View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12660_low_34 (Length: 282)

Name: NF12660_low_34
Description: NF12660
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12660_low_34
NF12660_low_34
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (11-282)||(25037098-25037369)
chr2 (11-282)||(25041205-25041476)
chr2 (11-282)||(30666979-30667250)
chr2 (11-282)||(22187941-22188212)
chr2 (11-282)||(23234997-23235268)
chr2 (11-275)||(20568596-20568860)
chr2 (11-278)||(24850508-24850776)
chr2 (11-282)||(9015210-9015478)
chr2 (27-282)||(38781405-38781658)
chr2 (11-282)||(24576025-24576295)
chr2 (11-239)||(25829124-25829352)
chr2 (11-282)||(10009590-10009860)
chr2 (15-252)||(30621210-30621447)
chr2 (15-252)||(30623831-30624068)
chr2 (11-282)||(21537087-21537358)
chr2 (11-239)||(13963860-13964088)
chr2 (11-266)||(19540406-19540659)
chr2 (11-252)||(18376775-18377016)
chr2 (47-282)||(22260432-22260665)
chr2 (11-252)||(24377091-24377332)
chr2 (38-252)||(20151905-20152118)
chr2 (11-282)||(22317583-22317856)
chr2 (27-252)||(6573993-6574218)
chr2 (11-282)||(40782467-40782730)
chr2 (11-278)||(22454833-22455100)
chr2 (11-231)||(28140509-28140729)
chr2 (11-252)||(39037511-39037752)
chr2 (11-203)||(24779333-24779525)
chr2 (11-266)||(23595427-23595677)
chr2 (99-277)||(7609039-7609216)
chr2 (11-266)||(41121577-41121829)
chr2 (11-236)||(28711585-28711808)
chr2 (11-236)||(31800774-31800997)
chr2 (11-282)||(33074216-33074486)
chr2 (14-252)||(25189391-25189629)
chr2 (11-282)||(35743842-35744110)
chr2 (38-282)||(45087022-45087267)
chr2 (27-250)||(6392639-6392862)
chr2 (27-281)||(30557160-30557415)
chr2 (28-236)||(28701116-28701322)
chr2 (27-196)||(26619027-26619195)
chr2 (27-281)||(31327806-31328060)
chr2 (27-281)||(31334527-31334781)
chr2 (39-281)||(34321777-34322018)
chr2 (27-221)||(22802466-22802658)
chr2 (11-266)||(23184170-23184414)
chr2 (28-282)||(22272139-22272391)
chr2 (27-266)||(44881173-44881409)
chr2 (27-244)||(19115089-19115305)
chr2 (27-218)||(18430844-18431034)
chr2 (11-236)||(28550815-28551028)
chr2 (11-236)||(31967940-31968153)
chr2 (237-282)||(28140475-28140520)
chr2 (187-281)||(22785506-22785599)
chr2 (142-252)||(1586913-1587021)
chr2 (11-106)||(44840424-44840519)
chr2 (180-231)||(22776190-22776239)
chr2 (180-231)||(22781568-22781617)
chr2 (11-106)||(22776303-22776398)
chr2 (11-106)||(22781681-22781776)
chr2 (11-106)||(40332077-40332172)
chr2 (11-52)||(22258191-22258232)
chr2 (27-239)||(18702744-18702955)
chr2 (27-79)||(23392710-23392762)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (11-279)||(49642658-49642926)
chr3 (11-281)||(31303381-31303651)
chr3 (11-282)||(20646149-20646421)
chr3 (11-282)||(6090727-6090998)
chr3 (14-282)||(13948334-13948602)
chr3 (14-282)||(15903196-15903465)
chr3 (11-252)||(2561183-2561424)
chr3 (11-282)||(14392899-14393168)
chr3 (11-281)||(18121515-18121786)
chr3 (13-282)||(28582103-28582373)
chr3 (29-282)||(52920419-52920671)
chr3 (11-239)||(12963021-12963249)
chr3 (11-239)||(37467328-37467556)
chr3 (11-278)||(29951335-29951602)
chr3 (11-278)||(30000489-30000756)
chr3 (27-252)||(38177566-38177791)
chr3 (30-252)||(14969341-14969563)
chr3 (14-239)||(17238858-17239083)
chr3 (11-252)||(16658541-16658782)
chr3 (11-252)||(47405346-47405585)
chr3 (11-196)||(41494994-41495179)
chr3 (38-210)||(13824091-13824263)
chr3 (11-231)||(18142696-18142916)
chr3 (27-252)||(47207717-47207941)
chr3 (27-266)||(49553400-49553637)
chr3 (11-252)||(40799869-40800108)
chr3 (11-184)||(13780575-13780748)
chr3 (11-239)||(12726166-12726394)
chr3 (27-282)||(2785075-2785330)
chr3 (28-252)||(20627356-20627578)
chr3 (28-282)||(46349738-46349991)
chr3 (27-282)||(14955438-14955692)
chr3 (11-281)||(24775427-24775698)
chr3 (11-236)||(16032520-16032743)
chr3 (11-239)||(19888880-19889107)
chr3 (11-282)||(25398168-25398419)
chr3 (27-252)||(11223574-11223797)
chr3 (27-278)||(33583240-33583492)
chr3 (11-236)||(53056668-53056891)
chr3 (85-266)||(11869137-11869317)
chr3 (12-203)||(12388845-12389035)
chr3 (40-203)||(19249385-19249547)
chr3 (11-150)||(22804048-22804187)
chr3 (27-282)||(20725098-20725350)
chr3 (27-231)||(5213588-5213789)
chr3 (11-221)||(22140759-22140967)
chr3 (109-282)||(49666309-49666480)
chr3 (27-282)||(29855420-29855675)
chr3 (27-281)||(21640878-21641130)
chr3 (221-282)||(41495179-41495240)
chr3 (38-163)||(50300245-50300370)
chr3 (29-156)||(23538185-23538312)
chr3 (139-236)||(46796318-46796412)
chr3 (27-156)||(12968317-12968446)
chr3 (11-282)||(21636573-21636834)
chr3 (11-79)||(11868264-11868332)
chr3 (28-120)||(11909079-11909171)
chr3 (180-282)||(21605557-21605658)
chr3 (226-282)||(22803993-22804049)
chr3 (180-278)||(33598015-33598112)
chr3 (39-242)||(26417613-26417815)
chr3 (249-282)||(13824265-13824298)
chr3 (11-79)||(30054313-30054381)
chr3 (64-120)||(45858804-45858860)
chr3 (54-120)||(51341040-51341107)
chr3 (203-279)||(51341189-51341266)
chr3 (207-282)||(1727919-1727995)
chr3 (242-282)||(12388751-12388791)
chr3 (242-282)||(16199704-16199744)
chr3 (11-103)||(21605726-21605818)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (11-282)||(377403-377674)
scaffold0004 (11-282)||(220234-220504)
scaffold0004 (27-154)||(244256-244383)
scaffold0004 (11-231)||(211394-211612)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (11-282)||(39693523-39693794)
chr8 (11-282)||(17914447-17914718)
chr8 (11-282)||(29693303-29693574)
chr8 (11-280)||(16207294-16207563)
chr8 (11-252)||(19156184-19156425)
chr8 (11-282)||(24646326-24646597)
chr8 (27-280)||(19943239-19943494)
chr8 (14-281)||(17525623-17525889)
chr8 (14-250)||(12757687-12757923)
chr8 (11-282)||(16681197-16681466)
chr8 (38-282)||(33082872-33083114)
chr8 (11-281)||(16188972-16189240)
chr8 (14-266)||(17441716-17441967)
chr8 (14-266)||(18321067-18321319)
chr8 (11-282)||(21932871-21933143)
chr8 (11-252)||(602642-602883)
chr8 (11-275)||(17701733-17701997)
chr8 (12-282)||(20382288-20382556)
chr8 (29-282)||(23263505-23263757)
chr8 (11-252)||(23185150-23185389)
chr8 (12-276)||(17267463-17267724)
chr8 (11-265)||(18121018-18121269)
chr8 (11-282)||(17797410-17797680)
chr8 (130-278)||(22745594-22745742)
chr8 (81-282)||(20255460-20255658)
chr8 (12-252)||(30421352-30421591)
chr8 (10-219)||(18679802-18680011)
chr8 (11-239)||(18718989-18719217)
chr8 (27-282)||(15335981-15336235)
chr8 (27-282)||(15425046-15425300)
chr8 (27-282)||(15516350-15516604)
chr8 (14-281)||(19707497-19707761)
chr8 (11-236)||(45538379-45538602)
chr8 (11-282)||(22673766-22674036)
chr8 (28-236)||(24551279-24551485)
chr8 (11-282)||(36105183-36105453)
chr8 (27-281)||(1237641-1237894)
chr8 (27-282)||(9320572-9320828)
chr8 (11-282)||(40845281-40845550)
chr8 (27-279)||(22663120-22663371)
chr8 (11-197)||(43644884-43645069)
chr8 (27-218)||(18685353-18685544)
chr8 (27-218)||(18722602-18722793)
chr8 (27-218)||(18730947-18731138)
chr8 (145-278)||(3598243-3598375)
chr8 (27-245)||(24832987-24833204)
chr8 (33-141)||(19956374-19956482)
chr8 (112-282)||(43639863-43640032)
chr8 (29-196)||(22461617-22461783)
chr8 (139-236)||(6407833-6407927)
chr8 (27-120)||(45567955-45568048)
chr8 (11-107)||(14989518-14989614)
chr8 (11-87)||(25164058-25164134)
chr8 (11-107)||(18151713-18151809)
chr8 (187-236)||(18151605-18151652)
chr8 (203-281)||(21541125-21541201)
chr8 (11-107)||(6407714-6407810)
chr8 (27-103)||(13430699-13430775)
chr8 (27-111)||(18772624-18772707)
chr8 (11-79)||(21301010-21301078)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (11-278)||(10883072-10883339)
chr7 (14-274)||(11319400-11319660)
chr7 (11-282)||(16316454-16316723)
chr7 (11-281)||(13880096-13880366)
chr7 (14-282)||(21283270-21283536)
chr7 (11-282)||(22577918-22578187)
chr7 (12-252)||(15088513-15088753)
chr7 (14-282)||(28409034-28409301)
chr7 (11-281)||(12366646-12366914)
chr7 (11-245)||(13137827-13138061)
chr7 (11-252)||(44467056-44467298)
chr7 (11-252)||(21695393-21695634)
chr7 (11-242)||(13302802-13303033)
chr7 (11-252)||(2500030-2500271)
chr7 (27-282)||(15467924-15468179)
chr7 (11-282)||(9069554-9069826)
chr7 (11-274)||(11792899-11793162)
chr7 (11-252)||(2913533-2913774)
chr7 (11-236)||(21692279-21692504)
chr7 (27-241)||(23279895-23280108)
chr7 (11-241)||(33691648-33691878)
chr7 (11-252)||(30025897-30026138)
chr7 (11-252)||(9709729-9709968)
chr7 (13-214)||(13730638-13730839)
chr7 (14-239)||(24788136-24788361)
chr7 (11-231)||(30944271-30944489)
chr7 (11-239)||(13648721-13648949)
chr7 (11-266)||(29935272-29935524)
chr7 (28-231)||(30945304-30945505)
chr7 (40-281)||(13692372-13692602)
chr7 (11-252)||(28622283-28622522)
chr7 (11-252)||(48236829-48237068)
chr7 (11-252)||(331637-331877)
chr7 (14-252)||(39284490-39284727)
chr7 (11-252)||(33605677-33605917)
chr7 (14-280)||(35952585-35952851)
chr7 (11-282)||(13260520-13260781)
chr7 (14-231)||(14426542-14426757)
chr7 (14-210)||(5000788-5000985)
chr7 (16-252)||(19236969-19237204)
chr7 (11-263)||(13018421-13018671)
chr7 (13-148)||(14193108-14193243)
chr7 (11-236)||(16111827-16112050)
chr7 (11-282)||(4821466-4821735)
chr7 (27-218)||(13893958-13894148)
chr7 (38-282)||(12174236-12174480)
chr7 (11-123)||(16309961-16310073)
chr7 (11-239)||(41842212-41842439)
chr7 (64-252)||(16542947-16543133)
chr7 (64-252)||(16622529-16622715)
chr7 (31-252)||(2265446-2265665)
chr7 (38-199)||(13880607-13880768)
chr7 (64-233)||(15704445-15704612)
chr7 (11-282)||(8182922-8183191)
chr7 (147-231)||(4494634-4494718)
chr7 (187-282)||(14193242-14193337)
chr7 (39-203)||(13032046-13032210)
chr7 (94-201)||(13472555-13472663)
chr7 (38-140)||(9098283-9098385)
chr7 (14-282)||(19710907-19711176)
chr7 (64-151)||(16556664-16556751)
chr7 (64-151)||(16608911-16608998)
chr7 (180-280)||(48062727-48062826)
chr7 (226-282)||(13303045-13303101)
chr7 (11-103)||(19339324-19339416)
chr7 (158-232)||(7339821-7339893)
chr7 (14-155)||(1293025-1293157)
chr7 (140-235)||(14425559-14425651)
chr7 (11-79)||(24794813-24794881)
chr7 (11-79)||(27871710-27871778)
chr7 (207-281)||(4428984-4429059)
chr7 (114-236)||(32264669-32264789)
chr7 (180-236)||(27871871-27871925)
chr7 (242-282)||(9098139-9098179)
chr7 (230-282)||(13031980-13032032)
chr7 (12-79)||(21381526-21381594)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (13-282)||(18465-18734)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (11-267)||(49328-49584)
scaffold0084 (11-252)||(32481-32722)
scaffold0084 (27-282)||(189-444)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (11-252)||(28492248-28492489)
chr1 (11-279)||(33256170-33256436)
chr1 (11-279)||(33276342-33276608)
chr1 (11-281)||(22599997-22600267)
chr1 (11-282)||(20954287-20954558)
chr1 (11-282)||(22153852-22154123)
chr1 (11-282)||(19717519-19717788)
chr1 (11-282)||(48704199-48704468)
chr1 (11-281)||(38282562-38282831)
chr1 (28-281)||(35401821-35402072)
chr1 (11-252)||(1900340-1900581)
chr1 (28-245)||(32785789-32786005)
chr1 (11-266)||(1577862-1578115)
chr1 (11-239)||(10757416-10757645)
chr1 (11-218)||(22201614-22201821)
chr1 (11-282)||(2268526-2268793)
chr1 (11-282)||(22427172-22427442)
chr1 (11-266)||(36134185-36134438)
chr1 (11-239)||(12284418-12284646)
chr1 (28-281)||(23036344-23036595)
chr1 (28-221)||(2267101-2267292)
chr1 (11-252)||(29215792-29216031)
chr1 (27-252)||(16235142-16235365)
chr1 (27-282)||(22464623-22464878)
chr1 (27-252)||(39200838-39201061)
chr1 (27-266)||(2834701-2834938)
chr1 (27-266)||(7309830-7310068)
chr1 (14-239)||(30893090-30893316)
chr1 (11-221)||(25448443-25448651)
chr1 (11-252)||(21028788-21029029)
chr1 (14-199)||(21191763-21191947)
chr1 (11-252)||(26701973-26702214)
chr1 (11-236)||(35040161-35040384)
chr1 (27-281)||(2327255-2327509)
chr1 (11-282)||(48570047-48570316)
chr1 (11-281)||(21702809-21703077)
chr1 (11-199)||(12613713-12613899)
chr1 (27-236)||(30572208-30572414)
chr1 (11-250)||(44821393-44821630)
chr1 (31-236)||(17024825-17025029)
chr1 (27-176)||(14263371-14263520)
chr1 (11-282)||(46088984-46089245)
chr1 (139-236)||(10251100-10251194)
chr1 (27-281)||(7744906-7745159)
chr1 (28-156)||(18896537-18896665)
chr1 (11-103)||(21121057-21121149)
chr1 (11-103)||(21135153-21135245)
chr1 (27-103)||(21204916-21204992)
chr1 (27-103)||(21984607-21984683)
chr1 (203-281)||(17371211-17371290)
chr1 (247-282)||(21191693-21191728)
chr1 (11-60)||(34255552-34255601)
chr1 (30-103)||(42284642-42284715)
chr1 (11-79)||(37642243-37642311)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (11-282)||(13602168-13602439)
chr6 (27-282)||(13435544-13435799)
chr6 (15-282)||(23284564-23284831)
chr6 (13-282)||(9717841-9718110)
chr6 (11-282)||(26972109-26972379)
chr6 (11-279)||(15531509-15531777)
chr6 (11-252)||(32544261-32544502)
chr6 (12-245)||(20112618-20112852)
chr6 (28-280)||(21625114-21625363)
chr6 (93-282)||(25597557-25597746)
chr6 (11-239)||(12715344-12715573)
chr6 (27-231)||(14100373-14100577)
chr6 (11-252)||(18435552-18435793)
chr6 (27-252)||(22802153-22802376)
chr6 (11-239)||(15302196-15302424)
chr6 (27-231)||(29918029-29918232)
chr6 (11-282)||(24116824-24117095)
chr6 (11-266)||(19623975-19624228)
chr6 (11-197)||(18378310-18378496)
chr6 (38-231)||(19688789-19688980)
chr6 (14-218)||(15987232-15987437)
chr6 (11-244)||(19086154-19086377)
chr6 (31-252)||(20730618-20730837)
chr6 (11-252)||(16265064-16265303)
chr6 (27-282)||(21618256-21618510)
chr6 (45-237)||(34451595-34451787)
chr6 (11-274)||(16336123-16336381)
chr6 (11-282)||(22076290-22076560)
chr6 (27-236)||(16877225-16877432)
chr6 (14-250)||(15954702-15954936)
chr6 (28-282)||(19470683-19470934)
chr6 (27-282)||(19832915-19833170)
chr6 (27-282)||(20487800-20488055)
chr6 (27-181)||(26943588-26943741)
chr6 (28-199)||(10640384-10640555)
chr6 (11-102)||(25594064-25594155)
chr6 (27-236)||(12349005-12349211)
chr6 (27-252)||(21235137-21235348)
chr6 (27-183)||(12423273-12423428)
chr6 (11-153)||(33351939-33352079)
chr6 (11-103)||(19066079-19066171)
chr6 (247-282)||(10640318-10640353)
chr6 (11-93)||(17381517-17381599)
chr6 (11-79)||(26589595-26589664)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (11-282)||(12205-12476)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (11-266)||(29680410-29680665)
chr4 (11-282)||(12811028-12811296)
chr4 (11-282)||(37435387-37435656)
chr4 (27-282)||(45833400-45833655)
chr4 (11-280)||(16632430-16632697)
chr4 (27-282)||(14604758-14605012)
chr4 (11-219)||(37985525-37985733)
chr4 (11-252)||(19884692-19884932)
chr4 (11-270)||(3395580-3395840)
chr4 (19-282)||(12601099-12601360)
chr4 (11-216)||(19666362-19666567)
chr4 (11-239)||(55380280-55380508)
chr4 (38-252)||(3483738-3483952)
chr4 (11-252)||(14904236-14904477)
chr4 (14-239)||(56034567-56034792)
chr4 (74-282)||(14833449-14833652)
chr4 (11-252)||(13575996-13576235)
chr4 (11-252)||(19911760-19912002)
chr4 (27-282)||(17247250-17247503)
chr4 (11-206)||(9140902-9141097)
chr4 (27-252)||(413008-413231)
chr4 (11-231)||(19620962-19621182)
chr4 (11-245)||(10072925-10073158)
chr4 (11-252)||(10692841-10693080)
chr4 (11-252)||(10906607-10906846)
chr4 (24-232)||(22675422-22675628)
chr4 (11-282)||(40846089-40846360)
chr4 (27-252)||(54679936-54680157)
chr4 (11-282)||(6641674-6641942)
chr4 (118-262)||(23123528-23123672)
chr4 (13-201)||(29121362-29121550)
chr4 (11-252)||(6517475-6517714)
chr4 (81-275)||(15139287-15139482)
chr4 (27-281)||(8105643-8105898)
chr4 (11-259)||(23750512-23750758)
chr4 (27-163)||(56533030-56533167)
chr4 (27-156)||(11915706-11915835)
chr4 (85-280)||(55731844-55732036)
chr4 (27-190)||(25651046-25651209)
chr4 (11-231)||(3105323-3105540)
chr4 (11-236)||(17398582-17398795)
chr4 (11-120)||(16853493-16853602)
chr4 (39-178)||(16940034-16940172)
chr4 (166-275)||(22089733-22089841)
chr4 (180-236)||(14571183-14571237)
chr4 (11-103)||(38513868-38513960)
chr4 (39-196)||(41114707-41114863)
chr4 (11-79)||(22190836-22190904)
chr4 (187-245)||(3793289-3793345)
chr4 (13-79)||(3499705-3499771)
chr4 (27-156)||(17540401-17540530)
chr4 (11-79)||(39419787-39419855)
chr4 (11-103)||(40860657-40860749)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (33-282)||(4791-5040)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (14-282)||(19318-19584)
scaffold0035 (11-282)||(99053-99320)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (11-282)||(14644-14913)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (14-282)||(474-742)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (11-282)||(17814960-17815229)
chr5 (11-252)||(41566338-41566579)
chr5 (11-282)||(7745569-7745838)
chr5 (11-266)||(21072131-21072385)
chr5 (11-239)||(6512348-6512573)
chr5 (11-239)||(89339-89567)
chr5 (11-239)||(23412891-23413119)
chr5 (11-239)||(21910548-21910776)
chr5 (11-252)||(33022656-33022895)
chr5 (11-282)||(19536176-19536446)
chr5 (11-231)||(20550887-20551107)
chr5 (11-252)||(26784346-26784587)
chr5 (27-222)||(13545454-13545641)
chr5 (27-282)||(30742988-30743242)
chr5 (11-245)||(4887014-4887246)
chr5 (11-281)||(23881059-23881328)
chr5 (11-236)||(11993880-11994103)
chr5 (11-231)||(31117869-31118088)
chr5 (27-282)||(42243688-42243943)
chr5 (27-282)||(642582-642836)
chr5 (11-282)||(21099579-21099849)
chr5 (11-282)||(29138283-29138551)
chr5 (27-236)||(15516977-15517184)
chr5 (27-282)||(26759157-26759411)
chr5 (11-253)||(6499231-6499471)
chr5 (11-281)||(33933259-33933532)
chr5 (11-236)||(21198925-21199148)
chr5 (11-250)||(14086445-14086684)
chr5 (27-203)||(25096777-25096955)
chr5 (27-203)||(25154747-25154925)
chr5 (27-282)||(32160774-32161029)
chr5 (11-252)||(9398649-9398879)
chr5 (11-183)||(12352768-12352940)
chr5 (27-155)||(26765506-26765634)
chr5 (14-236)||(3245364-3245583)
chr5 (216-282)||(12352692-12352758)
chr5 (11-130)||(30115863-30115982)
chr5 (11-150)||(28139599-28139738)
chr5 (139-236)||(25930087-25930182)
chr5 (121-236)||(5429985-5430099)
chr5 (11-236)||(9088961-9089174)
chr5 (112-236)||(10848857-10848979)
chr5 (180-236)||(30115798-30115852)
chr5 (27-131)||(11208011-11208114)
chr5 (11-103)||(35932059-35932151)
chr5 (207-282)||(35986116-35986192)
chr5 (14-236)||(28464271-28464481)
chr5 (11-60)||(21660204-21660253)
chr5 (11-107)||(25930205-25930301)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (11-282)||(1686-1955)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (14-282)||(25819-26087)
scaffold0083 (48-178)||(44652-44782)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (11-282)||(5536-5805)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (11-282)||(22672-22944)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (11-282)||(20815-21086)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (11-282)||(60012-60281)
scaffold0026 (11-239)||(7922-8150)
scaffold0026 (202-282)||(115708-115786)
scaffold0026 (226-282)||(151734-151788)
scaffold0026 (166-203)||(151794-151831)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (11-282)||(36619-36890)
scaffold0120 (11-282)||(42115-42386)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (27-282)||(212366-212620)
scaffold0005 (74-282)||(6047-6250)
scaffold0005 (180-236)||(246139-246193)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (24-252)||(7712-7940)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (14-252)||(9981-10220)
scaffold0161 (14-79)||(14819-14884)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (14-239)||(15116-15341)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (11-239)||(1656-1884)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (11-239)||(27316-27544)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (11-252)||(89931-90170)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (11-239)||(9965-10193)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (74-282)||(30283-30486)
scaffold0047 (11-266)||(9899-10151)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (11-250)||(19027-19266)
scaffold0217 (14-236)||(9559-9778)
scaffold0217 (11-282)||(21976-22246)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (11-183)||(13567-13739)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (28-266)||(103585-103821)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (81-282)||(632-831)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (45-282)||(9825-10060)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (27-282)||(215342-215596)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (27-281)||(6586-6839)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (11-221)||(15789-16001)
scaffold0193 (241-281)||(16004-16044)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (84-252)||(39494-39662)
scaffold0022 (84-252)||(137554-137722)
scaffold0022 (11-203)||(159051-159242)
scaffold0022 (27-76)||(37414-37463)
scaffold0022 (27-76)||(135474-135523)
scaffold0022 (242-282)||(159296-159336)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (56-252)||(143129-143325)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (131-282)||(4837-4988)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (14-231)||(552-767)
scaffold1359 (114-235)||(1658-1776)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (11-236)||(6003-6227)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (11-245)||(9952-10186)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (11-236)||(78258-78481)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (11-282)||(3300-3570)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (14-236)||(60802-61022)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (11-280)||(5446-5717)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (11-221)||(1606-1814)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (28-250)||(9168-9387)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (29-282)||(36031-36281)
scaffold0056 (14-282)||(25519-25777)
scaffold0056 (11-103)||(34827-34919)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (24-281)||(5636-5895)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (27-282)||(7001-7255)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (131-252)||(5813-5935)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (194-282)||(9252-9338)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (28-241)||(1407-1619)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (27-218)||(43828-44018)
scaffold0064 (206-282)||(43749-43823)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (27-132)||(164940-165045)
scaffold0011 (69-236)||(65321-65485)
scaffold0011 (69-236)||(144366-144530)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (27-158)||(40649-40780)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (196-274)||(13385-13462)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (46-236)||(7963-8150)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (196-266)||(60729-60799)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (11-116)||(74577-74682)
scaffold0025 (166-281)||(74718-74831)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (27-125)||(38086-38184)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (39-92)||(2029-2082)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (28-120)||(1803-1895)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (139-236)||(23455-23549)
scaffold0247 (11-132)||(25393-25514)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (27-108)||(1329-1410)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (27-108)||(1-82)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (11-155)||(2702-2845)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (27-120)||(15628-15721)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (27-79)||(7393-7445)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (11-79)||(87647-87715)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (158-264)||(17091-17197)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (31-79)||(3942-3990)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25037369 - 25037098
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25037369 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25037270  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25037269 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25037170  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25037169 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25037098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25041476 - 25041205
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25041476 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25041377  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25041376 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25041277  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25041276 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25041205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 30666979 - 30667250
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30666979 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaa 30667078  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30667079 tcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatct 30667178  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30667179 cctgatgaactacaacttctgatattcttcagcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatgac 30667250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22188212 - 22187941
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22188212 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22188113  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  22188112 tctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgt 22188013  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22188012 cctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 22187941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 23234997 - 23235268
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23234997 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaa 23235096  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23235097 ttctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 23235196  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23235197 catgatgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 23235268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20568860 - 20568596
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20568860 agcagatacacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20568761  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  20568760 tcctttcaaaattgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatct 20568661  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttc 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20568660 cctgatgaactacagcttctggtgatcttgaacttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttc 20568596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24850776 - 24850508
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||    
T  24850776 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaa 24850677  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24850676 tcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24850577  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
    |||||||| ||| || | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24850576 tcctgatgtacttcagcatctggtgatctttagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 24850508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9015478 - 9015210
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  9015478 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 9015381  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9015380 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 9015281  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||  |  |||||| ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9015280 cctgatgaactttagtttctgg-gatcttctgcttctgatgagttgtttctgatgaacttgcttctgatgac 9015210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 38781405 - 38781658
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38781405 gagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 38781504  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||   ||| |    
T  38781505 gttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatga--gacatc 38781602  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38781603 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 38781658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24576025 - 24576295
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  24576025 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaa 24576124  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaaga-ttaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24576125 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatc 24576224  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||| |||||||  | ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24576225 tcctaatgaactttagcttctggtgatctt--gcttatgatgatatgcttctgatgaactagcttctgatgac 24576295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 25829124 - 25829352
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25829124 agcagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 25829223  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25829224 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatct 25829323  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  25829324 cctgatgaactttagcttctggtgatctt 25829352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10009860 - 10009590
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10009860 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 10009761  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttc-cagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10009760 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 10009661  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10009660 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--tcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 10009590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 30621210 - 30621447
Alignment:
Q  15 gagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 114  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30621210 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30621309  T
Q  115 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 214  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30621310 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30621409  T
Q  215 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30621410 atgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30621447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 30623831 - 30624068
Alignment:
Q  15 gagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 114  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30623831 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30623930  T
Q  115 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 214  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30623931 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30624030  T
Q  215 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30624031 atgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30624068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21537358 - 21537087
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  21537358 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaa 21537259  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21537258 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21537159  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21537158 cctgatgaacttcatcttctagtgatctttaacttctgatgaggtgcttctggtgagcttgcttctgatgac 21537087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13964088 - 13963860
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13964088 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13963989  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13963988 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 13963889  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
     ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  13963888 actgatgaactagagcttctagtgatctt 13963860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 19540406 - 19540659
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19540406 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaa 19540505  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
     |||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540506 acctttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 19540605  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  19540606 catgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgaggtgcttctgatga 19540659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18377016 - 18376775
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18377016 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18376917  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  18376916 tcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 18376817  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18376816 tcaaatgaacttcaacttctggtgatcttctgcttctgatga 18376775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260665
Alignment:
Q  47 gtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtc 146  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  147 ttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttg 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||     
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatcttc--cttc 22260629  T
Q  247 tgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22260630 tgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgac 22260665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 24377091 - 24377332
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  24377091 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaa 24377190  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24377191 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24377289  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24377290 tcttgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatga 24377332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20152118 - 20151905
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 137  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  20152118 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcact 20152019  T
Q  138 cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatc 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  20152018 tttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgatt 20151920  T
Q  238 ttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||| ||||||    
T  20151919 ttcagcttctgatga 20151905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 22317583 - 22317856
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  22317583 agcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22317682  T
Q  111 tcctttcaaaa-tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  22317683 tcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatc 22317782  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    || ||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22317783 tcttgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgtacttgcttatgatgaacttgcttatgatgac 22317856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6574218 - 6573993
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacactt-gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6574218 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagt 6574119  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgc-ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 224  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||    
T  6574118 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaactgca 6574021  T
Q  225 acttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  6574020 acttctagtgattttcagcttctgatga 6573993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 40782467 - 40782730
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40782467 agcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 40782566  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    ||||  |||| ||||||||||||||    
T  40782567 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa----attt--agctctaagtcttgcatct 40782660  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||| |  | ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40782661 cctgatgaaatttagcttctggtgatctt--gcttctgatgaaatgcttctggtgaacttgcttctgatgac 40782730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22455100 - 22454833
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  22455100 agcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 22455001  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacattt-gaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    | | ||  || ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||    
T  22455000 ttcatttgaattaactgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatc 22454902  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
    | |||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22454901 ttctgaagaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgagcttgcttctga 22454833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28140729 - 28140509
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  28140729 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaa 28140630  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28140629 tcctttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatct 28140530  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctg 231  Q
    || |||||||| || ||||||    
T  28140529 cccgatgaacttcagcttctg 28140509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39037752 - 39037511
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||     
T  39037752 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaac 39037653  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  39037652 ttcatttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatct 39037553  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39037552 tctgatcaactttaacttccggtgatcttcagcttctgatga 39037511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 24779333 - 24779525
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24779333 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaa 24779432  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24779433 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23595677 - 23595427
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23595677 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc--ttcagagaacaagaatccaatgccttcaaa 23595580  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  23595579 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatct 23595481  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
     ||||||| || || |||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  23595480 tctgatgatcttcagcttctggtgaactt--gcttctgatgaggtgcttctgatga 23595427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Original strand, 7609039 - 7609216
Alignment:
Q  99 aatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag-tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7609039 aatgccttcaaatcctttcaaaataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagcttt 7609138  T
Q  198 aagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7609139 aagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctg 7609216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41121829 - 41121577
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  41121829 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaa 41121730  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||  || ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||  || ||    
T  41121729 tccttttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagct 41121631  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
     ||||||| || || ||||||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  41121630 tctgatgatcttcagcttctggtgatgtt--gcttctgatgaggtgcatctgatga 41121577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28711808 - 28711585
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  28711808 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28711709  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||     
T  28711708 ttcattcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcc 28711611  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    | | ||||||| || |||||||||||    
T  28711610 cattatgaactgcagcttctggtgat 28711585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31800997 - 31800774
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  31800997 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaa 31800898  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||| || ||  ||||| | | || | ||||||||||||||  |||||||     
T  31800897 tcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaag--ttgcatcc 31800800  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    | ||||||||| ||  ||||||||||    
T  31800799 catgatgaactgcagtttctggtgat 31800774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 33074216 - 33074486
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||| | ||  ||||| || |||| ||||||||| ||    
T  33074216 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaa 33074315  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||  | ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  ||||||||    
T  33074316 tctgtccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatct 33074413  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33074414 cctgatgaactacaacttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 33074486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 25189391 - 25189629
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||| | |    
T  25189391 agagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttc 25189490  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
     ||  || ||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  25189491 atttgaattagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttct 25189589  T
Q  214 gatgaac-tacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     || ||| |  | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25189590 aataaacttttagcttcaggtgatcttcagcttctgatga 25189629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35744110 - 35743842
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||  |||||  | ||| |||||||||||||    
T  35744110 agcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaa 35744011  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| | |||||||||  ||||||  | || | ||  || |||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  35744010 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatattctgcaatctttagac--gtttgagtctgttaaacaacttttgacgctttaag--ttgcatct 35743915  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35743914 cctgatgaactacagcttctggtgattttcagcttccgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 35743842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45087267 - 45087022
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||   |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45087267 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 45087168  T
Q  138 cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtga 235  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||  | ||||| ||||    
T  45087167 tttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatgaactgtagcttctagtga 45087070  T
Q  236 tcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | || ||||| ||||  |  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45087069 tatttagcttctgataaacttgcttcttatgaacttgcttctggtgac 45087022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 6392639 - 6392862
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||||||||   ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6392639 gagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagt 6392738  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatc-cattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 224  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||| |||| | |||||||| |||||   ||||||  |||||||||| ||    
T  6392739 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaag--atgcatcctctgatgaactgca 6392836  T
Q  225 acttctggtgatcttcagcttgtgat 250  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||    
T  6392837 acttatggtgatttttagcttctgat 6392862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30557415 - 30557160
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  30557415 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaattctttcaaaatagt 30557316  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 224  Q
     | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| || || ||| ||||| |||||  |||||||| |||||  |||||||  |||||||||| ||    
T  30557315 cgatgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgca 30557218  T
Q  225 acttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30557217 gcttctggtgatatttagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttttgatga 30557160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28701322 - 28701116
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28701322 agtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatatctg 28701223  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  | |||| || || |||| ||| |||| | |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| || ||    
T  28701222 ttgctttacttttccagtcttctgcaatcttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagct 28701125  T
Q  228 tctggtgat 236  Q
    |||||||||    
T  28701124 tctggtgat 28701116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26619195 - 26619027
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| | | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  26619195 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaatagtt 26619096  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  26619095 gttgcttcattcttccagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagctt 26619027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31328060 - 31327806
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |     ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||     
T  31328060 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagtc 31327961  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||  |||| | || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||     
T  31327960 gttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 31327863  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||   |||||| ||||  |  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31327862 cttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttatgatga 31327806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31334781 - 31334527
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |     ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||     
T  31334781 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagtc 31334682  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||  |||| | || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||     
T  31334681 gttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 31334584  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||   |||||| ||||  |  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31334583 cttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttatgatga 31334527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34322018 - 34321777
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 138  Q
    ||||||||||||| ||| ||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||     
T  34322018 tagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatactt 34321919  T
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatct 238  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||      
T  34321918 ttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaattacagcttctagtgattc 34321821  T
Q  239 tcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34321820 tcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttatgatga 34321777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Original strand, 22802466 - 22802658
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| || ||  ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||      
T  22802466 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaatcctttcaaaatagcc 22802565  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 221  Q
     |||||| ||  ||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||| || | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22802566 attgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaag--ttgcatctcctgatgaact 22802658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23184414 - 23184170
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  23184414 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc--ttcagagaacaga-atccaatgccttcaaa 23184318  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || |||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| |||    |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| |||||    
T  23184317 ttcatttgaattagtcg-tgcttcactcttctggtcttctgc-atgc-taggtgtgatt-aatcctttgaacaacctttgaagc-ttaattctt-catct 23184224  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
     ||||||| || || |||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  23184223 tctgatgatcttcagcttctggtgaactt--gcttctgatgaggtgcttctgatga 23184170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 282
Target Start/End: Original strand, 22272139 - 22272391
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaa-catccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| || | |||| ||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||     
T  22272139 agtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtc 22272238  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  ||||||||| |||||| ||  || |||  || || ||||||| || || |    
T  22272239 attgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaaactccaattctctcagcttctgatgatcttcagc 22272337  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||||| || |||||||||||||| |||| |||||    
T  22272338 ttctggtgatgtt--gcttctgatgaggtgtttctgatgaacttgtttctaatgac 22272391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 44881173 - 44881409
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| || | |||  || |||||||||||||||||||| || ||  || ||| |    
T  44881173 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagct 44881272  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||  ||||||| | |||||||||| || | |  || || ||||||| || || |    
T  44881273 gctgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcagc 44881371  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    || ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  44881372 ttttggtgatgtt--gcttctgatgaggtgcttctgatga 44881409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Original strand, 19115089 - 19115305
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| || | ||| ||| |  |||||| || ||||| |||| |   || |||||    
T  19115089 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagtt 19115188  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |||| || || ||||||| || || |    
T  19115189 gttgcttcattcttccagtcttctgcaat-agtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcagc 19115287  T
Q  227 ttctggtgatcttcagct 244  Q
      ||| ||||||||||||    
T  19115288 acctgatgatcttcagct 19115305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18431034 - 18430844
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||  |||  ||||| | | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||  || |||      
T  18431034 gagtagtggaggtcgtggttgtacacttcgtactattgtcgttttccaacgttttccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaattagcc 18430935  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 218  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| |  ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  18430934 gttgcttcatgcttctagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagctttaattctttcagcttctgatga 18430844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28551028 - 28550815
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  28551028 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 28550937  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
     |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||| | || || ||||| |  |||| | ||||| | |||||   ||||||||    
T  28550936 -cctttcaaaatagttgtttctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggttttaa--attgcatct 28550841  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  28550840 cctgatgaactgcagcttctggtgat 28550815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31968153 - 31967940
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||||||||| ||        
T  31968153 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcatt---- 31968058  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
         |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||  | || || ||||| |  |||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  31968057 -----tcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttatgcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaggctttaag--ttgcatct 31967966  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
     |||||||||| || |||||||||||    
T  31967965 tctgatgaactgcagcttctggtgat 31967940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28140520 - 28140475
Alignment:
Q  237 cttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28140520 cttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgac 28140475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22785599 - 22785506
Alignment:
Q  187 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  22785599 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgtagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 22785506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1587021 - 1586913
Alignment:
Q  142 cagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttca 241  Q
    ||||||||||||||  | |||  || || ||||| || |||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| || |||||||||||  |||    
T  1587021 cagtcttctgcaatcttcagatgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tccatctcctgatgaactccagcttctggtgattctca 1586924  T
Q  242 gcttgtgatga 252  Q
    |||| ||||||    
T  1586923 gcttctgatga 1586913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 44840424 - 44840519
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  44840424 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 44840519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22776239 - 22776190
Alignment:
Q  180 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22776239 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacagcttctg 22776190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22781617 - 22781568
Alignment:
Q  180 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22781617 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacagcttctg 22781568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22776398 - 22776303
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  22776398 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22781776 - 22781681
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  22781776 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22781681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 40332077 - 40332172
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  40332077 agcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 22258191 - 22258232
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacat 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22258191 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacat 22258232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 18702744 - 18702955
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  |||| |||| | | |||||||| |||| ||||  ||||| | | ||||||  || |||| ||||||||||||| ||||  || |||      
T  18702744 gagtagtggagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttttgaattagcc 18702843  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |  ||||||||| |||||||||| || |||| || || ||||||| || ||||    
T  18702844 gttacttcatgcttctagtcttctgtaatg-atagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaac 18702942  T
Q  227 ttctggtgatctt 239  Q
    | ||| |||||||    
T  18702943 tcctgatgatctt 18702955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23392762 - 23392710
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  23392762 gagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgct 23392710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 49642926 - 49642658
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49642926 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaa 49642827  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49642826 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 49642727  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49642726 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaccttgcttctgat 49642658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 31303381 - 31303651
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31303381 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaa 31303480  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  31303481 tcctttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatct 31303580  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31303581 cctgagtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 31303651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 20646149 - 20646421
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20646149 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 20646248  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  20646249 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatc 20646348  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646349 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 20646421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 6090727 - 6090998
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6090727 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaa 6090826  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6090827 tcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatct 6090926  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6090927 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgac 6090998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 13948334 - 13948602
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    |||||||||  ||||||| ||||  || |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13948334 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 13948433  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13948434 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 13948533  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13948534 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgac 13948602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 15903196 - 15903465
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaa-catccaatgccttcaaatc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15903196 agagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatc 15903295  T
Q  113 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15903296 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcc 15903395  T
Q  213 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15903396 tgataaattacagcttttggtgatcttcagcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatgac 15903465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 2561183 - 2561424
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||  |||||||    
T  2561183 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaa 2561282  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2561283 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 2561382  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  2561383 cctgatgaactagagcttctggtgattctcagcttctgatga 2561424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14393168 - 14392899
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14393168 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14393069  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  14393068 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 14392969  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||| ||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14392968 cctaatgaacttcagcttctagtgatctt--gcttttgatgagatgcttatgatgatcttgcttctgatgac 14392899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18121786 - 18121515
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||| || ||| ||||||||| |||    
T  18121786 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18121687  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18121686 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 18121587  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18121586 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 18121515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Original strand, 28582103 - 28582373
Alignment:
Q  13 cagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 112  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  28582103 cagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatc 28582202  T
Q  113 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28582203 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 28582302  T
Q  213 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28582303 tgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 28582373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 52920419 - 52920671
Alignment:
Q  29 gtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 128  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  52920419 gtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatacttt-aaattagttgt 52920517  T
Q  129 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaactt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  52920518 tgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagctt 52920617  T
Q  229 ctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52920618 ctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 52920671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12963249 - 12963021
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12963249 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12963150  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12963149 accttctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatct 12963050  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12963049 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 12963021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 37467328 - 37467556
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37467328 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37467427  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  37467428 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatct 37467527  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37467528 cctgatgaactactgcttctggtgatctt 37467556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29951602 - 29951335
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29951602 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29951503  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||    
T  29951502 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 29951403  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
     |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29951402 tctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 29951335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30000756 - 30000489
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30000756 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 30000657  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||    
T  30000656 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 30000557  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
     |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30000556 tctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 30000489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38177791 - 38177566
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38177791 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 38177692  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |    
T  38177691 gttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagagc 38177592  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38177591 ttctgatgatcttctgcttctgatga 38177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 252
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969563
Alignment:
Q  30 tagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 129  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  130 gcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttc 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||    
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttc 14969540  T
Q  230 tggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  14969541 tggtgatcttcagcatctgatga 14969563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17239083 - 17238858
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17239083 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 17238984  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17238983 tttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 17238884  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
     ||| ||| || ||||||||||||||    
T  17238883 tatgcacttcatcttctggtgatctt 17238858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16658782 - 16658541
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  16658782 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 16658683  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| || ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  16658682 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatct 16658583  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16658582 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 16658541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 47405585 - 47405346
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  47405585 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaa 47405486  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  47405485 tcctttcaaactagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 47405388  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47405387 cgtgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 47405346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 41494994 - 41495179
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41494994 agcagatacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 41495093  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41495094 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 13824091 - 13824263
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 137  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13824091 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcact 13824190  T
Q  138 cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13824191 cttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13824263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18142916 - 18142696
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||| || ||| ||||||||| |||    
T  18142916 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18142817  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18142816 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatct 18142717  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctg 231  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  18142716 cctgatgaactagagcttctg 18142696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 47207717 - 47207941
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  47207717 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaactagcc 47207816  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgc-ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||     
T  47207817 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatctcctgatgaactgcag 47207914  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47207915 cttctggtgattttcagcttctgatga 47207941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49553637 - 49553400
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49553637 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 49553538  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
      |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  49553537 actgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcggc 49553438  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||    
T  49553437 ttctggtgatctt--acttctgatgagatgcttctaatga 49553400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 40799869 - 40800108
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  40799869 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaa 40799968  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |  |||||||    
T  40799969 tactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgatgcatct 40800066  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40800067 cttgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 40800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13780748 - 13780575
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13780748 agcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaa 13780649  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa 184  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13780648 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12726394 - 12726166
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| || || |||||  || |||||||||| ||||||    
T  12726394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 12726295  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  12726294 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatct 12726195  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12726194 cctgatgaacttcaacttcttgtgatctt 12726166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 2785075 - 2785330
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2785075 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagt 2785174  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2785175 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaa 2785272  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785273 cttctggtgattctcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 2785330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20627578 - 20627356
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20627578 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaaatagttg 20627479  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  20627478 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaact 20627381  T
Q  228 tctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20627380 tctggtgattttcagcttctgatga 20627356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46349991 - 46349738
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | | |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  46349991 agtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcg 46349892  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  46349891 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaag--ttgcttctcctgatgaactgcaact 46349794  T
Q  228 tctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46349793 tctggtgattttcagcttctaatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 46349738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 14955438 - 14955692
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14955438 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaaatagtt 14955537  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  || |||||||||||||||| ||||    
T  14955538 gttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttacatctcctgatgaactgcaac 14955635  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955636 ttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 14955692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24775698 - 24775427
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||| ||  ||||| || ||| |||||||||||||    
T  24775698 agcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 24775599  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  24775598 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 24775501  T
Q  211 cctgatgaact--acaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||  |  || |||||||||||| |||||||||||    
T  24775500 cctgatgaactgcgcagcttctggtgattctcagcttgtgataaacttggttctgatgaactggcttctgatga 24775427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 16032520 - 16032743
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16032520 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16032619  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||| ||  ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  16032620 tcctttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtg-ataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 16032718  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
     |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16032719 tctgatg-acttcaacttcgggtgat 16032743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19889107 - 19888880
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19889107 agcagagacacaaactgag--gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 19889010  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  19889009 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatc 19888910  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    || |||||||||  | ||||| ||||||||    
T  19888909 tcttgatgaactttagcttctagtgatctt 19888880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25398419 - 25398168
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  25398419 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaa 25398320  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||                  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25398319 tcctttcaaaatagtcgttgcttcattgtt------------------tagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25398238  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
      ||||||   |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398237 tatgatgag--acaacttctgatgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25398168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 11223574 - 11223797
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11223574 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 11223673  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||  |||  ||| ||||||||||||||| |  |    
T  11223674 gttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaag--ttgtatctcctgatgaactgctgc 11223771  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||    
T  11223772 ttctggtgattttcagattctgatga 11223797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 278
Target Start/End: Original strand, 33583240 - 33583492
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  33583240 gagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagc 33583339  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 224  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||  |||||| |||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||    
T  33583340 cgttgcttcacttttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactaca 33583437  T
Q  225 acttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  33583438 acttttggtgatttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctga 33583492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 53056891 - 53056668
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  53056891 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 53056792  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |  || |||||||| |||| | |||||| | |||||  |||||||     
T  53056791 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaaccttaag--ttgcatcc 53056694  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    | ||||||||| || ||||| |||||    
T  53056693 catgatgaactgcagcttctagtgat 53056668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Original strand, 11869137 - 11869317
Alignment:
Q  85 aagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  11869137 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcattaaacaa 11869236  T
Q  185 catttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgaga-tgcttctgatga 266  Q
      |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11869237 attttgaagccttaag--ttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaaattgcttctgatga 11869317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12389035 - 12388845
Alignment:
Q  12 gcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 111  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  12389035 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaat 12388936  T
Q  112 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 203  Q
     ||||  || |||| || |||||||| |||   ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12388935 tcttttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattc-tagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 12388845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19249547 - 19249385
Alignment:
Q  40 agtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactct 139  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||    
T  19249547 agtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgttgcttcactct 19249448  T
Q  140 tccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 203  Q
    ||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19249447 tctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtct 19249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22804187 - 22804048
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||     
T  22804187 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaag 22804088  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttct 150  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  22804087 tcctttcaaaatagccgttgcttcactcttctggtcttct 22804048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 20725098 - 20725350
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||     
T  20725098 gagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattagtc 20725197  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||| | ||||||||||||| |||  || ||  |||||| || || |    
T  20725198 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgatcttcagc 20725296  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||| ||   ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20725297 ttctggtgatgtt--tcttttgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctgatgac 20725350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 231
Target Start/End: Original strand, 5213588 - 5213789
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||  ||||||||| || ||  || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5213588 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgcttttgaat-aataagcatctaatgccttcaaatccttccaaaatagtt 5213686  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| || || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  5213687 gttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagc 5213784  T
Q  227 ttctg 231  Q
    |||||    
T  5213785 ttctg 5213789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 22140759 - 22140967
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||  ||||||    
T  22140759 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaa 22140858  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||| ||||| | || || ||||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  22140859 acccttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 22140956  T
Q  211 cctgatgaact 221  Q
    |||||||||||    
T  22140957 cctgatgaact 22140967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 49666480 - 49666309
Alignment:
Q  109 aatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcat 208  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||||| |||||||||||||||  |||||    
T  49666480 aatcctttcaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcat 49666384  T
Q  209 ctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||   || ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  49666383 ctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacaacttatgatgaaattgcttctgatgaacttgcttctgatgac 49666309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 29855420 - 29855675
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||      
T  29855420 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaactagcc 29855519  T
Q  127 gttgcttcac-tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||  |||||  ||||||| | ||||||||| ||     
T  29855520 gttgcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtcttaag--ttgcatcccatgatgaactgcag 29855617  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     || ||||||| ||  ||||  |||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29855618 gttttggtgatttttggcttccgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 29855675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 21640878 - 21641130
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |   ||||| |||||||||| ||  || || || |||||||||| ||  ||||||| ||||||||      
T  21640878 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatccttccaaaatagcc 21640977  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||| | || || ||||| |  |||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21640978 gttgctatacttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaac 21641074  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||||||   |||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21641075 ttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgctgaacttgcttctgatga 21641130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 282
Target Start/End: Original strand, 41495179 - 41495240
Alignment:
Q  221 tacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41495179 tacaacttctggtgatcttcagtttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 41495240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Original strand, 50300245 - 50300370
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||  ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  50300245 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttc-aaatagcagttgcttcac 50300343  T
Q  137 tcttccagtcttctgcaatgcttagac 163  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||    
T  50300344 ttttccagtcttctgcaatccttagac 50300370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23538312 - 23538185
Alignment:
Q  29 gtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| | |  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||  |||||   ||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgt 23538213  T
Q  129 tgcttcactcttccagtcttctgcaatg 156  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  23538212 tgtttcattcttccagtcttctgcaatg 23538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46796412 - 46796318
Alignment:
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  46796412 ttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttcttgtgat 46796318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 12968317 - 12968446
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||||  ||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||  || ||||     
T  12968317 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaattagtc 12968416  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 156  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  12968417 gttacttcatgcttctagtcttctgcaatg 12968446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21636834 - 21636573
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  21636834 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 21636743  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
     | |||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||   ||| | || |  | ||| |  |||| | ||||||||||||||  || || ||    
T  21636742 -catttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttccaact 21636646  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||   |||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21636645 cctgatgaactgccacttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgac 21636573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 11868264 - 11868332
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  11868264 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgct 11868332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11909171 - 11909079
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 120  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11909171 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21605658 - 21605557
Alignment:
Q  180 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
    |||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||   || ||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||||    
T  21605658 aacaacttttgaagctttaagt--tccatctcctgatgaactgcaacttctggtgatacacaacttctgatgaacttgcttatgatgaccttgcttctga 21605561  T
Q  279 tgac 282  Q
    ||||    
T  21605560 tgac 21605557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22804049 - 22803993
Alignment:
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22804049 cttctgatgaacttcagcttctgatgagatgcttctgaggaacttgcttttgatgac 22803993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 278
Target Start/End: Original strand, 33598015 - 33598112
Alignment:
Q  180 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  33598015 aacaacttttgaagccttaagt--tgcatcctctgatgaactacaacttttggtgatttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctga 33598112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26417815 - 26417613
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 138  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||  |||  ||||| | | |||||||  | |||||||||||||||||| ||||  || |||  ||||||||| ||    
T  26417815 tagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcattc 26417716  T
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatct 238  Q
    ||| ||||||||| ||||  ||| |  ||||||| |  ||||||||  |||||||||| || |||| || || ||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  26417715 ttctagtcttctggaatg-ataggcgtgattaaaacatttgaacaaactttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaactcctgatgatct 26417617  T
Q  239 tcag 242  Q
    ||||    
T  26417616 tcag 26417613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 282
Target Start/End: Original strand, 13824265 - 13824298
Alignment:
Q  249 atgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13824265 atgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 13824298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 30054381 - 30054313
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  30054381 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 30054313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 45858860 - 45858804
Alignment:
Q  64 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45858860 gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45858804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 120
Target Start/End: Original strand, 51341040 - 51341107
Alignment:
Q  54 tcgtacactt-gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51341040 tcgtacacttcgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaattcctttcaaa 51341107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Original strand, 51341189 - 51341266
Alignment:
Q  203 ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgat 279  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||||| | |||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  51341189 ttgcatcttctgatgaactacagtttctagtgatatacagcttctgatgaaatagcttctgatagacttgcttctgat 51341266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1727995 - 1727919
Alignment:
Q  207 atctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1727995 atctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttttgatgaactagcttctgatgac 1727919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12388791 - 12388751
Alignment:
Q  242 gcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12388791 gcttctgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctgatgac 12388751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16199744 - 16199704
Alignment:
Q  242 gcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16199744 gcttctgatgaggtgcttcttatgaacttgcttctgatgac 16199704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21605818 - 21605726
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||| | |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21605818 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 377674 - 377403
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  377674 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 377575  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  377574 tcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatct 377475  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  377474 cctgatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 377403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 220234 - 220504
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  220234 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgc-ttcaaa 220332  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  220333 ttcatttgaattagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 220432  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  220433 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 220504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 244383 - 244256
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||    
T  244383 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattagtt 244284  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaa 154  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||    
T  244283 gttgcttcactcttctggtcttctgcaa 244256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 211394 - 211612
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||| || |||    
T  211394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaa 211493  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  211494 tccttacaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 211591  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctg 231  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  211592 cctgatgagctacagcttctg 211612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 39693523 - 39693794
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39693523 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 39693622  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39693623 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 39693722  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39693723 cctgatgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgacatgcttttgatgaacttgtttctgatgac 39693794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 17914447 - 17914718
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17914447 agcagagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 17914546  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  17914547 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaact 17914646  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17914647 cctaatgagctacaacttctagtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 17914718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 29693303 - 29693574
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  29693303 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaa 29693402  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  29693403 tcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatct 29693502  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29693503 cctaatgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 29693574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Original strand, 16207294 - 16207563
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  16207294 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16207393  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16207394 tcctttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 16207493  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatg 280  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16207494 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctaatgagatgcttctgataaacttgcttcagatg 16207563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 19156184 - 19156425
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19156184 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19156283  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  19156284 tcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatct 19156383  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19156384 cttgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 19156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24646326 - 24646597
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  24646326 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaa 24646425  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24646426 tcctttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 24646525  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24646526 cttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgataagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 24646597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 280
Target Start/End: Original strand, 19943239 - 19943494
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943239 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 19943338  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19943339 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttca 19943438  T
Q  225 acttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatg 280  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19943439 gcttctagtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttccgatg 19943494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17525889 - 17525623
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17525889 agagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcc 17525790  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17525789 tttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcc 17525690  T
Q  213 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17525689 tgatgaactacagtttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatga 17525623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12757923 - 12757687
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12757923 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 12757824  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12757823 tttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcct 12757724  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat 250  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  12757723 gatgaactagagctactggtgatcttcagcttctgat 12757687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16681466 - 16681197
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16681466 agcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 16681367  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16681366 tcctttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 16681267  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16681266 cctgatgaactttagcttctagtgatctt--gcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 16681197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 282
Target Start/End: Original strand, 33082872 - 33083114
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 137  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33082872 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 33082971  T
Q  138 cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatc 237  Q
    ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33082972 cttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatc 33083071  T
Q  238 ttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||  |||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  33083072 tt--gcttctgatgagttgcttcagatgaacttgtttctaatgac 33083114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 16188972 - 16189240
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  16188972 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaa 16189071  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16189072 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16189171  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||| ||||||| |  ||||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16189172 cctaatgaacttcggcttctggtgatctt--gcttctaatgagatacttctgatgaacttgcttctgatga 16189240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17441967 - 17441716
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  17441967 agagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgc-ttcaaatcc 17441869  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17441868 tttcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcct 17441769  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17441768 gatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgattagatgcttctgatga 17441716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18321319 - 18321067
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18321319 agagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcc 18321220  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18321219 tttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 18321120  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  18321119 gatgaacttcagcttctggtgatcttctacttctgatgagatgcttctgatga 18321067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 21932871 - 21933143
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||| |||    
T  21932871 agcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaa 21932970  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21932971 tcctttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21933070  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21933071 cctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgataaacttccttctgatgac 21933143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 602883 - 602642
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  602883 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 602784  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  602783 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcattt 602684  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  602683 cctgatgaactttagcttcttgtgatctttagcttttgatga 602642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 17701733 - 17701997
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||| ||||||| || || |||  | |||||||||||||||||    
T  17701733 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaa 17701832  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  17701833 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 17701932  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttc 275  Q
     |||||||||| || |||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17701933 tctgatgaacttcagcttctggtgatcatctgcttctgaagaggtgcttctgatgaacttgcttc 17701997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20382556 - 20382288
Alignment:
Q  12 gcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 111  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  20382556 gcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaat 20382457  T
Q  112 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 211  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  20382456 cctttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctc 20382357  T
Q  212 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20382356 ctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgac 20382288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23263757 - 23263505
Alignment:
Q  29 gtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23263757 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcat 23263658  T
Q  129 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagct-ttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    || |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  23263657 tgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagct 23263558  T
Q  228 tctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23263557 tctgatgatctt--gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 23263505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23185389 - 23185150
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  23185389 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 23185290  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  23185289 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatct 23185192  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23185191 cctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 23185150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Original strand, 17267463 - 17267724
Alignment:
Q  12 gcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  17267463 gcagagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaat 17267562  T
Q  112 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17267563 cctttcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 17267661  T
Q  212 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttct 276  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17267662 ttgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttct 17267724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18121269 - 18121018
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||| || ||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  18121269 agcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt---acacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 18121173  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  18121172 tcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 18121073  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatg 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18121072 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatg 18121018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 17797410 - 17797680
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  17797410 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 17797509  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  17797510 tcctttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatct 17797607  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17797608 cctgatgagctgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaatttgcttctgatgac 17797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 130 - 278
Target Start/End: Original strand, 22745594 - 22745742
Alignment:
Q  130 gcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttc 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  22745594 gcttcacacttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 22745693  T
Q  230 tggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22745694 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 22745742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20255658 - 20255460
Alignment:
Q  81 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20255658 ttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccattga 20255559  T
Q  181 acaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatg 280  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||   || |||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  20255558 acagcctttgacgctttaagtcttgcat---ctaatgagctttatcttctggtgatcttcagcttctgatgagatacttctgatgaacttccttatgatg 20255462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30421591 - 30421352
Alignment:
Q  12 gcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattc--aaagaacaaacatccaatgccttcaa 109  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30421591 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaa 30421493  T
Q  110 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||    
T  30421492 atccattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatc 30421395  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  30421394 ttctgatgaactgcagcttctggtgattttgagcttctgatga 30421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 18679802 - 18680011
Alignment:
Q  10 aagcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18679802 aagcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaa 18679901  T
Q  110 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  18679902 atcctatcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatc 18680001  T
Q  210 tcctgatgaa 219  Q
    | ||||||||    
T  18680002 ttctgatgaa 18680011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 18718989 - 18719217
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18718989 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18719088  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  || ||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18719089 tcctatcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 18719188  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
     |||| |||||  | ||||||||||||||    
T  18719189 tctgaagaacttaagcttctggtgatctt 18719217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15336235 - 15335981
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15336235 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 15336136  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  15336135 gttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagc 15336038  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15336037 ttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgac 15335981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15425300 - 15425046
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15425300 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 15425201  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  15425200 gttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagc 15425103  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15425102 ttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgac 15425046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15516604 - 15516350
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15516604 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 15516505  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  15516504 gttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagc 15516407  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15516406 ttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgac 15516350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Original strand, 19707497 - 19707761
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  19707497 agagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattc 19707596  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
     ||  || |||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  | |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  19707597 atttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttct 19707695  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||| || || ||||||| ||||||  |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19707696 gatgatcttcagcttctggcgatctt--gcttctaatgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatga 19707761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45538602 - 45538379
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||  |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  45538602 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 45538503  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||     
T  45538502 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcc 45538405  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    | ||||||||| || |||||||||||    
T  45538404 catgatgaactgcagcttctggtgat 45538379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 22673766 - 22674036
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||| ||    
T  22673766 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaa 22673865  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||    |||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  22673866 tccttccaaaatagatgttgctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 22673963  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22673964 ccggatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 22674036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 24551279 - 24551485
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24551279 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcg 24551378  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| || ||    
T  24551379 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagct 24551476  T
Q  228 tctggtgat 236  Q
    |||||||||    
T  24551477 tctggtgat 24551485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 36105183 - 36105453
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||| || |||||   ||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36105183 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 36105282  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  36105283 tccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 36105380  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36105381 cctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 36105453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 1237641 - 1237894
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1237641 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 1237740  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | || |    
T  1237741 gttgcttcacttttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaattgcagc 1237838  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||| || ||  |||| ||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1237839 ttctggtaatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 1237894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 9320572 - 9320828
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattca-aagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||   ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9320572 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaataat 9320671  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatcc-attgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  |||||||||| ||    
T  9320672 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgca 9320769  T
Q  225 acttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9320770 gcttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 9320828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40845550 - 40845281
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  40845550 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaa 40845451  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  40845450 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 40845354  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtga-tcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40845353 cctgatgaactatagcttctggtgagtctt-agcttctgataaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgac 40845281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 279
Target Start/End: Original strand, 22663120 - 22663371
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  || |||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  22663120 gagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatctttccaaaatagtt 22663219  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||  | | |||||||||||||||||  | |||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  22663220 gttgctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctaatgaactacaac 22663317  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgat 279  Q
    |||| |||||||||||||| | ||  |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  22663318 ttctagtgatcttcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgcatctgat 22663371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 43644884 - 43645069
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43644884 agcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 43644983  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 197  Q
    | | ||  || |||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  43644984 ttcatttgaattagccgtttcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttt 43645069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18685544 - 18685353
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18685544 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagtt 18685445  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 218  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||  ||||| |||| |||||||   |||||||| |||| ||||  |||| |||||||    
T  18685444 gttgcttcactcttctggtcttcttgcaatgc-tagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaactcttttatcttctgatga 18685353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18722793 - 18722602
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  18722793 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagtc 18722694  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 218  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||   |||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18722693 gttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18722602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18731138 - 18730947
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  18731138 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagtc 18731039  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 218  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||   |||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18731038 gttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18730947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3598375 - 3598243
Alignment:
Q  145 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 244  Q
    |||||||||||  |||||| || || ||||  || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3598375 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagct 3598278  T
Q  245 tgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
    | ||||| |  ||||| |||||| |||||||||||    
T  3598277 tctgatgaacttgcttatgatgaccttgcttctga 3598243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24833204 - 24832987
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   ||||  |||||||||| ||   || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||     
T  24833204 gagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaagtagc 24833105  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatcc-attgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 224  Q
      |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||| |||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||| ||    
T  24833104 cattgcttcacttttc-agtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatcctctgatgaactgca 24833008  T
Q  225 acttctggtgatcttcagctt 245  Q
     ||||||||||| || |||||    
T  24833007 gcttctggtgatttttagctt 24832987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19956482 - 19956374
Alignment:
Q  33 tggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 132  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||    
T  19956482 tggaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaatcctttagaattagtcgttgct 19956383  T
Q  133 tcactcttc 141  Q
    |||||||||    
T  19956382 tcactcttc 19956374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 282
Target Start/End: Original strand, 43639863 - 43640032
Alignment:
Q  112 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 211  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||| ||||||  |||| | || || ||||| |  |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  43639863 cctttcaaaatagtcgttgtcatacttttccagtcttttgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctc 43639960  T
Q  212 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     ||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43639961 atgatgaactgcatcttctggtgatacacagcttctgatgattttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 43640032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22461783 - 22461617
Alignment:
Q  29 gtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 128  Q
    ||||||||  |||||||||| || | |||||| |||| |||| ||||| || | ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||    
T  22461783 gtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgt 22461684  T
Q  129 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 196  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22461683 tgcttcattcttctagtcttctgcaatg-atatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaagctt 22461617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Original strand, 6407833 - 6407927
Alignment:
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6407833 ttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 6407927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 45568048 - 45567955
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 120  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45568048 gagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45567955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14989614 - 14989518
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 107  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  14989614 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 14989518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 25164058 - 25164134
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaag 87  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| || |||||||    
T  25164058 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactcttcaaag 25164134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18151809 - 18151713
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 107  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||| ||| ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  18151809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 18151713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18151652 - 18151605
Alignment:
Q  187 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18151652 tttgaagctttaagt--tgcatcttctgatgaactgcaacttctggtgat 18151605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 281
Target Start/End: Original strand, 21541125 - 21541201
Alignment:
Q  203 ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||| |||||| || ||||   |||||||||||||||||||    
T  21541125 ttgcatctcctgatgaactatagtttctggtgatatacagcttctgatgaaatagctt---atgaacttgcttctgatga 21541201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 6407714 - 6407810
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 107  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |   ||||| |||||||||| ||  |||||  | ||||||||||||||    
T  6407714 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc 6407810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13430775 - 13430699
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  13430775 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 111
Target Start/End: Original strand, 18772624 - 18772707
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 111  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||  ||||| | | ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18772624 gagtagtggaggtaatggttgtacattt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaat 18772707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 21301010 - 21301078
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||||    
T  21301010 agcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgct 21301078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10883339 - 10883072
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10883339 agcagagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaa 10883240  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10883239 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatct 10883140  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10883139 cctgatgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatgggatgcttctgatgaacttgcttctga 10883072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 11319400 - 11319660
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  11319400 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcc 11319499  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |    
T  11319500 tttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctctt 11319599  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgctt 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319600 gatgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctt 11319660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16316723 - 16316454
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16316723 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 16316624  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16316623 tcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcc 16316524  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16316523 cctgatgaacttcaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 16316454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 13880096 - 13880366
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  13880096 agcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaa 13880195  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |    
T  13880196 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaatt 13880295  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13880296 cctgatgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13880366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21283536 - 21283270
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21283536 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcc 21283437  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21283436 tttcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcct 21283337  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21283336 gatgaacttcaacttctggtgatctt--gcttctgatgagattcttctgatgaacttgattctgatgac 21283270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22578187 - 22577918
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  22578187 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaa 22578088  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22578087 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatct 22577988  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22577987 cctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcctctgatgagatgcttctgatgaccttgcttctaatgac 22577918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 252
Target Start/End: Original strand, 15088513 - 15088753
Alignment:
Q  12 gcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15088513 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaat 15088612  T
Q  112 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  15088613 cctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctc 15088712  T
Q  212 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15088713 ctgatgaattagagcttctggtgatcttcagcttatgatga 15088753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 28409034 - 28409301
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409034 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 28409133  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |    
T  28409134 tttcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctctt 28409233  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||  | |||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409234 gatgaactttagcttctggtga-ctgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 28409301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12366914 - 12366646
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12366914 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaa 12366815  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  12366814 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 12366715  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12366714 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctgatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 12366646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13138061 - 13137827
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13138061 agcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13137962  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13137961 tcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13137862  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 245  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13137861 ccttatgaactagagcttctggtgatcttcagctt 13137827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 44467056 - 44467298
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44467056 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 44467155  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44467156 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 44467255  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44467256 tcctgatgaacttcagcttttggtgatcttcagcttctgatga 44467298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 21695393 - 21695634
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21695393 agcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21695492  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    || |||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21695493 tcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatct 21695592  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21695593 cttgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21695634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 13302802 - 13303033
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13302802 agcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13302901  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13302902 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13303001  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcag 242  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13303002 cctaatgaactacagcttctggtgatcttcag 13303033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 2500030 - 2500271
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  2500030 agcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaa 2500129  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2500130 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 2500229  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||  ||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2500230 cctgaaaaacaagagcttctggtgatcctcagcttctgatga 2500271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 15467924 - 15468179
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15467924 gagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtc 15468023  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15468024 gttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 15468123  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15468124 ttctggtaatcttcagcatctgatgagatgcatatgatgaacttgcttctgatgac 15468179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 9069554 - 9069826
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  |  |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  9069554 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaa 9069653  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9069654 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 9069753  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  9069754 cctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgtttctgataaacttgcttctgatgac 9069826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 11792899 - 11793162
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  11792899 agcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaa 11792998  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11792999 tgctttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatct 11793098  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgctt 274  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  11793099 cctgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgtttatgatgaacttgctt 11793162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2913774 - 2913533
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2913774 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 2913675  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2913674 tcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatct 2913575  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2913574 cctgatgaactacagtttctggtgatcttcatcttctgatga 2913533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 21692279 - 21692504
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21692279 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21692378  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21692379 tcctttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatct 21692478  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    ||| ||||||| || |||||| ||||    
T  21692479 cctaatgaacttcagcttctgatgat 21692504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23280108 - 23279895
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  23280108 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagcc 23280009  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23280008 gttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 23279910  T
Q  227 ttctggtgatcttca 241  Q
    |||||||||| ||||    
T  23279909 ttctggtgattttca 23279895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33691878 - 33691648
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| || ||||| |||    
T  33691878 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaa 33691779  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  33691778 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatct 33691679  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttca 241  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  33691678 cctgatgaactagagcttctggtgattttca 33691648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 30025897 - 30026138
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||     
T  30025897 agcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaat 30025996  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  30025997 tcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 30026096  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30026097 cttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 30026138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9709968 - 9709729
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  9709968 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9709869  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||    
T  9709868 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 9709771  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9709770 cctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 9709729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13730839 - 13730638
Alignment:
Q  13 cagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13730839 cagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatc 13730740  T
Q  113 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13730739 ttttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcc 13730640  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  13730639 tg 13730638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 24788136 - 24788361
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  24788136 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcc 24788235  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24788236 tttcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 24788335  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
     ||||||| || ||||||||||||||    
T  24788336 aatgaacttcagcttctggtgatctt 24788361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30944489 - 30944271
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  30944489 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 30944390  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  30944389 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 30944292  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctg 231  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  30944291 cctgatgaactgcagcttctg 30944271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 13648721 - 13648949
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  13648721 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaa 13648820  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  13648821 tcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatct 13648920  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||| ||  | |||||| |||||||    
T  13648921 cctgatgagctttagcttctgttgatctt 13648949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29935524 - 29935272
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29935524 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29935425  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||     ||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  29935424 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatct 29935326  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  29935325 cctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatga 29935272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30945505 - 30945304
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945505 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 30945406  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  30945405 ttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagct 30945308  T
Q  228 tctg 231  Q
    ||||    
T  30945307 tctg 30945304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 281
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692602
Alignment:
Q  40 agtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactct 139  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||| ||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctt---------tcaaaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  140 tccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T
Q  240 cagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
      |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13692563 --gcttctgaagagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13692602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28622522 - 28622283
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||| ||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  28622522 agcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaa 28622423  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  28622422 tcctttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 28622325  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  28622324 cctgatgaactgcagcttctggtgatttttagcttatgatga 28622283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 48237068 - 48236829
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||  |||||||||||    
T  48237068 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaa 48236969  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  48236968 tcctttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 48236871  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48236870 cctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 48236829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 331637 - 331877
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |   || || ||||||||||||||| |    
T  331637 agcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgcttttgagc-aataagcatccaatgccttcaga 331735  T
Q  111 tcctttcaaaa-tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  331736 tcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatc 331834  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  331835 tcctgatggacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 331877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39284727 - 39284490
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39284727 agagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 39284628  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
     ||  || |||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||| |  |||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||  ||||| ||    
T  39284627 atttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttct 39284529  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39284528 gatgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39284490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 33605677 - 33605917
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  ||||||| | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  33605677 agcagagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33605776  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||  | |||||||    
T  33605777 tcctttcaaaatagtcattgcttcaattttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatc 33605874  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33605875 tcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 33605917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35952851 - 35952585
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35952851 agagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcc 35952752  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  |    
T  35952751 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctc 35952654  T
Q  213 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatg 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35952653 tgatgaactgcaacttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaatttgcttctgatg 35952585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13260781 - 13260520
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||| |    
T  13260781 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgctttcata 13260682  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
           | |||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  13260681 -------agaatagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatct 13260590  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13260589 cctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctaatgagatgcttatgatgaacttgcttctgatgac 13260520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 14426542 - 14426757
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14426542 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 14426641  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  || || |||||||| |||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  14426642 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcct 14426739  T
Q  214 gatgaactacaacttctg 231  Q
    |||||||| || ||||||    
T  14426740 gatgaactgcaccttctg 14426757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5000985 - 5000788
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5000985 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcc 5000886  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcac-tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||    ||||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5000885 tttcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5000788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19237204 - 19236969
Alignment:
Q  16 agacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 115  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19237204 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
Q  116 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctga 215  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaactctctcatcttctgg 19237006  T
Q  216 tgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    | | || || || ||  ||||||||||||| ||||||    
T  19237005 taatcttcagctcctaatgatcttcagcttctgatga 19236969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13018671 - 13018421
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||||||     
T  13018671 agcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaac 13018572  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | | | |  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  | ||    
T  13018571 ttcatttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaatac-tgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtct--cgtc 13018475  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctga 263  Q
    | |  ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  13018474 ttcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgaggtgcttctga 13018421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 14193108 - 14193243
Alignment:
Q  13 cagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 112  Q
    |||||||| | || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14193108 cagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatc 14193207  T
Q  113 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtctt 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14193208 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtctt 14193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16112050 - 16111827
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  16112050 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 16111951  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||| |  |||||| || || |||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  16111950 ttcttccaaaaaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcc 16111853  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
     ||||| |||| || |||||||||||    
T  16111852 tctgatcaactgcagcttctggtgat 16111827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 4821466 - 4821735
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  4821466 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4821565  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||| |||  |||||| || || |||   || |||| | ||||||||||||||  ||| ||||    
T  4821566 t-ctttcaaaatagccgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgtatct 4821662  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4821663 ccggatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgacgaacttgcttctgatgaccttgcttttgatgac 4821735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13894148 - 13893958
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||| |||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||      
T  13894148 gagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaatccttttgaattagcc 13894049  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 218  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  13894048 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatcttctgatga 13893958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12174480 - 12174236
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12174480 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 12174381  T
Q  137 tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtga 235  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||  |||| | |||||||| |||||  |||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  12174380 ttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagc-ttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtga 12174284  T
Q  236 tcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | || ||||| ||||  |  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12174283 tttttagcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatgac 12174236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16310073 - 16309961
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16310073 agcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16309974  T
Q  111 tcctttcaaaata 123  Q
    |||||||||||||    
T  16309973 tcctttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41842439 - 41842212
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  || ||| |||||  |||||||| ||||||     
T  41842439 agcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaac 41842340  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||| |   |||| |||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||    
T  41842339 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagc-ttaagtctctcatct 41842241  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||    
T  41842240 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 41842212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16543133 - 16542947
Alignment:
Q  64 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac 163  Q
    |||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||    
T  16543133 gtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattaaac 16543034  T
Q  164 aagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     || || |||||||| |||| | |||||||| |||  | ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  16543033 gagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagtttctgatga 16542947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 252
Target Start/End: Original strand, 16622529 - 16622715
Alignment:
Q  64 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac 163  Q
    |||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||    
T  16622529 gtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattaaac 16622628  T
Q  164 aagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     || || |||||||| |||| | |||||||| |||  | ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  16622629 gagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagtttctgatga 16622715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2265665 - 2265446
Alignment:
Q  31 agtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttg 130  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||  ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  2265665 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaaatagccgttg 2265566  T
Q  131 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttct 230  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||  |||||| || || ||||  || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2265565 ctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttct 2265468  T
Q  231 ggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||  ||||||| ||||||    
T  2265467 ggtgattctcagcttctgatga 2265446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 199
Target Start/End: Original strand, 13880607 - 13880768
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtac-atttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 136  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  13880607 gtagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcac 13880706  T
Q  137 tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  13880707 tcttctagtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaa 13880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15704612 - 15704445
Alignment:
Q  64 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac 163  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  15704612 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagac 15704513  T
Q  164 aagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggt 233  Q
     || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15704512 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--tttcatcttctgatgaactacaacttctggt 15704445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 8182922 - 8183191
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||| | || |||  ||    
T  8182922 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttcaa 8183021  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || || |  ||  ||||| ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  8183022 tcctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgag--ttgcatct 8183118  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8183119 cctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttttgatgaacttgcttctaatgaacttgcttctgatgac 8183191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 231
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494718
Alignment:
Q  147 ttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctg 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 4494718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 282
Target Start/End: Original strand, 14193242 - 14193337
Alignment:
Q  187 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14193242 tttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgataagatgcttatgatgaacttgcttctgatgac 14193337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13032210 - 13032046
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 138  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| | | | |||| |||| |||||| | | ||  ||||||||||||||||||||    
T  13032210 tagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttcactc 13032111  T
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtct 203  Q
    | |  |||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13032110 tcctggtcttctgcaatac-taggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtct 13032046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13472663 - 13472555
Alignment:
Q  94 catccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaa 192  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  13472663 catcaaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttaaa 13472564  T
Q  193 gctttaagt 201  Q
    |||||||||    
T  13472563 gctttaagt 13472555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9098385 - 9098283
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 137  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |||||||||||    
T  9098385 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcact 9098286  T
Q  138 ctt 140  Q
    |||    
T  9098285 ctt 9098283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19711176 - 19710907
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19711176 agagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcc 19711077  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttc--cagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||| |||| |||||  | || |||  |||||||   |  |  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||| ||||| |  ||||||||    
T  19711076 tttcaaattagtcgttgccac-cttttcttcagtctttcactctctttagacgagtttgaatccattaaacagctatttgaaactttagg--ttgcatct 19710980  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     |||||||||||||  |||||||||| | ||| || |||||| || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  19710979 tctgatgaactacagtttctggtgatatacagtttctgatgaaatagcttctgatagacttgcttctgatgac 19710907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16556751 - 16556664
Alignment:
Q  64 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctg 151  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16556751 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 151
Target Start/End: Original strand, 16608911 - 16608998
Alignment:
Q  64 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctg 151  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16608911 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16608998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48062826 - 48062727
Alignment:
Q  180 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctga 278  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  48062826 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcttgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatggacttgcttctgatgaacttgcttctga 48062729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 13303045 - 13303101
Alignment:
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13303045 cttctgatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaagttgcttctaatgac 13303101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19339416 - 19339324
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  19339416 agcagagacaaactcagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7339893 - 7339821
Alignment:
Q  158 ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgg 232  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7339893 ttagacgagtttaaatccattaaacaatttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctgg 7339821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 1293025 - 1293157
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||         ||    
T  1293025 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cc 1293115  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 155  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  1293116 tttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttttgcaat 1293157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 14425559 - 14425651
Alignment:
Q  140 tccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtga 235  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || || ||||| |  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  14425559 tccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactntagcttctggtga 14425651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24794881 - 24794813
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  24794881 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 27871710 - 27871778
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  27871710 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 27871778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4429059 - 4428984
Alignment:
Q  207 atctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||   |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4429059 atctccagatgaactgcagcttctggtgataaacagcttctgatgaatttgcttctgatgaacttgcttctgatga 4428984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32264789 - 32264669
Alignment:
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||  |||||   ||| |||||||||||||||||   ||| | || || ||||| |  || ||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  32264789 tttcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaataacttttgaagctttaagtc--gcatctcct 32264692  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  32264691 gatgaactgcagcttctggtgat 32264669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 27871871 - 27871925
Alignment:
Q  180 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  27871871 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatttcctgatgaactgcagcttctggtgat 27871925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9098179 - 9098139
Alignment:
Q  242 gcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9098179 gcttttgatgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatgac 9098139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13032032 - 13031980
Alignment:
Q  230 tggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  13032032 tggtgatcttctgcttctgatgaggtgtttctagtgaacttgcttctgatgac 13031980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21381594 - 21381526
Alignment:
Q  12 gcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtaca-tttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||    
T  21381594 gcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacattttcgtacagacgtactatgtcaacgct 21381526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18734 - 18465
Alignment:
Q  13 cagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18734 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatc 18635  T
Q  113 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||    
T  18634 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcc 18535  T
Q  213 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534 tgatgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 18465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 49328 - 49584
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49328 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 49427  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  49428 tcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatct 49527  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49528 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaa 49584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 32481 - 32722
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  32481 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaa 32580  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  32581 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatct 32680  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  32681 cctgatgaactacaagttgtggtgatctttagcttctgatga 32722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 444 - 189
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  444 gagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagcc 345  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    |||||| |  |  |  ||||||  ||  |  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||     
T  344 gttgctactttactttagtctttcgctctctttagacgagtttgaatccattaaacagctatttgaaactttagg--ttgcatcttctgatgaagtacag 247  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     |||||||||| | |||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  246 tttctggtgatatacagcttctgatagacttgcttctgataaacttgcttctgatgac 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28492489 - 28492248
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28492489 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28492390  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28492389 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 28492290  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28492289 cctgatgaactacaacttctgaagatcttcagcttctgatga 28492248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33256436 - 33256170
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33256436 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33256337  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33256336 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33256237  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 279  Q
    |||| ||||||  | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33256236 cctgttgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 33256170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33276608 - 33276342
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33276608 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33276509  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33276508 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33276409  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 279  Q
    |||| ||||||  | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33276408 cctggtgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 33276342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22600267 - 22599997
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22600168  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22600167 tcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22600068  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22600067 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 22599997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20954558 - 20954287
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  20954558 agcagagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaa 20954459  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20954458 tcctttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20954359  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20954358 cctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgaatctgatgac 20954287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 22153852 - 22154123
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22153852 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 22153951  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22153952 tcctttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22154051  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  22154052 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttcttatgagatgcttctaaggaacttgcttctaatgac 22154123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 19717519 - 19717788
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19717519 agcagagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaa 19717618  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19717619 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 19717718  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||  |||||||  | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19717719 ccatatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttatgatgac 19717788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 48704199 - 48704468
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | | |||||||||||   | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48704199 agcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaa 48704298  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48704299 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 48704398  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     ||||||||||  | |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48704399 tctgatgaactttagcttctggtgatct--agcttctgatgagatgcttctgatgaactagcttctgatgac 48704468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 38282562 - 38282831
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  38282562 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 38282660  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38282661 tcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 38282760  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38282761 cctgatgaactagagcttttggtgatctttagcatctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 38282831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 281
Target Start/End: Original strand, 35401821 - 35402072
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35401821 agtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 35401920  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||    
T  35401921 ttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagct 35402018  T
Q  228 tctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402019 tctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 35402072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900581
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  1900340 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 1900439  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1900440 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatct 1900539  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  1900540 cctgatgaactagatcttctggcgatctttagcttctgatga 1900581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32786005 - 32785789
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32786005 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 32785906  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32785905 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactacaact 32785807  T
Q  228 tctggtgatcttcagctt 245  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  32785806 tctagtgattttcagctt 32785789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 1577862 - 1578115
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1577862 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 1577961  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1577962 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 1578061  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    |||||| ||||  | ||||| ||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||    
T  1578062 cctgataaactttagcttcttgtgatctt--gcttctgacgagatgtttctgatga 1578115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 10757416 - 10757645
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10757416 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 10757515  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10757516 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 10757615  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||||||| || ||| || |||||||    
T  10757616 tcctgatgaacttcagcttttgatgatctt 10757645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22201821 - 22201614
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22201821 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaa 22201722  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||  ||||||||||||||||||    
T  22201721 tcctttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatct 22201622  T
Q  211 cctgatga 218  Q
    ||||||||    
T  22201621 cctgatga 22201614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 2268526 - 2268793
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  2268526 agcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaa 2268625  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    || ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2268626 tcatttcaaaatagttg---cttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatct 2268722  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||| |||||||  | ||||| ||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2268723 cctaatgaactttagcttctagtgat-tgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 2268793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22427442 - 22427172
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22427442 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22427343  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||  | ||||||||    
T  22427342 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatct 22427245  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22427244 cctgatgaactggagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctggtagacttgcttctgatgac 22427172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 36134185 - 36134438
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  36134185 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc-ttcaaa 36134283  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  36134284 tcctttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 36134383  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatga 266  Q
     |||||||   ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  36134384 tctgatga--gacagcttctggtgatcttcagcttctggtggagatgcttctgatga 36134438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 12284418 - 12284646
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12284418 agcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12284517  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12284518 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 12284617  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||    
T  12284618 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 12284646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23036595 - 23036344
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23036595 agtagaggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttg 23036496  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||    
T  23036495 ttgtttcacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagct 23036398  T
Q  228 tctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23036397 tctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaaattgcttctgatga 23036344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 2267101 - 2267292
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2267101 agtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattctttcaaactagttg 2267200  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2267201 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaact 2267292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 29215792 - 29216031
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29215792 agcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29215891  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  29215892 tcctttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 29215989  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29215990 cctgatgaattgcaacttctggtgattttcagcttctgatga 29216031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16235365 - 16235142
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16235365 gagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 16235266  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||   |||||    
T  16235265 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatcttatgatga--gacaac 16235168  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16235167 ttctggtgatcttcagcttctgatga 16235142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22464878 - 22464623
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  22464878 gagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaattagtc 22464779  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | || ||||||||||||||||  |     
T  22464778 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagcttta--tgttacatctcctgatgaactgtag 22464681  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | ||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22464680 catctggtgattttcagcttcttatgaacttgcttctggtggacttgcttctgatgac 22464623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39201061 - 39200838
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||      
T  39201061 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaactagcc 39200962  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| || |    
T  39200961 gttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaactgcagc 39200864  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||    
T  39200863 ttttggtgattttcagcttttgatga 39200838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 2834701 - 2834938
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  2834701 gagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagcc 2834800  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||| || |    
T  2834801 gttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatctcccgatgaactgcagc 2834898  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  2834899 ttctggtgattttcagcttctaatgacttgcttctgatga 2834938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 7309830 - 7310068
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||| || || |||| | |||||||||||||||||||| | ||||||        
T  7309830 gagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgcttttgaa-gaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgacc 7309928  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  7309929 gttgcttcactcttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagc 7310028  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7310029 ttatggtgatcttcagcttctgatgagatgtttctgatga 7310068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 30893090 - 30893316
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||    
T  30893090 agagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcc 30893189  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||   |||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  30893190 tttcaaaatagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcc 30893289  T
Q  213 tgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||    
T  30893290 tgatgaactttagcttttggtgatctt 30893316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25448651 - 25448443
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  25448651 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 25448552  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  25448551 tcctttcaaaatagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 25448454  T
Q  211 cctgatgaact 221  Q
     ||||||||||    
T  25448453 tctgatgaact 25448443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 21028788 - 21029029
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  21028788 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 21028887  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |    
T  21028888 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcatat 21028987  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     || ||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21028988 tctaatgatattcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21029029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21191947 - 21191763
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21191947 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 21191848  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 199  Q
    |||  || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  21191847 ttttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctttaa 21191763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26702214 - 26701973
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || |||||| | |||  |||||||||||||||     
T  26702214 agcagagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaac 26702115  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | || ||||| |||||||  |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  26702114 ttcatttgaattaattgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatct 26702015  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     ||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  26702014 tctgatgaactttagcttctggtgatcttcagtttctgatga 26701973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 35040161 - 35040384
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  35040161 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaa 35040260  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||     
T  35040261 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcc 35040358  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    | ||||||| | || |||||||||||    
T  35040359 catgatgaattgcagcttctggtgat 35040384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2327509 - 2327255
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||  ||  | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2327509 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcgaatcctttcaaaatagt 2327410  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    | |||||||||| || ||||| ||||||||  |||||| || || |||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||     
T  2327409 ttttgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 2327312  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||  |  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2327311 cttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatga 2327255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48570316 - 48570047
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||  ||    
T  48570316 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaa 48570217  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  48570216 tccttccaaaatagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 48570120  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgaga-tgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48570119 cctgatgaattacagcttctggtgattctcagcttctgataaaattgcttatgatgaacttgtttctgatgac 48570047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 21702809 - 21703077
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| ||||||| |  ||    
T  21702809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaa 21702908  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  21702909 tcctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaag--ttgcatct 21703005  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21703006 cctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 21703077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12613899 - 12613713
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  12613899 agcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaa 12613800  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 199  Q
    | ||||  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  12613799 t-cttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 30572208 - 30572414
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||      
T  30572208 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaatcctttcaaaatagcc 30572307  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||| || |||| || || ||||| |  |||| |  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  30572308 gttgctatacttttccagtcttctgcaat-ctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagctttaag--ttgtatctcctgatgaactgcaac 30572404  T
Q  227 ttctggtgat 236  Q
    ||||||||||    
T  30572405 ttctggtgat 30572414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44821630 - 44821393
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||   ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||| ||| |||||||||    
T  44821630 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaa 44821531  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| || ||||||||| |||  ||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  44821530 tccttccaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 44821433  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat 250  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||    
T  44821432 cctgatgaactacagcttatggtgattctcagcttctgat 44821393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17025029 - 17024825
Alignment:
Q  31 agtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttg 130  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||    
T  17025029 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttg 17024930  T
Q  131 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttc 229  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||| |||  |  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||  || || ||||||| || || ||||    
T  17024929 cttcactcttatggtcttttgcaatg-ttatgcgtgattaaatcctttgaacagaca-ttgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttc 17024832  T
Q  230 tggtgat 236  Q
    |||||||    
T  17024831 tggtgat 17024825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14263520 - 14263371
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   || ||||| ||||||| ||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14263520 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 14263421  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatcca 176  Q
    |||| ||  ||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  14263420 gttgttttgcttctccagtcttctgcaatccttagacgggatttaatcca 14263371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 46088984 - 46089245
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||        
T  46088984 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt---- 46089079  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
         |||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  |||| | || || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  46089080 -----tcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 46089172  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | ||||||||| || |||||||||||   || ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46089173 catgatgaactgcagcttctggtgatacacaacttatgatgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 46089245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Original strand, 10251100 - 10251194
Alignment:
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10251100 ttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 10251194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7745159 - 7744906
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| |   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||| ||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  7745159 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaact 7745060  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    |||||| | ||  | ||||||| |||| |  |||||  || || |||||||| |||||| |||||| || || |  |||||||| |||||||||| || |    
T  7745059 gttgctactcttcttcagtcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaaactgtagg--ttgcatcttctgatgaactgcagc 7744962  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgaga-tgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||| |   |||| |||||| |  |||||| || ||||||||||||||||    
T  7744961 ttctggtgatatatggcttctgatgaaacagcttctaataaacttgcttctgatga 7744906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18896665 - 18896537
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||  ||||| | | ||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || |||  |    
T  18896665 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccg 18896566  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 156  Q
    |||||||   |||| ||||||||||||||    
T  18896565 ttgcttcttgcttctagtcttctgcaatg 18896537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21121149 - 21121057
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21121149 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21135245 - 21135153
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  21135245 agcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21204992 - 21204916
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  21204992 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 21204916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 21984607 - 21984683
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21984607 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 281
Target Start/End: Original strand, 17371211 - 17371290
Alignment:
Q  203 ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||||  |||||||||  | ||||||||||| | |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17371211 ttgcatcttttgatgaactgtagcttctggtgatatgcagcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 17371290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21191728 - 21191693
Alignment:
Q  247 tgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21191728 tgatgagatgcttcagatgaacttgcttctgatgac 21191693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 34255601 - 34255552
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtaca 60  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34255601 agcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacagttcgtaca 34255552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 103
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284715
Alignment:
Q  30 tagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 37642243 - 37642311
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||| |   ||||| ||||||||||    
T  37642243 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgct 37642311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 13602168 - 13602439
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||     
T  13602168 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaat 13602267  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13602268 tcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13602367  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13602368 cctgatgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 13602439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 13435544 - 13435799
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  13435544 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 13435643  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13435644 gttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 13435743  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13435744 ttatggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgac 13435799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 23284564 - 23284831
Alignment:
Q  15 gagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 114  Q
    |||||||| |||||||||||||  || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23284564 gagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcct 23284663  T
Q  115 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23284664 ttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 23284763  T
Q  215 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23284764 atgaacttcagcttctagcgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgac 23284831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Original strand, 9717841 - 9718110
Alignment:
Q  13 cagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 112  Q
    |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  9717841 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatc 9717940  T
Q  113 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9717941 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcc 9718040  T
Q  213 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9718041 tgatgaactagagcttctagtgatctttaacttctgatgggatgcttatgataaacttgcttctgatgac 9718110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26972379 - 26972109
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  26972379 agcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaa 26972282  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26972281 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 26972182  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  26972181 cctgatgaaatagagcttctggtgattttctgcttctgatgaacttgcttctaataaacttgcttctgatgac 26972109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15531777 - 15531509
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  15531777 agcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 15531678  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||   |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15531677 tcctttcaaaataaccgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatct 15531578  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15531577 tctgatgaactacaacttctggtgatcttatgattctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 15531509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 32544261 - 32544502
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||    
T  32544261 agcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaa 32544360  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32544361 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 32544460  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  32544461 cctgatgaactagagcttatggtgattttcagcttctgatga 32544502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20112852 - 20112618
Alignment:
Q  12 gcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20112852 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaat 20112753  T
Q  112 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  20112752 cctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatct 20112653  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 245  Q
    | ||||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  20112652 cttgatgaacttcagcttcaggtgatctttagctt 20112618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 21625114 - 21625363
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||  |    
T  21625114 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgctttcaaa-tagccg 21625212  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  21625213 ttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatga--gacaact 21625310  T
Q  228 tctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatg 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21625311 tctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttatgatgaacttgcctctgatg 21625363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 93 - 282
Target Start/End: Original strand, 25597557 - 25597746
Alignment:
Q  93 acatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25597557 acatccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaa 25597656  T
Q  193 gctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25597657 gctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttcagatgac 25597746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12715573 - 12715344
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||||||    
T  12715573 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaa 12715474  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12715473 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 12715374  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12715373 tcctgatgaactacaacttctagtgatctt 12715344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14100577 - 14100373
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14100577 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 14100478  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14100477 gtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 14100378  T
Q  227 ttctg 231  Q
    |||||    
T  14100377 ttctg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 18435552 - 18435793
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || | ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18435552 agcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18435651  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  18435652 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatct 18435751  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18435752 cctgatgaactagagcttctagtgatcttcagcttctgatga 18435793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 22802153 - 22802376
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  22802153 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaacttgtc 22802252  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  22802253 gttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactacaac 22802350  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22802351 ttctggtgattttcagcttctgatga 22802376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 15302196 - 15302424
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15302196 agcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaa 15302295  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15302296 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatct 15302395  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    ||| |||| ||  | ||| ||||||||||    
T  15302396 cctaatgagctttagcttttggtgatctt 15302424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 231
Target Start/End: Original strand, 29918029 - 29918232
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||     
T  29918029 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaatcttttcaaactagtc 29918128  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29918129 gttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagc 29918227  T
Q  227 ttctg 231  Q
    |||||    
T  29918228 ttctg 29918232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24116824 - 24117095
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24116824 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 24116923  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    |||||||||||||   | | |||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  24116924 tcctttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 24117023  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtga-tgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||  |||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24117024 ttctgatgaacttcatcttctggtgatctt--gcttctaaccgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgac 24117095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 19623975 - 19624228
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactt-tgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 109  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||    
T  19623975 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaa 19624073  T
Q  110 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19624074 atcctttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatc 19624173  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  19624174 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gtttctgatgagatgcttctgatga 19624228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 18378310 - 18378496
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18378310 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaa 18378409  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  18378410 tcctttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagcttt 18378496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 19688789 - 19688980
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 137  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19688789 gtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcact 19688888  T
Q  138 cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctg 231  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  19688889 cttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaacttcagcttctg 19688980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 15987232 - 15987437
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat-c 112  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15987232 agagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 15987331  T
Q  113 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||| |    
T  15987332 cttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttc 15987431  T
Q  213 tgatga 218  Q
    ||||||    
T  15987432 tgatga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Original strand, 19086154 - 19086377
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||            
T  19086154 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg-------- 19086245  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaa-caacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||    
T  19086246 --ctttcaaaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatc 19086342  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 244  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19086343 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagct 19086377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20730837 - 20730618
Alignment:
Q  31 agtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttg 130  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20730837 agtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttg 20730738  T
Q  131 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttct 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||   | || |||||||||||||||| || |||||    
T  20730737 cttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagcttt--ttgttacatctcctgatgaactgcagcttct 20730640  T
Q  231 ggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     ||||| |||||||| ||||||    
T  20730639 agtgattttcagcttatgatga 20730618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16265303 - 16265064
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16265303 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaa 16265204  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
     ||||||||  || | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||    
T  16265203 acctttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta--tgttgcatct 16265106  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16265105 cttgacgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 16265064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 21618256 - 21618510
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21618256 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtc 21618355  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||  || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |    
T  21618356 gttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaactacagc 21618453  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618454 ttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 21618510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451595
Alignment:
Q  45 ttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 144  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  145 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatc 237  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 34451595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 16336123 - 16336381
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||| |  ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||| ||    
T  16336123 agcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaa 16336222  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  16336223 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaag--ttgcatct 16336320  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgctt 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||   |  ||||||||||||||||||    
T  16336321 cctgatgatctacaacttctggtgattctcagcttctgat---aaacttctgatgaacttgctt 16336381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22076560 - 22076290
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||| ||| ||    
T  22076560 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaa 22076461  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||| || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||    
T  22076460 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatct 22076363  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22076362 cctgatgaactacatcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgac 22076290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 16877225 - 16877432
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  | |||  | |||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  16877225 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaatccttttaagatagtc 16877324  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16877325 gttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaac 16877422  T
Q  227 ttctggtgat 236  Q
    || |||||||    
T  16877423 ttttggtgat 16877432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 15954702 - 15954936
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15954702 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcc 15954801  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||  || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  15954802 tttcaaattagtcgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctctt 15954899  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat 250  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||    
T  15954900 gatgaactacagcttctggtaattctcagcttctgat 15954936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 282
Target Start/End: Original strand, 19470683 - 19470934
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| |||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |    
T  19470683 agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcg 19470782  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||| |  |||  |||||  |||||| || |||||    
T  19470783 ttgcttcattcttctggtcttgtgcaatgc-taggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaact 19470881  T
Q  228 tctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||| ||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19470882 tcttgtgatgtt--gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 19470934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19833170 - 19832915
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||   || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19833170 gagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagt 19833071  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  || || ||||| || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19833070 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacat 19832973  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgatga-gatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| |   |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  19832972 cttctggtgattctcagcttctgataatcttgctttggatgaacttgtttctgatgac 19832915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20488055 - 20487800
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20488055 gagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagcc 20487956  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagatt-aaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| || || ||  ||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||  |||||||||| |||    
T  20487955 gttgcttcacttttacagtcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgcaa 20487858  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||  |  |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20487857 cttctagtgatttttagcttctgataaacttgcttctgattaactcgtttctgatgac 20487800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 26943588 - 26943741
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||||||      
T  26943588 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaatcctattgaaatagcg 26943687  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaa 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  26943688 gttgcttcactcttctagtcttctgcaatgc-tagacatgattaaatcctttgaa 26943741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10640555 - 10640384
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgt-caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||     
T  10640555 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtc 10640456  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 199  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10640455 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 10640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Original strand, 25594064 - 25594155
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatg 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25594064 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 12349005 - 12349211
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  12349005 gagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtc 12349104  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  12349105 gttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgatgaactgcagc 12349201  T
Q  227 ttctggtgat 236  Q
    ||||| ||||    
T  12349202 ttctgatgat 12349211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 21235137 - 21235348
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||           
T  21235137 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaaatgctttcaa------- 21235229  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||   || |      ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| || |    
T  21235230 gtccattgaa-----cagccttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagc 21235322  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21235323 ttctagtgattttcagcttctgatga 21235348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Original strand, 12423273 - 12423428
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  12423273 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcctttcaaaatagtc 12423372  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 183  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| || || |||||||| ||||    
T  12423373 gttgctatacttttccagtcttctgc-attcttagacgagtttgaatccattaaaca 12423428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33352079 - 33351939
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||  ||  ||    
T  33352079 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttgaa-gaataaacatccaatgtttttcaa 33351981  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgca 153  Q
    ||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||||    
T  33351980 tcctttcaaaatag-ccttgctatacttttccagtcttctgca 33351939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19066171 - 19066079
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  19066171 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10640353 - 10640318
Alignment:
Q  247 tgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10640353 tgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 10640318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 93
Target Start/End: Original strand, 17381517 - 17381599
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaa 93  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  17381517 agcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaa 17381599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 26589595 - 26589664
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtaca-tttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||    
T  26589595 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgct 26589664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 12205 - 12476
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  12205 agcagagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 12304  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||    
T  12305 ttctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtct 12404  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12405 cctgatgaactagagcttctggtgatcctcaacttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 12476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29680665 - 29680410
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29680665 agcagagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29680566  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29680565 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatct 29680466  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    |||| | ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29680465 cctggtaaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 29680410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12811296 - 12811028
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  12811296 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaa 12811200  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12811199 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 12811100  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12811099 cctaatgaactagagcttctggtgatcttctactactgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgac 12811028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37435656 - 37435387
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  37435656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37435557  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37435556 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37435457  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37435456 cctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcctctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 37435387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 45833400 - 45833655
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||      
T  45833400 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaatactttcaaaatagaa 45833499  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  45833500 gttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 45833599  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45833600 ttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttatgataaacttgcttctgatgac 45833655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Original strand, 16632430 - 16632697
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16632430 agcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaa 16632529  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16632530 tcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16632629  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatg 280  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16632630 cctgatgaactttagcttctagtgatctt--gcttctgatgagatgcttttgatgaccttgcttctgatg 16632697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14605012 - 14604758
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa-tagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  14605012 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatagt 14604913  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |     
T  14604912 tgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagtttag 14604813  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14604812 cttctgatgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 14604758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37985733 - 37985525
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37985733 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37985634  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37985633 tcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37985534  T
Q  211 cctgatgaa 219  Q
    | |||||||    
T  37985533 catgatgaa 37985525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 19884692 - 19884932
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || || |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  19884692 agcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19884791  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19884792 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 19884890  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  19884891 cctgatgaactacagcttctggtgattgtcagcttctgatga 19884932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Original strand, 3395580 - 3395840
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  3395580 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaa 3395679  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3395680 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatct 3395779  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaactt 270  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||  |  ||||||||||||||||    
T  3395780 cctgatgaactatagcttctagtgatcttcaacttctgataaacttgcttctgatgaactt 3395840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 282
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601360
Alignment:
Q  19 cacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttca 118  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  119 aaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 218  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcgagatga 12601298  T
Q  219 actacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     ||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  12601299 gctttaacttctagtgatctt--gcttctgatgagatgcttcttatgaaaatgcttttgatgac 12601360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 19666362 - 19666567
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  19666362 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaa 19666461  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19666462 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatct 19666561  T
Q  211 cctgat 216  Q
    ||||||    
T  19666562 cctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 55380280 - 55380508
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  55380280 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 55380379  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  55380380 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 55380478  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  55380479 tcctaatgaacttcagcttctgatgatctt 55380508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 252
Target Start/End: Original strand, 3483738 - 3483952
Alignment:
Q  38 gtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 137  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3483738 gtagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 3483837  T
Q  138 cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatc 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  3483838 tttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatc 3483937  T
Q  238 ttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||| ||||||    
T  3483938 ttcagcttctgatga 3483952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14904477 - 14904236
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  14904477 agcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaa 14904378  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  14904377 tcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatct 14904278  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14904277 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagattttgatga 14904236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 56034567 - 56034792
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||      
T  56034567 agagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatta 56034666  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  56034667 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttct 56034766  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  56034767 gatgaacttcagcttctggtgatctt 56034792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 282
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833652
Alignment:
Q  74 aacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat 173  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  174 ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgct 273  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |     ||||||||| |||||| ||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttct-----gatgcttcttatgaacctgct 14833643  T
Q  274 tctgatgac 282  Q
    |||||||||    
T  14833644 tctgatgac 14833652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13576235 - 13575996
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  13576235 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13576136  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||    
T  13576135 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 13576038  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13576037 cctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 13575996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19912002 - 19911760
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctatt-caaagaacaaacatccaatgccttcaa 109  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||    
T  19912002 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaa 19911903  T
Q  110 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19911902 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatc 19911803  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19911802 tcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 19911760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 17247250 - 17247503
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17247250 gagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagtc 17247349  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||| || |    
T  17247350 gttgcttcact-ttccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaactgcagc 17247446  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17247447 ttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 17247503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 9140902 - 9141097
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9140902 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 9141001  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgc 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9141002 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 413008 - 413231
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      
T  413008 gagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagcc 413107  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |    
T  413108 gttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcagc 413205  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    
T  413206 ttctggtgattttcagcttctgatga 413231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19621182 - 19620962
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  19621182 agcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaa 19621083  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19621082 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 19620983  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctg 231  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  19620982 cctgatgaacttcagcttctg 19620962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 10072925 - 10073158
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  10072925 agcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaa 10073024  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10073025 tcctttcaaactagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 10073123  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 245  Q
    |||||||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  10073124 cctgatgaactactgcttctggtaattttcagctt 10073158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 10692841 - 10693080
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10692841 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10692940  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  10692941 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10693038  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  10693039 cctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatga 10693080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 10906607 - 10906846
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10906607 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10906706  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  10906707 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10906804  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  10906805 cctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatga 10906846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22675628 - 22675422
Alignment:
Q  24 actgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaata 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22675628 actgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaacta 22675529  T
Q  124 gttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactac 223  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |    
T  22675528 gtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaactgc 22675431  T
Q  224 aacttctgg 232  Q
    | |||||||    
T  22675430 agcttctgg 22675422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 40846089 - 40846360
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||     
T  40846089 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaac 40846188  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacattt-gaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||    
T  40846189 ttcatttgaattagtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgct-aggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatc 40846287  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | |||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40846288 ttctgatgaacttcagcttccggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgac 40846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 54679936 - 54680157
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679936 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 54680035  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |  ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  54680036 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagc 54680131  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    
T  54680132 ttctggtgattttcagcttctgatga 54680157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 6641674 - 6641942
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  6641674 agcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaa 6641773  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||  || |||  |||| ||||||||||   |||||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  6641774 tccttttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgc-taggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatct 6641872  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     |||||||| | || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6641873 tctgatgaaattcagcttctggtgatatt--gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttatgatgac 6641942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 262
Target Start/End: Original strand, 23123528 - 23123672
Alignment:
Q  118 aaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123528 aaaatagtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 23123627  T
Q  218 aactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctg 262  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23123628 aacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttctg 23123672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 29121362 - 29121550
Alignment:
Q  13 cagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 112  Q
    |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29121362 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatc 29121461  T
Q  113 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  29121462 ctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 29121550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 6517475 - 6517714
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||  |||| ||| ||    
T  6517475 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaa 6517574  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  6517575 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaag--ttgcatct 6517672  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  6517673 cctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgatga 6517714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 15139287 - 15139482
Alignment:
Q  81 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 180  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| | | ||  || |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15139287 ttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattga 15139386  T
Q  181 acaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac-tacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttc 275  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15139387 acaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaacttttagcttctggtgatcttcagcttctgacgaggtgcttctaatgaacttgcttc 15139482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 8105643 - 8105898
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8105643 gagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagc 8105742  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac-aagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 224  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||  ||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||  || ||||||  ||    
T  8105743 cgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctaatgaacggca 8105840  T
Q  225 acttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||  |  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  8105841 acttctggtgatttttaacttctgataaacttgcttctgatgaactcacttctgatga 8105898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 23750512 - 23750758
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattca-aagaacaaacatccaatgccttcaa 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||  |||| || ||||| |||| |||||||| ||    
T  23750512 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaa 23750608  T
Q  110 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacattt-gaagctttaagtcttgcat 208  Q
     | | ||  ||  ||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23750609 cttcatttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgct-aggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 23750707  T
Q  209 ctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgctt 259  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  23750708 ctcctgatgaacttcagcttctggttatctttaacttctgatgagatgctt 23750758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 56533167 - 56533030
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  56533167 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagc 56533068  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac 163  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  56533067 cgttgcttcattttttcagtcttctgcaatccttagac 56533030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 11915706 - 11915835
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  11915706 gagtagtggaggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaatagtc 11915805  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 156  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11915806 gttgcttcactcttttagtcttctgcaatg 11915835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 280
Target Start/End: Original strand, 55731844 - 55732036
Alignment:
Q  85 aagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa 184  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||   ||||||||| ||||||  |||||| || || |||||||| |||||    
T  55731844 aagaataagcatccaat-ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatccattaaacaa 55731942  T
Q  185 catttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatg 280  Q
    | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||| | |  |  || ||||||||| |||||||||||||    
T  55731943 cttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttccggtgattctcagcttctaaaaacttgtttctgatgaccttgcttctgatg 55732036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25651209 - 25651046
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||   |||||  ||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||      
T  25651209 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatccttccaaaatagcc 25651110  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttg 190  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  25651109 gttgcttcacttttcaagtcttctgcgatctttagacaagtttgaatccgttaaacaacttttg 25651046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3105540 - 3105323
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||| | ||  ||    
T  3105540 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaa 3105441  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  3105440 tcctttcaaaatagccgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3105344  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctg 231  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  3105343 cctgatgaactgcagcttctg 3105323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17398795 - 17398582
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  17398795 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 17398704  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
     |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| | || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  17398703 -cctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 17398608  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    ||||||||||  || |||||||||||    
T  17398607 cctgatgaaccgcagcttctggtgat 17398582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 16853493 - 16853602
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||||||    
T  16853493 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgctttcaaa 16853592  T
Q  111 tcctttcaaa 120  Q
    ||| ||||||    
T  16853593 tcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Original strand, 16940034 - 16940172
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||  |  ||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||     
T  16940034 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatactt 16940133  T
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccatt 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  16940134 ttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccatt 16940172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 275
Target Start/End: Original strand, 22089733 - 22089841
Alignment:
Q  166 gattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatg 265  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  22089733 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctt-aattctttcatcttctgatgatctttagcttctggtgatcttcaacttctgatgaggtacttctgatg 22089831  T
Q  266 aacttgcttc 275  Q
     |||||||||    
T  22089832 cacttgcttc 22089841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 14571183 - 14571237
Alignment:
Q  180 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14571183 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 14571237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 38513868 - 38513960
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  38513868 agcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 38513960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41114863 - 41114707
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 138  Q
    |||||||||||||   |||||| |||| |||| ||||| || | |||  || || |||||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||||||| ||    
T  41114863 tagtggttgtacacgacgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagccgttgcttcattc 41114764  T
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 196  Q
    ||| |||||| |||||||   || |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41114763 ttctagtcttttgcaatg-acaggcttgattaaatcaattgaacaacctttgaagctt 41114707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 22190836 - 22190904
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  22190836 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 22190904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 245
Target Start/End: Original strand, 3793289 - 3793345
Alignment:
Q  187 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 245  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  3793289 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagctt 3793345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 3499771 - 3499705
Alignment:
Q  13 cagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||| || | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  3499771 cagagacaaactcagagtagtagaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgct 3499705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 17540401 - 17540530
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| || | ||| ||| |  |||||| || ||||| |||| |   || |||||    
T  17540401 gagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagtt 17540500  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  17540501 gttgcttcattctttcagtcttttgcaatg 17540530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 39419855 - 39419787
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  39419855 agcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 40860657 - 40860749
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||  || ||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  40860657 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5040 - 4791
Alignment:
Q  33 tggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 132  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5040 tggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgct 4941  T
Q  133 tcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgg 232  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  4940 tcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctgg 4841  T
Q  233 tgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4840 tgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 4791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19584 - 19318
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  19584 agagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcc 19485  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19484 tttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcct 19385  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384 catgaactacaacttctggtgatctt--gcttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 19318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 99320 - 99053
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||| |||| |   ||||| || |||||||||||||  ||    
T  99320 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcagcgctttg--aagaataagcatccaatgccttgtaa 99223  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||| ||| |||||||   |||||| || || ||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  |    
T  99222 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccggtcatctgcaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcactt 99126  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  99125 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttacttttgatgac 99053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 14644 - 14913
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14644 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 14743  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  14744 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 14843  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||| ||||  |  | ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  14844 cctaatgatttttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatgac 14913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 474 - 742
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    |||||||||  ||||||| ||||  || |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  474 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 573  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  574 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 673  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  674 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgac 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 17814960 - 17815229
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  17814960 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaa 17815059  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17815060 tcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 17815159  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | ||||||| |  | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17815160 cttgatgaaatttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctactgatgac 17815229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41566579 - 41566338
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41566579 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaa 41566480  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  41566479 tcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatct 41566380  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41566379 cctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 41566338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7745838 - 7745569
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  7745838 agcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 7745739  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7745738 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatct 7745639  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7745638 cctgatgtacttcagcttcttgtgatctt--gcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttcttatgac 7745569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21072385 - 21072131
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21072385 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 21072286  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21072285 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatct 21072187  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21072186 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 21072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6512573 - 6512348
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||    
T  6512573 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc---caatgccttcaaa 6512477  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6512476 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 6512377  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6512376 cctgatgaactacaacttctagtgatctt 6512348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 89567 - 89339
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  89567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaa 89468  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  89467 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatct 89368  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  89367 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 89339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23413119 - 23412891
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23413119 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaa 23413020  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23413019 tcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 23412920  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23412919 cctgatgaacttcagcttctggtgatctt 23412891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 21910548 - 21910776
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21910548 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21910647  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  21910648 tcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatct 21910747  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  21910748 cctgatgaactttagcttctggtgatctt 21910776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 33022656 - 33022895
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33022656 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 33022755  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  33022756 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 33022853  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33022854 cctgatgaactgcaaattctggtgattttcagcttctgatga 33022895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19536446 - 19536176
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19536446 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 19536347  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcact-cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19536346 tccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 19536247  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||| |  ||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19536246 tcctgatgaacttctgcttcttgcgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttacttctgatgac 19536176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 20550887 - 20551107
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20550887 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20550985  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20550986 tcttttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 20551085  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctg 231  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  20551086 tcctgatgaacttcagcttctg 20551107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 26784346 - 26784587
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| | | | ||||    
T  26784346 agcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaa 26784445  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  26784446 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatct 26784545  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26784546 cctgctgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatga 26784587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13545641 - 13545454
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13545641 gagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagtt 13545542  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 222  Q
    |||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13545541 gttgcttcact--------cttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 13545454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 30742988 - 30743242
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  30742988 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaataatc 30743087  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  30743088 gttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaac 30743185  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||| || ||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30743186 ttctcgtaattctcagcttatgataaatttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 30743242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 4887014 - 4887246
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  4887014 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4887113  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    || |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |    
T  4887114 tcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatat 4887211  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 245  Q
    | ||||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  4887212 cttgatgaactgcagcttctggtgattctcagctt 4887246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 23881059 - 23881328
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  23881059 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 23881158  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||    
T  23881159 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttt-agtctctcatc 23881256  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23881257 ttctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaccttgcttctgatga 23881328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 11993880 - 11994103
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  11993880 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 11993979  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  11993980 tcccttcaaattagccgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaag--ttgcatct 11994077  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  11994078 cctgatgaactacagcttctggtgat 11994103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 31117869 - 31118088
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  31117869 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 31117968  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||  | |||||||    
T  31117969 ttctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcatc 31118066  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctg 231  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  31118067 tcctgatgaactgcagcttctg 31118088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 42243688 - 42243943
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42243688 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaaatagt 42243787  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  42243788 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 42243885  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||  |||| || ||||  |  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42243886 cttctggtgattctcagtttttgataaatttgcttctgatgaccttgcatctgatgac 42243943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 642836 - 642582
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |   ||  || |||      
T  642836 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaactttatttgaattagcc 642737  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    |||| |||||||| |   ||||||| |||||| ||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||     
T  642736 gttgtttcactctcctgatcttctgtaatgct-aggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaactgcaat 642638  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  642637 ttctggtgatcttcagcatctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 642582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21099849 - 21099579
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||   ||| |||||||||||||||      
T  21099849 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagc 21099750  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || ||||||||||||||||||    ||||| || |||||| || || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||||    
T  21099749 ttcatttgaattagttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgct-aggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatct 21099651  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21099650 tctgatgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatgaggtgcttttgatgaacttgcttctgatgac 21099579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29138551 - 29138283
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| || ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  29138551 agcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 29138452  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||  || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  29138451 tccttccaaaatagttgttgctatact-ttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 29138356  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29138355 cctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 29138283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 15516977 - 15517184
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| || |||| || ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  15516977 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagcc 15517076  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  15517077 gttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaactacaac 15517174  T
Q  227 ttctggtgat 236  Q
    ||||||||||    
T  15517175 ttctggtgat 15517184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 26759157 - 26759411
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||| | ||| |||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  26759157 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtc 26759256  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||| | |  || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26759257 gttgttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaac 26759354  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26759355 ttctggtgattctcagcttctgataaatttgcttctgatgaatttgcttctgatgac 26759411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 6499231 - 6499471
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||     
T  6499231 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaac 6499330  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    | | ||  |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| | | |    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||    
T  6499331 ttcatttgaaatagatgttgcttcactctcctggtcttctgcaatac-tgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtct--catc 6499427  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgag 253  Q
    | |  ||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6499428 ttcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgag 6499471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 33933259 - 33933532
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaaacatccaatgccttcaa 109  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| | |||||||| ||   || ||||| |||||||||| || ||    
T  33933259 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaa 33933358  T
Q  110 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaac--atttgaagctttaagtcttgc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||    
T  33933359 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaacttttttgaagctttaag--ttgc 33933456  T
Q  207 atctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||  |||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||  |  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  33933457 atcctctgatgaactgcaacttatggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaactgtcttctgatga 33933532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21199148 - 21198925
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||    
T  21199148 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaa 21199049  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || |||  ||||| ||| | |||  |||||||||| | | ||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  21199048 ttcatttgaattagccgttgc-tcatttttctggtcttctgcagtac-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 21198951  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
     |||||||||| || || ||||||||    
T  21198950 tctgatgaacttcagctcctggtgat 21198925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14086684 - 14086445
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 109  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||    
T  14086684 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaa 14086585  T
Q  110 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcat 208  Q
    |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  ||||||    
T  14086584 atcacttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcat 14086487  T
Q  209 ctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat 250  Q
    |  |||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||    
T  14086486 cctctgatgaactgcagcttctggtaatttttagcttttgat 14086445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25096955 - 25096777
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgt---caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaata 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |   ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  25096955 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaatta 25096856  T
Q  124 gttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 203  Q
     | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25096855 atcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25096777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25154925 - 25154747
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgt---caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaata 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |   ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  25154925 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaatta 25154826  T
Q  124 gttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 203  Q
     | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25154825 atcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 32160774 - 32161029
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  32160774 gagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagct 32160873  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    |||||| |  |  | |||||||  ||  |  |||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||     
T  32160874 gttgctactatacttcagtctttcgctttctttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttagg--ttgcatcttctgatgaactacag 32160971  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     |||||||||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160972 tttctggtgatatacagcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 32161029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9398879 - 9398649
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  || ||| ||||||||||||     
T  9398879 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaac 9398780  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || |||| |||||| |||||| |        ||  || ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  9398779 ttcatttgaattagtcgttgctccactctcc--------tg--at-cttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatct 9398691  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9398690 tctgatgaacttcaacttctggtgatcttgagcttctgatga 9398649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12352940 - 12352768
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||| ||     
T  12352940 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctttaac 12352841  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 183  Q
    | | ||  || |||   ||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12352840 ttcatttgaattagccattgcttcaccctcctgatcttctgcaatgcttagacaagatcaaatccaatgaaca 12352768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Original strand, 26765506 - 26765634
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||   ||||| | ||| |||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26765506 gagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtt 26765605  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaat 155  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  26765606 gttgctatacttttccagtcttctgcaat 26765634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3245583 - 3245364
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||||||  ||| |    
T  3245583 agagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattc 3245484  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  ||||   || |||||||||||  |||||||||||    
T  3245483 tttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaag--ttgcatctcct 3245387  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  3245386 gatgaactgcagcttctggtgat 3245364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12352758 - 12352692
Alignment:
Q  216 tgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12352758 tgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttttgatgac 12352692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30115982 - 30115863
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| |||||| |  ||    
T  30115982 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaa 30115883  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttg 130  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  30115882 tcctttcaaaatagtcgttg 30115863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Original strand, 28139599 - 28139738
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| |   ||||| || ||||||||| |||  ||    
T  28139599 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttcaa 28139698  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttct 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||    
T  28139699 tcctttcaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttct 28139738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25930182 - 25930087
Alignment:
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  25930182 ttccagtcttatgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaattgcagcttctggtgat 25930087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 5429985 - 5430099
Alignment:
Q  121 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatcc-attgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 219  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| || || || ||||| ||  |||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  5429985 atagctgttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatctcctgatgaa 5430082  T
Q  220 ctacaacttctggtgat 236  Q
    || || |||||||||||    
T  5430083 ctgcagcttctggtgat 5430099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 9088961 - 9089174
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  |||||  | ||||||||||||||       
T  9088961 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc--- 9089057  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
          ||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| | ||||| || || | ||| || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  9089058 ------caaaatagtcgttgtaatacttttccagtcttcttcaat-catagacgagtttgattcctttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 9089148  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  9089149 cctgatgaactgcagcttctggtgat 9089174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 236
Target Start/End: Original strand, 10848857 - 10848979
Alignment:
Q  112 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 211  Q
    ||||||||||||| || |||   ||| ||||||| |||||||||  |||| | || || ||||| |  |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  10848857 cctttcaaaatagctgatgccatacttttccagttttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctc 10848954  T
Q  212 ctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  10848955 atgatgaactgcagcttctggtgat 10848979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30115852 - 30115798
Alignment:
Q  180 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30115852 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 30115798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11208114 - 11208011
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||  |||    | |||||||||| ||||||||  |||||||||||     
T  11208114 gagtagtggaggtagtggttatacacttcgtaca-tagtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatccaatgcattcaaatctcttcaaaatagtc 11208016  T
Q  127 gttgc 131  Q
    |||||    
T  11208015 gttgc 11208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 35932151 - 35932059
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  35932151 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35986192 - 35986116
Alignment:
Q  207 atctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35986192 atctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgaattagcttctgatgac 35986116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28464481 - 28464271
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||           
T  28464481 agagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt------- 28464389  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
      |||||||||  |||| |  ||| ||  ||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  || |||||||    
T  28464388 --tcaaaatagccgttgttatacttttttagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgtatctcct 28464294  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  28464293 gatgaactgcagcttctggtgat 28464271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 21660204 - 21660253
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtaca 60  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21660204 agcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtaca 21660253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25930301 - 25930205
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 107  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||||||    
T  25930301 agcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgccttc 25930205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 1686 - 1955
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1686 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 1785  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1786 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 1885  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||| ||||  |  | ||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  1886 cctaatgatttttagcttctagtgatctt--gcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatgac 1955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26087 - 25819
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26087 agagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 25988  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25987 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcct 25888  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  25887 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgtttttcatgaacgtgcttctgatgac 25819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44652
Alignment:
Q  48 tacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtct 147  Q
    |||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtct 44683  T
Q  148 tctgcaatgcttagacaagattaaatccatt 178  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44682 tctacaatacttagacgagattaaatccatt 44652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5805 - 5536
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5805 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcata 5706  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5705 tcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5606  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5605 cctgatgaacttcagcttcaggtgatctt--gcttctagtgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 5536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22944
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| || ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  22672 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 22771  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22772 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 22871  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22872 cctgatgaactacagcctctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctggtggacttgattctgatgac 22944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21086 - 20815
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  21086 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 20987  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20986 tcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20887  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20886 cttgatgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgac 20815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 60012 - 60281
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  60012 agcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 60111  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  60112 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 60211  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     ||||||||||  | ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  60212 tctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttcttatgagatgcttctaatgaacttgcatctgatgac 60281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 7922 - 8150
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  7922 agcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaa 8021  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8022 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 8121  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||    
T  8122 cctgatgaactttagcttctggttatctt 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 282
Target Start/End: Original strand, 115708 - 115786
Alignment:
Q  202 cttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  115708 cttgcatctcctgatgaacatcagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttttgatgac 115786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 151788 - 151734
Alignment:
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  151788 cttctggtgatctt--gcttctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 151734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 151831 - 151794
Alignment:
Q  166 gattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 203  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  151831 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36890 - 36619
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36890 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 36791  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  36790 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 36691  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36690 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgac 36619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 42115 - 42386
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42115 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 42214  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  42215 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 42314  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42315 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgac 42386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 212366 - 212620
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa-tagt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  212366 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatagt 212465  T
Q  126 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |     
T  212466 tgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagtttag 212565  T
Q  226 cttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212566 cttctgatgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 212620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6047
Alignment:
Q  74 aacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat 173  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  174 ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgct 273  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |     ||||||||| |||||| ||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttct-----gatgcttcttatgaacctgct 6056  T
Q  274 tctgatgac 282  Q
    |||||||||    
T  6055 tctgatgac 6047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 246193 - 246139
Alignment:
Q  180 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  246193 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 246139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 252
Target Start/End: Original strand, 7712 - 7940
Alignment:
Q  24 actgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaata 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  7712 actgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaaaata 7811  T
Q  124 gttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactac 223  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7812 gtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatag 7911  T
Q  224 aacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7912 agcttctggtgatcttcagcttctgatga 7940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10220 - 9981
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10220 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcc 10121  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcc 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10120 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcc 10021  T
Q  213 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  10020 tgatgaacttcagcttctggtgattttcagtttctgatga 9981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14819
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14884 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 14819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 15116 - 15341
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15116 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 15215  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15216 tttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 15315  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
     ||| ||| || ||||||||||||||    
T  15316 tatgcacttcatcttctggtgatctt 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1884
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  1656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 1755  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1756 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 1855  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1856 cctgatgaacttcagcttctggtgatctt 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27544 - 27316
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27544 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaa 27445  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27444 tcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 27345  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||    
T  27344 cctgatgaacttcagcatctggtgatctt 27316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 90170 - 89931
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  90170 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 90071  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  90070 tcctttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatct 89973  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  89972 cctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 89931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10193
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  9965 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 10064  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  10065 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatct 10164  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 239  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10165 cctgatgaacttcaacttcttgtgatctt 10193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 282
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30486
Alignment:
Q  74 aacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat 173  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  174 ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgct 273  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |     ||||||||| |||||| ||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttct-----gatgcttcttatgaacctgct 30477  T
Q  274 tctgatgac 282  Q
    |||||||||    
T  30478 tctgatgac 30486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 9899 - 10151
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9899 agcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9998  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    | | ||  || |||| |||| | ||||||||   ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |  |||||    
T  9999 ttcatttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgc-tagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatct 10097  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
     |||||||||| || ||||||||||| ||  |||| | ||||| ||||||||||||    
T  10098 tctgatgaacttcagcttctggtgatatt--gcttctaatgaggtgcttctgatga 10151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 19027 - 19266
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| |||    
T  19027 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaa 19126  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||     
T  19127 tccttccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatca 19226  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat 250  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19227 cctgatgaaatagagcttctggtgatcttcaacttctgat 19266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 9559 - 9778
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||   |||| || ||||||||||| |  |||||    
T  9559 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcc 9658  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  9659 tttcaaaatagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcct 9755  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  9756 gatgaactgcagcttctggtgat 9778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 21976
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||   ||| | ||||||||||  |  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  22246 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaa 22147  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    |||||  || ||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  22146 tccttcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaag--ttgcatct 22049  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     || ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22048 tctaatgaactacaacttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 21976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Original strand, 13567 - 13739
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 13666  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13667 tcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 13739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Original strand, 103585 - 103821
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||  |    
T  103585 agtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaaatagccg 103684  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  103685 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 103784  T
Q  228 tctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    |||||||  |||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  103785 tctggtgtcctt--gcttctgatgagatacttctgatga 103821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 632
Alignment:
Q  81 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  831 ttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattga 732  T
Q  181 acaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatg 280  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  731 acagtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatg 634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10060
Alignment:
Q  45 ttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 144  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||   |    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  145 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 244  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatctt--gct 10022  T
Q  245 tgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10023 tatgatgagatgcttctgattaacttgcttctgatgac 10060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 215596 - 215342
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  215596 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagcc 215497  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| || |    
T  215496 gttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatctcctgataaactgcagc 215399  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  215398 ttctggtgattttcggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 215342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6839 - 6586
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  6839 gagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtc 6740  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  6739 ggtgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagc 6642  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||  |  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6641 ttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttttgatga 6586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 15789 - 16001
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacactt-gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15789 agcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa 15888  T
Q  110 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcat 208  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15889 gtcctttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcat 15988  T
Q  209 ctcctgatgaact 221  Q
    |||||||||||||    
T  15989 ctcctgatgaact 16001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 281
Target Start/End: Original strand, 16004 - 16044
Alignment:
Q  241 agcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16004 agcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatga 16044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 252
Target Start/End: Original strand, 39494 - 39662
Alignment:
Q  84 aaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 183  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39494 aaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaaca 39593  T
Q  184 acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39594 gcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 252
Target Start/End: Original strand, 137554 - 137722
Alignment:
Q  84 aaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 183  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  137554 aaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaaca 137653  T
Q  184 acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  137654 gcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 137722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 159051 - 159242
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||| || ||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  159051 agcagagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaa 159150  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 203  Q
    | | ||  || |||  |||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  159151 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtct 159242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Original strand, 37414 - 37463
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaac 76  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  37414 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Original strand, 135474 - 135523
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaac 76  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  135474 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 282
Target Start/End: Original strand, 159296 - 159336
Alignment:
Q  242 gcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  159296 gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 159336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 252
Target Start/End: Original strand, 143129 - 143325
Alignment:
Q  56 gtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 155  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  143129 gtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 143228  T
Q  156 gcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  143229 gctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatctcgtgatgaaatagagcttctagtgatcttcagcttctgatga 143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 131 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4837
Alignment:
Q  131 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttct 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  4988 cttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaattaaaactttt 4889  T
Q  231 ggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4888 ggtgatctccagcttctaataagatgcttttgatgaacttgcttttgatgac 4837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 767 - 552
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  767 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 668  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||  |||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  667 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcct 570  T
Q  214 gatgaactacaacttctg 231  Q
    |||||||| || ||||||    
T  569 gatgaactgcaccttctg 552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1776 - 1658
Alignment:
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    |||||||||||  |||||   ||| |||||||||||||||||| |||| | || || ||||| |  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  1776 tttcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcct 1680  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtga 235  Q
    ||||||||  | ||||||||||    
T  1679 gatgaactgtagcttctggtga 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6227
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6003 agcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6102  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||  || |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||  |||||    
T  6103 tccttttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatct 6201  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
     |||||||||| |||||||| |||||    
T  6202 tctgatgaacttcaacttctagtgat 6227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 9952 - 10186
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9952 agcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaa 10051  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 209  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||    
T  10052 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatc 10150  T
Q  210 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 245  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  10151 ttctgatgaacttcagcttctggtgaactttagctt 10186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 78481 - 78258
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  78481 agcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaa 78382  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||  | || | | ||||||||||||||   |||||||    
T  78381 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag--ctgcatct 78284  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  78283 catgatgaactacagcttctggtgat 78258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 3300 - 3570
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||| || |||||   ||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3300 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 3399  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  3400 tccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3497  T
Q  211 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3498 cctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 3570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 60802 - 61022
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  60802 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatcc 60901  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
    || ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  60902 ttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcct 60999  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  61000 gatgaactacaacttctggtgat 61022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5717 - 5446
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| ||  ||||| || |||| ||||||||||||    
T  5717 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaa 5618  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| |||||| ||||||   ||||||||    
T  5617 tcctttcaaaatagttgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaa--attgcatct 5520  T
Q  211 cctgatgaa---ctacaacttctggtgatcttcagcttgtgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatg 280  Q
     ||||||||   |  || |||||||||||  ||||||| ||||  |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  5519 tctgatgaacagcagcagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaccttgcttctgatg 5446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1606
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||| |||| | |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  1814 agcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaa 1715  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| || || || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||||    
T  1714 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttgcatct 1617  T
Q  211 cctgatgaact 221  Q
    |||||||||||    
T  1616 cctgatgaact 1606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 250
Target Start/End: Original strand, 9168 - 9387
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  9168 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaaatagtcg 9267  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    |||||  ||| ||||| ||||||||||| ||| ||  || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9268 ttgctatacttttccaatcttctgcaat-ctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaact 9364  T
Q  228 tctggtgatcttcagcttgtgat 250  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  9365 tctggtgattctcagcttctgat 9387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36281 - 36031
Alignment:
Q  29 gtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||| || | ||| ||| || ||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||    
T  36281 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgt 36182  T
Q  129 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaactt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| || | |  ||  | ||||||| || || |||    
T  36181 tgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattttctcagattctgatgatcttcagctt 36083  T
Q  229 ctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
     ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36082 atggtgatgtt--gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 36031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25777 - 25519
Alignment:
Q  14 agagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 113  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||| ||           
T  25777 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatgcatt------- 25685  T
Q  114 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 213  Q
      ||||||||  ||||||   ||| |||||||||| ||||||   ||| | || || ||||| |  |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  25684 --tcaaaatatctgttgccatacttttccagtcttttgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaaactttaagt--tgcatctcct 25589  T
Q  214 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatga-gatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||| || |||||||||||    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25588 gatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaagttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 34919 - 34827
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 103  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  34919 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 281
Target Start/End: Original strand, 5636 - 5895
Alignment:
Q  24 actgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaata 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||  ||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  5636 actgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttc-caacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaata 5734  T
Q  124 gttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactac 223  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||| |||| | || || ||||||| |  ||||||| | |||||||||| || |||| || || ||||||| || |    
T  5735 gtcgttgcttcattcttctagtcttctggaatgat-aggcatgattaaaacatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttc 5833  T
Q  224 aacttctggtgatcttcag--cttgtgatgagat--gcttctgatgaacttgcttctgatga 281  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5834 aactcctgatgatcttcagagcttctgatgatgtcagcttctggtgaacttgcttctgatga 5895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7255 - 7001
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||  |||||||| | ||  ||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  7255 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaaatagtc 7156  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 226  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||  | ||||  | || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  7155 gttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagc 7058  T
Q  227 ttctggtgatcttcagcttgtgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||   |||||| ||||| |  |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  7057 ttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgataacattgcttctgatgac 7001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5935 - 5813
Alignment:
Q  131 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacattt-gaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttc 229  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  5935 cttcactcttatggtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttc 5836  T
Q  230 tggtgatcttcagcttgtgatga 252  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  5835 tggtgatctttagcttctgatga 5813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9338 - 9252
Alignment:
Q  194 ctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9338 ctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaactttcttctgatgac 9252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1619 - 1407
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  1619 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcg 1520  T
Q  128 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 227  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||  | | |  |||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||  || || ||||||| || || ||    
T  1519 ttgcttcactcctatagtcttctgcaatg-atgggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttcaattctctcagcttctgatgatcttcagct 1421  T
Q  228 tctggtgatcttca 241  Q
     ||| |||||||||    
T  1420 cctgatgatcttca 1407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44018 - 43828
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||  || |||      
T  44018 gagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaatctttttgaattagcc 43919  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 218  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||| |||| |  |||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  43918 tttgcttcactcttctgatcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatcttctgatga 43828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43823 - 43749
Alignment:
Q  206 catctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 282  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||  |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43823 catctcctgatgaaaaactgcttctggtgatgtt--gcttctgattaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 43749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 165045 - 164940
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  165045 gagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtt 164946  T
Q  127 gttgct 132  Q
    ||||||    
T  164945 gttgct 164940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 65485 - 65321
Alignment:
Q  69 ttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagat 168  Q
    ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  65485 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 65387  T
Q  169 taaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  65386 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 65321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 144530 - 144366
Alignment:
Q  69 ttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagat 168  Q
    ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  144530 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 144432  T
Q  169 taaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  144431 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 144366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 158
Target Start/End: Original strand, 40649 - 40780
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 126  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||  || |||      
T  40649 gagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattcttttgaattagcc 40748  T
Q  127 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgct 158  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40749 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct 40780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13462 - 13385
Alignment:
Q  196 ttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatgaacttgctt 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13462 ttaagtcttgcatctc-tgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacatgctt 13385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8150
Alignment:
Q  46 tgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagt 145  Q
    |||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  146 cttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    |||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  || ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  8063 cttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgat 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 60799 - 60729
Alignment:
Q  196 ttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatga 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  60799 ttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatga 60729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Original strand, 74577 - 74682
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||| ||| ||  |||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  74577 agcagagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaa 74676  T
Q  111 tccttt 116  Q
    ||||||    
T  74677 tccttt 74682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 281
Target Start/End: Original strand, 74718 - 74831
Alignment:
Q  166 gattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagatgcttctgatg 265  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  || || |||||||  | || ||||||||||| ||  | || ||||||| ||||| |||||    
T  74718 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatgttcagcttctggtgatgtt--gtttctgatgaggtgcttatgatg 74815  T
Q  266 aacttgcttctgatga 281  Q
    ||||||||| ||||||    
T  74816 aacttgcttatgatga 74831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 38184 - 38086
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 125  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38184 gagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagt 38086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 2082 - 2029
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaa 92  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2082 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa 2029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1803
Alignment:
Q  28 agtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 120  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1895 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23549 - 23455
Alignment:
Q  139 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23549 ttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25514 - 25393
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| || ||  ||||| ||  |||||||||| |  ||    
T  25514 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaa 25415  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgct 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  25414 tcctttcaaaatagtcgttgct 25393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Original strand, 1329 - 1410
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 108  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||    
T  1329 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 82 - 1
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 108  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||    
T  82 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2702
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| || ||  ||||| |  |||||||||| ||| ||    
T  2845 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa 2746  T
Q  111 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 155  Q
     |||| ||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||    
T  2745 -ccttccaaaatagtcgttgcaatacttttccagtcttctgcaat 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15721 - 15628
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 120  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||| ||| ||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15721 gagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 15628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 7393 - 7445
Alignment:
Q  27 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  7393 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgct 7445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 87715 - 87647
Alignment:
Q  11 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  87715 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgct 87647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 264
Target Start/End: Original strand, 17091 - 17197
Alignment:
Q  158 ttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttgtgatgagat- 255  Q
    |||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| ||     
T  17091 ttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttaggt--tgcattttctgatgaactacaatttctggtgatatacagcttctgatgaaata 17188  T
Q  256 gcttctgat 264  Q
    |||||||||    
T  17189 gcttctgat 17197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 3990 - 3942
Alignment:
Q  31 agtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgct 79  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  3990 agtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgct 3942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University