View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12660_low_25 (Length: 321)

Name: NF12660_low_25
Description: NF12660
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12660_low_25
NF12660_low_25
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (9-318)||(11212372-11212681)
chr3 (9-319)||(4408543-4408852)
chr3 (9-318)||(1790151-1790459)
chr3 (9-318)||(9386862-9387171)
chr3 (32-318)||(16387165-16387451)
chr3 (25-318)||(29467482-29467775)
chr3 (26-318)||(17905822-17906114)
chr3 (32-321)||(14317328-14317616)
chr3 (32-312)||(6496627-6496907)
chr3 (32-312)||(9988172-9988452)
chr3 (10-321)||(9002061-9002372)
chr3 (32-318)||(6216329-6216616)
chr3 (32-318)||(12243838-12244123)
chr3 (32-318)||(19782695-19782982)
chr3 (28-321)||(1057851-1058145)
chr3 (28-294)||(7800361-7800629)
chr3 (42-321)||(16666714-16666994)
chr3 (32-318)||(37870734-37871021)
chr3 (32-318)||(37879252-37879539)
chr3 (32-318)||(13378944-13379230)
chr3 (32-318)||(13389538-13389824)
chr3 (32-317)||(14469893-14470178)
chr3 (32-317)||(20679476-20679761)
chr3 (73-317)||(13126004-13126248)
chr3 (32-317)||(5623675-5623961)
chr3 (32-318)||(23761568-23761854)
chr3 (32-317)||(24389797-24390082)
chr3 (32-317)||(39376357-39376642)
chr3 (73-317)||(510449-510694)
chr3 (30-321)||(15222347-15222639)
chr3 (73-317)||(11278676-11278921)
chr3 (73-317)||(5543300-5543545)
chr3 (104-318)||(10633102-10633320)
chr3 (32-317)||(5871975-5872262)
chr3 (42-315)||(29897872-29898145)
chr3 (42-315)||(29939832-29940105)
chr3 (42-315)||(29988986-29989259)
chr3 (77-317)||(4748036-4748277)
chr3 (77-317)||(24664187-24664428)
chr3 (77-317)||(41687966-41688207)
chr3 (32-317)||(5514945-5515231)
chr3 (77-317)||(12292468-12292709)
chr3 (77-317)||(16425436-16425678)
chr3 (73-317)||(28320517-28320762)
chr3 (27-184)||(13075257-13075415)
chr3 (73-317)||(8778975-8779221)
chr3 (77-317)||(38198969-38199210)
chr3 (42-220)||(17963984-17964165)
chr3 (34-321)||(17010408-17010699)
chr3 (34-321)||(17021214-17021505)
chr3 (30-144)||(5197394-5197508)
chr3 (49-321)||(13143421-13143699)
chr3 (32-130)||(17219787-17219886)
chr3 (32-130)||(12389798-12389898)
chr3 (49-229)||(15837532-15837717)
chr3 (32-118)||(17251232-17251320)
chr3 (28-88)||(15657098-15657157)
chr3 (33-101)||(12393913-12393983)
chr3 (32-80)||(12954448-12954496)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (9-321)||(26871357-26871669)
chr2 (9-312)||(24421251-24421554)
chr2 (9-318)||(21127239-21127549)
chr2 (30-318)||(21168201-21168489)
chr2 (32-318)||(43086927-43087213)
chr2 (32-318)||(24334046-24334333)
chr2 (32-318)||(29248449-29248736)
chr2 (32-318)||(9903870-9904156)
chr2 (32-318)||(34796514-34796800)
chr2 (32-317)||(40244838-40245123)
chr2 (27-235)||(28727651-28727859)
chr2 (32-317)||(4214124-4214410)
chr2 (32-317)||(9769061-9769346)
chr2 (32-317)||(39176393-39176679)
chr2 (77-317)||(10271259-10271500)
chr2 (42-315)||(22768005-22768278)
chr2 (32-317)||(11401471-11401757)
chr2 (33-321)||(22747820-22748109)
chr2 (90-317)||(22939955-22940184)
chr2 (73-317)||(43349671-43349916)
chr2 (77-317)||(35257277-35257518)
chr2 (77-317)||(35267902-35268143)
chr2 (77-317)||(27225711-27225952)
chr2 (49-220)||(24810512-24810689)
chr2 (30-130)||(18942102-18942203)
chr2 (34-147)||(19308850-19308966)
chr2 (43-130)||(24719586-24719676)
chr2 (279-318)||(28727614-28727653)
chr2 (42-101)||(28707603-28707663)
chr2 (242-321)||(19308715-19308795)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (9-321)||(17450883-17451194)
chr5 (9-318)||(23402311-23402620)
chr5 (9-321)||(34058330-34058642)
chr5 (27-318)||(20786445-20786736)
chr5 (27-317)||(34778297-34778588)
chr5 (26-318)||(20558147-20558440)
chr5 (9-318)||(19470301-19470607)
chr5 (25-318)||(1115450-1115744)
chr5 (69-318)||(24933864-24934114)
chr5 (32-318)||(5294716-5295003)
chr5 (32-318)||(39358896-39359183)
chr5 (32-317)||(40396763-40397049)
chr5 (32-318)||(27607595-27607882)
chr5 (32-317)||(31839822-31840107)
chr5 (32-317)||(14562227-14562512)
chr5 (28-315)||(21418543-21418832)
chr5 (32-318)||(15997471-15997757)
chr5 (32-317)||(22152918-22153203)
chr5 (32-317)||(6982207-6982493)
chr5 (32-317)||(23302679-23302965)
chr5 (32-317)||(39495060-39495346)
chr5 (32-317)||(22682518-22682804)
chr5 (73-317)||(23703182-23703427)
chr5 (73-317)||(30231640-30231885)
chr5 (73-317)||(42049182-42049427)
chr5 (77-317)||(24814315-24814556)
chr5 (73-317)||(9342357-9342602)
chr5 (73-317)||(14451226-14451471)
chr5 (77-317)||(27046454-27046695)
chr5 (77-317)||(14036444-14036685)
chr5 (77-317)||(27466564-27466805)
chr5 (32-317)||(36586690-36586976)
chr5 (73-317)||(23368338-23368583)
chr5 (77-317)||(24821094-24821335)
chr5 (77-317)||(17613464-17613705)
chr5 (77-317)||(24573474-24573715)
chr5 (77-317)||(24592280-24592521)
chr5 (73-317)||(15746371-15746616)
chr5 (73-317)||(17725320-17725565)
chr5 (32-315)||(13527488-13527773)
chr5 (73-317)||(31354936-31355181)
chr5 (73-317)||(35221904-35222149)
chr5 (73-317)||(36694100-36694345)
chr5 (73-317)||(37734181-37734426)
chr5 (27-231)||(21672337-21672545)
chr5 (49-317)||(23482388-23482664)
chr5 (30-231)||(21613040-21613242)
chr5 (32-130)||(23433770-23433869)
chr5 (32-130)||(23445135-23445236)
chr5 (26-71)||(24932394-24932439)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (9-321)||(16309378-16309689)
chr4 (9-321)||(3377196-3377508)
chr4 (27-319)||(15203093-15203386)
chr4 (32-318)||(40463026-40463311)
chr4 (23-318)||(14842365-14842660)
chr4 (32-318)||(27821213-27821499)
chr4 (32-312)||(4994084-4994364)
chr4 (32-312)||(4997974-4998254)
chr4 (32-312)||(18758779-18759059)
chr4 (32-317)||(55751535-55751820)
chr4 (32-321)||(11540307-11540597)
chr4 (32-318)||(17922385-17922672)
chr4 (84-318)||(27192236-27192470)
chr4 (32-314)||(19950680-19950963)
chr4 (73-318)||(22000746-22000991)
chr4 (32-318)||(24023750-24024037)
chr4 (42-321)||(10294970-10295250)
chr4 (32-317)||(16260152-16260437)
chr4 (32-318)||(30932771-30933056)
chr4 (32-318)||(454850-455136)
chr4 (73-318)||(14846225-14846469)
chr4 (73-317)||(27660939-27661184)
chr4 (77-317)||(49511866-49512107)
chr4 (77-317)||(10746881-10747122)
chr4 (77-317)||(10960650-10960891)
chr4 (77-317)||(36022622-36022863)
chr4 (28-223)||(39516594-39516791)
chr4 (77-317)||(24644662-24644903)
chr4 (9-137)||(19575279-19575406)
chr4 (73-143)||(15010413-15010484)
chr4 (28-60)||(11519400-11519432)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (10-321)||(25207406-25207717)
chr7 (26-318)||(9163812-9164106)
chr7 (27-318)||(20983507-20983799)
chr7 (25-318)||(15884183-15884477)
chr7 (32-318)||(9437519-9437806)
chr7 (32-318)||(6873591-6873878)
chr7 (73-318)||(2711974-2712219)
chr7 (33-321)||(18432784-18433070)
chr7 (32-317)||(17956476-17956761)
chr7 (32-318)||(463335-463621)
chr7 (32-317)||(22093397-22093682)
chr7 (32-317)||(26396457-26396742)
chr7 (32-317)||(8621617-8621904)
chr7 (32-317)||(4216263-4216548)
chr7 (73-317)||(40048467-40048713)
chr7 (73-317)||(24738396-24738641)
chr7 (32-317)||(171143-171430)
chr7 (77-317)||(9089533-9089774)
chr7 (73-317)||(26692105-26692350)
chr7 (73-317)||(11009480-11009725)
chr7 (73-317)||(1991851-1992096)
chr7 (77-317)||(8008429-8008670)
chr7 (73-317)||(42870128-42870373)
chr7 (92-321)||(13180466-13180697)
chr7 (34-160)||(4421348-4421476)
chr7 (32-130)||(21695068-21695168)
chr7 (30-146)||(14137906-14138021)
chr7 (32-130)||(13660851-13660951)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (9-318)||(23465626-23465937)
chr8 (25-318)||(30321017-30321310)
chr8 (26-316)||(19422594-19422884)
chr8 (9-318)||(19229029-19229339)
chr8 (9-318)||(25680300-25680610)
chr8 (32-317)||(26115546-26115831)
chr8 (32-318)||(19132954-19133241)
chr8 (33-321)||(3837127-3837415)
chr8 (32-317)||(6155340-6155625)
chr8 (32-317)||(44485388-44485673)
chr8 (77-317)||(36297242-36297482)
chr8 (73-317)||(13694884-13695129)
chr8 (73-317)||(29080705-29080950)
chr8 (73-317)||(32084010-32084255)
chr8 (77-317)||(9345416-9345657)
chr8 (73-264)||(15787033-15787225)
chr8 (77-317)||(3354949-3355190)
chr8 (32-315)||(23787690-23787976)
chr8 (73-317)||(246122-246367)
chr8 (73-317)||(809242-809487)
chr8 (32-321)||(22152596-22152887)
chr8 (73-317)||(36082225-36082470)
chr8 (206-318)||(16741118-16741230)
chr8 (30-319)||(22667336-22667623)
chr8 (34-321)||(21292581-21292869)
chr8 (35-231)||(19933400-19933596)
chr8 (30-231)||(24649176-24649376)
chr8 (32-130)||(17263636-17263737)
chr8 (33-130)||(20378182-20378281)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (9-318)||(18921723-18922030)
chr6 (9-318)||(12369901-12370213)
chr6 (32-312)||(27497930-27498210)
chr6 (9-282)||(25798057-25798329)
chr6 (32-318)||(27377018-27377305)
chr6 (32-318)||(27467375-27467662)
chr6 (26-318)||(20036192-20036483)
chr6 (32-312)||(26037840-26038120)
chr6 (32-318)||(9118779-9119065)
chr6 (33-321)||(18830592-18830881)
chr6 (32-317)||(34813451-34813736)
chr6 (27-321)||(25731141-25731434)
chr6 (31-317)||(32968234-32968520)
chr6 (32-317)||(26869029-26869314)
chr6 (73-317)||(3665694-3665938)
chr6 (28-321)||(22290211-22290505)
chr6 (32-321)||(13917474-13917765)
chr6 (73-317)||(12723125-12723370)
chr6 (32-317)||(12859150-12859444)
chr6 (77-317)||(27346014-27346255)
chr6 (77-317)||(27406754-27406995)
chr6 (73-317)||(25791982-25792226)
chr6 (77-317)||(26029691-26029932)
chr6 (42-321)||(25682403-25682682)
chr6 (77-317)||(16953278-16953520)
chr6 (73-317)||(4635193-4635438)
chr6 (34-321)||(21123715-21124004)
chr6 (73-317)||(32307335-32307580)
chr6 (10-220)||(17783732-17783943)
chr6 (28-315)||(18547605-18547893)
chr6 (49-236)||(14065862-14066056)
chr6 (34-231)||(22380263-22380463)
chr6 (85-321)||(19457679-19457915)
chr6 (43-154)||(7665537-7665649)
chr6 (85-231)||(1655062-1655209)
chr6 (177-315)||(11239925-11240063)
chr6 (34-220)||(17051676-17051866)
chr6 (34-130)||(11239823-11239920)
chr6 (34-153)||(16880403-16880523)
chr6 (30-79)||(22809510-22809559)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (23-318)||(39199-39493)
scaffold0047 (73-318)||(43060-43305)
scaffold0047 (32-130)||(2747-2848)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (25-318)||(7683356-7683649)
chr1 (25-318)||(149998-150291)
chr1 (32-318)||(5646027-5646315)
chr1 (32-318)||(19183133-19183419)
chr1 (32-318)||(4171517-4171804)
chr1 (32-318)||(12734744-12735030)
chr1 (32-317)||(7511488-7511774)
chr1 (32-317)||(21867878-21868164)
chr1 (32-317)||(12619476-12619763)
chr1 (73-317)||(36242756-36243001)
chr1 (32-317)||(51652198-51652484)
chr1 (73-317)||(7695796-7696041)
chr1 (73-317)||(38099340-38099585)
chr1 (73-317)||(35644363-35644607)
chr1 (77-317)||(3175850-3176091)
chr1 (73-317)||(5837459-5837704)
chr1 (73-317)||(47614257-47614502)
chr1 (34-321)||(19165968-19166258)
chr1 (77-317)||(35396821-35397062)
chr1 (30-315)||(20879322-20879607)
chr1 (42-147)||(21212168-21212275)
chr1 (34-143)||(21130797-21130908)
chr1 (33-130)||(20933522-20933620)
chr1 (33-130)||(22125711-22125810)
chr1 (30-144)||(22460559-22460674)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (26-318)||(38648-38940)
scaffold0133 (32-317)||(35389-35674)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (41-317)||(1-278)
scaffold0398 (41-312)||(8261-8533)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (32-312)||(215-495)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (50-318)||(5098-5371)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (35-318)||(77-360)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (10-254)||(1813-2057)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (27-277)||(1-251)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (32-319)||(2710-2998)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (43-312)||(31149-31419)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (33-318)||(49255-49544)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (10-321)||(179717-180030)
scaffold0017 (92-321)||(49547-49776)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (27-291)||(6603-6868)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (30-321)||(5944-6236)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (32-321)||(69136-69426)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (9-210)||(18426-18627)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (33-254)||(220565-220785)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (73-317)||(43274-43519)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (28-321)||(62782-63077)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (42-321)||(131946-132226)
scaffold0012 (92-319)||(485-712)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (47-321)||(10835-11111)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (176-318)||(195413-195555)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (28-321)||(55022-55317)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (28-315)||(5688-5977)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (35-254)||(30302-30520)
[»] scaffold0752 (1 HSPs)
scaffold0752 (28-321)||(6210-6505)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (28-315)||(313-602)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (92-321)||(109230-109460)
[»] scaffold1078 (1 HSPs)
scaffold1078 (34-319)||(70-357)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (27-321)||(73839-74136)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (30-229)||(6287-6489)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (85-312)||(8583-8825)
scaffold0099 (26-71)||(10345-10390)
[»] scaffold0537 (1 HSPs)
scaffold0537 (10-164)||(1471-1626)
[»] scaffold1362 (1 HSPs)
scaffold1362 (9-102)||(1-93)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (49-220)||(2456-2633)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (33-145)||(1-114)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (34-161)||(162063-162192)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (85-321)||(20966-21203)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (85-321)||(6203-6439)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (49-321)||(161277-161555)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (27-130)||(1836-1940)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (30-147)||(3174-3291)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (49-160)||(24723-24838)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (32-130)||(8301-8401)
scaffold0004 (32-130)||(2439-2539)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (35-144)||(30679-30791)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (77-153)||(5617-5693)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (32-130)||(487-586)
[»] scaffold1365 (1 HSPs)
scaffold1365 (35-130)||(1075-1173)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (173-321)||(11396-11543)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (32-118)||(7073-7161)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (85-220)||(13417-13552)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (32-130)||(372-471)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (30-118)||(10999-11090)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (43-147)||(11395-11501)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (30-130)||(42094-42198)
[»] scaffold0594 (1 HSPs)
scaffold0594 (32-130)||(3545-3643)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (85-220)||(20948-21084)
scaffold0132 (85-220)||(34149-34285)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (74-220)||(13420-13565)
scaffold0176 (30-66)||(13389-13425)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (32-130)||(13580-13683)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (32-66)||(2685-2719)
[»] scaffold2124 (1 HSPs)
scaffold2124 (71-130)||(536-597)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (32-88)||(11809-11868)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11212681 - 11212372
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11212681 agcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttattaaaacgtttgcaattcaaaagag 11212583  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11212582 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 11212483  T
Q  208 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212482 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 11212383  T
Q  308 gcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||    
T  11212382 gcaaagaatac 11212372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 4408543 - 4408852
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4408543 agcagagaagattaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagaga 4408641  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4408642 caaacaaacatagcattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 4408741  T
Q  209 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4408742 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacaactgttactaaaagtaacttccaacgatcccactagccttgctattcagaag 4408841  T
Q  309 caaagaataca 319  Q
    |||||||||||    
T  4408842 caaagaataca 4408852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1790459 - 1790151
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1790459 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagaga 1790361  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1790360 caaacaaacatagcattaatgacaaattggaggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagata 1790261  T
Q  209 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  1790260 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacattcggataatgggaaagctgttacaaaaagtaactgccaatgatcccactaggcttgctattcagaaa 1790161  T
Q  309 caaagaatac 318  Q
    ||||||||||    
T  1790160 caaagaatac 1790151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9387171 - 9386862
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |    
T  9387171 agcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgtagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaagggg 9387073  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9387072 acaaacaaacatagcattaatgacaaatagggggcgcgtgatagtaagttcaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 9386973  T
Q  208 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9386972 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaa 9386873  T
Q  308 gcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||    
T  9386872 gcaaagaatac 9386862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16387451 - 16387165
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  16387451 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgttagttttaagtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacaaagcattaatgac 16387352  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16387351 aaattgggggcacgtgttagtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 16387252  T
Q  232 aaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  16387251 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcctcgctgatcagaagcaaggaatac 16387165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29467775 - 29467482
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29467775 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 29467676  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29467675 ttaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcactgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 29467576  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  29467575 ttttcagaaaaataacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaggtaactgccaacgttcccactagcc-aactattcagaagcaaagaatac 29467482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17906114 - 17905822
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17906114 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 17906016  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17906015 taatgacaaattgggg-cgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaact 17905917  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaa-agtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17905916 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggaccgctgttacaaaagagtaactgtaaacgatcccactagccatgctattcaggagcaaagaatac 17905822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14317616 - 14317328
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  14317616 gaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttattt-aagtgtctttagtaaaaacgtttgcaattcaaaggggacaaacaaacaaagcattaatga 14317518  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14317517 caaatagggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcag 14317418  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    |  | ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14317417 actaataacc-ttggttaatgggacatgtgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagtaaagaatacagc 14317328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6496907 - 6496627
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6496907 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 6496809  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  6496808 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccgcgtcagagacttttcag 6496709  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6496708 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 6496627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9988452 - 9988172
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9988452 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgttttaattaaaccgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 9988354  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9988353 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 9988254  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9988253 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 9988172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9002372 - 9002061
Alignment:
Q  10 gcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9002372 gcagagaaggttggagaagaaattaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaaggg 9002274  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9002273 acaaacacacaaagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataattcatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 9002174  T
Q  208 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9002173 agaccacgtcagaaacttttcagactaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactg-caacgatcccactagccttgctattcaga 9002076  T
Q  307 agcaaagaatacagc 321  Q
    || ||||||||||||    
T  9002075 agtaaagaatacagc 9002061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6216616 - 6216329
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6216616 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 6216518  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  6216517 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 6216418  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6216417 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 6216329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12244123 - 12243838
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12244123 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcataaaagacaaacaaacatagcattaatga 12244025  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  12244024 caaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagatagaccacgtcagagacttttcag 12243925  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12243924 aaaact-acctttgggtaatgagacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataatac 12243838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 19782695 - 19782982
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19782695 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 19782793  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19782794 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgcccttttggttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 19782893  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
     ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19782894 taaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 19782982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 1057851 - 1058145
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatt 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  1057851 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcatt 1057949  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1057950 aatgacaaattgggggtgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgctctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagaaactt 1058049  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||||||  | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1058050 ttcagactaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagcaaagaacacagc 1058145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7800629 - 7800361
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatta 126  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7800629 aaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagtatta 7800531  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttt 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  7800530 atgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaacctat 7800431  T
Q  227 tcag-aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttac-taaaagtcactgccaacgatcccactagcc 294  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7800430 tcagaaaaactaacctttgggtaatgggacaactgttacaaaaaagtaactgcaaacgatcccactagcc 7800361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16666994 - 16666714
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16666994 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacaaagcattaatgacaaattggg 16666896  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  | ||||    
T  16666895 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaacaagtcagaaacttttcagactaataac 16666796  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    | ||||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16666795 c-ttggttaatgggacaggtgttacaaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcagaagtaaagaatacagc 16666714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 37870734 - 37871021
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37870734 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtatgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 37870832  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  37870833 acaaattgggggcgtatgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacacatagaccatgtcagagactcttca 37870932  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  37870933 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaatac 37871021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 37879252 - 37879539
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37879252 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtatgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 37879350  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  37879351 acaaattgggggcgtatgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacacatagaccatgtcagagactcttca 37879450  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  37879451 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaatac 37879539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13379230 - 13378944
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13379230 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 13379132  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  13379131 caaattgggggtgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 13379032  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13379031 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 13378944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13389824 - 13389538
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13389824 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 13389726  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  13389725 caaattgggggtgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 13389626  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13389625 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 13389538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 14469893 - 14470178
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14469893 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 14469991  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14469992 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaaacaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 14470091  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  14470092 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 14470178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20679761 - 20679476
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20679761 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 20679663  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  20679662 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 20679563  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  20679562 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 20679476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 13126004 - 13126248
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13126004 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaaacaaataaaa 13126103  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||     
T  13126104 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 13126203  T
Q  273 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  13126204 actgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 13126248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5623961 - 5623675
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5623961 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 5623863  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  5623862 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 5623763  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  5623762 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 5623675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 23761568 - 23761854
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  23761568 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgg 23761666  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  23761667 caaattgggggcgcgtgatagtatatttaaaagcaagtaaaacatcattgcccggtttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 23761766  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23761767 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 23761854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24390082 - 24389797
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24390082 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 24389984  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  24389983 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 24389884  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  24389883 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaata 24389797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 39376357 - 39376642
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39376357 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacacacatagcattaatga 39376455  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  39376456 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcag 39376555  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  39376556 aaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 39376642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 510694 - 510449
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  510694 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 510595  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  510594 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 510495  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  510494 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 510449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15222639 - 15222347
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacatagcattaa 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  15222639 atgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgcgtgttt-ttctatgtgtttttagtgaaaacgattacaattcaaaaagggacaaacaaacaaagcattaa 15222541  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15222540 tgaaaaattggaggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattaccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgttagaaactttt 15222441  T
Q  228 cagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| | || ||||||||| | || ||||||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||    
T  15222440 cagactaataacc-ttggttaatggaacaggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactgaccctgttattcagaagtaaagaatacagc 15222347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11278921 - 11278676
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  11278921 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 11278822  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  11278821 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 11278722  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11278721 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 11278676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5543545 - 5543300
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5543545 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 5543446  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  5543445 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 5543346  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  5543345 aactgccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaata 5543300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 104 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10633320 - 10633102
Alignment:
Q  104 agagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt----gttatactcca 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  10633320 agagacaaacaaacatagaattaatgacaaattgggggcgcgtgatagtatatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttttttgttatactcca 10633221  T
Q  200 atactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgct 299  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10633220 atacaaatagaccacgtcagagactttttagaaaactaacctttgagtaatgggacagctgtcacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgct 10633121  T
Q  300 attcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  10633120 attcagaagcaaataatac 10633102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5872262 - 5871975
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5872262 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 5872164  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaat-aaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5872163 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 5872064  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  5872063 gaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 5871975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29898145 - 29897872
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29898145 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 29898048  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  | |||     
T  29898047 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcaaagacttttcagactaataa- 29897949  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||    
T  29897948 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaattctgctattcagaagtaaagaa 29897872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29940105 - 29939832
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29940105 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 29940008  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  | |||     
T  29940007 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcaaagacttttcagactaataa- 29939909  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||    
T  29939908 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaattctgctattcagaagtaaagaa 29939832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29989259 - 29988986
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29989259 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 29989162  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  | |||     
T  29989161 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcaaagacttttcagactaataa- 29989063  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||    
T  29989062 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaattctgctattcagaagtaaagaa 29988986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 4748036 - 4748277
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  4748036 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 4748135  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  4748136 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 4748235  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  4748236 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 4748277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 24664187 - 24664428
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24664187 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24664286  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  24664287 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24664386  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  24664387 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 24664428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 41687966 - 41688207
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  41687966 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 41688065  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  41688066 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 41688165  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  41688166 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 41688207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 5514945 - 5515231
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5514945 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 5515043  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5515044 caaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 5515143  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||||   ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  5515144 gaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaata 5515231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12292709 - 12292468
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  12292709 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 12292610  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  12292609 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactgctttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 12292510  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  12292509 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 12292468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16425678 - 16425436
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  16425678 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 16425579  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcac 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||    
T  16425578 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaac 16425479  T
Q  275 tgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    | |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  16425478 taccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 16425436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28320762 - 28320517
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  28320762 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 28320663  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  28320662 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 28320563  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  28320562 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 28320517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Original strand, 13075257 - 13075415
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa--cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13075257 gaaatgaaagtgtgagatgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 13075355  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct 184  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13075356 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct 13075415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 8778975 - 8779221
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaa-gcaaataaa 171  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||| || ||||||    
T  8778975 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaaagcgaataaa 8779074  T
Q  172 a-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaag 270  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||    
T  8779075 aacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaag 8779174  T
Q  271 tcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    | ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  8779175 taacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 8779221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 38198969 - 38199210
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  38198969 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 38199068  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  38199069 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 38199168  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  38199169 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 38199210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 17963984 - 17964165
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattcaa--aagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | | ||||||   | | |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  17963984 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttaaataaaacgatagaaattcatgtaggggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgg 17964082  T
Q  139 gggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcaga 220  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17964083 gggcgcgtgaaagtaaatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttagttatactccaatacaaatagaccacgtcaga 17964165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Original strand, 17010408 - 17010699
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||     
T  17010408 aagtgtaggttgtgaagtgagttgtgtgtgttttgtcaaagtgtttatgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacatcattaatgac 17010507  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgttt-aaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17010508 aaattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaaagcttataaaatcattattgcccttttagtaatacactaatacaaatagaccacgtcatagacttttca 17010607  T
Q  230 gaaaactaacc-tttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    || ||  ||||  ||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  17010608 gacaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacgttcccactaacgctgctatgcagaagcaaataatacagc 17010699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Original strand, 17021214 - 17021505
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||     
T  17021214 aagtgtaggttgtgaagtgagttgtgtgtgttttgtcaaagtgtttatgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacatcattaatgac 17021313  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgttt-aaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17021314 aaattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaaagcttataaaatcattattgcccttttagtaatacactaatacaaatagaccacgtcatagacttttca 17021413  T
Q  230 gaaaactaacc-tttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    || ||  ||||  ||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  17021414 gacaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacgttcccactaacgctgctatgcagaagcaaataatacagc 17021505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 5197394 - 5197508
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||    
T  5197394 atgaacgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaat 5197493  T
Q  129 gaaaaattgggggcgc 144  Q
    | | ||||||||||||    
T  5197494 g-acaattgggggcgc 5197508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 321
Target Start/End: Original strand, 13143421 - 13143699
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttt-tagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||     
T  13143421 agtgagtagtgtgtgtttggtttatatagtgttttaaaaaaaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacactgcattaatgacaaattaggggcgt 13143520  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccctttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctt 242  Q
    |||  | ||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||   ||||||| | || |  |||    
T  13143521 gtgaaaatacatttaaaagcttataaagtcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagagcacgtcagaggtttttcag-acacaatgctt 13143619  T
Q  243 tggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    |||||| ||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||   |||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  13143620 tggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactaccaacgcctccactaaccctgccgttcagaagcaaagaatacagc 13143699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17219886 - 17219787
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  17219886 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagcaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacaaagcattaatga 17219787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12389898 - 12389798
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-taagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | ||||||||    
T  12389898 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtatgtgattttgtctaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaggggaaaaacaaacacaacattaatg 12389799  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  12389798 a 12389798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Original strand, 15837532 - 15837717
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttg---ttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||| |||||||||||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  15837532 agtgagttgtgtgtgtttggtatttatagtgtttttgagtaaaacgtttgcaattcagaggggacaaacaaacacaacattaatg-acaattgggggcgc 15837630  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    |||  |||| ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||  ||||||| ||||||| || | ||||||||||| || |||||    
T  15837631 gtgaaagtacgtttaaaagcttataaaatcaccatagcccttttaagttatacaccaatacaaacaaaccacgtcagagacgtttca 15837717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17251320 - 17251232
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaaca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17251320 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtggtgtgtgttttctctaagtgttttaagcaaaaacgtttgcaattcagaaagcgacaaacaaaca 17251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15657157 - 15657098
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa 88  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  15657157 aaataaaagtgttagttgtgaagtgagtagtgtgtgattg-tctaagtgtttttagtaaaa 15657098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12393983 - 12393913
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgt-tttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12393983 aaagtgtaggttgtgaagtgagaaatgtgtgtttttgtctaagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattca 12393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12954496 - 12954448
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttt 80  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  12954496 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgtttt 12954448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Original strand, 26871357 - 26871669
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtt-aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871357 agcagagaaggttgaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 26871455  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26871456 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcacgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 26871555  T
Q  208 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871556 agaccacgtcagaaacttttcagagaactaccctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 26871655  T
Q  308 gcaaagaatacagc 321  Q
    | ||||||||||||    
T  26871656 gtaaagaatacagc 26871669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24421554 - 24421251
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24421554 agcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 24421456  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24421455 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagat 24421356  T
Q  208 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24421355 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggaaagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 24421256  T
Q  308 gcaaa 312  Q
     ||||    
T  24421255 acaaa 24421251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21127549 - 21127239
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  21127549 agcagagaaggtttgaaatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttg-aagtgtttttataaaaaacgtttgcaattcaaatga 21127451  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21127450 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 21127351  T
Q  207 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21127350 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 21127251  T
Q  307 agcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||    
T  21127250 agcaaagaatac 21127239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21168489 - 21168201
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21168489 atgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcattaat 21168391  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 228  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21168390 gacaaattgggggtgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttc 21168291  T
Q  229 agaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21168290 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcaaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 21168201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 43086927 - 43087213
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43086927 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatga 43087025  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  43087026 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 43087125  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  43087126 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaatac 43087213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24334333 - 24334046
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24334333 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacaaagcattaatg 24334235  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24334234 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 24334135  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24334134 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgtcaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 24334046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 29248449 - 29248736
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29248449 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatg 29248547  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29248548 acaaattgggggggcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatacttcaatacaaatagaccaagtcagagactcttca 29248647  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  29248648 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaatac 29248736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9904156 - 9903870
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9904156 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacacagcattaatga 9904058  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  9904057 caaattaggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 9903958  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9903957 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaacttccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 9903870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34796800 - 34796514
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34796800 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatga 34796702  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  34796701 caaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 34796602  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||   ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34796601 aaaactacattttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 34796514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 40244838 - 40245123
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40244838 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 40244936  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  40244937 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 40245036  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40245037 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 40245123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28727859 - 28727651
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28727859 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcatt 28727761  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28727760 aatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcagtgtcctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaactt 28727661  T
Q  226 ttcagaaaac 235  Q
    ||||||||||    
T  28727660 ttcagaaaac 28727651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 4214124 - 4214410
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4214124 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 4214222  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc-tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  4214223 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 4214322  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4214323 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 4214410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9769346 - 9769061
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9769346 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 9769248  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  9769247 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaaataaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 9769148  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9769147 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 9769061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39176679 - 39176393
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39176679 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 39176581  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  39176580 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 39176481  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  39176480 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 39176393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 10271259 - 10271500
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10271259 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 10271358  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  10271359 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactctttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 10271458  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  10271459 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 10271500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 315
Target Start/End: Original strand, 22768005 - 22768278
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  22768005 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaaggggacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 22768102  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 239  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||     
T  22768103 ggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataagacatcattgccctttctattatactccaatacaaatacaccacgtcagagacttttcagacta-aaaa 22768201  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22768202 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactagcgttgctattcagaagtaaagaa 22768278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11401757 - 11401471
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11401757 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 11401659  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11401658 caaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 11401559  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  11401558 gaaaactactttttgggtaatgggacggctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 11401471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22748109 - 22747820
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaag-agacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22748109 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataaggagacaaacaaacatagcattaatga 22748011  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
     |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22748010 cag-ttgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttagttatacaccaatacaaatagaccacgtcataaatttttca 22747912  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  22747911 gactaataa-ctttggttaatgggataggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcataagtaaagaacacagc 22747820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 90 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22940184 - 22939955
Alignment:
Q  90 gtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt- 188  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22940184 gtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttt 22940085  T
Q  189 -gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatccc 287  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| ||||    
T  22940084 tgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttccc 22939985  T
Q  288 actagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  22939984 actaaccaagctattcagaagcaaagaata 22939955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 43349671 - 43349916
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || |||||| |||||||    
T  43349671 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtacattaaaaagcgaataaaa 43349770  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  43349771 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagagaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 43349870  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  43349871 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 43349916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 35257277 - 35257518
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  35257277 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 35257376  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  35257377 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 35257476  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  35257477 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 35257518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 35267902 - 35268143
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  35267902 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 35268001  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  35268002 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 35268101  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  35268102 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 35268143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 27225711 - 27225952
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  27225711 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggtgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 27225810  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  27225811 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 27225910  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  27225911 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 27225952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24810689 - 24810512
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| | | |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24810689 agtgagttgtgtgtgtttggtttatatagtgttttgatgaaaaacgattacaattcagaggagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgc 24810590  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgcccttt-ttgttatactccaatactaatagaccacgtcaga 220  Q
    |||  |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24810589 gtgaaagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccctttcaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcaga 24810512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 18942102 - 18942203
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  18942102 atgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgtttttagtaaaatgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaat 18942201  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  18942202 ga 18942203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19308966 - 19308850
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19308966 aagtgtaggttttgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttaaagtaaaaacgttagcaattcagaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 19308867  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtg 147  Q
     |||||||| |||||||    
T  19308866 caaattgggagcgcgtg 19308850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Original strand, 24719586 - 24719676
Alignment:
Q  43 ttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24719586 ttgtgaagtgagtagtgtgtgattttgtctacgtatttttagtaaaaacgtttgcaattcagaagaggacaaacaaacacagcattaatga 24719676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28727653 - 28727614
Alignment:
Q  279 aacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28727653 aacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaatac 28727614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 28707663 - 28707603
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28707663 gttgtgaagtgagtagtgtgtgttttggctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattca 28707603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19308795 - 19308715
Alignment:
Q  242 ttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||    
T  19308795 ttggttagtgggacaggtgttactaagaagtaactgccaacgtttccactaatcctgctattcagaagtaaagaacacagc 19308715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Original strand, 17450883 - 17451194
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17450883 agcagagaagattaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagaga 17450981  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17450982 caaacaaacataacattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgtcctttttgttatactccaatacaaata 17451081  T
Q  209 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17451082 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaacttccaacgatcccactagccttgctattcagaag 17451181  T
Q  309 caaagaatacagc 321  Q
    |||||||||||||    
T  17451182 caaagaatacagc 17451194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23402620 - 23402311
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23402620 agcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 23402522  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23402521 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 23402422  T
Q  208 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23402421 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttactaaaagtaactgcaaacgatctcactagccttgctattcagaa 23402322  T
Q  308 gcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||    
T  23402321 gcaaagaatac 23402311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34058642 - 34058330
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaag-atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34058642 agcagagaaggtttaggacgaaatgaaagtgtgagttgtgaggtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 34058544  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34058543 acaaacaaacatagcattaatgacaaatagagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 34058444  T
Q  208 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34058443 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggatagctgttactaaaagtaacttccaacgatcccactagccttgctatttagaa 34058344  T
Q  308 gcaaagaatacagc 321  Q
    ||||||||||||||    
T  34058343 gcaaagaatacagc 34058330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20786736 - 20786445
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20786736 gaaatgaaagtgtgagtagtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 20786638  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20786637 aatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 20786538  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20786537 ttcagaaaactaacccttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 20786445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34778588 - 34778297
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34778588 gaaatgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 34778490  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  34778489 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 34778390  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34778389 tttcagaaaactaacttttgggtaatgggacagctgttaccaagagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 34778297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20558440 - 20558147
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20558440 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 20558342  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  20558341 taatgacaaatttggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 20558242  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttac-taaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20558241 tttcagaaaactaacatttgggtaatgagacagctgttacaaaaaagtaactgcaaacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaatac 20558147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19470607 - 19470301
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||    
T  19470607 agcagagaaggtttgagacgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgtaattcggaagag 19470509  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    ||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19470508 acaaacaa---tagcattaatgacaaattgggggcgcgtgctagtatgttcaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 19470412  T
Q  208 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 307  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19470411 agaccacgtcagagactcttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 19470312  T
Q  308 gcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||    
T  19470311 gcaaagaatac 19470301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Original strand, 1115450 - 1115744
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt--ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115450 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagcgagtagtgtgtgttttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 1115549  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1115550 attaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaa 1115649  T
Q  223 cttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1115650 cttttcagaaaaccaacctttgggtaatgagacagctgttacacaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agccattcagaagcaaagaatac 1115744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 69 - 318
Target Start/End: Original strand, 24933864 - 24934114
Alignment:
Q  69 tttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaa 167  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24933864 tttaagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggggcgtgttagtatgtttaaaagcaaa 24933963  T
Q  168 taaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  24933964 taaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaa 24934063  T
Q  268 aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24934064 aagtaactgcaaacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaatac 24934114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 5294716 - 5295003
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294716 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 5294814  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||    
T  5294815 acaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaaatcagagactcttca 5294914  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5294915 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaatgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 5295003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39359183 - 39358896
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39359183 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 39359085  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  39359084 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 39358985  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39358984 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 39358896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40397049 - 40396763
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40397049 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatg 40396951  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  40396950 acaaattgggggcgcgtgttagtatgtcaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 40396851  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||| | ||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40396850 gaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaata 40396763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 27607595 - 27607882
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27607595 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 27607693  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |    
T  27607694 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttta 27607793  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||    
T  27607794 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttccaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcaaaagcaaagaatac 27607882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31840107 - 31839822
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31840107 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 31840009  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  31840008 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 31839909  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31839908 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 31839822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 14562227 - 14562512
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14562227 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 14562325  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14562326 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 14562425  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  14562426 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaata 14562512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 21418543 - 21418832
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  21418543 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgttttaagtaaaaacgattgcaattcaaaaaggagacaaacaaacaaagcat 21418641  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  21418642 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatt 21418741  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    |||||||  | ||||||||  ||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21418742 tttcagactaataaccttt-attaatgggacaggtgtttctaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaa 21418832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 15997471 - 15997757
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15997471 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtgtttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 15997569  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  15997570 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 15997669  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15997670 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 15997757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22153203 - 22152918
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  22153203 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacatcattaatga 22153105  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  22153104 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 22153005  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  22153004 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 22152918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6982493 - 6982207
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6982493 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 6982395  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  6982394 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 6982295  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  6982294 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 6982207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23302965 - 23302679
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23302965 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 23302867  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  23302866 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 23302767  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  23302766 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 23302679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 39495060 - 39495346
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39495060 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 39495158  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  39495159 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 39495258  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  39495259 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 39495346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22682804 - 22682518
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22682804 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 22682706  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  22682705 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 22682606  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||    ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  22682605 aaaactgctttttggataatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 22682518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23703427 - 23703182
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  23703427 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 23703328  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  23703327 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 23703228  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23703227 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 23703182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 30231640 - 30231885
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  30231640 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 30231739  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  30231740 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 30231839  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30231840 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 30231885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42049427 - 42049182
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  42049427 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 42049328  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  42049327 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 42049228  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42049227 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 42049182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24814556 - 24814315
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  24814556 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 24814457  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  24814456 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 24814357  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  24814356 gccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 24814315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9342602 - 9342357
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  9342602 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 9342503  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  9342502 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 9342403  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  9342402 aactgccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaata 9342357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 14451226 - 14451471
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14451226 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 14451325  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  14451326 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 14451425  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  14451426 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 14451471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 27046454 - 27046695
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27046454 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 27046553  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  27046554 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 27046653  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  27046654 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 27046695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14036685 - 14036444
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  14036685 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 14036586  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  14036585 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 14036486  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  14036485 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 14036444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27466805 - 27466564
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  27466805 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 27466706  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  27466705 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 27466606  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  27466605 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 27466564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 36586690 - 36586976
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36586690 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 36586788  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  36586789 caaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 36586888  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||||   ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  36586889 gaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaata 36586976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23368583 - 23368338
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  23368583 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 23368484  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  23368483 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 23368384  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  23368383 aactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaata 23368338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 24821094 - 24821335
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24821094 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24821193  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  24821194 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24821293  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  24821294 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 24821335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17613705 - 17613464
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  17613705 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 17613606  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  17613605 cattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 17613506  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  17613505 tccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 17613464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24573715 - 24573474
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24573715 tttttattaaaacgtttgtaattcagaatggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24573616  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  24573615 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgttagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24573516  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  24573515 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 24573474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 24592280 - 24592521
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24592280 tttttattaaaacgtttgtaattcagaatggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24592379  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  24592380 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgttagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24592479  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  24592480 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 24592521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15746616 - 15746371
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  15746616 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacagacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 15746517  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  15746516 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 15746417  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  15746416 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 15746371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17725565 - 17725320
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  17725565 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgtcaaaaagcgaataaaa 17725466  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  17725465 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 17725366  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  17725365 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 17725320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 315
Target Start/End: Original strand, 13527488 - 13527773
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  13527488 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgtttgaaattcataaggggacgaacaaacatagcattaatga 13527587  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13527588 caaattgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaaacttataaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaaattttca 13527687  T
Q  230 gaaaactaac--ctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    |   ||||||  | ||||||||||||| || ||||||| | | |  |||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  13527688 g---actaacaacattggttaatgggacaggtgttactgagacgcaactgccaacgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaa 13527773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31355181 - 31354936
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  31355181 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 31355082  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  31355081 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 31354982  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  31354981 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 31354936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35222149 - 35221904
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  35222149 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 35222050  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  35222049 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 35221950  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  35221949 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 35221904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36694345 - 36694100
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  36694345 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 36694246  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  36694245 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 36694146  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  36694145 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 36694100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 37734181 - 37734426
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||  |||||| |||||||    
T  37734181 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaattacgtcaaaaagcgaataaaa 37734280  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  37734281 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 37734380  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  37734381 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 37734426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21672545 - 21672337
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag---acaaacaaacatagc 122  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  21672545 gaaaagaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcagaaaaggggacaaacaaacatagc 21672447  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaa 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  21672446 attaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaaagcatataaagtcatcattgccctttttgttatactccaatacaagtacaccacgtcagag 21672347  T
Q  222 acttttcaga 231  Q
    |||| |||||    
T  21672346 acttatcaga 21672337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 317
Target Start/End: Original strand, 23482388 - 23482664
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggc 142  Q
    |||||||  |||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  23482388 agtgagttatgtgtgtttggtttatatagtgttttgagtaaaaacgttagcaattcagaaaggggacaaacaaacacagtattaatgacaaattgagggc 23482487  T
Q  143 gcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac- 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||  |||     
T  23482488 gcgtgttagtacgtttaaaagcttataaaatcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagatcacgtcggagacttttcagacaa--aact 23482585  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
      ||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||  | |||||| |  |||| |||||||| ||||||||    
T  23482586 gcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacatttccactaactctgctgttcagaagtaaagaata 23482664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21613242 - 21613040
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaa 127  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||||||    
T  21613242 atgaaagtgtaggttttaaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaa 21613143  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttt 226  Q
    || | ||||||||||||| | |||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||| ||  || |||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||    
T  21613142 tg-acaattgggggcgcgagatagta-ctttcaaagctaaaaaatcatcattgccctcttaagtcatacaccaatacaaataaaccacgtcagaagcgtt 21613045  T
Q  227 tcaga 231  Q
    |||||    
T  21613044 tcaga 21613040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23433869 - 23433770
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  23433869 gaaagtgtaggttgtgaattgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 23433770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23445236 - 23445135
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  23445236 gaaagtgtaggttgtgaattgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaaagggacaaacaaacacaacattaat 23445137  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  23445136 ga 23445135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 71
Target Start/End: Original strand, 24932394 - 24932439
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 71  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932394 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 24932439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Original strand, 16309378 - 16309689
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  16309378 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgatgtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaaggga 16309476  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16309477 caaacaaacatagcattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 16309576  T
Q  209 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16309577 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 16309676  T
Q  309 caaagaatacagc 321  Q
    |||||||||||||    
T  16309677 caaagaatacagc 16309689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Original strand, 3377196 - 3377508
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  3377196 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgttttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 3377294  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  3377295 acaaacaaacatagcattaaggacaaatagggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcatataaaacatcattgtcctttttgttatactccaatacaaat 3377394  T
Q  208 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3377395 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacaactattactaaaagtaactgctaacgatcccactaaccttgctattcagaa 3377494  T
Q  308 gcaaagaatacagc 321  Q
    | ||||||||||||    
T  3377495 gtaaagaatacagc 3377508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 27 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15203386 - 15203093
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15203386 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaagagagacaaacaaacatagcatta 15203288  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct--ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15203287 atgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 15203188  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaataca 319  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15203187 ttttagagaactaacctttagttaatgggacaactgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagtaaagaataca 15203093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40463311 - 40463026
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  40463311 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatgac 40463212  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40463211 aaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaatttttcaga 40463112  T
Q  232 aaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  40463111 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agccattcagaagcaaagaatac 40463026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14842660 - 14842365
Alignment:
Q  23 agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842660 agatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 14842562  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcag-aa 221  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  14842561 attaatgacaaattgggggcgtgtgttagtacatttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagatagaccacgtcagaaa 14842462  T
Q  222 acttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14842461 acttttcagaaaactaacatttggataatgggacagttgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaaacaaagaatac 14842365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27821499 - 27821213
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821499 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcataagagacaaacaaacatagcattaatga 27821401  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  27821400 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 27821301  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27821300 aaaactaacttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 27821213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4994364 - 4994084
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4994364 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaaagacaaacaaacatagcattaatga 4994266  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4994265 caaattgggggcgcgtgttggtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 4994166  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4994165 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 4994084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Original strand, 4997974 - 4998254
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4997974 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaaagacaaacaaacatagcattaatga 4998072  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4998073 caaattgggggcgcgtgttggtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 4998172  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4998173 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 4998254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18759059 - 18758779
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18759059 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaaaagagacgaacaaacatagcattaatga 18758961  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18758960 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 18758861  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18758860 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 18758779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 55751820 - 55751535
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55751820 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 55751722  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  55751721 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 55751622  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  55751621 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 55751535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 321
Target Start/End: Original strand, 11540307 - 11540597
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  11540307 gaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaagaggacaaacaaacaaagcattaatt 11540405  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11540406 acaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaaacatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 11540505  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11540506 gactaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaatgtaactgccaacgatcccactaaccttgctatttagaagtaaagaacacagc 11540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 17922385 - 17922672
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17922385 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 17922483  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17922484 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 17922583  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17922584 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaccgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 17922672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 84 - 318
Target Start/End: Original strand, 27192236 - 27192470
Alignment:
Q  84 taaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27192236 taaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccc 27192335  T
Q  184 tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacga 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  27192336 tttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgt 27192435  T
Q  284 tcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27192436 tcccactaaccaagctattcagaagcaaagaatac 27192470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19950963 - 19950680
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19950963 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaggagacaaacaaacatagcattaatg 19950865  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19950864 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 19950765  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaaga 314  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19950764 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaaga 19950680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 73 - 318
Target Start/End: Original strand, 22000746 - 22000991
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22000746 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaa 22000845  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||     
T  22000846 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 22000945  T
Q  273 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22000946 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 22000991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24024037 - 24023750
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24024037 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacacagcattaatg 24023939  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24023938 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 24023839  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24023838 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaccgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 24023750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 321
Target Start/End: Original strand, 10294970 - 10295250
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10294970 gttgtgaagtgagtagtgtgtatttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgacaaattggg 10295068  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  10295069 ggcgcgtgttagtacgtttaaaaacatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagatacttttcagactaataac 10295168  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10295169 c-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaactaaagaatacagc 10295250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 16260152 - 16260437
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16260152 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 16260250  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  16260251 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 16260350  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  16260351 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 16260437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30933056 - 30932771
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30933056 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 30932958  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  30932957 caaattgggg-cgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 30932859  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30932858 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 30932771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 454850 - 455136
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  454850 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacacacaaacacagcattaatga 454948  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  454949 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacatcagagactcttcag 455048  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  455049 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacattcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 455136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 73 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14846469 - 14846225
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  14846469 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaa- 14846371  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||     
T  14846370 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 14846271  T
Q  273 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14846270 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 14846225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 27660939 - 27661184
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  27660939 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 27661038  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  27661039 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 27661138  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27661139 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 27661184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 49511866 - 49512107
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  49511866 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 49511965  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  49511966 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 49512065  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  49512066 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 49512107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10747122 - 10746881
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10747122 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 10747023  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  10747022 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 10746923  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  10746922 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 10746881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10960891 - 10960650
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10960891 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 10960792  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  10960791 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 10960692  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  10960691 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 10960650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 36022622 - 36022863
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  36022622 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 36022721  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  36022722 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 36022821  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  36022822 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 36022863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39516791 - 39516594
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa--cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  39516791 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcat 39516693  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39516692 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 39516594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 24644662 - 24644903
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  24644662 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 24644761  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  24644762 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 24644861  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  24644862 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 24644903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 19575279 - 19575406
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19575279 agcagagaagattaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagaga 19575377  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19575378 caaacaaacatagcattaatgacaaattg 19575406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15010484 - 15010413
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcg 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||| | | ||||||||    
T  15010484 agtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaagaggacaaacaaacacaaaattaatgacatagtgggggcg 15010413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 11519400 - 11519432
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgt 60  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11519400 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgt 11519432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25207717 - 25207406
Alignment:
Q  10 gcagagaaggttaag-atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25207717 gcagagaaggtttaggacgaaatgaaagtgtgagttttgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 25207619  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25207618 caaacaaacatagcattaatgacaaattgggggctcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 25207519  T
Q  209 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25207518 gaccacgtcagaaacttttcagataaataacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagcctttctattcagaag 25207419  T
Q  309 caaagaatacagc 321  Q
     ||| ||||||||    
T  25207418 taaaaaatacagc 25207406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 318
Target Start/End: Original strand, 9163812 - 9164106
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt---agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 122  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9163812 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttg-tttaagtgtttttataaaaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagc 9163910  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9163911 attaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaa 9164010  T
Q  223 cttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9164011 cttttcaaaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcaaacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaatac 9164106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 20983507 - 20983799
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20983507 gaaatgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 20983605  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  20983606 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 20983705  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20983706 tttcagaaaactaacttttgggtaatgggacagctgttaccaagagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 20983799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15884477 - 15884183
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15884477 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttgtcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 15884378  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15884377 ttaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 15884278  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15884277 ttttcagaaaactaccctttgggtaatgggacagctgttacttaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaaaaatac 15884183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 9437519 - 9437806
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9437519 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 9437617  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  9437618 acaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttca 9437717  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9437718 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 9437806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6873878 - 6873591
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6873878 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 6873780  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  6873779 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 6873680  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6873679 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctatttagaagcaaagaatac 6873591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 73 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2712219 - 2711974
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2712219 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaa 2712120  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||     
T  2712119 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 2712020  T
Q  273 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2712019 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 2711974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 321
Target Start/End: Original strand, 18432784 - 18433070
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  18432784 aaagtgcatgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgac 18432882  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18432883 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcatataattcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcaga 18432982  T
Q  232 aaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
      | ||||| ||||||||||||| || |||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18432983 ctaataacc-ttggttaatgggacaggtgt--ctaacaagtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaacacagc 18433070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17956761 - 17956476
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17956761 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 17956663  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  17956662 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacgaatagaccacgtcagagactcttcag 17956563  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  17956562 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgttattcagaagcaaagaata 17956476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 463621 - 463335
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  463621 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 463523  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  463522 caaattgggggcgcgtgatagtatgttaaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 463423  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  463422 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaaaaatac 463335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 22093397 - 22093682
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  22093397 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 22093495  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  22093496 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaatgaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 22093595  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22093596 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 22093682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26396742 - 26396457
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtt-tgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26396742 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaaatgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 26396644  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  26396643 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 26396544  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  26396543 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 26396457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 8621617 - 8621904
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8621617 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 8621715  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc--tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 228  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  8621716 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttc 8621815  T
Q  229 agaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8621816 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 8621904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 4216263 - 4216548
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  4216263 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtaatgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcaaaagggataaacaaacacagcattaatga 4216361  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  4216362 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 4216461  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||| | |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  4216462 aaaactaccttttgggtaatggaacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 4216548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40048713 - 40048467
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  40048713 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 40048614  T
Q  173 -catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaag 270  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  40048613 acatcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaag 40048514  T
Q  271 tcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40048513 taactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 40048467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 24738396 - 24738641
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24738396 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 24738495  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||    
T  24738496 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagt 24738595  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  24738596 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 24738641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 171143 - 171430
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  171143 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 171241  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagca--aataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 228  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  171242 caaattgggggtgcgtgtaagtatgttaaaaaaaacgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaacagaccacgtcagagactcttc 171341  T
Q  229 agaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  171342 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 171430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 9089533 - 9089774
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  9089533 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 9089632  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  9089633 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 9089732  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  9089733 gccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaata 9089774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26692350 - 26692105
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  26692350 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 26692251  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  26692250 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 26692151  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  26692150 aactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaata 26692105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 11009480 - 11009725
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  11009480 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 11009579  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  11009580 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 11009679  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  11009680 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 11009725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 1991851 - 1992096
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  1991851 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 1991950  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  1991951 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 1992050  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  1992051 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 1992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8008670 - 8008429
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  8008670 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 8008571  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  8008570 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 8008471  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  8008470 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 8008429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 42870128 - 42870373
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  42870128 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 42870227  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  42870228 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 42870327  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  42870328 aacttccaccgttctcactaaccaagttattcagaagcaaagaata 42870373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13180697 - 13180466
Alignment:
Q  92 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccctttt-tg 189  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||  |    
T  13180697 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaaagcttataaagtcatcattgcccttttaag 13180598  T
Q  190 ttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatccca 288  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| | || |  | ||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  13180597 ttatacaccaatacaaatagaccatgtcagaggtttttcag-acacaatgcattggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgtcaacgttccca 13180499  T
Q  289 ctagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13180498 ctaactctgctattcagaagcaaagaatacagc 13180466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4421476 - 4421348
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| | |||||||||     
T  4421476 aagtgtaggttgtgaagtaagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 4421377  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaa 160  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  4421376 aaattgggggcgcgtgaaagtacgtttaa 4421348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 21695068 - 21695168
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||    
T  21695068 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagcaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaataaacacatcattaatg 21695167  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  21695168 a 21695168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 14137906 - 14138021
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaa 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||  || ||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||    
T  14137906 atgaacgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttatctaagtg--ttgagtaaaaaggtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaa 14138003  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgt 146  Q
    || | ||||||||||||||    
T  14138004 tg-acaattgggggcgcgt 14138021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 13660851 - 13660951
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||    
T  13660851 gaaagtgtgggttgtgaagtgggtaatgtgtgatttgtataagtgttttgagcaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacaaaacattaatg 13660950  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  13660951 a 13660951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23465937 - 23465626
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  23465937 agcagagaaggtttgagatgaaaagaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatga 23465839  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatga-aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23465838 gacaaacaaacatagcattaatgacaaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaa 23465739  T
Q  206 atagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcag 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23465738 atagaccatgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 23465639  T
Q  306 aagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||    
T  23465638 aagcaaagaatac 23465626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30321310 - 30321017
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30321310 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 30321211  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 223  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30321210 ttaatgacaaattgggggcgtgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 30321111  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  30321110 ttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agccattcagaagcaaagaatac 30321017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 19422594 - 19422884
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19422594 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagggagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 19422692  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19422693 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaact 19422792  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttac-taaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19422793 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaaagtaactgcaaacgatcccactagcc-agctattcagaagcaaagaat 19422884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Original strand, 19229029 - 19229339
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19229029 agcagagaaggtttgaaatgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaaga 19229128  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19229129 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattaggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccttttttgttatactccaatacaaa 19229228  T
Q  207 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  19229229 tagaccacgtcagaaatttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agctattcaga 19229327  T
Q  307 agcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||    
T  19229328 agcaaagaatac 19229339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25680610 - 25680300
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  25680610 agcagagaaggtttgagacgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacttttgcaattcaaaaga 25680512  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25680511 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgagtgttaatacgtttaaaagctaataaaacatcgttgccctttttgttatactccaatacaaa 25680412  T
Q  207 tagaccacgtcagaaacttttcag-aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcag 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25680411 tagaccacatcagaaacttttcagaaaaactaacatttgggtaatgggacagctgttac-aaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 25680313  T
Q  306 aagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| |||||    
T  25680312 aagcaaaaaatac 25680300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 26115546 - 26115831
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26115546 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 26115644  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26115645 acaaattgggg-cgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 26115743  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26115744 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaata 26115831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 19132954 - 19133241
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19132954 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatg 19133052  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  19133053 acaaattgggggcgtgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttca 19133152  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  19133153 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaatac 19133241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 321
Target Start/End: Original strand, 3837127 - 3837415
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3837127 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataagggacaaacaaacatagcattaatgac 3837225  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3837226 aaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctctttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcaga 3837325  T
Q  232 aaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
      | ||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  3837326 ctaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacagc 3837415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 6155340 - 6155625
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6155340 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 6155438  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  6155439 caaattggaggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 6155538  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  6155539 aaaactatcttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 6155625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 44485388 - 44485673
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44485388 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 44485486  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  44485487 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcag 44485586  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  44485587 aaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 44485673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 36297242 - 36297482
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  36297242 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 36297341  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactg 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||    
T  36297342 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactg 36297441  T
Q  277 ccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  36297442 ccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 36297482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13695129 - 13694884
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  13695129 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 13695030  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  13695029 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 13694930  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13694929 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 13694884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 29080705 - 29080950
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29080705 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 29080804  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  29080805 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 29080904  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29080905 aactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 29080950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32084255 - 32084010
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  32084255 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 32084156  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  32084155 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 32084056  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  32084055 aactgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 32084010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 9345416 - 9345657
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  9345416 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 9345515  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  9345516 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 9345615  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  9345616 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 9345657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15787225 - 15787033
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15787225 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaa 15787126  T
Q  173 catcattgccct-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttac 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  15787125 catcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttac 15787033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3355190 - 3354949
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  3355190 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 3355091  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  3355090 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactattttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 3354991  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  3354990 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 3354949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 315
Target Start/End: Original strand, 23787690 - 23787976
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23787690 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaatg 23787789  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 228  Q
    | ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23787790 acaaatttggggcgtgtgtaagtacgtttaaaagcttataaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttc 23787889  T
Q  229 agaaaactaac--ctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    ||   ||||||  | ||||||||||||| || ||||||| | | || |||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  23787890 ag---actaacaacattggttaatgggacaggtgttactgatacgtaactgccaacgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaa 23787976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 246122 - 246367
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  246122 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 246221  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||   ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  246222 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactctttagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 246321  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  246322 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 246367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 809242 - 809487
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  809242 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 809341  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||   ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  809342 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactctttagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 809441  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  809442 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 809487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22152887 - 22152596
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22152887 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaatga 22152788  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
     |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22152787 caaattgggggtgcgtgtaagtaagtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 22152688  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||     |||| ||||||||||||| || ||||||| | | || |||||||||| | ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  22152687 gacttacaacc-ttggttaatgggacaggtgttactgagacgtaactgccaacgtttccaataaccctgctattcagaagtaaagaacacagc 22152596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 36082225 - 36082470
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  36082225 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 36082324  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  36082325 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 36082424  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  36082425 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 36082470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Original strand, 16741118 - 16741230
Alignment:
Q  206 atagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcag 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741118 atagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggacagctattacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 16741217  T
Q  306 aagcaaagaatac 318  Q
    || ||||||||||    
T  16741218 aaacaaagaatac 16741230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 319
Target Start/End: Original strand, 22667336 - 22667623
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  22667336 atgaatgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaat 22667435  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 227  Q
    | | |||||||| ||| || ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||     || |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  22667436 g-ataattggggacgcatgatagtatg-ttcaaagcaaa-aaagcatcattgccctccaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagaagcgttt 22667532  T
Q  228 cagaa-aactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaataca 319  Q
    ||||| ||||     || |||| ||||| || ||||||| |||||| ||| |||||| | |||||| |  |||||||||||||||| |||||||    
T  22667533 cagaataact---gcttagttagtgggacagatgttactgaaaagtaacttccaacgtttccactaacactgctattcagaagcaaggaataca 22667623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Original strand, 21292581 - 21292869
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatgaaa 132  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||| |    
T  21292581 aagtgtagcttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatgaca 21292680  T
Q  133 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttt-ttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
    |||| |||| |||||  |||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||    
T  21292681 aattaggggtgcgtgaaagtacgttt-aaagctattaaaatcatcattgccctttaaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcatttcag 21292779  T
Q  231 a-aaactaacctttggttaatgggaaagctgttacta-aaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    | | |||     || |||  ||||| || |||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21292780 agagact---gcttagttggtgggacaggtgttactagaaagtaacttccaacgtttccactaactttgctattcagaagcaaagaattcagc 21292869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 231
Target Start/End: Original strand, 19933400 - 19933596
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatgaaa 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| ||||| | |||||||||| |     
T  19933400 agtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcagacggggacagacaaatacagcattaatg-ac 19933498  T
Q  133 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc-tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    ||||||||||||||| |||||   || |||||||| ||| |||||||||||  |   || |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  19933499 aattgggggcgcgtgatagta-cattcaaagcaaa-aaatcatcattgcccactaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcttttcaga 19933596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 231
Target Start/End: Original strand, 24649176 - 24649376
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| | |||||||    
T  24649176 atgaaagtgtaggttgttaagtgtgtagtgtgtgatttgtcaaagtgtttttagtaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaat 24649275  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 227  Q
    | | | ||||||||||| | |||||   || ||||| || ||| |||||||||||| ||  || |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  24649276 g-acatttgggggcgcgagatagta-cattcaaagctaa-aaatcatcattgccctcttaagtcatacaccaatacaaataaaccacgtcagaagctttt 24649372  T
Q  228 caga 231  Q
    ||||    
T  24649373 caga 24649376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 17263636 - 17263737
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  17263636 gaaaatgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaattgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaaagggacaaacaaacacatcattaat 17263735  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  17263736 ga 17263737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20378281 - 20378182
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  | |||| ||||| | | ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  20378281 aaagtgtaggttgtgtagtgagtagtgtgtgatttgtctaagagttttgaataaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatga 20378182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18922030 - 18921723
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||    
T  18922030 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaag-gaga 18921933  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18921932 caaacaaacataacattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactctaatacaaata 18921833  T
Q  209 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18921832 gaccaagtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 18921733  T
Q  309 caaagaatac 318  Q
    ||||||||||    
T  18921732 caaagaatac 18921723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Original strand, 12369901 - 12370213
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt--ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaag 105  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  12369901 agcagagaaggtttgaaatgaaatgagagtgtgagttgtgaagcgagtagtgtgtgttttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaag 12370000  T
Q  106 agacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12370001 agacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaaacaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaa 12370100  T
Q  206 atagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcag 305  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12370101 atagaccacgttagagacttttcagaaaactatcctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcag 12370200  T
Q  306 aagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||    
T  12370201 aagcaaagaatac 12370213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Original strand, 27497930 - 27498210
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  27497930 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttgttaaaacgtttgcaattcagaacagacaaacaaacatagcattaatgac 27498029  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27498030 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaattgcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 27498129  T
Q  232 aaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27498130 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 27498210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Original strand, 25798057 - 25798329
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  25798057 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgattttatcaaaacgtttgcaattcagaagaga 25798155  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25798156 caaacaaacatagcattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagttcaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 25798255  T
Q  209 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacg 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25798256 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacg 25798329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 27377018 - 27377305
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27377018 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatga 27377117  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27377118 caaattgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttatcag 27377217  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27377218 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaataatac 27377305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 27467375 - 27467662
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27467375 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatga 27467474  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27467475 caaattgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttatcag 27467574  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27467575 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaataatac 27467662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20036483 - 20036192
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20036483 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtctgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 20036385  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20036384 taatgacaaattgggggcgtgtgttagtatgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaact 20036285  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||    
T  20036284 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcaaacgatcccactaacc-agctattcaaaagcaaagaatac 20036192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Original strand, 26037840 - 26038120
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26037840 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaatcgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagtattaatga 26037938  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26037939 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaagtgcagataaaacatcattgccctttttgtcatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcag 26038038  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26038039 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 26038120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9119065 - 9118779
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9119065 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatga 9118967  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  9118966 caaattgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 9118867  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9118866 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgtcaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 9118779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18830881 - 18830592
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagaga-caaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  18830881 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaagagggaacaaacaaacatagcattaatga 18830783  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18830782 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcag 18830683  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    |  | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||    
T  18830682 actaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctatttagtagtaaagaatacagc 18830592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34813736 - 34813451
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34813736 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 34813638  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  34813637 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacattattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 34813538  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||   |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34813537 aaaactaccttttggataatgggacagctgttacatgaagtaactgccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 34813451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25731434 - 25731141
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25731434 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaagggacaaacaaacatagcatt 25731336  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    ||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  25731335 aatgacag-ttgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcagatactt 25731237  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||||||  |  || ||||||||| | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  25731236 ttcagacta-aaaactttggttagttggacaggtgttactaaaatgtaactgccaacgatcccactatccctgctattcagaagtaaagaacacagc 25731141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32968520 - 32968234
Alignment:
Q  31 tgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||     
T  32968520 tgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatc 32968422  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32968421 acaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 32968322  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32968321 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 32968234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 26869029 - 26869314
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26869029 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 26869127  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26869128 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 26869227  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  26869228 aaacctaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 26869314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 3665694 - 3665938
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3665694 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 3665793  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||     
T  3665794 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 3665893  T
Q  273 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  3665894 actgccaacgttcccgctaaccaagctattcagaagcaaagaata 3665938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 22290211 - 22290505
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatt 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  22290211 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaatttaaaaggggacaaacaaacaaagcatt 22290309  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || | ||    
T  22290310 aatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataagtcatcattgccctttttgttctactccaatacaaatagacaacgtcggagattt 22290409  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||||||  | ||||| ||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22290410 ttcagactaataacc-ttggttaatgggacaggtgtttctaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaacacagc 22290505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 321
Target Start/End: Original strand, 13917474 - 13917765
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13917474 gaaagtgtgatttgtgaagtaagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaggggacaaacaaacatagcattaatga 13917572  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc--tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 228  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13917573 caaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcatataagtcatcattgccctttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttc 13917672  T
Q  229 agaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    | |  | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||    | || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13917673 aaactaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacagaattggcaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaatacagc 13917765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12723370 - 12723125
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12723370 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 12723271  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  12723270 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 12723171  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  12723170 aactgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 12723125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 12859150 - 12859444
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12859150 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 12859248  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc---------tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaa 221  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12859249 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgcccccttttttttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagag 12859348  T
Q  222 acttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12859349 actcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 12859444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 27346014 - 27346255
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27346014 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 27346113  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  27346114 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 27346213  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  27346214 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 27346255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 27406754 - 27406995
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27406754 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 27406853  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  27406854 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 27406953  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  27406954 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 27406995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 25791982 - 25792226
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25791982 agtgttttttttaaaacgtttgtaattcagaggggactaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 25792081  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||  |||||     
T  25792082 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 25792181  T
Q  273 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  25792182 actgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 25792226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 26029691 - 26029932
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  26029691 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 26029790  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  26029791 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 26029890  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  26029891 accaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaata 26029932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25682682 - 25682403
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagaga-caaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  25682682 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaagggaacaaacaaacataacattaatgacag-ttggg 25682585  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 239  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||     
T  25682584 ggcgcgtgtaagtacgtttaaaagtatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcagatacttttcagacta-aaaa 25682486  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  25682485 cttaggttagttggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactatccctgctattcagaagtaaagaacacagc 25682403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 16953278 - 16953520
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  16953278 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 16953377  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcac 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||    
T  16953378 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaac 16953477  T
Q  275 tgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    | |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  16953478 taccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 16953520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 4635193 - 4635438
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  4635193 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 4635292  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  4635293 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 4635392  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  4635393 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 4635438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Original strand, 21123715 - 21124004
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatgaaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||| |    
T  21123715 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatgaca 21123814  T
Q  133 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21123815 aattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaagcgtataaaatcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 21123914  T
Q  231 aaaactaacc-tttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    | ||  ||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21123915 acaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaataactgacaacgttcccactaactctgctattcagaagcaaagaatacagc 21124004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32307580 - 32307335
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  32307580 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 32307481  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  32307480 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 32307381  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  32307380 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 32307335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 17783732 - 17783943
Alignment:
Q  10 gcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaag-aga 108  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  17783732 gcagagaaagtttaga-gaaaagaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcacaaggaga 17783830  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagca-aataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17783831 caaacaaacaaagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagcataaaaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 17783930  T
Q  208 agaccacgtcaga 220  Q
    |||||||||||||    
T  17783931 agaccacgtcaga 17783943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 18547605 - 18547893
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  18547605 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcatta 18547704  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagca-aataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  18547705 atgacaaattaggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatggaccacgtcagaaa-tt 18547803  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    ||||||     |||| ||||||||||||| ||  |||||| | | |  |||||||||||| |||||| || || |||||||||| ||||||    
T  18547804 ttcagacttacaacc-ttggttaatgggacaggagttactgagacgcaactgccaacgattccactaaccctgttattcagaagtaaagaa 18547893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14066056 - 14065862
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttg---ttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcg 143  Q
    |||||||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  14066056 agtgagtagtgtgtgtttggtatttatagtgttttaagtaaaacgtttgcaattcagaaaagagacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggagcg 14065957  T
Q  144 cgtgttagtatgtttaaaagcaaata-aaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcag-aaacttttcagaaaact 236  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14065956 cgtgatagtacgttt-aaagcaaaaataatcatcattgccctttttagttatacgccaatacaactaaaccacgtcagaaaacttttcagaaaact 14065862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 231
Target Start/End: Original strand, 22380263 - 22380463
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  22380263 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacagcattaatgac 22380362  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttt-ttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    ||||||||||||||||  ||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  22380363 aaattgggggcgcgtgaaagtacattt-aaagcttataaaatcatcattgccctttcaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcttttca 22380461  T
Q  230 ga 231  Q
    ||    
T  22380462 ga 22380463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19457915 - 19457679
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaac-atcattgccc 183  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||  ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  19457915 aaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaacgacaaat-gggggcgtgtgaaagtacatttaaaagcttataaaaatatcattgccc 19457817  T
Q  184 tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga-aaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaac 281  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||    
T  19457816 ttttagttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagacaaaata--cattggttagtgggacaggtgttactaagaagtaactgccaac 19457719  T
Q  282 gatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
      | ||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19457718 atttccactaatcctgccattcaaaagcaaagaatacagc 19457679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 154
Target Start/End: Original strand, 7665537 - 7665649
Alignment:
Q  43 ttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggg 140  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7665537 ttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaatgtttacaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggg 7665635  T
Q  141 gcgcgtgttagtat 154  Q
    ||||||||| ||||    
T  7665636 gcgcgtgtttgtat 7665649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 1655062 - 1655209
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccc 183  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  1655062 aaaacgtttgcgattcagaggagacaaacaaacacggcattaatg-acagttgggggcgcgtgatagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccc 1655160  T
Q  184 tttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    ||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  1655161 ttttaagttatacaccaatacaaacagaccacgtcagaggcttttcaga 1655209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 315
Target Start/End: Original strand, 11239925 - 11240063
Alignment:
Q  177 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac--ctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtca 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||    ||||||||||||| || ||||||||| | || |    
T  11239925 attgcccttttagttatactccaatacgaatagaccacgtcagagacttttcag---actaacaatattggttaatgggacaggtgttactaagacgtaa 11240021  T
Q  274 ctgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    ||||||| | | |||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  11240022 ctgccaatgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaa 11240063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 17051676 - 17051866
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaa-gtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | || ||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | ||||| |||||| ||||||||||    
T  17051676 aagtgtaagttgtgaagtgagtggtgtgcgtttttgtaaaagtgtttaaagtaaaaacgttaccaattcaggaaggggacaagcaaacacagcattaatg 17051775  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcaga 220  Q
    | ||||||||||||||||  ||||  || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  17051776 acaaattgggggcgcgtgaaagtacattcaaact-aaataaaatcatcattgcccttttagttatacgccaataccaatagaccatgtcaga 17051866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Original strand, 11239823 - 11239920
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  11239823 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaggtgttttgagtaaagcgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacataacattaatga 11239920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 153
Target Start/End: Original strand, 16880403 - 16880523
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattc-aaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||| |||||||| ||  || | |||||||||||| | |||||||| |    
T  16880403 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttgttagtaaaaatgtttgcaactcggaaggggacaaacaaacacaacattaatg-a 16880501  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagta 153  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  16880502 caattgggggcgcgtgatagta 16880523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 22809510 - 22809559
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttt 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  22809510 atgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtattttgtctaagtgttt 22809559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39493 - 39199
Alignment:
Q  23 agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39493 agatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 39395  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaa 222  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39394 attaatgacaaattgggggcgtgtgttagtacatttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagatagaccacgtcagaaa 39295  T
Q  223 cttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39294 cttttcagaaaactaacatttggataatgggacagttgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaaacaaagaatac 39199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 43305 - 43060
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43305 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaa 43206  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||     
T  43205 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 43106  T
Q  273 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43105 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 43060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 2747 - 2848
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  | | |||||||||||| | |||||||    
T  2747 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagcgtgtgattttgtctaaatgtttttagtaaaaacgtttgcaagtcatgaggggacaaacaaacacaacattaat 2846  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  2847 ga 2848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Original strand, 7683356 - 7683649
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7683356 atgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgattgcaattcaaatgagacaaacaaacatagca 7683454  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7683455 ttaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 7683554  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7683555 tcttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcataagcaaagaatac 7683649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 150291 - 149998
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150291 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgttttttcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 150192  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  150191 ttaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 150092  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  150091 ttttcagaaaaataacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaggttattgccaacgttcccactagcc-aactattcagaagcaaagaatac 149998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5646315 - 5646027
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttt--agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5646315 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgttttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaat 5646217  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  5646216 gacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttc 5646117  T
Q  229 agaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5646116 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatac 5646027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 19183133 - 19183419
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19183133 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatga 19183231  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  19183232 caaattgggggcgtgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctatttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 19183331  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  19183332 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaatac 19183419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 4171517 - 4171804
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4171517 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 4171615  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  4171616 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcgttgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 4171715  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  4171716 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaatac 4171804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 12734744 - 12735030
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  12734744 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 12734842  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  12734843 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 12734942  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12734943 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatac 12735030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 7511488 - 7511774
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7511488 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 7511586  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  7511587 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 7511686  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  7511687 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 7511774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 21867878 - 21868164
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21867878 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgttttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatg 21867976  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21867977 acaaattgggggcgcttgtaagtatgttaaaaagcgaatgaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 21868076  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21868077 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 21868164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12619763 - 12619476
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12619763 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 12619665  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgtt--atactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 228  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  12619664 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgtttattactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttc 12619565  T
Q  229 agaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12619564 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaaagttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaata 12619476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36243001 - 36242756
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  36243001 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 36242902  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  36242901 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 36242802  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36242801 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 36242756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51652484 - 51652198
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  51652484 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacataacattaatga 51652386  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  51652385 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 51652286  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||||||    ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  51652285 aaaactgctttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 51652198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7696041 - 7695796
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  7696041 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 7695942  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctg-ttactaaaagt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||    
T  7695941 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagt 7695842  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  7695841 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 7695796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 38099340 - 38099585
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  38099340 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaatttggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 38099439  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  38099440 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 38099539  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38099540 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 38099585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35644607 - 35644363
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  35644607 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 35644508  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||     
T  35644507 catcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagta 35644408  T
Q  273 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  35644407 acttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 35644363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Original strand, 3175850 - 3176091
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  3175850 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 3175949  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  3175950 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 3176049  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  3176050 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 3176091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 5837459 - 5837704
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  5837459 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 5837558  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  5837559 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 5837658  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  5837659 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 5837704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47614502 - 47614257
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  47614502 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 47614403  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  |||||    
T  47614402 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 47614303  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  47614302 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 47614257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19166258 - 19165968
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | ||||||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||     
T  19166258 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttatgagtaaaacgtttgcaatacagaatgggacaaacaaacacagcattaatgac 19166159  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19166158 aaattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaagcgtataaaatcatcattgcacttttaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 19166059  T
Q  230 gaaaactaacc-tttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    || ||  ||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  19166058 gacaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaataactgccaacgttcccactaactctactattcagaagcaaagaatacagc 19165968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35397062 - 35396821
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  35397062 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 35396963  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  35396962 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 35396863  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  35396862 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaata 35396821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20879607 - 20879322
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaa 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20879607 atgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgtttttaactaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaa 20879508  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagc-aaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttt 226  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||    
T  20879507 tgacaaattgggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagcttgaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaata---tacgtcagaaacttt 20879411  T
Q  227 tcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    |||||     |||| ||||||||||||| || ||||||| | | || ||||||||||   |||||| || || |||||||||| ||||||    
T  20879410 tcagacttacaacc-ttggttaatgggacaggtgttactgatacgtaactgccaacgcctccactaaccctgttattcagaagtaaagaa 20879322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21212275 - 21212168
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21212275 gttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgacaaattggg 21212176  T
Q  140 ggcgcgtg 147  Q
    ||||||||    
T  21212175 ggcgcgtg 21212168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21130908 - 21130797
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaatt--caaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| | ||||||||||||||||   ||| | |||||||||||| | |||||||||     
T  21130908 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgaataaaacgtttgcaattaagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 21130809  T
Q  132 aaattgggggcg 143  Q
    ||||||||||||    
T  21130808 aaattgggggcg 21130797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Original strand, 20933522 - 20933620
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||| | | |||||||||    
T  20933522 aaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaatacaacattaatga 20933620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Original strand, 22125711 - 22125810
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  22125711 aaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagcaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacataacattaatga 22125810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22460674 - 22460559
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaa 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||| |  |||||    
T  22460674 atgaatgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaatattaa 22460575  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgc 144  Q
    || | ||||||||||||    
T  22460574 tg-acaattgggggcgc 22460559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38940 - 38648
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  38940 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacgtagcac 38842  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38841 taatgacaaattaggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaact 38742  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38741 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggatagctgttacaaaaagtaactgcttacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaatac 38648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 35389 - 35674
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35389 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 35487  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  35488 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 35587  T
Q  231 aaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||||   ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  35588 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaata 35674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 41 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 1
Alignment:
Q  41 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  278 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgttcgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattggg 179  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  178 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 79  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78 ctttgggtaatgagacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8533 - 8261
Alignment:
Q  41 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8533 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgttcgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattggg 8434  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8433 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 8334  T
Q  240 ctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8333 ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaa 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 495 - 215
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  495 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaacagacaaacaaacatagcattaatgac 396  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  395 aaattgggggcgcgtgatagtatatttaatatcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagatacttttcaga 296  T
Q  232 aaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  295 aaactaacctttgggtaatgggacagttgttacataaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaa 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 50 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5371 - 5098
Alignment:
Q  50 gtgagtagtgtgtgtttgttt-taagtgtttttagtaaaac-----gtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcg 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5371 gtgagtagtgtgtgtttgtttataagtgttttta-taaaacaaaatgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacatattgggggcg 5273  T
Q  144 cgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaaccttt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5272 cgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaattaaccttt 5173  T
Q  244 ggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    || |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5172 gggtaatgggacagctgttacaaagagtaactgccaacgttcccactagccttgcttttcagaagcaaagaatac 5098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 360 - 77
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  360 agtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacaa 261  T
Q  134 attgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaa 233  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  260 aatgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagacaacgtcagaaacttttcagaaa 161  T
Q  234 actaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    | |||||||||| |||||||| |  |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  160 aataacctttgggtaatgggacaattgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agctattcagaagcaaagaatac 77  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2057 - 1813
Alignment:
Q  10 gcagagaaggtt-aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057 gcagagaaggttgaagacgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 1959  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 208  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1958 caaacaaacatagcattaaagacaagttgggggcgcgtgttagtacgtttaaaatcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 1859  T
Q  209 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatggga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1858 gaccacgtcagaaacttttcagataaataacctttggttaatggga 1813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 251 - 1
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  251 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaatgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcatt 153  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  152 aatgacaaattgggggtgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaactt 53  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgc 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  52 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagttgttacaaaaagtaactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2710
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2998 gaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaaaga 2900  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2899 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcatataaaacatcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttta 2800  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaataca 319  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  2799 gactaataaac-ttggttaatgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacgatcccactaaccctactattcagaagtaaagaataca 2710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 312
Target Start/End: Original strand, 31149 - 31419
Alignment:
Q  43 ttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggggg 141  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31149 ttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgttttaagtgttttaattaaaacgtttgcaattcagaacaaaaaaacaaacatagcattaatgacaaattgaggg 31248  T
Q  142 cgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacct 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31249 cgcgtgttagtatgtttaaaaccaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct 31348  T
Q  242 ttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31349 ttgggtaatgggacagctgtaacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 31419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 49544 - 49255
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  49544 aaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttggtaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgac 49446  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt----gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  49445 aaattgggggggcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttttttgttatagtccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 49346  T
Q  228 cagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49345 cagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaatcaaagaatac 49255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 321
Target Start/End: Original strand, 179717 - 180030
Alignment:
Q  10 gcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  179717 gcagagaaggttggagaagaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttactaaaaacgtttgcaattcaaaaggg 179815  T
Q  108 -acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaa 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  179816 gacaaacaaacagagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcatataaatcatcattgtcctttttgttatactccaatacaaa 179915  T
Q  207 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcag 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  179916 tagaccacgtcagaaactttttagactaataatc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactaccaacgatcccactagccttgctattcag 180014  T
Q  306 aagcaaagaatacagc 321  Q
    ||| |||||| |||||    
T  180015 aagtaaagaacacagc 180030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 49776 - 49547
Alignment:
Q  92 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaata-aaacatcattgccctttttgt 190  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  49776 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacaaaattaaagacaa-ttgggggcacgtgagagtacgtttaaaagcttatagaaacatcattgcccttttagt 49678  T
Q  191 tatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccac 289  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | || |  | ||||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  49677 tatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcag-atacaatgcattggttaatgggacaggtgtcactaaaaagtaactgccaacgttcccac 49579  T
Q  290 tagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    || |  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49578 taactctgctatttagaagcatagaatacagc 49547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 291
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6868
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603 gaaatgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaccgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 6701  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6702 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 6801  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcactgccaacgatcccacta 291  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  6802 tttcagaaaactaccctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccacta 6868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6236 - 5944
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaa 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  6236 atgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaa 6138  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 227  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6137 tgacaaattgggggcgtgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaactttt 6038  T
Q  228 cagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6037 cagactaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactaacgctgctattcagaagtaaagaacacagc 5944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 69426 - 69136
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  69426 gaaagtgtgagttgcgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagagtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaaggattaatg 69328  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  69327 acaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataagtcatcattgcccttttttttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 69228  T
Q  230 gaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaa-gtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||  | ||||| |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  69227 gactaataacc-ttgggtaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcagaagtaaagaatacagc 69136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 18426 - 18627
Alignment:
Q  9 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18426 agcagagaaggttggagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaaatgagtagtgtgtgtttgttt-aactgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagat 18524  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18525 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 18624  T
Q  208 aga 210  Q
    |||    
T  18625 aga 18627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 254
Target Start/End: Original strand, 220565 - 220785
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  220565 aaagtgtatgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgac 220663  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  220664 aaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcaga 220763  T
Q  232 aaactaacctttggttaatggga 254  Q
      | ||||| |||||||||||||    
T  220764 ctaataacc-ttggttaatggga 220785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43519 - 43274
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  43519 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 43420  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  43419 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 43320  T
Q  272 cactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 317  Q
     |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43319 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaata 43274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 62782 - 63077
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga-caaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||    
T  62782 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataagggggcaaataaacatagcatta 62881  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  62882 atgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttattctccaatacaaatagaccacgtcagaaactt 62981  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||||||     |||| ||||||||||| | || ||||||| | | || |||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  62982 ttcagacttacaacc-ttggttaatggaacaggtgttactgagacgtaactgccaacgcttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacagc 63077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 321
Target Start/End: Original strand, 131946 - 132226
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaag-agacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  131946 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataaggagacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 132043  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaa 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  | |||    
T  132044 ggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataaaacatcatgaccctttttcgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcagactaataa 132143  T
Q  239 cctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  132144 -ctttggttaatgggacaggtgttactaagacgtaactgcgaacgatcccactaactctgctattcagaagtaaagaacacagc 132226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 712 - 485
Alignment:
Q  92 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgt 190  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||  |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  712 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaaagacaa-tggggggcgcgtgaaagtacgtttaaaagcttataaaaacatcatttcccttttagt 614  T
Q  191 tatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccac 289  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |  | |  | ||||||||||||| || ||| ||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  613 tatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttca-cacgcaatgcattggttaatgggacaggtgtcactgaaaagtaattgccaacgttcccac 515  T
Q  290 tagccttgctattcagaagcaaagaataca 319  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  514 taactctgctattcagaagcaaagaataca 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 321
Target Start/End: Original strand, 10835 - 11111
Alignment:
Q  47 gaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10835 gaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtatttagtaaaaacgattgcaattcataaggggataaacaaacatagcattaatgacaaattgtgggcgc 10933  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaaccttt 243  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||   | ||    
T  10934 gtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttagttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag-acactgtacatt 11032  T
Q  244 ggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
     |||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11033 agttagtggaaaaggtgttactaagaagtaactgccaacgtttccactaactttgctattcagaagcaaagaatacagc 11111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 318
Target Start/End: Original strand, 195413 - 195555
Alignment:
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaagtcact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  195413 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 195512  T
Q  276 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195513 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatac 195555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 55317 - 55022
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  55317 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagggtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcatta 55218  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  55217 atgacaaattaggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacatatagaccacgtcagaaactt 55118  T
Q  226 ttcagaaaactaac--ctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    |||||   ||||||  | ||||||||||||| || ||||||| | | |  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||| |||||    
T  55117 ttcag---actaacaacattggttaatgggacaggtgttactgagatgcaactgccaacgattccactaaccctactattcagaagtaaagaacacagc 55022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5977 - 5688
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||    
T  5977 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgtttgcgatccataaggggacaaacaaacatagcatta 5878  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5877 atgacaaattgggggcgcatgtaagtatgtttaaaagcttataaattcatcattgcccttttagtaatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 5778  T
Q  226 ttcagaaaactaac--ctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    |||||   ||||||  | ||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5777 ttcag---actaacaacattggttagtgggacaggtgttactaagatgtaactgccaacgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaa 5688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 254
Target Start/End: Original strand, 30302 - 30520
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30302 agtgtatgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtctttagtaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgacaa 30400  T
Q  134 attgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||      
T  30401 attgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatatatttcatcattgccctttttgttatactccaatccacatagaccacgtcagagatttttcagact 30500  T
Q  234 actaacctttggttaatggga 254  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  30501 aataacc-ttggttaatggga 30520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 6210 - 6505
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||    
T  6210 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgtttgcgatccataaggggacaaacaaacatagcatta 6309  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  6310 ataaaaaattgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcttataaattcatcattgcccttttagtaatactccaatacaaatagaccacgtcatagactt 6409  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    ||||||  |  |||| ||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||| | ||||||  | ||||||||||||  |||||| |||||    
T  6410 ttcagactaacaacc-ttggttagtgggataggtgttactaagacgtaactgccaacgtttccactaatcctgctattcagaactaaagaacacagc 6505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 313
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||    
T  602 aaatgaaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcacaaggggacaaacaaacacaacatta 503  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  502 atgacaaattgggggcgcgtgtaagctagtttaaaagcatataaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacgaatagaccacgtcagaaactt 403  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaa 315  Q
    ||||||     |||| ||||||||||||  || ||||||| | | || |||||||||| | |||||| || || |||||||||| ||||||    
T  402 ttcagacttacaacc-ttggttaatggggcaggtgttactgagacgtaactgccaacgcttccactaaccctgttattcagaagtaaagaa 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 109230 - 109460
Alignment:
Q  92 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgt 190  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  109230 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgt 109329  T
Q  191 tatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga-aaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaa-aagtcactgccaacgatccca 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| | |||    
T  109330 tatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagacaaaata--cattggttagtgggacaggtgttactaagaagtaactgccaacgtttcca 109427  T
Q  289 ctagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    |||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  109428 ctaatcctgccattcagaagcaaagaatacagc 109460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1078 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1078
Description:

Target: scaffold1078; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 357 - 70
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatgaaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || |||||||| |    
T  357 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacatttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagtattaatgaca 258  T
Q  133 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||     
T  257 aattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaagcttataaaatcatcattgcccttttagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcag- 159  T
Q  232 aaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaataca 319  Q
    | || |  | ||||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  158 acacaatgcattggttaatgggacaggtgtcactaaaaagtaactgccaacgttcccactaactctgctattcagaagcaaagactaca 70  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 321
Target Start/End: Original strand, 73839 - 74136
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag---acaaacaaacatagc 122  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  73839 gaaaagaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgttg--tttaagtgttttttgtaaaaacgattgcaattcagaagaggggacaaacaaacatagc 73936  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaa 221  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||  || ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  73937 attaatgacaaattaggggcgcgtgaaagtacattgaaaagcatataaagtcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcagag 74036  T
Q  222 acttttcagaaaactaacctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacag 320  Q
    ||||||||||     |||| ||||||||||||| || ||||||| | | || |||||||||| | ||| || || || |||||||||| |||||| ||||    
T  74037 acttttcagacttacaacc-ttggttaatgggacaggtgttactgatacgtaactgccaacgcttccattaaccctgttattcagaagtaaagaacacag 74135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Original strand, 6287 - 6489
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcatta 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||  | ||||| |||| |||||||||    
T  6287 atgaaagtgtgagttatgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacggttgcaattcagaaaggggacaagcaaagatagcatta 6385  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  6386 atgacaaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaaagcatataaagtcatcattgccctttttgttatactccaatacaagtacaccacgtcagagactt 6485  T
Q  226 ttca 229  Q
    ||||    
T  6486 ttca 6489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8825 - 8583
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacat-agcattaatgaaaaa--ttgggggcgcgtgttagt-atgtttaaaagcaaataaaacatcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8825 aaaacgtttgcaattcaaattgagacaaacaaacattagcattaatgaacaaagttgggggggcgtgttagttatgtttaaaagcaaataaaacatcatt 8726  T
Q  180 gccctttttg--ttatactccaa-tactaa-tagaccacgtcagaaac-ttttcagaaaactaacc-tttggttaatgggaaagct-gttactaaaagt- 271  Q
    |||||||||   ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||     
T  8725 gcccttttttgtttatactcccagtacaaactagaccacgtcagaaactttttcagaaaactaaccttttgggtaatgggacagctagttacaaaaagta 8626  T
Q  272 cactgccaacgat-cccactagccttgctattc-agaagcaaa 312  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8625 aactgcaaacgatccccactagccatgctattctagaagcaaa 8583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 10390 - 10345
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 71  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10390 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 10345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0537 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0537
Description:

Target: scaffold0537; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1626 - 1471
Alignment:
Q  10 gcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-a 108  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |    
T  1626 gcagagaaagtttagagaaaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcaaaagggga 1527  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagc 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1526 caaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagc 1471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1362 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1362
Description:

Target: scaffold1362; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 93 - 1
Alignment:
Q  9 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  93 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagttgtgtgtgtttg-tttaagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2633 - 2456
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| | | |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2633 agtgagttgtgtgtgtttggtttatatagtgttttgatgaaaaacgattacaattcagaggagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgc 2534  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgcccttt-ttgttatactccaatactaatagaccacgtcaga 220  Q
    |||  |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2533 gtgaaagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccctttcaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcaga 2456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 114 - 1
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  114 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaatga 16  T
Q  131 aaaattgggggcgcg 145  Q
     ||||||||||||||    
T  15 caaattgggggcgcg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 162192 - 162063
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  162192 aagtgtaggttgtgaagtgagtggtgtgtgttttgtctaagtgtttttagtaaaaatgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatgac 162093  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaa 161  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  162092 aaatttggggcgcgtgaaagtatgtttaaa 162063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 20966 - 21203
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccc 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  20966 aaaacgtttgcaattcaaaggagacaaacaaacacaacattaatg-acaattgggggcgcgtgaaagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccc 21064  T
Q  184 tttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac-ctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaa 280  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||| |  ||||| ||| ||  |||   || |||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  21065 ttttatgttatacaccaatacaaacggaccacgtcaaaggctttttagacaa--aactggttagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaa 21162  T
Q  281 cgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    || | |||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21163 cgtttccactaacactgctgttcagaagcaaagaattcagc 21203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6439 - 6203
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||  |||| |||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  6439 aaaacgtttgcaattcaaaagggacaaacaaacacagcattaatg-acaactgggggcgcgtgaaagtacgttt-aaagcttataaaatcatcattgccc 6342  T
Q  184 tttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac-ctttggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaa 280  Q
    ||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |   |||   || |||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  6341 ttttaagttatacaccaatacaaacagaccacgtcagagccttttcagaca--gaactgcttagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaa 6244  T
Q  281 cgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    || | |||||| |  | || |||||||||||||||||||||    
T  6243 cgtttccactaacactactgttcagaagcaaagaatacagc 6203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 161555 - 161277
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttt-tagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||     
T  161555 agtgagtagtgtgtgtttggtttatatagtgttttaaaaaaaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacactgcattaatgacaaattaggggcgt 161456  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccctttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctt 242  Q
    |||  | ||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||   ||||||| | || |  |||    
T  161455 gtgaaaatacatttaaaagcttataaagtcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagagcacgtcagaggtttttcag-acacaatgctt 161357  T
Q  243 tggttaatgggaaagctgttact-aaaagtcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    |||||| ||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||   |||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  161356 tggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactaccaacgcctccactaaccctgccgttcagaagcaaagaatacagc 161277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Original strand, 1836 - 1940
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||||    
T  1836 gaaatgaaagtgtatgttatgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgtttttagtaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacatt 1935  T
Q  126 aatga 130  Q
    |||||    
T  1936 aatga 1940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Original strand, 3174 - 3291
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||    
T  3174 atgaatgtgtaggttgtgaagtgagtaatgtgtgttttgtctaagtgttttaagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaat 3273  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtg 147  Q
    | | ||||||||| |||||    
T  3274 g-acaattgggggtgcgtg 3291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Original strand, 24723 - 24838
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga-aaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24723 agtgagttgtgtgtgtttggtatatatagtgttttaagtaaaacgtttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaatgacaaatttgggggcgc 24822  T
Q  145 gtgttagtatgtttaa 160  Q
    |||  |||| ||||||    
T  24823 gtgaaagtacgtttaa 24838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8401 - 8301
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  8401 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttatctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatg 8302  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  8301 a 8301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 2439 - 2539
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||    
T  2439 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagcgtgtgatttgtctaagtgttttgagaaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatg 2538  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  2539 a 2539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30791 - 30679
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||     
T  30791 agtgtaggttgtgaggtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 30692  T
Q  132 aaattgggggcgc 144  Q
    |||||||||||||    
T  30691 aaattgggggcgc 30679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 5617 - 5693
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagta 153  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5617 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagta 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 487 - 586
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||    
T  487 gaaagtgtaggttgtgaagtgcgtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagtaaaatgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatga 586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1365 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1365
Description:

Target: scaffold1365; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1173 - 1075
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||    
T  1173 agtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgattttgtctaagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatga 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 321
Target Start/End: Original strand, 11396 - 11543
Alignment:
Q  173 catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga-aaactaacctttggttaatgggaaagctgttactaaaag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| | |||     || |||| ||||| || ||||||| |||     
T  11396 catcattgccctttttagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagatgcgtttcagagagact---gcttagttagtgggacaggtgttactgaaaa 11492  T
Q  271 tcactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 321  Q
    | ||| |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11493 taacttccaacgtttccactaaccctgctattcagaagcaaagaatacagc 11543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 7073 - 7161
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaaca 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  |||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  7073 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttttctaagtgttttgagcaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaaca 7161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 13417 - 13552
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 183  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| || | |||||| ||||   |||  |||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  13417 aaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacacaacattaatgacaa-tcgggggcacgtgaacgtacatttaaaagcttataaaatcatcatttccc 13515  T
Q  184 tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcaga 220  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  13516 ttttagttatacaccaatacagatagaccacgtcaga 13552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 372
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  |  ||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  471 gaaagtgtaggtagtgaagtgagttgtgtgtgatttgtccaagtgttttgagtaaaacatttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatga 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Original strand, 10999 - 11090
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaaca 118  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  10999 atgaaagtgtaggttgtgaggtgagtagtgtgtgttttgtcttaagtgttttgagtaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaaca 11090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11501 - 11395
Alignment:
Q  43 ttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||     ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||    
T  11501 ttgtgaagcgagtagtgtgtgttttgccaaagtgttttgagtaaaaatgtttgcaattcaaaaggggacaaacaaacacatcattaatgacaaattaggg 11402  T
Q  141 gcgcgtg 147  Q
    |||||||    
T  11401 gcgcgtg 11395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 42094 - 42198
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttt---tagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| | ||||    
T  42094 atgaaagtgtaggttgttaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgaatagtaaaacgtttgcaattcagaaggggaaaaacaaacacaacatt 42193  T
Q  126 aatga 130  Q
    |||||    
T  42194 aatga 42198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0594
Description:

Target: scaffold0594; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3643 - 3545
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  3643 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgtgtaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaatttagaagggac-aacaaacacaacattaatga 3545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21084 - 20948
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccc 183  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||  |||||||||||    
T  21084 aaaacgtttacaattcagaggagacaaacaaacacagcactaatg-acagttgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcttataaactcatcattgccc 20986  T
Q  184 t-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcaga 220  Q
    | |   || |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  20985 tctaaagtcatacaccaatacaaataggccacgtcaga 20948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34285 - 34149
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccc 183  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||  |||||||||||    
T  34285 aaaacgtttacaattcagaggagacaaacaaacacagcactaatg-acagttgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcttataaactcatcattgccc 34187  T
Q  184 t-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcaga 220  Q
    | |   || |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  34186 tctaaagtcatacaccaatacaaataggccacgtcaga 34149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Original strand, 13420 - 13565
Alignment:
Q  74 gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaag-agacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||| || | ||||||||| ||||| ||||| | || |||||||| |||     
T  13420 gtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaagtggacaaacaaacacaacattattg-acaattgggggggcgtgatagtacg-ttcaaagcaaa-aaat 13516  T
Q  173 catcattgccc-tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcaga 220  Q
    |||||||||||  |   || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13517 catcattgcccactaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcaga 13565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 13389 - 13425
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgttt 66  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13389 atgaaagggtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttt 13425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13683 - 13580
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttt---tagtaaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcatta 126  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||   |||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| | |||||    
T  13683 gaaattgtaggttgttaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagtagtaaaacgattgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacatta 13584  T
Q  127 atga 130  Q
    ||||    
T  13583 atga 13580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 66
Target Start/End: Original strand, 2685 - 2719
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgttt 66  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2685 gaaagtgtatgttgtgaagtgagtagtgtgtgttt 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2124
Description:

Target: scaffold2124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 130
Target Start/End: Original strand, 536 - 597
Alignment:
Q  71 taagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  536 taagtgtttttagtaaaaaagtttgcaattcagaaggggacaaacaaacataacattaatga 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Original strand, 11809 - 11868
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt---taagtgtttttagtaaaa 88  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||    
T  11809 gaaagtgtaggttgtgatgtgagtagtgtgtgtgtttttgtctaagtgtttttagtaaaa 11868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University