View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12668_low_4 (Length: 409)

Name: NF12668_low_4
Description: NF12668
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12668_low_4
NF12668_low_4
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (44-393)||(747-1096)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (83-393)||(28889332-28889643)
chr5 (83-393)||(28896036-28896347)
chr5 (83-393)||(28924862-28925173)
chr5 (83-393)||(28909284-28909595)
chr5 (83-393)||(28945679-28945990)
chr5 (83-393)||(20819968-20820276)
chr5 (83-393)||(20827068-20827376)
chr5 (83-393)||(20772718-20773029)
chr5 (83-393)||(20781493-20781804)
chr5 (72-386)||(24929912-24930229)
chr5 (168-393)||(28931061-28931287)
chr5 (44-208)||(19236835-19237000)
chr5 (73-319)||(22460977-22461226)
chr5 (73-319)||(22467601-22467850)
chr5 (83-142)||(34830086-34830144)
[»] scaffold1469 (1 HSPs)
scaffold1469 (71-369)||(1129-1427)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (73-393)||(79475-79798)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (73-393)||(16146815-16147138)
chr4 (83-145)||(27906264-27906326)
chr4 (91-202)||(14486601-14486713)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (83-386)||(9099066-9099372)
chr6 (73-296)||(21364467-21364688)
chr6 (73-296)||(23968449-23968670)
chr6 (44-319)||(20007902-20008181)
chr6 (221-289)||(29097719-29097787)
chr6 (71-141)||(15458492-15458562)
chr6 (71-141)||(15465087-15465157)
chr6 (71-271)||(31252293-31252495)
chr6 (83-141)||(11288663-11288721)
chr6 (83-143)||(10986175-10986235)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (83-386)||(19235063-19235369)
chr3 (44-386)||(12033400-12033745)
chr3 (44-393)||(14865593-14865946)
chr3 (44-375)||(17131497-17131832)
chr3 (26-178)||(13323727-13323879)
chr3 (26-145)||(13302180-13302297)
chr3 (26-145)||(13312836-13312953)
chr3 (71-141)||(10389426-10389496)
chr3 (71-141)||(10414515-10414585)
chr3 (71-141)||(10421185-10421255)
chr3 (73-143)||(23370490-23370560)
chr3 (83-160)||(51301572-51301649)
chr3 (11-39)||(24933753-24933781)
chr3 (80-140)||(24933820-24933880)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (73-393)||(16090822-16091145)
chr7 (73-393)||(29181094-29181417)
chr7 (83-296)||(2465208-2465421)
chr7 (83-296)||(3857360-3857574)
chr7 (83-375)||(20906456-20906749)
chr7 (44-188)||(2971209-2971354)
chr7 (183-384)||(2966721-2966925)
chr7 (71-141)||(31155396-31155466)
chr7 (73-145)||(14319614-14319686)
chr7 (73-145)||(14230779-14230851)
chr7 (73-143)||(14567204-14567274)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (83-382)||(91197-91499)
scaffold0029 (83-382)||(96923-97225)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (44-375)||(21710584-21710918)
chr1 (44-319)||(20851087-20851366)
chr1 (44-319)||(20857714-20857993)
chr1 (44-319)||(21706097-21706376)
chr1 (12-141)||(20044876-20045004)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (12-369)||(9108-9467)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (12-393)||(15989-16370)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (73-364)||(49955-50250)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (44-319)||(24320625-24320904)
chr8 (89-145)||(29643386-29643442)
chr8 (71-143)||(44477623-44477695)
chr8 (71-143)||(44492781-44492853)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (44-319)||(25180884-25181163)
chr2 (84-375)||(10342-10636)
chr2 (73-145)||(26885181-26885252)
chr2 (73-145)||(27207704-27207776)
chr2 (73-141)||(23168283-23168351)
chr2 (73-141)||(23579540-23579608)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (73-372)||(135208-135508)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (73-237)||(1897-2062)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (90-285)||(12812-13019)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (71-266)||(5840-6037)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (83-141)||(6-64)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (73-203)||(10180-10309)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (71-141)||(13877-13947)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (73-143)||(10180-10250)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (73-143)||(1510-1580)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (73-145)||(493013-493084)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (156-210)||(1382-1436)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (83-145)||(23564-23626)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (73-145)||(3387-3459)
[»] scaffold2054 (1 HSPs)
scaffold2054 (88-141)||(717-770)
[»] scaffold0796 (2 HSPs)
scaffold0796 (12-61)||(1656-1704)
scaffold0796 (12-61)||(5679-5727)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (84-145)||(10546-10607)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (334-375)||(3921-3962)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (83-143)||(111686-111746)


Alignment Details
Target: scaffold0131 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 44 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1096 - 747
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgtatctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1096 gaagaacctaggaattgatttgctgtgcttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggatcatctctcaatagtgataatatatgatttctgaaaatt 997  T
Q  144 aagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgat 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  996 aagcaatttaactgttcttatggtaaaattgggaaaattagggttaatggcgattttgaagaaaatgtgtaagatttaggtttataaagttgtgtttgat 897  T
Q  244 gattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttga 343  Q
    |||||||| || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  896 gattagtaagagtttccgatctataatgttgttgttgatcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtattaatgcttga 797  T
Q  344 ttgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgttccttttgatgtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  796 ttgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgttcctgttgatgtc 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Original strand, 28889332 - 28889643
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa-ttgggaaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28889332 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagtgatattatatgatttctgaaaattaaactatttaattgttcttaaggtaaaaattgggaaaat 28889431  T
Q  182 tagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttga 281  Q
    |||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  28889432 taggtttgatgatgattttgaagaaaatgcgtaaaattcaggtttatgacgttgtatttaatgattagtatgatttcctaatctgtatcgctgttgttga 28889531  T
Q  282 tcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgtt 381  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28889532 tcataattggatgaaaagagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcctgattgggctggattgttgttgttaatgtttagttgctgtt 28889631  T
Q  382 ccttttgatgtc 393  Q
    ||| ||||||||    
T  28889632 cctgttgatgtc 28889643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Original strand, 28896036 - 28896347
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa-ttgggaaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28896036 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagtgatattatatgatttctgaaaattaaactatttaattgttcttaaggtaaaaattgggaaaat 28896135  T
Q  182 tagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttga 281  Q
    |||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  28896136 taggtttgatgatgattttgaagaaaatgcgtaaaattcaggtttatgacgttgtatttaatgattagtatgatttcctaatctgtatcgctgttgttga 28896235  T
Q  282 tcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgtt 381  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28896236 tcataattggatgaaaagagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcctgattgggctggattgttgttgttaatgtttagttgctgtt 28896335  T
Q  382 ccttttgatgtc 393  Q
    ||| ||||||||    
T  28896336 cctgttgatgtc 28896347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Original strand, 28924862 - 28925173
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa-ttgggaaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28924862 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagtgatattatatgatttctgaaaattaaactatttaattgttcttaaggtaaaaattgggaaaat 28924961  T
Q  182 tagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttga 281  Q
    |||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  28924962 taggtttgatgatgattttgaagaaaatgcgtaaaattcaggtttatgacgttgtatttaatgattagtatgatttcctaatctgtatcgctgttgttga 28925061  T
Q  282 tcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgtt 381  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28925062 tcataattggatgaaaagagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcctgattgggctggattgttgttgttaatgtttagttgctgtt 28925161  T
Q  382 ccttttgatgtc 393  Q
    ||| ||||||||    
T  28925162 cctgttgatgtc 28925173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Original strand, 28909284 - 28909595
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa-ttgggaaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28909284 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagtgatattatatgatttctgaaaattaaactatttaattgttcttaaggtaaaaattgggaaaat 28909383  T
Q  182 tagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttga 281  Q
    |||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  28909384 taggtttgatgatgattttgaagaaaatgcgtaaaattcaggtttatgacgttgtatttaatgattagtatgatttcctaatctgtatcgctgttgttga 28909483  T
Q  282 tcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgtt 381  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28909484 tcataattggatgaaaagagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcctgattgggctggattgttgttgttaatgtttagttgttgtt 28909583  T
Q  382 ccttttgatgtc 393  Q
    ||| ||||||||    
T  28909584 cctgttgatgtc 28909595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Original strand, 28945679 - 28945990
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa-ttgggaaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28945679 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagtgatattatatgatttctgaaaattaaactatttaattgttcttaaggtaaaaattgggaaaat 28945778  T
Q  182 tagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttga 281  Q
    |||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  28945779 taggtttgatgatgattttgaagaaaatgcgtaaaattcaggtttatgacgttgtatttaatgattagtatgatttcctaatctgtatcgctgttgttga 28945878  T
Q  282 tcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgtt 381  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28945879 tcataattggatgaaaagagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcctgattgggctggattgttgttgttaatgtttagttgttgtt 28945978  T
Q  382 ccttttgatgtc 393  Q
    ||| ||||||||    
T  28945979 cctgttgatgtc 28945990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20820276 - 20819968
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaatt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20820276 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagtgttaatatataatttctgatgattaagtaattcaaccgttcttaaggtaaaattgg-aaaatt 20820178  T
Q  183 agggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgat 282  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||  ||| |||||| ||||||    
T  20820177 agggttaatgatgattttgaagagaatgcataagattcaggtttataatgttgtatttgatgatgagtatgatcc-ctaattagtattgttgtagttgat 20820079  T
Q  283 cataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgttc 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20820078 cataattggatgcaaatagcatgttatgtatgaatttggaattttctgtatgaatgcttgattgggctaaattgttgttgtttatgtttagttgctgttc 20819979  T
Q  383 cttttgatgtc 393  Q
    || ||||||||    
T  20819978 ctgttgatgtc 20819968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20827376 - 20827068
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaatt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20827376 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagtgttaatatataatttctgatgattaagtaattcaaccgttcttaaggtaaaattgg-aaaatt 20827278  T
Q  183 agggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgat 282  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||  ||| |||||| ||||||    
T  20827277 agggttaatgatgattttgaagagaatgcataagattcaggtttataatgttgtatttgatgatgagtatgatcc-ctaattagtattgttgtagttgat 20827179  T
Q  283 cataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgttc 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20827178 cataattggatgcaaatagcatgttatgtatgaatttggaattttctgtatgaatgcttgattgggctaaattgttgttgtttatgtttagttgctgttc 20827079  T
Q  383 cttttgatgtc 393  Q
    || ||||||||    
T  20827078 ctgttgatgtc 20827068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20773029 - 20772718
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20773029 caattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaatcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaattt 20772930  T
Q  183 agggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgat 282  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||    
T  20772929 agggttaatgatgattttgaagaaaatgtgtaagaatcaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgatttcctactctatattgttgatgttgat 20772830  T
Q  283 cataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaa-tttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgtt 381  Q
    ||||||||||||||| ||| || | ||| ||||| ||| |||  ||||| ||||||| ||||||||  |  |||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  20772829 cataattggatgaaagtagaatataatggatgaagttttggaagttctgaatgaatgtttgattggagttaattgttgttgttgatgttgaattgttgtt 20772730  T
Q  382 ccttttgatgtc 393  Q
     |||||||||||    
T  20772729 tcttttgatgtc 20772718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20781804 - 20781493
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20781804 caattctaaggtaagggtgggattatctttcaataattataatatatgatttctgaaaattaatcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaattt 20781705  T
Q  183 agggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgat 282  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||| |||||||    
T  20781704 agggttaatgatgattttgaagaaaatgtgtaagaatcaggtttataatgttgtatttgatgattattatgatttcctactctatattgttgatgttgat 20781605  T
Q  283 cataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaa-tttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgtt 381  Q
    ||||||||||||||| ||| || | ||| ||||| ||| |||  ||||| ||||||| ||||||||  |  |||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  20781604 cataattggatgaaagtagaatataatggatgaagttttggaagttctgaatgaatgtttgattggagttaattgttgttgttgatgttgaattgttgtt 20781505  T
Q  382 ccttttgatgtc 393  Q
     |||||||||||    
T  20781504 tcttttgatgtc 20781493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 386
Target Start/End: Original strand, 24929912 - 24930229
Alignment:
Q  72 ctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa-ttaagcaatttaactgttcttaaggtaaa 170  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929912 ctttatctttacaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagttctaatatatgatttctaaaaaattaatcaatttaactgttcttaaggtaaa 24930011  T
Q  171 attgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaat 270  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24930012 attgggaaatttagggttaatgatgattctgaaggaaatgtgtaagaatcaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgatttcctaatctataat 24930111  T
Q  271 gttgttgttgatcataa-ttgga-tgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatg 368  Q
    |||| | |||||||||| ||||| ||||||||| || | ||  |||||| | |||  ||||| ||||||| ||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  24930112 gttgatattgatcataatttggagtgaaaatagaatatgatagatgaatgttggaagttctgaatgaatgtttgattggagttaattgttgttgttgatg 24930211  T
Q  369 tttagttgctgttccttt 386  Q
     | | |||||||| ||||    
T  24930212 ctaatttgctgtttcttt 24930229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 168 - 393
Target Start/End: Original strand, 28931061 - 28931287
Alignment:
Q  168 aaaattgggaaaattagggttaatggtgatttt-gaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctg 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||| || |||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28931061 aaaattgggaaaattaggtttgatgatggtttttgaagaaaatgggtaaaattcaggtttatgacgttgtatttaatgattagtatgatttcctaatctg 28931160  T
Q  267 taatgttgttgttgatcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgttta 366  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28931161 tatcgctgttgttgatcataattggatgaaaagagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcctgattgggctggattgttgttgttaa 28931260  T
Q  367 tgtttagttgctgttccttttgatgtc 393  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28931261 tgtttagttgctgttcctgttgatgtc 28931287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19237000 - 19236835
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19237000 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaat 19236901  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaa 208  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  19236900 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaatttagggttaaggatgattttgaaagaaa 19236835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22461226 - 22460977
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctg-aaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22461226 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaaattaatcaattgaactgttcttaaggtaaaa 22461127  T
Q  172 ttgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-tttgatgattagtatgattttctaatctgtaat 270  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||  ||| ||| || ||||  | ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||  || ||| |  |    
T  22461126 ttgggaaatttagggttaaggatgatttgaaagaaaaggtataaggatcaggtttatattgtcgtactttgatgtttagtatgttttcttattctatgtt 22461027  T
Q  271 gttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaattt 319  Q
    |||| || ||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||    
T  22461026 gttgatgctgatcgtaattggaatgaaaatagaatatgatgaatgaattt 22460977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22467850 - 22467601
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctg-aaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22467850 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaaattaatcaattgaactgttcttaaggtaaaa 22467751  T
Q  172 ttgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-tttgatgattagtatgattttctaatctgtaat 270  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||  ||| ||| || ||||  | ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||  || ||| |  |    
T  22467750 ttgggaaatttagggttaaggatgatttgaaagaaaaggtataaggatcaggtttatattgtcgtactttgatgtttagtatgttttcttattctatgtt 22467651  T
Q  271 gttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaattt 319  Q
    |||| || ||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||    
T  22467650 gttgatgctgatcgtaattggaatgaaaatagaatatgatgaatgaattt 22467601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34830144 - 34830086
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  34830144 caattctaaggtaagggtgggattatctttcaataatt-taatgtataatttctgaaaat 34830086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1469 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1469
Description:

Target: scaffold1469; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 71 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1427 - 1129
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaa 170  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1427 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggatttcctttcaatagtgttaatatatgctttctgaaaattaaacaatttaactgttcttaaggtaaa 1328  T
Q  171 attgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaat 270  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1327 attgggaaaattaggtctaatgatgattttgaagaaaatgcgtaagattcaggtttacaatgttataattgatgattagtatgatttcctaatctgtatt 1228  T
Q  271 gttgttgttgatcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1227 gttgttgttgatcataattggatgaaaatagcatgttatgtgtgaatttggaagtttctgtatgaatgcttgattgggctgaattgttgttgttgatgt 1129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 393
Target Start/End: Original strand, 79475 - 79798
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaat 172  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  79475 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatgtaatttctgaaaattaatcaattaaactgttcttaaggtaaaat 79574  T
Q  173 tgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttg-atgattagtatgattttctaatctgtaat 270  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |  |    
T  79575 tgggaaaataagggttaatgatgattttgaaagaaaaggtgtaagaatcaggtttataatgttgtatttgaatgattagtatgatttcttaatccatgtt 79674  T
Q  271 gttgttgttgatcataattg-gatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgt 369  Q
    |||| | |||||| ||||||  |||||||||| || | ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  79675 gttgatattgatcgtaattgaaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagttctgtatgaatgcttgattgggctgaattgatgttgttgatgt 79774  T
Q  370 ttagttgctgttccttttgatgtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  79775 ttagttgctgttccttttgatgtc 79798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 73 - 393
Target Start/End: Original strand, 16146815 - 16147138
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaat 172  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16146815 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatgtaatttctgaaaattaatcaattaaactgttcttaaggtaaaat 16146914  T
Q  173 tgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttg-atgattagtatgattttctaatctgtaat 270  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |  |    
T  16146915 ttggaaaataagggttaatgatgattttgaaagaaaaggtgtaagaatcaggtttataatgttgtatttgaatgattagtatgatttcttaatccatgtt 16147014  T
Q  271 gttgttgttgatcataattg-gatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgt 369  Q
    |||| | |||||| ||||||  |||||||||| || | ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  16147015 gttgatattgatcgtaattgaaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagttctgtatgaatgcttgattgggctgaattgatgttgttgatgt 16147114  T
Q  370 ttagttgctgttccttttgatgtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16147115 ttagttgctgttccttttgatgtc 16147138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27906326 - 27906264
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  27906326 caattctaagataagggtgggattatctttcaatgatcataatgtataatttctgaaaattaa 27906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14486713 - 14486601
Alignment:
Q  91 aggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagc-aatttaactgttctt-aaggtaaaattgggaaaattagggtt 188  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||    
T  14486713 aggtaagggtgagactatccttcaatgatcataatatataatttctgaaaattaatcgaattgaattgttcttgaagataaaattgggaata-tagggtt 14486615  T
Q  189 aatggtgattttga 202  Q
     ||| |||||||||    
T  14486614 gatgatgattttga 14486601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 83 - 386
Target Start/End: Original strand, 9099066 - 9099372
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa-ttaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9099066 caattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaaattaatcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaatt 9099165  T
Q  182 tagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttga 281  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||    
T  9099166 tagggttaatgatgattctgaagaaaatgtgtaagaatcaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgatttcctaatctatattgttgatattga 9099265  T
Q  282 tcataa-ttgga-tgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctg 379  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || | ||  |||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||  |  |||||||||||| ||| | | ||||||    
T  9099266 tcataatttggagtgaaaatagaatatgatagatgaattttggaagttctgaatgaatgtttgattggagttaattgttgttgttgatgctaatttgctg 9099365  T
Q  380 ttccttt 386  Q
    || ||||    
T  9099366 tttcttt 9099372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 296
Target Start/End: Original strand, 21364467 - 21364688
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaat 172  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21364467 tttgtctttgcaattcaaaggtaagggtgggattatccttcagtaatgataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgtt-ttatggtaaaat 21364565  T
Q  173 tgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||||   |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||    
T  21364566 tgggaaa-ttagggttaatggcatttttgaagaaaatatgtaagacttaggtttataatgttgtatttgatgattaatatgatttcctactctgtattgt 21364664  T
Q  273 tgttgttgatcataattggatgaa 296  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  21364665 tgatgttgatcataattggatgaa 21364688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 296
Target Start/End: Original strand, 23968449 - 23968670
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaat 172  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23968449 tttgtctttgcaattcaaaggtaagggtgggattatccttcagtaatgataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgtt-ttatggtaaaat 23968547  T
Q  173 tgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||||   |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||    
T  23968548 tgggaaa-ttagggttaatggcatttttgaagaaaatatgtaagacttaggtttataatgttgtatttgatgattaatatgatttcctactctgtattgt 23968646  T
Q  273 tgttgttgatcataattggatgaa 296  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  23968647 tgatgttgatcataattggatgaa 23968670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 319
Target Start/End: Original strand, 20007902 - 20008181
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgtatctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctg-aaaat 142  Q
    ||||||| |||||||| | ||| |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  20007902 gaagaacttaggaactcatttgctgtgcttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagtcataatatataatttatgaaaaat 20008001  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-ttt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||| || ||||  | ||||||||| ||||||| |||    
T  20008002 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaatttagggttaaggatgattttgaaagaaaaggtataaggatcaggtttatattgttgtacttt 20008101  T
Q  241 gatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaattt 319  Q
    |||| |||||||| |||  |||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||    
T  20008102 gatgtttagtatgttttcttaatctatattgttgatgctgatcgtaattggaatgaaaatagaatatgatgaatgaattt 20008181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29097787 - 29097719
Alignment:
Q  221 aggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataatt 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  29097787 aggtttatactgttgtatttgatgattagtatgatttcctaatctataatgttgatattgatcataatt 29097719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15458562 - 15458492
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15458562 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatatataatttctgaaaa 15458492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15465157 - 15465087
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15465157 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatatataatttctgaaaa 15465087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31252495 - 31252293
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagc-aatttaactgttctt-aaggta 168  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||  |||||| ||| ||    
T  31252495 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgagattatcttttaatgattataatatataatttctgaaaattaatctaattgaatagttcttgaagata 31252396  T
Q  169 aaattgggaaaattagggt-taatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgt-atttgatgattagtatgattttctaatctg 266  Q
    |||||  || ||||||||| | | | |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||||||| |  |||||||||  |||||||    
T  31252395 aaatt--gagaattagggtatgaggctgattttgaaagaaaggtgtaagaattatgtttaacgtgttgtaatttgatgctatgtatgatttcttaatctg 31252298  T
Q  267 taatg 271  Q
    |||||    
T  31252297 taatg 31252293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 141
Target Start/End: Original strand, 11288663 - 11288721
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| |||||||||||    
T  11288663 caattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgatcttaatatataatttctgaaaa 11288721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 143
Target Start/End: Original strand, 10986175 - 10986235
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||    
T  10986175 caattctaaggtaagggtgagactatctttcaataatcataatctataatttctaaaaatt 10986235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 83 - 386
Target Start/End: Original strand, 19235063 - 19235369
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa-ttaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19235063 caattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaaattaatcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaatt 19235162  T
Q  182 tagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttga 281  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||    
T  19235163 tagggttaatgatgattctgaagaaaatgtgtaagaatcaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgatttcctaatctatattgttgatattga 19235262  T
Q  282 tcataa-ttgga-tgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctg 379  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || | ||  |||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||  |  |||||||||||| ||| | | ||||||    
T  19235263 tcataatttggagtgaaaatagaatatgatagatgaattttggaagttctgaatgaatgtttgattggagttaattgttgttgttgatgctaatttgctg 19235362  T
Q  380 ttccttt 386  Q
    || ||||    
T  19235363 tttcttt 19235369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 386
Target Start/End: Original strand, 12033400 - 12033745
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgtatctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12033400 gaagaacttaggaactgatttgatgtgcttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 12033499  T
Q  144 aagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-tttg 241  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  12033500 aatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaattaagggttaatgatgattttgaaagaaaaggtataagaatcaggtttataatgttgtactttg 12033599  T
Q  242 atgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgga-tgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgct 340  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| || | ||| |||||||| |||  || ||||||||||||    
T  12033600 atgtttagtatgatttcttaatctatgttgttgatgttgatcgtaattgaattgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagttttgtatgaatgct 12033699  T
Q  341 tgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgttccttt 386  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12033700 tgaatgggctgaattgttgttgttgatgtttagtttctgttccttt 12033745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14865946 - 14865593
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  14865946 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctatttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatgtaatttctgaaaat 14865847  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-ttt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||     
T  14865846 taatcaattaaactgttcttaaggtaaaattgggaaaataatggttaatgatgattttgaaagaaaaggtgtaagaagcaggtttataatgttgtacttg 14865747  T
Q  241 gatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattg-gatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgc 339  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |  ||||| | |||||| ||||||  |||||||||| || | ||| |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  14865746 gatgattagtatgatttcttaatccatgttgttgatattgatcgtaattgaaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagttctgtatgaatgc 14865647  T
Q  340 ttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgttccttttgatgtc 393  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14865646 ttgattgggctgaattgttgttgttgatgtttagttgttgttcctgttgatgtc 14865593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17131832 - 17131497
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17131832 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaat 17131733  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-ttt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||| || ||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  17131732 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaatttagggttaaggatgattttgaaagaaaaggtataaggatcaggtttataatgttgtacttt 17131633  T
Q  241 gatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgc 339  Q
    |||| ||||||||||||  |||||| |  ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| || | ||| |||||||| |||   | || ||||||||    
T  17131632 gatgtttagtatgatttcttaatctatgttgttgatgttgattgtaattggaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagctttgcatgaatgc 17131533  T
Q  340 ttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagtt 375  Q
    || | || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17131532 ttaaatgagctgaattgttgttgttgatgtttagtt 17131497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 178
Target Start/End: Original strand, 13323727 - 13323879
Alignment:
Q  26 aaaccaagaacaagaggggaagaacgtaggaactgaattgttgtatctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataat 125  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| || || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  13323727 aaaccaagaacaag-ggagaagaacctaggaactgatttgctg-atttttttttctacaattctaaggtaagggtgagattatctttcaataatcataat 13323824  T
Q  126 atatgatttctgaaaattaagcaattta-actgttctt-aaggtaaaattgggaa 178  Q
    || | ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13323825 atgtaatttctgaaaattaatcaaattagattgttcttgaagataaaattgggaa 13323879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 13302180 - 13302297
Alignment:
Q  26 aaaccaagaacaagaggggaagaacgtaggaactgaattgttgtatctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataat 125  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  13302180 aaaccaagaacaag-ggagatgaacctaggaactgatttgctgtgttttttt-tctacaattctaaggtaagggtgagattatctttcaataatcataat 13302277  T
Q  126 atatgatttctgaaaattaa 145  Q
    || | |||||||||||||||    
T  13302278 atgtaatttctgaaaattaa 13302297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 13312836 - 13312953
Alignment:
Q  26 aaaccaagaacaagaggggaagaacgtaggaactgaattgttgtatctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataat 125  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  13312836 aaaccaagaacaag-ggagatgaacctaggaactgatttgctgtgttttttt-tctacaattctaaggtaagggtgagattatctttcaataatcataat 13312933  T
Q  126 atatgatttctgaaaattaa 145  Q
    || | |||| ||||||||||    
T  13312934 atgtaatttttgaaaattaa 13312953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Original strand, 10389426 - 10389496
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  10389426 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatgtataatttctgaaaa 10389496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Original strand, 10414515 - 10414585
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  10414515 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatgtataatttctgaaaa 10414585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Original strand, 10421185 - 10421255
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  10421185 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatgtataatttctgaaaa 10421255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Original strand, 23370490 - 23370560
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  23370490 tttgtctatacaattctaaggtaagggtgggactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaatt 23370560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51301649 - 51301572
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttc 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  51301649 caattctaaggtaagggtgagattatcttccaataatcataatatgtaatttctgaaaattaatcaattgaattgttc 51301572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 39
Target Start/End: Original strand, 24933753 - 24933781
Alignment:
Q  11 cagagaaagcaagagaaaccaagaacaag 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933753 cagagaaagcaagagaaaccaagaacaag 24933781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 140
Target Start/End: Original strand, 24933820 - 24933880
Alignment:
Q  80 ctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  24933820 ctacaattctaaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaa 24933880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 73 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16091145 - 16090822
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaat 172  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16091145 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatgtaatttctgaaagttaatcaattaaactgttcctaaggtaaaat 16091046  T
Q  173 tgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttg-atgattagtatgattttctaatctgtaat 270  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |  |    
T  16091045 tgggaaaataagggttaatgatgattttgaaagaaaaggtgtaagaatcaggtttataatgttgtatttgaatgattagtatgatttcttaatccatgtt 16090946  T
Q  271 gttgttgttgatcataattg-gatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgt 369  Q
    |||| | |||||| ||||||  |||||||||| || | ||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  16090945 gttgatattgatcgtaattgaaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagttctgaatgaatgcttgattgggctgaattgatgttgttgatgt 16090846  T
Q  370 ttagttgctgttccttttgatgtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16090845 ttagttgctgttccttttgatgtc 16090822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 73 - 393
Target Start/End: Original strand, 29181094 - 29181417
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaat 172  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  29181094 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatgtaatttctgaaaattaatcaattaaactattcttaaggtaaaat 29181193  T
Q  173 tgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttg-atgattagtatgattttctaatctgtaat 270  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |  |    
T  29181194 ttggaaaataagggttaatgatgattttgaaagaaaaggtgtaagaatcaggcttataatgttgtatttgaatgattagtatgatttcttaatccatgtt 29181293  T
Q  271 gttgttgttgatcataattg-gatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgt 369  Q
    |||| | |||||| ||||||  |||||||||| || | ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  29181294 gttgatattgatcgtaattgaaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagttctgtatgaatgcttgattgggctgaattgatgttgttgatgt 29181393  T
Q  370 ttagttgctgttccttttgatgtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29181394 ttagttgctgttccttttgatgtc 29181417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2465421 - 2465208
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |||||    
T  2465421 caattctaaggtaagggtgggatcatccttcaataatgataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgtttttatggtaaaaattgggaaatt 2465322  T
Q  183 agggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgat 282  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||    
T  2465321 agggttaatggcaattttgaagaaaatgtgtaagatttaggtttataatgttatatttgatgattaatatgatttcctactctgtattgttgatgttgat 2465222  T
Q  283 cataattggatgaa 296  Q
    ||||||||||||||    
T  2465221 cataattggatgaa 2465208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 83 - 296
Target Start/End: Original strand, 3857360 - 3857574
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa---ttgggaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||    
T  3857360 caattctaaggtaagggtgggatcatctt-caataatgataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgtttttatggtaaaaaaattgggaaa 3857458  T
Q  180 attagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgtt 279  Q
     |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||    
T  3857459 -ttagggttaatggcaattttgaagaaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattaatatgatttcctactctgtattgttgatgtt 3857557  T
Q  280 gatcataattggatgaa 296  Q
    ||| |||||||||||||    
T  3857558 gattataattggatgaa 3857574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 375
Target Start/End: Original strand, 20906456 - 20906749
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |     
T  20906456 caattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaattaatcaattgaactattcttaaggtaaaattggg-aatta 20906554  T
Q  183 agggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-tttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttg 280  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| |  ||||| |||||    
T  20906555 agggttaatgatgattttgaaagaaaaggtataagaatcaagtttataatgttgtactttgatgtttagtatgatttcttaatctatgttgttgatgttg 20906654  T
Q  281 atcataattg-gatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagtt 375  Q
    ||| ||||||  |||||||||| || | ||| ||||| ||| ||  || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20906655 atcgtaattgaaatgaaaatagaatatgatggatgaa-ttgagaagttttgtaagaatgcttgaatgggctgaattgttgttgttgatgtttagtt 20906749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2971354 - 2971209
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  2971354 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatttataatttctgaaaat 2971255  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggtt 188  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2971254 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaagataagggtt 2971209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2966925 - 2966721
Alignment:
Q  183 agggttaatggtgattttgaaggaaatg-tgtaagatttaggtttataatgttgta-tttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttg 280  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| | | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||| |||||    
T  2966925 agggttaatgatgtttttgaaagaaaaggtataagaatcaggtttttaatgttgtactttgatgattagtatgatttcttaatccatgttgttgatgttg 2966826  T
Q  281 atcataattgga-tgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctg 379  Q
    ||| |||||||| ||||||||| || | ||| |||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  2966825 atcgtaattggaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagttttgtatgaatgcttgaatgggctgaattgttgttgttgatgtttagtttctg 2966726  T
Q  380 ttcct 384  Q
    |||||    
T  2966725 ttcct 2966721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31155466 - 31155396
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  31155466 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatatataatttctgaaaa 31155396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Original strand, 14319614 - 14319686
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||    
T  14319614 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattttaatgtataatttctgaaaattaa 14319686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14230851 - 14230779
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||| ||| |||||||||||||||    
T  14230851 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgaatttaatgtataatttctgaaaattaa 14230779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14567274 - 14567204
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   | | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  14567274 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgaggctaaccttcaatgattataatatatggtttctgaaaatt 14567204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 382
Target Start/End: Original strand, 91197 - 91499
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa---ttgggaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||    
T  91197 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaataatgataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgtttttatggtaaaaaaattgggaaa 91296  T
Q  180 attagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgtt 279  Q
     |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || || ||||    
T  91297 -ttagggttaatggcaattttgaagaaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattaatatgatttcctactctgtattggtgatgtt 91395  T
Q  280 gatcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaa-tttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgct 378  Q
    |||||||||||||||||  ||| || | ||| ||||| ||| | |  ||||| ||||||| |||||| |  || |||||||||||| ||||| | |||||    
T  91396 gatcataattggatgaaggtagaatataatggatgaagttttgaaagttctgaatgaatgtttgatttgaatgaattgttgttgttgatgttgaattgct 91495  T
Q  379 gttc 382  Q
    ||||    
T  91496 gttc 91499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 382
Target Start/End: Original strand, 96923 - 97225
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaa---ttgggaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||    
T  96923 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaataatgataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgtttttatggtaaaaaaattgggaaa 97022  T
Q  180 attagggttaatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgtt 279  Q
     |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || || ||||    
T  97023 -ttagggttaatggcaattttgaagaaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattaatatgatttcctactctgtattggtgatgtt 97121  T
Q  280 gatcataattggatgaaaatagcatgttatgtatgaa-tttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgct 378  Q
    |||||||||||||||||  ||| || | ||| ||||| ||| | |  ||||| ||||||| |||||| |  || |||||||||||| ||||| | |||||    
T  97122 gatcataattggatgaaggtagaatataatggatgaagttttgaaagttctgaatgaatgtttgatttgaatgaattgttgttgttgatgttgaattgct 97221  T
Q  379 gttc 382  Q
    ||||    
T  97222 gttc 97225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21710918 - 21710584
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21710918 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaat 21710819  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttg 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| ||| ||| || ||||  | |||||||||||||| || |||    
T  21710818 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaatttagggtttaagatgattttgaaagaaaaagtataaggatcaggtttataatgttatacttg 21710719  T
Q  242 atgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgct 340  Q
    ||| |||||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||| |||   | ||||||||||||    
T  21710718 atgtttagtatgattccttaatctatgttgttgatgttgatcataattggaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagctttgtatgaatgct 21710619  T
Q  341 tgattgggctggattgttgttgtttatgtttagtt 375  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21710618 tgaatgggctgaattgttgttgttgatgtttagtt 21710584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 319
Target Start/End: Original strand, 20851087 - 20851366
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20851087 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaat 20851186  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-ttt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||| || ||||  | ||||||||| ||||||| |||    
T  20851187 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaatttagggttaaggatgattttgaaagaaaaggtataaggatcaggtttatattgttgtacttt 20851286  T
Q  241 gatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaattt 319  Q
    |||| ||||||||||||  |||||| |  ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||    
T  20851287 gatgtttagtatgatttcttaatctatgttgttgatgctgatcgtaattggaatgaaaatagaatatgatgaatgaattt 20851366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 319
Target Start/End: Original strand, 20857714 - 20857993
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20857714 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaat 20857813  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-ttt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||| || ||||  | ||||||||| ||||||| |||    
T  20857814 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaatttagggttaaggatgattttgaaagaaaaggtataaggatcaggtttatattgttgtacttt 20857913  T
Q  241 gatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaattt 319  Q
    |||| |||||||| |||  |||||| |  ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||    
T  20857914 gatgtttagtatgttttcttaatctatgttgttgatgctgatcgtaattggaatgaaaatagaatatgatgaatgaattt 20857993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21706376 - 21706097
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21706376 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaat 21706277  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-ttt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||| || ||||  | ||||||||| ||||||| |||    
T  21706276 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaatttagggttaaggatgattttgaaagaaaaggtataaggatcaggtttatattgttgtacttt 21706177  T
Q  241 gatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaattt 319  Q
    |||| |||||||| |||  |||||| |  ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||    
T  21706176 gatgtttagtatgttttcttaatctatgttgttgatgctgatcgtaattggaatgaaaatagaatatgatgaatgaattt 21706097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 141
Target Start/End: Original strand, 20044876 - 20045004
Alignment:
Q  12 agagaaagcaagagaaaccaagaacaagaggggaagaacgtaggaactgaattgttgtatct-ttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatct 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||| ||| |   || |  |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20044876 agagaaagcaagagaaaacaagaacaag-ggggaa-aacttaggagctgatttgctgtgttaattcttcctacaattctaaggtaagggtgggattatcc 20044973  T
Q  111 ttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||  |  |||||||| | |||||||||    
T  20044974 ttcaatgatcttaatatataaattctgaaaa 20045004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9467 - 9108
Alignment:
Q  12 agagaaagcaagagaaaccaagaacaagaggggaagaacgtaggaa-ctgaattgttgtatctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatct 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9467 agaggaagcaagagaaaccaagaacaagggggga-gaacttaggaaactgaattgctgtgtctctgtctctacaattctaaggtaagggtgggattatct 9369  T
Q  111 ttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttctt-aaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaa 208  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||| |||    
T  9368 ttcaatagtcataatatataatttctgaaaattaatcaattgaactgttcttaaaagtaaaattggg-aattaagggttaatgatgattttgaaagaaaa 9270  T
Q  209 tgtgtaagatttaggtttataatgttgt-atttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgt 306  Q
     |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| |  ||||| |  |||||| |||||| | |||||||| || |    
T  9269 ggtgtaagaattaggtttattgtgttgtaatttgatgtttagtatgatttctcaatctatgttgttgattgtgatcagaattggaacgaaaatagaatat 9170  T
Q  307 tatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgt 369  Q
     ||| ||||| ||||||  || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  9169 gatggatgaa-ttgggaagttttgtatgattgcttgaatgggctgaattgttgttgttgatgt 9108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 393
Target Start/End: Original strand, 15989 - 16370
Alignment:
Q  12 agagaaagcaagagaaaccaagaacaagaggggaagaacgtaggaactgaattgttgtatct-ttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||| ||| |   || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15989 agagaaagcaagagaaaccaagaacaag-ggggaa-aacttaggagctgatttgctgtgttaattcttcctacaattctaaggtaagggtgggattatct 16086  T
Q  111 ttcaatagttataatatatgatttctgaaaa-ttaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16087 ttcaatagttataatatatgatttctgaaaaattaatcaatttaactgtttttaagataaaaattggaat-ttagggttaatgatgattttgaagaaaat 16185  T
Q  210 gtgtaagatttaggtttataatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgga-tg-aaaatagcatgtt 307  Q
    ||| |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||| | || ||||||| || |     
T  16186 gtgcaagaatcaggttcatgatgttgtatttgatgattagtatgattttctaatctatattgttcatattgatcataattgaagtgaaaaatagaatatg 16285  T
Q  308 atgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagttgctgttccttttgatgtc 393  Q
    ||  | || ||| |||  ||||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  16286 atagaagagttttggaagttctgaatgaatg-ttgattgtaatgaattgttgttgtttatgttggattgctgtttcttttgatgtc 16370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 364
Target Start/End: Original strand, 49955 - 50250
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggt-aaaa 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49955 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatgtaatttctaaaaattaatcaattaaactgttcttaaggtaaaaa 50054  T
Q  172 ttgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgtatttg-atgattagtatgattttctaatctgtaa 269  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |||||  |      
T  50055 ttgggaaaataagggttaatgatgattttgaaagaaaaggtgtaagaatcaggtttataatgttatatttgaaagattagtatgatttcttaatccatgt 50154  T
Q  270 tgttgttgttgatcataattg-gatgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtt 364  Q
    ||||| | |||||| ||||||  |||||||||| || | ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50155 tgttgatattgatcgtaattgaaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagttctgtatgaatgcttgattgggctgaattgatgttgtt 50250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 319
Target Start/End: Original strand, 24320625 - 24320904
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24320625 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaat 24320724  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-ttt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||| || || |  | ||||||||| ||||||| |||    
T  24320725 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaatttagggttaaggatgattttgaaagaaaaggtatagggatcaggtttatattgttgtacttt 24320824  T
Q  241 gatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaattt 319  Q
    |||| ||||||||||||  |||||| |  ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||    
T  24320825 gatgtttagtatgatttcttaatctatgttgttgatgctgatcgtaattggaatgaaaatagaatatgatgaatgaattt 24320904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 29643386 - 29643442
Alignment:
Q  89 taaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  29643386 taaggtaagggtgagattatctttcaataatcataatatgtaatttctgaaaattaa 29643442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 44477695 - 44477623
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  44477695 tctttgtcttcacaattctaaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaatt 44477623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 44492853 - 44492781
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  44492853 tctttgtcttcacaattctaaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaatt 44492781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 319
Target Start/End: Original strand, 25180884 - 25181163
Alignment:
Q  44 gaagaacgtaggaactgaattgttgta-tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25180884 gaagaacttaggaactgatttgctgtgctttttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaat 25180983  T
Q  143 taagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-ttt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||| || ||    | ||||||||| | ||||| |||    
T  25180984 taatcaattgaactgttcttaaggtaaaattgggaaatttagggttaaggatgattttgaaagaaaaggtatattgatcaggtttatatttttgtacttt 25181083  T
Q  241 gatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaattt 319  Q
    |||| ||||||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||    
T  25181084 gatgtttagtatgatttcttaatctatgttgttgatgttgatcgtaattggaatgaaaatagaatatgatggatgaattt 25181163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10636 - 10342
Alignment:
Q  84 aattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaaggtaaaattgggaaaatta 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  10636 aattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaattaatcaattgaattgttcttaaggtaaaattgggaaattta 10537  T
Q  184 gggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta-tttgatgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttgttga 281  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||| || || |  | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| |  ||||| || |||    
T  10536 gggttaaggatgattttgaaagaaaaggtatagggataaggtttatattgttgtactttgatgtttagtatgatttcttaatctatgttgttgatgctga 10437  T
Q  282 tcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagtt 375  Q
    || ||||||| |||||||||| || | ||| |||||||| |||   | || |||||||||||| ||  | | |||| ||||||| ||||||||||    
T  10436 tcgtaattggaatgaaaatagaatatgatggatgaattttggaagctttgcatgaatgcttgaatgaaccgaattgatgttgttgatgtttagtt 10342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26885252 - 26885181
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||    
T  26885252 tttgtctctgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaata-atctaatgtataatttctgaaaattaa 26885181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Original strand, 27207704 - 27207776
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||    
T  27207704 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattttaatgtataatttctgaaaattaa 27207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Original strand, 23168283 - 23168351
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||| ||| |||||||||||    
T  23168283 tttgtttctgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcattgatcataatgtataatttctgaaaa 23168351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Original strand, 23579540 - 23579608
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||| ||| |||||||||||    
T  23579540 tttgtttctgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcattgatcataatgtataatttctgaaaa 23579608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 135508 - 135208
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttctt-aaggtaaaa 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  135508 tttgtctttgcaattctaaggtaagcgtgagattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaattaatcaattgaactgttcttaaaggtaaaa 135409  T
Q  172 ttgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgt-atttgatgattagtatgattttctaatctgtaa 269  Q
    ||| | || | |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| |      
T  135408 ttgag-aattaagggttaatgatgattttgaaagaaaaggtgtaagaatcaggtttattgtgttgtaatttgatg-ttagtatgatttcttaatctatgt 135311  T
Q  270 tgttgttgttgatcataattgg-atgaaaatagcatgttatgtatgaatttgggattttctgtatgaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatg 368  Q
    ||||| |  |||||| |||||| |||||||||| || | ||| ||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  135310 tgttgatcgtgatcaaaattggaatgaaaatagaatatgatggatgaa-ttgggaagttttgtatgaatgcttgaatgggctgaattgttgttgttgatg 135212  T
Q  369 ttta 372  Q
    ||||    
T  135211 ttta 135208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Original strand, 1897 - 2062
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttctt-aaggtaaaa 171  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  1897 tttgtctttgcaattgtaaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaattaatcaattgaactgttcttgaaagtaaaa 1996  T
Q  172 ttgggaaaattagggttaatggtgattttg-aaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgta 237  Q
    ||||| || | |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  1997 ttggg-aattaagggttaatgatgattttgaaagaaaaggtgtaagaattaggtttattgtgttgta 2062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13019 - 12812
Alignment:
Q  90 aaggtaagggtgggatcatcttt-caatagttataatatatgatttctgaaaa-ttaagcaa---tttaactgttcttaa-ggtaaaatt--gggaaaat 181  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |   ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| |    
T  13019 aaggtaagggtgggattatctttacaatagttctaatatatgatttctaaaaaattaatctaaattttaactgttcttaaaggtaaaaattggggaaatt 12920  T
Q  182 tagggttaatgg-tgattttgaaggaaatgtgt-aagatt-taggtttataatgttgtatttg-atgattagtatgattttctaatctgtaatgttgttg 277  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |     
T  12919 tagggttaatgtatgattctgaaggaaatgtgttaagaatctaggtttataatgttgtatttgtatgattagtatgatttcctaatctataatgttgata 12820  T
Q  278 ttgatcat 285  Q
    ||||||||    
T  12819 ttgatcat 12812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 266
Target Start/End: Original strand, 5840 - 6037
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagc-aatttaactgttctt-aaggta 168  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||  |||||| ||| ||    
T  5840 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatatataatttctgaaaattaatctaattgaatagttcttgaagata 5939  T
Q  169 aaattgggaaaattagggt-taatggtgattttgaaggaaatgtgtaagatttaggtttataatgttgt-atttgatgattagtatgattttctaatctg 266  Q
    |||||  || ||||||||| | | | |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||| |  |||||||||  |||||||    
T  5940 aaatt--gagaattagggtatgaggctgattttgaaagaaaggtgtaagaattatgtttaacatgttgtaatttgatgttatgtatgatttcttaatctg 6037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 6
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  64 caattctaaggtaagggtgggattatctttcaatagttctaatatatgatttctgaaaa 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10309 - 10180
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaagcaatttaactgttcttaag-gtaaaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||  |||||    
T  10309 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgagattatcttccaataatcataatatgtaatttctgaaaattaatcaattgaattgttcatgagaataaaa 10210  T
Q  172 ttgggaaaattagggttaatggtgattttgaa 203  Q
    |||||  |||||||||| ||| | ||||||||    
T  10209 ttggg--aattagggttgatgctaattttgaa 10180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Original strand, 13877 - 13947
Alignment:
Q  71 tctttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  13877 tctttgtctttgcaattctaaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatatataatttctgaaaa 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Original strand, 10180 - 10250
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  10180 tttgtctatacaattctaaggtaagggtgggactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaatt 10250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Original strand, 1510 - 1580
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  1510 tttgtctatacaattctaaggtaagggtgggactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaatt 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Original strand, 493013 - 493084
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||    
T  493013 tttgtctctgcaattctaaggtaagggtgagattatctttcaata-atctaatgtataatttctgaaaattaa 493084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1436 - 1382
Alignment:
Q  156 tgttcttaaggtaaaattgggaaaattagggttaatggtgattttgaaggaaatg 210  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1436 tgttcttgagataaaattggaaaaattagggttaatgctgattttgaagggaatg 1382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 23564 - 23626
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  23564 caattctaaggtaagggtgggattatctttgaatgatcataatgtataatttctgaaaattaa 23626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Original strand, 3387 - 3459
Alignment:
Q  73 tttgtctctacaattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||    
T  3387 tttgtctttgcaattctaaggtaagggtgatattatctttcaatgaatttaatatataatttctgaaaattaa 3459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2054 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2054
Description:

Target: scaffold2054; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 770 - 717
Alignment:
Q  88 ctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaa 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| |||||||||||    
T  770 ctaaggtaagggtgggattatctttcaatgatcttaatatataatttctgaaaa 717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0796 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0796
Description:

Target: scaffold0796; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1704
Alignment:
Q  12 agagaaagcaagagaaaccaagaacaagaggggaagaacgtaggaactga 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  1656 agagaaagcaagagaaaccaagaacaag-ggggaaaaacttaggagctga 1704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0796; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 5679 - 5727
Alignment:
Q  12 agagaaagcaagagaaaccaagaacaagaggggaagaacgtaggaactga 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  5679 agagaaagcaagagaaaccaagaacaag-ggggaaaaacttaggagctga 5727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 145
Target Start/End: Original strand, 10546 - 10607
Alignment:
Q  84 aattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaattaa 145  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |  |||| ||| |||||||||||||||    
T  10546 aattctaaggtaagtgtgggattatctttcaatgatcttaatgtataatttctgaaaattaa 10607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 3921 - 3962
Alignment:
Q  334 gaatgcttgattgggctggattgttgttgtttatgtttagtt 375  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3921 gaatgcttgaatgggctgaattgttgttgttgatgtttagtt 3962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 111746 - 111686
Alignment:
Q  83 caattctaaggtaagggtgggatcatctttcaatagttataatatatgatttctgaaaatt 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  111746 caattctaaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaatt 111686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University