View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1266_low_24 (Length: 359)

Name: NF1266_low_24
Description: NF1266
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1266_low_24
NF1266_low_24
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (85-313)||(15388178-15388406)
chr4 (85-315)||(14760106-14760336)
chr4 (85-315)||(14668255-14668485)
chr4 (85-315)||(5009114-5009344)
chr4 (85-315)||(6573097-6573327)
chr4 (85-315)||(17016285-17016515)
chr4 (85-310)||(34185760-34185985)
chr4 (85-315)||(18313978-18314208)
chr4 (85-315)||(24589161-24589391)
chr4 (85-315)||(54836630-54836860)
chr4 (85-315)||(14101782-14102012)
chr4 (85-315)||(20335221-20335451)
chr4 (85-315)||(24115901-24116131)
chr4 (85-315)||(27160117-27160347)
chr4 (85-315)||(39853876-39854106)
chr4 (85-315)||(15231111-15231341)
chr4 (85-315)||(18797414-18797644)
chr4 (85-315)||(36341317-36341547)
chr4 (85-308)||(1903500-1903723)
chr4 (85-315)||(33670600-33670830)
chr4 (85-307)||(15281737-15281959)
chr4 (85-315)||(30756999-30757229)
chr4 (85-315)||(31123312-31123542)
chr4 (85-315)||(40102437-40102667)
chr4 (85-310)||(21972945-21973170)
chr4 (85-172)||(22146369-22146456)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (85-313)||(27394789-27395017)
chr2 (85-315)||(23125357-23125587)
chr2 (85-315)||(37948651-37948881)
chr2 (85-315)||(27806928-27807158)
chr2 (85-315)||(34294379-34294609)
chr2 (85-310)||(12658766-12658991)
chr2 (92-315)||(28885432-28885655)
chr2 (85-315)||(20841138-20841368)
chr2 (85-307)||(27431230-27431452)
chr2 (85-315)||(39048608-39048838)
chr2 (85-315)||(11631973-11632203)
chr2 (85-315)||(13933336-13933566)
chr2 (85-315)||(257442-257672)
chr2 (85-315)||(40236733-40236963)
chr2 (85-315)||(12590033-12590263)
chr2 (85-315)||(39893294-39893524)
chr2 (85-310)||(31879516-31879741)
chr2 (85-315)||(19413290-19413520)
chr2 (85-315)||(34864909-34865139)
chr2 (85-315)||(37380902-37381132)
chr2 (85-315)||(37682684-37682914)
chr2 (85-315)||(37697949-37698179)
chr2 (85-315)||(37928594-37928824)
chr2 (85-310)||(16826127-16826352)
chr2 (85-310)||(16895128-16895353)
chr2 (85-310)||(32053033-32053258)
chr2 (85-315)||(9346775-9347005)
chr2 (85-315)||(12713390-12713620)
chr2 (85-315)||(21673964-21674194)
chr2 (85-288)||(21699960-21700163)
chr2 (85-307)||(19453212-19453434)
chr2 (90-200)||(31890285-31890395)
chr2 (90-200)||(3785833-3785943)
chr2 (90-200)||(16164820-16164930)
chr2 (90-200)||(22924942-22925052)
chr2 (90-200)||(27779574-27779684)
chr2 (90-200)||(27819331-27819441)
chr2 (96-200)||(34158184-34158288)
chr2 (90-200)||(27119864-27119974)
chr2 (85-159)||(27827841-27827915)
chr2 (212-268)||(12383932-12383988)
chr2 (212-268)||(22949665-22949721)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (85-313)||(22077672-22077900)
chr8 (85-315)||(27605666-27605896)
chr8 (85-315)||(18793929-18794159)
chr8 (85-315)||(14560849-14561079)
chr8 (85-310)||(19691328-19691553)
chr8 (85-315)||(2134021-2134251)
chr8 (85-315)||(19205123-19205353)
chr8 (85-315)||(29832551-29832781)
chr8 (85-310)||(9357855-9358080)
chr8 (85-315)||(19677672-19677902)
chr8 (85-315)||(28358713-28358943)
chr8 (85-315)||(31357753-31357983)
chr8 (85-315)||(18712709-18712939)
chr8 (85-315)||(12089484-12089714)
chr8 (85-310)||(33261964-33262189)
chr8 (85-315)||(31486632-31486862)
chr8 (90-200)||(15770914-15771024)
chr8 (90-177)||(44564347-44564434)
chr8 (96-183)||(21344943-21345030)
chr8 (248-315)||(16286626-16286694)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (85-315)||(5593200-5593430)
chr3 (85-315)||(18054449-18054679)
chr3 (85-315)||(18273895-18274125)
chr3 (85-315)||(18289196-18289426)
chr3 (85-315)||(18304497-18304727)
chr3 (85-315)||(18333817-18334047)
chr3 (85-308)||(4793478-4793701)
chr3 (85-315)||(6205090-6205320)
chr3 (85-307)||(8286313-8286535)
chr3 (85-315)||(8299158-8299388)
chr3 (85-315)||(15889548-15889778)
chr3 (85-315)||(21677890-21678120)
chr3 (85-315)||(35883953-35884183)
chr3 (85-315)||(4686842-4687072)
chr3 (85-315)||(4724818-4725048)
chr3 (85-315)||(15737937-15738167)
chr3 (85-315)||(22384421-22384651)
chr3 (85-315)||(29145599-29145829)
chr3 (85-315)||(29661813-29662043)
chr3 (85-315)||(8214922-8215152)
chr3 (85-315)||(20069227-20069457)
chr3 (85-315)||(20573686-20573916)
chr3 (85-315)||(32442338-32442568)
chr3 (85-315)||(48469114-48469344)
chr3 (85-315)||(7076393-7076623)
chr3 (85-315)||(28112797-28113027)
chr3 (85-315)||(47026640-47026870)
chr3 (85-315)||(5606157-5606387)
chr3 (85-315)||(10399331-10399561)
chr3 (85-315)||(28342364-28342594)
chr3 (85-310)||(5016906-5017131)
chr3 (85-315)||(4343519-4343749)
chr3 (85-315)||(4420102-4420332)
chr3 (85-315)||(5470175-5470405)
chr3 (85-315)||(6539585-6539815)
chr3 (85-315)||(7999747-7999977)
chr3 (85-315)||(10646260-10646490)
chr3 (85-315)||(18245928-18246158)
chr3 (85-315)||(22867691-22867921)
chr3 (85-315)||(22882750-22882980)
chr3 (85-315)||(28024469-28024699)
chr3 (85-305)||(19697687-19697907)
chr3 (85-307)||(16621333-16621555)
chr3 (85-315)||(24331350-24331580)
chr3 (85-315)||(31961298-31961528)
chr3 (85-315)||(51785210-51785440)
chr3 (85-315)||(17981792-17982022)
chr3 (85-315)||(18228383-18228613)
chr3 (116-310)||(11107226-11107420)
chr3 (90-200)||(17992779-17992889)
chr3 (90-200)||(31033084-31033194)
chr3 (85-200)||(4627087-4627202)
chr3 (90-200)||(32293930-32294040)
chr3 (85-200)||(5714375-5714490)
chr3 (85-200)||(5725285-5725400)
chr3 (85-200)||(5766968-5767083)
chr3 (85-172)||(6963276-6963363)
chr3 (210-268)||(15592879-15592937)
chr3 (212-268)||(5950772-5950828)
chr3 (212-268)||(15918751-15918807)
chr3 (212-268)||(20443351-20443407)
chr3 (212-268)||(41440477-41440533)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (85-315)||(10913554-10913784)
chr7 (85-315)||(2157797-2158027)
chr7 (85-315)||(26438480-26438710)
chr7 (85-315)||(26534558-26534788)
chr7 (85-315)||(2106848-2107078)
chr7 (85-315)||(11421464-11421694)
chr7 (85-315)||(45390443-45390673)
chr7 (85-315)||(5131219-5131449)
chr7 (85-315)||(5144025-5144255)
chr7 (85-307)||(16515115-16515337)
chr7 (85-315)||(22145418-22145648)
chr7 (85-315)||(26516015-26516245)
chr7 (85-315)||(26271771-26272001)
chr7 (85-315)||(26316533-26316763)
chr7 (85-307)||(10844851-10845073)
chr7 (85-315)||(3448529-3448759)
chr7 (85-315)||(4141931-4142161)
chr7 (85-315)||(4202612-4202842)
chr7 (85-315)||(11444110-11444340)
chr7 (85-315)||(31561075-31561305)
chr7 (99-307)||(16044550-16044758)
chr7 (85-307)||(10842679-10842901)
chr7 (85-315)||(26666599-26666829)
chr7 (85-298)||(16748202-16748415)
chr7 (85-315)||(24589219-24589449)
chr7 (85-288)||(16446691-16446894)
chr7 (90-200)||(2776592-2776702)
chr7 (90-200)||(26512386-26512496)
chr7 (90-200)||(26681796-26681906)
chr7 (90-200)||(31127245-31127355)
chr7 (90-200)||(39209829-39209939)
chr7 (160-315)||(9621873-9622028)
chr7 (90-193)||(45734658-45734761)
chr7 (90-200)||(31087312-31087422)
chr7 (212-268)||(9469590-9469646)
chr7 (212-268)||(16393246-16393302)
chr7 (212-268)||(30369758-30369814)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (85-315)||(27022359-27022589)
chr6 (85-315)||(27287107-27287337)
chr6 (85-315)||(29552780-29553010)
chr6 (85-315)||(13295694-13295924)
chr6 (85-315)||(15421063-15421293)
chr6 (85-315)||(22931627-22931857)
chr6 (85-315)||(23854072-23854302)
chr6 (85-315)||(24866939-24867169)
chr6 (85-315)||(27626454-27626684)
chr6 (85-315)||(16677363-16677593)
chr6 (85-315)||(27179679-27179909)
chr6 (85-315)||(27269330-27269560)
chr6 (85-315)||(34461249-34461479)
chr6 (85-315)||(3699306-3699536)
chr6 (85-315)||(4760986-4761216)
chr6 (85-315)||(27010954-27011184)
chr6 (85-310)||(17089186-17089411)
chr6 (96-315)||(26921600-26921819)
chr6 (96-315)||(16753044-16753263)
chr6 (85-315)||(27060729-27060959)
chr6 (85-315)||(29504639-29504869)
chr6 (85-315)||(4528508-4528738)
chr6 (85-315)||(4542517-4542747)
chr6 (85-315)||(4720878-4721108)
chr6 (85-315)||(27488356-27488586)
chr6 (85-315)||(29576237-29576467)
chr6 (85-315)||(30554759-30554989)
chr6 (85-288)||(20171797-20172000)
chr6 (85-288)||(22163991-22164194)
chr6 (85-315)||(16940770-16941000)
chr6 (85-315)||(26113155-26113385)
chr6 (85-315)||(28210677-28210907)
chr6 (85-315)||(4776103-4776333)
chr6 (85-200)||(22455857-22455972)
chr6 (85-237)||(26992096-26992248)
chr6 (85-200)||(26775370-26775485)
chr6 (85-200)||(27358853-27358968)
chr6 (85-200)||(27449196-27449311)
chr6 (90-200)||(14142142-14142252)
chr6 (90-200)||(26789154-26789264)
chr6 (90-200)||(27197523-27197633)
chr6 (90-200)||(27251602-27251712)
chr6 (90-193)||(8902451-8902554)
chr6 (85-193)||(28163836-28163944)
chr6 (85-184)||(33373174-33373273)
chr6 (90-200)||(13520940-13521049)
chr6 (212-268)||(9136223-9136279)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (85-315)||(15655455-15655685)
chr5 (85-315)||(41677938-41678168)
chr5 (85-315)||(11552588-11552818)
chr5 (85-315)||(24973139-24973369)
chr5 (85-315)||(33295761-33295991)
chr5 (85-315)||(33780722-33780952)
chr5 (85-315)||(22995814-22996044)
chr5 (85-315)||(23629203-23629433)
chr5 (85-315)||(24684842-24685072)
chr5 (85-315)||(40470247-40470477)
chr5 (85-315)||(18372231-18372461)
chr5 (85-315)||(31434697-31434927)
chr5 (85-315)||(37355340-37355570)
chr5 (85-315)||(3792774-3793004)
chr5 (85-315)||(9320709-9320939)
chr5 (85-315)||(12135408-12135638)
chr5 (85-315)||(18497422-18497652)
chr5 (85-307)||(23895447-23895669)
chr5 (85-315)||(26483627-26483857)
chr5 (90-315)||(43081488-43081713)
chr5 (85-315)||(13321527-13321757)
chr5 (85-315)||(28652475-28652705)
chr5 (85-315)||(30032661-30032891)
chr5 (85-315)||(37767688-37767918)
chr5 (85-315)||(6877538-6877768)
chr5 (85-315)||(8662172-8662402)
chr5 (85-315)||(24586607-24586837)
chr5 (85-315)||(30155264-30155494)
chr5 (85-315)||(30171702-30171932)
chr5 (85-315)||(30937868-30938098)
chr5 (85-315)||(31823104-31823334)
chr5 (85-315)||(33519613-33519843)
chr5 (85-315)||(34619751-34619981)
chr5 (85-315)||(37668183-37668413)
chr5 (85-315)||(37758216-37758446)
chr5 (85-304)||(22891707-22891926)
chr5 (85-315)||(15755549-15755779)
chr5 (85-315)||(24727202-24727432)
chr5 (85-307)||(25203519-25203741)
chr5 (85-307)||(25267674-25267896)
chr5 (85-315)||(32592971-32593201)
chr5 (85-315)||(5641021-5641251)
chr5 (85-315)||(28956482-28956712)
chr5 (85-315)||(2514295-2514525)
chr5 (85-200)||(18125113-18125228)
chr5 (85-199)||(13439380-13439494)
chr5 (90-200)||(9547411-9547521)
chr5 (90-200)||(11326985-11327095)
chr5 (85-200)||(13183490-13183605)
chr5 (90-200)||(29887899-29888009)
chr5 (90-200)||(33878479-33878588)
chr5 (85-172)||(351912-351999)
chr5 (212-268)||(5440049-5440105)
chr5 (212-268)||(11944246-11944302)
chr5 (212-268)||(15784549-15784605)
chr5 (212-268)||(17957376-17957432)
chr5 (212-268)||(36375786-36375842)
chr5 (212-268)||(37000440-37000496)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (85-315)||(9262-9492)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (85-315)||(30519-30749)
scaffold0143 (85-307)||(19304-19526)
scaffold0143 (85-200)||(7301-7416)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (85-307)||(3301-3523)
scaffold0089 (171-315)||(43877-44021)
scaffold0089 (236-307)||(32096-32167)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (85-298)||(21894549-21894762)
chr1 (85-315)||(51641446-51641676)
chr1 (85-304)||(20339101-20339320)
chr1 (85-315)||(10965893-10966123)
chr1 (85-315)||(3644360-3644593)
chr1 (85-310)||(28588218-28588443)
chr1 (85-315)||(10948305-10948535)
chr1 (85-298)||(41790110-41790323)
chr1 (85-306)||(16204834-16205055)
chr1 (99-307)||(20464212-20464420)
chr1 (90-200)||(28153079-28153189)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (85-315)||(15807-16037)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (85-304)||(1424-1643)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (85-315)||(22991-23221)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (85-315)||(9248-9478)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (85-315)||(12797-13027)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (85-315)||(11728-11958)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (85-315)||(11175-11405)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (85-315)||(5979-6209)
scaffold0159 (237-315)||(23105-23183)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (85-307)||(9279-9501)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (85-307)||(5471-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (213-315)||(1149-1251)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (96-299)||(43541-43754)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (210-268)||(35165-35223)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (234-295)||(33706-33770)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (212-268)||(29443-29499)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 15388178 - 15388406
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388178 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 15388277  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15388278 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15388377  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388378 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 15388406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 14760106 - 14760336
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14760106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14760205  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14760206 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14760305  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14760306 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 14760336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14668485 - 14668255
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14668485 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14668386  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14668385 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 14668286  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14668285 tctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 14668255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5009344 - 5009114
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5009344 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5009245  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5009244 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5009145  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  5009144 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5009114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6573327 - 6573097
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6573327 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6573228  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6573227 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6573128  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  6573127 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6573097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17016515 - 17016285
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17016515 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17016416  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17016415 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 17016316  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17016315 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 17016285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 34185760 - 34185985
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  34185760 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 34185859  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34185860 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34185959  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  34185960 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 34185985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 18313978 - 18314208
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18313978 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18314077  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18314078 tacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18314177  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  18314178 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 18314208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 24589161 - 24589391
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  24589161 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 24589260  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24589261 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 24589360  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  24589361 cctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 24589391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 54836860 - 54836630
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  54836860 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 54836761  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  54836760 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 54836661  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  54836660 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 54836630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14102012 - 14101782
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14102012 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 14101913  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14101912 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 14101813  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  14101812 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 14101782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 20335221 - 20335451
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20335221 acataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20335320  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20335321 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20335420  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20335421 cctctgacttgcttctcggtccgtggagctg 20335451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24116131 - 24115901
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24116131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24116032  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     |  | ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24116031 tacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24115932  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24115931 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24115901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 27160117 - 27160347
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27160117 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27160216  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27160217 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27160316  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  27160317 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27160347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39854106 - 39853876
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39854106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39854007  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39854006 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39853907  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| ||||    
T  39853906 cctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 39853876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15231341 - 15231111
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  15231341 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15231242  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15231241 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15231142  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  15231141 cctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 15231111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 18797414 - 18797644
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18797414 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18797513  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18797514 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18797613  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| ||||    
T  18797614 cctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 18797644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 36341317 - 36341547
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  36341317 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattcca 36341416  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     |  ||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36341417 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 36341516  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| |||||| || || |||||||| ||||    
T  36341517 cctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 36341547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1903723 - 1903500
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||    
T  1903723 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttcca 1903624  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1903623 tacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 1903524  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgt 308  Q
    |||| |||||| || |||||||||    
T  1903523 cctctgacttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 33670600 - 33670830
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33670600 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33670699  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  33670700 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 33670799  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  33670800 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 33670830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 15281737 - 15281959
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  15281737 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15281836  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15281837 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15281936  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  15281937 cctctgacttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30757229 - 30756999
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30757229 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30757130  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  30757129 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 30757030  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  30757029 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30756999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 31123312 - 31123542
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31123312 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31123411  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31123412 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31123511  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  31123512 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31123542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 40102437 - 40102667
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40102437 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 40102536  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  40102537 tacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 40102636  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  40102637 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 40102667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21973170 - 21972945
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21973170 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21973071  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  21973070 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21972971  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  21972970 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 21972945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 172
Target Start/End: Original strand, 22146369 - 22146456
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 172  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| | || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22146369 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggaccagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 22146456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27395017 - 27394789
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395017 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 27394918  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27394917 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27394818  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394817 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 27394789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 23125357 - 23125587
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23125357 acataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23125456  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23125457 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23125556  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23125557 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 23125587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 37948651 - 37948881
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37948651 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37948750  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37948751 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 37948850  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37948851 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 37948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27807158 - 27806928
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27807158 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27807059  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27807058 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27806959  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| ||||    
T  27806958 cctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 27806928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34294609 - 34294379
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  34294609 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 34294510  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34294509 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 34294410  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34294409 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 34294379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12658991 - 12658766
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12658991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12658892  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12658891 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 12658792  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  12658791 cctctgacttgcttctcggtttgtgg 12658766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28885655 - 28885432
Alignment:
Q  92 caagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataata 191  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||    
T  28885655 caagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaata 28885556  T
Q  192 ggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcgga 291  Q
    ||||||||| || |||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  28885555 ggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctga 28885456  T
Q  292 cttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||    
T  28885455 cttgcttctcggtctgtggagctg 28885432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20841368 - 20841138
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20841368 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20841269  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20841268 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20841169  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20841168 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 20841138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 27431230 - 27431452
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27431230 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27431329  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| | |||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  27431330 tacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 27431429  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  27431430 cctctgacttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 39048608 - 39048838
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39048608 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39048707  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39048708 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39048807  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||  |||||||| || |||||||| ||||    
T  39048808 cctcttacttgcttctcagtctgtggagctg 39048838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 11631973 - 11632203
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11631973 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11632072  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  11632073 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 11632172  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  11632173 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11632203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 13933336 - 13933566
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13933336 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13933435  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13933436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 13933535  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| ||||    
T  13933536 cctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 13933566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 257442 - 257672
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  257442 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 257541  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  257542 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 257641  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| ||||    
T  257642 cctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 257672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40236963 - 40236733
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40236963 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattcca 40236864  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40236863 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 40236764  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  40236763 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 40236733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12590263 - 12590033
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  12590263 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 12590164  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12590163 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 12590064  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| ||||    
T  12590063 cctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 12590033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39893524 - 39893294
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39893524 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39893425  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39893424 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39893325  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  39893324 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 39893294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31879741 - 31879516
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31879741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31879642  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31879641 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31879542  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31879541 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31879516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 19413290 - 19413520
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19413290 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19413389  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  19413390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 19413489  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  19413490 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 19413520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34865139 - 34864909
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34865139 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34865040  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  34865039 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 34864940  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  34864939 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 34864909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37381132 - 37380902
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37381132 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37381033  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  37381032 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaa 37380933  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  37380932 cctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 37380902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 37682684 - 37682914
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37682684 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37682783  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37682784 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37682883  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  37682884 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37682914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 37697949 - 37698179
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37697949 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37698048  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37698049 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37698148  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  37698149 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37698179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37928824 - 37928594
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37928824 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37928725  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37928724 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37928625  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  37928624 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37928594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 16826127 - 16826352
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16826127 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16826226  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  16826227 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16826326  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  16826327 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 16826352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16895353 - 16895128
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16895353 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16895254  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  16895253 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16895154  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  16895153 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 16895128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32053258 - 32053033
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32053258 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32053159  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  32053158 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 32053059  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  32053058 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 32053033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 9346775 - 9347005
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9346775 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9346874  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  9346875 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9346974  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| ||||    
T  9346975 cctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 9347005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 12713390 - 12713620
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12713390 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12713489  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  12713490 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12713589  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  12713590 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12713620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 21673964 - 21674194
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21673964 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21674063  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  21674064 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21674163  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| ||||    
T  21674164 cctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 21674194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 21699960 - 21700163
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  21699960 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 21700059  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21700060 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 21700159  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  21700160 cctc 21700163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 19453212 - 19453434
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  19453212 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19453311  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19453312 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19453411  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  19453412 cctctgacttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 31890285 - 31890395
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  31890285 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaa 31890384  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  31890385 taggctgattc 31890395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3785943 - 3785833
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  3785943 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 3785844  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  3785843 taggctgattc 3785833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16164930 - 16164820
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16164930 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 16164831  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  16164830 taggctgattc 16164820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 22924942 - 22925052
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  22924942 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 22925041  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||||||||||    
T  22925042 taggttgattc 22925052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27779684 - 27779574
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27779684 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27779585  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  27779584 taggctgattc 27779574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27819441 - 27819331
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27819441 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27819342  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  27819341 taggctgattc 27819331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34158288 - 34158184
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggtt 195  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| |    
T  34158288 ggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggct 34158189  T
Q  196 gattc 200  Q
    |||||    
T  34158188 gattc 34158184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27119974 - 27119864
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27119974 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27119875  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  27119874 taggctgattc 27119864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27827915 - 27827841
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaa 159  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  27827915 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12383988 - 12383932
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12383988 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22949721 - 22949665
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949721 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 22077672 - 22077900
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077672 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22077771  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22077772 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22077871  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077872 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 22077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 27605666 - 27605896
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27605666 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27605765  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27605766 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27605865  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27605866 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27605896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18794159 - 18793929
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18794159 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18794060  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18794059 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaa 18793960  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18793959 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18793929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14561079 - 14560849
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  14561079 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 14560980  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14560979 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14560880  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14560879 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 14560849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19691553 - 19691328
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19691553 acataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19691454  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  19691453 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19691354  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  19691353 cctctgacttgcttctcggtttgtgg 19691328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 2134021 - 2134251
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  2134021 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 2134120  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2134121 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2134220  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2134221 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 2134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 19205123 - 19205353
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19205123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19205222  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  19205223 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19205322  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| ||||    
T  19205323 cctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 19205353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29832781 - 29832551
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29832781 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29832682  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29832681 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29832582  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  29832581 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 29832551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9358080 - 9357855
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9358080 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9357981  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  9357980 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 9357881  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  9357880 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 9357855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19677902 - 19677672
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19677902 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19677803  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  19677802 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19677703  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  19677702 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 19677672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 28358713 - 28358943
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28358713 acataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28358812  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28358813 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28358912  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| ||||    
T  28358913 cctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 28358943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31357983 - 31357753
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31357983 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31357884  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| |||| || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31357883 tacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31357784  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  31357783 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31357753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18712939 - 18712709
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  18712939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18712840  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18712839 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 18712740  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  18712739 cctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 18712709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 12089484 - 12089714
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12089484 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12089583  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  12089584 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12089683  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  12089684 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12089714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33262189 - 33261964
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33262189 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33262090  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  33262089 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33261990  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  33261989 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 33261964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 31486632 - 31486862
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31486632 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31486731  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31486732 tacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 31486831  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  31486832 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31486862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15771024 - 15770914
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  15771024 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 15770925  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  15770924 taggctgattc 15770914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44564434 - 44564347
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 177  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564434 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 44564347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 183
Target Start/End: Original strand, 21344943 - 21345030
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  21344943 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcc 21345030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286626
Alignment:
Q  248 tatgaatcgggagatgtaattaaaacgcc-cgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 16286626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 5593200 - 5593430
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5593200 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 5593299  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5593300 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 5593399  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  5593400 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5593430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18054679 - 18054449
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  18054679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18054580  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18054579 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18054480  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18054479 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18054449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 18273895 - 18274125
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18273895 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18273994  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18273995 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18274094  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18274095 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18274125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 18289196 - 18289426
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18289196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18289295  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18289296 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18289395  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18289396 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18289426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 18304497 - 18304727
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18304497 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18304596  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18304597 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18304696  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18304697 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18304727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18334047 - 18333817
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18334047 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18333948  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18333947 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18333848  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18333847 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 18333817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Original strand, 4793478 - 4793701
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4793478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4793577  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4793578 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4793677  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgt 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  4793678 cctctgacttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6205320 - 6205090
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6205320 acataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6205221  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6205220 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6205121  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  6205120 cctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 6205090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 8286313 - 8286535
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8286313 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8286412  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286413 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 8286512  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  8286513 cctctgacttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8299388 - 8299158
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  8299388 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 8299289  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8299288 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 8299189  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8299188 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 8299158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 15889548 - 15889778
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15889548 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15889647  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15889648 tacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15889747  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15889748 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15889778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21678120 - 21677890
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  21678120 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 21678021  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21678020 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21677921  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21677920 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 21677890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35884183 - 35883953
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35884183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 35884084  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35884083 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 35883984  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35883983 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 35883953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4687072 - 4686842
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4687072 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4686973  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4686972 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4686873  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4686872 cctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 4686842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4725048 - 4724818
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4725048 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4724949  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4724948 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4724849  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4724848 cctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 4724818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 15737937 - 15738167
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  15737937 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 15738036  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | | |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15738037 tacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15738136  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15738137 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15738167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 22384421 - 22384651
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  22384421 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22384520  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22384521 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaa 22384620  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22384621 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 22384651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 29145599 - 29145829
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29145599 acataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29145698  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29145699 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29145798  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  29145799 cctctaacttgcttctcggtctgtggagctg 29145829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 29661813 - 29662043
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29661813 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29661912  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29661913 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 29662012  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29662013 cctctgacttgcttctcggtctgtggggctg 29662043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8215152 - 8214922
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8215152 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8215053  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
    || || ||| |||||  || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  8215052 cacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 8214953  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  8214952 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 8214922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20069457 - 20069227
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20069457 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20069358  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     |  ||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20069357 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20069258  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  20069257 cctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 20069227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 20573686 - 20573916
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  20573686 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattcca 20573785  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20573786 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20573885  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| ||||    
T  20573886 cctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 20573916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32442568 - 32442338
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32442568 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32442469  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||  |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32442468 tacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 32442369  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||| || |||| ||||    
T  32442368 cctctgacttgcttctcgatccgtggagctg 32442338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 48469344 - 48469114
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48469344 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 48469245  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48469244 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 48469145  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||  |||||| || || |||||||| ||||    
T  48469144 cctatgacttgtttctctgtctgtggagctg 48469114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7076623 - 7076393
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7076623 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7076524  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  7076523 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 7076424  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7076423 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 7076393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 28112797 - 28113027
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  28112797 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 28112896  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28112897 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28112996  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  28112997 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28113027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47026870 - 47026640
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47026870 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 47026771  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  47026770 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 47026671  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  47026670 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 47026640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 5606157 - 5606387
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5606157 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5606256  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5606257 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5606356  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  5606357 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5606387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10399561 - 10399331
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10399561 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10399462  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10399461 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10399362  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| |||||| || || |||||||| ||||    
T  10399361 cctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 10399331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28342594 - 28342364
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28342594 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28342495  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  28342494 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28342395  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  28342394 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28342364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5017131 - 5016906
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5017131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5017032  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5017031 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5016932  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5016931 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5016906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 4343519 - 4343749
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4343519 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4343618  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4343619 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4343718  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4343719 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4343749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4420332 - 4420102
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4420332 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4420233  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4420232 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4420133  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4420132 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4420102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5470405 - 5470175
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5470405 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5470306  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5470305 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5470206  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  5470205 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5470175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 6539585 - 6539815
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6539585 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6539684  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  6539685 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6539784  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  6539785 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6539815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7999977 - 7999747
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7999977 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7999878  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  7999877 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 7999778  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  7999777 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 7999747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10646490 - 10646260
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10646490 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10646391  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  10646390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10646291  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  10646290 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 10646260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18246158 - 18245928
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18246158 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18246059  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  18246058 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18245959  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  18245958 cctctgacttgcttctctatctgtggagctg 18245928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 22867691 - 22867921
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22867691 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22867790  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  22867791 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22867890  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  22867891 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 22867921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 22882750 - 22882980
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22882750 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22882849  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  22882850 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22882949  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  22882950 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 22882980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28024699 - 28024469
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  28024699 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28024600  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28024599 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28024500  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  28024499 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28024469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19697907 - 19697687
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  19697907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 19697808  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| | ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||    
T  19697807 tacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19697708  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtc 305  Q
    |||| |||||| || ||||||    
T  19697707 cctctgacttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 16621333 - 16621555
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  16621333 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 16621432  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16621433 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 16621532  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  16621533 cctctgacttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24331580 - 24331350
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24331580 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattcca 24331481  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24331480 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24331381  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  24331380 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24331350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 31961298 - 31961528
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31961298 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31961397  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31961398 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31961497  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  31961498 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31961528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 51785440 - 51785210
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51785440 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 51785341  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  51785340 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 51785241  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  51785240 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 51785210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 17981792 - 17982022
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17981792 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17981891  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  17981892 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 17981991  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  17981992 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 17982022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18228613 - 18228383
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18228613 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18228514  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  18228513 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18228414  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  18228413 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 18228383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 310
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107420
Alignment:
Q  116 gacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttg 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||| ||| || || |||| |  |||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  216 aaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 11107420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 17992779 - 17992889
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  17992779 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 17992878  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||||||||||    
T  17992879 taggttgattc 17992889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 31033084 - 31033194
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  31033084 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataa 31033183  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  31033184 taggctgattc 31033194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4627202 - 4627087
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4627202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4627103  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  4627102 tacaataggctgattc 4627087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32294040 - 32293930
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  32294040 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 32293941  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  32293940 taggctgattc 32293930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5714490 - 5714375
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  5714490 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5714391  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  5714390 tacaataggctgattc 5714375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5725400 - 5725285
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  5725400 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5725301  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  5725300 tacaataggctgattc 5725285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 5766968 - 5767083
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  5766968 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5767067  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  5767068 tacaataggctgattc 5767083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 172
Target Start/End: Original strand, 6963276 - 6963363
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 172  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6963276 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 6963363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 268
Target Start/End: Original strand, 15592879 - 15592937
Alignment:
Q  210 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15592879 aatttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatt 15592937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 5950772 - 5950828
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950772 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15918807 - 15918751
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15918807 tttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatt 15918751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20443407 - 20443351
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20443407 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaatt 20443351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41440533 - 41440477
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41440533 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaatt 41440477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 10913554 - 10913784
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  10913554 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 10913653  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10913654 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 10913753  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10913754 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 10913784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2158027 - 2157797
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2158027 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 2157928  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2157927 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 2157828  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2157827 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 2157797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26438710 - 26438480
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26438710 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26438611  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26438610 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 26438511  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  26438510 cctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 26438480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 26534558 - 26534788
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26534558 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26534657  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26534658 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26534757  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26534758 cctctgacttgcttctcggtttgtggagctg 26534788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 2106848 - 2107078
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  2106848 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 2106947  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2106948 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2107047  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  2107048 cctctgacttgcttctcggtatgtggagctg 2107078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 11421464 - 11421694
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  11421464 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 11421563  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11421564 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaac 11421663  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11421664 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 11421694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45390673 - 45390443
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45390673 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 45390574  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  45390573 tacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 45390474  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  45390473 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 45390443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5131449 - 5131219
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5131449 acataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5131350  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5131349 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5131250  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  5131249 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5131219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 5144025 - 5144255
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  5144025 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 5144124  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  5144125 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaa 5144224  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5144225 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 5144255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 16515115 - 16515337
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16515115 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattcca 16515214  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16515215 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 16515314  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  16515315 cctctgacttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22145648 - 22145418
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22145648 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22145549  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  22145548 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 22145449  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||  ||||| || ||||||||||| ||||    
T  22145448 cctctaacttgtttctcggtctgtggagctg 22145418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26516245 - 26516015
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26516245 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26516146  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26516145 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26516046  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| ||||    
T  26516045 cctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 26516015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 26271771 - 26272001
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26271771 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 26271870  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26271871 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26271970  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  26271971 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26272001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 26316533 - 26316763
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26316533 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26316632  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  26316633 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26316732  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  26316733 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26316763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10845073 - 10844851
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  10845073 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 10844974  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10844973 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 10844874  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  10844873 cctctgacttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3448759 - 3448529
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3448759 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 3448660  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  3448659 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 3448560  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  3448559 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 3448529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 4141931 - 4142161
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4141931 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4142030  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4142031 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4142130  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4142131 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4142161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4202842 - 4202612
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4202842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4202743  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| ||  || || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  4202742 tacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 4202643  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||  |||||||| || |||||||| ||||    
T  4202642 cctctaacttgcttctctgtctgtggagctg 4202612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11444340 - 11444110
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11444340 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11444241  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  11444240 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 11444141  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  11444140 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11444110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 31561075 - 31561305
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31561075 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31561174  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31561175 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31561274  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| ||||    
T  31561275 cctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 31561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16044758 - 16044550
Alignment:
Q  99 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 198  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  16044758 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgat 16044659  T
Q  199 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 298  Q
    || |  |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||    
T  16044658 tcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 16044559  T
Q  299 ttcggtctg 307  Q
     ||||||||    
T  16044558 ctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 10842679 - 10842901
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  10842679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 10842778  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  10842779 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaa 10842878  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  10842879 cctctaacttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 26666599 - 26666829
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26666599 acataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26666698  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     |  | ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  26666699 tacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26666798  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  26666799 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26666829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 298
Target Start/End: Original strand, 16748202 - 16748415
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16748202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16748301  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || |||||||||| |  |||| |  ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16748302 tacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 16748401  T
Q  285 cctcggacttgctt 298  Q
    |||| |||||||||    
T  16748402 cctctgacttgctt 16748415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 24589219 - 24589449
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24589219 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24589318  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24589319 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24589418  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  24589419 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24589449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 16446691 - 16446894
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||    
T  16446691 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttcca 16446790  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||  |||||| |  |||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16446791 tacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaa 16446890  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  16446891 cctc 16446894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2776702 - 2776592
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  2776702 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 2776603  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  2776602 taggctgattc 2776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 26512386 - 26512496
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26512386 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26512485  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  26512486 taggctgattc 26512496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 26681796 - 26681906
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26681796 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26681895  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  26681896 taggctgattc 26681906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31127355 - 31127245
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  31127355 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 31127256  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  31127255 taggctgattc 31127245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 39209829 - 39209939
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  39209829 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 39209928  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||||||||||    
T  39209929 taggttgattc 39209939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621873
Alignment:
Q  160 aagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcggga 259  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  260 gatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9621873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45734761 - 45734658
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  45734761 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 45734662  T
Q  190 tagg 193  Q
    ||||    
T  45734661 tagg 45734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 31087312 - 31087422
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  31087312 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 31087411  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  31087412 taggctgattc 31087422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9469646 - 9469590
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469646 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 16393246 - 16393302
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 30369758 - 30369814
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369758 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27022589 - 27022359
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27022589 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27022490  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27022489 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27022390  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27022389 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27022359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 27287107 - 27287337
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27287107 acataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27287206  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||  || |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27287207 tacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27287306  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27287307 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27287337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29553010 - 29552780
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29553010 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29552911  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29552910 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29552811  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  29552810 cctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 29552780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 13295694 - 13295924
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  13295694 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattcca 13295793  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13295794 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 13295893  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13295894 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 13295924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 15421063 - 15421293
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15421063 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15421162  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15421163 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15421262  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15421263 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15421293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 22931627 - 22931857
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  22931627 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22931726  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22931727 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22931826  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22931827 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 22931857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 23854072 - 23854302
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  23854072 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 23854171  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23854172 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23854271  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23854272 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 23854302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24867169 - 24866939
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24867169 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24867070  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24867069 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24866970  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24866969 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24866939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 27626454 - 27626684
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27626454 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27626553  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
    || |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27626554 cacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 27626653  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  27626654 cctctgacttgcttctcggtccgtggagctg 27626684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16677593 - 16677363
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16677593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16677494  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16677493 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 16677394  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| |||||| || || |||||||| ||||    
T  16677393 cctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 16677363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27179909 - 27179679
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27179909 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27179810  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27179809 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27179710  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27179709 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27179679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 27269330 - 27269560
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27269330 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27269429  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27269430 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27269529  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27269530 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 34461249 - 34461479
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34461249 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34461348  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34461349 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34461448  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  34461449 cctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 34461479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3699536 - 3699306
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3699536 acatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3699437  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3699436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3699337  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| |||||| || || |||||||| ||||    
T  3699336 cctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 3699306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4761216 - 4760986
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4761216 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4761117  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4761116 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4761017  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4761016 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4760986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27011184 - 27010954
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27011184 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27011085  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  27011084 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27010985  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  27010984 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27010954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 17089186 - 17089411
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  17089186 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 17089285  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
    || |||||| |||||| |  |||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17089286 cacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 17089385  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  17089386 cctctgacttgcttctcggtccgtgg 17089411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26921819 - 26921600
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggtt 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || ||| |    
T  26921819 ggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggct 26921720  T
Q  196 gattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttg 295  Q
    ||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26921719 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttg 26921620  T
Q  296 cttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  26921619 cttctcggtctgtggagctg 26921600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16753263 - 16753044
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggtt 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |    
T  16753263 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggct 16753164  T
Q  196 gattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttg 295  Q
    ||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  16753163 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttg 16753064  T
Q  296 cttttcggtctgtggtgctg 315  Q
     || ||||||||||| ||||    
T  16753063 tttctcggtctgtggagctg 16753044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27060959 - 27060729
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  27060959 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 27060860  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  27060859 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 27060760  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  27060759 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27060729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29504869 - 29504639
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29504869 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29504770  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29504769 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29504670  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  29504669 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 29504639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4528738 - 4528508
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  4528738 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 4528639  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4528638 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4528539  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4528538 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4528508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 4542517 - 4542747
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4542517 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4542616  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4542617 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4542716  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4542717 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4542747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 4720878 - 4721108
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4720878 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4720977  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4720978 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4721077  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4721078 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4721108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27488586 - 27488356
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27488586 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27488487  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  27488486 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27488387  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  27488386 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27488356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29576467 - 29576237
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29576467 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29576368  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29576367 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29576268  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  29576267 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 29576237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 30554759 - 30554989
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30554759 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30554858  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  30554859 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30554958  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  30554959 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30554989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20172000 - 20171797
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  20172000 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 20171901  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
    || ||| ||||||||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20171900 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20171801  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  20171800 cctc 20171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 22163991 - 22164194
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  22163991 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 22164090  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
    || ||| ||||||||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22164091 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 22164190  T
Q  285 cctc 288  Q
    ||||    
T  22164191 cctc 22164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 16940770 - 16941000
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16940770 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16940869  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  16940870 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16940969  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  16940970 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 16941000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 26113155 - 26113385
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26113155 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26113254  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  26113255 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26113354  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  26113355 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26113385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28210907 - 28210677
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28210907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28210808  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  28210807 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28210708  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  28210707 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28210677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4776333 - 4776103
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4776333 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4776234  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4776233 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4776134  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  4776133 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4776103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 22455857 - 22455972
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22455956  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
    || |||||||||||||    
T  22455957 cacaataggttgattc 22455972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26992248 - 26992096
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  26992248 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 26992149  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcgg 237  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||    
T  26992148 tagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 26775370 - 26775485
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26775370 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 26775469  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  26775470 tacaataggctgattc 26775485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 27358853 - 27358968
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27358853 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27358952  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  27358953 tacaataggctgattc 27358968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 27449196 - 27449311
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27449196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27449295  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  27449296 tacaataggctgattc 27449311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 14142142 - 14142252
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  14142142 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 14142241  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  14142242 taggctgattc 14142252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26789264 - 26789154
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26789264 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26789165  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  26789164 taggctgattc 26789154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27197633 - 27197523
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27197633 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27197534  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  27197533 taggctgattc 27197523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 27251602 - 27251712
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27251602 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27251701  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  27251702 taggctgattc 27251712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 193
Target Start/End: Original strand, 8902451 - 8902554
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  8902451 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 8902550  T
Q  190 tagg 193  Q
    ||||    
T  8902551 tagg 8902554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28163944 - 28163836
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28163944 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28163845  T
Q  185 cataatagg 193  Q
     | ||||||    
T  28163844 tacaatagg 28163836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 33373174 - 33373273
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33373174 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33373273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 13520940 - 13521049
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||    
T  13520940 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 13521038  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  13521039 taggctgattc 13521049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 9136223 - 9136279
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136223 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 15655455 - 15655685
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15655455 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15655554  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | ||| || |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15655555 tacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15655654  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15655655 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15655685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41678168 - 41677938
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41678168 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41678069  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41678068 tacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 41677969  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  41677968 cctctaacttgcttctcggtctgtggagctg 41677938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11552818 - 11552588
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11552818 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11552719  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11552718 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 11552619  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  11552618 cctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 11552588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24973369 - 24973139
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24973369 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 24973270  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  24973269 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaa 24973170  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24973169 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24973139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33295991 - 33295761
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33295991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33295892  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33295891 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 33295792  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33295791 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 33295761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33780952 - 33780722
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33780952 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33780853  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33780852 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 33780753  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33780752 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 33780722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 22995814 - 22996044
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  22995814 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22995913  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22995914 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22996013  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  22996014 cctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 22996044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23629433 - 23629203
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23629433 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23629334  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23629333 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 23629234  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23629233 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 23629203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 24684842 - 24685072
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24684842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24684941  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24684942 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24685041  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24685042 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24685072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 40470247 - 40470477
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40470247 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 40470346  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40470347 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 40470446  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| ||||    
T  40470447 cctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 40470477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 18372231 - 18372461
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372231 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 18372330  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  18372331 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 18372430  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  18372431 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 18372461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31434927 - 31434697
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31434927 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31434828  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31434827 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31434728  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  31434727 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31434697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 37355340 - 37355570
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37355340 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37355439  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37355440 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37355539  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  37355540 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37355570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3793004 - 3792774
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3793004 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3792905  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3792904 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3792805  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  3792804 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 3792774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9320939 - 9320709
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9320939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9320840  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  9320839 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9320740  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  9320739 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9320709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12135638 - 12135408
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12135638 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12135539  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  12135538 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 12135439  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  12135438 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12135408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 18497422 - 18497652
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18497422 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18497521  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18497522 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18497621  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| |||||| || || |||||||| ||||    
T  18497622 cctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 18497652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23895669 - 23895447
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||    
T  23895669 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttcca 23895570  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  23895569 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 23895470  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  23895469 cctctgacttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26483857 - 26483627
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26483857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26483758  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  26483757 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26483658  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  26483657 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26483627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43081713 - 43081488
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  43081713 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 43081614  T
Q  190 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcg 289  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||     
T  43081613 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 43081514  T
Q  290 gacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43081513 gacttgcttctcggtctgtggagctg 43081488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 13321527 - 13321757
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13321527 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13321626  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  13321627 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 13321726  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  13321727 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 13321757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28652705 - 28652475
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28652705 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28652606  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28652605 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28652506  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28652505 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 28652475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30032891 - 30032661
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30032891 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30032792  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||| || | || |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  30032791 tacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30032692  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  30032691 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30032661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 37767688 - 37767918
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37767688 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37767787  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37767788 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37767887  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  37767888 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37767918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6877768 - 6877538
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  6877768 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 6877669  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  6877668 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6877569  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  6877568 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6877538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 8662172 - 8662402
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8662172 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8662271  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  8662272 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 8662371  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  8662372 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 8662402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24586837 - 24586607
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24586837 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24586738  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24586737 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24586638  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  24586637 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24586607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30155494 - 30155264
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30155494 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30155395  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  30155394 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30155295  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  30155294 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30155264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30171932 - 30171702
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  30171932 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattcca 30171833  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30171832 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 30171733  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  30171732 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30171702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30938098 - 30937868
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  30938098 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 30937999  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30937998 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30937899  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30937898 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 30937868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 31823104 - 31823334
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31823104 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31823203  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31823204 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31823303  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  31823304 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31823334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33519843 - 33519613
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33519843 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33519744  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  33519743 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33519644  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  33519643 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 33519613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34619981 - 34619751
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  34619981 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 34619882  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34619881 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34619782  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  34619781 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 34619751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 37668183 - 37668413
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37668183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37668282  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37668283 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37668382  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  37668383 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37668413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37758446 - 37758216
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37758446 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37758347  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37758346 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37758247  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  37758246 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37758216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22891926 - 22891707
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  22891926 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 22891827  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22891826 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22891727  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggt 304  Q
    |||| |||||| || |||||    
T  22891726 cctctgacttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 15755549 - 15755779
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15755549 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15755648  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  15755649 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 15755748  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| ||||    
T  15755749 cctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 15755779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24727432 - 24727202
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24727432 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24727333  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24727332 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24727233  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  24727232 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24727202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25203741 - 25203519
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||    
T  25203741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25203642  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  25203641 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25203542  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25203541 cctctgacttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25267896 - 25267674
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||    
T  25267896 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25267797  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  25267796 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25267697  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25267696 cctctgacttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 32592971 - 32593201
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  32592971 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 32593070  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32593071 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 32593170  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  32593171 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 32593201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5641251 - 5641021
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5641251 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5641152  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5641151 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5641052  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  5641051 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5641021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 28956482 - 28956712
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  28956482 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28956581  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28956582 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28956681  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  28956682 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28956712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2514525 - 2514295
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||   ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  2514525 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 2514426  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  2514425 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 2514326  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  2514325 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 2514295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 18125113 - 18125228
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18125113 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18125212  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  18125213 tacaataggctgattc 18125228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 199
Target Start/End: Original strand, 13439380 - 13439494
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13439380 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 13439479  T
Q  185 cataataggttgatt 199  Q
     | |||||| |||||    
T  13439480 tacaataggctgatt 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 9547411 - 9547521
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  9547411 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 9547510  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  9547511 taggctgattc 9547521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11327095 - 11326985
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  11327095 atcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 11326996  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||||||||||    
T  11326995 taggttgattc 11326985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 13183490 - 13183605
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  13183490 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttcca 13183589  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  13183590 tacaataggctgattc 13183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 29887899 - 29888009
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  29887899 atcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 29887998  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  29887999 taggctgattc 29888009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33878588 - 33878479
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||    
T  33878588 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 33878490  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  33878489 taggctgattc 33878479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 172
Target Start/End: Original strand, 351912 - 351999
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 172  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  351912 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 351999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 5440049 - 5440105
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440049 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 11944246 - 11944302
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 15784549 - 15784605
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784549 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17957432 - 17957376
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957432 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 36375786 - 36375842
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375786 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 37000440 - 37000496
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000440 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9492 - 9262
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  9492 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 9393  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9392 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 9293  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9292 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 9262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30749 - 30519
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30749 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30650  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30649 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30550  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30549 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 30519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19526 - 19304
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  19526 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19427  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19426 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19327  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  19326 cctctaacttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7416 - 7301
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7416 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7317  T
Q  185 cataataggttgattc 200  Q
     | |||||| ||||||    
T  7316 tacaataggctgattc 7301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3523 - 3301
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  3523 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 3424  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3423 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3324  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  3323 cctctgacttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 315
Target Start/End: Original strand, 43877 - 44021
Alignment:
Q  171 cattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaa 270  Q
    ||||||| |||||| | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43877 cattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 43976  T
Q  271 aacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  43977 aacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtggagctg 44021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 236 - 307
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  236 ggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 298
Target Start/End: Original strand, 21894549 - 21894762
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21894549 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21894648  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21894649 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21894748  T
Q  285 cctcggacttgctt 298  Q
    |||| |||||||||    
T  21894749 cctctgacttgctt 21894762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 51641676 - 51641446
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51641676 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 51641577  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  51641576 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 51641477  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  51641476 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 51641446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 304
Target Start/End: Original strand, 20339101 - 20339320
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  20339101 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 20339200  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20339201 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 20339300  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggt 304  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20339301 cctctgacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10966123 - 10965893
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10966123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10966024  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| |||||| |  |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10966023 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10965924  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| ||||    
T  10965923 cctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 10965893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3644593 - 3644360
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataat-ctttgatgctatcaaaagcttcct-ggcattcattattc 182  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  3644593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattc 3644494  T
Q  183 cacataataggttgattcattt-tgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgagg 281  Q
    || | |||||| |||||| ||| | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3644493 catacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 3644394  T
Q  282 aaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  3644393 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 3644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28588443 - 28588218
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28588443 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28588344  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28588343 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 28588244  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 310  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28588243 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28588218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10948535 - 10948305
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10948535 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10948436  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  10948435 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10948336  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  10948335 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 10948305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 298
Target Start/End: Original strand, 41790110 - 41790323
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41790110 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41790209  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  41790210 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 41790309  T
Q  285 cctcggacttgctt 298  Q
    |||| |||||||||    
T  41790310 cctctgacttgctt 41790323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 306
Target Start/End: Original strand, 16204834 - 16205055
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||   ||||| ||||  |||||    
T  16204834 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttcca 16204933  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||    
T  16204934 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaa 16205033  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtct 306  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  16205034 cctctgacttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20464420 - 20464212
Alignment:
Q  99 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 198  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  20464420 cttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 20464321  T
Q  199 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 298  Q
    || |  |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20464320 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagacttgttt 20464221  T
Q  299 ttcggtctg 307  Q
     ||||||||    
T  20464220 ctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28153189 - 28153079
Alignment:
Q  90 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 189  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  28153189 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 28153090  T
Q  190 taggttgattc 200  Q
    |||| ||||||    
T  28153089 taggctgattc 28153079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16037 - 15807
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16037 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15938  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15937 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15838  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15837 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 304
Target Start/End: Original strand, 1424 - 1643
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  1424 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 1523  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1524 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 1623  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggt 304  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  1624 cctctgacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 22991 - 23221
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23090  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||    
T  23091 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 23190  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  23191 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 23221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9248
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9379  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  9378 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 9279  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  9278 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13027 - 12797
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13027 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12928  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||  || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  12927 tacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 12828  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  12827 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 11728 - 11958
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11728 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11827  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  11828 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11927  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  11928 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11405 - 11175
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11405 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11306  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  11305 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11206  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  11205 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 5979 - 6209
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  5979 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 6078  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  6079 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6178  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  6179 cctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23105
Alignment:
Q  237 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgctg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 23105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9501 - 9279
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||  | || |||||||  |||||    
T  9501 acataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttcca 9402  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     | |||||| |||||| |   ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  9401 tacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaag 9302  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  9301 cctctgacttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 5471 - 5693
Alignment:
Q  85 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 184  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  5471 acatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttca 5570  T
Q  185 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 284  Q
     |  | |||||||||  |  |||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  5571 taccacaggttgatttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaa 5670  T
Q  285 cctcggacttgcttttcggtctg 307  Q
    |||| ||||||||| || |||||    
T  5671 cctctgacttgcttctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1251 - 1149
Alignment:
Q  213 ttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtggtg 312  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  1251 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggag 1152  T
Q  313 ctg 315  Q
    |||    
T  1151 ctg 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 299
Target Start/End: Original strand, 43541 - 43754
Alignment:
Q  96 ggccttccttccactggcgggacaaggata-ggtggttccagcagataatct-ttgatgctatc--aaaagcttcctggcattcatt--attccacataa 189  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||   ||||||||| ||||||||| |  |||||| | ||    
T  43541 ggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatacaa 43640  T
Q  190 taggt-tgattcattttga-gaaatttgaaaattggcccgcaggtt-gcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaa-ttaaaacgcccgaggaaac 285  Q
    ||||  |||||| || | | | |  ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  43641 taggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaac 43740  T
Q  286 ctcggacttgcttt 299  Q
    ||| ||||||||||    
T  43741 ctctgacttgcttt 43754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 268
Target Start/End: Original strand, 35165 - 35223
Alignment:
Q  210 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35165 aatttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatt 35223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33706
Alignment:
Q  234 gcggtcatatgagatat-gaa-tcgggagatgtaattaaaacg-cccgaggaaacctcggacttg 295  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttg 33706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29499 - 29443
Alignment:
Q  212 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 268  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29499 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University