View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12611_low_42 (Length: 278)

Name: NF12611_low_42
Description: NF12611
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12611_low_42
NF12611_low_42
[»] chr5 (80 HSPs)
chr5 (42-232)||(6500443-6500632)
chr5 (50-232)||(40296292-40296473)
chr5 (40-230)||(6500813-6501002)
chr5 (42-232)||(27502013-27502202)
chr5 (42-204)||(18603124-18603286)
chr5 (42-208)||(32487386-32487551)
chr5 (43-208)||(41170627-41170792)
chr5 (47-207)||(36492218-36492378)
chr5 (53-232)||(25327938-25328117)
chr5 (50-208)||(15370099-15370257)
chr5 (40-204)||(624186-624350)
chr5 (50-221)||(3295002-3295172)
chr5 (53-208)||(3295345-3295498)
chr5 (50-219)||(13415750-13415918)
chr5 (52-232)||(42405574-42405752)
chr5 (50-230)||(41632782-41632961)
chr5 (41-208)||(9498655-9498821)
chr5 (50-232)||(26074122-26074304)
chr5 (52-230)||(26074614-26074792)
chr5 (52-232)||(1028493-1028673)
chr5 (52-220)||(6224198-6224366)
chr5 (57-208)||(11416977-11417128)
chr5 (50-232)||(36568545-36568725)
chr5 (51-208)||(299490-299647)
chr5 (60-204)||(34753029-34753173)
chr5 (50-208)||(12662652-12662810)
chr5 (52-201)||(26075168-26075318)
chr5 (50-209)||(35150007-35150165)
chr5 (42-208)||(623810-623976)
chr5 (76-221)||(15370428-15370573)
chr5 (62-204)||(33747783-33747925)
chr5 (47-185)||(29549278-29549416)
chr5 (42-188)||(5723811-5723957)
chr5 (52-220)||(24489194-24489360)
chr5 (52-182)||(26074807-26074938)
chr5 (55-200)||(38427553-38427697)
chr5 (50-200)||(26590918-26591068)
chr5 (52-206)||(300961-301107)
chr5 (52-208)||(35167838-35167994)
chr5 (53-219)||(2411010-2411176)
chr5 (53-208)||(35914852-35915007)
chr5 (42-125)||(7768842-7768925)
chr5 (51-182)||(36521922-36522053)
chr5 (136-218)||(26900007-26900089)
chr5 (52-145)||(42508614-42508707)
chr5 (53-168)||(36522277-36522392)
chr5 (52-130)||(26074320-26074398)
chr5 (50-168)||(31509623-31509742)
chr5 (53-187)||(41635212-41635346)
chr5 (52-207)||(13786002-13786157)
chr5 (64-175)||(31509745-31509857)
chr5 (117-168)||(13042606-13042657)
chr5 (137-208)||(38427306-38427377)
chr5 (52-131)||(39309686-39309764)
chr5 (108-209)||(13785631-13785732)
chr5 (134-186)||(795254-795306)
chr5 (121-188)||(9498343-9498410)
chr5 (107-186)||(36527117-36527196)
chr5 (52-145)||(42524719-42524811)
chr5 (108-168)||(32445943-32446003)
chr5 (117-164)||(13112604-13112651)
chr5 (53-110)||(6225047-6225104)
chr5 (42-90)||(5660290-5660338)
chr5 (87-175)||(19275566-19275653)
chr5 (130-168)||(13042784-13042822)
chr5 (130-168)||(13112782-13112820)
chr5 (50-92)||(35150747-35150789)
chr5 (50-92)||(35151038-35151080)
chr5 (108-206)||(42435486-42435583)
chr5 (152-204)||(24489583-24489635)
chr5 (117-168)||(36389016-36389067)
chr5 (132-162)||(5963765-5963795)
chr5 (104-182)||(9510546-9510624)
chr5 (42-99)||(22298956-22299014)
chr5 (148-184)||(795152-795189)
chr5 (140-204)||(5660340-5660405)
chr5 (121-162)||(34103625-34103666)
chr5 (155-208)||(35150810-35150863)
chr5 (53-85)||(13785732-13785764)
chr5 (118-162)||(41341523-41341567)
[»] chr1 (79 HSPs)
chr1 (40-232)||(44290800-44290993)
chr1 (40-208)||(44290458-44290626)
chr1 (42-208)||(41759475-41759641)
chr1 (42-219)||(3537589-3537765)
chr1 (50-208)||(41142372-41142531)
chr1 (40-230)||(48588465-48588656)
chr1 (50-219)||(41157375-41157545)
chr1 (52-208)||(26661522-26661678)
chr1 (50-232)||(41156991-41157175)
chr1 (42-204)||(3550712-3550871)
chr1 (52-205)||(17294579-17294733)
chr1 (50-232)||(31767138-31767319)
chr1 (52-199)||(37556113-37556260)
chr1 (41-232)||(45493951-45494146)
chr1 (50-208)||(29798199-29798357)
chr1 (50-232)||(34364507-34364688)
chr1 (52-208)||(34649440-34649596)
chr1 (50-209)||(34364925-34365084)
chr1 (50-208)||(5319965-5320123)
chr1 (58-208)||(14318875-14319025)
chr1 (42-208)||(50052024-50052189)
chr1 (51-200)||(40082408-40082556)
chr1 (50-234)||(45084382-45084559)
chr1 (54-220)||(9955911-9956079)
chr1 (52-208)||(11977282-11977438)
chr1 (42-232)||(32168674-32168853)
chr1 (44-176)||(32594748-32594880)
chr1 (50-219)||(22077484-22077653)
chr1 (50-206)||(3875333-3875489)
chr1 (50-221)||(37850588-37850758)
chr1 (47-193)||(38804370-38804516)
chr1 (52-185)||(26661921-26662054)
chr1 (53-199)||(37555733-37555878)
chr1 (50-201)||(24600321-24600472)
chr1 (50-204)||(66476-66630)
chr1 (50-208)||(39066201-39066358)
chr1 (56-234)||(5575110-5575286)
chr1 (40-129)||(3537226-3537315)
chr1 (50-233)||(24131964-24132143)
chr1 (50-232)||(41184383-41184583)
chr1 (41-170)||(44043810-44043944)
chr1 (75-217)||(22077101-22077243)
chr1 (51-202)||(22793279-22793431)
chr1 (50-197)||(66100-66247)
chr1 (50-219)||(22077818-22077986)
chr1 (60-200)||(5528762-5528902)
chr1 (50-230)||(19283434-19283613)
chr1 (50-198)||(30630648-30630796)
chr1 (52-198)||(45839629-45839779)
chr1 (121-208)||(11977015-11977102)
chr1 (50-232)||(21378036-21378199)
chr1 (50-198)||(44685456-44685605)
chr1 (50-221)||(1188574-1188746)
chr1 (120-208)||(50051689-50051776)
chr1 (50-221)||(1187349-1187522)
chr1 (121-232)||(47380143-47380254)
chr1 (65-207)||(44091909-44092051)
chr1 (92-168)||(10351202-10351278)
chr1 (77-197)||(4956218-4956340)
chr1 (42-82)||(50051777-50051817)
chr1 (50-97)||(35154150-35154197)
chr1 (50-109)||(50469180-50469239)
chr1 (50-116)||(4878803-4878869)
chr1 (99-144)||(41184152-41184197)
chr1 (149-208)||(4266798-4266855)
chr1 (50-210)||(5996870-5997029)
chr1 (105-165)||(35154046-35154106)
chr1 (143-237)||(30697310-30697403)
chr1 (42-115)||(4266875-4266948)
chr1 (91-207)||(9499020-9499136)
chr1 (132-168)||(12466365-12466401)
chr1 (50-82)||(22077248-22077280)
chr1 (59-118)||(30630912-30630972)
chr1 (190-234)||(45084576-45084619)
chr1 (50-102)||(47379891-47379943)
chr1 (123-169)||(9956212-9956258)
chr1 (132-168)||(31973375-31973411)
chr1 (190-234)||(45084636-45084679)
chr1 (50-186)||(50556451-50556587)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (40-208)||(29518910-29519078)
chr6 (42-208)||(29518495-29518661)
chr6 (42-208)||(32741171-32741337)
chr6 (40-208)||(2378116-2378284)
chr6 (42-232)||(35210196-35210384)
chr6 (42-198)||(3409251-3409407)
chr6 (40-208)||(3409650-3409818)
chr6 (42-232)||(3058218-3058409)
chr6 (41-219)||(3415449-3415629)
chr6 (42-208)||(14748342-14748504)
chr6 (52-208)||(2377756-2377912)
chr6 (50-221)||(2579860-2580030)
chr6 (43-208)||(1846741-1846906)
chr6 (52-208)||(2578443-2578598)
chr6 (50-219)||(10074352-10074521)
chr6 (56-221)||(16454913-16455078)
chr6 (42-198)||(26544041-26544197)
chr6 (42-220)||(1127352-1127530)
chr6 (50-210)||(10073989-10074149)
chr6 (52-208)||(16454577-16454733)
chr6 (52-199)||(16107680-16107827)
chr6 (56-208)||(2843560-2843713)
chr6 (51-221)||(2578822-2578991)
chr6 (52-230)||(5832007-5832182)
chr6 (55-222)||(2579478-2579645)
chr6 (50-220)||(10073604-10073772)
chr6 (53-205)||(6999799-6999951)
chr6 (50-221)||(593694-593867)
chr6 (52-232)||(2579087-2579261)
chr6 (53-193)||(1950200-1950340)
chr6 (55-158)||(32460630-32460733)
chr6 (50-204)||(10911565-10911720)
chr6 (52-207)||(16108065-16108208)
chr6 (56-175)||(9062383-9062501)
chr6 (50-221)||(12071678-12071849)
chr6 (50-221)||(12085021-12085191)
chr6 (50-220)||(12092470-12092640)
chr6 (45-202)||(5958613-5958766)
chr6 (50-182)||(6071132-6071264)
chr6 (50-231)||(31714671-31714849)
chr6 (50-169)||(8481927-8482045)
chr6 (54-219)||(17135058-17135223)
chr6 (65-166)||(2975567-2975668)
chr6 (70-123)||(35210498-35210551)
chr6 (57-220)||(30618606-30618766)
chr6 (118-162)||(22605301-22605345)
chr6 (154-201)||(3409405-3409452)
chr6 (118-169)||(11637760-11637811)
chr6 (87-133)||(14789279-14789325)
chr6 (118-162)||(21130103-21130147)
chr6 (142-200)||(10902438-10902496)
chr6 (126-168)||(11638053-11638095)
chr6 (175-232)||(2975296-2975352)
chr6 (184-232)||(35210554-35210601)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (41-208)||(36178605-36178772)
chr2 (42-232)||(41283451-41283641)
chr2 (40-206)||(37106178-37106344)
chr2 (42-208)||(14745667-14745833)
chr2 (40-208)||(5542625-5542793)
chr2 (46-208)||(37105920-37106082)
chr2 (40-204)||(5543002-5543166)
chr2 (52-208)||(6421387-6421543)
chr2 (50-205)||(962598-962753)
chr2 (52-202)||(15880265-15880415)
chr2 (50-208)||(42514649-42514807)
chr2 (57-208)||(15511495-15511646)
chr2 (50-208)||(35580724-35580881)
chr2 (68-208)||(36178171-36178311)
chr2 (66-208)||(6422126-6422268)
chr2 (40-201)||(14745300-14745462)
chr2 (52-208)||(6712978-6713135)
chr2 (52-201)||(36005887-36006035)
chr2 (50-207)||(38796619-38796778)
chr2 (55-232)||(33731653-33731831)
chr2 (50-205)||(40679632-40679787)
chr2 (50-232)||(37632575-37632755)
chr2 (52-208)||(40733519-40733675)
chr2 (40-218)||(7598599-7598769)
chr2 (42-198)||(1769884-1770040)
chr2 (54-189)||(28254258-28254391)
chr2 (50-206)||(28531316-28531472)
chr2 (42-157)||(36178320-36178435)
chr2 (61-218)||(40163362-40163520)
chr2 (63-232)||(23346250-23346417)
chr2 (52-208)||(40733885-40734040)
chr2 (50-209)||(7598228-7598387)
chr2 (52-194)||(5367457-5367599)
chr2 (50-207)||(29676903-29677065)
chr2 (112-231)||(6421793-6421911)
chr2 (50-157)||(16542449-16542556)
chr2 (58-208)||(29676543-29676687)
chr2 (50-158)||(31468800-31468904)
chr2 (104-232)||(3673122-3673249)
chr2 (50-198)||(12529038-12529186)
chr2 (50-232)||(16590888-16591065)
chr2 (53-138)||(31899496-31899581)
chr2 (50-208)||(30313178-30313335)
chr2 (122-231)||(3672773-3672882)
chr2 (52-208)||(29874023-29874179)
chr2 (58-162)||(37895107-37895211)
chr2 (53-166)||(31259658-31259774)
chr2 (50-168)||(33561491-33561609)
chr2 (50-128)||(38796298-38796376)
chr2 (112-204)||(6421688-6421780)
chr2 (50-167)||(30323464-30323581)
chr2 (103-195)||(36784273-36784365)
chr2 (50-220)||(29873525-29873695)
chr2 (50-168)||(37894732-37894850)
chr2 (50-107)||(36785664-36785721)
chr2 (53-208)||(9231252-9231407)
chr2 (51-181)||(31385738-31385868)
chr2 (66-155)||(28254165-28254254)
chr2 (50-158)||(33953821-33953929)
chr2 (53-206)||(3594180-3594333)
chr2 (140-221)||(31899090-31899170)
chr2 (114-204)||(35580443-35580534)
chr2 (53-157)||(12910231-12910335)
chr2 (50-157)||(41678419-41678527)
chr2 (52-98)||(6421306-6421352)
chr2 (233-274)||(13265751-13265792)
chr2 (50-191)||(33954279-33954419)
chr2 (92-168)||(30312831-30312907)
chr2 (104-163)||(25390313-25390372)
chr2 (117-168)||(28226404-28226455)
chr2 (65-112)||(42515031-42515078)
chr2 (92-149)||(2336666-2336723)
chr2 (50-86)||(3673085-3673121)
chr2 (120-168)||(8904498-8904546)
chr2 (154-233)||(2109988-2110067)
chr2 (121-168)||(28226726-28226772)
chr2 (117-166)||(13792536-13792585)
chr2 (50-86)||(3672719-3672755)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (50-232)||(1085593-1085774)
chr7 (50-232)||(7517580-7517762)
chr7 (44-232)||(29157559-29157747)
chr7 (40-208)||(37533011-37533178)
chr7 (50-208)||(23377-23535)
chr7 (42-208)||(37533364-37533530)
chr7 (52-208)||(30244272-30244428)
chr7 (57-208)||(11845198-11845349)
chr7 (52-208)||(6054562-6054718)
chr7 (52-220)||(45433243-45433411)
chr7 (50-208)||(40094774-40094932)
chr7 (50-230)||(22567017-22567196)
chr7 (40-205)||(14681500-14681663)
chr7 (50-200)||(36939741-36939891)
chr7 (50-179)||(7554025-7554154)
chr7 (52-197)||(45754718-45754862)
chr7 (58-198)||(19122740-19122879)
chr7 (52-208)||(30245079-30245231)
chr7 (50-208)||(24177435-24177593)
chr7 (56-206)||(34218036-34218186)
chr7 (52-208)||(45434638-45434794)
chr7 (50-232)||(118277-118459)
chr7 (52-221)||(47129097-47129265)
chr7 (50-232)||(8128417-8128599)
chr7 (50-231)||(36622960-36623140)
chr7 (50-169)||(22566702-22566820)
chr7 (55-208)||(30032572-30032725)
chr7 (53-206)||(9901648-9901799)
chr7 (50-170)||(16569196-16569316)
chr7 (50-170)||(16596346-16596466)
chr7 (50-204)||(40230295-40230449)
chr7 (53-185)||(24838724-24838857)
chr7 (50-176)||(1085280-1085407)
chr7 (53-205)||(20599317-20599471)
chr7 (50-199)||(36534795-36534942)
chr7 (50-208)||(41854635-41854792)
chr7 (71-206)||(37167808-37167937)
chr7 (92-208)||(30253534-30253646)
chr7 (96-232)||(28300229-28300366)
chr7 (53-202)||(41910592-41910749)
chr7 (50-171)||(43241495-43241616)
chr7 (131-232)||(47129450-47129549)
chr7 (50-138)||(28301613-28301701)
chr7 (50-123)||(30245494-30245567)
chr7 (50-123)||(30255339-30255412)
chr7 (133-207)||(28300569-28300644)
chr7 (50-120)||(30244701-30244771)
chr7 (50-118)||(36109007-36109075)
chr7 (138-206)||(37532753-37532821)
chr7 (151-232)||(30244453-30244533)
chr7 (151-232)||(30253671-30253751)
chr7 (55-155)||(44361517-44361616)
chr7 (117-168)||(21416181-21416232)
chr7 (151-232)||(30245256-30245336)
chr7 (160-232)||(7517767-7517839)
chr7 (160-232)||(7518033-7518105)
chr7 (119-167)||(23569043-23569091)
chr7 (50-168)||(4124128-4124246)
chr7 (44-87)||(14681281-14681324)
chr7 (118-197)||(40094424-40094503)
chr7 (50-100)||(40094502-40094552)
chr7 (133-195)||(45755010-45755072)
chr7 (117-162)||(21619091-21619136)
chr7 (105-208)||(37393114-37393216)
chr7 (52-102)||(36967335-36967385)
chr7 (50-168)||(37345916-37346036)
chr7 (92-208)||(15902342-15902457)
chr7 (118-162)||(27391815-27391859)
chr7 (145-199)||(4719305-4719359)
chr7 (186-232)||(7517982-7518028)
chr7 (117-157)||(27598052-27598092)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (40-230)||(50630731-50630921)
chr4 (50-232)||(25483336-25483517)
chr4 (52-231)||(36629239-36629418)
chr4 (42-208)||(41370349-41370515)
chr4 (42-217)||(55933113-55933288)
chr4 (50-232)||(10245920-10246101)
chr4 (50-205)||(54017596-54017751)
chr4 (50-232)||(3340807-3340988)
chr4 (50-207)||(1731646-1731803)
chr4 (52-221)||(39792845-39793014)
chr4 (47-208)||(50002423-50002584)
chr4 (52-207)||(39404400-39404555)
chr4 (50-232)||(22027936-22028117)
chr4 (50-220)||(36608647-36608817)
chr4 (50-198)||(52884695-52884844)
chr4 (52-232)||(39404020-39404200)
chr4 (50-221)||(44620660-44620830)
chr4 (65-198)||(54108928-54109060)
chr4 (52-207)||(34646648-34646803)
chr4 (50-232)||(22028342-22028527)
chr4 (42-188)||(49880152-49880297)
chr4 (53-207)||(50459724-50459878)
chr4 (60-208)||(54343006-54343147)
chr4 (59-208)||(44620362-44620511)
chr4 (52-208)||(36572021-36572177)
chr4 (50-198)||(52884887-52885038)
chr4 (50-217)||(22183253-22183420)
chr4 (50-191)||(4955332-4955473)
chr4 (59-208)||(44621011-44621160)
chr4 (41-208)||(18932747-18932925)
chr4 (50-209)||(49076828-49076986)
chr4 (69-208)||(54936215-54936353)
chr4 (56-232)||(20825842-20826018)
chr4 (51-218)||(16888804-16888971)
chr4 (50-201)||(32941128-32941279)
chr4 (53-209)||(49302907-49303065)
chr4 (49-208)||(54108537-54108694)
chr4 (50-221)||(2740700-2740869)
chr4 (51-207)||(16889535-16889691)
chr4 (56-203)||(20826223-20826370)
chr4 (65-179)||(45496820-45496934)
chr4 (50-209)||(3244448-3244607)
chr4 (50-205)||(4390102-4390257)
chr4 (50-159)||(2741071-2741180)
chr4 (104-208)||(23817679-23817783)
chr4 (52-221)||(43174508-43174677)
chr4 (52-168)||(41707503-41707618)
chr4 (42-173)||(6975489-6975620)
chr4 (50-205)||(34004586-34004739)
chr4 (50-208)||(49076449-49076604)
chr4 (50-232)||(54741154-54741334)
chr4 (50-208)||(3341128-3341286)
chr4 (52-196)||(19504707-19504842)
chr4 (52-207)||(45489331-45489485)
chr4 (50-205)||(51768061-51768216)
chr4 (50-205)||(3700365-3700512)
chr4 (96-206)||(18879852-18879962)
chr4 (90-208)||(43827480-43827597)
chr4 (101-202)||(31691203-31691306)
chr4 (63-158)||(54017750-54017845)
chr4 (52-187)||(40067045-40067181)
chr4 (50-208)||(28034229-28034387)
chr4 (71-208)||(48111696-48111833)
chr4 (72-208)||(3271806-3271947)
chr4 (55-219)||(760194-760356)
chr4 (92-191)||(15841383-15841482)
chr4 (50-139)||(10246347-10246436)
chr4 (42-102)||(50788087-50788147)
chr4 (58-116)||(44620304-44620362)
chr4 (50-182)||(23556890-23557022)
chr4 (56-208)||(45489712-45489864)
chr4 (142-208)||(43174233-43174299)
chr4 (50-116)||(44621426-44621492)
chr4 (117-168)||(11197293-11197344)
chr4 (53-168)||(34544107-34544225)
chr4 (75-206)||(39698944-39699077)
chr4 (52-116)||(44620946-44621011)
chr4 (113-232)||(11783528-11783646)
chr4 (130-204)||(41370738-41370812)
chr4 (163-232)||(23817431-23817498)
chr4 (50-138)||(11348396-11348484)
chr4 (56-168)||(15841023-15841134)
chr4 (117-168)||(10396198-10396249)
chr4 (117-168)||(10396483-10396534)
chr4 (117-169)||(922485-922537)
chr4 (118-157)||(1868119-1868158)
chr4 (160-199)||(19895406-19895445)
chr4 (108-166)||(11706584-11706641)
chr4 (116-162)||(51681604-51681650)
chr4 (164-221)||(11702284-11702341)
chr4 (104-164)||(2891864-2891924)
chr4 (50-98)||(45050601-45050649)
chr4 (128-204)||(50787996-50788072)
chr4 (117-168)||(11197003-11197054)
chr4 (42-73)||(18933103-18933134)
chr4 (40-87)||(41370691-41370738)
chr4 (105-148)||(45484774-45484817)
chr4 (94-168)||(31249896-31249970)
chr4 (126-168)||(41707279-41707321)
chr4 (178-232)||(45496678-45496732)
chr4 (50-91)||(11706636-11706677)
chr4 (161-198)||(19895533-19895570)
chr4 (113-146)||(29802604-29802637)
chr4 (178-218)||(1731581-1731621)
chr4 (177-233)||(20695925-20695980)
chr4 (132-168)||(34946151-34946187)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (40-227)||(22304559-22304747)
chr3 (52-232)||(37990615-37990795)
chr3 (52-218)||(37990967-37991133)
chr3 (52-206)||(43346793-43346947)
chr3 (52-208)||(35946524-35946680)
chr3 (50-232)||(15772854-15773035)
chr3 (50-220)||(29644890-29645060)
chr3 (50-232)||(42342364-42342546)
chr3 (50-220)||(12114550-12114720)
chr3 (50-208)||(32589704-32589861)
chr3 (50-208)||(33803252-33803410)
chr3 (41-200)||(39934963-39935124)
chr3 (50-232)||(54017793-54017974)
chr3 (50-208)||(54018198-54018356)
chr3 (50-208)||(29644581-29644739)
chr3 (42-199)||(39389062-39389219)
chr3 (50-208)||(41359765-41359919)
chr3 (50-208)||(25739425-25739583)
chr3 (52-205)||(32462903-32463057)
chr3 (52-208)||(52634678-52634833)
chr3 (50-208)||(21832345-21832501)
chr3 (50-206)||(42342092-42342248)
chr3 (42-208)||(50612447-50612618)
chr3 (52-200)||(22303963-22304104)
chr3 (40-191)||(4823645-4823796)
chr3 (50-202)||(15773192-15773346)
chr3 (50-209)||(31190017-31190168)
chr3 (50-208)||(53577364-53577522)
chr3 (52-208)||(25755396-25755552)
chr3 (50-232)||(1634291-1634473)
chr3 (50-205)||(45395656-45395811)
chr3 (57-182)||(3135099-3135224)
chr3 (52-208)||(3135454-3135617)
chr3 (52-209)||(45901715-45901873)
chr3 (51-208)||(53117975-53118131)
chr3 (50-210)||(39914252-39914412)
chr3 (50-209)||(8327904-8328067)
chr3 (52-208)||(32462558-32462715)
chr3 (42-208)||(37726496-37726654)
chr3 (52-200)||(49336694-49336843)
chr3 (42-209)||(51886553-51886714)
chr3 (53-207)||(11661954-11662108)
chr3 (108-232)||(22303634-22303759)
chr3 (52-232)||(33175635-33175820)
chr3 (50-201)||(9240149-9240300)
chr3 (50-208)||(44160547-44160702)
chr3 (124-233)||(41359466-41359575)
chr3 (60-232)||(42584800-42584970)
chr3 (50-182)||(47964544-47964676)
chr3 (76-174)||(33362327-33362425)
chr3 (40-157)||(3384317-3384434)
chr3 (40-105)||(22304236-22304301)
chr3 (50-220)||(39336219-39336387)
chr3 (120-208)||(54017548-54017636)
chr3 (50-208)||(47964915-47965073)
chr3 (53-142)||(7767380-7767469)
chr3 (52-168)||(11661537-11661638)
chr3 (159-232)||(22304302-22304376)
chr3 (53-158)||(46546375-46546480)
chr3 (50-106)||(43346650-43346706)
chr3 (92-178)||(39336000-39336086)
chr3 (92-197)||(12749211-12749316)
chr3 (100-160)||(52634990-52635050)
chr3 (154-207)||(8328374-8328427)
chr3 (53-182)||(25317161-25317290)
chr3 (52-168)||(25991405-25991521)
chr3 (117-168)||(53596027-53596078)
chr3 (117-168)||(53596342-53596393)
chr3 (105-162)||(17731950-17732007)
chr3 (105-162)||(19033181-19033238)
chr3 (130-208)||(43978865-43978947)
chr3 (117-168)||(53596542-53596593)
chr3 (132-208)||(7766783-7766857)
chr3 (117-164)||(48127859-48127906)
chr3 (177-221)||(9239940-9239984)
chr3 (50-82)||(12747878-12747910)
chr3 (118-162)||(16871005-16871049)
chr3 (118-162)||(17735037-17735081)
chr3 (118-162)||(19036306-19036350)
chr3 (117-162)||(16143505-16143550)
chr3 (121-162)||(16869843-16869884)
chr3 (55-116)||(36986040-36986101)
chr3 (55-116)||(37011479-37011540)
chr3 (113-149)||(50329391-50329427)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (41-208)||(3669678-3669845)
chr8 (42-220)||(3670052-3670229)
chr8 (40-233)||(30441071-30441267)
chr8 (52-206)||(3038292-3038446)
chr8 (52-218)||(34835211-34835377)
chr8 (52-200)||(34834878-34835026)
chr8 (42-232)||(20870550-20870741)
chr8 (50-198)||(45122067-45122215)
chr8 (42-200)||(1014253-1014411)
chr8 (50-220)||(45121898-45122068)
chr8 (52-232)||(30359273-30359454)
chr8 (40-200)||(1013879-1014039)
chr8 (52-211)||(25561812-25561972)
chr8 (50-208)||(6876862-6877021)
chr8 (50-209)||(9608745-9608904)
chr8 (52-207)||(33113368-33113523)
chr8 (52-218)||(34835476-34835643)
chr8 (52-218)||(34835742-34835909)
chr8 (52-208)||(40518071-40518229)
chr8 (52-206)||(40518584-40518738)
chr8 (52-208)||(37544490-37544646)
chr8 (64-208)||(45122638-45122782)
chr8 (53-208)||(147454-147609)
chr8 (57-204)||(9482608-9482755)
chr8 (50-208)||(9309355-9309512)
chr8 (75-221)||(9483174-9483320)
chr8 (52-208)||(1513915-1514071)
chr8 (57-205)||(70277-70425)
chr8 (50-208)||(8918764-8918922)
chr8 (44-202)||(40579512-40579670)
chr8 (50-208)||(5915872-5916025)
chr8 (50-206)||(5420651-5420807)
chr8 (52-204)||(30359611-30359763)
chr8 (50-205)||(41972158-41972316)
chr8 (40-210)||(6731894-6732055)
chr8 (50-208)||(45123006-45123164)
chr8 (60-232)||(18371970-18372142)
chr8 (50-208)||(9308977-9309139)
chr8 (53-198)||(32640542-32640682)
chr8 (52-201)||(45121663-45121811)
chr8 (54-207)||(18380020-18380171)
chr8 (41-208)||(6651496-6651652)
chr8 (57-204)||(18371665-18371807)
chr8 (44-208)||(32305478-32305635)
chr8 (50-198)||(4154678-4154824)
chr8 (50-198)||(147829-147968)
chr8 (50-201)||(9507777-9507933)
chr8 (73-187)||(9609108-9609222)
chr8 (42-128)||(41416251-41416335)
chr8 (53-163)||(43274824-43274934)
chr8 (128-221)||(41129066-41129159)
chr8 (52-168)||(8794113-8794229)
chr8 (50-220)||(9620666-9620834)
chr8 (125-208)||(40579269-40579352)
chr8 (40-122)||(18372785-18372867)
chr8 (54-154)||(18372988-18373085)
chr8 (50-199)||(12283873-12284021)
chr8 (132-208)||(8919144-8919220)
chr8 (52-158)||(18372656-18372758)
chr8 (40-122)||(18372342-18372424)
chr8 (50-219)||(4154270-4154438)
chr8 (53-140)||(3037776-3037865)
chr8 (54-199)||(43398077-43398225)
chr8 (60-123)||(25561729-25561792)
chr8 (55-155)||(20130454-20130553)
chr8 (50-182)||(5274775-5274907)
chr8 (127-233)||(20995392-20995497)
chr8 (53-217)||(40991756-40991920)
chr8 (144-208)||(43274635-43274699)
chr8 (40-94)||(18372485-18372539)
chr8 (131-188)||(16524446-16524503)
chr8 (161-232)||(3037944-3038016)
chr8 (86-142)||(18373236-18373292)
chr8 (104-191)||(40417733-40417820)
chr8 (150-204)||(18372288-18372342)
chr8 (121-158)||(12156708-12156745)
chr8 (50-107)||(20995502-20995559)
chr8 (50-127)||(33831978-33832055)
chr8 (108-149)||(11442911-11442952)
chr8 (50-82)||(18645713-18645745)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (52-208)||(514-670)
scaffold0702 (40-208)||(147-310)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (52-232)||(1083-1262)
scaffold0391 (97-168)||(1731-1802)
scaffold0391 (50-101)||(3092-3143)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (50-199)||(5396-5546)
scaffold0734 (50-199)||(5777-5931)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (50-208)||(47360-47518)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (50-170)||(5357-5477)
scaffold0078 (50-201)||(4982-5133)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (50-166)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (52-127)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (52-182)||(39459-39588)
scaffold0113 (52-175)||(39840-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (44-128)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (88-128)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 80)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500632
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaaca 6500632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296292
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctca-tgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 230
Target Start/End: Original strand, 6500813 - 6501002
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6500813 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaa 6500911  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6500912 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaa 6501002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca-tgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487551
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 32487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170792
Alignment:
Q  43 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 142  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  143 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  47 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  147 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328117
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctcagtgacccaaca 25328117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370257
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Original strand, 624186 - 624350
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  624186 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttga 624285  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  624286 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggt 624350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3295172 - 3295002
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3295172 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggt 3295074  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3295073 atgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctca 3295002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295345
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13415918 - 13415750
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13415918 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggt 13415819  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||    
T  13415818 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgaaatgg-cggtccccgtggctcccct 13415750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405574
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccagtgacccaaca 42405574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632961
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccca-gctccccttaatgacccaa 41632961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498655
Alignment:
Q  41 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  141 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtcccc 9498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26074304 - 26074122
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26074304 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggttttgggt 26074205  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  26074204 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccccaaagctcccctctctgacccaaca 26074122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 26074614 - 26074792
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074614 caagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26074713  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 230  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  26074714 gagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccctaaagctcccctctctgacccaa 26074792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028493
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacccaaca 1028493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224366
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416977
Alignment:
Q  57 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  157 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568545
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctcaatgacccaaca 36568545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 208
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299647
Alignment:
Q  51 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccc 299647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  60 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  160 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662652
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 150  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150165
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccct 35150165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623976
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 623976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370573
Alignment:
Q  76 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 175  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  176 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctca 15370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 204
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  62 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  162 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  47 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  147 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 188  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24489360 - 24489194
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24489360 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaa 24489263  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  24489262 gagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccctcagactcccctc 24489194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26074938 - 26074807
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  26074938 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaa 26074839  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074838 agagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 200
Target Start/End: Original strand, 38427553 - 38427697
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  38427553 gtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagag 38427651  T
Q  155 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    ||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427652 tgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590918
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167838
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcccc 35167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 219
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 208
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915007
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcccc 35915007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 125
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36522053 - 36521922
Alignment:
Q  51 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36522053 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggta 36521954  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
    ||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36521953 agagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900007
Alignment:
Q  136 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc 26900007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 145
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 145  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36522392 - 36522277
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36522392 aagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaag 36522293  T
Q  153 agtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522292 agtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 130
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 31509623 - 31509742
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttggg 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  31509623 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttgg 31509722  T
Q  149 taagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  31509723 taagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635212
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 187  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786002
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    |||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtccc 13786002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 175
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  64 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  163 ctctcttgcttgt 175  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427377
Alignment:
Q  137 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccc 38427377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785631
Alignment:
Q  108 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  208 ct 209  Q
    ||    
T  13785632 ct 13785631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  134 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 186  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  121 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 188  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  107 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 186  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 145
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 145  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 168
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  108 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 164
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 110
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 175
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  87 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 175  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  130 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  130 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  108 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 204
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 162
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  132 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  104 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 99  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  148 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 204  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  121 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 208
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  155 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13785764 - 13785732
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785764 aagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 79)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290800
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  140 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccactgacccaaca 44290800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44290626 - 44290458
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290626 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290527  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290526 ggttttgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537589
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccct 3537589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142531
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  150 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48588656 - 48588465
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  48588656 agtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaa 48588557  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-ccctaggctcccctcactgacccaa 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  48588556 ggttttgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcgcccaaagttcccctcactgaaccaa 48588465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Original strand, 41157375 - 41157545
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41157375 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagt 41157474  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc-ctaggctcccct 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41157475 aagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccctcaaggctcccct 41157545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26661678 - 26661522
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26661678 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 26661579  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26661578 gagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcccc 26661522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157175
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctccccttcagtgacccaaca 41157175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294733
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767138
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctca-tgacccaaca 31767138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 199
Target Start/End: Original strand, 37556113 - 37556260
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37556113 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggta 37556211  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556212 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493951
Alignment:
Q  41 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcc 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  136 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca-gctccccccaatgacccaaca 45493951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798357
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364688
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc-cagtgacccaaca 34364688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649596
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 34649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Original strand, 34364925 - 34365084
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364925 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggt 34365024  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34365025 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttccct 34365084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319025
Alignment:
Q  58 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 157  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  158 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052024
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccc 50052024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 200
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082556
Alignment:
Q  51 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084559
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacatt 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctca-tgacccaacatt 45084559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 220
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956079
Alignment:
Q  54 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccctaggctctcctc 9956079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 11977282 - 11977438
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11977282 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 11977381  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977382 gagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168674
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-aggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccctaaggctcccct-agtgacccaaca 32168674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  44 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  144 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22077653 - 22077484
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22077653 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggt 22077554  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22077553 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccct 22077484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875333
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850588
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta-gctcccctca 37850588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  47 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 146  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  147 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661921
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 199
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600321
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66476
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggt 66476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066201
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccc 39066201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 234
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575286
Alignment:
Q  56 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 155  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  156 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacatt 234  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtcccccagactctcctcagtgacccaacatt 5575286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3537315 - 3537226
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537315 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131964
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacat 233  Q
    |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||| |||||||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctca-tgacccaacat 24131964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184383
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------- 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  141 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaac 231  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  232 a 232  Q
    |    
T  41184383 a 41184383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  41 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  135 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22077243 - 22077101
Alignment:
Q  75 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 174  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |||     
T  22077243 atcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcactta 22077144  T
Q  175 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 217  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22077143 tgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtcccccaggctccc 22077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 202
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  51 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 66247 - 66100
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 147  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  66247 tgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgg 66148  T
Q  148 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 197  Q
    |||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66147 gtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077818
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528762
Alignment:
Q  60 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  160 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
     |||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtgga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 230  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctca-tgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30630796 - 30630648
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30630796 tgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 30630697  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30630696 aagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  147 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 208
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977102
Alignment:
Q  121 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378036
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc-cagtgacccaaca 21378036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  149 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188574
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta-ggctcccctca 221  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcggtccccaagggctcccctca 1188574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051689
Alignment:
Q  120 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtcccc 50051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187349
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctca 221  Q
    || ||||||  ||||||||  | || | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacggtcccctagagctcccctca 1187349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380143
Alignment:
Q  121 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccctagactccccta 47380155  T
Q  221 actgacccaaca 232  Q
    | ||||||||||    
T  47380154 attgacccaaca 47380143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  65 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 164  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  165 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 168
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  92 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 197
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  77 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 174  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  175 tgtggttgttctagcctcgatgt 197  Q
    || | ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 50051817 - 50051777
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051817 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 50469239 - 50469180
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469239 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 116
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 116  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  99 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 144  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  149 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996870
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 210  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgggcagtccccta 5996870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  105 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Original strand, 30697310 - 30697403
Alignment:
Q  143 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacatttaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  30697310 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactttgcgtggttgctatggcctagatgtgggcggtcccc-aggctcccctc-gtgacccaacatttaa 30697403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 115  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 207
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  91 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 190  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  191 tcgatgtggacggtccc 207  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 168
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  132 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22077280 - 22077248
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077280 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 22077248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  59 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 118  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 45084576 - 45084619
Alignment:
Q  190 ctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacatt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  45084576 ctcgatgtggacggtcccctaggcttccctca-tgacccaacatt 45084619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 47379943 - 47379891
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  47379943 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  123 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 169  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  132 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 45084636 - 45084679
Alignment:
Q  190 ctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacatt 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  45084636 ctcgatgtggacggtcccccaggcttccctca-tgacccaacatt 45084679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 186
Target Start/End: Original strand, 50556451 - 50556587
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  50556451 tgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaaggttttgaat 50556550  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 186  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556551 aaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Original strand, 29518910 - 29519078
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29518910 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 29519009  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29519010 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518661
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Original strand, 2378116 - 2378284
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2378116 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 2378215  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378216 ggttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210384
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccc-cagtgacccaaca 35210384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Original strand, 3409650 - 3409818
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3409650 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttta 3409749  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409750 ttttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058409
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||| || ||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccccaaagctcccctcaccgaaccaaca 3058409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415629
Alignment:
Q  41 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  141 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377912
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2377912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579860
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc-aagctcccctca 2579860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  43 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 142  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  143 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2578598 - 2578443
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2578598 caagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 2578500  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578499 gagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2578443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10074521 - 10074352
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10074521 tgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 10074422  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  10074421 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctcccct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 16454913 - 16455078
Alignment:
Q  56 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16454913 tgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagt 16455012  T
Q  156 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16455013 gtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctca 16455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127530
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtccccaaagctcccctc 1127530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10074149 - 10073989
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074149 tgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 10074050  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 210  Q
    || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10074049 aaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtccccta 10073989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454733
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 16454733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 199
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 208
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843713
Alignment:
Q  56 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 154  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  155 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2578991 - 2578822
Alignment:
Q  51 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2578991 gcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaactcattaccttaaggttttgggta 2578893  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578892 agagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 2578822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 230  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc-aggctcccctca-tgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2579645 - 2579478
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2579645 gtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaag 2579546  T
Q  155 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcac 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  2579545 tatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctcac 2579478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10073772 - 10073604
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10073772 tgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggt 10073675  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  10073674 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcccctc 10073604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  150 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2579261 - 2579087
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||    
T  2579261 caagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccataaacccataactttaaggctttggctaa 2579166  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  2579165 gagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccccga-gctcccctca-tgacccaaca 2579087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 193  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  155 tgtg 158  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  149 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Original strand, 16108065 - 16108208
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  16108065 caagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg---------- 16108154  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16108155 --gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  56 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  156 gtggtgtctctcttgcttgt 175  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071678
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctca 12071678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085021
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctca 12085021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092470
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtccccttggcccccctc 12092470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  45 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 144  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  145 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 202  Q
    ||||  |||||||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 182
Target Start/End: Original strand, 6071132 - 6071264
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  6071132 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggat 6071231  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071232 aagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714849
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 231  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgttttt-tcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctcccagactcccctcaatgacccaac 31714849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 169
Target Start/End: Original strand, 8481927 - 8482045
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8481927 tgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggt 8482025  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctctt 169  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8482026 aagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135058
Alignment:
Q  54 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  154 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccccagactcccct 17135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 2975567 - 2975668
Alignment:
Q  65 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 164  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  2975567 tatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtct 2975666  T
Q  165 ct 166  Q
    ||    
T  2975667 ct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Original strand, 35210498 - 35210551
Alignment:
Q  70 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35210498 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618606
Alignment:
Q  57 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 156  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  157 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct-aatgtgggtggtccccaaggctcccctc 30618606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  154 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 169  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  87 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  126 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 232
Target Start/End: Original strand, 2975296 - 2975352
Alignment:
Q  175 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| ||||    
T  2975296 tgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcctct-gactcccctcagtgacctaaca 2975352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 35210554 - 35210601
Alignment:
Q  184 tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  35210554 tctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaaca 35210601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178605
Alignment:
Q  41 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  141 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccc 36178605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283451
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctcacttacccaaca 41283451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 206
Target Start/End: Original strand, 37106178 - 37106344
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37106178 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaa 37106277  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106278 ggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745667
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 14745667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5542793 - 5542625
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5542793 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaa 5542694  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5542693 ggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 5542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 46 - 208
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106082
Alignment:
Q  46 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  146 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5543002
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421543
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccc 6421543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962753
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 202
Target Start/End: Original strand, 15880265 - 15880415
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880265 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 15880364  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880365 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514807
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 42514807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  57 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 156  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  157 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580724
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35580724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178171
Alignment:
Q  68 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  168 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccc 36178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Original strand, 6422126 - 6422268
Alignment:
Q  66 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 165  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6422126 atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctc 6422225  T
Q  166 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6422226 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 6422268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14745462 - 14745300
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745462 agtgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaa 14745363  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745362 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713135
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6713135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796619
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  150 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 232
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731831
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 154  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  155 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||  ||||||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcctccaaagctcccctcggtgacccaaca 33731831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40679787 - 40679632
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40679787 tgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggt 40679688  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679687 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632575
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg-cccct-ggctcccctcagtgtcccaaca 37632575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 40733519 - 40733675
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||    
T  40733519 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaa 40733618  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  40733619 gagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcccc 40733675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Original strand, 7598599 - 7598769
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  7598599 agtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaa 7598690  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 218  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  7598691 cgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacggcccactgggctcccc 7598769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  54 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  154 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 189  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28531472 - 28531316
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28531472 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggt 28531373  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531372 aagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36178435 - 36178320
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  36178435 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaagg 36178336  T
Q  142 ttttgggtaagagtgt 157  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178335 ttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163362
Alignment:
Q  61 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  160 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||  |||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctcccc 40163362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346417
Alignment:
Q  63 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  163 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctca-tgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 40733885 - 40734040
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  40733885 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaa 40733983  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40733984 gagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 40734040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598387
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccct 7598387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 194
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Original strand, 29676903 - 29677065
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttt 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29676903 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctt 29677002  T
Q  145 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29677003 taagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421911
Alignment:
Q  112 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  212 gctcccctcactgacccaac 231  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  6421893 gctcccctca-tgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 157
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  150 aagagtgt 157  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  58 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 157  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  158 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31468904 - 31468800
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31468904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 31468809  T
Q  150 aagagtgtg 158  Q
    |||||||||    
T  31468808 aagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673249
Alignment:
Q  104 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673122 ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 3673221  T
Q  204 tcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||    
T  3673222 tccccctggctcccc-cagtgacccaaca 3673249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591065
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  149 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctcaatgacccaaca 16591065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 30313178 - 30313335
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30313178 tgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggt 30313276  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||    
T  30313277 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccc 30313335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672882
Alignment:
Q  122 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  |    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccccta 3672872  T
Q  222 ctgacccaac 231  Q
     |||||||||    
T  3672873 gtgacccaac 3672882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874023
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||| |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  58 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  158 ggtgt 162  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  150 aagagtgtggtgtctct 166  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33561609 - 33561491
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33561609 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggt 33561510  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  33561509 aagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38796376 - 38796298
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38796376 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  112 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 167
Target Start/End: Original strand, 30323464 - 30323581
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30323464 tgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggt 30323563  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctc 167  Q
    |||||||||| |||||||    
T  30323564 aagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  103 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29873695 - 29873525
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  29873695 tgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagt 29873596  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| | || ||||| | |||||| |  ||||||||||    
T  29873595 aagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctggctcccctc 29873525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37894850 - 37894732
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  37894850 tgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggtt 37894751  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctct 168  Q
    || |||||||||| |||||    
T  37894750 aaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 36785721 - 36785664
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785721 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 208
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||| || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 181
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  51 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 181  Q
      |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  66 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 155  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33953929 - 33953821
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  33953929 tgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggt 33953830  T
Q  150 aagagtgtg 158  Q
    |||||||||    
T  33953829 aagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899090
Alignment:
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc-aagctcccctca 31899090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  114 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 157
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  153 agtgt 157  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41678527 - 41678419
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 147  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  41678527 tgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttga 41678429  T
Q  148 gtaagagtgt 157  Q
    ||||||||||    
T  41678428 gtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 98
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 274
Target Start/End: Original strand, 13265751 - 13265792
Alignment:
Q  233 tttaattcatataaactctgcaagtttatcttcttctctctc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13265751 tttaattcatataaactctgcaagtttatcttcttctttctc 13265792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954279
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 191  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 168
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  92 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  104 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 163  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Original strand, 42515031 - 42515078
Alignment:
Q  65 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 112  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42515031 tatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  92 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Original strand, 3673085 - 3673121
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3673085 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaat 3673121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  120 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 2109988 - 2110067
Alignment:
Q  154 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacat 233  Q
    |||||| ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||    
T  2109988 gtgtggcgtccctctcgcttgtatgattgctctagtctcgatgtggacggtccccctgactcccctcagtaacccaacat 2110067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  121 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 166  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 86  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085593
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctca-tgacccaaca 1085593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517762
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtaacccaaca 7517762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157747
Alignment:
Q  44 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  144 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctcccagactctcctcactgacccaaca 29157747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37533178 - 37533011
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37533178 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 37533079  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533078 ggttttgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 37533011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23377
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533364
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37533364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 30244272 - 30244428
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244272 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 30244371  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30244372 gagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845349
Alignment:
Q  57 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  157 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccc 11845349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054718
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433411
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094774
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 40094774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567017
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||  |||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcaacgacccaa 22567017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 205
Target Start/End: Original strand, 14681500 - 14681663
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14681500 agtgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaa 14681599  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681600 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 7554025 - 7554154
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7554025 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggt 7554124  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7554125 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 197
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 198
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  58 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  158 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 30245079 - 30245231
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30245079 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 30245178  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30245179 gagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30245231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177593
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  56 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  156 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 45434638 - 45434794
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  45434638 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaa 45434737  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45434738 gagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtcccc 45434794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118277
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  150 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 118277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129265
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-gctcccctca 47129265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128417
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||||| ||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctcactaacccaaca 8128417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623140
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 231  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctca-tgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22566820 - 22566702
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566820 tgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 22566721  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctctt 169  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22566720 aagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 208
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032725
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  155 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttg 170  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttg 170  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230295
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 185  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1085407 - 1085280
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 148  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1085407 tgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttggg 1085308  T
Q  149 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 176  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085307 taagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    |||||||||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854792
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  71 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 170  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  171 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 208
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  92 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  192 cgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||| |||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300229
Alignment:
Q  96 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  195 tgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||| |  | ||||||| | ||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcctcctgactccccttattgacccaaca 28300229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  145 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 202  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 171
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgc 171  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 232
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129549
Alignment:
Q  131 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtccccga-gctcccctca-tgacccaa 47129547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 123
Target Start/End: Original strand, 30245494 - 30245567
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245494 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 123
Target Start/End: Original strand, 30255339 - 30255412
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30255339 tgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  133 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 30244701 - 30244771
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244701 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 118  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  138 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244533
Alignment:
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctca-tgacccaaca 30244533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctca-tgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 154  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245336
Alignment:
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctcccctta-tgacccaaca 30245336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 232
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517839
Alignment:
Q  160 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7517839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 232
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518105
Alignment:
Q  160 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  119 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctct 168  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 87
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  44 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 197  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 40094552 - 40094502
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094552 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  133 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 195  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393216
Alignment:
Q  105 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  205 cccc 208  Q
    ||||    
T  37393213 cccc 37393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 37345916 - 37346036
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 147  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  37345916 tgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttga 37346015  T
Q  148 gtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  37346016 gtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 208
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  92 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 191  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  192 cgatgtggacggtcccc 208  Q
     |||||||  |||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  145 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Original strand, 7517982 - 7518028
Alignment:
Q  186 tagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517982 tagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 157
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 157  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630731
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctag-ctcccctcactgacccaa 50630731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483517
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc-cagtgacccaaca 25483517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 36629239 - 36629418
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36629239 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36629338  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  36629339 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcccctcaatgacccaac 36629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370515
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933113
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246101
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctcgctgacccaaca 10246101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340988
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc-cagtgacccaaca 3340988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792845
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctca 39792845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002584
Alignment:
Q  47 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  147 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 50002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Original strand, 39404400 - 39404555
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  39404400 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaa 39404499  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404500 gaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22028117 - 22027936
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22028117 tgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaaggttttgggt 22028018  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22028017 aagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcccctca-tgacccaaca 22027936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608647
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 36608647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  149 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404200
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaaca 39404200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Original strand, 44620660 - 44620830
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  44620660 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggt 44620758  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44620759 aagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 44620830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Original strand, 54108928 - 54109060
Alignment:
Q  65 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54108928 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtct 54109026  T
Q  165 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54109027 ctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028342
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 147  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  148 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcactgacccaaca 22028342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 188
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 207
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  60 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  160 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  59 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  159 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Original strand, 52884887 - 52885038
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884887 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggg 52884986  T
Q  149 taagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884987 taagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183253
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 217  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccagactccc 22183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 191  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621160
Alignment:
Q  59 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 158  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  159 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18932925 - 18932747
Alignment:
Q  41 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca-----------tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18932925 gtgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcggtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaaccc 18932826  T
Q  130 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18932825 attgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076828
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccct 49076828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 208
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936353
Alignment:
Q  69 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  169 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 54936353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 232
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826018
Alignment:
Q  56 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  156 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| ||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaaca 20826018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888804
Alignment:
Q  51 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 218  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccc 16888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 209
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303065
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccct 49303065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 208
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108694
Alignment:
Q  49 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  148 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccc 54108694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889535
Alignment:
Q  51 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Original strand, 20826223 - 20826370
Alignment:
Q  56 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  20826223 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagt 20826322  T
Q  156 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 203  Q
    ||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20826323 gtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  65 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  165 ctcttgcttgtgtgg 179  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3244607 - 3244448
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3244607 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggt 3244508  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    |||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3244507 aagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtcccct 3244448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 159
Target Start/End: Original strand, 2741071 - 2741180
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2741071 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggt 2741170  T
Q  150 aagagtgtgg 159  Q
    ||||||||||    
T  2741171 aagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817679
Alignment:
Q  104 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 203  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  204 tcccc 208  Q
    |||||    
T  23817683 tcccc 23817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 43174508 - 43174677
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| || |||||||    
T  43174508 caagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgaccttaaagtgttgggta 43174607  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    ||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43174608 agagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggttcccta-gctcccctca 43174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  152 gagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004586
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49076604 - 49076449
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  49076604 tgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggt 49076506  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |  || | ||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49076505 a--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741154
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||| ||||||||||||||  ||| || ||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctcagtgtagatggtccctcgggctcccctcagtgacccaaca 54741154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 3341128 - 3341286
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||    
T  3341128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggt 3341227  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  3341228 aagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggtcccc 3341286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 196  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45489485 - 45489331
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||    
T  45489485 caagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaa 45489387  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489386 gagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  96 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  196 gtggacggtcc 206  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 208
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  90 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 189  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  190 ctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  101 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  199 gacg 202  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  63 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 187
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 187  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034387
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111696
Alignment:
Q  71 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 170  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  171 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |   ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccc 48111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271947
Alignment:
Q  72 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 167  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  168 -ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 3271947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760356
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  155 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||   || |||||||  |||||||| |||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctct-tactggatgtgggtggtcccctgggctcccct 760356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  92 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 191  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 139
Target Start/End: Original strand, 10246347 - 10246436
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10246347 tgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 116
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  58 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489712
Alignment:
Q  56 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 155  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  156 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccc 45489712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174299
Alignment:
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccc 43174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 116
Target Start/End: Original strand, 44621426 - 44621492
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621426 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  75 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 172  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  173 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 116
Target Start/End: Original strand, 44620946 - 44621011
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620946 caagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783528
Alignment:
Q  113 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg 212  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||  ||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  213 ctcccctcactgacccaaca 232  Q
    | ||||||| ||||||||||    
T  11783546 cacccctca-tgacccaaca 11783528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 204
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  130 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817431
Alignment:
Q  163 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 23817431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 138  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  56 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 155  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  156 gtggtgtctctct 168  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 169
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 157
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 199
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  160 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  108 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 166  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 162
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  116 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702284
Alignment:
Q  164 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctca 11702284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  104 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50787996
Alignment:
Q  128 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 87
Target Start/End: Original strand, 41370691 - 41370738
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 87  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370691 agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 148
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  105 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 148  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  94 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  126 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 232
Target Start/End: Original strand, 45496678 - 45496732
Alignment:
Q  178 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||||||    
T  45496678 ggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctccccttactgacccaaca 45496732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 91  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 198
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  161 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 146
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  113 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1731621 - 1731581
Alignment:
Q  178 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1731621 ggttattctagcctcgatgtggatggtcccccaggctcccc 1731581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Original strand, 20695925 - 20695980
Alignment:
Q  177 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacat 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  20695925 tggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagct-ccctcactgacccaacat 20695980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  132 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 227
Target Start/End: Original strand, 22304559 - 22304747
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22304559 agtgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaa 22304658  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  22304659 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccctagcttcccctcactgacc 22304747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37990795 - 37990615
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37990795 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 37990696  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  37990695 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctcaatgacccaaca 37990615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990967
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccc 37990967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946680
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773035
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtccttttgactcccctca-tgacccaaca 15773035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644890
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342364
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctccccttagtgacccaaca 42342364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114550
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccccagactcccctc 12114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803252
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 33803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934963
Alignment:
Q  41 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 138  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  139 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54017974 - 54017793
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54017974 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggt 54017875  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  54017874 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctcccc-cagtgacccaaca 54017793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018198
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 54018198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29644739 - 29644581
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29644739 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644640  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  29644639 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatggtcccc 29644581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41359919 - 41359765
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359919 tgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 41359824  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41359823 aagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 41359765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739425
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 25739425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634833
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccc 52634833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21832501 - 21832345
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21832501 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggt 21832402  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21832401 aaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 21832345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42342248 - 42342092
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42342248 tgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggt 42342149  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342148 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  137 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22304104 - 22303963
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22304104 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 22304012  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22304011 gagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 191
Target Start/End: Original strand, 4823645 - 4823796
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4823645 agtgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaa 4823744  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823745 gattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 202
Target Start/End: Original strand, 15773192 - 15773346
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15773192 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggt 15773291  T
Q  150 aagagtgtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 202  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773292 aagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190168
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccct 31190168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577522
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccc 53577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755552
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634291
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  149 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacacaaca 1634291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3135224 - 3135099
Alignment:
Q  57 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3135224 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtg 3135125  T
Q  157 tggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  3135124 tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135454
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  145 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3135454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901873
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccct 45901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117975
Alignment:
Q  51 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914412
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 210  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgtagacagcccccta 39914412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328067
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccct 8328067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32462715 - 32462558
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  32462715 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggata 32462616  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  32462615 agagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726654
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  152 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886714
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggtaccct 51886714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 207
Target Start/End: Original strand, 11661954 - 11662108
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11661954 aagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaa 11662053  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11662054 gagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303634
Alignment:
Q  108 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-c 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtctc 22303660  T
Q  207 cctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||  || |||||||||| |||||    
T  22303659 cctagcttctcctcactgactcaaca 22303634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175635
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  149 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| || |||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctcagtggcccaaca 33175635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 9240149 - 9240300
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |    
T  9240149 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggat 9240248  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
    |||| ||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9240249 aagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160547
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359466
Alignment:
Q  124 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcact 223  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccagactcccctcgct 41359476  T
Q  224 gacccaacat 233  Q
    ||||||||||    
T  41359475 gacccaacat 41359466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584800
Alignment:
Q  60 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  160 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||  |||  | ||| ||||| ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacggctcccccgactctcctcaatgacccaaca 42584800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47964676 - 47964544
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47964676 tgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 47964577  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964576 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  76 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3384434 - 3384317
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||    
T  3384434 agtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgccttaa 3384335  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgt 157  Q
     |||||||||||||||||    
T  3384334 agttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Original strand, 22304236 - 22304301
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304236 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336219
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctc 220  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctc 39336219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017548
Alignment:
Q  120 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtcccc 54017548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964915
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttcccc 47964915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  152 gagtgtggtgtctctct 168  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 232
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304376
Alignment:
Q  159 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccctcactgacccaaca 22304376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  153 agtgtg 158  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  92 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 178  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 197
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  92 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 191  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  192 cgatgt 197  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 160
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  100 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  154 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 182
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  152 gagtgtggtgtctctct 168  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  105 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  105 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978865
Alignment:
Q  130 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccc 43978865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  132 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 164  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Original strand, 9239940 - 9239984
Alignment:
Q  177 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9239940 tggtttttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 9239984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  118 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 162
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  117 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  121 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  113 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669845
Alignment:
Q  41 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  141 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 3669845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 3670052 - 3670229
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3670052 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaagg 3670151  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3670152 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccta-gctcccctc 3670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441267
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  136 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctc-gtgacccaacat 30441267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038292
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 218
Target Start/End: Original strand, 34835211 - 34835377
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34835211 caagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaa 34835310  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835311 gagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835026
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctca-tgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014253
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  142 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1014253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359454
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctcaatgacccaaca 30359454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1014039 - 1013879
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1014039 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttag 1013940  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 200  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013939 agttttgagtaagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561812
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 211  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccctag 25561812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876862
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  149 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608904
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 209  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccct 9608904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 218
Target Start/End: Original strand, 34835476 - 34835643
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835476 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835575  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835576 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 218
Target Start/End: Original strand, 34835742 - 34835909
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835742 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835841  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835842 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518229
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 40518229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Original strand, 40518584 - 40518738
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40518584 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaa 40518683  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518684 gagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544490
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 208
Target Start/End: Original strand, 45122638 - 45122782
Alignment:
Q  64 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 163  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  45122638 atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtc 45122737  T
Q  164 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45122738 tctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45122782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 208
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147609
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccc 147609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9482755 - 9482608
Alignment:
Q  57 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 156  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  9482755 gtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtg 9482656  T
Q  157 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482655 tggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 9309355 - 9309512
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||    
T  9309355 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggt 9309454  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309455 aagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483174
Alignment:
Q  75 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  175 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513915
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  57 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  157 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8918922 - 8918764
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8918922 tgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggt 8918823  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918822 aagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579512
Alignment:
Q  44 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 143  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  144 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 202  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 206
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 206  Q
    |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Original strand, 30359611 - 30359763
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30359611 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaa 30359710  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  30359711 gagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  147 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 205  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 6731894 - 6732055
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6731894 agtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa---------agtaagagaacccataaattcattgccttaa 6731984  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6731985 ggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggatgatccccta 6732055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 45123006 - 45123164
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45123006 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggt 45123103  T
Q  150 a--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45123104 aagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371970
Alignment:
Q  60 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 159  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  160 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctca-tgacccaaca 18371970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309139
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  148 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640542
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  153 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45121811 - 45121663
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  45121811 caagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaa 45121713  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45121712 gagtgtgatatctctcttacttatggggttgttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  54 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  154 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 207  Q
    ||||||||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Original strand, 6651496 - 6651652
Alignment:
Q  41 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 140  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6651496 gtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacccataaattcattgccttaag 6651584  T
Q  141 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6651585 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18371807 - 18371665
Alignment:
Q  57 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18371807 gtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtg 18371713  T
Q  157 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    |||||| |||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18371712 tggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggt 18371665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305635
Alignment:
Q  44 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  144 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154678
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Original strand, 147829 - 147968
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  147829 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa---------cccataaacctattgccttaaggttttgggt 147919  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  147920 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  145 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 187
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  73 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 172  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  173 tgtgtggttgttcta 187  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  42 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  153 agtgtggtgtc 163  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129159
Alignment:
Q  128 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 221  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 41129159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  152 gagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620666
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 220  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctc 9620666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579269
Alignment:
Q  125 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 40579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18372867 - 18372785
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 122  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372867 agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18373085 - 18372988
Alignment:
Q  54 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 153  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  18373085 agtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaaga 18372989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 199
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919144
Alignment:
Q  132 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcccc 8919144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  152 gagtgtg 158  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18372424 - 18372342
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 122  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372424 agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4154438 - 4154270
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  4154438 tgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggt 4154340  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 219  Q
    ||| ||||| |||||||||   |||| |||||| ||| |||| |||||||  ||||||| || |||||||    
T  4154339 aagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgggtggtccccgagactcccct 4154270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 140  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  54 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 150  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  151 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  60 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  55 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 154  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 182
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274907
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995392
Alignment:
Q  127 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||  ||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctc-gtgac 20995399  T
Q  227 ccaacat 233  Q
    |||||||    
T  20995398 ccaacat 20995392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991920
Alignment:
Q  53 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aa 151  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggttaa 40991855  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 217  Q
    || |||||||||   ||  | |||||||||| ||||| | | ||||||| | ||||||||||||||    
T  40991856 ga-tgtggtgtccaactcacctgtgtggttgctctaggcccaatgtggatgatcccctaggctccc 40991920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  144 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18372539 - 18372485
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 94  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372539 agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 188
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  131 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 188  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037944
Alignment:
Q  161 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaaca 232  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaaca 3037944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  86 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  104 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 191  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372288
Alignment:
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggt 18372288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  121 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 149
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  108 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 82  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 514
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 147
Alignment:
Q  40 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| |    
T  310 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--acttta 215  T
Q  140 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 gg-tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1083
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 1163  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 232  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||    
T  1162 gagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc-cagtgacccaaca 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  97 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 3092
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3143 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 199
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  149 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 199
Target Start/End: Original strand, 5777 - 5931
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  5777 tgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattt 5876  T
Q  145 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 199  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5877 tgagtaagagtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47518
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 208  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 5357 - 5477
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  5357 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggat 5456  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttg 170  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5457 aagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  150 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17614 - 17496
Alignment:
Q  50 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg--ttttgg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  17614 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgg 17515  T
Q  148 gtaagagtgtggtgtctct 166  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17514 gtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaa 39556  T
Q  152 gagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 182  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 175
Target Start/End: Original strand, 39840 - 39963
Alignment:
Q  52 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| ||| ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| |||    
T  39840 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaattttggttaa 39939  T
Q  152 gagtgtggtgtctctcttgcttgt 175  Q
     | |||||||||||||| ||||||    
T  39940 aaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 128
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  44 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 128  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  88 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 128  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University