View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12660_high_1 (Length: 802)

Name: NF12660_high_1
Description: NF12660
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12660_high_1
NF12660_high_1
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (16-785)||(39575770-39576539)
chr4 (16-785)||(39521128-39521894)
chr4 (88-762)||(39510957-39511625)
chr4 (24-762)||(39524630-39525368)
chr4 (407-745)||(39544309-39544647)
chr4 (89-296)||(39543997-39544204)
chr4 (425-733)||(39580719-39581016)
chr4 (115-243)||(39580415-39580543)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (481-758)||(3331422-3331696)
chr7 (436-477)||(3331275-3331316)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 690; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 690; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 785
Target Start/End: Original strand, 39575770 - 39576539
Alignment:
Q  16 atgaaacctaagtaaatgatctacgttcttctctacaggaacactccaacttatgctactagaaccgttaatactctctttgccagtttgataaaccctg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  39575770 atgaaacctaagaaaatgatctacgttcttctctacaggaacactccaacttatgctgctagaaccgttaatactctctttgccagttttataaacaata 39575869  T
Q  116 tctggagcaatatattgatttgaatttggaccatcagatgtatcatttgcagtgcgtggaataccaccgccaaagaagtgattcttagcgttttgtagat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  39575870 tctggagcaatatattgatttgaatttggaccatcagacgtatcatttgcagtgcgtggaatatcaccgtcaaaggagcaattcttagcgttttgtagat 39575969  T
Q  216 tagttacataactgtcatctggtaaccattctctcgataaagtatcagttcctctatcaacggttcccccaccaacgttaaaacgatgttttgtttccaa 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39575970 tagttacatatctgtcatctggtaaccattctctcgataaagtatcagttcctctatcaacggttcccccaccgacgttaaaacgatgttttgtttccaa 39576069  T
Q  316 ggctcgttgtgagtgtaaaccgccaatataagtagataagcctcctcgaacaccagattcttcgtaagagaaacgtgtcattgaatcagggattaaatga 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39576070 ggctcgttgtgagtgtaaaccgccaatataagtagataagcctcctcgaacaccagattctttgtaagagaaatgtggcattgaatcagggattaaatga 39576169  T
Q  416 accggaagcataaagagttctattgcgttaacaaacgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaatatgattttgaatctttttctaatgattttaacgtaat 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39576170 accggaagcataaagagttctattgcattaacaaacgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaatatgattttgaatctttttctaatgattttaacgtaat 39576269  T
Q  516 actcttttactaaagcagatttggtggtgttttcagcgttgaaattatgtaacagaaggaaaccaggaacggaaatgttgaattttgcagtggaaagttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39576270 actcttttactaaagcagatttggtggtgttttcagcgttgaaattatgtaacagaaggaaaccaggaacggaaatgttgaattttgcagtggaaagttt 39576369  T
Q  616 agttggtgaagagaatgaaaagaaacggaaacgtaccatataagtgttgtttggtacggtagaaaattcgtaggaggattcagaatggaaaattcttgct 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39576370 agttggtgaagagaatgaaaagaaacggaaacgtaccatataagtgttgtttggtatggtagaaaattcgtaggaggattcagaatggaaaattcttgct 39576469  T
Q  716 gtttggtaaagaggtgaagacactgatgatggattggtttctatggaacttctttggctgaataattttt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39576470 gtttggtaaagaggtgaagacactgatgatggattggtttctatggaacttctttggctgaatgattttt 39576539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 785
Target Start/End: Original strand, 39521128 - 39521894
Alignment:
Q  16 atgaaacctaagtaaatgatctacgttcttctctacaggaacactccaacttatgctactagaaccgttaatactctctttgccagtttgataaaccctg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39521128 atgaaacctaagtaaatgatctacgttcttctctacaggaacactccaacttatgttgctagaaccgttaatactctctttgccagtttgataaaccctg 39521227  T
Q  116 tctggagcaatatattgatttgaatttggaccatcagatgtatcatttgcagtgcgtggaataccaccgccaaagaagtgattcttagcgttttgtagat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  39521228 tctggagcaatatattgatttgaatttggaccatcagatgtatcatttgcagtgcgtggaatatgaacgtcaaaggagcgattcttagcgttttgtggat 39521327  T
Q  216 tagttacataactgtcatctggtaaccattctctcgataaagtatcagttcctctatcaacggttcccccaccaacgttaaaacgatgttttgtttccaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||    |||| ||||||| |||  |||| ||||||||    
T  39521328 tagttacataactgtcatctgctaaccattctctcgataatgtatcggttcctctatcgacagtttggtcaccgacgttaagacggagtttggtttccaa 39521427  T
Q  316 ggctcgttgtgagtgtaaaccgccaatataagtagataagcctcctcgaacaccagattcttcgtaagagaaacgtgtcattgaatcagggattaaatga 415  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   || ||| ||  |||  |   ||||  ||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  39521428 cgatcgttgtgagtgtaaaccgccactataagtagttaag---ccccgaccagtagaaccgatgtaattgaaacgtgctactgaatcggggattaaatga 39521524  T
Q  416 accggaagcataaagagttctattgcgttaacaaacgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaatatgattttgaatctttttctaatgattttaacgtaat 515  Q
    |  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39521525 agagggagcataaagagttcaattgcattaacaaacgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaaagtgattgtgaatctttttctgatgattttaacgtaat 39521624  T
Q  516 actcttttactaaagcagatttggtggtgttttcagcgttgaaattatgtaacagaaggaaaccaggaacggaaatgttgaattttgcagtggaaagttt 615  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  39521625 actcttttactaaaggagagttggtggtgttttcagcgttgaaattatgtaacagaaggaaaccaggaactgaaacggtgaattttgcagaggaaaggtt 39521724  T
Q  616 agttggtgaagagaatgaaaagaaacggaaacgtaccatataagtgttgtttggtacggtagaaaattcgtaggaggattcagaatggaaaattcttgct 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    ||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||||    
T  39521725 agttggtgaagagaatgaaaagaaatggaaacgtaccatgtaagtgttgcttggaacggttttgaattcataggaagaattggaaaggaaaattcttgct 39521824  T
Q  716 gtttggtaaagaggtgaagacactgatgatggattggtttctatggaacttctttggctgaataattttt 785  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||| || | ||| || ||||  | |||| ||||||||||||||    
T  39521825 gtttggttgagaggtgaagacactggtgattgacttgttactttggagttactttcgctgaataattttt 39521894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 88 - 762
Target Start/End: Original strand, 39510957 - 39511625
Alignment:
Q  88 actctctttgccagtttgataaaccctgtctggagcaatatattgatttgaatttggaccatcagatgtatcatttgcagtgcgtggaataccaccgcca 187  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||  |||| ||||   |    
T  39510957 actctcttggccagttttataaacaatatctggaccaatatatatacttgaatttggaccatcagattcatcatttgcagcgtgtttaatatcacc---a 39511053  T
Q  188 aagaagtgattcttagcgttttgtagattagttacataactgtcatctggtaaccattctctcgataaagtatcagttcctctatcaacggttcccccac 287  Q
    ||| |   | |||| || |||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||   ||  |  | || |    
T  39511054 aaggaaccaatcttcgcattttgtggattagttatgtatctgtcatctcgtaaccattctcttgataatgtatcggcttctctagtgacattatcaccgc 39511153  T
Q  288 caacgttaaaacgatgttttgtttccaaggctcgttgtgagtgtaaaccgccaatataagtagataagcctcctcgaacaccagattcttcgtaagagaa 387  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    ||  || |||||||| |||||  ||    
T  39511154 ctacgttaagacgatgtttcgtttccaaagctcgttgtgagtttaaaccgccactataattagataagcctg---gagaactagattctttgtaagtaaa 39511250  T
Q  388 acgtgtcattgaatcagggattaaatgaaccggaagcataaagagttctattgcgttaacaaacgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaatatgattttg 487  Q
    |||   || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  39511251 acgcaacactgaatcagggattaaatgaacggggagcacaaagagttctattgcgttaacaaatgcgagtgatgatttttgaggtgtgaaagtgattttg 39511350  T
Q  488 aatctttttctaatgattttaacgtaatactcttttactaaagcagatttggtggtgttttcagcgttgaaattatgtaacagaaggaaaccaggaacgg 587  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  39511351 aatctttttctgatgatttgaacgtagtattcttttactaaaggagagttggtggtgttttcagcgttgaaattttgtaacagaatgaaaccaggaactg 39511450  T
Q  588 aaatgttgaattttgcagtggaaagtttagttggtgaagagaatgaaaagaaacggaaacgtaccatataagtgttgtttggtacggtagaaaattcgta 687  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||    ||||||||    
T  39511451 aaacagtgaattttgcagtggaaagtttagttggtgtagagaatgaaaggaaatggaaacgtaccatataggtgttgtttgggatggttttgaattcgta 39511550  T
Q  688 ggaggattcagaatggaaaattcttgctgtttggtaaagaggtgaagacactgatgatggattggtttctatgga 762  Q
      | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  39511551 ccaagattcggaacggaaaatccttgcagtttggtagagagatgaaggaactgatgattgatttgtttctatgga 39511625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 762
Target Start/End: Original strand, 39524630 - 39525368
Alignment:
Q  24 taagtaaatgatctacgttcttctctacaggaacactccaacttatgct---ac---tagaaccgttaatactctctttgccagtttgataaaccctgtc 117  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||   | ||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||  | ||    
T  39524630 taaggaaatgatctatattcttctccacaggaacactccaacttatgtttaaaccgattgaaccattaacactcactttggcagttttataaacaatatc 39524729  T
Q  118 tggagcaatatattgatttgaatttggaccatcagatgtatcatttgcagtgcgtggaataccaccgccaaagaagtgattcttagcgttttgtagatta 217  Q
    |||| | || |||| ||||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||  |||| ||||  ||||| |   |||||||||||||||  ||| |    
T  39524730 tggacctatgtatttatttgaatttgaatcaacagattcatcatttgcagtgcgtttaatatcaccttcaaaggaaccattcttagcgttttggggatca 39524829  T
Q  218 gttacataactgtcatctggtaaccattctctcgataaagtatcagttcctctatcaacggttcccccaccaacgttaaaacgatgttttgtttccaagg 317  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||  |||| |||||||| |||| |||  | || |||||||| |    
T  39524830 gttatatatctgtcatctggtaaccattctcttgatagtgtatcagtttctctattaacaattccgccaccaacattaagacggaggttggtttccaacg 39524929  T
Q  318 ctcgttgtgagtgtaaaccgccaatataagtagataagcctcctcgaacaccagattcttcgtaagagaaacgtgtcattgaatcagggattaaatgaac 417  Q
     |||    ||| | ||| |   | ||||||||||||||  ||  |   ||  ||| |||| ||||  |||| | |  ||||| || ||||||||||||||    
T  39524930 atcga---gagaggaaatcattactataagtagataagtttctgc---cagtagactctttgtaatggaaaagcgcgattgagtcggggattaaatgaac 39525023  T
Q  418 cggaagcataaagagttctattgcgttaacaaacgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaatatgattttgaatctttttctaatgattttaacgtaatac 517  Q
     || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  39525024 agggagcataaagagttctattgcattagcaaaggcaaatgatgctttttgaggtgtgaacgtgattttgaatttttttctgatgattttaaggtaatac 39525123  T
Q  518 tcttttactaaagcagatttggtggtgttttcagcgttgaaattatgtaacagaaggaaaccaggaacggaaatgttgaattttgcagtggaaagtttag 617  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  || | |||||| |||||||||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  39525124 tcttttactaaaggagagttggtggtgttttttgcatcgaaattttgtaacagaatgaaaccagggactgaaacggtgaattttgcagtggaaaggttaa 39525223  T
Q  618 ttggtgaagagaatgaaaagaaacggaaacgtaccatataagtgttgtttggtacggtagaaaattcgtaggaggattcagaatggaaaattcttgctgt 717  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    || |||||  | ||||| ||||| || || ||||||||    
T  39525224 gtggtgaagagaatgaaaagaaatggaaacgtaccatgtaggtgttgtttggtacggttttgaactcgtataaagattcggaatgaaatatccttgctgt 39525323  T
Q  718 ttggtaaagaggtgaagacactgatgatggattggtttctatgga 762  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  39525324 ttggtagagaggtgaaggcactgatgattgactggtttctatgga 39525368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 407 - 745
Target Start/End: Original strand, 39544309 - 39544647
Alignment:
Q  407 attaaatgaaccggaagcataaagagttctattgcgttaacaaacgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaatatgattttgaatctttttctaatgattt 506  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39544309 attaaatgaagagggagaataaagagttcaaatgcattaaaaaacgcaaatgaagatgtttgaggtgtgaaagtgattgtgaatctttttctgatgattt 39544408  T
Q  507 taacgtaatactcttttactaaagcagatttggtggtgttttcagcgttgaaattatgtaacagaaggaaaccaggaacggaaatgttgaattttgcagt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||     
T  39544409 taacgtaatactcttttactaaagaagagttggtggtgttttcagagttgaaattttgtaacagaatgaaaccagggactgaaacattgaattttgcaga 39544508  T
Q  607 ggaaagtttagttggtgaagagaatgaaaagaaacggaaacgtaccatataagtgttgtttggtacggtagaaaattcgtaggaggattcagaatggaaa 706  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||     
T  39544509 ggaaaggttagttggtgaagagaatgaaaagaaatggaaacataccatgtaggtgttgtttggtatggtagaaaattcataggaagactcggaatggaat 39544608  T
Q  707 attcttgctgtttggtaaagaggtgaagacactgatgat 745  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  39544609 atccttgctgtttggtagagaggtgaaaacactggtgat 39544647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 296
Target Start/End: Original strand, 39543997 - 39544204
Alignment:
Q  89 ctctctttgccagtttgataaaccctgtctggagcaatatattgatttgaatttggaccatcagatgtatcatttgcagtgcgtggaataccaccgccaa 188  Q
    ||||||||| |||||| ||||||   ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||  || |  |||    
T  39543997 ctctctttggcagtttcataaacagcgtccggagcaatatatatatttgaatttggaccttcatatgtattatttgcagtgcgtttaatttcatctgcaa 39544096  T
Q  189 agaagtgattcttagcgttttgtagattagttacataactgtcatctggtaaccattctctcgataaagtatcagttcctctatcaacggttcccccacc 288  Q
    || |   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||||| | |||    
T  39544097 aggaaccattcttagcgttttgtggattagttatataactgtcatctggtaaccattctctcgataaagtatcggtttttctatcgacagttccgctacc 39544196  T
Q  289 aacgttaa 296  Q
    ||| ||||    
T  39544197 aacattaa 39544204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 425 - 733
Target Start/End: Original strand, 39580719 - 39581016
Alignment:
Q  425 ataaagagttctattgcgttaacaaacgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaatatgattttgaatctttttctaatgattttaacgtaatactctttta 524  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |   ||||||||| | |||| ||||| |    
T  39580719 ataaagagttccattgcattaacaaacgcaaatgatgaggtttgaggtgtgaaagtgattttgaatcttttacgggtgattttaaagaaatattctttaa 39580818  T
Q  525 ct-aaagcagatttggtggtgttttcagcgttgaaattatgtaacagaaggaaaccaggaacggaaatgttgaattttgcagtggaaagtttagttggtg 623  Q
     | ||||| || ||  |       |||      ||||| |||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  39580819 ttgaaagcggagtttata------tca------aaattttgtaacagagagaaacctggaaaggaaacgttgaattttgcagtggaaagattagttggta 39580906  T
Q  624 aagagaatgaaaagaaacggaaacgtaccatataagtgttgtttggtacggtagaaaattcgtaggaggattcagaatggaaaattcttgctgtttggta 723  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||| | ||||  ||| |||| ||  |||||||||||||    
T  39580907 aagagaatagaaagaaatggaaacgtaccatgtaagtgttgtttggtacggttttgaattcgtagaaagatttggaagggaatataattgctgtttggta 39581006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 243
Target Start/End: Original strand, 39580415 - 39580543
Alignment:
Q  115 gtctggagcaatatattgatttgaatttggaccatcagatgtatcatttgcagtgcgtggaataccaccgccaaagaagtgattcttagcgttttgtaga 214  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||  |||| |||| ||||||||   |||||||||||| ||| ||    
T  39580415 gtctggaccaatatgtatatttgaatttggaccatcagattcatcacctgcagtgcgtttaatatcacctccaaagaaaccattcttagcgttatgtgga 39580514  T
Q  215 ttagttacataactgtcatctggtaacca 243  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  39580515 ttagtgatgtaactgtcatctggtaacca 39580543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 481 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 3331696 - 3331422
Alignment:
Q  481 gattttgaatctttttctaatgattttaacgtaatactcttttactaaagcagatttggtggtgttttcagcgttgaaattatgtaacagaaggaaacca 580  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||     
T  3331696 gattgtgaatctttttatgatgattttaacgtaatactcttttactaaaggagagttggtggtgtttttagcgtcgaaattagttaacagaaggaaaccg 3331597  T
Q  581 ggaacggaaatgttgaattttgcagtggaaagtttagttggtgaagagaatgaaaagaaacggaaacgtaccatataagtgttgtttggtacggtagaaa 680  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |   |||  |    
T  3331596 gaaacagaaatgttgaa-tttgcagtggaaaggttaattggtgaagagaatgaaaggaaatggaaacgtaccatgtaggtgttgtttgggataatagtga 3331498  T
Q  681 attcgtaggaggattcagaatggaaaattcttgctgtttggtaaagaggtgaagacactgatgatggattggtttcta 758  Q
    ||   ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || |||| |||||||    
T  3331497 at--ctaccaagattcagaatggaaaattcttgctctttggtaaagaggtgaaggaactgattattgatttgtttcta 3331422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 3331316 - 3331275
Alignment:
Q  436 tattgcgttaacaaacgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaa 477  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3331316 tattgcattaacaaatgcaaatgatgatgtttgaggtgtgaa 3331275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University