View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12661_high_5 (Length: 562)

Name: NF12661_high_5
Description: NF12661
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12661_high_5
NF12661_high_5
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (20-350)||(23701684-23702022)
chr4 (383-553)||(1756752-1756926)
chr4 (357-553)||(38055157-38055362)
chr4 (383-551)||(23776449-23776621)
chr4 (385-553)||(44379175-44379347)
chr4 (382-553)||(27488636-27488811)
chr4 (383-553)||(11639566-11639740)
chr4 (383-553)||(19913618-19913792)
chr4 (383-553)||(31969712-31969886)
chr4 (383-553)||(54189576-54189750)
chr4 (383-552)||(37968746-37968919)
chr4 (393-553)||(27536092-27536256)
chr4 (383-553)||(15241016-15241190)
chr4 (383-553)||(28032700-28032874)
chr4 (383-553)||(35490761-35490935)
chr4 (383-553)||(40428708-40428882)
chr4 (383-553)||(44784905-44785079)
chr4 (383-552)||(20877078-20877251)
chr4 (357-553)||(45424522-45424727)
chr4 (388-553)||(53717452-53717621)
chr4 (386-550)||(23704200-23704368)
chr4 (383-553)||(6688615-6688783)
chr4 (383-553)||(8591080-8591254)
chr4 (383-553)||(16700812-16700986)
chr4 (383-544)||(50055098-50055263)
chr4 (383-550)||(30423556-30423726)
chr4 (386-553)||(50353835-50354006)
chr4 (383-553)||(2481396-2481570)
chr4 (387-553)||(6611348-6611518)
chr4 (383-553)||(37464752-37464926)
chr4 (386-550)||(43289951-43290119)
chr4 (386-553)||(40680026-40680197)
chr4 (383-550)||(52139234-52139405)
chr4 (384-554)||(8932165-8932339)
chr4 (383-553)||(14987823-14987997)
chr4 (383-553)||(54412659-54412833)
chr4 (425-553)||(23269034-23269162)
chr4 (354-553)||(1617081-1617289)
chr4 (383-551)||(48909877-48910049)
chr4 (383-552)||(53353090-53353267)
chr4 (383-553)||(19164961-19165134)
chr4 (383-553)||(53875688-53875862)
chr4 (400-553)||(33703889-33704046)
chr4 (425-553)||(47632112-47632240)
chr4 (387-550)||(16703856-16704023)
chr4 (386-553)||(30171614-30171785)
chr4 (385-553)||(27583620-27583792)
chr4 (425-544)||(44375922-44376041)
chr4 (386-553)||(15669217-15669388)
chr4 (363-519)||(28360436-28360602)
chr4 (383-553)||(38071314-38071482)
chr4 (383-553)||(55344813-55344987)
chr4 (466-553)||(53408137-53408225)
chr4 (387-497)||(50053478-50053592)
chr4 (490-553)||(23261874-23261937)
chr4 (427-496)||(51780763-51780832)
chr4 (500-553)||(9595890-9595943)
chr4 (505-553)||(50055302-50055350)
chr4 (487-553)||(48748197-48748263)
chr4 (439-492)||(55344724-55344777)
chr4 (383-432)||(23265870-23265919)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (383-553)||(20726824-20726994)
chr6 (383-553)||(6086599-6086773)
chr6 (383-553)||(26946876-26947050)
chr6 (383-553)||(3347523-3347697)
chr6 (383-553)||(21893488-21893662)
chr6 (383-553)||(26704339-26704513)
chr6 (357-553)||(18613540-18613745)
chr6 (385-553)||(1153628-1153800)
chr6 (386-553)||(9459599-9459770)
chr6 (383-553)||(2837578-2837752)
chr6 (383-553)||(30691884-30692058)
chr6 (429-553)||(33464412-33464536)
chr6 (397-553)||(28199508-28199667)
chr6 (383-553)||(17261073-17261247)
chr6 (383-552)||(35198317-35198489)
chr6 (358-553)||(34887292-34887496)
chr6 (386-553)||(11167276-11167447)
chr6 (357-546)||(16307015-16307213)
chr6 (383-553)||(3955769-3955940)
chr6 (439-553)||(53001-53115)
chr6 (386-548)||(30698934-30699100)
chr6 (383-502)||(52869-52992)
chr6 (386-428)||(33463737-33463779)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (386-553)||(8042638-8042809)
chr3 (383-552)||(46452149-46452322)
chr3 (383-553)||(25999416-25999590)
chr3 (383-553)||(38856121-38856295)
chr3 (383-553)||(35226475-35226649)
chr3 (388-548)||(32244153-32244317)
chr3 (383-553)||(12117644-12117818)
chr3 (383-553)||(15520128-15520302)
chr3 (383-553)||(37698129-37698303)
chr3 (388-553)||(32359292-32359461)
chr3 (383-552)||(42307892-42308065)
chr3 (383-553)||(42104957-42105131)
chr3 (383-553)||(54870160-54870334)
chr3 (357-553)||(25494271-25494476)
chr3 (363-553)||(21581045-21581244)
chr3 (383-553)||(22174976-22175150)
chr3 (387-553)||(44609319-44609489)
chr3 (383-553)||(50528957-50529131)
chr3 (386-553)||(20842334-20842505)
chr3 (383-552)||(15520664-15520837)
chr3 (383-552)||(20699177-20699350)
chr3 (388-553)||(29445521-29445690)
chr3 (385-553)||(38933975-38934147)
chr3 (383-553)||(54534314-54534486)
chr3 (387-552)||(24835686-24835855)
chr3 (383-552)||(44688789-44688961)
chr3 (425-553)||(53028291-53028419)
chr3 (383-553)||(48924989-48925161)
chr3 (383-553)||(2895213-2895391)
chr3 (407-553)||(16354398-16354548)
chr3 (383-553)||(34700369-34700543)
chr3 (383-552)||(26122842-26123015)
chr3 (387-503)||(35643249-35643369)
chr3 (465-552)||(24366143-24366230)
chr3 (425-550)||(12915980-12916105)
chr3 (472-553)||(13696914-13696995)
chr3 (387-485)||(50529827-50529929)
chr3 (504-553)||(50528868-50528917)
chr3 (383-479)||(49128077-49128177)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (387-553)||(33991178-33991348)
chr5 (386-550)||(1165604-1165772)
chr5 (383-550)||(1579070-1579241)
chr5 (383-550)||(1605574-1605745)
chr5 (383-549)||(27420892-27421062)
chr5 (383-553)||(8374339-8374512)
chr5 (383-553)||(9008057-9008231)
chr5 (383-553)||(16737447-16737621)
chr5 (357-553)||(16069356-16069561)
chr5 (383-553)||(3921615-3921789)
chr5 (383-553)||(4120971-4121145)
chr5 (383-553)||(24105671-24105845)
chr5 (383-553)||(27679169-27679343)
chr5 (358-553)||(31883148-31883352)
chr5 (387-553)||(3386486-3386656)
chr5 (383-553)||(33491196-33491370)
chr5 (388-552)||(5203011-5203179)
chr5 (386-553)||(19358563-19358734)
chr5 (386-553)||(38598450-38598621)
chr5 (387-553)||(20992146-20992316)
chr5 (383-553)||(35782644-35782818)
chr5 (425-553)||(27025036-27025164)
chr5 (357-553)||(26602942-26603137)
chr5 (383-550)||(31410510-31410681)
chr5 (383-480)||(20992354-20992455)
chr5 (363-486)||(33284642-33284774)
chr5 (495-553)||(35420424-35420482)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (383-553)||(39260346-39260520)
chr1 (383-552)||(16052127-16052300)
chr1 (357-553)||(29288149-29288352)
chr1 (357-553)||(25897374-25897579)
chr1 (385-553)||(38829102-38829274)
chr1 (386-553)||(33510518-33510689)
chr1 (383-553)||(20089502-20089676)
chr1 (387-553)||(41928495-41928665)
chr1 (383-553)||(52753147-52753321)
chr1 (383-552)||(29078547-29078720)
chr1 (357-552)||(46760966-46761170)
chr1 (383-553)||(1940747-1940921)
chr1 (384-553)||(2347688-2347862)
chr1 (383-553)||(5215416-5215590)
chr1 (383-553)||(23498491-23498665)
chr1 (383-553)||(26663289-26663463)
chr1 (383-550)||(1170447-1170618)
chr1 (383-553)||(1168534-1168708)
chr1 (383-553)||(26580270-26580444)
chr1 (363-553)||(40149479-40149668)
chr1 (388-553)||(7145244-7145412)
chr1 (357-553)||(42370795-42371000)
chr1 (384-553)||(51359217-51359389)
chr1 (357-553)||(970524-970731)
chr1 (385-553)||(17591721-17591893)
chr1 (383-553)||(12682851-12683025)
chr1 (383-553)||(52696822-52696996)
chr1 (386-553)||(19715161-19715332)
chr1 (387-553)||(8120904-8121074)
chr1 (383-553)||(13996723-13996897)
chr1 (383-553)||(43905685-43905859)
chr1 (388-553)||(32671615-32671784)
chr1 (386-553)||(40092525-40092696)
chr1 (383-553)||(15203143-15203317)
chr1 (383-552)||(8079710-8079883)
chr1 (425-553)||(49146249-49146377)
chr1 (383-550)||(2473753-2473924)
chr1 (388-548)||(6765495-6765659)
chr1 (386-553)||(17587505-17587676)
chr1 (358-553)||(46409436-46409642)
chr1 (383-553)||(15554152-15554318)
chr1 (389-550)||(15717822-15717986)
chr1 (425-514)||(29695753-29695842)
chr1 (480-552)||(38171951-38172023)
chr1 (427-496)||(23322897-23322966)
chr1 (383-477)||(52086298-52086396)
chr1 (387-465)||(38171867-38171949)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (358-553)||(144397-144601)
chr8 (383-553)||(14422736-14422910)
chr8 (357-553)||(6144273-6144478)
chr8 (383-553)||(10836755-10836929)
chr8 (383-553)||(18594570-18594744)
chr8 (383-553)||(29938094-29938268)
chr8 (387-553)||(33278437-33278607)
chr8 (383-553)||(39206619-39206793)
chr8 (357-553)||(24113166-24113371)
chr8 (354-553)||(13110403-13110611)
chr8 (383-553)||(35118031-35118205)
chr8 (383-552)||(4035880-4036053)
chr8 (383-551)||(2042526-2042698)
chr8 (388-552)||(44804945-44805113)
chr8 (386-553)||(22260630-22260801)
chr8 (383-553)||(34679457-34679631)
chr8 (383-553)||(34842365-34842539)
chr8 (383-549)||(38167159-38167329)
chr8 (388-553)||(7774802-7774971)
chr8 (388-553)||(7812033-7812202)
chr8 (383-552)||(39218810-39218983)
chr8 (387-552)||(41575550-41575719)
chr8 (388-553)||(7791449-7791618)
chr8 (388-553)||(34998896-34999065)
chr8 (425-553)||(36491236-36491364)
chr8 (425-550)||(28639361-28639484)
chr8 (388-553)||(5320602-5320771)
chr8 (383-553)||(42571627-42571798)
chr8 (425-550)||(9807339-9807464)
chr8 (357-509)||(33287069-33287230)
chr8 (383-553)||(8021752-8021918)
chr8 (383-502)||(40117903-40118026)
chr8 (425-552)||(66180-66308)
chr8 (383-485)||(26783801-26783907)
chr8 (388-497)||(2322068-2322181)
chr8 (383-429)||(5005199-5005245)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (382-553)||(24792322-24792497)
chr7 (383-553)||(42673497-42673667)
chr7 (383-551)||(3511355-3511527)
chr7 (387-553)||(933321-933491)
chr7 (383-553)||(22649684-22649858)
chr7 (383-553)||(42964986-42965160)
chr7 (357-553)||(43067963-43068168)
chr7 (383-553)||(7164216-7164390)
chr7 (383-553)||(33359080-33359254)
chr7 (385-552)||(36890821-36890992)
chr7 (383-553)||(12101168-12101342)
chr7 (383-553)||(20346520-20346694)
chr7 (383-553)||(30181014-30181188)
chr7 (383-553)||(32041574-32041748)
chr7 (388-553)||(25748524-25748693)
chr7 (355-551)||(48865639-48865837)
chr7 (386-553)||(5280895-5281066)
chr7 (386-553)||(12097580-12097751)
chr7 (383-553)||(42204186-42204361)
chr7 (357-553)||(16894497-16894692)
chr7 (363-553)||(1803033-1803232)
chr7 (383-553)||(6394783-6394957)
chr7 (399-553)||(9452638-9452796)
chr7 (390-553)||(8630705-8630872)
chr7 (383-553)||(4347305-4347478)
chr7 (383-553)||(4477311-4477485)
chr7 (383-553)||(15655944-15656118)
chr7 (383-553)||(38866576-38866750)
chr7 (425-553)||(46134294-46134422)
chr7 (383-551)||(43156745-43156917)
chr7 (386-553)||(17753635-17753806)
chr7 (383-553)||(33846519-33846688)
chr7 (407-553)||(46891329-46891479)
chr7 (385-492)||(19828304-19828415)
chr7 (387-553)||(43021570-43021736)
chr7 (388-497)||(37005857-37005970)
chr7 (383-432)||(37705012-37705061)
chr7 (385-497)||(43405054-43405170)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (383-553)||(36736-36910)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (357-553)||(10238-10443)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (363-553)||(33906047-33906246)
chr2 (383-553)||(3873244-3873418)
chr2 (383-553)||(31517215-31517389)
chr2 (383-533)||(1108310-1108464)
chr2 (387-553)||(26323186-26323356)
chr2 (388-553)||(42937755-42937925)
chr2 (386-550)||(19383938-19384106)
chr2 (386-553)||(18806884-18807055)
chr2 (383-553)||(4232142-4232316)
chr2 (383-553)||(5733430-5733604)
chr2 (357-553)||(28329839-28330042)
chr2 (388-553)||(4016075-4016244)
chr2 (388-553)||(30270679-30270848)
chr2 (387-552)||(39635487-39635656)
chr2 (386-553)||(6174828-6174999)
chr2 (383-548)||(19901143-19901311)
chr2 (407-553)||(2178769-2178919)
chr2 (383-553)||(16588776-16588950)
chr2 (385-553)||(851030-851202)
chr2 (383-553)||(1482903-1483076)
chr2 (383-545)||(16066302-16066468)
chr2 (388-549)||(429852-430017)
chr2 (383-551)||(30420181-30420341)
chr2 (388-553)||(44947549-44947711)
chr2 (427-497)||(3585369-3585439)
chr2 (387-497)||(42446625-42446739)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (383-553)||(6-180)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (383-553)||(3741-3915)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (383-548)||(22956-23125)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (387-552)||(145246-145415)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (397-553)||(6-165)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (388-553)||(295-464)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 350
Target Start/End: Original strand, 23701684 - 23702022
Alignment:
Q  20 agcttaacaagagattttttatatc----aatcaaagtttattaatgaaacctctataactatcatgaaacaaaatcgatttctattattaaacatgtca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23701684 agcttaacaagagattttttatatccatcaatcaaagtttaataatgaaacctctaaaactatcatgaaacaaaatcgatttctattattaaacatgtca 23701783  T
Q  116 cctta----gagatggaaaaatatcgattgctaatctaaatttgcattaatcaaccggttgaattagaagagaactaaggatgcagtaactaaccttgtc 211  Q
    |||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23701784 ccttaattagagatggaaaaatatcgattactaatctaaatttgtattaatcaaccggttgaattagaagagaactaaggatgcagtgactaaccttgtc 23701883  T
Q  212 attgaatgatcgatgagaatgtgttcgttggttgtttatacttttaggttgggaaaagataagaatttggagcggtggttatgcttggcagttctgagtg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23701884 attgaatgatcgatgagaatgtgttcgttggttgtttatacttttaggttgggaaaagataggaatttggagcagtggttatgcttggcagttctgagtg 23701983  T
Q  312 agctcttttaggtctccggttagtgctaacaaattctgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23701984 agctcttttaggtctccggttagtgctaacaaattctgt 23702022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1756926 - 1756752
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1756926 tgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 1756827  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1756826 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctctg 1756752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Original strand, 38055157 - 38055362
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  38055157 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 38055256  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  38055257 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattc 38055356  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  38055357 tctctg 38055362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 383 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23776621 - 23776449
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23776621 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 23776522  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctc 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  23776521 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 23776449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44379347 - 44379175
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44379347 ggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaataag 44379248  T
Q  481 cctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  44379247 cctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctctg 44379175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 382 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27488811 - 27488636
Alignment:
Q  382 ctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 477  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27488811 ctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaat 27488712  T
Q  478 aagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27488711 aagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 27488636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11639740 - 11639566
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11639740 tgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 11639641  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  11639640 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattctctctg 11639566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 19913792 - 19913618
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  19913792 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 19913693  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19913692 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 19913618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 31969712 - 31969886
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  31969712 tgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaata 31969811  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31969812 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 31969886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 54189576 - 54189750
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  54189576 tgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 54189675  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  54189676 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 54189750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 37968919 - 37968746
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  37968919 tgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaata 37968820  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  37968819 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 37968746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 393 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27536256 - 27536092
Alignment:
Q  393 tacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaatt 488  Q
    |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536256 tactcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaatt 27536157  T
Q  489 ttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27536156 ttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 27536092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15241190 - 15241016
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  15241190 tgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 15241091  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15241090 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 15241016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 28032874 - 28032700
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28032874 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtatcataagctgcttatgccatattttaata 28032775  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  28032774 agtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctctg 28032700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 35490935 - 35490761
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35490935 tgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 35490836  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  35490835 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccaccttcgattctctctg 35490761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40428882 - 40428708
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||    
T  40428882 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttataccatattttgata 40428783  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40428782 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 40428708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44785079 - 44784905
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44785079 tgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 44784980  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44784979 agcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 44784905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 20877078 - 20877251
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  20877078 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 20877177  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||    
T  20877178 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctccttagattctctct 20877251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 45424727 - 45424522
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacctg-----ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||      ||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  45424727 cccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 45424628  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45424627 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 45424528  T
Q  548 tctctg 553  Q
    | ||||    
T  45424527 tttctg 45424522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 53717621 - 53717452
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  53717621 ttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccctattttaataagcct 53717522  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  53717521 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 53717452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 386 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 23704368 - 23704200
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23704368 gcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagc 23704269  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23704268 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttgattctct 23704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6688783 - 6688615
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  6688783 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc------tgcttatgccatattttaata 6688690  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6688689 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 6688615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8591254 - 8591080
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  8591254 tgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatgttaata 8591155  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8591154 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcggttctctctg 8591080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 16700812 - 16700986
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  16700812 tgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 16700911  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16700912 agcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattctctctg 16700986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 383 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 50055263 - 50055098
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50055263 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatggtttcataagctgcttatgccatattttaata 50055164  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcga 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50055163 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 50055098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 383 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30423726 - 30423556
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  30423726 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaata 30423627  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30423626 agcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctccttcgattctct 30423556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 50353835 - 50354006
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  50353835 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatgatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 50353934  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  50353935 ctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctctg 50354006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 2481570 - 2481396
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2481570 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 2481471  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2481470 agccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 2481396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6611518 - 6611348
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||    
T  6611518 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcc 6611419  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6611418 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 6611348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 37464752 - 37464926
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37464752 tgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 37464851  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37464852 agcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 37464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 386 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 43290119 - 43289951
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43290119 gcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 43290020  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43290019 ctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 43289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40680197 - 40680026
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  40680197 gcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttcataagc 40680098  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40680097 ctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctctg 40680026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 550
Target Start/End: Original strand, 52139234 - 52139405
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  52139234 tgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 52139333  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52139334 agcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 52139405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 384 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8932339 - 8932165
Alignment:
Q  384 gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa 479  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    ||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8932339 gggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataa 8932240  T
Q  480 gcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctgc 554  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8932239 acctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctgc 8932165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 14987823 - 14987997
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  14987823 tgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 14987922  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  14987923 agcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctttctg 14987997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 54412659 - 54412833
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  54412659 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattctaata 54412758  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  54412759 agtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 54412833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 425 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269034
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  23269062 atttatgtaatctccttcgattctctctg 23269034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 354 - 553
Target Start/End: Original strand, 1617081 - 1617289
Alignment:
Q  354 aggcccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatca 444  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||     | ||||||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||  ||||||    
T  1617081 aggcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatca 1617180  T
Q  445 tagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcga 544  Q
    |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1617181 tagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 1617280  T
Q  545 ttctctctg 553  Q
    |||||||||    
T  1617281 ttctctctg 1617289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 383 - 551
Target Start/End: Original strand, 48909877 - 48910049
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  48909877 tgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaaca 48909976  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctc 551  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  48909977 aacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctctc 48910049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 53353090 - 53353267
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53353090 tgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 53353189  T
Q  479 ----agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  53353190 tataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacctccttcgattctctct 53353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 19165134 - 19164961
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataag-catttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 477  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  19165134 tgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccata-tttaat 19165036  T
Q  478 aagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||    
T  19165035 aagcctaaattttcagcttaccct-cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgtttttctctg 19164961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 53875688 - 53875862
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  53875688 tgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttttataagctgcttatgtcatatttcaata 53875787  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  53875788 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctctg 53875862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 400 - 553
Target Start/End: Original strand, 33703889 - 33704046
Alignment:
Q  400 ataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagct 495  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || |  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703889 ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagct 33703988  T
Q  496 taccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33703989 tatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33704046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 425 - 553
Target Start/End: Original strand, 47632112 - 47632240
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47632112 taaataaaaatagcttctcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 47632211  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  47632212 atttatgtaacctccttcaattctctctg 47632240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 387 - 550
Target Start/End: Original strand, 16703856 - 16704023
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttg----ggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16703856 cttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 16703955  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  16703956 taaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaacccccttcgattctct 16704023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 30171614 - 30171785
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  30171614 gcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttataccatatttcaataagc 30171713  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  30171714 ctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctccttcgattctctctg 30171785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27583792 - 27583620
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||     ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  27583792 ggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgcataagctgcttatgccatattttcataag 27583693  T
Q  481 cctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  27583692 cctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctctg 27583620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 425 - 544
Target Start/End: Original strand, 44375922 - 44376041
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  44375922 taaataaaaatagtttatcatagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatga 44376021  T
Q  525 attaatgtaacctcattcga 544  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  44376022 atttatgtaacctccttcga 44376041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 15669217 - 15669388
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  15669217 gcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatactttaataagc 15669316  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  15669317 ctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttccattctctctg 15669388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 363 - 519
Target Start/End: Original strand, 28360436 - 28360602
Alignment:
Q  363 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcat 453  Q
    |||||||||||||||||| ||     |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||    
T  28360436 tggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttat 28360535  T
Q  454 atgttgcttatgccat-attttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagct 519  Q
    | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28360536 aagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38071482 - 38071314
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38071482 tgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 38071383  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||| ||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  38071382 agcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc---ttcgattctctctg 38071314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 55344987 - 55344813
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    ||||| |||||||| || |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  55344987 tgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatatttgcatgagttgtttataccatattttaata 55344888  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  55344887 agccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgattctctctg 55344813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 466 - 553
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408225
Alignment:
Q  466 ccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct-ccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 53408225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 497
Target Start/End: Original strand, 50053478 - 50053592
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttggg----taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  50053478 cttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtc 50053577  T
Q  483 taaattttcagctta 497  Q
    |||||||||| ||||    
T  50053578 taaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 490 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261874
Alignment:
Q  490 tcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 23261874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 51780832 - 51780763
Alignment:
Q  427 aataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 496  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51780832 aataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9595943 - 9595890
Alignment:
Q  500 ctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9595943 ctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 9595890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 553
Target Start/End: Original strand, 50055302 - 50055350
Alignment:
Q  505 gcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  50055302 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 50055350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 553
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748263
Alignment:
Q  487 ttttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctctg 48748263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 439 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 55344777 - 55344724
Alignment:
Q  439 ttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 492  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344777 ttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23265919 - 23265870
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa 432  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23265919 tgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa 23265870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 20726824 - 20726994
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20726824 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaaaataacttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 20726923  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20726924 taaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 20726994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6086773 - 6086599
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  6086773 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 6086674  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6086673 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 6086599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26947050 - 26946876
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  26947050 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 26946951  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26946950 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 26946876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 3347697 - 3347523
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  3347697 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 3347598  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3347597 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 3347523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 21893488 - 21893662
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaata----aaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21893488 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 21893587  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21893588 agcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 21893662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26704513 - 26704339
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26704513 tgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 26704414  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26704413 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 26704339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Original strand, 18613540 - 18613745
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||    
T  18613540 cccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatag 18613639  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    || |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18613640 ttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 18613739  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  18613740 tctctg 18613745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 1153628 - 1153800
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1153628 ggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 1153727  T
Q  481 cctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  1153728 cctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctccttcgtttctctctg 1153800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 9459599 - 9459770
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9459599 gcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 9459698  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9459699 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctccttcgattctctctg 9459770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 2837578 - 2837752
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  2837578 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcatgagctgctcatgccatattttaata 2837677  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2837678 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 2837752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 30691884 - 30692058
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30691884 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 30691983  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30691984 agcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 30692058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 429 - 553
Target Start/End: Original strand, 33464412 - 33464536
Alignment:
Q  429 taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatta 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33464412 taaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaattt 33464511  T
Q  529 atgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  33464512 atgtaacctccttcgattctctctg 33464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 397 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 28199667 - 28199508
Alignment:
Q  397 tccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 492  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28199667 tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttca 28199569  T
Q  493 gcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28199568 gcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 28199508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17261247 - 17261073
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  17261247 tgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatattttcataagctgcttatgctatattttaata 17261148  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17261147 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 17261073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 35198317 - 35198489
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  35198317 tgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaata 35198415  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  35198416 agcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtgatctcattcgattctctct 35198489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 358 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887292
Alignment:
Q  358 ccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagt 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||     ||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  449 ttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattct 548  Q
    |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctccttcgattct 34887297  T
Q  549 ctctg 553  Q
    |||||    
T  34887296 ctctg 34887292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 11167276 - 11167447
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||| || || ||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  11167276 gcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagc 11167375  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11167376 ctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 11167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16307213 - 16307015
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacctg-----ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||      ||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||     |||||||||| || |||||||||    
T  16307213 cccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatag 16307114  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgatt 546  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16307113 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 16307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 3955940 - 3955769
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  3955940 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgctatattttaata 3955841  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  3955840 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc---ttcgattctctctg 3955769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 439 - 553
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53115
Alignment:
Q  439 ttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctc 538  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  539 attcgattctctctg 553  Q
     ||||||||||||||    
T  53101 cttcgattctctctg 53115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 386 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30699100 - 30698934
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||| || ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  30699100 gcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttttattagctgcttatgccatattttaataagc 30699001  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattct 548  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30699000 ctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 383 - 502
Target Start/End: Original strand, 52869 - 52992
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  52869 tgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 52968  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  52969 agcctaaattttcagcttaccctc 52992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 428
Target Start/End: Original strand, 33463737 - 33463779
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa 428  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33463737 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 8042638 - 8042809
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8042638 gcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 8042737  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8042738 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 8042809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 46452322 - 46452149
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46452322 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 46452223  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46452222 agcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 46452149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 25999416 - 25999590
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25999416 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 25999515  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  25999516 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctctg 25999590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 38856121 - 38856295
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38856121 tgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 38856220  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  38856221 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattatctctg 38856295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 35226475 - 35226649
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa---aat-agtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35226475 tgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 35226574  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35226575 agcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 35226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 388 - 548
Target Start/End: Original strand, 32244153 - 32244317
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  32244153 ttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagctt 32244252  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattct 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32244253 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 32244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12117818 - 12117644
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12117818 tgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaata 12117719  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12117718 agcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctctg 12117644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15520302 - 15520128
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||  ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  15520302 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatcgtttcataaactgcttatgccatattttaata 15520203  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15520202 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctctg 15520128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 37698303 - 37698129
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  37698303 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 37698204  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37698203 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 37698129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 32359292 - 32359461
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32359292 ttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 32359391  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  32359392 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 32359461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 42308065 - 42307892
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42308065 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 42307966  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42307965 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctct 42307892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 42105131 - 42104957
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  42105131 tgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 42105032  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  42105031 agcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattccctctg 42104957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 54870334 - 54870160
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  54870334 tgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatcgtttcataagctgcttatgtcatattttaata 54870235  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  54870234 agcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctttctg 54870160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25494476 - 25494271
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  25494476 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 25494377  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  25494376 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattc 25494277  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  25494276 tctctg 25494271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 363 - 553
Target Start/End: Original strand, 21581045 - 21581244
Alignment:
Q  363 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcat 453  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||    
T  21581045 tggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcat 21581144  T
Q  454 atgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  21581145 aagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctctctg 21581244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22175150 - 22174976
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22175150 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 22175051  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22175050 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 22174976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44609489 - 44609319
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  44609489 cttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 44609390  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44609389 taaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctctttcgattctctctg 44609319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 50528957 - 50529131
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50528957 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 50529056  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  50529057 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 50529131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20842505 - 20842334
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || |  |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  20842505 gcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgcttatatcatattttaataagc 20842406  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20842405 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 20842334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 15520664 - 15520837
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15520664 tgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 15520763  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  15520764 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctccttcgattctctct 15520837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 20699177 - 20699350
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20699177 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 20699276  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  20699277 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctccttcgattctctct 20699350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 29445521 - 29445690
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||    
T  29445521 ttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcct 29445620  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  29445621 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttccattctatctg 29445690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 38933975 - 38934147
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  38933975 ggcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataag 38934074  T
Q  481 cctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
     |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38934075 tctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 38934147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 54534486 - 54534314
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||| ||| | |||||||||||||||  ||||    
T  54534486 tgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggttt-ataagctgcttatgccatattc-aata 54534389  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  54534388 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 54534314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 387 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 24835855 - 24835686
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  24835855 cttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcc 24835756  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  24835755 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactccttcgattatctct 24835686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 44688789 - 44688961
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  44688789 tgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catattttaata 44688887  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  44688888 agcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 44688961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 425 - 553
Target Start/End: Original strand, 53028291 - 53028419
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53028291 taaataaaaatagcttatcatattttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 53028390  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  53028391 atttatgtaacctccttcgattctctctg 53028419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 48925161 - 48924989
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttggg----taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  48925161 tgggtttatctacttccataagcttttttaa--aagtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgtttatgtcatattttaata 48925064  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  48925063 agtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 48924989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 2895213 - 2895391
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2895213 tgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 2895312  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagct----tatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  2895313 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctccttcgattctctctg 2895391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 407 - 553
Target Start/End: Original strand, 16354398 - 16354548
Alignment:
Q  407 tttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 502  Q
    ||||||| ||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16354398 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcctaaattttcagcttatcctc 16354497  T
Q  503 cagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||    
T  16354498 ctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctgcgattatctctg 16354548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 34700369 - 34700543
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  34700369 tgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 34700468  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||    
T  34700469 agcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcctttgattatctctg 34700543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 26122842 - 26123015
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  26122842 tgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaata 26122941  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||    
T  26122942 agcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaacattcttcgattctctct 26123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 387 - 503
Target Start/End: Original strand, 35643249 - 35643369
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  35643249 cttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcc 35643348  T
Q  483 taaattttcagcttaccctcc 503  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  35643349 taaattttgagcttaccctcc 35643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 465 - 552
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366230
Alignment:
Q  465 gccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttagattctctct 24366230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 425 - 550
Target Start/End: Original strand, 12915980 - 12916105
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||    
T  12915980 taaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatatttaaataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatga 12916079  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||    
T  12916080 atttatgtaacccccttcgattctct 12916105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 472 - 553
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696995
Alignment:
Q  472 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctctctg 13696995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 387 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 50529929 - 50529827
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  50529929 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatgagcc 50529830  T
Q  483 taa 485  Q
    |||    
T  50529829 taa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 50528917 - 50528868
Alignment:
Q  504 agcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  50528917 agcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctatctg 50528868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 479
Target Start/End: Original strand, 49128077 - 49128177
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||||||| | |||||||||||||    |||||||  ||||| || ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  49128077 tgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgtaatttcataagctgcttatgctatattttaata 49128176  T
Q  479 a 479  Q
    |    
T  49128177 a 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 33991178 - 33991348
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33991178 cttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcc 33991277  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33991278 taaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctctg 33991348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 386 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 1165772 - 1165604
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1165772 gcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagc 1165673  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1165672 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1165604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 383 - 550
Target Start/End: Original strand, 1579070 - 1579241
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1579070 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 1579169  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1579170 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 383 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 1605745 - 1605574
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1605745 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 1605646  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1605645 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1605574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 549
Target Start/End: Original strand, 27420892 - 27421062
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27420892 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 27420991  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27420992 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctc 27421062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8374512 - 8374339
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8374512 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 8374413  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8374412 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctccttcgattctctctg 8374339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9008231 - 9008057
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9008231 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 9008132  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  9008131 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctctg 9008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16737621 - 16737447
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16737621 tgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 16737522  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16737521 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 16737447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Original strand, 16069356 - 16069561
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacctg-----ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||    ||||||||| |||||||||    
T  16069356 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 16069455  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16069456 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 16069555  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  16069556 tctctg 16069561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 3921615 - 3921789
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3921615 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 3921714  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3921715 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 3921789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 4120971 - 4121145
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4120971 tgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 4121070  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  4121071 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgattctctctg 4121145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24105845 - 24105671
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  24105845 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 24105746  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24105745 agcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 24105671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27679343 - 27679169
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27679343 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 27679244  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  27679243 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctctctg 27679169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 553
Target Start/End: Original strand, 31883148 - 31883352
Alignment:
Q  358 ccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagt 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||     || ||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  31883148 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 31883247  T
Q  449 ttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattct 548  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31883248 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 31883347  T
Q  549 ctctg 553  Q
    |||||    
T  31883348 ctctg 31883352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 3386656 - 3386486
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3386656 cttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 3386557  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  3386556 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctccttcgattatctctg 3386486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 33491370 - 33491196
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  33491370 tgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttttgccatattttaata 33491271  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33491270 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33491196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 388 - 552
Target Start/End: Original strand, 5203011 - 5203179
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  5203011 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcct 5203110  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  5203111 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcaccttcttcgattctctct 5203179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 19358563 - 19358734
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  19358563 gcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttagtaagc 19358662  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  19358663 ctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctctctg 19358734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38598621 - 38598450
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38598621 gcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 38598522  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  38598521 ctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctctg 38598450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20992316 - 20992146
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    |||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  20992316 cttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagtttcataagctgattatgccatattttaataagcc 20992217  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20992216 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattctctctg 20992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 35782818 - 35782644
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35782818 tgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 35782719  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctcc-agcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35782718 agcttaaattttcagcctaccctccgtgctt-acaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctctg 35782644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 425 - 553
Target Start/End: Original strand, 27025036 - 27025164
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  27025036 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataa 27025135  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27025136 atttatgtaacctccttcgattctctctg 27025164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26603137 - 26602942
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttca 452  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||    
T  26603137 cccgtttggattggcttattttga-----gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 26603043  T
Q  453 tatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26603042 taaactgcttatgccatattttaataagcataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctct 26602943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 383 - 550
Target Start/End: Original strand, 31410510 - 31410681
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||  |||||||  ||||||| |||||||| |||||    ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  31410510 tgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagttttataagctgcttatgccatatttcaata 31410609  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  31410610 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 31410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 383 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 20992455 - 20992354
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20992455 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 20992356  T
Q  479 ag 480  Q
    ||    
T  20992355 ag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 33284774 - 33284642
Alignment:
Q  363 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttggg----taaataaaaatagtttatcatagtttcat 453  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  |    ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33284774 tggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagttttat 33284675  T
Q  454 atgttgcttatgccatattttaataagcctaaa 486  Q
    |   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284674 aaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 495 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420424
Alignment:
Q  495 ttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 35420424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 39260520 - 39260346
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39260520 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 39260421  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  39260420 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 39260346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 16052127 - 16052300
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16052127 tgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 16052226  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16052227 agcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 16052300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Original strand, 29288149 - 29288352
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  29288149 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 29288248  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29288249 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaat--atgtaacctccttcgattc 29288346  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  29288347 tctctg 29288352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Original strand, 25897374 - 25897579
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||    
T  25897374 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 25897473  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25897474 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 25897573  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  25897574 tctctg 25897579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 38829102 - 38829274
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  38829102 ggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttgtgccatattttaataag 38829201  T
Q  481 cctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  38829202 cctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattctctctg 38829274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 33510518 - 33510689
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33510518 gcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 33510617  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33510618 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33510689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 20089502 - 20089676
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  20089502 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 20089601  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20089602 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 20089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 41928665 - 41928495
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  41928665 cttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcc 41928566  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  41928565 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctctg 41928495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 52753321 - 52753147
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  52753321 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctacttatgccatattttaata 52753222  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  52753221 agcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 52753147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 29078547 - 29078720
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29078547 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 29078646  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29078647 aacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 29078720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 357 - 552
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761170
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  46761066 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttccttcgattc 46761165  T
Q  548 tctct 552  Q
    |||||    
T  46761166 tctct 46761170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1940921 - 1940747
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  1940921 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgtttatgtcatattttaata 1940822  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  1940821 agcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaattctctctg 1940747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 384 - 553
Target Start/End: Original strand, 2347688 - 2347862
Alignment:
Q  384 gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatatttt-aata 478  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  2347688 gggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttttaata 2347787  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2347788 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 2347862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 5215416 - 5215590
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5215416 tgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 5215515  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  5215516 agcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctctg 5215590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 23498491 - 23498665
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  23498491 tgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcatagtttcataagttgcttatatcatattttaata 23498590  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23498591 agcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctctg 23498665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 26663289 - 26663463
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  26663289 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 26663388  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26663389 agcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 26663463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 1170618 - 1170447
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  1170618 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 1170519  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1170518 agcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 1168534 - 1168708
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1168534 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 1168633  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||    
T  1168634 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattctctctg 1168708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26580444 - 26580270
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaa----ataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26580444 tgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 26580345  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  26580344 agcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctctg 26580270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 363 - 553
Target Start/End: Original strand, 40149479 - 40149668
Alignment:
Q  363 tggattgacttattttgacctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgtt 458  Q
    ||||||||||||||||||     ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| ||| | |    
T  40149479 tggattgacttattttga-----gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagct 40149573  T
Q  459 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40149574 gcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 40149668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 7145244 - 7145412
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7145244 ttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 7145342  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7145343 aaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 7145412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 42371000 - 42370795
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || |  |||||||||    
T  42371000 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcatag 42370901  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42370900 tttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 42370801  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  42370800 tctctg 42370795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 384 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 51359389 - 51359217
Alignment:
Q  384 gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa 479  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51359389 gggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcatagtttcataaggtgcttatgccatattttaataa 51359291  T
Q  480 gcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  51359290 gcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 51359217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 970731 - 970524
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcata- 446  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||     
T  970731 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatat 970632  T
Q  447 -gtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgat 545  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  970631 agtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgat 970532  T
Q  546 tctctctg 553  Q
    ||||||||    
T  970531 tctctctg 970524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 17591721 - 17591893
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  17591721 ggcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataag 17591820  T
Q  481 cctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17591821 cctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 17591893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 12682851 - 12683025
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  12682851 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttcata 12682950  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12682951 agcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 12683025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 52696822 - 52696996
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  52696822 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 52696921  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  52696922 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctctg 52696996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 19715332 - 19715161
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  19715332 gcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagc 19715233  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19715232 ctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 19715161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 8120904 - 8121074
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||     
T  8120904 cttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagct 8121003  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8121004 taaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 8121074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 13996897 - 13996723
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    ||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13996897 tgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataatggtttcataagctgcttatgccatattttaata 13996798  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13996797 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcattcgattctctctg 13996723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 43905685 - 43905859
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43905685 tgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 43905784  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||    
T  43905785 agcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctccttcgattgtctctg 43905859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 32671615 - 32671784
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  32671615 ttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctacttatgccatattttaataagcct 32671714  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  32671715 aaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattctctctg 32671784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 40092525 - 40092696
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40092525 gcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 40092624  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  40092625 ctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctttttcgattttctctg 40092696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 15203143 - 15203317
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  15203143 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatatttcaata 15203242  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  15203243 agcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctctg 15203317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 8079883 - 8079710
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  8079883 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctacttatgccatattttaata 8079784  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||    
T  8079783 agcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattctctct 8079710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 425 - 553
Target Start/End: Original strand, 49146249 - 49146377
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  49146249 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatga 49146348  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  49146349 atttatgtaacgtcattcgattctctctg 49146377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 383 - 550
Target Start/End: Original strand, 2473753 - 2473924
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  2473753 tgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaata 2473852  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  2473853 agcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctccttcgagtctct 2473924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 388 - 548
Target Start/End: Original strand, 6765495 - 6765659
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  6765495 ttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatattttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcct 6765594  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattct 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  6765595 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttcgattct 6765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17587676 - 17587505
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    || || |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17587676 gcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgcttatgccatattttaataagc 17587577  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  17587576 ctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctttctg 17587505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 358 - 553
Target Start/End: Original strand, 46409436 - 46409642
Alignment:
Q  358 ccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagt 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||     || |||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  46409436 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 46409535  T
Q  449 ttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagc--ttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgatt 546  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  46409536 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 46409635  T
Q  547 ctctctg 553  Q
    |||||||    
T  46409636 ctctctg 46409642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15554318 - 15554152
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |  | | |||   ||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  15554318 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat-agcat---ttcataaactgctgatgccatattttaataagcc 15554223  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15554222 taaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 15554152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 389 - 550
Target Start/End: Original strand, 15717822 - 15717986
Alignment:
Q  389 tatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagccta 484  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15717822 tatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtttcataagctgcttatgccataatttaataagccta 15717920  T
Q  485 aattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  15717921 aattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctccttcaattctct 15717986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 425 - 514
Target Start/End: Original strand, 29695753 - 29695842
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaag 514  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29695753 taaataaaaataatttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 480 - 552
Target Start/End: Original strand, 38171951 - 38172023
Alignment:
Q  480 gcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38171951 gcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 38172023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23322966 - 23322897
Alignment:
Q  427 aataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 496  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23322966 aataaaaatagtttatcataatttcataagctgcttatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 477
Target Start/End: Original strand, 52086298 - 52086396
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 477  Q
    |||| |||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||    |||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  52086298 tgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcataatttcataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 465
Target Start/End: Original strand, 38171867 - 38171949
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatg 465  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38171867 cttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatagtttcataagctgcttatg 38171949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 358 - 553
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144601
Alignment:
Q  358 ccgtctggattgacttattttgacc-----tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaa----ataaaaatagtttatcatagt 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| |     ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  449 ttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattct 548  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  144497 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 144596  T
Q  549 ctctg 553  Q
    |||||    
T  144597 ctctg 144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 14422736 - 14422910
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14422736 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 14422835  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14422836 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 14422910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6144478 - 6144273
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  6144478 cccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 6144379  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6144378 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 6144279  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  6144278 tctctg 6144273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 10836929 - 10836755
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  10836929 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaata 10836830  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  10836829 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattatctctg 10836755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 18594570 - 18594744
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  18594570 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 18594669  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18594670 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 18594744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 29938094 - 29938268
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29938094 tgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 29938193  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29938194 agcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 29938268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 33278437 - 33278607
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33278437 cttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 33278536  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33278537 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33278607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 39206619 - 39206793
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39206619 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 39206718  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  39206719 agtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 39206793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24113371 - 24113166
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||    
T  24113371 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcatag 24113272  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24113271 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 24113172  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  24113171 tctctg 24113166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 354 - 553
Target Start/End: Original strand, 13110403 - 13110611
Alignment:
Q  354 aggcccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatca 444  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||     ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||||    
T  13110403 aggcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 13110502  T
Q  445 tagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcga 544  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  13110503 tagtttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcga 13110602  T
Q  545 ttctctctg 553  Q
    |||||||||    
T  13110603 ttctctctg 13110611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 35118205 - 35118031
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  35118205 tgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 35118106  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35118105 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctctg 35118031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 4035880 - 4036053
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4035880 tgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 4035979  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4035980 agcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 4036053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 383 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 2042698 - 2042526
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  2042698 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 2042599  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctc 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2042598 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 2042526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 388 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 44805113 - 44804945
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |     ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  44805113 ttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcct 44805014  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44805013 aaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 44804945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22260801 - 22260630
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22260801 gcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcctagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 22260702  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22260701 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 22260630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34679631 - 34679457
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttg----ggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  34679631 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttataccatattttaata 34679532  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  34679531 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctttctg 34679457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34842539 - 34842365
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  34842539 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaata 34842440  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34842439 agcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctccttcgattctctctg 34842365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 38167329 - 38167159
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaa----tagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38167329 tgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 38167230  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctc 549  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38167229 agcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 38167159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 7774802 - 7774971
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |    
T  7774802 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagctt 7774901  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7774902 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 7774971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 7812033 - 7812202
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |    
T  7812033 ttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagctt 7812132  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7812133 aaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctctg 7812202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 552
Target Start/End: Original strand, 39218810 - 39218983
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  39218810 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcatagcttcataagctgcttatgccatatttcaata 39218909  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  39218910 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 39218983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 387 - 552
Target Start/End: Original strand, 41575550 - 41575719
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||    ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  41575550 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcc 41575649  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41575650 taaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctct 41575719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 7791449 - 7791618
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |    
T  7791449 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagctt 7791548  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7791549 aaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 7791618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34999065 - 34998896
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34999065 ttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 34998966  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  34998965 aaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctccttcgattctctctg 34998896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 425 - 553
Target Start/End: Original strand, 36491236 - 36491364
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  36491236 taaataaaaacagcttatcatagtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatga 36491335  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36491336 atttatgtaacctctttcgattctctctg 36491364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 425 - 550
Target Start/End: Original strand, 28639361 - 28639484
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  28639361 taaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga 28639460  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
      | |||||||||| |||||||||||    
T  28639461 --ttatgtaacctccttcgattctct 28639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 5320602 - 5320771
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  5320602 ttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcatagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcct 5320701  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  5320702 aaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 5320771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 42571627 - 42571798
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa---aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa 479  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||      
T  42571627 tgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaat-- 42571724  T
Q  480 gcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  42571725 gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctctttcgattctctctg 42571798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 425 - 550
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807464
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    ||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  9807439 atttatgaaacctccttcgtttctct 9807464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 357 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 33287230 - 33287069
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  33287230 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatag 33287131  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagctta 509  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33287130 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagctta 33287069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 8021752 - 8021918
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  8021752 tgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 8021851  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||||    
T  8021852 agcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacctacttcgattctctctg 8021918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 383 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 40118026 - 40117903
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  40118026 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 40117927  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctc 502  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  40117926 agcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 425 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 66308 - 66180
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccc-tccagcttaacaaggagcttatg 523  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  66308 taaataaaaataacttataatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatg 66209  T
Q  524 aattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    |||| | || ||||| |||||||||||||    
T  66208 aatttacgtgacctccttcgattctctct 66180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 383 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26783907 - 26783801
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaa----tagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26783907 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 26783808  T
Q  479 agcctaa 485  Q
    |||||||    
T  26783807 agcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2322181 - 2322068
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    ||||| || |||||| | ||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||    
T  2322181 ttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcacaatttcataagctgcttatatcatattttgataagcct 2322082  T
Q  484 aaattttcagctta 497  Q
    ||||||| ||||||    
T  2322081 aaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 429
Target Start/End: Original strand, 5005199 - 5005245
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  5005199 tgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaat 5005245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 382 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24792497 - 24792322
Alignment:
Q  382 ctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 477  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24792497 ctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaat 24792398  T
Q  478 aagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24792397 aagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 24792322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 42673497 - 42673667
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  42673497 tgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 42673596  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42673597 taaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 42673667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 383 - 551
Target Start/End: Original strand, 3511355 - 3511527
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaata----aaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3511355 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 3511454  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctc 551  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3511455 agcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 3511527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 933321 - 933491
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  933321 cttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 933420  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  933421 taaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgaatctctctg 933491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22649858 - 22649684
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22649858 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaata 22649759  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22649758 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattttctctg 22649684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 42965160 - 42964986
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42965160 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 42965061  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42965060 agcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 42964986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43068168 - 43067963
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  43068168 cccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 43068069  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43068068 tttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 43067969  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  43067968 tctctg 43067963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 7164216 - 7164390
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7164216 tgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 7164315  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  7164316 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctatctg 7164390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 33359254 - 33359080
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33359254 tgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 33359155  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33359154 agcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33359080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 385 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 36890992 - 36890821
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36890992 ggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatatttcaataag 36890893  T
Q  481 cctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36890892 cctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 36890821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12101342 - 12101168
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12101342 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 12101243  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12101242 agcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 12101168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 20346520 - 20346694
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20346520 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 20346619  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  20346620 agtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctccttcgattctctctg 20346694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 30181188 - 30181014
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30181188 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 30181089  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  30181088 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacccccttcgattctctctg 30181014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 32041574 - 32041748
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||    
T  32041574 tgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttcata 32041673  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32041674 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaaccttattcgattctctctg 32041748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 25748524 - 25748693
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25748524 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 25748623  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  25748624 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctctg 25748693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 355 - 551
Target Start/End: Original strand, 48865639 - 48865837
Alignment:
Q  355 ggcccgtctggattgacttattttgacctgggcttatctacttccataagcattttt---aagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 447  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  48865639 ggcccgtttggattgacttattttga-----gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 48865733  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48865734 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 48865833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 5280895 - 5281066
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  5280895 gcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagc 5280994  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5280995 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 5281066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12097751 - 12097580
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||    
T  12097751 gcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctacttatgtcatattttaataagc 12097652  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12097651 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 12097580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 42204186 - 42204361
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataag-catttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 477  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42204186 tgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaat 42204285  T
Q  478 aagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  42204286 aagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctctg 42204361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16894692 - 16894497
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttca 452  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  16894692 cccgtttggattggcttattttga-----gcttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttca 16894598  T
Q  453 tatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||    
T  16894597 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctttct 16894498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 363 - 553
Target Start/End: Original strand, 1803033 - 1803232
Alignment:
Q  363 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcat 453  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  1803033 tggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcat 1803132  T
Q  454 atgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    | | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1803133 aagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 1803232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 6394783 - 6394957
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6394783 tgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaata 6394882  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  6394883 agcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 6394957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 399 - 553
Target Start/End: Original strand, 9452638 - 9452796
Alignment:
Q  399 cataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 494  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452638 cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagc 9452737  T
Q  495 ttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9452738 ttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 9452796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 390 - 553
Target Start/End: Original strand, 8630705 - 8630872
Alignment:
Q  390 atctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaa 485  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630705 atctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 8630804  T
Q  486 attttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  8630805 attttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaatccccttcgattctctctg 8630872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 4347305 - 4347478
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  4347305 tgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaaca 4347404  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  4347405 agcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc-ccttctattctctctg 4347478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4477485 - 4477311
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  4477485 tgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaata 4477386  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  4477385 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 4477311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 15655944 - 15656118
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15655944 tgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 15656043  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15656044 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 15656118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 38866576 - 38866750
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  38866576 tgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 38866675  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  38866676 agcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctctg 38866750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 425 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 46134422 - 46134294
Alignment:
Q  425 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatga 524  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46134422 taaataaaaatagtttattatagtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatta 46134323  T
Q  525 attaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46134322 atttatgtaacctcattcgattctctctg 46134294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 383 - 551
Target Start/End: Original strand, 43156745 - 43156917
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| || |||| ||||    
T  43156745 tgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatggcaaatttcaata 43156844  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctc 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43156845 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 43156917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Original strand, 17753635 - 17753806
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||  | ||||||||||||||    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17753635 gcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 17753734  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  17753735 ctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctctctg 17753806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 33846688 - 33846519
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  33846688 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgtcatattttaata 33846589  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33846588 agcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33846519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 407 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 46891479 - 46891329
Alignment:
Q  407 tttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 502  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  46891479 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcatagttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttaccctt 46891380  T
Q  503 cagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  46891379 cagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattgtctctg 46891329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 492
Target Start/End: Original strand, 19828304 - 19828415
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19828304 ggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaattgcttatgccatattttaataag 19828403  T
Q  481 cctaaattttca 492  Q
    || |||||||||    
T  19828404 ccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43021736 - 43021570
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||    ||||  |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||   |    |    
T  43021736 cttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattatagtttcataagctgcttatggcatatttcggt----c 43021641  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  43021640 taaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 43021570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 37005970 - 37005857
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||    |||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  37005970 ttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaatttcataagctgcttatgctatattttaataaggct 37005871  T
Q  484 aaattttcagctta 497  Q
    || |||| ||||||    
T  37005870 aattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 432
Target Start/End: Original strand, 37705012 - 37705061
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa 432  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37705012 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa 37705061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 497
Target Start/End: Original strand, 43405054 - 43405170
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    |||||||||||| | |||||  ||||||| || ||||||||||||    |||||||| ||||| || ||||||| |||| || | | |||||||||||||    
T  43405054 ggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcgtaatttcataagttgtttctactatattttaataag 43405153  T
Q  481 cctaaattttcagctta 497  Q
    || || |||| ||||||    
T  43405154 cccaattttttagctta 43405170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 36736 - 36910
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  36736 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 36835  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36836 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 36910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Original strand, 10238 - 10443
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  10238 cccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 10337  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10338 tttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 10437  T
Q  548 tctctg 553  Q
    ||||||    
T  10438 tctctg 10443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 363 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 33906246 - 33906047
Alignment:
Q  363 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcat 453  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||    
T  33906246 tggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcat 33906147  T
Q  454 atgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  33906146 aagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctctg 33906047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 3873418 - 3873244
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaa----tagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3873418 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 3873319  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3873318 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctcattcgattctctctg 3873244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31517389 - 31517215
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  31517389 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaata 31517290  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31517289 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 31517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 383 - 533
Target Start/End: Original strand, 1108310 - 1108464
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1108310 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 1108409  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgta 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1108410 agcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26323356 - 26323186
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26323356 cttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 26323257  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26323256 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctctg 26323186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 42937755 - 42937925
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa-gcc 482  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  42937755 ttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaagcc 42937854  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42937855 taaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 42937925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 386 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 19384106 - 19383938
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19384106 gcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgtttatgccatattttaataagc 19384007  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctct 550  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19384006 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19383938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 18807055 - 18806884
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18807055 gcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagc 18806956  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18806955 ctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 18806884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4232316 - 4232142
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |    
T  4232316 tgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttcaca 4232217  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4232216 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcattcgattatctctg 4232142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 5733430 - 5733604
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggt----aaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    ||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  5733430 tgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 5733529  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  5733530 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctctg 5733604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329839
Alignment:
Q  357 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  448 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattc 547  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattc 28329845  T
Q  548 tctctg 553  Q
    | ||||    
T  28329844 tttctg 28329839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 4016075 - 4016244
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggt----aaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4016075 ttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcct 4016174  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4016175 aaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 4016244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 30270848 - 30270679
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaa----atagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  30270848 ttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcct 30270749  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  30270748 aaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattatctctg 30270679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 387 - 552
Target Start/End: Original strand, 39635487 - 39635656
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaa----tagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  39635487 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcc 39635586  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39635587 taaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctccttcgattctctct 39635656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 386 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6174999 - 6174828
Alignment:
Q  386 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 481  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||    
T  6174999 gcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagc 6174900  T
Q  482 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||    
T  6174899 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgattctctctg 6174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 383 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19901311 - 19901143
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa---aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  19901311 tgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatatttcaataa 19901212  T
Q  480 gcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattct 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19901211 gcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 19901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 407 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 2178919 - 2178769
Alignment:
Q  407 tttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 502  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178919 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 2178820  T
Q  503 cagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2178819 tgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 2178769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16588950 - 16588776
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |  |||||||||||||||    ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  16588950 tgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttcata 16588851  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16588850 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctccgtcgattatctctg 16588776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 851030 - 851202
Alignment:
Q  385 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa--aatagt--ttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 480  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||   |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  851030 ggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataattttataagctgcttatgccatattttaataag 851129  T
Q  481 cctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  851130 cttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 851202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1483076 - 1482903
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1483076 tgggcttatctact-ccataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgtttcataagctgcttatgccatattttaata 1482978  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  1482977 agcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctctctg 1482903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 383 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16066468 - 16066302
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  ||||| |  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16066468 tgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 16066369  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgat 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16066368 agcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 16066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 388 - 549
Target Start/End: Original strand, 429852 - 430017
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  429852 ttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataatttcataagttgcttatgcgatattttaataagcct 429951  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctc 549  Q
    ||||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  429952 aaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctc 430017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 383 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 30420341 - 30420181
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30420341 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataggttcataagctgcttatgccatattttaata 30420242  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctc 551  Q
    |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  30420241 agcctaaattttcag------------cttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattctctc 30420181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44947711 - 44947549
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||        ||    
T  44947711 ttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttg-------ct 44947619  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44947618 aaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 44947549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 497
Target Start/End: Original strand, 3585369 - 3585439
Alignment:
Q  427 aataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 497  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  3585369 aataaaaacaatttatcacaatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 42446739 - 42446625
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    ||||| |  |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||      
T  42446739 cttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgccatattttaataagat 42446640  T
Q  483 taaattttcagctta 497  Q
     ||||||| ||||||    
T  42446639 caaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 180 - 6
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  180 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 81  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  80 atcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 553
Target Start/End: Original strand, 3741 - 3915
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3741 tgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 3840  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  3841 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattctctctg 3915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23125 - 22956
Alignment:
Q  383 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 478  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23125 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 23026  T
Q  479 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattct 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23025 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 387 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 145415 - 145246
Alignment:
Q  387 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 482  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  145415 cttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcc 145316  T
Q  483 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctct 552  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  145315 taaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattctctct 145246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 397 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 165 - 6
Alignment:
Q  397 tccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 492  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  165 tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttca 67  T
Q  493 gcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  66 gcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 464 - 295
Alignment:
Q  388 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 483  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |    
T  464 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagctt 365  T
Q  484 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaattaatgtaacctcattcgattctctctg 553  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  364 aaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University