View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1270_low_75 (Length: 257)

Name: NF1270_low_75
Description: NF1270
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1270_low_75
NF1270_low_75
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (1-188)||(29518915-29519102)
chr6 (1-187)||(29518498-29518684)
chr6 (1-187)||(32741174-32741360)
chr6 (1-166)||(2378121-2378286)
chr6 (1-154)||(3409254-3409407)
chr6 (12-187)||(16454913-16455088)
chr6 (1-164)||(35210199-35210362)
chr6 (8-187)||(2578420-2578598)
chr6 (4-174)||(14748332-14748498)
chr6 (1-165)||(3409655-3409819)
chr6 (8-187)||(16454577-16454756)
chr6 (5-187)||(1846747-1846928)
chr6 (6-164)||(2579872-2580030)
chr6 (1-175)||(3415453-3415629)
chr6 (1-165)||(3058221-3058385)
chr6 (8-166)||(2377756-2377914)
chr6 (1-154)||(26544044-26544197)
chr6 (12-187)||(2843560-2843736)
chr6 (8-155)||(16107680-16107827)
chr6 (6-175)||(10074352-10074521)
chr6 (6-177)||(593694-593867)
chr6 (6-164)||(10073991-10074149)
chr6 (1-164)||(1127355-1127518)
chr6 (7-180)||(2578819-2578991)
chr6 (8-185)||(5832007-5832182)
chr6 (6-188)||(10073592-10073772)
chr6 (11-177)||(2579479-2579645)
chr6 (9-149)||(1950200-1950340)
chr6 (9-161)||(6999799-6999951)
chr6 (8-187)||(2579087-2579261)
chr6 (11-114)||(32460630-32460733)
chr6 (6-160)||(10911565-10911720)
chr6 (8-163)||(16108065-16108208)
chr6 (12-131)||(9062383-9062501)
chr6 (6-180)||(12071675-12071849)
chr6 (6-164)||(12092482-12092640)
chr6 (1-158)||(5958613-5958766)
chr6 (6-180)||(12085018-12085191)
chr6 (6-131)||(6071132-6071257)
chr6 (6-125)||(8481927-8482045)
chr6 (10-165)||(17135068-17135223)
chr6 (6-161)||(31714671-31714823)
chr6 (21-122)||(2975567-2975668)
chr6 (26-79)||(35210498-35210551)
chr6 (110-157)||(3409405-3409452)
chr6 (74-118)||(22605301-22605345)
chr6 (74-125)||(11637760-11637811)
chr6 (43-89)||(14789279-14789325)
chr6 (134-187)||(2975033-2975086)
chr6 (74-118)||(21130103-21130147)
chr6 (13-147)||(30618634-30618766)
chr6 (98-156)||(10902438-10902496)
chr6 (82-124)||(11638053-11638095)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (3-173)||(36178596-36178766)
chr2 (1-187)||(5542602-5542788)
chr2 (2-175)||(37105920-37106093)
chr2 (1-162)||(37106183-37106344)
chr2 (8-187)||(6421387-6421566)
chr2 (1-174)||(14745657-14745830)
chr2 (1-187)||(5542975-5543161)
chr2 (1-177)||(41283462-41283638)
chr2 (8-172)||(15880265-15880429)
chr2 (6-187)||(962598-962778)
chr2 (6-187)||(42514649-42514830)
chr2 (24-187)||(36178148-36178311)
chr2 (6-165)||(35580723-35580881)
chr2 (8-187)||(6712978-6713159)
chr2 (13-164)||(15511495-15511646)
chr2 (8-174)||(36005870-36006035)
chr2 (22-165)||(6422126-6422269)
chr2 (11-162)||(33731653-33731804)
chr2 (19-187)||(23346250-23346417)
chr2 (6-163)||(38796619-38796778)
chr2 (6-161)||(40679632-40679787)
chr2 (1-157)||(14745300-14745457)
chr2 (8-165)||(40733519-40733676)
chr2 (10-145)||(28254258-28254391)
chr2 (6-162)||(28531316-28531472)
chr2 (1-187)||(1769887-1770073)
chr2 (6-188)||(7598228-7598410)
chr2 (6-159)||(37632602-37632755)
chr2 (1-113)||(36178320-36178432)
chr2 (17-187)||(40163349-40163520)
chr2 (8-150)||(5367457-5367599)
chr2 (68-186)||(6421793-6421911)
chr2 (1-159)||(7598604-7598754)
chr2 (8-165)||(40733885-40734041)
chr2 (6-163)||(29676903-29677065)
chr2 (6-154)||(12529038-12529186)
chr2 (6-113)||(16542449-16542556)
chr2 (14-164)||(29676543-29676687)
chr2 (6-114)||(31468800-31468904)
chr2 (6-177)||(16590888-16591054)
chr2 (8-165)||(29874022-29874179)
chr2 (6-187)||(30313178-30313358)
chr2 (9-94)||(31899496-31899581)
chr2 (60-174)||(3673122-3673236)
chr2 (14-118)||(37895107-37895211)
chr2 (9-122)||(31259658-31259774)
chr2 (6-124)||(33561491-33561609)
chr2 (6-84)||(38796298-38796376)
chr2 (188-257)||(13952335-13952404)
chr2 (188-257)||(14093542-14093611)
chr2 (78-174)||(3672773-3672869)
chr2 (68-165)||(6421688-6421785)
chr2 (6-123)||(30323464-30323581)
chr2 (9-164)||(9231252-9231407)
chr2 (6-124)||(37894732-37894850)
chr2 (6-63)||(36785664-36785721)
chr2 (59-151)||(36784273-36784365)
chr2 (6-176)||(29873525-29873695)
chr2 (22-111)||(28254165-28254254)
chr2 (6-114)||(33953821-33953929)
chr2 (7-122)||(31385738-31385853)
chr2 (96-187)||(31899080-31899170)
chr2 (70-190)||(35580411-35580534)
chr2 (9-113)||(12910231-12910335)
chr2 (48-187)||(30312831-30312971)
chr2 (6-113)||(41678419-41678527)
chr2 (9-162)||(3594180-3594333)
chr2 (8-54)||(6421306-6421352)
chr2 (60-119)||(25390313-25390372)
chr2 (73-124)||(28226404-28226455)
chr2 (21-68)||(42515031-42515078)
chr2 (6-124)||(33954302-33954419)
chr2 (48-105)||(2336666-2336723)
chr2 (6-42)||(3673085-3673121)
chr2 (76-124)||(8904498-8904546)
chr2 (77-124)||(28226726-28226772)
chr2 (73-122)||(13792536-13792585)
chr2 (6-42)||(3672719-3672755)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (1-174)||(44290814-44290988)
chr1 (1-174)||(44290448-44290621)
chr1 (1-164)||(3537599-3537762)
chr1 (8-176)||(17294579-17294748)
chr1 (6-166)||(41142372-41142533)
chr1 (1-164)||(41759478-41759641)
chr1 (1-161)||(48588491-48588651)
chr1 (8-190)||(26661496-26661678)
chr1 (1-160)||(3550715-3550871)
chr1 (6-163)||(41157375-41157532)
chr1 (6-165)||(41156991-41157150)
chr1 (6-187)||(31767138-31767319)
chr1 (14-166)||(14318875-14319027)
chr1 (6-174)||(34364507-34364675)
chr1 (7-174)||(40082408-40082574)
chr1 (8-166)||(11977282-11977440)
chr1 (6-156)||(34364925-34365075)
chr1 (9-187)||(50052001-50052178)
chr1 (8-155)||(37556113-37556260)
chr1 (6-165)||(29798199-29798358)
chr1 (6-180)||(3875315-3875489)
chr1 (8-166)||(34649440-34649598)
chr1 (6-187)||(45084382-45084557)
chr1 (1-133)||(32594747-32594879)
chr1 (6-186)||(37850579-37850758)
chr1 (6-164)||(5319965-5320123)
chr1 (3-149)||(38804370-38804516)
chr1 (6-175)||(22077484-22077653)
chr1 (10-164)||(9955911-9956067)
chr1 (1-164)||(32168698-32168850)
chr1 (1-165)||(45493973-45494142)
chr1 (6-187)||(66449-66630)
chr1 (8-185)||(26661877-26662054)
chr1 (9-155)||(37555733-37555878)
chr1 (6-166)||(24600312-24600472)
chr1 (6-165)||(39066200-39066358)
chr1 (6-187)||(41184383-41184583)
chr1 (6-187)||(24131965-24132143)
chr1 (1-85)||(3537226-3537310)
chr1 (12-165)||(5575110-5575261)
chr1 (31-165)||(22077109-22077243)
chr1 (6-175)||(66078-66247)
chr1 (16-156)||(5528762-5528902)
chr1 (1-126)||(44043810-44043940)
chr1 (6-175)||(22077818-22077986)
chr1 (7-158)||(22793279-22793431)
chr1 (6-185)||(19283434-19283613)
chr1 (8-154)||(45839629-45839779)
chr1 (6-154)||(30630648-30630796)
chr1 (77-172)||(11977015-11977110)
chr1 (6-154)||(44685456-44685605)
chr1 (6-174)||(21378049-21378199)
chr1 (76-187)||(50051666-50051776)
chr1 (6-180)||(1188571-1188746)
chr1 (33-153)||(4956218-4956340)
chr1 (48-124)||(10351202-10351278)
chr1 (6-124)||(1187404-1187522)
chr1 (21-163)||(44091909-44092051)
chr1 (6-53)||(35154150-35154197)
chr1 (6-65)||(50469180-50469239)
chr1 (6-72)||(4878803-4878869)
chr1 (55-100)||(41184152-41184197)
chr1 (1-38)||(50051777-50051814)
chr1 (105-164)||(4266798-4266855)
chr1 (61-121)||(35154046-35154106)
chr1 (88-124)||(12466365-12466401)
chr1 (6-38)||(22077248-22077280)
chr1 (15-74)||(30630912-30630972)
chr1 (6-58)||(47379891-47379943)
chr1 (12-71)||(4266875-4266934)
chr1 (77-164)||(47380167-47380254)
chr1 (6-164)||(5996872-5997029)
chr1 (79-125)||(9956212-9956258)
chr1 (47-163)||(9499020-9499136)
chr1 (88-124)||(31973375-31973411)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (1-186)||(3669682-3669867)
chr8 (1-160)||(3670055-3670214)
chr8 (8-173)||(3038281-3038446)
chr8 (1-187)||(30441076-30441266)
chr8 (8-191)||(34835211-34835394)
chr8 (8-173)||(34834878-34835043)
chr8 (1-174)||(1014234-1014408)
chr8 (1-187)||(20870550-20870738)
chr8 (6-154)||(45122067-45122215)
chr8 (8-186)||(37544469-37544646)
chr8 (6-174)||(6876852-6877021)
chr8 (8-174)||(40518071-40518239)
chr8 (9-165)||(147454-147610)
chr8 (1-156)||(1013879-1014034)
chr8 (13-160)||(9482608-9482755)
chr8 (31-177)||(9483174-9483320)
chr8 (6-164)||(9608745-9608903)
chr8 (6-174)||(9309355-9309522)
chr8 (16-187)||(18371970-18372142)
chr8 (8-191)||(34835476-34835660)
chr8 (8-191)||(34835742-34835926)
chr8 (8-163)||(33113368-33113523)
chr8 (8-177)||(30359273-30359443)
chr8 (8-162)||(40518584-40518738)
chr8 (6-176)||(45121898-45122068)
chr8 (8-165)||(1513914-1514071)
chr8 (8-164)||(25561815-25561972)
chr8 (20-165)||(45122638-45122783)
chr8 (1-180)||(40579490-40579669)
chr8 (6-164)||(5915872-5916025)
chr8 (8-160)||(30359611-30359763)
chr8 (13-166)||(70272-70425)
chr8 (6-165)||(45123006-45123165)
chr8 (6-164)||(8918764-8918922)
chr8 (6-187)||(41972158-41972341)
chr8 (6-162)||(5420651-5420807)
chr8 (4-156)||(6731902-6732045)
chr8 (13-187)||(18371637-18371807)
chr8 (6-174)||(9308977-9309149)
chr8 (10-163)||(18380020-18380171)
chr8 (8-157)||(45121663-45121811)
chr8 (13-165)||(6651510-6651653)
chr8 (9-180)||(32640515-32640682)
chr8 (1-165)||(32305479-32305636)
chr8 (6-154)||(147829-147968)
chr8 (81-175)||(40579258-40579352)
chr8 (6-187)||(4154645-4154824)
chr8 (6-157)||(9507777-9507933)
chr8 (29-143)||(9609108-9609222)
chr8 (9-119)||(43274824-43274934)
chr8 (6-186)||(9620656-9620834)
chr8 (8-124)||(8794113-8794229)
chr8 (1-84)||(41416251-41416332)
chr8 (10-110)||(18372988-18373085)
chr8 (9-78)||(18372785-18372854)
chr8 (8-114)||(18372656-18372758)
chr8 (84-179)||(41129066-41129161)
chr8 (10-155)||(43398077-43398225)
chr8 (88-165)||(8919143-8919220)
chr8 (6-155)||(12283873-12284021)
chr8 (9-78)||(18372342-18372411)
chr8 (9-96)||(3037776-3037865)
chr8 (16-79)||(25561729-25561792)
chr8 (6-124)||(4154321-4154438)
chr8 (11-111)||(20130454-20130553)
chr8 (100-173)||(43274626-43274699)
chr8 (106-185)||(18372262-18372342)
chr8 (6-132)||(5274775-5274901)
chr8 (83-187)||(20995393-20995497)
chr8 (117-174)||(3037959-3038016)
chr8 (9-50)||(18372485-18372526)
chr8 (42-98)||(18373236-18373292)
chr8 (9-105)||(40991756-40991852)
chr8 (87-144)||(16524446-16524503)
chr8 (77-114)||(12156708-12156745)
chr8 (6-63)||(20995502-20995559)
chr8 (6-83)||(33831978-33832055)
chr8 (60-124)||(40417756-40417820)
chr8 (64-105)||(11442911-11442952)
chr8 (142-174)||(3038042-3038074)
chr8 (6-38)||(18645713-18645745)
chr8 (101-157)||(34629708-34629764)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (6-187)||(1085593-1085774)
chr7 (1-187)||(37532988-37533173)
chr7 (4-187)||(37533341-37533524)
chr7 (6-173)||(23368-23535)
chr7 (13-174)||(11845198-11845359)
chr7 (6-177)||(7517580-7517751)
chr7 (8-175)||(30244272-30244439)
chr7 (6-177)||(22567026-22567196)
chr7 (1-161)||(29157560-29157720)
chr7 (6-166)||(40094772-40094932)
chr7 (8-176)||(45433243-45433411)
chr7 (8-171)||(6054562-6054725)
chr7 (8-187)||(30245079-30245254)
chr7 (6-156)||(36939741-36939891)
chr7 (6-165)||(24177435-24177594)
chr7 (12-187)||(34218011-34218186)
chr7 (8-173)||(45434638-45434803)
chr7 (8-187)||(47129097-47129275)
chr7 (6-132)||(7554025-7554151)
chr7 (8-153)||(45754718-45754862)
chr7 (14-154)||(19122740-19122879)
chr7 (11-174)||(30032572-30032735)
chr7 (1-161)||(14681505-14681663)
chr7 (6-177)||(8128428-8128599)
chr7 (6-186)||(36622960-36623140)
chr7 (6-125)||(22566702-22566820)
chr7 (6-164)||(118299-118459)
chr7 (9-162)||(9901648-9901799)
chr7 (6-126)||(16569196-16569316)
chr7 (6-126)||(16596346-16596466)
chr7 (27-174)||(37167808-37167949)
chr7 (6-165)||(40230290-40230449)
chr7 (6-165)||(41854635-41854793)
chr7 (9-141)||(24838724-24838857)
chr7 (48-185)||(30253534-30253667)
chr7 (6-132)||(1085280-1085407)
chr7 (87-187)||(47129450-47129549)
chr7 (9-161)||(20599317-20599471)
chr7 (6-155)||(36534795-36534942)
chr7 (94-186)||(37532729-37532821)
chr7 (6-127)||(43241495-43241616)
chr7 (9-158)||(41910592-41910749)
chr7 (52-162)||(28300255-28300366)
chr7 (6-94)||(28301613-28301701)
chr7 (6-79)||(30245494-30245567)
chr7 (6-79)||(30255339-30255412)
chr7 (6-76)||(30244701-30244771)
chr7 (6-74)||(36109007-36109075)
chr7 (89-163)||(28300569-28300644)
chr7 (11-111)||(44361517-44361616)
chr7 (107-187)||(30244453-30244533)
chr7 (107-187)||(30253671-30253751)
chr7 (73-124)||(21416181-21416232)
chr7 (75-123)||(23569043-23569091)
chr7 (107-187)||(30245256-30245336)
chr7 (6-124)||(4124128-4124246)
chr7 (1-43)||(14681282-14681324)
chr7 (6-56)||(40094502-40094552)
chr7 (73-118)||(21619091-21619136)
chr7 (74-153)||(40094424-40094503)
chr7 (101-155)||(4719305-4719359)
chr7 (8-58)||(36967335-36967385)
chr7 (89-151)||(45755010-45755072)
chr7 (127-188)||(5825561-5825621)
chr7 (48-185)||(15902342-15902478)
chr7 (6-124)||(37345916-37346036)
chr7 (61-166)||(37393114-37393218)
chr7 (74-118)||(27391815-27391859)
chr7 (73-113)||(27598052-27598092)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (6-187)||(40296292-40296473)
chr5 (1-177)||(6500446-6500621)
chr5 (1-187)||(27502013-27502199)
chr5 (6-186)||(3294993-3295172)
chr5 (9-186)||(3295323-3295498)
chr5 (1-177)||(6500818-6500993)
chr5 (6-174)||(15370099-15370267)
chr5 (3-160)||(18603124-18603281)
chr5 (1-186)||(32487389-32487573)
chr5 (3-163)||(36492218-36492378)
chr5 (1-165)||(41170629-41170793)
chr5 (1-174)||(624191-624364)
chr5 (6-150)||(13415774-13415918)
chr5 (9-177)||(25327938-25328106)
chr5 (8-174)||(42405588-42405752)
chr5 (6-165)||(41632782-41632941)
chr5 (7-180)||(299490-299664)
chr5 (13-171)||(11416970-11417128)
chr5 (8-177)||(1028504-1028673)
chr5 (8-176)||(6224198-6224366)
chr5 (1-185)||(9498634-9498817)
chr5 (16-160)||(34753029-34753173)
chr5 (6-177)||(36568556-36568725)
chr5 (6-165)||(12662651-12662810)
chr5 (8-155)||(26074614-26074761)
chr5 (8-157)||(26075168-26075318)
chr5 (6-155)||(26074155-26074304)
chr5 (32-188)||(15370428-15370584)
chr5 (1-172)||(623813-623984)
chr5 (18-160)||(33747783-33747925)
chr5 (6-164)||(35150007-35150164)
chr5 (8-163)||(24489207-24489360)
chr5 (1-144)||(5723811-5723954)
chr5 (3-141)||(29549278-29549416)
chr5 (11-156)||(38427553-38427697)
chr5 (8-127)||(26074818-26074938)
chr5 (8-187)||(300961-301132)
chr5 (6-165)||(26590909-26591068)
chr5 (8-165)||(35167837-35167994)
chr5 (9-175)||(2411010-2411176)
chr5 (9-187)||(35914852-35915029)
chr5 (92-187)||(26899995-26900089)
chr5 (7-114)||(36521946-36522053)
chr5 (9-135)||(36522266-36522392)
chr5 (8-101)||(42508614-42508707)
chr5 (1-81)||(7768845-7768925)
chr5 (93-187)||(38427306-38427401)
chr5 (8-86)||(26074320-26074398)
chr5 (6-124)||(31509623-31509742)
chr5 (9-187)||(41635170-41635346)
chr5 (20-138)||(31509745-31509864)
chr5 (90-142)||(795254-795306)
chr5 (73-124)||(13042606-13042657)
chr5 (8-87)||(39309686-39309764)
chr5 (8-124)||(13786041-13786157)
chr5 (8-101)||(42524719-42524811)
chr5 (64-164)||(13785632-13785732)
chr5 (64-124)||(32445943-32446003)
chr5 (77-144)||(9498343-9498410)
chr5 (73-120)||(13112604-13112651)
chr5 (63-142)||(36527117-36527196)
chr5 (9-66)||(6225047-6225104)
chr5 (43-131)||(19275566-19275653)
chr5 (108-160)||(24489583-24489635)
chr5 (86-124)||(13042784-13042822)
chr5 (86-124)||(13112782-13112820)
chr5 (6-48)||(35150747-35150789)
chr5 (6-48)||(35151038-35151080)
chr5 (1-46)||(5660293-5660338)
chr5 (73-124)||(36389016-36389067)
chr5 (88-118)||(5963765-5963795)
chr5 (64-162)||(42435486-42435583)
chr5 (77-118)||(34103625-34103666)
chr5 (128-187)||(795081-795141)
chr5 (9-41)||(13785732-13785764)
chr5 (111-187)||(35150810-35150885)
chr5 (74-118)||(41341523-41341567)
[»] chr4 (103 HSPs)
chr4 (1-177)||(50630740-50630916)
chr4 (6-174)||(25483336-25483504)
chr4 (1-165)||(55933121-55933285)
chr4 (1-166)||(41370352-41370517)
chr4 (8-177)||(36629239-36629408)
chr4 (6-185)||(44620660-44620838)
chr4 (3-166)||(50002423-50002586)
chr4 (6-174)||(54017583-54017751)
chr4 (6-154)||(52884695-52884844)
chr4 (6-174)||(3340807-3340975)
chr4 (8-180)||(39792842-39793014)
chr4 (6-176)||(10245920-10246089)
chr4 (6-188)||(36608635-36608817)
chr4 (6-163)||(1731646-1731803)
chr4 (8-177)||(39404020-39404189)
chr4 (21-154)||(54108928-54109060)
chr4 (8-163)||(39404400-39404555)
chr4 (15-187)||(44621011-44621180)
chr4 (6-187)||(22027936-22028117)
chr4 (8-164)||(36572021-36572177)
chr4 (6-165)||(22183261-22183420)
chr4 (15-187)||(44620362-44620531)
chr4 (6-147)||(4955332-4955473)
chr4 (6-187)||(49076807-49076986)
chr4 (16-166)||(54343004-54343147)
chr4 (8-163)||(34646648-34646803)
chr4 (9-163)||(50459724-50459878)
chr4 (1-126)||(49880155-49880280)
chr4 (25-174)||(54936215-54936363)
chr4 (6-177)||(2740700-2740869)
chr4 (12-187)||(20825842-20826018)
chr4 (6-154)||(52884887-52885038)
chr4 (6-157)||(32941128-32941279)
chr4 (24-166)||(18932745-18932887)
chr4 (6-165)||(22028366-22028527)
chr4 (9-164)||(49302907-49303064)
chr4 (12-159)||(20826223-20826370)
chr4 (7-164)||(16888814-16888971)
chr4 (7-187)||(16889511-16889691)
chr4 (6-161)||(4390102-4390257)
chr4 (5-165)||(54108537-54108695)
chr4 (6-187)||(34004560-34004739)
chr4 (6-174)||(49076439-49076604)
chr4 (21-132)||(45496820-45496931)
chr4 (6-164)||(3244449-3244607)
chr4 (6-115)||(2741071-2741180)
chr4 (60-165)||(23817678-23817783)
chr4 (8-124)||(41707503-41707618)
chr4 (46-177)||(43827480-43827610)
chr4 (3-129)||(6975489-6975615)
chr4 (6-165)||(3341128-3341287)
chr4 (57-187)||(31691203-31691335)
chr4 (8-160)||(43174508-43174661)
chr4 (6-187)||(51768035-51768216)
chr4 (8-152)||(19504707-19504842)
chr4 (6-177)||(54741165-54741334)
chr4 (52-187)||(18879852-18879987)
chr4 (8-163)||(45489331-45489485)
chr4 (6-166)||(3700365-3700517)
chr4 (6-165)||(28034229-28034388)
chr4 (19-114)||(54017750-54017845)
chr4 (8-143)||(40067045-40067181)
chr4 (27-166)||(48111694-48111833)
chr4 (28-165)||(3271806-3271948)
chr4 (11-124)||(760194-760306)
chr4 (6-95)||(10246347-10246436)
chr4 (48-147)||(15841383-15841482)
chr4 (14-72)||(44620304-44620362)
chr4 (1-58)||(50788087-50788144)
chr4 (98-174)||(43174233-43174309)
chr4 (31-187)||(39698919-39699077)
chr4 (6-72)||(44621426-44621492)
chr4 (9-138)||(34544107-34544239)
chr4 (12-165)||(45489711-45489864)
chr4 (120-180)||(11702281-11702341)
chr4 (6-138)||(23556890-23557022)
chr4 (73-124)||(11197293-11197344)
chr4 (8-72)||(44620946-44621011)
chr4 (69-187)||(11783528-11783646)
chr4 (6-94)||(11348396-11348484)
chr4 (12-124)||(15841023-15841134)
chr4 (73-124)||(10396198-10396249)
chr4 (73-124)||(10396483-10396534)
chr4 (116-155)||(19895406-19895445)
chr4 (86-160)||(41370738-41370812)
chr4 (73-125)||(922485-922537)
chr4 (74-113)||(1868119-1868158)
chr4 (64-122)||(11706584-11706641)
chr4 (72-118)||(51681604-51681650)
chr4 (119-160)||(23817457-23817498)
chr4 (60-120)||(2891864-2891924)
chr4 (6-54)||(45050601-45050649)
chr4 (131-175)||(45496675-45496719)
chr4 (73-124)||(11197003-11197054)
chr4 (61-104)||(45484774-45484817)
chr4 (1-35)||(18932887-18932921)
chr4 (50-124)||(31249896-31249970)
chr4 (82-124)||(41707279-41707321)
chr4 (84-122)||(50788034-50788072)
chr4 (6-47)||(11706636-11706677)
chr4 (69-102)||(29802604-29802637)
chr4 (1-29)||(18933103-18933131)
chr4 (88-124)||(34946151-34946187)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (1-165)||(22304564-22304728)
chr3 (8-179)||(43346775-43346947)
chr3 (6-187)||(32589704-32589884)
chr3 (8-165)||(35946524-35946681)
chr3 (8-177)||(37990626-37990795)
chr3 (6-176)||(29644890-29645060)
chr3 (6-175)||(42342377-42342546)
chr3 (8-187)||(37990953-37991133)
chr3 (6-165)||(12114561-12114720)
chr3 (6-187)||(29644558-29644739)
chr3 (6-162)||(15772854-15773010)
chr3 (6-165)||(33803251-33803410)
chr3 (8-174)||(52634678-52634843)
chr3 (6-174)||(54017806-54017974)
chr3 (6-165)||(25739424-25739583)
chr3 (6-165)||(54018197-54018356)
chr3 (8-161)||(32462903-32463057)
chr3 (1-155)||(39389065-39389219)
chr3 (1-156)||(39934963-39935120)
chr3 (6-165)||(41359764-41359919)
chr3 (8-180)||(25755396-25755568)
chr3 (6-162)||(42342092-42342248)
chr3 (6-187)||(15773192-15773375)
chr3 (6-165)||(21832344-21832501)
chr3 (8-165)||(22303954-22304104)
chr3 (8-186)||(3135432-3135617)
chr3 (1-147)||(4823650-4823796)
chr3 (13-138)||(3135099-3135224)
chr3 (6-164)||(31190017-31190167)
chr3 (1-165)||(50612446-50612615)
chr3 (6-166)||(53577364-53577524)
chr3 (6-161)||(45395656-45395811)
chr3 (6-177)||(1634302-1634473)
chr3 (8-187)||(32462536-32462715)
chr3 (6-153)||(39914252-39914399)
chr3 (8-164)||(45901715-45901872)
chr3 (7-165)||(53117974-53118131)
chr3 (6-164)||(8327904-8328066)
chr3 (8-156)||(49336694-49336843)
chr3 (6-165)||(44160546-44160702)
chr3 (6-157)||(9240149-9240300)
chr3 (64-161)||(22303662-22303759)
chr3 (8-177)||(33175646-33175820)
chr3 (9-172)||(11661954-11662117)
chr3 (1-166)||(37726499-37726656)
chr3 (16-159)||(42584829-42584970)
chr3 (1-160)||(51886556-51886709)
chr3 (6-138)||(47964544-47964676)
chr3 (32-130)||(33362327-33362425)
chr3 (80-165)||(41359490-41359575)
chr3 (6-187)||(39336208-39336387)
chr3 (1-113)||(3384317-3384429)
chr3 (1-61)||(22304241-22304301)
chr3 (9-98)||(7767380-7767469)
chr3 (76-165)||(54017547-54017636)
chr3 (6-165)||(47964914-47965073)
chr3 (8-124)||(11661537-11661638)
chr3 (9-114)||(46546375-46546480)
chr3 (6-62)||(43346650-43346706)
chr3 (115-165)||(22304302-22304352)
chr3 (48-132)||(39336002-39336086)
chr3 (56-116)||(52634990-52635050)
chr3 (110-177)||(8328374-8328441)
chr3 (48-153)||(12749211-12749316)
chr3 (8-124)||(25991405-25991521)
chr3 (73-124)||(53596027-53596078)
chr3 (73-124)||(53596342-53596393)
chr3 (86-173)||(43978856-43978947)
chr3 (134-187)||(9239941-9239994)
chr3 (61-118)||(17731950-17732007)
chr3 (61-118)||(19033181-19033238)
chr3 (9-138)||(25317161-25317290)
chr3 (73-124)||(53596542-53596593)
chr3 (73-120)||(48127859-48127906)
chr3 (88-165)||(7766782-7766857)
chr3 (6-38)||(12747878-12747910)
chr3 (74-118)||(16871005-16871049)
chr3 (74-118)||(17735037-17735081)
chr3 (74-118)||(19036306-19036350)
chr3 (137-176)||(41360125-41360164)
chr3 (73-118)||(16143505-16143550)
chr3 (77-118)||(16869843-16869884)
chr3 (11-72)||(36986040-36986101)
chr3 (11-72)||(37011479-37011540)
chr3 (69-105)||(50329391-50329427)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (8-166)||(512-670)
scaffold0702 (1-166)||(145-305)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (8-174)||(1096-1262)
scaffold0391 (53-187)||(1660-1802)
scaffold0391 (6-57)||(3092-3143)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (6-165)||(47360-47519)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (6-155)||(5396-5546)
scaffold0734 (6-155)||(5777-5931)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (6-126)||(5357-5477)
scaffold0078 (6-157)||(4982-5133)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (6-122)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (8-83)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (8-138)||(39459-39588)
scaffold0113 (8-131)||(39840-39963)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (44-84)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 29518915 - 29519102
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29518915 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttt 29519014  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  29519015 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaacac 29519102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 29518498 - 29518684
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29518498 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttt 29518597  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  29518598 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 29518684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 32741174 - 32741360
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32741174 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttt 32741273  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  32741274 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 32741360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 2378121 - 2378286
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2378121 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttt 2378220  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378221 taggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 2378286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 3409254 - 3409407
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3409254 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 3409353  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409354 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 16454913 - 16455088
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16454913 tgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagt 16455012  T
Q  112 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16455013 gtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcataatccaaca 16455088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 35210199 - 35210362
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35210199 tggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaaggttt 35210298  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35210299 tgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccc 35210362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2578598 - 2578420
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2578598 caagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 2578500  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  2578499 gagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcccccctcatgacccaaca 2578420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14748498 - 14748332
Alignment:
Q  4 tttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14748498 tttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaaggttttgg 14748399  T
Q  104 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748398 gtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 14748332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 3409655 - 3409819
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  3409655 tggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttt 3409754  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409755 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3409819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454756
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 16454756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 1846747 - 1846928
Alignment:
Q  5 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 104  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1846747 ttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggttttgga 1846846  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  1846847 taagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagcttccc-catgacccaaca 1846928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579872
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2579872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 3415453 - 3415629
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415453 tggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 3415552  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  3415553 ttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 3058221 - 3058385
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3058221 tggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaaggttt 3058320  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3058321 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtccccc 3058385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377914
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccg 2377914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 26544044 - 26544197
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26544044 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaaggttt 26544143  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26544144 tgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843736
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  111 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctaactcccctcatgatccaaca 2843736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10074521 - 10074352
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10074521 tgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 10074422  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  10074421 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctcccct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  106 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    || |||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10074149 - 10073991
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074149 tgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 10074050  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    || |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10074049 aaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtcccc 10073991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 1127355 - 1127518
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1127355 tggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 1127454  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  1127455 tgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtcccc 1127518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2578991 - 2578819
Alignment:
Q  7 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2578991 gcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaactcattaccttaaggttttgggta 2578893  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2578892 agagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcatga 2578819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 185  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtccccag-gctcccctcatgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10073772 - 10073592
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10073772 tgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggt 10073675  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 188  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||| |||||||    
T  10073674 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcccctcgtgacccaacac 10073592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2579645 - 2579479
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2579645 gtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaag 2579546  T
Q  111 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| || |  ||||||||||    
T  2579545 tatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctca 2579479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 149  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2579261 - 2579087
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||    
T  2579261 caagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccataaacccataactttaaggctttggctaa 2579166  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2579165 gagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggt-ccccgagctcccctcatgacccaaca 2579087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  111 tgtg 114  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 16108065 - 16108208
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  16108065 caagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg---------- 16108154  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16108155 --gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  112 gtggtgtctctcttgcttgt 131  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071675
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 180  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctcatga 12071675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092482
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtcccc 12092482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 158  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    || | |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctctcttg----tgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085018
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 180  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||   |||||||||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctcatga 12085018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 131
Target Start/End: Original strand, 6071132 - 6071257
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  6071132 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggat 6071231  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgt 131  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    
T  6071232 aagagtgtggcgtctctctcgcttgt 6071257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Original strand, 8481927 - 8482045
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8481927 tgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggt 8482025  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctctt 125  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8482026 aagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135068
Alignment:
Q  10 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  110 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||  | |||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtccccc 17135068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714823
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    |||||||||| || | | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgt-tttttcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtc 31714823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 2975567 - 2975668
Alignment:
Q  21 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 120  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  2975567 tatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtct 2975666  T
Q  121 ct 122  Q
    ||    
T  2975667 ct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Original strand, 35210498 - 35210551
Alignment:
Q  26 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35210498 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 157
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  110 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 125  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  43 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 89  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 187
Target Start/End: Original strand, 2975033 - 2975086
Alignment:
Q  134 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2975033 ggttgttctagcctcgatgtggcaggtcccacgcgctcctctcatgatccaaca 2975086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618634
Alignment:
Q  13 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  113 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 147  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct 30618634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  98 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  82 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36178766 - 36178596
Alignment:
Q  3 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178766 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 36178667  T
Q  103 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36178666 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccccgcgctccc 36178596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5542788 - 5542602
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5542788 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttt 5542689  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5542688 ttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccccgagctccccccatgatccaaca 5542602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106093
Alignment:
Q  2 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  102 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccct 37106093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 37106183 - 37106344
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37106183 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaaggttt 37106282  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106283 tgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421566
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 6421566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14745830 - 14745657
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745830 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 14745731  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14745730 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc 14745657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5543161 - 5542975
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  5543161 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaagattt 5543062  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||    
T  5543061 tgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtaccttgagctccccccatgatccaaca 5542975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41283638 - 41283462
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41283638 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 41283539  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41283538 taggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctca 41283462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 15880265 - 15880429
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880265 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 15880364  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  15880365 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacgttcctccgagctcc 15880429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962778
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctcccgaactcccc-catgatccaaca 962778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514830
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 42514830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178148
Alignment:
Q  24 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  124 ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccccgcgctcccctcgtgacccaaca 36178148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580723
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 35580723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713159
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca-tgatccaaca 187  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaacttccctcactgatccaaca 6713159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  13 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 112  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  113 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005870
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacagtctctcgagctcccc 36005870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 6422126 - 6422269
Alignment:
Q  22 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 121  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6422126 atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctc 6422225  T
Q  122 tcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6422226 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtccccc 6422269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 162
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731804
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 110  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  111 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcc 33731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346417
Alignment:
Q  19 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  119 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctcatgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796619
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  106 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    |||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40679787 - 40679632
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40679787 tgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggt 40679688  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679687 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14745457 - 14745300
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745457 tggtttgcaactgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttt 14745358  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gcggttgttctagcctcgatgtggac 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||||    
T  14745357 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 40733519 - 40733676
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||    
T  40733519 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaa 40733618  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  40733619 gagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtccccc 40733676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  10 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  110 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagc 145  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28531472 - 28531316
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28531472 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggt 28531373  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531372 aagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 1769887 - 1770073
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | | ||    
T  1769887 tggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaagctt 1769986  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||  |||| ||||||    
T  1769987 tgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtgaacgatcctcctagctcccccaatgacccaaca 1770073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598410
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 188  Q
    |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccctgatctcccctcgtgacccaacac 7598410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632602
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 159  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg 37632602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 36178432 - 36178320
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36178432 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaaggttt 36178333  T
Q  101 tgggtaagagtgt 113  Q
    |||||||||||||    
T  36178332 tgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163349
Alignment:
Q  17 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  116 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| || | |||||||  |||| ||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctccccctatgacccaaca 40163349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 186
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421911
Alignment:
Q  68 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgc 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  168 gctcccctcatgatccaac 186  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  6421893 gctcccctcatgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 7598604 - 7598754
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||    
T  7598604 tggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaacgttt 7598695  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 159  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  7598696 ttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacgg 7598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 40733885 - 40734041
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  40733885 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaa 40733983  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40733984 gagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtccccc 40734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 29676903 - 29677065
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29676903 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctt 29677002  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29677003 taagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  106 aagagtgt 113  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  14 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  114 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 31468904 - 31468800
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31468904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 31468809  T
Q  106 aagagtgtg 114  Q
    |||||||||    
T  31468808 aagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591054
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctca 16591054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874022
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||| |||| ||   |||||||||||| | | |||| ||||||| |||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtccccc 29874022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 30313178 - 30313358
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30313178 tgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggt 30313276  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||| |||| ||| | |||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  30313277 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccccgggctctcctcgtgacccaaca 30313358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 174
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673236
Alignment:
Q  60 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3673122 ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 3673221  T
Q  160 tcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||  |||||||    
T  3673222 tccccctggctcccc 3673236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  14 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  114 ggtgt 118  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  106 aagagtgtggtgtctct 122  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33561609 - 33561491
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33561609 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggt 33561510  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  33561509 aagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 38796376 - 38796298
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38796376 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13952404 - 13952335
Alignment:
Q  188 cattattatttgcttgcccagacaaatattcctttaaatgttggtcacacaaaactcaaccaataatgac 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13952404 cattattatttgcttgcccggacaaatattcctttaaatgttggtcacacaaaactcaaccaataatgac 13952335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14093611 - 14093542
Alignment:
Q  188 cattattatttgcttgcccagacaaatattcctttaaatgttggtcacacaaaactcaaccaataatgac 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14093611 cattattatttgcttgcccggacaaatattcctttaaatgttggtcacacaaaactcaaccaataatgac 14093542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 174
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672869
Alignment:
Q  78 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccc 3672869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421785
Alignment:
Q  68 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggtacccc 6421785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Original strand, 30323464 - 30323581
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30323464 tgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggt 30323563  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctc 123  Q
    |||||||||| |||||||    
T  30323564 aagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||| || |||||||  ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37894850 - 37894732
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  37894850 tgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggtt 37894751  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctct 124  Q
    || |||||||||| |||||    
T  37894750 aaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 36785721 - 36785664
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785721 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  59 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29873695 - 29873525
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  29873695 tgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagt 29873596  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 176  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||| | || ||||| | |||||| ||  |||||||||    
T  29873595 aagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctggctcccctc 29873525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  22 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 33953929 - 33953821
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  33953929 tgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggt 33953830  T
Q  106 aagagtgtg 114  Q
    |||||||||    
T  33953829 aagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385853
Alignment:
Q  7 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  107 agagtgtggtgtctct 122  Q
      ||||||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctct 31385853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899080
Alignment:
Q  96 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggt-ccccaagctcccctcatgatccaaca 31899080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580411
Alignment:
Q  70 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccg 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | || | ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggttcccccg 35580436  T
Q  167 cgctcccc-tcatgatccaacacat 190  Q
     ||||||| |||||| |||||||||    
T  35580435 agctccccttcatgacccaacacat 35580411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 113
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  109 agtgt 113  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312971
Alignment:
Q  48 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct-tgcttgtgcggttgttctagcc 146  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    ||||||||||| ||| |||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctctcaatttgtgcggttgctctggcc 30312930  T
Q  147 tcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |  ||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  30312931 tgaatgtgggtggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 30312971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 41678527 - 41678419
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 103  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  41678527 tgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttga 41678429  T
Q  104 gtaagagtgt 113  Q
    ||||||||||    
T  41678428 gtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    |||||| | |||||| | || ||| | || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 54  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  60 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 119  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 68
Target Start/End: Original strand, 42515031 - 42515078
Alignment:
Q  21 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 68  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42515031 tatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954302
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctct 33954302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 105
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  48 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 42
Target Start/End: Original strand, 3673085 - 3673121
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3673085 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaat 3673121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 124
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  76 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 124
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  77 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 122  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 42
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 42  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44290988 - 44290814
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290988 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 44290889  T
Q  101 tgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44290888 tgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 44290814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44290621 - 44290448
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290621 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 44290522  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44290521 tgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 44290448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3537762 - 3537599
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3537762 tggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaaggttt 3537663  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537662 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3537599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294748
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgc-ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 176  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtcgcccgagctcccctc 17294748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142533
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  106 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 41142533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 41759478 - 41759641
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  41759478 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaaggttt 41759577  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759578 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 48588651 - 48588491
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  48588651 tggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttt 48588552  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588551 tgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 48588491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26661678 - 26661496
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26661678 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 26661579  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacacat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||    
T  26661578 gagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtccccctaactctcctcgtgacccaacacat 26661496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 3550715 - 3550871
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3550715 tggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaagttt 3550814  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3550815 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 41157375 - 41157532
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41157375 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagt 41157474  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41157475 aagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccc 41157532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157150
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 41157150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767138
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctcatgacccaaca 31767138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319027
Alignment:
Q  14 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 113  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  114 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccg 14319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364675
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc 34364675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082574
Alignment:
Q  7 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatc-ataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtggatagtcctccgagctcccc 40082574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 11977282 - 11977440
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11977282 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 11977381  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977382 gagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 11977440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Original strand, 34364925 - 34365075
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364925 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggt 34365024  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  34365025 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtgga 34365075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 50052178 - 50052001
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  50052178 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaagttttgggtaag 50052079  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  50052078 agtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 50052001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 37556113 - 37556260
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37556113 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggta 37556211  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37556212 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798358
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtccccc 29798358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875315
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 180  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccctcatga 3875315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649598
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 34649598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084557
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataac------gtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctcatgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32594879 - 32594747
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32594879 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttt 32594780  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32594779 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgc 32594747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850579
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggt-cccctagctcccctcatgatccaac 37850579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  3 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  103 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 149  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22077653 - 22077484
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22077653 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggt 22077554  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  22077553 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccct 22077484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956067
Alignment:
Q  10 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccc 9956067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32168850 - 32168698
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32168850 tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgaggttt 32168762  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32168761 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 32168698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45494142 - 45493973
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 95  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  45494142 tggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgccttaa 45494043  T
Q  96 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45494042 agttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccc 45493973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66449
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||  ||||||||||||| ||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctcatgacccaaca 66449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661877
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| |||| |||  ||||||||| ||| ||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaatccttgatgcggatggtctccctagctcccctcgtgacccaa 26661877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600312
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggacagttccccg 24600312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066200
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtccccc 39066200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184383
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------- 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  97 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccccgcgctcccctca-tgatccaac 186  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  187 a 187  Q
    |    
T  41184383 a 41184383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131965
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |  ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |||| || || | || |||||||||| ||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctcatgacccaaca 24131965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3537310 - 3537226
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537310 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575261
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 111  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  112 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtccccc 5575261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22077243 - 22077109
Alignment:
Q  31 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 130  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |||     
T  22077243 atcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcactta 22077144  T
Q  131 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22077143 tgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccc 22077109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 66247 - 66078
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 103  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  66247 tgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgg 66148  T
Q  104 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    |||||||||||| | |||||   |||||  ||||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  66147 gtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgtagacaatcccccgagctcccct 66078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528762
Alignment:
Q  16 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  116 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 156  Q
     |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtgga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 44043940 - 44043810
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44043940 tggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgtctta 44043842  T
Q  95 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 126  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043841 agattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077818
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  7 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 158  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 185  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||    |||||||||||| ||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctcatgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  103 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30630796 - 30630648
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30630796 tgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 30630697  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    ||||||| || ||| || |  ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  30630696 aagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 172
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977110
Alignment:
Q  77 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 172  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 11977110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378049
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc 21378049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051666
Alignment:
Q  76 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctagcatcgatgtggacggtccccctagctcccct 50051678  T
Q  176 catgatccaaca 187  Q
    | ||| ||||||    
T  50051677 cgtgacccaaca 50051666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188571
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc-cgcgctcccctcatga 180  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| || ||||| |||  ||| ||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcggtccccaagggctcccctcatga 1188571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 153
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  33 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  131 tgcggttgttctagcctcgatgt 153  Q
    |||| ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 124
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  48 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187404
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctct 124  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctct 1187404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  21 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 120  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  121 ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
     |||  |||||   |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 50469239 - 50469180
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 65  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469239 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 72  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  55 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 50051814 - 50051777
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051814 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  61 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 124
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  88 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 22077280 - 22077248
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077280 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 22077248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  15 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 47379943 - 47379891
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 58  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  47379943 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 4266934 - 4266875
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 71  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266934 tgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380167
Alignment:
Q  77 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  |||||  ||||| || ||||| |||||||  |||||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccc 47380167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996872
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
     ||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||  ||||||| | ||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgggcagtcccc 5996872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  79 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 125  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 163
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  47 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcc 146  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  147 tcgatgtggacggtccc 163  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  88 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 3669682 - 3669867
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3669682 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttt 3669781  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  3669782 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccccctagctcccctcgtgacccaac 3669867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 3670055 - 3670214
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3670055 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttt 3670154  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670155 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3670214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038281
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 173  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 3038281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 30441076 - 30441266
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgccttaag 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30441076 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgccttaag 30441175  T
Q  97 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||| ||||||    
T  30441176 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctcgtgacccaaca 30441266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Original strand, 34835211 - 34835394
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34835211 caagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaa 34835310  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacacatt 191  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| | ||||||||    
T  34835311 gagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccccaatgacctaacacatt 34835394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 173
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835043
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatgatcccttgcgctccc 34835043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1014408 - 1014234
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||    
T  1014408 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaagttt 1014309  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  1014308 tgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggttcccccgagctcccc 1014234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20870738 - 20870550
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20870738 tggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagat 20870639  T
Q  99 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  20870638 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctcatgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544469
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgat-ccccgagttcccctcatgacccaac 37544469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876852
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 6876852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518239
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctcccc 40518239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147610
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtccccc 147610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1014034 - 1013879
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  1014034 tggtttgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttt 1013935  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 156  Q
    || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013934 tgagtaagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9482755 - 9482608
Alignment:
Q  13 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 112  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  9482755 gtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtg 9482656  T
Q  113 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482655 tggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483174
Alignment:
Q  31 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  131 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608903
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccc 9608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 9309355 - 9309522
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||    
T  9309355 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggt 9309454  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||||||||||||| |   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9309455 aagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 9309522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371970
Alignment:
Q  16 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 115  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  116 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctcatgacccaaca 18371970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Original strand, 34835476 - 34835660
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835476 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835575  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacacatt 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| | ||||||||    
T  34835576 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccccaatgacctaacacatt 34835660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Original strand, 34835742 - 34835926
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835742 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835841  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacacatt 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| | ||||||||    
T  34835842 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccccaatgacctaacacatt 34835926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359443
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| || |||| || ||||||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctca 30359443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 40518584 - 40518738
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40518584 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaa 40518683  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518684 gagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 176  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513914
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtccccc 1513914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561815
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccc 25561815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Original strand, 45122638 - 45122783
Alignment:
Q  20 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  45122638 atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtc 45122737  T
Q  120 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45122738 tctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtccccc 45122783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40579669 - 40579490
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  40579669 tggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggttt 40579570  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 180  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  40579569 taggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacgatcctccatgctccccacatga 40579490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 30359611 - 30359763
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30359611 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaa 30359710  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30359711 gagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70272
Alignment:
Q  13 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  113 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtctcccg 70272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 45123006 - 45123165
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45123006 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggt 45123103  T
Q  106 a--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45123104 aagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtccccc 45123165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8918922 - 8918764
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8918922 tgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggt 8918823  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918822 aagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972341
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  103 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtctcccgaactcccc-catgacccaaca 41972341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    |||||||||  ||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 6731902 - 6732045
Alignment:
Q  4 tttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  6731902 tttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa---------agtaagagaacccataaattcattgccttaaggttttga 6731992  T
Q  104 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6731993 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtgga 6732045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18371807 - 18371637
Alignment:
Q  13 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18371807 gtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtg 18371713  T
Q  113 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||| |||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  18371712 tggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggttcccccgagctctcctcatgacccaaca 18371637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309149
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  104 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 9309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  10 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  110 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    ||||||||   |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 45121811 - 45121663
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  45121811 caagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaa 45121713  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 157  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45121712 gagtgtgatatctctcttacttatggggttgttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Original strand, 6651510 - 6651653
Alignment:
Q  13 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6651510 gtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacccataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtg 6651600  T
Q  113 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6651601 tggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtccccc 6651653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640515
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cccgcgctcccctcatga 180  Q
    ||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtgagcggtccgccagagctcccctcatga 32640515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 32305479 - 32305636
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  32305479 tggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagattt 32305571  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||| ||||||||||| |||| | || ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32305572 tggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtccccc 32305636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 147829 - 147968
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  147829 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa---------cccataaacctattgccttaaggttttgggt 147919  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  147920 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579258
Alignment:
Q  81 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccccgagctcccct 40579258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154645
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |||| ||||||   |||||| ||  ||||| |||||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtgagtggtccctcggactcccttcatgacccaaca 4154645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 157  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  29 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 128  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  129 tgtgcggttgttcta 143  Q
     ||| ||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  109 agtgtggtgtc 119  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620656
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    |||||| || |||||||||  |||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctcgtgacccaac 9620656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  108 gagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 41416332 - 41416251
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 84  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416332 tggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18373085 - 18372988
Alignment:
Q  10 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  18373085 agtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaaga 18372989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18372854 - 18372785
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372854 aagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  108 gagtgtg 114  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129161
Alignment:
Q  84 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatg 179  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcatg 41129161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  10 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919143
Alignment:
Q  88 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtccccc 8919143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18372411 - 18372342
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372411 aagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 96  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  16 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4154438 - 4154321
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  4154438 tgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggt 4154340  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  4154339 aagtgtgtgatgtctctct 4154321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 110  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274626
Alignment:
Q  100 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccccgagctccc 43274626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372262
Alignment:
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctcatgatccaa 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggttcccccgagctcccctcatgacccaa 18372262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 132
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274901
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 132  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtg 5274901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995393
Alignment:
Q  83 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| ||| |||  |||||| |  ||||||||| ||| |    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctcgtgacc 20995398  T
Q  183 caaca 187  Q
    |||||    
T  20995397 caaca 20995393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037959
Alignment:
Q  117 gtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 3037959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18372526 - 18372485
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372526 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  42 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991852
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggt 40991852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  87 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 144  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  77 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 83
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 83  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417756
Alignment:
Q  60 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctct 40417756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 105
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  64 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3038074 - 3038042
Alignment:
Q  142 tagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3038074 tagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 3038042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 38  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34629764 - 34629708
Alignment:
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  34629764 tgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggtagttatggccttgatgtggac 34629708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085593
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctcatgacccaaca 1085593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37533173 - 37532988
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37533173 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 37533074  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  37533073 tgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccccgcgctcccatcgtgacccaaca 37532988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37533524 - 37533341
Alignment:
Q  4 tttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533524 tttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgg 37533425  T
Q  104 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37533424 gtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcgtgacccaaca 37533341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23368
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccccgagctccc 23368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845359
Alignment:
Q  13 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  113 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcccc 11845359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517751
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctca 7517751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Original strand, 30244272 - 30244439
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244272 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 30244371  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30244372 gagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccct 30244439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567026
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctca 22567026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 29157560 - 29157720
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29157560 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggttt 29157659  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||    
T  29157660 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtc 29157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094772
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccccg 40094772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433411
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054725
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 171  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctc 6054725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 30245079 - 30245254
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30245079 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 30245178  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  30245179 gagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 30245254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 156  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177594
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtccccc 24177594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218011
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  112 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 34218011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 173
Target Start/End: Original strand, 45434638 - 45434803
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  45434638 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaa 45434737  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 173  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  45434738 gagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtccccctcgctccc 45434803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129275
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggt-ccccgagctcccctcatgatccaaca 47129275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 132
Target Start/End: Original strand, 7554025 - 7554151
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7554025 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggt 7554124  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7554125 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtg 7554151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  14 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  114 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032735
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  111 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 30032735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 14681505 - 14681663
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681505 tggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttt 14681604  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681605 tgggtaagagtgtggtgtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128428
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctca 8128428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623140
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctcatgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22566820 - 22566702
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566820 tgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 22566721  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctctt 125  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22566720 aagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118299
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  106 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc 118299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttg 126  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttg 126  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 174
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167949
Alignment:
Q  27 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  127 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcccc 37167949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230290
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||  ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggttcccc 40230290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854793
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtccccc 41854793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 141  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 185
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253667
Alignment:
Q  48 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  148 cgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 185  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccccgagctcccctcgtgacccaa 30253667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1085407 - 1085280
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 104  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1085407 tgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttggg 1085308  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 132  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085307 taagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 187
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129549
Alignment:
Q  87 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggt-ccccgagctcccctcatgacccaac 47129548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    |||||||||| |||||||   |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532729
Alignment:
Q  94 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcccctcgtgatccaac 37532729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 127
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgc 127  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 158  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300255
Alignment:
Q  52 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  151 tgtggacggtcc 162  Q
    ||||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcc 28300255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 94  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Original strand, 30245494 - 30245567
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245494 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Original strand, 30255339 - 30255412
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 79  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30255339 tgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 30244701 - 30244771
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244701 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 74  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  89 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 110  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244533
Alignment:
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctcatgacccaaca 30244533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctcatgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  75 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245336
Alignment:
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctccccttatgacccaaca 30245336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctct 124  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 14681282 - 14681324
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681282 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 40094552 - 40094502
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 56  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094552 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 153  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 58  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  89 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 151  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5825621 - 5825561
Alignment:
Q  127 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||    
T  5825621 cttgtgcggttgttctagccttgatgtggacggtctcccaagct-ccctcatgacccaacac 5825561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 185
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902478
Alignment:
Q  48 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 147  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  148 cgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 185  Q
     |||||||  |||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccccggactcccctcgtgacccaa 15902478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Original strand, 37345916 - 37346036
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 103  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  37345916 tgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttga 37346015  T
Q  104 gtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  37346016 gtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393218
Alignment:
Q  61 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| || ||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  161 cccccg 166  Q
    ||||||    
T  37393213 cccccg 37393218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 113  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296292
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctcatgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 6500446 - 6500621
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6500446 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaaggttt 6500544  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6500545 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 6500621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27502199 - 27502013
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27502199 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaagattt 27502100  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27502099 ttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcatgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3295172 - 3294993
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3295172 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggt 3295074  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3295073 atgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctcatgatccaac 3294993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295323
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctcactcccctcatgatccaac 3295323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 6500818 - 6500993
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6500818 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttt 6500916  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6500917 tggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 6500993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370267
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 15370267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18603281 - 18603124
Alignment:
Q  3 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603281 gttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 18603182  T
Q  103 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603181 ggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 32487389 - 32487573
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487389 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 32487487  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| |||||    
T  32487488 tgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccaagcttcccccatgacccaac 32487573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  3 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  103 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 41170629 - 41170793
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170629 tggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 41170728  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41170729 tgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtccccc 41170793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 624191 - 624364
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  624191 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttt 624290  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  624291 tgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctcccc 624364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13415918 - 13415774
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13415918 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggt 13415819  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 150  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415818 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328106
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctca 25328106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405588
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 42405588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632941
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccc 41632941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299664
Alignment:
Q  7 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc-gcgctcccctcatga 180  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccccggagctcccctcatga 299664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416970
Alignment:
Q  13 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  113 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 171  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtccccctcgctc 11416970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028504
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca 1028504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224366
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 176  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9498817 - 9498634
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9498817 tggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattt 9498718  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||  | || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  9498717 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgctggtctagcctcaatgtggacggtccccctagctcccctcgtgacccaa 9498634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  16 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  116 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568556
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctca 36568556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662651
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtccccc 12662651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 26074614 - 26074761
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074614 caagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26074713  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  26074714 gagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 106  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 157  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26074304 - 26074155
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26074304 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggttttgggt 26074205  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  26074204 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 188
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370584
Alignment:
Q  32 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 131  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  132 gcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 188  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctcatgtcccaacac 15370584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 623813 - 623984
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || ||||||||||||    
T  623813 tggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaaggttt 623912  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 172  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  623913 tgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccccgagctcc 623984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  18 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  118 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150164
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccc 35150164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24489360 - 24489207
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24489360 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaa 24489263  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24489262 gagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccc 24489207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5723954 - 5723811
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| ||||||||||    
T  5723954 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaaggttt 5723855  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 144  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723854 tgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  3 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  103 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 141  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 38427553 - 38427697
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  38427553 gtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagag 38427651  T
Q  111 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 156  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38427652 tgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26074938 - 26074818
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  26074938 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaa 26074839  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgc 127  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26074838 agagtgtggcgtctctcttgc 26074818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301132
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||| ||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcctccgaactcccctaatgacccaaca 301132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590909
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttcccc 26590909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167837
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtccccc 35167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    ||||| || ||||| || ||||   | |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915029
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    | |||||| |||||||||||| |  | ||| || | |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtccccc-agctccgctcatgacccaaca 35915029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26899995
Alignment:
Q  92 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc-catgacccaaca 26899995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36522053 - 36521946
Alignment:
Q  7 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36522053 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggta 36521954  T
Q  107 agagtgtg 114  Q
    ||||||||    
T  36521953 agagtgtg 36521946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 36522392 - 36522266
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36522392 aagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaag 36522293  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 135  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    
T  36522292 agtgtggtgtctctctcacttgtgcgg 36522266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 101
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 101  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 7768845 - 7768925
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 81  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768845 tggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 187
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427401
Alignment:
Q  93 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-atgatccaaca 187  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccccgagctcccttcgatgatccaaca 38427401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Original strand, 31509623 - 31509742
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  31509623 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttgg 31509722  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  31509723 taagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635170
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||| || ||||| || |||||  ||||| |||| | |  |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctctatctttaatgtggactgt--ccctcactcccctcatgatccaaca 41635170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509864
Alignment:
Q  20 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  119 ctctcttgcttgtgcggttg 138  Q
    |||||| |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgtacggttg 31509864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  90 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 87
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 87  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786041
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  107 agagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctct 13786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 101
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 101  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785632
Alignment:
Q  64 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  164 c 164  Q
    |    
T  13785632 c 13785632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  64 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  77 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 144  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 120
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  63 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 142  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 66  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 131
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  43 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 124
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  86 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 124
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  86 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 48
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 48
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 5660293 - 5660338
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 46  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660293 tggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 118
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  88 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 162
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  64 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  77 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 795141 - 795081
Alignment:
Q  128 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  795141 ttgtgtggttattttagcctcgatgtagacggttcccccgagctcccctcatgacccaaca 795081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 13785764 - 13785732
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 41  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785764 aagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150885
Alignment:
Q  111 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||||||  || ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccccttgctcccc-catgacccaaca 35150885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 103)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50630916 - 50630740
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630916 tggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 50630817  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  50630816 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctagctcccctca 50630740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483504
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc 25483504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 55933285 - 55933121
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55933285 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttt 55933186  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933185 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 55933121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 41370352 - 41370517
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41370352 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttt 41370451  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370452 tgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 41370517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Original strand, 36629239 - 36629408
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36629239 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36629338  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  36629339 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcccctca 36629408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 44620660 - 44620838
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  44620660 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacc-ataaccttaaggttttgggt 44620758  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44620759 aagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaa 44620838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002586
Alignment:
Q  3 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  103 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccg 50002586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017583
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctagctcccc 54017583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340975
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc 3340975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792842
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctcatga 39792842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246089
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctc 10246089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608635
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 188  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcgtgacccaacac 36608635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404189
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctca 39404189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 54108928 - 54109060
Alignment:
Q  21 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54108928 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtct 54109026  T
Q  121 ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54109027 ctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 39404400 - 39404555
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  39404400 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaa 39404499  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404500 gaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621180
Alignment:
Q  15 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 114  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  115 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtccc---cgctcctctcatgatccaaca 44621180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22028117 - 22027936
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22028117 tgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaaggttttgggt 22028018  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  22028017 aagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcccctcatgacccaaca 22027936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183261
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 22183261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620531
Alignment:
Q  15 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  115 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtccc---cgctcctctcatgatccaaca 44620531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 147  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076807
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccctgagct-ccctcatgacccaaca 49076807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343004
Alignment:
Q  16 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  116 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccg 54343004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 49880155 - 49880280
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49880155 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttt 49880254  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  49880255 tgggtaagagcgtggtgtctctcttg 49880280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936363
Alignment:
Q  25 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  125 tgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
      | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc 54936363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcacttgt--ggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826018
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  112 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-atgatccaaca 187  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaaca 20826018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 52884887 - 52885038
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884887 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggg 52884986  T
Q  105 taagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    ||||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884987 taagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 157  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18932887 - 18932745
Alignment:
Q  24 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18932887 gtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctc 18932788  T
Q  124 ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    || |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18932787 ttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccccg 18932745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028366
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 103  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  104 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 22028366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303064
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccc 49303064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 20826223 - 20826370
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  20826223 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagt 20826322  T
Q  112 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 159  Q
    ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20826323 gtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888814
Alignment:
Q  7 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccc 16888814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889511
Alignment:
Q  7 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccctcgagctccccacgtgacccaaca 16889511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108695
Alignment:
Q  5 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  104 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtccccc 54108695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004560
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtctcccgagctcctctcatgacccaaca 34004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 49076604 - 49076439
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  49076604 tgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggt 49076506  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |  || | ||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49076505 a--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 49076439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496931
Alignment:
Q  21 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  121 ctcttgcttgtg 132  Q
    ||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtg 45496931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3244607 - 3244449
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3244607 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggt 3244508  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||| ||||  ||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  3244507 aagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtcccc 3244449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 2741071 - 2741180
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2741071 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggt 2741170  T
Q  106 aagagtgtgg 115  Q
    ||||||||||    
T  2741171 aagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817678
Alignment:
Q  60 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 159  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  160 tccccc 165  Q
    ||||||    
T  23817683 tccccc 23817678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  108 gagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827610
Alignment:
Q  46 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagc 145  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  146 ctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccccgagcttccctca 43827610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6975615 - 6975489
Alignment:
Q  3 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||    
T  6975615 gtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaagattttg 6975516  T
Q  103 ggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975515 ggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 3341128 - 3341287
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||    
T  3341128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggt 3341227  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || || |||| || || ||||||||| |||||||||||    
T  3341228 aagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggtccccc 3341287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 187
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691335
Alignment:
Q  57 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  155 gacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||| |||  || |||||||  |||| ||||||    
T  31691303 gacgatccttcgagctcccccaatgacccaaca 31691335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 43174508 - 43174661
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| || |||||||    
T  43174508 caagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgaccttaaagtgttgggta 43174607  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    ||||||||| |||||||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43174608 agagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggt 43174661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768035
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |||   || ||||||||| ||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtctcccaaacttccctcatgacccaaca 51768035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatg 152  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741165
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||  ||||||||||||||  ||| || |||||| || ||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctcagtgtagatggtccctcgggctcccctca 54741165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 187
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879987
Alignment:
Q  52 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 151  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  152 gtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||    
T  18879952 gtggacggtcctccgagctcccccaatgacccaaca 18879987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45489485 - 45489331
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||    
T  45489485 caagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaa 45489387  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 163  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489386 gagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700517
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    |||||| || |||||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtctcccg 3700517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034388
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtccccc 28034388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  19 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 143
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 143  Q
    | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111694
Alignment:
Q  27 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 126  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  127 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    |   || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccccg 48111694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271948
Alignment:
Q  28 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 123  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  124 -ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
     ||  || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtccccc 3271948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760306
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  111 tgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctct 760306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 95
Target Start/End: Original strand, 10246347 - 10246436
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 95  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10246347 tgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  48 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 147  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  14 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 50788144 - 50788087
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 58  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788144 tggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 174
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174309
Alignment:
Q  98 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccccgagctcccc 43174309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698919
Alignment:
Q  31 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 128  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  129 tgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   | |||| |||||| ||||||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcctatgagctctcctcatcatccaaca 39698919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 44621426 - 44621492
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621426 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544239
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 138  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctctcacttgtacggttg 34544239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489711
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 111  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  112 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatccccc 45489711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702281
Alignment:
Q  120 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctcatga 11702281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 138  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Original strand, 44620946 - 44621011
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 72  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620946 caagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783528
Alignment:
Q  69 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcg 168  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||   |||| |||||||| |||||||  ||||||||  |    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  169 ctcccctcatgatccaaca 187  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  11783546 cacccctcatgacccaaca 11783528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 94  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  12 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 111  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  112 gtggtgtctctct 124  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 155
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  116 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 160
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  86 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 113
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  64 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 122  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 118
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  72 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817457
Alignment:
Q  119 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 23817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  60 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 54  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 175
Target Start/End: Original strand, 45496675 - 45496719
Alignment:
Q  131 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  45496675 tgcggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctcccct 45496719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 104
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  61 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 104  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 18932921 - 18932887
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 35  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18932921 tggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcgg 18932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  50 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  82 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50788034
Alignment:
Q  84 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctct 50788034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 47  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 102
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  69 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 18933131 - 18933103
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933131 tggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  88 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 22304564 - 22304728
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22304564 tggtttgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttt 22304663  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22304664 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccc 22304728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346775
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg-cgctcccctcatg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcctccgaagctcccctcatg 43346775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589884
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtccccctcgctcccttcatgatccaaca 32589884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946681
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 35946681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37990795 - 37990626
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37990795 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 37990696  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37990695 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctca 37990626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644890
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342377
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 175  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctcccct 42342377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990953
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgct-cccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctccccctcatgacccaaca 37990953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114561
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtccccc 12114561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29644739 - 29644558
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29644739 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644640  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||    
T  29644639 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatggtcccccaaactcccctcgtgacccaaca 29644558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773010
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 15773010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803251
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 33803251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634843
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcccc 52634843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 54017974 - 54017806
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54017974 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggt 54017875  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  54017874 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctcccc 54017806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739424
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtccccc 25739424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018197
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 54018197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 39389065 - 39389219
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39389065 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaaggttt 39389164  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||||    
T  39389165 tgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39935120 - 39934963
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  39935120 tggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaagt 39935021  T
Q  99 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 156  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39935020 tttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41359919 - 41359764
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359919 tgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 41359824  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41359823 aagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 41359764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755568
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 180  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccgaactcccctcatga 25755568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42342248 - 42342092
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42342248 tgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggt 42342149  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342148 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 15773192 - 15773375
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15773192 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggt 15773291  T
Q  106 aagagtgtggtgtctct--cttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||    
T  15773292 aagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacgatcctcctaactcccctcatgatccaaca 15773375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21832501 - 21832344
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21832501 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggt 21832402  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21832401 aaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtccccc 21832344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22304104 - 22303954
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22304104 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 22304012  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22304011 gagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggattgtccccc 22303954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135432
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 186  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctgactctcctcatgacccaac 3135432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 4823650 - 4823796
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4823650 tggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaagattt 4823749  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 147  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  4823750 tgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3135224 - 3135099
Alignment:
Q  13 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3135224 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtg 3135125  T
Q  113 tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3135124 tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190167
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccc 31190167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 50612615 - 50612446
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgccttaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  |||||    
T  50612615 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatcttaa 50612516  T
Q  96 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  50612515 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtccccc 50612446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577524
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccccg 53577524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634302
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca 1634302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32462715 - 32462536
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  32462715 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggata 32462616  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  32462615 agagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacgg-cccccaaactcccctcatgatccaaca 32462536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914399
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901872
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccc 45901872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117974
Alignment:
Q  7 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  107 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtccccc 53117974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328066
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctct----tgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 164  Q
    |||||||||||||||||||     |   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccc 8328066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  108 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 156  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160546
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 44160546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 9240149 - 9240300
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |    
T  9240149 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggat 9240248  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 157  Q
    |||| ||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9240249 aagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303662
Alignment:
Q  64 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtc 22303662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175646
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  105 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctca 33175646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Original strand, 11661954 - 11662117
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11661954 aagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaa 11662053  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 172  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  11662054 gagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtcccacgagctcc 11662117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 37726499 - 37726656
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| ||||||    
T  37726499 tggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttaggttt 37726590  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||| ||||||||||  || | |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726591 tggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 37726656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584829
Alignment:
Q  16 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  116 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 159  Q
    |||  ||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacgg 42584829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 51886556 - 51886709
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||    
T  51886556 tggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------gttt 51886649  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 160  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||  ||| | ||||||||  ||||||||| |||||    
T  51886650 tggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggt 51886709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 47964676 - 47964544
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47964676 tgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 47964577  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 138  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  47964576 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  32 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359490
Alignment:
Q  80 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 41359490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336208
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc-gcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctcgtgatccaaca 39336208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3384429 - 3384317
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  3384429 tggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgccttaaagttt 3384330  T
Q  101 tgggtaagagtgt 113  Q
    |||||||||||||    
T  3384329 tgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 22304241 - 22304301
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304241 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017547
Alignment:
Q  76 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtccccc 54017547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964914
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  | ||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttccccc 47964914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  108 gagtgtggtgtctctct 124  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  109 agtgtg 114  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 62  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 165
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304352
Alignment:
Q  115 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 22304352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336002
Alignment:
Q  48 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 132  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtg 39336002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 116
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  56 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 177
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328441
Alignment:
Q  110 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtcccacgaactcccctca 8328441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 153
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  48 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 147  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  148 cgatgt 153  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  108 gagtgtggtgtctctct 124  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978856
Alignment:
Q  86 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 173  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccccgagctccc 43978856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 187
Target Start/End: Original strand, 9239941 - 9239994
Alignment:
Q  134 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9239941 ggtttttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaaca 9239994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  61 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  61 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  9 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  109 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 138  Q
    ||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766782
Alignment:
Q  88 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtccccc 7766782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  74 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41360164 - 41360125
Alignment:
Q  137 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41360164 tgttctagcctcgatgtggacggttccccgggctcccctc 41360125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 118
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  73 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  77 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  11 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  69 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 512
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccg 512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 305 - 145
Alignment:
Q  1 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| ||| ||    
T  305 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg-tt 211  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 166  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210 taggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1096
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 1163  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 174  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  1162 gagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1660
Alignment:
Q  53 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct--------tgtgcggttgttctag 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||         ||| |||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctctctctctcacacaagtgtggttgttctag 1703  T
Q  145 cctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 187  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  1702 cctcgatgtgggcagtccccctagctcccctcgtgacccaaca 1660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 3092
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3143 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47519
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 165  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtccccc 47519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  105 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Original strand, 5777 - 5931
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  5777 tgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattt 5876  T
Q  101 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 155  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5877 tgagtaagagtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 5357 - 5477
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  5357 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggat 5456  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5457 aagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  106 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17614 - 17496
Alignment:
Q  6 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg--ttttgg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  17614 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgg 17515  T
Q  104 gtaagagtgtggtgtctct 122  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17514 gtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 83  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaa-gttttgggtaa 39556  T
Q  108 gagtg-tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 138  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 39840 - 39963
Alignment:
Q  8 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| ||| ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| |||    
T  39840 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaattttggttaa 39939  T
Q  108 gagtgtggtgtctctcttgcttgt 131  Q
     | |||||||||||||| ||||||    
T  39940 aaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  44 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 84  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University