View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12701_high_24 (Length: 250)

Name: NF12701_high_24
Description: NF12701
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12701_high_24
NF12701_high_24
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (1-239)||(3618801-3619039)
chr7 (1-239)||(29101838-29102076)
chr7 (1-239)||(29115983-29116221)
chr7 (1-231)||(29072883-29073113)
chr7 (3-230)||(29058307-29058534)
chr7 (3-230)||(29071535-29071762)
chr7 (3-230)||(29111019-29111246)
chr7 (3-230)||(3617614-3617841)
chr7 (3-238)||(28956604-28956839)
chr7 (3-230)||(29078268-29078495)
chr7 (3-230)||(29069073-29069300)
chr7 (17-218)||(29098135-29098336)
chr7 (112-227)||(29113378-29113493)
chr7 (4-154)||(29066632-29066782)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (1-239)||(11850055-11850293)
chr4 (3-230)||(11851410-11851637)
chr4 (3-230)||(11854124-11854351)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3619039 - 3618801
Alignment:
Q  1 ttgttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3619039 ttgttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccgcctccatctccacctttttgaa 3618940  T
Q  101 aactgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3618939 aactgttgagcgtgagatatgctttagtgtgagtagacgctgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcatt 3618840  T
Q  201 ctcctggttgcattgtccggaaggagctttttctccttt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3618839 ctcctggttgcattgtccggaaggagctttttctccttt 3618801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29102076 - 29101838
Alignment:
Q  1 ttgttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29102076 ttgttgaaccatccagtagaaagtgcaacaaccggggtgtcatcggaatgatattgattatcacacgctgaaggtccacctccatctccaccttcttgaa 29101977  T
Q  101 aactgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcatt 200  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29101976 aactattgagcgtgagatacgctttagtgtgagtagatactgatggtgagcatttatatgttgtgtacatttttccctgtacacaacaatcagagtcatt 29101877  T
Q  201 ctcctggttgcattgtccggaaggagctttttctccttt 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29101876 ctcctggttacattgtccggaaggagttttttctccttt 29101838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29116221 - 29115983
Alignment:
Q  1 ttgttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  29116221 ttgttgaaccatccagtagaaagtgcaacaaccggggtgtcgtcggaatgatattgattatcacacgctgaaggaccacctccatctccaccttcttcaa 29116122  T
Q  101 aactgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcatt 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  29116121 aactattgagcgtgagatatgctttagtgtgagtagatactgatggtgagcatttataagttgtgtacatttttccttgcacacaacaatctgaatcatt 29116022  T
Q  201 ctcctggttgcattgtccggaaggagctttttctccttt 239  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29116021 ttcctggttgcattgtccggaaggagctttttctccttt 29115983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29073113 - 29072883
Alignment:
Q  1 ttgttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaa 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29073113 ttgttgaaccatccactagaaagtgcaacaactggagtgtcatcagaatgatattgattatcacacgctgaaggaccacctccatctccaccttcttgaa 29073014  T
Q  101 aactgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcatt 200  Q
    |||| || ||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29073013 aactatttagcgtgataaattctttagtgtgagtagatactgatggtgaacatttataagttgtgtacatttttccctgtacacaacaatcagagtcatt 29072914  T
Q  201 ctcctggttgcattgtccggaaggagctttt 231  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29072913 ctcctgattacattgtccggaaggagctttt 29072883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 29058307 - 29058534
Alignment:
Q  3 gttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29058307 gttgaaccatcctgtggaaagtgcaacgactggagtgtcatcagaatgatactgattatcacatgctgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 29058406  T
Q  103 ctgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattct 202  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||| |||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29058407 ctgttaagtgtgaggtatgctttagtatgagcagacaccgatggtgaacattcataagttgtgtacatctttccttgtacacaacaatcagagtcattct 29058506  T
Q  203 cctggttgcattgtccggaaggagcttt 230  Q
    | | |||||||||||| || ||||||||    
T  29058507 ctttgttgcattgtccagatggagcttt 29058534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 29071535 - 29071762
Alignment:
Q  3 gttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  29071535 gttgaaccatccggtggaaagtgcaacaactggagtgtcatcagaatgatattgattatcacacgctgaaggtccgcctccatctccacctttctggaaa 29071634  T
Q  103 ctgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattct 202  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29071635 ctgttaagtgtgaggtatgccttagtatgagtagacactgatggtgaacattcataagttgtgtacatctttccttgtacacaacaatcagagtcattct 29071734  T
Q  203 cctggttgcattgtccggaaggagcttt 230  Q
    | | |||||||||||| || ||||||||    
T  29071735 ctttgttgcattgtcccgatggagcttt 29071762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 29111019 - 29111246
Alignment:
Q  3 gttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29111019 gttgaaccatccggtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatgatactgcttgtcacattctgaaggaccacctccatctccacccttttgaaaa 29111118  T
Q  103 ctgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattct 202  Q
    || || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29111119 ctattaagagtgagatatgctttggtgtgagtggacactgatggtgaacatacataagttgtgtacatttttccttgtacgcaacaatcagaatcattct 29111218  T
Q  203 cctggttgcattgtccggaaggagcttt 230  Q
    | || ||||||| ||| | |||||||||    
T  29111219 cttgattgcattttcctggaggagcttt 29111246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 3617614 - 3617841
Alignment:
Q  3 gttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3617614 gttgaaccatcctgtggaaagtgcaacgactggtgtatcatcagaatgatactgattatcacatgctgaagggccacctccatctccacctttctgaaaa 3617713  T
Q  103 ctgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattct 202  Q
    || || || ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617714 ctattaagtgtgaggtatgccttagtatgagtagatactgatggtgaacattcataagttgtgtacatctttccttgtacacaacaatcagagtcattct 3617813  T
Q  203 cctggttgcattgtccggaaggagcttt 230  Q
    | | ||| |||||||| || ||||||||    
T  3617814 ctttgttacattgtccagatggagcttt 3617841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28956839 - 28956604
Alignment:
Q  3 gttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28956839 gttgaaccatccggtggaaagtgcaacaactggagtgtcatcagaatggtattgattatcacattctgaagggccacctccatcaccaccattttgaaaa 28956740  T
Q  103 ctgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattct 202  Q
    || || || ||||||||||  || |||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  28956739 ctattaagagtgagatatgccttggtgtaagtagacactgctggagaacattcataagttgtgtacattttttcttgtacacaacaatcagaatcgttct 28956640  T
Q  203 cctggttgcattgtccggaaggagctttttctcctt 238  Q
    | || || |||||||| | |||||| |||| |||||    
T  28956639 cttgattacattgtcctggaggagcattttttcctt 28956604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 29078268 - 29078495
Alignment:
Q  3 gttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| || |||||||||||||| |||| ||||    
T  29078268 gttgaaccatccggtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatctgaatgatattgcttgtcacattctgaaggaccgcctccatctccacccttttcaaaa 29078367  T
Q  103 ctgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattct 202  Q
    || || || |||||||||| ||| |||||||| |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29078368 ctattaagagtgagatatgctttggtgtgagtggacacatatggtgaacatacataagttgtgtacatttttccttctacacaacaatcagaatcattct 29078467  T
Q  203 cctggttgcattgtccggaaggagcttt 230  Q
    | || ||||||||||| | |||||||||    
T  29078468 cttgattgcattgtcctggaggagcttt 29078495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 29069073 - 29069300
Alignment:
Q  3 gttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 102  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29069073 gttgaaccatccggttgagagtgcaacaacgggagtgtcatcggaatgatactgcttgtcacattctgaaggaccacctccatctccacccttttcaaaa 29069172  T
Q  103 ctgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattct 202  Q
    || || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29069173 ctattaagagtgagatatgcttttgtgtgagtagacactgatggagaacatacatatgttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagaatcgttct 29069272  T
Q  203 cctggttgcattgtccggaaggagcttt 230  Q
    | || || |||||||| | |||||||||    
T  29069273 cttgattacattgtcctggaggagcttt 29069300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29098336 - 29098135
Alignment:
Q  17 tggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaactgttgagcgtgag 116  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||    
T  29098336 tggaaagtgcaacaactgaagtatcgtcagaatgatattgattatcacaatacgaaggaccaccaccatcaccacctttttgaaaactattaagtatgag 29098237  T
Q  117 atatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattctcctggttgcattgt 216  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  29098236 atatgctttagtgtaagtagacactgatggcgaacattcataagttgtatacatttgtccttgtacacaacaatcagaatcattctcttgattgcattgt 29098137  T
Q  217 cc 218  Q
    ||    
T  29098136 cc 29098135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29113493 - 29113378
Alignment:
Q  112 gtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattctcctggttgc 211  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  29113493 gtgagatatgctttagtgtaagtagatactgatggcgaacattcataagttgtacacatttgtccttgtacccaacaatcagaatcattctcttgattgc 29113394  T
Q  212 attgtccggaaggagc 227  Q
    ||||| | ||||||||    
T  29113393 attgtgcagaaggagc 29113378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29066782 - 29066632
Alignment:
Q  4 ttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||  || | ||| ||||| |  ||||||||    ||||||||||||||||  ||||    
T  29066782 ttgaaccatccagtggaaagtgccaccacaggcgtatcatcggaataatacttgttgtcacaagttgaagggccgttaccatctccacctttttcgaaac 29066683  T
Q  104 tgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacatt 154  Q
    |||| || ||||||||||  || |||||| |||| || | |||||||||||    
T  29066682 tgttaagagtgagatatgccttcgtgtgactagataccggcggtgaacatt 29066632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 11850055 - 11850293
Alignment:
Q  1 ttgttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11850055 ttgttgaaccatccagtagaaagtgcaacaactggggtgtcatcagaatgatattgattatcacacgctgaaggaccacctccatctccaccttcttgaa 11850154  T
Q  101 aactgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcatt 200  Q
    |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11850155 aactattgagcgtgagaaacgctttagtgtgagtagatactgatggtgaacatttataagttgtgtacatttttccctgtacacaacaatcaaagtcatt 11850254  T
Q  201 ctcctggttgcattgtccggaaggagctttttctccttt 239  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11850255 ctcctggttacattgtcttgaaggagctttttctccttt 11850293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11851637 - 11851410
Alignment:
Q  3 gttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  11851637 gttgaaccatccggtggaaagtgcaacaactggagtgtcatcagaatgatattgattatcacacgctgaaggtccgcctccatctccacctttctggaaa 11851538  T
Q  103 ctgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattct 202  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11851537 ctgttaagtgtgaggtatgccttagtatgagtagacactgatggtgaacattcataagttgtgtacatctttccttgtacacaacaatcagagtcattct 11851438  T
Q  203 cctggttgcattgtccggaaggagcttt 230  Q
    | | |||||||||||| || ||||||||    
T  11851437 ctttgttgcattgtcccgatggagcttt 11851410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11854351 - 11854124
Alignment:
Q  3 gttgaaccatccagtggaaagtgcaacaacaggagtgtcatcagaatggtattggttatcacatgccgaagggccacctccatctccacctttttgaaaa 102  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11854351 gttgaaccatccggttgagagtgcaacaacgggagtgtcatcggaatgatactgcttgtcacattctgaaggaccacctccatctccacccttttcaaaa 11854252  T
Q  103 ctgttgagcgtgagatatgttttagtgtgagtagacactgacggtgaacattgataagttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagagtcattct 202  Q
    || || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11854251 ctattaagagtgagatatgcttttgtgtgagtagacactgatggagaacatacatatgttgtgtacatttttccttgtacacaacaatcagaatcgttct 11854152  T
Q  203 cctggttgcattgtccggaaggagcttt 230  Q
    | || ||||||||||| | |||||||||    
T  11854151 cttgattgcattgtcctggaggagcttt 11854124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University