View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12611_low_59 (Length: 250)

Name: NF12611_low_59
Description: NF12611
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12611_low_59
NF12611_low_59
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (37-238)||(14422697-14422898)
chr8 (42-238)||(18594536-18594732)
chr8 (42-238)||(39206585-39206781)
chr8 (41-238)||(29938059-29938256)
chr8 (45-238)||(13110406-13110599)
chr8 (47-238)||(2042536-2042727)
chr8 (41-235)||(35118046-35118240)
chr8 (42-235)||(10836770-10836963)
chr8 (42-238)||(6144285-6144481)
chr8 (42-238)||(22260642-22260838)
chr8 (42-238)||(24113178-24113374)
chr8 (48-238)||(34679469-34679659)
chr8 (37-238)||(4035841-4036042)
chr8 (46-238)||(144397-144589)
chr8 (42-238)||(33278399-33278595)
chr8 (42-238)||(39218776-39218972)
chr8 (43-238)||(34842377-34842572)
chr8 (45-238)||(34998908-34999101)
chr8 (39-238)||(38167167-38167366)
chr8 (40-235)||(41575510-41575705)
chr8 (42-238)||(7774763-7774959)
chr8 (44-238)||(7791412-7791606)
chr8 (37-238)||(44804956-44805157)
chr8 (38-234)||(8021714-8021902)
chr8 (42-235)||(7811994-7812187)
chr8 (41-238)||(5320562-5320759)
chr8 (42-235)||(36491156-36491349)
chr8 (42-199)||(40117903-40118060)
chr8 (45-238)||(28639280-28639475)
chr8 (42-199)||(33287076-33287233)
chr8 (47-235)||(42571598-42571783)
chr8 (42-182)||(26783801-26783941)
chr8 (46-238)||(66191-66384)
chr8 (122-238)||(9807339-9807455)
chr8 (42-194)||(2322068-2322220)
chr8 (45-194)||(39220258-39220407)
chr8 (48-171)||(5005171-5005294)
chr8 (45-130)||(9806875-9806960)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (37-238)||(26946888-26947089)
chr6 (42-238)||(2837544-2837740)
chr6 (42-238)||(6086611-6086807)
chr6 (37-238)||(30691845-30692046)
chr6 (42-238)||(3347535-3347731)
chr6 (42-238)||(26704351-26704547)
chr6 (39-238)||(20726787-20726982)
chr6 (45-238)||(17261085-17261278)
chr6 (39-234)||(3955782-3955977)
chr6 (37-238)||(9459557-9459758)
chr6 (42-238)||(21893454-21893650)
chr6 (42-238)||(18613537-18613733)
chr6 (42-235)||(16307023-16307216)
chr6 (46-238)||(34887304-34887496)
chr6 (42-238)||(11167239-11167435)
chr6 (42-229)||(35198283-35198469)
chr6 (53-238)||(1153603-1153788)
chr6 (45-238)||(28199520-28199714)
chr6 (42-206)||(52835-52999)
chr6 (47-238)||(30698941-30699132)
chr6 (113-238)||(33464399-33464524)
chr6 (136-238)||(53001-53103)
chr6 (45-121)||(33463703-33463779)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (42-238)||(22963-23159)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (42-238)||(1579036-1579232)
chr5 (42-238)||(1605583-1605779)
chr5 (37-234)||(9008073-9008270)
chr5 (42-235)||(27420858-27421051)
chr5 (47-238)||(16737459-16737650)
chr5 (42-238)||(27679181-27679377)
chr5 (45-238)||(16069356-16069549)
chr5 (46-238)||(24105683-24105875)
chr5 (42-238)||(33491208-33491404)
chr5 (48-238)||(3386498-3386688)
chr5 (42-246)||(4120937-4121141)
chr5 (45-238)||(3921584-3921777)
chr5 (42-238)||(8374351-8374546)
chr5 (42-234)||(38598466-38598658)
chr5 (49-238)||(1165613-1165802)
chr5 (42-235)||(33991140-33991333)
chr5 (42-238)||(19358526-19358722)
chr5 (42-238)||(20992158-20992354)
chr5 (46-238)||(31883148-31883340)
chr5 (39-234)||(5202969-5203164)
chr5 (37-235)||(35782659-35782857)
chr5 (41-238)||(31410475-31410672)
chr5 (41-235)||(26602957-26603141)
chr5 (87-238)||(27025001-27025152)
chr5 (37-177)||(20992354-20992498)
chr5 (50-183)||(33284642-33284775)
chr5 (33-194)||(25634573-25634732)
chr5 (192-238)||(35420436-35420482)
chr5 (79-178)||(31638182-31638281)
chr5 (108-161)||(41818552-41818605)
chr5 (79-176)||(19516044-19516141)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (39-235)||(38856084-38856280)
chr3 (37-234)||(25999377-25999574)
chr3 (42-238)||(37698141-37698337)
chr3 (42-235)||(42307906-42308099)
chr3 (37-235)||(15520143-15520341)
chr3 (34-238)||(8042593-8042797)
chr3 (42-238)||(22174988-22175184)
chr3 (42-238)||(46452160-46452356)
chr3 (33-238)||(25494283-25494488)
chr3 (42-238)||(29445482-29445678)
chr3 (42-238)||(50528923-50529119)
chr3 (45-238)||(32244117-32244310)
chr3 (42-238)||(20842346-20842542)
chr3 (42-238)||(24835697-24835893)
chr3 (48-238)||(21581042-21581232)
chr3 (42-238)||(15520630-15520826)
chr3 (42-238)||(54870172-54870368)
chr3 (43-238)||(20699144-20699339)
chr3 (42-238)||(35226441-35226637)
chr3 (42-238)||(38933940-38934135)
chr3 (42-238)||(54534326-54534520)
chr3 (36-235)||(12117659-12117858)
chr3 (48-235)||(44609334-44609521)
chr3 (45-238)||(32359256-32359449)
chr3 (41-232)||(26122807-26122998)
chr3 (42-240)||(34700335-34700533)
chr3 (52-238)||(42104969-42105155)
chr3 (42-238)||(2895179-2895379)
chr3 (41-238)||(44688759-44688950)
chr3 (70-237)||(16354368-16354535)
chr3 (48-238)||(48925001-48925189)
chr3 (42-238)||(53028219-53028407)
chr3 (43-200)||(35643212-35643369)
chr3 (48-182)||(50529827-50529961)
chr3 (36-176)||(49128037-49128177)
chr3 (71-238)||(12915930-12916096)
chr3 (162-238)||(24366143-24366219)
chr3 (169-246)||(13696914-13696991)
chr3 (1-41)||(32732618-32732658)
chr3 (202-235)||(50528883-50528916)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (34-238)||(31517227-31517431)
chr2 (42-238)||(33906059-33906255)
chr2 (42-238)||(18806896-18807092)
chr2 (39-235)||(3873259-3873455)
chr2 (42-235)||(26323201-26323394)
chr2 (42-230)||(1108277-1108464)
chr2 (42-238)||(39635449-39635645)
chr2 (45-238)||(4016039-4016232)
chr2 (42-235)||(4232157-4232350)
chr2 (45-238)||(28329851-28330042)
chr2 (46-238)||(42937720-42937913)
chr2 (42-238)||(5733396-5733592)
chr2 (42-238)||(6174840-6175036)
chr2 (34-235)||(19901153-19901353)
chr2 (46-238)||(1482915-1483106)
chr2 (42-238)||(30270691-30270887)
chr2 (46-236)||(16588790-16588980)
chr2 (42-238)||(2178781-2178977)
chr2 (59-238)||(19383947-19384126)
chr2 (45-238)||(850997-851190)
chr2 (44-194)||(30420223-30420373)
chr2 (49-238)||(16066306-16066495)
chr2 (41-235)||(429812-430006)
chr2 (43-238)||(44947561-44947749)
chr2 (42-194)||(42446625-42446777)
chr2 (43-187)||(22101210-22101353)
chr2 (46-194)||(3585291-3585439)
chr2 (38-178)||(12517256-12517395)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (42-238)||(24792334-24792530)
chr7 (42-238)||(43067975-43068171)
chr7 (44-235)||(7164184-7164375)
chr7 (37-238)||(33359092-33359293)
chr7 (35-235)||(22649699-22649899)
chr7 (42-238)||(30181026-30181222)
chr7 (42-238)||(12101180-12101376)
chr7 (42-238)||(42964998-42965194)
chr7 (43-238)||(20346487-20346682)
chr7 (45-238)||(3511324-3511517)
chr7 (41-238)||(25748484-25748681)
chr7 (37-238)||(42204147-42204349)
chr7 (35-238)||(15655903-15656106)
chr7 (36-238)||(5280852-5281054)
chr7 (37-238)||(12097592-12097793)
chr7 (42-238)||(933283-933479)
chr7 (46-238)||(4477323-4477515)
chr7 (47-238)||(1803029-1803220)
chr7 (42-238)||(6394749-6394945)
chr7 (42-238)||(33846531-33846722)
chr7 (36-233)||(4347265-4347462)
chr7 (49-238)||(43156718-43156907)
chr7 (42-234)||(32041540-32041732)
chr7 (42-238)||(36890832-36891027)
chr7 (46-238)||(42673467-42673655)
chr7 (45-238)||(9452591-9452784)
chr7 (43-231)||(8630665-8630853)
chr7 (47-238)||(38866547-38866738)
chr7 (39-238)||(17753595-17753794)
chr7 (45-238)||(46891341-46891535)
chr7 (44-235)||(46134309-46134500)
chr7 (79-238)||(48865665-48865827)
chr7 (37-238)||(16894509-16894700)
chr7 (42-238)||(43021582-43021774)
chr7 (42-189)||(19828268-19828415)
chr7 (42-139)||(37704978-37705075)
chr7 (37-194)||(37005857-37006014)
chr7 (37-194)||(43405013-43405170)
chr7 (49-133)||(27691433-27691517)
chr7 (42-194)||(15655458-15655610)
chr7 (39-194)||(30075277-30075429)
chr7 (40-187)||(36849590-36849737)
chr7 (49-178)||(20163824-20163953)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (42-246)||(1168500-1168704)
chr1 (42-238)||(1940759-1940955)
chr1 (42-238)||(25897371-25897567)
chr1 (42-238)||(33510481-33510677)
chr1 (42-238)||(39260358-39260554)
chr1 (44-238)||(26663257-26663451)
chr1 (48-238)||(29078519-29078709)
chr1 (37-238)||(20089463-20089664)
chr1 (42-238)||(16052093-16052289)
chr1 (42-238)||(26580282-26580478)
chr1 (42-238)||(52753159-52753355)
chr1 (45-238)||(46760966-46761159)
chr1 (48-236)||(38829072-38829260)
chr1 (42-234)||(41928511-41928703)
chr1 (42-238)||(52696788-52696984)
chr1 (36-238)||(42370807-42371009)
chr1 (45-246)||(8079713-8079914)
chr1 (42-238)||(29288146-29288340)
chr1 (41-238)||(970536-970735)
chr1 (42-238)||(1170456-1170652)
chr1 (46-238)||(43905655-43905847)
chr1 (42-238)||(32671576-32671772)
chr1 (42-234)||(40092488-40092680)
chr1 (44-238)||(5215384-5215578)
chr1 (37-238)||(12682812-12683013)
chr1 (42-235)||(13996738-13996931)
chr1 (45-238)||(19715173-19715366)
chr1 (42-238)||(2347653-2347850)
chr1 (45-238)||(2473722-2473915)
chr1 (42-238)||(17591688-17591881)
chr1 (46-238)||(8120870-8121062)
chr1 (41-238)||(51359229-51359425)
chr1 (39-234)||(15203106-15203301)
chr1 (42-238)||(15554164-15554352)
chr1 (46-238)||(46409436-46409630)
chr1 (39-235)||(23498454-23498650)
chr1 (45-238)||(7145207-7145400)
chr1 (46-232)||(49146173-49146359)
chr1 (61-238)||(17587517-17587694)
chr1 (47-238)||(15717787-15717977)
chr1 (34-238)||(6765448-6765652)
chr1 (79-238)||(40149497-40149656)
chr1 (43-211)||(29695673-29695842)
chr1 (46-238)||(38171833-38172012)
chr1 (42-174)||(52086264-52086396)
chr1 (58-193)||(23322897-23323032)
chr1 (42-194)||(5217840-5217991)
chr1 (37-116)||(5675097-5675176)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (44-235)||(1756767-1756958)
chr4 (40-238)||(19913630-19913828)
chr4 (42-234)||(23776463-23776655)
chr4 (42-238)||(50055101-50055297)
chr4 (42-238)||(54189542-54189738)
chr4 (43-246)||(11639570-11639773)
chr4 (39-236)||(38055151-38055348)
chr4 (42-238)||(27488648-27488844)
chr4 (42-238)||(50353798-50353994)
chr4 (42-238)||(53717464-53717660)
chr4 (45-238)||(20877047-20877240)
chr4 (42-246)||(23704201-23704405)
chr4 (42-238)||(28032712-28032908)
chr4 (37-238)||(31969673-31969874)
chr4 (45-238)||(35490773-35490966)
chr4 (42-238)||(2481408-2481604)
chr4 (42-238)||(6611360-6611556)
chr4 (42-238)||(14987789-14987985)
chr4 (42-238)||(15241028-15241224)
chr4 (46-238)||(43289960-43290152)
chr4 (42-238)||(44784917-44785113)
chr4 (42-238)||(45424534-45424730)
chr4 (43-238)||(40428720-40428915)
chr4 (39-238)||(52139197-52139396)
chr4 (44-238)||(54412627-54412821)
chr4 (46-238)||(16700782-16700974)
chr4 (42-238)||(48909843-48910039)
chr4 (45-238)||(1617084-1617277)
chr4 (42-238)||(6688627-6688817)
chr4 (45-238)||(30423565-30423757)
chr4 (42-238)||(37464718-37464914)
chr4 (43-238)||(47632032-47632228)
chr4 (42-238)||(27536104-27536296)
chr4 (43-238)||(37968757-37968952)
chr4 (40-238)||(8591092-8591290)
chr4 (42-238)||(53353052-53353256)
chr4 (37-238)||(8932178-8932379)
chr4 (46-238)||(19164973-19165164)
chr4 (42-238)||(15669180-15669376)
chr4 (46-238)||(53875658-53875850)
chr4 (42-238)||(44379187-44379383)
chr4 (41-238)||(33703837-33704034)
chr4 (49-235)||(40680041-40680227)
chr4 (49-238)||(27583632-27583821)
chr4 (46-238)||(30171581-30171773)
chr4 (42-246)||(55344817-55345021)
chr4 (44-238)||(44375844-44376038)
chr4 (48-216)||(28360433-28360602)
chr4 (42-194)||(50053440-50053592)
chr4 (54-234)||(38071327-38071504)
chr4 (80-238)||(16703856-16704014)
chr4 (122-238)||(23269046-23269162)
chr4 (45-130)||(23265865-23265950)
chr4 (42-194)||(44548185-44548338)
chr4 (163-238)||(53408137-53408213)
chr4 (52-194)||(17493340-17493482)
chr4 (111-193)||(51780763-51780845)
chr4 (187-238)||(23261886-23261937)
chr4 (147-238)||(9595902-9595982)
chr4 (184-238)||(48748197-48748251)
chr4 (201-238)||(50055301-50055338)
chr4 (132-189)||(55344724-55344781)
chr4 (42-98)||(9595975-9596030)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (42-238)||(36702-36898)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (43-246)||(3708-3911)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (42-238)||(18-214)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (42-238)||(10235-10431)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (45-238)||(145257-145450)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (44-238)||(307-501)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (45-238)||(18-212)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 14422697 - 14422898
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422697 attatggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 14422796  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422797 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 14422896  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  14422897 tt 14422898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 18594536 - 18594732
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18594536 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 18594635  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594636 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18594732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 39206585 - 39206781
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39206585 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 39206684  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206685 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 39206781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 29938059 - 29938256
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  29938059 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatc 29938158  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938159 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 29938256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110599
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctcctt 13110599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042536
Alignment:
Q  47 cgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  147 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2042536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35118240 - 35118046
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35118240 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 35118141  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35118140 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctc 35118046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10836963 - 10836770
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10836963 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 10836864  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836863 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 10836770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6144481 - 6144285
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6144481 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6144382  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144381 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 6144285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22260838 - 22260642
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||      
T  22260838 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcc 22260739  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260738 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 22260642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24113374 - 24113178
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  24113374 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatca 24113275  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113274 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 24113178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679469
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  148 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34679559 cataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 34679469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 4035841 - 4036042
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4035841 attaaggccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagct 4035940  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035941 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 4036040  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  4036041 tt 4036042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144589
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144497 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 144589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 33278399 - 33278595
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  33278399 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33278498  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278499 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33278595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 39218776 - 39218972
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  39218776 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatca 39218875  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  39218876 tagcttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctcctt 39218972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34842572 - 34842377
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  34842572 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 34842473  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34842472 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctcctt 34842377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34999101 - 34998908
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34999101 cccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttag 34999002  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34999001 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctcctt 34998908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38167366 - 38167167
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  38167366 tatggccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagttta 38167267  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38167266 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcctt 38167167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 235
Target Start/End: Original strand, 41575510 - 41575705
Alignment:
Q  40 atggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41575510 atggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttat 41575609  T
Q  140 tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575610 catagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 41575705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 7774763 - 7774959
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7774763 ggcctcgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 7774862  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774863 tagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 7774959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 7791412 - 7791606
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  7791412 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 7791511  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791512 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 7791606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44805157 - 44804956
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44805157 attatggcctcatttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagct 44805058  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805057 tatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 44804958  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  44804957 tt 44804956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Original strand, 8021714 - 8021902
Alignment:
Q  38 ttatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8021714 ttatggtcccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagttt 8021813  T
Q  138 attatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8021814 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacct 8021902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Original strand, 7811994 - 7812187
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || | ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7811994 ggccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 7812093  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7812094 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 7812187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 5320562 - 5320759
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||     
T  5320562 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatc 5320661  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5320662 atagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 5320759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Original strand, 36491156 - 36491349
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36491156 ggccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 36491255  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36491256 tagtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctc 36491349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40118060 - 40117903
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40118060 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 40117961  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40117960 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 28639280 - 28639475
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccata----agcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  28639280 cccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatc 28639379  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28639380 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacctcctt 28639475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33287233 - 33287076
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  33287233 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33287134  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287133 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 33287076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 235
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571783
Alignment:
Q  47 cgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  147 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42571697 tcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctc 42571783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26783941 - 26783801
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26783941 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatca 26783842  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26783841 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 66384 - 66191
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || | | |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  66384 ccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagt 66285  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccc-tccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  66284 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctcctt 66191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807455
Alignment:
Q  122 taaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 221  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  222 atttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||| |||||||||    
T  9807439 atttatgaaacctcctt 9807455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2322220 - 2322068
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  2322220 ggccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatca 2322121  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
     | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2322120 caatttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220407
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |     
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaa 39220357  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  39220358 tttcataagctgctcatactatattttaataagctcaaattttgagctta 39220407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 171
Target Start/End: Original strand, 5005171 - 5005294
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || | |    
T  5005171 gtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactct 5005270  T
Q  148 cataagctgcttatgccatatttt 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  5005271 cataaactgcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 130
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26947089 - 26946888
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26947089 attagggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 26946990  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946989 tatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 26946890  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  26946889 tt 26946888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 2837544 - 2837740
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2837544 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 2837643  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837644 tagtttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2837740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6086807 - 6086611
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6086807 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6086708  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086707 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 6086611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 30691845 - 30692046
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691845 attagggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 30691944  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691945 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 30692044  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  30692045 tt 30692046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3347731 - 3347535
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  3347731 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatca 3347632  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347631 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 3347535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26704547 - 26704351
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26704547 ggccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26704448  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704447 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 26704351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Original strand, 20726787 - 20726982
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||    
T  20726787 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataactta 20726882  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726883 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 20726982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17261278 - 17261085
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17261278 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatat 17261179  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17261178 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctcctt 17261085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3955977 - 3955782
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955977 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 3955878  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955877 tcatagtttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 3955782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 9459557 - 9459758
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9459557 attagggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 9459656  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9459657 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctcc 9459756  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  9459757 tt 9459758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 21893454 - 21893650
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21893454 ggccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatca 21893553  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893554 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 21893650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 18613537 - 18613733
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18613537 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 18613636  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613637 tagttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18613733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16307216 - 16307023
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  16307216 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatca 16307117  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307116 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 16307023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887304
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctcctt 34887304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 11167239 - 11167435
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11167239 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 11167338  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167339 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 11167435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 35198283 - 35198469
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35198283 ggccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 35198381  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35198382 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgt 35198469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 238
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153788
Alignment:
Q  53 gattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataa 152  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  153 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1153703 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctcctt 1153788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28199714 - 28199520
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatc---tactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28199714 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 28199616  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199615 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 28199520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 52835 - 52999
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52835 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 52934  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52935 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 52999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30698941
Alignment:
Q  47 cgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtt 146  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||| || |||||| || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  147 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30699032 ttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 30698941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 113 - 238
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464524
Alignment:
Q  113 ttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 212  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  213 agcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacctcctt 33464524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53103
Alignment:
Q  136 ttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  236 ctt 238  Q
    |||    
T  53101 ctt 53103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 121
Target Start/End: Original strand, 33463703 - 33463779
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463703 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23159 - 22963
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23159 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23060  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23059 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 22963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 1579036 - 1579232
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1579036 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 1579135  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579136 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1579232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1605779 - 1605583
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1605779 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 1605680  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605679 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1605583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9008270 - 9008073
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008270 attaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 9008171  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008170 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 9008073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Original strand, 27420858 - 27421051
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  27420858 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatca 27420957  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27420958 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 27421051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737459
Alignment:
Q  47 cgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtt 146  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  147 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 16737459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27679377 - 27679181
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27679377 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 27679278  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27679277 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 27679181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 16069356 - 16069549
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16069356 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 16069455  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069456 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 16069549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24105875 - 24105683
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24105875 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 24105776  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105775 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 24105683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33491404 - 33491208
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33491404 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33491305  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491304 tagtttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33491208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386498
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  148 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3386588 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctcctt 3386498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 246
Target Start/End: Original strand, 4120937 - 4121141
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |    
T  4120937 ggccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatca 4121036  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4121037 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttga 4121136  T
Q  242 ttctc 246  Q
    |||||    
T  4121137 ttctc 4121141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 3921584 - 3921777
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3921584 cccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 3921683  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921684 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 3921777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8374546 - 8374351
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  8374546 ggccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 8374447  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8374446 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctcctt 8374351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38598658 - 38598466
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  38598658 ggcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatca 38598559  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598558 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 38598466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165613
Alignment:
Q  49 tttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttc 148  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  149 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165702 ataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1165613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Original strand, 33991140 - 33991333
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33991140 ggccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33991239  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991240 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 33991333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 19358526 - 19358722
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19358526 ggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 19358625  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19358626 tagtttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 19358722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20992354 - 20992158
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20992354 ggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatca 20992255  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20992254 tagtttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccccctt 20992158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 31883148 - 31883340
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31883148 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 31883247  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883248 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 31883340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 234
Target Start/End: Original strand, 5202969 - 5203164
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5202969 tatggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 5203068  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5203069 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcacct 5203164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35782857 - 35782659
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782857 attaaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 35782758  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782757 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctta-caaggagcttatgaatttatgtaacctc 35782659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 31410475 - 31410672
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  31410475 tggccgcgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatc 31410574  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31410575 atagttttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctcctt 31410672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26603141 - 26602957
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26603141 tggccccgtttggattggcttattttga----------gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 26603052  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603051 atagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 26602957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025152
Alignment:
Q  87 actcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattt 186  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattt 27025100  T
Q  187 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27025101 tcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctcctt 27025152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20992498 - 20992354
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttat----atgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 132  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992498 attaaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 20992399  T
Q  133 agcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 177  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992398 agcatatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284642
Alignment:
Q  50 ttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttca 149  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  150 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaa 183  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284675 taaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Original strand, 25634573 - 25634732
Alignment:
Q  33 ttatattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 132  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||  | | |||||||||  |||||||  ||| |||   ||||||||||||||   |||||    
T  25634573 ttatatttaggccccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataat--aaaat 25634670  T
Q  133 agcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
    ||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  25634671 agcttataacaatttcataagccgcttataccatattttaataaaccataattttgagctta 25634732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420436
Alignment:
Q  192 ttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 35420436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 178
Target Start/End: Original strand, 31638182 - 31638281
Alignment:
Q  79 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 178  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||| | | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31638182 gcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataagcttcttatgtcatattttaataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  108 ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttat 161  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19516141 - 19516044
Alignment:
Q  79 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataa 176  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  19516141 gcttatctattaacataagtctttttaacggcgtttggacaaagtaataaaaatagcttatatcaatttcataaactgcttatgtaatattttaataa 19516044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Original strand, 38856084 - 38856280
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856084 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 38856183  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856184 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 38856280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 25999377 - 25999574
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999377 attatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 25999476  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999477 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 25999574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37698337 - 37698141
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37698337 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 37698238  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698237 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 37698141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42308099 - 42307906
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42308099 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 42308000  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307999 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 42307906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15520341 - 15520143
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15520341 attaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataact 15520242  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520241 tatcatcgtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 15520143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 238
Target Start/End: Original strand, 8042593 - 8042797
Alignment:
Q  34 tatattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 133  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8042593 tatattaaggccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaata 8042692  T
Q  134 gcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 233  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042693 gtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 8042792  T
Q  234 tcctt 238  Q
    |||||    
T  8042793 tcctt 8042797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22175184 - 22174988
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22175184 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 22175085  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175084 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 22174988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 46452356 - 46452160
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  46452356 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 46452257  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452256 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 46452160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25494488 - 25494283
Alignment:
Q  33 ttatattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494488 ttatactatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 25494389  T
Q  133 agcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25494388 agcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaac 25494289  T
Q  233 ctcctt 238  Q
    ||||||    
T  25494288 ctcctt 25494283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 29445482 - 29445678
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29445482 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 29445581  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445582 tagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 29445678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 50528923 - 50529119
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50528923 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 50529022  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50529023 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcctt 50529119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 32244117 - 32244310
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32244117 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 32244216  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244217 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 32244310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20842542 - 20842346
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  20842542 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatca 20842443  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842442 tagtttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 20842346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24835893 - 24835697
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24835893 ggccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatta 24835794  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24835793 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactcctt 24835697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581232
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  148 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21581142 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatcctt 21581232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 15520630 - 15520826
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  15520630 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 15520729  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15520730 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctcctt 15520826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 54870368 - 54870172
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54870368 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 54870269  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870268 tcgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 54870172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Original strand, 20699144 - 20699339
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  20699144 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 20699243  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20699244 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctcctt 20699339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 35226441 - 35226637
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  35226441 ggccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatca 35226540  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226541 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 35226637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 38933940 - 38934135
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38933940 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 38934038  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934039 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 38934135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 54534520 - 54534326
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54534520 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 54534421  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54534420 tggttt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 54534326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12117858 - 12117659
Alignment:
Q  36 tattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 135  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12117858 tattaaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagt 12117759  T
Q  136 ttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117758 ttatcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 12117659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44609521 - 44609334
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44609521 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 44609422  T
Q  148 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44609421 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctc 44609334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 32359256 - 32359449
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32359256 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatag 32359355  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32359356 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 32359449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 232
Target Start/End: Original strand, 26122807 - 26122998
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  26122807 tggcccagtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 26122906  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26122907 atagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaac 26122998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 240
Target Start/End: Original strand, 34700335 - 34700533
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  34700335 ggccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatca 34700434  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34700435 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcctttg 34700533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42105155 - 42104969
Alignment:
Q  52 ggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcata 151  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42105155 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcata 42105056  T
Q  152 agctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105055 agctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42104969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 2895179 - 2895379
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  2895179 ggccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatca 2895278  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct----tatgaatttatgtaacctcct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||    
T  2895279 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctcct 2895378  T
Q  238 t 238  Q
    |    
T  2895379 t 2895379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 44688759 - 44688950
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||      ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  44688759 tggccccgtttgaattggcttatg-----cttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatc 44688853  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44688854 atagtttcataagctgcttatg-catattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctcctt 44688950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Original strand, 16354368 - 16354535
Alignment:
Q  70 cttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatatt 169  Q
    |||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16354368 cttatatgagattatctacactcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgtt 16354467  T
Q  170 ttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354468 ttaataagcctaaattttcagcttatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 16354535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48925001
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  148 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48925091 cataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 48925001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 53028219 - 53028407
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        ||||||||||||||||||||| |    
T  53028219 ggccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatca 53028310  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028311 tattttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 53028407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Original strand, 35643212 - 35643369
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35643212 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35643311  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35643312 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccctcc 35643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529827
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  148 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50529861 cataagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Original strand, 49128037 - 49128177
Alignment:
Q  36 tattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 135  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  49128037 tattaaggccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataac 49128136  T
Q  136 ttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataa 176  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49128137 ttatcgtaatttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 238
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916096
Alignment:
Q  71 ttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattt 170  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttactcc-ataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatattt 12916028  T
Q  171 taataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12916029 aaataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaaccccctt 12916096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 238
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366219
Alignment:
Q  162 gccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 24366219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696991
Alignment:
Q  169 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgcttctc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctc 13696991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 32732618 - 32732658
Alignment:
Q  1 ccaaactttattccactgtgtcggctacatcattatattat 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32732618 ccaaactttattccactgtgtcggctacatcattatattat 32732658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528883
Alignment:
Q  202 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 50528883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31517431 - 31517227
Alignment:
Q  34 tatattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517431 tataatatggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 31517332  T
Q  134 gcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 233  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31517331 gcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacc 31517232  T
Q  234 tcctt 238  Q
    |||||    
T  31517231 tcctt 31517227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33906255 - 33906059
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33906255 ggccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33906156  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906155 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33906059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18807092 - 18806896
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18807092 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 18806993  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806992 tagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18806896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3873455 - 3873259
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3873455 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagctta 3873356  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3873355 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctc 3873259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26323394 - 26323201
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  26323394 ggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatca 26323295  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323294 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 26323201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 1108277 - 1108464
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1108277 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 1108375  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108376 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 39635449 - 39635645
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  39635449 ggccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatca 39635548  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39635549 tagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctcctt 39635645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016232
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 4016232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4232350 - 4232157
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4232350 ggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 4232251  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4232250 tagtttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctc 4232157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329851
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctcctt 28329851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 42937720 - 42937913
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42937720 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 42937819  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaat-aagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937820 ttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42937913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 5733396 - 5733592
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |    
T  5733396 ggccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatca 5733495  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5733496 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 5733592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6175036 - 6174840
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  6175036 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 6174937  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6174936 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctcctt 6174840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19901353 - 19901153
Alignment:
Q  34 tatattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19901353 tatattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaata 19901255  T
Q  134 gcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19901254 gcttatcatagtttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 19901155  T
Q  234 tc 235  Q
    ||    
T  19901154 tc 19901153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1483106 - 1482915
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1483106 ccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgt 1483008  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1483007 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatcctt 1482915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30270887 - 30270691
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||| |    
T  30270887 ggccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatca 30270788  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30270787 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 30270691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16588980 - 16588790
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588980 ccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 16588881  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16588880 ttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctcc 16588790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2178977 - 2178781
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2178977 ggccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 2178878  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178877 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2178781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 59 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19384126 - 19383947
Alignment:
Q  59 cttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgct 158  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |    
T  19384126 cttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgtt 19384027  T
Q  159 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384026 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 19383947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851190
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||     
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851097 ttttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 851190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30420373 - 30420223
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30420373 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30420274  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420273 ggttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 30420223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066306
Alignment:
Q  49 tttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttc 148  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  149 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 16066306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Original strand, 429812 - 430006
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  429812 tggctccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 429911  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  429912 ataatttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 430006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44947749 - 44947561
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  44947749 gccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 44947650  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44947649 agtttcataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctcctt 44947561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42446777 - 42446625
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |    
T  42446777 ggccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatca 42446678  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  42446677 caatttcataagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22101353 - 22101210
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||| |||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||| |     
T  22101353 gccccgtttgaattgggttattcagaatttatgtggt-ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcac 22101255  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 187  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22101254 aatttcataagctgcttatgtcatattttaataagcccaaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 194
Target Start/End: Original strand, 3585291 - 3585439
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    |||||||||| ||||||||   | ||||| |||  ||||| |||  ||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |  |||| | | |    
T  3585291 ccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaat 3585390  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  3585391 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12517395 - 12517256
Alignment:
Q  38 ttatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 137  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||   |||||| ||  |||| |||||||| ||  | ||| |||| |||||    
T  12517395 ttatgggcctgtttggattggcttattta-agcttatgtgagcttatctactaaaataagctttcctaaaagtgtttggataccttaattaaaagagctt 12517297  T
Q  138 attatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 178  Q
    ||  || |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  12517296 atcctaatttcataagcagcttaagcaatattttaacaagc 12517256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24792530 - 24792334
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24792530 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 24792431  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792430 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 24792334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43068171 - 43067975
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43068171 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 43068072  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068071 tagtttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 43067975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 235
Target Start/End: Original strand, 7164184 - 7164375
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7164184 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 7164283  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164284 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 7164375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33359293 - 33359092
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359293 attatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 33359194  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359193 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 33359094  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  33359093 tt 33359092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22649899 - 22649699
Alignment:
Q  35 atattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649899 atattatggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 22649800  T
Q  135 cttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649799 tttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 22649700  T
Q  235 c 235  Q
    |    
T  22649699 c 22649699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30181222 - 30181026
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30181222 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 30181123  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30181122 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaaccccctt 30181026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12101376 - 12101180
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12101376 ggccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 12101277  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101276 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 12101180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42965194 - 42964998
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42965194 ggccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 42965095  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965094 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42964998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Original strand, 20346487 - 20346682
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  20346487 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 20346586  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20346587 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctcctt 20346682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 3511324 - 3511517
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3511324 cccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatag 3511423  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511424 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 3511517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 25748484 - 25748681
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25748484 tggccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 25748583  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748584 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 25748681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 42204147 - 42204349
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42204147 attaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagc 42204246  T
Q  136 ttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42204247 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctc 42204346  T
Q  236 ctt 238  Q
    |||    
T  42204347 ctt 42204349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 15655903 - 15656106
Alignment:
Q  35 atattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15655903 atattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacag 15656002  T
Q  135 cttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15656003 cttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacct 15656102  T
Q  235 cctt 238  Q
    ||||    
T  15656103 cctt 15656106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 5280852 - 5281054
Alignment:
Q  36 tattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 135  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5280852 tattaaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 5280951  T
Q  136 ttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280952 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 5281051  T
Q  236 ctt 238  Q
    |||    
T  5281052 ctt 5281054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12097793 - 12097592
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12097793 attagggccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagat 12097694  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097693 tatcatagtttcataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 12097594  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  12097593 tt 12097592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 933283 - 933479
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  933283 ggccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 933382  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933383 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 933479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477323
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4477415 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 4477323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803220
Alignment:
Q  47 cgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtt 146  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  147 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcctt 1803220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 6394749 - 6394945
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  6394749 ggccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 6394848  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6394849 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 6394945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33846722 - 33846531
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33846722 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33846623  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846622 tagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33846531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Original strand, 4347265 - 4347462
Alignment:
Q  36 tattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 135  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347265 tattaaggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 4347364  T
Q  136 ttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 233  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347365 ttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 4347462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156907
Alignment:
Q  49 tttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttc 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  149 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  43156818 ataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctcctt 43156907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Original strand, 32041540 - 32041732
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32041540 ggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 32041639  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32041640 tagtttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacct 32041732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36891027 - 36890832
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36891027 ggccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 36890929  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890928 tagtttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 36890832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 42673467 - 42673655
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||    
T  42673467 ccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatagt 42673562  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673563 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42673655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452784
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 9452784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 8630665 - 8630853
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  8630665 gccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcat 8630764  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8630765 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 8630853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866738
Alignment:
Q  47 cgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtt 146  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  147 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866647 tcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 38866738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Original strand, 17753595 - 17753794
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753595 tatgaccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 17753694  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17753695 acatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 17753794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 46891535 - 46891341
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  46891535 cccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcata 46891436  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46891435 gttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctcctt 46891341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46134500 - 46134309
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46134500 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattata 46134401  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46134400 gtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctc 46134309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 79 - 238
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865827
Alignment:
Q  79 gcttatctactcccataagcctttt---taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 48865764  T
Q  176 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865765 agcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 48865827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16894700 - 16894509
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  16894700 attaaggccccgtttggattggcttattttga----------gcttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtt 16894611  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16894610 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatcc 16894511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43021774 - 43021582
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43021774 ggccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttatta 43021675  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021674 tagtttcataagctgcttatggcatatt----tcggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 43021582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 189
Target Start/End: Original strand, 19828268 - 19828415
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  19828268 ggccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatca 19828367  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 189  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828368 tagtttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 139
Target Start/End: Original strand, 37704978 - 37705075
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 139  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704978 ggccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37006014 - 37005857
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  37006014 attaaggctccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagct 37005915  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  37005914 tatcgtaatttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 194
Target Start/End: Original strand, 43405013 - 43405170
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  43405013 attaaggccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagct 43405112  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
    |||  || ||||||||| || || | | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  43405113 tatcgtaatttcataagttgtttctactatattttaataagcccaattttttagctta 43405170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27691517 - 27691433
Alignment:
Q  49 tttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 133  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27691517 tttgaattggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15655610 - 15655458
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  15655610 ggccgcgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttacca 15655511  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
     | ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  15655510 caattttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaattttgagctta 15655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30075429 - 30075277
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || | |||||||||  |||||||| ||| | |   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30075429 tatggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaat-aataaaaatagctta 30075331  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
     |||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30075330 -tata-tttcataaaccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36849737 - 36849590
Alignment:
Q  40 atggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   | ||||| |||| || ||||||  |||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  36849737 atggccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttat 36849638  T
Q  140 tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 187  Q
     | | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  36849637 cacaatttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 178
Target Start/End: Original strand, 20163824 - 20163953
Alignment:
Q  49 tttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttc 148  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |||   ||||| ||||| | || | |||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  20163824 tttggattgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttc 20163923  T
Q  149 ataagctgcttatgccatattttaataagc 178  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20163924 ataagctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 246
Target Start/End: Original strand, 1168500 - 1168704
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1168500 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 1168599  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgc 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  1168600 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttga 1168699  T
Q  242 ttctc 246  Q
    |||||    
T  1168700 ttctc 1168704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1940955 - 1940759
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1940955 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 1940856  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940855 tagtttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1940759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 25897371 - 25897567
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25897371 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25897470  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897471 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 25897567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 33510481 - 33510677
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  33510481 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33510580  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510581 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33510677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39260554 - 39260358
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39260554 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 39260455  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260454 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 39260358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 26663257 - 26663451
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  26663257 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 26663356  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663357 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 26663451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078709
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  148 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 29078709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 20089463 - 20089664
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20089463 attaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 20089562  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089563 tatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 20089662  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  20089663 tt 20089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 16052093 - 16052289
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16052093 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 16052192  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052193 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 16052289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26580478 - 26580282
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26580478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatca 26580379  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580378 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 26580282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52753355 - 52753159
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52753355 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 52753256  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753255 tagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 52753159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761159
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46761066 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttcctt 46761159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829260
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  148 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829172 cataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 38829260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41928703 - 41928511
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  41928703 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 41928604  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928603 tagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 41928511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 52696788 - 52696984
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  52696788 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 52696887  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696888 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 52696984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42371009 - 42370807
Alignment:
Q  36 tattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 135  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  42371009 tattttggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaac 42370910  T
Q  136 ttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370909 ttatcatagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 42370810  T
Q  236 ctt 238  Q
    |||    
T  42370809 ctt 42370807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8079914 - 8079713
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8079914 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8079815  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgcttc 244  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  8079814 tttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattc 8079715  T
Q  245 tc 246  Q
    ||    
T  8079714 tc 8079713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 29288146 - 29288340
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29288146 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 29288245  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29288246 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctcctt 29288340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 970735 - 970536
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat- 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  970735 tggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 970636  T
Q  140 -tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  970635 atatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 970536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1170652 - 1170456
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1170652 ggccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 1170553  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1170552 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcctt 1170456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 43905655 - 43905847
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43905655 ccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43905754  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43905755 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctcctt 43905847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 32671576 - 32671772
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32671576 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 32671675  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32671676 tagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccccctt 32671772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Original strand, 40092488 - 40092680
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40092488 ggccctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatca 40092587  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092588 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 40092680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 5215384 - 5215578
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5215384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 5215483  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215484 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 5215578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 12682812 - 12683013
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682812 attagggccctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 12682911  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12682912 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcc 12683011  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  12683012 tt 12683013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13996931 - 13996738
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  13996931 ggccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataa 13996832  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13996831 tggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctc 13996738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715173
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 19715173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 2347653 - 2347850
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  2347653 ggccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 2347752  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccata-ttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2347753 tagtttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 2347850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 2473722 - 2473915
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2473722 cccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 2473821  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2473822 tttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctcctt 2473915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 17591688 - 17591881
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17591688 ggccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 17591784  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591785 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 17591881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8121062
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 8120969  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120970 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 8121062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51359425 - 51359229
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  51359425 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatc 51359327  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51359326 atagtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcctt 51359229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 234
Target Start/End: Original strand, 15203106 - 15203301
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15203106 tatggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagctta 15203205  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203206 tcatagtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 15203301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15554352 - 15554164
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  15554352 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcat---- 15554257  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
        ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554256 ----ttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 15554164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 46409436 - 46409630
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46409436 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 46409535  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46409536 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 46409630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Original strand, 23498454 - 23498650
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23498454 tatggccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttca 23498553  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23498554 tcatagtttcataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 23498650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 7145207 - 7145400
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttatttt-gaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  7145207 cccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcata 7145305  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145306 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 7145400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 49146173 - 49146359
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  49146173 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 49146272  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49146273 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 49146359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 61 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587517
Alignment:
Q  61 tattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgctta 160  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  161 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 17587517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717977
Alignment:
Q  47 cgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtt 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| | ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtt 15717885  T
Q  147 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15717886 tcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctcctt 15717977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 238
Target Start/End: Original strand, 6765448 - 6765652
Alignment:
Q  34 tatattatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 133  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6765448 tatattaagaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaata 6765547  T
Q  134 gcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 233  Q
    | |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6765548 gtttatcatattttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatc 6765647  T
Q  234 tcctt 238  Q
    |||||    
T  6765648 tcctt 6765652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 238
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149656
Alignment:
Q  79 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataagc 40149596  T
Q  179 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149597 ctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 40149656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Original strand, 29695673 - 29695842
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataa-gcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  29695673 gccctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatca 29695772  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29695773 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 38171833 - 38172012
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  38171833 ccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatagt 38171932  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38171933 ttcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 38172012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 174
Target Start/End: Original strand, 52086264 - 52086396
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |    
T  52086264 ggccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatca 52086363  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaat 174  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52086364 taatttcataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23323032 - 23322897
Alignment:
Q  58 gcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgc 157  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  23323032 gcttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgc 23322933  T
Q  158 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 193  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23322932 ttatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5217991 - 5217840
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||  |||||||  ||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  5217991 ggcctcgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaataa-taaaaatagcttatac 5217893  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
     | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  5217892 caatttcataagccgcttataccatatttttataagccataattttgagctta 5217840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 116
Target Start/End: Original strand, 5675097 - 5675176
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgg 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||    
T  5675097 attaaggccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1756958 - 1756767
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  1756958 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 1756859  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756858 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 1756767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19913828 - 19913630
Alignment:
Q  40 atggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19913828 atggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttat 19913729  T
Q  140 tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913728 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 19913630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23776655 - 23776463
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23776655 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23776556  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23776555 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaacct 23776463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50055297 - 50055101
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  50055297 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatca 50055198  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055197 tggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 50055101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 54189542 - 54189738
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54189542 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 54189641  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189642 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 54189738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11639773 - 11639570
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11639773 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 11639674  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11639673 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgat 11639574  T
Q  243 tctc 246  Q
    ||||    
T  11639573 tctc 11639570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 39 - 236
Target Start/End: Original strand, 38055151 - 38055348
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  38055151 tatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatttta 38055250  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055251 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 38055348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27488844 - 27488648
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27488844 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 27488745  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27488744 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 27488648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 50353798 - 50353994
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50353798 ggccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatga 50353897  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353898 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 50353994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 53717660 - 53717464
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53717660 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 53717561  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717560 tagtttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 53717464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 20877047 - 20877240
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20877047 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 20877146  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20877147 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctcctt 20877240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23704405 - 23704201
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23704405 ggccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 23704306  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgc 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23704305 tagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttga 23704206  T
Q  242 ttctc 246  Q
    |||||    
T  23704205 ttctc 23704201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28032908 - 28032712
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28032908 ggccctgtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 28032809  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28032808 tagtatcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 28032712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 31969673 - 31969874
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    ||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  31969673 attatggtcccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtt 31969772  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969773 tatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 31969872  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  31969873 tt 31969874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35490966 - 35490773
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35490966 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 35490867  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35490866 tttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccacctt 35490773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2481604 - 2481408
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  2481604 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 2481505  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481504 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2481408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6611556 - 6611360
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6611556 ggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6611457  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6611456 tagtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 6611360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 14987789 - 14987985
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14987789 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 14987888  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14987889 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 14987985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15241224 - 15241028
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  15241224 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatca 15241125  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241124 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 15241028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43290152 - 43289960
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43290152 ccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43290053  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290052 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 43289960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44785113 - 44784917
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  44785113 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatca 44785014  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44785013 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 44784917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45424730 - 45424534
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  45424730 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 45424631  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424630 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 45424534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40428915 - 40428720
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40428915 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 40428816  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428815 agtttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 40428720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Original strand, 52139197 - 52139396
Alignment:
Q  39 tatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139197 tatggtcccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 52139296  T
Q  139 ttatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52139297 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcctt 52139396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 54412627 - 54412821
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  54412627 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 54412726  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54412727 gtttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctcctt 54412821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700974
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctcctt 16700974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 48909843 - 48910039
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  48909843 ggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 48909942  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48909943 tagtttcataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 48910039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617277
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1617277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6688817 - 6688627
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6688817 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6688718  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688717 tagttt------ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 6688627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30423757 - 30423565
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30423757 cccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 30423658  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30423657 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctcctt 30423565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 37464718 - 37464914
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  37464718 ggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatca 37464817  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37464818 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 37464914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Original strand, 47632032 - 47632228
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47632032 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctca 47632131  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632132 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 47632228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27536296 - 27536104
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27536296 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 27536201  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536200 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 27536104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37968952 - 37968757
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37968952 gccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 37968853  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37968852 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 37968757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8591290 - 8591092
Alignment:
Q  40 atggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 139  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591290 atggtcccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 8591191  T
Q  140 tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591190 catagtttcataagctgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 8591092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 53353052 - 53353256
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaactta----tatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353052 ggccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 53353151  T
Q  138 attatagtttcataagctgcttatgccatatttta----ataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53353152 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacc 53353251  T
Q  234 tcctt 238  Q
    |||||    
T  53353252 tcctt 53353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8932379 - 8932178
Alignment:
Q  37 attatggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8932379 attaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagct 8932280  T
Q  137 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 236  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8932279 taacgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctcc 8932180  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  8932179 tt 8932178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19164973
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165064 tttcataagctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagcttaccct-cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 19164973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 15669180 - 15669376
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15669180 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 15669279  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15669280 tagtttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 15669376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875850
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53875758 tttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 53875850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44379383 - 44379187
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  44379383 ggccctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 44379284  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44379283 tagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 44379187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 33703837 - 33704034
Alignment:
Q  41 tggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  33703837 tggcctcgttttaattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatc 33703936  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703937 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680041
Alignment:
Q  49 tttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttc 148  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  149 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40680127 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctc 40680041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583632
Alignment:
Q  49 tttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttc 148  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  149 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27583721 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 27583632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171773
Alignment:
Q  46 ccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  146 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctcctt 30171773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 55345021 - 55344817
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55345021 ggccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 55344922  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgc 241  Q
    || || ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55344921 tatttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttga 55344822  T
Q  242 ttctc 246  Q
    |||||    
T  55344821 ttctc 55344817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 44375844 - 44376038
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  44375844 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 44375943  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44375944 gtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 44376038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  48 gtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 147  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  148 cataagctgcttatgcca-tattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 216  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360533 tataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Original strand, 50053440 - 50053592
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  50053440 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatca 50053539  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50053540 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071327
Alignment:
Q  54 attggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataag 153  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  154 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071404 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 38071327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 238
Target Start/End: Original strand, 16703856 - 16704014
Alignment:
Q  80 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 179  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16703856 cttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 16703955  T
Q  180 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  16703956 taaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaaccccctt 16704014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269046
Alignment:
Q  122 taaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  222 atttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||| ||||||    
T  23269062 atttatgtaatctcctt 23269046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23265950 - 23265865
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265950 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44548338 - 44548185
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggc-ttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 140  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||     
T  44548338 ggccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatc 44548239  T
Q  141 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
    | | ||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44548238 acaattttataagttgtttatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408213
Alignment:
Q  163 ccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct-ccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 53408213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 194
Target Start/End: Original strand, 17493340 - 17493482
Alignment:
Q  52 ggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcata 151  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||| |||    
T  17493340 ggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttata 17493439  T
Q  152 agctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 194  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17493440 agctgcttataccatgttttaataagctcaaattttgagctta 17493482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780763
Alignment:
Q  111 gtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 193  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261886
Alignment:
Q  187 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 23261886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595902
Alignment:
Q  147 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaact-----------ctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 9595902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748251
Alignment:
Q  184 ttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 48748251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055338
Alignment:
Q  201 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 50055338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 55344781 - 55344724
Alignment:
Q  132 tagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 189  Q
    |||||||| ||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344781 tagcttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 9596030 - 9595975
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9596030 ggccccgtttggattggctta-tttgagtttatgtgggcttatctactctcataagc 9595975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 36702 - 36898
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36702 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 36801  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36802 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 36898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 246
Target Start/End: Original strand, 3708 - 3911
Alignment:
Q  43 gccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattat 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3708 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 3807  T
Q  143 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  3808 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgat 3907  T
Q  243 tctc 246  Q
    ||||    
T  3908 tctc 3911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 18
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  214 ggccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 115  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 10235 - 10431
Alignment:
Q  42 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10235 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 10334  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10335 tagtttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 10431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145257
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  145 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctcctt 145257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 307
Alignment:
Q  44 ccccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattata 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  501 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 402  T
Q  144 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  401 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 18
Alignment:
Q  45 cccgtttggattggcttattttgaacttatatgggcttatc---tactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  212 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 114  T
Q  142 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University