View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12612_high_4 (Length: 412)

Name: NF12612_high_4
Description: NF12612
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12612_high_4
NF12612_high_4
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (87-393)||(35099739-35100044)
chr8 (76-393)||(38206452-38206769)
chr8 (76-393)||(1634279-1634596)
chr8 (80-393)||(17742003-17742316)
chr8 (87-393)||(15053941-15054246)
chr8 (80-393)||(30532006-30532319)
chr8 (87-393)||(1957679-1957984)
chr8 (80-393)||(13815235-13815548)
chr8 (80-392)||(5212579-5212891)
chr8 (127-393)||(7511534-7511800)
chr8 (80-312)||(34955219-34955451)
chr8 (80-273)||(5735573-5735766)
chr8 (87-197)||(18029164-18029274)
chr8 (273-369)||(13784114-13784210)
chr8 (76-141)||(26244814-26244879)
chr8 (76-141)||(40283792-40283857)
chr8 (95-137)||(35099703-35099745)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (87-393)||(631822-632127)
chr6 (87-393)||(17960720-17961025)
chr6 (87-393)||(34838890-34839195)
chr6 (80-393)||(6379959-6380272)
chr6 (76-393)||(24932720-24933037)
chr6 (87-393)||(8219251-8219556)
chr6 (80-393)||(29427993-29428306)
chr6 (88-143)||(26654068-26654123)
chr6 (88-143)||(26760037-26760092)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (87-393)||(25790237-25790542)
chr3 (87-393)||(17466822-17467127)
chr3 (80-393)||(33748980-33749293)
chr3 (87-393)||(6048152-6048457)
chr3 (87-393)||(30417886-30418191)
chr3 (87-392)||(30691877-30692182)
chr3 (80-393)||(43474189-43474501)
chr3 (80-393)||(25832194-25832507)
chr3 (80-393)||(42600975-42601288)
chr3 (88-393)||(42561210-42561514)
chr3 (87-393)||(47144477-47144778)
chr3 (76-393)||(28154411-28154728)
chr3 (80-393)||(51427390-51427703)
chr3 (95-393)||(50017307-50017604)
chr3 (127-391)||(21225634-21225898)
chr3 (94-335)||(51973827-51974070)
chr3 (76-259)||(49028157-49028340)
chr3 (125-283)||(49357093-49357251)
chr3 (80-268)||(6832685-6832872)
chr3 (81-296)||(21231718-21231933)
chr3 (76-214)||(33935276-33935414)
chr3 (252-390)||(50034023-50034161)
chr3 (80-197)||(25450300-25450417)
chr3 (291-393)||(49028055-49028157)
chr3 (87-213)||(10426066-10426191)
chr3 (121-191)||(7008357-7008427)
chr3 (76-143)||(51304650-51304717)
chr3 (76-165)||(20139656-20139744)
chr3 (80-141)||(50033958-50034019)
chr3 (76-143)||(36178393-36178460)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (87-393)||(12855325-12855630)
chr2 (87-393)||(8852363-8852668)
chr2 (87-393)||(7587959-7588264)
chr2 (87-393)||(22351070-22351375)
chr2 (87-393)||(30822039-30822344)
chr2 (80-393)||(5146181-5146494)
chr2 (95-393)||(2780258-2780556)
chr2 (129-393)||(39433453-39433716)
chr2 (127-325)||(6363272-6363470)
chr2 (125-351)||(31192511-31192737)
chr2 (80-262)||(36855374-36855556)
chr2 (145-390)||(40881203-40881429)
chr2 (80-164)||(31173885-31173969)
chr2 (80-143)||(39433732-39433795)
chr2 (88-146)||(926876-926934)
chr2 (76-140)||(7763203-7763267)
chr2 (80-133)||(1987408-1987461)
chr2 (76-110)||(31192736-31192770)
chr2 (80-133)||(16218581-16218634)
chr2 (87-148)||(44280289-44280349)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (87-393)||(31468433-31468738)
chr1 (80-393)||(17680722-17681034)
chr1 (80-393)||(10266418-10266730)
chr1 (76-393)||(33164727-33165044)
chr1 (87-393)||(2477785-2478090)
chr1 (87-393)||(45239446-45239751)
chr1 (87-393)||(48387564-48387869)
chr1 (87-393)||(48404636-48404941)
chr1 (80-393)||(47299958-47300270)
chr1 (80-393)||(36230804-36231116)
chr1 (84-393)||(17783666-17783975)
chr1 (132-393)||(51520544-51520805)
chr1 (87-393)||(8468625-8468933)
chr1 (80-290)||(45455716-45455925)
chr1 (76-171)||(43739268-43739362)
chr1 (87-157)||(23093074-23093143)
chr1 (80-141)||(44929007-44929068)
chr1 (76-140)||(45362988-45363052)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (80-393)||(22191507-22191820)
chr7 (76-393)||(26812431-26812748)
chr7 (113-393)||(32129703-32129983)
chr7 (87-393)||(36518826-36519131)
chr7 (121-393)||(40301948-40302220)
chr7 (87-393)||(22656982-22657287)
chr7 (87-323)||(35028641-35028876)
chr7 (87-272)||(25218398-25218583)
chr7 (80-241)||(1940279-1940440)
chr7 (85-157)||(114831-114903)
chr7 (76-143)||(45549301-45549368)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (87-393)||(2214745-2215050)
chr4 (87-393)||(46916972-46917277)
chr4 (88-393)||(16174476-16174780)
chr4 (87-393)||(3532765-3533070)
chr4 (80-393)||(28899633-28899945)
chr4 (87-393)||(3617910-3618215)
chr4 (87-393)||(8992094-8992399)
chr4 (87-393)||(13110872-13111177)
chr4 (80-393)||(53183566-53183879)
chr4 (95-387)||(19409389-19409681)
chr4 (80-393)||(12158425-12158736)
chr4 (76-322)||(53347593-53347839)
chr4 (80-256)||(36656846-36657022)
chr4 (87-235)||(7401302-7401449)
chr4 (294-393)||(36657018-36657117)
chr4 (112-193)||(4981853-4981934)
chr4 (187-381)||(32462920-32463114)
chr4 (76-143)||(13094076-13094143)
chr4 (76-143)||(35809482-35809549)
chr4 (76-143)||(27863996-27864063)
chr4 (76-141)||(19273101-19273166)
chr4 (80-141)||(47749950-47750010)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (86-393)||(30647574-30647880)
chr5 (87-393)||(27942801-27943106)
chr5 (131-393)||(31013316-31013578)
chr5 (80-393)||(4577293-4577606)
chr5 (87-393)||(27406503-27406807)
chr5 (127-393)||(32976026-32976292)
chr5 (87-393)||(40889205-40889510)
chr5 (84-393)||(10569230-10569539)
chr5 (80-393)||(25032643-25032956)
chr5 (80-225)||(34710162-34710306)
chr5 (76-174)||(29618671-29618769)
chr5 (87-188)||(23648845-23648945)
chr5 (87-188)||(23809627-23809727)
chr5 (76-143)||(13479508-13479575)
chr5 (76-141)||(39238731-39238796)
chr5 (76-137)||(3455050-3455111)
chr5 (95-137)||(31013608-31013650)
chr5 (170-282)||(2299846-2299958)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (80-393)||(169987-170300)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (80-393)||(30006-30308)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (87-330)||(4860-5086)
[»] scaffold1240 (1 HSPs)
scaffold1240 (292-393)||(2229-2330)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (87-173)||(56811-56896)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 35099739 - 35100044
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099739 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 35099837  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099838 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 35099937  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099938 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 35100037  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  35100038 aacaatc 35100044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 38206769 - 38206452
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcat 175  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38206769 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagataacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcac 38206670  T
Q  176 gaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 275  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38206669 catacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 38206570  T
Q  276 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38206569 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 38206470  T
Q  376 cgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38206469 cgttcatcctcaacaatc 38206452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1634596 - 1634279
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcat 175  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  1634596 taaacacgcaacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgaaacaaatcatcttcaatcac 1634497  T
Q  176 gaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 275  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634496 tatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 1634397  T
Q  276 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634396 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 1634297  T
Q  376 cgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1634296 cgttcatcctcaacaatc 1634279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 17742003 - 17742316
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  17742003 cacgcggcacacaaataatttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatagaaatcatcttcaatcacgata 17742102  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17742103 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcatgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 17742202  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17742203 aaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgtggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 17742302  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  17742303 catcctcaacaatc 17742316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 15053941 - 15054246
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15053941 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgcgaaacattcca 15054039  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15054040 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 15054139  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15054140 gtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatacacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 15054239  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  15054240 aacaatc 15054246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30532319 - 30532006
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30532319 cacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagataacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatctttaatcatgata 30532220  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30532219 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttacaattcgtgatgaacatttagatcacgcaactcggatctagcacgcatatgatttgca 30532120  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30532119 aaagctggtaatacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 30532020  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  30532019 catcctcaacaatc 30532006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1957984 - 1957679
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1957984 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 1957886  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1957885 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcgcatgatttgcaaaagtgg 1957786  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1957785 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcggattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 1957686  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  1957685 aacaatc 1957679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 13815235 - 13815548
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  13815235 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtaggatacaaatcatcttcaatcacgata 13815334  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815335 catttcaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 13815434  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815435 aaagctagtaacacctcggtcgagtatgattgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 13815534  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  13815535 catcctcaacaatc 13815548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 80 - 392
Target Start/End: Original strand, 5212579 - 5212891
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5212579 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 5212678  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212679 cattccaaactttgtccgtatgtgtttcactagatctgcttgtaattcgtaatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 5212778  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212779 aaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcctgcaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 5212878  T
Q  380 catcctcaacaat 392  Q
    |||||||||||||    
T  5212879 catcctcaacaat 5212891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7511800 - 7511534
Alignment:
Q  127 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7511800 acaacaaacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgtaatt 7511701  T
Q  227 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatcc 326  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  7511700 catgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgtgtaacacctcagtcgagtatggttgcggtataatagatcc 7511601  T
Q  327 acttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7511600 actttcctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgaacatatgtatctcattcatcctcaacaatc 7511534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34955451 - 34955219
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34955451 cacgcgacacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaaccataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 34955352  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34955351 cattccaaactttgtccatatgtgtttcacttgatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 34955252  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgc 312  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34955251 aaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgc 34955219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 273
Target Start/End: Original strand, 5735573 - 5735766
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5735573 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 5735672  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5735673 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctgaatcacgcaactcggatctagcacgcacatga 5735766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18029274 - 18029164
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18029274 cacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgatacattcca 18029175  T
Q  187 aactttgtcca 197  Q
    |||||||||||    
T  18029174 aactttgtcca 18029164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13784210 - 13784114
Alignment:
Q  273 atttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatat 369  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13784210 atttgcaaaagatggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaagttgctcaaaattggtccaacgttgagcatat 13784114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 26244814 - 26244879
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 141  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26244814 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 26244879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 40283792 - 40283857
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 141  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40283792 taaacacgcgatacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcgtacaacacacaagtaa 40283857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 137
Target Start/End: Original strand, 35099703 - 35099745
Alignment:
Q  95 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaa 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35099703 taacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatgcaacacacaa 35099745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 631822 - 632127
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  631822 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 631920  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  631921 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 632020  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  632021 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 632120  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  632121 aacaatc 632127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17961025 - 17960720
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17961025 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 17960927  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960926 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 17960827  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960826 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 17960727  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  17960726 aacaatc 17960720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 34838890 - 34839195
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34838890 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 34838988  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34838989 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 34839088  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34839089 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcggattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 34839188  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  34839189 aacaatc 34839195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6380272 - 6379959
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  6380272 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 6380173  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6380172 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacgcacatgatttgca 6380073  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6380072 aaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 6379973  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  6379972 catcctcaacaatc 6379959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24933037 - 24932720
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcat 175  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24933037 taaacacgcaacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatagaacgcacaggtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcac 24932938  T
Q  176 gaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 275  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932937 tatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatttgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 24932838  T
Q  276 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932837 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatgattgcagtgtattggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 24932738  T
Q  376 cgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24932737 cgttcatcctcaacaatc 24932720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 8219251 - 8219556
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8219251 cacacaaatagcttaaaatgtaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattcca 8219349  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8219350 aactttgtccatatgcgcttcacaatatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 8219449  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8219450 gtaacacctcggtcgagtatggctgcggtgtactagatccacttccctcaaattgctcaaaatctttccaacgttgagcatatgtatttcgttcatcctc 8219549  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  8219550 aacaatc 8219556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29428306 - 29427993
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  29428306 cacgcggcacacaaataacttaaaatacaatacaaaaaactaagcatacagcacacaggtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 29428207  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29428206 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagaacgcacatgatttgca 29428107  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29428106 aatgctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtattagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttaagcatatgcatctcgtt 29428007  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  29428006 catcctcaacaatc 29427993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26654123 - 26654068
Alignment:
Q  88 acacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26654123 acacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 26654068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26760092 - 26760037
Alignment:
Q  88 acacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26760092 acacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 26760037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25790542 - 25790237
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790542 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 25790444  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790443 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 25790344  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790343 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 25790244  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  25790243 aacaatc 25790237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 17466822 - 17467127
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17466822 cacacaaatagcttaaaatgcaagacagcaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 17466920  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17466921 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 17467020  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17467021 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 17467120  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  17467121 aacaatc 17467127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 33748980 - 33749293
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  33748980 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaaccacgata 33749079  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33749080 cattccaaactttgtccatatctgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 33749179  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33749180 aaagttggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 33749279  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  33749280 catcctcaacaatc 33749293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6048457 - 6048152
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6048457 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 6048359  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6048358 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 6048259  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6048258 gtaacacctcggtcgagtatggttgcgctgtactagatccacttccctcatattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatcgcgttcatcctc 6048159  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  6048158 aacaatc 6048152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30418191 - 30417886
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30418191 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 30418093  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30418092 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 30417993  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30417992 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 30417893  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  30417892 aacaatc 30417886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30692182 - 30691877
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  30692182 cacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacgcaagtaatttatttagtacgatagaaatcatcttcaatcacgatacattcca 30692083  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30692082 aactttgtccatatgtgcttcactaggtctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagttg 30691983  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691982 gtaacacctcggtcgagcatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 30691883  T
Q  387 aacaat 392  Q
    ||||||    
T  30691882 aacaat 30691877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 43474189 - 43474501
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43474189 cacgcgtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatataaatcatcttcaatcacgaaa 43474287  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43474288 catttcaaactttgtccatatgtccttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacacacatgatttgca 43474387  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43474388 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtttactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 43474487  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  43474488 catcctcaacaatc 43474501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25832507 - 25832194
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25832507 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 25832408  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25832407 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacgcacatgatttgca 25832308  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25832307 aaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 25832208  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  25832207 catcctcaacaatc 25832194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42601288 - 42600975
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  42601288 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 42601189  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42601188 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacgcacatgatttgca 42601089  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42601088 aaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 42600989  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  42600988 catcctcaacaatc 42600975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 88 - 393
Target Start/End: Original strand, 42561210 - 42561514
Alignment:
Q  88 acacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaa 187  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  42561210 acacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacagaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacatttcaa 42561308  T
Q  188 actttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtggg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42561309 actttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatatagcacacacatgatttgcaaaagtggg 42561408  T
Q  288 taacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctca 387  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42561409 taacacctcagtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccatcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctca 42561508  T
Q  388 acaatc 393  Q
    ||||||    
T  42561509 acaatc 42561514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 47144477 - 47144778
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47144477 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaaataattta----gtacaatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 47144571  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47144572 aattttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaatgtgg 47144671  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47144672 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 47144771  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  47144772 aacaatc 47144778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28154728 - 28154411
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcat 175  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||   || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  28154728 taaacacgtgacacacaaataacttaaaatgcaagataataaactaaacatacaacacacaaggaatttatttagtacaatacaaatcatcttcaatcac 28154629  T
Q  176 gaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 275  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28154628 tatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttgaatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 28154529  T
Q  276 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 375  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28154528 tgcaaaagatggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcaggttgctcaaaatcggtccaacgttgaacctatgtatct 28154429  T
Q  376 cgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28154428 cgttcatcctcaacaatc 28154411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 51427390 - 51427703
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  51427390 cacgcgacacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcgcgata 51427489  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51427490 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgtaattcgtgataaacatctggatcacgcaactcggatctaacacgcacatgatttgca 51427589  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51427590 aaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacgtgatccacttcccgctggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 51427689  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  51427690 catcctcaacaatc 51427703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 95 - 393
Target Start/End: Original strand, 50017307 - 50017604
Alignment:
Q  95 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgt 194  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  50017307 taacttaaaatacaatacaa-aaactaaacatacaatacgcaagtaatatatttagtacgatacaaatcattttcaatcacaatacattccaaactttat 50017405  T
Q  195 ccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50017406 ccatatgtgtttcactagatctgcttgcaatttgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagttggtaacacc 50017505  T
Q  295 tcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50017506 tcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacattgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 50017604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 127 - 391
Target Start/End: Original strand, 21225634 - 21225898
Alignment:
Q  127 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 226  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21225634 acaacacacaagtaacttaattagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgagcttcactagatctgcttgcaatt 21225733  T
Q  227 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21225734 cgtgatgaacatttggatcacgtaactcagatctagcacgtacatgatttgtaaaagcgggtaacacctcggttgagtatggttgcggtgtactagatcc 21225833  T
Q  327 acttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaa 391  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21225834 attttcctcagattgctcaaaatcggtccaatgttgagcataagtatctcgttcatccttaacaa 21225898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 51973827 - 51974070
Alignment:
Q  94 ataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttg 193  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  51973827 ataacttaaaatgcaagacaacaaactaagaacacaacacacaagtaacttaattagtacaatacaaatcatcttcaatcacgaaacatttcaaacattg 51973926  T
Q  194 tccatat--gtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaac 291  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51973927 tccatatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttagatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagcgggtaac 51974026  T
Q  292 acctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctc 335  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  51974027 tccttggtcgagtatggttgcggtgttttagatccactttcctc 51974070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 49028340 - 49028157
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcat 175  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49028340 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcac 49028241  T
Q  176 gaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatc 259  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49028240 tatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatc 49028157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 125 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49357251 - 49357093
Alignment:
Q  125 atacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49357251 atacaacacacaagtaatttatttagtacaatacaaatcatcttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaa 49357152  T
Q  225 ttcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaag 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49357151 ttcgtgatgaacatatggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaag 49357093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 268
Target Start/End: Original strand, 6832685 - 6832872
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6832685 cacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaa 6832783  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgca 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6832784 cattccaaactttgtccatatttgcttcactagatctgcttgtaattcgtgatgaacatttgcatcacgcaactcggatctagcacgca 6832872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21231933 - 21231718
Alignment:
Q  81 acgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaac 180  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21231933 acgcggcacacaaataccttaaaatgtaagacaacaaactaagcacacaacacacaagtaacttaattagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaac 21231834  T
Q  181 attccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaa 280  Q
    |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21231833 attccaaattgtgtccatatattcttcactagatctgcttgcaattcatgatgaacagttggataacgcaactcagatctagcacacacatgatttgcaa 21231734  T
Q  281 aagtgggtaacacctc 296  Q
    ||| || |||||||||    
T  21231733 aagcggctaacacctc 21231718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 214
Target Start/End: Original strand, 33935276 - 33935414
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33935276 taaacacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcac 33935375  T
Q  176 gaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagat 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33935376 gatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagat 33935414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 390
Target Start/End: Original strand, 50034023 - 50034161
Alignment:
Q  252 ctcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcg 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  50034023 ctcggatctagcacgcacatgatttgaaaaagctagtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtgctagatccacttcccccaggttgctcaaaatcg 50034122  T
Q  352 gtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50034123 gtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 50034161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25450417 - 25450300
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25450417 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 25450318  T
Q  180 cattccaaactttgtcca 197  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25450317 cattccaaactttgtcca 25450300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 291 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 49028157 - 49028055
Alignment:
Q  291 cacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 390  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49028157 cacctcggtcgagtatggttgcggtgtactggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 49028058  T
Q  391 atc 393  Q
    |||    
T  49028057 atc 49028055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10426191 - 10426066
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10426191 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 10426093  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactaga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10426092 aactttgtccatatgtgcttcactaga 10426066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 7008357 - 7008427
Alignment:
Q  121 aagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactt 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7008357 aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattccaaactt 7008427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Original strand, 51304650 - 51304717
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51304650 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 51304717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 165
Target Start/End: Original strand, 20139656 - 20139744
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcat 165  Q
    |||||| | |||||||| |||  |||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139656 taaacatgtggcacacaaatagtttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcat 20139744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Original strand, 50033958 - 50034019
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 141  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50033958 cacgcggcacacaaaaaatttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 50034019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36178460 - 36178393
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36178460 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacgacaaactaatcatacaacacacaagtaatt 36178393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 12855325 - 12855630
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855325 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 12855423  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855424 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 12855523  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855524 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 12855623  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  12855624 aacaatc 12855630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 8852363 - 8852668
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8852363 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacataagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 8852461  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8852462 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 8852561  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8852562 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 8852661  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  8852662 aacaatc 8852668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7588264 - 7587959
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7588264 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 7588166  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7588165 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 7588066  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7588065 gtaacacctcggtcgagtatggttgcgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 7587966  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  7587965 aacaatc 7587959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22351375 - 22351070
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22351375 cacacaaatagcttaaaatgtaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 22351277  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22351276 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 22351177  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22351176 gtaacacctcggccgagtatggttgcgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatcgcgttcatcctc 22351077  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  22351076 aacaatc 22351070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30822344 - 30822039
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30822344 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 30822246  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30822245 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 30822146  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30822145 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 30822046  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  30822045 aacaatc 30822039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5146494 - 5146181
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  5146494 cacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaaataatttatttagtatgatacaaatcatcttcaatcacgata 5146395  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5146394 cattccaaactttgttcatacgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 5146295  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5146294 aaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 5146195  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
     |||||||||||||    
T  5146194 tatcctcaacaatc 5146181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 95 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2780556 - 2780258
Alignment:
Q  95 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgt 194  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  2780556 taacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgatacatttcaaactttgt 2780457  T
Q  195 ccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2780456 ccatatgtgtttcactagatctacttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcaaatctagcacgcacatgatttgcaaaagctggtaacacc 2780357  T
Q  295 tcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2780356 tcggtcgagtatggttgcattgtactagatccaattcccctaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 2780258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 129 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39433716 - 39433453
Alignment:
Q  129 aacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  39433716 aacacacaagtaatttatttaatacgatacaaatcatcttcaatcacgatacatttcaaactttgtccatatgtgtttcattatatctccttgcaattcg 39433617  T
Q  229 tgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccac 328  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  39433616 tgatgaacatctggatcacacaattcggatctaccacgcacatgatttgcaaaagctagtaacacctcggttaagtatggttgcgatgtattagatccac 39433517  T
Q  329 ttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39433516 ttccc-caggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 39433453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 127 - 325
Target Start/End: Original strand, 6363272 - 6363470
Alignment:
Q  127 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6363272 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattccaaactctgtccatatgcgcttcactagatctgcttgcaatt 6363371  T
Q  227 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatc 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6363372 cgtgatgaacatttgaatcacgcaactcggatctagcacacacatgattttcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatc 6363470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 125 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31192737 - 31192511
Alignment:
Q  125 atacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaa 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31192737 atacaacacacaaataatttatttagtacgatagaaatcatcttcaatcatgatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctacttgcag 31192638  T
Q  225 ttcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagat 324  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31192637 ttcgtgacgaacatctggatgacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagctggtaacaccccggtcgagtatggttgcggtgtacttgat 31192538  T
Q  325 ccacttccctcagattgctcaaaatcg 351  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31192537 ccacttcccccaggttgctcaaaatcg 31192511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36855556 - 36855374
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  36855556 cacgcgacacacaaataacttaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacagcacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 36855457  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctag 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36855456 cattccaaactttgttcatatgtgtttcaatagatttgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctag 36855374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 40881429 - 40881203
Alignment:
Q  145 atttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||               
T  40881429 atttagtacgatacaaatcatcttcaaa----atacattctaaactttgtccacgtgtgcttcactagatctacttgtaattcgtgatg----------- 40881345  T
Q  245 cacgcaactcgg-atctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgct 343  Q
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40881344 ----caactcgggatctagcacgcacatgatttgcaaaagctagtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccc-caggttgct 40881250  T
Q  344 caaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 390  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  40881249 caaaatcggtccaactttgagcatatatatcttgtccatcctcaaca 40881203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31173969 - 31173885
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatca 164  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31173969 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaattaagcatacaatacacaaataatttatttaatacgatagaaatca 31173885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39433795 - 39433732
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39433795 cacgcgacacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 39433732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 926934 - 926876
Alignment:
Q  88 acacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttat 146  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  926934 acacaaataacttaaaatgcattacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttat 926876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7763267 - 7763203
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagta 140  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7763267 taaacacgcgacacacatataagttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaagta 7763203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Original strand, 1987408 - 1987461
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1987408 cacgcggcacacaaataactcaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacaacac 1987461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 31192770 - 31192736
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaat 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31192770 taaacacgcggcacacaaataacttaaaatgaaat 31192736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16218634 - 16218581
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacac 133  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  16218634 cacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcacacaacac 16218581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 148
Target Start/End: Original strand, 44280289 - 44280349
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttattt 148  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44280289 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttattt 44280349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 31468433 - 31468738
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468433 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 31468531  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468532 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 31468631  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468632 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 31468731  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  31468732 aacaatc 31468738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17681034 - 17680722
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17681034 cacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaa 17680936  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17680935 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgattttca 17680836  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17680835 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtctactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcttt 17680736  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  17680735 catcctcaacaatc 17680722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 10266730 - 10266418
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10266730 cacgcgtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaacaaa-cacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaataatcttcaatcacgaaa 10266632  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266631 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 10266532  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266531 aaagtgggtaacacctcggttgagtatggttgcgatgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 10266432  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  10266431 catcctcaacaatc 10266418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Original strand, 33164727 - 33165044
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcat 175  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33164727 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaaccac 33164826  T
Q  176 gaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 275  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33164827 tgtacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 33164926  T
Q  276 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 375  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33164927 tgcaaaagatggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatctacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 33165026  T
Q  376 cgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33165027 cgttcatcctcaacaatc 33165044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2478090 - 2477785
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2478090 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 2477992  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477991 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 2477892  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477891 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 2477792  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  2477791 aacaatc 2477785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 45239446 - 45239751
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45239446 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 45239544  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239545 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 45239644  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239645 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 45239744  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  45239745 aacaatc 45239751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 48387869 - 48387564
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48387869 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 48387771  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48387770 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 48387671  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48387670 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 48387571  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  48387570 aacaatc 48387564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 48404636 - 48404941
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48404636 cacacaaatagcttaaaatgcaacacaacaaac-aagcacacaacacacaggtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattcca 48404734  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48404735 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgtttgcaattcgtgatgaacatttggatcacacaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 48404834  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48404835 gtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtctaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 48404934  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  48404935 aacaatc 48404941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 47300270 - 47299958
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| ||   ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47300270 cacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagataacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaa 47300172  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47300171 cattccaaactttgttcatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcagatctagcacgcacatgatttgca 47300072  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47300071 aaagtaggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagaaccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 47299972  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  47299971 catcctcaacaatc 47299958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 36230804 - 36231116
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36230804 cacgcgacatacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacataagtaatttatttagtacgatataaatcatcttcaatcacgaaa 36230902  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36230903 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgacgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 36231002  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36231003 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatgattgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaatgttgagcatatgtatctcgtt 36231102  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  36231103 catcctcaacaatc 36231116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 84 - 393
Target Start/End: Original strand, 17783666 - 17783975
Alignment:
Q  84 cggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacatt 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17783666 cggcacacaaataacttaaaatgcaatacagaaaactaagcatccagcacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgatacatt 17783765  T
Q  184 ccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaag 283  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17783766 ccaaattttgtccatatgtgtttcactagatttgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatatagcacgcacatgatttgcaaatg 17783865  T
Q  284 tgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatc 383  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17783866 ctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccaaagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatc 17783965  T
Q  384 ctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||    
T  17783966 ctcaacaatc 17783975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 132 - 393
Target Start/End: Original strand, 51520544 - 51520805
Alignment:
Q  132 acacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtga 231  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520544 acacaagtagtttatttagtaccatacaaatcatcttcaatcacgaaacatcccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtga 51520643  T
Q  232 tgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttc 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51520644 tgaacatttggatcacacaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacatctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttc 51520743  T
Q  332 cctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520744 ccttagattgctcaaaatcggtccaacgttgatcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 51520805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 8468625 - 8468933
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8468625 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtcatttatttagcacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattcca 8468723  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    |||||| || ||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8468724 aactttatcaatatgagcttcacaaaatatgcttgcaattcatgatgaacatttagatcaagcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 8468823  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccactt---ccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8468824 gtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgaacatatgtatctggttcatc 8468923  T
Q  384 ctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||    
T  8468924 ctcaacaatc 8468933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 45455925 - 45455716
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  45455925 cacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacataacacacaagtaatttatttagtacgatacaaataatcttcaatcacaaaa 45455827  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45455826 cattccaaactttgtccatatgtggttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaattcggatctagcacgcacatgatttgca 45455727  T
Q  280 aaagtgggtaa 290  Q
    |||||||||||    
T  45455726 aaagtgggtaa 45455716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 171
Target Start/End: Original strand, 43739268 - 43739362
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaa 171  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43739268 taaacacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtatgatacaaatcatcttcaa 43739362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 157
Target Start/End: Original strand, 23093074 - 23093143
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgata 157  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23093074 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgata 23093143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 44929068 - 44929007
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  44929068 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaataaaaaaaactaagcatacatcacacaagtaa 44929007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Original strand, 45362988 - 45363052
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagta 140  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45362988 taaacacacgacacacatataagttaaaatgcaagacaacaaactatgcatacaacacacaagta 45363052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 22191507 - 22191820
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22191507 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 22191606  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22191607 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 22191706  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22191707 aaagttggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 22191806  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  22191807 catcctcaacaatc 22191820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Original strand, 26812431 - 26812748
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcat 175  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26812431 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaaacatacaacacacaactaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcac 26812530  T
Q  176 gaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 275  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812531 tatactttccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 26812630  T
Q  276 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812631 tgcaaaagtgggtaacacctcggtggagtatggttgcggtgtactggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatct 26812730  T
Q  376 cgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26812731 cgttcatcctcaacaatc 26812748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 113 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32129983 - 32129703
Alignment:
Q  113 aacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129983 aacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcactatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactag 32129884  T
Q  213 atctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32129883 atctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtggagtatggttgc 32129784  T
Q  313 tgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129783 ggtgtactggattcacttccatcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 32129703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 36518826 - 36519131
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36518826 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 36518924  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36518925 aactttatccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 36519024  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36519025 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgatgtactagatccacttccctcggattgctcaaaatcggtccaatgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 36519124  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  36519125 aacaatc 36519131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 121 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 40302220 - 40301948
Alignment:
Q  121 aagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgctt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40302220 aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacagatcatcttcaatcacgaaacatttcaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgctt 40302121  T
Q  221 gcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtact 320  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  40302120 gcaatttgtgatgaacatgtggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggcgtact 40302021  T
Q  321 agatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40302020 agatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcgacaatc 40301948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 22656982 - 22657287
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  22656982 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatagaaatcatattcaatcacgaaacatttca 22657080  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22657081 aactttgtccatatgtgcttcactagatttgcttgcaattcgcgatgaacatttggatcacgtaactcggatctggcacgcacatgatttgcaaaagtgg 22657180  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  22657181 gtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacattgagcatatgtatctaattcatcctc 22657280  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  22657281 aacaatc 22657287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 87 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 35028876 - 35028641
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35028876 cacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 35028778  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35028777 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 35028678  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactaga 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35028677 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtattaga 35028641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25218583 - 25218398
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25218583 cacacaaataacataaaatgcaatacaaaaaactaatcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgatacattcca 25218484  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatg 272  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25218483 aactttgtcgatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctagatcacgcaacccggatctagcacgcacatg 25218398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1940440 - 1940279
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1940440 cacgcgacacacaaataacttaagatgcaagacaacaaactaagcacacaacacacaagtaacttaattagtatgatacaaatcatcttcaatcacgaaa 1940341  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1940340 cattccaaactttgcccatatgtctttcactagatctgcttgcaattcatgatcaacatttg 1940279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Original strand, 114831 - 114903
Alignment:
Q  85 ggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgata 157  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  114831 ggcacacaaataacttaaaatgcaagaaaacaaactaagcatacaacacacaagtattttatttagtacgata 114903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45549368 - 45549301
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45549368 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 45549301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2215050 - 2214745
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2215050 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 2214952  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214951 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 2214852  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214851 gtaacacctcagtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 2214752  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  2214751 aacaatc 2214745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 46917277 - 46916972
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46917277 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 46917179  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46917178 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttacaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 46917079  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46917078 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 46916979  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  46916978 aacaatc 46916972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 88 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16174780 - 16174476
Alignment:
Q  88 acacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaa 187  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16174780 acacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattccaa 16174682  T
Q  188 actttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtggg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16174681 actttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtggg 16174582  T
Q  288 taacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16174581 taacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctca 16174482  T
Q  388 acaatc 393  Q
    ||||||    
T  16174481 acaatc 16174476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3533070 - 3532765
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3533070 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 3532972  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532971 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 3532872  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532871 gtaacacctcggtcgagtatggttgcgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 3532772  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  3532771 aacaatc 3532765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 28899633 - 28899945
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28899633 cacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaa 28899731  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  28899732 cattccaaactttgtccgtatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcatgtacatgattttca 28899831  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28899832 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 28899931  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  28899932 catcctcaacaatc 28899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3618215 - 3617910
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3618215 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 3618117  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3618116 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 3618017  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3618016 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 3617917  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  3617916 aacaatc 3617910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 8992094 - 8992399
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8992094 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 8992192  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8992193 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 8992292  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8992293 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 8992392  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  8992393 aacaatc 8992399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 13110872 - 13111177
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13110872 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 13110970  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110971 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 13111070  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111071 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 13111170  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  13111171 aacaatc 13111177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 53183879 - 53183566
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  53183879 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 53183780  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53183779 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacgcacatgatttgca 53183680  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53183679 aaagctggtaacacctcggccgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 53183580  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  53183579 catcctcaacaatc 53183566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 95 - 387
Target Start/End: Original strand, 19409389 - 19409681
Alignment:
Q  95 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgt 194  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19409389 taacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatagaaatcatcttcaatcacgatacattccaaactttgt 19409488  T
Q  195 ccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  19409489 ccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcatgatgaacatatggatcatgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagctggtaacgcc 19409588  T
Q  295 tcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctca 387  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19409589 tcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtctaacgttgagcatatgtacctcgttcatcctca 19409681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 12158425 - 12158736
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  12158425 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaaaaaattaagcatacagcacacaagtaatttatttagtacg-tacaaatcatcttcaatcacgata 12158523  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12158524 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcatgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 12158623  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    || |  |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12158624 aatgctggtagcaccttggtcgagtatggttgcgatgtactagatccacttccc-caggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 12158722  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
     |||||||||||||    
T  12158723 tatcctcaacaatc 12158736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 76 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 53347839 - 53347593
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcat 175  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  53347839 taaacatgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaaataatttatttagtaccatacaaatcatcttcaatcac 53347740  T
Q  176 gaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 275  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53347739 gatacattccaaactttgtccatatgggcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatt 53347640  T
Q  276 tgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactag 322  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53347639 tgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactag 53347593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 256
Target Start/End: Original strand, 36656846 - 36657022
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |    
T  36656846 cacgcgacacacaaacaacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttaatacgatacaaatcatcttcaatcacggta 36656945  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcgg 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36656946 cattccaaactttatccatatgtgtttcactagatctgtttgcaatttgtgatgaacatctggatcacgcaactcgg 36657022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 7401302 - 7401449
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7401302 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttaatacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 7401400  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7401401 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgttgaa 7401449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 393
Target Start/End: Original strand, 36657018 - 36657117
Alignment:
Q  294 ctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36657018 ctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccatttcccccaggttgctcaaattcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 36657117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 193
Target Start/End: Original strand, 4981853 - 4981934
Alignment:
Q  112 caacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  4981853 caacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcactatagattccaaactttg 4981934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 381
Target Start/End: Original strand, 32462920 - 32463114
Alignment:
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  32462920 aactttgcccatatgtgtttgactagatctgcttgccattcgtgatgtacatttgaatcacacatcacagatctagcacgcacatgattcacaaatgtag 32463019  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttca 381  Q
    ||| |||||  || ||  |||| |   |||||||||| ||||||  |||||| || ||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32463020 gtagcaccttagttgaaaatggctcaagtgtactagacccacttgtctcagactgatcataatttgtccaatgttgagcatatgtatcttgttca 32463114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13094143 - 13094076
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13094143 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 13094076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Original strand, 35809482 - 35809549
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35809482 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 35809549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Original strand, 27863996 - 27864063
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27863996 taaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcgtacaacacacaagtaatt 27864063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 19273101 - 19273166
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 141  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19273101 taaacacgcgaaacacaaataaattaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 19273166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 47750010 - 47749950
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 141  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47750010 cacgcggcac-caaataacttaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacagcacacaagtaa 47749950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30647880 - 30647574
Alignment:
Q  86 gcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcc 185  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30647880 gcacacaaatagcttaaaatgcaagataacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattcc 30647782  T
Q  186 aaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30647781 aaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtg 30647682  T
Q  286 ggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcct 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30647681 ggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactggatccacttccctcagattgctcaaaatcaatccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcct 30647582  T
Q  386 caacaatc 393  Q
    ||||||||    
T  30647581 caacaatc 30647574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 27942801 - 27943106
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27942801 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 27942899  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27942900 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 27942999  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27943000 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 27943099  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  27943100 aacaatc 27943106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 131 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 31013578 - 31013316
Alignment:
Q  131 cacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtg 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013578 cacacaaataatttatttagtacaatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaattttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtg 31013479  T
Q  231 atgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccactt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013478 atgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccactt 31013379  T
Q  331 ccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013378 ccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 31013316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 4577293 - 4577606
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  4577293 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaattacgata 4577392  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4577393 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacgcacatgatttgca 4577492  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4577493 aaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 4577592  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  4577593 catcctcaacaatc 4577606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27406807 - 27406503
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  27406807 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcgagaa-cattcca 27406710  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27406709 aactttatccatatgtgtttcactagatctgcttgcgattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 27406610  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27406609 gtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccactttcctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 27406510  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  27406509 aacaatc 27406503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32976292 - 32976026
Alignment:
Q  127 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32976292 acaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 32976193  T
Q  227 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  32976192 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatcc 32976093  T
Q  327 acttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32976092 acttccctcggattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 32976026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 40889205 - 40889510
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40889205 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaag-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaattgtgaaacattcca 40889303  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40889304 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 40889403  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40889404 gtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcggattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctc 40889503  T
Q  387 aacaatc 393  Q
    |||||||    
T  40889504 aacaatc 40889510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 84 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 10569539 - 10569230
Alignment:
Q  84 cggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacatt 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10569539 cggcacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgatacatt 10569440  T
Q  184 ccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaag 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  10569439 ccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgtaatacgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatttagcacacacatgatttgcaaaac 10569340  T
Q  284 tgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatc 383  Q
      |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10569339 ctggtaacacatcggtcaagtatggttgcagtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatc 10569240  T
Q  384 ctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||    
T  10569239 ctcaacaatc 10569230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 25032643 - 25032956
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25032643 cacgcgacacataaataacttaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgata 25032742  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25032743 cattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatttgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacacacttgatttgca 25032842  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25032843 aatgctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 25032942  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||||||||    
T  25032943 catcctcaacaatc 25032956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 34710162 - 34710306
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34710162 cacgcgacacacaaatagtttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttaatacgatacaaatcatcttcaatcacgaaa 34710260  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34710261 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttacaat 34710306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29618769 - 29618671
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatca 174  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29618769 taaacacgcgacacacaaataacttaaaacggaagacaacaaactaagcatacaagacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatca 29618671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23648945 - 23648845
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23648945 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 23648847  T
Q  187 aa 188  Q
    ||    
T  23648846 aa 23648845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 23809627 - 23809727
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23809627 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 23809725  T
Q  187 aa 188  Q
    ||    
T  23809726 aa 23809727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13479575 - 13479508
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 143  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13479575 taaacacgcgacgcacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 13479508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 39238731 - 39238796
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 141  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39238731 taaacacgcgacacacaaataatttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 39238796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 3455050 - 3455111
Alignment:
Q  76 taaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaa 137  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3455050 taaacacgcaacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaa 3455111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31013650 - 31013608
Alignment:
Q  95 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaa 137  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31013650 taacttaaaatgcaatacaacaaactaagcacacaacacacaa 31013608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 282
Target Start/End: Original strand, 2299846 - 2299958
Alignment:
Q  170 aatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcac 269  Q
    |||||||||||||||  ||| |||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||  |||| |||| || | ||| || | | ||||||||| ||||    
T  2299846 aatcatgaaacattctgaaccttgctcatatgtgtttgactagatatgcttgcaattcacgatgtacatctgaaccacacatcacagatctagcatgcac 2299945  T
Q  270 atgatttgcaaaa 282  Q
    || ||| ||||||    
T  2299946 attattcgcaaaa 2299958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 170300 - 169987
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  170300 cacgcggcacacaaataacttagaatgcaagacaacaaactaagcacacaacacacaagtaacttaattagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaa 170201  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  170200 cattccaaactttgaccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcatgatgaacatttggatcacgcaactcagatatagcacgcacatgatttgca 170101  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  170100 aaagcagttaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtaccatatccactttcctcatatttctcaaaatcgctccaatgttgagcatatgtatctcgtt 170001  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    |||| |||||||||    
T  170000 catcatcaacaatc 169987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30308 - 30006
Alignment:
Q  80 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |          ||||||||||||||| || |    
T  30308 cacgcggcacacaaataacttaaaatgcattacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatgga----------aatcatcttcaatcacgata 30219  T
Q  180 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30218 cattccaaactttgtccagatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgtaactcggatctagcacacacatgatttgca 30119  T
Q  280 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 379  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30118 aaagctggtaacacctcagtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccct-agattgctctaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 30020  T
Q  380 catcctcaacaatc 393  Q
    ||||||||| ||||    
T  30019 catcctcaataatc 30006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5086 - 4860
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5086 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatataaatcatcttcaatcacgaaacattcca 4988  T
Q  187 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 286  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||    
T  4987 aactttgtccataggtccttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcg----------------gatttgcaaaagtgg 4904  T
Q  287 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccactt 330  Q
     ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4903 ataacacctcagtcgagtatgcttgcggtgtactagatccactt 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1240 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1240
Description:

Target: scaffold1240; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 292 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2229
Alignment:
Q  292 acctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2330 acctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaa 2231  T
Q  392 tc 393  Q
    ||    
T  2230 tc 2229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 56896 - 56811
Alignment:
Q  87 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatc 173  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56896 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatc 56811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University