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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12661_low_25 (Length: 337)

Name: NF12661_low_25
Description: NF12661
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12661_low_25
NF12661_low_25
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (1-319)||(4974691-4974999)
chr2 (1-319)||(4992599-4992907)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4974999 - 4974691
Alignment:
Q  1 aacgatatccaacaccatatattgattggatgtgtcacaccatgtcataatttttacatcccaaacttcatcaactaaaatacaatttacatttaggacc 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4974999 aacgatatcccacacgatatattgattggatgtgtcacaccatgtcataatttttacatcccaaacttcatcaactaaaatacaatttacatttaggacc 4974900  T
Q  101 cccc-taaacaatacaacataacacactttccatttaatcataaatagctaattaaggtatttaatgatgaagacttttacaacataacactattgagat 199  Q
    |||| |||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4974899 ccccctaaacaata-------acacacttttcatttaatcataaatagctaattaaggtatttaatgatgaagacttttacaacataacactattgagat 4974807  T
Q  200 tgaagaaatgcttttagtagcaaacatcaatcaatataccactctagttatatctttgaagaggatagagagagtcttgttgaatgttgatttaaaacac 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  4974806 tgaagaaatgctttaagtagcaaacatcaatcaatataccactctagttatatctttgaagaggatagagagagtcttgttgaatgttgat----aacac 4974711  T
Q  300 agtgagatagaaactgattt 319  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4974710 agtgagatagaaactgattt 4974691  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4992907 - 4992599
Alignment:
Q  1 aacgatatccaacaccatatattgattggatgtgtcacaccatgtcataatttttacatcccaaacttcatcaactaaaatacaatttacatttaggacc 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4992907 aacgatatcccacacgatatattgattggatgtgtcacaccatgtcataatttttacatcccaaacttcatcaactaaaatacaatttacatttaggacc 4992808  T
Q  101 cccc-taaacaatacaacataacacactttccatttaatcataaatagctaattaaggtatttaatgatgaagacttttacaacataacactattgagat 199  Q
    |||| |||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4992807 ccccctaaacaata-------acacacttttcatttaatcataaatagctaattaaggtatttaatgatgaagacttttacaacataacactattgagat 4992715  T
Q  200 tgaagaaatgcttttagtagcaaacatcaatcaatataccactctagttatatctttgaagaggatagagagagtcttgttgaatgttgatttaaaacac 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  4992714 tgaagaaatgctttaagtagcaaacatcaatcaatataccactctagttatatctttgaagaggatagagagagtcttgttgaatgttgat----aacac 4992619  T
Q  300 agtgagatagaaactgattt 319  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4992618 agtgagatagaaactgattt 4992599  T

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