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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF12661_low_16 (Length: 419)
Name: NF12661_low_16
Description: NF12661
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF12661_low_16 |
 |  |
|
| [»] chr1 (30 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0022 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (61 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] chr4 (50 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0076 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1500 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0761 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0191 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0107 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0213 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0155 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0892 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0516 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1666 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0670 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0367 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0364 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0598 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0406 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0020 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0153 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0193 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0065 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 22227811 - 22228229
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22227811 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
22227910 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22227911 |
acaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatca |
22228010 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22228011 |
tcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt |
22228110 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22228111 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcttaagcttaccccaattgattcttc |
22228210 |
T |
 |
| Q |
401 |
aagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22228211 |
aagttattcccttcaaaac |
22228229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 22232508 - 22232926
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22232508 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
22232607 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22232608 |
acaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatca |
22232707 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22232708 |
tcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt |
22232807 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22232808 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcataaacttaccccaattgattcatc |
22232907 |
T |
 |
| Q |
401 |
aagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22232908 |
aagatattcacttcaaaac |
22232926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116589
Alignment:
| Q |
3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaa-tctcaagttaa |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
2116258 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa |
2116357 |
T |
 |
| Q |
102 |
caacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
201 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2116358 |
caataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
2116457 |
T |
 |
| Q |
202 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattg |
301 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2116458 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaaa---t |
2116554 |
T |
 |
| Q |
302 |
tacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2116555 |
tacatgattatgataatcactaacccctttacctt |
2116589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5072638 - 5072261
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
5072638 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta |
5072539 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
5072538 |
acaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac |
5072439 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
5072438 |
atcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaaat |
5072339 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaa |
379 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5072338 |
--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttcaattcagctcctaa |
5072261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 20931347 - 20931597
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20931347 |
tcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
20931446 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20931447 |
acaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatca |
20931546 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20931547 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
20931597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18601368 - 18601052
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
18601368 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta |
18601269 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
18601268 |
acaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac |
18601169 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
18601168 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat |
18601069 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataat |
318 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18601068 |
--tacatgattgtgataat |
18601052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 336
Target Start/End: Original strand, 45051484 - 45051757
Alignment:
| Q |
60 |
caaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttaca |
159 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45051484 |
caacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttaca |
45051583 |
T |
 |
| Q |
160 |
taattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgtt |
259 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
45051584 |
tatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgtt |
45051683 |
T |
 |
| Q |
260 |
catcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45051684 |
catcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---tcacatgattatgataaagactaacccccttacctt |
45051757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 20913039 - 20913282
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
20913039 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaat-------ta |
20913131 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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20913132 |
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20913231 |
T |
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251 |
Q |
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tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
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Target Start/End: Original strand, 41394224 - 41394558
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T |
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200 |
Q |
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41394324 |
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T |
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| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
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| T |
41394424 |
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41394522 |
T |
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301 |
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336 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #10
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4 |
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103 |
Q |
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20445783 |
T |
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104 |
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203 |
Q |
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20445784 |
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20445883 |
T |
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204 |
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251 |
Q |
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attcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 1 - 251
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Q |
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tcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatcta |
20893788 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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20893688 |
T |
 |
| Q |
201 |
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251 |
Q |
| |
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tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 20531449 - 20531696
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Q |
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T |
 |
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104 |
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203 |
Q |
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| T |
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20531648 |
T |
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204 |
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251 |
Q |
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attcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 4 - 251
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4 |
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103 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |
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tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
37844610 |
T |
 |
| Q |
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202 |
Q |
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| T |
37844609 |
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37844510 |
T |
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| Q |
203 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
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37844509 |
aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
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Target Start/End: Complemental strand, 18059877 - 18059608
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Q |
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T |
 |
| Q |
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334 |
Q |
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18059678 |
T |
 |
| Q |
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405 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr1; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 17148704 - 17148974
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T |
 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaa-cccccttac |
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Q |
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gagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccccttac |
17148903 |
T |
 |
| Q |
334 |
ctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
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17148904 |
ctttgaagttgattatccccaacccttgcttcaattcagctcct-atgtcaccccacttgattcctcaagct |
17148974 |
T |
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Target: chr1; HSP #16
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Q |
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa |
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T |
 |
| Q |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
| T |
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gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacc |
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T |
 |
| Q |
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419 |
Q |
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| |
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|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
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T |
 |
| Q |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
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gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
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T |
 |
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tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
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Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
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17004975 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #18
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| || |
|
|
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaa |
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T |
 |
| Q |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38055110 |
aagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaagatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
38055011 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38055010 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||||| || |||||||||||| || | || ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
19962617 |
ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag |
19962518 |
T |
 |
| Q |
236 |
agcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacct |
335 |
Q |
| |
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|
| T |
19962517 |
agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct |
19962418 |
T |
 |
| Q |
336 |
ttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
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| T |
19962417 |
ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
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Q |
| |
|
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|
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22035585 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaa-acagcaacataacaa |
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T |
 |
| Q |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
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Q |
| |
|
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|
| T |
22035684 |
gagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttacc |
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T |
 |
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tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
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| T |
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ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7641052 - 7640769
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| |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
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|
| T |
7640953 |
gagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttacc |
7640854 |
T |
 |
| Q |
335 |
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419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
7640853 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
7640769 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
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Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861254
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305 |
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404 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15861358 |
atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttatcccaattgattcctcaagc |
15861259 |
T |
 |
| Q |
405 |
tattc |
409 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
15861258 |
tattc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
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Target Start/End: Original strand, 51452624 - 51452744
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131 |
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230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
51452624 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
51452723 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452724 |
gttgaagcacgaatttagcaa |
51452744 |
T |
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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 18598914 - 18598850
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| Q |
314 |
ataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaa |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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18598914 |
ataataactaacccccttaccttagaagaagattaaccc-aactcttgcttcaattcagctcctaa |
18598850 |
T |
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Target: chr1; HSP #25
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Target Start/End: Complemental strand, 5768393 - 5768169
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acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| ||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
5768393 |
acccaatctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaa |
5768294 |
T |
 |
| Q |
123 |
caattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||| || || ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
5768293 |
caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaac |
5768196 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5768195 |
atatcatcataacaagagcacgaattt |
5768169 |
T |
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Target: chr1; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40436493 - 40436269
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| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
40436493 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaaaaacaacaacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
40436394 |
T |
 |
| Q |
123 |
caattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||| || || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||| || ||||| |
|
|
| T |
40436393 |
caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaac |
40436296 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
40436295 |
atatcatcataacaagagcacgaattt |
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T |
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Target: chr1; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051487
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| Q |
3 |
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44 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45051446 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaac |
45051487 |
T |
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Target: chr1; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27329985 - 27329874
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| Q |
17 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| | || ||| | ||| ||| ||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
27329985 |
atgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcata |
27329886 |
T |
 |
| Q |
117 |
attcaccaattg |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
27329885 |
attcaccaattg |
27329874 |
T |
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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
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Target Start/End: Complemental strand, 22143471 - 22143361
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235 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| || || |
|
|
| T |
22143471 |
ttcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttag |
22143372 |
T |
 |
| Q |
236 |
agcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
22143371 |
agcacgaattt |
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T |
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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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Target Start/End: Complemental strand, 38033748 - 38033675
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| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
38033748 |
aatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaatt |
38033675 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5464 - 5047
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
5464 |
tcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
5366 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5365 |
acaacaactcagcaaaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
5266 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5265 |
tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaatt |
5166 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctc |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
5165 |
gtacatgattatgataataactaactcccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttc |
5066 |
T |
 |
| Q |
401 |
aagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
5065 |
aagctattcccttaaaaac |
5047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Original strand, 109608 - 109717
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| Q |
18 |
tgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaa |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | |||||||| | | || ||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
109608 |
tgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaa |
109707 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttcaccaatt |
127 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
109708 |
ttcaacaatt |
109717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:
Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 3724 - 4143
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3724 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
3823 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcattttt-acataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3824 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
3923 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3924 |
atcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaat |
4023 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcct |
399 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4024 |
tgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcct |
4123 |
T |
 |
| Q |
400 |
caagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4124 |
caagctattgccttcaaaac |
4143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0529 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:
Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 3 - 419
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3382
Alignment:
| Q |
3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaa-caagaatcaaatctcaagttaa |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| | || |
|
|
| T |
2966 |
atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa |
3065 |
T |
 |
| Q |
102 |
caacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3066 |
caacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
3165 |
T |
 |
| Q |
202 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattg |
301 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3166 |
caattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaattg |
3264 |
T |
 |
| Q |
302 |
tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctca |
401 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
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| T |
3265 |
tacataattatgataataattaacccccttaccttagaagaagattaaccgaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttca |
3364 |
T |
 |
| Q |
402 |
agctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||| |
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| T |
3365 |
agctattcccttcaaaac |
3382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21365 - 20950
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21365 |
tcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaatta |
21266 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21265 |
acaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatca |
21166 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21165 |
tcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaatt |
21067 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctc |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
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| T |
21066 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctc |
20968 |
T |
 |
| Q |
401 |
aagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| |
|
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| T |
20967 |
aagct-ttcccttcaaaac |
20950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14310 - 13896
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
14310 |
tcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaatta |
14211 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
14210 |
tcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatca |
14111 |
T |
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| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
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14110 |
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14013 |
T |
 |
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301 |
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400 |
Q |
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| T |
14012 |
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13914 |
T |
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| Q |
401 |
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419 |
Q |
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| T |
13913 |
aagct-ttcccttcaaaac |
13896 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774109
Alignment:
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3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaac |
102 |
Q |
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| T |
6774505 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
6774406 |
T |
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| Q |
103 |
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202 |
Q |
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| T |
6774405 |
aataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
6774306 |
T |
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| Q |
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302 |
Q |
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| T |
6774305 |
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6774209 |
T |
 |
| Q |
303 |
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402 |
Q |
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| T |
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acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctagtc---acccacttgattcctcaa |
6774112 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 378
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549358
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3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaac |
102 |
Q |
| |
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| T |
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atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
24549085 |
T |
 |
| Q |
103 |
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202 |
Q |
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| T |
24549086 |
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24549185 |
T |
 |
| Q |
203 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgt |
302 |
Q |
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| T |
24549186 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---tt |
24549282 |
T |
 |
| Q |
303 |
acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
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| T |
24549283 |
acatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctccta |
24549358 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
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Target Start/End: Original strand, 30120724 - 30121102
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100 |
Q |
| |
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| T |
30120724 |
tcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatta |
30120823 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
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| T |
30120824 |
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30120923 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
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| T |
30120924 |
ataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaaat |
30121023 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
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| T |
30121024 |
tacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttcaattcagctccta |
30121102 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21852211 - 21851869
Alignment:
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caatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaa |
104 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |
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| T |
21852211 |
caatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaa |
21852112 |
T |
 |
| Q |
105 |
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203 |
Q |
| |
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| T |
21852111 |
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21852012 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgta |
303 |
Q |
| |
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| T |
21852011 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--ta |
21851914 |
T |
 |
| Q |
304 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
21851913 |
catgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgatta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21844818 - 21844476
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5 |
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104 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||| |
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|
| T |
21844818 |
caatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaa |
21844719 |
T |
 |
| Q |
105 |
caacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
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| T |
21844718 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatca |
21844619 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgta |
303 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21844618 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--ta |
21844521 |
T |
 |
| Q |
304 |
catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta |
348 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
21844520 |
catgattgtgataataactaacccccttaccgttgaagttgatta |
21844476 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 419
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17346001
Alignment:
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109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| | ||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
17345581 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact |
17345679 |
T |
 |
| Q |
110 |
tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17345680 |
tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
17345779 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgtaaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||| || || | |
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|
| T |
17345780 |
gcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaata |
17345879 |
T |
 |
| Q |
298 |
attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattc |
397 |
Q |
| |
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| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
17345880 |
aatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc |
17345979 |
T |
 |
| Q |
398 |
ctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| |
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|
| T |
17345980 |
ctcaagttattctctccaaaac |
17346001 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43373729 - 43373480
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
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tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
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T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43373629 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattatca |
43373530 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43373529 |
tcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16674642 - 16674270
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
16674642 |
tcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta |
16674543 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
16674542 |
acaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac |
16674443 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
16674442 |
ataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat |
16674343 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctc |
375 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16674342 |
--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactc-aactcttgcttcaattcagctc |
16674270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16193974 - 16193727
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4 |
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103 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16193974 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaaca |
16193875 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16193874 |
acaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatca |
16193775 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16193774 |
attcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaa |
16193727 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13721047 - 13720763
Alignment:
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137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
13721047 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa |
13720948 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13720947 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
13720848 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13720847 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 22006377 - 22006093
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137 |
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234 |
Q |
| |
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|
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22006278 |
T |
 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
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|
|
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22006178 |
T |
 |
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419 |
Q |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 137 - 419
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137 |
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234 |
Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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T |
 |
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419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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T |
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Target: chr8; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 16195370 - 16195652
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Q |
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|
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T |
 |
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gcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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gaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttacctt |
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T |
 |
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337 |
tgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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Target: chr8; HSP #14
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Q |
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T |
 |
| Q |
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
16405036 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #15
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Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928802
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Q |
| |
|
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|
|
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24929043 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact |
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T |
 |
| Q |
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tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
24928844 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaa |
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Target: chr8; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16873170 - 16872886
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234 |
Q |
| |
|
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|
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16873170 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaa |
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T |
 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16873070 |
gagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
16872971 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
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16872970 |
ttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
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T |
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Target: chr8; HSP #17
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Q |
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|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
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|
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
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T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
271379 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
271280 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
271279 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
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644441 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
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T |
 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
644541 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
644640 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
644641 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
644684 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 137 - 378
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
830176 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
830275 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
830276 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
830375 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
830376 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
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aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa |
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T |
 |
| Q |
266 |
cccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgcttt |
365 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||| |
|
|
| T |
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cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc |
15319048 |
T |
 |
| Q |
366 |
aattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
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aattcagctccta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |
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|
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15499616 |
aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa |
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T |
 |
| Q |
266 |
cccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgcttt |
365 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||| |
|
|
| T |
15499516 |
cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc |
15499417 |
T |
 |
| Q |
366 |
aattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
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aattcagctccta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 137 - 378
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22088913 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
22088814 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22088813 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacc |
22088714 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22088713 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
22088670 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 1 - 251
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| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | |||||||||| |||||||||| | ||||| | | |
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22907375 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22907374 |
actacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatta |
22907276 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22907275 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
222842 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaat |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
222841 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
222754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 736564 - 736377
Alignment:
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1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
736564 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
736465 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaat |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
736464 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
736377 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 860459 - 860272
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| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
860459 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
860360 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaat |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
860359 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
860272 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Original strand, 5238219 - 5238339
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131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
5238219 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
5238318 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5238319 |
gttggagcacgaatttagcaa |
5238339 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24661379 - 24661259
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cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
24661379 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
24661280 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661279 |
gttggagcacgaatttagcaa |
24661259 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Original strand, 43685678 - 43685798
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| Q |
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cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
43685678 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
43685777 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685778 |
gttggagcacgaatttagcaa |
43685798 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #30
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Target Start/End: Complemental strand, 691965 - 691909
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaat |
187 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
691965 |
cacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
691909 |
T |
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Target: chr8; HSP #31
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| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
18261695 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
18261596 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt-gcacacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| |||| || ||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
18261595 |
caattagagcacaa--ttcacaatatatcattttcacatactatgaagatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaac |
18261498 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
18261497 |
atatcatcataactagagcacgaattt |
18261471 |
T |
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Target: chr8; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45559161 - 45558937
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23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
45559161 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
45559062 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt-gcacacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca-tcaattcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| |||| || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | | |||||| | ||||| |
|
|
| T |
45559061 |
caattagagcacaa--ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaac |
45558964 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
45558963 |
atatcatcataacaagagcatgaattt |
45558937 |
T |
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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24552761 - 24552570
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| Q |
56 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| ||||||||||| || || |||||| ||||| | ||||||| || || |||||||| |
|
|
| T |
24552761 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattt |
24552664 |
T |
 |
| Q |
155 |
ttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24552663 |
tcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
24552570 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #34
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163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
26011657 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
26011741 |
T |
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Target: chr8; HSP #35
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| Q |
67 |
aacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcaccaattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-t |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||| || || ||||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
33172295 |
aacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactat |
33172392 |
T |
 |
| Q |
165 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | |||||| || ||||| |
|
|
| T |
33172393 |
gaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagtacaaattt |
33172475 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45465209 - 45465126
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| Q |
164 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
45465209 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaggagcacgaattt |
45465126 |
T |
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Target: chr8; HSP #37
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| Q |
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ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15933461 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca |
15933527 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
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| Q |
37 |
tcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcaccaatt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
29306454 |
tcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
29306544 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
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163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
21198236 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
21198152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
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acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
23226156 |
acatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
23226076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
25296321 |
ttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattt |
25296405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 246
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Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
25758341 |
ttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattt |
25758425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 2437459 - 2437862
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2437459 |
tcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatatta |
2437558 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
2437559 |
acaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac |
2437658 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2437659 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaat |
2437757 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcct |
399 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2437758 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaattgattcct |
2437856 |
T |
 |
| Q |
400 |
caagct |
405 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
2437857 |
caagct |
2437862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18254096 - 18253761
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18254096 |
tcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
18253997 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253996 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
18253897 |
T |
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300 |
Q |
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tcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt |
18253797 |
T |
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Q |
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| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |
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T |
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Target: chr7; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 16479211 - 16478837
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T |
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200 |
Q |
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16479111 |
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16479012 |
T |
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201 |
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300 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #4
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Target Start/End: Original strand, 13572682 - 13573093
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T |
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203 |
Q |
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T |
 |
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303 |
Q |
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attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--ta |
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T |
 |
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403 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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199 |
Q |
| |
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| T |
10989512 |
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T |
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Q |
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T |
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399 |
Q |
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T |
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caagct |
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Target: chr7; HSP #6
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
298 |
Q |
| |
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| T |
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catcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatg-caaaa |
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T |
 |
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Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212115
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T |
 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
16211868 |
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16211967 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
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| T |
16211968 |
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16212066 |
T |
 |
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gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaa |
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Q |
| |
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| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |
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|
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T |
 |
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
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| T |
47481192 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatca |
47481093 |
T |
 |
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Q |
| |
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47481092 |
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T |
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Q |
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|
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T |
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Q |
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Target: chr7; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15760233 - 15759949
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| |
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 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
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Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11580897 |
acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
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T |
 |
| Q |
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attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
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|
|
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attcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaa |
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|
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T |
 |
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
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| |
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|
|
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T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacag |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
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tcaattcatgcatacaaacgtatcatcacag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 4 - 251
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|
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 |
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acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
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| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatca |
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T |
 |
| Q |
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attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
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Q |
| |
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| T |
13037072 |
attcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
13037025 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18980140 - 18979858
Alignment:
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137 |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
18980041 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
18979941 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
18979940 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa--gtcacccacttgattcctaaagctcttctctccaaaac |
18979858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 417
Target Start/End: Original strand, 13321016 - 13321447
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | |
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T |
 |
| Q |
101 |
acaa-caacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
197 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13321116 |
acaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
13321214 |
T |
 |
| Q |
198 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atga |
285 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13321215 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccacttattcaattcaacccatattcatacaacaaatga |
13321314 |
T |
 |
| Q |
286 |
gaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttac |
385 |
Q |
| |
|
|||| || || || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| || | | |||| | || ||||||||| ||||| |
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| T |
13321315 |
gaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagcttac |
13321414 |
T |
 |
| Q |
386 |
cccaa-ttgattcctcaagctattctcttcaaa |
417 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
13321415 |
cccaatttgattcttcaagctcttctctccaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 13758507 - 13758791
Alignment:
| Q |
137 |
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234 |
Q |
| |
|
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|
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13758507 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaa |
13758606 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13758607 |
gagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
13758706 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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| T |
13758707 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
13758791 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14251017 - 14250734
Alignment:
| Q |
137 |
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234 |
Q |
| |
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| T |
14251017 |
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14250918 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14250917 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttacc |
14250818 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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|
| T |
14250817 |
ttagaagaaga-taactcaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
14250734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 3059971 - 3060218
Alignment:
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4 |
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103 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
3059971 |
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3060070 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
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|
| T |
3060071 |
acaacttaacaaaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatca |
3060170 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
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| T |
3060171 |
attaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaa |
3060218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 15927705 - 15927987
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||| |
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| T |
15927705 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa |
15927804 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15927805 |
gagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
15927904 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |
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|
| T |
15927905 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa--gtcacccacttgattcctaaagctcttctctccaaaac |
15927987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Original strand, 7822865 - 7823134
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| Q |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7822865 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
7822964 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7822965 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
7823064 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
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|
|
| T |
7823065 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Original strand, 7830176 - 7830445
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| Q |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7830176 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
7830275 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7830276 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
7830375 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7830376 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct |
7830445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Original strand, 27176570 - 27176839
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| Q |
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27176570 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
27176669 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27176670 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
27176769 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27176770 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct |
27176839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27101756 - 27101513
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| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
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|
| T |
27101756 |
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27101657 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27101656 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
27101557 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27101556 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
27101513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27109104 - 27108861
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| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27109104 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
27109005 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27109004 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
27108905 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
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| T |
27108904 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
27108861 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38783848 - 38783605
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137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
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38783848 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
38783749 |
T |
 |
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235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38783748 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
38783649 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38783648 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 7293019 - 7293268
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1 |
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Q |
| |
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|
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7293019 |
tcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca |
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 |
| Q |
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200 |
Q |
| |
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| T |
7293119 |
acaacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatta |
7293217 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7293218 |
ttaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa |
7293268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292349
Alignment:
| Q |
5 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaa |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||||| | |
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|
| T |
25292595 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga |
25292496 |
T |
 |
| Q |
105 |
caacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
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|
| T |
25292495 |
caacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaa |
25292396 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25292395 |
ttcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaa |
25292349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 296224 - 295977
Alignment:
| Q |
2 |
catcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagt-ta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |||| |||||| | | ||| | | |
|
|
| T |
296224 |
catcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatca---acaacatcaattaatagcaacaacatcaattgaacatgaatcacaacacaattcaa |
296128 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
296127 |
acatcaatttagcaaaattcaccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatca |
296028 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
296027 |
tcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaa |
295977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 48622757 - 48622571
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcat |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
48622757 |
ttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcat |
48622658 |
T |
 |
| Q |
263 |
caacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
48622657 |
caacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaa |
48622571 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Original strand, 11516359 - 11516479
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
11516359 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
11516458 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11516459 |
gttggagcacgaatttagcaa |
11516479 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15441695 - 15441575
Alignment:
| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
15441695 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
15441596 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15441595 |
gttggagcacgaatttagcaa |
15441575 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30262260 - 30262140
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
30262260 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
30262161 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30262160 |
gttggagcacgaatttagcaa |
30262140 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 336
Target Start/End: Original strand, 15862175 - 15862257
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| Q |
254 |
attgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862175 |
attgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15862257 |
T |
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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516691
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| Q |
305 |
atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaa--ttgattcctcaa |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
15516793 |
atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttaccccaatcttgattcttcaa |
15516694 |
T |
 |
| Q |
403 |
gct |
405 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
15516693 |
gct |
15516691 |
T |
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Target: chr7; HSP #35
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Target Start/End: Original strand, 16418635 - 16418848
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| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacata-attgaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| ||| | | | || || | ||| |
|
|
| T |
16418635 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagca-acagcaacataacaa |
16418733 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16418734 |
gagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaacccccttacc |
16418833 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||| |
|
|
| T |
16418834 |
ttagatgatgtttaa |
16418848 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10000488 - 10000275
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| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacata-attgaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| ||| || | |||| || | ||| |
|
|
| T |
10000488 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaa-acaacaacataacaa |
10000390 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
10000389 |
gagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatgaagacaaacccccttacc |
10000290 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||| |
|
|
| T |
10000289 |
ttagatgatgtttaa |
10000275 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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Target Start/End: Original strand, 28722256 - 28722357
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| Q |
147 |
tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
28722256 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaat |
28722355 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
28722356 |
tt |
28722357 |
T |
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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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| Q |
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ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16915012 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
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T |
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Target: chr7; HSP #39
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| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| | || |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||| ||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13449051 |
acccaagctacgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaa |
13448952 |
T |
 |
| Q |
123 |
caattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
|| || | ||||||| || || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
13448951 |
catttagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaac |
13448854 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||| | | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
13448853 |
ataacatgataacaagagcatgaattt |
13448827 |
T |
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Target: chr7; HSP #40
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| Q |
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ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13377692 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
13377758 |
T |
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Target: chr7; HSP #41
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| Q |
147 |
tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || || | | ||||||||||| |
|
|
| T |
14935506 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaat |
14935605 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
14935606 |
tt |
14935607 |
T |
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Target: chr7; HSP #42
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| Q |
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tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || || | | ||||||||||| |
|
|
| T |
15363099 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaat |
15363198 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
15363199 |
tt |
15363200 |
T |
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Target: chr7; HSP #43
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26 |
caagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcaccaa |
125 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
46474027 |
caagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaa |
46474126 |
T |
 |
| Q |
126 |
tt |
127 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
46474127 |
tt |
46474128 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
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163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9611471 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9611555 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
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acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
9724031 |
acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
9723932 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt |
127 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
9723931 |
caatt |
9723927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 246
Target Start/End: Original strand, 9839042 - 9839126
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9839042 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9839126 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17947816 - 17947712
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| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
17947816 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
17947717 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt |
127 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
17947716 |
caatt |
17947712 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 4484748 - 4484956
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| Q |
21 |
atacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
4484748 |
atacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattc |
4484847 |
T |
 |
| Q |
121 |
accaa-ttgcacacaattttcataacttatcatttttacata-attgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaa |
217 |
Q |
| |
|
| ||| ||| || || |||| || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
4484848 |
aacaatttgagcataa--ttcacaatatatcattttcacatacaatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaa |
4484945 |
T |
 |
| Q |
218 |
acataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
4484946 |
acatatcatca |
4484956 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9319674 - 9319563
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| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
9319674 |
tttcataatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataacaa |
9319575 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |
|
|
| T |
9319574 |
gagtacgaattt |
9319563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20583778 - 20583578
Alignment:
| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| || | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
20583778 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaa |
20583679 |
T |
 |
| Q |
123 |
caa-ttgcacacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||| ||| || || |||| || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
20583678 |
caatttgagcataa--ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaac |
20583581 |
T |
 |
| Q |
220 |
ata |
222 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
20583580 |
ata |
20583578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 28390476 - 28390559
Alignment:
| Q |
164 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28390476 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
28390559 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34241288 - 34241225
Alignment:
| Q |
166 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34241288 |
aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatca |
34241225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Original strand, 48356807 - 48356873
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
48356807 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca |
48356873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Original strand, 15358943 - 15359020
Alignment:
| Q |
147 |
tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15358943 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata |
15359020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 38424365 - 38424466
Alignment:
| Q |
147 |
tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| || ||| || |||||||| ||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
38424365 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataaccagagcacgaat |
38424464 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
38424465 |
tt |
38424466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16570236 - 16570132
Alignment:
| Q |
17 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||| ||| |||| | |||||||||| | || ||| | ||||||| | ||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
16570236 |
atgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcata |
16570137 |
T |
 |
| Q |
117 |
attca |
121 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
16570136 |
attca |
16570132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Original strand, 16595426 - 16595530
Alignment:
| Q |
17 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||| ||| |||| | |||||||||| | || ||| | ||||||| | ||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
16595426 |
atgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcata |
16595525 |
T |
 |
| Q |
117 |
attca |
121 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
16595526 |
attca |
16595530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25292228 - 25292173
Alignment:
| Q |
361 |
gctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaa |
417 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
25292228 |
gcttcaatttagctcctaagcttaccc-aattgattcctcaagttcttctcttcaaa |
25292173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 127
Target Start/End: Original strand, 31501196 - 31501300
Alignment:
| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
31501196 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
31501295 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt |
127 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
31501296 |
caatt |
31501300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 45149625 - 45149689
Alignment:
| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatc |
87 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45149625 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatc |
45149689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626003
Alignment:
| Q |
3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626377 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac |
14626278 |
T |
 |
| Q |
103 |
aacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626277 |
aacaacttagcataattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
14626178 |
T |
 |
| Q |
203 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||| ||||||| || ||| | ||| || |
|
|
| T |
14626177 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcaca-attcaaacaacatttgagaatttgtaaagtga |
14626079 |
T |
 |
| Q |
303 |
acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14626078 |
agatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
14626003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650022
Alignment:
| Q |
3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1650352 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
1650253 |
T |
 |
| Q |
103 |
aacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
202 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650252 |
cataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
1650153 |
T |
 |
| Q |
203 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
1650152 |
aattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---tt |
1650056 |
T |
 |
| Q |
303 |
acatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650055 |
acatgattatgataaagactaacccccttacctt |
1650022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657579
Alignment:
| Q |
10 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaact |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
1657999 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact |
1657901 |
T |
 |
| Q |
110 |
tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1657900 |
tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
1657801 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgtaaaa |
297 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||| || || | |
|
|
| T |
1657800 |
gcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaata |
1657701 |
T |
 |
| Q |
298 |
attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattc |
397 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1657700 |
aatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc |
1657601 |
T |
 |
| Q |
398 |
ctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1657600 |
ctcaagctattctcttcaaaac |
1657579 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 25175565 - 25175944
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
25175565 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
25175664 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
25175665 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
25175764 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25175765 |
atcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaaat |
25175864 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccct-acctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||| |
|
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tatacatgattatggtaatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctccta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27654233 - 27653856
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Q |
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T |
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| Q |
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acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27654133 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
27654034 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
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|
| T |
27654033 |
atcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaat |
27653935 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27653934 |
tacacatgattatgataatcactaaccccctcacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
27653856 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 419
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862903
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10 |
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109 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| || |||| |||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
110 |
tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
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||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862582 |
tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
15862681 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgtaaaa |
297 |
Q |
| |
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| T |
15862682 |
gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaata |
15862781 |
T |
 |
| Q |
298 |
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397 |
Q |
| |
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| T |
15862782 |
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15862881 |
T |
 |
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398 |
ctcaagctattctcttcaaaac |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
15862882 |
ctcaagctattctcttcaaaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 1556142 - 1556426
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Q |
| |
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| T |
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
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T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1556242 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacc |
1556341 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16826004 - 16825678
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Q |
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|
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T |
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| Q |
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acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatca--tacaatta |
197 |
Q |
| |
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| T |
16825904 |
acaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaacta |
16825805 |
T |
 |
| Q |
198 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaa |
297 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16825804 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaa |
16825706 |
T |
 |
| Q |
298 |
attgtacatgattatgataataactaac |
325 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
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16825705 |
attacacatgattatgataatcactaac |
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T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 19610186 - 19610439
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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cccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgcttt |
365 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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cccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc |
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T |
 |
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366 |
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419 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
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19610386 |
aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctcttctctccaaaac |
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T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 248
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153696
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10 |
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109 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |
|
|
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23153458 |
catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
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T |
 |
| Q |
110 |
tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23153558 |
tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
23153657 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttag |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23153658 |
gcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttag |
23153696 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35009700 - 35009450
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
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tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattca |
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T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009600 |
acaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
35009501 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009500 |
tcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaa |
35009450 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 16232029 - 16232311
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| Q |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16232029 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
16232128 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16232129 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
16232228 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
16232229 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa--gtcacccacttgattcctaaagctcttctctccaaaac |
16232311 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 23977906 - 23978190
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| Q |
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||| |
|
|
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23977906 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaa |
23978005 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23978006 |
gagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttacc |
23978105 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
23978106 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
23978190 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 137 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18086942 - 18086698
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||| |
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|
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa |
18086843 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18086842 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttacc |
18086743 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaa |
379 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
18086742 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa |
18086698 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22225857 - 22225588
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||| || |
|
|
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22225857 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaa |
22225758 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22225757 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacc |
22225658 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22225657 |
tttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct |
22225588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16376492 - 16376223
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137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16376492 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
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T |
 |
| Q |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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| T |
16376392 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
16376293 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
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||||||| |||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16376292 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct |
16376223 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16383816 - 16383547
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234 |
Q |
| |
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| T |
16383816 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
16383717 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16383716 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
16383617 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16383616 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct |
16383547 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 172 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251416
Alignment:
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172 |
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Q |
| |
|
|||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
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22251648 |
taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt |
22251549 |
T |
 |
| Q |
272 |
ttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattca |
371 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22251548 |
ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca |
22251449 |
T |
 |
| Q |
372 |
gctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
|
|||||| | | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22251448 |
gctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct |
22251416 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 10488836 - 10489079
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10488836 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
10488935 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488936 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
10489035 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
10489036 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
10489079 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16556258 - 16556015
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16556258 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcag |
16556159 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16556158 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
16556059 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
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||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
16556058 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
16556015 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16632814 - 16632571
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| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| |||||||||| |
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|
| T |
16632814 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcag |
16632715 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16632714 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
16632615 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16632614 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
16632571 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 19299375 - 19299617
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| Q |
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235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||||| || |||||||||||| || | || ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
19299375 |
ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag |
19299474 |
T |
 |
| Q |
236 |
agcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacct |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19299475 |
agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct |
19299574 |
T |
 |
| Q |
336 |
ttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19299575 |
ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
19299617 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 417
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666294
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67 |
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164 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||| || |
|
|
| T |
29665941 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatgcatactttg |
29666039 |
T |
 |
| Q |
165 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatca |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
29666040 |
aaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatca |
29666139 |
T |
 |
| Q |
265 |
acccattttcatacaac-atgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgct |
363 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||| || || |||||||| || | || ||| |
|
|
| T |
29666140 |
ccccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccacttatgttagataatgattaatccaaacttaggct |
29666239 |
T |
 |
| Q |
364 |
ttaattcagctcctaatcttaccccaa-ttgattcctcaagctattctcttcaaa |
417 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
29666240 |
tcaatttagctcctaagctcaccccaatttgattcttcaagctcttctctccaaa |
29666294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13620913 - 13620712
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| Q |
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
13620913 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaa |
13620814 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13620813 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacc |
13620714 |
T |
 |
| Q |
335 |
tt |
336 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
13620713 |
tt |
13620712 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 168 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 29869861 - 29869613
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267 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| ||| || | | || || | ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
29869861 |
catgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaa-acagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc |
29869763 |
T |
 |
| Q |
268 |
cattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaa |
367 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
29869762 |
cattttcatacaacatgagaagatgtaaaattttaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaa |
29869663 |
T |
 |
| Q |
368 |
ttcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
29869662 |
ttcagctcctaa--gtcacccacttgattcctaaagctcttctctccaaaac |
29869613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991510
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305 |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4991396 |
atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaatt-attcctcaag |
4991494 |
T |
 |
| Q |
404 |
ctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
4991495 |
ctattctcttcaaaac |
4991510 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 27740840 - 27741021
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||| | | | ||||||||| |||| |||||| ||||||| | | |
|
|
| T |
27740840 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca |
27740939 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataatt--gaacatgtaatttcacc |
181 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27740940 |
acaacgacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatacttcgaaacatgtaatttcacc |
27741021 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 249
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751675
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| Q |
177 |
tcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc |
249 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27751603 |
tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagc |
27751675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 366 - 419
Target Start/End: Original strand, 16240402 - 16240455
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| Q |
366 |
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419 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16240402 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 19854319 - 19854402
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18629692 - 18629608
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
18629692 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 29160534 - 29160423
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16 |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |
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|
| T |
29160534 |
tatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcgcaaatcaacaacaacatagcac |
29160435 |
T |
 |
| Q |
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aattcaccaatt |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
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aattcaacaatt |
29160423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 34966890 - 34967114
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23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
34966890 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaa |
34966989 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt-gcacacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | |||| |||| || |||| |||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
34966990 |
caattagagtacaa--ttcacaatatatctttttcacatactatgaacatgcaatttcacgaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaac |
34967087 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34967088 |
atatcatcataacaagagcacgaattt |
34967114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17083298 - 17083200
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| Q |
147 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
17083298 |
tatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
17083200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Original strand, 29605614 - 29605672
Alignment:
| Q |
164 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
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||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29605614 |
tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacata |
29605672 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 16887876 - 16887792
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
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16887876 |
ttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt |
16887792 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16814930 - 16814872
Alignment:
| Q |
320 |
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378 |
Q |
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|
|||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
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|
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16814930 |
actaaccctcttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
16814872 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17557101 - 17557017
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
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17557101 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-caaacatatcatcataattagagcacgaattta |
17557017 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
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Query Start/End: Original strand, 163 - 222
Target Start/End: Original strand, 25651400 - 25651460
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
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|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |
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25651400 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata |
25651460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35136096 - 35136013
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
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35136096 |
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35136013 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14842822 - 14842405
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14842822 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
14842723 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14842722 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatct |
14842623 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14842622 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaca-attcatacaacatttgagaatttgcaaagt |
14842524 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctc |
400 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
14842523 |
gaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgatccctc |
14842424 |
T |
 |
| Q |
401 |
aagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14842423 |
aagctattctcttcaaaac |
14842405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15936888 - 15936553
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15936888 |
tcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
15936789 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15936788 |
acaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
15936689 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15936688 |
tcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt |
15936589 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15936588 |
gaacatgattataatgataactaacccccatacctt |
15936553 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938395
Alignment:
| Q |
2 |
catcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaa |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15938729 |
catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa |
15938630 |
T |
 |
| Q |
102 |
caacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15938629 |
caacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
15938530 |
T |
 |
| Q |
202 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattg |
301 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15938529 |
caattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg |
15938430 |
T |
 |
| Q |
302 |
tacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15938429 |
aacatgattataatgataactaacccccttacctt |
15938395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 55316221 - 55316598
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
55316221 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta |
55316320 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
55316321 |
acaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac |
55316420 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
55316421 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat |
55316520 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaa |
379 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
55316521 |
--tacatgattgtgataataactaacccctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaa |
55316598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615168
Alignment:
| Q |
3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
15614838 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
15614937 |
T |
 |
| Q |
103 |
aacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
202 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15614938 |
aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatc |
15615037 |
T |
 |
| Q |
203 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgt |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
15615038 |
aattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---tt |
15615134 |
T |
 |
| Q |
303 |
acatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15615135 |
acatgattatgataaagactaacccccttacctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 16821141 - 16821556
Alignment:
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | |
|
|
| T |
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tcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca |
16821240 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821241 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
16821340 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
16821341 |
atcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa-- |
16821438 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcct |
399 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16821439 |
-ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattctt |
16821536 |
T |
 |
| Q |
400 |
caagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16821537 |
caagttattcccttcaaaac |
16821556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 415
Target Start/End: Original strand, 41270077 - 41270488
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
41270077 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta |
41270176 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
41270177 |
acaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaac |
41270276 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
41270277 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaat |
41270376 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcct |
399 |
Q |
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| T |
41270377 |
--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaa--gtcacccacttgattcct |
41270472 |
T |
 |
| Q |
400 |
caagctattctcttca |
415 |
Q |
| |
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|
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| T |
41270473 |
aaagctcttctcttca |
41270488 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51158276 - 51158029
Alignment:
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4 |
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103 |
Q |
| |
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|
| T |
51158276 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
51158177 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
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| T |
51158176 |
acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
51158077 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
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| T |
51158076 |
attcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
51158029 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 18911130 - 18911414
Alignment:
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137 |
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234 |
Q |
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18911130 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa |
18911229 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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| T |
18911230 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
18911329 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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|
| T |
18911330 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
18911414 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15859285 - 15859035
Alignment:
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100 |
Q |
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|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | | |
|
|
| T |
15859285 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattca |
15859186 |
T |
 |
| Q |
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15859185 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
15859086 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
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| T |
15859085 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
15859035 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15468594 - 15468175
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15468594 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttca |
15468495 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
198 |
Q |
| |
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| | ||| || |||| |||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || || |
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| T |
15468494 |
atcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataattt-catgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataat |
15468396 |
T |
 |
| Q |
199 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
298 |
Q |
| |
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| T |
15468395 |
catcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat |
15468296 |
T |
 |
| Q |
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ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcc |
398 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15468295 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcc |
15468196 |
T |
 |
| Q |
399 |
tcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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|
| T |
15468195 |
tcaagctattctcttcaaaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 25058876 - 25059160
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
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|
| T |
25058876 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
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T |
 |
| Q |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25058976 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacc |
25059075 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25059076 |
tttgaagaagattaaccctaatttttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 2049812 - 2050062
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Q |
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|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2049812 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaatta |
2049911 |
T |
 |
| Q |
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2049912 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatca |
2050011 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
2050012 |
tcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaa |
2050062 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12030408 - 12030158
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
12030408 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaatta |
12030309 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12030308 |
acaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatca |
12030209 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12030208 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
12030158 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 417
Target Start/End: Original strand, 22275211 - 22275627
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| Q |
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Q |
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|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||||||||| || | |||| | |||||| | | |
|
|
| T |
22275211 |
tcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttca |
22275310 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
198 |
Q |
| |
|
| | ||| || |||| |||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
22275311 |
atcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataattt-catgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataat |
22275409 |
T |
 |
| Q |
199 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22275410 |
catcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat |
22275509 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcc |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22275510 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaacttttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcc |
22275608 |
T |
 |
| Q |
399 |
tcaagctattctcttcaaa |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |
|
|
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22275609 |
tcaagctattcccttcaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 168 - 419
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catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacc |
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| |
|
||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18897130 |
catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc |
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T |
 |
| Q |
268 |
cattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaa |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
18897030 |
cattttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaa |
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T |
 |
| Q |
368 |
ttcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18896930 |
ttcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839146
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
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catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
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T |
 |
| Q |
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tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13839005 |
tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat |
13839104 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13839105 |
gcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
13839146 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 139 - 419
Target Start/End: Original strand, 5228452 - 5228733
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tcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
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5228452 |
tcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaaga |
5228551 |
T |
 |
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gcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
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|
| T |
5228552 |
gcacgaatttagcaacaat-gttcatcaacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
5228650 |
T |
 |
| Q |
337 |
tgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
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|
| T |
5228651 |
agaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
5228733 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12265047 - 12264668
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
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Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||| | || ||||||||| |||| | | | ||||||||| |||| |||||| |||||| | | |
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|
| T |
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tcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttca |
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 |
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acaacaacttagcaaaatt-caccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
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| |
|
|||||||| || ||||||| || ||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || | |
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| T |
12264947 |
acaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatct-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa |
12264849 |
T |
 |
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198 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
12264749 |
T |
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298 |
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378 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12264748 |
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12264668 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 137 - 375
Target Start/End: Original strand, 49232573 - 49232813
Alignment:
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137 |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
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49232672 |
T |
 |
| Q |
235 |
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334 |
Q |
| |
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| T |
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49232772 |
T |
 |
| Q |
335 |
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375 |
Q |
| |
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| T |
49232773 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 419
Target Start/End: Original strand, 54651558 - 54651879
Alignment:
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100 |
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197 |
Q |
| |
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||||||||| || |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
54651558 |
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54651656 |
T |
 |
| Q |
198 |
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297 |
Q |
| |
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|
| T |
54651657 |
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54651756 |
T |
 |
| Q |
298 |
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396 |
Q |
| |
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| T |
54651757 |
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54651856 |
T |
 |
| Q |
397 |
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419 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||| |||||| |
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|
| T |
54651857 |
catcaagctcttctctccaaaac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17912742 - 17912494
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
17912642 |
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T |
 |
| Q |
201 |
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251 |
Q |
| |
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| T |
17912543 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaa |
17912494 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1467858 - 1467615
Alignment:
| Q |
137 |
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234 |
Q |
| |
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| T |
1467858 |
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1467759 |
T |
 |
| Q |
235 |
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334 |
Q |
| |
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| T |
1467758 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
1467659 |
T |
 |
| Q |
335 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
1467658 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12902209 - 12902008
Alignment:
| Q |
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
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| T |
12902209 |
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T |
 |
| Q |
235 |
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334 |
Q |
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| T |
12902109 |
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12902010 |
T |
 |
| Q |
335 |
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336 |
Q |
| |
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|| |
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12902009 |
tt |
12902008 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 12811979 - 12812221
Alignment:
| Q |
138 |
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235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||| |||||||| |
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|
| T |
12811979 |
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12812078 |
T |
 |
| Q |
236 |
agcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacct |
335 |
Q |
| |
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| T |
12812079 |
agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct |
12812178 |
T |
 |
| Q |
336 |
ttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
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| T |
12812179 |
ttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
12812221 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13975979 - 13975733
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104 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| |||| | |
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| T |
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13975880 |
T |
 |
| Q |
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203 |
Q |
| |
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| T |
13975879 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaaca |
13975780 |
T |
 |
| Q |
204 |
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251 |
Q |
| |
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| T |
13975779 |
attcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa |
13975733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 45860811 - 45861057
Alignment:
| Q |
5 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaa |
104 |
Q |
| |
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| T |
45860811 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatga |
45860910 |
T |
 |
| Q |
105 |
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203 |
Q |
| |
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| T |
45860911 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaaca |
45861010 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
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| T |
45861011 |
attcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa |
45861057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13955147 - 13954901
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caatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaa |
104 |
Q |
| |
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| T |
13955147 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatga |
13955048 |
T |
 |
| Q |
105 |
caacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
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| T |
13955047 |
caacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaaca |
13954948 |
T |
 |
| Q |
204 |
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251 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
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|
| T |
13954947 |
attcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa |
13954901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16744375 - 16744130
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | | |||||||||| |||||||||| | ||||| | | |
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|
| T |
16744375 |
tcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca |
16744276 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
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|| | ||| | |||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |
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| T |
16744275 |
actataacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttatta |
16744177 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
16744176 |
tcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492810
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305 |
atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
23492696 |
atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttacccaaattgattcctcaagc |
23492795 |
T |
 |
| Q |
405 |
tattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
23492796 |
tattctcttcaaaac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2449369 - 2449249
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cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
2449369 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
2449270 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2449269 |
gttggagcacgaatttagcaa |
2449249 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 5 - 247
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104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||| | | ||||||||| |||| |||||| || || | ||||| |
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|
| T |
11986424 |
caatccatgaatatgcatacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaa |
11986325 |
T |
 |
| Q |
105 |
caacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
11986324 |
caacttagcaaaattcactatttgagcacaattt-cataacttgacattaatacatactttaaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatt |
11986226 |
T |
 |
| Q |
203 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
11986225 |
aaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattta |
11986181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 44228987 - 44229336
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Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||| | || ||||||||| |||| | | ||||| | ||| |||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
44228987 |
tcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcatttta |
44229086 |
T |
 |
| Q |
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
198 |
Q |
| |
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|||||||| || ||| |||||| ||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||| | |||| ||||| || || |
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|
| T |
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44229185 |
T |
 |
| Q |
199 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaaatgtaaaa |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
44229186 |
catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaa |
44229284 |
T |
 |
| Q |
298 |
attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
44229285 |
atttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaa |
44229336 |
T |
 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
47984652 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatcca |
47984751 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
47984752 |
acaacaacttagca |
47984765 |
T |
 |
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1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
48003226 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatcca |
48003325 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
48003326 |
acaacaacttagca |
48003339 |
T |
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Target: chr3; HSP #36
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1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
47993939 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatcca |
47994038 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
47994039 |
acaacaacttagca |
47994052 |
T |
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Target: chr3; HSP #37
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
48012512 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatcca |
48012611 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
48012612 |
acaacaacttagca |
48012625 |
T |
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catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccc |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8268683 |
catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttaccc |
8268600 |
T |
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Target: chr3; HSP #39
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| Q |
304 |
catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccc |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8275783 |
catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttaccc |
8275700 |
T |
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Target: chr3; HSP #40
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244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41661711 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaat |
41661810 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
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|
|| |
|
|
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41661811 |
tt |
41661812 |
T |
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tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
31412434 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaat |
31412335 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
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31412334 |
tt |
31412333 |
T |
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16 |
tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaa |
115 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16880139 |
tatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcat |
16880238 |
T |
 |
| Q |
116 |
aatt |
119 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
16880239 |
aatt |
16880242 |
T |
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147 |
tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
4145914 |
tatcattttcacatactatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacata |
4145838 |
T |
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| Q |
162 |
attgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
3576523 |
attgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatca |
3576456 |
T |
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atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||| | ||| ||| | | ||||||| ||||| | |
|
|
| T |
17100670 |
atgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcata |
17100769 |
T |
 |
| Q |
117 |
attcaccaattg |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
17100770 |
attcaccaattg |
17100781 |
T |
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17 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||| | ||| ||| | | ||||||| ||||| | |
|
|
| T |
17101355 |
atgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcata |
17101454 |
T |
 |
| Q |
117 |
attcaccaattg |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
17101455 |
attcaccaattg |
17101466 |
T |
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Target: chr3; HSP #47
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ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatt |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
47784850 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
47784767 |
T |
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17 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | |||||||||| | || ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
11329191 |
atgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcata |
11329092 |
T |
 |
| Q |
117 |
attcaccaatt |
127 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
11329091 |
attcaacaatt |
11329081 |
T |
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atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19231979 |
atcatcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
19232033 |
T |
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ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30207379 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
30207445 |
T |
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tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| |
|
|
| T |
6228726 |
tatcattttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacata |
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T |
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395 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| || | || |||| |||| ||||||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
11986120 |
aattgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaatttgat |
11986021 |
T |
 |
| Q |
396 |
tcctcaagctattctcttcaaa |
417 |
Q |
| |
|
|| |||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
11986020 |
tcttcaaactcttctctccaaa |
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T |
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
13301552 |
tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatca |
13301487 |
T |
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| Q |
164 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
13312208 |
tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatca |
13312143 |
T |
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303 |
acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaa--ttgattcctc |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| || || |||| ||||||| || |
|
|
| T |
17912432 |
acatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccacctcaggcttcaatttagctcctaagctcactccaaccttgattcttc |
17912333 |
T |
 |
| Q |
401 |
aagct |
405 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
17912332 |
aagct |
17912328 |
T |
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tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca-tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
50313333 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaat |
50313432 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
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tt |
50313434 |
T |
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163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
14080672 |
ttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
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Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
17191704 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
17191788 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #59
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| Q |
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ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
17204928 |
T |
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Target: chr3; HSP #60
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Q |
| |
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|
|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
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Target Start/End: Original strand, 34560062 - 34560122
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
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34560062 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata |
34560122 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
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Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9253
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102 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
9497 |
T |
 |
| Q |
103 |
aacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
202 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9496 |
aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
9397 |
T |
 |
| Q |
203 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgt |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |
|
|
| T |
9396 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---tt |
9300 |
T |
 |
| Q |
303 |
acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
9299 |
acatgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaa |
9253 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16151
Alignment:
| Q |
3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16494 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
16395 |
T |
 |
| Q |
103 |
aacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
202 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16394 |
aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
16295 |
T |
 |
| Q |
203 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgt |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |
|
|
| T |
16294 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---tt |
16198 |
T |
 |
| Q |
303 |
acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
16197 |
acatgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaa |
16151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 107749 - 108084
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
107749 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
107848 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
107849 |
acaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
107948 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
107949 |
tcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt |
108048 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108049 |
gaacatgattataatgataactaacccccttacctt |
108084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 64774 - 64362
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5 |
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104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
64774 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaa |
64675 |
T |
 |
| Q |
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caacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
64674 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatca |
64575 |
T |
 |
| Q |
204 |
at-----tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
298 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
64574 |
atataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaa |
64475 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcc |
398 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
64474 |
t--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa--gtcacccacttgattcc |
64379 |
T |
 |
| Q |
399 |
tcaagctattctcttca |
415 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
64378 |
ttaagctcttctcttca |
64362 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 47357656 - 47358071
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
47357656 |
tcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
47357755 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
47357756 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
47357855 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
47357856 |
atcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaaa-- |
47357953 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcct |
399 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357954 |
-ttacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaaccc-aactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcct |
47358051 |
T |
 |
| Q |
400 |
caagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
47358052 |
taagctcttctctccaaaac |
47358071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 10644221 - 10644566
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | |
|
|
| T |
10644221 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca |
10644320 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644321 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatc |
10644420 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
10644421 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa-- |
10644518 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta |
348 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10644519 |
-ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgatta |
10644566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15675350 - 15675100
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | |
|
|
| T |
15675350 |
tcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca |
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T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15675250 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
15675151 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15675150 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
15675100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7132184 - 7131900
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||| |
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|
| T |
7132184 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa |
7132085 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7132084 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
7131985 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7131984 |
ttagaagaagattaatccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 18169107 - 18169389
Alignment:
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137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18169107 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
18169206 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18169207 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
18169306 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18169307 |
-ttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
18169389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54118505 - 54118255
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| Q |
1 |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || || || |
|
|
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54118505 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatcta |
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T |
 |
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101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
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| T |
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
54118306 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
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| T |
54118305 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 13246435 - 13246662
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T |
 |
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203 |
Q |
| |
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| T |
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13246634 |
T |
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204 |
attcatgcatacaaacataacatcacag |
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Q |
| |
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attcatgcatacaaacatatcatcacag |
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T |
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Target: chr4; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17145911 - 17145492
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Q |
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T |
 |
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198 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
199 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
298 |
Q |
| |
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| T |
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catcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa |
17145613 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcc |
398 |
Q |
| |
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| T |
17145612 |
ttgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttacttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcc |
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T |
 |
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399 |
tcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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tcaagctattctcttcaaaac |
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Target: chr4; HSP #9
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Q |
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T |
 |
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101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31115731 |
acaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
31115830 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacag |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |
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Q |
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T |
 |
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334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
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419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
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|
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Q |
| |
|
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T |
 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
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T |
 |
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335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
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T |
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Q |
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|
|||||||||||||||| |||| ||||| || | |||| ||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
266 |
cccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgcttt |
365 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
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cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc |
15294243 |
T |
 |
| Q |
366 |
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379 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
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aattcagctcctaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #13
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|
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aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattga |
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T |
 |
| Q |
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acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
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|
|
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acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaa |
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Q |
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|
|
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tcatcaatcgataattatgtataccaaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttca |
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T |
 |
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198 |
Q |
| |
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|||||||| || ||||||||| ||||| | ||||| |||| |||| ||||| |||||| || |||||||||||||| | |||| ||||| || || |
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|
| T |
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acaacaacatattaaaattcactaattgagtataattt-catatcttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataat |
18248418 |
T |
 |
| Q |
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catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
298 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18248419 |
cctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
18248518 |
T |
 |
| Q |
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ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaa |
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Q |
| |
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|
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|
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|
|
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
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T |
 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacc |
19020822 |
T |
 |
| Q |
335 |
tt |
336 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
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tt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | |||||||||| |||||||||| | ||||| | | |
|
|
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T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
26680303 |
actacaacatgtcaaa-ttcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatta |
26680401 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa |
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Target: chr4; HSP #17
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|
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|
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T |
 |
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catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
298 |
Q |
| |
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catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccat-aagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
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T |
 |
| Q |
299 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
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| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||| | ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||| |
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca |
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T |
 |
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acttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
205 |
Q |
| |
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|||||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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T |
 |
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tcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
| |
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|
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Target: chr4; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 22352182 - 22351901
Alignment:
| Q |
137 |
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234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| ||| || | | || || | ||| |
|
|
| T |
22352182 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaa-acagcaacataacaa |
22352084 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22352083 |
gagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttacc |
22351984 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
22351983 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa--gtcacccacttgattcctaaagctcttctctccaaaac |
22351901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 418
Target Start/End: Original strand, 26339157 - 26339439
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacata-attgaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||| | ||| || | | || || | ||| |
|
|
| T |
26339157 |
tttcacaacttgacatttatacatagattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaa-acagcaacataacaa |
26339255 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26339256 |
gagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttacc |
26339355 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaa |
418 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| ||||| |
|
|
| T |
26339356 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaa |
26339439 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 304 - 419
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996559
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| Q |
304 |
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403 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14996444 |
catgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaaacttaccccaattgattcctcaag |
14996543 |
T |
 |
| Q |
404 |
ctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
14996544 |
ctattctcttcaaaac |
14996559 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Original strand, 111400 - 111484
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| Q |
4 |
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88 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
111400 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca |
111484 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 22738437 - 22738620
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| Q |
166 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| |
|
|
| T |
22738437 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcag |
22738536 |
T |
 |
| Q |
266 |
cccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | || |||||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
22738537 |
cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaattgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaa |
22738620 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
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| Q |
67 |
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165 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| || | |
|
|
| T |
40885749 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatactttg |
40885651 |
T |
 |
| Q |
166 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacag |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
40885650 |
aacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag |
40885585 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Original strand, 10488694 - 10488814
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
10488694 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
10488793 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488794 |
gttggagcacgaatttagcaa |
10488814 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16328057 - 16327937
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
16328057 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
16327958 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16327957 |
gttggagcacgaatttagcaa |
16327937 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 7850005 - 7850228
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| Q |
5 |
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104 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||| ||||| | ||| ||||||| | ||||| |
|
|
| T |
7850005 |
caattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaacaacatactcctttaacaacaacaacatcaatgaaacacaattcatatctcaattcaacaa |
7850104 |
T |
 |
| Q |
105 |
caacttagcaaaatt-caccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
7850105 |
tcacttagcaaaatttcatcacttgagcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatcacacagttttcatca |
7850204 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatc |
227 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7850205 |
atacattcattcaaacataacatc |
7850228 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 336
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
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| Q |
261 |
atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9795490 |
atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
9795564 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18238381 - 18238157
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| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
18238381 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
18238282 |
T |
 |
| Q |
123 |
caattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat-tcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||| || || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
18238281 |
caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaac |
18238184 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18238183 |
atatcatcataacaagagcacgaattt |
18238157 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952197
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| Q |
305 |
atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
14952085 |
atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa--gtcacccacttgattcctaaagc |
14952182 |
T |
 |
| Q |
405 |
tattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| |
|
|
| T |
14952183 |
tcttctctccaaaac |
14952197 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 8374510 - 8374722
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||| |||||||||| || ||||| | || ||||||||| |||| | | | ||||||||| |||| |||||| |||||| | | |
|
|
| T |
8374510 |
tcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttca |
8374609 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataatt-gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
8374610 |
acaacaacatattaaaattcactaattgagtataattt-cataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacataccataat |
8374708 |
T |
 |
| Q |
199 |
catcaattcatgca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
8374709 |
catcaattcatgca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
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189 |
atacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33240890 |
atacaatcatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #34
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| Q |
294 |
aaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
8378482 |
aaaaattgtacatgattatgataataactaatccccttaccttagatgatgtttaa |
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T |
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Back To:
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac |
44 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104492 |
tcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac |
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T |
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Back To:
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15044991 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
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T |
 |
Back To:
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15109433 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
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T |
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16 |
tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaaca |
81 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||| |
|
|
| T |
41166177 |
tatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaaca |
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T |
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acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13590298 |
acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
13590199 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt |
127 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
13590198 |
caatt |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
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acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | || |||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
15013506 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaa |
15013407 |
T |
 |
| Q |
123 |
caattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
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| T |
15013406 |
caatttgagcataatt--cacaatatgtcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattc-aac |
15013310 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
|
||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
15013309 |
atatcatcataattagagcacgaattta |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 40905034 - 40904934
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Q |
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atcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatt |
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T |
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246 |
t |
246 |
Q |
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t |
40904934 |
T |
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Target: chr4; HSP #42
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244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
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| T |
47468449 |
tatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaat |
47468350 |
T |
 |
| Q |
245 |
t |
245 |
Q |
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|
| |
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47468349 |
t |
47468349 |
T |
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116 |
Q |
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atgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgaccatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcata |
12837331 |
T |
 |
| Q |
117 |
attcaccaattg |
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Q |
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|||||||||||| |
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attcaccaattg |
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T |
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Target: chr4; HSP #44
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Q |
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|||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
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tgaacatgcaatttcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
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T |
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116 |
Q |
| |
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30232726 |
atgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcata |
30232627 |
T |
 |
| Q |
117 |
attcaccaattg |
128 |
Q |
| |
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|||||||||||| |
|
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30232626 |
attcaccaattg |
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T |
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acataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
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acatacttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca |
7964730 |
T |
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Target: chr4; HSP #47
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17 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaa |
116 |
Q |
| |
|
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| T |
13809740 |
atgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcata |
13809641 |
T |
 |
| Q |
117 |
attca |
121 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
13809640 |
attca |
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T |
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Target: chr4; HSP #48
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246 |
Q |
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|
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18276597 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattt |
18276681 |
T |
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Target: chr4; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 163 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47535149 - 47535065
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
47535149 |
ttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
47535065 |
T |
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Target: chr4; HSP #50
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Target Start/End: Original strand, 54398406 - 54398510
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23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
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| T |
54398406 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaa |
54398505 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt |
127 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
54398506 |
caatt |
54398510 |
T |
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Target: scaffold0175 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1216 - 801
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Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-tta |
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T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1117 |
acaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
1018 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
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|
| T |
1017 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaca-attcatacaacatttgagaatttgtaaagt |
919 |
T |
 |
| Q |
301 |
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400 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
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| T |
918 |
gaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaactcttgattcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctc |
819 |
T |
 |
| Q |
401 |
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418 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
818 |
aagctattcccttcaaaa |
801 |
T |
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Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 29188486 - 29188159
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
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aacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaactt |
29188387 |
T |
 |
| Q |
148 |
atcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
29188386 |
atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatcta |
29188287 |
T |
 |
| Q |
248 |
gcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatt |
347 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29188286 |
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29188190 |
T |
 |
| Q |
348 |
aaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29188189 |
atctctaacccttgcttcaattcagctccta |
29188159 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 419
Target Start/End: Original strand, 27009847 - 27010258
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caatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaa |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaa |
27009946 |
T |
 |
| Q |
105 |
caacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27009947 |
caacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatca |
27010046 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
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attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--ta |
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T |
 |
| Q |
304 |
catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaag |
403 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
404 |
ctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||| |
|
|
| T |
27010243 |
ctcttctctccaaaac |
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Target: chr5; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 25426630 - 25427008
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
25426630 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
25426729 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
25426730 |
acaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
25426829 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25426830 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaat |
25426928 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccct-acctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25426929 |
tacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctccta |
25427008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18778242 - 18777865
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
18778242 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
18778143 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
18778142 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
18778043 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18778042 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaat |
18777944 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18777943 |
tacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttaattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
18777865 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22366731 - 22366354
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| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
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Q |
| |
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|
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Q |
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22366532 |
T |
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299 |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 19499901 - 19500302
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T |
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T |
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T |
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199 |
Q |
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T |
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atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
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T |
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T |
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Target: chr5; HSP #9
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T |
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 |
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Q |
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Target: chr5; HSP #10
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Q |
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|
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T |
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tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
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Target: chr5; HSP #11
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T |
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Q |
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atcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatg-caaaat |
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T |
 |
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tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 35791215 - 35790933
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gcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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|
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|
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Q |
| |
|
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|
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
18531129 |
T |
 |
| Q |
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tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
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Q |
| |
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18531128 |
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
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T |
 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
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Q |
| |
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gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacc |
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T |
 |
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tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
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Q |
| |
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ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagttattctcttcaaaac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 1 - 419
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11212319 |
tcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatccacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttca |
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T |
 |
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101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
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Q |
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| T |
11212219 |
acaacaacatattaaaattcactacttgagtataattt-cataacttaacatttatacacactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataat |
11212121 |
T |
 |
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catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
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Q |
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| T |
11212120 |
catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa |
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T |
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11212020 |
ttgaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattttgatt |
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cctcaagctattctcttcaaaac |
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Q |
| |
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| ||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
11211921 |
cttcaagctattcccttcaaaac |
11211899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22054094 - 22053844
Alignment:
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Q |
| |
|
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tcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca |
22053995 |
T |
 |
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
22053994 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatca |
22053895 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
22053894 |
tcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
22053844 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27182808 - 27182558
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1 |
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100 |
Q |
| |
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27182808 |
tcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatcta |
27182709 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
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| T |
27182708 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatca |
27182609 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
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| T |
27182608 |
tcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaa |
27182558 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17471842 - 17471426
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
17471842 |
tcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatcttatttca |
17471743 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataatt--gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
198 |
Q |
| |
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| | ||| || |||| |||| ||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || || |
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| T |
17471742 |
atcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataa-tttcattacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataat |
17471644 |
T |
 |
| Q |
199 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
298 |
Q |
| |
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| T |
17471643 |
catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaat |
17471544 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcc |
398 |
Q |
| |
|
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|
| T |
17471543 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcc |
17471445 |
T |
 |
| Q |
399 |
tcaagctattctcttcaaa |
417 |
Q |
| |
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17471444 |
tcaagctattcccttcaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939529
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109 |
Q |
| |
|
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catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact |
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T |
 |
| Q |
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tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
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|
| T |
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tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
34939487 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
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|
| T |
34939488 |
gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1219639 - 1219355
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| Q |
137 |
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234 |
Q |
| |
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| T |
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
1219540 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
| T |
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gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttacc |
1219440 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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| T |
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ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 137 - 379
Target Start/End: Original strand, 7425461 - 7425705
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234 |
Q |
| |
|
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|
| T |
7425461 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaa |
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T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
| T |
7425561 |
gagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
7425660 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaa |
379 |
Q |
| |
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| T |
7425661 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa |
7425705 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10778089 - 10777820
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| Q |
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
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T |
 |
| Q |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
| T |
10777989 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacc |
10777890 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
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|
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10777889 |
tttgaagatgattatccttaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccacttgattcctcaagct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21932500 - 21932231
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| Q |
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21932500 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
21932401 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21932400 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
21932301 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
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||||||| |||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21932300 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct |
21932231 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21938670 - 21938401
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
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|
| T |
21938670 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
21938571 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
| T |
21938570 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
21938471 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21938470 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 35582173 - 35582416
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
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|
| T |
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tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
35582272 |
T |
 |
| Q |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
35582372 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35582373 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
35582416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22883203 - 22882960
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tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| | | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
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|
| T |
22883203 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
22883104 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
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| T |
22883103 |
gagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttatc |
22883004 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
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||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
22883003 |
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22882960 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36989889 - 36989646
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137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| | |
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|
| T |
36989889 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcta |
36989790 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
36989789 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
36989690 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36989689 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 23328695 - 23328978
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Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||| | ||| || | | || || | ||| |
|
|
| T |
23328695 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaa-acagcaacataacaa |
23328793 |
T |
 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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23328794 |
gagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttacc |
23328893 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
23328894 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
23328978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 419
Target Start/End: Original strand, 24616395 - 24616582
Alignment:
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232 |
caagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccctt |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24616395 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24616494 |
T |
 |
| Q |
332 |
acctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
24616495 |
accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
24616582 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 419
Target Start/End: Original strand, 24712771 - 24712958
Alignment:
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232 |
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331 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24712771 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24712870 |
T |
 |
| Q |
332 |
acctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
24712871 |
accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
24712958 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 419
Target Start/End: Original strand, 24745789 - 24745976
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| Q |
232 |
caagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccctt |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24745789 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24745888 |
T |
 |
| Q |
332 |
acctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
24745889 |
accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
24745976 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Original strand, 20623101 - 20623221
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cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
20623101 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
20623200 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623201 |
gttggagcacgaatttagcaa |
20623221 |
T |
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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
21233659 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
21233560 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233559 |
gttggagcacgaatttagcaa |
21233539 |
T |
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Target: chr5; HSP #34
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
25900537 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
25900438 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900437 |
gttggagcacgaatttagcaa |
25900417 |
T |
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Target: chr5; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Original strand, 16536329 - 16536449
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
16536329 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
16536428 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16536429 |
gttggagcacgaatttagcaa |
16536449 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
37052876 |
cacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
37052975 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37052976 |
gttggagcacgaatttagcaa |
37052996 |
T |
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Target: chr5; HSP #37
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| Q |
4 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaaca |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||| |||| | | ||||||||| |||| |||||| ||||| | |||| |
|
|
| T |
32950698 |
tcaatccatgaatatgcagacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaaca |
32950797 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttat-catttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32950798 |
acaacatagtaaaattcaccatttgagcacaattt-cataactttgacctttatacatactttgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatca |
32950896 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
|
|||| |||| || || || |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32950897 |
tcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattta |
32950943 |
T |
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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 405
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106066
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305 |
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404 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16105967 |
atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc |
16106065 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 405
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343107
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| Q |
305 |
atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccct-acctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaag |
403 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11343008 |
atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctc-tgcttcaattcagctcct-aggtcaccccacttgattcctcaag |
11343105 |
T |
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Target: chr5; HSP #40
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147 |
tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26559916 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaat |
26559817 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
26559816 |
tt |
26559815 |
T |
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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
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| Q |
3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac |
44 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29190522 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac |
29190481 |
T |
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Target: chr5; HSP #42
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| Q |
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ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21310793 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
21310709 |
T |
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Target: chr5; HSP #43
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23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
21109773 |
acccaagctatgaatcatcaataacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaa |
21109872 |
T |
 |
| Q |
123 |
caattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||| || || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
21109873 |
caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattattaccaatttcatgtactcaaac |
21109970 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21109971 |
atatcatcagaacaagagcacgaattt |
21109997 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #44
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ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5450927 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #45
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| Q |
138 |
ttcataacttatcatttttacataatt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaag |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | || |
|
|
| T |
23981626 |
ttcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattag |
23981527 |
T |
 |
| Q |
236 |
agcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
23981526 |
agcacgaattt |
23981516 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr5; HSP #46
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
19862372 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19862456 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
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23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaaca |
81 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37983387 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattaaaca |
37983445 |
T |
 |
Back To:
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| Q |
164 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
22885806 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca |
22885871 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
164 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
29918129 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
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Target Start/End: Complemental strand, 21297259 - 21297175
Alignment:
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163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||| || |||| |||||||| |
|
|
| T |
21297259 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattt |
21297175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24225558 - 24225478
Alignment:
| Q |
6 |
aatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaat |
86 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
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24225558 |
aatccatgattatgaacacccaagttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaataacatcaattaaacatgaat |
24225478 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 419
Target Start/End: Original strand, 41 - 452
Alignment:
| Q |
5 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaa |
104 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41 |
caattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaa |
140 |
T |
 |
| Q |
105 |
caacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
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|
|
| T |
141 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatca |
240 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgta |
303 |
Q |
| |
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|
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| T |
241 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgag-caatgcaaaa---tta |
336 |
T |
 |
| Q |
304 |
catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaag |
403 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
337 |
catgattttgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactctcgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaag |
436 |
T |
 |
| Q |
404 |
ctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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|| | |||| |||||| |
|
|
| T |
437 |
ctctcctctccaaaac |
452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19886911 - 19886564
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
19886911 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
19886812 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
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| T |
19886811 |
acaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
19886712 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
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|
|
| T |
19886711 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaat |
19886613 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta |
348 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19886612 |
tacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgatta |
19886564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 336
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463074
Alignment:
| Q |
4 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaaca |
103 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
462743 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
462842 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
462843 |
acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatca |
462942 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| || | | |||||||||||| |||||| || ||| || |
|
|
| T |
462943 |
attcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat-aagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat |
463041 |
T |
 |
| Q |
304 |
catgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
463042 |
gatgattatgataaagactaacccccttacctt |
463074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7508105 - 7507758
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| || |
|
|
| T |
7508105 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa-tt |
7508007 |
T |
 |
| Q |
100 |
aacaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7508006 |
aacaacaacttagccaaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
7507907 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgaga |
287 |
Q |
| |
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||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |
|
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| T |
7507906 |
atcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaataattattcattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatgaga |
7507807 |
T |
 |
| Q |
288 |
aaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
|| || || || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7507806 |
aattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt |
7507758 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 16935730 - 16936014
Alignment:
| Q |
137 |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16935730 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
16935829 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16935830 |
gagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
16935929 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16935930 |
ttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
16936014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 17006390 - 17006674
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17006390 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
17006489 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17006490 |
gagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
17006589 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17006590 |
ttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
17006674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 42178088 - 42177804
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
42178088 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaa |
42177989 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42177988 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
42177889 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42177888 |
ttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagcccctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
42177804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20627571 - 20627328
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| Q |
4 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaaca |
103 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20627571 |
tcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaaca |
20627472 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20627471 |
acaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
20627372 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20627371 |
attcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta |
20627328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 8891247 - 8891494
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| Q |
4 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaaca |
103 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
8891247 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
8891346 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8891347 |
acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatca |
8891446 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8891447 |
attcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaa |
8891494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36982702 - 36982452
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| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||| | | |
|
|
| T |
36982702 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattca |
36982603 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36982602 |
acaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatca |
36982503 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36982502 |
tcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24341650 - 24341420
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | |
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|
| T |
24341650 |
tcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca |
24341551 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
24341550 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattatca |
24341451 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacag |
231 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24341450 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19794965 - 19794719
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| T |
19794965 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattca |
19794866 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
19794865 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatta |
19794766 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19794765 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta |
19794719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 12728529 - 12728813
Alignment:
| Q |
137 |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
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| T |
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12728628 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12728629 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
12728728 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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|
| T |
12728729 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
12728813 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25265651 - 25265224
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
25265651 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattca |
25265552 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25265551 |
acaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
25265452 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaa |
288 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25265451 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaa |
25265352 |
T |
 |
| Q |
289 |
aatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttacccc |
388 |
Q |
| |
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| || || || || ||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||| || | | |||| | || ||||||||| |||||||| |
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| T |
25265351 |
attgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacattagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagcttacccc |
25265252 |
T |
 |
| Q |
389 |
aa-ttgattcctcaagctattctcttca |
415 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||| ||||||||| |
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|
| T |
25265251 |
aatttgattcttcaagctcttctcttca |
25265224 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 34824612 - 34824896
Alignment:
| Q |
137 |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
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|
| T |
34824612 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
34824711 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
34824712 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttacc |
34824811 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
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| T |
34824812 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
34824896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43643218 - 43642968
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
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| T |
43643218 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaatta |
43643119 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
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| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
43643118 |
ataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
43643019 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43643018 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaa |
43642968 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 137 - 387
Target Start/End: Original strand, 8943983 - 8944235
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||| |
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|
| T |
8943983 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa |
8944082 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
| T |
8944083 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
8944182 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccc |
387 |
Q |
| |
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|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |
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|
| T |
8944183 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttaccc |
8944235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12635987 - 12635703
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
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|
| T |
12635987 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa |
12635888 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
| T |
12635887 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcatacaacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
12635788 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
12635787 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
12635703 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3798722 - 3798438
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||| |
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| T |
3798722 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaa |
3798623 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3798622 |
gagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacc |
3798523 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
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| T |
3798522 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcataagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
3798438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12641761 - 12641477
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||| |
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| T |
12641761 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaa |
12641662 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
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|
| T |
12641661 |
gagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
12641562 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
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| T |
12641561 |
ttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
12641477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11231457 - 11231214
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| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
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|
| T |
11231457 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
11231358 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11231357 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
11231258 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11231257 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
11231214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22513304 - 22513061
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22513304 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
22513205 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22513204 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
22513105 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22513104 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
22513061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24685900 - 24685657
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137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24685900 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
24685801 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24685800 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
24685701 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24685700 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
24685657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28775926 - 28775683
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137 |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
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|
| T |
28775926 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
28775827 |
T |
 |
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gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
| T |
28775826 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
28775727 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
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||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
28775726 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
28775683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23778164 - 23777963
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23778164 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaa |
23778065 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23778064 |
gagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccctttacc |
23777965 |
T |
 |
| Q |
335 |
tt |
336 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
23777964 |
tt |
23777963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17396910 - 17396664
Alignment:
| Q |
5 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaa |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || || || ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| |||| | |
|
|
| T |
17396910 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatga |
17396811 |
T |
 |
| Q |
105 |
caacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
17396810 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca |
17396711 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17396710 |
attcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa |
17396664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Original strand, 23774274 - 23774557
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacata-attgaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||| | ||| || | | || || | ||| |
|
|
| T |
23774274 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaa-acagcaacataacaa |
23774372 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23774373 |
gagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaacccccttacc |
23774472 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
23774473 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagttcttctctccaaaac |
23774557 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19689532 - 19689412
Alignment:
| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
19689532 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
19689433 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19689432 |
gttggagcacgaatttagcaa |
19689412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Original strand, 23820203 - 23820323
Alignment:
| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
23820203 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
23820302 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23820303 |
gttggagcacgaatttagcaa |
23820323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14906571 - 14906451
Alignment:
| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
14906571 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
14906472 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906471 |
gttggagcacgaatttagcaa |
14906451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213486
Alignment:
| Q |
305 |
atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccct-acctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaag |
403 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25213372 |
atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaatt-attcctcaat |
25213470 |
T |
 |
| Q |
404 |
ctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
25213471 |
ctattctcttcaaaac |
25213486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Original strand, 20015143 - 20015263
Alignment:
| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |
|
|
| T |
20015143 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaa |
20015242 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20015243 |
gttggagcacgaatttagcaa |
20015263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5888748 - 5888535
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacata-attgaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| ||| | | | || || | ||| |
|
|
| T |
5888748 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagca-acagcaacataacaa |
5888650 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5888649 |
gagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaacccccttacc |
5888550 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||| |
|
|
| T |
5888549 |
ttagatgatgtttaa |
5888535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 21141897 - 21142187
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||| | || ||||||||| |||| | | ||||| | ||| |||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
21141897 |
tcatcaatccataattatgtatacccaagtcgtaattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcatttta |
21141996 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| |||||| ||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||| | |||| ||||| || || |
|
|
| T |
21141997 |
acaacaacatatcaagattcactaattgagtataattt-catagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataat |
21142095 |
T |
 |
| Q |
199 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa |
289 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21142096 |
cctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa |
21142187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 246
Target Start/End: Original strand, 24277783 - 24278008
Alignment:
| Q |
22 |
tacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattca |
121 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||| ||||||| || || ||| ||| | ||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
24277783 |
tacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattca |
24277882 |
T |
 |
| Q |
122 |
ccaattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat-tcatgcatacaaa |
218 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||| || || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
24277883 |
acaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaa |
24277980 |
T |
 |
| Q |
219 |
cataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24277981 |
catatcatcataacaagagcacgaattt |
24278008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 9636761 - 9636992
Alignment:
| Q |
16 |
tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaa |
115 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9636761 |
tatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcac |
9636860 |
T |
 |
| Q |
116 |
aattcaccaatt-gcacacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgca |
212 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | || || |||| || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| | |
|
|
| T |
9636861 |
aattcaacaattagagcataa--ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgta |
9636958 |
T |
 |
| Q |
213 |
tacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||| | |||||| || ||||| |
|
|
| T |
9636959 |
ttcaaacatatcatcataacaagagtacaaattt |
9636992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24826646 - 24826573
Alignment:
| Q |
305 |
atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24826646 |
atgattatgatgatgactaacccctttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
24826573 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Original strand, 68155 - 68221
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
68155 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
68221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 246
Target Start/End: Original strand, 24884849 - 24884933
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
24884849 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
24884933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 6094732 - 6094843
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| Q |
16 |
tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaa |
115 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| || || |
|
|
| T |
6094732 |
tatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacac |
6094831 |
T |
 |
| Q |
116 |
aattcaccaatt |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
6094832 |
aattcaacaatt |
6094843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19669191 - 19669133
Alignment:
| Q |
165 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19669191 |
gaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacata |
19669133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 36890915 - 36890805
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| Q |
17 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||| | |||| ||||| | || ||| | ||| ||| ||| ||||||| ||||| | |
|
|
| T |
36890915 |
atgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcata |
36890816 |
T |
 |
| Q |
117 |
attcaccaatt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
36890815 |
attcaccaatt |
36890805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Original strand, 19660044 - 19660109
Alignment:
| Q |
164 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
19660044 |
tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatca |
19660109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 6324 - 5912
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6324 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-tta |
6226 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6225 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
6126 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
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| T |
6125 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaca-attcatacaacatttgagaatttgcaaagt |
6027 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctttga-agatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcct |
399 |
Q |
| |
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| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
6026 |
gaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataga-gattaatcctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttactctaattgattcct |
5928 |
T |
 |
| Q |
400 |
caagctattctcttca |
415 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
5927 |
caagctattctcttca |
5912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 36095 - 36472
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
36095 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaatta |
36194 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
36195 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac |
36294 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
36295 |
atcaattcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatg-caaaat |
36393 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36394 |
tacacatgattatgataatcattaacccccttacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctccta |
36472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 154126 - 153842
Alignment:
| Q |
137 |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
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|
| T |
154126 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
154027 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
154026 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
153927 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
153926 |
ttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
153842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 48600 - 48934
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48600 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatcta |
48699 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48700 |
gcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
48799 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
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| T |
48800 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat-aagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat |
48898 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48899 |
gatgatgattatgataaagactaacccccttacctt |
48934 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 169951 - 169759
Alignment:
| Q |
211 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgatt |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
169951 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaattatacatgatt |
169853 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
169852 |
atgataatcactaacccccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagct-cttatgtcaccccacttgattcctcaagct |
169759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 42999 - 43345
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
42999 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaatta |
43098 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43099 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
43198 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaat |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43199 |
atcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaaat |
43298 |
T |
 |
| Q |
300 |
tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta |
348 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43299 |
--tacatgtttgtgatagtaactaacccccttacctttgaagttgatta |
43345 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 39240 - 39483
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39240 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
39339 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39340 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
39439 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39440 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
39483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3593
Alignment:
| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3843 |
tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
3744 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3743 |
acaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
3644 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3643 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
3593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 1126 - 1376
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1126 |
tcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
1225 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1226 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatta |
1325 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1326 |
tcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa |
1376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 148723 - 148953
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
148723 |
tcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
148822 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
148823 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatca |
148922 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacag |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
148923 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
148953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 8851 - 9101
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||| ||||||| | | |
|
|
| T |
8851 |
tcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaattca |
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T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8951 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
9050 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9051 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaa |
9101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Original strand, 53509 - 53575
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228 |
Q |
| |
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|
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53509 |
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53575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 8880 - 9130
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1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
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Q |
| |
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|
| T |
8880 |
tcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
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T |
 |
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acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
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Q |
| |
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| T |
8980 |
acaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatca |
9079 |
T |
 |
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201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
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Q |
| |
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9080 |
tcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaa |
9130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0420 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:
Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 98 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13477 - 13230
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98 |
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197 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13477 |
ttaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
13378 |
T |
 |
| Q |
198 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13377 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-aaaa |
13279 |
T |
 |
| Q |
298 |
attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta |
348 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13278 |
at--tacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgatta |
13230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31926 - 31548
Alignment:
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | |
|
|
| T |
31926 |
tcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca |
31827 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaactt-agca-aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
31826 |
acaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaa |
31727 |
T |
 |
| Q |
199 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
31726 |
catcaattcatgcattcaaacataacatcaccacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatg-caaaa |
31628 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31627 |
ttacacatgattatgataatcactaacccccttacatttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
31548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 128429 - 128096
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
128429 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-tta |
128331 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
128330 |
acaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatca |
128231 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| || | | |||||||||| | |||||| | ||| | |
|
|
| T |
128230 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat-aagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaat |
128132 |
T |
 |
| Q |
301 |
gtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
128131 |
gaagatgattatgataaagactaacccccttacctt |
128096 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:
Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1439 - 1143
Alignment:
| Q |
115 |
aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1439 |
aaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcata |
1340 |
T |
 |
| Q |
215 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
1339 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtga |
1242 |
T |
 |
| Q |
315 |
taataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttc |
414 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1241 |
taataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaa--gtcaccaacttgattcctaaagctattctcttc |
1144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 48189 - 48439
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| Q |
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48189 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
48288 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48289 |
acaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
48388 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48389 |
tcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaa |
48439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 19208 - 19458
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||||| | | |
|
|
| T |
19208 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattca |
19307 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19308 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatca |
19407 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19408 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
19458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 21292 - 21542
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||||| | | |
|
|
| T |
21292 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattca |
21391 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21392 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatca |
21491 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21492 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
21542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1500 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:
Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1633 - 1349
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
1633 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaa |
1534 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1533 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
1434 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1433 |
ttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
1349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 34722 - 34374
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaa-caagaatcaaatctcaagtt |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
34722 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattc |
34623 |
T |
 |
| Q |
100 |
aacaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34622 |
aacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
34523 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgaga |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34522 |
atcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatgaga |
34423 |
T |
 |
| Q |
288 |
aaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
|| || || || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34422 |
aattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccctcttacctt |
34374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0761 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:
Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 137 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1694 - 1412
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1694 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
1595 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1594 |
gtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacc |
1495 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaa |
417 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1494 |
ttagaagaagattaacccaaacccttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaa |
1412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 224 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 10778 - 10583
Alignment:
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224 |
catcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataacta |
323 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10778 |
catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta |
10679 |
T |
 |
| Q |
324 |
acccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10678 |
acccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccacaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
10583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 123422 - 123175
Alignment:
| Q |
4 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaaca |
103 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || ||||| |
|
|
| T |
123422 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaaca |
123323 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
123322 |
acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
123223 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
123222 |
attcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaa |
123175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0191 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:
Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7710 - 7292
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||| ||||| | ||| |||| |||||| |||||| ||| |
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| T |
7710 |
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7611 |
T |
 |
| Q |
101 |
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198 |
Q |
| |
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| T |
7610 |
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7512 |
T |
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199 |
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298 |
Q |
| |
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| T |
7511 |
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7412 |
T |
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299 |
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398 |
Q |
| |
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| T |
7411 |
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7313 |
T |
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| Q |
399 |
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419 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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tcaagctattctcttcaaaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 12117 - 12365
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
12117 |
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12214 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
12215 |
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12314 |
T |
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| Q |
201 |
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251 |
Q |
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| T |
12315 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 41650 - 41996
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tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
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| T |
41650 |
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41749 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
41750 |
acaacaacatagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
41849 |
T |
 |
| Q |
201 |
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289 |
Q |
| |
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| T |
41850 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaatgagaaa |
41949 |
T |
 |
| Q |
290 |
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336 |
Q |
| |
|
|| || || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41950 |
ttgaaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt |
41996 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37174 - 36928
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100 |
Q |
| |
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| T |
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tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatcca |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|
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| T |
37074 |
accacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatca |
36975 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
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| T |
36974 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta |
36928 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26673 - 26328
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4 |
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103 |
Q |
| |
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||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| |
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tcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaaca |
26574 |
T |
 |
| Q |
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203 |
Q |
| |
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| T |
26573 |
acaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatca |
26474 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgta |
303 |
Q |
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| T |
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26374 |
T |
 |
| Q |
304 |
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349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
26373 |
catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa |
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T |
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Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
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Target Start/End: Complemental strand, 8438 - 8191
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100 |
Q |
| |
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|||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | || ||| || | | |
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|
| T |
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tcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattca |
8339 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8338 |
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8242 |
T |
 |
| Q |
201 |
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251 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8241 |
ccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaa |
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T |
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Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 392
Target Start/End: Original strand, 12055 - 12150
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392 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| || | || | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |
|
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12055 |
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12150 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
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Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5319 - 5072
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4 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaaca |
103 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
5319 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaaca |
5220 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
5219 |
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5120 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5119 |
attcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaa |
5072 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:
Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 784 - 545
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tgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaactta |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |
|
|
| T |
784 |
tgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaactta |
685 |
T |
 |
| Q |
112 |
gcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
684 |
gcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
585 |
T |
 |
| Q |
212 |
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251 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
584 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
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Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
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Target Start/End: Original strand, 41733 - 42065
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3 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
41733 |
atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac |
41832 |
T |
 |
| Q |
103 |
aacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41833 |
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41932 |
T |
 |
| Q |
203 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgt |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| || | | |||||||||||| |||||| || ||| || |
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|
| T |
41933 |
aattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat-aagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga |
42031 |
T |
 |
| Q |
303 |
acatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
42032 |
tgatgattatgataaagaccaacccccttacctt |
42065 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247453
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catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaact |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
247595 |
T |
 |
| Q |
110 |
tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
247594 |
tagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcat |
247495 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
247494 |
gcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaa |
247453 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34276 - 33993
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235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
34276 |
ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaag |
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T |
 |
| Q |
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agcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaaca-tgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34176 |
agcacgaatttagcaacaatttttcatcaacccattt-catacaacaatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacc |
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T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34077 |
ttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacgccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
33993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 166 - 417
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2811
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166 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||| | || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2560 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaa |
2659 |
T |
 |
| Q |
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cccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaa-ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctt |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
2660 |
cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctt |
2759 |
T |
 |
| Q |
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taattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaa |
417 |
Q |
| |
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|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
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| T |
2760 |
caattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaaa |
2811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172157
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| Q |
10 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaact |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
171916 |
catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
172015 |
T |
 |
| Q |
110 |
tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
172016 |
tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat |
172115 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
172116 |
ccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaa |
172157 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177860
Alignment:
| Q |
10 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaact |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
177619 |
catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
177718 |
T |
 |
| Q |
110 |
tagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
177719 |
tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat |
177818 |
T |
 |
| Q |
210 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
177819 |
ccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaa |
177860 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 13511 - 13758
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| Q |
4 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaaca |
103 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | || ||| || | |||| |
|
|
| T |
13511 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaca |
13610 |
T |
 |
| Q |
104 |
acaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13611 |
acaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
13710 |
T |
 |
| Q |
204 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13711 |
attcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaa |
13758 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 337
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42709
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305 |
atgattatgataataactaacccccttaccttt |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42677 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttt |
42709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272257
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| Q |
5 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaa |
104 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
272031 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca |
272130 |
T |
 |
| Q |
105 |
caacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
272131 |
caacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaa |
272230 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttcatgcatacaaacataacatcacag |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
272231 |
ttcattcatacaaacatatcattacag |
272257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:
Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 31446 - 31689
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31446 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaa |
31545 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31546 |
gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
31645 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctccta |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31646 |
tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta |
31689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 287
Target Start/End: Original strand, 39783 - 39935
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
39783 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaa |
39882 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39883 |
gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga |
39935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0467 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:
Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10458 - 10188
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10458 |
tttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaa |
10359 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
10358 |
gagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttacc |
10259 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct |
405 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| | || |||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10258 |
ttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctcataagcttaccccaattgattcctcaagct |
10188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 417
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5957
Alignment:
| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagca-aaattca |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
5552 |
acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca |
5651 |
T |
 |
| Q |
122 |
ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacat |
221 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5652 |
ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat |
5751 |
T |
 |
| Q |
222 |
aacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttca----------tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgtaaaaattgtacatgat |
309 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
5752 |
aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattattcattcattcgtttcaatcca-tttcatacaaatcatgaaaaattgtaaagaatgaacatgat |
5850 |
T |
 |
| Q |
310 |
tatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta-accctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctatt |
408 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
5851 |
tatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacct-aggcttcaatttagctcctaagctta-cccaattgattcctcaagttctt |
5948 |
T |
 |
| Q |
409 |
ctcttcaaa |
417 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
5949 |
ctctccaaa |
5957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 54418 - 54755
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||| |||| | | | ||||||||| |||| |||||| |||||| | | |
|
|
| T |
54418 |
tcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttca |
54517 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
54518 |
acaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaattat |
54616 |
T |
 |
| Q |
199 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgtaaaa |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | |
|
|
| T |
54617 |
catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaaattgcaata |
54716 |
T |
 |
| Q |
298 |
attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
54717 |
attgaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt |
54755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 336
Target Start/End: Original strand, 45077 - 45369
Alignment:
| Q |
46 |
acaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataac |
145 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | | | ||||||||| |||| |||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| ||| |
|
|
| T |
45077 |
acaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcaaaac |
45175 |
T |
 |
| Q |
146 |
ttatcatttttacataatt--gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaa |
243 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
45176 |
ttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaa |
45275 |
T |
 |
| Q |
244 |
tttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45276 |
tttaacaacaattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt |
45369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0213 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:
Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Original strand, 29330 - 29512
Alignment:
| Q |
166 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || |||| || |||| ||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29330 |
aacatgtaatttcacccataaacataacataatcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa |
29429 |
T |
 |
| Q |
266 |
cccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29430 |
cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgatta |
29512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37326 - 37077
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | |||||||||| |||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
37326 |
tcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatcca |
37227 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
200 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37226 |
actacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatta |
37128 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37127 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa |
37077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0183 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:
Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 379
Target Start/End: Original strand, 6735 - 6978
Alignment:
| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacata-attgaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| ||| || | | || || | ||| |
|
|
| T |
6735 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaa-acagcaacataacaa |
6833 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6834 |
gagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttacc |
6933 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaa |
379 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6934 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa |
6978 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
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Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
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Target Start/End: Complemental strand, 51377 - 51193
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aacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattga |
166 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||| ||| | | |||| || || || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
51377 |
aacatcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttga |
51278 |
T |
 |
| Q |
167 |
acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51277 |
acatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
51193 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
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Target: scaffold0028; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 89618 - 89465
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| Q |
98 |
ttaacaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89618 |
ttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
89519 |
T |
 |
| Q |
198 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89518 |
tcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaa |
89465 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 305 - 405
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130979
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| Q |
305 |
atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130880 |
atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaattgattcctcaagc |
130978 |
T |
 |
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Target: scaffold0028; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 165 - 246
Target Start/End: Original strand, 79704 - 79786
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| Q |
165 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
79704 |
gaacatgcaatttcaccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattt |
79786 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
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Target Start/End: Original strand, 54039 - 54225
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcat |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
54039 |
ttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcat |
54138 |
T |
 |
| Q |
263 |
caacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
54139 |
caacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaa |
54225 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0155 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:
Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23867 - 23586
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| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacata-attgaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||| |||| ||| || | |||| || | | | |
|
|
| T |
23867 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataagaa-acaacaacataacca |
23769 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23768 |
gagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaacccccttaac |
23669 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
23668 |
ttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagttcctaa--gtcacccacttgattcctaaagctcttctctccaaaac |
23586 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 9384 - 9471
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| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatca |
88 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9384 |
tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatca |
9471 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0084 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:
Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 56347 - 56114
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| Q |
15 |
atatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagca |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||| || || | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
56347 |
atatgcatacccaagtcatgattcacccacaacaacatcaattaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca |
56248 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
56247 |
aaattcaccatttgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgca |
56149 |
T |
 |
| Q |
213 |
tacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
247 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
56148 |
cacgaaaataacatcacagttagagcacgaattta |
56114 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:
Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 250
Target Start/End: Original strand, 3257 - 3441
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| Q |
67 |
aacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataattg- |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
3257 |
aacatcaattgaacaataatcacatatcctctcaacaacaacttagcaaaattcaccatttgagtacaattt-cataacttgatatttatacatactttg |
3355 |
T |
 |
| Q |
166 |
-aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
250 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3356 |
aaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagca |
3441 |
T |
 |
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Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
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Target Start/End: Original strand, 3210 - 3266
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| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatt |
57 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3210 |
tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaatt |
3266 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0892 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:
Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
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Target Start/End: Original strand, 3578 - 3715
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaggattgttcat |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | | || | |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3578 |
ttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttcat |
3677 |
T |
 |
| Q |
263 |
caacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3678 |
caacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatt |
3715 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
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Target Start/End: Original strand, 22672 - 22792
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
22672 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
22771 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22772 |
gttggagcacgaatttagcaa |
22792 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Original strand, 26927 - 27047
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
26927 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
27026 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27027 |
gttggagcacgaatttagcaa |
27047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
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| Q |
131 |
cacaattttcataacttatcatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
1713 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
1614 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcaagagcacgaatttagcaa |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1613 |
gttggagcacgaatttagcaa |
1593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 48516 - 48620
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| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48516 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaatta |
48615 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaac |
105 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
48616 |
acaac |
48620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 113 - 9
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| Q |
1 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagtta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
113 |
tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaatta |
14 |
T |
 |
| Q |
101 |
acaac |
105 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
13 |
acaac |
9 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 349
Target Start/End: Original strand, 7347 - 7560
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| Q |
137 |
tttcataacttatcatttttacata-attgaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa |
234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| ||| | | | || || | ||| |
|
|
| T |
7347 |
tttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagca-acagcaacataacaa |
7445 |
T |
 |
| Q |
235 |
gagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7446 |
gagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaacccccttacc |
7545 |
T |
 |
| Q |
335 |
tttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||| |
|
|
| T |
7546 |
ttagatgatgtttaa |
7560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
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| Q |
261 |
atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13342 |
atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
13268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 107993
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| Q |
305 |
atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
108107 |
atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcacgc |
108008 |
T |
 |
| Q |
405 |
tattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
108007 |
tattctcttcaaaac |
107993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 104733 - 104623
Alignment:
| Q |
138 |
ttcataacttatcatttttacataatt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaag |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||||| || |||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
104733 |
ttcataagttagcatttatacatactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttag |
104634 |
T |
 |
| Q |
236 |
agcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |
|
|
| T |
104633 |
agcatgaattt |
104623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 104869 - 104791
Alignment:
| Q |
1 |
tcatcaatccatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaa |
78 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
104869 |
tcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaa |
104791 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0516 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:
Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12032
Alignment:
| Q |
232 |
caagagcacgaatttagcaaggattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccct |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12149 |
caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct |
12051 |
T |
 |
| Q |
331 |
tacctttgaagatgattaa |
349 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
12050 |
taccttagatgatgtttaa |
12032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0151 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:
Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22646 - 22422
Alignment:
| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| || ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
22646 |
acccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaattaacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
22547 |
T |
 |
| Q |
123 |
caa-ttgcacacaattttcataacttatcatttttacata-attgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
|| ||| || || ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22546 |
taatttgagcataa--ttcataagttagcatttatacatattttgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaac |
22449 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
22448 |
atatcatcatatttagagcacgaattt |
22422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 154373 - 154268
Alignment:
| Q |
312 |
tgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctc |
411 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
154373 |
tgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa--gtcacccacttgattcctaaagctcttctc |
154276 |
T |
 |
| Q |
412 |
ttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
| |||||| |
|
|
| T |
154275 |
tccaaaac |
154268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1666 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:
Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 84 - 1
Alignment:
| Q |
166 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc |
249 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
84 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaatttagc |
1 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0670 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:
Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7899 - 7675
Alignment:
| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
7899 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
7800 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt-gcacacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| |||| || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
7799 |
caattagagcacaa--ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtagtcaaac |
7702 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7701 |
atatcatcataacaagagcacaaattt |
7675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:
Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Original strand, 22019 - 22246
Alignment:
| Q |
20 |
catacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaatt |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
22019 |
catacccaagctgtgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcccaatt |
22118 |
T |
 |
| Q |
120 |
caccaattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcataca |
216 |
Q |
| |
|
|| || || | ||||||| || || || |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| | || |
|
|
| T |
22119 |
caacatttagagcacaatt--cacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatactca |
22216 |
T |
 |
| Q |
217 |
aacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22217 |
aacataacatcatagcaagagcacgaattt |
22246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 246
Target Start/End: Original strand, 29986 - 30211
Alignment:
| Q |
22 |
tacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattca |
121 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||| ||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
29986 |
tacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattca |
30085 |
T |
 |
| Q |
122 |
ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | ||| |||| || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
30086 |
acaattagag-caaaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcacctacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaac |
30184 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
30185 |
atatcatcatagtaagagcacgaattt |
30211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0367 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:
Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17142
Alignment:
| Q |
305 |
atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctacctcttgctttaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17241 |
atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaattgattcctcaagc |
17143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 246
Target Start/End: Original strand, 8173 - 8257
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
8173 |
ttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0364 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:
Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17748 - 17710
Alignment:
| Q |
381 |
cttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
419 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17748 |
cttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac |
17710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0598 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:
Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 3275 - 3498
Alignment:
| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || | | || ||| | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
3275 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgatttca-tcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
3373 |
T |
 |
| Q |
123 |
caattgca-cacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
||||| | | ||||| || || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
3374 |
caattagagcccaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaac |
3471 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
3472 |
atatcatcataacaagcgcacgaattt |
3498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0406 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:
Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14283
Alignment:
| Q |
164 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14200 |
tgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
14283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0020 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:
Target: scaffold0020; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 164 - 246
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| Q |
164 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
108173 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
108256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
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Alignment:
| Q |
23 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattaaacaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcaaaattcac |
122 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | | ||||||||||||| || || ||| ||| | |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
27520 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaa |
27619 |
T |
 |
| Q |
123 |
caatt-gcacacaattttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaac |
219 |
Q |
| |
|
|| || | ||||||| || || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
27620 |
catttagggcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaac |
27717 |
T |
 |
| Q |
220 |
ataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27718 |
atatcatcataacaagagcacaaattt |
27744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:
Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
457 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2400 - 2334
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2400 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
2334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0153 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:
Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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| Q |
138 |
ttcataacttatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaag |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
8627 |
ttcataatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcacaacaag |
8726 |
T |
 |
| Q |
236 |
agcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
8727 |
agcacgaattt |
8737 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1449 - 1348
Alignment:
| Q |
147 |
tatcatttttacataatt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
1449 |
tatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaat |
1350 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
1349 |
tt |
1348 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9704 - 9603
Alignment:
| Q |
147 |
tatcatttttacataatt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
9704 |
tatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaat |
9605 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
9604 |
tt |
9603 |
T |
 |
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Target: scaffold0700 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 246
Target Start/End: Original strand, 2688 - 2772
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| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
2688 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
2772 |
T |
 |
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Target: scaffold0138 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
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Target: scaffold0138; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 163 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22513 - 22453
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22513 |
ttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacata |
22453 |
T |
 |
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Target: scaffold0483 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
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Target: scaffold0483; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6890
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
6824 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatca |
6890 |
T |
 |
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Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 192 - 245
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Alignment:
| Q |
192 |
caattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatt |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
10854 |
caattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt |
10908 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43882 - 43816
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
43882 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatca |
43816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 76931 - 76865
Alignment:
| Q |
163 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
76931 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatca |
76865 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0193 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:
Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Original strand, 4751 - 4828
Alignment:
| Q |
147 |
tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacata |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4751 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata |
4828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0065 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:
Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 67998 - 67897
Alignment:
| Q |
147 |
tatcatttttacataat-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
244 |
Q |
| |
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||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| | | |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
67998 |
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67899 |
T |
 |
| Q |
245 |
tt |
246 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
67898 |
tt |
67897 |
T |
 |
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