View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12700_high_11 (Length: 299)

Name: NF12700_high_11
Description: NF12700
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12700_high_11
NF12700_high_11
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (4-283)||(17086081-17086358)
chr8 (15-283)||(22963351-22963618)
chr8 (1-283)||(20502026-20502308)
chr8 (5-286)||(19154814-19155097)
chr8 (5-283)||(23943922-23944196)
chr8 (5-283)||(20533337-20533616)
chr8 (4-192)||(23667816-23668002)
chr8 (5-283)||(17439434-17439713)
chr8 (8-209)||(17438148-17438349)
chr8 (11-262)||(37116283-37116535)
chr8 (9-283)||(24352935-24353209)
chr8 (96-283)||(22525472-22525661)
chr8 (1-149)||(37515755-37515901)
chr8 (11-209)||(22995832-22996029)
chr8 (8-123)||(25363134-25363248)
chr8 (8-209)||(5083085-5083285)
chr8 (5-123)||(19808291-19808408)
chr8 (5-123)||(22237948-22238065)
chr8 (5-149)||(23659457-23659599)
chr8 (9-283)||(17266925-17267202)
chr8 (5-123)||(17460981-17461098)
chr8 (5-123)||(14397791-14397908)
chr8 (8-149)||(18833612-18833751)
chr8 (1-209)||(22253090-22253296)
chr8 (5-89)||(25484168-25484252)
chr8 (1-209)||(28397539-28397744)
chr8 (156-283)||(22419491-22419619)
chr8 (5-123)||(16799561-16799679)
chr8 (3-77)||(27941581-27941655)
chr8 (9-283)||(20498475-20498751)
chr8 (5-115)||(14103152-14103262)
chr8 (8-82)||(21346164-21346239)
chr8 (140-283)||(19929671-19929816)
chr8 (158-283)||(983486-983614)
chr8 (11-120)||(35026797-35026903)
chr8 (53-115)||(8728620-8728682)
chr8 (11-283)||(2418808-2419077)
chr8 (9-113)||(22364748-22364850)
chr8 (62-123)||(23409870-23409930)
chr8 (181-283)||(21580096-21580199)
chr8 (52-149)||(23914087-23914183)
chr8 (186-228)||(40492913-40492955)
chr8 (53-115)||(44476753-44476814)
chr8 (53-115)||(44480015-44480076)
chr8 (238-283)||(40493173-40493218)
chr8 (183-265)||(13665360-13665443)
chr8 (183-265)||(13724635-13724718)
chr8 (5-52)||(40492781-40492828)
chr8 (11-120)||(22419349-22419455)
chr8 (182-283)||(39936950-39937052)
chr8 (181-265)||(18302863-18302948)
chr8 (181-265)||(41681010-41681095)
chr8 (11-67)||(13508019-13508075)
chr8 (11-67)||(13597551-13597607)
chr8 (45-86)||(18024465-18024506)
chr8 (5-54)||(22525659-22525708)
chr8 (140-192)||(27941669-27941722)
chr8 (181-265)||(29763756-29763841)
chr8 (177-222)||(35026961-35027006)
chr8 (243-283)||(22253331-22253371)
chr8 (11-67)||(41598315-41598370)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (1-283)||(21237669-21237949)
chr2 (8-283)||(19201906-19202181)
chr2 (19-283)||(26392297-26392559)
chr2 (23-283)||(23287277-23287537)
chr2 (1-209)||(34136929-34137136)
chr2 (3-209)||(9241916-9242120)
chr2 (3-209)||(21073419-21073624)
chr2 (5-283)||(24697534-24697814)
chr2 (3-123)||(19662347-19662466)
chr2 (5-123)||(34874141-34874258)
chr2 (8-149)||(27472469-27472608)
chr2 (8-123)||(23069215-23069329)
chr2 (9-123)||(18358666-18358779)
chr2 (5-123)||(21081665-21081782)
chr2 (5-123)||(31345191-31345308)
chr2 (5-283)||(20520121-20520400)
chr2 (5-112)||(22173722-22173828)
chr2 (9-280)||(23791189-23791463)
chr2 (9-283)||(23207190-23207466)
chr2 (3-119)||(6261070-6261186)
chr2 (5-283)||(22413064-22413345)
chr2 (3-119)||(30643973-30644088)
chr2 (2-209)||(18546870-18547077)
chr2 (5-283)||(23004662-23004942)
chr2 (8-149)||(9784731-9784869)
chr2 (158-283)||(18786983-18787111)
chr2 (215-283)||(21115654-21115722)
chr2 (2-114)||(43947298-43947408)
chr2 (16-122)||(22703174-22703279)
chr2 (63-123)||(24671070-24671129)
chr2 (181-283)||(24781779-24781882)
chr2 (181-283)||(24834971-24835074)
chr2 (53-115)||(6482838-6482899)
chr2 (53-115)||(6486305-6486366)
chr2 (181-282)||(24815570-24815672)
chr2 (177-283)||(7833-7941)
chr2 (63-123)||(23707275-23707334)
chr2 (63-123)||(24918185-24918244)
chr2 (181-283)||(6576223-6576326)
chr2 (17-122)||(13101577-13101682)
chr2 (9-76)||(25109010-25109077)
chr2 (11-68)||(24529508-24529564)
chr2 (181-222)||(24865659-24865700)
chr2 (63-123)||(24681489-24681548)
chr2 (181-283)||(9974935-9975038)
chr2 (181-283)||(22500849-22500952)
chr2 (181-283)||(22508783-22508886)
chr2 (181-265)||(24436081-24436157)
chr2 (181-283)||(24883472-24883575)
chr2 (5-67)||(23708547-23708609)
chr2 (181-222)||(9975053-9975094)
chr2 (181-214)||(21367926-21367959)
chr2 (10-67)||(22173808-22173864)
chr2 (10-67)||(24642835-24642891)
chr2 (10-67)||(32039477-32039533)
chr2 (181-284)||(20915114-20915218)
chr2 (19-59)||(24834804-24834844)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (1-283)||(685-965)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (4-283)||(55612-55889)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (4-283)||(11768846-11769121)
chr7 (8-283)||(20619295-20619570)
chr7 (3-209)||(11661261-11661466)
chr7 (11-283)||(9177600-9177873)
chr7 (1-209)||(42461938-42462145)
chr7 (44-283)||(18203727-18203965)
chr7 (4-209)||(9033273-9033478)
chr7 (1-209)||(38519361-38519568)
chr7 (11-283)||(1867929-1868202)
chr7 (1-199)||(11525488-11525686)
chr7 (5-283)||(17017396-17017662)
chr7 (3-209)||(18607443-18607647)
chr7 (4-209)||(130744-130949)
chr7 (3-208)||(14421940-14422145)
chr7 (157-271)||(11772372-11772486)
chr7 (11-283)||(20220124-20220395)
chr7 (5-283)||(48991094-48991372)
chr7 (1-209)||(16996211-16996417)
chr7 (5-123)||(46580604-46580721)
chr7 (3-123)||(14566243-14566362)
chr7 (3-123)||(18872401-18872520)
chr7 (5-283)||(15008427-15008707)
chr7 (5-123)||(14273589-14273706)
chr7 (3-149)||(16008594-16008738)
chr7 (5-123)||(16998667-16998784)
chr7 (20-283)||(16091673-16091934)
chr7 (8-163)||(14157036-14157189)
chr7 (8-123)||(14258525-14258639)
chr7 (8-123)||(16460697-16460811)
chr7 (8-123)||(32301362-32301476)
chr7 (5-123)||(1858760-1858877)
chr7 (8-166)||(10501355-10501511)
chr7 (8-123)||(16579833-16579947)
chr7 (8-123)||(16585716-16585830)
chr7 (29-283)||(14044660-14044916)
chr7 (29-283)||(14354690-14354946)
chr7 (8-149)||(20487591-20487730)
chr7 (5-123)||(13918454-13918571)
chr7 (5-123)||(25927180-25927294)
chr7 (9-112)||(13647492-13647594)
chr7 (166-268)||(14323296-14323399)
chr7 (5-123)||(17060352-17060470)
chr7 (1-87)||(9725584-9725670)
chr7 (8-114)||(14929152-14929257)
chr7 (8-114)||(15352618-15352723)
chr7 (5-75)||(2529982-2530052)
chr7 (3-77)||(147704-147778)
chr7 (16-122)||(16109453-16109558)
chr7 (191-283)||(12901233-12901327)
chr7 (31-122)||(837311-837401)
chr7 (31-122)||(1202491-1202581)
chr7 (151-265)||(14183537-14183650)
chr7 (52-123)||(15720070-15720140)
chr7 (181-285)||(30821145-30821250)
chr7 (31-122)||(833315-833405)
chr7 (31-122)||(1198495-1198585)
chr7 (174-265)||(43277704-43277796)
chr7 (181-283)||(36686139-36686242)
chr7 (53-115)||(10896687-10896748)
chr7 (53-115)||(15167285-15167346)
chr7 (63-123)||(8940324-8940383)
chr7 (181-283)||(12371288-12371391)
chr7 (181-283)||(46387001-46387104)
chr7 (1-122)||(38828304-38828423)
chr7 (181-265)||(12128103-12128188)
chr7 (181-265)||(48811929-48812014)
chr7 (158-283)||(16056241-16056369)
chr7 (63-123)||(38898181-38898240)
chr7 (181-283)||(59331-59434)
chr7 (181-228)||(709431-709478)
chr7 (186-283)||(811242-811341)
chr7 (5-68)||(2280047-2280110)
chr7 (186-283)||(2280231-2280330)
chr7 (181-283)||(8852104-8852207)
chr7 (181-262)||(11066499-11066581)
chr7 (10-67)||(13647456-13647512)
chr7 (10-67)||(15081928-15081984)
chr7 (181-265)||(15281337-15281422)
chr7 (96-149)||(18279357-18279409)
chr7 (96-149)||(18283320-18283372)
chr7 (181-222)||(38480159-38480200)
chr7 (181-217)||(16462176-16462212)
chr7 (11-67)||(17061895-17061950)
chr7 (11-67)||(19486678-19486734)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (4-283)||(14852803-14853080)
chr4 (1-283)||(32306920-32307199)
chr4 (5-283)||(17333191-17333472)
chr4 (7-283)||(14825383-14825658)
chr4 (1-265)||(16042946-16043208)
chr4 (3-209)||(18212722-18212926)
chr4 (3-209)||(24047226-24047431)
chr4 (8-283)||(15041893-15042170)
chr4 (8-283)||(15112254-15112531)
chr4 (1-209)||(26050400-26050606)
chr4 (5-123)||(10056713-10056830)
chr4 (1-209)||(15791763-15791969)
chr4 (9-268)||(53082084-53082344)
chr4 (1-149)||(13591851-13591997)
chr4 (8-123)||(17048066-17048180)
chr4 (9-283)||(46640388-46640663)
chr4 (5-112)||(51463761-51463867)
chr4 (5-89)||(23803158-23803242)
chr4 (5-89)||(630597-630681)
chr4 (5-112)||(12611106-12611209)
chr4 (1-148)||(40907122-40907267)
chr4 (1-89)||(26789445-26789533)
chr4 (16-123)||(40906989-40907094)
chr4 (50-209)||(26045268-26045425)
chr4 (16-122)||(4831475-4831580)
chr4 (16-122)||(4834770-4834875)
chr4 (181-265)||(19738172-19738257)
chr4 (158-283)||(13931-14059)
chr4 (31-122)||(14047715-14047805)
chr4 (181-283)||(50160067-50160170)
chr4 (181-265)||(15364994-15365079)
chr4 (31-122)||(30146462-30146552)
chr4 (5-218)||(52243122-52243337)
chr4 (181-283)||(10357379-10357482)
chr4 (64-166)||(14185012-14185112)
chr4 (181-265)||(27995836-27995921)
chr4 (63-123)||(14746570-14746629)
chr4 (174-265)||(19435656-19435748)
chr4 (181-262)||(13036654-13036736)
chr4 (181-265)||(19609352-19609437)
chr4 (158-283)||(12288290-12288418)
chr4 (19-82)||(19738362-19738425)
chr4 (10-68)||(13784-13842)
chr4 (237-271)||(14650631-14650665)
chr4 (181-286)||(33185959-33186065)
chr4 (181-222)||(10357323-10357364)
chr4 (10-67)||(18215253-18215309)
chr4 (92-149)||(19857571-19857627)
chr4 (158-218)||(43198635-43198696)
chr4 (10-67)||(51463847-51463903)
chr4 (181-264)||(20635-20719)
chr4 (174-265)||(19734374-19734466)
chr4 (243-283)||(55582292-55582332)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (10-283)||(16493062-16493333)
chr6 (5-283)||(33442961-33443237)
chr6 (5-283)||(20223858-20224135)
chr6 (5-283)||(22117842-22118119)
chr6 (11-283)||(23076645-23076918)
chr6 (1-209)||(18453171-18453378)
chr6 (3-209)||(23838164-23838368)
chr6 (11-283)||(35008063-35008336)
chr6 (1-283)||(20136583-20136865)
chr6 (1-283)||(22196004-22196286)
chr6 (11-271)||(18204005-18204265)
chr6 (1-207)||(18199341-18199547)
chr6 (5-123)||(15817450-15817567)
chr6 (1-271)||(18177597-18177866)
chr6 (8-123)||(19773474-19773588)
chr6 (5-123)||(4476899-4477016)
chr6 (5-123)||(14979316-14979433)
chr6 (5-123)||(23414959-23415076)
chr6 (8-149)||(15705375-15705514)
chr6 (5-112)||(20556787-20556893)
chr6 (5-123)||(25619651-25619768)
chr6 (5-112)||(25754972-25755078)
chr6 (26-226)||(20182764-20182962)
chr6 (26-226)||(22153029-22153227)
chr6 (8-123)||(22806007-22806120)
chr6 (5-123)||(27556717-27556834)
chr6 (9-123)||(28103831-28103944)
chr6 (1-283)||(23528031-23528309)
chr6 (6-122)||(23539045-23539160)
chr6 (5-75)||(25752838-25752908)
chr6 (13-209)||(18896252-18896445)
chr6 (158-283)||(19668284-19668412)
chr6 (11-117)||(19362507-19362611)
chr6 (11-129)||(23538879-23538996)
chr6 (5-147)||(18706357-18706497)
chr6 (17-122)||(29416845-29416949)
chr6 (183-283)||(15895842-15895943)
chr6 (181-267)||(16245265-16245352)
chr6 (158-284)||(9098594-9098715)
chr6 (181-265)||(23083174-23083259)
chr6 (1-80)||(17105849-17105928)
chr6 (181-283)||(18708510-18708613)
chr6 (9-75)||(18696609-18696675)
chr6 (181-261)||(19829843-19829924)
chr6 (37-122)||(25738457-25738540)
chr6 (181-265)||(31733742-31733827)
chr6 (11-67)||(8227445-8227501)
chr6 (247-283)||(18453096-18453132)
chr6 (11-67)||(19847929-19847984)
chr6 (19-82)||(15896051-15896114)
chr6 (181-283)||(17319009-17319112)
chr6 (186-283)||(20109048-20109147)
chr6 (214-283)||(27573236-27573306)
chr6 (10-67)||(20556873-20556929)
chr6 (181-265)||(20734335-20734420)
chr6 (185-265)||(22376793-22376874)
chr6 (158-218)||(25644300-25644361)
chr6 (96-149)||(31477910-31477962)
chr6 (11-67)||(18456846-18456901)
chr6 (182-222)||(23151206-23151246)
chr6 (181-221)||(31733834-31733874)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (10-283)||(21809515-21809786)
chr5 (10-283)||(21731395-21731666)
chr5 (1-283)||(25575587-25575865)
chr5 (1-283)||(25574394-25574672)
chr5 (11-283)||(26740581-26740852)
chr5 (11-282)||(26732768-26733038)
chr5 (5-209)||(23469792-23469994)
chr5 (1-283)||(15796335-15796616)
chr5 (156-283)||(25578110-25578238)
chr5 (9-283)||(22178152-22178428)
chr5 (1-123)||(25576780-25576900)
chr5 (3-149)||(42960592-42960736)
chr5 (3-123)||(37598809-37598928)
chr5 (30-283)||(27988880-27989137)
chr5 (9-123)||(6765903-6766016)
chr5 (3-123)||(28370948-28371067)
chr5 (11-209)||(21328150-21328347)
chr5 (5-123)||(30138857-30138974)
chr5 (8-123)||(22107367-22107480)
chr5 (8-87)||(33895587-33895666)
chr5 (5-149)||(29448053-29448196)
chr5 (6-283)||(25743636-25743913)
chr5 (53-123)||(22336642-22336711)
chr5 (53-123)||(22340180-22340249)
chr5 (3-65)||(38145430-38145492)
chr5 (31-122)||(23538504-23538594)
chr5 (17-122)||(10816478-10816582)
chr5 (181-283)||(31454938-31455040)
chr5 (181-282)||(21555269-21555371)
chr5 (53-115)||(22750264-22750325)
chr5 (181-283)||(31455551-31455653)
chr5 (158-283)||(20027021-20027149)
chr5 (181-283)||(12122410-12122513)
chr5 (181-283)||(17875074-17875177)
chr5 (11-58)||(20572025-20572072)
chr5 (53-115)||(19511516-19511577)
chr5 (70-123)||(18356271-18356323)
chr5 (11-67)||(2154593-2154648)
chr5 (11-67)||(20901988-20902043)
chr5 (247-283)||(23202699-23202735)
chr5 (181-264)||(25250783-25250867)
chr5 (181-264)||(25314568-25314652)
chr5 (11-67)||(40725984-40726040)
chr5 (181-283)||(21557934-21558037)
chr5 (96-149)||(10753318-10753370)
chr5 (70-123)||(20910910-20910962)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (4-255)||(29351-29600)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (5-283)||(332232-332507)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (7-283)||(316034-316309)
chr3 (5-283)||(13919243-13919521)
chr3 (3-209)||(10834031-10834235)
chr3 (5-283)||(12377835-12378114)
chr3 (1-209)||(9577614-9577818)
chr3 (34-283)||(43925872-43926123)
chr3 (5-123)||(324309-324426)
chr3 (1-209)||(15246007-15246215)
chr3 (5-123)||(52989651-52989768)
chr3 (3-123)||(23371399-23371518)
chr3 (11-147)||(28194743-28194878)
chr3 (3-123)||(51300636-51300755)
chr3 (8-123)||(12339780-12339894)
chr3 (8-123)||(14179445-14179559)
chr3 (8-123)||(43889558-43889672)
chr3 (5-123)||(14966243-14966360)
chr3 (8-149)||(14670972-14671111)
chr3 (8-149)||(14682471-14682610)
chr3 (8-124)||(12469974-12470089)
chr3 (3-123)||(14763653-14763772)
chr3 (16-283)||(37427620-37427895)
chr3 (8-123)||(16796560-16796674)
chr3 (5-123)||(5223378-5223495)
chr3 (11-123)||(54876322-54876433)
chr3 (8-123)||(10542364-10542478)
chr3 (5-112)||(50242985-50243091)
chr3 (1-209)||(15265128-15265336)
chr3 (5-123)||(16643246-16643363)
chr3 (9-268)||(37251100-37251360)
chr3 (9-199)||(32402892-32403081)
chr3 (16-123)||(18700247-18700353)
chr3 (5-112)||(43550371-43550477)
chr3 (5-123)||(15465149-15465266)
chr3 (8-123)||(21837499-21837612)
chr3 (1-209)||(15206925-15207133)
chr3 (10-283)||(22110285-22110560)
chr3 (11-123)||(17691644-17691754)
chr3 (14-110)||(44494893-44494988)
chr3 (3-76)||(9533416-9533489)
chr3 (11-209)||(23318650-23318845)
chr3 (1-122)||(8928355-8928474)
chr3 (58-207)||(36527734-36527882)
chr3 (16-122)||(34852596-34852701)
chr3 (53-115)||(20248741-20248803)
chr3 (1-67)||(29172552-29172618)
chr3 (98-283)||(606345-606533)
chr3 (16-123)||(14568899-14569007)
chr3 (58-157)||(3264997-3265094)
chr3 (181-283)||(22307522-22307625)
chr3 (53-115)||(38311759-38311820)
chr3 (181-265)||(31224843-31224928)
chr3 (181-265)||(31415282-31415367)
chr3 (243-283)||(323971-324011)
chr3 (63-123)||(11914003-11914062)
chr3 (181-283)||(5214928-5215031)
chr3 (181-283)||(15447886-15447989)
chr3 (181-283)||(40807006-40807109)
chr3 (181-283)||(40811821-40811924)
chr3 (174-283)||(13516404-13516514)
chr3 (181-265)||(41173258-41173343)
chr3 (11-67)||(17248221-17248276)
chr3 (11-67)||(24340657-24340713)
chr3 (11-67)||(37642199-37642255)
chr3 (181-283)||(5206542-5206645)
chr3 (181-228)||(6805837-6805884)
chr3 (92-123)||(11854715-11854746)
chr3 (181-283)||(30175453-30175556)
chr3 (175-222)||(52466427-52466474)
chr3 (10-67)||(8899221-8899277)
chr3 (181-222)||(17519788-17519829)
chr3 (181-222)||(17534650-17534691)
chr3 (245-286)||(23318883-23318924)
chr3 (158-218)||(52523809-52523870)
chr3 (16-68)||(2051138-2051190)
chr3 (243-283)||(9577539-9577579)
chr3 (181-221)||(15932393-15932433)
chr3 (174-265)||(50348982-50349074)
chr3 (16-68)||(52523666-52523718)
chr3 (11-67)||(53070633-53070688)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (7-283)||(22193-22468)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (7-283)||(14051-14326)
scaffold0005 (9-229)||(267629-267849)
scaffold0005 (237-271)||(166627-166661)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (8-267)||(7362-7619)
scaffold0111 (8-267)||(14481-14738)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (11-283)||(21533808-21534077)
chr1 (3-209)||(28312503-28312708)
chr1 (36-283)||(16381098-16381346)
chr1 (1-209)||(22124274-22124481)
chr1 (1-209)||(20958097-20958304)
chr1 (1-209)||(21043206-21043413)
chr1 (1-209)||(14800518-14800730)
chr1 (1-209)||(14809392-14809604)
chr1 (3-209)||(20437919-20438125)
chr1 (1-169)||(52940802-52940967)
chr1 (9-268)||(50614048-50614309)
chr1 (9-268)||(50621876-50622137)
chr1 (1-209)||(47190590-47190796)
chr1 (5-149)||(13881310-13881452)
chr1 (9-283)||(16368219-16368493)
chr1 (165-283)||(52954414-52954533)
chr1 (5-123)||(27653151-27653268)
chr1 (9-283)||(41049968-41050244)
chr1 (8-123)||(48603527-48603641)
chr1 (8-164)||(635914-636068)
chr1 (5-89)||(45574735-45574819)
chr1 (9-283)||(50686525-50686801)
chr1 (5-86)||(22130759-22130840)
chr1 (9-123)||(41781522-41781634)
chr1 (29-124)||(48520585-48520679)
chr1 (29-283)||(26064851-26065107)
chr1 (5-268)||(35261009-35261270)
chr1 (17-90)||(11945563-11945636)
chr1 (25-88)||(20329118-20329182)
chr1 (10-283)||(21896189-21896464)
chr1 (16-122)||(32649787-32649892)
chr1 (53-123)||(16372072-16372141)
chr1 (158-235)||(21861650-21861728)
chr1 (5-283)||(16758563-16758843)
chr1 (156-283)||(20634487-20634616)
chr1 (48-122)||(2332946-2333019)
chr1 (16-122)||(29534624-29534729)
chr1 (181-283)||(51274477-51274580)
chr1 (181-222)||(41227633-41227674)
chr1 (92-149)||(51326842-51326898)
chr1 (11-67)||(433137-433193)
chr1 (181-221)||(11809424-11809464)
chr1 (247-283)||(20958022-20958058)
chr1 (243-283)||(22124199-22124239)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (5-283)||(206453-206731)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (5-283)||(4625-4902)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (11-234)||(30295-30518)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-209)||(636-843)
scaffold0010 (5-229)||(60643-60868)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (4-209)||(36169-36373)
scaffold0107 (5-123)||(10013-10130)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-209)||(1883-2090)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-209)||(18092-18299)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (11-283)||(96919-97193)
scaffold0006 (11-283)||(106197-106471)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (11-283)||(128904-129177)
scaffold0022 (9-283)||(78235-78510)
scaffold0022 (63-123)||(53825-53884)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (8-208)||(142571-142771)
scaffold0020 (5-123)||(169678-169795)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (8-265)||(2602-2860)
scaffold0507 (9-118)||(7991-8100)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (8-209)||(927-1128)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (4-207)||(3858-4061)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (1-208)||(221132-221337)
scaffold0012 (1-68)||(225536-225603)
scaffold0012 (191-283)||(225362-225456)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (1-190)||(17510-17698)
scaffold0293 (5-123)||(20139-20256)
scaffold0293 (243-283)||(17417-17457)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (8-209)||(2945-3146)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (8-222)||(7420-7634)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (58-283)||(2576-2802)
scaffold0357 (5-283)||(16028-16308)
scaffold0357 (5-68)||(13259-13322)
scaffold0357 (5-42)||(2849-2886)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (3-209)||(9648-9851)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (11-283)||(75763-76036)
[»] scaffold0019 (3 HSPs)
scaffold0019 (3-209)||(132906-133110)
scaffold0019 (8-73)||(29325-29390)
scaffold0019 (3-39)||(133856-133892)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (5-123)||(492-609)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (3-123)||(110728-110847)
scaffold0026 (181-265)||(145815-145900)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (8-123)||(126030-126144)
scaffold0011 (135-209)||(38208-38283)
scaffold0011 (237-283)||(125681-125727)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (96-268)||(2605-2779)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (5-123)||(24526-24643)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (5-123)||(105155-105272)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (8-149)||(6091-6230)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (8-149)||(902-1041)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (8-149)||(21216-21355)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (5-149)||(209-351)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (8-123)||(20825-20939)
scaffold0018 (181-282)||(7544-7646)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (8-166)||(8064-8220)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (5-123)||(1803-1920)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (13-283)||(25021-25290)
scaffold0123 (5-149)||(587-729)
scaffold0123 (9-60)||(6330-6380)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (5-123)||(39327-39444)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (9-283)||(19817-20093)
[»] scaffold0708 (2 HSPs)
scaffold0708 (163-283)||(2498-2619)
scaffold0708 (5-82)||(2355-2432)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (19-123)||(15817-15920)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (5-123)||(17648-17765)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (5-123)||(31198-31315)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (5-112)||(269-375)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (8-123)||(6686-6800)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (5-116)||(67342-67452)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (16-209)||(10152-10344)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-209)||(19571-19777)
scaffold0106 (63-123)||(15225-15284)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (5-89)||(135-219)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (5-112)||(12221-12327)
scaffold0394 (10-67)||(12185-12241)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (26-283)||(11052-11316)
scaffold0040 (26-283)||(22152-22416)
scaffold0040 (158-283)||(103711-103839)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (8-149)||(120058-120197)
scaffold0034 (243-283)||(117093-117133)
scaffold0034 (186-283)||(32446-32545)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (5-89)||(3256-3340)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (11-120)||(101-209)
scaffold1419 (11-51)||(1-41)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (98-268)||(480-652)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (5-207)||(10464-10666)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (7-112)||(82235-82343)
scaffold0037 (96-149)||(80435-80487)
scaffold0037 (243-283)||(113610-113650)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (3-77)||(2419-2493)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (5-114)||(1785-1894)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (41-123)||(15030-15111)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (19-148)||(29723-29851)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (69-209)||(3246-3385)
scaffold0108 (181-265)||(5490-5575)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (5-89)||(3703-3787)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (19-209)||(16861-17048)
scaffold0046 (14-117)||(26016-26117)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (5-115)||(589-699)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (9-192)||(6215-6399)
scaffold0420 (230-283)||(13836-13890)
[»] scaffold0737 (3 HSPs)
scaffold0737 (158-283)||(1878-2006)
scaffold0737 (181-283)||(6566-6669)
scaffold0737 (9-75)||(1730-1796)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (158-283)||(27829-27957)
scaffold0165 (5-55)||(27677-27727)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (9-176)||(38339-38506)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (4-123)||(85620-85739)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (8-82)||(13430-13502)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (31-149)||(7884-8000)
scaffold0278 (243-283)||(7570-7610)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (14-209)||(57807-57999)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (29-117)||(6116-6203)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (16-122)||(146261-146366)
scaffold0021 (186-283)||(136493-136592)
scaffold0021 (186-283)||(145201-145300)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (174-283)||(11225-11335)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (31-122)||(48403-48493)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (181-283)||(4680-4783)
scaffold0379 (181-267)||(14726-14813)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (165-283)||(12481-12602)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (181-265)||(54945-55030)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (181-265)||(39190-39275)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (63-123)||(634-693)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (188-267)||(970-1050)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (63-123)||(1279-1338)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (243-283)||(7466-7506)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (63-123)||(15072-15131)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (174-265)||(20724-20816)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (9-89)||(18170-18250)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (177-283)||(53649-53757)
scaffold0075 (10-68)||(53482-53540)
scaffold0075 (181-264)||(60334-60418)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (181-283)||(9697-9800)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (181-283)||(11700-11803)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (181-283)||(14200-14303)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (63-149)||(4256-4340)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (237-279)||(15375-15417)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (158-218)||(1012-1073)
[»] scaffold1351 (2 HSPs)
scaffold1351 (11-76)||(127-192)
scaffold1351 (181-222)||(1488-1529)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (181-265)||(10773-10858)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (11-67)||(11595-11651)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (63-123)||(6889-6948)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (11-67)||(17961-18017)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (11-67)||(38190-38246)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (9-218)||(8006-8215)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (237-280)||(56792-56835)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (181-283)||(76761-76864)
scaffold0001 (19-82)||(446608-446671)
scaffold0001 (181-265)||(446417-446502)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (13-67)||(9877-9930)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (183-283)||(24221-24322)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (10-67)||(1259-1315)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (182-265)||(19334-19419)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (96-149)||(58819-58871)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (67-123)||(6932-6987)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (181-221)||(8325-8365)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (11-67)||(79264-79319)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 283
Target Start/End: Original strand, 17086081 - 17086358
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  17086081 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatgttgat-tattatttggta 17086179  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17086180 ttgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctattttgcttttgtaaattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaatat 17086278  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17086279 tggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 17086358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 22963351 - 22963618
Alignment:
Q  15 tttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 114  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22963351 tttgatgttgttggtaatgtgatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatct 22963450  T
Q  115 tgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatat 214  Q
    ||||||||| ||| |  || |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22963451 tgagatgtt-tatgtactgcctatgttgctgttgtatattaattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaatattggagttaaat 22963549  T
Q  215 aagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22963550 aagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccaagaatactcattcatgttgggggcttgatg 22963618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 20502026 - 20502308
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||| |||||    
T  20502026 ctgatataatatgatttgatgttgttagtaatatgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttgttg-gttatcatttg 20502124  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || || |||| |||||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502125 atattgttatatcttgagatatt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgttccaaa 20502223  T
Q  200 ttattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20502224 ttattggagtcatataagatgtcgatgttttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcatccatgttgggggcttgatg 20502308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 19154814 - 19155097
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  | |||||||    
T  19154814 tataatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tagcacttgatat 19154912  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgtt-ccaaatt 201  Q
    | |||||||| || ||||| |||||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  19154913 tattatatctggatatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaaagatgttgtttccaaatt 19155012  T
Q  202 attggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatgtcc 286  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19155013 attggatttatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgtcc 19155097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 23943922 - 23944196
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||    
T  23943922 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttg-attatcacttgatat 23944020  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    | |||||||| || |||||  || || ||  ||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||| || |||||| ||||   |||||||||||||    
T  23944021 tattatatctggatatgtt-aatgtgctgcatatgttgctgctgtctattaattaaactgcatgagtcgatctaagatgaaaga---tgttccaaattat 23944116  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  23944117 tggatttatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgtatacgcattcatgttgggggcttgatg 23944196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 20533337 - 20533616
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || | |||||||    
T  20533337 tataatgtgatttattgttgatagtaatgtaatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatc-atcacttgatat 20533435  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    | |||||||| || ||||| ||| |  ||| ||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  20533436 tattatatctggatatgttttatgtactgtttatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtatatgatgtaagaagttgttccaaattat 20533535  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20533536 tggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgaatattcattcatgttgggggcttgatg 20533616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23668002 - 23667816
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23668002 atatgatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgata 23667903  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttg 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || || | || ||||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23667902 ttgttatatcttgagatggt-tatgtgctg-ccatgttgctgttgtaaattaattaagctgcatgagtcagtcaagatgtaagatgttg 23667816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 17439434 - 17439713
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||    
T  17439434 tataatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatat 17439532  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    ||||||||| |||  |||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||    
T  17439533 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatgaaaaatgttgttccaaatta 17439632  T
Q  203 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17439633 ttggatttatataagaggtcgatgtttttaagatgtaagttgttaagttcatgcatactcattcatgtttggggcttgatg 17439713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 17438148 - 17438349
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  17438148 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 17438247  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| | ||||    
T  17438248 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgtttctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagaggtcgttccaaagtgttgg 17438346  T
Q  207 agt 209  Q
    |||    
T  17438347 agt 17438349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37116535 - 37116283
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||    
T  37116535 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttat 37116437  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||     
T  37116436 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaaaatgttgttccaaattattggat 37116337  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactc 262  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37116336 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagttcatgcatactc 37116283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24353209 - 24352935
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || || ||||||  | |   |||||||||||    
T  24353209 atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttga--tttgcattgatattgtt 24353112  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24353111 atatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 24353012  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24353011 atttatataagaggtccatgtt-ctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 24352935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22525661 - 22525472
Alignment:
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||  ||| |||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22525661 atttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgtt 22525562  T
Q  195 ccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22525561 ctaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagttcatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 22525472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37515901 - 37515755
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  37515901 ctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 37515803  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  37515802 atattgttatatcttgatatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 37515755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22996029 - 22995832
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  22996029 atgatttgatgttaaaaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttat 22995931  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    ||||  | ||||| | | || || |||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22995930 atctgaatatgttat-tgtgctgcctatgttgctgttgtctagtaattaagctgtatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattgttggagt 22995832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 25363134 - 25363248
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  25363134 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 25363232  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  25363233 tatatcttgagatgtt 25363248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 5083085 - 5083285
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  5083085 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgt 5083184  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| || | | |||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  5083185 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgttg-tatatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttgg 5083282  T
Q  207 agt 209  Q
    |||    
T  5083283 agt 5083285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 19808291 - 19808408
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |    
T  19808291 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatgttg-attatcatttgatgt 19808389  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19808390 tgttatatcttgagatgtt 19808408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 22237948 - 22238065
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  22237948 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 22238046  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22238047 tgttatatcttgagatgtt 22238065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23659599 - 23659457
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  23659599 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 23659501  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  23659500 tgttatatctcaagatgtt-tatgtgatgcctatgttgctgttgt 23659457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Original strand, 17266925 - 17267202
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||    
T  17266925 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 17267023  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||   ||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17267024 atatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 17267123  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| |||| | || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17267124 atttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 17267202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 17460981 - 17461098
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  17460981 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 17461079  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  17461080 tgttatatctctagatgtt 17461098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 14397791 - 14397908
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||    
T  14397791 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctgttg-attatcaattgatat 14397889  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14397890 tgttatatcttgagatgtt 14397908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18833751 - 18833612
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattg 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18833751 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttg-tttattatttgatattg 18833653  T
Q  107 ttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  18833652 ttatatc-tgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 18833612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22253090 - 22253296
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  22253090 ctgatataatatgatttgatgttcttagtaatgtgataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatgtt-aattatcatttg 22253188  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || |  ||||  || |||||  | |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22253189 atattgttatatcttgagatg-tatatgtgctacctat-gtgttgttgaatgttgactaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaa 22253286  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  22253287 gtattggagt 22253296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 25484168 - 25484252
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484168 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 25484252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28397744 - 28397539
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattattt 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||     
T  28397744 ctgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttg-attattcttg 28397648  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    ||||||||||||| |||   |||| | | ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  28397647 gatattgttatat-ttggattgttat-tgtgttgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgtcgttccaa 28397550  T
Q  199 attattggagt 209  Q
    | |||||||||    
T  28397549 agtattggagt 28397539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 283
Target Start/End: Original strand, 22419491 - 22419619
Alignment:
Q  156 attaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccat 254  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  22419491 attaagctgcatgagtcggtctatgatgtatgaagttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttttaagatgtaagttgttgagtccat 22419590  T
Q  255 gcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22419591 gcatacacattcatgttgggggcttgatg 22419619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16799679 - 16799561
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  16799679 tataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaaatatataagatgttttaagttgatgttg-attatcatttgata 16799581  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  16799580 ttgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 27941581 - 27941655
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 77  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27941581 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatgttta 27941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20498751 - 20498475
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| || ||||| || || || |||  |   ||||||||||||    
T  20498751 atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgc-atttgatattgt 20498653  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattg 205  Q
    |||||| ||  || ||  |||   || |||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20498652 tatatcatgctattttacatac--tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattg 20498555  T
Q  206 gagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    || |||||||||| |||| |||| |||||| | | || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  20498554 gatttatataagaggtcgttgtttctaagatgctgagttgttgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttgatg 20498475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 115
Target Start/End: Original strand, 14103152 - 14103262
Alignment:
Q  5 tataatatgatttga-tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
T  14103152 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatg 14103250  T
Q  104 ttgttatatctt 115  Q
    ||||||||||||    
T  14103251 ttgttatatctt 14103262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 21346164 - 21346239
Alignment:
Q  8 aatatgatttgat-gttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 82  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21346164 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 283
Target Start/End: Original strand, 19929671 - 19929816
Alignment:
Q  140 ttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaag 237  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| | || |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||  |||||  |    
T  19929671 ttgctgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtccaagttgtaagttgttgttccaaaatattggaatcatataagttgtcgacgttgtctaagttg 19929770  T
Q  238 taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  19929771 taagttgttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatg 19929816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 983486 - 983614
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 255  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  983486 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttttataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatg 983585  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  983586 cattcgcattcattgttgggggcttgatg 983614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 35026797 - 35026903
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  35026797 atgatttgatgttgttaataatgtgatatgattttatatgcattatgtgaattatatatgatgtttta--agatgttg-attatcgtttgatattgttat 35026893  T
Q  111 atcttgagat 120  Q
    ||||||||||    
T  35026894 atcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Original strand, 8728620 - 8728682
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  8728620 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattaccatttgatactgttatatctt 8728682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 2418808 - 2419077
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  2418808 atgatttgatgttgttaacaatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttcaa--gatgttgat-tatcgtttgatattgttat 2418904  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattga-ttaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    || || ||||    | | || || | || ||||||||   |||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2418905 atattaagattgcttgtgtgctgcc-atgttgctgtttattattgaattaagctgcatatgtcggtctaagttgtaagatgttgatccaaattattggag 2419003  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtc-catgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    | ||||| |    || ||||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2419004 tcatatatgtctacgttgtt--taagttgtaagatgttgagtctcatgcatactcattcaagttgagggcttgatg 2419077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22364850 - 22364748
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||  || || ||||||||||||    
T  22364850 atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttg--attttctttgatattgtt 22364753  T
Q  109 atatc 113  Q
    |||||    
T  22364752 atatc 22364748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409870
Alignment:
Q  62 ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 23409870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 21580096 - 21580199
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  21580096 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 21580195  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  21580196 gatg 21580199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914087
Alignment:
Q  52 attatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgctgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt-tatgtgatgcctatgttgctgttgt 23914087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 40492913 - 40492955
Alignment:
Q  186 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40492913 gatgttgttccaaattattggatttatataagatgtcgatgtt 40492955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 283
Target Start/End: Original strand, 40493173 - 40493218
Alignment:
Q  238 taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40493173 taagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 40493218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 13665360 - 13665443
Alignment:
Q  183 taagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13665360 taagatgttgttccaaagcattggagtcatataagttgttgatgttatccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 13665443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 13724635 - 13724718
Alignment:
Q  183 taagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13724635 taagatgttgttccaaagcattggagtcatataagttgttgatgttatccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 13724718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 52
Target Start/End: Original strand, 40492781 - 40492828
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgca 52  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40492781 tataatatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgca 40492828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 22419349 - 22419455
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||| ||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |   ||||||| | |||  ||||| ||||||||    
T  22419349 atgatttaatgttgtcaataatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgtttta--agatgttg-attatcgtttgaaattgttat 22419445  T
Q  111 atcttgagat 120  Q
    ||||||||||    
T  22419446 atcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 283
Target Start/End: Original strand, 39936950 - 39937052
Alignment:
Q  182 gtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttg 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||    
T  39936950 gtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgagtccatgcatacttatttaagttgagggcttg 39937049  T
Q  281 atg 283  Q
    |||    
T  39937050 atg 39937052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 18302863 - 18302948
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  18302863 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaggttgctgagtccatgcatactcatt 18302948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 41681010 - 41681095
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41681010 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 41681095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508075
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13508075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597607
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13597607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 86
Target Start/End: Original strand, 18024465 - 18024506
Alignment:
Q  45 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 86  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  18024465 tatatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgatgt 18024506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22525708 - 22525659
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcatt 54  Q
    ||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22525708 tataacatgatttaatgttgttggtaatgtcatatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 27941669 - 27941722
Alignment:
Q  140 ttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttg 192  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27941669 ttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgttg 27941722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 29763756 - 29763841
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||  | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29763756 tgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatatgagatgtttaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 29763841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 35026961 - 35027006
Alignment:
Q  177 aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35026961 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcgtataagatgtc 35027006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Original strand, 22253331 - 22253371
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  22253331 tgttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatg 22253371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598315
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41598370 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41598315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21237949 - 21237669
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21237949 ctgatatactataatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgatgaattattatttg 21237850  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21237849 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgtc-atgttgctgttgtaaattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaat 21237752  T
Q  201 tattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21237751 tattggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagttcatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 21237669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 19201906 - 19202181
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  19201906 aatatgatttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 19202005  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19202006 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattaattaaattgcacgagtcggtctaagatgaaagatgttcttccaaattattgg 19202104  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||  |||||   |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  19202105 atttatataagaggtcgatgtttctaagttgtaagacattgagttcatgcatactcattcaagttgagggcttgatg 19202181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26392559 - 26392297
Alignment:
Q  19 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgag 118  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26392559 atgttgatagaaaggtgatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaagtat-tgttgat-tattatttgatattgttatatcctgag 26392462  T
Q  119 atgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataag 217  Q
    ||||| |||    || |||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26392461 atgtt-tatgcactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaaattattggagttatataag 26392363  T
Q  218 atgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26392362 atgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 26392297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23287537 - 23287277
Alignment:
Q  23 tgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23287537 tgatagtaatgtgatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgat-tattatttgatattgttatatcttgagatgt 23287440  T
Q  123 tctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgt 221  Q
    | ||| |  || |||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23287439 tttatgtactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaaattattggagttgtataagatgt 23287340  T
Q  222 cgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||| |||||  | |||| |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  23287339 cgatgtttctaagttgttaagttgttgagttcatgcatacttattcatgtcgggggcttgatg 23287277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34137136 - 34136929
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  34137136 ctgatataatatgatgtgatgttactagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 34137038  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  34137037 atattgttatctcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaaaatgtaagatgtcgttccaaa 34136939  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  34136938 gtattggagt 34136929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9242120 - 9241916
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  9242120 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgat 9242022  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |    
T  9242021 attgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagt 9241924  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  9241923 attggagt 9241916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 21073419 - 21073624
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  21073419 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatgttg-attatcatttgat 21073517  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  21073518 attgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcatatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagt 21073616  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  21073617 attggagt 21073624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 24697534 - 24697814
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||| || |||| || || ||||||| |   |||||||||    
T  24697534 tataatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgc-atttgatat 24697632  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    ||||||||| |||  ||||  || |  || |||  ||| |||| || |||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  24697633 tgttatatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattg 24697732  T
Q  203 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24697733 ttggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 24697814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 19662347 - 19662466
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  19662347 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 19662445  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19662446 attgttatatcttgagatgtt 19662466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 34874141 - 34874258
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  34874141 tataatatgatttaatgttgaaagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 34874239  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34874240 tgttatatcttgagatgtt 34874258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27472608 - 27472469
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  27472608 aatatgatttaatgttgatagtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 27472510  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||    
T  27472509 tatatcttgagatgtt-tacgtgctgtctatgttgctgttgt 27472469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 23069215 - 23069329
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  23069215 aatatgatttgatgttgatggcaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 23069313  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  23069314 tatatcttgagatgtt 23069329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 18358666 - 18358779
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  18358666 atatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttg-attattatttgatgttgtt 18358764  T
Q  109 atatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||    
T  18358765 atatcttgagatgtt 18358779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 21081665 - 21081782
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  21081665 tataatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 21081763  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  21081764 ttttatatctttagatgtt 21081782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31345308 - 31345191
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  31345308 tataatatgaattagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 31345210  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31345209 tgttatatcttgagatgtt 31345191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 20520121 - 20520400
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  | |   |||||||    
T  20520121 tataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttga--tttgcattgatat 20520218  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    ||||||||| |||  |||| ||| |  ||  ||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  20520219 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagataatgttccaaatta 20520318  T
Q  203 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaaga-agtaaggtgttgagtccatgcatactcattc-atgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  20520319 ttggatttatataagaggtcaatgtt-ctaagatattaagttgttgagtccatgcatagtcattctttgttgggggcttgatg 20520400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Original strand, 22173722 - 22173828
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  22173722 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 22173820  T
Q  105 tgttatat 112  Q
    ||||||||    
T  22173821 tgttatat 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23791463 - 23791189
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  |||||| || || ||||||  |   |||||||||| ||    
T  23791463 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattttt 23791365  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtct-attgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  || |||| ||| ||||  || ||| | |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23791364 atatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 23791265  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttg 280  Q
    | |||||||||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23791264 atttatataagaggtcaatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttg 23791189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23207466 - 23207190
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||  ||||| | | ||  |||||  |   |||||||||||||    
T  23207466 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatgttga-gatgtcgttgatttgc-atttgatattgtt 23207369  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| |||||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23207368 atatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgatgttccaaattattgg 23207269  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| ||| ||||| ||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23207268 atttatataagaggtcaatgtttctatgatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 23207190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Original strand, 6261070 - 6261186
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtata-tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttga 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  6261070 gatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttga 6261168  T
Q  102 tattgttatatcttgaga 119  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6261169 tattgttatatcttgaga 6261186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 22413064 - 22413345
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| || |||||| | | || ||||||  |   |||||||||    
T  22413064 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgttga-gatgttgttgatttgc-atttgatat 22413161  T
Q  105 --tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaat 200  Q
      ||||||||| |||| |||| |||||  || |||| ||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  22413162 attgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgatgttccaaat 22413261  T
Q  201 tattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22413262 tattggatttatataagaggtcaatgtt-ttaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 22413345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Original strand, 30643973 - 30644088
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||    
T  30643973 gatataatacaatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagatattg-attatcatttgat 30644071  T
Q  103 attgttatatcttgaga 119  Q
    |||||||||||||||||    
T  30644072 attgttatatcttgaga 30644088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 18546870 - 18547077
Alignment:
Q  2 tgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| | |||  ||||    
T  18546870 tgatataatatattttgatgttgttagtaatgtgatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatgttg-attatcctttg 18546968  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    |||||||||| ||| || ||||| | | || || | || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||    
T  18546969 atattgttatgtctggatatgttat-tgtgatgcccatgttgctgttgtctactgattaaactgcatgagtcggtctatgatgtaagatgtcaatccaaa 18547067  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  18547068 gtattggagt 18547077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23004942 - 23004662
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||| |||||||| | |||| || | |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||    
T  23004942 tatactatgatttaacgttgttaatgatgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatat 23004844  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    | ||||||| |||  | || ||| |  |  |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||     
T  23004843 tattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaaagatgatgttccaaattg 23004744  T
Q  203 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  23004743 ttggatttatataagaggtcgatgtttctaaaatgtaagttgttgagtccatgcatactccttcattgttgggggcttgatg 23004662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 9784869 - 9784731
Alignment:
Q  8 aatatgatttgat-gttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattg 106  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||| ||| ||| |||    
T  9784869 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttg-attatcattggatgttg 9784773  T
Q  107 ttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  9784772 ttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 9784731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 18786983 - 18787111
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 255  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  18786983 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatg 18787082  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  18787083 cattcgcattcattgttgggggcttgatg 18787111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21115722 - 21115654
Alignment:
Q  215 aagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21115722 aagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 21115654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 114
Target Start/End: Original strand, 43947298 - 43947408
Alignment:
Q  2 tgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt-taagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| || |    
T  43947298 tgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatatatt-gtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatgttg-attattcttgg 43947394  T
Q  101 atattgttatatct 114  Q
    ||||||||||||||    
T  43947395 atattgttatatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22703279 - 22703174
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 114  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  22703279 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 22703182  T
Q  115 tgagatgt 122  Q
    ||||||||    
T  22703181 tgagatgt 22703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24671070
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 24671070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 24781779 - 24781882
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  24781779 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttatgttgagggctt 24781878  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  24781879 gatg 24781882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 24834971 - 24835074
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  24834971 tgtaagatgtagttccaaagtattggaatcatataaaatgtcgatattgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 24835070  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  24835071 gatg 24835074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 6482899 - 6482838
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  6482899 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgtt-aattaccatttgatattgttatatctt 6482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 6486366 - 6486305
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  6486366 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgtt-aattaccatttgatattgttatatctt 6486305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Original strand, 24815570 - 24815672
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  24815570 tgtaagatgtagttccaaagtattggaatcatataagttttcgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 24815669  T
Q  280 gat 282  Q
    |||    
T  24815670 gat 24815672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 283
Target Start/End: Original strand, 7833 - 7941
Alignment:
Q  177 aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcgg 274  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||   |||||| |||| ||    
T  7833 aagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagcattcattgttggg 7932  T
Q  275 ggcttgatg 283  Q
    |||||||||    
T  7933 ggcttgatg 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707334
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 23707334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918185
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 24918185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6576326 - 6576223
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  6576326 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 6576227  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  6576226 gatg 6576223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Original strand, 13101577 - 13101682
Alignment:
Q  17 tgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat-attgttatatct 114  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  13101577 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgataatttttatatct 13101674  T
Q  115 tgagatgt 122  Q
    ||||||||    
T  13101675 tgagatgt 13101682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25109077 - 25109010
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 76  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25109077 atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 25109010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529564
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 68  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatata 24529564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 24865659 - 24865700
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24865659 tgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtc 24865700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24681548 - 24681489
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24681548 tatatatgatgtttaagttgatgttgatc-atcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 24681489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9975038 - 9974935
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||    
T  9975038 tgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatataagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatacccatttaagttgagggctt 9974939  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  9974938 gatg 9974935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22500952 - 22500849
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||  ||||||    
T  22500952 tgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtctattgcatactcatttaagttgagggctt 22500853  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  22500852 gatg 22500849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22508886 - 22508783
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||  ||||||    
T  22508886 tgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtctattgcatactcatttaagttgagggctt 22508787  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  22508786 gatg 22508783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24436157 - 24436081
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||        |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24436157 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt--------ctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatt 24436081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24883575 - 24883472
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||    
T  24883575 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactaatttaagttgagggctt 24883476  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  24883475 gatg 24883472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Original strand, 23708547 - 23708609
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23708547 tataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23708609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9975094 - 9975053
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9975094 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 9975053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21367959 - 21367926
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21367959 tgtaagatgttgttccaaattattggagtcatat 21367926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 22173808 - 22173864
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22173808 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22173864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 24642835 - 24642891
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24642835 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24642891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 32039477 - 32039533
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32039477 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32039533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20915218 - 20915114
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||  ||||||    
T  20915218 tgtaagatgttgttctaaagtattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgaatccattgcatgctcatttaagttgagggctt 20915119  T
Q  280 gatgt 284  Q
    |||||    
T  20915118 gatgt 20915114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 24834804 - 24834844
Alignment:
Q  19 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24834804 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 24834844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 685 - 965
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||    
T  685 ctgatataatgtgatctgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgat-tatcttttg 783  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  784 atattgttatatcttgagatgtt-tatatgctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaa 882  T
Q  201 tattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  883 tattggagttatataagatgccgatgtctctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 283
Target Start/End: Original strand, 55612 - 55889
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612 atataatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 55711  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || | ||  || ||||||  ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55712 ttgttatatcttgagatgtt-tatgtgctg-ccatgatggtgttgtaaattaattaagctgcatgaatcagtcaagatgtaagatgttgttccaaattat 55809  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55810 tggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 55889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 283
Target Start/End: Original strand, 11768846 - 11769121
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaa-tattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11768846 atataatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaaatattatttgat 11768945  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||   ||  | || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11768946 attgttatatcttgagatgat---tatgtg--ctgccatgttgttgtaaattaattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgtttcaaatta 11769040  T
Q  203 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11769041 ttggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 11769121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20619570 - 20619295
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  20619570 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 20619471  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20619470 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgttgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattag 20619372  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  20619371 atttatataagaggtcgatgtttctaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatg 20619295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11661466 - 11661261
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  11661466 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgat 11661368  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggt-caagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  11661367 attgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtataagatgtaagatgttgttccaaagt 11661269  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  11661268 attggagt 11661261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 9177600 - 9177873
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  9177600 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tatcatttgatattattat 9177698  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattga-ttaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    || | || |||||  || || ||  ||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  9177699 atttggatatgtta-atgtgctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaaattattggat 9177797  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9177798 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 9177873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42462145 - 42461938
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  42462145 ctgatataatataatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 42462047  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  42462046 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattaattaagatgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaat 42461948  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  42461947 gtattggagt 42461938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203727
Alignment:
Q  44 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgc 143  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||     
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgat-tattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgtctatgttgt 18203868  T
Q  144 tgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 242  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||     
T  18203867 tgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagt 18203768  T
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18203767 tgttgagtccacgcatactcattcatgttgggggcttgatg 18203727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 9033273 - 9033478
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9033273 atataatgtgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgata 9033372  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  9033373 ttgttatatcctgagatatt-tatgtgttgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgaaagatgtcgttccaaagta 9033471  T
Q  203 ttggagt 209  Q
    |||||||    
T  9033472 ttggagt 9033478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38519568 - 38519361
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  38519568 ctgatataatatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 38519470  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38519469 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctgagatgtaagatgtcgttccaaa 38519371  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  38519370 gtattggagt 38519361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1868202
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |  | |   |||||||||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttca--tttgcattgatattgttat 1868026  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    ||| |||| |||| |||||  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |     
T  1868027 atcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgttgttccaaattattgaat 1868126  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1868127 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 1868202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 11525488 - 11525686
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  11525488 ctgatataatatgatatgatgttattagtaatttgatatattggtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttg 11525587  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11525588 atattgttatatcctgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgttgttgtatattaattaagatgcatgtgtcggtttaagatgtaagatgttgttccaaa 11525686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 17017396 - 17017662
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||| |    
T  17017396 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tatcacttgatgt 17017494  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    | |||||||| || |||||    ||||          |||| || ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17017495 tattatatctggatatgtta---atgt----------gctgctgcctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattat 17017581  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17017582 tggagtagtataaaatgtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 17017662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18607647 - 18607443
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  18607647 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgat 18607549  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||| || || |||| ||||||||||  |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |    
T  18607548 atttttatatattgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgaatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagt 18607451  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  18607450 attggagt 18607443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 130744 - 130949
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  130744 atataatatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgata 130843  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| |     
T  130844 ttgttatatcttgagatgtt-tctgtgctgcctatgttgatgttgtatattaattaagttgcatgtgtcagtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtg 130942  T
Q  203 ttggagt 209  Q
    |||||||    
T  130943 ttggagt 130949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14422145 - 14421940
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  14422145 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatgttg-attatcatttga 14422047  T
Q  102 tattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaat 200  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || || |||| || |||||||  |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||     
T  14422046 tattgttatatcttgaggtgtt-tatgtgctgcctatgttactgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagatgtcgttccaaag 14421948  T
Q  201 tattggag 208  Q
    ||||||||    
T  14421947 tattggag 14421940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 271
Target Start/End: Original strand, 11772372 - 11772486
Alignment:
Q  157 ttaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgc 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11772372 ttaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagatgttgagtccatgc 11772471  T
Q  257 atactcattcatgtt 271  Q
    |||||||||||||||    
T  11772472 atactcattcatgtt 11772486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 20220124 - 20220395
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||   |||||||  |   |||||||||||||||    
T  20220124 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgag---atgttgatttgc-atttgatattgttat 20220219  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20220220 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggat 20220319  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20220320 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 20220395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48991372 - 48991094
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||    
T  48991372 tataatatgatttaatgttgatagtaat-tgatatatt-gtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttg-attatcacttgatat 48991276  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattgattaagttgcatgagtcggt-caagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    | ||||||||  | ||||| |||||  || |||| ||| || |||| |||| | |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| |    
T  48991275 tattatatctgaatatgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatgaaagatgttgttctaaatga 48991176  T
Q  203 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48991175 ttggatttatatgagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgtggagtccatgcatactcgttcatgttgggggcttgatg 48991094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16996417 - 16996211
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| | | | |||||    
T  16996417 ctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttgttg-attttcatttg 16996320  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  16996319 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctacgttgctgttgtataatgaataagatgcatgtgtcggtctaagatgcaagatgtcgttccaaa 16996221  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     | |||||||    
T  16996220 gtgttggagt 16996211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 46580604 - 46580721
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  46580604 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 46580702  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46580703 tgttatatcttgagatgtt 46580721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14566362 - 14566243
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  14566362 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 14566264  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14566263 attgttatatcttgagatgtt 14566243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18872520 - 18872401
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  18872520 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 18872422  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18872421 attgttatatcttgagatgtt 18872401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 15008427 - 15008707
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  | |   |||||||    
T  15008427 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttga--tttgcattgatat 15008524  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||  |  |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||    
T  15008525 tgttatatcatgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaagaatgatgttccaaatta 15008624  T
Q  203 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15008625 ttggatttatataagaggtcaatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 15008707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14273706 - 14273589
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  14273706 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 14273608  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14273607 tgttatatcttgagatgtt 14273589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16008738 - 16008594
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  16008738 gatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 16008640  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||    
T  16008639 attgttatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgccgttgt 16008594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16998784 - 16998667
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  16998784 tataatatgatttaatgttgataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 16998686  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16998685 tgttatatcttgagatgtt 16998667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16091934 - 16091673
Alignment:
Q  20 tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgaga 119  Q
    ||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||  ||| |||||||||| |||||| | || |    
T  16091934 tgttgttaataatgttacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgat-tatcatttgatattattatatttggata 16091837  T
Q  120 tgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 218  Q
    ||||  || ||  || ||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16091836 tgtta-atgtgcggtatatgttgctgctgtctattaattaaactgcatgagtcagtctaagatggaagatgttgttccaaattattggatatatataaga 16091738  T
Q  219 tgtcgatgttcctaagaagt-aaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
     |||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16091737 ggtcgatgttc-taagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 16091673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 14157036 - 14157189
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  14157036 aatatgatttgatatcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 14157134  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagtt 163  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  14157135 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgtctatgttgctgttgcatattgatcaagtt 14157189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14258639 - 14258525
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  14258639 aatatgatttgatattgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 14258541  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  14258540 tatatcttgagatgtt 14258525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 16460697 - 16460811
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  16460697 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 16460795  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  16460796 tatatcttgagatgtt 16460811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301362
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 32301378  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  32301377 tatatcttgagatgtt 32301362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 1858760 - 1858877
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  1858760 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 1858858  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1858859 tgttatatcttgagatgtt 1858877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 10501355 - 10501511
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  10501355 aatatgatttgattttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 10501453  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgca 166  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  10501454 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgttgttgcatattgatcaagttgca 10501511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16579947 - 16579833
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||| ||||    
T  16579947 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttg-attatcatttgatgttgt 16579849  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  16579848 tatatcttgagatgtt 16579833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 16585716 - 16585830
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||| ||||    
T  16585716 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttg-attatcatttgatgttgt 16585814  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  16585815 tatatcttgagatgtt 16585830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14044916 - 14044660
Alignment:
Q  29 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctata 128  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || || |  | |  |||| ||||||||||||||  ||| |||| |||     
T  14044916 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcaggagctgttttatg 14044818  T
Q  129 tgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatg 226  Q
    |  || |||| ||||| || || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatg 14044718  T
Q  227 ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14044717 tttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 14044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14354946 - 14354690
Alignment:
Q  29 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctata 128  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || || |  | |  |||| ||||||||||||||  ||| |||| |||     
T  14354946 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcaggagctgttttatg 14354848  T
Q  129 tgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatg 226  Q
    |  || |||| ||||| || || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatg 14354748  T
Q  227 ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14354747 tttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 14354690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20487730 - 20487591
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  20487730 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 20487632  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||| ||||||||| || ||| || || |||| ||||||||||    
T  20487631 tatgtcttgagatatt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 20487591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 13918454 - 13918571
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  13918454 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtt-aattatcatttgatat 13918552  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13918553 cgttatatcttgagatgtt 13918571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 25927180 - 25927294
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    ||| |||||||||    
T  25927180 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgat----tatcatttgatat 25927275  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25927276 tgttatatcttgagatgtt 25927294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13647594 - 13647492
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  13647594 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttg-attatgatttgatgttgtt 13647496  T
Q  109 atat 112  Q
    ||||    
T  13647495 atat 13647492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14323399 - 14323296
Alignment:
Q  166 atgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 264  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14323399 atgagtcggtctaagttgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcat 14323300  T
Q  265 tcat 268  Q
    ||||    
T  14323299 tcat 14323296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 17060352 - 17060470
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||  |||||||    
T  17060352 tataacatgatttaatgttgatagtaatgtcaaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaagttg-attatcgtttgata 17060450  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  17060451 ttgttatattttgagatgtt 17060470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 9725584 - 9725670
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 87  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9725584 ctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgtt 9725670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 14929152 - 14929257
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  14929152 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgt 14929250  T
Q  108 tatatct 114  Q
    | |||||    
T  14929251 tgtatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 15352618 - 15352723
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  15352618 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgt 15352716  T
Q  108 tatatct 114  Q
    | |||||    
T  15352717 tgtatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Original strand, 2529982 - 2530052
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 75  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2529982 tataatatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 147778 - 147704
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 77  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  147778 gatataatatgatttgatgttgtgagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatgttta 147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 16109453 - 16109558
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 114  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  16109453 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattgctatatct 16109550  T
Q  115 tgagatgt 122  Q
    ||||||||    
T  16109551 tgagatgt 16109558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12901327 - 12901233
Alignment:
Q  191 tgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagt-aaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12901327 tgttccaaattataggatttatataagaggtcgttgttgctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 12901233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Original strand, 837311 - 837401
Alignment:
Q  31 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  837311 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 837401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Original strand, 1202491 - 1202581
Alignment:
Q  31 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1202491 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 1202581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 265
Target Start/End: Original strand, 14183537 - 14183650
Alignment:
Q  151 tattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgag 249  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||  |||||  ||||||    
T  14183537 tattaattaagctgcatgtgtcggtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtctttgtt--taagttgtaagacgttgag 14183634  T
Q  250 tccatgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||||||||    
T  14183635 tccatgcatactcatt 14183650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720070
Alignment:
Q  52 attatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 15720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 285
Target Start/End: Original strand, 30821145 - 30821250
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  30821145 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 30821244  T
Q  280 gatgtc 285  Q
    ||||||    
T  30821245 gatgtc 30821250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Original strand, 833315 - 833405
Alignment:
Q  31 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  833315 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcaattgatattgttatatcttgagatgt 833405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Original strand, 1198495 - 1198585
Alignment:
Q  31 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1198495 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcaattgatattgttatatcttgagatgt 1198585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Original strand, 43277704 - 43277796
Alignment:
Q  174 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43277704 gtcaagttgtaagttgttgttccaaaatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 43277796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 36686139 - 36686242
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  36686139 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 36686238  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  36686239 gatg 36686242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940324
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 8940324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12371391 - 12371288
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||   ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  12371391 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacattgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 12371292  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  12371291 gatg 12371288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 46387001 - 46387104
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  46387001 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 46387100  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  46387101 gatg 46387104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38828423 - 38828304
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattattt 99  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || | | ||| || ||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||    
T  38828423 ctgatataagatgatt-gatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgat-tatcattt 38828327  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  38828326 gatattattatatcttgagatgt 38828304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 12128103 - 12128188
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12128103 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 12128188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48812014 - 48811929
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48812014 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 48811929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16056369 - 16056241
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 255  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||||| | | || |||||||||||||    
T  16056369 taaggtgcatcagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatg 16056270  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||   |||||| |||| |||||||||||    
T  16056269 cattagcattcattgttgggggcttgatg 16056241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Original strand, 38898181 - 38898240
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38898181 tatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctagagatgtt 38898240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 59331 - 59434
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||    
T  59331 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatgctcatttaagttgagggctt 59430  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  59431 gatg 59434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 228
Target Start/End: Original strand, 709431 - 709478
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  709431 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgtt 709478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Original strand, 811242 - 811341
Alignment:
Q  186 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  811242 gatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccatgcattagcattcattgttgggggcttgatg 811341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 2280047 - 2280110
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 68  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  2280047 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatata 2280110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Original strand, 2280231 - 2280330
Alignment:
Q  186 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  2280231 gatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagcattcattgttgggggcttgatg 2280330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 8852104 - 8852207
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||   ||||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  8852104 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacattgagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 8852203  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  8852204 gatg 8852207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11066581 - 11066499
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactc 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  11066581 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactc 11066499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13647512 - 13647456
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13647512 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13647456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 15081928 - 15081984
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15081928 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15081984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15281422 - 15281337
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15281422 tgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaagtcgtaagttgctgagtccatgcatactcatt 15281337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18279409 - 18279357
Alignment:
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||    
T  18279409 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgtcgcctatgttgctgttgt 18279357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18283372 - 18283320
Alignment:
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||    
T  18283372 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgtcgcctatgttgctgttgt 18283320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38480200 - 38480159
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38480200 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 38480159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16462212 - 16462176
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataag 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16462212 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataag 16462176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17061950
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17061895 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 17061950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 19486678 - 19486734
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  19486678 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatat 19486734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 283
Target Start/End: Original strand, 14852803 - 14853080
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14852803 atataatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 14852902  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || | ||  || ||||||  ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14852903 ttgttatatcttgagatgtt-tatgtgctg-ccatgatggtgttgtaaattaattaagctgcatgaatcagtcaagatgtaagatgttgttccaaattat 14853000  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14853001 tggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 14853080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 32306920 - 32307199
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  32306920 ctgatataatatggtttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgat-tattattta 32307018  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || | || || ||||||   | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32307019 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcc-atgttactgttgaaaactaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgtttcaaaa 32307116  T
Q  201 tattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32307117 tattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 32307199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17333472 - 17333191
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga--aatattatttgat 102  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||  | |||||||||||    
T  17333472 tataatatgatttaatgttgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattattattatttgat 17333374  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  17333373 attgttatatcttgagatgttttatgtactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtctatgatgtaagaagttgttccaaatt 17333274  T
Q  202 attggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17333273 attggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 17333191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14825658 - 14825383
Alignment:
Q  7 taatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatatt 105  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||    
T  14825658 taatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgat-tattcttggatatt 14825560  T
Q  106 gttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattatt 204  Q
    |||||||||  |||| ||   | || || |||| ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14825559 gttatatct--agatttttattgtgctgcctatgttgttgtcgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattatt 14825462  T
Q  205 ggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14825461 ggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 14825383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16043208 - 16042946
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  16043208 ctgaaataagatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 16043110  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    || |||||||||||||||||||  | | || || | || ||||||||| |||||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16043109 atgttgttatatcttgagatgt--tgtgtgctg-ccatgttgctgttgactattgattaagctgcatatgttggtctaagatgtaagatgttgatccaaa 16043013  T
Q  200 ttattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||||  |||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16043012 ctattggagtcatataagatgttcatgttgtctaaggtataagatgttgagtccatgcatactcatt 16042946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18212926 - 18212722
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  18212926 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgat 18212828  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||| |  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||| |    
T  18212827 attgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttctaaattgattaagctgcatgtgacggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagt 18212730  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  18212729 attggagt 18212722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 24047226 - 24047431
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  24047226 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgat 24047324  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| || || |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||| |    
T  24047325 attgttatatcttaagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtatcggtctaagatgtaagatttcgttccaaagt 24047423  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  24047424 attggagt 24047431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 15041893 - 15042170
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||||     
T  15041893 aatatgatttgatgttcttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattga 15041992  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15041993 tatatcttaagatgtt-tatgtgctgcatatgttgttgttgtatattaattaagttgcatgtgtcggtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgg 15042091  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgt--tcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||| |||| ||||||| | ||  |  ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  15042092 agtcatatgagatgtctaagttgttttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatg 15042170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15112531 - 15112254
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||||     
T  15112531 aatatgatttgatgtttttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattga 15112432  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15112431 tatatcttaagatgtt-tatgtgctgcatatgttgttgttgtatattaattaagttgcatgtgtcggtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgg 15112333  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgt--tcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||| |||| ||||||| | ||  |  ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  15112332 agtcatatgagatgtctaagttgttttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatg 15112254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 26050400 - 26050606
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | | | |||||    
T  26050400 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttg-attttcatttg 26050497  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || |||| |||||||||| |||| | |||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26050498 atattgttatatcttgagatgtt-tttgtgctgcctattttgctgttgtatattaactaagctgcatgatccggtctaagatgtaagatgtcgttccaaa 26050596  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     | |||||||    
T  26050597 gtgttggagt 26050606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10056830 - 10056713
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  10056830 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 10056732  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10056731 tgttatatcttgagatgtt 10056713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15791969 - 15791763
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  15791969 ctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttg 15791871  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    |||||||||||||| ||  |||| | | ||||| |||| ||| |||||||| || |||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  15791870 atattgttatatctgga-ttgttat-tgtgttgcctatgttgttgttgtcttttaattaaactacatgagtcggtctaagatgaaagatgttgtttcaaa 15791773  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  15791772 gtattggagt 15791763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Original strand, 53082084 - 53082344
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | ||||  | |  ||||||||||||    
T  53082084 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattga--tttgctttgatattgtt 53082181  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  ||  ||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53082182 atatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 53082281  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 268  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  53082282 atttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgtgtccatgcatactcattcat 53082344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 13591851 - 13591997
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  13591851 ctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 13591949  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  13591950 atattgttatattttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 13591997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 17048066 - 17048180
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  17048066 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 17048164  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  17048165 tatatcttgagatgtt 17048180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Original strand, 46640388 - 46640663
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | | || | ||||  | | |||||||||||||    
T  46640388 atatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttga-gatgttattgattt-tcatttgatattgtt 46640485  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| |||||  ||||||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  46640486 atatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaaaatgttgtttcaaattattgg 46640585  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| ||||||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46640586 atttatataagaggtcgatggt-ctaagatgttaagatgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 46640663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Original strand, 51463761 - 51463867
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  51463761 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 51463859  T
Q  105 tgttatat 112  Q
    ||||||||    
T  51463860 tgttatat 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 23803158 - 23803242
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803158 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 23803242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 630597 - 630681
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  630597 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatgttga 630681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12611209 - 12611106
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  12611209 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 12611114  T
Q  105 tgttatat 112  Q
    ||||||||    
T  12611113 tgttatat 12611106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40907267 - 40907122
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||    
T  40907267 ctgatataagatgttttgatgttgttaatgatgtgaaatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttg-attatcatttg 40907169  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttg 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||||    
T  40907168 atatttttatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctgtgttgctgttg 40907122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 26789533 - 26789445
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttga 89  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26789533 ctgatataa-ataatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttga 26789445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 40907094 - 40906989
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  40907094 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattgttatatctt 40906997  T
Q  116 gagatgtt 123  Q
    ||||||||    
T  40906996 gagatgtt 40906989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045425
Alignment:
Q  50 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||| ||||||||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgattt-tcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tttgtgctgcctattttgctgttgt 26045364  T
Q  150 ctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
     |||| | |||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26045365 atattaactaagctgcatgatccggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttggagt 26045425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 4831475 - 4831580
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 114  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  4831475 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 4831572  T
Q  115 tgagatgt 122  Q
    ||||||||    
T  4831573 tgagatgt 4831580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 4834770 - 4834875
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 114  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  4834770 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 4834867  T
Q  115 tgagatgt 122  Q
    ||||||||    
T  4834868 tgagatgt 4834875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19738257 - 19738172
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19738257 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 19738172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14059
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 255  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||| | | || |||||||||||||    
T  13931 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttttaagatgttgagttgttgagtccatg 14030  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  14031 cattcacattcattgttgggggcttgatg 14059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14047805 - 14047715
Alignment:
Q  31 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14047805 atgtggtatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 14047715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 50160170 - 50160067
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcct-aagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  50160170 tgtaagaagttgttccaaagtattggattcatataagctgtcgatgttgtttaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 50160071  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  50160070 gatg 50160067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15365079 - 15364994
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15365079 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 15364994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30146552 - 30146462
Alignment:
Q  31 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30146552 atgtggtatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 30146462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 52243122 - 52243337
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || ||||| ||| | ||||||||    
T  52243122 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttg-aatttcatttgata 52243220  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    |||||||||| |||  || | |  ||  || |||| |||||| ||||   || | |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||    
T  52243221 ttgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaatt 52243320  T
Q  202 attggagttatataaga 218  Q
    |||||| ||||||||||    
T  52243321 attggatttatataaga 52243337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 10357379 - 10357482
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  10357379 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 10357478  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  10357479 gatg 10357482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185012
Alignment:
Q  64 atataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagtt 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgatgttatatcttgagacgtt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattgatcaaatt 14185015  T
Q  164 gca 166  Q
    |||    
T  14185014 gca 14185012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27995921 - 27995836
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27995921 tgtaagatgttattccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 27995836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746629
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 14746629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Original strand, 19435656 - 19435748
Alignment:
Q  174 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19435656 gtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 19435748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 262
Target Start/End: Original strand, 13036654 - 13036736
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactc 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13036654 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataatttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactc 13036736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19609437 - 19609352
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19609437 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagctgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 19609352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 12288290 - 12288418
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg-tgttgagtccatg 255  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  |||| |||||| || ||| ||||||||||  |    
T  12288290 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttacataagagatcattgtttctaagatgttaggttgttgagtcccag 12288389  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  12288390 cattcgcattcattgttgggggcttgatg 12288418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19738425 - 19738362
Alignment:
Q  19 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 82  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  19738425 atgttgatagtaatgttatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 19738362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 68
Target Start/End: Original strand, 13784 - 13842
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 68  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  13784 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 13842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14650665 - 14650631
Alignment:
Q  237 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgtt 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14650665 gtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgtt 14650631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33186065 - 33185959
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  33186065 tgtaagatgttgatccaaatcattggtatcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 33185966  T
Q  280 gatgtcc 286  Q
    |||||||    
T  33185965 gatgtcc 33185959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 10357323 - 10357364
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10357323 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 10357364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 18215253 - 18215309
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18215253 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19857627 - 19857571
Alignment:
Q  92 tattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  19857627 tattatttgatgttgttatatcttgaggtgtt-taagtgttgtctatgttgctgttgt 19857571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 43198635 - 43198696
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 218  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43198635 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaattattggatttatataaga 43198696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 51463847 - 51463903
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  51463847 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatat 51463903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20719 - 20635
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 264  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||| ||| || |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20719 tgtaagttgttattccaagatattggaggtatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcat 20635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19734466 - 19734374
Alignment:
Q  174 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || ||| || |||  |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19734466 gtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcatt 19734374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 55582332 - 55582292
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  55582332 tgttgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatg 55582292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16493333 - 16493062
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 109  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  16493333 tatgaattgaggttgttagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttc 16493235  T
Q  110 tatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    |||||||||||||| ||| |  || |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16493234 tatcttgagatgtt-tatgttctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgatgttccaaattattggagt 16493136  T
Q  210 tatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16493135 tacataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 16493062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33443237 - 33442961
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    |||||||||||||    
T  33443237 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgat----tattatttgatat 33443142  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  33443141 tgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaaggagttgttccaaattat 33443042  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33443041 tggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcatttatgttgggggcttgatg 33442961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20224135 - 20223858
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||    
T  20224135 tataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tatcacttgatat 20224037  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    | |||||||| || ||||| | | || |   ||| |||||| ||| |||| |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20224036 tattatatctggatatgttat-tgtgcttcatatgttgctgctgtttattaattaaactgcataagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattat 20223938  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20223937 tggatttatataagaggtcgatgtttttaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgtttggggcttgatg 20223858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22118119 - 22117842
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||    
T  22118119 tataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tatcacttgatat 22118021  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    | |||||||| || ||||| | | || |   ||| |||||| ||| |||| |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22118020 tattatatctggatatgttat-tgtgcttcatatgttgctgctgtttattaattaaactgcataagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattat 22117922  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22117921 tggatttatataagaggtcgatgtttttaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgtttggggcttgatg 22117842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23076918 - 23076645
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| ||||    
T  23076918 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgat-tatcacttgatattattat 23076820  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    |||| || ||||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||     
T  23076819 atctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagaagaaagaggttgttccaaattattggat 23076720  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23076719 atatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 23076645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18453378 - 18453171
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  18453378 ctgatattatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 18453280  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  18453279 attttgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaagatgtaagatgtcgtttcaaa 18453181  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  18453180 gtattggagt 18453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23838368 - 23838164
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  23838368 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgat 23838270  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||| |    
T  23838269 attgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgacggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagt 23838172  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  23838171 attggagt 23838164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35008336 - 35008063
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||| | |||||||| ||||    
T  35008336 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgat-tatcacttgatattattat 35008238  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    |||| || ||||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||     
T  35008237 atctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagaagaaagaggttgttccaaattattggat 35008138  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35008137 atatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 35008063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20136865 - 20136583
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  20136865 ctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttg 20136768  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || || |||| ||||||||    |||| || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20136767 atattgttatatcttgagatgtt-tacgtgctgcctatgttgctgttaaaatattaatcaagttgcatgtgttggtctaagatgtaagatgttgttccaa 20136669  T
Q  199 attattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  20136668 aatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatg 20136583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 22196004 - 22196286
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  22196004 ctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttg 22196101  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || || |||| ||||||||    |||| || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22196102 atattgttatatcttgagatgtt-tacgtgctgcctatgttgctgttaaaatattaatcaagttgcatgtgttggtctaagatgtaagatgttgttccaa 22196200  T
Q  199 attattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  22196201 aatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatg 22196286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18204265 - 18204005
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgaaatattatttgatattgtta 109  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  18204265 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttg-attatcatttgatattgtta 18204167  T
Q  110 tatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    |||| |||| |||| ||| || |  |||| ||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  18204166 tatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgttgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatccaaatttttggaa 18204067  T
Q  209 ttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgtt 271  Q
    |   ||||||||| || | || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18204066 t--cataagatgttgaggttttctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatttatgtt 18204005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18199341 - 18199547
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgaaatattattt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| ||||    
T  18199341 ctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttg-attatcattt 18199438  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||| || |  |||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18199439 gatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgctgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatccaa 18199538  T
Q  199 attattgga 207  Q
    ||| |||||    
T  18199539 atttttgga 18199547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 15817450 - 15817567
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  15817450 tataatatgatttgatgttgttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgtt-aattatcatttgatat 15817548  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15817549 tgttatatcttgagatgtt 15817567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 18177597 - 18177866
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgaaatattattt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| ||||    
T  18177597 ctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttg-attatcattt 18177694  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||| || |  |||| ||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18177695 gatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgttgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatccaa 18177794  T
Q  199 attattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgtt 271  Q
    ||| ||||| |   ||||||||| || | || ||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18177795 atttttggaat--cataagatgttgaggttttctacgttgtaagatgttgagtgcatgcatactcatttatgtt 18177866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 19773474 - 19773588
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||    
T  19773474 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttcttg-attatcatttgatattgt 19773572  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  19773573 tatatcttgagatgtt 19773588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4477016 - 4476899
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||    
T  4477016 tataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatat 4476918  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4476917 tgttatatcttgagatgtt 4476899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 14979316 - 14979433
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  14979316 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 14979414  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  14979415 tgttatatctcaagatgtt 14979433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23415076 - 23414959
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  23415076 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 23414978  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23414977 tgttatatcttgagatgtt 23414959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 15705375 - 15705514
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  15705375 aatatggtttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 15705473  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||    
T  15705474 tatatcttgagatgtt-tacttgttttctatgttgctgttgt 15705514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Original strand, 20556787 - 20556893
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  20556787 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 20556885  T
Q  105 tgttatat 112  Q
    ||||||||    
T  20556886 tgttatat 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 25619651 - 25619768
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  25619651 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 25619749  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  25619750 tgttatatctcaagatgtt 25619768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25755078 - 25754972
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  25755078 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 25754980  T
Q  105 tgttatat 112  Q
    ||||||||    
T  25754979 tgttatat 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182764
Alignment:
Q  26 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttct 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgtt-aattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-t 20182867  T
Q  126 atatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggt--caagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcg 223  Q
    || || || |||| ||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||  ||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  20182866 atgtgctgcctatattgctattgaatattaattaagttgtatgtgttcgttataagatgtaagatgttgtttcaaaatattggagtcgtataagatgtcg 20182767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153227
Alignment:
Q  26 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttct 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgtt-aattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-t 22153124  T
Q  126 atatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggt--caagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcg 223  Q
    || || || |||| ||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||  ||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22153125 atgtgctgcctatattgctattgaatattaattaagttgtatgtgttcgttataagatgtaagatgttgtttcaaaatattggagtcgtataagatgtcg 22153224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22806120 - 22806007
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  22806120 aatatgatttaatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-agttgttgttg-attatcatttgatattgt 22806023  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||| ||||||    
T  22806022 tatatcttgtgatgtt 22806007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27556834 - 27556717
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  || ||||||| |    
T  27556834 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-atcatcatttgatgt 27556736  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27556735 tgttatatattgagatgtt 27556717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 28103831 - 28103944
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  28103831 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgtt 28103929  T
Q  109 atatcttgagatgtt 123  Q
    ||| |||||||||||    
T  28103930 ataccttgagatgtt 28103944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 23528031 - 23528309
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |   |  ||||    
T  23528031 ctgaaataagatgatttgatgttgatagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatgttg-atcgtcctttg 23528129  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggt-caagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
      ||||||| ||||||||||||  | | || || | || ||| |||||  |||||| |||| |||||  || |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  23528130 --attgttacatcttgagatgt--tgtgtgctg-ccatgttgttgttgattattgaataagctgcatatgttggtataagatgtaagatgttgatccaaa 23528224  T
Q  200 ttattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
     ||||||||| |||||||||||  ||| |  |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  23528225 ctattggagtcatataagatgttcatgatgtctaagttgtaagatgttgagttcatgcatactcatttaagttgagggcttgatg 23528309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23539160 - 23539045
Alignment:
Q  6 ataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatatt 105  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23539160 ataagatgatttaatgttaataataaggtgatatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgtt-aattatcatttgatatt 23539062  T
Q  106 gttatatcttgagatgt 122  Q
    |||||||||||||||||    
T  23539061 gttatatcttgagatgt 23539045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25752908 - 25752838
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 75  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25752908 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 18896252 - 18896445
Alignment:
Q  13 gatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatat 112  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  |  |||||||||||||||    
T  18896252 gatttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg--attgtcattgatattgttatat 18896349  T
Q  113 cttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    |||||  || | | | || || |||| |||||| ||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  18896350 cttgaagtgatat-tttgctgcctatgttgctgatgtatatt-aataagctgtatgagtcggtctaagatgaatgatgtcgttccaaaatattggagt 18896445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19668412 - 19668284
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 255  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||| | |||| |||||||||||||    
T  19668412 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgattctaagatgttaagttgttgagtccatg 19668313  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19668312 catactcattcattgttgggggcttgatg 19668284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19362611 - 19362507
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||  |  |||||||||||||    
T  19362611 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaagatgttcaagttgttgttg--attgtcattgatattgttat 19362514  T
Q  111 atcttga 117  Q
    |||||||    
T  19362513 atcttga 19362507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23538996 - 23538879
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  23538996 atgaattgatgttgttgttaatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatgttg-attgtcatttgatattgttat 23538898  T
Q  111 atcttgagatgttctatat 129  Q
    ||| |||| |||| |||||    
T  23538897 atcatgagctgttttatat 23538879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18706497 - 18706357
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || | |||  || |  ||||||||    
T  18706497 tataatatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattg--atttgctttgatat 18706400  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt 147  Q
    ||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  18706399 tgttatatcatgaactgttttatatattgcctatgttgctgtt 18706357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Original strand, 29416845 - 29416949
Alignment:
Q  17 tgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  29416845 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgtt-aattatcatttgatattgttatatctt 29416942  T
Q  116 gagatgt 122  Q
    |||||||    
T  29416943 gagatgt 29416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15895943 - 15895842
Alignment:
Q  183 taagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  15895943 taagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttga 15895844  T
Q  282 tg 283  Q
    ||    
T  15895843 tg 15895842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16245352 - 16245265
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16245352 tgtaagatgttgttccaaagtattggattcatataagttgtccatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattca 16245265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 284
Target Start/End: Original strand, 9098594 - 9098715
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgc 256  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||       ||||||||||||||    
T  9098594 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaaga-------tgttgagtccatgc 9098686  T
Q  257 atactcattca-tgttcggggcttgatgt 284  Q
    || | |||||| |||| ||||||||||||    
T  9098687 attcgcattcattgttgggggcttgatgt 9098715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 23083174 - 23083259
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23083174 tgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 23083259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17105928 - 17105849
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagt 80  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  17105928 ctgacataaaatgaattgatgttgttaataacgtgatatagttgtatatgaattatgtgaattatgtatgatgttaaagt 17105849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18708613 - 18708510
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  18708613 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 18708514  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  18708513 gatg 18708510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 18696675 - 18696609
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 75  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  18696675 atatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 18696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 261
Target Start/End: Original strand, 19829843 - 19829924
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatact 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  19829843 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtctatgcatact 19829924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25738540 - 25738457
Alignment:
Q  37 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25738540 tatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttga-gttgat-tattaattgatattgtcatatcttgagatgt 25738457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31733827 - 31733742
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31733827 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 31733742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227501
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18453132 - 18453096
Alignment:
Q  247 gagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18453132 gagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 18453096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847984
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 19847984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15896114 - 15896051
Alignment:
Q  19 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 82  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||    
T  15896114 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaaaatgtaagatgttcaagttg 15896051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 17319009 - 17319112
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||    
T  17319009 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgtatactcatttaagttgagggctt 17319108  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  17319109 gatg 17319112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20109147 - 20109048
Alignment:
Q  186 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  20109147 gatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagcattcattgttgggggcttgatg 20109048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 283
Target Start/End: Original strand, 27573236 - 27573306
Alignment:
Q  214 taagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  27573236 taagatgtcgatgttgtccaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatg 27573306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 20556873 - 20556929
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20556873 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20556929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 20734335 - 20734420
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||  ||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20734335 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcataagatgttgagtccattgcatactcatt 20734420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 22376793 - 22376874
Alignment:
Q  185 agatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22376793 agatgttgttccaaagttttggagtcatataacttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 22376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25644361 - 25644300
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 218  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25644361 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaattattggatttatataaga 25644300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 149
Target Start/End: Original strand, 31477910 - 31477962
Alignment:
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||    
T  31477910 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tacgtgtcgtctatgttgctgttgt 31477962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456846
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18456901 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 222
Target Start/End: Original strand, 23151206 - 23151246
Alignment:
Q  182 gtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23151206 gtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 23151246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31733874 - 31733834
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgt 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31733874 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 31733834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Original strand, 21809515 - 21809786
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 109  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  21809515 tatgaattgaggttgttagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttc 21809613  T
Q  110 tatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    |||||||||||||| ||| |  || |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21809614 tatcttgagatgtt-tatgttctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgatgttccaaattattggagt 21809712  T
Q  210 tatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21809713 tacataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 21809786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Original strand, 21731395 - 21731666
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 109  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  21731395 tatgaattgaggttgttagtaatgagatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttc 21731493  T
Q  110 tatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    |||||||||||||| ||| |  || |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21731494 tatcttgagatgtt-tatgttctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgatgttccaaattattggagt 21731592  T
Q  210 tatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21731593 tacataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 21731666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 25575587 - 25575865
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  25575587 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgat-tattatt-g 25575684  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaat 200  Q
    | || |||||||||||||||||| ||| || || | || |  |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25575685 aaatagttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcc-atgtcactgttgtaaattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaa 25575782  T
Q  201 tattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  25575783 tattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatttaagttgttgagtccatgcatactcattcaaattgggggcttgatg 25575865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 25574394 - 25574672
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  25574394 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatta-ttg 25574491  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaat 200  Q
    | || |||||||||||||||||| ||| || || | || |  |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25574492 aaatagttatatcttgagatgtt-tatgtgctg-ccatgtcactgttgtaaattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaa 25574589  T
Q  201 tattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  25574590 tattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatttaagttgttgaatccatgcatactcattcaaattgggggcttgatg 25574672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 26740581 - 26740852
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26740581 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaagt-gttgttgat-tattatttgatattgttat 26740678  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    ||| | ||||||| |||    ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26740679 atccttagatgtt-tatgcactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggagt 26740777  T
Q  210 tatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26740778 tatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcataatcattcatgttgggggcttgatg 26740852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 26732768 - 26733038
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    
T  26732768 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaagt-gtcgttgat-tattatttgatattgttat 26732865  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    ||| ||||||||| |||    || |||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732866 atcctgagatgtt-tatgcactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttgcaagatgttgttccaaattattagagt 26732964  T
Q  210 tatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgat 282  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26732965 tatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgcgggcttgat 26733038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23469994 - 23469792
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||     
T  23469994 tataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgata- 23469897  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    || |||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  23469896 tggtatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgt 23469798  T
Q  204 tggagt 209  Q
    ||||||    
T  23469797 tggagt 23469792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15796616 - 15796335
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgaaatattattt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||    
T  15796616 ctgatataa-atgatttgatgttgctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttg-attatcattt 15796519  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| ||| || || |||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15796518 gatattgctatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatccaa 15796419  T
Q  199 attattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||| |   |||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15796418 attattggaat--cataagatgtcgatgttttctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatttatgtttagggcttgatg 15796335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 283
Target Start/End: Original strand, 25578110 - 25578238
Alignment:
Q  156 attaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgtt-gttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccat 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  25578110 attaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgtttgttccaaaatattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccat 25578209  T
Q  255 gcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25578210 gcatactcattcacgttgggggcttgatg 25578238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Original strand, 22178152 - 22178428
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   ||||||||||||     
T  22178152 atatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgtc 22178250  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||| |||| |||||  || |||| ||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22178251 atatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 22178350  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | | |||||||| ||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22178351 attgatataagaggtcgatgtttc-aagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 22178428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 25576780 - 25576900
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  25576780 ctgatataatatgattttatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatta-ttg 25576877  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25576878 atattgttatatcttgagatgtt 25576900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 42960736 - 42960592
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  42960736 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 42960638  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||    
T  42960637 attgttatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgccgttgt 42960592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 37598809 - 37598928
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  37598809 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 37598907  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37598908 attgttatatcttgagatgtt 37598928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 283
Target Start/End: Original strand, 27988880 - 27989137
Alignment:
Q  30 aatgtgatata--tttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttc 124  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||     
T  27988880 aatgtgatataaatttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatgttgat-tatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T
Q  125 tatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcg 223  Q
    ||   ||||||||  ||  ||||   |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27988979 taagagttgtctacgttcttgtt---tattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcg 27989075  T
Q  224 atgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27989076 atgtttctaagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 27989137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6766016 - 6765903
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  6766016 atatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttg-attattatttgatgttgtt 6765918  T
Q  109 atatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||    
T  6765917 atatcttgagatgtt 6765903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 28370948 - 28371067
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  28370948 gatataatatgatctgatgttgttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 28371046  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28371047 attgttatatcttgagatgtt 28371067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 21328150 - 21328347
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  21328150 atgatttgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgctat 21328248  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    ||||  | ||||| | | || || |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21328249 atctgaatatgtt-tttgtgctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgtcgttccaaattgttggagt 21328347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 30138857 - 30138974
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |    
T  30138857 tataatatgatttaatgttcgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgt 30138955  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30138956 tgttatatcttgagatgtt 30138974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 22107367 - 22107480
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  22107367 aatatgatatgat-ttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 22107464  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  22107465 tatatcttgagatgtt 22107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 87
Target Start/End: Original strand, 33895587 - 33895666
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 87  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33895587 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtt 33895666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29448196 - 29448053
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||  || ||||||| || || ||||| | |   |||||||||    
T  29448196 tataatatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttg-atttgcatttgatat 29448098  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||  || |||| ||||||||||    
T  29448097 tgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttgt 29448053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25743913 - 25743636
Alignment:
Q  6 ataatatgatttgatgttgatagtaatgtga--tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| || |    || || |||||    
T  25743913 ataagatgatttggtgttgttattaatgtgacatatatttatatatgcattatgtgaattatttgtgatgttttaagttgttgat----tactacttgat 25743818  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||| | || |||| ||| || |||| ||  |||||||   |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  25743817 attgttatatcataagttgttttatgtgctgtc-atgctgctgtttattattgattgaactgcatgagtcggtctaagatgtaagatgtcaatccaaatt 25743719  T
Q  202 attggagttatataagatgt---cgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||| |||| ||||||   || ||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  25743718 attggagtcatatgagatgttcacgttgtt--taagttgtaagaagttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatg 25743636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336642
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 22336642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340180
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 22340180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 65
Target Start/End: Original strand, 38145430 - 38145492
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 65  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38145430 gatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23538594 - 23538504
Alignment:
Q  31 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23538594 atgtggtatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatgatttgatattgttatatcttgagatgt 23538504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10816582 - 10816478
Alignment:
Q  17 tgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  10816582 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatctt 10816485  T
Q  116 gagatgt 122  Q
    |||||||    
T  10816484 gagatgt 10816478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31455040 - 31454938
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttg 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||    
T  31455040 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagttcatgcatactcatttaagttgagggcttg 31454941  T
Q  281 atg 283  Q
    |||    
T  31454940 atg 31454938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Original strand, 21555269 - 21555371
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  21555269 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 21555368  T
Q  280 gat 282  Q
    |||    
T  21555369 gat 21555371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31455653 - 31455551
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttg 280  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||    
T  31455653 tgtaagatgttgatacaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagttcatgcatactcatttaagttgagggcttg 31455554  T
Q  281 atg 283  Q
    |||    
T  31455553 atg 31455551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 20027021 - 20027149
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 255  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||| | | || |||||||||||||    
T  20027021 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgtttcaaattattggatttatataagaggtcgttgtttataagaggttgagttgttgagtccatg 20027120  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||   |||||| |||| |||||||||||    
T  20027121 cattagcattcattgttgggggcttgatg 20027149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 12122410 - 12122513
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  12122410 tgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 12122509  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  12122510 gatg 12122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17875177 - 17875074
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||  ||||| || |||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  17875177 tgtaagatattgatccaaattattggagtcatataagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgctgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 17875078  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  17875077 gatg 17875074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 20572072 - 20572025
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt 58  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20572072 atgatttgatgttgttagtaatgtaatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19511577 - 19511516
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||    
T  19511577 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatatcgttatatctt 19511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356271
Alignment:
Q  70 gatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 18356271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154648
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 2154648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902043
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 20902043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 283
Target Start/End: Original strand, 23202699 - 23202735
Alignment:
Q  247 gagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23202699 gagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 23202735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Original strand, 25250783 - 25250867
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 264  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25250783 tgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcat 25250867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Original strand, 25314568 - 25314652
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 264  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25314568 tgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcat 25314652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725984
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 40725984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 21557934 - 21558037
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||  ||||  || || ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  21557934 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtccaacttgttaagtcgttagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 21558033  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  21558034 gatg 21558037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10753370 - 10753318
Alignment:
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||    
T  10753370 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tacatgttgcctatgttgctattgt 10753318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Original strand, 20910910 - 20910962
Alignment:
Q  70 gatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20910910 gatgtataagttgttgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 20910962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 29351 - 29600
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351 atatgatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 29450  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || || | || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  29451 ttgttatatcttgagaagtt-tatgtgctg-ccatgttgctgttgtaaattaattaagttgcatgagtcagtcaaggcttaagatgttgttccaaattat 29548  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29549 tggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatg 29600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 332507 - 332232
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  332507 tatattatgattttatgttgaaagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaattatgtttaagttgatgttgaaatattatt-gatat 332409  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    ||| |||||||||||||||  || || || | || | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  332408 tgt-atatcttgagatgttg-atgtgctgcc-atgtcgctgttgtaaattgattaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaaattat 332312  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  332311 tggagttatataagatgtcggtgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 332232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 316309 - 316034
Alignment:
Q  7 taatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatatt 105  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||    
T  316309 taatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgat-tattcttggatatt 316211  T
Q  106 gttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattatt 204  Q
    ||||||||| ||  |||| | | || || |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  316210 gttatatctggat-tgttat-tgtgctgcctatgttgttgctgtctattaattaaattgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattatt 316113  T
Q  205 ggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  316112 ggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 316034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13919521 - 13919243
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||     
T  13919521 tataatatgatttaatgtttatagcgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttgttg-attattatgtgataa 13919424  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    |||||||||||||||| || ||| |  |  |||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  13919423 tgttatatcttgagatattttatgtactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaaattat 13919324  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13919323 tggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 13919243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 10834031 - 10834235
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  10834031 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt-gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgat 10834128  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || | || ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  10834129 attgttatatcttgagatgtt-tatttgctgccaatattgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagt 10834227  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  10834228 attggagt 10834235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12378114 - 12377835
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |   |||||||||    
T  12378114 tataatatgatttaatgttgatagtaatttaatatatt-gtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgc-atttgatat 12378017  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    ||||||||| |||| | || |||||  || |||| |||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  12378016 tgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagataaaatatgttgttccaaatta 12377917  T
Q  203 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagt-aaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||  ||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12377916 ttgaatttatataagaggtcgatgtttttaagatgttaagttgttgagtctatgcatacttattcatgttgggggcttgatg 12377835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9577818 - 9577614
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||    
T  9577818 ctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttgttg-attatcatttg 9577720  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||   | ||| ||||| |||| |||||||||| || | | |||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  9577719 atattgttatatcttgaga---tttatgtgttgcctatgttgctgttgtata-taaataagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagtcgttccaaa 9577624  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     | |||||||    
T  9577623 gtgttggagt 9577614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925872
Alignment:
Q  34 tgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttg 133  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||||| |||| |||| ||| |  ||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactg 43926025  T
Q  134 tctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcct 231  Q
     |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  43926024 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttct 43925925  T
Q  232 aagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43925924 aagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 43925872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 324426 - 324309
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  324426 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 324328  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  324327 tgttatatcttgagatgtt 324309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15246215 - 15246007
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgaaatattattt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  15246215 ctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttg-attatccttt 15246117  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| | | || || |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  15246116 gatattgttatgtctggatatgttat-tgtgctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagttgtcgttccaa 15246018  T
Q  199 attattggagt 209  Q
    | |||||||||    
T  15246017 agtattggagt 15246007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 52989651 - 52989768
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  52989651 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 52989749  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  52989750 tgttatatcttgagatgtt 52989768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 23371399 - 23371518
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  23371399 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 23371497  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23371498 attgttatatcttgagatgtt 23371518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28194878 - 28194743
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||    
T  28194878 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 28194779  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt 147  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  28194778 atcttgagatgtt-tatgtgctgtctatgttgctgtt 28194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 51300755 - 51300636
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  51300755 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 51300657  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  51300656 attgttatatcttgagatgtt 51300636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12339894 - 12339780
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  12339894 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 12339796  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  12339795 tatatcttgagatgtt 12339780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14179559 - 14179445
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  14179559 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 14179461  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  14179460 tatatcttgagatgtt 14179445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 43889558 - 43889672
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  43889558 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 43889656  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  43889657 tatatcttgagatgtt 43889672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14966360 - 14966243
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |    
T  14966360 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatgttg-attatcatttgatgt 14966262  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14966261 tgttatatcttgagatgtt 14966243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14671111 - 14670972
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  14671111 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 14671013  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  14671012 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 14670972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14682610 - 14682471
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  14682610 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatcttgt 14682512  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  14682511 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 14682471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12470089 - 12469974
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  12470089 aatatgatgtgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 12469991  T
Q  108 tatatcttgagatgttc 124  Q
    |||||||||||||||||    
T  12469990 tatatcttgagatgttc 12469974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 14763653 - 14763772
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  14763653 gatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 14763751  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14763752 attgttatatcttgagatgtt 14763772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37427895 - 37427620
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||    
T  37427895 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgatg-attatcatttgatactgttatatctt 37427797  T
Q  116 gagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatg--------taagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||| ||| || || || |  ||||||||| |||  ||||||||| |   ||||||| ||| ||        ||||||||||||||||| ||||||    
T  37427796 gagatgtt-tatgtgctgcctgtgctgctgttgtatatctattaagttgaaaatgtcggtctaagttgtgaagtgttaagatgttgttccaaaatattgg 37427698  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  37427697 agtcatataagatgtcgatgttgtctaagctgtaagttgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatg 37427620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16796674 - 16796560
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  16796674 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 16796576  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||| |||||    
T  16796575 tatatcttgaaatgtt 16796560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5223495 - 5223378
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  5223495 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 5223397  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5223396 tgttatatcttgagatgtt 5223378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876433
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttat 54876420  T
Q  111 atcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||    
T  54876421 atcttgagatgtt 54876433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 10542364 - 10542478
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  10542364 aatatgatttgatgtcgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 10542462  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  10542463 tatatcttgagatgtt 10542478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 50243091 - 50242985
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  50243091 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 50242993  T
Q  105 tgttatat 112  Q
    ||||||||    
T  50242992 tgttatat 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15265336 - 15265128
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgaaatattattt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  15265336 ctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttg-attatccttt 15265238  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| | | || || |||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||||||| |||||| ||| |||  ||||||    
T  15265237 gatattgttatgtctggatatgttat-tgtgctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactacacgagtcggtctaagatgaaagttgtcattccaa 15265139  T
Q  199 attattggagt 209  Q
    | |||||||||    
T  15265138 agtattggagt 15265128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16643363 - 16643246
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  16643363 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 16643265  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  16643264 tgttatatctcaagatgtt 16643246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Original strand, 37251100 - 37251360
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| || |||||| | | || ||||||  |   |||||||||||||    
T  37251100 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgttga-gatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 37251197  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| |||||  || |||| |||||||| || |||| | |||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37251198 atatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatggaagatgatgttccaaattattgg 37251297  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 268  Q
    | |||||||||| |||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37251298 atttatataagaggtcgatttttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcat 37251360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 32402892 - 32403081
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  32402892 atatgatttgttgttgcgagtaatgtgatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgctattg-attattatttgatattgt 32402990  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    |||||||||||| ||  ||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  32402991 tatatcttgagacgt--tatgtgctgtctatgttgctgttgtatattgattaggctgcatgtgtcagtcaaagttgtaagatgtcgttccaaa 32403081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 18700247 - 18700353
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18700247 ttgatgttgatggtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtt-aattatcatttgatattgttatatctt 18700345  T
Q  116 gagatgtt 123  Q
    ||||||||    
T  18700346 gagatgtt 18700353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Original strand, 43550371 - 43550477
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  43550371 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttg-attatgatttgatgt 43550469  T
Q  105 tgttatat 112  Q
    ||||||||    
T  43550470 tgttatat 43550477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15465266 - 15465149
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  15465266 tataatataatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttgttg-attatcatttgatat 15465168  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15465167 tgttatatcttgagatgtt 15465149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21837612 - 21837499
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  21837612 aatatgatttaatgatgatagtaatgtaataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 21837515  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  21837514 tatatcttgagatgtt 21837499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15207133 - 15206925
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgaaatattattt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  15207133 ctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttg-attatccttt 15207035  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    ||||||  ||| ||| || ||||| | | |  || |||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  15207034 gatatttatatgtctggatatgttat-tgtactgcctatgttgttgttgtctattaattaaactgcatgagttggtctaagatgaaagttgtcgttccaa 15206936  T
Q  199 attattggagt 209  Q
    | |||||||||    
T  15206935 agtattggagt 15206925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Original strand, 22110285 - 22110560
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 109  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||| |||| |||||| | | || ||||||  |   ||||||||||||||    
T  22110285 tatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatgatgttga-gatgctgttgatttgc-atttgatattgtta 22110382  T
Q  110 tatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgga 207  Q
    |||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  22110383 tatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgatgttccaaattattgga 22110482  T
Q  208 gttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
     |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22110483 tttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 22110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691754
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || ||||    
T  17691644 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgata-atcatttgatgttattat 17691742  T
Q  111 atcttgagatgtt 123  Q
    ||| |||||||||    
T  17691743 atc-tgagatgtt 17691754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 44494988 - 44494893
Alignment:
Q  14 atttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||    
T  44494988 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattattat 44494893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9533489 - 9533416
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 76  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9533489 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 23318650 - 23318845
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||  |  |||||||||||||    
T  23318650 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagttgttcaagttgttgttg--attgtcattgatattgttat 23318747  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    |||||||  || |   | || ||||||  |||||| ||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  23318748 atcttgaagtgat-actttgatgtctacgttgctgatgtatatt-aataagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgtcgttccaaagtattggagt 23318845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 8928355 - 8928474
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattattt 99  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||    
T  8928355 ctgatataagatgatt-gatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcattt 8928451  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8928452 gatattgttatatcttgagatgt 8928474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36527882 - 36527734
Alignment:
Q  58 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgat 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  36527882 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatatt-tatgtgttgcctatgttgctgttgcatattgat 36527785  T
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgga 207  Q
     |||||||| | || |||| ||| |||||| |||  ||||||| |||||||    
T  36527784 caagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtattgga 36527734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 34852596 - 34852701
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 114  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  34852596 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 34852693  T
Q  115 tgagatgt 122  Q
    ||||||||    
T  34852694 tgagatgt 34852701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Original strand, 20248741 - 20248803
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  20248741 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattatcatttgatactgttatatctt 20248803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 29172552 - 29172618
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29172552 ctgatataatataatttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29172618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 606345 - 606533
Alignment:
Q  98 ttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttc 195  Q
    |||||||||||||||| |||  || | ||| || || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||  |||||| | |||| |||||    
T  606345 ttgatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatgaatgatgatgttc 606444  T
Q  196 caaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||  ||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  606445 caaattgttggatttatataagaggtcgatgtt-ctaagatgctaatttgtagagtccatgcatactcatacattgttgggggcttgatg 606533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 14568899 - 14569007
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatat--ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatc 113  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | | | ||||||||||||||||    
T  14568899 ttgatgttgttgttaatgtgatatataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatgttgac-tgtcacttgatattgttatatc 14568997  T
Q  114 ttgagatgtt 123  Q
     |||| ||||    
T  14568998 atgagctgtt 14569007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Original strand, 3264997 - 3265094
Alignment:
Q  58 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgat 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||  |||||||    
T  3264997 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcatgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgttgttgcatattgat 3265094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 22307522 - 22307625
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  22307522 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 22307621  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  22307622 gatg 22307625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 31224843 - 31224928
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31224843 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 31224928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31415367 - 31415282
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31415367 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 31415282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 324011 - 323971
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  324011 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 323971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914062
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 11914062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5215031 - 5214928
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  5215031 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagtcgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 5214932  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  5214931 gatg 5214928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 15447886 - 15447989
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  15447886 tgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 15447985  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  15447986 gatg 15447989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40807109 - 40807006
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  40807109 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 40807010  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  40807009 gatg 40807006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40811924 - 40811821
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  40811924 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 40811825  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  40811824 gatg 40811821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13516514 - 13516404
Alignment:
Q  174 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttc 272  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||     
T  13516514 gtcaagttgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgagatgtccaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatacttatttaagttg 13516415  T
Q  273 ggggcttgatg 283  Q
     ||||||||||    
T  13516414 agggcttgatg 13516404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 41173258 - 41173343
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41173258 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 41173343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248276
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 17248276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340713
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24340713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642255
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 37642255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 5206542 - 5206645
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||  ||||  |||||  ||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  5206542 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttttttaagttgtaagacgttaagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 5206641  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  5206642 gatg 5206645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 228
Target Start/End: Original strand, 6805837 - 6805884
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  6805837 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgtt 6805884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11854746 - 11854715
Alignment:
Q  92 tattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11854746 tattatttgatattgttatatcttgagatgtt 11854715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 30175453 - 30175556
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  ||||| | |||||||||||| |||||||| | |||  ||||||    
T  30175453 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagattttgagtccatgcttactcatttaagttgagggctt 30175552  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  30175553 gatg 30175556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Original strand, 52466427 - 52466474
Alignment:
Q  175 tcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  52466427 tcaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 52466474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8899277 - 8899221
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8899277 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8899221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 17519788 - 17519829
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17519788 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 17519829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 17534650 - 17534691
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17534650 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 17534691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Original strand, 23318883 - 23318924
Alignment:
Q  245 ttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatgtcc 286  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  23318883 ttgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgtcc 23318924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 52523809 - 52523870
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 218  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52523809 taagctgcatgagtcggtctaagatgacagaagatgttccaaattattggatttatataaga 52523870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051190
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 68  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 2051190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9577579 - 9577539
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  9577579 tgttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatg 9577539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Original strand, 15932393 - 15932433
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgt 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15932393 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 15932433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Original strand, 50348982 - 50349074
Alignment:
Q  174 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50348982 gtcaagttttaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatattcatt 50349074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523718
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 68  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 52523718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070688
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  53070633 atgatttgatgttgttag-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 53070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22468 - 22193
Alignment:
Q  7 taatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatatt 105  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||    
T  22468 taatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgat-tattcttggatatt 22370  T
Q  106 gttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattatt 204  Q
    |||||||||  |||| ||   | || || |||| ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22369 gttatatct--agatttttattgtgctgcctatgttgttgtcgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattatt 22272  T
Q  205 ggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22271 ggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 22193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 283
Target Start/End: Original strand, 14051 - 14326
Alignment:
Q  7 taatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatatt 105  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||    
T  14051 taatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgat-tattcttggatatt 14149  T
Q  106 gttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattatt 204  Q
    |||||||||  |||| ||   | || || |||| ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14150 gttatatct--agatttttattgtgctgcctatgttgttgtcgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattatt 14247  T
Q  205 ggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14248 ggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 14326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 267849 - 267629
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | | |  ||||||  |   |||||||||||||    
T  267849 atatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttga-gatattgttgatttgc-atttgatattgtt 267752  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| |||||  ||  ||| ||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  267751 atatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgatgttccaaattatttg 267652  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttc 229  Q
    | |||||||||| ||||||||||    
T  267651 atttatataagaggtcgatgttc 267629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 271
Target Start/End: Original strand, 166627 - 166661
Alignment:
Q  237 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgtt 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  166627 gtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgtt 166661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7619 - 7362
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  7619 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 7520  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||||||  |||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  7519 tatatctt--gatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttttaaattattgg 7423  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 267  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7422 atttatataagaggtcgatgtttctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattca 7362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14738 - 14481
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  14738 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 14639  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||||||  |||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  14638 tatatctt--gatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttttaaattattgg 14542  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 267  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14541 atttatataagaggtcgatgtttctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattca 14481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 21533808 - 21534077
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21533808 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgat-tattatttgatattgttat 21533905  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    ||| | ||| ||| ||| |  ||  ||| ||| |||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21533906 atcctaagaagtt-tatgtactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatccaaattattggagt 21534004  T
Q  210 tatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21534005 tatataagatgtcgatgtt-ctaagatgtaagttgtcgagttcatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 21534077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28312708 - 28312503
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  28312708 gatataatatgatttgatgtttttagtaatgagatatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgat 28312610  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  28312609 attgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgtctatgttgatgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagt 28312511  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  28312510 attggagt 28312503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381098
Alignment:
Q  36 atatatttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgtt 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| || |    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatgttgat-tatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgat 16381248  T
Q  133 gtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcct 231  Q
    ||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||    
T  16381247 gtctatgctgctgtttattattgattaagttgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatccaaattattggaatcata--agatgtcgatgtttct 16381150  T
Q  232 aagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  16381149 aagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatttatgttgagggcttgatg 16381098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22124481 - 22124274
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  22124481 ctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttg 22124383  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  22124382 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgtcgtatattaattaagatgcatgagtcagtctatgatgtaagaagtcgttccaaa 22124284  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     | |||||||    
T  22124283 gtgttggagt 22124274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20958304 - 20958097
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  20958304 ctgatataatatgttttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 20958206  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||  || ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  20958205 atattgtcatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactggatgagtcggtctaagttgtaagatttcgttccaaa 20958107  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  20958106 gtattggagt 20958097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21043206 - 21043413
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||    
T  21043206 ctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-ttttattatcatttg 21043304  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcg-gtcaagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  21043305 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcgttttaagatgtaagatgtcgttccaaa 21043403  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  21043404 gtattggagt 21043413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14800730 - 14800518
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgata-gtaatgtgatatat----ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatatt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14800730 ctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatt 14800632  T
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  14800631 atttgatattgttatatcttgatatgtt-tatgtgctgcatatgttgctgatgtatattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgtt 14800533  T
Q  195 ccaaattattggagt 209  Q
    ||||| |||||||||    
T  14800532 ccaaagtattggagt 14800518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14809604 - 14809392
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgata-gtaatgtgatatat----ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatatt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14809604 ctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatt 14809506  T
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  14809505 atttgatattgttatatcttgatatgtt-tatgtgctgcatatgttgctgatgtatattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgtt 14809407  T
Q  195 ccaaattattggagt 209  Q
    ||||| |||||||||    
T  14809406 ccaaagtattggagt 14809392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 20437919 - 20438125
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  20437919 gatataatatgatttgatgctgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttg-attatcatttga 20438017  T
Q  102 tattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaat 200  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| || |||||     
T  20438018 tattgttatatcttgaggtgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagatgtcgtcccaaag 20438116  T
Q  201 tattggagt 209  Q
    |||||||||    
T  20438117 tattggagt 20438125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 52940802 - 52940967
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  52940802 ctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attattatttg 52940900  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatga 169  Q
     |||||||||||||||||||||  ||| || || |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||    
T  52940901 gtattgttatatcttgagatgt--tatgtgctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatga 52940967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Original strand, 50614048 - 50614309
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||    
T  50614048 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 50614146  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50614147 atatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgttgttccaaattattgg 50614246  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 268  Q
    | |||||| ||| || | |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50614247 atttatatgagaggttggtgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcat 50614309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Original strand, 50621876 - 50622137
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||    
T  50621876 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 50621974  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50621975 atatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgttgttccaaattattgg 50622074  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 268  Q
    | |||||| ||| || | |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50622075 atttatatgagaggttggtgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcat 50622137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47190796 - 47190590
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||    
T  47190796 ctgatataa-atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatgttgatttcctctttg 47190698  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    |||||||||||||| ||  |||| | | || || |||| ||| ||||||||||| |||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47190697 atattgttatatctgga-ttgttat-tgtgctgcctatgttgatgttgtctattaattaaactacatgagccggtctaagatgaaagatgttgttccaaa 47190600  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  47190599 gtattggagt 47190590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 13881310 - 13881452
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  13881310 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 13881408  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  13881409 tgttatatctcaagatgtt-tatgtgatgcctatgttgctgttgt 13881452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Original strand, 16368219 - 16368493
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| | |||||| | | || ||||||  | |   |||||||||||    
T  16368219 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatgttga-gatgttgttga--tttgcattgatattgtt 16368315  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| |||||| || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  16368316 atatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgatgttccaaattattgg 16368415  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16368416 atttatataagaggtcgatgtt-ctaagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 16368493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 165 - 283
Target Start/End: Original strand, 52954414 - 52954533
Alignment:
Q  165 catgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactca 263  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  52954414 catgagtcggtctaagaagtaagatgttgttccaaaatattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactca 52954513  T
Q  264 ttcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||| | |||||||||    
T  52954514 ttcatgttggaggcttgatg 52954533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 27653151 - 27653268
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  27653151 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 27653249  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27653250 tgttatatcttgagatgtt 27653268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Original strand, 41049968 - 41050244
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | | || ||||||  |   |||||||||||||    
T  41049968 atatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgttga-gatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 41050065  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  | || |||||  || |||| |||||||| || || | | |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  41050066 atatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgatgttccaaattattgg 41050165  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41050166 atttatataagaggtcgttgtttctaagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttaggggcttgatg 41050244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 48603641 - 48603527
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  48603641 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 48603543  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    || |||||||||||||    
T  48603542 tagatcttgagatgtt 48603527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 635914 - 636068
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  635914 aatatgatttgatgttgttagcaatgtgat-tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgt 636012  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttg 164  Q
    |||||||||| || || ||| || || |||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  636013 tatatcttgaaatatt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattgatcaagttg 636068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 45574735 - 45574819
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45574735 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttga 45574819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 50686801 - 50686525
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||| ||||||    
T  50686801 atatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgacattgtt 50686703  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  | || |||    || |||| |||| ||| || |||| | |||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50686702 atatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 50686603  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  50686602 atttatataagaggtcgatgtt-ctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 50686525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Original strand, 22130759 - 22130840
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 86  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22130759 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgt 22130840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 41781522 - 41781634
Alignment:
Q  9 atatgatttgat-gttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  41781522 atatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttg-attatcatttgatgttgt 41781618  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||| |||||    
T  41781619 tatatcttgaaatgtt 41781634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48520679 - 48520585
Alignment:
Q  29 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48520679 taatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttg-tttattatttgatattgttatatc-tgagatgttc 48520585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26065107 - 26064851
Alignment:
Q  29 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctata 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||  | |   ||| |||||||||||| |||  | || |||     
T  26065107 taatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttga--tttgcattggtattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  129 tgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatg 226  Q
    |  || |||| |||||||| || |||  | |||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatgaaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcaatg 26064910  T
Q  227 ttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26064909 tttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 26064851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 35261009 - 35261270
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| || || ||||| ||   |||||||  |   ||||||||    
T  35261009 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgag---atgttgatttgc-atttgata 35261104  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    |||||||||| ||   |||| |  ||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |  ||  |||||||||||    
T  35261105 ttgttatatcatgc--tgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaagaattatgttccaaatt 35261202  T
Q  202 attggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 268  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35261203 attggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcat 35261270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11945636 - 11945563
Alignment:
Q  17 tgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaa 90  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11945636 tgatgatgaaagtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttgctgttgaa 11945563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 20329182 - 20329118
Alignment:
Q  25 atagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttg 88  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20329182 atagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatgttg 20329118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Original strand, 21896189 - 21896464
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| || ||||| || || || |||  |   |||||||||||||    
T  21896189 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgc-atttgatattgtt 21896287  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| ||   |||| | |||  || |||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||    
T  21896288 atatcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaggaagatgttccaaattattgg 21896385  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| | |  |||| |||||| | | || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  21896386 atttatataagaggccattgtttctaagatgttgagttgttgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttgatg 21896464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32649892 - 32649787
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 114  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  32649892 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 32649795  T
Q  115 tgagatgt 122  Q
    ||||||||    
T  32649794 tgagatgt 32649787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372072
Alignment:
Q  53 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 16372072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Original strand, 21861650 - 21861728
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaaga 235  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  21861650 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaaga 21861728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16758843 - 16758563
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||  | || ||||| | | | |||||||||    
T  16758843 tataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgt-atttgatat 16758745  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgat-taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    ||||||||| |||  || | |  ||  || |||| ||||||||   |||| |  ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  16758744 tgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaatta 16758645  T
Q  203 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||| || |||| || |||| |||| |||||| | | ||  |||||||||||||||   |||||||  | |||||||||||    
T  16758644 ttggatttttatacgaggtcgttgtttctaagatgctgagtcgttgagtccatgcatttgcattcattgttggggcttgatg 16758563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 283
Target Start/End: Original strand, 20634487 - 20634616
Alignment:
Q  156 attaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtcca 253  Q
    ||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  ||||| |||||||| ||    
T  20634487 attaagttgcatatgttggtctaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgagtaca 20634586  T
Q  254 tgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  20634587 tgcatactcatttaagttgagggcttgatg 20634616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Original strand, 2332946 - 2333019
Alignment:
Q  48 atgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2332946 atgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 2333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29534729 - 29534624
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 114  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||  | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  29534729 ttgatgttgttaatgatgtggtatattttcaaatgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatatcgttatatct 29534632  T
Q  115 tgagatgt 122  Q
    ||||||||    
T  29534631 tgagatgt 29534624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 51274477 - 51274580
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||  ||||||    
T  51274477 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtctattgcatactcatttaagttgagggctt 51274576  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  51274577 gatg 51274580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 41227633 - 41227674
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41227633 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 41227674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 51326898 - 51326842
Alignment:
Q  92 tattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||    
T  51326898 tattatttgatgttgttatatcttgagatgtt-taggtgctgtctatgttgctgttgt 51326842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433137
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 433137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Original strand, 11809424 - 11809464
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgt 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11809424 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 11809464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20958058 - 20958022
Alignment:
Q  247 gagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20958058 gagtccatgcgtactcattcatgttgggggcttgatg 20958022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22124239 - 22124199
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  22124239 tgttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatg 22124199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 206453 - 206731
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||    
T  206453 tataacatgatttaatattgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttgttg-attattatttgatat 206550  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  || |||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||| || | || ||| || |||||||||||||||    
T  206551 tgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctatgaagtaggaagttgttccaaattat 206650  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  206651 tggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 206731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 4625 - 4902
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||  ||| || ||||||    
T  4625 tataatatgatttaatgatgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttgatgat-tatcatatgatat 4723  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 203  Q
    | |||||||| || |||||  || |||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4724 tattatatctggatatgtta-atgtgttgtatatgttgttgttgtctattaattcaactgcatgagtcggtccaagatgaaagatgttgttccaaattat 4822  T
Q  204 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4823 tggatttatctaagaggtcgatgtttctaagatgtaagttattgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 4902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30295
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |  | |||||||||| ||||||||    
T  30518 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttat 30419  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
     |||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30418 gtcttgagatgtt-tatgtgatgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatt 30320  T
Q  210 tatataagatgtcgatgttcctaag 234  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||    
T  30319 tatataagaggtcgatgtttctaag 30295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 843 - 636
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  843 ctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attattatttc 745  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  744 atgatgtgatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaa 646  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  645 gtattggagt 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 60643 - 60868
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||||  | |   ||||||    
T  60643 tataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga--tttgcattgata 60740  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||| |||||| |||| |||| | |||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  60741 ttggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaaagatgatgttccaaatt 60840  T
Q  202 attggagttatataagatgtcgatgttc 229  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  60841 attggatttatataagaggtcgatgttc 60868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36373 - 36169
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||    
T  36373 atataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgtcgttg-attatcatttgata 36275  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||    
T  36274 ttgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgtctttccaaagta 36176  T
Q  203 ttggagt 209  Q
    |||||||    
T  36175 ttggagt 36169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 10013 - 10130
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |    
T  10013 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatgttg-attatcatttgatgt 10111  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10112 tgttatatcttgagatgtt 10130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 1883
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  2090 ctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 1992  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||| || || ||||||| ||| || |||||    
T  1991 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcgttctaatatgtaaggtgtcgtcccaaa 1893  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  1892 gtattggagt 1883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18092 - 18299
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||    
T  18092 ctgatataatatgatttgatattgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtt-tattatcatttg 18190  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || || |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  18191 atattgttatatcttgagatatt-tatgtgctgcctatgttgttgttgtatattaattaagttgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgtcccaaa 18289  T
Q  200 ttattggagt 209  Q
     |||||||||    
T  18290 gtattggagt 18299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 97193 - 96919
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||    
T  97193 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttat 97095  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttg-tctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| ||||||||  | |||| | |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  97094 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggat 96995  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  96994 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 96919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 106471 - 106197
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||    
T  106471 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttat 106373  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttg-tctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| ||||||||  | |||| | |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  106372 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggat 106273  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106272 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 106197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 128904 - 129177
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||    
T  128904 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttat 129002  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| ||||||||   |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  129003 atcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatt 129102  T
Q  210 tatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  129103 tatataagaattcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 129177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 78510 - 78235
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| | |||||| | | || ||||||  | |   |||||||||||    
T  78510 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatgttga-gatgttgttga--tttgcattgatattgtt 78414  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgtt-ccaaattattg 205  Q
    ||||| |||  |||| |||||| || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | || | |||| |||||| ||||    
T  78413 atatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaatgaagatgtttccaaatgattg 78314  T
Q  206 gagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  78313 gatttatataagaggtcgatgttc-taagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 78235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Original strand, 53825 - 53884
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53825 tatatatgatgtttaagtagatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 53884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 142771 - 142571
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  142771 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 142672  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| | ||||    
T  142671 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagaggtcgttccaaagtgttgg 142573  T
Q  207 ag 208  Q
    ||    
T  142572 ag 142571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 169678 - 169795
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  169678 tataatatgatttaatatttataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 169776  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  169777 tgttatatcttgagatgtt 169795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 2602 - 2860
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| || |     
T  2602 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatgga 2701  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcg-gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| | |||| |||| |||||| |||||| ||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2702 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgactatgttgttcttgtatattaattaagctgcatgtgtcgatttaagttgtaagatgttgatccaaattattgg 2800  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2801 agtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 2860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 118
Target Start/End: Original strand, 7991 - 8100
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||| | |||||||||| |    
T  7991 atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttg-aatttcatttgatattat 8089  T
Q  108 tatatcttgag 118  Q
    |||||| ||||    
T  8090 tatatcatgag 8100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 927
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |    
T  1128 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattct 1029  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| || |||||||| | ||||    
T  1028 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatctaagaggtcgttccaaagtgttgg 930  T
Q  207 agt 209  Q
    |||    
T  929 agt 927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4061 - 3858
Alignment:
Q  4 atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  4061 atataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttg-attatcatttggt 3963  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| |    
T  3962 aatgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagatgtcgttccaaagt 3864  T
Q  202 attgga 207  Q
    ||||||    
T  3863 attgga 3858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 221132 - 221337
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||    
T  221132 ctgatataatttgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataaga-ctttaagttgatgttg-attatcatttg 221229  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| | |||||| | |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  221230 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgtagctgttatatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaa 221328  T
Q  200 ttattggag 208  Q
     ||||||||    
T  221329 gtattggag 221337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 225603 - 225536
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 68  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  225603 ctgatatatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 225536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 225456 - 225362
Alignment:
Q  191 tgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||||| | | || ||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  225456 tgttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagcattcattgttgggggcttgatg 225362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17698 - 17510
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  17698 ctgatataatatgatttgaagttgttggtaatgtgatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 17600  T
Q  101 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||  |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17599 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtactgcctaagttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgt 17510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 20139 - 20256
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | ||  |||||||||    
T  20139 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttgttg-attagcatttgatat 20237  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  20238 tgttaaatcttgagatgtt 20256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17457 - 17417
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  17457 tgttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatg 17417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3146 - 2945
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  3146 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 3047  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| || |  |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| | ||||    
T  3046 tatatcttgagatgtt-tatgtgctacctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagaggtcgttccaaagtgttgg 2948  T
Q  207 agt 209  Q
    |||    
T  2947 agt 2945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 7420 - 7634
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||||     
T  7420 aatatgattatatgctgttagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattga 7519  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7520 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtctcggtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgg 7618  T
Q  207 agttatataagatgtc 222  Q
    ||| |||| |||||||    
T  7619 agtcatatgagatgtc 7634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2802 - 2576
Alignment:
Q  58 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattga 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |  || |||| ||| || |||| |||| |    
T  2802 tgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgcttgtttattaa 2704  T
Q  157 ttaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatg 255  Q
     |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  2703 ctaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatg 2604  T
Q  256 catactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2603 catactcattcatgttggggacttgatg 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 16028 - 16308
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || || ||||||  ||  ||||||||    
T  16028 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttac-atttgata 16126  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    |||||||||| ||   |||| |  ||  |  |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||    
T  16127 ttgttatatcatgt--tgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaatt 16224  T
Q  202 attggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | | || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  16225 attggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttgagttgttgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttgatg 16308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13322 - 13259
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 68  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13322 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 13259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 2886 - 2849
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 42  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2886 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 9648 - 9851
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  9648 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgatgttg-attatcatttgat 9745  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||| |    
T  9746 attgttatatcttgagatg-tctatgtgctgcctatgttgttgttgtaaattgattaagctgcatgtgacggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagt 9843  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  9844 attggagt 9851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 75763 - 76036
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  75763 atgatttgatgttgttagtaatgtgataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgttat 75861  T
Q  111 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 208  Q
    ||||||||||||| ||  || || |||  ||||||||    |||| || ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  75862 atcttgagatgtt-tacgtgctgcctacgttgctgttaaaatattaatcaagctgcatgtgttggtctaagatgtaagatgttgttccaaaatgttggag 75960  T
Q  209 ttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||   |||| ||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||    
T  75961 tcatataagatgtcgatgttgtctaagttataagatgttgagtccatgcatactgatttaagttgagggcttgatg 76036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 133110 - 132906
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  133110 gatataatatgatttgatgttgttagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgat 133012  T
Q  103 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| ||| || |||  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||| |    
T  133011 attgttatatcttgaaatgtt-tatgtgctgcatatgttgatgatgtaaattgattaagctgcatgtgacggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagt 132914  T
Q  202 attggagt 209  Q
    ||||||||    
T  132913 attggagt 132906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29390 - 29325
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 73  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29390 aatatgatttactgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagtatttaagatg 29325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 133856 - 133892
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatat 39  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  133856 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 133892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 609 - 492
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  609 tataatataatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgtt-aattatcatttgatat 511  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  510 tgttatatcttgagatgtt 492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 110847 - 110728
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  110847 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgat 110749  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  110748 attgttatatcttgagatgtt 110728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 145900 - 145815
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  |||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  145900 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaaattgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 145815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 126144 - 126030
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  126144 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 126046  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  126045 tatatcttgagatgtt 126030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Original strand, 38208 - 38283
Alignment:
Q  135 ctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38208 ctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaagtattggagt 38283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 125727 - 125681
Alignment:
Q  237 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  125727 gtaagttgttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatg 125681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2779 - 2605
Alignment:
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgt 193  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||  || |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2779 atttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgt 2680  T
Q  194 tccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcat 268  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2679 tccaaaatattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgcaagttgttgagcccatgcatactcattcat 2605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 24526 - 24643
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  24526 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 24624  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  24625 tgttatatcttgaaatgtt 24643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 105272 - 105155
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||    
T  105272 tataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatgtt-aattatcatttgatat 105174  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  105173 tgttatatcttgagatgtt 105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 6091 - 6230
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  6091 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 6189  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  6190 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 902
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  1041 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 943  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  942 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgtctatgttgctgttgt 902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21355 - 21216
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  21355 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 21257  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  21256 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 21216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 351 - 209
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  351 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 253  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||    
T  252 tgttatatcttgatatgtt-tacgtgttgcctatgttgctgttgt 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20939 - 20825
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  20939 aatatgatttgatgttaatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 20841  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  20840 tatatcttgagatgtt 20825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Original strand, 7544 - 7646
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  7544 tgtaagatgtagttccaaagtattggaatcatataagttttcgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 7643  T
Q  280 gat 282  Q
    |||    
T  7644 gat 7646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8220 - 8064
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  8220 aatatgatttgatgtcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 8122  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgca 166  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8121 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcatatgttgctgttgcatattgataaagttgca 8064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 1803 - 1920
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||      
T  1803 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatga 1901  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1902 tgttatatcttgagatgtt 1920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25290 - 25021
Alignment:
Q  13 gatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatat 112  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  | |   ||||||| |||||||    
T  25290 gatttgatgttg-taataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttga--tttgcattgatatcgttatat 25194  T
Q  113 cttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagtt 210  Q
    | |||| |||| |||||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||| ||    
T  25193 catgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaggttgttccaatttattggattt 25094  T
Q  211 atataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||  ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25093 ataatagaggtcgatgttc-taagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 25021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 729 - 587
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||  || |  ||||||||    
T  729 tataatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattg--atttgctttgatat 632  T
Q  105 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    ||||||||| |||  |||| ||| | |||||||| ||| ||||||    
T  631 tgttatatcatgaactgttttatgtattgtctatgttgttgttgt 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6380 - 6330
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtga 60  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6380 atatgatttggtgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcattatgtga 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39444 - 39327
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  39444 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 39346  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39345 tgttatatcttgagatgtt 39327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Original strand, 19817 - 20093
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| || |||| | | | || ||||||| |   |||||||||||||    
T  19817 atatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgagttatttatgatgctga-gatgttgttgaattgc-atttgatattgtt 19914  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  |||| |||||  || |||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19915 atatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgatgttccaaattattgg 20014  T
Q  207 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  20015 atttatataagaggtcgatgtttctaagaggttaagttgttgagtccatgcatacttattcattgttgggggcttgatg 20093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 283
Target Start/End: Original strand, 2498 - 2619
Alignment:
Q  163 tgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatact 261  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2498 tgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgcatact 2597  T
Q  262 cattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  2598 cattcatgttgggggcttgatg 2619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 2355 - 2432
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2355 tataatatgatttaatgttgatagtaatttaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttg 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15920 - 15817
Alignment:
Q  19 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgag 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15920 atgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgag 15822  T
Q  119 atgtt 123  Q
    |||||    
T  15821 atgtt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17765 - 17648
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  17765 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 17667  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17666 tgttatatcttgagatgtt 17648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31315 - 31198
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||    
T  31315 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtt-tattatcatttgatat 31217  T
Q  105 tgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31216 tgttatatcttgagatgtt 31198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 375 - 269
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |    
T  375 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatgttg-attatgatttgatgt 277  T
Q  105 tgttatat 112  Q
    ||||||||    
T  276 tgttatat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6800 - 6686
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  6800 aatatgatttgaggttgatggtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 6702  T
Q  108 tatatcttgagatgtt 123  Q
    ||||||||||||||||    
T  6701 tatatcttgagatgtt 6686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 67452 - 67342
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  67452 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 67354  T
Q  105 tgttatatcttg 116  Q
    ||||||||||||    
T  67353 tgttatatcttg 67342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10344 - 10152
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  10344 ttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgatg-attattatttgatattgttacatctt 10246  T
Q  116 gagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    |||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||  | | |||||| | |||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  10245 gagatgtt-tatgtgctgcttatgttgctgttgtaaaataattaagctccatgtgtcagtctaagatgtaatatgtcgttccaaagtgttggagt 10152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19571 - 19777
Alignment:
Q  1 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattattt 99  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| |||    
T  19571 ctgatattatgtgatttgatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatgttg-attattgttt 19669  T
Q  100 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 198  Q
    || |||||||||| |||||||||| | | || |||| || |||| | ||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||    
T  19670 gacattgttatat-ttgagatgtt-tctgtgctgtc-atgttgcaggtgtatattaaataagatgcatgagtcggtctaagatgaatgatgtcgttccaa 19766  T
Q  199 attattggagt 209  Q
    | |||||||||    
T  19767 agtattggagt 19777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15284
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 219 - 135
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  219 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttga 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12327 - 12221
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  12327 tataatatggtttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatgttg-attatgatttgatgt 12229  T
Q  105 tgttatat 112  Q
    ||||||||    
T  12228 tgttatat 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12241 - 12185
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12241 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11316 - 11052
Alignment:
Q  26 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttct 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11316 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattgttatatcctgagatgtt-t 11220  T
Q  126 atatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcg---------gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataa 216  Q
    || || || || | |||||||||| |||  |||||||||||   ||||         || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11219 atgtgctgcctgtgttgctgttgtatatctattaagttgcaaatgtcgatctaagttgtgaagttgtaagatgttgttccaaaatattggagtcatataa 11120  T
Q  217 gatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||  | |||  ||| | ||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  11119 gatgtcgatgttgtccaagttgtaggatgtttggtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatg 11052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22416 - 22152
Alignment:
Q  26 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttct 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22416 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattgttatatcctgagatgtt-t 22320  T
Q  126 atatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcg---------gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataa 216  Q
    || || || || | |||||||||| |||  |||||||||||   ||||         || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22319 atgtgctgcctgtgttgctgttgtatatctattaagttgcaaatgtcgatctaagttgtgaagttgtaagatgttgttccaaaatattggagtcatataa 22220  T
Q  217 gatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||  | |||  ||||| | || || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  22219 gatgtcgatgttgtccaagttgtaagatatttaggccatgcatactcatttaagttgggggcttgatg 22152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 103711 - 103839
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 255  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  103711 taagctgcattagtcggtctaagttgaaagaggatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgttgctaagatgttaagttgttgagtccatg 103810  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  103811 catactcattcattgttgggggcttgatg 103839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 120197 - 120058
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||    
T  120197 aatacgatttgatgttgatgataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagttattgttg-attatcatttgatattgt 120099  T
Q  108 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||    
T  120098 tatatcttgagatgtt-tacgtgttgcctatgttgctgttgt 120058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 117133 - 117093
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  117133 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 117093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32545 - 32446
Alignment:
Q  186 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  32545 gatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagcattcattgttgggggcttgatg 32446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 3256 - 3340
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 89  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3256 tataatatcatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttga 3340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 101
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||    
T  209 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatgatg-tttatcatttgatattgttat 111  T
Q  111 atcttgagat 120  Q
    ||||||||||    
T  110 atcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 1
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgc 51  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  41 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 480
Alignment:
Q  98 ttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttc 195  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||| || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |  ||| |||||    
T  652 ttgatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaattatgatgttc 553  T
Q  196 caaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 268  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  552 caaattattggatttatataagaggtcgatgtt-ctaagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcat 480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10666 - 10464
Alignment:
Q  5 tataatatgatttga-tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
T  10666 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatg 10568  T
Q  104 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 202  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||  ||||||| |||||||| | || |||| ||| |||||| |||  ||||||| ||    
T  10567 ttgttacatctagagatgtt-tatgtgttgcctatgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagta 10469  T
Q  203 ttgga 207  Q
    |||||    
T  10468 ttgga 10464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 82343 - 82235
Alignment:
Q  7 taatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcat----tatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  82343 taatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgat 82245  T
Q  103 attgttatat 112  Q
     |||||||||    
T  82244 gttgttatat 82235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 149
Target Start/End: Original strand, 80435 - 80487
Alignment:
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||    
T  80435 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgtcgcctatgttgctgttgt 80487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Original strand, 113610 - 113650
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  113610 tgttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatg 113650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 2419 - 2493
Alignment:
Q  3 gatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 77  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2419 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 1894 - 1785
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  1894 tataatatagtttgatgttgttaatgatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatgttg-attatcatttgata 1796  T
Q  104 ttgttatatct 114  Q
    |||||||||||    
T  1795 ttgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15111
Alignment:
Q  41 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29851 - 29723
Alignment:
Q  19 atgttgatagtaatgtgatatattt-gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttga 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29851 atgttgatagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatctgga 29753  T
Q  118 gatgttctatatgttgtctatcttgctgttg 148  Q
     ||||| | | |||||||||| ||| |||||    
T  29752 tatgttat-tgtgttgtctatgttgttgttg 29723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3385 - 3246
Alignment:
Q  69 agatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatg 168  Q
    |||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  3385 agatgtttcagttgatgttgat-tgtcatttgatattgttatatcttgagatatt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatg 3288  T
Q  169 agtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
     ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  3287 tgtcggtctaagatgtaagatgtcgtcccaaagtattggagt 3246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5575 - 5490
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5575 tgtaagatgttgttccaaagtatttgagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 5490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3787 - 3703
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 89  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3787 tataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagtgaatgttga 3703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 16861 - 17048
Alignment:
Q  19 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgag 118  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  |  ||||||||||||||||||||     
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttg--attgtcattgatattgttatatcttgaa 16958  T
Q  119 atgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
     || | | | || || || | |||||| ||| |||| | |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  16959 gtgatat-tttgctgcctctgttgctgatgtatatt-aataagctgcatgagccggtctaagatgaaagatgtcgttccaaagtattggagt 17048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26117
Alignment:
Q  14 atttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatc 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  |  ||||||||||||||||    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttg--attgtccttgatattgttatatc 26113  T
Q  114 ttga 117  Q
    ||||    
T  26114 ttga 26117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 115
Target Start/End: Original strand, 589 - 699
Alignment:
Q  5 tataatatgatttga-tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 103  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
T  589 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatg 687  T
Q  104 ttgttatatctt 115  Q
    ||||||||||||    
T  688 ttgttatatctt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6399
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||| | |   ||||||||||||     
T  6215 atatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttg-atttgcatttgatattgtc 6313  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttg 192  Q
    ||||| |||| |||| |||||  || |||| |||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6314 atatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttg 6399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 13836 - 13890
Alignment:
Q  230 ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13836 ctaagatgaaagatgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatg 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 1878 - 2006
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 255  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||| | |||| |||||||||||||    
T  1878 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgttgagtccatg 1977  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  1978 cacactcattcattgttgggggcttgatg 2006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 6566 - 6669
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  6566 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagttcatgcatactcatttaagttgagggctt 6665  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  6666 gatg 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1796
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 75  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||| ||||||    
T  1730 atatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatgtt 1796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 27829 - 27957
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 255  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  27829 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatg 27928  T
Q  256 catactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  27929 cattcgcattcattgttgggggcttgatg 27957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 27677 - 27727
Alignment:
Q  5 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 55  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27677 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcatta 27727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38506 - 38339
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||| |||   ||||||||||||     
T  38506 atatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttg-aattgcatttgatattgtc 38408  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc 176  Q
    ||||| |||| |||| |||||  || |||| |||||| ||||  ||| | |||| ||||||||||||||    
T  38407 atatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 85739 - 85620
Alignment:
Q  4 atataatatgatttga-tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 102  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  85739 atataatatgattttaatgtcgatattaatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatgttg-attattatttgat 85641  T
Q  103 attgttatatcttgagatgtt 123  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  85640 gttgttatatcttgaggtgtt 85620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 13430 - 13502
Alignment:
Q  8 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 82  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13430 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttg--tatgcattatctgaattatataagatgtttaagttg 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7884
Alignment:
Q  31 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatat 129  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  8000 atgtaatatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttg-cttattatttgatattgttatatc-tgagatgtt-tatgt 7904  T
Q  130 gttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||| |||| ||| ||||||    
T  7903 gttgcctatgttgttgttgt 7884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7610 - 7570
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7610 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 7570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57807
Alignment:
Q  14 atttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatc 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||  ||  |  ||||||||||||||||    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaaatgttcaagttgttgttg--attgtcattgatattgttatatc 57902  T
Q  114 ttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 209  Q
    ||||  || | | | || || |||| |||||| ||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||  ||||||||    
T  57901 ttgaagtgatgt-tttgctgcctatgttgctgatgtatatt-aataagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgtcgttccaaagcattggagt 57807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6203 - 6116
Alignment:
Q  29 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttga 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6203 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgaggatg-tttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 146366 - 146261
Alignment:
Q  16 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 114  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  146366 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 146269  T
Q  115 tgagatgt 122  Q
    ||||||||    
T  146268 tgagatgt 146261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Original strand, 136493 - 136592
Alignment:
Q  186 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| | | || ||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  136493 gatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgaggtttctaagatgttgagttgtcgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttgatg 136592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Original strand, 145201 - 145300
Alignment:
Q  186 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttgatg 283  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| | | || ||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  145201 gatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgaggtttctaagatgttgagttgtcgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttgatg 145300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11335 - 11225
Alignment:
Q  174 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttc 272  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  | | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11335 gtcaagttgtaagttgttgatccaaagtattggagtcatataagatgtcgatgatgtccatgttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttg 11236  T
Q  273 ggggcttgatg 283  Q
     ||||||||||    
T  11235 agggcttgatg 11225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48493 - 48403
Alignment:
Q  31 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 122  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48493 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 48403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 4680 - 4783
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  4680 tgtaagatgttgttccaaagtattggattcatataagttgtggatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 4779  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  4780 gatg 4783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 267
Target Start/End: Original strand, 14726 - 14813
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||  |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14726 tgtaagatgttgttccaaagtattggattcatataaattgtcgatgttgtctaagttgtaagttgttgagaccatgcatactcattca 14813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12602 - 12481
Alignment:
Q  165 catgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactc 262  Q
    |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||| | |||| |||||||||||||||| | |    
T  12602 catgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgttgagtccatgcattcgc 12503  T
Q  263 attcat-gttcggggcttgatg 283  Q
    ||| || ||| |||||||||||    
T  12502 atttatcgttgggggcttgatg 12481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 55030 - 54945
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55030 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttatccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 54945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39275 - 39190
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39275 tgtaagatgttgttctaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 39190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 634
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1050 - 970
Alignment:
Q  188 tgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 267  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1050 tgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattca 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1338
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 1338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7506 - 7466
Alignment:
Q  243 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7506 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatg 7466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 15072
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 15072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20816 - 20724
Alignment:
Q  174 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20816 gtcaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataaattgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccgtgcatactcatt 20724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Original strand, 18170 - 18250
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 89  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  18170 atatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttga 18250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 283
Target Start/End: Original strand, 53649 - 53757
Alignment:
Q  177 aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcgg 274  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||| | | || |||||||||||||||| | |||||| |||| ||    
T  53649 aagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttataagatgatgagttgttgagtccatgcattcacattcattgttggg 53748  T
Q  275 ggcttgatg 283  Q
    |||||||||    
T  53749 ggcttgatg 53757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 68
Target Start/End: Original strand, 53482 - 53540
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 68  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  53482 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 53540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 60418 - 60334
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 264  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||| ||| || |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  60418 tgtaagttgttattccaagatattggaggtatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcat 60334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 9697 - 9800
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  9697 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttaagttgagggctt 9796  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  9797 gatg 9800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 11700 - 11803
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||  | |||  ||||| || ||||||||| |||||||||| | |||  ||||||    
T  11700 tgtaagatgttgttccaaagtattggaatcatataagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgctgagtccatacatactcatttaagttgagggctt 11799  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  11800 gatg 11803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14303 - 14200
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||    
T  14303 tgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgagggctt 14204  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  14203 gatg 14200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 149
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4340
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgatatgtt-tacgtgttgcctattttgctgttgt 4340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15417 - 15375
Alignment:
Q  237 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15417 gtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggctt 15375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1073 - 1012
Alignment:
Q  158 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 218  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1073 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattggacttatataaga 1012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 127
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 76  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  192 atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1529 - 1488
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1529 tgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtc 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10858 - 10773
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10858 tgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgaggtgtataagttattaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 10773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11595
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Original strand, 6889 - 6948
Alignment:
Q  63 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6889 tatatatgatgtttaagttgatgttg-agtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtt 6948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18017
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38246
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 38246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 8006 - 8215
Alignment:
Q  9 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 108  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||   | || ||||||  | | |||||||||||||    
T  8006 atatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgttgt-gatgttgttgatttgt-atttgatattgtt 8103  T
Q  109 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 206  Q
    ||||| |||  || | | |||  || |||| |||||||| || | || | |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  8104 atatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattgg 8203  T
Q  207 agttatataaga 218  Q
    | |||| |||||    
T  8204 atttatttaaga 8215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 56835 - 56792
Alignment:
Q  237 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  56835 gtaagttgttgagtccatgcagactcattcatgttgggggcttg 56792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 76864 - 76761
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  76864 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtcaaagttgtttaagttgtaagacgttgagtgcatgcatactcatttaagttgagggctt 76765  T
Q  280 gatg 283  Q
    ||||    
T  76764 gatg 76761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 446671 - 446608
Alignment:
Q  19 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 82  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  446671 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 446608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 446502 - 446417
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 265  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  446502 tgtaaaatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttaattccatgcatactcatt 446417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9877
Alignment:
Q  13 gatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9930 gatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24322 - 24221
Alignment:
Q  183 taagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 281  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||  ||||| || |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||    
T  24322 taagttgtagttctaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttga 24223  T
Q  282 tg 283  Q
    ||    
T  24222 tg 24221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 1259 - 1315
Alignment:
Q  10 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1259 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 265
Target Start/End: Original strand, 19334 - 19419
Alignment:
Q  182 gtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19334 gtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatt 19419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 149
Target Start/End: Original strand, 58819 - 58871
Alignment:
Q  96 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||    
T  58819 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgtcgcctatgttgctgttgt 58871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 6932 - 6987
Alignment:
Q  67 taagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6932 taagttgtttaagttgatgttgat-tatcatttaatgttgttatatcttgagatgtt 6987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Original strand, 8325 - 8365
Alignment:
Q  181 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgt 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8325 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 8365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79319
Alignment:
Q  11 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 67  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  79264 atgatttgatgttgtta-tattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatat 79319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University