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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1263_low_24 (Length: 251)

Name: NF1263_low_24
Description: NF1263
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1263_low_24
NF1263_low_24
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (1-243)||(23959157-23959399)
chr6 (1-243)||(31150629-31150871)
chr6 (1-243)||(29286469-29286711)
chr6 (1-243)||(29667387-29667639)
chr6 (1-243)||(25140669-25140912)
chr6 (14-243)||(18609797-18610026)
chr6 (23-243)||(1608583-1608803)
chr6 (1-243)||(2259352-2259593)
chr6 (35-243)||(13382942-13383150)
chr6 (49-243)||(7537515-7537709)
chr6 (49-238)||(2051356-2051545)
chr6 (51-243)||(28362281-28362473)
chr6 (24-210)||(34230770-34230956)
chr6 (1-71)||(26702448-26702518)
chr6 (17-102)||(18351348-18351433)
chr6 (23-154)||(20448440-20448571)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (1-243)||(45479385-45479627)
chr2 (1-243)||(41181677-41181919)
chr2 (1-243)||(28342789-28343032)
chr2 (1-242)||(12905786-12906037)
chr2 (35-243)||(3795651-3795859)
chr2 (23-243)||(5351295-5351515)
chr2 (23-243)||(10620263-10620483)
chr2 (23-243)||(41564054-41564274)
chr2 (17-243)||(7267008-7267234)
chr2 (23-243)||(209274-209494)
chr2 (17-243)||(39798004-39798228)
chr2 (17-243)||(24753588-24753814)
chr2 (1-243)||(43943958-43944210)
chr2 (1-243)||(81814-82070)
chr2 (1-243)||(1096836-1097092)
chr2 (49-243)||(9659604-9659800)
chr2 (49-243)||(24601968-24602160)
chr2 (49-243)||(24611954-24612146)
chr2 (49-243)||(439374-439568)
chr2 (1-243)||(41004793-41005045)
chr2 (55-243)||(1150595-1150783)
chr2 (49-243)||(41052950-41053142)
chr2 (17-139)||(38950234-38950356)
chr2 (23-108)||(18000522-18000607)
chr2 (141-243)||(38949750-38949852)
chr2 (58-229)||(25613526-25613697)
chr2 (7-73)||(3207020-3207086)
chr2 (1-47)||(41052888-41052934)
chr2 (1-47)||(439584-439630)
chr2 (1-47)||(24601906-24601952)
chr2 (1-47)||(24612162-24612208)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (7-243)||(22588006-22588242)
chr8 (1-243)||(35962574-35962816)
chr8 (17-243)||(23924248-23924474)
chr8 (7-243)||(7171881-7172127)
chr8 (1-243)||(43679663-43679905)
chr8 (23-243)||(30301424-30301644)
chr8 (23-243)||(32375941-32376161)
chr8 (23-243)||(7344120-7344340)
chr8 (23-243)||(8419694-8419914)
chr8 (24-243)||(39747-39966)
chr8 (49-243)||(43376843-43377037)
chr8 (51-243)||(31959611-31959803)
chr8 (49-243)||(2124509-2124703)
chr8 (14-243)||(22661138-22661367)
chr8 (1-215)||(4867385-4867609)
chr8 (71-243)||(41744160-41744332)
chr8 (1-147)||(39751327-39751473)
chr8 (17-128)||(20548938-20549049)
chr8 (14-162)||(30972519-30972667)
chr8 (141-238)||(39751661-39751758)
chr8 (58-184)||(31281136-31281262)
chr8 (1-47)||(2124447-2124493)
chr8 (1-47)||(43377053-43377099)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (1-243)||(24053420-24053672)
chr5 (1-243)||(24050293-24050547)
chr5 (1-243)||(7796844-7797086)
chr5 (1-243)||(33994713-33994955)
chr5 (17-243)||(13563924-13564150)
chr5 (17-243)||(27863686-27863912)
chr5 (17-243)||(37814865-37815091)
chr5 (17-243)||(28882271-28882497)
chr5 (17-243)||(38855998-38856224)
chr5 (17-243)||(25890277-25890503)
chr5 (23-243)||(14280542-14280762)
chr5 (17-187)||(34079751-34079921)
chr5 (17-243)||(11029292-11029516)
chr5 (49-243)||(34122853-34123047)
chr5 (14-243)||(4196796-4197023)
chr5 (17-167)||(7017794-7017944)
chr5 (1-243)||(30352687-30352939)
chr5 (49-243)||(1039356-1039549)
chr5 (83-242)||(28387821-28387979)
chr5 (1-195)||(25877885-25878091)
chr5 (23-185)||(6267763-6267924)
chr5 (113-243)||(43179429-43179559)
chr5 (14-76)||(43179631-43179693)
chr5 (1-47)||(34122791-34122837)
chr5 (1-42)||(41799534-41799575)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (1-243)||(47742553-47742795)
chr7 (1-242)||(10705514-10705765)
chr7 (1-238)||(34622765-34623002)
chr7 (17-243)||(15069914-15070140)
chr7 (17-243)||(18109357-18109583)
chr7 (17-243)||(604062-604288)
chr7 (17-243)||(42503402-42503628)
chr7 (23-243)||(43619969-43620189)
chr7 (23-243)||(45767424-45767644)
chr7 (23-243)||(30790570-30790790)
chr7 (49-243)||(19044621-19044815)
chr7 (49-243)||(20709821-20710015)
chr7 (1-243)||(47064858-47065114)
chr7 (71-243)||(29592839-29593011)
chr7 (1-240)||(12111482-12111729)
chr7 (1-47)||(19044559-19044605)
chr7 (1-47)||(20710031-20710077)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (1-243)||(38690176-38690417)
chr1 (1-243)||(25039645-25039887)
chr1 (1-243)||(7966250-7966497)
chr1 (1-243)||(37018960-37019202)
chr1 (1-241)||(36072629-36072879)
chr1 (1-243)||(8459224-8459466)
chr1 (1-243)||(9710844-9711086)
chr1 (17-243)||(44469575-44469801)
chr1 (1-243)||(51666230-51666472)
chr1 (17-243)||(29352516-29352742)
chr1 (35-243)||(6558202-6558410)
chr1 (1-243)||(19495306-19495562)
chr1 (17-243)||(30909593-30909819)
chr1 (1-243)||(1655644-1655896)
chr1 (23-243)||(3944264-3944484)
chr1 (17-243)||(5081928-5082154)
chr1 (49-243)||(12643520-12643714)
chr1 (1-243)||(13177690-13177942)
chr1 (17-243)||(13633436-13633662)
chr1 (49-243)||(50113636-50113830)
chr1 (23-243)||(3993406-3993626)
chr1 (23-242)||(20353500-20353719)
chr1 (23-243)||(38771920-38772140)
chr1 (7-243)||(33168176-33168422)
chr1 (23-242)||(5141435-5141654)
chr1 (70-243)||(46978798-46978971)
chr1 (64-242)||(4517959-4518135)
chr1 (17-102)||(15051053-15051138)
chr1 (1-63)||(46979002-46979064)
chr1 (1-63)||(4518160-4518222)
chr1 (14-76)||(1179893-1179955)
chr1 (1-58)||(46886137-46886194)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (1-243)||(18578889-18579141)
chr4 (1-243)||(38460692-38460934)
chr4 (1-243)||(10374306-10374548)
chr4 (17-243)||(3407803-3408029)
chr4 (7-243)||(10422972-10423208)
chr4 (1-243)||(4774168-4774420)
chr4 (1-243)||(24415425-24415679)
chr4 (1-242)||(37394768-37395023)
chr4 (23-243)||(49564131-49564351)
chr4 (35-243)||(19069501-19069709)
chr4 (49-237)||(44050650-44050837)
chr4 (70-243)||(11506658-11506831)
chr4 (7-151)||(50904819-50904963)
chr4 (23-216)||(6186937-6187140)
chr4 (1-139)||(51642273-51642421)
chr4 (64-208)||(30043022-30043166)
chr4 (1-47)||(44050853-44050899)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (17-243)||(4890-5116)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (17-243)||(9426888-9427114)
chr3 (1-240)||(21952066-21952305)
chr3 (17-243)||(13743549-13743775)
chr3 (1-243)||(67140-67392)
chr3 (23-243)||(8156798-8157018)
chr3 (23-243)||(30943480-30943700)
chr3 (49-243)||(46989841-46990035)
chr3 (1-243)||(48246678-48246920)
chr3 (23-243)||(3952778-3952998)
chr3 (49-243)||(14402569-14402763)
chr3 (35-243)||(2743756-2743964)
chr3 (23-243)||(6744890-6745110)
chr3 (17-243)||(2857546-2857772)
chr3 (49-243)||(6489658-6489852)
chr3 (35-243)||(50957243-50957451)
chr3 (49-243)||(4002055-4002249)
chr3 (51-243)||(36813168-36813360)
chr3 (1-113)||(7841362-7841474)
chr3 (1-47)||(46989779-46989825)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (17-243)||(15519-15745)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (49-243)||(22729-22923)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (70-243)||(1315-1488)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (93-243)||(10828-10978)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (17-137)||(8482-8602)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (1-240)||(21904-22144)
[»] scaffold0219 (3 HSPs)
scaffold0219 (49-161)||(19743-19855)
scaffold0219 (159-243)||(19498-19582)
scaffold0219 (1-47)||(19871-19917)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 23959157 - 23959399
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23959157 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctactt 23959256  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||     
T  23959257 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttacaccatattccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtcgtgaata 23959356  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23959357 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 23959399  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31150871 - 31150629
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31150871 atttggttccaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacat 31150772  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||     
T  31150771 acattcaacgcaattgcatatcgatcaaacatacatatataatatattatcttccaccatattctaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 31150672  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31150671 agccaaggcatatagcttgccgttttccaagcgtattcatctc 31150629  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29286469 - 29286711
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  29286469 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacctctactt 29286568  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||     
T  29286569 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 29286668  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||    
T  29286669 agccaaggcatatagtttgccgttttctatgtgtattcgtctc 29286711  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29667639 - 29667387
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca----------catcattaaattaa 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  29667639 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaa 29667540  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  29667539 atccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattaacttccaccatattccgaaacataaatctgacatcgctatc 29667440  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29667439 gtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 29667387  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25140912 - 25140669
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25140912 atttggttcaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaacacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 25140813  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacataca-tatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||   |||    
T  25140812 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacattatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatgcgacgtcgctatcgtcacgaat 25140713  T
Q  200 tagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25140712 aagccaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcgtctc 25140669  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18610026 - 18609797
Alignment:
Q  14 tacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaa 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | |||    
T  18610026 tacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaa 18609927  T
Q  114 ttgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatat 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18609926 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatataattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatat 18609827  T
Q  214 agctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | |||  |||||||||||| |||| |||||    
T  18609826 aacttgtcgttttccatgcatatttatctc 18609797  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 1608583 - 1608803
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  1608583 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 1608682  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  1608683 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 1608782  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1608783 ttttccatgcgtattcatctc 1608803  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 2259352 - 2259593
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  2259352 atttggttcaaaatgcacaaaatgttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaacttattaaattaaatccttactt 2259451  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||     
T  2259452 acattcaacg-tattgcatatggaacaaacatgcatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctttcgtctttaata 2259550  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2259551 agccaatgcatatagcttgtcgttttctatgcgtattcatctc 2259593  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 13382942 - 13383150
Alignment:
Q  35 tcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatac 134  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13382942 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 13383041  T
Q  135 atatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13383042 atatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgacgttttccatgcgt 13383141  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  13383142 attcatctc 13383150  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 7537515 - 7537709
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7537515 agtgtccataattaaacaaatcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaaatgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 7537614  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  7537615 atcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgctgttttccatgcgtattcgtctc 7537709  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Original strand, 2051356 - 2051545
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2051356 agtgttcataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 2051455  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattc 238  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2051456 atcttccaccatatttcgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagccaagacatataacttgccgttttccatgcgtattc 2051545  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28362473 - 28362281
Alignment:
Q  51 tgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattat 150  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  28362473 tgtccatcattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattctacacaattgcatatcgatcgaacatacatatataatatattat 28362374  T
Q  151 cttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  28362373 cttccaccatattctgaaacataaattcgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcttattcatctc 28362281  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 34230770 - 34230956
Alignment:
Q  24 tttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatag 123  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| || || ||||| || |    
T  34230770 tttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacattacacatcgttaaattaaatctctactaacattctacacagttgcagatgg 34230869  T
Q  124 aacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggca 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||    
T  34230870 aacgaacatacatatataatatattatcttctaccatattctaaaacataaatcggacgtcactatcctcttgaataagccaaggca 34230956  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 26702518 - 26702448
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacaca 71  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26702518 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacaca 26702448  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 18351433 - 18351348
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttac 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18351433 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactacttattacacatcattaaattaaatccctacttac 18351348  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20448571 - 20448440
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||  ||||  |||||| || || ||||| ||     
T  20448571 gtttgaaattcataaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacatttcatatcattacataaaatatctatcgacattctacacatttgcaaatg 20448472  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttc 154  Q
     ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20448471 taacaaacacacatatataatatattatcttc 20448440  T

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Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45479627 - 45479385
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45479627 atttggttcaaaatacaaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctactt 45479528  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||     
T  45479527 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgccgatatcgtcgcgaata 45479428  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  45479427 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctc 45479385  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41181677 - 41181919
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41181677 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 41181776  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    ||     
T  41181777 acattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgtata 41181876  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41181877 agccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 41181919  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 28342789 - 28343032
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28342789 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatccctactt 28342888  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctg-aaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  28342889 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaat 28342988  T
Q  200 tagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||    
T  28342989 aagccaaggcatatagcttgccgttttacatgtgtattcgtctc 28343032  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 12905786 - 12906037
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacatt----------acacatcattaaattaa 90  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  12905786 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtcaataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaa 12905885  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12905886 atccgtacttacattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc 12905985  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    |||   ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  12905986 gtcgcgaataagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatct 12906037  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 3795651 - 3795859
Alignment:
Q  35 tcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatac 134  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3795651 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 3795750  T
Q  135 atatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3795751 atatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcacgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 3795850  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  3795851 attcatctc 3795859  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5351515 - 5351295
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  5351515 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 5351416  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  5351415 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 5351316  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5351315 ttttccatgcgtattcatctc 5351295  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 10620263 - 10620483
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  10620263 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 10620362  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  10620363 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 10620462  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10620463 ttttccatgcgtattcatctc 10620483  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41564274 - 41564054
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  41564274 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 41564175  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  41564174 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 41564075  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41564074 ttttccatgcgtattcatctc 41564054  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7267234 - 7267008
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  7267234 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaatta 7267135  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||| |||||||    
T  7267134 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggtatatagc 7267035  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  7267034 ttgtcgttttccatgcgtattcatctc 7267008  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 209274 - 209494
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||     
T  209274 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatg 209373  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  209374 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 209473  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  209474 ttttccatgcgtattcatctc 209494  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39798228 - 39798004
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  39798228 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--ccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaatta 39798131  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  39798130 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 39798031  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  39798030 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 39798004  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24753814 - 24753588
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24753814 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 24753715  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||   |||||   ||| ||| || |||||||||    
T  24753714 catatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatacgatgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaagcatatagc 24753615  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||    
T  24753614 ttgccgttttccatacgtattcatctc 24753588  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 43943958 - 43944210
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacatt----------acacatcattaaattaa 90  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  43943958 atttggttcaaattacaaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccatgcataaacaacacattacaattcattacacatcattaaattaa 43944057  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  43944058 atccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatatattatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatc 43944157  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
     ||   ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43944158 atcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 43944210  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 82070 - 81814
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaa--------------acaacacattacacatcattaaa 86  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||              ||||| |||||||||| |||| |    
T  82070 atttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtgcataattaaacaactcattacacatgattata 81971  T
Q  87 ttaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgt 186  Q
    |||||| | || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  81970 ttaaatgcatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttcaaccatattccgaaacataaatccgacgtcgt 81871  T
Q  187 tatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  81870 tatcgtctttaataagtcaagggatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 81814  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 1096836 - 1097092
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccata--------------attaaacaacacattacacatcattaaa 86  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||              |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1096836 atttggttcaaactacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgttcataattaaacaactcattacatatcattaaa 1096935  T
Q  87 ttaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  1096936 ttaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaattcgacgtcgc 1097035  T
Q  187 tatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||   ||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1097036 tatcgtcgcaaataagcccaagcatataacttgccgttttccatgcgtattcgtctc 1097092  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9659800 - 9659604
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatac--atatacaatata 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  9659800 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatacctacttacattcaacgcaattgcatattgaacgaacatacaaatataaaatata 9659701  T
Q  147 ttatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9659700 ttatcttccaccatattccgaaacataaactcgacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 9659604  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 24601968 - 24602160
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  24601968 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatatt 24602065  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  24602066 atcttccaccatattccgaaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattcgtctc 24602160  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24612146 - 24611954
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  24612146 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatatt 24612049  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  24612048 atcttccaccatattccgaaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattcgtctc 24611954  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 439568 - 439374
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  439568 agtgttcataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctccttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 439469  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  439468 actttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccagggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 439374  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41004793 - 41005045
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacatt----------acacatcattaaattaa 90  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||| |||||    
T  41004793 atttggtttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatattaa 41004892  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  41004893 atcactacttacattcatcacaattgcatatggaatgaacatacatatataatatataatttttcaacatattctgaaacataaatctgacgtcccaatc 41004992  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41004993 gtctttaataagccagggcatgtagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 41005045  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1150783 - 1150595
Alignment:
Q  55 cataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttc 154  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1150783 cataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatcactacttacattcaatgaaattgcatatggaacgaacatacatatataatatagtatcttc 1150684  T
Q  155 caccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||   ||| | ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  1150683 catcatattccaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcacaaataaaccaaggcgtatagtttgccgttttccatgcgtatttatctc 1150595  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 41052950 - 41053142
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata--gaacgaacatacatatacaa-tat 145  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||    
T  41052950 agtgtccataattaaacaattcattacacatcattaaatt-----cctacttacattcaatgcaattgcatatatggaacgaacacacatatataaatat 41053044  T
Q  146 attatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  41053045 attatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttggcgttttcaatgcgtattcgtctc 41053142  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38950356 - 38950234
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  38950356 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaatta 38950257  T
Q  117 catatagaacgaacatacatata 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  38950256 catatggaacgaacatacatata 38950234  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 18000522 - 18000607
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18000522 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaa 18000607  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38949852 - 38949750
Alignment:
Q  141 aatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38949852 aatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgccgttttccatgcgtattcat 38949753  T
Q  241 ctc 243  Q
    |||    
T  38949752 ctc 38949750  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 229
Target Start/End: Original strand, 25613526 - 25613697
Alignment:
Q  58 aattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccac 157  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||  |||| || ||||||||| | | ||| |||||||||||||  |     
T  25613526 aattaatcaacacattacatatcattacataaaatctctattgacattctatgcacatgcagatggaacgaacacaaagatataatatattatctttaat 25613625  T
Q  158 catattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttcca 229  Q
     ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||   ||| || ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  25613626 tatattcataaacataaatcctacgtcgctatcgtcacgaataagtcaaggcacatagctcgccgttttcca 25613697  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 3207020 - 3207086
Alignment:
Q  7 ttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacatt 73  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  3207020 ttcaaagtatacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttgcatggtgtccataattaaaaatcacatt 3207086  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 41052888 - 41052934
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41052888 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 41052934  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 439630 - 439584
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  439630 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaagcgttaca 439584  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 24601906 - 24601952
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24601906 atttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 24601952  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 24612208 - 24612162
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24612208 atttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 24612162  T

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Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22588242 - 22588006
Alignment:
Q  7 ttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattc 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22588242 ttcaaattacacaaacgtttgaaattgatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 22588143  T
Q  107 aacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22588142 aacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagccaa 22588043  T
Q  207 ggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22588042 gacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 22588006  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 35962574 - 35962816
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  35962574 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtgcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaattcctactt 35962673  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||     
T  35962674 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 35962773  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35962774 agccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 35962816  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 23924248 - 23924474
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23924248 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactg 23924347  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  23924348 catatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 23924447  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  23924448 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 23924474  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7172127 - 7171881
Alignment:
Q  7 ttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca----------catcattaaattaaatccct 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||    
T  7172127 ttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatgaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcagtacacatcattaaattaaatctct 7172028  T
Q  97 atttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttc 196  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||       
T  7172027 acttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcg 7171928  T
Q  197 aattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7171927 aataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcatctc 7171881  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 43679663 - 43679905
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  43679663 atttggttcaaattacacaaaagtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattatattaaatccctgctt 43679762  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||     
T  43679763 acattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtctctatcgtctttaata 43679862  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  43679863 agtcaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtgttcatctc 43679905  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 30301424 - 30301644
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  30301424 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 30301523  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  30301524 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 30301623  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30301624 ttttccatgcgtattcatctc 30301644  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 32375941 - 32376161
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  32375941 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 32376040  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  32376041 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 32376140  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  32376141 tttcccatgcgtattcatctc 32376161  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7344340 - 7344120
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  7344340 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 7344241  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  7344240 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 7344141  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7344140 ttttccatgcgtattcatctc 7344120  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 8419694 - 8419914
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  8419694 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 8419793  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  8419794 gaacgaacgtacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 8419893  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8419894 ttttccatgcgtattcatctc 8419914  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 243
Target Start/End: Original strand, 39747 - 39966
Alignment:
Q  24 tttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatag 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  39747 tttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgg 39846  T
Q  124 aacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||    ||| ||| ||| ||||||||||  |||    
T  39847 aacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacatcgccgtcgttgcgaataagcaaagacatatagcttgtcgt 39946  T
Q  224 tttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39947 tttccatgcgtattcatctc 39966  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43377037 - 43376843
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43377037 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 43376938  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||   ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43376937 atcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcactatcgtcgcgaataaaccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 43376843  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31959803 - 31959611
Alignment:
Q  51 tgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattat 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31959803 tgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattat 31959704  T
Q  151 cttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31959703 tttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 31959611  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 2124509 - 2124703
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2124509 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaaatacatatataatatatt 2124608  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2124609 atcttccaccatattccgaaacataaatccaaagtcgctattgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 2124703  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22661367 - 22661138
Alignment:
Q  14 tacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaa 113  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||  ||||     
T  22661367 tacacgaatgtttgagattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacattacatatcgttaaattaaatctctactgacattctgcgcag 22661268  T
Q  114 ttgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatat 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  22661267 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattccgaaacatagacccgacgtcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatat 22661168  T
Q  214 agctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22661167 ggcttgccgttttccatgcatattcatctc 22661138  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4867609 - 4867385
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacac----------atcattaaattaa 90  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||           |||||||||||||    
T  4867609 atttgatttaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattacatagtctccataattaaacaacagattacaactcattacttatcattaaattaa 4867510  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4867509 atccctacttacattcaacgcaattggatatggaacgaacatacgtatataatatattattttccaccataatccgaaacataaatccgacgtcgttatc 4867410  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatag 215  Q
     |||  ||| |||||| ||| ||||    
T  4867409 atctcgaataagccaatgcacatag 4867385  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 41744160 - 41744332
Alignment:
Q  71 attacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaac 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41744160 attacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggagcgaatatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaat 41744259  T
Q  171 ataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  41744260 ataaatccgacgtcgctatcgtcatgaataagccaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtattcatctc 41744332  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 39751327 - 39751473
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39751327 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 39751426  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39751427 acattcaacgtaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 39751473  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20549049 - 20548938
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20549049 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttacttacattcaacgcaattg 20548950  T
Q  117 catatagaacga 128  Q
    ||||| ||||||    
T  20548949 catatggaacga 20548938  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30972667 - 30972519
Alignment:
Q  14 tacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaa 113  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||  |||||| |||||     
T  30972667 tacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattacagagtatacataattaaacaacacattacacatcattacataaaatatctatcgacattctacgcat 30972568  T
Q  114 ttgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatat 162  Q
     |||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30972567 gtgcaaatggaacaaacacacatatataatatattatcttcaaccatat 30972519  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 238
Target Start/End: Original strand, 39751661 - 39751758
Alignment:
Q  141 aatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattc 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39751661 aatatattatcttctaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagtttgccgttttccatgcgtattc 39751758  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Original strand, 31281136 - 31281262
Alignment:
Q  58 aattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccac 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||   |||  |||||| |||||  |||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  31281136 aattaaacaacacattacatatcattacataagatatttatcaacattctacgcacgtgcagatggaacgaacataaagatataatatattatcttcaac 31281235  T
Q  158 catattctgaaacataaatccgacgtc 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31281236 catattctgaaacataaatcctacgtc 31281262  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 2124447 - 2124493
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2124447 atttggttcaaattacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttaca 2124493  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 43377099 - 43377053
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43377099 atttggttcaagttacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 43377053  T

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Target: chr5 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24053420 - 24053672
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcattaaattaa 90  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||     
T  24053420 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaattat 24053519  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24053520 atccctaattacattcaacgcaattgcatatagaaagaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatc 24053619  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24053620 gtcttcaattcgccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 24053672  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24050293 - 24050547
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca----------catcattaaattaa 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||     
T  24050293 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtatccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattat 24050392  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatat--attatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgtta 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24050393 atccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgcta 24050492  T
Q  189 tcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24050493 tcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 24050547  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 7796844 - 7797086
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7796844 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 7796943  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||     
T  7796944 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 7797043  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7797044 agccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 7797086  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33994955 - 33994713
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33994955 atttggttcaaaatacaaaaaagtttgaaattcttcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctactt 33994856  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||   |||     
T  33994855 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattaagaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 33994756  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  33994755 agccaaggcatatagtttgccgttgtccatgcgtattcatctc 33994713  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 13563924 - 13564150
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13563924 acaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 13564023  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  13564024 catatggatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagc 13564123  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13564124 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 13564150  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 27863686 - 27863912
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27863686 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 27863785  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  27863786 caaatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 27863885  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  27863886 ttgccgtttttcatgcgtattcatctc 27863912  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 37814865 - 37815091
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  37814865 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttactttcaacgcaatta 37814964  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| | ||| ||| ||||||||||||    
T  37814965 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgtgaataagcaaaggcatatagc 37815064  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  37815065 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 37815091  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 28882271 - 28882497
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28882271 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccccacttacattcaacgcaattg 28882370  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| || |||||||||    
T  28882371 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaatgcatatagc 28882470  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  28882471 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 28882497  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 38855998 - 38856224
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  38855998 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattcaatccctacttacattcaacgcaatta 38856097  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  38856098 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 38856197  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  38856198 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 38856224  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 25890277 - 25890503
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25890277 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 25890376  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||| ||    
T  25890377 catatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgacgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatcgc 25890476  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || | |||||||| |||||||||||||    
T  25890477 ttgctgttttccacgcgtattcatctc 25890503  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14280762 - 14280542
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  14280762 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 14280663  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  14280662 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 14280563  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14280562 ttttccatgcgtattcatctc 14280542  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34079921 - 34079751
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34079921 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttacttacattcaacgcaattg 34079822  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgtt 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34079821 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgccgtcgtt 34079751  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 11029292 - 11029516
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  11029292 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--ccataattaaactactcatcacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatta 11029389  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  11029390 catatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 11029489  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  11029490 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 11029516  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 34122853 - 34123047
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34122853 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcatacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatatatatataatatatt 34122952  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34122953 atcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttaccgttttccatgcgtattcatctc 34123047  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 4196796 - 4197023
Alignment:
Q  14 tacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaa 113  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| | |||    
T  4196796 tacacaaacgtttggtattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacatatgattatattaaatccctacttacattcatcacaa 4196895  T
Q  114 ttgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatat 213  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  4196896 ttgcatatggaacga--atacatatataatatattattttcgaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatgt 4196993  T
Q  214 agctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  4196994 agcttgtcgttttccatgcatattcatctc 4197023  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Original strand, 7017794 - 7017944
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7017794 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 7017893  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctga 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7017894 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctga 7017944  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 30352687 - 30352939
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcatta----------aattaa 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||          ||||||    
T  30352687 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacagcacattacaactcattacatatcaataaattaa 30352786  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    |||  || |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  30352787 atctttacttacattcaatgcaattgcatatggaaaaaacatacatatataatatattattttccacaatattccgaaacataaatacgacgtcgctatc 30352886  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  30352887 gtctttaacaagccaaggcatataacttgccgtttttcatgcatattcatctc 30352939  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1039549 - 1039356
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  1039549 agtgtcaataatttaacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggtacgaacatacatatataacatatt 1039450  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1039449 attttccaccatattc-caaacataaatccgatgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 1039356  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28387979 - 28387821
Alignment:
Q  83 taaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacg 182  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28387979 taaattaaatccctacttacaatcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacg 28387880  T
Q  183 tcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    ||| ||||||| | || || | |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28387879 tcgctatcgtcgtgaa-taacaaaggcatataacttgtcgttttccatgtgtattcatct 28387821  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 25877885 - 25878091
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaa--------------acaacacattacacatcattaaa 86  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||              ||||| |||||||| | |||| |    
T  25877885 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacgtgattata 25877984  T
Q  87 ttaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgt 186  Q
    ||||||||||| |||||  || | ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25877985 ttaaatccctacttaca--catcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 25878082  T
Q  187 tatcgtctt 195  Q
    |||||||||    
T  25878083 tatcgtctt 25878091  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Original strand, 6267763 - 6267924
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||| ||     
T  6267763 gtttgaaattcatcataacattaaagagtgtccataattaaacaacacattacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgcagttgcagatg 6267862  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcg 185  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  6267863 gaacaaaaatacatatataatatattatcttccatcatattccg-aacataaattcgacgtcg 6267924  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43179559 - 43179429
Alignment:
Q  113 attgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcata 212  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||   ||| ||||||||||||    
T  43179559 attgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcaaacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcata 43179460  T
Q  213 tagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  43179459 tagcttaccgttttccatgcgtgttcatctc 43179429  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 43179693 - 43179631
Alignment:
Q  14 tacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca 76  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43179693 tacacgaatgtttgaaattcatcaaaacgttaaagagtgtccataattaaacaacacattaca 43179631  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 34122791 - 34122837
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34122791 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaaggttaca 34122837  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 41799575 - 41799534
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 42  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41799575 atttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 41799534  T

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Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47742795 - 47742553
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47742795 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 47742696  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||   |||     
T  47742695 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaata 47742596  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47742595 agccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 47742553  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 10705514 - 10705765
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacatt----------acacatcattaaattaa 90  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||          |||||||| ||||||||    
T  10705514 atttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaatacattacaactcattacacatcaataaattaa 10705613  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10705614 atctctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatc 10705713  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10705714 gtcttcaattagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatct 10705765  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 34622765 - 34623002
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||    
T  34622765 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacttctactt 34622864  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||     
T  34622865 acattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 34622964  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattc 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34622965 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 34623002  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15070140 - 15069914
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15070140 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 15070041  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  15070040 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 15069941  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  15069940 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 15069914  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18109583 - 18109357
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18109583 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 18109484  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  18109483 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 18109384  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  18109383 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 18109357  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 604062 - 604288
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  604062 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatta 604161  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  604162 catatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 604261  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  604262 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 604288  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42503628 - 42503402
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42503628 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattg 42503529  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||| ||||    
T  42503528 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatgtagc 42503429  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  42503428 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 42503402  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 43619969 - 43620189
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  43619969 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 43620068  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  43620069 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 43620168  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43620169 ttttccatgcgtattcatctc 43620189  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45767644 - 45767424
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  45767644 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 45767545  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  45767544 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 45767445  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45767444 ttttccatgcgtattcatctc 45767424  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30790790 - 30790570
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  30790790 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 30790691  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| | |    
T  30790690 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgctg 30790591  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30790590 ttttccatgcgtattcatctc 30790570  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 19044621 - 19044815
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19044621 agtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 19044720  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  19044721 atcttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttctc 19044815  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20710015 - 20709821
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20710015 agtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 20709916  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  20709915 atcttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttctc 20709821  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47065114 - 47064858
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagt--------------gtccataattaaacaacacattacacatcattaaa 86  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||              ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  47065114 atttgatttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtatccataattaaatgtccataattaaacaactcattacacatgattata 47065015  T
Q  87 ttaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||     
T  47065014 ttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaatttgacgtcgc 47064915  T
Q  187 tatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||| |||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47064914 tatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 47064858  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 29592839 - 29593011
Alignment:
Q  71 attacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaac 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29592839 attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatgtattatcttccaccatattccgaaac 29592938  T
Q  171 ataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||| ||||||| ||||||    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29592939 ataaatctgacgtcgctatcgttgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcgtattcatctc 29593011  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12111482 - 12111729
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacac----------atcattaaattaa 90  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||    
T  12111482 atttggttcaaattacaccaaagtttaaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacaatacattacaactcattacatatcattaaattaa 12111581  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  12111582 atccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatata--atattattttccaccatattccgaaatataaatccgacgtcgctatc 12111679  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcat 240  Q
     |||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12111680 atctttaataaaccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattcat 12111729  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 19044559 - 19044605
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19044559 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattaca 19044605  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 20710077 - 20710031
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20710077 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattaca 20710031  T

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Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 38690176 - 38690417
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  38690176 atttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacacatcattatattaaatcc-tactt 38690274  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  38690275 acattcatcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaata 38690374  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38690375 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 38690417  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25039887 - 25039645
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25039887 atttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctactt 25039788  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||     
T  25039787 acattcaacgcaattgtatatggaacgaacatacacatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgttatcgacgcgaata 25039688  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25039687 agccaaggcgtatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 25039645  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 7966250 - 7966497
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattac------acatcattaaattaaatcc 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||    
T  7966250 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacatttacacatcattaaattaaatcc 7966349  T
Q  95 ctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtct 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||     
T  7966350 ctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatgtaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcg 7966449  T
Q  195 tcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
      ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7966450 cgaataag-caaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 7966497  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37019202 - 37018960
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37019202 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatctctactt 37019103  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||   |||     
T  37019102 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcctatgtcgctatcgtcgcgaata 37019003  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37019002 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 37018960  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 36072629 - 36072879
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcattaaattaa 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||||    
T  36072629 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattagatagtgtccatgattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaattaa 36072728  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  36072729 atctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc 36072828  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatc 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  36072829 atcttcaattagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatc 36072879  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 8459224 - 8459466
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8459224 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattaaattaaatccctactt 8459323  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||     
T  8459324 acattcaacgcaattacatatagaacgaacatacatgtataatatattatcttctaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 8459423  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8459424 agccaagacatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 8459466  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 9710844 - 9711086
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9710844 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 9710943  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   |||     
T  9710944 acattcaacgcaattgcatatggaaagaacatacatatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaata 9711043  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9711044 agcaaaggcatatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctc 9711086  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44469801 - 44469575
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44469801 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 44469702  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  44469701 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 44469602  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  44469601 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 44469575  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51666472 - 51666230
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  51666472 atttggttcaaattacataaaagtttgaaattcatcaaaaagttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattatattaaatccctactt 51666373  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||     
T  51666372 acattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtctttaata 51666273  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  51666272 agccaaggcatatagcttgtcgtgttccatgtgtattcatctc 51666230  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 29352516 - 29352742
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  29352516 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaatta 29352615  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  29352616 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 29352715  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  29352716 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 29352742  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 6558202 - 6558410
Alignment:
Q  35 tcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatac 134  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6558202 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 6558301  T
Q  135 atatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6558302 atatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 6558401  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  6558402 attcatctc 6558410  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19495306 - 19495562
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaac---gttacatagtgtccataattaaacaacacatt----------acacatcattaaat 87  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  19495306 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaacgcgtgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaagtcattacacatcattaaat 19495405  T
Q  88 taaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgtt 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  19495406 taaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaacgtcgct 19495505  T
Q  188 atcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg-ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  19495506 atcgtctcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttttcatacgtattcatctc 19495562  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30909819 - 30909593
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30909819 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 30909720  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  30909719 catatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 30909620  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  30909619 ttgctgttttccatgcgtattcatctc 30909593  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1655896 - 1655644
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca----------catcattaaattaa 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  1655896 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaatcgttacatagtatccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaa 1655797  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1655796 atcattacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc 1655697  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||   ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1655696 gtcgcgaataagccaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 1655644  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 3944264 - 3944484
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  3944264 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 3944363  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  3944364 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 3944463  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3944464 ttttccatgcgtattcatctc 3944484  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5082154 - 5081928
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5082154 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactccttacacatcattaaattaaatccatatttacattcaacgcaattg 5082055  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||| |    
T  5082054 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatacc 5081955  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  5081954 ttgtcgttttccatgcgtattcatctc 5081928  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 12643520 - 12643714
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12643520 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 12643619  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12643620 attttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 12643714  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13177942 - 13177690
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca----------catcattaaattaa 90  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          ||| ||||||||||    
T  13177942 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccatagttaaacaacacattacaactcattacacattattaaattaa 13177843  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13177842 atccctacttactttcaatgcaattgcatatggaatgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc 13177743  T
Q  191 gtcttcaatt-agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || | | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13177742 gt-tgcgattaagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 13177690  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13633662 - 13633436
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13633662 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcaataaattaaatccctacttacattcaacgcaatta 13633563  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||   ||| ||| ||||||||||||    
T  13633562 catatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcatcgcgaataagcaaaggcatatagc 13633463  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13633462 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 13633436  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 50113636 - 50113830
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50113636 agtgtccataattaaacaactcattacacattattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 50113735  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50113736 atcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 50113830  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3993626 - 3993406
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  3993626 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 3993527  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  3993526 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 3993427  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3993426 ttttccatgcgtattcatctc 3993406  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20353719 - 20353500
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  20353719 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattatacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 20353620  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  20353619 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 20353520  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatct 242  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20353519 ttttccatgcgtattcatct 20353500  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 38771920 - 38772140
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  38771920 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 38772019  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||    || ||| |||||||||||||| |||    
T  38772020 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcaccgtcgtcgcggataagcaaaggcatatagcttgccg 38772119  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38772120 ttttccatgcgtattcatctc 38772140  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 33168176 - 33168422
Alignment:
Q  7 ttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacac----------atcattaaattaaatccct 96  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||    
T  33168176 ttcaaagtacacgaaagtttgaaaatcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaaattaaatccct 33168275  T
Q  97 atttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttc 196  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||      
T  33168276 acttacactcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctaa 33168375  T
Q  197 aattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  33168376 aataagtcaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatctc 33168422  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5141654 - 5141435
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||     
T  5141654 gtttgaaattcattaaaacgttaaatagtgtcaataattaaacaacacattatatatcgttaaattaaatctctactgacattctacgcaattgcatatg 5141555  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||   ||| |||||| ||||||||||| |||    
T  5141554 gaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacatacatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaacgcatatagcttgccg 5141455  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatct 242  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5141454 ttttccatgcgtattcatct 5141435  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 46978971 - 46978798
Alignment:
Q  70 cattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaa 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  46978971 cattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcattaggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcgaaa 46978872  T
Q  170 cataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  46978871 cataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctc 46978798  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4518135 - 4517959
Alignment:
Q  64 acaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatatt 163  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  4518135 acaactcattacacatcattatat--aatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatatt 4518038  T
Q  164 ctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    | |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4518037 ccgaaacataaatccgacgttgctatagtctttaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcatct 4517959  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15051138 - 15051053
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttac 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15051138 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttac 15051053  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 46979064 - 46979002
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaa 63  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46979064 atttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 46979002  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4518222 - 4518160
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaa 63  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  4518222 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcagaacgttacaaaatgtccataattaa 4518160  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 1179893 - 1179955
Alignment:
Q  14 tacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca 76  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1179893 tacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccacaattaaacaacacattaca 1179955  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 46886194 - 46886137
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccata 58  Q
    ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  46886194 atttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatcgaaacattacaaagtgtccata 46886137  T

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Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18578889 - 18579141
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacatt----------acacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  18578889 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaa 18578988  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  18578989 atcacttcttacattcaacgcaattgcatatagaactaacatacatatataatatattatcttctaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatc 18579088  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18579089 gtcttcaattagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 18579141  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 38460692 - 38460934
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  38460692 atttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctactt 38460791  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||     
T  38460792 acattcatcacaattgcatatgcaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctttaata 38460891  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38460892 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgcattcatctc 38460934  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 10374306 - 10374548
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10374306 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaggtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 10374405  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| |||||||   |||     
T  10374406 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgatgtcgctatcgtcgcgaata 10374505  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10374506 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 10374548  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3408029 - 3407803
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3408029 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 3407930  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  3407929 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 3407830  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || |||||||||||| |||||||||||    
T  3407829 ttgccgttttccatgtgtattcatctc 3407803  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10423208 - 10422972
Alignment:
Q  7 ttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattc 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10423208 ttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccataattaaacaactcattacatatcattagattaaatccctacttacattc 10423109  T
Q  107 aacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaa 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |   ||| ||||||    
T  10423108 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcaatcgccgcgaataagccaa 10423009  T
Q  207 ggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  10423008 gacatatagcttgtcgttttccatgtgtattcgtctc 10422972  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4774420 - 4774168
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca----------catcattaaattaa 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  4774420 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaa 4774321  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4774320 atccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc 4774221  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||   ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4774220 gtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 4774168  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24415425 - 24415679
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacac----------atcattaaattaa 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||    
T  24415425 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaaattaa 24415524  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  24415525 atccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccatcatattccgaaacataaatgcaacgtcgctatc 24415624  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggc--atatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  24415625 gtcttcaataagtcaaggcatatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctc 24415679  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37395023 - 37394768
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaa--------------acaacacattacacatcattaaa 86  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||              ||||| |||||||||||||||||    
T  37395023 atttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaa 37394924  T
Q  87 ttaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  37394923 ttaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgc 37394824  T
Q  187 tatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    |||||||   ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37394823 tatcgtcgcgaataagccaaggcatacaacttgccgttttccatgcgtattcatct 37394768  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 49564131 - 49564351
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  49564131 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 49564230  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  49564231 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 49564330  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49564331 ttttccatgcgtattcatctc 49564351  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 19069501 - 19069709
Alignment:
Q  35 tcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatac 134  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19069501 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 19069600  T
Q  135 atatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgt 234  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19069601 atgtataatatattatcttccaccatattccgaaacataaacccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 19069700  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  19069701 attcatctc 19069709  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44050837 - 44050650
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44050837 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttgcattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 44050738  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtatt 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  44050737 atcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa-acatatagcttgttgttttccatgcgtatt 44050650  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11506831 - 11506658
Alignment:
Q  70 cattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaa 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||    
T  11506831 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa 11506732  T
Q  170 cataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11506731 cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 11506658  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 50904963 - 50904819
Alignment:
Q  7 ttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattc 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50904963 ttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgatacaaagtgttcataattaaacaattcatttcacatcattaaattaaatccctacttacattc 50904864  T
Q  107 aacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatc 151  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  50904863 aacacaattgcatatggaacaaacatacaaatataatatattatc 50904819  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 6186937 - 6187140
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacac----------atcattaaattaaatccctatttacattcaacgca 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  6186937 gtttgaaattcatcaaaacattaaagggtgtccataattaaacaacacattacaacatattacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgca 6187036  T
Q  113 attgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcata 212  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||| ||||||| | ||| ||||||| || |    
T  6187037 tttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattgctaaacataaatccaatgtcgctatcgtcgtgaataagccaagacaca 6187136  T
Q  213 tagc 216  Q
    ||||    
T  6187137 tagc 6187140  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 51642273 - 51642421
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcattaaattaa 90  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||          ||||||| |||||||| ||||    
T  51642273 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaattgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaagttaa 51642372  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatata 139  Q
    ||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51642373 atcccaacttacattcatcacaattacatatagaacgaacatacatata 51642421  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30043166 - 30043022
Alignment:
Q  64 acaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatatt 163  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  | |||||| | | | ||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30043166 acaacacattacatatcgttaaatgaaatctctggtgacattctatgaagttgcaaatggaacgaaaatacaaatataatatattatcttccaccatatt 30043067  T
Q  164 ctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||    
T  30043066 ctgaaacataaatccgacgtcattatcgccctgaataagccaagg 30043022  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 44050899 - 44050853
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44050899 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 44050853  T

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Target: scaffold0494 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5116 - 4890
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5116 acaaacgtttgaaattcatgaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 5017  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  5016 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 4917  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  4916 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 4890  T

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Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 9426888 - 9427114
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9426888 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatta 9426987  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||     
T  9426988 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagt 9427087  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  9427088 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 9427114  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 21952066 - 21952305
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21952066 atttgattaaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccatgattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctagtt 21952165  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||   |||     
T  21952166 acattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatatcatcttccaccatattccgaaacctaaatccgacgtcgctatcatcgcgaata 21952265  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcat 240  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21952266 agccaaggcacatagcttgccgttttccatgcgtattcat 21952305  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 13743549 - 13743775
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  13743549 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaatta 13743648  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  13743649 catatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 13743748  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13743749 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 13743775  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 67140 - 67392
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacatt----------acacatcattaaattaa 90  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||    
T  67140 atttggttcaaactacacaaaagtttgaaattcatcaaaacggtacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaatgaa 67239  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  67240 atccctacttacattcaacgcaatcacatatggaacgaacatacatatataatgtattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatt 67339  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  67340 gtctttaataagccaagacatatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctc 67392  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 8156798 - 8157018
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  8156798 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 8156897  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  8156898 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 8156997  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8156998 ttttccatgcgtattcatctc 8157018  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 30943480 - 30943700
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  30943480 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 30943579  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  30943580 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 30943679  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30943680 ttttccatgcgtattcatctc 30943700  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 46989841 - 46990035
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46989841 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatgtggaacgaacatacatatataatatatt 46989940  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46989941 atcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgtcatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 46990035  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 48246678 - 48246920
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48246678 atttggttaaaattacacaaacttttgaaattcatcaaaaaattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 48246777  T
Q  101 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaatt 200  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||   |||     
T  48246778 acattcaacgcagttgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaata 48246877  T
Q  201 agccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48246878 agccaaagcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 48246920  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3952998 - 3952778
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  3952998 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 3952899  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  3952898 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 3952799  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3952798 ttttccatgcgtattcatctc 3952778  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14402763 - 14402569
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14402763 agtgtccataattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 14402664  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14402663 attttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 14402569  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 2743756 - 2743964
Alignment:
Q  35 tcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatac 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2743756 tcaaaacattacaaagtgttcataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 2743855  T
Q  135 atatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgt 234  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2743856 gtatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 2743955  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  2743956 attcatctc 2743964  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6745110 - 6744890
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  6745110 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatg 6745011  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||   ||| ||| ||| |||||||||| |||    
T  6745010 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccg 6744911  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6744910 ttttccatgcgtattcatctc 6744890  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2857772 - 2857546
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2857772 acaaacgtttgaaattcatcttaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatta 2857673  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  2857672 catatggaatgaacatacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 2857573  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  2857572 ttgccgttttccatgcgtattcatctc 2857546  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 6489658 - 6489852
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6489658 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 6489757  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6489758 atcttccaccatattccgaaatataaatccgacgacgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 6489852  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50957451 - 50957243
Alignment:
Q  35 tcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatac 134  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50957451 tcaaaacattccaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 50957352  T
Q  135 atatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||   ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  50957351 atatataatatattatcttccaccatattccgaaacaaaaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgt 50957252  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  50957251 attcatctc 50957243  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4002249 - 4002055
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4002249 agtgtccataattaaataactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 4002150  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4002149 attttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 4002055  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Original strand, 36813168 - 36813360
Alignment:
Q  51 tgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattat 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36813168 tgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattat 36813267  T
Q  151 cttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  36813268 attccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccacacgtattcatctc 36813360  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 7841362 - 7841474
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctattt 100  Q
    ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  7841362 atttggttaaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctactt 7841461  T
Q  101 acattcaacgcaa 113  Q
    |||||||||||||    
T  7841462 acattcaacgcaa 7841474  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 46989779 - 46989825
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  46989779 atttggttcaaattacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttaca 46989825  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15745 - 15519
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15745 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 15646  T
Q  117 catatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  15645 catatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtccccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 15546  T
Q  217 tttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||    
T  15545 ttgccgttttccatacgtattcatctc 15519  T

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Target: scaffold0201 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 22729 - 22923
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |    
T  22729 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatataat 22828  T
Q  149 atcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22829 attttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 22923  T

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Target: scaffold0794 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1315
Alignment:
Q  70 cattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaa 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||    
T  1488 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa 1389  T
Q  170 cataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1388 cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 1315  T

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Target: scaffold0169 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10978 - 10828
Alignment:
Q  93 ccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgt 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10978 ccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgt 10879  T
Q  193 cttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |   ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10878 cacgaataagccaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattcatctc 10828  T

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Target: scaffold0513 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 137
Target Start/End: Original strand, 8482 - 8602
Alignment:
Q  17 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8482 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 8581  T
Q  117 catatagaacgaacatacata 137  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  8582 catatggaacgaacatacata 8602  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 21904 - 22144
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcattaaattaa 90  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||    
T  21904 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatattaa 22003  T
Q  91 atccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgttatc 190  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||          | |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||     
T  22004 atccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatata---------tttttccaccatattccaaaacataaattcgacgtcgctatt 22094  T
Q  191 gtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcat 240  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  22095 gtctttaataagccaagacatataacttgtcattttccatgcgtattcat 22144  T

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Target: scaffold0219 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19855 - 19743
Alignment:
Q  49 agtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctatttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  19855 agtgttcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgagcatacatatataatatatt 19756  T
Q  149 atcttccaccata 161  Q
    |||||||||||||    
T  19755 atcttccaccata 19743  T

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Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19582 - 19498
Alignment:
Q  159 atattctgaaacataaatccgacgtcgttatcgtcttcaattagccaaggcatatagctttccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||   ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19582 atattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 19498  T

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Target: scaffold0219; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 19917 - 19871
Alignment:
Q  1 atttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 47  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19917 atttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttaca 19871  T

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