View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1263_low_12 (Length: 288)

Name: NF1263_low_12
Description: NF1263
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1263_low_12
NF1263_low_12
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (85-288)||(3320-3523)
scaffold0089 (166-288)||(43872-43994)
scaffold0089 (236-288)||(32096-32148)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (85-288)||(22891723-22891926)
chr5 (85-288)||(11552615-11552818)
chr5 (85-288)||(15655455-15655658)
chr5 (85-288)||(22995814-22996017)
chr5 (85-288)||(25203538-25203741)
chr5 (85-288)||(25267693-25267896)
chr5 (85-288)||(33295788-33295991)
chr5 (85-288)||(33780749-33780952)
chr5 (85-288)||(41677965-41678168)
chr5 (85-288)||(23629230-23629433)
chr5 (85-288)||(23895466-23895669)
chr5 (85-288)||(24684842-24685045)
chr5 (85-288)||(30937895-30938098)
chr5 (85-288)||(9320736-9320939)
chr5 (85-288)||(12135435-12135638)
chr5 (85-288)||(18497422-18497625)
chr5 (85-288)||(26483654-26483857)
chr5 (85-288)||(24973166-24973369)
chr5 (90-288)||(43081515-43081713)
chr5 (85-288)||(3792801-3793004)
chr5 (85-288)||(28652502-28652705)
chr5 (85-288)||(34619778-34619981)
chr5 (85-288)||(18372231-18372434)
chr5 (85-288)||(30171729-30171932)
chr5 (85-288)||(31434724-31434927)
chr5 (85-288)||(32592971-32593174)
chr5 (85-288)||(37355340-37355543)
chr5 (85-288)||(8662172-8662375)
chr5 (85-288)||(15755549-15755752)
chr5 (85-288)||(24586634-24586837)
chr5 (85-288)||(30032688-30032891)
chr5 (85-288)||(30155291-30155494)
chr5 (85-288)||(31823104-31823307)
chr5 (85-288)||(33519640-33519843)
chr5 (85-288)||(37668183-37668386)
chr5 (85-288)||(37758243-37758446)
chr5 (85-288)||(40470247-40470450)
chr5 (85-288)||(2514322-2514525)
chr5 (85-288)||(13321527-13321730)
chr5 (85-288)||(24727229-24727432)
chr5 (85-288)||(28956482-28956685)
chr5 (85-288)||(37767688-37767891)
chr5 (85-288)||(5641048-5641251)
chr5 (85-288)||(6877565-6877768)
chr5 (85-221)||(13183490-13183626)
chr5 (85-202)||(18125113-18125230)
chr5 (85-199)||(13439380-13439494)
chr5 (90-202)||(9547411-9547523)
chr5 (90-202)||(29887899-29888011)
chr5 (90-202)||(33878477-33878588)
chr5 (90-202)||(11326983-11327095)
chr5 (85-268)||(15784422-15784605)
chr5 (85-268)||(11944119-11944302)
chr5 (206-268)||(5440043-5440105)
chr5 (206-268)||(17957376-17957438)
chr5 (206-268)||(36375780-36375842)
chr5 (206-268)||(37000434-37000496)
chr5 (214-270)||(34468900-34468956)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (85-288)||(15281737-15281940)
chr4 (85-288)||(1903520-1903723)
chr4 (85-288)||(15231138-15231341)
chr4 (85-288)||(5009141-5009344)
chr4 (85-288)||(6573124-6573327)
chr4 (85-284)||(14668286-14668485)
chr4 (85-288)||(18313978-18314181)
chr4 (85-288)||(14760106-14760309)
chr4 (85-288)||(17016312-17016515)
chr4 (85-288)||(24589161-24589364)
chr4 (85-288)||(34185760-34185963)
chr4 (85-288)||(20335221-20335424)
chr4 (85-288)||(36341317-36341520)
chr4 (85-288)||(54836657-54836860)
chr4 (85-288)||(24115928-24116131)
chr4 (85-288)||(18797414-18797617)
chr4 (85-288)||(27160117-27160320)
chr4 (85-288)||(40102437-40102640)
chr4 (85-288)||(14101809-14102012)
chr4 (85-288)||(33670600-33670803)
chr4 (85-288)||(21972967-21973170)
chr4 (85-288)||(30757026-30757229)
chr4 (85-288)||(31123312-31123515)
chr4 (85-288)||(39853903-39854106)
chr4 (85-288)||(15388178-15388381)
chr4 (166-221)||(24459636-24459691)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (85-288)||(21699960-21700163)
chr2 (85-288)||(13933336-13933539)
chr2 (85-288)||(34294406-34294609)
chr2 (85-288)||(11631973-11632176)
chr2 (85-288)||(19453212-19453415)
chr2 (85-288)||(39048608-39048811)
chr2 (85-288)||(12590060-12590263)
chr2 (85-288)||(12658788-12658991)
chr2 (85-288)||(20841165-20841368)
chr2 (85-288)||(23125357-23125560)
chr2 (85-288)||(27431230-27431433)
chr2 (85-288)||(37380929-37381132)
chr2 (92-288)||(28885459-28885655)
chr2 (85-288)||(27806955-27807158)
chr2 (85-288)||(39893321-39893524)
chr2 (85-288)||(257442-257645)
chr2 (85-288)||(9346775-9346978)
chr2 (85-288)||(37948651-37948854)
chr2 (85-288)||(40236760-40236963)
chr2 (85-288)||(16826127-16826330)
chr2 (85-288)||(16895150-16895353)
chr2 (85-288)||(19413290-19413493)
chr2 (85-288)||(21673964-21674167)
chr2 (85-288)||(32053055-32053258)
chr2 (85-288)||(34864936-34865139)
chr2 (85-288)||(37682684-37682887)
chr2 (85-288)||(37697949-37698152)
chr2 (85-288)||(37928621-37928824)
chr2 (85-288)||(12713390-12713593)
chr2 (85-288)||(27394814-27395017)
chr2 (85-288)||(31879538-31879741)
chr2 (90-202)||(16164818-16164930)
chr2 (90-202)||(27779572-27779684)
chr2 (90-202)||(27819329-27819441)
chr2 (96-202)||(34158182-34158288)
chr2 (90-202)||(3785831-3785943)
chr2 (90-202)||(31890285-31890397)
chr2 (90-202)||(22924942-22925054)
chr2 (90-202)||(27119862-27119974)
chr2 (85-159)||(27827841-27827915)
chr2 (85-268)||(12383932-12384115)
chr2 (206-268)||(22949665-22949727)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (85-288)||(1424-1627)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (85-288)||(19323-19526)
scaffold0143 (85-288)||(30546-30749)
scaffold0143 (85-202)||(7299-7416)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (85-288)||(2157824-2158027)
chr7 (85-288)||(10844870-10845073)
chr7 (85-288)||(10913554-10913757)
chr7 (85-288)||(26534558-26534761)
chr7 (85-288)||(10842679-10842882)
chr7 (85-288)||(16446691-16446894)
chr7 (85-288)||(22145445-22145648)
chr7 (85-288)||(26516042-26516245)
chr7 (85-288)||(5131246-5131449)
chr7 (85-288)||(2106848-2107051)
chr7 (85-288)||(5144025-5144228)
chr7 (85-288)||(26271771-26271974)
chr7 (85-288)||(26316533-26316736)
chr7 (99-288)||(16044569-16044758)
chr7 (85-288)||(11421464-11421667)
chr7 (85-288)||(16515115-16515318)
chr7 (85-288)||(4202639-4202842)
chr7 (85-288)||(3448556-3448759)
chr7 (85-288)||(4141931-4142134)
chr7 (85-288)||(11444137-11444340)
chr7 (85-288)||(26438507-26438710)
chr7 (85-288)||(45390470-45390673)
chr7 (85-288)||(16748202-16748405)
chr7 (85-288)||(31561075-31561278)
chr7 (85-288)||(26666599-26666802)
chr7 (85-288)||(24589219-24589422)
chr7 (160-288)||(9621900-9622028)
chr7 (90-202)||(2776590-2776702)
chr7 (90-202)||(26512386-26512498)
chr7 (90-202)||(26681796-26681908)
chr7 (90-202)||(31127243-31127355)
chr7 (90-202)||(31087312-31087424)
chr7 (90-202)||(39209829-39209941)
chr7 (90-202)||(45734649-45734761)
chr7 (85-268)||(9469590-9469773)
chr7 (85-268)||(16393119-16393302)
chr7 (85-268)||(30369631-30369814)
chr7 (214-270)||(16287193-16287249)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (85-288)||(29552807-29553010)
chr6 (85-288)||(16677390-16677593)
chr6 (85-288)||(17089186-17089389)
chr6 (85-288)||(27022386-27022589)
chr6 (85-288)||(3699333-3699536)
chr6 (85-288)||(13295694-13295897)
chr6 (85-288)||(15421063-15421266)
chr6 (85-288)||(22931627-22931830)
chr6 (85-288)||(23854072-23854275)
chr6 (85-288)||(27179706-27179909)
chr6 (85-288)||(27269330-27269533)
chr6 (85-288)||(27287107-27287310)
chr6 (85-288)||(24866966-24867169)
chr6 (96-288)||(16753071-16753263)
chr6 (85-288)||(27060756-27060959)
chr6 (85-288)||(27626454-27626657)
chr6 (85-288)||(34461249-34461452)
chr6 (85-288)||(29504666-29504869)
chr6 (85-288)||(4761013-4761216)
chr6 (85-288)||(26113155-26113358)
chr6 (85-288)||(27010981-27011184)
chr6 (85-288)||(28210704-28210907)
chr6 (96-288)||(26921627-26921819)
chr6 (85-288)||(4542517-4542720)
chr6 (85-288)||(4720878-4721081)
chr6 (85-288)||(27488383-27488586)
chr6 (85-288)||(29576264-29576467)
chr6 (85-288)||(30554759-30554962)
chr6 (85-288)||(16940770-16940973)
chr6 (85-288)||(4528535-4528738)
chr6 (85-288)||(4776130-4776333)
chr6 (85-288)||(20171797-20172000)
chr6 (85-288)||(22163991-22164194)
chr6 (85-237)||(26992096-26992248)
chr6 (85-221)||(33373174-33373310)
chr6 (85-202)||(26775370-26775487)
chr6 (85-202)||(27358853-27358970)
chr6 (85-202)||(27449196-27449313)
chr6 (90-202)||(14142142-14142254)
chr6 (90-202)||(26789152-26789264)
chr6 (90-202)||(27197521-27197633)
chr6 (90-202)||(27251602-27251714)
chr6 (85-202)||(28163827-28163944)
chr6 (90-202)||(13520940-13521051)
chr6 (90-202)||(8902451-8902563)
chr6 (85-202)||(22455857-22455974)
chr6 (85-268)||(9136096-9136279)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (85-288)||(4793478-4793681)
chr3 (85-288)||(6205117-6205320)
chr3 (85-288)||(8286313-8286516)
chr3 (85-288)||(16621333-16621536)
chr3 (85-288)||(4686869-4687072)
chr3 (85-288)||(4724845-4725048)
chr3 (85-288)||(18333844-18334047)
chr3 (85-288)||(21677917-21678120)
chr3 (85-288)||(29145599-29145802)
chr3 (85-288)||(15737937-15738140)
chr3 (85-288)||(15889548-15889751)
chr3 (85-288)||(18054476-18054679)
chr3 (85-288)||(18273895-18274098)
chr3 (85-288)||(18289196-18289399)
chr3 (85-288)||(18304497-18304700)
chr3 (85-288)||(29661813-29662016)
chr3 (85-288)||(32442365-32442568)
chr3 (85-288)||(35883980-35884183)
chr3 (85-288)||(5593200-5593403)
chr3 (85-288)||(8299185-8299388)
chr3 (85-288)||(19697704-19697907)
chr3 (85-288)||(20069254-20069457)
chr3 (85-288)||(10399358-10399561)
chr3 (85-288)||(22384421-22384624)
chr3 (85-288)||(28112797-28113000)
chr3 (85-288)||(7076420-7076623)
chr3 (85-288)||(5470202-5470405)
chr3 (85-288)||(28024496-28024699)
chr3 (85-288)||(47026667-47026870)
chr3 (85-287)||(48469142-48469344)
chr3 (85-288)||(5606157-5606360)
chr3 (85-288)||(20573686-20573889)
chr3 (85-288)||(28342391-28342594)
chr3 (85-288)||(4343519-4343722)
chr3 (85-288)||(4420129-4420332)
chr3 (85-288)||(6539585-6539788)
chr3 (85-288)||(7999774-7999977)
chr3 (85-288)||(8214949-8215152)
chr3 (85-288)||(10646287-10646490)
chr3 (85-288)||(22867691-22867894)
chr3 (85-288)||(22882750-22882953)
chr3 (85-288)||(18245955-18246158)
chr3 (85-288)||(24331377-24331580)
chr3 (85-288)||(31961298-31961501)
chr3 (85-288)||(51785237-51785440)
chr3 (116-288)||(11107226-11107398)
chr3 (85-288)||(5016928-5017131)
chr3 (85-288)||(17981792-17981995)
chr3 (85-288)||(18228410-18228613)
chr3 (85-202)||(5714373-5714490)
chr3 (85-202)||(5725283-5725400)
chr3 (85-202)||(5766968-5767085)
chr3 (85-202)||(4627085-4627202)
chr3 (90-202)||(32293928-32294040)
chr3 (90-202)||(17992779-17992891)
chr3 (90-202)||(31033084-31033196)
chr3 (206-270)||(15918749-15918813)
chr3 (85-268)||(5950645-5950828)
chr3 (213-270)||(15592882-15592939)
chr3 (213-270)||(20443349-20443406)
chr3 (213-270)||(41440475-41440532)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (85-288)||(20339101-20339304)
chr1 (85-288)||(21894549-21894752)
chr1 (99-288)||(20464231-20464420)
chr1 (85-288)||(16204834-16205037)
chr1 (85-288)||(10965920-10966123)
chr1 (85-288)||(41790110-41790313)
chr1 (85-288)||(51641473-51641676)
chr1 (85-288)||(10948332-10948535)
chr1 (85-288)||(28588240-28588443)
chr1 (85-288)||(3644387-3644593)
chr1 (90-202)||(28153077-28153189)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (85-288)||(18793956-18794159)
chr8 (85-288)||(27605666-27605869)
chr8 (85-288)||(14560876-14561079)
chr8 (85-288)||(19205123-19205326)
chr8 (85-288)||(2134021-2134224)
chr8 (85-288)||(19691350-19691553)
chr8 (85-288)||(29832578-29832781)
chr8 (85-288)||(9357877-9358080)
chr8 (85-288)||(18712736-18712939)
chr8 (85-288)||(28358713-28358916)
chr8 (85-288)||(12089484-12089687)
chr8 (85-288)||(19677699-19677902)
chr8 (85-288)||(22077672-22077875)
chr8 (85-288)||(31357780-31357983)
chr8 (85-288)||(31486632-31486835)
chr8 (85-288)||(33261986-33262189)
chr8 (90-202)||(15770912-15771024)
chr8 (90-202)||(44564322-44564434)
chr8 (96-202)||(21344943-21345049)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (85-288)||(9289-9492)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (85-288)||(9298-9501)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (85-288)||(15834-16037)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (85-288)||(22991-23194)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (85-288)||(11202-11405)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (85-288)||(9275-9478)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (85-288)||(12824-13027)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (85-288)||(11728-11931)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (85-288)||(5979-6182)
scaffold0159 (237-288)||(23132-23183)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (85-288)||(5471-5674)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (96-288)||(43541-43743)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (198-288)||(1176-1266)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (85-268)||(29443-29626)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (234-288)||(33713-33770)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (213-270)||(35168-35225)


Alignment Details
Target: scaffold0089 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3523 - 3320
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3523 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 3424  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3324  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  3323 cctc 3320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 288
Target Start/End: Original strand, 43872 - 43994
Alignment:
Q  166 cttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgta 265  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43872 cttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgta 43971  T
Q  266 attcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43972 attcaaacgcccgaggaaacctc 43994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 288
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32148
Alignment:
Q  236 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 32148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22891926 - 22891723
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22891926 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 22891827  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22891826 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22891727  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22891726 cctc 22891723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11552818 - 11552615
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11552818 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11552719  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552718 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 11552619  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  11552618 cctc 11552615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 15655455 - 15655658
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15655455 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15655554  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15655555 tacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15655654  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  15655655 cctc 15655658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 22995814 - 22996017
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22995814 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22995913  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995914 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22996013  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22996014 cctc 22996017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25203741 - 25203538
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25203741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25203642  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25203641 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25203542  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  25203541 cctc 25203538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25267896 - 25267693
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25267896 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25267797  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25267796 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25267697  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  25267696 cctc 25267693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33295991 - 33295788
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33295991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33295892  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33295891 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 33295792  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  33295791 cctc 33295788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33780952 - 33780749
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33780952 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33780853  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780852 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 33780753  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  33780752 cctc 33780749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41678168 - 41677965
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41678168 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41678069  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41678068 tacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 41677969  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  41677968 cctc 41677965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23629433 - 23629230
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23629433 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23629334  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23629333 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 23629234  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  23629233 cctc 23629230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23895669 - 23895466
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23895669 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttcca 23895570  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23895569 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 23895470  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  23895469 cctc 23895466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 24684842 - 24685045
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24684842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24684941  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24684942 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24685041  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  24685042 cctc 24685045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30938098 - 30937895
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30938098 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 30937999  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30937998 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30937899  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  30937898 cctc 30937895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9320939 - 9320736
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9320939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9320840  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  9320839 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9320740  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  9320739 cctc 9320736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12135638 - 12135435
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12135638 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12135539  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  12135538 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 12135439  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  12135438 cctc 12135435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 18497422 - 18497625
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18497422 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18497521  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497522 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18497621  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18497622 cctc 18497625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26483857 - 26483654
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26483857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26483758  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  26483757 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26483658  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  26483657 cctc 26483654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24973369 - 24973166
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  24973369 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 24973270  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  24973269 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaa 24973170  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  24973169 cctc 24973166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 90 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43081713 - 43081515
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43081713 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 43081614  T
Q  190 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
     |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43081613 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctc 43081515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3793004 - 3792801
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  3793004 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3792905  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3792904 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3792805  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  3792804 cctc 3792801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28652705 - 28652502
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28652705 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28652606  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28652605 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28652506  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  28652505 cctc 28652502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34619981 - 34619778
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  34619981 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 34619882  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34619881 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34619782  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  34619781 cctc 34619778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 18372231 - 18372434
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  18372231 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 18372330  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  18372331 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 18372430  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18372431 cctc 18372434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30171932 - 30171729
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  30171932 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattcca 30171833  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171832 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 30171733  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  30171732 cctc 30171729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31434927 - 31434724
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31434927 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31434828  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31434827 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31434728  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  31434727 cctc 31434724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 32592971 - 32593174
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  32592971 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 32593070  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32593071 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 32593170  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  32593171 cctc 32593174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 37355340 - 37355543
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37355340 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37355439  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37355440 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37355539  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  37355540 cctc 37355543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 8662172 - 8662375
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8662172 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8662271  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  8662272 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 8662371  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  8662372 cctc 8662375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 15755549 - 15755752
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15755549 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15755648  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  15755649 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 15755748  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  15755749 cctc 15755752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24586837 - 24586634
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24586837 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24586738  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24586737 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24586638  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  24586637 cctc 24586634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30032891 - 30032688
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30032891 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30032792  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30032791 tacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30032692  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  30032691 cctc 30032688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30155494 - 30155291
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30155494 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30155395  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30155394 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30155295  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  30155294 cctc 30155291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 31823104 - 31823307
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31823104 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31823203  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31823204 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31823303  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  31823304 cctc 31823307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33519843 - 33519640
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33519843 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33519744  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  33519743 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33519644  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  33519643 cctc 33519640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 37668183 - 37668386
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37668183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37668282  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37668283 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37668382  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  37668383 cctc 37668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37758446 - 37758243
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37758446 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37758347  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37758346 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37758247  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  37758246 cctc 37758243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 40470247 - 40470450
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  40470247 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 40470346  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470347 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 40470446  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  40470447 cctc 40470450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2514525 - 2514322
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  2514525 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 2514426  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  2514425 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 2514326  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  2514325 cctc 2514322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 13321527 - 13321730
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13321527 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13321626  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  13321627 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 13321726  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  13321727 cctc 13321730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24727432 - 24727229
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24727432 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24727333  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24727332 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24727233  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  24727232 cctc 24727229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 28956482 - 28956685
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  28956482 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28956581  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28956582 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28956681  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  28956682 cctc 28956685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 37767688 - 37767891
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37767688 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37767787  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37767788 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37767887  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  37767888 cctc 37767891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5641251 - 5641048
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5641251 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5641152  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5641151 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5641052  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  5641051 cctc 5641048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6877768 - 6877565
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  6877768 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 6877669  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6877668 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6877569  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  6877568 cctc 6877565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 13183490 - 13183626
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  13183490 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttcca 13183589  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatc 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13183590 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatc 13183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Original strand, 18125113 - 18125230
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18125113 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18125212  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18125213 tacaataggctgattctt 18125230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 199
Target Start/End: Original strand, 13439380 - 13439494
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13439380 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 13439479  T
Q  185 tacaataggctgatt 199  Q
    |||||||||||||||    
T  13439480 tacaataggctgatt 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 9547411 - 9547523
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9547411 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 9547510  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  9547511 taggctgattctt 9547523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 29887899 - 29888011
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29887899 atcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 29887998  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  29887999 taggctgattctt 29888011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33878588 - 33878477
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  33878588 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcattcatcgttccatacaa 33878490  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  33878489 taggctgattctt 33878477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11327095 - 11326983
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11327095 atcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 11326996  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||| ||||||||    
T  11326995 taggttgattctt 11326983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Original strand, 15784422 - 15784605
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||| ||| ||||    
T  15784422 acatgatcaaaggtctcccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcattcttcggtcca 15784521  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||||   || |  || | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784522 tacaataccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Original strand, 11944119 - 11944302
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||| ||||    
T  11944119 acatgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtcca 11944218  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
     ||||||   || |  || | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944219 cacaataccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Original strand, 5440043 - 5440105
Alignment:
Q  206 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440043 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17957438 - 17957376
Alignment:
Q  206 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957438 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Original strand, 36375780 - 36375842
Alignment:
Q  206 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375780 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Original strand, 37000434 - 37000496
Alignment:
Q  206 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000434 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34468956 - 34468900
Alignment:
Q  214 tgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 270  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34468956 tgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 34468900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 15281737 - 15281940
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281737 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15281836  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15281837 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15281936  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  15281937 cctc 15281940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1903723 - 1903520
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1903723 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttcca 1903624  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903623 tacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 1903524  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  1903523 cctc 1903520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15231341 - 15231138
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231341 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15231242  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15231241 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15231142  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  15231141 cctc 15231138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5009344 - 5009141
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5009344 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5009245  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5009244 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5009145  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  5009144 cctc 5009141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6573327 - 6573124
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6573327 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6573228  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573227 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6573128  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  6573127 cctc 6573124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14668485 - 14668286
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14668485 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14668386  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668385 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 14668286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 18313978 - 18314181
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18313978 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18314077  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314078 tacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18314177  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18314178 cctc 18314181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 14760106 - 14760309
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14760106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14760205  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14760206 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14760305  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  14760306 cctc 14760309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17016515 - 17016312
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17016515 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17016416  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17016415 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 17016316  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  17016315 cctc 17016312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 24589161 - 24589364
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  24589161 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 24589260  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589261 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 24589360  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  24589361 cctc 24589364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 34185760 - 34185963
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  34185760 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 34185859  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185860 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34185959  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  34185960 cctc 34185963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 20335221 - 20335424
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20335221 acataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20335320  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20335321 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20335420  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  20335421 cctc 20335424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 36341317 - 36341520
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  36341317 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattcca 36341416  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36341417 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 36341516  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  36341517 cctc 36341520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 54836860 - 54836657
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  54836860 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 54836761  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54836760 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 54836661  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  54836660 cctc 54836657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24116131 - 24115928
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24116131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24116032  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24116031 tacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24115932  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  24115931 cctc 24115928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 18797414 - 18797617
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18797414 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18797513  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797514 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18797613  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18797614 cctc 18797617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 27160117 - 27160320
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27160117 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27160216  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160217 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27160316  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27160317 cctc 27160320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 40102437 - 40102640
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40102437 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 40102536  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  40102537 tacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 40102636  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  40102637 cctc 40102640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14102012 - 14101809
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  14102012 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 14101913  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  14101912 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 14101813  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  14101812 cctc 14101809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 33670600 - 33670803
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33670600 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33670699  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  33670700 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 33670799  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  33670800 cctc 33670803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21973170 - 21972967
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21973170 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21973071  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  21973070 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21972971  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  21972970 cctc 21972967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30757229 - 30757026
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30757229 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30757130  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  30757129 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 30757030  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  30757029 cctc 30757026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 31123312 - 31123515
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31123312 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31123411  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31123412 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31123511  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  31123512 cctc 31123515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39854106 - 39853903
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39854106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39854007  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854006 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39853907  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  39853906 cctc 39853903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 15388178 - 15388381
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  15388178 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 15388277  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
     |||||||| |||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388278 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15388377  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  15388378 cctc 15388381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 24459636 - 24459691
Alignment:
Q  166 cttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatc 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24459636 cttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatc 24459691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 21699960 - 21700163
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699960 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 21700059  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21700060 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 21700159  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  21700160 cctc 21700163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 13933336 - 13933539
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13933336 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13933435  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 13933535  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  13933536 cctc 13933539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34294609 - 34294406
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34294609 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 34294510  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34294509 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 34294410  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  34294409 cctc 34294406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 11631973 - 11632176
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11631973 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11632072  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11632073 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 11632172  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  11632173 cctc 11632176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 19453212 - 19453415
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453212 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19453311  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19453312 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19453411  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  19453412 cctc 19453415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 39048608 - 39048811
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39048608 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39048707  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048708 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39048807  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  39048808 cctc 39048811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12590263 - 12590060
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12590263 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 12590164  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12590163 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 12590064  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  12590063 cctc 12590060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12658991 - 12658788
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12658991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12658892  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12658891 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 12658792  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  12658791 cctc 12658788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20841368 - 20841165
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20841368 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20841269  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20841268 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20841169  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  20841168 cctc 20841165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 23125357 - 23125560
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23125357 acataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23125456  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125457 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23125556  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  23125557 cctc 23125560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 27431230 - 27431433
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27431230 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27431329  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27431330 tacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 27431429  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27431430 cctc 27431433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37381132 - 37380929
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37381132 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37381033  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  37381032 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaa 37380933  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  37380932 cctc 37380929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 92 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28885655 - 28885459
Alignment:
Q  92 caagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaata 191  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  28885655 caagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaata 28885556  T
Q  192 ggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28885555 ggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctc 28885459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27807158 - 27806955
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27807158 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27807059  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807058 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27806959  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27806958 cctc 27806955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39893524 - 39893321
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39893524 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39893425  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893424 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39893325  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  39893324 cctc 39893321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 257442 - 257645
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  257442 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 257541  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257542 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 257641  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  257642 cctc 257645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 9346775 - 9346978
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9346775 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9346874  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9346875 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9346974  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  9346975 cctc 9346978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 37948651 - 37948854
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37948651 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37948750  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37948751 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 37948850  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  37948851 cctc 37948854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40236963 - 40236760
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||    
T  40236963 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattcca 40236864  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40236863 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 40236764  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  40236763 cctc 40236760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 16826127 - 16826330
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16826127 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16826226  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16826227 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16826326  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16826327 cctc 16826330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16895353 - 16895150
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16895353 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16895254  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16895253 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16895154  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16895153 cctc 16895150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 19413290 - 19413493
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19413290 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19413389  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  19413390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 19413489  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  19413490 cctc 19413493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 21673964 - 21674167
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21673964 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21674063  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  21674064 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21674163  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  21674164 cctc 21674167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32053258 - 32053055
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32053258 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32053159  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  32053158 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 32053059  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  32053058 cctc 32053055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34865139 - 34864936
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34865139 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34865040  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  34865039 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 34864940  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  34864939 cctc 34864936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 37682684 - 37682887
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37682684 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37682783  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37682784 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37682883  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  37682884 cctc 37682887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 37697949 - 37698152
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37697949 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37698048  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37698049 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37698148  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  37698149 cctc 37698152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37928824 - 37928621
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37928824 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37928725  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37928724 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37928625  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  37928624 cctc 37928621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 12713390 - 12713593
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12713390 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12713489  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  12713490 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12713589  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  12713590 cctc 12713593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27395017 - 27394814
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  27395017 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 27394918  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
     |||||||| |||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394917 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27394818  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27394817 cctc 27394814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31879741 - 31879538
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31879741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31879642  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31879641 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31879542  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  31879541 cctc 31879538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16164930 - 16164818
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16164930 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 16164831  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  16164830 taggctgattctt 16164818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27779684 - 27779572
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27779684 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27779585  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  27779584 taggctgattctt 27779572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27819441 - 27819329
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27819441 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27819342  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  27819341 taggctgattctt 27819329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34158288 - 34158182
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggct 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158288 ggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggct 34158189  T
Q  196 gattctt 202  Q
    |||||||    
T  34158188 gattctt 34158182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3785943 - 3785831
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3785943 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 3785844  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  3785843 taggctgattctt 3785831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 31890285 - 31890397
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  31890285 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaa 31890384  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  31890385 taggctgattctt 31890397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 22924942 - 22925054
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22924942 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 22925041  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||| ||||||||    
T  22925042 taggttgattctt 22925054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27119974 - 27119862
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27119974 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27119875  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  27119874 taggctgattctt 27119862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27827915 - 27827841
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaa 159  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27827915 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12384115 - 12383932
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||| ||||    
T  12384115 acatgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtcca 12384016  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
     ||||||   || |  || | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12384015 cacaataccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22949727 - 22949665
Alignment:
Q  206 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949727 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 1424 - 1627
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1424 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 1523  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1524 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 1623  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  1624 cctc 1627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19526 - 19323
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19427  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19426 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19327  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  19326 cctc 19323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30749 - 30546
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30749 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30650  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30649 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30550  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  30549 cctc 30546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7416 - 7299
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7416 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7317  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7316 tacaataggctgattctt 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2158027 - 2157824
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2158027 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 2157928  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157927 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 2157828  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  2157827 cctc 2157824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10845073 - 10844870
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10845073 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 10844974  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10844973 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 10844874  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  10844873 cctc 10844870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 10913554 - 10913757
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  10913554 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 10913653  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913654 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 10913753  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  10913754 cctc 10913757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 26534558 - 26534761
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26534558 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26534657  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26534658 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26534757  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  26534758 cctc 26534761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 10842679 - 10842882
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10842679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 10842778  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10842779 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaa 10842878  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  10842879 cctc 10842882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 16446691 - 16446894
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16446691 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttcca 16446790  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16446791 tacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaa 16446890  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16446891 cctc 16446894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22145648 - 22145445
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22145648 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22145549  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22145548 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 22145449  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22145448 cctc 22145445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26516245 - 26516042
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26516245 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26516146  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516145 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26516046  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  26516045 cctc 26516042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5131449 - 5131246
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5131449 acataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5131350  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5131349 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5131250  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  5131249 cctc 5131246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 2106848 - 2107051
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  2106848 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 2106947  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2106948 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2107047  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  2107048 cctc 2107051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 5144025 - 5144228
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  5144025 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 5144124  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5144125 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaa 5144224  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  5144225 cctc 5144228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 26271771 - 26271974
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  26271771 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 26271870  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271871 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26271970  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  26271971 cctc 26271974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 26316533 - 26316736
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26316533 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26316632  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  26316633 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26316732  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  26316733 cctc 26316736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16044758 - 16044569
Alignment:
Q  99 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 198  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044758 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgat 16044659  T
Q  199 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16044658 tcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctc 16044569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 11421464 - 11421667
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  11421464 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 11421563  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11421564 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaac 11421663  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  11421664 cctc 11421667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 16515115 - 16515318
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  16515115 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattcca 16515214  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16515215 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 16515314  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16515315 cctc 16515318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4202842 - 4202639
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4202842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4202743  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  4202742 tacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 4202643  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4202642 cctc 4202639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3448759 - 3448556
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3448759 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 3448660  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  3448659 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 3448560  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  3448559 cctc 3448556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 4141931 - 4142134
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4141931 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4142030  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4142031 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4142130  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4142131 cctc 4142134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11444340 - 11444137
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11444340 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11444241  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  11444240 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 11444141  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  11444140 cctc 11444137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26438710 - 26438507
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26438710 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26438611  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26438610 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 26438511  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  26438510 cctc 26438507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45390673 - 45390470
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45390673 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 45390574  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  45390573 tacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 45390474  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  45390473 cctc 45390470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 16748202 - 16748405
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16748202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16748301  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  16748302 tacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 16748401  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16748402 cctc 16748405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 31561075 - 31561278
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31561075 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31561174  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31561175 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31561274  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  31561275 cctc 31561278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 26666599 - 26666802
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26666599 acataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26666698  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  26666699 tacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26666798  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  26666799 cctc 26666802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 24589219 - 24589422
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24589219 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24589318  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24589319 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24589418  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  24589419 cctc 24589422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621900
Alignment:
Q  160 aagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcggga 259  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  260 gatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctc 9621900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2776702 - 2776590
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2776702 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 2776603  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  2776602 taggctgattctt 2776590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 26512386 - 26512498
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26512386 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26512485  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  26512486 taggctgattctt 26512498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 26681796 - 26681908
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26681796 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26681895  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  26681896 taggctgattctt 26681908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31127355 - 31127243
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31127355 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 31127256  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  31127255 taggctgattctt 31127243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 31087312 - 31087424
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31087312 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 31087411  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  31087412 taggctgattctt 31087424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 39209829 - 39209941
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39209829 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 39209928  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||| ||||||||    
T  39209929 taggttgattctt 39209941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45734761 - 45734649
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45734761 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 45734662  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    ||||| |||||||    
T  45734661 taggccgattctt 45734649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9469773 - 9469590
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||| ||||    
T  9469773 acatgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtcca 9469674  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
     ||||||   || |  || | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469673 cacaataccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Original strand, 16393119 - 16393302
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||| ||||    
T  16393119 acatgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtcca 16393218  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
     ||||||   || |  || | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393219 cacaatactttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Original strand, 30369631 - 30369814
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||| ||||    
T  30369631 acatgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtcca 30369730  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
     ||||||   || |  || | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369731 cacaataccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 270
Target Start/End: Original strand, 16287193 - 16287249
Alignment:
Q  214 tgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 270  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16287193 tgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 16287249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29553010 - 29552807
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29553010 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29552911  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552910 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29552811  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  29552810 cctc 29552807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16677593 - 16677390
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16677593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16677494  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677493 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 16677394  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16677393 cctc 16677390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 17089186 - 17089389
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089186 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 17089285  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089286 cacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 17089385  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  17089386 cctc 17089389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27022589 - 27022386
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27022589 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27022490  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022489 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27022390  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27022389 cctc 27022386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3699536 - 3699333
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  3699536 acatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3699437  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3699337  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  3699336 cctc 3699333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 13295694 - 13295897
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  13295694 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattcca 13295793  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13295794 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 13295893  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  13295894 cctc 13295897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 15421063 - 15421266
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15421063 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15421162  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15421163 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15421262  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  15421263 cctc 15421266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 22931627 - 22931830
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22931627 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22931726  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931727 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22931826  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22931827 cctc 22931830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 23854072 - 23854275
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  23854072 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 23854171  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854172 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23854271  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  23854272 cctc 23854275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27179909 - 27179706
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  27179909 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27179810  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179809 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27179710  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27179709 cctc 27179706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 27269330 - 27269533
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  27269330 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27269429  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269430 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27269529  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27269530 cctc 27269533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 27287107 - 27287310
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27287107 acataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27287206  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287207 tacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27287306  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27287307 cctc 27287310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24867169 - 24866966
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24867169 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24867070  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24867069 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24866970  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  24866969 cctc 24866966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 96 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16753263 - 16753071
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggct 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16753263 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggct 16753164  T
Q  196 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16753163 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctc 16753071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27060959 - 27060756
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27060959 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 27060860  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27060859 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 27060760  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27060759 cctc 27060756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 27626454 - 27626657
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27626454 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27626553  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27626554 cacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 27626653  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27626654 cctc 27626657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 34461249 - 34461452
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34461249 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34461348  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461349 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34461448  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  34461449 cctc 34461452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29504869 - 29504666
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29504869 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29504770  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29504769 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29504670  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  29504669 cctc 29504666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4761216 - 4761013
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4761216 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4761117  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4761116 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4761017  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4761016 cctc 4761013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 26113155 - 26113358
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26113155 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26113254  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  26113255 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26113354  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  26113355 cctc 26113358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27011184 - 27010981
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27011184 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27011085  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  27011084 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27010985  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27010984 cctc 27010981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28210907 - 28210704
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28210907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28210808  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  28210807 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28210708  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  28210707 cctc 28210704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 96 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26921819 - 26921627
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggct 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  26921819 ggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggct 26921720  T
Q  196 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26921719 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctc 26921627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 4542517 - 4542720
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4542517 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4542616  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4542617 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4542716  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4542717 cctc 4542720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 4720878 - 4721081
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4720878 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4720977  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4720978 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4721077  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4721078 cctc 4721081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27488586 - 27488383
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27488586 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27488487  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  27488486 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27488387  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27488386 cctc 27488383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29576467 - 29576264
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29576467 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29576368  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29576367 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29576268  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  29576267 cctc 29576264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 30554759 - 30554962
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30554759 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30554858  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30554859 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30554958  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  30554959 cctc 30554962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 16940770 - 16940973
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16940770 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16940869  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16940870 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16940969  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16940970 cctc 16940973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4528738 - 4528535
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  4528738 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 4528639  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4528638 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4528539  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4528538 cctc 4528535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4776333 - 4776130
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4776333 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4776234  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4776233 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4776134  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4776133 cctc 4776130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20172000 - 20171797
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20172000 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 20171901  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20171900 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20171801  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  20171800 cctc 20171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 22163991 - 22164194
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22163991 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 22164090  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22164091 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 22164190  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22164191 cctc 22164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26992248 - 26992096
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  26992248 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 26992149  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 237  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26992148 tagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 33373174 - 33373310
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33373174 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33373273  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatc 221  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33373274 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatc 33373310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Original strand, 26775370 - 26775487
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26775370 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 26775469  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26775470 tacaataggctgattctt 26775487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Original strand, 27358853 - 27358970
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27358853 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27358952  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27358953 tacaataggctgattctt 27358970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Original strand, 27449196 - 27449313
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27449196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27449295  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27449296 tacaataggctgattctt 27449313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 14142142 - 14142254
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14142142 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 14142241  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  14142242 taggctgattctt 14142254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26789264 - 26789152
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26789264 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26789165  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  26789164 taggctgattctt 26789152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27197633 - 27197521
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27197633 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27197534  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  27197533 taggctgattctt 27197521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 27251602 - 27251714
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27251602 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27251701  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  27251702 taggctgattctt 27251714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28163944 - 28163827
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28163944 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28163845  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    |||||||||| |||||||    
T  28163844 tacaataggccgattctt 28163827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 13520940 - 13521051
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13520940 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcattcatcgttccatacaa 13521038  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  13521039 taggctgattctt 13521051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 8902451 - 8902563
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  8902451 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 8902550  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    ||||| |||||||    
T  8902551 taggccgattctt 8902563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Original strand, 22455857 - 22455974
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  22455857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22455956  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
     |||||||| ||||||||    
T  22455957 cacaataggttgattctt 22455974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Original strand, 9136096 - 9136279
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||| ||||    
T  9136096 acatgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtcca 9136195  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
     ||||||   || |  || | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136196 cacaataccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 4793478 - 4793681
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4793478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4793577  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793578 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4793677  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4793678 cctc 4793681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6205320 - 6205117
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6205320 acataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6205221  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205220 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6205121  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  6205120 cctc 6205117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 8286313 - 8286516
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8286313 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8286412  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286413 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 8286512  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  8286513 cctc 8286516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 16621333 - 16621536
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621333 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 16621432  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16621433 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 16621532  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16621533 cctc 16621536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4687072 - 4686869
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4687072 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4686973  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4686972 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4686873  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4686872 cctc 4686869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4725048 - 4724845
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4725048 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4724949  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724948 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4724849  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4724848 cctc 4724845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18334047 - 18333844
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18334047 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18333948  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333947 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18333848  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18333847 cctc 18333844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21678120 - 21677917
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21678120 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 21678021  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678020 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21677921  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  21677920 cctc 21677917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 29145599 - 29145802
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29145599 acataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29145698  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145699 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29145798  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  29145799 cctc 29145802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 15737937 - 15738140
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  15737937 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 15738036  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738037 tacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15738136  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  15738137 cctc 15738140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 15889548 - 15889751
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15889548 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15889647  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15889648 tacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15889747  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  15889748 cctc 15889751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18054679 - 18054476
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  18054679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18054580  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054579 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18054480  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18054479 cctc 18054476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 18273895 - 18274098
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18273895 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18273994  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18273995 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18274094  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18274095 cctc 18274098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 18289196 - 18289399
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18289196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18289295  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18289296 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18289395  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18289396 cctc 18289399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 18304497 - 18304700
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18304497 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18304596  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18304597 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18304696  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18304697 cctc 18304700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 29661813 - 29662016
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29661813 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29661912  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29661913 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 29662012  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  29662013 cctc 29662016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32442568 - 32442365
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32442568 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32442469  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32442468 tacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 32442369  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  32442368 cctc 32442365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35884183 - 35883980
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35884183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 35884084  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35884083 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 35883984  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  35883983 cctc 35883980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 5593200 - 5593403
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  5593200 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 5593299  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593300 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 5593399  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  5593400 cctc 5593403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8299388 - 8299185
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  8299388 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 8299289  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8299288 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 8299189  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  8299188 cctc 8299185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19697907 - 19697704
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19697907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 19697808  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  19697807 tacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19697708  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  19697707 cctc 19697704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20069457 - 20069254
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20069457 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20069358  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069357 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20069258  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  20069257 cctc 20069254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10399561 - 10399358
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10399561 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10399462  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10399461 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10399362  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  10399361 cctc 10399358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 22384421 - 22384624
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22384421 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22384520  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22384521 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaa 22384620  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22384621 cctc 22384624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 28112797 - 28113000
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28112797 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 28112896  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28112897 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28112996  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  28112997 cctc 28113000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7076623 - 7076420
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7076623 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7076524  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  7076523 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 7076424  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  7076423 cctc 7076420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5470405 - 5470202
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5470405 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5470306  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5470305 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5470206  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  5470205 cctc 5470202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28024699 - 28024496
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  28024699 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28024600  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024599 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28024500  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  28024499 cctc 28024496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47026870 - 47026667
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  47026870 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 47026771  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  47026770 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 47026671  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  47026670 cctc 47026667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48469344 - 48469142
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  48469344 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 48469245  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469244 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 48469145  T
Q  285 cct 287  Q
    |||    
T  48469144 cct 48469142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 5606157 - 5606360
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5606157 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5606256  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5606257 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5606356  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  5606357 cctc 5606360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 20573686 - 20573889
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  20573686 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattcca 20573785  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573786 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20573885  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  20573886 cctc 20573889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28342594 - 28342391
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28342594 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28342495  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  28342494 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28342395  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  28342394 cctc 28342391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 4343519 - 4343722
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4343519 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4343618  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4343619 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4343718  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4343719 cctc 4343722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4420332 - 4420129
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4420332 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4420233  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4420232 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4420133  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  4420132 cctc 4420129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 6539585 - 6539788
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6539585 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6539684  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6539685 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6539784  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  6539785 cctc 6539788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7999977 - 7999774
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7999977 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7999878  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  7999877 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 7999778  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  7999777 cctc 7999774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8215152 - 8214949
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8215152 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8215053  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
     |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  8215052 cacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 8214953  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  8214952 cctc 8214949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10646490 - 10646287
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10646490 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10646391  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  10646390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10646291  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  10646290 cctc 10646287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 22867691 - 22867894
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22867691 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22867790  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22867791 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22867890  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22867891 cctc 22867894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 22882750 - 22882953
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22882750 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22882849  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22882850 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22882949  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22882950 cctc 22882953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18246158 - 18245955
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18246158 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18246059  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  18246058 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18245959  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18245958 cctc 18245955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24331580 - 24331377
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  24331580 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattcca 24331481  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24331480 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24331381  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  24331380 cctc 24331377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 31961298 - 31961501
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31961298 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31961397  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31961398 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31961497  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  31961498 cctc 31961501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 51785440 - 51785237
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  51785440 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 51785341  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  51785340 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 51785241  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  51785240 cctc 51785237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 116 - 288
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107398
Alignment:
Q  116 gacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttg 215  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  216 aagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 11107398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5017131 - 5016928
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5017131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5017032  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5017031 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5016932  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  5016931 cctc 5016928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 17981792 - 17981995
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17981792 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17981891  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  17981892 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 17981991  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  17981992 cctc 17981995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18228613 - 18228410
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18228613 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18228514  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  18228513 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18228414  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18228413 cctc 18228410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5714490 - 5714373
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5714490 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5714391  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5714390 tacaataggctgattctt 5714373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5725400 - 5725283
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5725400 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5725301  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5725300 tacaataggctgattctt 5725283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Original strand, 5766968 - 5767085
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5766968 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5767067  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5767068 tacaataggctgattctt 5767085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4627202 - 4627085
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4627202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4627103  T
Q  185 tacaataggctgattctt 202  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4627102 tacaataggctgattctt 4627085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32294040 - 32293928
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32294040 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 32293941  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  32293940 taggctgattctt 32293928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 17992779 - 17992891
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17992779 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 17992878  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||| ||||||||    
T  17992879 taggttgattctt 17992891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 31033084 - 31033196
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  31033084 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataa 31033183  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  31033184 taggctgattctt 31033196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15918813 - 15918749
Alignment:
Q  206 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 270  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15918813 gagtagtttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15918749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Original strand, 5950645 - 5950828
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||| ||||    
T  5950645 acatgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcctcggtcca 5950744  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
     ||||||   || |  || | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950745 cacaataccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 270
Target Start/End: Original strand, 15592882 - 15592939
Alignment:
Q  213 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 270  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15592882 ttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15592939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20443406 - 20443349
Alignment:
Q  213 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 270  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20443406 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 20443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41440532 - 41440475
Alignment:
Q  213 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 270  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41440532 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 41440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 20339101 - 20339304
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20339101 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 20339200  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20339201 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 20339300  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  20339301 cctc 20339304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 21894549 - 21894752
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21894549 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21894648  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894649 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21894748  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  21894749 cctc 21894752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20464420 - 20464231
Alignment:
Q  99 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 198  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464420 cttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 20464321  T
Q  199 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20464320 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctc 20464231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 16204834 - 16205037
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16204834 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttcca 16204933  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  16204934 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaa 16205033  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16205034 cctc 16205037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10966123 - 10965920
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10966123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10966024  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10966023 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10965924  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  10965923 cctc 10965920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 41790110 - 41790313
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41790110 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41790209  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  41790210 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 41790309  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  41790310 cctc 41790313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 51641676 - 51641473
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  51641676 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 51641577  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  51641576 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 51641477  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  51641476 cctc 51641473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10948535 - 10948332
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10948535 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10948436  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  10948435 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10948336  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  10948335 cctc 10948332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28588443 - 28588240
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28588443 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28588344  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28588343 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 28588244  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  28588243 cctc 28588240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3644593 - 3644387
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattctt-gatgctatcaaaagctcctt-ggcattcatcgttc 182  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  3644593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattc 3644494  T
Q  183 catacaataggctgattcttc-ctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 281  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644493 catacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 3644394  T
Q  282 aaacctc 288  Q
    |||||||    
T  3644393 aaacctc 3644387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28153189 - 28153077
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28153189 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 28153090  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  28153089 taggctgattctt 28153077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18794159 - 18793956
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18794159 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18794060  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18794059 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaa 18793960  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18793959 cctc 18793956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 27605666 - 27605869
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27605666 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27605765  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605766 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27605865  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  27605866 cctc 27605869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14561079 - 14560876
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  14561079 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 14560980  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14560979 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14560880  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  14560879 cctc 14560876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 19205123 - 19205326
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19205123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19205222  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19205223 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19205322  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  19205323 cctc 19205326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 2134021 - 2134224
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  2134021 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 2134120  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2134121 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2134220  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  2134221 cctc 2134224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19691553 - 19691350
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19691553 acataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19691454  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19691453 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19691354  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  19691353 cctc 19691350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29832781 - 29832578
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29832781 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29832682  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29832681 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29832582  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  29832581 cctc 29832578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9358080 - 9357877
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9358080 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9357981  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  9357980 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 9357881  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  9357880 cctc 9357877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18712939 - 18712736
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  18712939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18712840  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18712839 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 18712740  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  18712739 cctc 18712736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 28358713 - 28358916
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28358713 acataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28358812  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28358813 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28358912  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  28358913 cctc 28358916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 12089484 - 12089687
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12089484 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12089583  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  12089584 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12089683  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  12089684 cctc 12089687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19677902 - 19677699
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19677902 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19677803  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  19677802 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19677703  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  19677702 cctc 19677699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 22077672 - 22077875
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  22077672 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22077771  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
     |||||||| |||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077772 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22077871  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22077872 cctc 22077875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31357983 - 31357780
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31357983 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31357884  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| ||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31357883 tacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31357784  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  31357783 cctc 31357780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 31486632 - 31486835
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31486632 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31486731  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31486732 tacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 31486831  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  31486832 cctc 31486835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33262189 - 33261986
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33262189 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33262090  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  33262089 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33261990  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  33261989 cctc 33261986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15771024 - 15770912
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15771024 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 15770925  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  15770924 taggctgattctt 15770912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44564434 - 44564322
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  44564434 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttctatacaa 44564335  T
Q  190 taggctgattctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  44564334 taggctgattctt 44564322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 202
Target Start/End: Original strand, 21344943 - 21345049
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggct 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  21344943 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccctacaagaggct 21345042  T
Q  196 gattctt 202  Q
     ||||||    
T  21345043 aattctt 21345049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9492 - 9289
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  9492 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 9393  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9392 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 9293  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  9292 cctc 9289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9501 - 9298
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9501 acataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttcca 9402  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9401 tacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaag 9302  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  9301 cctc 9298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16037 - 15834
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16037 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15938  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15937 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15838  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  15837 cctc 15834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 22991 - 23194
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23090  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||    
T  23091 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 23190  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  23191 cctc 23194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11405 - 11202
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11405 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11306  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  11305 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11206  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  11205 cctc 11202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9275
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9379  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  9378 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 9279  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  9278 cctc 9275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13027 - 12824
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13027 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12928  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  12927 tacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 12828  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  12827 cctc 12824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 11728 - 11931
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11728 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11827  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  11828 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11927  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  11928 cctc 11931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 5979 - 6182
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  5979 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 6078  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6079 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6178  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  6179 cctc 6182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23132
Alignment:
Q  237 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctc 23132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 5471 - 5674
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||    
T  5471 acatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttca 5570  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 284  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5571 taccacaggttgatttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaa 5670  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  5671 cctc 5674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 288
Target Start/End: Original strand, 43541 - 43743
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggata-ggtggttccagcaggtaatt-cttgatgctatc--aaaagctccttggcattca--tcgttccatacaa 189  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||    
T  43541 ggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatacaa 43640  T
Q  190 tagg-ctgattcttcctga-gtagcttgaagatcggcccgcaggtt-gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaa-ttcaaacgcccgaggaaac 285  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  43641 taggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaac 43740  T
Q  286 ctc 288  Q
    |||    
T  43741 ctc 43743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1266 - 1176
Alignment:
Q  198 ttcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||    
T  1266 ttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctc 1176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29626 - 29443
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 184  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||  ||||    
T  29626 acatgatcaaaggtcttccttcaactggagggataagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcagtcca 29527  T
Q  185 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
     ||||||   || || || | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29526 cacaataccttgttttttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33713
Alignment:
Q  234 gcggtcatgtgagatat-gaa-tcgggagatgtaattcaaacg-cccgaggaaacctc 288  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctc 33713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 270
Target Start/End: Original strand, 35168 - 35225
Alignment:
Q  213 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 270  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35168 ttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 35225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University