View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12659_high_5 (Length: 513)

Name: NF12659_high_5
Description: NF12659
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12659_high_5
NF12659_high_5
[»] scaffold0400 (2 HSPs)
scaffold0400 (18-503)||(12512-12997)
scaffold0400 (23-495)||(6229-6701)
[»] scaffold0365 (2 HSPs)
scaffold0365 (18-503)||(13155-13640)
scaffold0365 (23-495)||(6873-7345)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (18-503)||(14532639-14533124)
chr1 (18-497)||(14503715-14504194)
chr1 (18-503)||(15032191-15032676)
chr1 (18-503)||(15010733-15011218)
chr1 (18-503)||(15001840-15002325)
chr1 (18-503)||(15036753-15037238)
chr1 (18-497)||(14467536-14468015)
chr1 (18-503)||(15016848-15017333)
chr1 (148-502)||(14481848-14482202)
chr1 (24-503)||(14522518-14522997)
chr1 (18-402)||(15024850-15025234)
chr1 (30-503)||(15040504-15040962)
[»] chr7 (4 HSPs)
chr7 (257-503)||(14605870-14606116)
chr7 (257-503)||(16025047-16025293)
chr7 (257-503)||(16102851-16103098)
chr7 (257-423)||(16172529-16172695)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (378-440)||(37026857-37026919)


Alignment Details
Target: scaffold0400 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 503
Target Start/End: Original strand, 12512 - 12997
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  12512 ctttgttaatcaaactctcgataaataacaataatcttttgggagaagttcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgaaaa 12611  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12612 aaataatttaagtggcttcatccctagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 12711  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12712 gagtttggccaattagaagttattgaagatcttgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 12811  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812 cattgaatctttcacataataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 12911  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12912 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaattgaagcactgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 12997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 495
Target Start/End: Original strand, 6229 - 6701
Alignment:
Q  23 ttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnnnnnta 122  Q
    |||||| | |||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||   | |||||  |||||||||||       ||    
T  6229 ttgatccagctcttgataagtagcaatcatcttgtaggagaagttcctgaacaaattgcattattgcataaaataactatcttggagcttgcaacaaata 6328  T
Q  123 atttaagtggcttcatccatagaaga-cttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccattgagt 221  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||||||| ||  || | ||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||    
T  6329 atttcagtggcttcatccc-agaacaacttggaagattacctaatttattggacttgaatttgagccaaaataagtttgaaggagacattcctgctgagt 6427  T
Q  222 ttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacatt 321  Q
    |||| |||||  || |||||||| || |||| ||||| |  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||    
T  6428 ttggacaattgaaaattattgaaaatcttgatcttagcgagaatgttttgaatggaaccataccaacaatgcttggagagttaaatcgcttagaaacatt 6527  T
Q  322 gaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggt 421  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||    
T  6528 gaatctctcacataataatttttctggtaccattcccttgacctatggtgagatgtcaagcttaacaactattgatatatcatacaaccaatttgaaggt 6627  T
Q  422 ccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaa 495  Q
    || ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6628 ccaattccaaacattccagccttcaaaaatgctccaattgaagcattaagaaataacaaaggcttgtgtggtaa 6701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 503
Target Start/End: Original strand, 13155 - 13640
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  13155 ctttgttaatcaaactctcgataaataacaataatcttttgggagaagttcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgaaaa 13254  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255 aaataatttaagtggcttcatccctagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 13354  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13355 gagtttggccaattagaagttattgaagatcttgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 13454  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455 cattgaatctttcacataataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 13554  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13555 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaattgaagcactgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 13640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 495
Target Start/End: Original strand, 6873 - 7345
Alignment:
Q  23 ttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnnnnnta 122  Q
    |||||| | |||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||   | |||||  |||||||||||       ||    
T  6873 ttgatccagctcttgataagtagcaatcatcttgtaggagaagttcctgaacaaattgcattattgcataaaataactatcttggagcttgcaacaaata 6972  T
Q  123 atttaagtggcttcatccatagaaga-cttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccattgagt 221  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||||||| ||  || | ||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||    
T  6973 atttcagtggcttcatccc-agaacaacttggaagattacctaatttattggacttgaatttgagccaaaataagtttgaaggagacattcctgctgagt 7071  T
Q  222 ttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacatt 321  Q
    |||| |||||  || |||||||| || |||| ||||| |  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||    
T  7072 ttggacaattgaaaattattgaaaatcttgatcttagcgagaatgttttgaatggaaccataccaacaatgcttggagagttaaatcgcttagaaacatt 7171  T
Q  322 gaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggt 421  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||    
T  7172 gaatctctcacataataatttttctggtaccattcccttgacctatggtgagatgtcaagcttaacaactattgatatatcatacaaccaatttgaaggt 7271  T
Q  422 ccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaa 495  Q
    || ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7272 ccaattccaaacattccagccttcaaaaatgctccaattgaagcattaagaaataacaaaggcttgtgtggtaa 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14533124 - 14532639
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  14533124 ctttgttaatcaaactctcgataaataacaataatcttttgggagaagttcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgaaaa 14533025  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||    
T  14533024 aaataatttaagtggcttcatccctagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataagttcgaaggaaacattcctgtt 14532925  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14532924 gagtttgaccaattaaaggttattgaagatcttgatcttagtgaaaatgttatgagtggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacttacaaa 14532825  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14532824 cattgaatctttcacataataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 14532725  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    |||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14532724 gggtccaattccaagcattacagccttccaaaaagctccaattgaagcacttagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 14532639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 497
Target Start/End: Original strand, 14503715 - 14504194
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||        
T  14503715 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaatcatctttctggagaggttcctatacaaattgcatcattgcaagcactaactaccttggagcttgcaac 14503814  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14503815 aaataatttaagtggcttcatccctagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataagtttgaaggaaacattcccgtt 14503914  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||  || |||    
T  14503915 gagtttggccgattaaatgttattgaagatcttgatctcagtggaaattttatgaatggaacgataccttcaatgtttggagtgttaaatcatttagaaa 14504014  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14504015 cattgaatctctcacataataatctgtctggtacgatcccctttagctctggtgatatgttaagcttgacaattattgatatatcatacaaccaattgga 14504114  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatg 497  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14504115 gggtccgattccaagcattccagccttccaacaagctccaattgaagcactgagaaacaacaaagacttgtgtggtaatg 14504194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 503
Target Start/End: Original strand, 15032191 - 15032676
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||        
T  15032191 ctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcacctttctggagaagttcctgtacaaattgcatcattgcacgagctaactgcattggagcttgcaac 15032290  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||  |||| | || || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||   |    
T  15032291 aaataatttgagtggcttcatccctaaaagacttggtaggttatctaggttattgcagttaaatttgagccaaaataagtttgaggggaacattcctgct 15032390  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    ||||||| ||||||  | ||||||||| || |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||    
T  15032391 gagtttgcccaattgaatgttattgaaaatcttgatcttagtgggaattttatgaatggaaccataccatcaatgcttgggcagttaaatcgcttagaaa 15032490  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||  | | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15032491 cattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattccctcaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgatatatcttacaaccagttgga 15032590  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    |||||| ||||| |||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15032591 gggtccaattccaaacattacagctttcaaaaaagctccaattgaagcattgacaaataacaaaggcttatgtggtaatgtctctg 15032676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 503
Target Start/End: Original strand, 15010733 - 15011218
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||        
T  15010733 ctttgttgttcaaactctccttaagtaacaatcatctttctggagaagttcctgtacaaattgcatcattgcatcaactaactgcattggagcttgcaat 15010832  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||| ||||||||||||| || || |||||| | |||||||  |||| | || || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||    
T  15010833 aaataatttgagtggcttcatccctaaaaaacttggtatgttgtctatgttattgcagttaaatttgagccaaaataagtttgaggggaacattcctgtt 15010932  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || |||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||    
T  15010933 gagtttggccaattgaatgttattgaaaatcttgatcttagtgggaattctatgaatggaaccataccagcaatgcttggccagttaaatcacttagaaa 15011032  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||  | | | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15011033 cattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattccctcaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgatatatcttacaaccaattgga 15011132  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    |||||||||||| ||  || |||| |||  || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15011133 gggtccgattccaaatgttacagctttcaaaagagctccaattgaagcattgacaaataacaaaggcttatgtggtaatgtctctg 15011218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 503
Target Start/End: Original strand, 15001840 - 15002325
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||        
T  15001840 ctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttatggagaagttccagtacaaattgcatcattgcatcaactaactgcattggagcttgcaac 15001939  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||| ||||| ||||||| |  || |||||| | |||||||  |||| | || || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||    
T  15001940 aaataatttgagtggattcatccctgaaaaacttggtatgttgtctatgttattgcagttaaatttgagccaaaataagtttgaggggaacattcctgtt 15002039  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |  |||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||    
T  15002040 gagtttggccaattgaatgttattgaaaaccttgatcttagtgggaattctatgaatggaaccataccagcaatgcttggccagttaaatcacttagaaa 15002139  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||  | | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15002140 cattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattccctaaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgatatatcttacaaccagttgga 15002239  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    |||||||| ||| |||||| |||| |||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15002240 gggtccgactccaaacattacagctttcgaaagagctccaattgaagcactgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtttctg 15002325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 503
Target Start/End: Original strand, 15036753 - 15037238
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||        
T  15036753 ctttgttgttcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagttcctgtacaaattgcatcattgcatcaactaactgcattggagcttgcaac 15036852  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       ||| ||||||||||||||||    || |||||| | |||||||  |||| | || |||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||  ||    
T  15036853 aaataacttaagtggcttcatcctggaaaaacttggtatgttgtctaggttattgcagttgaatttgagccataataagcttgaggggaacattcctgtt 15036952  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |  |||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||    
T  15036953 gagtttggccaattgaatgttattgaaaaccttgatcttagtgggaattctatgaatggaaccataccagcaatgcttggccagttaaatcacttagaaa 15037052  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||  | | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15037053 cattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattcccttaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgatatatcttacaaccagttgga 15037152  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||  || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15037153 gggtccgattccaaacattacagctttcaaaagagctccaattgaagcattgacaaataacaaaggcttatgtggtaatgtctctg 15037238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 497
Target Start/End: Original strand, 14467536 - 14468015
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||   ||||  | |||||||||||         
T  14467536 ctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaagttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaac 14467635  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||||||||| |  ||||  | |  ||||||||| |||||   |||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  |     
T  14467636 aaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacacttgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtc 14467735  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  14467736 gagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaa 14467835  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||  | | | |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  14467836 cattgaatctctcacataataatctttctggtaccattctcttcagctcagttgatatgttaagcttgacaactgtagatatatcgtacaaccagttgga 14467935  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatg 497  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14467936 gggtccgattccaagcattccagccttccaacaggctccaattgaagcactgagaaacaacaaagacttgtgtggtaatg 14468015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 503
Target Start/End: Original strand, 15016848 - 15017333
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||| |||| |||| | | ||||||| ||||||||||        
T  15016848 ctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagttcctgaacaaattgaatcattgcacgaattaactgcattggagcttgcagc 15016947  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||| ||||||||||||| |  || |||||| | |||||||  |||| |  | || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||    
T  15016948 aaataatttcagtggcttcatccctgaaaaacttggtatgttgtctaggttattgaagttaaatttgagccaaaataagtttgaggggaacattcctgtt 15017047  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || |||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||    
T  15017048 gagtttggccaattgaatgttattgaaaatcttgatcttagtgggaattctatgaatggaaccataccagcaatgcttggccagttaaatcacttagaaa 15017147  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattgga 417  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||  | | | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  15017148 cattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattccctcaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgatgtatcttacaaccagttgga 15017247  T
Q  418 gggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    |||||||| ||| |||||| |||| |||  || |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15017248 gggtccgactccaaacattacagctttcggaagagctccaattgaagcattgacaaataacaagggcttgtgtggtaatatctctg 15017333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 148 - 502
Target Start/End: Original strand, 14481848 - 14482202
Alignment:
Q  148 acttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccattgagtttggccaattagaagttattgaagat 247  Q
    ||||||||| |||||   |||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  14481848 acttggaagtttgtcaatgttattacacttgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagat 14481947  T
Q  248 attgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctg 347  Q
     |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14481948 cttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctg 14482047  T
Q  348 gaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcct 447  Q
    | |||||||| || || || ||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  14482048 gtaccattcccttcagatatggttagatgttaagcttgataactgtagatatatcgtacaaccagttggagggtccgattccaagcattccagccttcca 14482147  T
Q  448 aaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctct 502  Q
     ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14482148 gaaaactccaattgaagcactgagaaacaacaaagacttgtgtggtaatgcctct 14482202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14522997 - 14522518
Alignment:
Q  24 tgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnnnnntaa 123  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||| | || ||||||||| |||| | ||||||| | ||||| ||||       |||    
T  14522997 tgatccaactctcgataagtaataatcatctttcgggagaagttcctatgcagattgcatcattgcatgaactaactacattggatcttgcaacaaataa 14522898  T
Q  124 tttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccattgagttt 223  Q
    ||||||||| || |||| |  || ||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  14522897 tttaagtggttttatccctgaaaaacttggaaggttgtctaggttattgcagttgaatttgagccaaaataagtttgaaggaaacattcctgttgaactt 14522798  T
Q  224 ggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacattga 323  Q
    || |||||  | |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  14522797 ggtcaattgaatgttattgaagatcttgatcttagcgggaattttttgaatggaaccataccaacaatgcttggacagttaaatcgcttagaaacattga 14522698  T
Q  324 atctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtcc 423  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| | |||||| || ||||    | | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  14522697 atctctcacataataatctctatggtaacattcccttaagcttttttgatatgttaagtttgacaactgttgatatatcttacaaccggttggagggtcc 14522598  T
Q  424 gattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
     ||||| |||||| |||| |||| || |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14522597 aattccaaacattacagcattccaaagagctccagttgaagcatttagaaataacaaaggcttgtgcggtaatgtctctg 14522518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 402
Target Start/End: Original strand, 15024850 - 15025234
Alignment:
Q  18 ctttgttgatcaaactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnn 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||        
T  15024850 ctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcacctttctggagaagttcctgtacaaattgcatcattgcacgagctaactgcattggagcttgcaac 15024949  T
Q  118 nnntaatttaagtggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccatt 217  Q
       |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||  |||| | || || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||   |    
T  15024950 aaataatttgagtggcttcatccctaaaagacttggtaggttatctaggttattgcagttaaatttgagccaaaataagtttgaggggaacattcctgct 15025049  T
Q  218 gagtttggccaattagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaa 317  Q
    ||||||| ||||||  | ||||||||| || |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||    
T  15025050 gagtttgcccaattgaatgttattgaaaatcttgatcttagtgggaattttatgaatggaaccataccatcaatgcttgggcagttaaatcgcttagaaa 15025149  T
Q  318 cattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatc 402  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||  | | | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15025150 cattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattccctcaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgatatatc 15025234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 503
Target Start/End: Original strand, 15040504 - 15040962
Alignment:
Q  30 aactctcgataagtaacaataatcttttaggagaaattcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgnnnnnnntaatttaag 129  Q
    ||||||||||||||| |||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||| | |  ||  ||||||||| |       |||||||||    
T  15040504 aactctcgataagtagcaattacttttcaggggaagttcctgtacaaattgcctcattgaaggaagttgctatcttggagctggcaacaaataatttaag 15040603  T
Q  130 tggcttcatccatagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttgaatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccattgagtttggccaa 229  Q
    ||||||| |||  | |  ||||||||| || |||  |||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||| ||     
T  15040604 tggcttcgtcccaaaacaacttggaagattatctatgttattacacttaaatatgagccaaaataagtttgaaggaaacattcctgatgagattggacag 15040703  T
Q  230 ttagaagttattgaagatattgaccttagtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacattgaatcttt 329  Q
    ||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  15040704 ttaaaagttattgaaaatcttgatcttagtgggaattctttgaatggaaccataccaacaatgcttggacagttaaatcgcttagaaacattgaatcttt 15040803  T
Q  330 cacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtccgattcc 429  Q
                |||   | |||||||| |||| ||| ||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  15040804 ------------ttt---gtaccattcccttgacctatggtgagatgtcaggcttgacaactgttgatatatcatgcaaccaattgaagggtccaattcc 15040888  T
Q  430 taacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
     || ||| || |||||||| |||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15040889 aaaaatttcatccttcctacaagccccatttgaagcattaagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 15040962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 503
Target Start/End: Original strand, 14605870 - 14606116
Alignment:
Q  257 agtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattc 356  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||| ||  || |  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    ||||    
T  14605870 agtggaaattttttggatggaacaataccatcaatgcttacacagttgaaatacttggaaacattgaatatctcacataataatctttctggttttattc 14605969  T
Q  357 ctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctcc 456  Q
    | |  |||| || | ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| |||   || ||| |    
T  14605970 cctctagcttcgatcagatgttcagcttaacatctgttgatatatcatataaccaattggagggtccactccccaatattcgagctttcagcaacgctac 14606069  T
Q  457 aactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14606070 aattgaagtggtgagaaataataaaggcttgtgtggtaatgtctctg 14606116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 503
Target Start/End: Original strand, 16025047 - 16025293
Alignment:
Q  257 agtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattc 356  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||| ||  || |  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    ||||    
T  16025047 agtggaaattttttggatggaacaataccatcaatgcttacacagttgaaatacttggaaacattgaatatctcacataataatctttctggttttattc 16025146  T
Q  357 ctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctcc 456  Q
    | |  |||| || | ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| |||   || ||| |    
T  16025147 cctctagcttcgatcagatgttcagcttaacgtctgttgatatatcatataaccaattggagggtccactccccaatattcgagctttcagcaacgctac 16025246  T
Q  457 aactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16025247 aattgaagtggtgagaaataataaaggcttgtgtggtaatgtctctg 16025293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 503
Target Start/End: Original strand, 16102851 - 16103098
Alignment:
Q  257 agtggaaattttttgaac-ggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccatt 355  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||  |||||| ||  || |  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    |||    
T  16102851 agtggaaatttttttaaatggaacaataccatcaatgcttacacagttgaaatacttggaaacattgaatatctcacataataatctttctggctttatt 16102950  T
Q  356 cctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctc 455  Q
    || |  ||||  | | | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||| ||| |||  ||| |||     
T  16102951 ccctctagctttgatcaaatgttaagcttgacatctgttgatatatcatataaccaattggagggtccactccccaacattcgagctttcagaaacgcta 16103050  T
Q  456 caactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 503  Q
    |||  ||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16103051 caatcgaagtgttgagaaataataaagacttgtgtggtaatgtctctg 16103098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 423
Target Start/End: Original strand, 16172529 - 16172695
Alignment:
Q  257 agtggaaattttttgaacggaaccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattc 356  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||| ||  || |  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||||    
T  16172529 agtggaaattttttaaatggaacaataccatcaatgcttacacagttgaaatacttggaaacattgaatatctcacataataatctttctggatttattc 16172628  T
Q  357 ctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtcc 423  Q
    | |  |||| || | ||||||| || || ||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16172629 cctctagcttcgatcagatgttcagtttaacgtctgttgatatatcatataaccaattggaaggtcc 16172695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 440
Target Start/End: Original strand, 37026857 - 37026919
Alignment:
Q  378 taagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccag 440  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  37026857 taagcttgacaatggttgacatatcttataaccaattagagggttcaattcctaacaatccag 37026919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University