View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12613_low_8 (Length: 271)

Name: NF12613_low_8
Description: NF12613
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12613_low_8
NF12613_low_8
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (15-271)||(19247244-19247500)
chr8 (15-271)||(19320428-19320684)
chr8 (15-271)||(14079429-14079686)
chr8 (15-253)||(23967006-23967244)
chr8 (15-253)||(37029101-37029339)
chr8 (15-253)||(42061280-42061518)
chr8 (15-253)||(44939705-44939943)
chr8 (15-271)||(30548906-30549163)
chr8 (15-271)||(33424857-33425114)
chr8 (15-271)||(44383539-44383796)
chr8 (15-271)||(20663543-20663800)
chr8 (15-271)||(30825583-30825839)
chr8 (15-271)||(12759605-12759864)
chr8 (15-271)||(38961306-38961563)
chr8 (15-271)||(41155770-41156027)
chr8 (15-271)||(41906990-41907246)
chr8 (18-271)||(6478091-6478345)
chr8 (15-271)||(44213660-44213916)
chr8 (15-271)||(38991651-38991907)
chr8 (15-271)||(41976600-41976847)
chr8 (15-253)||(6301103-6301330)
chr8 (15-271)||(41628033-41628279)
chr8 (15-216)||(36602722-36602924)
chr8 (55-263)||(23626951-23627160)
chr8 (15-271)||(39203773-39204019)
chr8 (27-254)||(29433199-29433419)
chr8 (15-220)||(19396015-19396221)
chr8 (18-156)||(45294767-45294905)
chr8 (15-156)||(42811665-42811806)
chr8 (91-271)||(22343103-22343271)
chr8 (91-271)||(22354763-22354931)
chr8 (184-271)||(42811534-42811621)
chr8 (189-271)||(12250793-12250875)
chr8 (189-271)||(39444332-39444414)
chr8 (15-97)||(22345559-22345641)
chr8 (15-97)||(22357219-22357301)
chr8 (211-271)||(36598138-36598198)
chr8 (216-271)||(45294697-45294752)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (15-271)||(1515603-1515860)
chr2 (15-271)||(9917302-9917562)
chr2 (15-271)||(21097121-21097378)
chr2 (15-253)||(6343343-6343581)
chr2 (15-253)||(14323827-14324065)
chr2 (19-271)||(4810975-4811228)
chr2 (15-271)||(18093326-18093582)
chr2 (15-271)||(26821042-26821299)
chr2 (15-271)||(42884813-42885070)
chr2 (15-253)||(1993555-1993793)
chr2 (15-253)||(28501705-28501943)
chr2 (15-271)||(3710317-3710574)
chr2 (15-271)||(11866842-11867099)
chr2 (15-271)||(16724962-16725219)
chr2 (15-271)||(35358235-35358492)
chr2 (15-271)||(14752595-14752852)
chr2 (15-271)||(9544231-9544477)
chr2 (15-271)||(10048608-10048854)
chr2 (15-271)||(36633699-36633945)
chr2 (15-271)||(30567478-30567724)
chr2 (15-271)||(33664408-33664654)
chr2 (15-250)||(4291280-4291505)
chr2 (15-271)||(45205631-45205893)
chr2 (55-271)||(17036731-17036948)
chr2 (55-271)||(17091239-17091456)
chr2 (15-271)||(16883358-16883604)
chr2 (15-271)||(17041048-17041294)
chr2 (55-263)||(17025054-17025263)
chr2 (20-271)||(10822539-10822787)
chr2 (15-174)||(11447071-11447230)
chr2 (84-271)||(30571163-30571340)
chr2 (65-271)||(19168255-19168449)
chr2 (181-271)||(11447955-11448045)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (15-271)||(33639290-33639547)
chr7 (15-271)||(42917241-42917498)
chr7 (15-271)||(4481815-4482072)
chr7 (15-271)||(23767054-23767311)
chr7 (15-253)||(6911977-6912215)
chr7 (15-253)||(47573955-47574193)
chr7 (15-271)||(3794901-3795158)
chr7 (15-271)||(9226836-9227093)
chr7 (17-271)||(5962092-5962347)
chr7 (15-271)||(8926506-8926763)
chr7 (18-271)||(14308324-14308578)
chr7 (15-271)||(19034271-19034528)
chr7 (15-271)||(20720108-20720365)
chr7 (15-271)||(27735664-27735921)
chr7 (15-271)||(34282720-34282977)
chr7 (15-271)||(39649566-39649812)
chr7 (15-271)||(9148752-9149009)
chr7 (15-271)||(29490348-29490605)
chr7 (15-271)||(33230577-33230834)
chr7 (15-271)||(20764770-20765026)
chr7 (15-271)||(31898405-31898651)
chr7 (15-271)||(17170450-17170696)
chr7 (15-271)||(48528374-48528621)
chr7 (15-271)||(23300335-23300581)
chr7 (15-271)||(47164167-47164431)
chr7 (15-271)||(47173879-47174124)
chr7 (15-271)||(19520565-19520814)
chr7 (27-271)||(42245471-42245705)
chr7 (15-271)||(42686960-42687200)
chr7 (15-271)||(17477291-17477537)
chr7 (15-271)||(17575677-17575923)
chr7 (15-271)||(33030199-33030444)
chr7 (15-271)||(17481737-17481984)
chr7 (15-271)||(17571230-17571477)
chr7 (189-271)||(38435165-38435247)
chr7 (189-271)||(42996019-42996101)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (15-271)||(1073882-1074139)
chr6 (15-271)||(18599605-18599862)
chr6 (15-271)||(14888556-14888813)
chr6 (15-271)||(33322072-33322329)
chr6 (15-271)||(34320463-34320720)
chr6 (15-253)||(13457350-13457588)
chr6 (15-271)||(11946088-11946345)
chr6 (15-271)||(15275029-15275286)
chr6 (16-271)||(34855327-34855583)
chr6 (15-271)||(7222115-7222372)
chr6 (15-271)||(249283-249540)
chr6 (15-271)||(7219483-7219740)
chr6 (15-271)||(2520534-2520791)
chr6 (15-271)||(12580415-12580672)
chr6 (15-271)||(17938893-17939150)
chr6 (15-271)||(25532636-25532881)
chr6 (15-271)||(9979678-9979924)
chr6 (15-271)||(24445351-24445597)
chr6 (15-250)||(1219948-1220173)
chr6 (58-271)||(11935299-11935513)
chr6 (15-271)||(33978344-33978590)
chr6 (16-270)||(4423756-4424000)
chr6 (21-271)||(1931420-1931661)
chr6 (15-194)||(22374549-22374728)
chr6 (15-108)||(1080374-1080467)
chr6 (230-271)||(22374460-22374501)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (19-271)||(21029465-21029718)
chr5 (15-271)||(12588889-12589146)
chr5 (15-271)||(20996553-20996810)
chr5 (15-271)||(26321684-26321941)
chr5 (15-271)||(33611749-33612006)
chr5 (15-271)||(27065255-27065512)
chr5 (15-271)||(37463737-37463994)
chr5 (15-271)||(2194518-2194775)
chr5 (15-271)||(30141927-30142173)
chr5 (15-253)||(19394842-19395079)
chr5 (15-271)||(7285030-7285287)
chr5 (15-263)||(30688668-30688917)
chr5 (15-271)||(25697132-25697378)
chr5 (15-271)||(3210807-3211063)
chr5 (15-271)||(34717014-34717260)
chr5 (15-271)||(289961-290218)
chr5 (15-271)||(41690700-41690946)
chr5 (15-271)||(3151213-3151469)
chr5 (15-251)||(3397771-3398007)
chr5 (55-271)||(9701645-9701862)
chr5 (15-253)||(31296170-31296398)
chr5 (15-271)||(4881638-4881883)
chr5 (15-240)||(20349293-20349508)
chr5 (15-225)||(3027813-3028013)
chr5 (15-271)||(1852539-1852783)
chr5 (206-271)||(19447546-19447611)
chr5 (227-271)||(3028314-3028358)
chr5 (15-48)||(19447484-19447517)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (15-271)||(11951586-11951843)
chr3 (15-271)||(11326253-11326510)
chr3 (15-271)||(22477094-22477351)
chr3 (15-253)||(5252872-5253110)
chr3 (15-271)||(11598575-11598832)
chr3 (15-271)||(35436368-35436625)
chr3 (15-271)||(55295390-55295647)
chr3 (15-271)||(31369628-31369885)
chr3 (15-270)||(36168063-36168319)
chr3 (15-271)||(35088449-35088703)
chr3 (15-271)||(23192848-23193105)
chr3 (15-271)||(52854053-52854310)
chr3 (18-271)||(8242095-8242343)
chr3 (40-271)||(40827646-40827878)
chr3 (15-271)||(48976071-48976328)
chr3 (15-271)||(49112461-49112718)
chr3 (15-271)||(51247759-51248005)
chr3 (15-271)||(16495280-16495537)
chr3 (15-271)||(44073332-44073584)
chr3 (15-271)||(918068-918314)
chr3 (15-253)||(39796971-39797198)
chr3 (15-271)||(6104737-6104983)
chr3 (15-271)||(21700181-21700427)
chr3 (18-271)||(19893980-19894223)
chr3 (15-271)||(52841145-52841391)
chr3 (15-271)||(50740750-50740996)
chr3 (17-269)||(11382562-11382810)
chr3 (15-271)||(50771858-50772104)
chr3 (15-256)||(9879550-9879781)
chr3 (15-271)||(54793576-54793822)
chr3 (15-156)||(28164813-28164954)
chr3 (15-136)||(54512345-54512466)
chr3 (15-108)||(2845558-2845651)
chr3 (175-271)||(48521633-48521730)
chr3 (15-111)||(11952050-11952146)
chr3 (181-271)||(2845468-2845558)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (15-271)||(18813614-18813871)
chr1 (15-271)||(34686982-34687239)
chr1 (15-271)||(41830647-41830904)
chr1 (15-271)||(42681785-42682042)
chr1 (15-253)||(18111113-18111351)
chr1 (15-253)||(43255170-43255408)
chr1 (15-253)||(50395584-50395822)
chr1 (15-271)||(10694787-10695044)
chr1 (15-271)||(29841285-29841542)
chr1 (15-271)||(31619084-31619341)
chr1 (15-271)||(52522166-52522423)
chr1 (15-271)||(52309229-52309486)
chr1 (15-271)||(28566315-28566572)
chr1 (15-271)||(38845822-38846079)
chr1 (15-271)||(41963528-41963785)
chr1 (15-271)||(4891524-4891770)
chr1 (15-271)||(29186717-29186963)
chr1 (15-271)||(51966331-51966577)
chr1 (15-271)||(12713872-12714129)
chr1 (15-271)||(50560448-50560694)
chr1 (15-250)||(33361133-33361358)
chr1 (15-271)||(13663000-13663257)
chr1 (15-271)||(34691520-34691767)
chr1 (15-271)||(15314656-15314902)
chr1 (24-271)||(48339728-48339981)
chr1 (15-78)||(10762949-10763012)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (15-271)||(26971-27228)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (15-271)||(9315-9572)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (15-271)||(14830137-14830394)
chr4 (15-253)||(15520254-15520492)
chr4 (15-271)||(34057189-34057447)
chr4 (15-271)||(40621552-40621811)
chr4 (15-253)||(740923-741161)
chr4 (15-257)||(39745486-39745729)
chr4 (18-271)||(54332268-54332522)
chr4 (15-271)||(13627458-13627715)
chr4 (15-271)||(17739446-17739703)
chr4 (15-271)||(26924888-26925145)
chr4 (15-271)||(10259949-10260206)
chr4 (15-271)||(21564249-21564506)
chr4 (15-271)||(24078018-24078275)
chr4 (15-271)||(43331770-43332027)
chr4 (15-271)||(53341816-53342073)
chr4 (15-271)||(51451837-51452094)
chr4 (15-271)||(23478314-23478573)
chr4 (15-271)||(39715136-39715382)
chr4 (15-271)||(52800449-52800695)
chr4 (40-271)||(574772-575001)
chr4 (15-271)||(55999323-55999580)
chr4 (15-271)||(19590252-19590498)
chr4 (15-271)||(35496149-35496395)
chr4 (15-271)||(19832023-19832269)
chr4 (15-271)||(28120847-28121092)
chr4 (15-232)||(5274409-5274627)
chr4 (15-271)||(28135692-28135938)
chr4 (15-271)||(47720695-47720942)
chr4 (18-271)||(33503624-33503867)
chr4 (18-233)||(7644773-7644989)
chr4 (15-271)||(36856507-36856751)
chr4 (15-271)||(1943902-1944154)
chr4 (15-151)||(17698412-17698548)
chr4 (154-271)||(17698721-17698839)
chr4 (189-271)||(26870910-26870992)
chr4 (15-78)||(35712930-35712993)
chr4 (227-271)||(7644410-7644454)
chr4 (229-271)||(37702225-37702267)
chr4 (227-271)||(5272881-5272925)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (15-271)||(4866-5123)
scaffold0032 (15-271)||(11315-11572)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (15-271)||(119428-119684)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (15-271)||(18997-19243)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (15-271)||(152765-153022)
scaffold0006 (15-271)||(65246-65498)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (15-235)||(13493-13714)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (15-220)||(10991-11197)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (95-271)||(4700-4877)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (15-225)||(13191-13391)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (15-256)||(49455-49687)
[»] scaffold1555 (1 HSPs)
scaffold1555 (90-216)||(1521-1648)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (189-271)||(901-983)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (189-271)||(54711-54793)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (210-271)||(1-62)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 19247244 - 19247500
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19247244 gacatcaatgtcaaatggtgatagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtaaacgggattcatat 19247343  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19247344 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataacaggaagataaattaaaagtcataatacattttctttagcttaaaattagttatgcta 19247443  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19247444 ccttta-tttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 19247500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 19320428 - 19320684
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19320428 gacatcaatgtcaaatggtgatagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtaaacgggattcatat 19320527  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19320528 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataacaggaagataaattaaaagtcataatacattttctttagcttaaaattagttatgcta 19320627  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19320628 ccttta-tttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 19320684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14079686 - 14079429
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14079686 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 14079587  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14079586 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14079487  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14079486 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 14079429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23967244 - 23967006
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967244 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 23967145  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  23967144 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 23967046  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23967045 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 23967006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 37029101 - 37029339
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37029101 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 37029200  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  37029201 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 37029299  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37029300 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 37029339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 42061518 - 42061280
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42061518 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 42061419  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  42061418 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 42061320  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42061319 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 42061280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 44939705 - 44939943
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44939705 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 44939804  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  44939805 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 44939903  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44939904 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 44939943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30549163 - 30548906
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30549163 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 30549064  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  30549063 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 30548964  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30548963 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 30548906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33425114 - 33424857
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33425114 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 33425015  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33425014 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatccgttatgcta 33424915  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33424914 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccgtgtaaatat 33424857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44383796 - 44383539
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383796 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 44383697  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  44383696 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaagaaaaaaaaaagaagataaattagaagtcatgatacatgttctttaacttaaaatcagttatgcta 44383597  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44383596 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttgatat 44383539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20663800 - 20663543
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20663800 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 20663701  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20663700 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 20663601  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20663600 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 20663543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 30825583 - 30825839
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30825583 gacatcaatg-caaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 30825681  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30825682 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaggataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 30825781  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30825782 cctttattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgtaaatat 30825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 12759605 - 12759864
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccat---ttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||  || |||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  12759605 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccataatttgtttcaacaattttaattggttaacggg-ttca 12759703  T
Q  112 tataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||    
T  12759704 tataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacaatttttttagcttaaaatcaattatg 12759803  T
Q  211 ctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12759804 ctacctttattttataaattatatataactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 12759864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 38961306 - 38961563
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38961306 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcatatgcgaaagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatat 38961405  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38961406 aatctacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 38961505  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38961506 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 38961563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 41155770 - 41156027
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||  || |||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  41155770 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcatatgcttgagtgatgcttaatttctatttgtttcaacaattttatttggtcaatggtgttcatat 41155869  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  41155870 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaattcagttatgtta 41155969  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41155970 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatat 41156027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 41906990 - 41907246
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||  || |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  41906990 gacatcaatgtcaaatggtgctcgctatagatgcacatgcggaagcgatgcttaattttcgtttgtttcaacaatgtta-ttggccaacggggtacatat 41907088  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41907089 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 41907188  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41907189 ccttcattttataaattatatgtaattatatttgtatacatcttatccatgttaatat 41907246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6478345 - 6478091
Alignment:
Q  18 atcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataat 117  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6478345 atcaatgtcaaatggtggcagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaacttccatttgttttaacaatattaattgatcaacggggtacatataat 6478246  T
Q  118 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacct 216  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6478245 gtacatgcatgcatttatctagactttatgggaagataataggaaaataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacat 6478146  T
Q  217 ttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6478145 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 6478091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44213916 - 44213660
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44213916 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatg-gagagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 44213818  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  44213817 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 44213718  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44213717 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 44213660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 38991651 - 38991907
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38991651 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcatatgcgaaagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatat 38991750  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38991751 aatctacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 38991850  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38991851 ccttta-tttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 38991907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 41976600 - 41976847
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41976600 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacattgttaattggtcaacggggttcatat 41976699  T
Q  115 aatgcacatgcatgca-tttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgct 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||            |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41976700 aatgcacatgaatgcattttatttagccttt-----------ttaggaagataaattagaagtcattgtacattttctttagcttaaaatcagttatgct 41976788  T
Q  213 acctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41976789 acctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 41976847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6301330 - 6301103
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6301330 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 6301231  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6301230 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 6301143  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6301142 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 6301103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 41628033 - 41628279
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41628033 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgtaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 41628132  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41628133 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcctgctacattttatttagcttaaaatcagttatgcta 41628221  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41628222 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 41628279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36602924 - 36602722
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36602924 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 36602825  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36602824 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataataggaagataaattagaagtcatgttacattttctgtagcttaaaatcagttatgcta 36602725  T
Q  214 cct 216  Q
    |||    
T  36602724 cct 36602722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 55 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23627160 - 23626951
Alignment:
Q  55 gggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23627160 gggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatcaacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 23627061  T
Q  155 aataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23627060 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 23626961  T
Q  254 tcttatccat 263  Q
    ||||||||||    
T  23626960 tcttatccat 23626951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 39203773 - 39204019
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  39203773 gacatcaatgtcaaatggttctagctataaatgcgcatgcgggagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggcgaacggggtacatat 39203872  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39203873 aatccacattcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcgtggtacattttctttagcttaaaatcaattatgcta 39203961  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203962 cattcattttataaattttatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 39204019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 254
Target Start/End: Original strand, 29433199 - 29433419
Alignment:
Q  27 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  29433199 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatgtaatccacatgca 29433298  T
Q  127 tgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttat 225  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||        |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29433299 tgcatttatcttaactttataggaagataataggaa--------agaagtcatgttacattttctttagcttaaaatctgttatgctaccttcattttat 29433390  T
Q  226 gaattatatgtaactatattcgcatacat 254  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29433391 aaattatatgtaactttattcgcatacat 29433419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19396221 - 19396015
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| || || |||||    
T  19396221 gacatcaatgtaaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggagtacatat 19396122  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattaga-atcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19396121 aatgtacatgcatacatttatctagactttatacgaagataattggaagataaattagacgtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttaagcta 19396022  T
Q  214 cctttat 220  Q
    |||||||    
T  19396021 cctttat 19396015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45294905 - 45294767
Alignment:
Q  18 atcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataat 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45294905 atcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcaaatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggttcatataat 45294806  T
Q  118 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45294805 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataa 45294767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42811806 - 42811665
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42811806 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaacgttaattggtcaacggggtacatat 42811707  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataa 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42811706 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa 42811665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22343271 - 22343103
Alignment:
Q  91 ttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||           ||||||| ||||  ||||||| |    
T  22343271 ttaattggtcaacggggtacatataatgtgcatacatgcatttatctagattttataggaagataa-----------attagaagtcatgttacattttc 22343183  T
Q  190 tttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22343182 tttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaac--tattcgcatacatcttatccatgtaaatat 22343103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22354931 - 22354763
Alignment:
Q  91 ttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||           ||||||| ||||  ||||||| |    
T  22354931 ttaattggtcaacggggtacatataatgtgcatacatgcatttatctagattttataggaagataa-----------attagaagtcatgttacattttc 22354843  T
Q  190 tttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22354842 tttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaac--tattcgcatacatcttatccatgtaaatat 22354763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42811621 - 42811534
Alignment:
Q  184 atttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42811621 attttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 42811534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12250875 - 12250793
Alignment:
Q  189 ctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12250875 ctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatat 12250793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 39444332 - 39444414
Alignment:
Q  189 ctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39444332 ctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatat 39444414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22345641 - 22345559
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattg 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  22345641 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatacacatacggaagtgatgcttaatttccatttgtctgaacaatgttaattg 22345559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22357301 - 22357219
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattg 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  22357301 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatacacatacggaagtgatgcttaatttccatttgtctgaacaatgttaattg 22357219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36598198 - 36598138
Alignment:
Q  211 ctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36598198 ctacctttattttataaattatatgtaattatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 36598138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45294752 - 45294697
Alignment:
Q  216 tttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45294752 tttattttatgaattatatgtaactatattcacatacattttatccatgttaatat 45294697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1515860 - 1515603
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1515860 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 1515761  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1515760 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1515661  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1515660 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatat 1515603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9917562 - 9917302
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9917562 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatat 9917463  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagc---ttaaaatcagttatg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  9917462 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaattagaagtcataatacattttctttagcttattaaaatcagttatg 9917363  T
Q  211 ctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9917362 ctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 9917302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 21097121 - 21097378
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21097121 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 21097220  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21097221 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaattagttatgcta 21097320  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21097321 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 21097378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6343581 - 6343343
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6343581 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 6343482  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6343481 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 6343383  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6343382 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 6343343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14324065 - 14323827
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14324065 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 14323966  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  14323965 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 14323867  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14323866 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 14323827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 271
Target Start/End: Original strand, 4810975 - 4811228
Alignment:
Q  19 tcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatg 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4810975 tcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatg 4811074  T
Q  119 cacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctt 217  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4811075 aacatgcatgcatatatctagactttatatgaagataataggaatataaattagaagtcatgatacattttttttagcttaaaatcagttacgctacctt 4811174  T
Q  218 tattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4811175 tattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatat 4811228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18093582 - 18093326
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18093582 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcggaagcgatgcttaattttcatctgtttcagcaatgttaattggtcaacggggttcatat 18093483  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18093482 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcag-tatgcta 18093384  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18093383 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 18093326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 26821042 - 26821299
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26821042 gacatcaatgtcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 26821141  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26821142 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataagatgataaattagaagccatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 26821241  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26821242 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatat 26821299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 42884813 - 42885070
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42884813 gacatcaatgtcaaatggtgtcagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttacatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 42884912  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  42884913 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagtaatgtta 42885012  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42885013 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 42885070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1993793 - 1993555
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1993793 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgtgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 1993694  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  1993693 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 1993595  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1993594 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 1993555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 28501705 - 28501943
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501705 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 28501804  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  28501805 aatgcacatacatgtatttatctagactttctaggaagataataagaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 28501903  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28501904 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 28501943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 3710317 - 3710574
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3710317 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 3710416  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  3710417 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 3710516  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3710517 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 3710574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11867099 - 11866842
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11867099 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 11867000  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11866999 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 11866900  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11866899 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 11866842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16725219 - 16724962
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16725219 gacatcaatgtcaaatgatgctagttatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggatgcatat 16725120  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16725119 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 16725020  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16725019 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttagccatgtaaatat 16724962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35358492 - 35358235
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35358492 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 35358393  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35358392 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 35358293  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35358292 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 35358235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 14752595 - 14752852
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14752595 gacattaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgtgggagcgatgcataattttcgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 14752694  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14752695 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14752794  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14752795 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatat 14752852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9544477 - 9544231
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544477 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 9544378  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9544377 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9544289  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9544288 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 9544231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10048854 - 10048608
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048854 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 10048755  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10048754 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatatattttctttaacttaaaatcagttatgcta 10048666  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10048665 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatat 10048608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36633945 - 36633699
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36633945 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 36633846  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36633845 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 36633757  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  36633756 cctttattttataaattatatgtaactatattcgattacatcttatccatgtaaatat 36633699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30567724 - 30567478
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30567724 gacatcaatttcaaatggttctagctatatatgcacatgtggtagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatat 30567625  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30567624 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 30567536  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30567535 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 30567478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33664654 - 33664408
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33664654 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatat 33664555  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  33664554 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagtttaaaatcagttatggta 33664466  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33664465 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 33664408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4291505 - 4291280
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4291505 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 4291406  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4291405 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 4291317  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcat 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4291316 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcat 4291280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45205893 - 45205631
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45205893 gacatcaaggtcaaattgtgcaagctatatatgcccatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatat 45205794  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45205793 aatgtagatgcatgcatttatctagactttatattaagataataggaagataaattagaagtcatggtgcattttctttaacttaaaatcagttatgcta 45205694  T
Q  214 cctttatttta-----tgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45205693 cctttattttataaattaaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 45205631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 271
Target Start/End: Original strand, 17036731 - 17036948
Alignment:
Q  55 gggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagat 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17036731 gggagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 17036830  T
Q  155 aataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17036831 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 17036930  T
Q  254 tcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17036931 tcttatccatgttaatat 17036948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 271
Target Start/End: Original strand, 17091239 - 17091456
Alignment:
Q  55 gggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagat 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17091239 gggagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 17091338  T
Q  155 aataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17091339 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 17091438  T
Q  254 tcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17091439 tcttatccatgttaatat 17091456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 16883358 - 16883604
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  16883358 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggattgatgcttaattttcatttgtttcaacaattttacttggccaacggagtacatat 16883457  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16883458 aatccacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattataagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 16883546  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  16883547 ccttcattttataacttatatgtaactatatattcatacatcttatccatgttaatat 16883604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 17041048 - 17041294
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  17041048 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggattgatgcttaattttcatttgtttcaacaattttacttggccaacggagtacatat 17041147  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17041148 aatccacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattataagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 17041236  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  17041237 ccttcattttataacttatatgtaactatatattcatacatcttatccatgttaatat 17041294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 263
Target Start/End: Original strand, 17025054 - 17025263
Alignment:
Q  55 gggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagat 154  Q
    |||||||||| || ||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17025054 gggagtgatgtttcatttccatttgtttcaacaatattaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 17025153  T
Q  155 aataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17025154 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 17025253  T
Q  254 tcttatccat 263  Q
    ||||||||||    
T  17025254 tcttatccat 17025263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10822787 - 10822539
Alignment:
Q  20 caatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgc 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |    
T  10822787 caatgttaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgtggtacatataatcc 10822688  T
Q  120 acatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaatcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctaccttta 219  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |   || ||   ||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10822687 acatgcatgcatttatctatactatataggaagata--aattagttatgcta-cttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttttgctaccttca 10822591  T
Q  220 ttttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822590 ttttataaatcatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 10822539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Original strand, 11447071 - 11447230
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11447071 gacatcaatgtcagatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggttacatat 11447170  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447171 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaa 11447230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30571340 - 30571163
Alignment:
Q  84 aacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataata 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||||||| ||||  ||    
T  30571340 aacaatgttaattggtcaacagggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attagaagtcatgcta 30571252  T
Q  183 catttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30571251 cattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 30571163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19168449 - 19168255
Alignment:
Q  65 cttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaaga 164  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||             |||||||||    
T  19168449 cttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatatattgtacatgcatgcagttatctagact-------------ataggaaga 19168363  T
Q  165 taaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccat 263  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19168362 taaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatactacctttattttaaaaattatatgtaactatattcgcagacatcttatccat 19168263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 271
Target Start/End: Original strand, 11447955 - 11448045
Alignment:
Q  181 tacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447955 tacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaaatatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 11448045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33639547 - 33639290
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639547 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 33639448  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33639447 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaaaataatatgaagataaattagaattcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33639348  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33639347 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 33639290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 42917241 - 42917498
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  42917241 gacattaatgtcaaatggtgctacctatagacgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacgaagttcatat 42917340  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42917341 aatgcacatgcatgcatttatctaaccttcatatgaagataataggaagataaattagaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 42917440  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42917441 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 42917498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4482072 - 4481815
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4482072 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 4481973  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  4481972 aatccatatacatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagtttaaaatcaattatgcta 4481873  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4481872 ccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgttaatat 4481815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23767311 - 23767054
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23767311 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 23767212  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23767211 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagtcatgcta 23767112  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23767111 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 23767054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6912215 - 6911977
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6912215 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 6912116  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6912115 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 6912017  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6912016 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 6911977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47574193 - 47573955
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47574193 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 47574094  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  47574093 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 47573995  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47573994 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 47573955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 3794901 - 3795158
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  || ||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  3794901 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcggtgcttaatttccatttgtttcaacgatattagttggtcaacggggttcatat 3795000  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3795001 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgcta 3795100  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3795101 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 3795158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9227093 - 9226836
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9227093 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcatatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 9226994  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9226993 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9226894  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9226893 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatat 9226836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 5962092 - 5962347
Alignment:
Q  17 catcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5962092 catcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgttttattaatgttaattggtcaacggggtacatataa 5962191  T
Q  117 tgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacc 215  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5962192 tgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacc 5962291  T
Q  216 tttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5962292 tttattttataaattatatgtaattatattcgcatacattttatccatgtaaatat 5962347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8926763 - 8926506
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8926763 gacatcaatgtcaaatggtgctggctataaatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 8926664  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8926663 aatgtacatgcatgcatttatctagactttacaggaagataataggatgataaattaaaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 8926564  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8926563 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatat 8926506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 14308324 - 14308578
Alignment:
Q  18 atcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataat 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14308324 atcaatgtcaaatggtgctggctatatatacacatgcggaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggttgcatataat 14308423  T
Q  118 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacct 216  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308424 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 14308523  T
Q  217 ttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14308524 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 14308578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19034528 - 19034271
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19034528 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 19034429  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19034428 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 19034329  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19034328 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 19034271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 20720108 - 20720365
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20720108 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 20720207  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20720208 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 20720307  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20720308 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 20720365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27735921 - 27735664
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27735921 gacatcattgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaatttgtcaacggggttcatat 27735822  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27735821 aatgcacatgaatgcatttttctagccttttcaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 27735722  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27735721 cctttcttttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatat 27735664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34282977 - 34282720
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34282977 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggaatgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 34282878  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  34282877 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 34282778  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34282777 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 34282720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39649812 - 39649566
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39649812 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 39649713  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39649712 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 39649624  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39649623 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 39649566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 9148752 - 9149009
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148752 gacatcattgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagcgatacttaattttcatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 9148851  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  9148852 aatgcacatgaatgtatttatctaccctttttaggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttattcta 9148951  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9148952 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatat 9149009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 29490348 - 29490605
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29490348 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacattcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 29490447  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29490448 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 29490547  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29490548 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 29490605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33230834 - 33230577
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33230834 gacatcaatgtcaaatggtgctagctgtagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaaaggggtacatat 33230735  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  33230734 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 33230635  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33230634 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 33230577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 20764770 - 20765026
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20764770 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatg-gggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 20764868  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20764869 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 20764968  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20764969 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 20765026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31898651 - 31898405
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31898651 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 31898552  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31898551 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 31898463  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31898462 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 31898405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 17170450 - 17170696
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17170450 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 17170549  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17170550 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 17170638  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17170639 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 17170696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 48528621 - 48528374
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaa-ttaaacaatgttaattggtcaacggggttcata 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48528621 gacatcatcgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtgttcaacaatgttaattggtcaacggggttcata 48528522  T
Q  114 taatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgct 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||           ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48528521 taatgcacatgaatgcatttatctagcctttttacgaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgct 48528433  T
Q  213 acctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48528432 acctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 48528374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23300581 - 23300335
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23300581 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagtaatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggatcctat 23300482  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaatcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctac 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||      ||||    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23300481 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagat-ata-----ttaaa----agtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctac 23300392  T
Q  215 ctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23300391 ctttattttataaattacatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatat 23300335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47164431 - 47164167
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  47164431 gacatcaatgttaaatggtgctagctataaatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgggatacatat 47164332  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattag--------aatcataatacatttcctttagcttaaaatcagt 206  Q
    | | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||          || |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  47164331 agttcacatgcatgcatttatctatactctataggaagataatatgaagataaattagttatgctacttcctggtacattttctttagcttaaaatcagt 47164232  T
Q  207 tatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47164231 tatgctaccttcattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatat 47164167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 47173879 - 47174124
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  47173879 gacatcaatgtcaaa-ggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaagttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggtacatat 47173977  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47173978 aatgcacatgcgtgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcggttatgcta 47174066  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47174067 cctttactttataaattatatataattatattcgcatacatcttatccatgttaatat 47174124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 19520565 - 19520814
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19520565 gacataaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 19520664  T
Q  115 a---atgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattag-aatcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatg 210  Q
    |   ||||||||||||| |||||||||| ||||           ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19520665 aatcatgcacatgcatgaatttatctagacttt-----------ataggaagataaactagaaatcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatg 19520753  T
Q  211 ctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19520754 ctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatcaatgtaaatat 19520814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42245705 - 42245471
Alignment:
Q  27 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  42245705 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggcaaacggggtacatataatccacatgca 42245606  T
Q  127 tgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttat 225  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||           ||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42245605 tgcatttatccaaactttataggaag-----------ataaattagaagtcatggtacagtttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttat 42245517  T
Q  226 gaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245516 aaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 42245471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 42686960 - 42687200
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42686960 gacatcaacgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttatttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 42687059  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattaga-atcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| ||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  42687060 aatgtacatgcatgc-----------------aggaagataataggaagataaattagaggtcatgctacattttctttagcttaaaattagttatgcta 42687142  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42687143 cctttattttataaattacatgtatctatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 42687200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 17477291 - 17477537
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17477291 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17477390  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaatcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctac 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || ||  | ||||  || ||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  17477391 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaagata----------aattttaagtcatgctatattttttttagcttaaaatcagttatggtac 17477480  T
Q  215 ctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  17477481 ctttatttaataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatat 17477537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17575923 - 17575677
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17575923 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17575824  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaatcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctac 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || ||  | ||||  || ||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  17575823 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaagata----------aattttaagtcatgctatattttttttagcttaaaatcagttatggtac 17575734  T
Q  215 ctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  17575733 ctttatttaataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatat 17575677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 33030199 - 33030444
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33030199 gacatcaatgtcaaatggtactagctatatatgcacatgcggaagtggtgcttaattttcatttgtttcaagaatgttaattggtcaacggggtacatat 33030298  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33030299 aatgtacatacatacatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcacgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33030387  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33030388 ccttta-tttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgtaaatat 33030444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 17481737 - 17481984
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17481737 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17481836  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaatcataataca-tttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || ||  | ||||  || | |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  17481837 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaagata----------aattttaagtcatgctatatttttttttagcttaaaatcagttatggta 17481926  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  17481927 cctttatttaataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatat 17481984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17571477 - 17571230
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17571477 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17571378  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaatcataataca-tttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || ||  | ||||  || | |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  17571377 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaagata----------aattttaagtcatgctatatttttttttagcttaaaatcagttatggta 17571288  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  17571287 cctttatttaataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatat 17571230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38435247 - 38435165
Alignment:
Q  189 ctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38435247 ctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatat 38435165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 42996019 - 42996101
Alignment:
Q  189 ctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42996019 ctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatat 42996101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1074139 - 1073882
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1074139 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 1074040  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1074039 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1073940  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1073939 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 1073882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18599862 - 18599605
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18599862 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 18599763  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18599762 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 18599663  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18599662 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 18599605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14888813 - 14888556
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14888813 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttcattggtcaacggggtgcatat 14888714  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14888713 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14888614  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14888613 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 14888556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33322329 - 33322072
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33322329 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcaaatgtggaagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 33322230  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33322229 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33322130  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  33322129 cctttattttataaattatatgtaactatatctgcatacgtcttatccatgttaatat 33322072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 34320463 - 34320720
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34320463 gacatcaatgtcaaatggtgctagatatagatgcacaagcgggagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 34320562  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34320563 aattcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaacatatattagaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgcta 34320662  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34320663 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataaatctcatccatgttaatat 34320720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13457588 - 13457350
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13457588 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 13457489  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  13457488 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 13457390  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13457389 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 13457350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11946345 - 11946088
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11946345 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 11946246  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11946245 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagtaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 11946146  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11946145 catttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 11946088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 15275029 - 15275286
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15275029 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatattcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 15275128  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15275129 aatgtacattcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 15275228  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15275229 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 15275286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 34855327 - 34855583
Alignment:
Q  16 acatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatata 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34855327 acatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtgcatata 34855426  T
Q  116 atgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctac 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34855427 atgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctac 34855526  T
Q  215 ctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34855527 ctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 34855583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 7222115 - 7222372
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7222115 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcgtaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 7222214  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7222215 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagagaaattagaagtcatgctgcattttctttaacttaaaatcagttatgcta 7222314  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7222315 cctttattttataaattatatgtaactgtattcgcatacatcttatccatgtaaatat 7222372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 249283 - 249540
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  249283 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 249382  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  249383 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 249482  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  249483 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 249540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7219740 - 7219483
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7219740 gacatcaatgtcaaattgtgctagctatatatgccaatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatat 7219641  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7219640 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 7219541  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7219540 cctttattttataaattagatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 7219483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 2520534 - 2520791
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2520534 gacatcaatgtcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagagatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 2520633  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  2520634 aatgtacttgcatgcatttatctagactttataggtagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgata 2520733  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2520734 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 2520791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12580672 - 12580415
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12580672 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatat 12580573  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  12580572 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 12580473  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12580472 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 12580415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 17938893 - 17939150
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17938893 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacattt 17938992  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  17938993 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagttatgctacatgttctttagcttaaaatcagttatggta 17939092  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17939093 cctttatttaataaattatttgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatat 17939150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 25532636 - 25532881
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532636 gacatcaatgtcaaatggtgctatctatacatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 25532735  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||            |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25532736 aatgcacatgaatgcatttatctagcattt------------taggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 25532823  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25532824 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatat 25532881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9979924 - 9979678
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9979924 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 9979825  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9979824 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9979736  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9979735 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 9979678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 24445351 - 24445597
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445351 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 24445450  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24445451 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 24445539  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24445540 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 24445597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Original strand, 1219948 - 1220173
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219948 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 1220047  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1220048 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1220136  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcat 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1220137 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcat 1220173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11935513 - 11935299
Alignment:
Q  58 agtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataat 157  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11935513 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttatagtaagataat 11935414  T
Q  158 aggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatct 256  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935413 aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacatttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 11935314  T
Q  257 tatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| |||||    
T  11935313 tatccatgtaaatat 11935299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 33978344 - 33978590
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33978344 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaataatgttaattggtcaatggggtacatat 33978443  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  33978444 aatgcacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatggtacattttatttagcttaaaatcagttatgtta 33978532  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33978533 ccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 33978590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Original strand, 4423756 - 4424000
Alignment:
Q  16 acatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatata 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4423756 acattaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacggggtacatata 4423855  T
Q  116 atgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctac 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4423856 atgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctac 4423944  T
Q  215 ctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaata 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4423945 ctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgtaaata 4424000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 1931420 - 1931661
Alignment:
Q  21 aatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgca 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||  || ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  1931420 aatgtcaaatgatgctagctatagatgcccatgcaggagcgatgtttaatttccgtttgcttcaacaatgttaattagccaacggggtacatataatcca 1931519  T
Q  121 catgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctaccttta 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||          ||||||||||||||    
T  1931520 catgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagc----------ttatgctaccttta 1931609  T
Q  220 ttttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1931610 ttttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatat 1931661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22374728 - 22374549
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22374728 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggaacatat 22374629  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttag 194  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  22374628 aatatacatgcatgcatttatctagacttt-taagaagataataagaagataaattagaagtcatgctacattttctttag 22374549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1080467 - 1080374
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggt 108  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  1080467 gacatcaatgtcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 1080374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22374501 - 22374460
Alignment:
Q  230 tatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22374501 tatatgtaactatattcgcatatatcttatccatgtaaatat 22374460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 271
Target Start/End: Original strand, 21029465 - 21029718
Alignment:
Q  19 tcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21029465 tcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatg 21029564  T
Q  119 cacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctt 217  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21029565 tacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcaaactacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctt 21029664  T
Q  218 tattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21029665 tattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 21029718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12589146 - 12588889
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || || ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12589146 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaataatattagttggtcaacggggttcatat 12589047  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12589046 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 12588947  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12588946 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgttaatat 12588889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20996810 - 20996553
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20996810 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 20996711  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  20996710 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgttacgttttctttagcttaaaatatgttatgcta 20996611  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20996610 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 20996553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26321941 - 26321684
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26321941 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtgcatat 26321842  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26321841 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 26321742  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26321741 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 26321684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33612006 - 33611749
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33612006 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 33611907  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33611906 aatgtacatgcttgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcgtgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33611807  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33611806 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 33611749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 27065255 - 27065512
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27065255 gacatcaatgtcaaatggtgctagctgtatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaataatgttaattggtcaacggggtacatat 27065354  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  27065355 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataatttagaagtcatgctacattttctttagtttaaaatcagttatacta 27065454  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27065455 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 27065512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 37463737 - 37463994
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37463737 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatat 37463836  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  37463837 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 37463936  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37463937 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 37463994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 2194518 - 2194775
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2194518 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtaatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 2194617  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2194618 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 2194717  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2194718 cctttattttataaattatatataactatattcacatacatcttatccatgtaaatat 2194775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 30141927 - 30142173
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30141927 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 30142026  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30142027 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 30142115  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30142116 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 30142173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 19394842 - 19395079
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19394842 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggttcatat 19394941  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  19394942 aatgca-atacatgtatttatctagactttataagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 19395039  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19395040 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 19395079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 7285030 - 7285287
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7285030 gacatcaacgtcaaatggtgctaactatatatgcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggtacatat 7285129  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7285130 aatgtacatgcatgcatttatctagactttattggaagataataagatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 7285229  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7285230 cctttattttatagattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 7285287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Original strand, 30688668 - 30688917
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30688668 gacatcaatgtcagatggtgctggctatatatgcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 30688767  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30688768 aatgtacatgcatgcatttatctagaatttataggaagataataggatgataaagtagaagtcaagttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 30688867  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccat 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688868 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccat 30688917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25697378 - 25697132
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25697378 gacatcattgtaaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 25697279  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25697278 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 25697190  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25697189 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 25697132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3211063 - 3210807
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| | |||||    
T  3211063 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcgcatgcgggagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggccaacggg-tacatat 3210965  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  3210964 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatgggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatgaattatgcta 3210865  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    | || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3210864 cattcattttataaattacatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 3210807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 34717014 - 34717260
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717014 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 34717113  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||            ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34717114 aatgcacatgaatgcatttatctaaccttt-----------ttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 34717202  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34717203 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 34717260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 289961 - 290218
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||  || ||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  289961 gacatcaatgtaaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttgtttgtttcaacaatgttaattggccaacgggatacatat 290060  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  290061 aatctacatgcatgcatttacctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcattgtatattttctttagtttaaaatcagttatgcta 290160  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  290161 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatatatcttatccatgttaatat 290218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 41690700 - 41690946
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41690700 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 41690799  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41690800 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 41690888  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  41690889 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatatgtcttatccatgttaatat 41690946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3151469 - 3151213
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||  | ||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3151469 gacatcaatgtcaaatggagctagctatatgtgcacatgcagaagtgatgcttaatttt-agttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 3151371  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3151370 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatatgaagataaattagaagtaatgctacattttctttagcttaaaattagttatgcta 3151271  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3151270 cctttattttataaattatatgtaattatattcgcatatatcttatccatgtaaatat 3151213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3398007 - 3397771
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3398007 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcaaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtaaatat 3397908  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
     ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3397907 -atgtacatgtatacatttatctagactttataggaagataatgggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 3397809  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcata 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3397808 cctttattttataaattatatgtaactatatttgcata 3397771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 271
Target Start/End: Original strand, 9701645 - 9701862
Alignment:
Q  55 gggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9701645 gggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatctacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 9701744  T
Q  155 aataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9701745 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 9701844  T
Q  254 tcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9701845 tcttatccatgttaatat 9701862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31296398 - 31296170
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaa-tggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcata 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31296398 gacatcaatgtcaaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcata 31296299  T
Q  114 taatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgct 212  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||           ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  31296298 taatgcacatacatgtatttatctaaactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagct 31296211  T
Q  213 acctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31296210 acctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 31296170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 4881638 - 4881883
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4881638 gacatcaatatcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaattttcatttatttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatat 4881737  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4881738 aatatacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaagatcagttatgcta 4881826  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4881827 cctttattttataaattatatgtaactatattcg-atacatcttatccatgtaaatat 4881883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 20349293 - 20349508
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20349293 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 20349392  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||| || ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  20349393 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggta 20349481  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaact 240  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  20349482 cctttatttaataaattatatgtaact 20349508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 3027813 - 3028013
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3027813 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttatttcaacaatgttaattggtcaacgtggtacatat 3027912  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| | ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3027913 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagttatgctacattttctatagcttaaaatcagttatgcta 3028001  T
Q  214 cctttattttat 225  Q
    ||||||||||||    
T  3028002 cctttattttat 3028013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1852783 - 1852539
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1852783 gacatcaatgtcaaatcgtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatacttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatat 1852684  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1852683 aatgtacatgcatacatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1852595  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  || ||||||||||||| |||||    
T  1852594 cctttattttataaattatatgt--ttatattcgtgtatatcttatccatgtaaatat 1852539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 271
Target Start/End: Original strand, 19447546 - 19447611
Alignment:
Q  206 ttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19447546 ttatgctacctttattttataaattatatataactatattcgtatacatcttatccatgtaaatat 19447611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 271
Target Start/End: Original strand, 3028314 - 3028358
Alignment:
Q  227 aattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3028314 aattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 3028358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 48
Target Start/End: Original strand, 19447484 - 19447517
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgc 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19447484 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgc 19447517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11951843 - 11951586
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11951843 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatat 11951744  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11951743 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttgaaatcagttatgcta 11951644  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11951643 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 11951586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11326510 - 11326253
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11326510 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 11326411  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11326410 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 11326311  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11326310 cctttattttataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatat 11326253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 22477094 - 22477351
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22477094 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattagttggtcaacggagttcatat 22477193  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22477194 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 22477293  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22477294 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 22477351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5253110 - 5252872
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253110 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 5253011  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  5253010 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 5252912  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5252911 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 5252872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11598832 - 11598575
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11598832 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcaggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 11598733  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||    
T  11598732 aatgcatatgagtgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcaattaagata 11598633  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11598632 cctttattttataaattatatgtaactatattagcatacgtcttatccatgttaatat 11598575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 35436368 - 35436625
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35436368 gacatcaatgtcaactggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 35436467  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35436468 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 35436567  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35436568 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatat 35436625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 55295647 - 55295390
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55295647 gacatcattgtcaaatggtgctagctataaattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaatttgtcaacggggttcatat 55295548  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  55295547 aatgcacatgaatgcatttttctagccttttcaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaataagttatgcta 55295448  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55295447 cctttcttttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 55295390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31369885 - 31369628
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31369885 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 31369786  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31369785 aatgtacatgcatgcatttatctagactttagaggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaataagttatgcta 31369686  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  31369685 cctttattttataaattatacgtaactatattcatatacatcttatccatgtaaatat 31369628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36168319 - 36168063
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  36168319 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtgcatat 36168220  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  36168219 aatccacatgcatgcatttttctagactttataggaagctaataagaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgata 36168120  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaata 270  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36168119 ccttgattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaata 36168063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35088703 - 35088449
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35088703 gacatcaatgtcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 35088604  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35088603 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt---tgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 35088507  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35088506 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatat 35088449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 23192848 - 23193105
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  23192848 gacatcaatgtcaaattgtgctagctatatatgcccatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggatacatat 23192947  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23192948 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 23193047  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23193048 cctttattataaaaattaaatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 23193105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 52854310 - 52854053
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52854310 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatccacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgtggtacatat 52854211  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  52854210 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagatgataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaattagttatgata 52854111  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52854110 tctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 52854053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 8242095 - 8242343
Alignment:
Q  18 atcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataat 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8242095 atcaatgtcaaatggtgctagcaatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacggggtacatataat 8242194  T
Q  118 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacct 216  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||     |||||||    
T  8242195 gcacatgcatgcatttatctagactctataagaagataagaggaagataaattagaagtcatgatacattt-ctttagcttaaaatca-----gctacct 8242288  T
Q  217 ttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8242289 ttattttataaattatatgtaactacattcgcatacatcttatccatgttaatat 8242343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40827878 - 40827646
Alignment:
Q  40 tatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctag 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40827878 tatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttagttggtcaacgagtttcatataatgcacatgaatgcatttatctag 40827779  T
Q  140 cctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaa 238  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40827778 ccttttttggaagataataggaagataaattagaagtgatgatacattttctttagcttaaaatcagttatactacctttattttataaattatatgtaa 40827679  T
Q  239 ctatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40827678 ctatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 40827646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 48976071 - 48976328
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48976071 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcgaaagtgatgcataattttcatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 48976170  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48976171 aatgtacatgtatgcatttatctatactttataggaagataatatgaagataaattagaagtcaagctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 48976270  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  48976271 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatat 48976328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 49112461 - 49112718
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  49112461 gacatcaatgccagatggtgctggctatatatgcacatgcgaaagtgatgcataatttccatttgtttcaacaatgttgtttggtcaacggggtacatat 49112560  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49112561 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataagaagataaattagaattcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 49112660  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49112661 cctttattttataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatat 49112718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 51247759 - 51248005
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51247759 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacgtgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 51247858  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51247859 aatgtacatgcgtgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 51247947  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51247948 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 51248005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 16495280 - 16495537
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16495280 gacatcaatgtaaaatggtgttagctataaatgcgcatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatat 16495379  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16495380 aatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataataggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 16495479  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16495480 ccttcattttataaattatatgtaactatattaacatacatcttatccatgttaatat 16495537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44073584 - 44073332
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44073584 gacatcaatatcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatat 44073485  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||     ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  44073484 aatgcacatgcatgcatttctctagactt-----gaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 44073390  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44073389 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 44073332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 918068 - 918314
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  918068 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatat 918167  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||           ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  918168 aatgcacatgcatgcatttctctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 918256  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  918257 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 918314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39797198 - 39796971
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797198 gacattaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 39797099  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  39797098 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 39797011  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39797010 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 39796971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6104983 - 6104737
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6104983 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatggacatgcggaagtgatacttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtctacggggtgcatat 6104884  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6104883 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 6104795  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6104794 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatgcatcttatccatgtaaatat 6104737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21700427 - 21700181
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  21700427 gacatcaatgtcaaatggtgctaactatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtaaatat 21700328  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21700327 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 21700239  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21700238 cctttattttataaataatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 21700181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19894223 - 19893980
Alignment:
Q  18 atcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataat 117  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19894223 atcattgtcaaatggtcttagctaaagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtctacggggttcatataat 19894124  T
Q  118 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||           ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19894123 gcacatgaatgcatttatctagcctatttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 19894035  T
Q  217 ttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19894034 ttattttataagttatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 19893980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 52841391 - 52841145
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52841391 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 52841292  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||           ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  52841291 aatgtacatgcatgcatttatctggactttgtaggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcggttatgcca 52841203  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52841202 cctttatttcataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 52841145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 50740750 - 50740996
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50740750 gacatcaatgtcaaatggtggtagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaatggggttcatat 50740849  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||| || ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  50740850 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggta 50740938  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  50740939 cctttatttaataaattatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatat 50740996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 11382562 - 11382810
Alignment:
Q  17 catcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataa 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11382562 catcaaagtcaaatggtgctagctatagatgtacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataa 11382661  T
Q  117 tgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacc 215  Q
    | |||||||||| |||||| | | |||||||||||| |     || ||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  11382662 tccacatgcatggatttatatggactttataggaagct-----gaggataaattacaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttacgttacc 11382756  T
Q  216 tttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaat 269  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11382757 ttcattttataaattatatataactatattcgcagacattttatccatgttaat 11382810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 50772104 - 50771858
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50772104 gacatcaatgtcaaatggtggtagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaatggggtgcatat 50772005  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           |||||||| || ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  50772004 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggta 50771916  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  50771915 cctttatttaataaattatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatat 50771858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9879781 - 9879550
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9879781 gacattaatgtcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatat 9879682  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||           |||||||| || | || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  9879681 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattaaaagtgatgatacattttctttagtttaaaatcaattatgcta 9879593  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatct 256  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9879592 ccttcattttataaattatatgtaattatattcgcatacatct 9879550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54793822 - 54793576
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  54793822 gacatcaatgtcaaatggtgttagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaac-gggtacatat 54793724  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaatcataatacatttcctttagct-taaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||          ||||| | | |    |||| |||||    
T  54793723 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaatataataggaagataaattagactaata----------tttaggtattatgagagttgtgcta 54793634  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54793633 ccttcattttataaattatatgtaattatattcacatacatcttatccatgttaatat 54793576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28164954 - 28164813
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28164954 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgagggagtgatgcttaatttccattcgtttcaaaaatgttaattgatcaacgaggttcatat 28164855  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataa 156  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28164854 aatgtgcatgcatgcatttatctagactttataggaagataa 28164813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 54512345 - 54512466
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  54512345 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttctaattgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacataa 54512444  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatc 136  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  54512445 aatgtacatgcatgcatttatc 54512466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 2845651 - 2845558
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| ||||    
T  2845651 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcatcaatgttaattggtcaaccgggt 2845558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 48521730 - 48521633
Alignment:
Q  175 tcataatacatttcctttagcttaaaa-tcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48521730 tcatgatacattttctttagcttaaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 48521633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11952146 - 11952050
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11952146 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttca 11952050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2845558 - 2845468
Alignment:
Q  181 tacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||    
T  2845558 tacatttgctttagcttaaaatcaattatgctacctttattttataaattatatgtaactatatttacatacaccttacacatgttaatat 2845468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 18813614 - 18813871
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18813614 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 18813713  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18813714 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 18813813  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18813814 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 18813871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 34686982 - 34687239
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34686982 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 34687081  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34687082 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 34687181  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34687182 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 34687239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41830904 - 41830647
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41830904 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 41830805  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41830804 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 41830705  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41830704 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 41830647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 42681785 - 42682042
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || || ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  42681785 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaataatattagttggtcaacgggattcatat 42681884  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42681885 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 42681984  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42681985 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgttaatat 42682042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 18111113 - 18111351
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111113 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 18111212  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  18111213 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 18111311  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18111312 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 18111351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 43255408 - 43255170
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43255408 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 43255309  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  43255308 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 43255210  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43255209 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 43255170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 50395822 - 50395584
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50395822 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 50395723  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  50395722 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 50395624  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50395623 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 50395584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10695044 - 10694787
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10695044 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtaatgcttagtttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggttcatat 10694945  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattaga-atcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  10694944 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagatcaattagaggtcatgatacattttctttagcttaaagtaagttatgcta 10694845  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10694844 catttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 10694787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29841542 - 29841285
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  || ||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  29841542 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcggtgcttaatttccatttgtttcaacgatattagttggtcaacggggttcatat 29841443  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29841442 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgcta 29841343  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29841342 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 29841285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 31619084 - 31619341
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31619084 gacatcaatgtcaaatgatgccagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 31619183  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31619184 aatgcacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 31619283  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31619284 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatat 31619341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 52522423 - 52522166
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  52522423 gacatcaatgttaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttagttggtcaacggggtacatat 52522324  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52522323 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcaattatgcta 52522224  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52522223 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 52522166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 52309229 - 52309486
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52309229 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttgcatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 52309328  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  52309329 aatgcacatgaatgcatttacctagccttcttaagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagtcatgcta 52309428  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  52309429 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatat 52309486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28566572 - 28566315
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  28566572 gacatcaatgtcaaatggtgttagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatat 28566473  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28566472 aatccacatgcatgcatatatctagactttataggaatataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 28566373  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28566372 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatat 28566315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38846079 - 38845822
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38846079 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacgtgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 38845980  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38845979 aatgtacatgcatgcgtttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagtcatgcta 38845880  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  38845879 cctttattttataaattatatgtaaatatattcaaatacatcttatccatgtaaatat 38845822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41963785 - 41963528
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41963785 gacatcaatgtcaaatggtaccggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggtgcatat 41963686  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41963685 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataagaggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttacgcta 41963586  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41963585 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 41963528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 4891524 - 4891770
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4891524 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 4891623  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4891624 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 4891712  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4891713 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 4891770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29186963 - 29186717
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29186963 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 29186864  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29186863 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 29186775  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29186774 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 29186717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51966577 - 51966331
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51966577 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagagatgcttaatttccatttgtatcaacaatgttaattggtcaacggagttcatat 51966478  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  51966477 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcaattatgcta 51966389  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51966388 cctatattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 51966331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 12713872 - 12714129
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  12713872 gacatcaatgtcaaatggtgttagctataaatgcacatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacaaggtgcatat 12713971  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||||||||| ||    
T  12713972 aatccacatgcatgcattaatctagactttataggaatataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttttttaacttaaaatcagttatgata 12714071  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12714072 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatat 12714129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 50560448 - 50560694
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50560448 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 50560547  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50560548 aatgcacatgaatgaatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattagaagtcatgatacattttatttagcttaaaatcagttatgcta 50560636  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50560637 tctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatat 50560694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Original strand, 33361133 - 33361358
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361133 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 33361232  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33361233 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33361321  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcat 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33361322 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcat 33361358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13663257 - 13663000
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  13663257 gacatcaatgtaaaatggtgttagctataaatgcgcatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatat 13663158  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13663157 aatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataataggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 13663058  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13663057 ccttcattttataaattatatgtaactatattaacatacatcttatccatgttaatat 13663000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 34691520 - 34691767
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34691520 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 34691619  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34691620 aatgtacacgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcgtgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 34691719  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34691720 cctttattttat----------aaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 34691767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 15314656 - 15314902
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15314656 gacatcaatgtcaaatggtgatagctataaatgcaaatgaaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 15314755  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15314756 aatccacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 15314844  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15314845 ccttcattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatat 15314902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 271
Target Start/End: Original strand, 48339728 - 48339981
Alignment:
Q  24 gtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacat 123  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  48339728 gtcaaattatgctagctatatatgcccatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatataatgtacat 48339827  T
Q  124 gcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattag-aatcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattt 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48339828 gcatgcatttatctagactttatattaagataataggaagataaattagaaatcatggtgcattttctttaacttaaaatcagttatgatacctttattt 48339927  T
Q  223 ta-----tgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48339928 tataaattaaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 48339981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 78
Target Start/End: Original strand, 10762949 - 10763012
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccattt 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10762949 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccattt 10763012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27228 - 26971
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27228 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 27129  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27128 aatgcacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 27029  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27028 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 26971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 9315 - 9572
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9315 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 9414  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9415 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9514  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9515 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 9572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14830394 - 14830137
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14830394 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 14830295  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14830294 aatgcacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14830195  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14830194 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 14830137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 15520254 - 15520492
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520254 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 15520353  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15520354 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 15520452  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15520453 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 15520492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34057447 - 34057189
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattt-ccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057447 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcata 34057348  T
Q  114 taatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgct 212  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34057347 taatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgct 34057248  T
Q  213 acctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34057247 acctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 34057189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 40621552 - 40621811
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattt--ccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40621552 gacatcaatgtcaaacggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggttcat 40621651  T
Q  113 ataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgc 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40621652 ataatgcacatgaatgcatttatctagcatttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgc 40621751  T
Q  212 tacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40621752 tacctttattttataaattatatgtaactatatttgcatacgtcttatccatgttaatat 40621811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 741161 - 740923
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  741161 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcatcggggttcatat 741062  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  741061 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 740963  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcataca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  740962 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 740923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39745729 - 39745486
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39745729 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 39745630  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39745629 aatgtacatgcatgcatttatctagactctataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatgcta 39745530  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatctt 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39745529 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatctt 39745486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54332522 - 54332268
Alignment:
Q  18 atcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataat 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54332522 atcaatgtcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataat 54332423  T
Q  118 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacct 216  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54332422 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 54332323  T
Q  217 ttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54332322 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatat 54332268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 13627458 - 13627715
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13627458 gacatcaatgtcaaatggttctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatgt 13627557  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  13627558 aatgtacatgaatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttttttagtttaaaatcagttatgcta 13627657  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13627658 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 13627715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 17739446 - 17739703
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739446 gacatcaatgtcaaatggtactaactatagatgcaaatgaggaagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 17739545  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17739546 aatgcacatgaatgcatttatccagcttttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 17739645  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17739646 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatat 17739703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26925145 - 26924888
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26925145 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 26925046  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26925045 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 26924946  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924945 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 26924888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10260206 - 10259949
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10260206 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 10260107  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  10260106 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 10260007  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10260006 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 10259949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 21564249 - 21564506
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21564249 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 21564348  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  21564349 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 21564448  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564449 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 21564506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24078275 - 24078018
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24078275 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 24078176  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24078175 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 24078076  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24078075 ccttcatttcataagttatatataactatatttgcatacatcttatccatgttaatat 24078018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 43331770 - 43332027
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43331770 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 43331869  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  43331870 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 43331969  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43331970 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 43332027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 53341816 - 53342073
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53341816 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtctcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 53341915  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53341916 aatgtacatgcattcatttatctagactttataggaagataataggaagacaaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 53342015  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  53342016 cctttattttataaattatatataactatattcgcatatatcttatccatgtaaatat 53342073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 51451837 - 51452094
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  51451837 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 51451936  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  51451937 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaaaataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 51452036  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452037 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 51452094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 23478314 - 23478573
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23478314 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 23478413  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataataca-tttcctttag-cttaaaatcagttatgc 211  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23478414 aatgtacatgcatgcgtttatctagactttataggaagataataggataataaattagaagtcatgttacattttactttagtcttaaaatcagttatgc 23478513  T
Q  212 tacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23478514 tacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 23478573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39715382 - 39715136
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715382 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 39715283  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39715282 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 39715194  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39715193 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatctatgttaatat 39715136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 52800449 - 52800695
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52800449 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 52800548  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52800549 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 52800637  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52800638 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 52800695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 575001 - 574772
Alignment:
Q  40 tatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctag 139  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  575001 tatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatataatgcacatgaatgcatttatctag 574902  T
Q  140 cctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaa 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  574901 cctttttaggaagataataggaaaataaattagaagtcataatacattttctttagctt---atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaa 574805  T
Q  239 ctatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  574804 ctatattcgcatacgtcttatctatgttaatat 574772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 55999580 - 55999323
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||| |||||||||| || |||| | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55999580 gacattaatgtcaaattgttctagttgtatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttatttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 55999481  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55999480 aatgttcatgcatgcatttatctagactttataggaagataatatcaagataaattataagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 55999381  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  55999380 cctttattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatacatgtaaatat 55999323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 19590252 - 19590498
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  19590252 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaatgggatacatat 19590351  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  19590352 aatgcacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatggtacattttatttagcttaaaatcagttatgtta 19590440  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19590441 ccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 19590498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35496395 - 35496149
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35496395 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatcagtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 35496296  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35496295 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 35496207  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  35496206 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttacccatgtaaatat 35496149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19832269 - 19832023
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19832269 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatacacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 19832170  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19832169 aatgtagatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagctcaaaatcagttatgcta 19832081  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19832080 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 19832023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28121092 - 28120847
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  28121092 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatagggtacatat 28120993  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  28120992 aatgcacatggatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 28120904  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28120903 ccttcattttataaattatatgt-actatattcacatacatcttatccatgttaatat 28120847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5274627 - 5274409
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5274627 gacatcaatatcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 5274528  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5274527 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagatgatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 5274428  T
Q  214 cctttattttatgaattat 232  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  5274427 cctttattttataaattat 5274409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28135938 - 28135692
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28135938 gacaccaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatat 28135839  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||| ||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  28135838 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagataaaaatcagttatgcta 28135750  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28135749 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatat 28135692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47720942 - 47720695
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  47720942 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattagccaacgaggtacatat 47720843  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||          |||||| |    
T  47720842 aattcacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaatatgaagataaattagaagtcatggtacattttctttagc----------ttatgcca 47720753  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47720752 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatat 47720695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33503867 - 33503624
Alignment:
Q  18 atcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| | |||| | | ||||||||    
T  33503867 atcaatgtcaaatggtgctagctatttatgcagatgcggaagtgatgcttaatctccatttgtttcaacaatgttaattgattaacgagatacatataat 33503768  T
Q  118 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacct 216  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33503767 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 33503679  T
Q  217 ttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33503678 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 33503624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7644989 - 7644773
Alignment:
Q  18 atcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatataat 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7644989 atcaatgtgaaatggtgctagctatatatgcatatgcagaagtgatgattaattcccatttgttttaacaatgttaattggtcaacgggctacatataat 7644890  T
Q  118 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattaga-atcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacct 216  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7644889 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatatgaagataaattagacgtcatgctacattttctttagcgtaaaatcagttatgctacct 7644790  T
Q  217 ttattttatgaattata 233  Q
    ||||||||| |||||||    
T  7644789 ttattttataaattata 7644773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 36856507 - 36856751
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36856507 gacatcaatgttaaatgatgctagctatatatgca-atgcggaagtgatgcttaatttcaatttgtttcaa-aatgttaattggtcaacggggtacatat 36856604  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  36856605 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgata 36856693  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36856694 cttttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 36856751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 1943902 - 1944154
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  1943902 gacatcaatgttaaacgctgctagctataaatgcacatgcgggagggatgcttaatt-ccatctgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatat 1944000  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaatcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||     || ||   ||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1944001 aatccacatgcatgcatttatctatactctataggaagataaatt--agttatgctact-tcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctac 1944097  T
Q  215 ctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1944098 cttcattttataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgttaatat 1944154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 17698412 - 17698548
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  17698412 gacatgaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatcggtcaacgggttacatat 17698511  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17698512 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaa 17698548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 271
Target Start/End: Original strand, 17698721 - 17698839
Alignment:
Q  154 taataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatac 252  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17698721 taatagaaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatggtacctttattttataaattatatgtaaatatattcgcatac 17698820  T
Q  253 atcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  17698821 atcttatccatgtaaatat 17698839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26870992 - 26870910
Alignment:
Q  189 ctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26870992 ctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatat 26870910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35712993 - 35712930
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccattt 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35712993 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccattt 35712930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7644454 - 7644410
Alignment:
Q  227 aattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7644454 aattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 7644410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37702267 - 37702225
Alignment:
Q  229 ttatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37702267 ttatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatat 37702225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5272925 - 5272881
Alignment:
Q  227 aattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5272925 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatat 5272881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5123 - 4866
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5123 gacatcaatgtctaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 5024  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5023 aatgcacatgagtggatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaatcagaagtcattatatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 4924  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4923 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 4866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11572 - 11315
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11572 gacatcaatgtctaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 11473  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11472 aatgcacatgagtggatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaatcagaagtcattatatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 11373  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11372 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 119428 - 119684
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  119428 gacatcaatgtcaaa-ggtgctggctatagatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgctcaacggggtacatat 119526  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  119527 aatgcacatgcattcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 119626  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  119627 cctttattttataaattatatgtaactatattcacttacatcttatccatgttaatat 119684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19243 - 18997
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19243 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 19144  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19143 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 19055  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19054 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 18997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 153022 - 152765
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  153022 gacatcaatgtaaaatggtgttagctataaatgcgcatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatat 152923  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  152922 aatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataataggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 152823  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  152822 ccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatat 152765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 65498 - 65246
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  65498 gacatcaatgttaaaagctgctagctataaatgcacatgcgggagggatgcttaatt-ccatctgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatat 65400  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaatcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgctac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||     || ||   ||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  65399 aatccacatgcatgcatttatctatactctataggaagataaatt--agttatgctact-tcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctac 65303  T
Q  215 ctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  65302 cttcattttataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgttaatat 65246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13714 - 13493
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  13714 gacatcaatgtcaaatagtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaattgggctcatat 13615  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13614 aatgcacatgaatgcttttatctagcctttttatgaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 13515  T
Q  214 cctttattttatgaattatatg 235  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  13514 cctttattttataacttatatg 13493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11197 - 10991
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 11098  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11097 aatgcacatcaatgcatttatctaacctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaattagttatgcta 10998  T
Q  214 cctttat 220  Q
    |||||||    
T  10997 cctttat 10991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4877 - 4700
Alignment:
Q  95 ttggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttccttta 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  4877 ttggtcaacggggttcatataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttcttta 4778  T
Q  194 gcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4777 gcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 4700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 13191 - 13391
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 13290  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13291 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 13379  T
Q  214 cctttattttat 225  Q
    ||||||||||||    
T  13380 cctttattttat 13391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 256
Target Start/End: Original strand, 49455 - 49687
Alignment:
Q  15 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttaattaaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  49455 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttctatttgtttcaacaatgttaattagccaacggggtacatat 49554  T
Q  115 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttcctttagcttaaaatcagttatgcta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||  ||||||          ||||||||    
T  49555 aatccacatgcatgcatttatctaggctttataagaagctaataggaatataaattagaagtcatggtacattttatttagc----------ttatgcta 49644  T
Q  214 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatct 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49645 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct 49687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1555 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1555
Description:

Target: scaffold1555; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1648 - 1521
Alignment:
Q  90 gttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaagataaattagaa-tcataatacatttc 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||     
T  1648 gttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataataggaagataaattagaagtcatgttacatttt 1549  T
Q  189 ctttagcttaaaatcagttatgctacct 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  1548 ctgtagcttaaaatcagttatgctacct 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 901 - 983
Alignment:
Q  189 ctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  901 ctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatat 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54793 - 54711
Alignment:
Q  189 ctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54793 ctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatat 54711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 271
Target Start/End: Original strand, 1 - 62
Alignment:
Q  210 gctacctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatat 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1 gctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcctatccatgtaaatat 62  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University