View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12611_high_8 (Length: 498)

Name: NF12611_high_8
Description: NF12611
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12611_high_8
NF12611_high_8
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (16-479)||(17310476-17310939)
chr4 (16-479)||(17307481-17307944)
chr4 (19-482)||(14732206-14732669)
chr4 (40-482)||(19764347-19764789)
chr4 (19-394)||(10791147-10791522)
chr4 (160-196)||(12509614-12509650)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (16-482)||(25723477-25723943)
chr7 (18-482)||(16234431-16234895)
chr7 (19-482)||(16130076-16130539)
chr7 (19-482)||(29086482-29086945)
chr7 (19-480)||(15190054-15190515)
chr7 (18-480)||(2553504-2553966)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (16-482)||(19841128-19841594)
chr8 (18-480)||(14209016-14209478)
[»] chr3 (7 HSPs)
chr3 (16-482)||(15701398-15701864)
chr3 (18-474)||(6568274-6568730)
chr3 (19-482)||(7091893-7092356)
chr3 (18-482)||(24211436-24211900)
chr3 (18-480)||(22956371-22956833)
chr3 (18-480)||(11928224-11928686)
chr3 (19-480)||(16428341-16428802)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (18-482)||(42190-42654)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (16-354)||(22476974-22477312)
chr1 (350-482)||(22486322-22486454)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (18-482)||(23974528-23974992)
chr6 (19-480)||(18116441-18116902)
chr6 (19-480)||(18215435-18215896)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (18-482)||(3486927-3487391)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (19-480)||(42390508-42390969)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (160-196)||(10827-10863)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 17310476 - 17310939
Alignment:
Q  16 agacaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17310476 agacaacagtttgatcccatacaaatgacttatggagcattacttccttctttgctcgcacaaaacctggttcaaacaataccgcctcctcgcattccag 17310575  T
Q  116 accctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  17310576 accctctcccacgctggtacagtcctgaccttcattgtgtttatcatctaggggcaccaggtcatgatgtggaacgttgttttgccctcaagaaggaagt 17310675  T
Q  216 ccaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17310676 ccaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcatgtagtccagaacaatcctctgcctccccatgggcctgttgttaacatgatt 17310775  T
Q  316 caagactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagcc 415  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17310776 caagactgtcaggatgaggcttgcattctctacgcatgtcatatcaagacccctttggtaccaatacatgtgaaaatgtgtgaagcggctctcttcagcc 17310875  T
Q  416 acgatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatga 479  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17310876 acgatcacgaggcttgtgatatatgttcggtggatccccgtggttgcatgcaagtccagaatga 17310939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17307944 - 17307481
Alignment:
Q  16 agacaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccag 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  || || |||||||||| |||    
T  17307944 agacaacaatttgatctcataccaatgacttatgcagcattacttccttctttgctcgcacaaaacctggttcaaacaatactgcatcctcgcatttcag 17307845  T
Q  116 accctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagt 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17307844 accatctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacgttgttttgccctcaagaaagaagt 17307745  T
Q  216 ccaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17307744 ctaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcctgtactctagaacaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatt 17307645  T
Q  316 caagactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagcc 415  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17307644 caagactgtcaggaagaggcttgcattctccacacatgtgatatcaagacccctttagtaccaatacatgcgaaaatgtgtgaagcggctctcttcagcc 17307545  T
Q  416 acgatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatga 479  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17307544 acgatcacgaggcttgtgatatatgttcggtggatccccgtggttgcatgcaagtccagaatga 17307481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14732669 - 14732206
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || || || ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  14732669 caacaatttgatcccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctagtccaaacaataccacctcctcgcattccagacc 14732570  T
Q  119 ctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcca 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||    
T  14732569 ctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttca 14732470  T
Q  219 aaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaa 318  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14732469 gaaactgataaatagcaaagagttaaccttcaccgaccctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattcaa 14732370  T
Q  319 gactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacg 418  Q
    |||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||     
T  14732369 gacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccaca 14732270  T
Q  419 atcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    |||| || ||||||||  |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  14732269 atcatgaagcttgtgacatatgttcgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgatgt 14732206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 482
Target Start/End: Original strand, 19764347 - 19764789
Alignment:
Q  40 atgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagaccctctcccacgctggtaccgtc 139  Q
    ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || || || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19764347 atgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctagtccaaacaataccacctcctcgcattccagaccctctcccacgctggtaccgtc 19764446  T
Q  140 ctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtccaaaaactgatcaatagcaaaga 239  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  19764447 cggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttcagaaactgataaatagtaaaga 19764546  T
Q  240 gttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaagactgtcaggaagaggtttgc 339  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| |  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| | ||    
T  19764547 gttaaccttcaccgaccctgatgctgtggctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattcaagacgatcaggaagaggctcgc 19764646  T
Q  340 attccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacgatcacgaggcttgtgatgtat 439  Q
    |||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||   ||||||||| |||| |||| || ||||||||  |||    
T  19764647 attctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtagagcaactctcttcaaccacaatcatgaagcttgtgacatat 19764746  T
Q  440 gttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  19764747 gttcgatggatcctcgtggatgtgtacaagtccagaatgatgt 19764789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 394
Target Start/End: Original strand, 10791147 - 10791522
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  10791147 caacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccggacc 10791246  T
Q  119 ctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcca 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||    
T  10791247 ctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttca 10791346  T
Q  219 aaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaa 318  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10791347 gaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgatcctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattcaa 10791446  T
Q  319 gactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgt 394  Q
    |||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10791447 gacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgt 10791522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12509650 - 12509614
Alignment:
Q  160 catcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgtt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12509650 catcaaggggcaccaggtcatgatgctgaacattgtt 12509614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25723943 - 25723477
Alignment:
Q  16 agacaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  25723943 agacaacagtttgatcccataccaatgacttatggagcattacttccttctttgctcgcacaaaacctggttcaaacaataccgcctcctcgaattccag 25723844  T
Q  116 accctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25723843 accctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcactaggtcatgatgtggaacgttgttatgccctcaagaaagaagt 25723744  T
Q  216 ccaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25723743 ccaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcgccgaccccgatcctgttgcctagaacaatcctctgcctctccatgggcctgctgttaacatgatt 25723644  T
Q  316 caagactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagcc 415  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  25723643 caagactgtcaggaagatgcttgcattctctacgcacgtgatatcaagacccctttggtaccaatacatgtgaagatgtgtgaagcaactctcttcagcc 25723544  T
Q  416 acgatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25723543 acaatcacgaggcttgttatatatgttcagtggatccccgtggttgcatgcaagtccataatgatgt 25723477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 18 - 482
Target Start/End: Original strand, 16234431 - 16234895
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||  || || || |||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||     
T  16234431 acaacaatttgatctcataccaatgacttatggagcattactgccttccttgctcgcgcaaaacctggttcacacactaccaccccctcgcattccagat 16234530  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16234531 cctctcccacgctggtaccgtcctgaacttcattgtgtttatcatcaaggggcagcaggtcacgatgtggaacgttgttatgccctcaagaaagaggtcc 16234630  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||    
T  16234631 aaaaactgctcaatagcaaagagttaactttcgccgaccctgatcatgttgcccaaaacaatcctctgcctccccgtgggcctgttgttaatatgattca 16234730  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  16234731 agactgtcaggaagatgcctgcattctctacgcatgtgacatcaagacccctttggtaccgatacatgtgaaaatgtgtgaagtagctctcttcagtcac 16234830  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234831 gatcacgaggcttgtgatgtgtgttcggtagatcctcgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 16234895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16130539 - 16130076
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  16130539 caacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccagacc 16130440  T
Q  119 ctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcca 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||    
T  16130439 ctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttca 16130340  T
Q  219 aaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaa 318  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16130339 gaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgaccctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattcaa 16130240  T
Q  319 gactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacg 418  Q
    |||  |||||||| || | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||   ||||||||| ||||     
T  16130239 gacgatcaggaaggggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtagagcaactctcttcaaccaca 16130140  T
Q  419 atcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    |||| || ||||||||  |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  16130139 atcatgaagcttgtgacatatgttcgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgatgt 16130076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Original strand, 29086482 - 29086945
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  29086482 caacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccagacc 29086581  T
Q  119 ctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcca 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||    
T  29086582 ctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttca 29086681  T
Q  219 aaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaa 318  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29086682 gaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgaccctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattcaa 29086781  T
Q  319 gactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacg 418  Q
    |||  | ||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||     
T  29086782 gacgattaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccaca 29086881  T
Q  419 atcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    |||| || ||||||||  |||||||| ||||| | ||||  || || |||||||| ||||||||    
T  29086882 atcatgaagcttgtgacatatgttcgatggatcctcgtgaatgtatacaagtccagaatgatgt 29086945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 480
Target Start/End: Original strand, 15190054 - 15190515
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  15190054 caacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccagacc 15190153  T
Q  119 ctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcca 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||    
T  15190154 ctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttca 15190253  T
Q  219 aaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaa 318  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| |||    
T  15190254 gaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgatcctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgttgttaatatgattcaa 15190353  T
Q  319 gactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacg 418  Q
    |||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||     
T  15190354 gacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccaca 15190453  T
Q  419 atcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgat 480  Q
    |||| || ||||||||  |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||    
T  15190454 atcatgaagcttgtgacatatgttcgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgat 15190515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 480
Target Start/End: Original strand, 2553504 - 2553966
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    |||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||  |||||||||||||| |||    
T  2553504 acaacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaatactacctcctcgcattccggac 2553603  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |    
T  2553604 cctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttc 2553703  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2553704 agaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgatcctgatgctgtagcccagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattca 2553803  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||||  ||||||||||  | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||    
T  2553804 agacgatcaggaagagactcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccac 2553903  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgat 480  Q
     |||| || ||||||||  |||||| | ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||    
T  2553904 aatcatgaagcttgtgacatatgtttgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgat 2553966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 19841128 - 19841594
Alignment:
Q  16 agacaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  19841128 agacaacagtttgatcccataccaatgacttatggagcattacttccttctttgctcgcacaaaacatggttcaaacaataccgtctcctcgcattccag 19841227  T
Q  116 accctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| |||||    
T  19841228 accctctccgacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgacgtggaacgttgtttttccctcaagaaggaagt 19841327  T
Q  216 ccaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| | |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19841328 ccaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgattctgtagcccggaacagtcctctacttgcccgtgggcctgctgttaacatgatc 19841427  T
Q  316 caagactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagcc 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  19841428 caagactgtcaggaggaggtttgcattctctacgcatgtgatatcaagactcctttggtaccaatacatgtgaaaatgtgtgaagcggctttcttcagcc 19841527  T
Q  416 acgatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  19841528 acgatcacgaggcttgtgatatatgttctgtggacccccgtggttgcaagcaagtccagaattatgt 19841594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 480
Target Start/End: Original strand, 14209016 - 14209478
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    |||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||    
T  14209016 acaacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccggac 14209115  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |    
T  14209116 cctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttc 14209215  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14209216 agaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgatcctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattca 14209315  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||||  || |||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||   ||||||||| ||||    
T  14209316 agacgatcgggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaactgtgtaaagcaactctcttcaaccac 14209415  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgat 480  Q
     |||| |  ||||||||  |||||| | ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||    
T  14209416 aatcatggagcttgtgacatatgtttgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgat 14209478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 15701398 - 15701864
Alignment:
Q  16 agacaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15701398 agacaacagtttgatcccataccaatgacctatgaagcattacttccttctttgctcgcacaaaaccgggttcaaacaataccgcctcctcgcattccag 15701497  T
Q  116 accctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  15701498 accctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtctatcatcaaggggcaccaggtcatgatgttgaacgttgttatgcccttaagaaagaggt 15701597  T
Q  216 ccaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatc 315  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15701598 ccaaaaattgctcaatagtaaagagttaactttcgccgaccctgatcatgttgcccaggacaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaatatgatt 15701697  T
Q  316 caagactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagcc 415  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15701698 caagactgtcagggagatgcttgcattctctacgcatgtgatatcaagacccctttggtaccgatacatgtaaaaatgtgtgaagtggctctcttcagtc 15701797  T
Q  416 acgatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    ||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15701798 acgatcatgaagcttgtcatatatgttcggtggatccccgtggttgcatgcaagtccagaatgatgt 15701864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 474
Target Start/End: Original strand, 6568274 - 6568730
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  || || || |||||||  ||||| |||  ||| |||||||||||||||||     
T  6568274 acaacaatttgaccccataccaatgacttatggagcattattgccttccttgctcgcgcaaaaccgagttcacacattaccacctcctcgcattccagat 6568373  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  6568374 cctctcccacgctggtaccgccctgaacttcattgtgtttttcatcaaggggcagcgggtcacgatgtggaacgctgttatgccctcaagaaagaggtcc 6568473  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    ||||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6568474 aaaaattgctcgatagcaaagagttgactttcgccgaccctgatcatgttgcccagaacaatcctctgccgcctcatgggcctgctgttaatatgattca 6568573  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
     |||||||| ||||| | |||||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||    
T  6568574 ggactgtcaagaagatgcttgcattatctacgcacgcgacatcaagacccctttggtaccgatacatgtgaaaatgtgcgagatggctctcttcagtcac 6568673  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaa 474  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  6568674 gatcatgaagcttgtcatgtatgttcggtgaatcctcgtgggtgcatgcaagtccaa 6568730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 7092356 - 7091893
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || || || ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  7092356 caacaatttgatcccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctagtccaaacaataccacctcctcgcattccagacc 7092257  T
Q  119 ctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcca 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||    
T  7092256 ctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttca 7092157  T
Q  219 aaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaa 318  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7092156 gaaactgataaatagcaaagagttaaccttcaccgaccctgatactgtagatcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattcaa 7092057  T
Q  319 gactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacg 418  Q
    |||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||     
T  7092056 gacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtactgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccaca 7091957  T
Q  419 atcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    |||| || ||||||||  |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  7091956 atcatgaagcttgtgacatatgttcgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgatgt 7091893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24211900 - 24211436
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    |||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||    
T  24211900 acaacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccggac 24211801  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |    
T  24211800 cctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttc 24211701  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24211700 agaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgaccctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattca 24211601  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||    
T  24211600 agacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccac 24211501  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
     |||| || ||||||||  |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  24211500 aatcatgaagcttgtgacatatgttcgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgatgt 24211436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 480
Target Start/End: Original strand, 22956371 - 22956833
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    |||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| |||||   ||| |||||||||||||| |||    
T  22956371 acaacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaactataccacctcctcgcattccggac 22956470  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |    
T  22956471 cctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttc 22956570  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    | ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22956571 agaaattgataaatagtaaagagttaaccttcaccgaccctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattca 22956670  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||    
T  22956671 agacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccac 22956770  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgat 480  Q
     |||| || ||||||||  |||||| | ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||    
T  22956771 aatcatgaagcttgtgacatatgtttgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgat 22956833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 11928686 - 11928224
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    |||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||    
T  11928686 acaacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccggac 11928587  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |    
T  11928586 cctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttc 11928487  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11928486 agaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgatcctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattca 11928387  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||||  || |||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||   ||||||||| ||||    
T  11928386 agacgatcgggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaactgtgtaaagcaactctcttcaaccac 11928287  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgat 480  Q
     |||| |  ||||||||  |||||| | ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||    
T  11928286 aatcatggagcttgtgacatatgtttgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgat 11928224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 480
Target Start/End: Original strand, 16428341 - 16428802
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||| | || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  16428341 caacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgca-agaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccggacc 16428439  T
Q  119 ctctcccacgctggta-ccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |    
T  16428440 ctctcccacgctggtatccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttc 16428539  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16428540 agaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgatcctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattca 16428639  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||    
T  16428640 agacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccac 16428739  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgat 480  Q
     |||| || ||||||||  |||||| | ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||    
T  16428740 aatcatgaagcttgtgacatatgtttgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgat 16428802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 482
Target Start/End: Original strand, 42190 - 42654
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||| |||  ||| || |||| |||||||||     
T  42190 acaacagtttgatcccataccaatgacttatggagcattacttccttccttgctcgcgcaaaacctggttcacacactaccaccccctcacattccagat 42289  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42290 cctctcccacgctggtaccgtcctgaacttcattgtgtttatcatcaaggggcagcaagtcacgatgcggaacgttgttatgccctcaagaaagaggtcc 42389  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42390 aaaaactgctcaatagcaaagagttaaccttcgccgaccctgatcatgttgcccagaacaatcccctacctccccatgggcctgctgttaatatgattca 42489  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  42490 agactatcaggaagatgcttgcattctctacgcatgtgacatcaagacccctttggtaccgatacatgtgaaaatgtgtgaagtggctctcttcagtcac 42589  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42590 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggatccccgtggttgcatgcaagtctagaatgatgt 42654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Original strand, 22476974 - 22477312
Alignment:
Q  16 agacaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22476974 agacaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattactaccttcgttacttgcacaaaacctggtttaaacagcaccgcctcctttcattccag 22477073  T
Q  116 accctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagt 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22477074 accctctcccatgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacgttgttatgccctcaagaaagaggt 22477173  T
Q  216 ccaaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477174 ccaaaaactgatcaatagtaaagagttaatctttaccgaccctgatcctgtagtccagaacaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatc 22477273  T
Q  316 caagactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477274 caagactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgt 22477312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 350 - 482
Target Start/End: Original strand, 22486322 - 22486454
Alignment:
Q  350 catgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacgatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtgga 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22486322 catgtgatatcaagacccctttggtaccgatacatgtgaaaatgtgtgaagtggctctcttcagtcacgatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtgga 22486421  T
Q  450 ttcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22486422 tccccgtggttgtatgcaagtccagaatgatgt 22486454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 18 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23974992 - 23974528
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  || || |  |||||||||||||| |||  ||  || ||||||||||||||     
T  23974992 acaacaatttgatcccataccaatgacttatggagcattactgccttccttgctcgtgcaaaacctggttcacacactacaaccccctcgcattccagat 23974893  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23974892 cctctcccacgctggtaccgtcctgaacttcattgtgtttatcatcaaggggcagcaggtcacgatgtggaacgttgttatgccctcaagaaagaggtcc 23974793  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  23974792 aaaaactgctcaatagcaaagagttaactttcgccgaccctgatcatgttgcacagaacaatcctctgcctccccatgggcctgttgttaatatgattca 23974693  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  23974692 agattgtcatgaagatgcttgcattctctacgcatgtgacatcaagactcctttggtaccgatacatgtgaaaatgtgtgaagtagctctcttcagtcat 23974593  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23974592 gatcacgaggcttgtgaggtgtgttcggtggatcctcgtggttgcatgcaagtacaaaatgatgt 23974528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 480
Target Start/End: Original strand, 18116441 - 18116902
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||| | || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  18116441 caacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcatagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccggacc 18116540  T
Q  119 ctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcca 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||    
T  18116541 ctctcccacgctggtatcgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttca 18116640  T
Q  219 aaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaa 318  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18116641 gaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgatcctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctacccatgggcctgctgttaatatgattcaa 18116740  T
Q  319 gactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacg 418  Q
    |||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||     
T  18116741 gacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccaca 18116840  T
Q  419 atcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgat 480  Q
    |||| || ||||||||  |||||| | ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||    
T  18116841 atcatgaagcttgtgacatatgtttgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgat 18116902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18215896 - 18215435
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||     
T  18215896 caacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccggact 18215797  T
Q  119 ctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcca 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||    
T  18215796 ctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttca 18215697  T
Q  219 aaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaa 318  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18215696 gaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgatcctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattcaa 18215597  T
Q  319 gactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacg 418  Q
    |||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||     
T  18215596 gacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccaca 18215497  T
Q  419 atcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgat 480  Q
    |||| || ||||||||  |||||| | ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||    
T  18215496 atcatgaagcttgtgacatatgtttgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgat 18215435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3487391 - 3486927
Alignment:
Q  18 acaacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagac 117  Q
    |||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||    
T  3487391 acaacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccggac 3487292  T
Q  118 cctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |    
T  3487291 cctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttc 3487192  T
Q  218 aaaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatcca 317  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3487191 agaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgaccctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattca 3487092  T
Q  318 agactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccac 417  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||    
T  3487091 agacgatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccac 3486992  T
Q  418 gatcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgatgt 482  Q
     |||| || ||||||||  |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  3486991 aatcatgaagcttgtgacatatgttcgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgatgt 3486927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 480
Target Start/End: Original strand, 42390508 - 42390969
Alignment:
Q  19 caacagtttgatcccatacctatgacttacggagcattacttccttttttacttgcacaaaacctggttcaaacagcaccgcctcctcgcattccagacc 118  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  42390508 caacaatttgaccccttgccaatgacctatggagcattgctcccttctttacttgcacagaatctggtccaaacaataccacctcctcgcattccagacc 42390607  T
Q  119 ctctcccacgctggtaccgtcctgaccttcattgtgtttatcatcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgttatgccctcaagaaagaagtcca 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||    
T  42390608 ctctcccacgctggtaccgtccggaccttcattgtatttaccatcaaggggcaccaggccacgatgtggagcgttgttttgctcttaagaaagaggttca 42390707  T
Q  219 aaaactgatcaatagcaaagagttaactttcaccgaccctgatcttgtagtccagaagaatcctctgcctccccatgggcctgctgttaacatgatccaa 318  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  42390708 gaaactgataaatagtaaagagttaaccttcaccgaccctgatgctgtagctcagaacaatcctctgcctactcatgggcctgctgttaatatgattcaa 42390807  T
Q  319 gactgtcaggaagaggtttgcattccctacgcatgtgatatcaagacccctttggtatcgatacatgtgaaaatgtatgaagtggctctcttcagccacg 418  Q
    ||   ||||||||||| | |||||| ||  | | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||| ||||     
T  42390808 gaagatcaggaagaggctcgcattctctctgtaggtgatatcaagactcctctggtaccgatacatgtgaaaatgtgtaaagcaactctcttcaaccaca 42390907  T
Q  419 atcacgaggcttgtgatgtatgttcggtggattcccgtggttgcatgcaagtccaaaatgat 480  Q
    |||| || ||||||||  |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||    
T  42390908 atcatgaagcttgtgacatatgttcgatggatcctcgtggatgtatacaagtccagaatgat 42390969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 196
Target Start/End: Original strand, 10827 - 10863
Alignment:
Q  160 catcaaggggcaccaggtcatgatgtggaacattgtt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10827 catcaaggggcaccaggtcatgatgctgaacattgtt 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University