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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12671_low_22 (Length: 340)

Name: NF12671_low_22
Description: NF12671
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12671_low_22
NF12671_low_22
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (19-332)||(14178693-14179005)
chr4 (59-332)||(14173939-14174208)
chr4 (19-332)||(28611619-28611931)
chr4 (61-332)||(28606902-28607169)
chr4 (19-332)||(44161588-44161898)
chr4 (19-326)||(11104477-11104778)
chr4 (20-272)||(48826752-48827000)
chr4 (64-165)||(48708155-48708256)
chr4 (80-173)||(24726288-24726381)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (19-332)||(12930678-12930989)
chr8 (59-332)||(12935424-12935693)
chr8 (103-173)||(26504985-26505055)
chr8 (59-171)||(15588948-15589060)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (19-332)||(34907141-34907452)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (59-332)||(37040520-37040789)
chr7 (59-323)||(15290243-15290499)
chr7 (66-273)||(12099060-12099263)
chr7 (116-328)||(12082021-12082227)
chr7 (61-173)||(2757307-2757418)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (23-318)||(29106933-29107224)
chr5 (19-326)||(42911044-42911346)
chr5 (60-150)||(38997230-38997320)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (19-332)||(8539185-8539497)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (189-327)||(51302168-51302306)
chr3 (59-95)||(51302308-51302344)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (59-150)||(2100291-2100379)
chr6 (143-173)||(2100723-2100753)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14179005 - 14178693
Alignment:
Q  19 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnn---tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14179005 aaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcaataaaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggac 14178906  T
Q  116 aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14178905 aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca----agagatacaatatagtgtttcccgtgag 14178810  T
Q  216 acctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14178809 acctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaac 14178710  T
Q  316 actctatttttcttctc 332  Q
    |||||||||||| ||||    
T  14178709 actctatttttcctctc 14178693  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14174208 - 14173939
Alignment:
Q  59 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14174208 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 14174109  T
Q  159 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaag 258  Q
    |||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14174108 ttctctccactctctcacacacaca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaag 14174013  T
Q  259 ttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14174012 ttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc 14173939  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 28611619 - 28611931
Alignment:
Q  19 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnn---tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28611619 aaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaacaccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggac 28611718  T
Q  116 aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28611719 aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca----agagatacaatatagtgtttcccgtgag 28611814  T
Q  216 acctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28611815 acctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaac 28611914  T
Q  316 actctatttttcttctc 332  Q
    |||||||||||| ||||    
T  28611915 actctatttttcctctc 28611931  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 61 - 332
Target Start/End: Original strand, 28606902 - 28607169
Alignment:
Q  61 aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28606902 aacaccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt 28607001  T
Q  161 ctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 260  Q
    |||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28607002 ctctccactctctcacacacaca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagtt 28607097  T
Q  261 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28607098 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc 28607169  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44161898 - 44161588
Alignment:
Q  19 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnn---tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44161898 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggac 44161799  T
Q  116 aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44161798 aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaat--tctctccactctcttacacacaca----agagatacaatatagtgtttcccgtaag 44161705  T
Q  216 acctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44161704 acctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaac 44161605  T
Q  316 actctatttttcttctc 332  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  44161604 actctattattcctctc 44161588  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11104778 - 11104477
Alignment:
Q  19 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnntgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  11104778 aaagagattggatcttgcagcgcagctgtagcgataaaaatgaacaccaatatttaacatagaaaatcctctaatatcgagggtaaa-ccacgggacaaa 11104680  T
Q  119 ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacc 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104679 ctccgaaaaatattccaccatatctaagaatattacaatattctctccactctcttacacacaa-----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacc 11104585  T
Q  219 tacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacact 318  Q
     ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11104584 cactcctattcaaatgctattattttataacacctagaagttatagagatgatatccacccggtgtatttttcctacactctctggatttactcaacact 11104485  T
Q  319 ctattttt 326  Q
    ||||||||    
T  11104484 ctattttt 11104477  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 48826752 - 48827000
Alignment:
Q  20 aagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnnt-gaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  48826752 aagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatagaaaaagaacaccaatatttaacgtggaaaatcctctaataccgagggaaaaatcacgggacaa- 48826850  T
Q  119 ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||              |||||||||||||||||||||||||||||      
T  48826851 ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctcttcgctctct----tacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagatt 48826946  T
Q  219 tacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgata 272  Q
     ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48826947 cactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgata 48827000  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 165
Target Start/End: Original strand, 48708155 - 48708256
Alignment:
Q  64 accaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc 163  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  48708155 accaatatttaacatgaaaaactctataatactaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctc 48708254  T
Q  164 tc 165  Q
    ||    
T  48708255 tc 48708256  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Original strand, 24726288 - 24726381
Alignment:
Q  80 gaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct 173  Q
    ||||||| |||||||   |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  24726288 gaaaaccatctaatatcaagggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctct 24726381  T

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Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12930989 - 12930678
Alignment:
Q  19 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnn--tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggaca 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12930989 aaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggaca 12930890  T
Q  117 aactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgaga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930889 aactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca----agagatacaatatagtgtttcccgtgaga 12930794  T
Q  217 cctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930793 cctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaaca 12930694  T
Q  317 ctctatttttcttctc 332  Q
    ||||||||||| ||||    
T  12930693 ctctatttttcctctc 12930678  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12935693 - 12935424
Alignment:
Q  59 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12935693 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 12935594  T
Q  159 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaag 258  Q
    |||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12935593 ttctctccactctctcacacacaca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaag 12935498  T
Q  259 ttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12935497 ttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc 12935424  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 173
Target Start/End: Original strand, 26504985 - 26505055
Alignment:
Q  103 aaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct 173  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  26504985 aaaaccacagtacaaactccaaaaaatattcaactataataaaaaatattacaatattctttcaactctct 26505055  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15589060 - 15588948
Alignment:
Q  59 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 158  Q
    |||||| |||||||||   || ||||||||||| || |||| |||||| || | |||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |    
T  15589060 tgaacatcaatatttattttgaaaaaccctctattaatgagagaaaaatcaagtgacaaactctaaaaaatatttcactttatcaaacaatattacaaca 15588961  T
Q  159 ttctctccactct 171  Q
    || ||||||||||    
T  15588960 ttttctccactct 15588948  T

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Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34907452 - 34907141
Alignment:
Q  19 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnn--tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggaca 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34907452 aaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggaca 34907353  T
Q  117 aactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgaga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34907352 aactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca----agagatacaatatagtgtttcccgtgaga 34907257  T
Q  217 cctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34907256 cctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaaca 34907157  T
Q  317 ctctatttttcttctc 332  Q
    ||||||||||| ||||    
T  34907156 ctctatttttcctctc 34907141  T

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Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Original strand, 37040520 - 37040789
Alignment:
Q  59 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37040520 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 37040619  T
Q  159 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaag 258  Q
    || ||||||||||||              |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37040620 ttttctccactctctcacacacaca----agagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaag 37040715  T
Q  259 ttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37040716 ttatagagatgatacccacccgatgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc 37040789  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 59 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15290499 - 15290243
Alignment:
Q  59 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15290499 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaata 15290400  T
Q  159 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaag 258  Q
    |||||||||||||||              |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  15290399 ttctctccactctct----tacacacacaagagatacaatatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgaatgctat--tatttcagcacctagaag 15290307  T
Q  259 ttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15290306 ttatagagatgatacccacccggtgtattttt-ccacactttctggatttagtcaacactctatt 15290243  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12099263 - 12099060
Alignment:
Q  66 caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc 165  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12099263 caatattttacgtgaaaaaccctctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctctc 12099164  T
Q  166 cactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttataga 265  Q
    ||||||||              ||||| ||||||| |||||||  |||||||  ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  12099163 cactctct----tacacgcacaagagacacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttataga 12099068  T
Q  266 gatgatac 273  Q
    ||||||||    
T  12099067 gatgatac 12099060  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12082021
Alignment:
Q  116 aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgag 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||              |||||||||||||||||||||   ||||    
T  12082227 aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctcttacacggaaa----agagatacaatatagtgtttctaatgag 12082133  T
Q  216 acctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaac 315  Q
    ||   || |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |  | ||||||||||| ||||    
T  12082132 actcgctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaac 12082034  T
Q  316 actctatttttct 328  Q
    |||||| ||||||    
T  12082033 actctaattttct 12082021  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 173
Target Start/End: Original strand, 2757307 - 2757418
Alignment:
Q  61 aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt 160  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| |||| || | |||||||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||    
T  2757307 aacaccaatatttaatatgaaaacccctttaatgcttaaggaaaaaccatgagacaaattttgaaaa-tattccactatatttaaaaatattgcactatt 2757405  T
Q  161 ctctccactctct 173  Q
    |||||||||||||    
T  2757406 ctctccactctct 2757418  T

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Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Original strand, 29106933 - 29107224
Alignment:
Q  23 agattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnntgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactcc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29106933 agattggatcttgcagcgcagcggtagcgttaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactcc 29107032  T
Q  123 gaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctact 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29107033 gaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct----tacacacacaagagatacaa-atagtgtttcccgtgagacctact 29107127  T
Q  223 tctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgata-cccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacact 318  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29107128 tctattctaatgctattattttttagcacctagaagttataaagatgataccccacccaatgtatttttcccacactctctggatttactcaacact 29107224  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 42911044 - 42911346
Alignment:
Q  19 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnntgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaa 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42911044 aaagagattagatcttgcagcgcagcggcaacgataaaaatgaacaccaatatttaacatggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaa 42911143  T
Q  119 ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacc 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42911144 ctccgaaaa-tattccactatatttaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca----aaagatacaatatagtgtttcccttgagacc 42911238  T
Q  219 tacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacact 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42911239 tacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagttatagagatgatacccacccagtgtattttttccacactctctggatttactcaacact 42911338  T
Q  319 ctattttt 326  Q
    ||||||||    
T  42911339 ctattttt 42911346  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 150
Target Start/End: Original strand, 38997230 - 38997320
Alignment:
Q  60 gaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata 150  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38997230 gaacagcaatattttacgtcgaaaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata 38997320  T

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Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8539497 - 8539185
Alignment:
Q  19 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnn-tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8539497 aaagagattggatcttgcagcgcagcggtaacaataaaaaatgaacatcaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaa 8539398  T
Q  118 actccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaa---tatagtgtttcccgtga 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||              ||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  8539397 actccgaaagatattccactatatttaagaatattacaatattatctccactctct----tacacacacaagagatacaatattatagtgttt-ccgtga 8539303  T
Q  215 gacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaa 314  Q
    |||| ||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8539302 gacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaagttatagagatgatacccatccgatgtatttttcccacactctctgaatttactgaa 8539203  T
Q  315 cactctatttttcttctc 332  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  8539202 cactatatttttcctctc 8539185  T

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Target: chr3 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302168
Alignment:
Q  189 gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51302306 gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt 51302207  T
Q  289 ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttc 327  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51302206 tatccacactctctggatttactcaatactctatttttc 51302168  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 51302344 - 51302308
Alignment:
Q  59 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51302344 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac 51302308  T

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Target: chr6 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 150
Target Start/End: Original strand, 2100291 - 2100379
Alignment:
Q  59 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata 150  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2100291 tgaacatcaatatttaaggtggaaaaccctttaataatgagcgaaaaac---ggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata 2100379  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 173
Target Start/End: Original strand, 2100723 - 2100753
Alignment:
Q  143 aaagaatattacaatattctctccactctct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2100723 aaagaatattacaatattctctccactctct 2100753  T

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