 gatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaat-gaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttgg 126  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| | || ||    
T  216480 gatgatttgtaagacttgtacttgatgtaatcaa-tcctaatagtgaaaacataattgaagtgcagtaattgcaacatctaggatgatattcacatt-gg 216383  T
Q  127 aatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgctt-gattgatccat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | | || || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  216382 aatattcttagtacttcaatgtttatagtcttaa-tgaacattgaatatcctttttgacatttaactttataaatgtctttattgctttgattgatccat 216284  T
Q  225 gcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctg 324  Q
    ||||| ||||||| ||||| || | | ||| |||||  || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||    
T  216283 gcaaacgtacttttctggacatttgttcatatcacaaatgacttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattcttgacttgtataagaacaaccttctg 216185  T
Q  325 atctct 330  Q
    | ||||    
T  216184 acctct 216179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 21323 - 21612
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21323 tcagaatgttccatctgtttcatttgggatgatttgtaagaataccaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatttta 21422  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21423 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacaacaatgttcatattcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 21522  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttct 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21523 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctagacatatatccatgtcacatgtgccttgcacgaccttgatcaaagttct 21612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 4)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 234156 - 234472
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  234156 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 234255  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  234256 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 234355  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  234356 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 234455  T
Q  301 ggcttgtgtaataacaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  234456 ggcttgtataagaacaa 234472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 146540 - 146328
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |  | |||||||||| |||||| | || ||||    
T  146540 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaaaacacaactggagtgcagtgaatgcatcatctaggataatattctcatt-ggaa 146443  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||| ||    
T  146442 tattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttttccatgcctttatttgttgatagatccattca 146344  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
    |||||||||| |||||    
T  146343 aatgtacttttctgga 146328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 243
Target Start/End: Original strand, 153725 - 153934
Alignment:
Q  32 atttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaata 130  Q
    |||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||| ||| ||| |  | ||||||||||||||||| | || ||||||    
T  153725 atttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaaaacacaactgaagtgcattgaatgcatcatctaggatgatattctcatt-ggaata 153822  T
Q  131 ttcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataa-tccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaa 229  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||  |||||||||| || |||   |||||||||||  ||||| |||||||||| |    
T  153823 ttcctagtactttaatgttcgtagtcttgattgaacattaaagatcc--tttgacataattctttgaccatgcctttatttgttgatagatccatgcaga 153920  T
Q  230 tgtactttcctgga 243  Q
    |||||||| |||||    
T  153921 tgtacttttctgga 153934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 114721 - 114932
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| |||||||||| || ||||| | |||||  | ||||| ||||||| |  | |||||| |||||||||| | || ||||    
T  114721 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactc-taataataaaacacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaagatgatattctcatt-ggaa 114818  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataa-tccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||  |||||||||| || |||   |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  114819 tattcctagtactttaatgttcttagtcttgattgaacattaaagatcc--tttgacataattctttgaccatgcctttatttgttgatagatccatgca 114916  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  114917 gatgtacttttctgga 114932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 8010 - 8316
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8010 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatgata 8109  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8110 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8209  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8210 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8309  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  8310 ggcttgt 8316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 19543 - 19877
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||    
T  19543 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaataata 19642  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||||||||||| |    
T  19643 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatgt 19742  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaatgttcttgagattct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  19743 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtacttttctggacatatacccatgtcatatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 19842  T
Q  300 tggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  19843 tggcttgtttaaaaacaaccttctgatctcagctt 19877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 55987 - 56262
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55987 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatctgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatatta 56086  T
Q  101 a----catctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgt 196  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  56087 attaacatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacataatccttgt 56186  T
Q  197 atatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcat 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56187 atatgcctttattgcttaattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcat 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13722 - 13417
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13722 tcagaatggtccttttgtttctcttaggatgatttgtaagacttccatttgatgtaatcaaatcgtaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgaatgta 13623  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||  |    
T  13622 acatctaggatgatattccctttttgaatattcctagtactttaatgttcatagtcttaaatgaacatcgaatatcctttttgacattaaccttgtaatt 13523  T
Q  201 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || || ||| || ||||  |||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||     
T  13522 gtctttattgcttgattgatcgatgcaaatgtactttacctgaaatttattcaagtcatgtgtgtcttgcatgttcttgat-aatgttcttgagtttcta 13424  T
Q  301 ggcttgt 307  Q
    |||||||    
T  13423 ggcttgt 13417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 17454 - 17658
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgatttta 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17454 tcagaatgttccatctgtttcacttaggatgatttgtaagactaccatttaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaataaagagcagtgatttta 17553  T
Q  101 acatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17554 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcatttttgacataatccttgtatat 17653  T
Q  201 gcctt 205  Q
    |||||    
T  17654 gcctt 17658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 198868 - 199162
Alignment:
Q  9 ttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaa-tgaagagcagtgattttaacatcta 107  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||||  ||||||||    
T  198868 ttccatttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtatttgatgtaaacaa-tcctaatagtgaaaacataactgaagtgcagtgattgcaacatcta 198966  T
Q  108 ggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgccttta 207  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||    
T  198967 ggatgatattct-tattggaatattcatagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaaccttaaatatcctttttgacattaaccttgtaaatgcctcta 199065  T
Q  208 ttgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggctt 305  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  199066 ttgtttgattgattcatgcaaatgtactttcctggatacttattcatgtcacgtgtgacttgcatgatcttgat-aatgttcttgagattcttggctt 199162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 630 - 415
Alignment:
Q  121 ttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattga 219  Q
    |||| |||||||  |||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  630 tttttgaatatttttagttctttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttatatatgcctttattgcttgattga 532  T
Q  220 tccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaaga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  531 tccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgttacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattcttggcttgtataagaacaacc 432  T
Q  320 ttctgatctctgcttct 336  Q
    |||||||||||||||||    
T  431 ttctgatctctgcttct 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 330
Target Start/End: Original strand, 29010 - 29254
Alignment:
Q  83 tgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatccttttt 182  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29010 tgaagtgcagtgattgcaacatctaggatgatattctcatt-ggaatattgctagtatttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatccttttt 29108  T
Q  183 gacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatc 282  Q
    ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||  |||||||| ||| ||||||||  ||||||     
T  29109 gacattaaccttgtaaatgcatttattgcttgattga-ccatgcaaatgtacttttatggaaatttatttatgtcacaagtgacttgcatgttcttgat- 29206  T
Q  283 aatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctgatctct 330  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  29207 aatgttattgagattctttgcttgtttaagaacaaccttctgatctct 29254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 65583 - 65255
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacat 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | | || || ||||||    
T  65583 aatgttccttttgtttcacttaggatgatatgtaagatttccatttcatgtaatcaaatattaatagtgaaacatcaaagaagtggaatgtttgtaacat 65484  T
Q  105 ctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttc-aatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcc 203  Q
    ||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||| |  |||||| |||      
T  65483 ctaggatgatatt-cttgttcgaatattcctagtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacactgaagatcttttttgacattaatcttgtaaatgta 65385  T
Q  204 tttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggc 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||| || ||  ||||| || |||||||  ||||  |||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  65384 tttattgcttgattgttccatgtcaatgtactttattggacatttactcatgttacgtgtgcctctcatgttcttgat-aatgttcatgagcttctgggc 65286  T
Q  304 ttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||| ||| |||||  |||||| ||||||||    
T  65285 ttgtataagaacaaccttctgaactctgctt 65255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 1146 - 1327
Alignment:
Q  152 tagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggatatatatc 251  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| | || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||     
T  1146 tagtcttgaatgaaaattgaatatccttttttatattaatcttgtaaatgcctttattgcttgattgatccattccaatgtactttgctggacatttatt 1245  T
Q  252 catgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttggcttgtgtaataacaagattctgatctctgctt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||  |||||| ||||||||    
T  1246 catgtcacatgtaccttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattatgggcttctataagaacaaccttctgaactctgctt 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15282 - 15046
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtt-tcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaa-tgaagagcagtgattt 98  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||  |||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||| | ||||| |     
T  15282 tcagaatgttccatttgttcttacttagaatgatttgtaagacttgtttttgatgtaatcaa-tcctaatagtaaaaacataactgaagtgtagtgaatg 15184  T
Q  99 taacatctaggatgatattcccttttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgta 197  Q
    |||||| || ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||| |  ||||||    
T  15183 taacatatatgataatattctcttt-ggaatattcctagtacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaagatc-tttttgacattagtcttgta 15086  T
Q  198 tatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtacttt 237  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15085 aatgtctttatttcttgattgatccatgcagatgtacttt 15046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Original strand, 241857 - 241969
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacat 104  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| | ||||  | ||||||    
T  241857 aatgttccttt-gtttcacttaggatgatttgtaagacttctatttgatgtaatcagatcctaatagtaatacatcaatgaagtgtagtgtgtataacat 241955  T
Q  105 ctaggatgatattc 118  Q
    ||||||||||||||    
T  241956 ctaggatgatattc 241969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 969 - 1046
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  969 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 1046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 5640 - 5563
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5640 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 5563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19797 - 19720
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19797 tcagaatgtttcttttgtttcacttaggatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 19720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11072 - 10920
Alignment:
Q  122 tttggaatattcatagtacttcaa-tgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgattgat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11072 tttggaatattcctagtacttcaagtcttcatagtcttgaatgaactttgaaga-cttttttgacattattcttgtaaatgcctttattgcttgattgat 10974  T
Q  221 ccatgcaaatgtactttcctggata-tatatccatgtcacatgtgccttgcatg 273  Q
     || | | ||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||| | |||||||    
T  10973 tcaagtagatgtactttactggacattttattcatgtcacatgtacgttgcatg 10920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 111989 - 112201
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | | |  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  111989 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 112086  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  112087 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgca 112185  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||||||||| |||||    
T  112186 gatgtacttttctgga 112201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 3700 - 3778
Alignment:
Q  1 tcagaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaa 79  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3700 tcagaatgttccttttgtttcacttagtatgatttgtaagactcttattaaatgtaatcaaatcgtaatagtgaaacaa 3778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18608 - 18402
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||| |  | |||||||||| ||||||  | ||||||    
T  18608 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagccaacactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggataatattct-tattggaa 18511  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||  |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  18510 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacatcaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatgca 18412  T
Q  228 aatgtacttt 237  Q
     ||| |||||    
T  18411 gatgaacttt 18402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 87
Target Start/End: Original strand, 40765 - 40847
Alignment:
Q  5 aatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaag 87  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| | ||| ||||| | ||||||||    
T  40765 aatgttccttttgtttcacttaggatgatttgtgagactcccatttgatgtaaggaaatcttcataatgaaatatcaatgaag 40847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23130 - 23010
Alignment:
Q  123 ttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatc 221  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||    
T  23130 ttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatc 23032  T
Q  222 catgcaaatgtactttcctgga 243  Q
     ||||| ||||||||| |||||    
T  23031 tatgcagatgtacttttctgga 23010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 1064 - 1276
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | | |  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  1064 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 1161  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatgca 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  1162 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatctatgca 1260  T
Q  228 aatgtactttcctgga 243  Q
     ||| ||||| |||||    
T  1261 gatgaacttttctgga 1276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 232
Target Start/End: Original strand, 4429 - 4538
Alignment:
Q  123 ttggaatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgattgatc 221  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||| ||||    
T  4429 ttggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatc 4527  T
Q  222 catgcaaatgt 232  Q
    |||||| ||||    
T  4528 catgcagatgt 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1166
Alignment:
Q  4 gaatgttccttttgtttcagttatgatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 78  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  1092 gaatgttccttttggttcacttaggatgatttgtaagactcttatttgatgtaattgagtcttaatagtgaaaca 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 243
Target Start/End: Original strand, 24108 - 24224
Alignment:
Q  127 aatattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgattgatccatg 225  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  24108 aatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatg 24206  T
Q  226 caaatgtactttcctgga 243  Q
    || |||| |||| |||||    
T  24207 cagatgtgcttttctgga 24224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 59882 - 59766
Alignment:
Q  28 gatgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaa-acaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttgg 126  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| || |||  | ||||| ||||| ||| |||  |||||||  |||||| | |||||    
T  59882 gatgatttgtaagacttacttttgatgtaatc-aatcctaatagtaaagacacaactgaagtgcagtaattgtaatctctaggacaatattctc-tttgg 59785  T
Q  127 aatattcatagtacttcaa 145  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  59784 aatattcttagtacttcaa 59766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Original strand, 13648 - 13786
Alignment:
Q  30 tgatttgtaagact-accatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 128  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| | | |  | ||||| ||||||| |  | |||||||||  |||||| |||| ||||    
T  13648 tgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaa-cctaatagtaagatacaactgaagtgcagtgaatgcatcatctaggacaatattctcttt-ggaa 13745  T
Q  129 tattcatagtacttcaatgttcctagtcttaaatgaacatt 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||    
T  13746 tattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacatt 13786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University