View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12669_low_1 (Length: 515)

Name: NF12669_low_1
Description: NF12669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12669_low_1
NF12669_low_1
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (19-504)||(14467395-14467880)
chr1 (19-494)||(15016707-15017182)
chr1 (265-504)||(14481823-14482062)
chr1 (19-494)||(15001699-15002174)
chr1 (19-494)||(15024709-15025184)
chr1 (19-494)||(15032050-15032525)
chr1 (20-493)||(14503575-14504048)
chr1 (48-494)||(15010621-15011067)
chr1 (19-494)||(15036612-15037087)
chr1 (21-490)||(14532794-14533263)
chr1 (19-484)||(14522679-14523144)
chr1 (19-469)||(15040348-15040801)
[»] scaffold0400 (2 HSPs)
scaffold0400 (21-490)||(12373-12842)
scaffold0400 (19-494)||(6083-6558)
[»] scaffold0365 (2 HSPs)
scaffold0365 (21-490)||(13016-13485)
scaffold0365 (19-494)||(6727-7202)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (344-491)||(14605815-14605962)
chr7 (344-491)||(16024992-16025139)
chr7 (390-490)||(16172520-16172620)
chr7 (343-421)||(17848447-17848525)
chr7 (451-490)||(16102904-16102943)
chr7 (345-486)||(15670733-15670874)
chr7 (345-478)||(15677143-15677276)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 504
Target Start/End: Original strand, 14467395 - 14467880
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14467395 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccgccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaa 14467494  T
Q  119 ccatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14467495 ccatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaa 14467594  T
Q  219 gttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacact 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14467595 gttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacact 14467694  T
Q  319 tgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacgg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14467695 tgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacgg 14467794  T
Q  419 aaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtaccgttctcttca 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14467795 aaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtaccattctcttca 14467880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 494
Target Start/End: Original strand, 15016707 - 15017182
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaa 118  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15016707 atctcacaagccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaa 15016806  T
Q  119 ccatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaa 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15016807 ccatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagttcctgaacaa 15016906  T
Q  219 gttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacact 318  Q
     ||| |||||||||  || ||  | | ||||||||| || |||||||||| ||||| |  |||||  || ||||||| |  ||||| | ||||||  | |    
T  15016907 attgaatcattgcacgaattaactgcattggagcttgcagcaaataatttcagtggcttcatccctgaaaaacttggtatgttgtctaggttattgaagt 15017006  T
Q  319 tgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacgg 418  Q
    | ||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||    
T  15017007 taaatttgagccaaaataagtttgaggggaacattcctgttgagtttggccaattgaatgttattgaaaatcttgatcttagtgggaattctatgaatgg 15017106  T
Q  419 aaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtacc 494  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15017107 aaccataccagcaatgcttggccagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtacc 15017182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 265 - 504
Target Start/End: Original strand, 14481823 - 14482062
Alignment:
Q  265 atttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacacttgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtt 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14481823 atttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacacttgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtt 14481922  T
Q  365 tggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattg 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14481923 tggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattg 14482022  T
Q  465 aatctctcacataataatctttctggtaccgttctcttca 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14482023 aatctctcacataataatctttctggtaccattcccttca 14482062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 494
Target Start/End: Original strand, 15001699 - 15002174
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaa 118  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  15001699 atctcacaagcctaaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacaggagcttaacttgtcttcaaa 15001798  T
Q  119 ccatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaa 218  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||    
T  15001799 ccatctaatgcgaaaaattccaaaggagttagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttatggagaagttccagtacaa 15001898  T
Q  219 gttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacact 318  Q
     |||||||||||||  |||||  | | ||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||  || ||||||| |  ||||| |||||||| || |    
T  15001899 attgcatcattgcatcaactaactgcattggagcttgcaacaaataatttgagtggattcatccctgaaaaacttggtatgttgtctatgttattgcagt 15001998  T
Q  319 tgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacgg 418  Q
    | ||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||| ||    
T  15001999 taaatttgagccaaaataagtttgaggggaacattcctgttgagtttggccaattgaatgttattgaaaaccttgatcttagtgggaattctatgaatgg 15002098  T
Q  419 aaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtacc 494  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15002099 aaccataccagcaatgcttggccagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtacc 15002174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 494
Target Start/End: Original strand, 15024709 - 15025184
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaa 118  Q
    |||||||| ||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  15024709 atctcacaagccttaaaatctctggtaataatttaacaggaagaataccaccagagctaggcagcgcaacaaatttacaggagcttaacttgtcttcaaa 15024808  T
Q  119 ccatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaa 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  15024809 ccatctaacgggaaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcacctttctggagaagttcctgtacaa 15024908  T
Q  219 gttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacact 318  Q
     |||||||||||||  | |||  | | ||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||| |||  |||||| || || || | |||||| || |    
T  15024909 attgcatcattgcacgagctaactgcattggagcttgcaacaaataatttgagtggcttcatccctaaaagacttggtaggttatctaggttattgcagt 15025008  T
Q  319 tgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacgg 418  Q
    | ||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  15025009 taaatttgagccaaaataagtttgaggggaacattcctgctgagtttgcccaattgaatgttattgaaaatcttgatcttagtgggaattttatgaatgg 15025108  T
Q  419 aaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtacc 494  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15025109 aaccataccatcaatgcttgggcagttaaatcgcttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtacc 15025184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 494
Target Start/End: Original strand, 15032050 - 15032525
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaa 118  Q
    |||||||| ||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  15032050 atctcacaagccttaaaatctctggtaataatttaacaggaagaataccaccagagctaggcagcgcaacaaatttacaggagcttaacttgtcttcaaa 15032149  T
Q  119 ccatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaa 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  15032150 ccatctaacgggaaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcacctttctggagaagttcctgtacaa 15032249  T
Q  219 gttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacact 318  Q
     |||||||||||||  | |||  | | ||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||| |||  |||||| || || || | |||||| || |    
T  15032250 attgcatcattgcacgagctaactgcattggagcttgcaacaaataatttgagtggcttcatccctaaaagacttggtaggttatctaggttattgcagt 15032349  T
Q  319 tgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacgg 418  Q
    | ||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  15032350 taaatttgagccaaaataagtttgaggggaacattcctgctgagtttgcccaattgaatgttattgaaaatcttgatcttagtgggaattttatgaatgg 15032449  T
Q  419 aaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtacc 494  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15032450 aaccataccatcaatgcttgggcagttaaatcgcttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtacc 15032525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 493
Target Start/End: Original strand, 14503575 - 14504048
Alignment:
Q  20 tctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgag-caacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaa 118  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  14503575 tctcacaagccttaaaatctccaataacaatttaacaggaaatataccacaagaatt-ggctgagacaattaatttacatgaacttaacttgtcatcaaa 14503673  T
Q  119 ccatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaa 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  14503674 ccatcttactggaaaaattccaaaggatctaggaaacttgtctttgttgatcaaactctcgataagtaacaatcatctttctggagaggttcctatacaa 14503773  T
Q  219 gttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacact 318  Q
     ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| | |  ||||||||| |||||   |||| |||| |    
T  14503774 attgcatcattgcaagcactaactaccttggagcttgcaacaaataatttaagtggcttcatccctagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatt 14503873  T
Q  319 tgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacgg 418  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||    
T  14503874 tgaatttgagccaaaataagtttgaaggaaacattcccgttgagtttggccgattaaatgttattgaagatcttgatctcagtggaaattttatgaatgg 14503973  T
Q  419 aaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtac 493  Q
    ||| || ||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14503974 aacgataccttcaatgtttggagtgttaaatcatttagaaacattgaatctctcacataataatctgtctggtac 14504048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 48 - 494
Target Start/End: Original strand, 15010621 - 15011067
Alignment:
Q  48 aatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaaccatcttacgggaaaaattccaaaggagc 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  15010621 aatttaacaggaagaataccaccagaactaggaagtgcaacaaatttacaggagcttaacttgtcttcaaaccatctaatgggaaaaattccaaaggagt 15010720  T
Q  148 tagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaagttgcatcattgcaaaaactagatacctt 247  Q
    |||||  ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||  | | ||    
T  15010721 tagaatacttatctttgttgttcaaactctccttaagtaacaatcatctttctggagaagttcctgtacaaattgcatcattgcatcaactaactgcatt 15010820  T
Q  248 ggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacacttgaatttaagcaaaaatatgtttgaagga 347  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||| |  ||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| || || ||||| ||| |||||| |||||| ||     
T  15010821 ggagcttgcaataaataatttgagtggcttcatccctaaaaaacttggtatgttgtctatgttattgcagttaaatttgagccaaaataagtttgagggg 15010920  T
Q  348 aacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacagttaa 447  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  15010921 aacattcctgttgagtttggccaattgaatgttattgaaaatcttgatcttagtgggaattctatgaatggaaccataccagcaatgcttggccagttaa 15011020  T
Q  448 atcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtacc 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15011021 atcacttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtacc 15011067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 494
Target Start/End: Original strand, 15036612 - 15037087
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaa 118  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  15036612 atctcacaagcctaaaaatctccggtaataatttaactggaagaataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacaggagcttaacttgtcttcaaa 15036711  T
Q  119 ccatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaa 218  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15036712 cgatctaatgggaaaaattccaaaggagctaaaatatttatctttgttgttcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagttcctgtacaa 15036811  T
Q  219 gttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacact 318  Q
     |||||||||||||  |||||  | | ||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||   || ||||||| |  ||||| | |||||| || |    
T  15036812 attgcatcattgcatcaactaactgcattggagcttgcaacaaataacttaagtggcttcatcctggaaaaacttggtatgttgtctaggttattgcagt 15036911  T
Q  319 tgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacgg 418  Q
    ||||||| ||| | |||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||| ||    
T  15036912 tgaatttgagccataataagcttgaggggaacattcctgttgagtttggccaattgaatgttattgaaaaccttgatcttagtgggaattctatgaatgg 15037011  T
Q  419 aaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtacc 494  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15037012 aaccataccagcaatgcttggccagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtacc 15037087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 14533263 - 14532794
Alignment:
Q  21 ctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaacc 120  Q
    |||||| | ||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  14533263 ctcacaagtcttcaaatctccaacaataatttaactggaagcatacctcaagaactaggtggagcaacacaattacaagaacttaatctgtcttcaaacc 14533164  T
Q  121 atcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaagt 220  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| |    
T  14533163 atcttactggaaaaattccagaggagctaggaaacttatctttgttaatcaaactctcgataaataacaataatcttttgggagaagttcctgtacaaat 14533064  T
Q  221 tgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacacttg 320  Q
    ||||||| ||||   ||||  | |||||||||||  || ||||||||||||||| |  ||||| | |  ||||||||| |||||   |||| |||| |||    
T  14533063 tgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgaaaaaaataatttaagtggcttcatccctagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttg 14532964  T
Q  321 aatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaa 420  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||    
T  14532963 aatttgagccaaaataagttcgaaggaaacattcctgttgagtttgaccaattaaaggttattgaagatcttgatcttagtgaaaatgttatgagtggaa 14532864  T
Q  421 ccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctgg 490  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14532863 ccataccatcaatgcttggacagttaaatcacttacaaacattgaatctttcacataataatctttctgg 14532794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14523144 - 14522679
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccga-gcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaa 117  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||  |||  || |||| ||||    
T  14523144 atctgacaagccttaaaatctccaataataatttaataggaagcataccaccagaatt-ggctgaagcaaccaatttacatatacttgacttgtcctcaa 14523046  T
Q  118 accatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcaca 217  Q
    | || ||||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  14523045 atcaacttataggaaaaattccaaaggatctaggaaacttatctgcactgatccaactctcgataagtaataatcatctttcgggagaagttcctatgca 14522946  T
Q  218 agttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacac 317  Q
      |||||||||||||  |||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||| ||||| | |||||| ||     
T  14522945 gattgcatcattgcatgaactaactacattggatcttgcaacaaataatttaagtggttttatccctgaaaaacttggaaggttgtctaggttattgcag 14522846  T
Q  318 ttgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacg 417  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  14522845 ttgaatttgagccaaaataagtttgaaggaaacattcctgttgaacttggtcaattgaatgttattgaagatcttgatcttagcgggaattttttgaatg 14522746  T
Q  418 gaaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatct 484  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14522745 gaaccataccaacaatgcttggacagttaaatcgcttagaaacattgaatctctcacataataatct 14522679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Original strand, 15040348 - 15040801
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaa 118  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||| |||| | |   | ||||| |||||||||  |||  |  |||| || ||    
T  15040348 atctcataagccttaaaatctccaacaataatttaacagggagtataccactagaattggttggggcaaccaatttacatttacttgatttgtcctcgaa 15040447  T
Q  119 ccatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaac---tctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgca 215  Q
     || || || ||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||||||   ||||| |||||| |||| |  ||||||| |||||||||| |    
T  15040448 tcaactaacaggagaaattccaatggagctaggcaacttatcttcattgatccaacaactctcgataagtagcaattacttttcaggggaagttcctgta 15040547  T
Q  216 caagttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattac 315  Q
    ||| |||| |||||| |  || | | || |||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  15040548 caaattgcctcattgaaggaagttgctatcttggagctggcaacaaataatttaagtggcttcgtcccaaaacaacttggaagattatctatgttattac 15040647  T
Q  316 acttgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaa 415  Q
    |||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15040648 acttaaatatgagccaaaataagtttgaaggaaacattcctgatgagattggacagttaaaagttattgaaaatcttgatcttagtgggaattctttgaa 15040747  T
Q  416 cggaaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatct 469  Q
     |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15040748 tggaaccataccaacaatgcttggacagttaaatcgcttagaaacattgaatct 15040801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Original strand, 12373 - 12842
Alignment:
Q  21 ctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaacc 120  Q
    |||||| | ||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  12373 ctcacaagtcttcaaatctccaacaataatttaactggaagcataccgcaagaactaggtggagcaacacaattacaagaacttaatctgtcttcaaacc 12472  T
Q  121 atcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaagt 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| |    
T  12473 atcttactggaaaaattccaaaggagctaggaaacttatctttgttaatcaaactctcgataaataacaataatcttttgggagaagttcctgtacaaat 12572  T
Q  221 tgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacacttg 320  Q
    ||||||| ||||   ||||  | |||||||||||  || ||||||||||||||| |  ||||| | |  ||||||||| |||||   |||| |||| |||    
T  12573 tgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgaaaaaaataatttaagtggcttcatccctagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttg 12672  T
Q  321 aatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaa 420  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  12673 aatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccattgagtttggccaattagaagttattgaagatcttgaccttagtggaaattttttgaacggaa 12772  T
Q  421 ccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctgg 490  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12773 ccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacataataatctttctgg 12842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 494
Target Start/End: Original strand, 6083 - 6558
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccga-gcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaa 117  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||  |  |||  |||| || || |    
T  6083 atctcacaagccttaaagttttcaataataatatatcaggaagcataccacccgaatt-ggccgaagcaaccaatttaactatactggacctttcctcga 6181  T
Q  118 accatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcaca 217  Q
    | || || || ||| |||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||| |||| | |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  6182 atcaactcacaggagaaattccaaaggagctaggaaacttatcctcattgatccagctcttgataagtagcaatcatcttgtaggagaagttcctgaaca 6281  T
Q  218 agttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacac 317  Q
    | |||||| |||||| ||| ||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| ||  | |  |||||  ||    
T  6282 aattgcattattgcataaaataactatcttggagcttgcaacaaataatttcagtggcttcatcccagaacaacttggaagattacctaatttattggac 6381  T
Q  318 ttgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacg 417  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  6382 ttgaatttgagccaaaataagtttgaaggagacattcctgctgagtttggacaattgaaaattattgaaaatcttgatcttagcgagaatgttttgaatg 6481  T
Q  418 gaaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtacc 494  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6482 gaaccataccaacaatgcttggagagttaaatcgcttagaaacattgaatctctcacataataatttttctggtacc 6558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Original strand, 13016 - 13485
Alignment:
Q  21 ctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaacc 120  Q
    |||||| | ||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  13016 ctcacaagtcttcaaatctccaacaataatttaactggaagcataccgcaagaactaggtggagcaacacaattacaagaacttaatctgtcttcaaacc 13115  T
Q  121 atcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaagt 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| |    
T  13116 atcttactggaaaaattccaaaggagctaggaaacttatctttgttaatcaaactctcgataaataacaataatcttttgggagaagttcctgtacaaat 13215  T
Q  221 tgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacacttg 320  Q
    ||||||| ||||   ||||  | |||||||||||  || ||||||||||||||| |  ||||| | |  ||||||||| |||||   |||| |||| |||    
T  13216 tgcatcactgcaggcactaactgccttggagcttgaaaaaaataatttaagtggcttcatccctagaagacttggaaggttgtctgagttaatacatttg 13315  T
Q  321 aatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaa 420  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13316 aatttgagccaaaataggtttgaaggaaacattcccattgagtttggccaattagaagttattgaagatcttgaccttagtggaaattttttgaacggaa 13415  T
Q  421 ccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctgg 490  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13416 ccataccatcaatgcttggacagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacataataatctttctgg 13485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 494
Target Start/End: Original strand, 6727 - 7202
Alignment:
Q  19 atctcacatgccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccaccagaactaggccga-gcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaa 117  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||  |  |||  |||| || || |    
T  6727 atctcacaagccttaaagttttcaataataatatatcaggaagcataccacccgaatt-ggccgaagcaaccaatttaactatactggacctttcctcga 6825  T
Q  118 accatcttacgggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcaca 217  Q
    | || || || ||| |||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||| |||| | |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  6826 atcaactcacaggagaaattccaaaggagctaggaaacttatcctcattgatccagctcttgataagtagcaatcatcttgtaggagaagttcctgaaca 6925  T
Q  218 agttgcatcattgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatttaagtggttcaatcccaaaacaacttggaagtttgtcaatgttattacac 317  Q
    | |||||| |||||| ||| ||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| ||  | |  |||||  ||    
T  6926 aattgcattattgcataaaataactatcttggagcttgcaacaaataatttcagtggcttcatcccagaacaacttggaagattacctaatttattggac 7025  T
Q  318 ttgaatttaagcaaaaatatgtttgaaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacg 417  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  7026 ttgaatttgagccaaaataagtttgaaggagacattcctgctgagtttggacaattgaaaattattgaaaatcttgatcttagcgagaatgttttgaatg 7125  T
Q  418 gaaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtacc 494  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7126 gaaccataccaacaatgcttggagagttaaatcgcttagaaacattgaatctctcacataataatttttctggtacc 7202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 491
Target Start/End: Original strand, 14605815 - 14605962
Alignment:
Q  344 aggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacag 443  Q
    |||||| |||||| | || ||||| ||||| ||||| ||||||   || ||||| ||||  ||||||||| | ||||| || ||| ||||| ||  ||||    
T  14605815 aggaaatattcctattgaatttggacaatttaatgtccttgaaatcctagatctcagtggaaattttttggatggaacaataccatcaatgcttacacag 14605914  T
Q  444 ttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggt 491  Q
    || ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14605915 ttgaaatacttggaaacattgaatatctcacataataatctttctggt 14605962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 491
Target Start/End: Original strand, 16024992 - 16025139
Alignment:
Q  344 aggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacag 443  Q
    |||||| |||||| | || ||||| ||||| ||||| ||||||   || ||||| ||||  ||||||||| | ||||| || ||| ||||| ||  ||||    
T  16024992 aggaaatattcctattgaatttggacaatttaatgtccttgaaatcctagatctcagtggaaattttttggatggaacaataccatcaatgcttacacag 16025091  T
Q  444 ttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggt 491  Q
    || ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16025092 ttgaaatacttggaaacattgaatatctcacataataatctttctggt 16025139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 490
Target Start/End: Original strand, 16172520 - 16172620
Alignment:
Q  390 cttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctg 489  Q
    |||||||| ||||  |||||||| || ||||| || ||| ||||| ||  |||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16172520 cttgatctgagtggaaattttttaaatggaacaataccatcaatgcttacacagttgaaatacttggaaacattgaatatctcacataataatctttctg 16172619  T
Q  490 g 490  Q
    |    
T  16172620 g 16172620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 421
Target Start/End: Original strand, 17848447 - 17848525
Alignment:
Q  343 aaggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaac 421  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  17848447 aaggaaatattcctgttgagtttggccaatttaaagtccttcaaagtcttgatcttagtgggaattttctcaacggaac 17848525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 490
Target Start/End: Original strand, 16102904 - 16102943
Alignment:
Q  451 acttagaaacattgaatctctcacataataatctttctgg 490  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16102904 acttggaaacattgaatatctcacataataatctttctgg 16102943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15670874 - 15670733
Alignment:
Q  345 ggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacagt 444  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||| || || ||||||  ||||||||| ||||  ||| ||||||| ||| | || ||| ||||| ||||| |      
T  15670874 ggaaatattcctgatgagtttggacaatttaaagtccttgaaagtcttgatctcagtggaaatgttttgaatggagctataccaccaatgcttggaaacc 15670775  T
Q  445 taaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatcttt 486  Q
    | || | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15670774 tgaaacgcttagaaacattgaatatttcacataacaatcttt 15670733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 15677276 - 15677143
Alignment:
Q  345 ggaaacattcctgtcgagtttggccaattaaatgttcttgaagatcttgatcttagtgagaattttttgaacggaaccattccagcaatgtttggacagt 444  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||||||  ||||||||| ||||  ||| ||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||| |      
T  15677276 ggaaatattccttttgagtttggacaatttaaagtccttgaaagtcttgatctcagtggaaatgttttgaaaggagccataccaccaatgcttggaaacc 15677177  T
Q  445 taaatcacttagaaacattgaatctctcacataa 478  Q
    | || | |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15677176 tgaaacgcttagaaacattgaatatttcacataa 15677143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University