View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12651_low_6 (Length: 460)

Name: NF12651_low_6
Description: NF12651
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12651_low_6
NF12651_low_6
[»] chr6 (90 HSPs)
chr6 (28-419)||(27290315-27290706)
chr6 (28-444)||(26787776-26788195)
chr6 (28-442)||(14143230-14143647)
chr6 (28-442)||(27196151-27196568)
chr6 (28-442)||(27252672-27253089)
chr6 (36-298)||(22456887-22457149)
chr6 (63-299)||(33374236-33374472)
chr6 (72-299)||(8892299-8892526)
chr6 (72-299)||(8903534-8903761)
chr6 (28-299)||(13522018-13522289)
chr6 (63-298)||(22477253-22477488)
chr6 (63-299)||(28162637-28162873)
chr6 (28-299)||(22934825-22935096)
chr6 (28-299)||(23857270-23857541)
chr6 (63-299)||(20160681-20160917)
chr6 (63-299)||(22171914-22172150)
chr6 (28-298)||(13298896-13299166)
chr6 (28-298)||(16749835-16750105)
chr6 (28-298)||(24304563-24304833)
chr6 (28-298)||(26918361-26918631)
chr6 (28-298)||(26988982-26989252)
chr6 (28-298)||(24863698-24863968)
chr6 (30-298)||(27272527-27272795)
chr6 (28-298)||(27000054-27000324)
chr6 (28-299)||(29549455-29549726)
chr6 (28-298)||(15424262-15424532)
chr6 (307-444)||(27631135-27631272)
chr6 (30-276)||(4525289-4525535)
chr6 (30-265)||(4545722-4545957)
chr6 (30-276)||(4773009-4773255)
chr6 (307-444)||(26917014-26917151)
chr6 (307-444)||(28161968-28162105)
chr6 (30-276)||(4757767-4758013)
chr6 (28-298)||(29572994-29573264)
chr6 (28-298)||(30557961-30558231)
chr6 (307-444)||(8893058-8893195)
chr6 (307-444)||(8904293-8904430)
chr6 (307-444)||(13522821-13522958)
chr6 (307-444)||(33375004-33375141)
chr6 (30-298)||(27359939-27360207)
chr6 (30-298)||(27450282-27450550)
chr6 (30-274)||(34463293-34463537)
chr6 (30-265)||(4724081-4724316)
chr6 (28-274)||(16674144-16674390)
chr6 (30-276)||(27007730-27007976)
chr6 (28-274)||(3696086-3696332)
chr6 (305-419)||(22477886-22478000)
chr6 (30-276)||(26116357-26116603)
chr6 (307-444)||(16748488-16748624)
chr6 (305-416)||(13300375-13300486)
chr6 (305-416)||(15425741-15425852)
chr6 (305-416)||(24306042-24306153)
chr6 (346-444)||(16945492-16945590)
chr6 (30-276)||(17025280-17025526)
chr6 (28-298)||(26777560-26777830)
chr6 (30-276)||(29501418-29501664)
chr6 (346-444)||(29571646-29571744)
chr6 (305-416)||(22936284-22936395)
chr6 (305-416)||(23858729-23858840)
chr6 (30-265)||(28207468-28207703)
chr6 (346-444)||(30559481-30559579)
chr6 (30-298)||(27485110-27485378)
chr6 (28-295)||(16943972-16944239)
chr6 (309-416)||(24862378-24862485)
chr6 (305-416)||(26987665-26987776)
chr6 (305-416)||(26998733-26998844)
chr6 (30-276)||(27044390-27044637)
chr6 (309-419)||(27278885-27278995)
chr6 (309-419)||(27303776-27303886)
chr6 (312-444)||(4725556-4725688)
chr6 (312-444)||(4523940-4524072)
chr6 (312-444)||(4547197-4547329)
chr6 (312-444)||(26117832-26117964)
chr6 (312-444)||(26779041-26779173)
chr6 (312-444)||(27006363-27006495)
chr6 (312-444)||(27483768-27483900)
chr6 (312-444)||(28206093-28206225)
chr6 (385-444)||(27043040-27043099)
chr6 (312-443)||(29548130-29548261)
chr6 (312-444)||(3694753-3694885)
chr6 (312-444)||(34464774-34464906)
chr6 (385-444)||(29500057-29500116)
chr6 (312-418)||(20159396-20159502)
chr6 (312-418)||(22173329-22173435)
chr6 (359-444)||(4756412-4756497)
chr6 (359-444)||(4771648-4771733)
chr6 (391-444)||(17023913-17023966)
chr6 (385-444)||(16672778-16672837)
chr6 (312-444)||(27361423-27361555)
chr6 (312-444)||(27451766-27451898)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (28-419)||(30-421)
[»] chr5 (99 HSPs)
chr5 (28-419)||(29888981-29889372)
chr5 (28-299)||(22888462-22888733)
chr5 (28-299)||(25199021-25199292)
chr5 (1-298)||(23892199-23892505)
chr5 (63-299)||(13184582-13184818)
chr5 (28-299)||(11325786-11326057)
chr5 (28-299)||(33877239-33877510)
chr5 (63-299)||(13440428-13440664)
chr5 (28-298)||(23752349-23752619)
chr5 (28-295)||(24970014-24970281)
chr5 (28-299)||(30934625-30934896)
chr5 (28-298)||(11549347-11549617)
chr5 (28-298)||(23717887-23718157)
chr5 (28-298)||(24688056-24688326)
chr5 (28-298)||(33777480-33777750)
chr5 (28-298)||(9548442-9548712)
chr5 (28-298)||(22999013-22999283)
chr5 (28-298)||(15658659-15658929)
chr5 (30-276)||(37671384-37671630)
chr5 (30-298)||(2511044-2511312)
chr5 (30-298)||(8665376-8665644)
chr5 (30-298)||(15758758-15759026)
chr5 (307-444)||(9549923-9550060)
chr5 (30-298)||(6874298-6874566)
chr5 (28-276)||(18500629-18500877)
chr5 (305-444)||(23000492-23000631)
chr5 (30-265)||(31431466-31431701)
chr5 (28-298)||(9317444-9317714)
chr5 (28-298)||(12132148-12132418)
chr5 (305-419)||(24950780-24950894)
chr5 (28-298)||(30168462-30168732)
chr5 (307-444)||(33776132-33776269)
chr5 (28-299)||(32599371-32599642)
chr5 (28-298)||(26480385-26480655)
chr5 (28-298)||(30152011-30152281)
chr5 (28-274)||(31826306-31826552)
chr5 (28-298)||(33516349-33516619)
chr5 (30-276)||(37770888-37771134)
chr5 (307-444)||(11325117-11325254)
chr5 (307-444)||(13185350-13185487)
chr5 (307-444)||(13441196-13441333)
chr5 (307-444)||(33876570-33876707)
chr5 (308-444)||(24680082-24680218)
chr5 (308-444)||(24722609-24722745)
chr5 (28-276)||(28649250-28649498)
chr5 (305-416)||(23719361-23719472)
chr5 (28-298)||(18375311-18375581)
chr5 (305-419)||(23890894-23891008)
chr5 (307-444)||(31827799-31827936)
chr5 (30-298)||(41674702-41674970)
chr5 (30-274)||(43078269-43078513)
chr5 (28-298)||(5637903-5638173)
chr5 (30-276)||(13324730-13324976)
chr5 (30-276)||(37754995-37755241)
chr5 (30-299)||(34616510-34616779)
chr5 (30-274)||(24681457-24681701)
chr5 (30-274)||(24723984-24724228)
chr5 (307-419)||(25197702-25197814)
chr5 (30-298)||(28959687-28959955)
chr5 (30-274)||(40473450-40473694)
chr5 (346-444)||(2509696-2509794)
chr5 (346-444)||(5636555-5636653)
chr5 (346-444)||(6872947-6873045)
chr5 (346-444)||(8666894-8666992)
chr5 (346-444)||(9316096-9316194)
chr5 (346-444)||(12130800-12130898)
chr5 (346-444)||(15760276-15760374)
chr5 (346-444)||(18376831-18376929)
chr5 (346-444)||(26479037-26479135)
chr5 (28-298)||(29966965-29967235)
chr5 (28-298)||(30029408-30029678)
chr5 (346-444)||(30150663-30150761)
chr5 (36-298)||(37358550-37358812)
chr5 (359-444)||(30167114-30167199)
chr5 (305-416)||(24689535-24689646)
chr5 (30-276)||(3789556-3789802)
chr5 (346-444)||(29968485-29968583)
chr5 (346-444)||(30028060-30028158)
chr5 (346-444)||(33515001-33515099)
chr5 (305-416)||(30933309-30933420)
chr5 (30-299)||(33292517-33292786)
chr5 (312-444)||(34615184-34615316)
chr5 (307-416)||(11548027-11548136)
chr5 (312-444)||(13326211-13326343)
chr5 (312-444)||(15660127-15660259)
chr5 (312-444)||(31430091-31430223)
chr5 (312-444)||(37772366-37772498)
chr5 (312-444)||(41673372-41673504)
chr5 (312-444)||(3788189-3788321)
chr5 (312-444)||(28961166-28961298)
chr5 (359-443)||(33291196-33291280)
chr5 (312-444)||(37360022-37360154)
chr5 (312-444)||(37672859-37672991)
chr5 (312-444)||(43076912-43077044)
chr5 (385-444)||(18502188-18502247)
chr5 (385-444)||(40474992-40475051)
chr5 (312-444)||(37753631-37753763)
chr5 (402-444)||(28647889-28647931)
chr5 (402-444)||(32600926-32600968)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (28-444)||(39210911-39211330)
chr7 (28-416)||(26484558-26484949)
chr7 (28-419)||(2108893-2109287)
chr7 (28-299)||(16041307-16041578)
chr7 (36-299)||(16449894-16450157)
chr7 (28-416)||(2775223-2775614)
chr7 (63-299)||(31088387-31088623)
chr7 (30-416)||(18540663-18541052)
chr7 (63-299)||(45733444-45733680)
chr7 (28-298)||(5127977-5128247)
chr7 (28-298)||(11424664-11424934)
chr7 (28-299)||(10916756-10917027)
chr7 (28-298)||(5147228-5147498)
chr7 (28-298)||(16503268-16503538)
chr7 (28-298)||(2154558-2154828)
chr7 (28-298)||(16518304-16518574)
chr7 (28-298)||(26435242-26435512)
chr7 (28-298)||(26274982-26275252)
chr7 (305-444)||(5126629-5126768)
chr7 (28-298)||(4145011-4145281)
chr7 (28-298)||(26319757-26320027)
chr7 (307-444)||(31089155-31089292)
chr7 (30-298)||(16736350-16736618)
chr7 (30-298)||(16751404-16751672)
chr7 (30-298)||(17523517-17523785)
chr7 (30-298)||(17529430-17529698)
chr7 (28-274)||(3445315-3445561)
chr7 (305-419)||(16039988-16040102)
chr7 (305-419)||(16519782-16519896)
chr7 (30-276)||(31564280-31564526)
chr7 (28-298)||(45387328-45387598)
chr7 (307-444)||(11440197-11440334)
chr7 (307-444)||(45732775-45732912)
chr7 (28-298)||(9618636-9618906)
chr7 (305-419)||(16451362-16451476)
chr7 (28-298)||(26669802-26670072)
chr7 (307-444)||(3443931-3444068)
chr7 (305-416)||(10918232-10918343)
chr7 (346-444)||(4146531-4146629)
chr7 (346-444)||(9617288-9617386)
chr7 (305-419)||(16504746-16504860)
chr7 (346-444)||(24593949-24594047)
chr7 (346-444)||(26276502-26276600)
chr7 (346-444)||(26321277-26321375)
chr7 (28-274)||(26537758-26538004)
chr7 (346-444)||(26671322-26671420)
chr7 (346-444)||(45385980-45386078)
chr7 (28-265)||(11441590-11441827)
chr7 (28-148)||(4200682-4200802)
chr7 (346-444)||(16737868-16737966)
chr7 (346-444)||(16752922-16753020)
chr7 (346-444)||(17522169-17522267)
chr7 (346-444)||(17530948-17531046)
chr7 (307-416)||(2153237-2153346)
chr7 (28-298)||(24592429-24592699)
chr7 (307-416)||(11426145-11426254)
chr7 (30-298)||(31124905-31125173)
chr7 (30-299)||(5159503-5159772)
chr7 (312-444)||(26539229-26539361)
chr7 (93-148)||(26682953-26683008)
chr7 (312-444)||(26487100-26487232)
chr7 (385-444)||(5148769-5148828)
chr7 (385-444)||(31565828-31565887)
chr7 (312-444)||(26433912-26434044)
chr7 (312-444)||(31123566-31123698)
chr7 (359-444)||(5120115-5120200)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (28-416)||(28151724-28152115)
chr1 (32-299)||(20340341-20340608)
chr1 (28-295)||(16208033-16208300)
chr1 (63-292)||(20461070-20461299)
chr1 (28-298)||(10962653-10962923)
chr1 (30-298)||(41793312-41793580)
chr1 (306-419)||(20459768-20459881)
chr1 (305-419)||(16209505-16209619)
chr1 (305-419)||(20341120-20341234)
chr1 (28-298)||(28584964-28585234)
chr1 (30-298)||(51638201-51638469)
chr1 (346-444)||(10961305-10961403)
chr1 (346-444)||(28583616-28583714)
chr1 (346-444)||(41794830-41794928)
chr1 (346-444)||(51636853-51636951)
[»] chr3 (125 HSPs)
chr3 (28-416)||(32292576-32292967)
chr3 (28-416)||(31034160-31034551)
chr3 (63-292)||(18530339-18530568)
chr3 (63-299)||(16626584-16626820)
chr3 (63-299)||(4625888-4626124)
chr3 (63-299)||(5652331-5652567)
chr3 (63-299)||(17993862-17994098)
chr3 (28-298)||(15892749-15893019)
chr3 (28-299)||(8295916-8296187)
chr3 (28-298)||(6192261-6192531)
chr3 (28-298)||(15741137-15741407)
chr3 (28-298)||(18330614-18330884)
chr3 (28-299)||(8301310-8301581)
chr3 (28-298)||(18051207-18051477)
chr3 (28-298)||(18277095-18277365)
chr3 (28-298)||(18292396-18292666)
chr3 (28-298)||(18307697-18307967)
chr3 (28-298)||(29148798-29149068)
chr3 (28-298)||(4796696-4796966)
chr3 (28-299)||(22387621-22387892)
chr3 (28-298)||(4721576-4721846)
chr3 (28-298)||(7073157-7073427)
chr3 (28-298)||(4416864-4417134)
chr3 (30-276)||(6542507-6542753)
chr3 (28-298)||(10396078-10396348)
chr3 (28-298)||(28115997-28116267)
chr3 (28-298)||(35880711-35880981)
chr3 (307-444)||(4625219-4625356)
chr3 (30-298)||(5609367-5609635)
chr3 (30-298)||(17985001-17985269)
chr3 (30-298)||(28339247-28339515)
chr3 (28-299)||(4346730-4347001)
chr3 (31-298)||(21674638-21674905)
chr3 (28-298)||(5713172-5713442)
chr3 (28-298)||(5724082-5724352)
chr3 (28-298)||(5757125-5757395)
chr3 (28-298)||(5768016-5768286)
chr3 (28-274)||(11110392-11110638)
chr3 (309-419)||(15894232-15894342)
chr3 (28-274)||(36997120-36997366)
chr3 (307-444)||(4720228-4720365)
chr3 (307-444)||(6190913-6191050)
chr3 (30-298)||(31964518-31964786)
chr3 (30-298)||(50134116-50134384)
chr3 (307-444)||(5712499-5712636)
chr3 (307-444)||(5723409-5723546)
chr3 (307-444)||(5757919-5758056)
chr3 (307-444)||(5768822-5768959)
chr3 (307-444)||(18329271-18329408)
chr3 (30-298)||(47023398-47023666)
chr3 (30-277)||(22870901-22871148)
chr3 (30-277)||(22885960-22886207)
chr3 (305-419)||(5649461-5649575)
chr3 (305-419)||(15335489-15335603)
chr3 (305-415)||(15728337-15728447)
chr3 (307-437)||(17994630-17994760)
chr3 (28-298)||(18225136-18225406)
chr3 (28-298)||(20576890-20577160)
chr3 (28-274)||(29665013-29665259)
chr3 (28-274)||(48465896-48466142)
chr3 (307-444)||(29150279-29150415)
chr3 (307-444)||(36998613-36998750)
chr3 (30-298)||(7996507-7996775)
chr3 (30-298)||(10643015-10643283)
chr3 (305-419)||(4686664-4686778)
chr3 (305-419)||(4886132-4886246)
chr3 (305-419)||(18529014-18529128)
chr3 (331-444)||(50135619-50135732)
chr3 (30-214)||(51782052-51782236)
chr3 (305-416)||(8302783-8302894)
chr3 (28-299)||(28021219-28021490)
chr3 (305-416)||(35879391-35879502)
chr3 (346-444)||(5012309-5012407)
chr3 (30-276)||(5596402-5596648)
chr3 (346-444)||(5610885-5610983)
chr3 (306-416)||(8294600-8294710)
chr3 (346-444)||(24326756-24326854)
chr3 (346-444)||(28337900-28337998)
chr3 (346-444)||(31966036-31966134)
chr3 (28-265)||(8211716-8211953)
chr3 (30-298)||(5013657-5013925)
chr3 (305-416)||(4798175-4798286)
chr3 (28-275)||(5466953-5467200)
chr3 (373-444)||(7995159-7995230)
chr3 (373-444)||(10641667-10641738)
chr3 (305-416)||(18049887-18049998)
chr3 (346-444)||(4415513-4415611)
chr3 (346-444)||(17986519-17986617)
chr3 (346-444)||(18223788-18223886)
chr3 (30-214)||(51797141-51797326)
chr3 (308-416)||(15742599-15742707)
chr3 (30-298)||(18242684-18242952)
chr3 (305-419)||(16628006-16628119)
chr3 (308-416)||(14448442-14448550)
chr3 (30-298)||(24328104-24328372)
chr3 (30-299)||(32439098-32439367)
chr3 (312-444)||(4348195-4348327)
chr3 (385-444)||(28117541-28117600)
chr3 (312-444)||(7071827-7071959)
chr3 (32-276)||(20066010-20066254)
chr3 (312-444)||(28019893-28020025)
chr3 (385-444)||(18278636-18278695)
chr3 (385-444)||(18293937-18293996)
chr3 (385-444)||(18309238-18309297)
chr3 (307-444)||(22389081-22389218)
chr3 (359-444)||(32437772-32437857)
chr3 (359-444)||(51780608-51780693)
chr3 (359-444)||(51795695-51795780)
chr3 (312-444)||(6543985-6544117)
chr3 (312-444)||(18241342-18241474)
chr3 (312-444)||(22872385-22872517)
chr3 (312-444)||(22887444-22887576)
chr3 (385-444)||(5597950-5598009)
chr3 (385-444)||(8210356-8210415)
chr3 (385-444)||(10394751-10394810)
chr3 (385-444)||(20578446-20578505)
chr3 (359-441)||(4891831-4891913)
chr3 (402-444)||(29666586-29666628)
chr3 (402-444)||(47022068-47022110)
chr3 (123-299)||(4893154-4893330)
chr3 (312-444)||(5465600-5465732)
chr3 (385-444)||(11111945-11112004)
chr3 (385-444)||(21673308-21673367)
chr3 (385-444)||(48464530-48464589)
chr3 (369-419)||(16467862-16467912)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (28-299)||(21703155-21703426)
chr2 (63-299)||(19456447-19456683)
chr2 (63-299)||(34303329-34303565)
chr2 (63-299)||(27118667-27118903)
chr2 (28-295)||(27392952-27393219)
chr2 (72-299)||(34156990-34157217)
chr2 (63-299)||(3784633-3784869)
chr2 (63-299)||(16163578-16163814)
chr2 (63-299)||(31891354-31891590)
chr2 (28-298)||(20837898-20838168)
chr2 (28-298)||(12655522-12655792)
chr2 (28-298)||(23128557-23128827)
chr2 (28-298)||(27434435-27434705)
chr2 (28-298)||(28882194-28882464)
chr2 (30-274)||(40233515-40233759)
chr2 (29-298)||(34279429-34279698)
chr2 (30-298)||(21677175-21677443)
chr2 (307-444)||(31892122-31892259)
chr2 (30-298)||(34286334-34286602)
chr2 (30-298)||(34291394-34291662)
chr2 (305-419)||(21704631-21704745)
chr2 (305-419)||(27435913-27436027)
chr2 (28-265)||(260744-260981)
chr2 (307-444)||(34156321-34156458)
chr2 (30-298)||(11635179-11635447)
chr2 (30-298)||(22926021-22926289)
chr2 (28-276)||(37375163-37375411)
chr2 (28-298)||(16829329-16829599)
chr2 (28-298)||(16891882-16892152)
chr2 (28-298)||(34861660-34861930)
chr2 (28-298)||(37685900-37686170)
chr2 (28-298)||(37701165-37701435)
chr2 (28-298)||(37925473-37925743)
chr2 (307-444)||(3783964-3784101)
chr2 (307-444)||(12718077-12718214)
chr2 (307-444)||(16162909-16163046)
chr2 (30-298)||(11641368-11641636)
chr2 (28-299)||(13936535-13936809)
chr2 (30-298)||(32049778-32050046)
chr2 (28-298)||(31876261-31876531)
chr2 (305-419)||(34304077-34304191)
chr2 (30-298)||(12716595-12716863)
chr2 (305-416)||(27118044-27118155)
chr2 (28-274)||(27777226-27777472)
chr2 (28-274)||(27816984-27817230)
chr2 (312-416)||(27391672-27391776)
chr2 (305-416)||(23136863-23136974)
chr2 (28-298)||(27803687-27803957)
chr2 (305-416)||(28880874-28880985)
chr2 (346-444)||(11636699-11636797)
chr2 (346-444)||(11642888-11642986)
chr2 (28-274)||(12586814-12587060)
chr2 (305-419)||(19457870-19457984)
chr2 (346-444)||(21678693-21678791)
chr2 (346-444)||(22927539-22927637)
chr2 (346-444)||(31874913-31875011)
chr2 (346-444)||(34860312-34860410)
chr2 (346-444)||(37687420-37687518)
chr2 (346-444)||(37702685-37702783)
chr2 (346-444)||(37924125-37924223)
chr2 (28-274)||(39051813-39052059)
chr2 (305-416)||(20836578-20836689)
chr2 (346-444)||(16830849-16830947)
chr2 (346-444)||(16890534-16890632)
chr2 (346-444)||(19418010-19418108)
chr2 (346-444)||(32048430-32048528)
chr2 (312-444)||(37373811-37373943)
chr2 (305-416)||(12654202-12654313)
chr2 (28-274)||(9349973-9350219)
chr2 (30-298)||(39890054-39890322)
chr2 (30-298)||(19416492-19416760)
chr2 (312-444)||(34278099-34278231)
chr2 (312-444)||(39053288-39053420)
chr2 (385-444)||(40232149-40232208)
chr2 (385-444)||(9351526-9351585)
chr2 (385-444)||(40191084-40191143)
chr2 (402-444)||(262312-262354)
chr2 (402-444)||(12585451-12585493)
chr2 (402-444)||(27802342-27802384)
chr2 (391-444)||(13938082-13938135)
chr2 (385-444)||(27775857-27775916)
chr2 (385-444)||(27815624-27815683)
chr2 (402-444)||(39888712-39888754)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (63-419)||(33244525-33244884)
chr8 (72-299)||(44563084-44563311)
chr8 (72-299)||(19659044-19659271)
chr8 (28-295)||(22080839-22081106)
chr8 (72-299)||(9354605-9354832)
chr8 (28-298)||(16283433-16283703)
chr8 (28-298)||(16277538-16277808)
chr8 (28-298)||(27608866-27609136)
chr8 (28-299)||(14557607-14557878)
chr8 (28-298)||(19688082-19688352)
chr8 (29-298)||(2137221-2137490)
chr8 (28-298)||(31489711-31489981)
chr8 (305-419)||(16282113-16282227)
chr8 (28-298)||(18710570-18710840)
chr8 (28-298)||(19674425-19674695)
chr8 (307-444)||(44562415-44562552)
chr8 (30-276)||(12092687-12092933)
chr8 (28-298)||(19208321-19208591)
chr8 (307-444)||(9353936-9354073)
chr8 (30-298)||(31354508-31354776)
chr8 (305-416)||(21374979-21375090)
chr8 (305-416)||(27610345-27610456)
chr8 (30-276)||(3329470-3329716)
chr8 (305-419)||(19659783-19659897)
chr8 (28-298)||(28361916-28362186)
chr8 (30-276)||(29829328-29829574)
chr8 (305-416)||(14556291-14556402)
chr8 (305-416)||(2138699-2138810)
chr8 (305-416)||(16276218-16276329)
chr8 (346-444)||(19209841-19209939)
chr8 (346-444)||(31491231-31491329)
chr8 (346-444)||(33257359-33257457)
chr8 (375-444)||(18709222-18709291)
chr8 (312-416)||(22082301-22082405)
chr8 (30-276)||(19286468-19286714)
chr8 (346-444)||(28363436-28363534)
chr8 (28-298)||(33258707-33258977)
chr8 (359-444)||(31353158-31353243)
chr8 (305-416)||(19686762-19686873)
chr8 (312-444)||(3330949-3331081)
chr8 (312-444)||(12094162-12094294)
chr8 (385-444)||(19279989-19280048)
chr8 (385-444)||(19285119-19285178)
chr8 (391-444)||(29827967-29828020)
chr8 (402-444)||(19519662-19519704)
chr8 (402-444)||(19673092-19673134)
chr8 (28-120)||(189256-189348)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (32-299)||(2664-2931)
scaffold0260 (305-419)||(3443-3557)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (28-295)||(20375-20641)
scaffold0124 (28-298)||(30437-30706)
scaffold0124 (306-416)||(29117-29227)
scaffold0124 (307-417)||(19073-19184)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (36-299)||(15227868-15228131)
chr4 (63-299)||(15284965-15285201)
chr4 (28-299)||(1900255-1900526)
chr4 (63-299)||(24460642-24460878)
chr4 (28-295)||(15391340-15391607)
chr4 (28-298)||(14235527-14235797)
chr4 (28-298)||(17013999-17014269)
chr4 (28-299)||(24592316-24592587)
chr4 (28-298)||(14763306-14763576)
chr4 (36-298)||(14665017-14665279)
chr4 (28-295)||(6569855-6570122)
chr4 (28-298)||(14098540-14098810)
chr4 (28-298)||(31126520-31126790)
chr4 (305-444)||(24593792-24593931)
chr4 (28-298)||(40105640-40105910)
chr4 (307-444)||(24461410-24461547)
chr4 (28-276)||(36344517-36344765)
chr4 (28-298)||(5005872-5006142)
chr4 (30-274)||(33673802-33674046)
chr4 (305-419)||(1898936-1899050)
chr4 (307-444)||(33678827-33678964)
chr4 (28-276)||(18800615-18800863)
chr4 (30-298)||(27163321-27163589)
chr4 (305-417)||(15286388-15286500)
chr4 (30-298)||(21969700-21969968)
chr4 (30-274)||(30753777-30754021)
chr4 (30-274)||(39850661-39850905)
chr4 (305-416)||(17012679-17012790)
chr4 (346-444)||(14097192-14097290)
chr4 (307-444)||(30752393-30752530)
chr4 (312-416)||(15392804-15392908)
chr4 (305-416)||(14663697-14663808)
chr4 (346-444)||(21968352-21968450)
chr4 (346-444)||(31128040-31128138)
chr4 (346-444)||(40107160-40107258)
chr4 (30-276)||(54833408-54833654)
chr4 (30-299)||(34188964-34189233)
chr4 (30-299)||(24112660-24112929)
chr4 (305-419)||(14236988-14237102)
chr4 (385-444)||(5004539-5004598)
chr4 (385-444)||(14764847-14764906)
chr4 (385-444)||(36346055-36346114)
chr4 (385-444)||(54832059-54832118)
chr4 (337-419)||(15222721-15222803)
chr4 (391-444)||(39849292-39849345)
chr4 (385-444)||(6568522-6568581)
chr4 (385-444)||(19371930-19371989)
chr4 (402-444)||(18801504-18801546)
chr4 (385-444)||(34190500-34190559)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (28-294)||(21549-21815)
scaffold0109 (312-416)||(20249-20353)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (28-212)||(1920-2103)
scaffold0415 (28-214)||(6080-6268)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (28-298)||(29747-30017)
scaffold0089 (28-298)||(40071-40341)
scaffold0089 (28-298)||(46987-47257)
scaffold0089 (305-419)||(28424-28538)
scaffold0089 (305-416)||(48466-48577)
scaffold0089 (305-416)||(41550-41661)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (28-298)||(27276-27546)
scaffold0143 (305-416)||(25956-26067)
scaffold0143 (385-444)||(17658-17717)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (28-298)||(131-402)
scaffold0029 (307-416)||(1613-1722)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (28-298)||(7241-7511)
scaffold0350 (346-444)||(8761-8859)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (28-298)||(9068-9338)
scaffold0159 (28-298)||(19999-20269)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (28-299)||(9549-9820)
scaffold0336 (312-444)||(6886-7018)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (28-298)||(26203-26474)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (28-298)||(14932-15202)
scaffold0237 (346-444)||(16452-16550)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (28-136)||(620-728)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (305-419)||(49681-49798)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (30-265)||(7966-8201)
scaffold0038 (312-444)||(6591-6723)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (325-419)||(40322-40416)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 90)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 28 - 419
Target Start/End: Original strand, 27290315 - 27290706
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27290315 ggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 27290414  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27290415 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtc 27290514  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggct 327  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27290515 gggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggctgattgttcctgggcggct 27290614  T
Q  328 aacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 419  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  27290615 agcagagcagtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagaagctaactcggcacggagctgaacattttcttcttccatagc 27290706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26788195 - 26787776
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26788195 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 26788096  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26788095 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtc 26787996  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  26787995 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcg 26787896  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttt 424  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  26787895 gctagcagagcagtcatggtgtcattgaccttagccaattcttccctcagagaagttaactcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttt 26787796  T
Q  425 tctttcttctgtattctctg 444  Q
    || |||||||||||||||||    
T  26787795 tccttcttctgtattctctg 26787776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 14143230 - 14143647
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14143230 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 14143329  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14143330 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtc 14143429  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  14143430 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcg 14143529  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttt 424  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  14143530 gctagcagagcagtcatggtgtcattgaccttagccaattcttccctcagagaagttaactcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttt 14143629  T
Q  425 tctttcttctgtattctc 442  Q
    || |||||||||||||||    
T  14143630 tccttcttctgtattctc 14143647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27196568 - 27196151
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27196568 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 27196469  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27196468 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtc 27196369  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27196368 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcg 27196269  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttt 424  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  27196268 gctagcagagcagtcatggtgtcattgaccttagccaattcttccctcagagaagttaactcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttt 27196169  T
Q  425 tctttcttctgtattctc 442  Q
    || |||||||||||||||    
T  27196168 tccttcttctgtattctc 27196151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 27252672 - 27253089
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27252672 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 27252771  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27252772 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtc 27252871  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27252872 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcg 27252971  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttt 424  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  27252972 gctagcagagcagtcatggtgtcattgaccttagccaattcttccctcagagaagttaactcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttt 27253071  T
Q  425 tctttcttctgtattctc 442  Q
    || |||||||||||||||    
T  27253072 tccttcttctgtattctc 27253089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 22456887 - 22457149
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    ||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22456887 ttctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaat 22456986  T
Q  136 cacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtag 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  22456987 cacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaa 22457086  T
Q  236 ctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22457087 ctcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttg 22457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 33374236 - 33374472
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33374236 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 33374335  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  33374336 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 33374435  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  33374436 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 33374472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Original strand, 8892299 - 8892526
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaaca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |      
T  8892299 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 8892398  T
Q  172 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtagg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8892399 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 8892498  T
Q  272 tctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  8892499 tctagcctgttgctgctgtcgttgttga 8892526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Original strand, 8903534 - 8903761
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaaca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |      
T  8903534 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 8903633  T
Q  172 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtagg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8903634 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 8903733  T
Q  272 tctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  8903734 tctagcctgttgctgctgtcgttgttga 8903761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 13522018 - 13522289
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13522018 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 13522117  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13522118 atggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtc 13522217  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  13522218 gggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 13522289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 63 - 298
Target Start/End: Original strand, 22477253 - 22477488
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22477253 atgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttagaacggaacctgg 22477352  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  22477353 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagagg 22477452  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22477453 aaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttg 22477488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28162873 - 28162637
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28162873 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 28162774  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  28162773 gaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 28162674  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28162673 aaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttga 28162637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 22934825 - 22935096
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  22934825 ggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 22934924  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  22934925 atggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 22935024  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  22935025 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 22935096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 23857270 - 23857541
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  23857270 ggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 23857369  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  23857370 atggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 23857469  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  23857470 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 23857541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20160917 - 20160681
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  20160917 atgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgg 20160818  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20160817 gaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggagg 20160718  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  20160717 aaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttga 20160681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 22171914 - 22172150
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22171914 atgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgg 22172013  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22172014 gaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggagg 22172113  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  22172114 aaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttga 22172150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 13298896 - 13299166
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||    
T  13298896 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttg 13298995  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  13298996 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 13299095  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13299096 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 13299166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16750105 - 16749835
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  16750105 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 16750006  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  16750005 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 16749906  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16749905 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 16749835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 24304563 - 24304833
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||  | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  24304563 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 24304662  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  24304663 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 24304762  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24304763 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 24304833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26918631 - 26918361
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  26918631 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 26918532  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  26918531 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 26918432  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26918431 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 26918361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26989252 - 26988982
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  26989252 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 26989153  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  26989152 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 26989053  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  26989052 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttg 26988982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24863968 - 24863698
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  24863968 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 24863869  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  24863868 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 24863769  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24863768 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 24863698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 27272527 - 27272795
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||  |||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27272527 acattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgat 27272626  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||    
T  27272627 ggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcgg 27272726  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  27272727 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgacttgctgattctgttgttgttg 27272795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27000324 - 27000054
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  27000324 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 27000225  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  27000224 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 27000125  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27000124 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 27000054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29549726 - 29549455
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  29549726 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 29549627  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  29549626 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 29549527  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  29549526 ggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttga 29549455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 15424262 - 15424532
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||  || |||||    
T  15424262 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttg 15424361  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  15424362 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 15424461  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15424462 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 15424532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 27631135 - 27631272
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631135 gctgattgctcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 27631234  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631235 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27631272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4525535 - 4525289
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  4525535 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 4525436  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| ||    
T  4525435 gaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttgg 4525336  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4525335 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4525289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 4545722 - 4545957
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  4545722 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 4545821  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  4545822 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 4545921  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaa 265  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  4545922 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 4545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4773255 - 4773009
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  4773255 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 4773156  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  4773155 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 4773056  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4773055 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26917151 - 26917014
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26917151 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 26917052  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26917051 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 26917014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28162105 - 28161968
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28162105 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 28162006  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28162005 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 28161968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4758013 - 4757767
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  4758013 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 4757914  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  4757913 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 4757814  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4757813 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29573264 - 29572994
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  29573264 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 29573165  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  29573164 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 29573065  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29573064 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttg 29572994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 30557961 - 30558231
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  30557961 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 30558060  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  ||     
T  30558061 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggtt 30558160  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  30558161 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 30558231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 8893058 - 8893195
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8893058 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 8893157  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8893158 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 8893195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 8904293 - 8904430
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904293 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 8904392  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8904393 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 8904430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 13522821 - 13522958
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13522821 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 13522920  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13522921 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 13522958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 33375004 - 33375141
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33375004 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 33375103  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33375104 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 33375141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 27359939 - 27360207
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  27359939 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 27360038  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  27360039 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 27360138  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27360139 aagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27360207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 27450282 - 27450550
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  27450282 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 27450381  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  27450382 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 27450481  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27450482 aagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27450550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 34463293 - 34463537
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  34463293 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 34463392  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  34463393 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 34463492  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  34463493 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 4724081 - 4724316
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  4724081 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 4724180  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  4724181 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 4724280  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaa 265  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  4724281 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 4724316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16674390 - 16674144
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  16674390 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 16674291  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  16674290 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 16674191  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  16674190 ggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27007976 - 27007730
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  27007976 acattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 27007877  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  27007876 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 27007777  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27007776 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3696332 - 3696086
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  3696332 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 3696233  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  3696232 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 3696133  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  3696132 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 22477886 - 22478000
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22477886 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcaaggtatcattggccttagccaattattccctaagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 22477985  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  22477986 ttcttcttccatagc 22478000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 26116357 - 26116603
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  26116357 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 26116456  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||||||    
T  26116457 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcgg 26116556  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || || || ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  26116557 aagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16748624 - 16748488
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  16748624 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactct-tacggagctgagcgttct 16748526  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16748525 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 16748488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 13300375 - 13300486
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13300375 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 13300474  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  13300475 ctcttcttccat 13300486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 15425741 - 15425852
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15425741 tggctgattgttcttgagcggctagtaaagcggtcatgacatcattggccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 15425840  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  15425841 ctcttcttccat 15425852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 24306042 - 24306153
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24306042 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagccttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 24306141  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  24306142 ctcttcttccat 24306153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 16945492 - 16945590
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16945492 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16945590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17025526 - 17025280
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  17025526 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 17025427  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||||||| ||    
T  17025426 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttgg 17025327  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  17025326 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 26777560 - 26777830
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  26777560 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 26777659  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||     
T  26777660 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagtt 26777759  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  26777760 ggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 26777830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29501664 - 29501418
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  29501664 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 29501565  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  29501564 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttgg 29501465  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || || || ||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29501464 aagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29571744 - 29571646
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29571744 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 29571646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 22936284 - 22936395
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22936284 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 22936383  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     |||||||||||    
T  22936384 ttcttcttccat 22936395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 23858729 - 23858840
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23858729 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 23858828  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     |||||||||||    
T  23858829 ttcttcttccat 23858840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28207703 - 28207468
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  28207703 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 28207604  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  28207603 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 28207504  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaa 265  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  28207503 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 28207468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 30559481 - 30559579
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30559481 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 30559579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27485378 - 27485110
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  27485378 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 27485279  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  27485278 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 27485179  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27485178 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27485110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 16943972 - 16944239
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  16943972 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 16944071  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||     
T  16944072 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagtt 16944171  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 295  Q
    || || || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  ||||||||    
T  16944172 ggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttg 16944239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24862485 - 24862378
Alignment:
Q  309 tgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctct 408  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  24862485 tgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcattttct 24862386  T
Q  409 tcttccat 416  Q
    ||||||||    
T  24862385 tcttccat 24862378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26987776 - 26987665
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  26987776 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctaagcatt 26987677  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  26987676 ctcttcttccat 26987665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26998844 - 26998733
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26998844 tggctgattgttcttgagcggctagcatagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 26998745  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  26998744 ctcttcttccat 26998733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27044637 - 27044390
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagc-atccttcgacatcatgatccagagcaccttga 128  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || | | || |||||||||||| | |  |||||||||    
T  27044637 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttga 27044538  T
Q  129 tggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 228  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| |    
T  27044537 tgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttg 27044438  T
Q  229 ggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
    | || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  27044437 gaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 419
Target Start/End: Original strand, 27278885 - 27278995
Alignment:
Q  309 tgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctct 408  Q
    ||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27278885 tgattgttcttgagcagctagcagagcagtcatggtatcatgggccttagccagctcttcccttagagtagccaactcggtgcgaagctgagtgttctct 27278984  T
Q  409 tcttccatagc 419  Q
    |||||||||||    
T  27278985 tcttccatagc 27278995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 419
Target Start/End: Original strand, 27303776 - 27303886
Alignment:
Q  309 tgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctct 408  Q
    ||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27303776 tgattgttcttgagcagctagcagagcagtcatggtatcatgggccttagccagctcttcccttagagtagccaactcggtgcgaagctgagtgttctct 27303875  T
Q  409 tcttccatagc 419  Q
    |||||||||||    
T  27303876 tcttccatagc 27303886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 4725556 - 4725688
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  4725556 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgtgtgttctcttct 4725655  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725656 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4725688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4524072 - 4523940
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  4524072 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 4523973  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4523972 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4523940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 4547197 - 4547329
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  4547197 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 4547296  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4547297 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4547329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 26117832 - 26117964
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  26117832 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagctgtgtgttctcttct 26117931  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26117932 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26117964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 26779041 - 26779173
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  26779041 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 26779140  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26779141 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26779173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27006495 - 27006363
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  27006495 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 27006396  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27006395 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27006363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27483900 - 27483768
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  27483900 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 27483801  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27483800 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27483768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28206225 - 28206093
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  28206225 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 28206126  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206125 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28206093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27043099 - 27043040
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27043099 tcggtacggagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27043040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29548261 - 29548130
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  29548261 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagctgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 29548162  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctct 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29548161 tccatagcccttttctttcttctgtattctct 29548130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3694885 - 3694753
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  3694885 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 3694786  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3694785 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 3694753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 34464774 - 34464906
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  34464774 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 34464873  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34464874 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 34464906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29500116 - 29500057
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29500116 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 29500057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 20159502 - 20159396
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    |||||| || || ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||    
T  20159502 ttgttcttgtgcagctaacagagcagccgtggtatcatgggccttagccaagtcttctttcagagaggccaattcggcgcggagctgagcattctcttct 20159403  T
Q  412 tccatag 418  Q
    |||||||    
T  20159402 tccatag 20159396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 418
Target Start/End: Original strand, 22173329 - 22173435
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    |||||| || || ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22173329 ttgttcttgtgcagctaacagagcagccgtggtatcatgggccttagccaagtcttctttcagagaggccaattcggcgcggagctgagcattctcttct 22173428  T
Q  412 tccatag 418  Q
    |||||||    
T  22173429 tccatag 22173435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4756497 - 4756412
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4756497 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtactctctg 4756412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4771733 - 4771648
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4771733 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtactctctg 4771648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17023966 - 17023913
Alignment:
Q  391 cggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17023966 cggagctgtgtgttttcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17023913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16672837 - 16672778
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16672837 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 16672778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 27361423 - 27361555
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  27361423 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 27361522  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27361523 tccatagcctttttccttcttctgtactctctg 27361555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 27451766 - 27451898
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  27451766 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 27451865  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27451866 tccatagcctttttccttcttctgtactctctg 27451898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 28 - 419
Target Start/End: Original strand, 30 - 421
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30 ggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttg 129  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  130 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttgagcagtgccctctgagaagtagagtc 229  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggct 327  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||    
T  230 gggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgattgttcctgggcagct 329  T
Q  328 aacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 419  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  330 agcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgaacattttcttcttccatagc 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 99)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 419
Target Start/End: Original strand, 29888981 - 29889372
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29888981 ggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 29889080  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  29889081 atggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagtt 29889180  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggct 327  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |  |||||||||||||  |||||||    
T  29889181 gggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgattgttcccaggcggct 29889280  T
Q  328 aacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 419  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29889281 agcagagcagtcatggtatcattggcctttgccaattcttccctcagagaagccaactcggtgcgaagctgagtgttctcttcctccatagc 29889372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22888733 - 22888462
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22888733 ggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 22888634  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22888633 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtc 22888534  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888533 gggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 22888462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25199292 - 25199021
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25199292 ggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 25199193  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199192 atggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 25199093  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199092 gggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 25199021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23892505 - 23892199
Alignment:
Q  1 cagcatgattcggaagaggattgttga---------ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||  ||    
T  23892505 cagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagc 23892406  T
Q  92 gtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccc 191  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23892405 atagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccc 23892306  T
Q  192 tgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgtt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23892305 tgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgtt 23892206  T
Q  292 gttgttg 298  Q
    |||||||    
T  23892205 gttgttg 23892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 13184582 - 13184818
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13184582 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 13184681  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  13184682 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 13184781  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  13184782 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 13184818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11326057 - 11325786
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11326057 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 11325958  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11325957 atggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtc 11325858  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  11325857 gggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 11325786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33877510 - 33877239
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33877510 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 33877411  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33877410 atggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtc 33877311  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  33877310 gggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 33877239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 13440428 - 13440664
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13440428 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 13440527  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||    
T  13440528 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagagg 13440627  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  13440628 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 13440664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 23752349 - 23752619
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  23752349 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 23752448  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  23752449 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 23752548  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23752549 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 23752619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24970281 - 24970014
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  24970281 ggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 24970182  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  24970181 atggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 24970082  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 295  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24970081 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttg 24970014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30934896 - 30934625
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  30934896 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 30934797  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  30934796 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 30934697  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  30934696 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 30934625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11549617 - 11549347
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  11549617 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 11549518  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  11549517 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 11549418  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11549417 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11549347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 23717887 - 23718157
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  23717887 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 23717986  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  23717987 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 23718086  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23718087 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 23718157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 24688056 - 24688326
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||    
T  24688056 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttg 24688155  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  24688156 atggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 24688255  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24688256 ggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 24688326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33777750 - 33777480
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  33777750 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 33777651  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  33777650 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 33777551  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33777550 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 33777480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 9548442 - 9548712
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  9548442 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 9548541  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  9548542 atgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 9548641  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || |  |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9548642 ggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 9548712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 22999013 - 22999283
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  22999013 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 22999112  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||||||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||     
T  22999113 atgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtt 22999212  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22999213 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 22999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 15658659 - 15658929
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  15658659 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 15658758  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  15658759 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 15658858  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15658859 ggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 15658929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 37671384 - 37671630
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  37671384 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 37671483  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  37671484 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 37671583  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  37671584 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2511312 - 2511044
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  2511312 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 2511213  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  2511212 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 2511113  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  2511112 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 2511044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 8665376 - 8665644
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  8665376 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 8665475  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  8665476 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 8665575  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  8665576 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 8665644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 15758758 - 15759026
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  15758758 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 15758857  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  15758858 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 15758957  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  15758958 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 15759026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 9549923 - 9550060
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9549923 gctgattgctcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 9550022  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9550023 cttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 9550060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6874566 - 6874298
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  6874566 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 6874467  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  6874466 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 6874367  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  6874366 aagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 6874298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 18500629 - 18500877
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18500629 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18500728  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  18500729 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18500828  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  18500829 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 444
Target Start/End: Original strand, 23000492 - 23000631
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23000492 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 23000591  T
Q  405 ctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23000592 ctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 23000631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31431701 - 31431466
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  31431701 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 31431602  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  31431601 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 31431502  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaa 265  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  31431501 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 31431466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9317714 - 9317444
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  9317714 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 9317615  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  9317614 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 9317515  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  9317514 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9317444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12132418 - 12132148
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  12132418 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 12132319  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  12132318 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 12132219  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  12132218 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 12132148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24950894 - 24950780
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24950894 tggctgattgttcctgagcggctagcagagctgtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagtagctaactcggtacggagctgagcgtt 24950795  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  24950794 ttcttcttccatagc 24950780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30168732 - 30168462
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  30168732 ggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 30168633  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  30168632 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 30168533  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  30168532 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 30168462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33776269 - 33776132
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33776269 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 33776170  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33776169 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 33776132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 32599371 - 32599642
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  32599371 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttg 32599470  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  32599471 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 32599570  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  32599571 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 32599642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26480655 - 26480385
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  26480655 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 26480556  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  26480555 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 26480456  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26480455 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26480385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30152281 - 30152011
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  30152281 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 30152182  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  30152181 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 30152082  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  30152081 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 30152011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 31826306 - 31826552
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  31826306 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 31826405  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  31826406 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 31826505  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  31826506 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33516619 - 33516349
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  33516619 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 33516520  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  ||     
T  33516519 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggtt 33516420  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  33516419 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 33516349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 37770888 - 37771134
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  37770888 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 37770987  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| ||    
T  37770988 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttgg 37771087  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  37771088 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11325254 - 11325117
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11325254 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 11325155  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11325154 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 11325117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 13185350 - 13185487
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13185350 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 13185449  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13185450 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 13185487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 13441196 - 13441333
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13441196 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 13441295  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13441296 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 13441333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33876707 - 33876570
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33876707 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 33876608  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33876607 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 33876570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 308 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24680218 - 24680082
Alignment:
Q  308 ctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctc 407  Q
    ||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24680218 ctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttctc 24680119  T
Q  408 ttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24680118 ttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 24680082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 308 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24722745 - 24722609
Alignment:
Q  308 ctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctc 407  Q
    ||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24722745 ctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttctc 24722646  T
Q  408 ttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24722645 ttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 24722609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28649498 - 28649250
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  28649498 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 28649399  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  28649398 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 28649299  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
    || || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28649298 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 23719361 - 23719472
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23719361 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattggctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtgcggagctgagcatt 23719460  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  23719461 ctcttcttccat 23719472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 18375311 - 18375581
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  18375311 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 18375410  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18375411 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 18375510  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18375511 ggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18375581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23891008 - 23890894
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23891008 tggctgattgttcttgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 23890909  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  23890908 ttcctcttccatagc 23890894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 31827799 - 31827936
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31827799 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 31827898  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31827899 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31827936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41674970 - 41674702
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | || ||||||||||    
T  41674970 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgat 41674871  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  41674870 gaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 41674771  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || |  |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  41674770 aagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 41674702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43078513 - 43078269
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  43078513 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 43078414  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  43078413 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 43078314  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  43078313 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5638173 - 5637903
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  5638173 ggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 5638074  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5638073 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 5637974  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  5637973 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 5637903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 13324730 - 13324976
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  13324730 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 13324829  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  13324830 gaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 13324929  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  13324930 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37755241 - 37754995
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  37755241 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 37755142  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| ||    
T  37755141 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttgg 37755042  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  37755041 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34616779 - 34616510
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  34616779 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 34616680  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  34616679 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 34616580  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  34616579 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 34616510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24681701 - 24681457
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  24681701 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 24681602  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  24681601 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 24681502  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  24681501 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24724228 - 24723984
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  24724228 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 24724129  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  24724128 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 24724029  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  24724028 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 307 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25197814 - 25197702
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  25197814 gctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagctaattcttccctcaaagaagctaactcggtacggagctgagcatttt 25197715  T
Q  407 cttcttccatagc 419  Q
    | |||||||||||    
T  25197714 cctcttccatagc 25197702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 28959687 - 28959955
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  28959687 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 28959786  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  28959787 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttgg 28959886  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  28959887 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 28959955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 40473450 - 40473694
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  40473450 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 40473549  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  40473550 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 40473649  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  40473650 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2509794 - 2509696
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2509794 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 2509696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5636653 - 5636555
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5636653 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 5636555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6873045 - 6872947
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873045 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 6872947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 8666894 - 8666992
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8666894 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 8666992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9316194 - 9316096
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9316194 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 9316096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12130898 - 12130800
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12130898 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 12130800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 15760276 - 15760374
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760276 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 15760374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 18376831 - 18376929
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18376831 tcattagctttagccaattcctcctttagagagactaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18376929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26479135 - 26479037
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479135 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26479037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 29966965 - 29967235
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  29966965 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 29967064  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||     
T  29967065 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagtt 29967164  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  29967165 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 29967235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30029678 - 30029408
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  30029678 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 30029579  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||     
T  30029578 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagtt 30029479  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  30029478 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 30029408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30150761 - 30150663
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30150761 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 30150663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 37358550 - 37358812
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||| || |    
T  37358550 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagt 37358649  T
Q  136 cacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtag 235  Q
    |||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||    
T  37358650 cacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaag 37358749  T
Q  236 ctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  37358750 ttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 37358812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30167199 - 30167114
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30167199 ccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 30167114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 24689535 - 24689646
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24689535 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 24689634  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     |||||||||||    
T  24689635 ttcttcttccat 24689646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3789802 - 3789556
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  3789802 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 3789703  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  3789702 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 3789603  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  3789602 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 29968485 - 29968583
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29968485 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggccaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 29968583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30028158 - 30028060
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028158 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggccaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 30028060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33515099 - 33515001
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33515099 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 33515001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 30933420 - 30933309
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || || |||| || ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30933420 tggctgattgttcttgagcagctagcaaagcggtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 30933321  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     |||||||||||    
T  30933320 ttcttcttccat 30933309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33292786 - 33292517
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||    
T  33292786 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgat 33292687  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  33292686 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 33292587  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  33292586 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgttgctgctgctgttga 33292517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34615316 - 34615184
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  34615316 ttgttcctgagcagctaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 34615217  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34615216 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 34615184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11548136 - 11548027
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||| || ||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11548136 gctggttgttcttgagcggctagcagggcagtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaattcggtacggagctgagcgttct 11548037  T
Q  407 cttcttccat 416  Q
    ||||||||||    
T  11548036 cttcttccat 11548027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 13326211 - 13326343
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  13326211 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 13326310  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13326311 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 13326343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 15660127 - 15660259
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||| | |||||  |||||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  15660127 ttgttcctgagcagccaatagagcagtcatagcatcatgagccttggccaattcctcctttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 15660226  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15660227 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 15660259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31430223 - 31430091
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  31430223 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 31430124  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31430123 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31430091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 37772366 - 37772498
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  37772366 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 37772465  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37772466 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37772498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41673504 - 41673372
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  41673504 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagctgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 41673405  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41673404 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 41673372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3788321 - 3788189
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  3788321 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 3788222  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788221 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 3788189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 28961166 - 28961298
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||| ||||||    
T  28961166 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttttcttct 28961265  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28961266 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28961298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33291280 - 33291196
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctct 443  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33291280 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattctct 33291196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 37360022 - 37360154
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||   | || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  37360022 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagataccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 37360121  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37360122 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37360154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 37672859 - 37672991
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  37672859 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 37672958  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37672959 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37672991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 43077044 - 43076912
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  43077044 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 43076945  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43076944 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 43076912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 18502188 - 18502247
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18502188 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 18502247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 40474992 - 40475051
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40474992 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 40475051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37753763 - 37753631
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  37753763 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 37753664  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37753663 tccatagcccttttctttcttttgtattctctg 37753631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28647931 - 28647889
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28647931 gttctcttcttccatagccctcttctttcttctgtattctctg 28647889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Original strand, 32600926 - 32600968
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32600926 gttctcttcttccatagcctttttctttcttctatattctctg 32600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 444
Target Start/End: Original strand, 39210911 - 39211330
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39210911 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttg 39211010  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211011 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 39211110  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgc---tgttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  39211111 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgcggtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcg 39211210  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttt 424  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39211211 gctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagttaattcggtacggagctgagcgttctcttcttccatagcctttt 39211310  T
Q  425 tctttcttctgtattctctg 444  Q
    || ||||| |||| ||||||    
T  39211311 tccttcttatgtactctctg 39211330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26484949 - 26484558
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26484949 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 26484850  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484849 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 26484750  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26484749 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctaggcg 26484650  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 416  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  26484649 gctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 26484558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 419
Target Start/End: Original strand, 2108893 - 2109287
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2108893 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 2108992  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108993 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 2109092  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2109093 gggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcg 2109192  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 419  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  2109193 gctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagttaactcggtacggagctgaacattttcttcttccatagc 2109287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16041578 - 16041307
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16041578 ggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttg 16041479  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041478 atggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 16041379  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041378 gggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 16041307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 36 - 299
Target Start/End: Original strand, 16449894 - 16450157
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16449894 ttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaat 16449993  T
Q  136 cacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtag 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16449994 cacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaa 16450093  T
Q  236 ctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16450094 ctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttga 16450157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2775614 - 2775223
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2775614 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 2775515  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775514 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 2775415  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2775414 gggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcg 2775315  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 416  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  2775314 gctagcagagcagtcatggtatcattggccttagctaattcttccctcatagaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 2775223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 31088387 - 31088623
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31088387 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 31088486  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  31088487 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 31088586  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  31088587 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 31088623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18541052 - 18540663
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||    
T  18541052 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgat 18540953  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540952 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 18540853  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggc 326  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18540852 gagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggc 18540753  T
Q  327 taacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 416  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  18540752 tagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 18540663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45733680 - 45733444
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  45733680 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 45733581  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  45733580 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagagg 45733481  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  45733480 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 45733444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5128247 - 5127977
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  5128247 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttg 5128148  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5128147 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 5128048  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5128047 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 5127977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 11424664 - 11424934
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  11424664 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 11424763  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||     
T  11424764 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagtt 11424863  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11424864 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11424934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 10916756 - 10917027
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  10916756 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 10916855  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  10916856 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 10916955  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10916956 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 10917027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 5147228 - 5147498
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5147228 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5147327  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5147328 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5147427  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5147428 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttg 5147498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 16503268 - 16503538
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||  | ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  16503268 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 16503367  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  16503368 atggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 16503467  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16503468 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 16503538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2154828 - 2154558
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||    
T  2154828 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttg 2154729  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  2154728 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 2154629  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2154628 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttg 2154558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 16518304 - 16518574
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||  | ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  16518304 ggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 16518403  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  16518404 atggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 16518503  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16518504 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 16518574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26435512 - 26435242
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  26435512 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 26435413  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  26435412 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 26435313  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26435312 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttg 26435242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 26274982 - 26275252
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  26274982 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttg 26275081  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  26275082 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 26275181  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26275182 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26275252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5126768 - 5126629
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5126768 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 5126669  T
Q  405 ctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5126668 ctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 5126629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 4145011 - 4145281
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  4145011 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 4145110  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  4145111 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 4145210  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  4145211 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 4145281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 26319757 - 26320027
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  26319757 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 26319856  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  26319857 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 26319956  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26319957 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26320027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 31089155 - 31089292
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31089155 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 31089254  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31089255 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 31089292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 16736350 - 16736618
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||    
T  16736350 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgat 16736449  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  16736450 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 16736549  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  16736550 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 16736618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 16751404 - 16751672
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||    
T  16751404 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgat 16751503  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  16751504 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 16751603  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  16751604 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 16751672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17523785 - 17523517
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||    
T  17523785 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgat 17523686  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  17523685 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 17523586  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  17523585 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 17523517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 17529430 - 17529698
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||    
T  17529430 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgat 17529529  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  17529530 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 17529629  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  17529630 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 17529698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3445561 - 3445315
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  3445561 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 3445462  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  3445461 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 3445362  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  3445361 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16040102 - 16039988
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16040102 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 16040003  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  16040002 ttcttcttccatagc 16039988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 16519782 - 16519896
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16519782 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagtagctaactcggtacggagctgagcatt 16519881  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  16519882 ttcttcttccatagc 16519896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 31564280 - 31564526
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  31564280 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 31564379  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  31564380 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 31564479  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  31564480 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 45387598 - 45387328
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  45387598 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 45387499  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  45387498 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 45387399  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  45387398 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 45387328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11440334 - 11440197
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11440334 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 11440235  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11440234 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 11440197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 45732912 - 45732775
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45732912 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 45732813  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  45732812 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 45732775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9618906 - 9618636
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  9618906 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 9618807  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  9618806 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 9618707  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  9618706 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9618636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 16451362 - 16451476
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | ||    
T  16451362 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgcacatt 16451461  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  16451462 ttcttcttccatagc 16451476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 26669802 - 26670072
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  26669802 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 26669901  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  26669902 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 26670001  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26670002 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26670072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3444068 - 3443931
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3444068 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 3443969  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3443968 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 3443931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 10918232 - 10918343
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  10918232 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgatatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctaagcatt 10918331  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  10918332 ctcttcttccat 10918343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 4146531 - 4146629
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4146531 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4146629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9617386 - 9617288
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9617386 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 9617288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 16504746 - 16504860
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16504746 tggctgattgttcctgagtggctagaagagtagtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagtagctaactcggtacggagctgagcatt 16504845  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  16504846 ttcttcttccatagc 16504860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 24593949 - 24594047
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24593949 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 24594047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 26276502 - 26276600
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26276502 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26276600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 26321277 - 26321375
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321277 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26321375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 26537758 - 26538004
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  26537758 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 26537857  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| |||     
T  26537858 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagtt 26537957  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  26537958 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 26671322 - 26671420
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26671322 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26671420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 45386078 - 45385980
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45386078 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 45385980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11441827 - 11441590
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  11441827 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 11441728  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  11441727 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 11441628  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaa 265  Q
    || || || || || || | ||||||||| ||||||||    
T  11441627 ggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaa 11441590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4200802 - 4200682
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4200802 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 4200703  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtc 148  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  4200702 atggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 16737868 - 16737966
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737868 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcagtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16737966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 16752922 - 16753020
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752922 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcagtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16753020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17522267 - 17522169
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17522267 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcagtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17522169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 17530948 - 17531046
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17530948 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcagtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17531046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2153346 - 2153237
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2153346 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcattct 2153247  T
Q  407 cttcttccat 416  Q
    ||||||||||    
T  2153246 cttcttccat 2153237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 24592429 - 24592699
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  24592429 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 24592528  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||     
T  24592529 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagtt 24592628  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  24592629 ggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 24592699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 307 - 416
Target Start/End: Original strand, 11426145 - 11426254
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11426145 gctgattgttcttgagcggctagcagggcagtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 11426244  T
Q  407 cttcttccat 416  Q
    ||||||||||    
T  11426245 cttcttccat 11426254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31125173 - 31124905
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  31125173 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 31125074  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  31125073 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 31124974  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  31124973 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 31124905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5159772 - 5159503
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || |  ||||||||  | | ||| |||||||    
T  5159772 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgat 5159673  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  5159672 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 5159573  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  5159572 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 5159503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 26539229 - 26539361
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| ||||| || | ||||||||||    
T  26539229 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatggcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagttgcgtgttctcttct 26539328  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26539329 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26539361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 148
Target Start/End: Original strand, 26682953 - 26683008
Alignment:
Q  93 tagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682953 tagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 26487100 - 26487232
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  26487100 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 26487199  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487200 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26487232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 5148769 - 5148828
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5148769 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttccttcttctgtattctctg 5148828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 31565828 - 31565887
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31565828 tcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31565887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26434044 - 26433912
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  26434044 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 26433945  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26433944 tccatagcccttttctttcttctgtactctctg 26433912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31123698 - 31123566
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||| ||||||    
T  31123698 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttttcttct 31123599  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31123598 tccatagcccttttctttcttctgtactctctg 31123566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5120200 - 5120115
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5120200 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttccaccatagcctttttccttcttctgtattctctg 5120115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28152115 - 28151724
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28152115 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 28152016  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152015 atggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 28151916  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  28151915 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcg 28151816  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 416  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  28151815 gctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 28151724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 299
Target Start/End: Original strand, 20340341 - 20340608
Alignment:
Q  32 attgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatgg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20340341 attgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgg 20340440  T
Q  132 aaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20340441 aaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttggga 20340540  T
Q  232 gtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20340541 gtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttga 20340608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 16208033 - 16208300
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16208033 ggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 16208132  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208133 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 16208232  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 295  Q
    ||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16208233 gggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttg 16208300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 63 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20461299 - 20461070
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461299 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 20461200  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20461199 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggagg 20461100  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20461099 aaaggtaggtctagcttgttgctgttgttg 20461070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10962923 - 10962653
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  10962923 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 10962824  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | |||     
T  10962823 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagtt 10962724  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  10962723 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 10962653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 41793312 - 41793580
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  | ||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  41793312 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 41793411  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  41793412 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 41793511  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  41793512 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 41793580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 306 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20459881 - 20459768
Alignment:
Q  306 ggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  20459881 ggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcattt 20459782  T
Q  406 tcttcttccatagc 419  Q
    ||||||||||||||    
T  20459781 tcttcttccatagc 20459768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 16209505 - 16209619
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16209505 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 16209604  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  16209605 ttcctcttccatagc 16209619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 20341120 - 20341234
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20341120 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtattattagccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 20341219  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  20341220 ttcttcttccatagc 20341234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28585234 - 28584964
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  28585234 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 28585135  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28585134 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 28585035  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  28585034 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 28584964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 51638469 - 51638201
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  51638469 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 51638370  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  51638369 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 51638270  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  51638269 aagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 51638201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10961403 - 10961305
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10961403 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 10961305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28583714 - 28583616
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28583714 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28583616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 41794830 - 41794928
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41794830 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 41794928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51636951 - 51636853
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51636951 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 51636853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 125)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 32292967 - 32292576
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32292967 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 32292868  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292867 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 32292768  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  32292767 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctaggcg 32292668  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 416  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  32292667 gctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 32292576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 416
Target Start/End: Original strand, 31034160 - 31034551
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31034160 ggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 31034259  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034260 atggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 31034359  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcg 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  31034360 gggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcg 31034459  T
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 416  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  31034460 gctagcagagcagtcatggtatcattggccttagctaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 31034551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18530568 - 18530339
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530568 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 18530469  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  18530468 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggagg 18530369  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18530368 aaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg 18530339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 16626584 - 16626820
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626584 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 16626683  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  16626684 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggagg 16626783  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16626784 aaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttga 16626820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4626124 - 4625888
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  4626124 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 4626025  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  4626024 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 4625925  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4625924 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 4625888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5652567 - 5652331
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  5652567 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 5652468  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5652467 gaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 5652368  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  5652367 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 5652331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 17993862 - 17994098
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  17993862 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgg 17993961  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  17993962 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 17994061  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  17994062 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 17994098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 15892749 - 15893019
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  15892749 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 15892848  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  15892849 atggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 15892948  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15892949 ggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttg 15893019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8296187 - 8295916
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  8296187 ggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 8296088  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||    
T  8296087 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtc 8295988  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  8295987 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 8295916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6192531 - 6192261
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  6192531 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 6192432  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  6192431 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 6192332  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6192331 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 6192261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 15741137 - 15741407
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  15741137 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttg 15741236  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  15741237 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 15741336  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15741337 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 15741407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18330884 - 18330614
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  18330884 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 18330785  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  |||    
T  18330784 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtc 18330685  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18330684 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18330614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 8301310 - 8301581
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || || ||||||||| |||| || |||||    
T  8301310 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttg 8301409  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  8301410 atggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 8301509  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  8301510 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 8301581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18051477 - 18051207
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  18051477 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 18051378  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    || ||||||||| ||||| || || | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  18051377 atagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 18051278  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18051277 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18051207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 18277095 - 18277365
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18277095 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18277194  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18277195 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18277294  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18277295 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18277365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 18292396 - 18292666
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18292396 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18292495  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18292496 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18292595  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18292596 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18292666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 18307697 - 18307967
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18307697 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18307796  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18307797 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18307896  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18307897 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18307967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 29148798 - 29149068
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  29148798 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 29148897  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  29148898 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 29148997  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29148998 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 29149068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796966
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  4796696 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 4796795  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  4796796 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 4796895  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4796896 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 4796966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 22387621 - 22387892
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  22387621 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 22387720  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  22387721 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 22387820  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  22387821 ggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtctagcatattgttgctgctgctgttga 22387892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4721846 - 4721576
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| || || || || ||| |||| | |||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  4721846 ggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 4721747  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| || | |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  4721746 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 4721647  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4721646 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 4721576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7073427 - 7073157
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  7073427 ggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 7073328  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  7073327 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagtt 7073228  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  7073227 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 7073157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4417134 - 4416864
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||    
T  4417134 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctg 4417035  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  4417034 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 4416935  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  4416934 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 4416864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 6542507 - 6542753
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  6542507 acattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 6542606  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  6542607 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 6542706  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  6542707 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10396348 - 10396078
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  10396348 ggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 10396249  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| |||     
T  10396248 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 10396149  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10396148 ggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 10396078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 28115997 - 28116267
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||    
T  28115997 ggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttg 28116096  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28116097 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 28116196  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || |  |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28116197 ggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 28116267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35880981 - 35880711
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || || |||||    
T  35880981 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttg 35880882  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  35880881 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 35880782  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35880781 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 35880711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4625356 - 4625219
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4625356 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 4625257  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4625256 cttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 4625219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 5609367 - 5609635
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || |||||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  5609367 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 5609466  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  5609467 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 5609566  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  5609567 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 5609635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 17985001 - 17985269
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  17985001 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 17985100  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| || || ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| ||    
T  17985101 gaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttgg 17985200  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17985201 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 17985269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28339515 - 28339247
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | | |||||||||||    
T  28339515 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgat 28339416  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  28339415 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 28339316  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  28339315 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 28339247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 4346730 - 4347001
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  4346730 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 4346829  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  4346830 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 4346929  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  4346930 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 4347001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21674905 - 21674638
Alignment:
Q  31 cattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatg 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  |||||||||||    
T  21674905 cattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 21674806  T
Q  131 gaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggg 230  Q
     |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||     
T  21674805 aaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttgga 21674706  T
Q  231 agtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21674705 agaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttg 21674638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5713442 - 5713172
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5713442 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5713343  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5713342 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5713243  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  5713242 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttg 5713172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5724352 - 5724082
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5724352 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5724253  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5724252 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5724153  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  5724152 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttg 5724082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 5757125 - 5757395
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5757125 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5757224  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5757225 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5757324  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  5757325 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttg 5757395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 5768016 - 5768286
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5768016 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5768115  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5768116 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 5768215  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  5768216 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttg 5768286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 11110392 - 11110638
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  11110392 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 11110491  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  11110492 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 11110591  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  11110592 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 309 - 419
Target Start/End: Original strand, 15894232 - 15894342
Alignment:
Q  309 tgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctct 408  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15894232 tgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagtagctaactcggtacggagctgagcgttttct 15894331  T
Q  409 tcttccatagc 419  Q
    |||||||||||    
T  15894332 tcttccatagc 15894342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 36997120 - 36997366
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  36997120 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 36997219  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  36997220 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 36997319  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  36997320 ggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4720365 - 4720228
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4720365 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 4720266  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4720265 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 4720228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6191050 - 6190913
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6191050 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 6190951  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6190950 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 6190913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 31964518 - 31964786
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  31964518 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 31964617  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  31964618 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 31964717  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  31964718 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31964786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 50134116 - 50134384
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  50134116 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 50134215  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  50134216 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 50134315  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  50134316 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 50134384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5712636 - 5712499
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5712636 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 5712537  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5712536 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 5712499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5723546 - 5723409
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5723546 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 5723447  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5723446 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 5723409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 5757919 - 5758056
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5757919 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 5758018  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5758019 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 5758056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 5768822 - 5768959
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5768822 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 5768921  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5768922 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 5768959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18329408 - 18329271
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18329408 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 18329309  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  18329308 cttcttccatagcctttttccttcttctatattctctg 18329271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 47023666 - 47023398
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  47023666 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 47023567  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  47023566 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 47023467  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  47023466 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 47023398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 22870901 - 22871148
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  22870901 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 22871000  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  22871001 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 22871100  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 277  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22871101 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 22885960 - 22886207
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  22885960 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 22886059  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  22886060 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 22886159  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 277  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22886160 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5649575 - 5649461
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  5649575 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 5649476  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  5649475 ttcctcttccatagc 5649461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 15335489 - 15335603
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15335489 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttggccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 15335588  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  15335589 ttcttcttccatagc 15335603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 415
Target Start/End: Original strand, 15728337 - 15728447
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  15728337 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgaacatt 15728436  T
Q  405 ctcttcttcca 415  Q
     ||||||||||    
T  15728437 ttcttcttcca 15728447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 307 - 437
Target Start/End: Original strand, 17994630 - 17994760
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17994630 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 17994729  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgta 437  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17994730 cttcttccatagcctttttccttcttctgta 17994760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18225406 - 18225136
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  18225406 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 18225307  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||     
T  18225306 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagtt 18225207  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  18225206 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttg 18225136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 20576890 - 20577160
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  20576890 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 20576989  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  20576990 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 20577089  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  20577090 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgatgctgctgttgttg 20577160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 29665013 - 29665259
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||    
T  29665013 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttg 29665112  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  29665113 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 29665212  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  29665213 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48466142 - 48465896
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  48466142 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 48466043  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  48466042 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagtt 48465943  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  48465942 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 29150279 - 29150415
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29150279 gctgattgttcttgagcggctagtagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 29150378  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29150379 cttcttccatag-ccttttttttcttctgtattctctg 29150415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 36998613 - 36998750
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36998613 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 36998712  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36998713 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 36998750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7996775 - 7996507
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  7996775 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 7996676  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  7996675 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 7996576  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  7996575 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 7996507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10643283 - 10643015
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  10643283 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 10643184  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  10643183 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 10643084  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  10643083 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 10643015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4686778 - 4686664
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  4686778 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtattattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 4686679  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  4686678 ttcctcttccatagc 4686664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4886246 - 4886132
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4886246 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 4886147  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  4886146 ttcttcttccatagc 4886132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18529128 - 18529014
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18529128 tggctgattattcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 18529029  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  18529028 ttcctcttccatagc 18529014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 331 - 444
Target Start/End: Original strand, 50135619 - 50135732
Alignment:
Q  331 agagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttc 430  Q
    ||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50135619 agagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttc 50135718  T
Q  431 ttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||    
T  50135719 ttctgtattctctg 50135732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51782236 - 51782052
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  51782236 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 51782137  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 214  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782136 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 8302783 - 8302894
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8302783 tggctgattgttcctgagcggctagcagagctgtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 8302882  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     |||||||||||    
T  8302883 ttcttcttccat 8302894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28021490 - 28021219
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||| | | |  ||||||||    
T  28021490 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttg 28021391  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28021390 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagtt 28021291  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  28021290 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 28021219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 35879502 - 35879391
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35879502 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 35879403  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  35879402 ctcttcttccat 35879391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5012407 - 5012309
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5012407 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 5012309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 5596402 - 5596648
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  5596402 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 5596501  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  5596502 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttgg 5596601  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || || || ||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5596602 aagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 5610885 - 5610983
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5610885 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 5610983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 306 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8294710 - 8294600
Alignment:
Q  306 ggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttc 405  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8294710 ggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttaaagtggctaactcggtacggagctgagcattc 8294611  T
Q  406 tcttcttccat 416  Q
    |||||||||||    
T  8294610 tcttcttccat 8294600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24326854 - 24326756
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24326854 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 24326756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28337998 - 28337900
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28337998 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28337900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 31966036 - 31966134
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31966036 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31966134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8211953 - 8211716
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  8211953 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 8211854  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | ||||||||     
T  8211853 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagtt 8211754  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaa 265  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8211753 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaa 8211716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5013925 - 5013657
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  5013925 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 5013826  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| ||    
T  5013825 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttgg 5013726  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || || || | ||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  5013725 aagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 5013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 4798175 - 4798286
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4798175 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 4798274  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  4798275 ctcttcttccat 4798286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5467200 - 5466953
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5467200 ggacattattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5467101  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  5467100 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 5467001  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtcta 275  Q
    || || || || ||||| | ||| |||||  ||||||| || ||||||    
T  5467000 ggaaggagttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttggtcta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 373 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7995230 - 7995159
Alignment:
Q  373 agagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7995230 agagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 7995159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 373 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10641738 - 10641667
Alignment:
Q  373 agagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10641738 agagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 10641667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18049998 - 18049887
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18049998 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 18049899  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  18049898 ctcttcttccat 18049887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4415611 - 4415513
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4415611 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttttttcttctgtattctctg 4415513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 17986519 - 17986617
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17986519 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17986617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18223886 - 18223788
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18223886 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18223788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51797326 - 51797141
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  51797326 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 51797227  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacc-tgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 214  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797226 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 308 - 416
Target Start/End: Original strand, 15742599 - 15742707
Alignment:
Q  308 ctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctc 407  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15742599 ctgattgttcttgagcggctagcagggcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcattctc 15742698  T
Q  408 ttcttccat 416  Q
    |||||||||    
T  15742699 ttcttccat 15742707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18242952 - 18242684
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  18242952 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 18242853  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| ||    
T  18242852 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttgg 18242753  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  18242752 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 18242684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 16628006 - 16628119
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||    
T  16628006 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatagtgtcattggcctt-atcaattcttccctcagagaagctaactcggtatggagctgagcatt 16628104  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  16628105 ttcctcttccatagc 16628119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 308 - 416
Target Start/End: Original strand, 14448442 - 14448550
Alignment:
Q  308 ctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctc 407  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14448442 ctgattgttcttgagcggctancagagcagtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcattctc 14448541  T
Q  408 ttcttccat 416  Q
    |||||||||    
T  14448542 ttcttccat 14448550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24328372 - 24328104
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  24328372 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 24328273  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  24328272 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttgg 24328173  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  24328172 aagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 24328104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32439367 - 32439098
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||    
T  32439367 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgat 32439268  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  32439267 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 32439168  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  32439167 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 32439098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 4348195 - 4348327
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  4348195 ttgttcctgagcagctaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 4348294  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4348295 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4348327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 28117541 - 28117600
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28117541 tcggtacggagctgagagttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28117600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7071959 - 7071827
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  7071959 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagctgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 7071860  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071859 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 7071827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20066254 - 20066010
Alignment:
Q  32 attgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatgg 131  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||||    
T  20066254 attgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatgg 20066155  T
Q  132 aaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggga 231  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  |  | ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |    
T  20066154 aagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaa 20066055  T
Q  232 gtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  20066054 gaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28020025 - 28019893
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  28020025 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 28019926  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28019925 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28019893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 18278636 - 18278695
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18278636 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18278695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 18293937 - 18293996
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18293937 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18293996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 18309238 - 18309297
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18309238 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18309297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 22389081 - 22389218
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||| |||||| || || || |||||||| ||||| | |||||  || ||| ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | |||||    
T  22389081 gctggttgttcttgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttagccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttct 22389180  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22389181 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 22389218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 32437857 - 32437772
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32437857 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 32437772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51780693 - 51780608
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51780693 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 51780608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51795780 - 51795695
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51795780 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 51795695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 6543985 - 6544117
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  6543985 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 6544084  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6544085 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 6544117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18241474 - 18241342
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  18241474 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 18241375  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18241374 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18241342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 22872385 - 22872517
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  22872385 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 22872484  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22872485 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 22872517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 22887444 - 22887576
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  22887444 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 22887543  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22887544 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 22887576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 5597950 - 5598009
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5597950 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 5598009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8210415 - 8210356
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8210415 tcggtacgaagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 8210356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10394810 - 10394751
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10394810 tcggtacgaagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 10394751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 20578446 - 20578505
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20578446 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 20578505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4891913 - 4891831
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattct 441  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4891913 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattct 4891831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Original strand, 29666586 - 29666628
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29666586 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 29666628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 47022110 - 47022068
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47022110 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 47022068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4893330 - 4893154
Alignment:
Q  123 ccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 222  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | ||||    
T  4893330 ccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagta 4893231  T
Q  223 gagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
     ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  4893230 aagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 4893154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5465732 - 5465600
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  5465732 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 5465633  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5465632 tccatagcccttttctttcttctgtgttctctg 5465600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 11111945 - 11112004
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11111945 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 11112004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21673367 - 21673308
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21673367 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 21673308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 48464589 - 48464530
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48464589 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 48464530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 419
Target Start/End: Original strand, 16467862 - 16467912
Alignment:
Q  369 cctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 419  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16467862 cctcagagaagctaactcggtacggagctgagcattttcttcttccatagc 16467912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 21703155 - 21703426
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21703155 ggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttg 21703254  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703255 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 21703354  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703355 gggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 21703426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 19456447 - 19456683
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456447 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 19456546  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19456547 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 19456646  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19456647 aaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttga 19456683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 34303329 - 34303565
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  34303329 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 34303428  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  34303429 gaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 34303528  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34303529 aaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttga 34303565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27118903 - 27118667
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27118903 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 27118804  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||    
T  27118803 gaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagg 27118704  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27118703 gaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttga 27118667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27393219 - 27392952
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  27393219 ggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttg 27393120  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  27393119 atggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtc 27393020  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 295  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  27393019 gggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgttgttg 27392952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34157217 - 34156990
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaaca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |      
T  34157217 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 34157118  T
Q  172 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtagg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34157117 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 34157018  T
Q  272 tctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  34157017 tctagcctgttgctgctgtcgttgttga 34156990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3784869 - 3784633
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3784869 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 3784770  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  3784769 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 3784670  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  3784669 aaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttga 3784633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16163814 - 16163578
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16163814 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 16163715  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  16163714 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 16163615  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  16163614 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 16163578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 31891354 - 31891590
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||| |    
T  31891354 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttg 31891453  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  31891454 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 31891553  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31891554 aaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttga 31891590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20838168 - 20837898
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  20838168 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 20838069  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  20838068 atggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 20837969  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20837968 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 20837898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12655792 - 12655522
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  12655792 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 12655693  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  12655692 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 12655593  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12655592 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 12655522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 23128557 - 23128827
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  23128557 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 23128656  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  23128657 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 23128756  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23128757 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 23128827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 27434435 - 27434705
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  27434435 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 27434534  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| || |    
T  27434535 atggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagcc 27434634  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27434635 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 27434705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28882464 - 28882194
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  28882464 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 28882365  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28882364 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 28882265  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28882264 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 28882194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40233759 - 40233515
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40233759 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgat 40233660  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  40233659 ggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 40233560  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
     || ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  40233559 aagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34279698 - 34279429
Alignment:
Q  29 gacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttga 128  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || |||||||||    
T  34279698 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttga 34279599  T
Q  129 tggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 228  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| |    
T  34279598 tgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttg 34279499  T
Q  229 ggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    | || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34279498 gaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 34279429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 21677175 - 21677443
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  21677175 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 21677274  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  21677275 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 21677374  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  21677375 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 21677443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 31892122 - 31892259
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31892122 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 31892221  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31892222 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 31892259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34286602 - 34286334
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||    
T  34286602 acattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgat 34286503  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  34286502 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 34286403  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34286402 aagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 34286334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34291662 - 34291394
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||    
T  34291662 acattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgat 34291563  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  34291562 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 34291463  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34291462 aagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 34291394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 21704631 - 21704745
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21704631 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 21704730  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  21704731 ttcttcttccatagc 21704745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 27435913 - 27436027
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27435913 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctgagagtagctaactcggtacggagctgagcgtt 27436012  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  27436013 ttcttcttccatagc 27436027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 260744 - 260981
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  260744 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 260843  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  260844 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 260943  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaa 265  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  260944 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaa 260981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34156458 - 34156321
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34156458 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 34156359  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34156358 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 34156321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 11635179 - 11635447
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||  |||||||| || |||||| |||| || || || || || ||||||||| | |  ||||| ||||    
T  11635179 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgat 11635278  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  11635279 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 11635378  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11635379 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11635447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 22926021 - 22926289
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  22926021 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 22926120  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  22926121 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 22926220  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  22926221 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 22926289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37375411 - 37375163
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  37375411 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 37375312  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  37375311 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 37375212  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  37375211 ggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 16829329 - 16829599
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  16829329 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 16829428  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  ||     
T  16829429 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggtt 16829528  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  16829529 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 16829599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16892152 - 16891882
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  16892152 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 16892053  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  ||     
T  16892052 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggtt 16891953  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  16891952 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 16891882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34861930 - 34861660
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  34861930 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 34861831  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  34861830 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 34861731  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  34861730 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 34861660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 37685900 - 37686170
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  37685900 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 37685999  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  37686000 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 37686099  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  37686100 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 37686170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 37701165 - 37701435
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  37701165 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 37701264  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  37701265 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 37701364  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  37701365 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 37701435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37925743 - 37925473
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  37925743 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 37925644  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||| || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  37925643 atggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 37925544  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  37925543 ggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 37925473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3784101 - 3783964
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3784101 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 3784002  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  3784001 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 3783964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 12718077 - 12718214
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12718077 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 12718176  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718177 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 12718214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16163046 - 16162909
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16163046 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 16162947  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16162946 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 16162909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 11641368 - 11641636
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||  |||||||| || |||||| |||| || || || || || ||||||||| | |  ||||| ||||    
T  11641368 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgat 11641467  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  11641468 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 11641567  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11641568 aagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11641636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 13936535 - 13936809
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  13936535 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 13936634  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  13936635 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 13936734  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||   |||||||||||||||    
T  13936735 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgactttgctgttgttgttga 13936809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32050046 - 32049778
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  32050046 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 32049947  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  32049946 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 32049847  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  32049846 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 32049778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31876531 - 31876261
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  31876531 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 31876432  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  31876431 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 31876332  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || || || | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  31876331 ggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31876261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 34304077 - 34304191
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  34304077 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 34304176  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  34304177 ttcctcttccatagc 34304191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 12716595 - 12716863
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  12716595 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 12716694  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  12716695 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 12716794  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  12716795 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgttgttgttg 12716863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 27118155 - 27118044
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27118155 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 27118056  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     || ||||||||    
T  27118055 ttcctcttccat 27118044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27777472 - 27777226
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  27777472 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 27777373  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  27777372 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 27777273  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  27777272 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27817230 - 27816984
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  27817230 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 27817131  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  27817130 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 27817031  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  27817030 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 312 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 27391776 - 27391672
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  27391776 ttgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcattttcttct 27391677  T
Q  412 tccat 416  Q
    |||||    
T  27391676 tccat 27391672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 23136863 - 23136974
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23136863 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 23136962  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  23136963 ctcttcttccat 23136974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27803957 - 27803687
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||    
T  27803957 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttg 27803858  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  27803857 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 27803758  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |  | ||| ||||| ||||||||    
T  27803757 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgntgttgttg 27803687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28880985 - 28880874
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28880985 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 28880886  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  28880885 ctcttcttccat 28880874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 11636699 - 11636797
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11636699 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 11636797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 11642888 - 11642986
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11642888 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 11642986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12587060 - 12586814
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || |||||||||||||||||| | |  ||||||||    
T  12587060 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttg 12586961  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  12586960 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 12586861  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || ||   ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  12586860 ggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 19457870 - 19457984
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19457870 tggctgattgttcctgggcagccaacagagcagtcatggtgtcgttggtcttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 19457969  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  19457970 ttcttcttccatagc 19457984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 21678693 - 21678791
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678693 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 21678791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 22927539 - 22927637
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22927539 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 22927637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31875011 - 31874913
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31875011 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31874913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34860410 - 34860312
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34860410 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 34860312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 37687420 - 37687518
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37687420 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37687518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 37702685 - 37702783
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37702685 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37702783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37924223 - 37924125
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37924223 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37924125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 39051813 - 39052059
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||    
T  39051813 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttg 39051912  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  39051913 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 39052012  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  39052013 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20836689 - 20836578
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20836689 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 20836590  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     |||||||||||    
T  20836589 ttcttcttccat 20836578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 16830849 - 16830947
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16830849 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16830947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16890632 - 16890534
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16890632 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16890534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 19418010 - 19418108
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418010 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19418108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 32048528 - 32048430
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32048528 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 32048430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37373943 - 37373811
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37373943 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagatgccaattcggtgcggagctgagcgttctcttct 37373844  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373843 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37373811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12654313 - 12654202
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12654313 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaatacttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 12654214  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     |||||||||||    
T  12654213 ttcttcttccat 12654202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 9349973 - 9350219
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  9349973 ggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 9350072  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  9350073 atgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 9350172  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  9350173 ggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39890322 - 39890054
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||  || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  39890322 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 39890223  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||  | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || ||    
T  39890222 gaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttgg 39890123  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  39890122 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 39890054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 19416492 - 19416760
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  19416492 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 19416591  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  19416592 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttgg 19416691  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||| ||||| ||||| || || || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  19416692 aagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 19416760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34278231 - 34278099
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  34278231 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagctgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 34278132  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34278131 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 34278099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 39053288 - 39053420
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  39053288 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagttgcgcgttctcttct 39053387  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053388 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 39053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40232208 - 40232149
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40232208 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 40232149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 9351526 - 9351585
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9351526 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 9351585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 40191084 - 40191143
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40191084 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 40191143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Original strand, 262312 - 262354
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  262312 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 262354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12585493 - 12585451
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12585493 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 12585451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27802384 - 27802342
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27802384 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27802342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 444
Target Start/End: Original strand, 13938082 - 13938135
Alignment:
Q  391 cggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13938082 cggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 13938135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27775916 - 27775857
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27775916 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 27775857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27815683 - 27815624
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27815683 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 27815624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39888754 - 39888712
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39888754 gttctcttcctccatagcccttttctttcttctgtattctctg 39888712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 63 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 33244884 - 33244525
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  33244884 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttag 33244785  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  33244784 gaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagagg 33244685  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaac 359  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  33244684 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtattattggccttagc 33244585  T
Q  360 caattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 419  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33244584 caattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcattttcttcttccatagc 33244525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44563311 - 44563084
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaaca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |      
T  44563311 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 44563212  T
Q  172 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtagg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44563211 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtagg 44563112  T
Q  272 tctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  44563111 tctagcttgttgctgctgtcgttgttga 44563084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Original strand, 19659044 - 19659271
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaaca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||     
T  19659044 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacg 19659143  T
Q  172 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtagg 271  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19659144 ggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 19659243  T
Q  272 tctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  19659244 tctagcctgttgctgctgtcgttgttga 19659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 22080839 - 22081106
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  22080839 ggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttg 22080938  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  22080939 atggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtc 22081038  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 295  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  22081039 gggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgctgttg 22081106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9354832 - 9354605
Alignment:
Q  72 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaaca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |      
T  9354832 tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatg 9354733  T
Q  172 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtagg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9354732 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtagg 9354633  T
Q  272 tctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  9354632 tctagcctgttgctgctgtcgttgttga 9354605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16283703 - 16283433
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||    
T  16283703 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttg 16283604  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||    
T  16283603 atggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtc 16283504  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16283503 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttg 16283433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16277808 - 16277538
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  16277808 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 16277709  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  16277708 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 16277609  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16277608 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 16277538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 27608866 - 27609136
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  27608866 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttg 27608965  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  27608966 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 27609065  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27609066 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 27609136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14557878 - 14557607
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  14557878 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 14557779  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  14557778 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 14557679  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14557678 ggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 14557607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19688352 - 19688082
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  19688352 ggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttg 19688253  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  19688252 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 19688153  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19688152 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 19688082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Original strand, 2137221 - 2137490
Alignment:
Q  29 gacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttga 128  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||  || ||||||    
T  2137221 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttga 2137320  T
Q  129 tggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 228  Q
    || |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||    
T  2137321 tgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcg 2137420  T
Q  229 ggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    | || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2137421 gaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 2137490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 31489711 - 31489981
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  31489711 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 31489810  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  31489811 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 31489910  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  31489911 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31489981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16282227 - 16282113
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16282227 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 16282128  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  16282127 ttcttcttccatagc 16282113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18710840 - 18710570
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | || ||||| ||    
T  18710840 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctg 18710741  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| | |||||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  18710740 atgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 18710641  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  18710640 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 18710570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19674695 - 19674425
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || |  |||||||||||| | |  ||||| ||    
T  19674695 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctg 19674596  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  19674595 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 19674496  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  19674495 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 19674425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44562552 - 44562415
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44562552 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtgcgaagctgagcgttct 44562453  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44562452 cttcttccatagcccttttccttcttctgtactctctg 44562415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 12092687 - 12092933
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  12092687 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 12092786  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||    
T  12092787 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 12092886  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  12092887 aagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 19208321 - 19208591
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  19208321 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 19208420  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  19208421 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 19208520  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  19208521 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 19208591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9354073 - 9353936
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9354073 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 9353974  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9353973 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 9353936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31354776 - 31354508
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  31354776 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgat 31354677  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  31354676 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 31354577  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  31354576 aagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31354508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 21374979 - 21375090
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21374979 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 21375078  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  21375079 ctcttcttccat 21375090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 27610345 - 27610456
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27610345 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttccctcagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 27610444  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  27610445 ctcttcttccat 27610456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 3329470 - 3329716
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  3329470 acattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 3329569  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  3329570 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 3329669  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  3329670 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 19659783 - 19659897
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19659783 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 19659882  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  19659883 ttcctcttccatagc 19659897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 28361916 - 28362186
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  28361916 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 28362015  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  28362016 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 28362115  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  28362116 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 28362186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29829574 - 29829328
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  29829574 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 29829475  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  29829474 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttgg 29829375  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || || || || || | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  29829374 aagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14556402 - 14556291
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14556402 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 14556303  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  14556302 ctcttcttccat 14556291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 2138699 - 2138810
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2138699 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 2138798  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  2138799 ctcttcttccat 2138810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16276329 - 16276218
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16276329 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 16276230  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  16276229 ctcttcttccat 16276218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 19209841 - 19209939
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19209841 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19209939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 31491231 - 31491329
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31491231 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31491329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33257457 - 33257359
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33257457 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 33257359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 375 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18709291 - 18709222
Alignment:
Q  375 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18709291 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 18709222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 416
Target Start/End: Original strand, 22082301 - 22082405
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  22082301 ttgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcaaagaagctaactcggtacggagctgagcattttcttct 22082400  T
Q  412 tccat 416  Q
    |||||    
T  22082401 tccat 22082405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19286714 - 19286468
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  19286714 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 19286615  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  19286614 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 19286515  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  19286514 aagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 28363436 - 28363534
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28363436 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagctcttttctttcttctgtattctctg 28363534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33258977 - 33258707
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  33258977 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 33258878  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||     
T  33258877 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagtt 33258778  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  33258777 ggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 33258707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31353243 - 31353158
Alignment:
Q  359 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31353243 ccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtactctctg 31353158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19686873 - 19686762
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19686873 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagctaactcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 19686774  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  19686773 ctcttcttccat 19686762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 3330949 - 3331081
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | |||||||||     
T  3330949 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttcc 3331048  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3331049 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 3331081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Original strand, 12094162 - 12094294
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  12094162 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 12094261  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12094262 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 12094294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 19279989 - 19280048
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19279989 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19280048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19285178 - 19285119
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19285178 tcggtacggagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19285119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29828020 - 29827967
Alignment:
Q  391 cggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29828020 cggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 29827967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Original strand, 19519662 - 19519704
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19519662 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19519704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19673134 - 19673092
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19673134 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19673092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 189348 - 189256
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagag 120  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  189348 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 299
Target Start/End: Original strand, 2664 - 2931
Alignment:
Q  32 attgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatgg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2664 attgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgg 2763  T
Q  132 aaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2764 aaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttggga 2863  T
Q  232 gtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2864 gtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttga 2931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 3443 - 3557
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3443 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtattattagccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 3542  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  3543 ttcttcttccatagc 3557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20641 - 20375
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20641 ggacattgttctcaaaagttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 20543  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20542 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 20443  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 295  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20442 gggagtaactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttg 20375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30706 - 30437
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  30706 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 30607  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  ||     
T  30606 atgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggtt 30507  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30506 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaa-gtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 30437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 306 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29227 - 29117
Alignment:
Q  306 ggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttc 405  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  ||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29227 ggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcgttagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttc 29128  T
Q  406 tcttcttccat 416  Q
    |||||||||||    
T  29127 tcttcttccat 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19184 - 19073
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagc-gttc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||  ||     
T  19184 gctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggctttagccaattcttccctcaaagaagctaactcggtacagagctgagctattt 19085  T
Q  406 tcttcttccata 417  Q
    ||||||||||||    
T  19084 tcttcttccata 19073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15228131 - 15227868
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15228131 ttctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaat 15228032  T
Q  136 cacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtag 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15228031 cacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaa 15227932  T
Q  236 ctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15227931 ctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttga 15227868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 15284965 - 15285201
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15284965 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgg 15285064  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  15285065 gaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggagg 15285164  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15285165 aaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttga 15285201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1900526 - 1900255
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1900526 ggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttg 1900427  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900426 atggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 1900327  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1900326 gggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttga 1900255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 24460642 - 24460878
Alignment:
Q  63 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24460642 atgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgg 24460741  T
Q  163 gaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtagctcagcatatagcattggtatcggagg 262  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  24460742 gaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagagg 24460841  T
Q  263 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  24460842 aaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttga 24460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 15391340 - 15391607
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  15391340 ggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttg 15391439  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  15391440 atggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtc 15391539  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 295  Q
    ||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  15391540 gggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgttgttg 15391607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 14235527 - 14235797
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  14235527 ggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttg 14235626  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  14235627 atggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtc 14235726  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    ||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14235727 gggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttg 14235797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17014269 - 17013999
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  17014269 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 17014170  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  17014169 atgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtc 17014070  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17014069 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 17013999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 24592316 - 24592587
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  24592316 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 24592415  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  24592416 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtt 24592515  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  24592516 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 24592587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 14763306 - 14763576
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  14763306 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 14763405  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  14763406 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagtt 14763505  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14763506 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14763576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14665279 - 14665017
Alignment:
Q  36 ttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaat 135  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  14665279 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaat 14665180  T
Q  136 cacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtag 235  Q
    |||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || |     
T  14665179 cacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaa 14665080  T
Q  236 ctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14665079 ctcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14665017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6570122 - 6569855
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||    
T  6570122 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttg 6570023  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  6570022 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 6569923  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 295  Q
    || || || || ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  6569922 ggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttg 6569855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14098810 - 14098540
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  14098810 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 14098711  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  14098710 atgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 14098611  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14098610 ggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14098540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 31126520 - 31126790
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  31126520 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 31126619  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||     
T  31126620 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagtt 31126719  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  31126720 ggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31126790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 444
Target Start/End: Original strand, 24593792 - 24593931
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24593792 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 24593891  T
Q  405 ctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24593892 ctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 24593931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 40105640 - 40105910
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  40105640 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 40105739  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  40105740 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 40105839  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  40105840 ggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 40105910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 24461410 - 24461547
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24461410 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtgcgaagctgagcgttct 24461509  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24461510 cttcttccatagcccttttccttcttctgtactctctg 24461547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 36344517 - 36344765
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  36344517 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 36344616  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||     
T  36344617 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagtt 36344716  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
    || || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  36344717 ggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 36344765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5006142 - 5005872
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  5006142 ggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 5006043  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  5006042 atgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 5005943  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  5005942 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 5005872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 33673802 - 33674046
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  33673802 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 33673901  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  33673902 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 33674001  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  33674002 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1899050 - 1898936
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||    
T  1899050 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgtgcatt 1898951  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  1898950 ttcctcttccatagc 1898936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 33678827 - 33678964
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33678827 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 33678926  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33678927 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 33678964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 18800615 - 18800863
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  18800615 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 18800714  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| |||     
T  18800715 atgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagtt 18800814  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
    || || | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  18800815 ggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Original strand, 27163321 - 27163589
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||  |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  27163321 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 27163420  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  27163421 gaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttgg 27163520  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  27163521 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 27163589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 305 - 417
Target Start/End: Original strand, 15286388 - 15286500
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15286388 tggctgattgttcctgggcagccaacagagcagtcatggtgtcgttggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 15286487  T
Q  405 ctcttcttccata 417  Q
     ||||||||||||    
T  15286488 ttcttcttccata 15286500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21969968 - 21969700
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  21969968 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 21969869  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || |||||||||||||| || || || || || || |||||  | |||||||| ||    
T  21969868 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttgg 21969769  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  21969768 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 21969700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30754021 - 30753777
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  30754021 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 30753922  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| ||    
T  30753921 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttgg 30753822  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
     || || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||    
T  30753821 aagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39850905 - 39850661
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  39850905 acattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgat 39850806  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  39850805 gaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 39850706  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 274  Q
     || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  39850705 aagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 17012790 - 17012679
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17012790 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 17012691  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  17012690 ctcttcttccat 17012679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14097290 - 14097192
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14097290 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 14097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30752530 - 30752393
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30752530 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 30752431  T
Q  407 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30752430 cttcttccatagcccttttccttcttctgtactctctg 30752393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 416
Target Start/End: Original strand, 15392804 - 15392908
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  15392804 ttgttcctgggtggctagcagagcagtcatggtctcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcattttcttct 15392903  T
Q  412 tccat 416  Q
    |||||    
T  15392904 tccat 15392908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14663808 - 14663697
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14663808 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 14663709  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     |||||||||||    
T  14663708 ttcttcttccat 14663697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21968450 - 21968352
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21968450 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 21968352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 31128040 - 31128138
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128040 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31128138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 40107160 - 40107258
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40107160 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgctctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 40107258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54833654 - 54833408
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  54833654 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 54833555  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| ||    
T  54833554 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 54833455  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctag 276  Q
     || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  54833454 aagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 34188964 - 34189233
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | |||||||||||    
T  34188964 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgat 34189063  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  34189064 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 34189163  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  34189164 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 34189233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24112929 - 24112660
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | ||| |||||||    
T  24112929 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgat 24112830  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| ||    
T  24112829 ggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttgg 24112730  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  24112729 aagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 24112660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 14236988 - 14237102
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14236988 tggctgcttgttcctgggcggccagcagagcaatcatagtgtcatgagccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 14237087  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     || |||||||||||    
T  14237088 ttcctcttccatagc 14237102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5004598 - 5004539
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5004598 tcggtacggagctgcgagttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 5004539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 14764847 - 14764906
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764847 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 14764906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 36346055 - 36346114
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36346055 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 36346114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 54832118 - 54832059
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54832118 tcggtacggagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 54832059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15222803 - 15222721
Alignment:
Q  337 gtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 419  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  15222803 gtcatggtatcattggctttagccaattcttcccttagagaagctaactcggtacggagctgaacattttcttcttccatagc 15222721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39849345 - 39849292
Alignment:
Q  391 cggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39849345 cggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 39849292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6568581 - 6568522
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6568581 tcggtacgaagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 6568522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19371989 - 19371930
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19371989 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 19371930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 444
Target Start/End: Original strand, 18801504 - 18801546
Alignment:
Q  402 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18801504 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18801546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 34190500 - 34190559
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34190500 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccataacctttttctttcttctgtattctctg 34190559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21815 - 21549
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| |||||    
T  21815 ggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttg 21716  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  21715 atggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtc 21616  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt 294  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  21615 gggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgctgtt 21549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 20249
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  20353 ttgttcttgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctcacttggtacggagctgagcattttcttct 20254  T
Q  412 tccat 416  Q
    |||||    
T  20253 tccat 20249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 1920 - 2103
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1920 ggacattgttctcaaaagttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttg 2018  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2019 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6268 - 6080
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaac-gcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcacctt 126  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||  || || || || |||||||||||| | |  |||||||    
T  6268 ggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcacctt 6169  T
Q  127 gatggaaa-tcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 214  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6168 gatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30017 - 29747
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||| ||| |||| || |||||    
T  30017 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttg 29918  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
     ||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  29917 gtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 29818  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29817 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttg 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 40071 - 40341
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  40071 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 40170  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    |||||||||||| ||||| || || | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  40171 atggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 40270  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40271 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 40341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 46987 - 47257
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  46987 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 47086  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||||    
T  47087 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtc 47186  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  47187 ggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 47257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28538 - 28424
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28538 tggctgattgttcctgagcggctagcagagtagtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagtagctaactcggtacggagctgagcatt 28439  T
Q  405 ctcttcttccatagc 419  Q
     ||||||||||||||    
T  28438 ttcttcttccatagc 28424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 48466 - 48577
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48466 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 48565  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  48566 ctcttcttccat 48577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 41550 - 41661
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41550 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 41649  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
     |||||||||||    
T  41650 ttcttcttccat 41661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27546 - 27276
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||    
T  27546 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 27447  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  27446 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 27347  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27346 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 27276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26067 - 25956
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 404  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26067 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 25968  T
Q  405 ctcttcttccat 416  Q
    ||||||||||||    
T  25967 ctcttcttccat 25956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17717 - 17658
Alignment:
Q  385 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17717 tcggtacggagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 131 - 402
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||  || |||||    
T  131 ggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttg 230  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| || || | |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||    
T  231 atgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtc 330  T
Q  228 gggagtagct-cagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||  |||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  331 ggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 416
Target Start/End: Original strand, 1613 - 1722
Alignment:
Q  307 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1613 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 1712  T
Q  407 cttcttccat 416  Q
    ||||||||||    
T  1713 cttcttccat 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 7241 - 7511
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  7241 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 7340  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  7341 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 7440  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  7441 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 7511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 8761 - 8859
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 8859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 9068 - 9338
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  9068 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 9167  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  9168 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 9267  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  9268 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20269 - 19999
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  20269 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 20170  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  20169 atgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 20070  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  20069 ggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 19999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9820 - 9549
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  9820 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttg 9721  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||     
T  9720 atgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagtt 9621  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 299  Q
    || || || || ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  9620 ggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7018 - 6886
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  7018 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 6919  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6918 tccatagcctttttctttcttctgtattctctg 6886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 26203 - 26474
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||    
T  26203 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttg 26302  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctg-ggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 226  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||    
T  26303 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagt 26402  T
Q  227 cgggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
     || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26403 tggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 14932 - 15202
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||    
T  14932 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttg 15031  T
Q  128 atggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtc 227  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||     
T  15032 atgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagtt 15131  T
Q  228 gggagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 298  Q
    || || || || ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15132 ggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 15202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 16452 - 16550
Alignment:
Q  346 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Original strand, 620 - 728
Alignment:
Q  28 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  620 ggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttg 719  T
Q  128 atggaaatc 136  Q
    |||||||||    
T  720 atggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 49681 - 49798
Alignment:
Q  305 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctc-agagt--ggctaactcggtgcggagctgagc 401  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  | |||||||||| |||||||||||    
T  49681 tggctgattgttcctgagcggctagcagagctgtcatggtatcattggccttagccaattcttccctttagagttagtctaactcggtacggagctgagc 49780  T
Q  402 gttctcttcttccatagc 419  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  49781 gttttcttcttccatagc 49798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8201 - 7966
Alignment:
Q  30 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||    
T  8201 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgat 8102  T
Q  130 ggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacagatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 229  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| ||    
T  8101 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttgg 8002  T
Q  230 gagtagctcagcatatagcattggtatcggaggaaa 265  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8001 aagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6723 - 6591
Alignment:
Q  312 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 411  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  6723 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 6624  T
Q  412 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6623 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 6591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 40416 - 40322
Alignment:
Q  325 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 419  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40416 gctaacaaagcagtcatggtatcatgggccttagccaactcttccctcaaagtagccaactcggtgcgaagctgagtgttctcttcctccatagc 40322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University