View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12666_high_1 (Length: 244)

Name: NF12666_high_1
Description: NF12666
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12666_high_1
NF12666_high_1
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (14-231)||(27283707-27283924)
chr6 (11-225)||(27623058-27623272)
chr6 (11-225)||(28214094-28214316)
chr6 (11-225)||(30551331-30551553)
chr6 (11-225)||(34457837-34458059)
chr6 (11-225)||(27064127-27064349)
chr6 (60-233)||(26927427-26927608)
chr6 (60-233)||(27209574-27209755)
chr6 (60-233)||(27239473-27239654)
chr6 (11-225)||(29579660-29579882)
chr6 (60-233)||(16756496-16756677)
chr6 (34-233)||(22928198-22928406)
chr6 (79-233)||(24870402-24870564)
chr6 (11-225)||(26665988-26666210)
chr6 (11-225)||(26771959-26772181)
chr6 (11-225)||(27355434-27355656)
chr6 (60-232)||(24299105-24299285)
chr6 (47-225)||(4539110-4539296)
chr6 (87-233)||(15405874-15406028)
chr6 (87-233)||(15417661-15417815)
chr6 (60-225)||(33369781-33369954)
chr6 (11-172)||(4779537-4779698)
chr6 (47-225)||(13517545-13517731)
chr6 (47-225)||(27200859-27201045)
chr6 (47-225)||(27248188-27248374)
chr6 (11-225)||(8899028-8899250)
chr6 (60-225)||(29508096-29508269)
chr6 (60-225)||(29556231-29556404)
chr6 (65-233)||(27025822-27025998)
chr6 (65-233)||(27031701-27031877)
chr6 (60-233)||(13292288-13292470)
chr6 (60-225)||(14138752-14138925)
chr6 (11-172)||(16680785-16680946)
chr6 (36-225)||(16937357-16937554)
chr6 (65-225)||(4764442-4764610)
chr6 (47-225)||(27491800-27491987)
chr6 (60-225)||(26792491-26792664)
chr6 (60-225)||(27014399-27014572)
chr6 (58-225)||(26109752-26109928)
chr6 (47-225)||(4531956-4532142)
chr6 (118-226)||(20131253-20131369)
chr6 (118-226)||(22201501-22201617)
chr6 (79-225)||(28167188-28167342)
chr6 (183-226)||(20175368-20175411)
chr6 (183-226)||(22160580-22160623)
chr6 (184-225)||(16680966-16681007)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (11-233)||(26508968-26509198)
chr7 (11-225)||(26663179-26663401)
chr7 (11-225)||(26678371-26678593)
chr7 (11-225)||(31083890-31084113)
chr7 (34-233)||(16047981-16048189)
chr7 (34-233)||(16443264-16443472)
chr7 (33-225)||(16744787-16744987)
chr7 (11-225)||(26441891-26442113)
chr7 (11-172)||(45393866-45394027)
chr7 (11-233)||(16511708-16511939)
chr7 (11-172)||(26519454-26519615)
chr7 (60-233)||(5154758-5154939)
chr7 (34-233)||(10848253-10848461)
chr7 (11-225)||(4138512-4138734)
chr7 (11-172)||(11447535-11447696)
chr7 (47-225)||(26313130-26313317)
chr7 (60-233)||(2161247-2161427)
chr7 (11-225)||(24585802-24586025)
chr7 (47-225)||(31557671-31557858)
chr7 (47-225)||(4206058-4206244)
chr7 (11-225)||(26268353-26268574)
chr7 (60-233)||(5165059-5165240)
chr7 (60-233)||(11418062-11418243)
chr7 (47-225)||(26596338-26596525)
chr7 (60-234)||(10910208-10910390)
chr7 (60-225)||(2779919-2780092)
chr7 (47-225)||(31130579-31130765)
chr7 (60-172)||(3451926-3452038)
chr7 (11-225)||(5140604-5140826)
chr7 (60-225)||(22148563-22148736)
chr7 (60-225)||(22152790-22152963)
chr7 (60-225)||(22208705-22208878)
chr7 (79-225)||(39206431-39206585)
chr7 (79-225)||(45737995-45738149)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (11-233)||(24585747-24585978)
chr4 (11-225)||(54840050-54840272)
chr4 (34-233)||(1906949-1907157)
chr4 (34-233)||(15234500-15234708)
chr4 (11-225)||(20331819-20332041)
chr4 (11-225)||(21976363-21976585)
chr4 (11-225)||(31119894-31120116)
chr4 (11-225)||(5012540-5012763)
chr4 (34-233)||(15379614-15379822)
chr4 (11-225)||(40099017-40099239)
chr4 (79-233)||(15276002-15276164)
chr4 (11-172)||(33667246-33667407)
chr4 (79-233)||(14671717-14671879)
chr4 (47-225)||(27156710-27156896)
chr4 (11-172)||(30760423-30760584)
chr4 (60-232)||(17019737-17019917)
chr4 (11-225)||(14105203-14105425)
chr4 (60-225)||(6576544-6576718)
chr4 (60-225)||(14752900-14753073)
chr4 (47-225)||(5701224-5701410)
chr4 (79-225)||(39857342-39857496)
chr4 (60-225)||(36323721-36323894)
chr4 (60-225)||(36337930-36338103)
chr4 (50-225)||(18794027-18794208)
chr4 (59-225)||(34182341-34182515)
chr4 (60-225)||(24119349-24119523)
chr4 (184-225)||(24814685-24814726)
chr4 (184-225)||(24813781-24813822)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (34-233)||(21696553-21696761)
chr2 (11-225)||(13929983-13930205)
chr2 (11-225)||(19409856-19410078)
chr2 (11-225)||(3789091-3789313)
chr2 (34-231)||(27397005-27397211)
chr2 (11-225)||(39896717-39896939)
chr2 (11-225)||(21670545-21670767)
chr2 (11-225)||(37932025-37932247)
chr2 (34-233)||(34268287-34268495)
chr2 (11-225)||(11628557-11628779)
chr2 (11-225)||(16168126-16168348)
chr2 (11-225)||(16822710-16822932)
chr2 (11-225)||(16898548-16898770)
chr2 (11-225)||(27810351-27810573)
chr2 (11-225)||(34297797-34298019)
chr2 (11-225)||(254024-254246)
chr2 (11-225)||(9343359-9343581)
chr2 (11-225)||(32056400-32056622)
chr2 (11-225)||(37679270-37679492)
chr2 (11-225)||(37694535-37694757)
chr2 (11-225)||(37945237-37945459)
chr2 (11-225)||(12593462-12593684)
chr2 (34-233)||(19449776-19449985)
chr2 (60-233)||(23117471-23117652)
chr2 (11-225)||(22921516-22921738)
chr2 (11-172)||(34868282-34868443)
chr2 (11-225)||(39045254-39045477)
chr2 (60-233)||(20844590-20844771)
chr2 (60-233)||(28888929-28889110)
chr2 (79-233)||(27427837-27428000)
chr2 (14-225)||(27782874-27783093)
chr2 (47-225)||(31882955-31883141)
chr2 (79-225)||(37384371-37384525)
chr2 (60-233)||(31868173-31868354)
chr2 (11-225)||(40240171-40240393)
chr2 (60-232)||(12662165-12662346)
chr2 (47-225)||(34161525-34161711)
chr2 (60-225)||(12709996-12710169)
chr2 (79-225)||(27123216-27123370)
chr2 (184-225)||(3790473-3790514)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (11-225)||(29835976-29836198)
chr8 (11-225)||(12086075-12086297)
chr8 (11-225)||(28355299-28355521)
chr8 (34-233)||(22074267-22074475)
chr8 (11-225)||(31483218-31483440)
chr8 (60-233)||(2130623-2130804)
chr8 (60-233)||(15774250-15774431)
chr8 (11-172)||(19681109-19681270)
chr8 (36-233)||(19694767-19694973)
chr8 (11-225)||(33265373-33265595)
chr8 (65-233)||(22139595-22139771)
chr8 (11-233)||(19654681-19654912)
chr8 (79-233)||(18797404-18797566)
chr8 (60-233)||(33249039-33249220)
chr8 (65-233)||(14569836-14570012)
chr8 (11-233)||(16260564-16260795)
chr8 (11-225)||(31361181-31361404)
chr8 (11-172)||(44567633-44567794)
chr8 (65-233)||(21341525-21341702)
chr8 (79-225)||(18716177-18716331)
chr8 (47-225)||(19201730-19201917)
chr8 (11-225)||(9361257-9361478)
chr8 (87-233)||(19910522-19910676)
chr8 (60-233)||(27602268-27602449)
chr8 (184-225)||(15775288-15775329)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (11-225)||(15752142-15752364)
chr5 (11-225)||(30036081-30036303)
chr5 (34-233)||(22895084-22895292)
chr5 (11-225)||(33523039-33523261)
chr5 (11-225)||(40466833-40467055)
chr5 (11-225)||(32589559-32589781)
chr5 (34-233)||(23898552-23898761)
chr5 (11-225)||(43084909-43085124)
chr5 (11-225)||(13318110-13318332)
chr5 (11-172)||(37761629-37761790)
chr5 (11-225)||(3796188-3796410)
chr5 (47-225)||(6880984-6881170)
chr5 (11-225)||(11330289-11330511)
chr5 (11-225)||(30175123-30175345)
chr5 (47-172)||(31819766-31819891)
chr5 (11-225)||(18494052-18494274)
chr5 (60-233)||(23726921-23727102)
chr5 (11-225)||(28655900-28656122)
chr5 (65-233)||(22992417-22992593)
chr5 (11-225)||(5644455-5644677)
chr5 (47-225)||(37351948-37352134)
chr5 (47-225)||(28953079-28953265)
chr5 (47-225)||(9324154-9324341)
chr5 (47-225)||(26487064-26487251)
chr5 (60-233)||(24608929-24609110)
chr5 (60-233)||(24976528-24976709)
chr5 (65-232)||(23632659-23632834)
chr5 (65-232)||(25206998-25207173)
chr5 (65-232)||(25271154-25271329)
chr5 (47-225)||(12138853-12139039)
chr5 (47-225)||(33881797-33881983)
chr5 (60-225)||(9544012-9544185)
chr5 (65-233)||(11556043-11556219)
chr5 (47-223)||(37745635-37745819)
chr5 (11-225)||(13435953-13436175)
chr5 (11-225)||(18368814-18369036)
chr5 (47-225)||(30158711-30158897)
chr5 (60-230)||(30941314-30941492)
chr5 (47-225)||(34623190-34623376)
chr5 (60-225)||(2517749-2517922)
chr5 (65-225)||(18121717-18121886)
chr5 (60-233)||(33299220-33299401)
chr5 (60-233)||(33784166-33784347)
chr5 (93-233)||(13180093-13180241)
chr5 (60-225)||(15652045-15652218)
chr5 (60-225)||(31438141-31438314)
chr5 (79-225)||(8658777-8658931)
chr5 (60-225)||(24730653-24730826)
chr5 (79-225)||(41681408-41681564)
chr5 (60-225)||(37664788-37664961)
chr5 (184-225)||(13178783-13178824)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (11-225)||(24334788-24335010)
chr3 (11-225)||(18231804-18232026)
chr3 (11-223)||(17978378-17978598)
chr3 (11-225)||(6536168-6536390)
chr3 (11-225)||(10649683-10649904)
chr3 (11-225)||(29658392-29658614)
chr3 (47-225)||(28109388-28109575)
chr3 (34-232)||(15367877-15368085)
chr3 (34-229)||(19701029-19701233)
chr3 (11-233)||(15886157-15886388)
chr3 (11-225)||(5020323-5020545)
chr3 (11-225)||(28345783-28346005)
chr3 (60-233)||(4728265-4728446)
chr3 (60-233)||(5658773-5658954)
chr3 (60-233)||(6208534-6208715)
chr3 (11-225)||(5589781-5590003)
chr3 (11-225)||(5602738-5602960)
chr3 (11-225)||(32297243-32297465)
chr3 (11-172)||(51788634-51788795)
chr3 (34-233)||(16617907-16618116)
chr3 (60-233)||(18057907-18058088)
chr3 (60-233)||(22381020-22381201)
chr3 (60-233)||(29142194-29142375)
chr3 (65-233)||(18337268-18337444)
chr3 (39-233)||(4690292-4690495)
chr3 (11-225)||(47030068-47030290)
chr3 (11-225)||(16404217-16404439)
chr3 (59-233)||(16422845-16423027)
chr3 (11-225)||(20570281-20570503)
chr3 (47-222)||(5717703-5717886)
chr3 (47-222)||(5728613-5728796)
chr3 (47-222)||(5763572-5763755)
chr3 (11-225)||(31957881-31958103)
chr3 (60-233)||(4790071-4790252)
chr3 (11-225)||(10402764-10402986)
chr3 (60-225)||(11103809-11103982)
chr3 (34-233)||(22041041-22041250)
chr3 (60-233)||(35887399-35887580)
chr3 (65-233)||(8282900-8283076)
chr3 (87-231)||(15734558-15734710)
chr3 (60-225)||(31029691-31029864)
chr3 (47-225)||(17970305-17970492)
chr3 (11-225)||(21681332-21681554)
chr3 (60-225)||(4340124-4340297)
chr3 (60-225)||(5473628-5473801)
chr3 (60-225)||(18285804-18285977)
chr3 (60-225)||(18301105-18301278)
chr3 (60-225)||(32445791-32445964)
chr3 (58-225)||(22864289-22864464)
chr3 (58-225)||(22879348-22879523)
chr3 (60-225)||(4423557-4423730)
chr3 (60-225)||(4630420-4630593)
chr3 (50-225)||(18249369-18249552)
chr3 (60-161)||(7079867-7079968)
chr3 (79-225)||(20072693-20072847)
chr3 (47-225)||(28027919-28028105)
chr3 (79-225)||(48472590-48472744)
chr3 (47-172)||(8218273-8218398)
chr3 (184-225)||(7080022-7080063)
chr3 (184-225)||(16599406-16599447)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-225)||(14592-14814)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (11-225)||(51644874-51645096)
chr1 (34-233)||(20333793-20334001)
chr1 (11-225)||(10951744-10951966)
chr1 (65-233)||(16201407-16201583)
chr1 (34-231)||(20467458-20467664)
chr1 (60-233)||(14692293-14692474)
chr1 (60-233)||(14694975-14695156)
chr1 (60-233)||(14697659-14697840)
chr1 (70-233)||(14700340-14700511)
chr1 (39-233)||(21891126-21891329)
chr1 (11-225)||(28591733-28591955)
chr1 (11-225)||(3647799-3648021)
chr1 (60-225)||(10969344-10969517)
chr1 (47-225)||(41786718-41786903)
chr1 (79-225)||(28156425-28156579)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (34-230)||(27966-28169)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (34-233)||(444-652)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (34-233)||(12722-12931)
scaffold0322 (11-225)||(2307-2529)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (34-233)||(25946-26154)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (11-225)||(10568-10791)
scaffold0143 (60-232)||(33971-34151)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (11-225)||(2561-2783)
scaffold0159 (11-135)||(18458-18582)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (60-230)||(24353-24531)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (60-233)||(3992-4173)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-172)||(16226-16387)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (65-233)||(9037-9214)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (47-225)||(8325-8511)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (60-172)||(40067-40181)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (60-225)||(12715-12888)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (60-126)||(6741-6807)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27283924 - 27283707
Alignment:
Q  14 agatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  27283924 agatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccagaattctatccccagtaagttgattag 27283825  T
Q  114 ctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactcc 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283824 ctatctaccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactcc 27283725  T
Q  214 aatgtcttgtctgtctct 231  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27283724 aatgtcttgtctgtctct 27283707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27623272 - 27623058
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623272 cacagatgcgatatctacaacatacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 27623173  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatac 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623172 tagctatctaccctcagccatggttctggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatac 27623073  T
Q  211 tccaatgtcttgtct 225  Q
    || ||||||||||||    
T  27623072 tctaatgtcttgtct 27623058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 28214094 - 28214316
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| ||  |||||||||||      
T  28214094 cacagatgcgatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttttccccagtaaagccttccgagattcaatttccagcaagttgta 28214193  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  28214194 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 28214293  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  28214294 cccaatactctgatgtcttgtct 28214316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30551553 - 30551331
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  30551553 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 30551454  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  30551453 tagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 30551354  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  || ||||||||    
T  30551353 cccaatactctgatatcttgtct 30551331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34458059 - 34457837
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||      
T  34458059 cacagatgcgatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagactctatctccagcaagttgca 34457960  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||| |||    
T  34457959 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactatgtg 34457860  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  34457859 cccaatactctaatgtcttgtct 34457837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 27064127 - 27064349
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |      
T  27064127 cacagatgcaatgtctataacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagtcgca 27064226  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  27064227 tacttgcctgccctcagccatggttctgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 27064326  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  27064327 cccaatactctaatgtcttgtct 27064349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 26927427 - 26927608
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26927427 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcgagttgattagctatctatcctcagccttggttccgatacgtctcccaacggcgtta 26927526  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927527 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 26927608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 27209574 - 27209755
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27209574 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtta 27209673  T
Q  160 tctccaaagaggactt------ctatg--atgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||       ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27209674 tctccaaagaggatttactggaatatgtaatctagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctatctctgc 27209755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27239654 - 27239473
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27239654 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtta 27239555  T
Q  160 tctccaaagaggactt------ctatg--atgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||       ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27239554 tctccaaagaggatttactggaatatgtaatctagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctatctctgc 27239473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 29579660 - 29579882
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  29579660 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattctccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 29579759  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
     | ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||        | | || ||||||| |||||||||||    
T  29579760 cacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgggccactacgtg 29579859  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  29579860 cccaatactctaatgtcttgtct 29579882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 16756496 - 16756677
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  16756496 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 16756595  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756596 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 16756677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22928406 - 22928198
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagcata-acggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    |||| |||||||||||||| |||   ||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22928406 acccggcactgaaatgcccggcaacgacggcattatccctagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatg 22928307  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22928306 gttccgatacatctcccaacgatgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtc 22928207  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  22928206 tgtctctgc 22928198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 24870402 - 24870564
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  24870402 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 24870501  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
          | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24870502 ggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 24870564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26666210 - 26665988
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  26666210 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 26666111  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||  |  |||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  26666110 tacctgcccaccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtcatatagcacgagccactacgtg 26666011  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  26666010 cccaatactctaatgtcttgtct 26665988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26772181 - 26771959
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  26772181 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 26772082  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||  |  |||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  26772081 tacctgcccaccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtcatatagcacgagccactacgtg 26771982  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  26771981 cccaatactctaatgtcttgtct 26771959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27355656 - 27355434
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  27355656 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgagatgcccagcacaacggcgttttccccggtgaggtctctcaagattctatccccagcaagttgca 27355557  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  27355556 tacctacctgccctcagccttggctccgatacgtcccccaacgacgtcatctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 27355457  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  27355456 cccaatactctgatgtcttgtct 27355434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24299285 - 24299105
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  24299285 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 24299186  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctg 232  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24299185 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctg 24299105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4539296 - 4539110
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4539296 atgcccagcacaacggcattatccccagtaaagtctctcgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtct 4539197  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4539196 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 4539110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15406028 - 15405874
Alignment:
Q  87 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggact--------tcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |        | |     
T  15406028 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggattttcaggaatgtg 15405929  T
Q  179 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15405928 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 15405874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15417815 - 15417661
Alignment:
Q  87 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggact--------tcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |        | |     
T  15417815 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggattttcaggaatgtg 15417716  T
Q  179 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15417715 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 15417661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33369954 - 33369781
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  33369954 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 33369855  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33369854 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 33369781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 4779537 - 4779698
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  4779537 cacagatgcaatgtctacaacgtactcagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 4779636  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||  ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4779637 tacctgcctgccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagagga 4779698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13517731 - 13517545
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  13517731 atgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagcctaggtcccgatacgtct 13517632  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13517631 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtct 13517545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 27200859 - 27201045
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27200859 atgcccagcacaacggtgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtct 27200958  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27200959 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagctcgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 27201045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27248374 - 27248188
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27248374 atgcccagcacaacggtgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtct 27248275  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27248274 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagctcgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 27248188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8899250 - 8899028
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||       
T  8899250 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccaacacaatggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttaca 8899151  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga-cttctatgatg-------tagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || | |  |||       |||||||||||||||||||    
T  8899150 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtg 8899051  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  8899050 cccaatactctaatgtcttgtct 8899028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 29508096 - 29508269
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  29508096 cggcgttattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttacatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 29508195  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29508196 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 29508269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 29556231 - 29556404
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  29556231 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctatctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacggcgtca 29556330  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||| |||| |||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29556331 tcttcaaaaaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 29556404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 27025822 - 27025998
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  27025822 ttattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcataactaccggccctcagccttggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 27025921  T
Q  165 aaagaggact--------tctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||| |        | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025922 aaagaggattttcaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 27025998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 27031701 - 27031877
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  27031701 ttattcccagtagagtcttccgagatcctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 27031800  T
Q  165 aaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27031801 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatgctccagtgtcttgtctgtctctgc 27031877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13292470 - 13292288
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattag-ctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 158  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||     
T  13292470 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagactaccggccctcagccttggtcccgatacgtcccccaacgacgtc 13292371  T
Q  159 atctccaaagaggacttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||||||||| ||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292370 atctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 13292288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14138925 - 14138752
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  14138925 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 14138826  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14138825 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 14138752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 16680785 - 16680946
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||       
T  16680785 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcattgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttaca 16680884  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16680885 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagagga 16680946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16937554 - 16937357
Alignment:
Q  36 ccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||    || ||| | |||||| |||||||||    
T  16937554 ccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatccccagcaagtcacatacctaccggccctcggccatggtt 16937455  T
Q  136 ccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |  ||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16937454 ccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagagaatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 16937357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Original strand, 4764442 - 4764610
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  4764442 ttatccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctcc 4764541  T
Q  165 aaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4764542 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 4764610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 27491800 - 27491987
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||    
T  27491800 atgcccagcacaacggcgttttccccggtgaggtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttacctacctgccctcagccatggtcccgaaacgtc 27491899  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27491900 tcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagctactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 27491987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 26792491 - 26792664
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||      
T  26792491 cggcattatccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcg 26792590  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26792591 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 26792664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 27014399 - 27014572
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |    
T  27014399 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagtcgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtca 27014498  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27014499 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 27014572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26109928 - 26109752
Alignment:
Q  58 aacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctccc-aacggcg 156  Q
    |||||| |||||||||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  26109928 aacggcattatccccagtaaagtctctcgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaaacgacg 26109829  T
Q  157 ttatctccaaagaggacttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    | |||||||||||||| ||| | || |        |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  26109828 tcatctccaaagaggatttccaagaaggtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtct 26109752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 4531956 - 4532142
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||    
T  4531956 atgcccagcacaacggcattatccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatagctaccagccctcagcctaggtcccgaaacgtct 4532055  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4532056 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagctcgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 4532142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 226
Target Start/End: Original strand, 20131253 - 20131369
Alignment:
Q  118 ctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaata 209  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||        | |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  20131253 ctgccctcagccatggtttcgatacgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttccaggaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaaca 20131352  T
Q  210 ctccaatgtcttgtctg 226  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20131353 ctccgatgtcttgtctg 20131369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22201617 - 22201501
Alignment:
Q  118 ctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaata 209  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||        | |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22201617 ctgccctcagccatggtttcgatacgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttccaggaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaaca 22201518  T
Q  210 ctccaatgtcttgtctg 226  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22201517 ctccgatgtcttgtctg 22201501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 28167188 - 28167342
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  28167188 gtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 28167287  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28167288 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 28167342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Original strand, 20175368 - 20175411
Alignment:
Q  183 gtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctg 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  20175368 gtagcacgagccactacgtgctcaatactccgatgtctcgtctg 20175411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22160623 - 22160580
Alignment:
Q  183 gtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctg 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  22160623 gtagcacgagccactacgtgctcaatactccgatgtctcgtctg 22160580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 16680966 - 16681007
Alignment:
Q  184 tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16680966 tagcacgagccactatgtgcccaatactctgatgtcttgtct 16681007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26509198 - 26508968
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26509198 cacagatgcgatatctacaacatacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctacccccagcaagttgat 26509099  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | ||||||||||||||||||||||    
T  26509098 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtg 26508999  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508998 cccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 26508968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26663401 - 26663179
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  26663401 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 26663302  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  26663301 tacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 26663202  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  26663201 cccaatactctaatgtcttgtct 26663179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26678593 - 26678371
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  26678593 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 26678494  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  26678493 tacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 26678394  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  26678393 cccaatactctaatgtcttgtct 26678371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31084113 - 31083890
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  |||||||||||||||| ||||||||     
T  31084113 cacagatgcgatatctacgacatacccagcgctgacatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgt 31084014  T
Q  110 ttagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||    
T  31084013 ttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgt 31083914  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  31083913 gcccaatactctaatgtcttgtct 31083890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 16047981 - 16048189
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16047981 acccaacactgaaatgcccagcgatgacggcattatccccaacagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatg 16048080  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16048081 gttccgatacgtctcccaacgactttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 16048180  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  16048181 tgtctctgc 16048189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16443472 - 16443264
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16443472 acccagcactgaaatgcccagcaatgacggcattatccccagcagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatg 16443373  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16443372 gctccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacatgcccaatacttcaatgtcttgtc 16443273  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  16443272 tgtctctgc 16443264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16744987 - 16744787
Alignment:
Q  33 tacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||    
T  16744987 tacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatg 16744888  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16744887 gttccgtcacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtc 16744788  T
Q  225 t 225  Q
    |    
T  16744787 t 16744787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 26441891 - 26442113
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  26441891 cacagatgcaatgtctacaacatacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggggtctctcaagattctatccccagcaagttgca 26441990  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  26441991 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 26442090  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  26442091 cccaatactctaatgtcttgtct 26442113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 45393866 - 45394027
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  45393866 cacagatgcgatgtttacaacttacccaggactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 45393965  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  45393966 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctctcaacgacgtcatctccaaagagga 45394027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16511939 - 16511708
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttga 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||   | ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16511939 cacagatgcgacatccacgatacatccagcactgaaatgcccggcaatgacggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgc 16511840  T
Q  110 ttagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgt 201  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||| || |||||    
T  16511839 ataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagtcattacgt 16511740  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16511739 gcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 16511708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 26519454 - 26519615
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  26519454 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 26519553  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26519554 tacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagagga 26519615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 5154758 - 5154939
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  5154758 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 5154857  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154858 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 5154939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 10848253 - 10848461
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||| | | |||||||||||||    
T  10848253 acccaacactgaaatgcccagcgatgacggcattatctccagcagagtcttccgagattctgtccccagcaagtcgcgtagcaacccgccctcagccatg 10848352  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||        | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10848353 gttccgatacgtctcccaatgacgttatctccaaagaggatttccaagaatgtgtgatatagcgcgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 10848452  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  10848453 tgtctctgc 10848461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4138734 - 4138512
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  4138734 cacagatgcgatgtttacaacttacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 4138635  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  4138634 tacctgcctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 4138535  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  4138534 cccaatactctaatgtcttgtct 4138512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 11447535 - 11447696
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  11447535 cacagatgcaatgtctacaacgtacccggcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 11447634  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11447635 tacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagagga 11447696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26313317 - 26313130
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26313317 atgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccgatacgtc 26313218  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26313217 tcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 26313130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 2161247 - 2161427
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||      
T  2161247 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagcta-ctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcg 2161345  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2161346 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 2161427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24586025 - 24585802
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  24586025 cacagatgcgatgtttacaacttacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 24585926  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  24585925 tatctacctgccttcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 24585826  T
Q  203 cccaatactc-caatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  ||||||||||||    
T  24585825 cccaatactctaaatgtcttgtct 24585802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31557858 - 31557671
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31557858 atgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatccccaagcaagttgtttacctacctgccctcagccatggttccgatacgtc 31557759  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||| |||        | | || |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31557758 tcccaacgacgccatctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagctactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 31557671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 4206058 - 4206244
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4206058 atgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcggccatggttccggcacgtct 4206157  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4206158 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaacactctaatgtcttgtct 4206244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26268574 - 26268353
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  26268574 cacagatgcaatgtctacaacatacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 26268475  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||  |||||||||||| | | ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  26268474 tacctgcctgccctcagcc-taggtccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 26268376  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  26268375 cccaatactctgatgtcttgtct 26268353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 5165059 - 5165240
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| ||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  5165059 cggcattatccctagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 5165158  T
Q  160 tctccaaagaggacttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5165159 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 5165240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11418243 - 11418062
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  11418243 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 11418144  T
Q  160 tctccaaagaggacttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||| |        | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11418143 tctccaaagaggatttccaggaatgcgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtctgtctctgc 11418062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 26596338 - 26596525
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagcca-tggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  26596338 atgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctattggttccgacacgtc 26596437  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26596438 tcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcatgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 26596525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10910390 - 10910208
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |    
T  10910390 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacaacgtca 10910291  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgct 234  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10910290 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgct 10910208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 2779919 - 2780092
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2779919 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacggcgtca 2780018  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||| ||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2780019 tcttcaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 2780092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 31130579 - 31130765
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagcca-tggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  31130579 atgcccagcacaacggcatt-tccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccattggttccaatacgtc 31130677  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31130678 tcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 31130765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Original strand, 3451926 - 3452038
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  3451926 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctccggtacgtctcccaacgacgtca 3452025  T
Q  160 tctccaaagagga 172  Q
    |||||||||||||    
T  3452026 tctccaaagagga 3452038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5140826 - 5140604
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  | | ||||  ||||| | |||||||||||||||       
T  5140826 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcattgaaatgcccagcacaacggcgttttccccgttggagtctctcaagactttatccccagcaagttaca 5140727  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga-cttctatgatg-------tagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||| || | |  |||       |||||||||||||||||||    
T  5140726 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaatgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtg 5140627  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5140626 cccaatactctaatgtcttgtct 5140604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 22148563 - 22148736
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  22148563 cggcattattcccagtagagtcttccgagatcctatccccagccagttgcatgcctacctgccctcagccagggttccgatacgtctcccaacgacgtca 22148662  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22148663 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 22148736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 22152790 - 22152963
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  22152790 cggcattattcccagtagagtcttccgagatcctatccccagccagttgcatgcctacctgccctcagccagggttccgatacgtctcccaacgacgtca 22152889  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22152890 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 22152963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 22208705 - 22208878
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  22208705 cggcattattcccagtagagtcttccgagatcctatccccagccagttgcatgcctacctgccctcagccagggttccgatacgtctcccaacgacgtca 22208804  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22208805 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 22208878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39206585 - 39206431
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  39206585 gtctcccaagattctatcctcagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 39206486  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39206485 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 39206431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 45737995 - 45738149
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  45737995 gtctcccaagattctatccccagcaaattgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 45738094  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45738095 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 45738149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24585978 - 24585747
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttga 109  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||     
T  24585978 cacagatgcgatatctacaacatacccagcactgaaatgcccggcaatgacggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgc 24585879  T
Q  110 ttagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||    
T  24585878 atagctatctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgt 24585779  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24585778 gcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 24585747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 54840050 - 54840272
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  54840050 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 54840149  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  54840150 tacctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 54840249  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  54840250 cccaataatccaatgtcttgtct 54840272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 1906949 - 1907157
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  1906949 acccagcactgaaatgcccagcaatgacggcattatccccagtagagccttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatg 1907048  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907049 gttccgatacgtctcccaatgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 1907148  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  1907149 tgtctctgc 1907157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 15234500 - 15234708
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  15234500 acccagcactaaaatgcccagcgatgacggcattatccccagcagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatg 15234599  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15234600 gttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 15234699  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  15234700 tgtctctgc 15234708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20332041 - 20331819
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  20332041 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 20331942  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  20331941 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 20331842  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  20331841 cccaatactctaatgtcttgtct 20331819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 21976363 - 21976585
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  21976363 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 21976462  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  21976463 tagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 21976562  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  || ||||||||    
T  21976563 cccaatactctgatatcttgtct 21976585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31120116 - 31119894
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  31120116 cacagatgcaatgtttacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 31120017  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  31120016 tagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 31119917  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  31119916 cccaatactctgatgtcttgtct 31119894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 5012540 - 5012763
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  5012540 cacagatgcgatatctacgacatacccagcgctgacatgcccagcacaatggtgttatccccagtcgggtctctcaagattctatccccagcaagttgca 5012639  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  5012640 tacctacctgccctcagccgtggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 5012739  T
Q  203 -cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
     ||||| |||| ||||||||||||    
T  5012740 ccccaacactctaatgtcttgtct 5012763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15379822 - 15379614
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15379822 acccaacactaaaatgcccagcgatgacggcattatctccagcagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatg 15379723  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||        | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15379722 gtcccgatacgtctcccaacgacgttatatccaaagaggatttccaagaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatattccaatgtcttgtc 15379623  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  15379622 tgtctctgc 15379614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40099239 - 40099017
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  40099239 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 40099140  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  40099139 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 40099040  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  40099039 cccaatactctaatgtcttgtct 40099017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15276164 - 15276002
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||      
T  15276164 gtcttccgagattctgtccccagcaagtcgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacaacgttatctccaaagaggatttcca 15276065  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
          | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276064 agaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 15276002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33667407 - 33667246
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  33667407 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 33667308  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33667307 tacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagagga 33667246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 14671717 - 14671879
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  14671717 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 14671816  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
          | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14671817 ggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 14671879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27156896 - 27156710
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  27156896 atgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtct 27156797  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27156796 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 27156710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 30760423 - 30760584
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  30760423 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 30760522  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  30760523 tacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaaagga 30760584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Original strand, 17019737 - 17019917
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  17019737 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 17019836  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctg 232  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17019837 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctg 17019917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 14105203 - 14105425
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||       
T  14105203 cacagatgcaatgtctacaacatatccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatccccagcaagttaca 14105302  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||        | | || |||||||||||||||||||    
T  14105303 tacctaccgaccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 14105402  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  14105403 cccaatactctaatgtcttgtct 14105425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 6576544 - 6576718
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  6576544 cggcattatccccagtggagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacttacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 6576643  T
Q  160 tctcc-aaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||| |||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6576644 tctccaaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 6576718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14753073 - 14752900
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  14753073 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 14752974  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  14752973 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtct 14752900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 5701224 - 5701410
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  5701224 atgcccagcacaacggcattgtccccggtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggttctgatacgtct 5701323  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5701324 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 5701410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 39857342 - 39857496
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||      
T  39857342 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccacagaagaattcca 39857441  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39857442 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 39857496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36323894 - 36323721
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  36323894 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 36323795  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36323794 tctccaaggaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtct 36323721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36338103 - 36337930
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  36338103 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 36338004  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36338003 tctccaaggaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtct 36337930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18794208 - 18794027
Alignment:
Q  50 cccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctccc 149  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18794208 cccagcacaacggcgttttccccggtggagtct--caagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctccc 18794111  T
Q  150 aacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18794110 aacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 18794027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34182515 - 34182341
Alignment:
Q  59 acggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 158  Q
    ||||| |||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||     
T  34182515 acggcattattcccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgacacgtctcccaacgacgtc 34182416  T
Q  159 atctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34182415 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactatgtgcccaatactctaatgtcttgtct 34182341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 24119349 - 24119523
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||   |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  || |    
T  24119349 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatctactggccctcagccttggtcccgatacgtctcccaacgatgtca 24119448  T
Q  160 tctccaaagaggact---------tctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |         | | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24119449 tctccaaagaggattttccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 24119523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24814726 - 24814685
Alignment:
Q  184 tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24814726 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 24814685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24813822 - 24813781
Alignment:
Q  184 tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24813822 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 24813781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21696761 - 21696553
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  21696761 acccagcactgaaatgcccagcaatgacggcattatccccagtagagccttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatg 21696662  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696661 gttccgatacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatattgcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 21696562  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  21696561 tgtctctgc 21696553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13930205 - 13929983
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13930205 cacagatgcaatgtctacaacatacccaacactgaaatgcccagcacaacggcgttctccccagtcaggtctcccaagattctatctccagcaagttgtt 13930106  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  13930105 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 13930006  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  13930005 cccaatactctaatgtcttgtct 13929983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19410078 - 19409856
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  19410078 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 19409979  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  19409978 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 19409879  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  19409878 cccaatactctaatgtcttgtct 19409856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 3789091 - 3789313
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  3789091 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 3789190  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  3789191 tagctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 3789290  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  3789291 cccaatactctgatgtcttgtct 3789313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 231
Target Start/End: Original strand, 27397005 - 27397211
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  27397005 acccaacactgaaatgcccagcgatgacggcattatccccagcggagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatg 27397104  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397105 gttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaagaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 27397204  T
Q  225 tgtctct 231  Q
    |||||||    
T  27397205 tgtctct 27397211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 39896717 - 39896939
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39896717 cacagatgcgatatccacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatccccagcaagttgca 39896816  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  39896817 tacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 39896916  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  39896917 cccaatattctgatgtcttgtct 39896939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21670767 - 21670545
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  21670767 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 21670668  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  21670667 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 21670568  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  21670567 cccaatactctaatgtcttgtct 21670545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 37932025 - 37932247
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  37932025 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 37932124  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  37932125 tagctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 37932224  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||| |||  |||||||||||    
T  37932225 cccaatgctctgatgtcttgtct 37932247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34268495 - 34268287
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  34268495 acccagcactgaaatgctcggcaatgacagcattatccccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatg 34268396  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatg-atg-------tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34268395 gttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 34268296  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  34268295 tgtctctgc 34268287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11628779 - 11628557
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  11628779 cacagatgcaatgtctacgacttacccagcactgaaatgcctagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgca 11628680  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  11628679 tacctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 11628580  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11628579 cccaatactccaatgtcttgtct 11628557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 16168126 - 16168348
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  16168126 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 16168225  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  16168226 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 16168325  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  16168326 cccaatactctaatgtcttgtct 16168348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16822932 - 16822710
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  16822932 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 16822833  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  16822832 tagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 16822733  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  16822732 cccaatactctgatgtcttgtct 16822710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 16898548 - 16898770
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  16898548 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 16898647  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  16898648 tagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 16898747  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  16898748 cccaatactctgatgtcttgtct 16898770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 27810351 - 27810573
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  27810351 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 27810450  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  27810451 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 27810550  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  27810551 cccaatactctaatgtcttgtct 27810573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 34297797 - 34298019
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  34297797 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcatttttcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgca 34297896  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  34297897 tacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 34297996  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  34297997 cccaatactctaatgtcttgtct 34298019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 254246 - 254024
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  254246 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgtccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgta 254147  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  254146 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 254047  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  254046 cccaatactctaatgtcttgtct 254024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9343581 - 9343359
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  9343581 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 9343482  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||| |||||||||    
T  9343481 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagtcactacgtg 9343382  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  9343381 cccaatactctaatgtcttgtct 9343359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 32056400 - 32056622
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  32056400 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 32056499  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  32056500 tagctacctgccctcagctatggttccgacacatctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 32056599  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  32056600 cccaatactctgatgtcttgtct 32056622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37679492 - 37679270
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  37679492 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 37679393  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||        | | || |||||||||||||||||||    
T  37679392 tatctacctgccctcagctatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 37679293  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  37679292 cccaatactctaatgtcttgtct 37679270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37694757 - 37694535
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  37694757 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 37694658  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||        | | || |||||||||||||||||||    
T  37694657 tatctacctgccctcagctatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 37694558  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  37694557 cccaatactctaatgtcttgtct 37694535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37945459 - 37945237
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  37945459 cacagatgcaatgtctacaacatacccaacactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 37945360  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  37945359 tatctacctgccctcagctatggttccgacacatctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 37945260  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  37945259 cccaatactctaatgtcttgtct 37945237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 12593462 - 12593684
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  12593462 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 12593561  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga-cttctatgatg-------tagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || | |  |||       |||||||||||||||||||    
T  12593562 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtg 12593661  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  12593662 cccaatactctaatgtcttgtct 12593684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19449985 - 19449776
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||    
T  19449985 acccaacactgaaatgcccagcgatgacggtattatctccagcggagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcagccat 19449886  T
Q  132 ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||        |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19449885 ggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttctaagaatgtgtgatatagcgcgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 19449786  T
Q  224 ctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||    
T  19449785 ctgtctctgc 19449776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 23117471 - 23117652
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |    
T  23117471 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgcctcccaacgacgtca 23117570  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117571 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 23117652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22921738 - 22921516
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  22921738 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 22921639  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  22921638 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 22921539  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  22921538 cccaatactctgatgtcttgtct 22921516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 34868282 - 34868443
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  34868282 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 34868381  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34868382 tacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagagga 34868443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39045477 - 39045254
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagc-aagttga 109  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  39045477 cacagatgcaatgtctacaacatatccagcactggaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaaagttgc 39045378  T
Q  110 ttagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatg-atg-------tagcacgagccactacgt 201  Q
     || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||       ||||||||||||||||||    
T  39045377 atatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgt 39045278  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  39045277 gcccaatactctaatgtcttgtct 39045254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 20844590 - 20844771
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  20844590 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 20844689  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||||| || |||        | | || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20844690 tctccaaagatgatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcctaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 20844771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 28888929 - 28889110
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  28888929 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 28889028  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28889029 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacatgcccaatactccaacatcttgtctgtctctgc 28889110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27428000 - 27427837
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttg-attagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc- 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||     
T  27428000 gtcttccgagattctgtccccagcaagttgcataagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaggaggatttcc 27427901  T
Q  177 -------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
           | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27427900 aggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 27427837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 27782874 - 27783093
Alignment:
Q  14 agatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattag 113  Q
    |||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||   ||     
T  27782874 agatgcaatgtctacaacatacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgtttttcccagtggagtctctcaagattctatccccagcaagttacatac 27782973  T
Q  114 ctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgccc 205  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||| |||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||    
T  27782974 ctaccggccctcggccatggttccgatacgtctaccaacgacatcatctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgccc 27783073  T
Q  206 aatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  27783074 aatactctaatgtcttgtct 27783093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 31882955 - 31883141
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  31882955 atgcccagcacaacggcattgtccccggtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggttctgatacgtct 31883054  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31883055 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 31883141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 37384371 - 37384525
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||      
T  37384371 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccacagaagaattcca 37384470  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37384471 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 37384525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31868354 - 31868173
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||   || ||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  31868354 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccatcaagtttcatacctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 31868255  T
Q  160 tctccaaagaggacttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868254 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 31868173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 40240171 - 40240393
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | || |  ||||| |||||||||||||||||       
T  40240171 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcattgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtgtctcaagactctatccccagcaagttaca 40240270  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga-cttctatgatg-------tagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || | |  |||       |||||||||||||||||||    
T  40240271 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtg 40240370  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| || |||||||||    
T  40240371 cccaatactctaacgtcttgtct 40240393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Original strand, 12662165 - 12662346
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 158  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||     
T  12662165 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatcctcaagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtc 12662264  T
Q  159 atctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctg 232  Q
    |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12662265 atctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctg 12662346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 34161525 - 34161711
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||| ||| || | |||||||    
T  34161525 atgcccaacacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccagccctcagccttggctctgatacgtct 34161624  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttctatg-atg-------tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34161625 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 34161711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12710169 - 12709996
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |    
T  12710169 cggcattatccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagtggcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtca 12710070  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12710069 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgggccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 12709996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 27123216 - 27123370
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  27123216 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 27123315  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27123316 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 27123370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 3790473 - 3790514
Alignment:
Q  184 tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3790473 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 3790514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 29835976 - 29836198
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  29835976 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 29836075  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  29836076 tacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 29836175  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  29836176 cccaatactctgatgtcttgtct 29836198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12086297 - 12086075
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| ||  |||||||||||      
T  12086297 cacagatgcgatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttttccccagtaaagccttccgagattcaatttccagcaagttgta 12086198  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  12086197 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 12086098  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  12086097 cccaatactctgatgtcttgtct 12086075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28355521 - 28355299
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  28355521 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 28355422  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  28355421 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 28355322  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28355321 cccaatactctaatgtcttgtct 28355299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22074475 - 22074267
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22074475 acccaacacttaaatgcccagcgatgacggcattatctccagcagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatg 22074376  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||        | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22074375 gtcccgatacgtctcccaacgacgttatatccaaagaggatttccaagaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatattccaatgtcttgtc 22074276  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  22074275 tgtctctgc 22074267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31483440 - 31483218
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  31483440 cacagatgcaatgtctacaacatacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaaattgca 31483341  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  31483340 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 31483241  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  31483240 cccaatactctaatgtcttgtct 31483218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2130804 - 2130623
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  2130804 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 2130705  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2130704 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 2130623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 15774250 - 15774431
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  15774250 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 15774349  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15774350 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 15774431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 19681109 - 19681270
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  19681109 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 19681208  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19681209 tacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagagga 19681270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Original strand, 19694767 - 19694973
Alignment:
Q  36 ccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggt 134  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  19694767 ccagcactgaaatgcccggcaatgacggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggt 19694866  T
Q  135 tccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctg 226  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19694867 tccgatacgtctctcaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatataacacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctg 19694966  T
Q  227 tctctgc 233  Q
    |||||||    
T  19694967 tctctgc 19694973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 33265373 - 33265595
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  33265373 cacagatgcaatgtctacaacatacccagctttgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgca 33265472  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  33265473 tacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatttccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 33265572  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  33265573 cccaatactctaatgtcttgtct 33265595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 22139595 - 22139771
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22139595 ttatccccagtagagtcttccgagattctgtccccagcaagttgtatagctacctgccctcagtcatggttccgataagtctcccaacgacgttatctcc 22139694  T
Q  165 aaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22139695 aaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 22139771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19654912 - 19654681
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttga 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||   |||| |||||||||||||| | | | ||||| |||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19654912 cacagatgcgacatccacgatacacccggcactgaaatgcccggtaatgacggcattattcccagtagagccttccgagattctatccccagcaagttgc 19654813  T
Q  110 ttagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgt 201  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||    
T  19654812 atagctacctgccctcagtcatggttccgataagtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgt 19654713  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19654712 gcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 19654681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 18797404 - 18797566
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  18797404 gtctcccaagattctatccttagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 18797503  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797504 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 18797566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 33249039 - 33249220
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  33249039 cggcattattcccagtagagtcttccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagccttggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 33249138  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33249139 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtttgtctctgc 33249220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 14569836 - 14570012
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  14569836 ttattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 14569935  T
Q  165 aaagaggacttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||| ||| | ||        | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569936 aaagaggatttccaagaatgtgtagtatagcacgagccactgtgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 14570012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 16260564 - 16260795
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttga 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||| | | | ||||| |||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16260564 cacagatgcgacatccacgatacacccgacactgaaatgcccggtaatgacggcattattcccagtagagccttccgagattctatccccagcaagttgc 16260663  T
Q  110 ttagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgt 201  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||    
T  16260664 atagctacctgccctcagtcatggttccgataagtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgt 16260763  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16260764 gcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 16260795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 31361181 - 31361404
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccc-agcaagttga 109  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||| | ||||||| |||||||||     
T  31361181 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgttgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagactttatcccccagcaagttgc 31361280  T
Q  110 ttagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgt 201  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||    
T  31361281 atacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgt 31361380  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  31361381 gcccaatactctaatgtcttgtct 31361404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 44567633 - 44567794
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||      
T  44567633 cacagatgcaatgtctacaacatacccagctttgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatttccagcaagttgca 44567732  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44567733 tagctacctgtcctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagagga 44567794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21341702 - 21341525
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 163  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  21341702 ttattcccagtagagtcttccgagattctatcctcaagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctc 21341603  T
Q  164 caaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341602 caaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 21341525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 18716177 - 18716331
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  18716177 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 18716276  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18716277 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 18716331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19201917 - 19201730
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||  |||||    
T  19201917 atgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagctgtggttccgacacgtc 19201818  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19201817 tcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 19201730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 9361257 - 9361478
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||| |||||||||||| ||||       
T  9361257 cacagatgcaatgtctacgacgtatccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagccagttaca 9361356  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggact--------tctatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |        | | | || |||||||||||||||||||    
T  9361357 tacctaccggccctcagctatgg-tccgatacgtcccccaacgacgtcatctccaaagaggattttcaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 9361455  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  9361456 cccaatactctgatgtcttgtct 9361478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19910676 - 19910522
Alignment:
Q  87 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------ta 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        |     
T  19910676 agattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 19910577  T
Q  179 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    | || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19910576 taatatagcacgagccactgtgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 19910522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27602449 - 27602268
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  27602449 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccttagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 27602350  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
     |||||||||||| |||        | | || |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27602349 gctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccaccgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgc 27602268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 15775288 - 15775329
Alignment:
Q  184 tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15775288 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 15775329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15752364 - 15752142
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  15752364 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 15752265  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  15752264 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 15752165  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  15752164 cccaatactctaatgtcttgtct 15752142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 30036081 - 30036303
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  30036081 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 30036180  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  30036181 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 30036280  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  30036281 cccaatactctgatgtcttgtct 30036303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 22895084 - 22895292
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22895084 acccagcactgaaatgcccaacaatgatggcatcatccccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatg 22895183  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22895184 gttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgacttgtc 22895283  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  22895284 tgtctctgc 22895292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 33523039 - 33523261
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  33523039 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 33523138  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  33523139 tagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 33523238  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  33523239 cccaatactctgatgtcttgtct 33523261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40467055 - 40466833
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  40467055 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 40466956  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  40466955 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 40466856  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  40466855 cccaatactctaatgtcttgtct 40466833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32589781 - 32589559
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||      
T  32589781 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttctccccagtcaggtctcccaagattctatctccagcaagttgta 32589682  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  32589681 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 32589582  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32589581 cccaatactccaatgtcttgtct 32589559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 23898552 - 23898761
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccat 131  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  23898552 acccggcactgaaatgcccggcaatgacggcattatccccagtagagtcttccgagattctatccccaagcaagttgcatagctacctgccctcagccat 23898651  T
Q  132 ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23898652 ggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccaatgtcttgt 23898751  T
Q  224 ctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||    
T  23898752 ctgtctctgc 23898761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 43084909 - 43085124
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||       
T  43084909 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttaca 43085008  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatg-atgtagcacgagccactacgtgcccaata 209  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||    
T  43085009 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccagagaggatttccaagaatatagcacgagccattacgtgcccaata 43085108  T
Q  210 ctccaatgtcttgtct 225  Q
    ||| ||||||||||||    
T  43085109 ctctaatgtcttgtct 43085124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13318332 - 13318110
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  13318332 cacagatgcgatatctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 13318233  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||  ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  13318232 tacctgcctgccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 13318133  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  13318132 cccaatattctgatgtcttgtct 13318110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 37761629 - 37761790
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  37761629 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 37761728  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  37761729 cagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatcttcaaagagga 37761790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 3796188 - 3796410
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  3796188 cacagatgaaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 3796287  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  3796288 tacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 3796387  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  3796388 cccaatgctctaatgtcttgtct 3796410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 6880984 - 6881170
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6880984 atgcccagcacaacggcgttattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtct 6881083  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6881084 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 6881170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 11330289 - 11330511
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||       
T  11330289 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtctctcaagactctatccccagcaagttaca 11330388  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||| |||||||    
T  11330389 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccgctacgtg 11330488  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  11330489 cccaatactctaatgtcttgtct 11330511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 30175123 - 30175345
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  30175123 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 30175222  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  30175223 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaagatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 30175322  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  30175323 cccaatactctaatgtcttgtct 30175345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31819891 - 31819766
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31819891 atgcccagcacaacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtct 31819792  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31819791 cccaacgacgtcatctccaaagagga 31819766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18494274 - 18494052
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||      
T  18494274 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcattgaaatgctcagcacaacggcgttttccccggtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgca 18494175  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatg-atg-------tagcacgagccactacgtg 202  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||       ||||||||||||||| |||    
T  18494174 tagctactggccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactatgtg 18494075  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  18494074 cccaatactctgatgtcttgtct 18494052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 23726921 - 23727102
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  23726921 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 23727020  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23727021 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 23727102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 28655900 - 28656122
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||| ||      
T  28655900 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaaggtgca 28655999  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatg-atg-------tagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | | |||       |||||||||||||||||||    
T  28656000 tacctacctgccctcagccttgactccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaagatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtg 28656099  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28656100 cccaatactctaatgtcttgtct 28656122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22992593 - 22992417
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  22992593 ttattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 22992494  T
Q  165 aaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992493 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 22992417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 5644455 - 5644677
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  ||||||||| ||  ||||||||||      
T  5644455 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctgtctacagcaagttgca 5644554  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  5644555 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 5644654  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5644655 cccaatactctaatgtcttgtct 5644677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37352134 - 37351948
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37352134 atgcccagcacaacggcattatccccagtaaagtctctcgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtct 37352035  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37352034 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 37351948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28953265 - 28953079
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28953265 atgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccgagattctgtccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtct 28953166  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggactt------ctatg--atgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||       ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953165 cccaacgacgtcatctccaaagaggattttcaagaatatgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 28953079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 9324154 - 9324341
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9324154 atgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccgatacgtc 9324253  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9324254 tcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 9324341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 26487064 - 26487251
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26487064 atgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccgatacgtc 26487163  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26487164 tcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 26487251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 24608929 - 24609110
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |    
T  24608929 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctctcaacgacgtca 24609028  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24609029 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 24609110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 24976528 - 24976709
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  24976528 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 24976627  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24976628 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgc 24976709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 232
Target Start/End: Original strand, 23632659 - 23632834
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  23632659 ttattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 23632758  T
Q  165 aaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctg 232  Q
    |||||||| |||        | | || |||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23632759 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccaccgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctg 23632834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 232
Target Start/End: Original strand, 25206998 - 25207173
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25206998 ttatcctcagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccctggttctgatacgtctcccgacgacgttatctcc 25207097  T
Q  165 aaagaggact--------tctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctg 232  Q
    |||||||| |        | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25207098 aaagaggattcccaggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgactatctctg 25207173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 232
Target Start/End: Original strand, 25271154 - 25271329
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25271154 ttatcctcagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccctggttctgatacgtctcccgacgacgttatctcc 25271253  T
Q  165 aaagaggact--------tctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctg 232  Q
    |||||||| |        | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25271254 aaagaggattcccaggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgactatctctg 25271329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 12138853 - 12139039
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  12138853 atgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtct 12138952  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12138953 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 12139039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 33881797 - 33881983
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  33881797 atgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagcctaggtcccgatacgtct 33881896  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33881897 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtct 33881983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9544185 - 9544012
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  9544185 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 9544086  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9544085 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 9544012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 11556043 - 11556219
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11556043 ttattcccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 11556142  T
Q  165 aaagaggacttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||| ||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11556143 aaagaggatttccaggaatgcgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 11556219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37745819 - 37745635
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37745819 atgcccagcacaacggtgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcgagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtct 37745720  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 223  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37745719 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgt 37745635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13436175 - 13435953
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  13436175 cacagatgcaatgtctacaacatacccaacgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgca 13436076  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||||||| ||| || | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  13436075 tacctaccagccctcagccttggctctgatacgtctcccaatgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 13435976  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  13435975 cccaatactctgatgtcttgtct 13435953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18369036 - 18368814
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||       
T  18369036 cacagatgcaatgtctacaacatatccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagtctctcaaggctctatccccagcaagttaca 18368937  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |  ||        | | || |||||||||||||||||||    
T  18368936 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagagaatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 18368837  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  18368836 cccaatactctaatgtcttgtct 18368814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 30158711 - 30158897
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||  |||||||| |||||| | |||||||    
T  30158711 atgcccagcacaacggcattttccccagtcaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctatcctcagccttggttctgatacgtct 30158810  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30158811 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 30158897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 30941314 - 30941492
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  30941314 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 30941413  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctc 230  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30941414 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgtgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctc 30941492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 34623190 - 34623376
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  34623190 atgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgcccccagccttggctccgatacgtct 34623289  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34623290 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 34623376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 2517749 - 2517922
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  2517749 cggcattatccccagtaaagtctttcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccgtggctccggtacgtctcccaacgacgtca 2517848  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2517849 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 2517922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18121886 - 18121717
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  18121886 ttattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccttggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 18121787  T
Q  165 aaagaggacttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactc-caatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |        |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18121786 aaagaggatttccaggaatgcgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaaatgtcttgtct 18121717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 33299220 - 33299401
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || | ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  33299220 cggcattattcccagtagagtctcccgatattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctccgcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 33299319  T
Q  160 tctccaaagaggacttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33299320 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 33299401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 33784166 - 33784347
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |   ||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  33784166 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcaacttaggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 33784265  T
Q  160 tctccaaagaggacttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33784266 tctccaaagaggatttccaggaatgcgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 33784347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13180241 - 13180093
Alignment:
Q  93 tatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatga--------tgt 184  Q
    |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||        | |    
T  13180241 tatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatat 13180142  T
Q  185 agcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13180141 agcacgagccactacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 13180093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15652218 - 15652045
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| | | |    
T  15652218 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccttggtttcgacacgtctcccaacgacatca 15652119  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15652118 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 15652045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 31438141 - 31438314
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |    
T  31438141 cggcattatccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacttacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtca 31438240  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31438241 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 31438314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8658931 - 8658777
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||      
T  8658931 gtcttccgagattctatttccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccagcgacgtcatctccaaagaggatttcca 8658832  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8658831 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaacactctgatgtcttgtct 8658777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 24730653 - 24730826
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |    
T  24730653 cggcattatccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagtggcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtca 24730752  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24730753 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgggccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 24730826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 41681408 - 41681564
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttct- 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |     
T  41681408 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagttacctgccctcagtcatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttttc 41681507  T
Q  178 -----atg----atgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
         |||    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41681508 caagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgacttgtct 41681564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37664961 - 37664788
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||  |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  37664961 cggcgttttccccagtaaagtctttcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcccaccctcagccttggttccgaaacgtctcccaacgacgtca 37664862  T
Q  160 tctccaaagaggacttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| ||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37664861 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtct 37664788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13178824 - 13178783
Alignment:
Q  184 tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13178824 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 13178783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 24334788 - 24335010
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  24334788 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 24334887  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  24334888 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 24334987  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  24334988 cccaatactctaatgtcttgtct 24335010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 18231804 - 18232026
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  18231804 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 18231903  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  18231904 tagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 18232003  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  18232004 cccaatactctgatgtcttgtct 18232026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17978598 - 17978378
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  17978598 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcgctgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgca 17978499  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  17978498 tagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 17978399  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgt 223  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  17978398 cccaatactctgatgtcttgt 17978378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6536390 - 6536168
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  6536390 cacagatgcgatgtccacaacgtacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 6536291  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  6536290 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 6536191  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  6536190 cccaatattctgatgtcttgtct 6536168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 10649683 - 10649904
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||      
T  10649683 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaag-tcttccaagattctatccccagcaagttgca 10649781  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  10649782 tacctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 10649881  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  10649882 cccaatactctgatgtcttgtct 10649904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29658614 - 29658392
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  29658614 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgca 29658515  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatg-atg-------tagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||       |||||||||||||||||||    
T  29658514 tatctacctgccctcagctatggttccaacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtg 29658415  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  29658414 cccaatactctaatgtcttgtct 29658392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28109575 - 28109388
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtc-gggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28109575 atgcccagcacaacggcgttttccccagtcagggttttccaagattctatctccagcaagttgtttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtc 28109476  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28109475 tcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 28109388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 232
Target Start/End: Original strand, 15367877 - 15368085
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| ||||    
T  15367877 acccaacactgaaatgcccagcgatgacggcattatccccagcagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcaaccat 15367976  T
Q  132 ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 223  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||        | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367977 ggttccgatacgtctcccaatgacgttatctccaaagaggatttccaagaatgtgtgatgtagcgcgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 15368076  T
Q  224 ctgtctctg 232  Q
    |||||||||    
T  15368077 ctgtctctg 15368085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 19701029 - 19701233
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  19701029 acccggcactgaaaggcccggcaatgacggcattatccccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgtatagctacctgccctcagtcatg 19701128  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19701129 gttccgatacgtctcccaatggcgttatctccaaagaagatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 19701228  T
Q  225 tgtct 229  Q
    |||||    
T  19701229 tgtct 19701233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15886388 - 15886157
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttga 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||   | ||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  15886388 cacagatgcgacatccacgatacatccagcacagaaatgcccggcaatgacggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagatgc 15886289  T
Q  110 ttagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgt 201  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||    
T  15886288 atagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgt 15886189  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15886188 gcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgc 15886157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 5020323 - 5020545
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  5020323 cacagatgcaatgtctacaacatacccagctttgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgca 5020422  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  5020423 tatctacctgccctcagctatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 5020522  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5020523 cccaatactctaatgtcttgtct 5020545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 28345783 - 28346005
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  28345783 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 28345882  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  28345883 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagccactacgtg 28345982  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28345983 cccaatactctaatgtcttgtct 28346005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 4728265 - 4728446
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  4728265 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 4728364  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4728365 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 4728446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 5658773 - 5658954
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  5658773 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 5658872  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5658873 tctccaaagaggatttccaggaaggtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 5658954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 6208534 - 6208715
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  6208534 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 6208633  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208634 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 6208715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5590003 - 5589781
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||      
T  5590003 cacagatgcaatgtctacaacatatccagcactgaaatgcccagcgcaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctctagcaagttgca 5589904  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||| |||||||||    
T  5589903 tacctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagtcactacgtg 5589804  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5589803 cccaatactctaatgtcttgtct 5589781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5602960 - 5602738
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  5602960 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 5602861  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  5602860 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 5602761  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  5602760 cccaatactctgatgtcttgtct 5602738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 32297243 - 32297465
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||      
T  32297243 cacagaggcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcgagttgca 32297342  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||        | | || |||||||||||||||||||    
T  32297343 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 32297442  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  32297443 cccaatactctaatgtcttgtct 32297465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 51788634 - 51788795
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  51788634 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 51788733  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51788734 tacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagagga 51788795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16618116 - 16617907
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||    
T  16618116 acccaacactgaaatgcccagcgatgacagcattatccccagcggagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcagccat 16618017  T
Q  132 ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 223  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| |||        | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618016 ggttccgatgcgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttccaagaatgtgtgatatagcacgagctactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 16617917  T
Q  224 ctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||    
T  16617916 ctgtctctgc 16617907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 18057907 - 18058088
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  18057907 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 18058006  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18058007 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 18058088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22381201 - 22381020
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  22381201 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 22381102  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22381101 tctccaaagaggatttccaggaaagtataatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcctgtctgtctctgc 22381020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29142375 - 29142194
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  29142375 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 29142276  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||| ||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142275 tctccgaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 29142194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 18337268 - 18337444
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  18337268 ttattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcgtagctacctgccctcagccagggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 18337367  T
Q  165 aaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||| |||        ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18337368 aaagaggatttccaggaaagtataatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcctgtctgtctctgc 18337444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 233
Target Start/End: Original strand, 4690292 - 4690495
Alignment:
Q  39 gcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttcc 137  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4690292 gcactgaaatgcccagcaatgacggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtccc 4690391  T
Q  138 ggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtct 229  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4690392 gatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtct 4690491  T
Q  230 ctgc 233  Q
    ||||    
T  4690492 ctgc 4690495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 47030068 - 47030290
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagc-aagttga 109  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  47030068 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaa-tgcccagcacaacggcgttttccccagtggagtcttccaagattctatctccagcaaagttgc 47030166  T
Q  110 ttagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgt 201  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||    
T  47030167 atagctacctgccctcagccatggttccgatgcgtctcccaacgacgtcatcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgt 47030266  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||  |||||||||||    
T  47030267 gcccaatattctgatgtcttgtct 47030290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16404439 - 16404217
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  16404439 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagcactgagatgcccagcacaacggcgttttccccggtgaggtctctcaagattctatccccagcaagttgca 16404340  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  16404339 tacctacctgccctcagccttggctccgatacgtcccccaacgacgtcatctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 16404240  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  16404239 cccaatactctgatgtcttgtct 16404217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 233
Target Start/End: Original strand, 16422845 - 16423027
Alignment:
Q  59 acggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 158  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16422845 acggcattatccccagtagagtcttccgagattctatcccctgcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtt 16422944  T
Q  159 atctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16422945 atctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtacccaatactccagtgccttgtctgtctctgc 16423027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20570503 - 20570281
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||       
T  20570503 cacagatgcaatgtctacaacatacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagtctctcaagattctatccccagcaagttaca 20570404  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  20570403 tacctaccggtcctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 20570304  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  20570303 cccaatactctaatgtcttgtct 20570281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Original strand, 5717703 - 5717886
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  5717703 atgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtct 5717802  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttg 222  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5717803 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttg 5717886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Original strand, 5728613 - 5728796
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  5728613 atgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtct 5728712  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttg 222  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5728713 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttg 5728796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5763755 - 5763572
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  5763755 atgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtct 5763656  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttg 222  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5763655 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttg 5763572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31958103 - 31957881
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  31958103 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggtgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 31958004  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  31958003 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacaacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 31957904  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  31957903 cccaatactctgatgtcttgtct 31957881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4790252 - 4790071
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  4790252 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccttagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 4790153  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||| ||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790152 tctccgaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 4790071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 10402764 - 10402986
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||       
T  10402764 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggggtctctcaagactctatccccagcaagttaca 10402863  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga-cttctatgatg-------tagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || | |  |||       |||||||||||||||||||    
T  10402864 tacctaccggcccccggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtg 10402963  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  10402964 cccaatactctaatgtcttgtct 10402986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11103982 - 11103809
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  11103982 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 11103883  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11103882 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 11103809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 22041041 - 22041250
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||| || || |  ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||    
T  22041041 acccaacactgaaatgcccagcgatgactgtattatctccagcggagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcagccat 22041140  T
Q  132 ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 223  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| |||        | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22041141 ggttccgatgcgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttccaagaatgtgtgatatagcacgagctactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 22041240  T
Q  224 ctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||    
T  22041241 ctgtctctgc 22041250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 35887399 - 35887580
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  35887399 cggcattattcccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 35887498  T
Q  160 tctccaaagaggact--------tctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |        | | | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35887499 tctccaaagaggattttcaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatacttcaatgtcttgtctgtctctgc 35887580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8283076 - 8282900
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  8283076 ttatacccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 8282977  T
Q  165 aaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||| |||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8282976 aaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgc 8282900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15734710 - 15734558
Alignment:
Q  87 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------ta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        |     
T  15734710 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcaaccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 15734611  T
Q  179 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctct 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15734610 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctct 15734558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31029864 - 31029691
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  31029864 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccgtggttccgatacgtctcccaacgacgtca 31029765  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31029764 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 31029691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17970492 - 17970305
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtc 145  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  || |||    
T  17970492 atgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccaatatgtc 17970393  T
Q  146 tcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17970392 tcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 17970305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 21681332 - 21681554
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |  | ||||  ||||| |||||||||||||||||       
T  21681332 cacagatgcaatgtctacaacatacccagcattgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggcggagtctctcaagactctatccccagcaagttaca 21681431  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||        | | || |||||||||||||||||||    
T  21681432 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 21681531  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  21681532 cccaatactctaatgtcttgtct 21681554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4340297 - 4340124
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |    
T  4340297 cggcattatccccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtca 4340198  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4340197 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 4340124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 5473628 - 5473801
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  5473628 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 5473727  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5473728 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 5473801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18285977 - 18285804
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  18285977 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 18285878  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  18285877 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtct 18285804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18301278 - 18301105
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  18301278 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 18301179  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  18301178 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtct 18301105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 32445791 - 32445964
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  32445791 cggcattattcccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 32445890  T
Q  160 tctccaaagaggacttctatg-atg-------tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    || |||||||||| ||| | | |||       |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32445891 tcaccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 32445964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22864464 - 22864289
Alignment:
Q  58 aacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 157  Q
    ||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22864464 aacggcgttttccccagtaaagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 22864365  T
Q  158 tatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
     |||| ||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22864364 catcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgacgtcttgtct 22864289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22879523 - 22879348
Alignment:
Q  58 aacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 157  Q
    ||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22879523 aacggcgttttccccagtaaagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 22879424  T
Q  158 tatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
     |||| ||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22879423 catcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgacgtcttgtct 22879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 4423557 - 4423730
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |    
T  4423557 cggcattatccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtca 4423656  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4423657 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 4423730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 4630420 - 4630593
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  4630420 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacatgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 4630519  T
Q  160 tctccaaagaggacttctatg-atg-------tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    || |||||||||| ||| | | |||       |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4630520 tcaccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 4630593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Original strand, 18249369 - 18249552
Alignment:
Q  50 cccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctccc 149  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  18249369 cccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtccccc 18249468  T
Q  150 aacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18249469 aacgacgtcatctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 18249552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 7079867 - 7079968
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  7079867 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccttggttccgacacgtctcccaacgacgtta 7079966  T
Q  160 tc 161  Q
    ||    
T  7079967 tc 7079968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 20072693 - 20072847
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  20072693 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 20072792  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20072793 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 20072847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 28027919 - 28028105
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||    
T  28027919 atgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccggccctcagcctaggtcccgacacgtct 28028018  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||| |||        | | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  28028019 cccaacgacgtcatctccgaagaggatttccaagaatgtgtaatgtagcacgagccactacttgcccattactctaatgtcttgtct 28028105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 48472590 - 48472744
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  48472590 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 48472689  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  48472690 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 48472744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 8218273 - 8218398
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||  ||||| |||||| ||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||    
T  8218273 atgcccagcacaacggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatctccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtct 8218372  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  8218373 cccaacgacgtcatctccatagagga 8218398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 7080022 - 7080063
Alignment:
Q  184 tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7080022 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 7080063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 16599406 - 16599447
Alignment:
Q  184 tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16599406 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 16599447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 14592 - 14814
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| ||  |||||||||||      
T  14592 cacagatgcgatgtctacaacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttttccccagtaaagccttccgagattcaatttccagcaagttgta 14691  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  14692 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 14791  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  14792 cccaatactctgatgtcttgtct 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 51644874 - 51645096
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  51644874 cacagatgcaatgtctacaacgtacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgca 51644973  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  51644974 tagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 51645073  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  51645074 cccaatactctgatgtcttgtct 51645096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20334001 - 20333793
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  20334001 acccagcactgaaatgcccagcagtgatggcattatccccagcagagtcttctgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcggccatg 20333902  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20333901 gttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 20333802  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  20333801 tgtctctgc 20333793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 10951744 - 10951966
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  10951744 cacagatgcgatgtttacaacttacccagtactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgtt 10951843  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  10951844 tagctacctgccctcagccgtggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 10951943  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  10951944 cccaatactctaatgtcttgtct 10951966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16201583 - 16201407
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 164  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16201583 ttatccccagtagagtcttccgagattctacccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgatacgtctcccaacggtgttatctcc 16201484  T
Q  165 aaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||| |||        | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16201483 aaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcatgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 16201407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 231
Target Start/End: Original strand, 20467458 - 20467664
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||    
T  20467458 acccaacactgaaatgcccagcgatgacggcattatccccagcagagtcttccgagattctatccccagcaagttacatagctacctaccctcagccatg 20467557  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20467558 gttccgatatgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtggccaatactccaatgccttgtc 20467657  T
Q  225 tgtctct 231  Q
    |||||||    
T  20467658 tgtctct 20467664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14692474 - 14692293
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  14692474 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 14692375  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14692374 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 14692293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14695156 - 14694975
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  14695156 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 14695057  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14695056 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 14694975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14697840 - 14697659
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  14697840 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtca 14697741  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697740 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 14697659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14700511 - 14700340
Alignment:
Q  70 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 169  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14700511 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14700412  T
Q  170 ggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    ||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700411 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 14700340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21891329 - 21891126
Alignment:
Q  39 gcactgaaatgcccagca-taacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttcc 137  Q
    |||||||||||||| | | | ||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21891329 gcactgaaatgcccggtaatgacggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttcc 21891230  T
Q  138 ggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtct 229  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21891229 gatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtatgtct 21891130  T
Q  230 ctgc 233  Q
    ||||    
T  21891129 ctgc 21891126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 28591733 - 28591955
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||||||       
T  28591733 cacagatgcaatgtctacaacatatccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatccctagcaagttaca 28591832  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  28591833 tacctaccagccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 28591932  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  28591933 cccaatattctaatgtcttgtct 28591955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 3647799 - 3648021
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    |||||| || || ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||       
T  3647799 cacagacgcaatgtctacaacatacccagcattgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttaca 3647898  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga-cttctatgatg-------tagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || | |  |||       |||||||||||||||||||    
T  3647899 tacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtg 3647998  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  3647999 cccaatactctaatgtcttgtct 3648021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 10969344 - 10969517
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  10969344 cggcattatccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagtggcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 10969443  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10969444 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagtcactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 10969517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41786903 - 41786718
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41786903 atgcccagcatc-cggcattatccccagtaaagtctttcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccgtggttccgatacgtct 41786805  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  41786804 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgacgtcttgtct 41786718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 28156425 - 28156579
Alignment:
Q  79 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc-- 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||      
T  28156425 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 28156524  T
Q  177 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
          | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28156525 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 28156579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 230
Target Start/End: Original strand, 27966 - 28169
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  27966 acccaacactgaaatgcccagcgatgacggcattatccccagcggagtcttccgagattctatccccagcaagttatatagctacctgccctcagccatg 28065  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttctatg-atg-----tagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctg 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | |||     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28066 gttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaagaatgtgtgatataacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctg 28165  T
Q  227 tctc 230  Q
    ||||    
T  28166 tctc 28169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 444 - 652
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  444 acccagcactgaaatgcccaacgataacggcattatccccagcagagtcttccgagattctatccccagcaggttgcatagctacctgccctcaaccatg 543  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  544 gttctgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccgggaatgtgtaatatagcacgagacactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 643  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  644 tgtctctgc 652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 12722 - 12931
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagca-taacggcgttatcccc-agtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||| || ||||||   |||||| |||||||| ||| |    
T  12722 acccagcactgaaatgcccagcaatgacggcattatcccccagcagagtcttccgagattctatccgcaacaagtttcatagctacctgccctcggccgt 12821  T
Q  132 ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12822 ggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccagggatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgt 12921  T
Q  224 ctgtctctgc 233  Q
    ||||||||||    
T  12922 ctgtctctgc 12931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 2307 - 2529
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  2307 cacagatgcaatgtctacaacatacccagccctgaaatgcccagcacaacggcattttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgta 2406  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  2407 tatctacctgccctcagctttggttccgacacgtctcccaacaacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 2506  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  2507 cccaatgctctaatgtcttgtct 2529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26154 - 25946
Alignment:
Q  34 acccagcactgaaatgcccagc-ataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26154 acccaacactgaaatgcccagcgatgacggtattatctccagcggagtcttccgagattctttccccagcaagttgcttagctacctgccctcagccatg 26055  T
Q  133 gttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        | |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  26054 gttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaagaatgtgtgatatagcatgagccactacgtgcccaatagtccaatgttttgtg 25955  T
Q  225 tgtctctgc 233  Q
    |||||||||    
T  25954 tgtctctgc 25946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 10568 - 10791
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||      
T  10568 cacagatgcaatgtctacaacatacccagctttgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatttccagcaagttgca 10667  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc---------tatgatgtagcacgagccactacgt 201  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||         | | || ||||||||||||||||||    
T  10668 tagctacctgtcctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaaatgtgtaatatagcacgagccactacgt 10767  T
Q  202 gcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  10768 gcccaatattctaatgtcttgtct 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Original strand, 33971 - 34151
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  33971 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 34070  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctg 232  Q
    ||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34071 tctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctg 34151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2561
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  2783 cacagatacaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 2684  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg 202  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||    
T  2683 tatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtg 2584  T
Q  203 cccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  2583 cccaatactctgatgtcttgtct 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 18458 - 18582
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||      
T  18458 cacagatacaatgtctacaacatacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgca 18557  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggtt 135  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||    
T  18558 tatctacctgccctcagctatggtt 18582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24531 - 24353
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  24531 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtca 24432  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctc 230  Q
    ||||||||||| | |||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24431 tctccaaagagaatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctc 24353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4173 - 3992
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  4173 cggcattattcccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgcccttagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtca 4074  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||||||||  ||        | | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4073 tctccaaagaggatgtccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 3992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 16226 - 16387
Alignment:
Q  11 cacagatgcgatatctacgacgtacccagcactgaaatgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgat 110  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||  ||||| |||||||||||| ||||       
T  16226 cacagatgcaatgtccacaacgtacccagcactgaaatgcccagcacaacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagccagttaca 16325  T
Q  111 tagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagagga 172  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16326 tacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagagga 16387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9214 - 9037
Alignment:
Q  65 ttatccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 163  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  9214 ttattcccagtagagtcttccgagattctatcctcaagcaagttgcatggctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctc 9115  T
Q  164 caaagaggacttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 233  Q
    |||||||||  || | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9114 caaagaggatgtccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgc 9037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8325
Alignment:
Q  47 atgcccagcataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtct 146  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  8511 atgcccagcacaacggcattgtccccggtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggttctgatacgtct 8412  T
Q  147 cccaacggcgttatctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8411 cccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtct 8325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40181 - 40067
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttg-attagctatctgccc-tcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 157  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  40181 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcattaactacctgcccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 40082  T
Q  158 tatctccaaagagga 172  Q
     ||||||||||||||    
T  40081 catctccaaagagga 40067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 12715 - 12888
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtta 159  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |    
T  12715 cggcattattcccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgacacgtctcccaacgacgtca 12814  T
Q  160 tctccaaagaggacttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtct 225  Q
    ||||||||||||| |||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12815 tctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 12888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Original strand, 6741 - 6807
Alignment:
Q  60 cggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctca 126  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  6741 cggcattattcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctca 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University