View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12620_low_2 (Length: 645)

Name: NF12620_low_2
Description: NF12620
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12620_low_2
NF12620_low_2
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (317-638)||(19456701-19457022)
chr2 (317-638)||(21703444-21703765)
chr2 (28-277)||(21703155-21703404)
chr2 (63-277)||(19456447-19456661)
chr2 (28-274)||(27392973-27393219)
chr2 (336-626)||(27434746-27435036)
chr2 (63-277)||(34303329-34303543)
chr2 (63-277)||(3784655-3784869)
chr2 (63-277)||(27118689-27118903)
chr2 (72-277)||(34157012-34157217)
chr2 (63-277)||(16163600-16163814)
chr2 (317-638)||(27392630-27392951)
chr2 (63-277)||(31891354-31891568)
chr2 (336-637)||(23128868-23129169)
chr2 (336-637)||(28881852-28882153)
chr2 (336-637)||(20837556-20837857)
chr2 (336-637)||(12655180-12655481)
chr2 (28-277)||(12655543-12655792)
chr2 (28-277)||(23128557-23128806)
chr2 (28-277)||(27434435-27434684)
chr2 (28-277)||(28882215-28882464)
chr2 (30-274)||(40233515-40233759)
chr2 (28-277)||(20837919-20838168)
chr2 (29-277)||(34279450-34279698)
chr2 (317-451)||(31891608-31891742)
chr2 (30-277)||(21677175-21677422)
chr2 (317-451)||(27118515-27118649)
chr2 (327-451)||(3784481-3784605)
chr2 (327-451)||(34156838-34156962)
chr2 (28-276)||(37375163-37375411)
chr2 (30-277)||(34286355-34286602)
chr2 (30-277)||(34291415-34291662)
chr2 (336-451)||(34303602-34303717)
chr2 (327-451)||(16163426-16163550)
chr2 (30-277)||(11635179-11635426)
chr2 (30-277)||(22926021-22926268)
chr2 (28-274)||(13936535-13936781)
chr2 (28-274)||(27777226-27777472)
chr2 (28-274)||(27816984-27817230)
chr2 (339-637)||(34279087-34279385)
chr2 (28-277)||(34861681-34861930)
chr2 (28-277)||(37685900-37686149)
chr2 (28-277)||(37701165-37701414)
chr2 (28-277)||(37925494-37925743)
chr2 (28-268)||(260744-260984)
chr2 (30-274)||(12716595-12716839)
chr2 (30-277)||(11641368-11641615)
chr2 (339-586)||(13936849-13937096)
chr2 (30-277)||(32049799-32050046)
chr2 (28-274)||(12586814-12587060)
chr2 (339-553)||(21677487-21677701)
chr2 (28-274)||(27803711-27803957)
chr2 (28-274)||(39051813-39052059)
chr2 (28-277)||(16829329-16829578)
chr2 (28-277)||(16891903-16892152)
chr2 (453-637)||(37374799-37374983)
chr2 (339-586)||(261070-261317)
chr2 (339-637)||(11635494-11635792)
chr2 (339-637)||(11641683-11641981)
chr2 (28-277)||(31876282-31876531)
chr2 (339-586)||(34286043-34286290)
chr2 (339-586)||(34291103-34291350)
chr2 (28-274)||(9349973-9350219)
chr2 (372-554)||(12716943-12717125)
chr2 (339-586)||(37925182-37925429)
chr2 (447-586)||(12586490-12586629)
chr2 (447-554)||(31876002-31876109)
chr2 (447-554)||(34861401-34861508)
chr2 (447-554)||(37686322-37686429)
chr2 (447-554)||(37701587-37701694)
chr2 (447-554)||(39889783-39889890)
chr2 (339-586)||(40233188-40233435)
chr2 (339-547)||(32049526-32049734)
chr2 (447-586)||(9350407-9350546)
chr2 (459-554)||(16829763-16829858)
chr2 (459-554)||(16891623-16891718)
chr2 (447-586)||(27776896-27777035)
chr2 (447-586)||(27803381-27803520)
chr2 (447-586)||(27816663-27816802)
chr2 (30-277)||(39890075-39890322)
chr2 (447-577)||(19416912-19417042)
chr2 (447-553)||(22926441-22926547)
chr2 (30-202)||(19416492-19416664)
chr2 (333-586)||(39052127-39052380)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (317-638)||(16626838-16627158)
chr3 (317-638)||(18529999-18530320)
chr3 (63-277)||(16626584-16626798)
chr3 (63-277)||(18530354-18530568)
chr3 (28-277)||(31034160-31034409)
chr3 (28-277)||(32292718-32292967)
chr3 (63-277)||(4625910-4626124)
chr3 (63-277)||(5652353-5652567)
chr3 (336-626)||(15893060-15893350)
chr3 (63-277)||(17993862-17994076)
chr3 (336-637)||(8301618-8301919)
chr3 (336-637)||(8295578-8295879)
chr3 (336-637)||(18050865-18051166)
chr3 (336-637)||(4797007-4797308)
chr3 (336-637)||(15741436-15741737)
chr3 (28-277)||(15892749-15892998)
chr3 (28-277)||(15741137-15741386)
chr3 (28-277)||(18330635-18330884)
chr3 (336-637)||(35880369-35880670)
chr3 (28-277)||(8295938-8296187)
chr3 (28-277)||(8301310-8301559)
chr3 (28-277)||(22387621-22387870)
chr3 (339-637)||(4721234-4721532)
chr3 (28-277)||(6192282-6192531)
chr3 (28-277)||(18051228-18051477)
chr3 (28-277)||(29148798-29149047)
chr3 (30-276)||(6542507-6542753)
chr3 (28-277)||(4796696-4796945)
chr3 (28-277)||(18277095-18277344)
chr3 (28-277)||(18292396-18292645)
chr3 (28-277)||(18307697-18307946)
chr3 (336-637)||(29149109-29149410)
chr3 (28-277)||(4721597-4721846)
chr3 (28-277)||(7073178-7073427)
chr3 (336-637)||(18330277-18330573)
chr3 (339-637)||(6191919-6192217)
chr3 (28-277)||(4416885-4417134)
chr3 (28-277)||(28115997-28116246)
chr3 (28-277)||(35880732-35880981)
chr3 (28-274)||(11110392-11110638)
chr3 (28-274)||(36997120-36997366)
chr3 (28-277)||(4346730-4346979)
chr3 (328-637)||(8211344-8211653)
chr3 (28-277)||(10396099-10396348)
chr3 (327-451)||(17994126-17994250)
chr3 (30-277)||(5609367-5609614)
chr3 (30-277)||(28339268-28339515)
chr3 (28-274)||(5713196-5713442)
chr3 (28-274)||(5724106-5724352)
chr3 (28-274)||(5757125-5757371)
chr3 (28-274)||(5768016-5768262)
chr3 (339-637)||(28116314-28116612)
chr3 (28-274)||(29665013-29665259)
chr3 (336-451)||(4625736-4625851)
chr3 (30-277)||(17985001-17985248)
chr3 (30-277)||(22870901-22871148)
chr3 (30-277)||(22885960-22886207)
chr3 (30-277)||(31964518-31964765)
chr3 (30-277)||(50134116-50134363)
chr3 (339-637)||(7072815-7073113)
chr3 (28-274)||(20576890-20577136)
chr3 (31-277)||(21674659-21674905)
chr3 (28-274)||(48465896-48466142)
chr3 (328-637)||(18277398-18277707)
chr3 (328-637)||(18292699-18293008)
chr3 (328-637)||(18308000-18308309)
chr3 (327-451)||(5652179-5652303)
chr3 (328-547)||(20065739-20065958)
chr3 (30-277)||(47023419-47023666)
chr3 (328-626)||(10395750-10396048)
chr3 (339-637)||(47023056-47023354)
chr3 (30-214)||(51782052-51782236)
chr3 (30-277)||(7996528-7996775)
chr3 (30-277)||(10643036-10643283)
chr3 (372-586)||(22871264-22871478)
chr3 (372-586)||(22886323-22886537)
chr3 (372-553)||(5466672-5466853)
chr3 (372-577)||(5596756-5596961)
chr3 (28-277)||(28021241-28021490)
chr3 (339-451)||(5713016-5713128)
chr3 (339-451)||(5723926-5724038)
chr3 (339-451)||(5757439-5757551)
chr3 (339-451)||(5768330-5768442)
chr3 (28-268)||(8211713-8211953)
chr3 (28-275)||(5466953-5467200)
chr3 (339-589)||(7996213-7996463)
chr3 (339-589)||(10642721-10642971)
chr3 (372-554)||(18224877-18225059)
chr3 (348-637)||(21674296-21674585)
chr3 (30-214)||(51797141-51797326)
chr3 (459-637)||(5013315-5013493)
chr3 (30-268)||(5013687-5013925)
chr3 (30-276)||(5596402-5596648)
chr3 (447-625)||(6542939-6543117)
chr3 (372-554)||(17985346-17985528)
chr3 (30-276)||(18242706-18242952)
chr3 (372-554)||(28020964-28021146)
chr3 (339-577)||(36997446-36997684)
chr3 (453-554)||(4347155-4347256)
chr3 (339-586)||(11110718-11110965)
chr3 (447-586)||(18242381-18242520)
chr3 (447-586)||(20577327-20577466)
chr3 (447-577)||(51781674-51781804)
chr3 (28-277)||(18225157-18225406)
chr3 (30-277)||(32439120-32439367)
chr3 (447-553)||(4416603-4416709)
chr3 (447-577)||(24327822-24327952)
chr3 (447-553)||(28338989-28339095)
chr3 (447-553)||(31964938-31965044)
chr3 (447-553)||(50134536-50134642)
chr3 (32-276)||(20066010-20066254)
chr3 (30-202)||(24328200-24328372)
chr3 (339-523)||(29665342-29665526)
chr3 (447-550)||(5609787-5609890)
chr3 (447-577)||(51796762-51796893)
chr3 (123-277)||(4893176-4893330)
chr3 (328-476)||(22387921-22388069)
chr3 (447-586)||(48465569-48465708)
chr3 (328-626)||(32438771-32439069)
chr3 (328-476)||(4892977-4893125)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (317-638)||(20460748-20461069)
chr1 (317-638)||(16208319-16208640)
chr1 (28-277)||(16208033-16208282)
chr1 (32-277)||(20340341-20340586)
chr1 (63-277)||(20461085-20461299)
chr1 (28-277)||(28151866-28152115)
chr1 (317-451)||(20340626-20340760)
chr1 (28-277)||(10962674-10962923)
chr1 (30-277)||(41793312-41793559)
chr1 (339-637)||(41793624-41793922)
chr1 (28-277)||(28584985-28585234)
chr1 (447-586)||(10962362-10962501)
chr1 (30-277)||(51638222-51638469)
chr1 (447-586)||(51637910-51638049)
chr1 (372-577)||(28584682-28584887)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (317-636)||(15285219-15285538)
chr4 (317-638)||(15227529-15227850)
chr4 (317-638)||(1899916-1900237)
chr4 (36-277)||(15227890-15228131)
chr4 (28-277)||(1900277-1900526)
chr4 (63-277)||(15284965-15285179)
chr4 (28-274)||(15391340-15391586)
chr4 (317-638)||(14235819-14236140)
chr4 (63-277)||(24460642-24460856)
chr4 (28-277)||(14235527-14235776)
chr4 (336-637)||(14664675-14664976)
chr4 (336-637)||(17013657-17013958)
chr4 (28-277)||(17014020-17014269)
chr4 (341-638)||(15391650-15391948)
chr4 (336-637)||(24592624-24592925)
chr4 (28-277)||(24592316-24592565)
chr4 (28-277)||(14763306-14763555)
chr4 (36-277)||(14665038-14665279)
chr4 (28-277)||(6569873-6570122)
chr4 (28-277)||(14098561-14098810)
chr4 (28-277)||(31126520-31126769)
chr4 (30-274)||(33673802-33674046)
chr4 (28-276)||(36344517-36344765)
chr4 (336-637)||(6569510-6569811)
chr4 (28-276)||(18800615-18800863)
chr4 (327-451)||(24460906-24461030)
chr4 (28-277)||(5005893-5006142)
chr4 (328-637)||(14763609-14763918)
chr4 (328-637)||(36344817-36345126)
chr4 (30-274)||(39850661-39850905)
chr4 (355-637)||(19372918-19373200)
chr4 (339-637)||(27163633-27163931)
chr4 (28-277)||(40105640-40105889)
chr4 (345-586)||(54833098-54833339)
chr4 (30-274)||(30753777-30754021)
chr4 (30-277)||(27163321-27163568)
chr4 (339-637)||(5005527-5005825)
chr4 (372-637)||(14098198-14098463)
chr4 (339-554)||(30753482-30753697)
chr4 (372-554)||(31126867-31127049)
chr4 (30-276)||(54833408-54833654)
chr4 (30-277)||(21969721-21969968)
chr4 (30-277)||(34188964-34189211)
chr4 (372-577)||(18800971-18801176)
chr4 (30-277)||(24112682-24112929)
chr4 (447-577)||(33674234-33674364)
chr4 (447-625)||(40106062-40106240)
chr4 (339-554)||(21969441-21969656)
chr4 (447-586)||(39850331-39850470)
chr4 (328-476)||(24112483-24112631)
chr4 (328-476)||(34189262-34189410)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (317-638)||(20053-20374)
scaffold0124 (28-277)||(20393-20641)
scaffold0124 (336-637)||(30095-30396)
scaffold0124 (28-202)||(30532-30706)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (317-626)||(16040980-16041289)
chr7 (320-638)||(16450178-16450496)
chr7 (36-277)||(16449894-16450135)
chr7 (28-277)||(16041329-16041578)
chr7 (336-637)||(16518615-16518916)
chr7 (28-277)||(26484700-26484949)
chr7 (28-277)||(2108893-2109142)
chr7 (336-637)||(16503579-16503880)
chr7 (63-277)||(31088387-31088601)
chr7 (28-277)||(2775365-2775614)
chr7 (28-277)||(39210911-39211160)
chr7 (63-277)||(45733466-45733680)
chr7 (336-637)||(2154216-2154517)
chr7 (28-277)||(5127998-5128247)
chr7 (336-637)||(5127635-5127936)
chr7 (28-277)||(11424664-11424913)
chr7 (30-277)||(18540805-18541052)
chr7 (28-277)||(10916756-10917005)
chr7 (336-637)||(10917064-10917365)
chr7 (28-277)||(16503268-16503517)
chr7 (28-277)||(2154579-2154828)
chr7 (28-277)||(5147228-5147477)
chr7 (336-637)||(11424975-11425276)
chr7 (28-277)||(16518304-16518553)
chr7 (28-277)||(26435263-26435512)
chr7 (30-276)||(31564280-31564526)
chr7 (28-277)||(26274982-26275231)
chr7 (327-451)||(31088651-31088775)
chr7 (327-451)||(45733292-45733416)
chr7 (28-274)||(3445315-3445561)
chr7 (339-589)||(45387034-45387284)
chr7 (28-277)||(4145011-4145260)
chr7 (28-277)||(26319757-26320006)
chr7 (30-277)||(16736350-16736597)
chr7 (30-277)||(16751404-16751651)
chr7 (30-277)||(17523538-17523785)
chr7 (30-277)||(17529430-17529677)
chr7 (339-637)||(5147542-5147840)
chr7 (339-637)||(16736662-16736960)
chr7 (339-637)||(16751716-16752014)
chr7 (339-637)||(17523175-17523473)
chr7 (339-637)||(17529742-17530040)
chr7 (28-277)||(45387349-45387598)
chr7 (28-274)||(26537758-26538004)
chr7 (28-277)||(9618657-9618906)
chr7 (28-277)||(26669802-26670051)
chr7 (28-148)||(4200682-4200802)
chr7 (447-637)||(31124554-31124744)
chr7 (28-268)||(11441587-11441827)
chr7 (339-577)||(11441263-11441501)
chr7 (447-637)||(24592851-24593041)
chr7 (328-553)||(4145314-4145539)
chr7 (447-586)||(9618345-9618484)
chr7 (447-554)||(26275404-26275511)
chr7 (339-637)||(26434900-26435198)
chr7 (447-552)||(26320179-26320284)
chr7 (447-554)||(3445020-3445127)
chr7 (30-276)||(31124927-31125173)
chr7 (30-277)||(5159525-5159772)
chr7 (339-554)||(26485946-26486161)
chr7 (93-148)||(26682953-26683008)
chr7 (28-202)||(24592429-24592603)
chr7 (339-586)||(26538075-26538322)
chr7 (447-586)||(26670224-26670363)
chr7 (447-554)||(31564709-31564816)
chr7 (328-476)||(5159326-5159474)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (317-639)||(23891855-23892177)
chr5 (317-638)||(25198682-25199003)
chr5 (28-277)||(22888484-22888733)
chr5 (28-277)||(25199043-25199292)
chr5 (1-277)||(23892220-23892505)
chr5 (28-277)||(29888981-29889230)
chr5 (63-277)||(13184582-13184796)
chr5 (28-277)||(11325808-11326057)
chr5 (28-277)||(33877261-33877510)
chr5 (63-277)||(13440428-13440642)
chr5 (336-637)||(24688367-24688668)
chr5 (336-637)||(23752660-23752961)
chr5 (336-637)||(30934287-30934588)
chr5 (443-637)||(24951761-24951955)
chr5 (336-637)||(23718198-23718500)
chr5 (336-637)||(11549005-11549306)
chr5 (317-474)||(22888287-22888444)
chr5 (28-277)||(23752349-23752598)
chr5 (28-277)||(11549368-11549617)
chr5 (28-277)||(23717887-23718136)
chr5 (28-277)||(24688056-24688305)
chr5 (28-277)||(30934647-30934896)
chr5 (28-277)||(24970032-24970281)
chr5 (336-637)||(33777138-33777439)
chr5 (28-277)||(33777501-33777750)
chr5 (336-636)||(22999324-22999624)
chr5 (28-277)||(9548442-9548691)
chr5 (28-277)||(22999013-22999262)
chr5 (30-276)||(37671384-37671630)
chr5 (28-277)||(15658659-15658908)
chr5 (28-276)||(18500629-18500877)
chr5 (30-268)||(31431463-31431701)
chr5 (30-277)||(2511065-2511312)
chr5 (30-277)||(8665376-8665623)
chr5 (30-277)||(15758758-15759005)
chr5 (30-276)||(37770888-37771134)
chr5 (327-451)||(13184846-13184970)
chr5 (327-451)||(13440692-13440816)
chr5 (28-276)||(28649250-28649498)
chr5 (327-451)||(33877087-33877211)
chr5 (28-274)||(31826306-31826552)
chr5 (28-277)||(9317465-9317714)
chr5 (28-277)||(12132169-12132418)
chr5 (28-277)||(30168483-30168732)
chr5 (28-277)||(32599371-32599620)
chr5 (339-586)||(9548756-9549003)
chr5 (317-451)||(11325634-11325768)
chr5 (339-637)||(15658973-15659271)
chr5 (30-276)||(37754995-37755241)
chr5 (339-577)||(41674420-41674658)
chr5 (28-277)||(26480406-26480655)
chr5 (28-277)||(30152032-30152281)
chr5 (30-274)||(24681457-24681701)
chr5 (30-274)||(24723984-24724228)
chr5 (30-274)||(40473450-40473694)
chr5 (30-274)||(43078269-43078513)
chr5 (30-277)||(6874319-6874566)
chr5 (30-277)||(34616532-34616779)
chr5 (30-276)||(13324730-13324976)
chr5 (28-277)||(33516370-33516619)
chr5 (30-277)||(28959687-28959934)
chr5 (339-586)||(31431130-31431377)
chr5 (30-277)||(41674723-41674970)
chr5 (372-586)||(2510753-2510967)
chr5 (339-553)||(8665688-8665902)
chr5 (447-625)||(40473873-40474051)
chr5 (28-277)||(5637924-5638173)
chr5 (28-277)||(18375311-18375560)
chr5 (36-276)||(37358550-37358790)
chr5 (447-586)||(9317153-9317292)
chr5 (339-586)||(30168171-30168418)
chr5 (30-276)||(3789556-3789802)
chr5 (372-554)||(24681171-24681353)
chr5 (372-554)||(24723698-24723880)
chr5 (339-637)||(43077900-43078198)
chr5 (372-637)||(18375658-18375923)
chr5 (447-586)||(6874004-6874143)
chr5 (447-554)||(12131889-12131996)
chr5 (339-586)||(18500961-18501208)
chr5 (447-554)||(37771320-37771427)
chr5 (339-637)||(3789177-3789475)
chr5 (447-637)||(5637561-5637751)
chr5 (447-589)||(15759178-15759320)
chr5 (336-434)||(24969878-24969976)
chr5 (459-637)||(30151669-30151847)
chr5 (447-625)||(37358976-37359154)
chr5 (447-586)||(26480094-26480233)
chr5 (447-554)||(31826740-31826847)
chr5 (30-277)||(33292539-33292786)
chr5 (447-554)||(37671813-37671920)
chr5 (447-586)||(37754670-37754809)
chr5 (28-202)||(29966965-29967139)
chr5 (28-202)||(30029504-30029678)
chr5 (372-554)||(33516090-33516272)
chr5 (372-586)||(34616223-34616437)
chr5 (372-554)||(32599715-32599897)
chr5 (447-586)||(13325165-13325304)
chr5 (459-577)||(28648937-28649055)
chr5 (448-554)||(28960120-28960226)
chr5 (447-577)||(29967387-29967517)
chr5 (447-577)||(30029126-30029256)
chr5 (328-476)||(33292340-33292488)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (28-277)||(30-279)
[»] chr6 (89 HSPs)
chr6 (28-277)||(27290315-27290564)
chr6 (36-277)||(22456887-22457128)
chr6 (63-277)||(22477253-22477467)
chr6 (28-277)||(14143230-14143479)
chr6 (28-277)||(26787946-26788195)
chr6 (28-277)||(27196319-27196568)
chr6 (28-277)||(27252672-27252921)
chr6 (63-277)||(33374236-33374450)
chr6 (72-277)||(8892299-8892504)
chr6 (72-277)||(8903534-8903739)
chr6 (28-277)||(13522018-13522267)
chr6 (63-277)||(28162659-28162873)
chr6 (330-638)||(20160345-20160650)
chr6 (330-638)||(22172181-22172486)
chr6 (336-637)||(13299207-13299508)
chr6 (336-637)||(24863356-24863657)
chr6 (336-637)||(15424573-15424874)
chr6 (339-637)||(22935136-22935434)
chr6 (339-637)||(23857581-23857879)
chr6 (28-277)||(22934825-22935074)
chr6 (28-277)||(23857270-23857519)
chr6 (336-637)||(26988640-26988941)
chr6 (336-637)||(26999712-27000013)
chr6 (336-586)||(24304874-24305124)
chr6 (28-277)||(26989003-26989252)
chr6 (28-277)||(13298896-13299145)
chr6 (336-637)||(16749493-16749794)
chr6 (28-277)||(16749856-16750105)
chr6 (63-276)||(20160704-20160917)
chr6 (63-276)||(22171914-22172127)
chr6 (28-277)||(24304563-24304812)
chr6 (28-277)||(26918382-26918631)
chr6 (336-480)||(22477529-22477673)
chr6 (339-586)||(26918070-26918317)
chr6 (28-277)||(24863719-24863968)
chr6 (30-274)||(27272527-27272771)
chr6 (28-277)||(27000075-27000324)
chr6 (30-276)||(4525289-4525535)
chr6 (28-277)||(15424262-15424511)
chr6 (28-277)||(29549477-29549726)
chr6 (30-268)||(4545722-4545960)
chr6 (30-276)||(4773009-4773255)
chr6 (30-276)||(4757767-4758013)
chr6 (317-451)||(28162485-28162619)
chr6 (327-451)||(13522317-13522441)
chr6 (327-451)||(33374500-33374624)
chr6 (30-274)||(34463293-34463537)
chr6 (30-268)||(4724081-4724319)
chr6 (28-274)||(3696086-3696332)
chr6 (317-451)||(8892544-8892678)
chr6 (317-451)||(8903779-8903913)
chr6 (28-274)||(16674144-16674390)
chr6 (30-276)||(27007730-27007976)
chr6 (30-276)||(27359939-27360185)
chr6 (30-276)||(27450282-27450528)
chr6 (328-637)||(29549117-29549426)
chr6 (28-277)||(29573015-29573264)
chr6 (30-276)||(26116357-26116603)
chr6 (28-277)||(30557961-30558210)
chr6 (30-276)||(17025280-17025526)
chr6 (30-268)||(28207465-28207703)
chr6 (328-637)||(27044029-27044338)
chr6 (339-637)||(3695702-3696000)
chr6 (28-277)||(26777560-26777809)
chr6 (30-276)||(27044390-27044637)
chr6 (368-554)||(4525011-4525197)
chr6 (30-276)||(27485132-27485378)
chr6 (30-276)||(29501418-29501664)
chr6 (372-637)||(17024901-17025166)
chr6 (447-554)||(4757483-4757590)
chr6 (447-586)||(4772687-4772826)
chr6 (447-586)||(27007402-27007541)
chr6 (447-586)||(27484807-27484946)
chr6 (447-554)||(29572735-29572842)
chr6 (28-202)||(16943972-16944146)
chr6 (372-586)||(29501096-29501310)
chr6 (372-554)||(30558308-30558490)
chr6 (447-586)||(34463728-34463867)
chr6 (447-637)||(4546151-4546341)
chr6 (447-577)||(16944394-16944524)
chr6 (447-637)||(28207081-28207271)
chr6 (372-553)||(26777919-26778100)
chr6 (447-554)||(27360377-27360484)
chr6 (447-554)||(27450720-27450827)
chr6 (447-586)||(16673817-16673956)
chr6 (447-625)||(4724510-4724688)
chr6 (453-554)||(26116792-26116893)
chr6 (339-625)||(27629968-27630254)
chr6 (444-625)||(27272947-27273128)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (32-277)||(2664-2909)
scaffold0260 (317-451)||(2949-3083)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (28-274)||(22080839-22081085)
chr8 (336-637)||(16283091-16283392)
chr8 (72-277)||(44563106-44563311)
chr8 (72-277)||(19659044-19659249)
chr8 (72-277)||(9354627-9354832)
chr8 (63-277)||(33244670-33244884)
chr8 (336-637)||(16277196-16277497)
chr8 (336-637)||(19687740-19688041)
chr8 (317-638)||(22081125-22081446)
chr8 (336-637)||(2137531-2137832)
chr8 (28-277)||(16283454-16283703)
chr8 (336-637)||(14557269-14557570)
chr8 (28-277)||(16277559-16277808)
chr8 (28-277)||(27608866-27609115)
chr8 (336-637)||(27609177-27609478)
chr8 (28-277)||(14557629-14557878)
chr8 (28-277)||(19688103-19688352)
chr8 (29-277)||(2137221-2137469)
chr8 (28-277)||(18710591-18710840)
chr8 (327-451)||(19659299-19659423)
chr8 (336-451)||(44562932-44563047)
chr8 (28-277)||(31489711-31489960)
chr8 (327-451)||(9354453-9354577)
chr8 (30-277)||(31354529-31354776)
chr8 (30-276)||(3329470-3329716)
chr8 (30-276)||(12092687-12092933)
chr8 (28-277)||(19674446-19674695)
chr8 (339-637)||(18710228-18710526)
chr8 (339-637)||(19674080-19674378)
chr8 (30-276)||(29829328-29829574)
chr8 (28-277)||(19208321-19208570)
chr8 (345-586)||(19286158-19286399)
chr8 (28-277)||(28361916-28362165)
chr8 (339-577)||(31490025-31490263)
chr8 (30-276)||(19286468-19286714)
chr8 (328-553)||(31354250-31354475)
chr8 (447-554)||(19208743-19208850)
chr8 (459-586)||(28362350-28362477)
chr8 (447-625)||(3329902-3330080)
chr8 (447-625)||(29828967-29829145)
chr8 (28-202)||(33258803-33258977)
chr8 (447-586)||(19518526-19518665)
chr8 (447-577)||(33258425-33258555)
chr8 (447-637)||(12093116-12093306)
chr8 (28-120)||(189256-189348)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (28-274)||(21569-21815)
scaffold0109 (317-638)||(21208-21529)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (336-637)||(29405-29706)
scaffold0089 (339-637)||(40385-40683)
scaffold0089 (28-277)||(40071-40320)
scaffold0089 (28-277)||(46987-47236)
scaffold0089 (336-637)||(47298-47599)
scaffold0089 (28-277)||(29768-30017)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (28-212)||(1920-2103)
scaffold0415 (28-214)||(6080-6268)
scaffold0415 (447-586)||(5682-5821)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (336-637)||(26934-27235)
scaffold0143 (28-277)||(27297-27546)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (336-637)||(443-744)
scaffold0029 (28-277)||(131-381)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (28-277)||(7241-7490)
scaffold0350 (447-554)||(7663-7770)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (28-277)||(9571-9820)
scaffold0336 (368-637)||(7874-8143)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (28-277)||(9068-9317)
scaffold0159 (28-277)||(20020-20269)
scaffold0159 (447-550)||(9490-9593)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (28-136)||(620-728)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (28-277)||(26203-26453)
scaffold0144 (447-637)||(26626-26816)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (443-637)||(48568-48769)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (30-268)||(7963-8201)
scaffold0038 (447-637)||(7579-7769)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (28-277)||(14932-15181)
scaffold0237 (372-637)||(15279-15544)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (447-487)||(157-197)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Original strand, 19456701 - 19457022
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19456701 catttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgc 19456800  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456801 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 19456900  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19456901 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 19457000  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  19457001 agtccccatggtgaccatctca 19457022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Original strand, 21703444 - 21703765
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  21703444 catttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 21703543  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703544 gcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 21703643  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21703644 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 21703743  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  21703744 agtccccatggtgaccatctca 21703765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 21703155 - 21703404
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21703155 ggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttg 21703254  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703255 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 21703354  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21703355 gggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 21703404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 19456447 - 19456661
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19456447 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 19456546  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456547 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 19456646  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  19456647 aaaggtaggtctagc 19456661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27393219 - 27392973
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  27393219 ggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttg 27393120  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  27393119 atggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtc 27393020  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27393019 gggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtct 27392973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 336 - 626
Target Start/End: Original strand, 27434746 - 27435036
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  27434746 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 27434845  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  27434846 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 27434945  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 626  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  27434946 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatg 27435036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 34303329 - 34303543
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  34303329 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 34303428  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  34303429 gaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 34303528  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  34303529 aaaggtaggtctagc 34303543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3784869 - 3784655
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  3784869 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 3784770  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  3784769 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 3784670  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  3784669 aaaggtaggtctagc 3784655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27118903 - 27118689
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  27118903 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 27118804  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||    
T  27118803 gaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagg 27118704  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
     || |||||||||||    
T  27118703 gaaggtaggtctagc 27118689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34157217 - 34157012
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |    
T  34157217 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 34157118  T
Q  172 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  34157117 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 34157018  T
Q  272 tctagc 277  Q
    ||||||    
T  34157017 tctagc 34157012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16163814 - 16163600
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  16163814 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 16163715  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  16163714 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 16163615  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  16163614 aaaggtaggtctagc 16163600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 27392951 - 27392630
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27392951 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 27392852  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
       ||| ||||||  |||  || ||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27392851 atgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 27392752  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  27392751 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataatgccgtctctgacagcctcttctaagcg 27392652  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  27392651 ggttcccatggtgaccatctca 27392630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 31891354 - 31891568
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |    
T  31891354 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttg 31891453  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  31891454 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 31891553  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  31891554 aaaggtaggtctagc 31891568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 23128868 - 23129169
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  23128868 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 23128967  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  23128968 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 23129067  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  23129068 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 23129167  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  23129168 tc 23129169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 28882153 - 28881852
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  28882153 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 28882054  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  28882053 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 28881954  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  28881953 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacagcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 28881854  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  28881853 tc 28881852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 20837857 - 20837556
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  20837857 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggat 20837758  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  20837757 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 20837658  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  20837657 accatacctctttgatgcattcacagtggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 20837558  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  20837557 tc 20837556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 12655481 - 12655180
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  12655481 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 12655382  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  12655381 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 12655282  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  12655281 accatacctctttgatgcattcacagagggttcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 12655182  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  12655181 tc 12655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12655792 - 12655543
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  12655792 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 12655693  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  12655692 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 12655593  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12655592 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 12655543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 23128557 - 23128806
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  23128557 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 23128656  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  23128657 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 23128756  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23128757 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23128806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 27434435 - 27434684
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  27434435 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 27434534  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| || |    
T  27434535 atggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagcc 27434634  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27434635 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27434684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28882464 - 28882215
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  28882464 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 28882365  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28882364 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 28882265  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28882264 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 28882215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40233759 - 40233515
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40233759 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgat 40233660  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  40233659 ggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 40233560  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40233559 aagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20838168 - 20837919
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  20838168 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 20838069  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| || ||||| ||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  20838068 atggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 20837969  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20837968 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 20837919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34279698 - 34279450
Alignment:
Q  29 gacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttga 128  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || |||||||||    
T  34279698 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttga 34279599  T
Q  129 tggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 228  Q
    || |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| |    
T  34279598 tgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttg 34279499  T
Q  229 ggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    | || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34279498 gaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 34279450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 317 - 451
Target Start/End: Original strand, 31891608 - 31891742
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31891608 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 31891707  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  31891708 gcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 21677175 - 21677422
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  21677175 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 21677274  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  21677275 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 21677374  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  21677375 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 21677422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 317 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27118649 - 27118515
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27118649 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 27118550  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  27118549 gcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 27118515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3784605 - 3784481
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3784605 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 3784506  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  3784505 acgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 34156962 - 34156838
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34156962 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34156863  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  34156862 acgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37375411 - 37375163
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  37375411 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 37375312  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  37375311 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 37375212  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
    || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  37375211 ggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34286602 - 34286355
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||    
T  34286602 acattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgat 34286503  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  34286502 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 34286403  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34286402 aagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 34286355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34291662 - 34291415
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||    
T  34291662 acattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgat 34291563  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  34291562 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 34291463  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34291462 aagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 34291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 451
Target Start/End: Original strand, 34303602 - 34303717
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  34303602 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 34303701  T
Q  436 ataactgggcagcatt 451  Q
     || ||| ||||||||    
T  34303702 gtagctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16163550 - 16163426
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16163550 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 16163451  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  16163450 acgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 11635179 - 11635426
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||  |||||||| || |||||| |||| || || || || || ||||||||| | |  ||||| ||||    
T  11635179 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgat 11635278  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  11635279 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 11635378  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11635379 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11635426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 22926021 - 22926268
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  22926021 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 22926120  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  22926121 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 22926220  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22926221 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 22926268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 13936535 - 13936781
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  13936535 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 13936634  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  13936635 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 13936734  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13936735 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13936781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27777472 - 27777226
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  27777472 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 27777373  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  27777372 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 27777273  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27777272 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27817230 - 27816984
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  27817230 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 27817131  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  27817130 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 27817031  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27817030 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 34279385 - 34279087
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34279385 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34279286  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34279285 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34279186  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| || | |||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  34279185 atacctcttcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 34279087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34861930 - 34861681
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  34861930 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 34861831  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  34861830 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 34861731  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  34861730 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 34861681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 37685900 - 37686149
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  37685900 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 37685999  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  37686000 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 37686099  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37686100 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 37686149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 37701165 - 37701414
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  37701165 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 37701264  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  37701265 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 37701364  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37701365 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 37701414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37925743 - 37925494
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  37925743 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 37925644  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||| || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  37925643 atggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 37925544  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37925543 ggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcctagc 37925494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 260744 - 260984
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  260744 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 260843  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  260844 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 260943  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 268  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  260944 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 12716595 - 12716839
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  12716595 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 12716694  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  12716695 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 12716794  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12716795 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12716839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 11641368 - 11641615
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||  |||||||| || |||||| |||| || || || || || ||||||||| | |  ||||| ||||    
T  11641368 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgat 11641467  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  11641468 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 11641567  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  11641568 aagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagc 11641615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Original strand, 13936849 - 13937096
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  13936849 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 13936948  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  13936949 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 13937048  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13937049 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13937096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32050046 - 32049799
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  32050046 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 32049947  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  32049946 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 32049847  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  32049846 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 32049799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12587060 - 12586814
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || |||||||||||||||||| | |  ||||||||    
T  12587060 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttg 12586961  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  12586960 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 12586861  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || ||  |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12586860 ggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 339 - 553
Target Start/End: Original strand, 21677487 - 21677701
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21677487 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21677586  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  21677587 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 21677686  T
Q  539 gtacctctttgatgc 553  Q
     |||||||| |||||    
T  21677687 atacctcttcgatgc 21677701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27803957 - 27803711
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||    
T  27803957 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttg 27803858  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  27803857 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 27803758  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27803757 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27803711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 39051813 - 39052059
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||    
T  39051813 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttg 39051912  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  39051913 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 39052012  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39052013 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 16829329 - 16829578
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  16829329 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 16829428  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  ||     
T  16829429 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggtt 16829528  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16829529 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 16829578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16892152 - 16891903
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  16892152 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 16892053  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  ||     
T  16892052 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggtt 16891953  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16891952 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 16891903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 453 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 37374983 - 37374799
Alignment:
Q  453 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 552  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||    
T  37374983 ataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatg 37374884  T
Q  553 catttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    ||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  37374883 cattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 37374799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Original strand, 261070 - 261317
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  261070 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 261169  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  261170 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 261269  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  261270 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 261317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 11635494 - 11635792
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11635494 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11635593  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11635594 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11635693  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11635694 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 11641683 - 11641981
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11641683 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11641782  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11641783 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11641882  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11641883 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11641981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31876531 - 31876282
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  31876531 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 31876432  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  31876431 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 31876332  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31876331 ggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 31876282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34286290 - 34286043
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34286290 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34286191  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34286190 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34286091  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34286090 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34286043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34291350 - 34291103
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34291350 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34291251  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34291250 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34291151  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34291150 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34291103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 9349973 - 9350219
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  9349973 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 9350072  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  9350073 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 9350172  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9350173 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Original strand, 12716943 - 12717125
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12716943 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 12717042  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  12717043 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 12717125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37925429 - 37925182
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  37925429 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 37925330  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  37925329 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 37925230  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  37925229 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 37925182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12586629 - 12586490
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12586629 gcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12586530  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  12586529 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 12586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31876109 - 31876002
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  31876109 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 31876010  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  31876009 tcgatgca 31876002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34861508 - 34861401
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  34861508 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 34861409  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  34861408 tcgatgca 34861401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 37686322 - 37686429
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  37686322 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 37686421  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  37686422 tcgatgca 37686429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 37701587 - 37701694
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  37701587 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 37701686  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  37701687 tcgatgca 37701694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39889890 - 39889783
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  39889890 gcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 39889791  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  39889790 tcgatgca 39889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 40233435 - 40233188
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  40233435 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 40233336  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  40233335 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 40233236  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  40233235 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 40233188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 339 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 32049734 - 32049526
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  32049734 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 32049635  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  32049634 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 32049535  T
Q  539 gtacctctt 547  Q
     ||||||||    
T  32049534 atacctctt 32049526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Original strand, 9350407 - 9350546
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9350407 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9350506  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9350507 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9350546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 459 - 554
Target Start/End: Original strand, 16829763 - 16829858
Alignment:
Q  459 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16829763 gcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16829858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 459 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 16891718 - 16891623
Alignment:
Q  459 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16891718 gcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27777035 - 27776896
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27777035 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27776936  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27776935 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27776896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27803520 - 27803381
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27803520 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27803421  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27803420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27803381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27816802 - 27816663
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27816802 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27816703  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27816702 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27816663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39890322 - 39890075
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||  || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  39890322 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 39890223  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || ||    
T  39890222 gaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttgg 39890123  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39890122 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 39890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Original strand, 19416912 - 19417042
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  19416912 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 19417011  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  19417012 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 19417042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 553
Target Start/End: Original strand, 22926441 - 22926547
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  22926441 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 22926540  T
Q  547 ttgatgc 553  Q
    | |||||    
T  22926541 tcgatgc 22926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 19416492 - 19416664
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  19416492 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 19416591  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 202  Q
    | || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19416592 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 586
Target Start/End: Original strand, 39052127 - 39052380
Alignment:
Q  333 gcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacg 432  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  39052127 gcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 39052226  T
Q  433 gaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 532  Q
    ||   |  || || |||||  |||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  39052227 gaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 39052326  T
Q  533 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39052327 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39052380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Original strand, 16626838 - 16627158
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  16626838 catttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgt 16626937  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16626938 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-t 16627036  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16627037 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctaggcg 16627136  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16627137 agtccccatggtgaccatctca 16627158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 18530320 - 18529999
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18530320 catttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 18530221  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530220 gcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctt 18530121  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18530120 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 18530021  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  18530020 agtccccatggtgaccatctca 18529999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 16626584 - 16626798
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16626584 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 16626683  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16626684 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggagg 16626783  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  16626784 aaaggtaggtctagc 16626798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18530568 - 18530354
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18530568 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 18530469  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18530468 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggagg 18530369  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  18530368 aaaggtaggtctagc 18530354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 31034160 - 31034409
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31034160 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 31034259  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034260 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 31034359  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31034360 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32292967 - 32292718
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32292967 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 32292868  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292867 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 32292768  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32292767 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 32292718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4626124 - 4625910
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  4626124 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 4626025  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  4626024 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 4625925  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  4625924 aaaggtaggtctagc 4625910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5652567 - 5652353
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  5652567 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 5652468  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  5652467 gaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 5652368  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  5652367 aaaggtaggtctagc 5652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 336 - 626
Target Start/End: Original strand, 15893060 - 15893350
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  15893060 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 15893159  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  15893160 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 15893259  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 626  Q
    ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15893260 actatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacagcttcttccagacgagttcccatg 15893350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 17993862 - 17994076
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||    
T  17993862 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgg 17993961  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  17993962 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 17994061  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  17994062 aaaggtaggtctagc 17994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 8301618 - 8301919
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| | ||||||||||     
T  8301618 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggag 8301717  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8301718 gcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8301817  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| ||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8301818 accatacctctttgacgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8301917  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  8301918 tc 8301919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 8295879 - 8295578
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  8295879 ttaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 8295780  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8295779 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8295680  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  |||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8295679 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccttgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8295580  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  8295579 tc 8295578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 18051166 - 18050865
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  18051166 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 18051067  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18051066 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18050967  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18050966 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18050867  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  18050866 tc 18050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 4797007 - 4797308
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  4797007 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 4797106  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  4797107 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 4797206  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  4797207 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 4797306  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  4797307 tc 4797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 15741436 - 15741737
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  15741436 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 15741535  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15741536 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15741635  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
     || |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  15741636 gccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 15741735  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  15741736 tc 15741737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 15892749 - 15892998
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  15892749 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 15892848  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  15892849 atggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 15892948  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15892949 ggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 15892998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 15741137 - 15741386
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  15741137 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttg 15741236  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  15741237 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 15741336  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15741337 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 15741386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18330884 - 18330635
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  18330884 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 18330785  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  |||    
T  18330784 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtc 18330685  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18330684 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18330635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 35880670 - 35880369
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  35880670 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 35880571  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  35880570 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 35880471  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  35880470 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 35880371  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  35880370 tc 35880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8296187 - 8295938
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  8296187 ggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 8296088  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||    
T  8296087 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtc 8295988  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8295987 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 8295938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 8301310 - 8301559
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || || ||||||||| |||| || |||||    
T  8301310 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttg 8301409  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  8301410 atggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 8301509  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8301510 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 8301559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 22387621 - 22387870
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  22387621 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 22387720  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  22387721 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 22387820  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22387821 ggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtctagc 22387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 4721532 - 4721234
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  4721532 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 4721433  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  4721432 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 4721333  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4721332 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 4721234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6192531 - 6192282
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  6192531 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 6192432  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  6192431 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 6192332  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6192331 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 6192282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18051477 - 18051228
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  18051477 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 18051378  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    || ||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  18051377 atagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 18051278  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18051277 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18051228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 29148798 - 29149047
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  29148798 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 29148897  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  29148898 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 29148997  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29148998 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 29149047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 6542507 - 6542753
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  6542507 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 6542606  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  6542607 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 6542706  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6542707 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796945
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  4796696 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 4796795  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  4796796 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 4796895  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4796896 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 4796945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 18277095 - 18277344
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18277095 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18277194  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18277195 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18277294  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18277295 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18277344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 18292396 - 18292645
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18292396 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18292495  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18292496 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18292595  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18292596 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18292645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 18307697 - 18307946
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18307697 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18307796  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18307797 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18307896  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18307897 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18307946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 29149109 - 29149410
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  29149109 ttaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 29149208  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  29149209 gcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 29149308  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  29149309 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 29149408  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  29149409 tc 29149410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4721846 - 4721597
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| || || || || ||| |||| | |||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  4721846 ggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 4721747  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  4721746 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 4721647  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4721646 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 4721597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7073427 - 7073178
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  7073427 ggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 7073328  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  7073327 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagtt 7073228  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7073227 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 7073178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 18330573 - 18330277
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  18330573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 18330479  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18330478 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18330379  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18330378 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgagcacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18330279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 6192217 - 6191919
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  6192217 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 6192118  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  6192117 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 6192018  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  6192017 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 6191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4417134 - 4416885
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||    
T  4417134 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctg 4417035  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  4417034 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 4416935  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4416934 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 4416885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 28115997 - 28116246
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||    
T  28115997 ggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttg 28116096  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28116097 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 28116196  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28116197 ggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 28116246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35880981 - 35880732
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || || |||||    
T  35880981 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttg 35880882  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  35880881 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 35880782  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35880781 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 35880732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 11110392 - 11110638
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  11110392 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 11110491  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  11110492 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 11110591  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11110592 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 36997120 - 36997366
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  36997120 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 36997219  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  36997220 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 36997319  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36997320 ggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 4346730 - 4346979
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  4346730 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 4346829  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  4346830 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 4346929  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4346930 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 328 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 8211653 - 8211344
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  8211653 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggta 8211554  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  8211553 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 8211454  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 627  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  8211453 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggactcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 8211354  T
Q  628 tgtccatctc 637  Q
    || |||||||    
T  8211353 tgaccatctc 8211344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10396348 - 10396099
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  10396348 ggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 10396249  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| |||     
T  10396248 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 10396149  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10396148 ggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagc 10396099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Original strand, 17994126 - 17994250
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17994126 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 17994225  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  17994226 acgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 5609367 - 5609614
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || |||||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  5609367 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 5609466  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  5609467 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 5609566  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5609567 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 5609614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28339515 - 28339268
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | | |||||||||||    
T  28339515 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgat 28339416  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  28339415 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 28339316  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28339315 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28339268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5713442 - 5713196
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5713442 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5713343  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5713342 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5713243  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5713242 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5713196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5724352 - 5724106
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5724352 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5724253  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5724252 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5724153  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5724152 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5724106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 5757125 - 5757371
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5757125 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5757224  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5757225 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5757324  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5757325 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5757371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 5768016 - 5768262
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5768016 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5768115  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5768116 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5768215  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5768216 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5768262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 28116314 - 28116612
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  28116314 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 28116413  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  28116414 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 28116513  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28116514 atacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28116612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 29665013 - 29665259
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||    
T  29665013 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttg 29665112  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  29665113 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 29665212  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29665213 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4625851 - 4625736
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  4625851 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 4625752  T
Q  436 ataactgggcagcatt 451  Q
     || ||| ||||||||    
T  4625751 gtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 17985001 - 17985248
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  17985001 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 17985100  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| ||    
T  17985101 gaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttgg 17985200  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17985201 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 17985248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 22870901 - 22871148
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  22870901 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 22871000  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  22871001 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 22871100  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22871101 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 22885960 - 22886207
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  22885960 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 22886059  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  22886060 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 22886159  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22886160 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 31964518 - 31964765
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  31964518 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 31964617  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  31964618 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 31964717  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31964718 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31964765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 50134116 - 50134363
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  50134116 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 50134215  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  50134216 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 50134315  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  50134316 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 50134363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 7073113 - 7072815
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  7073113 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 7073014  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7073013 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7072914  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7072913 atacctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7072815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 20576890 - 20577136
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  20576890 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 20576989  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  20576990 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 20577089  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20577090 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21674905 - 21674659
Alignment:
Q  31 cattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatg 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  |||||||||||    
T  21674905 cattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 21674806  T
Q  131 gaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggg 230  Q
     |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||     
T  21674805 aaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttgga 21674706  T
Q  231 agtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21674705 agaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 21674659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48466142 - 48465896
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  48466142 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 48466043  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  48466042 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagtt 48465943  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48465942 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 637
Target Start/End: Original strand, 18277398 - 18277707
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  18277398 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18277497  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18277498 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18277597  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 627  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18277598 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18277697  T
Q  628 tgtccatctc 637  Q
    || |||||||    
T  18277698 tgaccatctc 18277707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 637
Target Start/End: Original strand, 18292699 - 18293008
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  18292699 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18292798  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18292799 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18292898  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 627  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18292899 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18292998  T
Q  628 tgtccatctc 637  Q
    || |||||||    
T  18292999 tgaccatctc 18293008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 637
Target Start/End: Original strand, 18308000 - 18308309
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  18308000 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18308099  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18308100 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18308199  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 627  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18308200 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18308299  T
Q  628 tgtccatctc 637  Q
    || |||||||    
T  18308300 tgaccatctc 18308309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 5652303 - 5652179
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5652303 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 5652204  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  5652203 acgacggaggtagctgagcagcatt 5652179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 328 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 20065958 - 20065739
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| |||||    
T  20065958 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggta 20065859  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  20065858 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttcttgtga 20065759  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctt 547  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  20065758 tgtccattaccatacctctt 20065739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47023666 - 47023419
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  47023666 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 47023567  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  47023566 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 47023467  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  47023466 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 47023419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 328 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 10396048 - 10395750
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||  ||  ||| |||||    
T  10396048 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggta 10395949  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  10395948 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 10395849  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 626  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||    
T  10395848 tgtccattaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatg 10395750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 47023354 - 47023056
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  47023354 acgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 47023255  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  47023254 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 47023155  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  47023154 atacctcttcgatgcattcacagaggattcggctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 47023056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51782236 - 51782052
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  51782236 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 51782137  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 214  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782136 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7996775 - 7996528
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  7996775 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 7996676  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  7996675 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 7996576  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7996575 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 7996528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10643283 - 10643036
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  10643283 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 10643184  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  10643183 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 10643084  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10643083 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 10643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 372 - 586
Target Start/End: Original strand, 22871264 - 22871478
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22871264 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22871363  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22871364 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22871463  T
Q  572 tttctcgaatacaat 586  Q
    |||||| || |||||    
T  22871464 tttctcaaacacaat 22871478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 372 - 586
Target Start/End: Original strand, 22886323 - 22886537
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22886323 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22886422  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22886423 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22886522  T
Q  572 tttctcgaatacaat 586  Q
    |||||| || |||||    
T  22886523 tttctcaaacacaat 22886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 372 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5466853 - 5466672
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5466853 tactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 5466754  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 553  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  5466753 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgc 5466672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 372 - 577
Target Start/End: Original strand, 5596756 - 5596961
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5596756 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 5596855  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  5596856 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcaac 5596955  T
Q  572 tttctc 577  Q
    ||||||    
T  5596956 tttctc 5596961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28021490 - 28021241
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||| | | |  ||||||||    
T  28021490 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttg 28021391  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28021390 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagtt 28021291  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28021290 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 5713128 - 5713016
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5713128 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5713029  T
Q  439 actgggcagcatt 451  Q
     ||| ||||||||    
T  5713028 gctgagcagcatt 5713016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 5724038 - 5723926
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5724038 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5723939  T
Q  439 actgggcagcatt 451  Q
     ||| ||||||||    
T  5723938 gctgagcagcatt 5723926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Original strand, 5757439 - 5757551
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5757439 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5757538  T
Q  439 actgggcagcatt 451  Q
     ||| ||||||||    
T  5757539 gctgagcagcatt 5757551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Original strand, 5768330 - 5768442
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5768330 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5768429  T
Q  439 actgggcagcatt 451  Q
     ||| ||||||||    
T  5768430 gctgagcagcatt 5768442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8211953 - 8211713
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  8211953 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 8211854  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | ||||||||     
T  8211853 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagtt 8211754  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 268  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8211753 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 8211713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5467200 - 5466953
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5467200 ggacattattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5467101  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  5467100 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 5467001  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtcta 275  Q
    || || |  || ||||| | ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  5467000 ggaaggagttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttggtcta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 7996463 - 7996213
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  7996463 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 7996364  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7996363 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7996264  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 589  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  7996263 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 7996213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10642971 - 10642721
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  10642971 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 10642872  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  10642871 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 10642772  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 589  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  10642771 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 10642721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18225059 - 18224877
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18225059 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 18224960  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  18224959 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 18224877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 348 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 21674585 - 21674296
Alignment:
Q  348 tgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcag 447  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || |    
T  21674585 tgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctg 21674486  T
Q  448 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 547  Q
    |||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||    
T  21674485 cattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctt 21674386  T
Q  548 tgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  21674385 cgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 21674296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51797326 - 51797141
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  51797326 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 51797227  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 214  Q
    | || ||||| ||||| |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797226 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 459 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 5013493 - 5013315
Alignment:
Q  459 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 558  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |    
T  5013493 gcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcg 5013394  T
Q  559 cggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
      || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5013393 tagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5013315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5013925 - 5013687
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  5013925 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 5013826  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| ||    
T  5013825 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttgg 5013726  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 268  Q
     || |  || || || | ||||||||| |||||||||||    
T  5013725 aagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagt 5013687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 5596402 - 5596648
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  5596402 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 5596501  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  5596502 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttgg 5596601  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||    
T  5596602 aagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 447 - 625
Target Start/End: Original strand, 6542939 - 6543117
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6542939 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6543038  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 625  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  6543039 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 6543117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Original strand, 17985346 - 17985528
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  17985346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 17985445  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||    
T  17985446 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctttttgatgca 17985528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18242952 - 18242706
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  18242952 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 18242853  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  18242852 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 18242753  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18242752 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18242706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28021146 - 28020964
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  28021146 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagcca 28021047  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  28021046 tggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgatgca 28020964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 577
Target Start/End: Original strand, 36997446 - 36997684
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| ||||||||| | || | ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  36997446 acgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 36997545  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  36997546 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 36997645  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  36997646 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 36997684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 453 - 554
Target Start/End: Original strand, 4347155 - 4347256
Alignment:
Q  453 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 552  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||    
T  4347155 ataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatg 4347254  T
Q  553 ca 554  Q
    ||    
T  4347255 ca 4347256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Original strand, 11110718 - 11110965
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11110718 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11110817  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  11110818 tttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattacc 11110917  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  11110918 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 11110965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18242520 - 18242381
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  18242520 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 18242421  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18242420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18242381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Original strand, 20577327 - 20577466
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  20577327 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 20577426  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  20577427 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 20577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 51781804 - 51781674
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  51781804 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 51781705  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51781704 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51781674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18225406 - 18225157
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  18225406 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 18225307  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||     
T  18225306 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagtt 18225207  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  18225206 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggtaggcctagc 18225157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32439367 - 32439120
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||    
T  32439367 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgat 32439268  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  32439267 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 32439168  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32439167 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 32439120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4416709 - 4416603
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4416709 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4416610  T
Q  547 ttgatgc 553  Q
    | |||||    
T  4416609 tcgatgc 4416603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 24327952 - 24327822
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  24327952 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 24327853  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  24327852 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 24327822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 28339095 - 28338989
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28339095 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 28338996  T
Q  547 ttgatgc 553  Q
    | |||||    
T  28338995 tcgatgc 28338989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 553
Target Start/End: Original strand, 31964938 - 31965044
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31964938 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 31965037  T
Q  547 ttgatgc 553  Q
    | |||||    
T  31965038 tcgatgc 31965044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 553
Target Start/End: Original strand, 50134536 - 50134642
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  50134536 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 50134635  T
Q  547 ttgatgc 553  Q
    | |||||    
T  50134636 tcgatgc 50134642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20066254 - 20066010
Alignment:
Q  32 attgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatgg 131  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||||    
T  20066254 attgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatgg 20066155  T
Q  132 aaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggga 231  Q
    || |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |    
T  20066154 aagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaa 20066055  T
Q  232 gtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
    | | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20066054 gaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24328372 - 24328200
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  24328372 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 24328273  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 202  Q
    | || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24328272 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 523
Target Start/End: Original strand, 29665342 - 29665526
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  29665342 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 29665441  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 523  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665442 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29665526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 550
Target Start/End: Original strand, 5609787 - 5609890
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5609787 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5609886  T
Q  547 ttga 550  Q
    ||||    
T  5609887 ttga 5609890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 51796893 - 51796762
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg-accgttaccgtacctc 545  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  || ||||| || |||    
T  51796893 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtgccattaccatatctc 51796794  T
Q  546 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
    || || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51796793 ttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4893330 - 4893176
Alignment:
Q  123 ccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 222  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | ||||    
T  4893330 ccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagta 4893231  T
Q  223 gagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4893230 aagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Original strand, 22387921 - 22388069
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||    
T  22387921 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggta 22388020  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 476  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22388021 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 48465708 - 48465569
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  48465708 gcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 48465609  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  48465608 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 48465569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 32439069 - 32438771
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  32439069 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 32438970  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||   | ||| || | || ||| || || || || ||||||||||| |||    
T  32438969 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtga 32438870  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 626  Q
    || || |||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  32438869 tgtccattaccgtatctcttcgcagcatttgcagatgactcaatcttctcaaacacaatgatgccttcccgaacagcttcttccagacgtgttcccatg 32438771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 4893125 - 4892977
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  4893125 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 4893026  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 476  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  4893025 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 20461069 - 20460748
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20461069 catttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 20460970  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20460969 gcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctt 20460870  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20460869 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcattggcggaggattcaactttctcgaatataataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20460770  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20460769 agtccccatggtgaccatctca 20460748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Original strand, 16208319 - 16208640
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16208319 catttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 16208418  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
       ||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208419 atgtactgatacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctt 16208518  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208519 tcttcttatgatgaccgttaccgtaactctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16208618  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16208619 agtccccatggtgaccatctca 16208640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 16208033 - 16208282
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16208033 ggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 16208132  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208133 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 16208232  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16208233 gggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 277
Target Start/End: Original strand, 20340341 - 20340586
Alignment:
Q  32 attgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatgg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20340341 attgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgg 20340440  T
Q  132 aaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggga 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20340441 aaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttggga 20340540  T
Q  232 gtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20340541 gtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 20340586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20461299 - 20461085
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20461299 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 20461200  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20461199 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggagg 20461100  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  20461099 aaaggtaggtctagc 20461085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28152115 - 28151866
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28152115 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 28152016  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152015 atggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 28151916  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28151915 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28151866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 317 - 451
Target Start/End: Original strand, 20340626 - 20340760
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20340626 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 20340725  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  20340726 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10962923 - 10962674
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  10962923 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 10962824  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | |||     
T  10962823 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagtt 10962724  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10962723 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 10962674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 41793312 - 41793559
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  | ||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  41793312 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 41793411  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  41793412 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 41793511  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  41793512 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 41793559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 41793624 - 41793922
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  41793624 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 41793723  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41793724 tttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41793823  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     ||||||||||||||| |  | |||| |||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  41793824 atacctctttgatgcactcacagaggtttcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 41793922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28585234 - 28584985
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  28585234 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 28585135  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28585134 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 28585035  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28585034 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28584985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10962501 - 10962362
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  10962501 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 10962402  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  10962401 tcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 10962362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 51638469 - 51638222
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  51638469 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 51638370  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  51638369 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 51638270  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || |  || ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  51638269 aagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagc 51638222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 51638049 - 51637910
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  51638049 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 51637950  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  51637949 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 51637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 372 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 28584887 - 28584682
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||||||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28584887 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 28584788  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28584787 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28584688  T
Q  572 tttctc 577  Q
    ||||||    
T  28584687 tttctc 28584682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 317 - 636
Target Start/End: Original strand, 15285219 - 15285538
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15285219 catttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 15285318  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15285319 gcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctt 15285418  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15285419 tcttcttatgatgaccgttaccgttcctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 15285518  T
Q  617 agtccccatgatgtccatct 636  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  15285519 agtccccatggtgaccatct 15285538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 15227850 - 15227529
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15227850 catttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 15227751  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227750 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 15227651  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15227650 tcttcttatgatgaccgttaccatgcctctttgatgcatttgcggaggattcatctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 15227551  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  15227550 agtccccatggtgaccatctca 15227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 1900237 - 1899916
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  1900237 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 1900138  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900137 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 1900038  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  1900037 tcttcttatgatgatcgttaccgtacctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttccaaacg 1899938  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  1899937 agtccccatggtgaccatctca 1899916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15228131 - 15227890
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15228131 ttctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaat 15228032  T
Q  136 cacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaa 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228031 cacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaa 15227932  T
Q  236 ctcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15227931 ctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15227890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1900526 - 1900277
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1900526 ggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttg 1900427  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900426 atggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 1900327  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1900326 gggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 1900277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 15284965 - 15285179
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15284965 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgg 15285064  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15285065 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggagg 15285164  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  15285165 aaaggtaggtctagc 15285179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 15391340 - 15391586
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  15391340 ggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttg 15391439  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  15391440 atggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtc 15391539  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15391540 gggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 15391586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Original strand, 14235819 - 14236140
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14235819 catttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 14235918  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
      |||| |||||| | ||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14235919 atatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 14236018  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||    
T  14236019 tcttcttatgatgaccattaccgtacttctttgatgtgcttgcagaggattcccctttctcgaacacaataatgtcttctctgacagcctcttctaagcg 14236118  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  14236119 ggttcccatggtgaccatctca 14236140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 24460642 - 24460856
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  24460642 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 24460741  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  24460742 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 24460841  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  24460842 aaaggtaggtctagc 24460856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 14235527 - 14235776
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  14235527 ggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttg 14235626  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  14235627 atggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtc 14235726  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14235727 gggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14235776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 14664976 - 14664675
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  | ||||| ||||| ||||||     
T  14664976 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggag 14664877  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14664876 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14664777  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  14664776 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctaacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 14664677  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  14664676 tc 14664675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 17013958 - 17013657
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| || |||     
T  17013958 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggag 17013859  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  17013858 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 17013759  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  17013758 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 17013659  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  17013658 tc 17013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17014269 - 17014020
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  17014269 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 17014170  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  17014169 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtc 17014070  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17014069 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 17014020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 341 - 638
Target Start/End: Original strand, 15391650 - 15391948
Alignment:
Q  341 gggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataac 440  Q
    ||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||| | |||| ||||  || |    
T  15391650 gggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagc 15391749  T
Q  441 tgggcagcattaataggggcaa-cagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccg 539  Q
    || ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  15391750 tgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccattgcca 15391849  T
Q  540 tacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 638  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  15391850 tacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttcccaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 15391948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 24592624 - 24592925
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24592624 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24592723  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24592724 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24592823  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  24592824 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 24592923  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  24592924 tc 24592925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 24592316 - 24592565
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  24592316 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 24592415  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  24592416 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 24592515  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24592516 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24592565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 14763306 - 14763555
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  14763306 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 14763405  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  14763406 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 14763505  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14763506 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 14763555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14665279 - 14665038
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  14665279 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaat 14665180  T
Q  136 cacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaa 235  Q
    |||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||    
T  14665179 cacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaa 14665080  T
Q  236 ctcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14665079 ctcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 14665038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6570122 - 6569873
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||    
T  6570122 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttg 6570023  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  6570022 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 6569923  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6569922 ggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 6569873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14098810 - 14098561
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  14098810 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 14098711  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  14098710 atgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 14098611  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098610 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 14098561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 31126520 - 31126769
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  31126520 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 31126619  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  31126620 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 31126719  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31126720 ggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 31126769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 33673802 - 33674046
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  33673802 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 33673901  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  33673902 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 33674001  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33674002 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 36344517 - 36344765
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  36344517 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 36344616  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  36344617 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 36344716  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
    || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  36344717 ggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 36344765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 6569811 - 6569510
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  6569811 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 6569712  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  6569711 gcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 6569612  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  6569611 accatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatc 6569512  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  6569511 tc 6569510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 18800615 - 18800863
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18800615 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18800714  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  18800715 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 18800814  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18800815 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Original strand, 24460906 - 24461030
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24460906 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 24461005  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  24461006 acgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5006142 - 5005893
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5006142 ggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5006043  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5006042 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 5005943  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5005942 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 5005893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 637
Target Start/End: Original strand, 14763609 - 14763918
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  14763609 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 14763708  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  14763709 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 14763808  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 627  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  14763809 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 14763908  T
Q  628 tgtccatctc 637  Q
    || |||||||    
T  14763909 tgaccatctc 14763918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 637
Target Start/End: Original strand, 36344817 - 36345126
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  36344817 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 36344916  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  36344917 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 36345016  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 627  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  36345017 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 36345116  T
Q  628 tgtccatctc 637  Q
    || |||||||    
T  36345117 tgaccatctc 36345126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39850905 - 39850661
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  39850905 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 39850806  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  39850805 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 39850706  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39850705 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 355 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 19373200 - 19372918
Alignment:
Q  355 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaat 454  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||    
T  19373200 gacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19373101  T
Q  455 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  19373100 aggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 19373001  T
Q  555 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    ||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19373000 ttcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19372918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 27163633 - 27163931
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  27163633 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 27163732  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  27163733 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 27163832  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    |||||| || |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  27163833 gtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 27163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 40105640 - 40105889
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  40105640 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 40105739  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  40105740 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 40105839  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  40105840 ggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 40105889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 54833339 - 54833098
Alignment:
Q  345 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 444  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  54833339 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 54833240  T
Q  445 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 544  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  54833239 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 54833140  T
Q  545 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  54833139 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 54833098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30754021 - 30753777
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  30754021 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 30753922  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| ||    
T  30753921 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttgg 30753822  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30753821 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 27163321 - 27163568
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  27163321 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 27163420  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  27163421 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 27163520  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27163521 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 27163568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 5005825 - 5005527
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  5005825 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 5005726  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5005725 tttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5005626  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| || | | | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5005625 atacctcttcgacgtactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5005527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 372 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 14098463 - 14098198
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14098463 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 14098364  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  14098363 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 14098264  T
Q  572 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  14098263 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 14098198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 339 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30753697 - 30753482
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30753697 acgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 30753598  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30753597 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30753498  T
Q  539 gtacctctttgatgca 554  Q
     |||||||| ||||||    
T  30753497 atacctcttcgatgca 30753482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Original strand, 31126867 - 31127049
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31126867 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31126966  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31126967 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54833654 - 54833408
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  54833654 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 54833555  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  54833554 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 54833455  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  54833454 aagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21969968 - 21969721
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  21969968 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 21969869  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || || || |||||  | |||||||| ||    
T  21969868 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 21969769  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21969768 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 21969721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 34188964 - 34189211
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | |||||||||||    
T  34188964 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgat 34189063  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  34189064 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 34189163  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34189164 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34189211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 372 - 577
Target Start/End: Original strand, 18800971 - 18801176
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18800971 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 18801070  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18801071 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18801170  T
Q  572 tttctc 577  Q
    ||||||    
T  18801171 tttctc 18801176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24112929 - 24112682
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||    
T  24112929 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgat 24112830  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  24112829 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 24112730  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24112729 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 24112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Original strand, 33674234 - 33674364
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  33674234 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 33674333  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  33674334 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 33674364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 625
Target Start/End: Original strand, 40106062 - 40106240
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||||||||| |    
T  40106062 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtctattaccgtaccttt 40106161  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 625  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  40106162 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgactgcttcctcaagacgggtccccat 40106240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 339 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 21969656 - 21969441
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21969656 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21969557  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  21969556 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 21969457  T
Q  539 gtacctctttgatgca 554  Q
     |||||||| ||||||    
T  21969456 atacctcttcgatgca 21969441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 39850470 - 39850331
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  39850470 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 39850371  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || | |||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39850370 tcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39850331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 24112631 - 24112483
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  24112631 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 24112532  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 476  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  24112531 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Original strand, 34189262 - 34189410
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  34189262 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 34189361  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 476  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  34189362 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 20374 - 20053
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  20374 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggc 20275  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20274 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 20175  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20174 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaacacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20075  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20074 agtccccatggtgaccatctca 20053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20641 - 20393
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20641 ggacattgttctcaaaagttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 20543  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20542 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 20443  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20442 gggagtaactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagc 20393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 30396 - 30095
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  30396 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 30297  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30296 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30197  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||| | ||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30196 accatacctcctcgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30097  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  30096 tc 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30706 - 30532
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  30706 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 30607  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 202  Q
    ||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30606 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 317 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 16041289 - 16040980
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  16041289 catttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 16041190  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041189 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 16041090  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16041089 tcttcttatgatgaccgttaccatacctctttgatgcatttacggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16040990  T
Q  617 agtccccatg 626  Q
    ||| ||||||    
T  16040989 agttcccatg 16040980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 320 - 638
Target Start/End: Original strand, 16450178 - 16450496
Alignment:
Q  320 ttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgca 419  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||     
T  16450178 ttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcg 16450277  T
Q  420 tacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttct 519  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450278 tacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttct 16450377  T
Q  520 tcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagt 619  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16450378 tcttatgatgaccgttaccgtatctttttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagt 16450477  T
Q  620 ccccatgatgtccatctca 638  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  16450478 ccccatggtgaccatctca 16450496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Original strand, 16449894 - 16450135
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16449894 ttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaat 16449993  T
Q  136 cacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaa 235  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449994 cacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaa 16450093  T
Q  236 ctcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450094 ctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16450135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16041578 - 16041329
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16041578 ggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttg 16041479  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041478 atggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 16041379  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16041378 gggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 16041329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 16518615 - 16518916
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16518615 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16518714  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16518715 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16518814  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16518815 accatacctctttgatgcatttacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16518914  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  16518915 tc 16518916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26484949 - 26484700
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26484949 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 26484850  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484849 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 26484750  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26484749 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26484700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 2108893 - 2109142
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2108893 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 2108992  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108993 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 2109092  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2109093 gggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2109142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 16503579 - 16503880
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16503579 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16503678  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16503679 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16503778  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16503779 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16503878  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  16503879 tc 16503880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 31088387 - 31088601
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  31088387 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 31088486  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  31088487 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 31088586  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  31088587 aaaggtaggtctagc 31088601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2775614 - 2775365
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2775614 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 2775515  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775514 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 2775415  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2775414 gggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 39210911 - 39211160
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39210911 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttg 39211010  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211011 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 39211110  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39211111 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 39211160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 45733680 - 45733466
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  45733680 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 45733581  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  45733580 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagagg 45733481  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  45733480 aaaggtaggtctagc 45733466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 2154517 - 2154216
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  2154517 ttaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 2154418  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2154417 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2154318  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||  | || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  2154317 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatttcatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 2154218  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  2154217 tc 2154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5128247 - 5127998
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  5128247 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttg 5128148  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5128147 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 5128048  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5128047 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 5127998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 5127936 - 5127635
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  5127936 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 5127837  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  5127836 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 5127737  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  5127736 accatacctcttcgatgcattcacagaggactcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 5127637  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  5127636 tc 5127635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 11424664 - 11424913
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  11424664 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 11424763  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||     
T  11424764 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagtt 11424863  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11424864 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11424913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18541052 - 18540805
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||    
T  18541052 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgat 18540953  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540952 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 18540853  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18540852 gagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagc 18540805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 10916756 - 10917005
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  10916756 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 10916855  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  10916856 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 10916955  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10916956 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 10917005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 10917064 - 10917365
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| |||| |     
T  10917064 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaag 10917163  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  10917164 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 10917263  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| ||  | || || |  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  10917264 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgatttcatccctaacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 10917363  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  10917364 tc 10917365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 16503268 - 16503517
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||  | ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  16503268 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 16503367  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  16503368 atggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 16503467  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16503468 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16503517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2154828 - 2154579
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||    
T  2154828 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttg 2154729  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  2154728 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 2154629  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  2154628 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagc 2154579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 5147228 - 5147477
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5147228 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5147327  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5147328 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5147427  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5147428 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 5147477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 11424975 - 11425276
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  11424975 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 11425074  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11425075 gcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11425174  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11425175 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11425274  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  11425275 tc 11425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 16518304 - 16518553
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||  | ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  16518304 ggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 16518403  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  16518404 atggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 16518503  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16518504 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16518553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26435512 - 26435263
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  26435512 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 26435413  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  26435412 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 26435313  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26435312 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 26435263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 31564280 - 31564526
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  31564280 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 31564379  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  31564380 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 31564479  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31564480 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 26274982 - 26275231
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  26274982 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttg 26275081  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  26275082 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 26275181  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26275182 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26275231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Original strand, 31088651 - 31088775
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31088651 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 31088750  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  31088751 acgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 45733416 - 45733292
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  45733416 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 45733317  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  45733316 acgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3445561 - 3445315
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  3445561 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 3445462  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  3445461 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 3445362  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3445361 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 339 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 45387284 - 45387034
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  45387284 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 45387185  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  45387184 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 45387085  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 589  Q
     |||||||| || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  45387084 atacctcttcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 45387034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 4145011 - 4145260
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  4145011 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 4145110  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  4145111 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 4145210  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4145211 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 4145260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 26319757 - 26320006
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  26319757 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 26319856  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  26319857 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 26319956  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26319957 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26320006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 16736350 - 16736597
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||    
T  16736350 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgat 16736449  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  16736450 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 16736549  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16736550 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 16736597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 16751404 - 16751651
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||    
T  16751404 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgat 16751503  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  16751504 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 16751603  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16751604 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 16751651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17523785 - 17523538
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||    
T  17523785 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgat 17523686  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  17523685 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 17523586  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17523585 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 17523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 17529430 - 17529677
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||    
T  17529430 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgat 17529529  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  17529530 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 17529629  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17529630 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 17529677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 5147542 - 5147840
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  5147542 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 5147641  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5147642 tttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5147741  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5147742 atacctcttcgatgcattcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5147840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 16736662 - 16736960
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16736662 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16736761  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16736762 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16736861  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16736862 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16736960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 16751716 - 16752014
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16751716 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16751815  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16751816 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16751915  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16751916 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16752014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 17523473 - 17523175
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17523473 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17523374  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17523373 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17523274  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17523273 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17523175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 17529742 - 17530040
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17529742 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17529841  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17529842 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17529941  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17529942 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 45387598 - 45387349
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  45387598 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 45387499  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  45387498 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 45387399  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  45387398 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 45387349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 26537758 - 26538004
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  26537758 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 26537857  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| |||     
T  26537858 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagtt 26537957  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  26537958 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9618906 - 9618657
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  9618906 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 9618807  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  9618806 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 9618707  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9618706 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9618657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 26669802 - 26670051
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  26669802 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 26669901  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  26669902 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 26670001  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26670002 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26670051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4200802 - 4200682
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4200802 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 4200703  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtc 148  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  4200702 atggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 447 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 31124744 - 31124554
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31124744 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31124645  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    | |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  31124644 tcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 31124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11441827 - 11441587
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  11441827 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 11441728  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  11441727 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 11441628  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 268  Q
    || || |  || || || | ||||||||| |||||||||||    
T  11441627 ggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagt 11441587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 11441501 - 11441263
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11441501 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11441402  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  11441401 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 11441302  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  11441301 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 11441263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 447 - 637
Target Start/End: Original strand, 24592851 - 24593041
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  24592851 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 24592950  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    | || |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592951 tcgacgcatttacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 24593041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 328 - 553
Target Start/End: Original strand, 4145314 - 4145539
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| |||||    
T  4145314 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 4145413  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4145414 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtgg 4145513  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 553  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  4145514 tgtccattaccatacctcttcgatgc 4145539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9618484 - 9618345
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9618484 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9618385  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9618384 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9618345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 26275404 - 26275511
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  26275404 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 26275503  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  26275504 tcgatgca 26275511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 26435198 - 26434900
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26435198 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26435099  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26435098 tttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26434999  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     || ||||| | |||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26434998 atatctcttcggtgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26434900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 447 - 552
Target Start/End: Original strand, 26320179 - 26320284
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  26320179 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 26320278  T
Q  547 ttgatg 552  Q
    | ||||    
T  26320279 tcgatg 26320284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 3445127 - 3445020
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3445127 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 3445028  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  3445027 tcgatgca 3445020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31125173 - 31124927
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  31125173 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 31125074  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  31125073 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 31124974  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31124973 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31124927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5159772 - 5159525
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || |  ||||||||  | | ||| |||||||    
T  5159772 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgat 5159673  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  5159672 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 5159573  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5159572 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 5159525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 339 - 554
Target Start/End: Original strand, 26485946 - 26486161
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26485946 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26486045  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26486046 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26486145  T
Q  539 gtacctctttgatgca 554  Q
     |||||||| ||||||    
T  26486146 atacctcttcgatgca 26486161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 148
Target Start/End: Original strand, 26682953 - 26683008
Alignment:
Q  93 tagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682953 tagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Original strand, 24592429 - 24592603
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  24592429 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 24592528  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 202  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592529 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Original strand, 26538075 - 26538322
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26538075 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26538174  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26538175 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26538274  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26538275 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26538322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Original strand, 26670224 - 26670363
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  26670224 gcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 26670323  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26670324 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26670363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 31564709 - 31564816
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31564709 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31564808  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  31564809 tcgatgca 31564816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 5159474 - 5159326
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  5159474 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 5159375  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 476  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5159374 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 317 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 23892177 - 23891855
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  23892177 catttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggc 23892078  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892077 gcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 23891978  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23891977 tcttcttatgatgtccgttaccatacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagacg 23891878  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctcat 639  Q
    |||||||||| || |||||||||    
T  23891877 agtccccatggtgaccatctcat 23891855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 25199003 - 25198682
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  25199003 catttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggc 25198904  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
    ||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25198903 gcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttcct 25198804  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  25198803 tcttcttatgatgtccgttaccgtacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagatg 25198704  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  25198703 agtccccatggtgaccatctca 25198682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22888733 - 22888484
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22888733 ggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 22888634  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22888633 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtc 22888534  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22888533 gggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 22888484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25199292 - 25199043
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25199292 ggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 25199193  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199192 atggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 25199093  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25199092 gggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagc 25199043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23892505 - 23892220
Alignment:
Q  1 cagcatgattcggaagaggattgttga---------ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||  ||    
T  23892505 cagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagc 23892406  T
Q  92 gtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccc 191  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23892405 atagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccc 23892306  T
Q  192 tgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23892305 tgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 23892220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 29888981 - 29889230
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29888981 ggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 29889080  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  29889081 atggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagtt 29889180  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29889181 gggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 29889230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 13184582 - 13184796
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  13184582 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 13184681  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  13184682 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 13184781  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  13184782 aaaggtaggtctagc 13184796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11326057 - 11325808
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11326057 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 11325958  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11325957 atggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtc 11325858  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11325857 gggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 11325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33877510 - 33877261
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33877510 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 33877411  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33877410 atggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtc 33877311  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33877310 gggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33877261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 13440428 - 13440642
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  13440428 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 13440527  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||    
T  13440528 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagagg 13440627  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  13440628 aaaggtaggtctagc 13440642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 24688367 - 24688668
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24688367 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 24688466  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24688467 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24688566  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  24688567 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 24688666  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  24688667 tc 24688668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 23752660 - 23752961
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23752660 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23752759  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23752760 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23752859  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  23752860 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 23752959  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  23752960 tc 23752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 30934588 - 30934287
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  30934588 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 30934489  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30934488 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30934389  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30934388 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30934289  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  30934288 tc 30934287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 443 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 24951955 - 24951761
Alignment:
Q  443 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 542  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24951955 ggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatac 24951856  T
Q  543 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  24951855 ctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 24951761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 23718198 - 23718500
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23718198 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23718297  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23718298 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23718397  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt-cttctagacgagtccccatgatgtccat 634  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||| |||| |||||||| |||||| || ||||    
T  23718398 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttccttccagacgagttcccatggtgaccat 23718497  T
Q  635 ctc 637  Q
    |||    
T  23718498 ctc 23718500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 11549306 - 11549005
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  11549306 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggag 11549207  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11549206 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11549107  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11549106 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11549007  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  11549006 tc 11549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 317 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22888444 - 22888287
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  22888444 catttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 22888345  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 474  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888344 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 23752349 - 23752598
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  23752349 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 23752448  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  23752449 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 23752548  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23752549 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11549617 - 11549368
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  11549617 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 11549518  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  11549517 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 11549418  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11549417 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11549368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 23717887 - 23718136
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  23717887 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 23717986  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  23717987 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 23718086  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23718087 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23718136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 24688056 - 24688305
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||    
T  24688056 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttg 24688155  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  24688156 atggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 24688255  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24688256 ggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24688305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30934896 - 30934647
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  30934896 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 30934797  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  30934796 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 30934697  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30934696 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 30934647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24970281 - 24970032
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  24970281 ggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 24970182  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  24970181 atggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 24970082  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24970081 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24970032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 33777439 - 33777138
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  33777439 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 33777340  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  33777339 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 33777240  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  33777239 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 33777140  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  33777139 tc 33777138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33777750 - 33777501
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  33777750 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 33777651  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  33777650 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 33777551  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33777550 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 33777501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 336 - 636
Target Start/End: Original strand, 22999324 - 22999624
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  22999324 ttaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 22999423  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  22999424 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 22999523  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  22999524 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 22999623  T
Q  636 t 636  Q
    |    
T  22999624 t 22999624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 9548442 - 9548691
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  9548442 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 9548541  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  9548542 atgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 9548641  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9548642 ggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 9548691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 22999013 - 22999262
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  22999013 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 22999112  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||     
T  22999113 atgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtt 22999212  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22999213 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 22999262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 37671384 - 37671630
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  37671384 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 37671483  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  37671484 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 37671583  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37671584 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 15658659 - 15658908
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  15658659 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 15658758  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  15658759 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 15658858  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15658859 ggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 15658908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 18500629 - 18500877
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18500629 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18500728  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  18500729 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18500828  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18500829 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31431701 - 31431463
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  31431701 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 31431602  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  31431601 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 31431502  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 268  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  31431501 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 31431463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2511312 - 2511065
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  2511312 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 2511213  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  2511212 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 2511113  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  2511112 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 2511065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 8665376 - 8665623
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  8665376 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 8665475  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  8665476 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 8665575  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8665576 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 8665623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 15758758 - 15759005
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  15758758 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 15758857  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  15758858 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 15758957  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15758958 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 15759005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 37770888 - 37771134
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  37770888 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 37770987  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| ||    
T  37770988 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttgg 37771087  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37771088 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Original strand, 13184846 - 13184970
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13184846 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13184945  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13184946 acgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Original strand, 13440692 - 13440816
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13440692 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13440791  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13440792 acgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28649498 - 28649250
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  28649498 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 28649399  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  28649398 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 28649299  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28649298 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 33877211 - 33877087
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33877211 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33877112  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33877111 acgacggaggtagctgagcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 31826306 - 31826552
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  31826306 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 31826405  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  31826406 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 31826505  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31826506 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9317714 - 9317465
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  9317714 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 9317615  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  9317614 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 9317515  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9317514 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9317465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12132418 - 12132169
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  12132418 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 12132319  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  12132318 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 12132219  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12132218 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 12132169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30168732 - 30168483
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  30168732 ggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 30168633  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  30168632 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 30168533  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30168532 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 30168483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 32599371 - 32599620
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  32599371 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttg 32599470  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  32599471 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 32599570  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32599571 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 32599620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Original strand, 9548756 - 9549003
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  9548756 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 9548855  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  9548856 tttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 9548955  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9548956 atacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9549003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 317 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 11325768 - 11325634
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11325768 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 11325669  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11325668 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 15658973 - 15659271
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||| | ||  || |||| || || ||||||   |    
T  15658973 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggca 15659072  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  15659073 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 15659172  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15659173 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37755241 - 37754995
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  37755241 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 37755142  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| ||    
T  37755141 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttgg 37755042  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37755041 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 41674658 - 41674420
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  41674658 acgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggca 41674559  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41674558 tttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41674459  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||    
T  41674458 atacctcttcgacgcattcacagaggattcggctttctc 41674420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26480655 - 26480406
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  26480655 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 26480556  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  26480555 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 26480456  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26480455 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26480406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30152281 - 30152032
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  30152281 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 30152182  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  30152181 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 30152082  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30152081 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 30152032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24681701 - 24681457
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  24681701 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 24681602  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  24681601 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 24681502  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24681501 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24724228 - 24723984
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  24724228 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 24724129  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  24724128 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 24724029  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24724028 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 40473450 - 40473694
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  40473450 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 40473549  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  40473550 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 40473649  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  40473650 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43078513 - 43078269
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  43078513 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 43078414  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  43078413 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 43078314  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43078313 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6874566 - 6874319
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  6874566 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 6874467  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  6874466 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 6874367  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || | ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6874366 aagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 6874319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34616779 - 34616532
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  34616779 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 34616680  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  34616679 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 34616580  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34616579 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 13324730 - 13324976
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  13324730 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 13324829  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  13324830 gaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 13324929  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13324930 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33516619 - 33516370
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  33516619 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 33516520  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  ||     
T  33516519 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggtt 33516420  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33516419 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 33516370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 28959687 - 28959934
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  28959687 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 28959786  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  28959787 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttgg 28959886  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28959887 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28959934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31431377 - 31431130
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31431377 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 31431278  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31431277 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31431178  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  31431177 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 31431130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41674970 - 41674723
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | || ||||||||||    
T  41674970 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgat 41674871  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  41674870 gaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 41674771  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41674770 aagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 41674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 372 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2510967 - 2510753
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2510967 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagcca 2510868  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  2510867 tggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 2510768  T
Q  572 tttctcgaatacaat 586  Q
    |||||| || |||||    
T  2510767 tttctcaaacacaat 2510753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 553
Target Start/End: Original strand, 8665688 - 8665902
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  8665688 acgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 8665787  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  8665788 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 8665887  T
Q  539 gtacctctttgatgc 553  Q
     |||||||| |||||    
T  8665888 atacctcttcgatgc 8665902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 447 - 625
Target Start/End: Original strand, 40473873 - 40474051
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  40473873 gcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 40473972  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 625  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  40473973 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcttcaagacgggttcccat 40474051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5638173 - 5637924
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  5638173 ggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 5638074  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5638073 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 5637974  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5637973 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 5637924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 18375311 - 18375560
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  18375311 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 18375410  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18375411 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 18375510  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18375511 ggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 18375560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 276
Target Start/End: Original strand, 37358550 - 37358790
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||| || |    
T  37358550 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagt 37358649  T
Q  136 cacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaa 235  Q
    |||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |     
T  37358650 cacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaag 37358749  T
Q  236 ctcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37358750 ttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37358790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9317292 - 9317153
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  9317292 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 9317193  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9317192 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9317153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 30168418 - 30168171
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30168418 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 30168319  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30168318 tttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30168219  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  30168218 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 30168171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3789802 - 3789556
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  3789802 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 3789703  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  3789702 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 3789603  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3789602 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24681353 - 24681171
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24681353 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24681254  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24681253 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24681171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24723880 - 24723698
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24723880 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24723781  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24723780 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24723698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 43078198 - 43077900
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||||||||||   |    
T  43078198 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggca 43078099  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  43078098 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 43077999  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  43077998 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcgagacgggttcccatggtgaccatctc 43077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 372 - 637
Target Start/End: Original strand, 18375658 - 18375923
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  18375658 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 18375757  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  18375758 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 18375857  T
Q  572 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18375858 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18375923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6874143 - 6874004
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6874143 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6874044  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  6874043 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 6874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12131996 - 12131889
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  12131996 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 12131897  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  12131896 tcgatgca 12131889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Original strand, 18500961 - 18501208
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  18500961 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 18501060  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18501061 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18501160  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18501161 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18501208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 37771320 - 37771427
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37771320 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 37771419  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  37771420 tcgatgca 37771427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 3789475 - 3789177
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| ||||||||  | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  3789475 acgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 3789376  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3789375 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3789276  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3789275 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3789177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 447 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 5637751 - 5637561
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5637751 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5637652  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5637651 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5637561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 447 - 589
Target Start/End: Original strand, 15759178 - 15759320
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  15759178 gcattgataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 15759277  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 589  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  15759278 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 15759320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 336 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24969976 - 24969878
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacgga 434  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||    
T  24969976 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacgga 24969878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 459 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 30151847 - 30151669
Alignment:
Q  459 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 558  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |    
T  30151847 gcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcg 30151748  T
Q  559 cggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
      || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  30151747 tagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 30151669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 447 - 625
Target Start/End: Original strand, 37358976 - 37359154
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37358976 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 37359075  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 625  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  37359076 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaatacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 37359154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26480233 - 26480094
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  26480233 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 26480134  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26480133 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26480094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 31826740 - 31826847
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31826740 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 31826839  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  31826840 tcgatgca 31826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33292786 - 33292539
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||    
T  33292786 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgat 33292687  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  33292686 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 33292587  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33292586 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 33292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 37671813 - 37671920
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37671813 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 37671912  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  37671913 tcgatgca 37671920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37754809 - 37754670
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  37754809 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 37754710  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  37754709 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 37754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Original strand, 29966965 - 29967139
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  29966965 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 29967064  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 202  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967065 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30029678 - 30029504
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  30029678 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 30029579  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 202  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30029578 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 33516272 - 33516090
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  33516272 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagcca 33516173  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  33516172 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 33516090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34616437 - 34616223
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34616437 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagcca 34616338  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  34616337 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 34616238  T
Q  572 tttctcgaatacaat 586  Q
    |||||| || |||||    
T  34616237 tttctcaaacacaat 34616223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Original strand, 32599715 - 32599897
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  32599715 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtca 32599814  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  32599815 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 32599897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Original strand, 13325165 - 13325304
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  13325165 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 13325264  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13325265 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13325304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 459 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 28649055 - 28648937
Alignment:
Q  459 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 558  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||      
T  28649055 gcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattca 28648956  T
Q  559 cggaggattcaactttctc 577  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  28648955 cagaggattcagctttctc 28648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 554
Target Start/End: Original strand, 28960120 - 28960226
Alignment:
Q  448 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 547  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  28960120 cattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctt 28960219  T
Q  548 tgatgca 554  Q
     ||||||    
T  28960220 cgatgca 28960226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Original strand, 29967387 - 29967517
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||    
T  29967387 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctct 29967486  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  29967487 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 29967517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 30029256 - 30029126
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||    
T  30029256 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctct 30029157  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  30029156 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 30029126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33292488 - 33292340
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  33292488 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 33292389  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 476  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33292388 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 30 - 279
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30 ggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttg 129  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  130 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttgagcagtgccctctgagaagtagagtc 229  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  230 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 89)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 27290315 - 27290564
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27290315 ggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 27290414  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27290415 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtc 27290514  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27290515 gggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27290564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Original strand, 22456887 - 22457128
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    ||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22456887 ttctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaat 22456986  T
Q  136 cacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaa 235  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22456987 cacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaa 22457086  T
Q  236 ctcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22457087 ctcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22457128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 22477253 - 22477467
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22477253 atgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttagaacggaacctgg 22477352  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  22477353 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagagg 22477452  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  22477453 aaaggtaggtctagc 22477467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 14143230 - 14143479
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14143230 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 14143329  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14143330 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtc 14143429  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14143430 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14143479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26788195 - 26787946
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26788195 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 26788096  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26788095 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtc 26787996  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26787995 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26787946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27196568 - 27196319
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27196568 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 27196469  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27196468 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtc 27196369  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27196368 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27196319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 27252672 - 27252921
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27252672 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 27252771  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27252772 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtc 27252871  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27252872 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27252921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 33374236 - 33374450
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  33374236 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 33374335  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  33374336 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 33374435  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  33374436 aaaggtaggtctagc 33374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 277
Target Start/End: Original strand, 8892299 - 8892504
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |    
T  8892299 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 8892398  T
Q  172 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  8892399 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 8892498  T
Q  272 tctagc 277  Q
    ||||||    
T  8892499 tctagc 8892504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 277
Target Start/End: Original strand, 8903534 - 8903739
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |    
T  8903534 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 8903633  T
Q  172 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  8903634 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 8903733  T
Q  272 tctagc 277  Q
    ||||||    
T  8903734 tctagc 8903739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 13522018 - 13522267
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13522018 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 13522117  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13522118 atggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtc 13522217  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13522218 gggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13522267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28162873 - 28162659
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  28162873 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 28162774  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  28162773 gaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 28162674  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  28162673 aaaggtaggtctagc 28162659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 330 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 20160650 - 20160345
Alignment:
Q  330 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacg 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |    
T  20160650 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 20160551  T
Q  430 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 529  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20160550 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 20160454  T
Q  530 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 629  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  20160453 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 20160354  T
Q  630 tccatctca 638  Q
     ||||||||    
T  20160353 accatctca 20160345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 330 - 638
Target Start/End: Original strand, 22172181 - 22172486
Alignment:
Q  330 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacg 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |    
T  22172181 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 22172280  T
Q  430 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 529  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22172281 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 22172377  T
Q  530 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 629  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  22172378 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 22172477  T
Q  630 tccatctca 638  Q
     ||||||||    
T  22172478 accatctca 22172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 13299207 - 13299508
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  13299207 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 13299306  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  13299307 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 13299406  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  13299407 accatatctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 13299506  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  13299507 tc 13299508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 24863657 - 24863356
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| || ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24863657 ttaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 24863558  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24863557 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24863458  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| | |||| || |||||    
T  24863457 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttctcatggtgaccatc 24863358  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  24863357 tc 24863356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 15424573 - 15424874
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  15424573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 15424672  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15424673 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15424772  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  15424773 accatacctctttgatgcattcacagaagattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 15424872  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  15424873 tc 15424874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 22935136 - 22935434
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  22935136 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 22935235  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  22935236 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 22935335  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  22935336 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 22935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 23857581 - 23857879
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  23857581 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 23857680  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  23857681 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 23857780  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23857781 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23857879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 22934825 - 22935074
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  22934825 ggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 22934924  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  22934925 atggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 22935024  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22935025 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 22935074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 23857270 - 23857519
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  23857270 ggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 23857369  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  23857370 atggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 23857469  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23857470 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23857519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 26988941 - 26988640
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  26988941 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26988842  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26988841 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26988742  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  26988741 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26988642  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  26988641 tc 26988640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 27000013 - 26999712
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  27000013 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26999914  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26999913 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26999814  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  26999813 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 26999714  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  26999713 tc 26999712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 336 - 586
Target Start/End: Original strand, 24304874 - 24305124
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24304874 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24304973  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24304974 gcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24305073  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  24305074 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 24305124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26989252 - 26989003
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  26989252 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 26989153  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  26989152 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 26989053  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26989052 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 26989003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 13298896 - 13299145
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||    
T  13298896 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttg 13298995  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  13298996 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 13299095  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13299096 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 13299145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16749794 - 16749493
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  16749794 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 16749695  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
    | |  || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16749694 acatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16749595  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  16749594 accatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatcccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 16749495  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  16749494 tc 16749493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16750105 - 16749856
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  16750105 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 16750006  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  16750005 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 16749906  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16749905 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16749856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20160917 - 20160704
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  20160917 atgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgg 20160818  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  20160817 gaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggagg 20160718  T
Q  263 aaaagtaggtctag 276  Q
    ||| ||||||||||    
T  20160717 aaaggtaggtctag 20160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 276
Target Start/End: Original strand, 22171914 - 22172127
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  22171914 atgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgg 22172013  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  22172014 gaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggagg 22172113  T
Q  263 aaaagtaggtctag 276  Q
    ||| ||||||||||    
T  22172114 aaaggtaggtctag 22172127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 24304563 - 24304812
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||  | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  24304563 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 24304662  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  24304663 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 24304762  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24304763 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24304812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26918631 - 26918382
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  26918631 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 26918532  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  26918531 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 26918432  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26918431 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 26918382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 22477529 - 22477673
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  22477529 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagag 22477628  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgac 480  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22477629 gtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26918317 - 26918070
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  26918317 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 26918218  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26918217 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26918118  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  26918117 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 26918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24863968 - 24863719
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  24863968 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 24863869  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  24863868 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 24863769  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24863768 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24863719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 27272527 - 27272771
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||  |||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27272527 acattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgat 27272626  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||    
T  27272627 ggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcgg 27272726  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27272727 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27000324 - 27000075
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  27000324 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 27000225  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  27000224 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 27000125  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27000124 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27000075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4525535 - 4525289
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  4525535 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 4525436  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||| | |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| ||    
T  4525435 gaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttgg 4525336  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4525335 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4525289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 15424262 - 15424511
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||  || |||||    
T  15424262 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttg 15424361  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  15424362 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 15424461  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15424462 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 15424511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29549726 - 29549477
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  29549726 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 29549627  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  29549626 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 29549527  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29549526 ggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 29549477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 4545722 - 4545960
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  4545722 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 4545821  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  4545822 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 4545921  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 268  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4545922 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4773255 - 4773009
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  4773255 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 4773156  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  4773155 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 4773056  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4773055 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4758013 - 4757767
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  4758013 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 4757914  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  4757913 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 4757814  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4757813 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 317 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28162619 - 28162485
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28162619 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 28162520  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    |||||||||||||| |||  || ||| ||||||||    
T  28162519 gcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Original strand, 13522317 - 13522441
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13522317 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13522416  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13522417 acgacggaggtagctgagcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Original strand, 33374500 - 33374624
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33374500 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33374599  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33374600 acgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 34463293 - 34463537
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  34463293 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 34463392  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  34463393 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 34463492  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  34463493 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 4724081 - 4724319
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  4724081 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 4724180  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  4724181 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 4724280  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 268  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4724281 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3696332 - 3696086
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  3696332 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 3696233  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  3696232 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 3696133  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3696132 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 317 - 451
Target Start/End: Original strand, 8892544 - 8892678
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8892544 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 8892643  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8892644 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 317 - 451
Target Start/End: Original strand, 8903779 - 8903913
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  8903779 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgc 8903878  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8903879 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16674390 - 16674144
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  16674390 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 16674291  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  16674290 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 16674191  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16674190 ggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27007976 - 27007730
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  27007976 acattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 27007877  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  27007876 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 27007777  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27007776 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 27359939 - 27360185
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  27359939 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 27360038  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  27360039 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 27360138  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27360139 aagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 27360185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 27450282 - 27450528
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  27450282 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 27450381  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  27450382 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 27450481  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27450482 aagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 27450528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 29549426 - 29549117
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  29549426 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 29549327  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  29549326 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtga 29549227  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 627  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  29549226 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 29549127  T
Q  628 tgtccatctc 637  Q
    || |||||||    
T  29549126 tgaccatctc 29549117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29573264 - 29573015
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  29573264 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 29573165  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  29573164 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 29573065  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29573064 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 29573015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 26116357 - 26116603
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  26116357 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 26116456  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||||||    
T  26116457 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcgg 26116556  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  26116557 aagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 30557961 - 30558210
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  30557961 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 30558060  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  ||     
T  30558061 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggtt 30558160  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30558161 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 30558210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17025526 - 17025280
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  17025526 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 17025427  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||||||| ||    
T  17025426 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttgg 17025327  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17025326 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28207703 - 28207465
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  28207703 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 28207604  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  28207603 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 28207504  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 268  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28207503 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 328 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 27044338 - 27044029
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| |||||    
T  27044338 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 27044239  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27044238 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 27044139  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 627  Q
    || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  27044138 tgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 27044039  T
Q  628 tgtccatctc 637  Q
    || |||||||    
T  27044038 tgaccatctc 27044029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 3696000 - 3695702
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  3696000 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 3695901  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3695900 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3695801  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3695800 atatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3695702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 26777560 - 26777809
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  26777560 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 26777659  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||     
T  26777660 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagtt 26777759  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  |||||||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  26777760 ggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggttggtctagc 26777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27044637 - 27044390
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagc-atccttcgacatcatgatccagagcaccttga 128  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || | | || |||||||||||| | |  |||||||||    
T  27044637 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttga 27044538  T
Q  129 tggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 228  Q
    || |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| |    
T  27044537 tgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttg 27044438  T
Q  229 ggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
    | || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27044437 gaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 4525197 - 4525011
Alignment:
Q  368 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 467  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  4525197 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagta 4525098  T
Q  468 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4525097 gccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4525011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27485378 - 27485132
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  27485378 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 27485279  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  27485278 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 27485179  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27485178 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27485132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29501664 - 29501418
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  29501664 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 29501565  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  29501564 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttgg 29501465  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||    
T  29501464 aagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 372 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 17025166 - 17024901
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17025166 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca 17025067  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | | |||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||  |    
T  17025066 tagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcggc 17024967  T
Q  572 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17024966 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17024901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 4757590 - 4757483
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4757590 gcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4757491  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  4757490 tcgatgca 4757483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4772826 - 4772687
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  4772826 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 4772727  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  4772726 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 4772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27007541 - 27007402
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27007541 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27007442  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27007441 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27007402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27484946 - 27484807
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  27484946 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 27484847  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27484846 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 29572842 - 29572735
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  29572842 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 29572743  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  29572742 tcgatgca 29572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Original strand, 16943972 - 16944146
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  16943972 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 16944071  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 202  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16944072 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29501310 - 29501096
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29501310 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29501211  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  |  |||||||| |    
T  29501210 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacaaaggattcagc 29501111  T
Q  572 tttctcgaatacaat 586  Q
    |||||| || |||||    
T  29501110 tttctcaaacacaat 29501096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 554
Target Start/End: Original strand, 30558308 - 30558490
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  30558308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 30558407  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 554  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  30558408 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 30558490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Original strand, 34463728 - 34463867
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  34463728 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 34463827  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34463828 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 637
Target Start/End: Original strand, 4546151 - 4546341
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4546151 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4546250  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4546251 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 4546341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Original strand, 16944394 - 16944524
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  16944394 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 16944493  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  16944494 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 16944524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 28207271 - 28207081
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28207271 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 28207172  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28207171 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28207081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 553
Target Start/End: Original strand, 26777919 - 26778100
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  26777919 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagcca 26778018  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 553  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  26778019 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 26778100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 27360377 - 27360484
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27360377 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27360476  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  27360477 tcgatgca 27360484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 27450720 - 27450827
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27450720 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27450819  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  27450820 tcgatgca 27450827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16673956 - 16673817
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  16673956 gcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 16673857  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  16673856 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 16673817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 625
Target Start/End: Original strand, 4724510 - 4724688
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |    
T  4724510 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccataccttt 4724609  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 625  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  4724610 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 4724688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 554
Target Start/End: Original strand, 26116792 - 26116893
Alignment:
Q  453 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 552  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||    
T  26116792 ataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatg 26116891  T
Q  553 ca 554  Q
    ||    
T  26116892 ca 26116893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 625
Target Start/End: Original strand, 27629968 - 27630254
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||| | ||| | | | | ||||| |  |||  ||    
T  27629968 acgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggta 27630067  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
     ||| ||| |||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  27630068 gctgagcaacattaacaggggcgacagtagccgtagactgacctgctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgcc 27630167  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 625  Q
     |||||||| ||  || |||  || || ||| | ||||| |||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  27630168 atacctcttcgacccacttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccctctctgacggcctcctctagacgagtccccat 27630254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 625
Target Start/End: Original strand, 27272947 - 27273128
Alignment:
Q  444 gcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacc 543  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  | |  ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  27272947 gcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgccatacc 27273046  T
Q  544 tctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 625  Q
    ||||  |  ||||||  || || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  27273047 tcttcaacccatttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccttccctgacggcttcctctagacgagtccccat 27273128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 277
Target Start/End: Original strand, 2664 - 2909
Alignment:
Q  32 attgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatgg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2664 attgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgg 2763  T
Q  132 aaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggga 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2764 aaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttggga 2863  T
Q  232 gtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2864 gtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 2909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 317 - 451
Target Start/End: Original strand, 2949 - 3083
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2949 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 3048  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  3049 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 22080839 - 22081085
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  22080839 ggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttg 22080938  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  22080939 atggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtc 22081038  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    ||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22081039 gggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 22081085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16283392 - 16283091
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  16283392 ttaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 16283293  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16283292 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16283193  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16283192 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaatacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16283093  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  16283092 tc 16283091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44563311 - 44563106
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |    
T  44563311 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 44563212  T
Q  172 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44563211 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtagg 44563112  T
Q  272 tctagc 277  Q
    ||||||    
T  44563111 tctagc 44563106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 277
Target Start/End: Original strand, 19659044 - 19659249
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||    
T  19659044 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacg 19659143  T
Q  172 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 271  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  19659144 ggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 19659243  T
Q  272 tctagc 277  Q
    ||||||    
T  19659244 tctagc 19659249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9354832 - 9354627
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |    
T  9354832 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 9354733  T
Q  172 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  9354732 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 9354633  T
Q  272 tctagc 277  Q
    ||||||    
T  9354632 tctagc 9354627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33244884 - 33244670
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |    
T  33244884 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttag 33244785  T
Q  163 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||    
T  33244784 gaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagagg 33244685  T
Q  263 aaaagtaggtctagc 277  Q
    ||| |||||||||||    
T  33244684 aaaggtaggtctagc 33244670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16277497 - 16277196
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16277497 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 16277398  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16277397 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16277298  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16277297 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16277198  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  16277197 tc 16277196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 19688041 - 19687740
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  19688041 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggag 19687942  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  19687941 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 19687842  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  19687841 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 19687742  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  19687741 tc 19687740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Original strand, 22081125 - 22081446
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22081125 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 22081224  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
       ||| | |||| ||||  || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22081225 atgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 22081324  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  22081325 tcttcttatgatgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacatttttcaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcg 22081424  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  22081425 ggttcccatggtgaccatctca 22081446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 2137531 - 2137832
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  2137531 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 2137630  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2137631 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2137730  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  2137731 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattcattccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 2137830  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  2137831 tc 2137832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16283703 - 16283454
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||    
T  16283703 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttg 16283604  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||    
T  16283603 atggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtc 16283504  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16283503 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagc 16283454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 14557570 - 14557269
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  14557570 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 14557471  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14557470 gcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14557371  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  14557370 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 14557271  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  14557270 tc 14557269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16277808 - 16277559
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  16277808 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 16277709  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  16277708 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 16277609  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16277608 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16277559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 27608866 - 27609115
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  27608866 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttg 27608965  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  27608966 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 27609065  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27609066 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27609115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 27609177 - 27609478
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||   | |||| ||||| ||||||     
T  27609177 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggag 27609276  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27609277 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27609376  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  27609377 accatacctctttgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 27609476  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  27609477 tc 27609478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14557878 - 14557629
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  14557878 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 14557779  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  14557778 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 14557679  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14557678 ggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 14557629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19688352 - 19688103
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  19688352 ggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 19688253  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  19688252 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 19688153  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19688152 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 19688103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 2137221 - 2137469
Alignment:
Q  29 gacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttga 128  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||  || ||||||    
T  2137221 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttga 2137320  T
Q  129 tggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 228  Q
    || |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||    
T  2137321 tgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcg 2137420  T
Q  229 ggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    | || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2137421 gaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 2137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18710840 - 18710591
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | || ||||| ||    
T  18710840 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctg 18710741  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18710740 atgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18710641  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18710640 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 18710591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Original strand, 19659299 - 19659423
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19659299 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 19659398  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  19659399 acgacggaggtagctgagcagcatt 19659423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 44563047 - 44562932
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  44563047 ttaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggag 44562948  T
Q  436 ataactgggcagcatt 451  Q
     || ||| ||||||||    
T  44562947 gtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 31489711 - 31489960
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  31489711 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 31489810  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  31489811 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 31489910  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31489911 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31489960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 9354577 - 9354453
Alignment:
Q  327 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9354577 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 9354478  T
Q  427 acgacggaaataactgggcagcatt 451  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  9354477 acgacggaggtagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31354776 - 31354529
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  31354776 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 31354677  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  31354676 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 31354577  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31354576 aagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31354529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 3329470 - 3329716
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  3329470 acattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 3329569  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  3329570 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 3329669  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3329670 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 12092687 - 12092933
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  12092687 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 12092786  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  12092787 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 12092886  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12092887 aagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19674695 - 19674446
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || |  |||||||||||| | |  ||||| ||    
T  19674695 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctg 19674596  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  19674595 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 19674496  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19674495 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 19674446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 18710526 - 18710228
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  18710526 acgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggca 18710427  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18710426 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18710327  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18710326 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 19674378 - 19674080
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  19674378 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 19674279  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19674278 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtgatgtccattacc 19674179  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19674178 atacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcgaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19674080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29829574 - 29829328
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  29829574 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 29829475  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  29829474 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttgg 29829375  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || |  || || || | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29829374 aagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 19208321 - 19208570
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  19208321 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 19208420  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  19208421 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 19208520  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19208521 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 19208570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19286399 - 19286158
Alignment:
Q  345 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 444  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  19286399 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 19286300  T
Q  445 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 544  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  19286299 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 19286200  T
Q  545 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  19286199 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 19286158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 28361916 - 28362165
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  28361916 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 28362015  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28362016 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 28362115  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28362116 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28362165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 577
Target Start/End: Original strand, 31490025 - 31490263
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31490025 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 31490124  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31490125 tttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31490224  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  31490225 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctc 31490263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19286714 - 19286468
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  19286714 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 19286615  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  19286614 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 19286515  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 276  Q
     || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19286514 aagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 328 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31354475 - 31354250
Alignment:
Q  328 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 427  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| |||||    
T  31354475 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 31354376  T
Q  428 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 527  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  31354375 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 31354276  T
Q  528 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 553  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  31354275 tgtccattaccatacctcttcgatgc 31354250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 19208743 - 19208850
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||    
T  19208743 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacttct 19208842  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  19208843 tcgatgca 19208850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 459 - 586
Target Start/End: Original strand, 28362350 - 28362477
Alignment:
Q  459 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 558  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |      
T  28362350 gcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactca 28362449  T
Q  559 cggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  28362450 cagaggattcagctttctcaaacacaat 28362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 625
Target Start/End: Original strand, 3329902 - 3330080
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  3329902 gcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 3330001  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 625  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  3330002 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgagttcccat 3330080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 29829145 - 29828967
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  29829145 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 29829046  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 625  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  29829045 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatctctgacggcttcctcaagacgggttcccat 29828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33258977 - 33258803
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  33258977 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 33258878  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 202  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33258877 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Original strand, 19518526 - 19518665
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  19518526 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 19518625  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  19518626 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 19518665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 33258555 - 33258425
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  33258555 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgcccattaccatatctct 33258456  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 577  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  33258455 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 33258425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 637
Target Start/End: Original strand, 12093116 - 12093306
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12093116 gcattgataggagcaatagtagccatagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12093215  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12093216 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 12093306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 189348 - 189256
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagag 120  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  189348 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21815 - 21569
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| |||||    
T  21815 ggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttg 21716  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  21715 atggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtc 21616  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 274  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21615 gggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 21569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 21529 - 21208
Alignment:
Q  317 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 416  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21529 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 21430  T
Q  417 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 516  Q
       ||| |||||| ||||  || ||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21429 atgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 21330  T
Q  517 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 616  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||    
T  21329 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataattccgtctctgacagcctcttctaagcg 21230  T
Q  617 agtccccatgatgtccatctca 638  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  21229 ggttcccatggtgaccatctca 21208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 29706 - 29405
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||     
T  29706 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggag 29607  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29606 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 29507  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  29506 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 29407  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  29406 tc 29405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 339 - 637
Target Start/End: Original strand, 40385 - 40683
Alignment:
Q  339 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 438  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||| ||||   |    
T  40385 acgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggca 40484  T
Q  439 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 538  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  40485 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 40584  T
Q  539 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  40585 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 40683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 40071 - 40320
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  40071 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 40170  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||   ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  40171 atggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 40270  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40271 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 40320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 46987 - 47236
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  46987 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 47086  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  47087 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 47186  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47187 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 47236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 47298 - 47599
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| || |||     
T  47298 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggag 47397  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  47398 gcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 47497  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  47498 accatacctctttgatgcattcacggaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 47597  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  47598 tc 47599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30017 - 29768
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||| ||| |||| || |||||    
T  30017 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttg 29918  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
     ||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  29917 gtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 29818  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29817 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 29768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 1920 - 2103
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1920 ggacattgttctcaaaagttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 2018  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2019 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6268 - 6080
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaac-gcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcacctt 126  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||  || || || || |||||||||||| | |  |||||||    
T  6268 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcacctt 6169  T
Q  127 gatggaaa-tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 214  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6168 gatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 447 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5821 - 5682
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatg-gattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctc 545  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||    
T  5821 gcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctc 5723  T
Q  546 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 586  Q
    || || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  5722 ttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 27235 - 26934
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  27235 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 27136  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27135 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27036  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  27035 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26936  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  26935 tc 26934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27546 - 27297
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  27546 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 27447  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  27446 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 27347  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27346 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 336 - 637
Target Start/End: Original strand, 443 - 744
Alignment:
Q  336 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 435  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  443 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 542  T
Q  436 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 535  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  543 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 642  T
Q  536 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  643 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 742  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  743 tc 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 131 - 381
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||  || |||||    
T  131 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttg 230  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  231 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 330  T
Q  228 gggagtaact-cggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||   ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  331 ggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 7241 - 7490
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  7241 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 7340  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  7341 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 7440  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7441 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 7490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 447 - 554
Target Start/End: Original strand, 7663 - 7770
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  7663 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 7762  T
Q  547 ttgatgca 554  Q
    | ||||||    
T  7763 tcgatgca 7770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9820 - 9571
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  9820 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 9721  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||     
T  9720 atgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagtt 9621  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9620 ggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 368 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 8143 - 7874
Alignment:
Q  368 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 467  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  8143 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagta 8044  T
Q  468 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggatt 567  Q
    ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  8043 gccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggatt 7944  T
Q  568 caactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    || ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7943 cagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 9068 - 9317
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  9068 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 9167  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  9168 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 9267  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9268 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20269 - 20020
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  20269 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 20170  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  20169 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 20070  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20069 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 20020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 550
Target Start/End: Original strand, 9490 - 9593
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9490 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9589  T
Q  547 ttga 550  Q
    ||||    
T  9590 ttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Original strand, 620 - 728
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  620 ggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttg 719  T
Q  128 atggaaatc 136  Q
    |||||||||    
T  720 atggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 26203 - 26453
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  26203 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 26302  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctg-ggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 226  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||    
T  26303 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagt 26402  T
Q  227 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
     || || | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26403 tggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 26453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 447 - 637
Target Start/End: Original strand, 26626 - 26816
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  26626 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 26725  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    | || |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26726 tcgacgcatttacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 443 - 637
Target Start/End: Original strand, 48568 - 48769
Alignment:
Q  443 ggcagcattaataggggcaacag-tagccatggattga--ccggctccggca-gataccatccc-tacttctgtttctttcttcttatgatgacc-gtta 536  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  48568 ggcagcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcccgtta 48667  T
Q  537 ccgtacctcttt-gatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 635  Q
    || ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  48668 ccatacctcttttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 48767  T
Q  636 tc 637  Q
    ||    
T  48768 tc 48769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8201 - 7963
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  8201 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 8102  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  8101 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 8002  T
Q  230 gagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 268  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8001 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 7769 - 7579
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 546  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  7769 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 7670  T
Q  547 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7669 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 14932 - 15181
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  14932 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 15031  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  15032 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 15131  T
Q  228 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 277  Q
    || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15132 ggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 15181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 372 - 637
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15544
Alignment:
Q  372 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 471  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  15279 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 15378  T
Q  472 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 571  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  15379 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 15478  T
Q  572 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 637  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15479 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 447 - 487
Target Start/End: Original strand, 157 - 197
Alignment:
Q  447 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 487  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  157 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctcc 197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University